View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19266_high_5 (Length: 640)

Name: NF19266_high_5
Description: NF19266
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19266_high_5
NF19266_high_5
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (1-623)||(35213988-35214603)
chr3 (1-258)||(29523715-29523977)
chr3 (3-258)||(11203729-11203989)
chr3 (1-258)||(12342196-12342457)
chr3 (1-258)||(33496455-33496717)
chr3 (1-269)||(19890586-19890859)
chr3 (13-255)||(48570012-48570259)
chr3 (1-190)||(7031055-7031249)
chr3 (1-197)||(36801106-36801307)
chr3 (124-246)||(40930510-40930632)
chr3 (100-248)||(26770969-26771117)
chr3 (100-248)||(2755854-2756002)
chr3 (138-238)||(34332805-34332905)
chr3 (100-248)||(963143-963291)
chr3 (113-246)||(2364302-2364435)
chr3 (113-246)||(7312801-7312934)
chr3 (113-194)||(19920263-19920344)
chr3 (109-201)||(15312604-15312696)
chr3 (113-193)||(10323606-10323686)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-264)||(10999915-11000182)
chr2 (5-269)||(14439665-14439933)
chr2 (4-269)||(12645447-12645717)
chr2 (20-258)||(38604344-38604587)
chr2 (12-237)||(40176588-40176817)
chr2 (1-237)||(41206924-41207165)
chr2 (4-203)||(15917565-15917769)
chr2 (1-196)||(17764994-17765194)
chr2 (1-193)||(28252628-28252825)
chr2 (113-246)||(4552194-4552327)
chr2 (13-70)||(33515947-33516004)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (1-269)||(2170248-2170523)
chr8 (1-269)||(43270358-43270634)
chr8 (1-258)||(37434040-37434302)
chr8 (1-258)||(20824204-20824466)
chr8 (1-258)||(17699390-17699652)
chr8 (4-262)||(13200034-13200297)
chr8 (147-269)||(42177548-42177670)
chr8 (7-159)||(2529800-2529957)
chr8 (13-216)||(13879499-13879707)
chr8 (100-248)||(25090399-25090547)
chr8 (7-71)||(42177727-42177791)
chr8 (15-246)||(13396310-13396546)
chr8 (137-245)||(41665352-41665460)
chr8 (113-248)||(9922626-9922761)
chr8 (15-191)||(32266486-32266667)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (1-269)||(20882992-20883265)
chr6 (1-258)||(10577219-10577481)
chr6 (1-258)||(17606304-17606566)
chr6 (1-258)||(21630077-21630341)
chr6 (1-258)||(17573625-17573887)
chr6 (1-269)||(11462320-11462588)
chr6 (1-200)||(17579109-17579313)
chr6 (100-248)||(15958793-15958941)
chr6 (113-200)||(18651262-18651349)
chr6 (113-201)||(12734150-12734238)
chr6 (137-195)||(2553686-2553744)
chr6 (140-246)||(24767406-24767512)
chr6 (100-244)||(13937712-13937856)
chr6 (1-54)||(14373170-14373223)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (1-258)||(27766950-27767212)
chr5 (1-262)||(18359058-18359323)
chr5 (1-258)||(33385344-33385606)
chr5 (1-258)||(10776672-10776935)
chr5 (1-258)||(8300152-8300414)
chr5 (15-258)||(25857394-25857642)
chr5 (13-216)||(27795403-27795611)
chr5 (1-196)||(19255154-19255355)
chr5 (113-238)||(28535665-28535790)
chr5 (109-246)||(26072913-26073050)
chr5 (122-246)||(42928165-42928289)
chr5 (113-195)||(8228051-8228133)
chr5 (111-245)||(18089744-18089878)
chr5 (15-195)||(23238306-23238491)
chr5 (100-248)||(33169670-33169818)
chr5 (137-238)||(35983781-35983882)
chr5 (148-248)||(27165932-27166032)
chr5 (113-237)||(31641537-31641660)
chr5 (155-269)||(24407995-24408109)
chr5 (137-195)||(27117194-27117252)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-258)||(12697721-12697983)
chr4 (1-269)||(20002626-20002906)
chr4 (1-258)||(8361008-8361270)
chr4 (113-258)||(45472679-45472824)
chr4 (95-269)||(55725645-55725819)
chr4 (109-255)||(2822010-2822156)
chr4 (1-216)||(54483171-54483391)
chr4 (1-75)||(4548377-4548451)
chr4 (12-216)||(48312014-48312223)
chr4 (1-246)||(7403821-7404071)
chr4 (100-245)||(11587181-11587326)
chr4 (139-246)||(15740272-15740379)
chr4 (1-238)||(1828530-1828772)
chr4 (137-246)||(19755316-19755425)
chr4 (137-246)||(19784381-19784490)
chr4 (113-191)||(47685932-47686010)
chr4 (100-248)||(46145687-46145835)
chr4 (113-193)||(47418829-47418909)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-258)||(43388275-43388537)
chr1 (1-269)||(37191169-37191442)
chr1 (1-258)||(16917779-16918041)
chr1 (12-199)||(51993757-51993949)
chr1 (113-246)||(51052505-51052638)
chr1 (125-237)||(47623068-47623180)
chr1 (122-248)||(35541083-35541209)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (1-269)||(37254666-37254939)
chr7 (33-258)||(18532568-18532798)
chr7 (1-269)||(25619367-25619646)
chr7 (113-246)||(235419-235552)
chr7 (113-246)||(11277234-11277367)
chr7 (113-248)||(17720660-17720795)
chr7 (137-246)||(47877032-47877141)
chr7 (100-186)||(551595-551681)
chr7 (140-193)||(29968027-29968080)
chr7 (1-37)||(18530418-18530454)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (113-195)||(3277-3359)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 35214603 - 35213988
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||    
T  35214603 gcaccaaaaattggacaagacaagaacaaatgattcacatcttcaacatgccaacatcccgttacacaaaactgagcttccacatatagaatcccacgtt 35214504  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35214503 ctggcaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacatccgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatatt 35214404  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgatattatatagttctttttggtcattat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35214403 ttgatgaacatgaggttgttcccgtgatgttaacatgt----tacaccacgaacagtataacctctaatatgatattatatagttctttttggtcattat 35214308  T
Q  296 atcactctaagaactaaccatatgcatatcatgaaatgcattagtattttgatcctcaatttgttttttattcgattctttattaaatctatagcatggg 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35214307 atcactctaagaactaaccatatgcatatcatgaaatgcattagtattttgatcctcaatttgttttttattcgattctttattaaatctatagcatggg 35214208  T
Q  396 attggttctgtagtgatatctgataaaggctttggctgcgacaaaattttaacatgtcgatgagaaatcactctatcctccacacttgacatatttttta 495  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |    
T  35214207 attggttcggtagtgatatctgataaaggctttggctgcgacaaaatattaacatgtcgatgagagatcactctatcctccacacttg-----------a 35214119  T
Q  496 catattttaaatcagaccaaaactgaggatttct---tcctaatttattgtagatcctagtttaaaacttaagattcatttcaaaggtttgtaaattatc 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35214118 catattttaaatcagaccaaaactgaggatttctacctcctaatttattgtagatcctagtttaaaacttaagattcgtttcaaaggtttgtaaattatc 35214019  T
Q  593 attccctttgagcaccaatctttgatgtaag 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35214018 attccctttgagcaccaatctttgatgtaag 35213988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29523977 - 29523715
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||     || ||||||||||     
T  29523977 gcaccaaaaattggacaagacaagaataaatgattcacatctttaacctgcctgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgtg 29523878  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  29523877 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 29523778  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  29523777 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 29523715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 258
Target Start/End: Original strand, 11203729 - 11203989
Alignment:
Q  3 accaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttct 97  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||     || ||||||||||||     
T  11203729 accaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgttcc 11203828  T
Q  98 gacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatttt 197  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11203829 accaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagtatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatttt 11203928  T
Q  198 gatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  11203929 gatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaaatcatatacaccacgaacagtataacc 11203989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12342457 - 12342196
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||     || |||||||||||    
T  12342457 gcaccaaaaattggacaagagaagaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgtt 12342358  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  12342357 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaa-gaacctgtttatgccaaattaactccatatt 12342259  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12342258 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccatgaacagtataacc 12342196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 33496455 - 33496717
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||  ||||     || |||||||||||    
T  33496455 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgtccgcatcccattacacaaaaccgattttccacagatataatcccacgtt 33496554  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||     
T  33496555 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaatgatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatata 33496654  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  33496655 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccatgaacagtataacc 33496717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 19890586 - 19890859
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| || || ||||  ||| | |||     |  ||| ||||| |    
T  19890586 gcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgagtcgtatcttcaacatgcccacatcctgtgacgcaaattcgatcctccacaaatgtaatgccacgat 19890685  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19890686 ctgccaagttggatttagtaggtaatcgatccctcaacaaccgcaatgcaaggatggaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatatt 19890785  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19890786 ttgatgaacatgaggttattcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctctaatctgat 19890859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48570259 - 48570012
Alignment:
Q  13 ggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaatttg 107  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||     || ||| || || | || || ||| |    
T  48570259 ggacaagtcaaaaacatatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcggtaaaatgccgcgatttgtcagattag 48570160  T
Q  108 atttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatg 207  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  48570159 ctttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgctaagcaaggactgaaacttttagaggtatctgtttgtgctagattaactccatattttgatgaatatg 48570060  T
Q  208 aggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtata 255  Q
    |||||||||   ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||    
T  48570059 aggttgttcatgtgatgtcaacaagtcatataccccacgaacagtata 48570012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7031249 - 7031055
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||     || |||||| |||     
T  7031249 gcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctaaaatccctcgtg 7031150  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactcc 190  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  7031149 ccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagacgccaagcaaggatagaaagttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactcc 7031055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36801307 - 36801106
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||     || |||| ||| |     
T  36801307 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgatttacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacagatataatctcacatg 36801208  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  | ||||||||||||||    
T  36801207 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcagcagttgccaagcaaggatataaacttttaagggaacctatttatgctaaattaactccatatt 36801108  T
Q  196 tt 197  Q
    ||    
T  36801107 tt 36801106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40930632 - 40930510
Alignment:
Q  124 atccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgat 223  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| |  |||||||| |||  ||||    
T  40930632 atccctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaactaactccatgttttgatgcaactgaggttgctcctgtgat 40930533  T
Q  224 gtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  40930532 gtcagcatgtcatagactccacg 40930510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26771117 - 26770969
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||  ||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  26771117 caaatttgctttcgtaggtaaacgatccctcaaaagccgccaagtaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccacattaactccatatttgga 26771018  T
Q  200 tgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    || |  | ||| ||||||  | |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  26771017 tgtaactaaggatgttcctgtaatgttagcatgtcatacacaccacgaa 26770969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 2755854 - 2756002
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    ||||||| |||||||||| || || ||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||||||||    
T  2755854 caaattttatttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaatatagacactttcaaaggtacctgtttgtgccaaatcaactccatattttga 2755953  T
Q  200 tg-aacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    || |||||| |||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2755954 tgtaacatg-ggttgttcctgcgatgtcaacatatcatacacaccacgaa 2756002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34332905 - 34332805
Alignment:
Q  138 gccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcata 237  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |  || || || |||  |||||||| |||||||||    
T  34332905 gccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcata 34332806  T
Q  238 g 238  Q
    |    
T  34332805 g 34332805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 963291 - 963143
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||||  ||||||||| || || ||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||||||||    
T  963291 caaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattttga 963192  T
Q  200 tg-aacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    || |||||| |||||||||   || |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  963191 tgtaacatg-ggttgttcctgcgaagtcagcatatcatacacaccacgaa 963143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 2364302 - 2364435
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| || ||||| |||||||| || || |  || || |    
T  2364302 gtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 2364401  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    | |||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  2364402 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 2364435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 7312801 - 7312934
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| || ||||| |||||||| || || |  || || |    
T  7312801 gtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 7312900  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    | |||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  7312901 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 7312934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19920344 - 19920263
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatat 194  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  19920344 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatat 19920263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Original strand, 15312604 - 15312696
Alignment:
Q  109 tttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatg 201  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  ||| | ||||||| ||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  15312604 tttaataggcaaacgattcctcagcagtcaccaagcaaatatatagacttttagaggtacctgtttatgccaaattaactccaaattttgatg 15312696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10323686 - 10323606
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccata 193  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  10323686 gtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccata 10323606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11000182 - 10999915
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  11000182 gcaccaaaaattggacaagataagaacaaatgattcacatcttcaacatgcccacattccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatcccacgtt 11000083  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11000082 ctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccct-aacagccaccaagcaaggatagaaacttttaaagaaacctgtttatggcagattaactccatatt 10999984  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaat 264  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  10999983 ttgatgaacatgagattgttcctatgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaatataacctctaat 10999915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 14439665 - 14439933
Alignment:
Q  5 caaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||      
T  14439665 caaaaattggacaagacaa-aacaaatgattcacatcttcaacctacccacatcccgttacataaaaccgagcttccacagatagaatcccacgttctac 14439763  T
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14439764 caaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgtcaagccaagatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccatagtttga 14439863  T
Q  200 tgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  14439864 tgaacatgaggtcgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaatataacctttaatctgat 14439933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Original strand, 12645447 - 12645717
Alignment:
Q  4 ccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctg 98  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||     |||||| |  || ||||    
T  12645447 ccaaaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaggtagaattctgcgatctg 12645546  T
Q  99 acaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttg 198  Q
     ||||||  |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12645547 tcaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagagaaacctgtttatgccaaattaactccatattttg 12645646  T
Q  199 atgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    || ||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  12645647 ataaacatgagggttttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccacgaacagtatatcctccagtctgat 12645717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 38604587 - 38604344
Alignment:
Q  20 acaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcctaga-----atcccacgttctgacaaatttgatttagt 114  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||| |||  ||     || ||||| | || ||||||   | | ||    
T  38604587 acaaaaacacatgatttacatcttcaacatgcccacagcctgagacacataaccgagcctccatgagaaggatgccacgatatgccaaattgactattgt 38604488  T
Q  115 aggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgt 214  Q
    ||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38604487 aggtaaacgatctcttaacagcagccatgcaaggattgaaacttttagaggtacttgtttatgccagattaactccatattttgatgaaaattaggttgt 38604388  T
Q  215 tcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  38604387 tcctgtgatgtcaacatgtcatacacaccccgaacagtgtaacc 38604344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Original strand, 40176588 - 40176817
Alignment:
Q  12 tggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-tag---aatcccacgttctgacaaatttg 107  Q
    ||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| | |   ||  || || | || ||||||      
T  40176588 tggacaaaacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcggtaaaagccgcgatttgtcaaattga 40176687  T
Q  108 atttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatg 207  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40176688 ctttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactccatattttgatgaatatg 40176787  T
Q  208 aggttgttcccatgatgtcaacatgtcata 237  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  40176788 aggttgttcctgtgatgtcaataagtcata 40176817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 41206924 - 41207165
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcctag-----aatcccacgtt 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||     ||| ||||| |    
T  41206924 gcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccgcgcctccaagggaataatgccacgat 41207023  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
     || ||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  41207024 ttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 41207123  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcata 237  Q
    | |||| |  ||||| ||||||   ||||||| |||||||||    
T  41207124 tggatgtaactgaggatgttcctgcgatgtcagcatgtcata 41207165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 15917565 - 15917769
Alignment:
Q  4 ccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctg 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||      | ||| ||||| | ||    
T  15917565 ccaaaagttggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacaaccagtgacacacaaccgcacttccaaaggaataataccacgatttg 15917664  T
Q  99 acaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttg 198  Q
     ||||||   ||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||| | ||||| || ||||||  | |||||||| ||||||||    
T  15917665 ccaaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagcaaggatacagactttcagaggaacctatttatgcgaaattaactcaatattttg 15917764  T
Q  199 atgaa 203  Q
    |||||    
T  15917765 atgaa 15917769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17765194 - 17764994
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttccta--gaatc---ccacgtt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| || ||| |  ||||    ||||| |    
T  17765194 gcaccaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgaccacaaccagtgacacacaaccgcgcctccaaaggaatgataccacggt 17765095  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
     || |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  17765094 ttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaatagccgccaagcaagaatagagactttaagaggagcctgtttatgccatattaactccatatt 17764995  T
Q  196 t 196  Q
    |    
T  17764994 t 17764994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28252628 - 28252825
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcct-----agaatcccacgtt 95  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |  ||||| |||||  | |||      | ||| ||| | |    
T  28252628 gcaccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcatcatgaccacaaccggaaacacataaccgcccctccatatgaataatgccatggt 28252727  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccata 193  Q
     || |||||||   || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  28252728 ttgccaaatttcccttcgtaggtaagcgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgtttatgccaaattaattccata 28252825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 4552194 - 4552327
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||| || ||||| |||||||| || || |  || || |    
T  4552194 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttaagaggaacctatttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 4552293  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    | |||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  4552294 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 4552327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 33516004 - 33515947
Alignment:
Q  13 ggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaa 70  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33516004 ggacaagacaaaaacatatgagacacatcttcaacatgcccacatctcgtgacacaaa 33515947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 2170248 - 2170523
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaac--cgagcttcc-----tagaatcccacg 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||  ||||     ||||||||||||    
T  2170248 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaccccgttacacaaaacaccgattttccacagatagaatcccacg 2170347  T
Q  94 ttctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccata 193  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2170348 ttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacggtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccata 2170447  T
Q  194 ttttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  2170448 ttttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacggacagtataaccagtaatctgat 2170523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 43270358 - 43270634
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||| ||||||    
T  43270358 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaacccgttacacaaaaccgagcttccacagatagaatctcacgtt 43270457  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43270458 ctaccaaatttgttttagtaggcaaacgatccttcaacagtcgccaagtaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccagatgaactccatatt 43270557  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttc---ccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  43270558 ttgatgaacatgaggttgttcaatatgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctttaatatgat 43270634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 37434040 - 37434302
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||     || |||||||||||    
T  37434040 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagatataatcccacgtt 37434139  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  37434140 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagaatagagacttttaaaggaacatgtttatgccaaattaactccatatt 37434239  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  37434240 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 37434302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 20824204 - 20824466
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||     || |||||| |||     
T  20824204 gcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtg 20824303  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  20824304 ccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 20824403  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  20824404 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcaccatgaacagtataacc 20824466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 17699390 - 17699652
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||  ||||     || ||||||| ||     
T  17699390 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcctacatcccgatacacaaaatcgattttccacagatataatcccatgtg 17699489  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  17699490 ccaccaaatttgatatagtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17699589  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  17699590 ttgatgaacatgaggttgttcatgtgatgtcaacaagtcatgaacaccacgaacagtataacc 17699652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Original strand, 13200034 - 13200297
Alignment:
Q  4 ccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctg 98  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||     |||||| |  || ||||    
T  13200034 ccaaaaattgggcaagacaaaaacatatgagtcacatcttcaacatgcccacacccagtaacacaaaaccgagcctccataggtagaattctgcgctctg 13200133  T
Q  99 acaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttg 198  Q
     ||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  13200134 ccaaattgtattttgtaggtaaacgatccctcaatagctgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacctgtttatgccaaactaactccatattttg 13200233  T
Q  199 atgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctcta 262  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  13200234 atgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccacgaacagtatagcctcta 13200297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42177670 - 42177548
Alignment:
Q  147 ggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42177670 ggatagaaacttttaaaggaacctgttaatgccatattaactccaaattttgatgaacataaagttgttcatgtgatgtcaacatgtcatatacaccacg 42177571  T
Q  247 aagagtataacctctaatctgat 269  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  42177570 tacagtataacctctaatctgat 42177548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 2529800 - 2529957
Alignment:
Q  7 aaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgaca 101  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||     |||||| ||||| |||  ||    
T  2529800 aaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaagtagaattccacgatctacca 2529899  T
Q  102 aatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttt 159  Q
    ||||  |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2529900 aattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttt 2529957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13879707 - 13879499
Alignment:
Q  13 ggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaatttg 107  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||     || ||| ||||| | || |||||| |    
T  13879707 ggacaagacaaaaacagatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccaacggtaaaatgccacgatttgccaaattgg 13879608  T
Q  108 atttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatg 207  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||| | ||| | || ||| || |||| |||||||||| |||||||||  ||    
T  13879607 ctttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctatttgtgccagactaactccatactttgatgaatctg 13879508  T
Q  208 aggttgttc 216  Q
    |||||||||    
T  13879507 aggttgttc 13879499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 25090399 - 25090547
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||| | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| ||  ||| |||||||||||| |||    
T  25090399 caaattggctttagtaggtagtcgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttagaggtacctgtttgtgctagactaactccatattgtga 25090498  T
Q  200 tgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    |||| |||||  |||||   ||||||||| | |||||| || |||||||    
T  25090499 tgaagatgagagtgttcatgtgatgtcaataagtcatataccccacgaa 25090547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 42177791 - 42177727
Alignment:
Q  7 aaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaa 71  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42177791 aaaattggacaagagaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaa 42177727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Original strand, 13396310 - 13396546
Alignment:
Q  15 acaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaatttgat 109  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||     || ||| ||||| | || ||||||   |    
T  13396310 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattt 13396409  T
Q  110 ttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgag 209  Q
    || ||||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| || |||||||||||||  ||||| |  || |    
T  13396410 tttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaactccatatgatgatgtaattggg 13396509  T
Q  210 gttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    | || |||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  13396510 gctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagaccccacg 13396546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41665460 - 41665352
Alignment:
Q  137 cgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||| |  || || || |||  |||||||| ||||||||    
T  41665460 cgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcat 41665361  T
Q  237 agacaccac 245  Q
    |||| ||||    
T  41665360 agaccccac 41665352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 9922626 - 9922761
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || || || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| || ||||||||||  |||||||| |  ||||| |    
T  9922626 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgtcatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccaagttttgatgtaagtgaggct 9922725  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    | |||  |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  9922726 gctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgaa 9922761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 32266486 - 32266667
Alignment:
Q  15 acaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaatttgat 109  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||     || ||| ||||| | || ||||||   |    
T  32266486 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattactt 32266585  T
Q  110 ttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactcca 191  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  32266586 ttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactcca 32266667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20883265 - 20882992
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     || ||| ||||| |    
T  20883265 gcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcatatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaaccgagcctccacagatataatgccacgat 20883166  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||  ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20883165 ctaccaagttcgatttagtaggtaaacaatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctatttatgccagattaactccatatt 20883066  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  20883065 ttgatgaacatgtggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaatatagcctctaatctgat 20882992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10577481 - 10577219
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||     || |||||||||||    
T  10577481 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagttataatcccacgtt 10577382  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  10577381 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactctatatt 10577282  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||||    
T  10577281 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaaaaagtcatatacaccacaaacagtataacc 10577219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17606566 - 17606304
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||||     || ||| |||||||    
T  17606566 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgtatcccgttacacaaaatcgattttccacagctataattccacgtt 17606467  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  17606466 ccaccaaatttgatttagtaggtaaatgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17606367  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  17606366 ttgatgaacatgagattgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 17606304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21630341 - 21630077
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||     || |||||||||||    
T  21630341 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagatataatcccacgtt 21630242  T
Q  96 ctgacaaattt--gatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccata 193  Q
    |   |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||    
T  21630241 ccaccaaatttttgattttgtaggtaaacgatccctcaatagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctggttatgccaaattaactccata 21630142  T
Q  194 ttttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  21630141 ttttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 21630077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17573887 - 17573625
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||     || |||||| |||     
T  17573887 gcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtg 17573788  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  17573787 ccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaatcttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17573688  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  17573687 ttgataaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcacaacgaacagtataacc 17573625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 11462320 - 11462588
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||     || ||| ||||| |    
T  11462320 gcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacaaaaaaccgagtctccgcatatataatgccacgat 11462419  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||| ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  11462420 ctgccaagttggatttagtaggtaaaagatccctcaacagctgccaagcaaggattgaaactttt-----aacctgtttataccagattaactccatatt 11462514  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    |||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||| ||||    
T  11462515 ttgatgaatatgttgttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacaatatagcatctaatatgat 11462588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17579313 - 17579109
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||     || |||||| |||     
T  17579313 gcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtg 17579214  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  17579213 ccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17579114  T
Q  196 ttgat 200  Q
    |||||    
T  17579113 ttgat 17579109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15958941 - 15958793
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||    
T  15958941 caaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagagactttaagaggaacctgtttatgccatattaacttcatatttgga 15958842  T
Q  200 tgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    || |  ||| ||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  15958841 tgtaactgaagttgttcctgtgatgtcagcatgtcagacacaccgcgaa 15958793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18651349 - 18651262
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgat 200  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18651349 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgat 18651262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 201
Target Start/End: Original strand, 12734150 - 12734238
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatg 201  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  12734150 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaaatccatattatgatg 12734238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 195
Target Start/End: Original strand, 2553686 - 2553744
Alignment:
Q  137 cgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  2553686 cgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 2553744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24767512 - 24767406
Alignment:
Q  140 caagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcataga 239  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |  |  || || |||  |||||||| |||||||||||    
T  24767512 caagcaaggatagagactttgataggaacctgtttatgcaaaattaactccatattttgatgtaactagggctgctcctgtgatgtcagcatgtcataga 24767413  T
Q  240 caccacg 246  Q
    | |||||    
T  24767412 ctccacg 24767406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Original strand, 13937712 - 13937856
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||||  ||||||||| || || ||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||||||||    
T  13937712 caaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattttga 13937811  T
Q  200 tg-aacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacacca 244  Q
    || |||||| |||||||||   || |||||||| ||||| ||||||    
T  13937812 tgtaacatg-ggttgttcctgcgaagtcaacatatcatacacacca 13937856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14373223 - 14373170
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgccca 54  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  14373223 gcaccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgatttacatcttcatcatgccca 14373170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 27766950 - 27767212
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||     || |||||||||||    
T  27766950 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacatatataatcccacgtt 27767049  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  27767050 ccaccaaatttgattttgtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 27767149  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  27767150 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 27767212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18359323 - 18359058
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||     || ||| | ||| |    
T  18359323 gcaccgaaaatcggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccagatcccgtgacacaaaaccgatcctccacatatataatgc-acgat 18359225  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  18359224 ctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaaggaacctgtttatgctagattaactccatatt 18359125  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctcta 262  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18359124 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatgtcatatacaccacgaacagtataacctcta 18359058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33385606 - 33385344
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||     || ||| ||||||     
T  33385606 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacagatataattccacgtg 33385507  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  33385506 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 33385407  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  33385406 ttgatgaatatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 33385344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 10776672 - 10776935
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||     || ||||||||||     
T  10776672 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacttgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacagatataatcccacgtg 10776771  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatat- 194  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||     
T  10776772 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatata 10776871  T
Q  195 tttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||    
T  10776872 tttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacggacagtataacc 10776935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8300414 - 8300152
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||     || |||||| |||     
T  8300414 gcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccggttttccacagctataatccctcgtg 8300315  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8300314 ccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 8300215  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8300214 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaggtcatatgcaccacgaacagtataacc 8300152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25857642 - 25857394
Alignment:
Q  15 acaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaatttgat 109  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||     || |||||| ||| |   |||||| |||    
T  25857642 acaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaatcggttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagat 25857543  T
Q  110 ttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgag 209  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25857542 ttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacaagag 25857443  T
Q  210 gttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  25857442 gttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcaccacgaacagtataacc 25857394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 27795403 - 27795611
Alignment:
Q  13 ggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaatttg 107  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | || ||| |||     || ||| ||||| | || |||||| |    
T  27795403 ggacaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacagcccgtgacacatagcctagcctccaacggtaaaatgccacgatttgccaaattgg 27795502  T
Q  108 atttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatg 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||| | ||| | |||||| || |||| |||||||||| || ||||||  ||    
T  27795503 ctttagtaggcaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctgtttgtgccagactaactccatacttggatgaatctg 27795602  T
Q  208 aggttgttc 216  Q
    |||||||||    
T  27795603 aggttgttc 27795611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19255355 - 19255154
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagc-ttcctag-----aatcccacgt 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||| ||     ||| ||||      
T  19255355 gcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtgacacacaaccgcgcgctccaagggaataatgccacaa 19255256  T
Q  95 tctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatat 194  Q
    | || ||||||   ||| ||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  19255255 tttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaaaccgccaagcaaggatagatactttgagagaaatctgtttatgccaaattaactccatat 19255156  T
Q  195 tt 196  Q
    ||    
T  19255155 tt 19255154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28535790 - 28535665
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||| |    
T  28535790 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccatgttttgatgtaactgaggct 28535691  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatag 238  Q
    | |||  |||||||| ||||||||||    
T  28535690 gctcctgtgatgtcagcatgtcatag 28535665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 246
Target Start/End: Original strand, 26072913 - 26073050
Alignment:
Q  109 tttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatga 208  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||||| |||||||  | |||||| || |||||||||| ||||||||| | |||     
T  26072913 tttagtaggtaatcgatccctcaacagtcgccaaacaaagatagggactttcaaaggaacatatttatgccaaattaactccaaattttgatgcaaatgg 26073012  T
Q  209 ggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    || ||||||   ||||||| || |||||| ||||||||    
T  26073013 ggctgttcctgcgatgtcagcaagtcatacacaccacg 26073050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 246
Target Start/End: Original strand, 42928165 - 42928289
Alignment:
Q  122 cgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatg 221  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||| |  || || ||||||   |    
T  42928165 cgatccctcagaagccgccaaacaaggatagagactttgagaggaacctgtttataccaaattaactccatatttggatgtaactggggctgttcctgcg 42928264  T
Q  222 atgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    |||||| |||||||||||| |||||    
T  42928265 atgtcagcatgtcatagactccacg 42928289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 8228051 - 8228133
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8228051 gtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaactccatatt 8228133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18089878 - 18089744
Alignment:
Q  111 tagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgagg 210  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || ||||||| |||||| ||||| || || | |||||| || || |||||||||| |||||| |||| | | ||    
T  18089878 tagtaggtaaacgatctctcaatagtcgtcaagcaaagatagagactttcaacggtacctgtttgtgccaaattaactccaaattttgttgaataagggg 18089779  T
Q  211 ttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccac 245  Q
    ||||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  18089778 ttgttcctacactgtcaacatgtcatacacaccac 18089744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 23238306 - 23238491
Alignment:
Q  15 acaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaatttgat 109  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| || |||     || ||| ||||| | || ||||||   |    
T  23238306 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaagctaaaatgccacggtttgccaaattactt 23238405  T
Q  110 ttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  23238406 ttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttgagaggaacctatttatgccaaattaactccatatt 23238491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 33169670 - 33169818
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||||  ||||||||| || || ||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||||||||    
T  33169670 caaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctgtttgtgccaaatcaactccatattttga 33169769  T
Q  200 tg-aacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    || |||||| |||| |||| | || |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  33169770 tgtaacatg-ggtttttcctacgaagtcagcatatcatacacaccacgaa 33169818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35983882 - 35983781
Alignment:
Q  137 cgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| || | || ||||||||||| |||||||| |  ||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  35983882 cgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtgtaagccaaattaactccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtcagcatgtcat 35983783  T
Q  237 ag 238  Q
    ||    
T  35983782 ag 35983781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27166032 - 27165932
Alignment:
Q  148 gatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacga 247  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||  || || ||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27166032 gatagagacttttagaggtacctgttggtgccaaattaattccatattttgatgtaaattgggttgttcctgtgatgccaacatgtcataaacaccacga 27165933  T
Q  248 a 248  Q
    |    
T  27165932 a 27165932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 237
Target Start/End: Original strand, 31641537 - 31641660
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||| |    
T  31641537 gtaggtaaccgatccctcagtagtctccatgcaaggatagaaacttt-agaggaacctgtgtatgccaaattaactccatgttttgatgtaagtgaggct 31641635  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcata 237  Q
    | |||  |||||||| |||||||||    
T  31641636 gctcctgtgatgtcagcatgtcata 31641660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 269
Target Start/End: Original strand, 24407995 - 24408109
Alignment:
Q  155 acttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatg-aacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagta 253  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||    
T  24407995 actttcaaaggtacctgtttatgccaaatcaactccatactttgatgtaacatg-ggttgttcctgcgatgtcaacatatcatacacaccacgaaccgta 24408093  T
Q  254 taacctctaatctgat 269  Q
    || || | ||||||||    
T  24408094 tacccaccaatctgat 24408109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27117252 - 27117194
Alignment:
Q  137 cgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27117252 cgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 27117194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 12697721 - 12697983
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||     || |||||||||||    
T  12697721 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgtt 12697820  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||    
T  12697821 ccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaatttcatatt 12697920  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  12697921 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 12697983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 20002626 - 20002906
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc------------tagaatc 88  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||            |  |||     
T  20002626 gcaccgaaaaatggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaaccgagcctccacagtccacagatgtaatg 20002725  T
Q  89 ccacgttctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaact 188  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||    
T  20002726 ccacggtctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacagccgccaagcaatgatagaaacttttaaaagaacctgtttatgccaaattaact 20002825  T
Q  189 ccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20002826 ccatattttgattaacatgaggttgttcgtgtgatgtcaacatgtcataaacaccacgaacagtatagcctctaatctgat 20002906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 8361008 - 8361270
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||      || ||| ||||||     
T  8361008 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttcaacagatataattccacgtg 8361107  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8361108 ccaccaaatttgatttactaggtaaacgattcctcagcagtcgccaaacaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 8361207  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||| |||||||||| | |||||||    
T  8361208 ttgatgaacatgaggttgttcctgtgatggcaacaaatcatatacaccacgaacaatataacc 8361270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45472824 - 45472679
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45472824 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgaacatgaggtg 45472725  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  45472724 gttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 45472679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 55725819 - 55725645
Alignment:
Q  95 tctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatat 194  Q
    |||| ||||||  |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||    
T  55725819 tctgccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacttgtttatgccaaattaactccatat 55725720  T
Q  195 tttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  55725719 tttgataaacatgaggttgttcctgtgatgtcaacatatcatacacaccatgaacagtatatcctccagtctgat 55725645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2822156 - 2822010
Alignment:
Q  109 tttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatga 208  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||| ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2822156 tttagtaggtaagcgatccctcaacaatcgccaagcatggactgaaacttttagaggtacctgtttgtgccagattaactccatattttgatgaatatga 2822057  T
Q  209 ggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtata 255  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||| ||||||    
T  2822056 ggttgttcctatgatgtcaacaagtcatataccccatgaacagtata 2822010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54483391 - 54483171
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||     || ||| || || |    
T  54483391 gcaccaaagaatggacaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcgataaaatgccgcgat 54483292  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
     || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||| || |||| |||||||||| |    
T  54483291 ttgtcaaattggttttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactccatact 54483192  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttc 216  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  54483191 ttgatgaatctgaggttgttc 54483171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4548451 - 4548377
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccga 75  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4548451 gcaccaaaaattgggcaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccga 4548377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 48312014 - 48312223
Alignment:
Q  12 tggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaattt 106  Q
    ||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||     || ||| |  || | || ||||||     
T  48312014 tggacaagataaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcggtaaaatgctgcgatttgtcaaattg 48312113  T
Q  107 gatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacat 206  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| | | | |||||| || |||| |||||||||| |||||||||  |    
T  48312114 gctttagtaggtaaatgatccctcaacaacccccaagcaaggactgtaacttttagatgtacctgtttgtgccagactaactccatactttgatgaatct 48312213  T
Q  207 gaggttgttc 216  Q
    ||||||||||    
T  48312214 gaggttgttc 48312223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 7403821 - 7404071
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| ||||| || |||     || ||| ||||| |    
T  7403821 gcactaaaagttggacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccagagacacacaaccgcgcctccaaacgtaaaatgccacggt 7403920  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
     || ||||||   ||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||| || ||||||| ||||||    
T  7403921 ttgccaaattcttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgaaatgaacttgtttatgccaaattaacttcatatt 7404020  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    |||||| |  || || || |||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  7404021 ttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 7404071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11587326 - 11587181
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||| |||||| || ||||||||||||  | ||    
T  11587326 caaattttctttcgtaggtaaacgattcctcagaagccgccaagcaagaatagatactttgataggtatctatttatgccaaattaactccatagatgga 11587227  T
Q  200 tgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccac 245  Q
    || |  ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  11587226 tgcaactgaggctgttcctgtgatgtcagcatgtcatacacaccac 11587181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 246
Target Start/End: Original strand, 15740272 - 15740379
Alignment:
Q  139 ccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| || || |  || || || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  15740272 ccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtcaacatatcatag 15740371  T
Q  239 acaccacg 246  Q
    || |||||    
T  15740372 actccacg 15740379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1828772 - 1828530
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||||| || |||     || ||| ||||| |    
T  1828772 gcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcaacatcttcaacattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggt 1828673  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
     || |||||| | ||| ||||| || | ||| | ||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1828672 ttgccaaattagtttttgtaggtaacctatctcgcaatagtctccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 1828573  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatag 238  Q
     ||||| |  || || || |||  |||||||||||| ||||||    
T  1828572 atgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcaacatatcatag 1828530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Original strand, 19755316 - 19755425
Alignment:
Q  137 cgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||  || || || ||   |||||||| ||||||||    
T  19755316 cgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtcagcatgtcat 19755415  T
Q  237 agacaccacg 246  Q
    |||| |||||    
T  19755416 agaccccacg 19755425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19784490 - 19784381
Alignment:
Q  137 cgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||  || || || ||   |||||||| ||||||||    
T  19784490 cgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtcagcatgtcat 19784391  T
Q  237 agacaccacg 246  Q
    |||| |||||    
T  19784390 agaccccacg 19784381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47686010 - 47685932
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactcca 191  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  47686010 gtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaagtcca 47685932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 46145687 - 46145835
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    |||||||  ||||||||| || || ||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||| ||||| | || ||| || || || |||||||||||||||    
T  46145687 caaattttgtttagtaggtaatcggtccctcagcaagcgccaagcaaaaatagacactttcaaaggcacctatttgtgccaaatcaactccatattttga 46145786  T
Q  200 tg-aacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    || |||||| |||||||||   || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  46145787 tgtaacatg-ggttgttcctgcgaagtcaacatatcatacacaccacgaa 46145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Original strand, 47418829 - 47418909
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccata 193  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  47418829 gtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccata 47418909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 43388275 - 43388537
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||     || |||||||||||    
T  43388275 gcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcctgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagctataatcccacgtt 43388374  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  43388375 ccaccaattttgatttagtaggtaaacgatccctcaacaatcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 43388474  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  43388475 ttgatgaacatgaagttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatacaccacgaacagtataacc 43388537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37191442 - 37191169
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||     |  ||| ||||| |    
T  37191442 gcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaatcgatcctccacagatgtaatgccacgat 37191343  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||| ||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  37191342 ctgccaagttggatttagtaggtaatcgatctctcaacagccgccaagcaaggatataaacttttaaatgaaccagtttatgccagattaactccatatt 37191243  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  37191242 ttgatgaacatgaggttgttcatgtgatgtcaacatgtcatatacaccacagacattataacctctaatctgat 37191169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16918041 - 16917779
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||     || |||||| |||     
T  16918041 gcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccattacacaaaaccggttttccgcagctataatccctcgtg 16917942  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  16917941 ccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 16917842  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  16917841 ttgatgaacaagaggttgttcctgtgatgtcaacaagtcatatgcaccacgaacagtataacc 16917779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51993949 - 51993757
Alignment:
Q  12 tggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaattt 106  Q
    |||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||     || ||| ||  | | || ||||||     
T  51993949 tggacaagacaaaatcaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctagcctccatcggtaaaatgccgtgatttgtcaaattg 51993850  T
Q  107 gatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttga 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||   | |||||||| ||| | |||||| || |||| |||||||||| |||||    
T  51993849 gctttagtaggtaaacgatcccttatcaaccgccaagcaagggctgtaacttttagaggtacctgtttgtgccagactaactccatactttga 51993757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 51052505 - 51052638
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||||| || || |  || || |    
T  51052505 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggct 51052604  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    | |||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  51052605 gctcctgtgatgtcagcatgtcatagactccacg 51052638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47623180 - 47623068
Alignment:
Q  125 tccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatg 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||||| || ||||| ||||||| |  ||| |  ||||||||||||  |||||    
T  47623180 tccctcaaaagccgccaagcaagaatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaattccatatatgaatgtaactgaggttgttcctgtgatg 47623081  T
Q  225 tcaacatgtcata 237  Q
    ||| |||||||||    
T  47623080 tcagcatgtcata 47623068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Original strand, 35541083 - 35541209
Alignment:
Q  122 cgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatg 221  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| || ||||| |||||||| || || |  || || || |||  ||    
T  35541083 cgatccctcagtagtcgccaagcaaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtg 35541182  T
Q  222 atgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  35541183 atgtcagcatgtcatagactccacgaa 35541209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 37254666 - 37254939
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||  |||     || ||| ||||  |    
T  37254666 gcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaaaatgtccacattccgtgacacaaaaccgagtctccacagatataatgccacaat 37254765  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37254766 ctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaagtaacctgtttatgccagattaactccatatt 37254865  T
Q  196 ttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  37254866 ttgatgaacatgaggttgttcccgtgatgtcaacatgtcgtatacaccacgaacaggatagcctctaatctgat 37254939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 258
Target Start/End: Original strand, 18532568 - 18532798
Alignment:
Q  33 attcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgttctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatcc 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18532568 attcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgattttccacagatagaattccacgttctaccaaaattgatttagtaggtaaacgatcc 18532667  T
Q  128 ctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtca 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  18532668 ctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgcgagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcatgtgatgtca 18532767  T
Q  228 acatgtcatagacaccacgaagagtataacc 258  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||||||    
T  18532768 acaagtcatatacaccacgaacaatataacc 18532798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 25619367 - 25619646
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgttacacaaaaccgagcttcc-----tagaatcccacgtt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||     |  ||| ||||| |    
T  25619367 gcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcctgtgacacaaaatcggtcctccacagatgcaatgccacgat 25619466  T
Q  96 ctgacaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||| ||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  25619467 ctgccaagttggatttagtaggtaatcgttccctcaacaaccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccatattaactccatatt 25619566  T
Q  196 ttgatga------acatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaagagtataacctctaatctgat 269  Q
    |||||||      |||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  25619567 ttgatgaacatgtacatgaggttgttcctgtgatataaacatgtcatatacaccacagacaatataacctctaatctgat 25619646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 235552 - 235419
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |  || || |    
T  235552 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagagactttgagatgaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgtaactggggct 235453  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  235452 gctcctgtgatgtcaacatgtcatagactccacg 235419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11277367 - 11277234
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| || || |  || ||||    
T  11277367 gtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggtt 11277268  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacg 246  Q
    | |||  |||||||| ||| |||||||| |||||    
T  11277267 gctcctgtgatgtcagcatatcatagactccacg 11277234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 17720660 - 17720795
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggtt 212  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| || ||||||||||  |||||||| |  ||||| |    
T  17720660 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccaagttttgatgtaagtgaggct 17720759  T
Q  213 gttcccatgatgtcaacatgtcatagacaccacgaa 248  Q
    | |||  |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17720760 gctcctgtgatgtcagcatgtcataggctccacgaa 17720795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Original strand, 47877032 - 47877141
Alignment:
Q  137 cgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatattttgatgaacatgaggttgttcccatgatgtcaacatgtcat 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  || || || |||  |||||||| ||||||||    
T  47877032 cgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccctattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtcagcatgtcat 47877131  T
Q  237 agacaccacg 246  Q
    | || |||||    
T  47877132 aaactccacg 47877141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 551681 - 551595
Alignment:
Q  100 caaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaa 186  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |  | ||||||||||||||  || || || |||||||||| ||||||||| || |||||    
T  551681 caaatttgatttggtaggcaagcgatcacggatcagccgccaagcaaaaattgacacctttaaaggaacctgtttatgccaaattaa 551595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Original strand, 29968027 - 29968080
Alignment:
Q  140 caagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccata 193  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  29968027 caagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccata 29968080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 18530418 - 18530454
Alignment:
Q  1 gcaccaaaaattggacaagacaagaacacatgattca 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18530418 gcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattca 18530454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 3277 - 3359
Alignment:
Q  113 gtaggcaaacgatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaatctgtttatgtcagattaactccatatt 195  Q
    ||||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  3277 gtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaactttaagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 3359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University