View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19275_low_7 (Length: 223)

Name: NF19275_low_7
Description: NF19275
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19275_low_7
NF19275_low_7
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (1-223)||(9224441-9224662)
chr4 (1-223)||(9229228-9229449)
chr4 (1-223)||(51520286-51520508)
chr4 (1-223)||(56146745-56146967)
chr4 (1-223)||(45347851-45348073)
chr4 (1-223)||(45357330-45357552)
chr4 (10-223)||(24741781-24741991)
chr4 (1-223)||(18855555-18855778)
chr4 (12-223)||(5732502-5732716)
chr4 (10-223)||(29760483-29760692)
chr4 (1-223)||(3813852-3814075)
chr4 (177-223)||(28468575-28468621)
chr4 (177-223)||(10047383-10047430)
chr4 (177-223)||(39245998-39246045)
chr4 (178-223)||(36315275-36315321)
chr4 (178-223)||(36329484-36329530)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (1-220)||(12396741-12396959)
chr7 (1-220)||(12406161-12406379)
chr7 (1-223)||(4866559-4866781)
chr7 (1-223)||(24024360-24024583)
chr7 (1-223)||(31109617-31109838)
chr7 (10-223)||(2057799-2058016)
chr7 (10-223)||(20357593-20357804)
chr7 (1-223)||(19992141-19992364)
chr7 (1-223)||(21812272-21812495)
chr7 (9-223)||(21639652-21639859)
chr7 (17-223)||(24266236-24266442)
chr7 (10-223)||(1533490-1533697)
chr7 (17-223)||(16879918-16880124)
chr7 (17-223)||(16884774-16884980)
chr7 (17-223)||(24261357-24261563)
chr7 (9-223)||(21645850-21646057)
chr7 (9-223)||(18408608-18408814)
chr7 (177-223)||(18413645-18413690)
chr7 (177-223)||(20284093-20284140)
chr7 (177-223)||(21983288-21983335)
chr7 (9-49)||(2580230-2580270)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-223)||(35096-35317)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (1-223)||(22173229-22173450)
chr3 (10-223)||(2671632-2671843)
chr3 (10-223)||(7167085-7167295)
chr3 (12-223)||(18656272-18656486)
chr3 (10-223)||(8739109-8739321)
chr3 (10-223)||(9091347-9091559)
chr3 (11-223)||(28503910-28504110)
chr3 (13-223)||(2677121-2677331)
chr3 (13-223)||(2672965-2673175)
chr3 (13-221)||(10207775-10207983)
chr3 (113-223)||(40372841-40372949)
chr3 (13-223)||(8512057-8512268)
chr3 (13-223)||(8516937-8517148)
chr3 (10-223)||(8477205-8477413)
chr3 (17-223)||(32475330-32475536)
chr3 (17-223)||(32480188-32480394)
chr3 (41-221)||(24967977-24968156)
chr3 (177-223)||(26928637-26928683)
chr3 (177-223)||(1305953-1305999)
chr3 (177-223)||(1417526-1417573)
chr3 (177-223)||(1736341-1736388)
chr3 (177-223)||(8370522-8370569)
chr3 (177-223)||(18552919-18552966)
chr3 (177-223)||(21711227-21711274)
chr3 (177-223)||(27974988-27975035)
chr3 (177-223)||(27986482-27986529)
chr3 (177-223)||(30709826-30709873)
chr3 (10-77)||(40372986-40373052)
chr3 (10-86)||(6794883-6794955)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-223)||(14737610-14737832)
chr6 (1-223)||(14742470-14742691)
chr6 (1-223)||(22010731-22010952)
chr6 (1-223)||(11856801-11857025)
chr6 (1-223)||(28184331-28184556)
chr6 (1-223)||(6438330-6438552)
chr6 (1-223)||(28155603-28155826)
chr6 (13-223)||(6005259-6005468)
chr6 (13-223)||(33330479-33330690)
chr6 (10-124)||(30125937-30126051)
chr6 (13-223)||(16838586-16838795)
chr6 (13-218)||(5343322-5343527)
chr6 (10-223)||(5674816-5675024)
chr6 (13-223)||(33335976-33336187)
chr6 (177-223)||(5757524-5757571)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (1-223)||(44312658-44312879)
chr2 (1-223)||(39812022-39812244)
chr2 (10-223)||(9296447-9296658)
chr2 (10-223)||(11098973-11099183)
chr2 (10-223)||(14291328-14291539)
chr2 (1-223)||(32246613-32246839)
chr2 (1-223)||(19344249-19344472)
chr2 (1-223)||(19349107-19349330)
chr2 (9-223)||(25398337-25398546)
chr2 (9-223)||(25403475-25403684)
chr2 (177-223)||(3491755-3491801)
chr2 (177-223)||(8040064-8040111)
chr2 (177-215)||(40738848-40738886)
chr2 (177-223)||(13569332-13569379)
chr2 (177-223)||(14699053-14699100)
chr2 (177-223)||(17865207-17865254)
chr2 (177-223)||(20522224-20522271)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (1-223)||(43592108-43592330)
chr5 (1-223)||(1457196-1457417)
chr5 (1-223)||(43598553-43598775)
chr5 (1-223)||(43604045-43604267)
chr5 (1-223)||(43609537-43609759)
chr5 (1-223)||(27444799-27445021)
chr5 (1-223)||(27449643-27449865)
chr5 (12-223)||(15044527-15044737)
chr5 (2-223)||(30631238-30631457)
chr5 (17-223)||(37556656-37556863)
chr5 (17-223)||(37561478-37561685)
chr5 (1-223)||(28807606-28807831)
chr5 (97-223)||(31180140-31180265)
chr5 (17-223)||(24135699-24135899)
chr5 (13-223)||(2785217-2785426)
chr5 (9-223)||(38192015-38192224)
chr5 (9-223)||(38219240-38219449)
chr5 (13-223)||(31401884-31402093)
chr5 (13-223)||(33791158-33791367)
chr5 (13-223)||(31397027-31397236)
chr5 (13-223)||(33768021-33768230)
chr5 (177-223)||(35387667-35387713)
chr5 (177-223)||(9353378-9353425)
chr5 (177-223)||(17004006-17004053)
chr5 (177-223)||(36932396-36932443)
chr5 (9-49)||(15464375-15464415)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-223)||(7289960-7290182)
chr8 (1-223)||(6311127-6311348)
chr8 (1-223)||(39784856-39785080)
chr8 (1-223)||(25328312-25328534)
chr8 (10-223)||(18853214-18853425)
chr8 (10-223)||(36979218-36979428)
chr8 (10-223)||(33037852-33038063)
chr8 (10-223)||(18870608-18870816)
chr8 (10-223)||(4760121-4760332)
chr8 (10-223)||(10689189-10689399)
chr8 (10-223)||(30655481-30655697)
chr8 (13-223)||(35745233-35745442)
chr8 (17-223)||(10684298-10684504)
chr8 (9-223)||(26287745-26287952)
chr8 (9-223)||(26312996-26313203)
chr8 (177-223)||(26301163-26301209)
chr8 (10-223)||(1262000-1262205)
chr8 (177-223)||(4696642-4696689)
chr8 (177-223)||(9765865-9765912)
chr8 (177-223)||(26403276-26403323)
chr8 (194-223)||(4456050-4456079)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (1-223)||(44023907-44024129)
chr1 (1-223)||(25445123-25445346)
chr1 (1-223)||(39445328-39445551)
chr1 (1-223)||(41398066-41398287)
chr1 (10-223)||(24787410-24787624)
chr1 (1-223)||(1055045-1055268)
chr1 (69-223)||(41390483-41390632)
chr1 (10-223)||(24202815-24203021)
chr1 (13-223)||(43988498-43988709)
chr1 (1-73)||(41386577-41386650)
chr1 (177-223)||(19358889-19358935)
chr1 (177-223)||(19361478-19361524)
chr1 (177-223)||(19380118-19380164)
chr1 (177-223)||(13598402-13598449)
chr1 (177-223)||(19072932-19072979)
chr1 (177-223)||(19120822-19120869)
chr1 (177-223)||(26644943-26644990)
chr1 (177-223)||(37069774-37069821)
chr1 (177-223)||(47703982-47704029)
chr1 (180-223)||(3281715-3281759)
chr1 (180-223)||(29651818-29651862)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (1-223)||(9676-9896)
scaffold0355 (1-115)||(28-137)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-223)||(191-414)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (10-205)||(300-494)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (13-221)||(148992-149199)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (13-221)||(2287-2494)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (13-223)||(19199-19408)
scaffold0197 (17-223)||(14343-14549)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (9-223)||(17998-18206)
scaffold0188 (9-223)||(24091-24299)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-223)||(181998-182204)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-73)||(34132-34205)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (177-222)||(85687-85733)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (177-223)||(8465-8512)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (177-223)||(5687-5734)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9224662 - 9224441
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9224662 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgt 9224563  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9224562 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatat 9224464  T
Q  201 ggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9224463 ggcctaatctgggggagagagca 9224441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9229449 - 9229228
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9229449 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgt 9229350  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9229349 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttaacccagttcagccaatat 9229251  T
Q  201 ggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9229250 ggcctaatctgggggagagagca 9229228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 51520286 - 51520508
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  51520286 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 51520385  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  51520386 atagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttctgccaata 51520484  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  51520485 tggcctaatctgggggagagagca 51520508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 56146967 - 56146745
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  56146967 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 56146868  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  56146867 atagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttggtccagttcagccaata 56146769  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  56146768 tggcctaatctgggggagagagca 56146745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45348073 - 45347851
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  45348073 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgt 45347974  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaat 198  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45347973 aaagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaat 45347876  T
Q  199 atggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  45347875 atggcttaatctgggggagagagca 45347851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45357552 - 45357330
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  45357552 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgt 45357453  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaat 198  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45357452 aaagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaat 45357355  T
Q  199 atggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  45357354 atggcataatctgggggagagagca 45357330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 24741781 - 24741991
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  24741781 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaa 24741878  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741879 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 24741976  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  24741977 ctgggggagagagca 24741991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18855555 - 18855778
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  18855555 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 18855653  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18855654 tatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagcca 18855751  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18855752 atatggcctaatctgggggagagagca 18855778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 5732502 - 5732716
Alignment:
Q  12 acaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacc 111  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||| ||||||    
T  5732502 acaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaacc 5732601  T
Q  112 acacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaac----aaaacaccg-agaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732602 acacaaagagctaacaaagc-aaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggccta 5732699  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  5732700 atctgggggagagagca 5732716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 29760483 - 29760692
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  29760483 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaa 29760580  T
Q  110 ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760581 ccacacaaagagagaacaaagcaaaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 29760678  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  29760679 tgggggagagagca 29760692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3813852 - 3814075
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  3813852 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtg 3813951  T
Q  100 tatagc-aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    ||| || |||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||    
T  3813952 tatcgcaaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccatgcaaga-ttgttgacccagttcagcca 3814048  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3814049 atatggcctaatctgggggagagagca 3814075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28468621 - 28468575
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28468621 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagca 28468575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047430
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 10047430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246045
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 39246045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315275
Alignment:
Q  178 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 36315275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329484
Alignment:
Q  178 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 36329484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12396741 - 12396959
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  12396741 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 12396840  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12396841 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatat 12396939  T
Q  201 ggcctaatctgggggagaga 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12396940 ggcctaatctgggggagaga 12396959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12406161 - 12406379
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  12406161 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 12406260  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12406261 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatat 12406359  T
Q  201 ggcctaatctgggggagaga 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12406360 ggcctaatctgggggagaga 12406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4866559 - 4866781
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4866559 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgt 4866658  T
Q  101 atagc-aaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4866659 atagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaata 4866757  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4866758 tggcctaatctgggggagagagca 4866781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24024583 - 24024360
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |    
T  24024583 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcctatgactagtat 24024484  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaac-aaaacaccg-agaagatttgttgacccagttcagccaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||   ||| | |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  24024483 atagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaaga-ttgttgacccagttcagccaa 24024386  T
Q  198 tatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24024385 tatggcctaatctgggggagagagca 24024360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31109838 - 31109617
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  31109838 caatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgt 31109740  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccg-agaagatttgttgacccagttcagccaat 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |   ||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31109739 atagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaaga-ttgttgacccagttcagccaat 31109642  T
Q  199 atggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  31109641 atggcctaatctaggggagagagca 31109617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 2057799 - 2058016
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||    
T  2057799 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaa 2057897  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaa-----caagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2057898 accacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggc 2057996  T
Q  204 ctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2057997 ctaatctgggggagagagca 2058016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20357804 - 20357593
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  20357804 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaa 20357706  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357705 accacacaaagagataacaaagcaaa-caagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaat 20357608  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
     ||||||||||||||    
T  20357607 ttgggggagagagca 20357593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19992141 - 19992364
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  19992141 caatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 19992239  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19992240 tatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagcca 19992337  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19992338 atatggcctaatctgggggagagagca 19992364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21812495 - 21812272
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  21812495 caatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 21812397  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaa-gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21812396 tatagcaaaaccacacaaagagttaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagatt-gttgacccagttcagcca 21812299  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  21812298 atgtggcctaatctgggggagagagca 21812272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 21639652 - 21639859
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||    
T  21639652 taaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaa 21639748  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||   |||||   ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639749 caccaca---agagaatacaaagcaaa-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggccta 21639842  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  21639843 atctgggggagagagca 21639859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24266442 - 24266236
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  24266442 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 24266344  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24266343 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 24266247  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  24266246 gggagagagca 24266236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1533697 - 1533490
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaac-agccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||| |||||||||||| ||||  || || ||||| |||||     
T  1533697 aaacaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagcaa-caacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaac 1533601  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 207  Q
    ||||||  ||||||   ||||||||| ||| ||||||   |||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533600 accaca--aagagaatacaaagcaaa-caatataagcaagaaag-aaagaacaaacacaccaataagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaa 1533506  T
Q  208 tctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  1533505 tctgggggagagagca 1533490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 16879918 - 16880124
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  16879918 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 16880016  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16880017 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 16880113  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  16880114 gggagagagca 16880124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 16884774 - 16884980
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  16884774 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 16884872  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16884873 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 16884969  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  16884970 gggagagagca 16884980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24261563 - 24261357
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  24261563 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 24261465  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24261464 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 24261368  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  24261367 gggagagagca 24261357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 21645850 - 21646057
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||    
T  21645850 taaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaa 21645946  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||   |||||   |||| |||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645947 caccaca---agagaatacaaaacaaa-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggccta 21646040  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  21646041 atctagggaagagagca 21646057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 18408608 - 18408814
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||    
T  18408608 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccacgcaa-caacaacaaaaacagccgtagtctagtgtagagcaa 18408704  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||  || | |||| |||||||| ||||||||||   |||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408705 caccaca--aacaaatac-aaagcaaa-caagataagcaagaaag-aaagaacaaacacaccaa-aagatt-gttgacccagttcagccaatatggccta 18408797  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  18408798 atctgggggagagagca 18408814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 18413645 - 18413690
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18413645 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagca 18413690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284140
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 20284140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983335
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 21983335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 2580230 - 2580270
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatg 49  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2580230 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatg 2580270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35317 - 35096
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35317 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgt 35218  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35217 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttaacccagttcagccaatat 35119  T
Q  201 ggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35118 ggcctaatctgggggagagagca 35096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22173450 - 22173229
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22173450 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgt 22173351  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22173350 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatat 22173252  T
Q  201 ggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22173251 ggcctaatctgggggagagagca 22173229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2671843 - 2671632
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||    
T  2671843 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaa 2671745  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671744 accacacaaagagataacaaagcaaaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaat 2671647  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  2671646 ctgggggagagagca 2671632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 7167085 - 7167295
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  7167085 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaa 7167182  T
Q  110 ccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167183 ccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaat 7167280  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  7167281 ctgggggagagagca 7167295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 18656272 - 18656486
Alignment:
Q  12 acaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacc 111  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||| ||||||    
T  18656272 acaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaacc 18656371  T
Q  112 acacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaac----aaaacaccg-agaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656372 acacaaagagctaacaaagc-aaacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggccta 18656469  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  18656470 atctgggggagagagca 18656486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8739321 - 8739109
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| || | ||||    
T  8739321 aaacaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaa 8739223  T
Q  109 a-ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739222 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaa 8739125  T
Q  208 tctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  8739124 tctgggggagagagca 8739109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9091559 - 9091347
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| || | ||||    
T  9091559 aaacaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaa 9091461  T
Q  109 a-ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091460 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaa 9091363  T
Q  208 tctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  9091362 tctgggggagagagca 9091347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28504110 - 28503910
Alignment:
Q  11 aacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaac 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28504110 aacaatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaac 28504013  T
Q  111 cacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||         ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28504012 cacacaaagagataacaaagcataaacaag---------aaagg-aagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 28503924  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||| ||||||||    
T  28503923 tggggaagagagca 28503910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2677331 - 2677121
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  2677331 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 2677232  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagc--ggtaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | ||||| |||||||||| |   | |||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2677231 cactaagagctaac-aagcataacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 2677135  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  2677134 tgggggagagagca 2677121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2673175 - 2672965
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  2673175 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 2673076  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagc--ggtaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | ||||| |||||||||| |   | |||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2673075 cactaagagctaac-aagcataacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 2672979  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  2672978 tgggggagagagca 2672965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 10207775 - 10207983
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  10207775 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 10207874  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagc--ggtaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | ||||| |||||||||| |   | |||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10207875 cactaagagctaac-aagcataacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 10207971  T
Q  210 tgggggagagag 221  Q
    ||||||||||||    
T  10207972 tgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40372949 - 40372841
Alignment:
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372949 cacatagagataacaaagcaaaacaagataagcaagataggaa-gaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 40372852  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  40372851 gggagagagca 40372841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 8512057 - 8512268
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||| ||||| |||||    
T  8512057 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaacca 8512156  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataag-cggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    ||| ||||| || ||| ||| | ||||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8512157 cactaagagttaacaa-gcata-caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 8512253  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  8512254 ctgggggagagagca 8512268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 8516937 - 8517148
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||| ||||| |||||    
T  8516937 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaacca 8517036  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataag-cggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    ||| ||||| || ||| ||| | ||||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8517037 cactaagagttaacaa-gcata-caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 8517133  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  8517134 ctgggggagagagca 8517148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 8477205 - 8477413
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaac-agccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||   || |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||     
T  8477205 aaacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaagtttc-ccaagcaa-caacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaac 8477302  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 207  Q
    ||||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477303 accaca--aagataatacaaagcaaa-caagataagcaagaaag-aaagaacaaacacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaa 8477397  T
Q  208 tctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  8477398 tctgggggagagagca 8477413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 32475330 - 32475536
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  32475330 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 32475428  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32475429 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 32475525  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  32475526 gggagagagca 32475536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 32480188 - 32480394
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  32480188 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 32480286  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32480287 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 32480383  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  32480384 gggagagagca 32480394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 24967977 - 24968156
Alignment:
Q  41 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaaga 140  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||    
T  24967977 taatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagc-atacaaga 24968074  T
Q  141 taagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 221  Q
    ||| || |||| ||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  24968075 taaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagag 24968156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26928683 - 26928637
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26928683 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagca 26928637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 1305953 - 1305999
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1305953 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagca 1305999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1417573 - 1417526
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1417573 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 1417526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736341
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 1736341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370522
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 8370522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552919
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 18552919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711274
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 21711274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974988
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 27974988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986482
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 27986482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709826
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 30709826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 40373052 - 40372986
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaaca 77  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  40373052 aaacaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaaca 40372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6794955 - 6794883
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacag 86  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6794955 aaacaacgatgtgtggagcaa-aggaagtggtaatcaat-agaa-aaagtgtctccaagc-aacaacaacaaaacag 6794883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14737832 - 14737610
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14737832 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgt 14737733  T
Q  101 atagcaaaaccacac-aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14737732 atagcaaaaccacacaaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgatccagttcagccaata 14737634  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14737633 tggcctaatctgggggagagagca 14737610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14742691 - 14742470
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14742691 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagactagtgt 14742592  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14742591 atagcaaaaccacacaaagagatatcaaagcaaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatat 14742493  T
Q  201 ggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  14742492 gacctaatttgggggagagagca 14742470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22010952 - 22010731
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||    
T  22010952 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgt 22010853  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22010852 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatat 22010754  T
Q  201 ggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22010753 ggcctaatctgggggagagagca 22010731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11856801 - 11857025
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11856801 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgt 11856900  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaac---aaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11856901 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaa 11856999  T
Q  198 tatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11857000 tatggcctaatatgggggagagagca 11857025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28184331 - 28184556
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaa--tggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttg 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  28184331 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactag 28184430  T
Q  98 tgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagcc 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28184431 tgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagcc 28184528  T
Q  196 aatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184529 aatatggcctaatctgggggagagagca 28184556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6438330 - 6438552
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||    
T  6438330 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagctagtgt 6438428  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  6438429 atagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgtcccagttcagccaa 6438526  T
Q  198 tatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6438527 tatggcctaatctgggggagagagca 6438552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28155826 - 28155603
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||    
T  28155826 caatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgt 28155727  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccg-agaagatttgttgacccagttcagccaa 197  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  28155726 atagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaaga-ttgttgacccagttcagccaa 28155629  T
Q  198 tatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28155628 tgtggcctaatctgggggagagagca 28155603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 6005259 - 6005468
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  6005259 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 6005358  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | |||| | ||||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6005359 cactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 6005454  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  6005455 tgggggagagagca 6005468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33330690 - 33330479
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaa-cc 111  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||| ||    
T  33330690 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaacc 33330591  T
Q  112 acacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||| ||||| || ||| ||| |||||||||| |  |  |||| |||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33330590 acactaagagctaacaa-gcataacaagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaat 33330494  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  33330493 ctgggggagagagca 33330479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30126051 - 30125937
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  30126051 aaacaaagatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaa 30125953  T
Q  109 accacacaaagagata 124  Q
    ||||||||||||||||    
T  30125952 accacacaaagagata 30125937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 16838586 - 16838795
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||| ||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  16838586 caatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 16838685  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | |||| | ||||||||| || |||| ||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16838686 cactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcttaatc 16838781  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  16838782 tgggggagagagca 16838795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 5343322 - 5343527
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagc-aaaacc 111  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||   ||||||| ||||||    
T  5343322 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaacc 5343421  T
Q  112 acacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||| ||||| || | |||| | ||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5343422 acactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 5343517  T
Q  209 ctgggggaga 218  Q
    || |||||||    
T  5343518 ctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5675024 - 5674816
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaac-agccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||   || |||||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||     
T  5675024 aaacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagtaaaaagtttc-ccaagcaa-caacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaac 5674927  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 207  Q
    ||||||  ||||||   ||||||||| ||| ||||||   |||| |||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674926 accaca--aagagaatacaaagcaaa-caatataagcaagaaag-aaagaacaaacacaccaaagagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaa 5674832  T
Q  208 tctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  5674831 tctgggggagagagca 5674816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33336187 - 33335976
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaa-cc 111  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  || ||  ||||||| |||| ||    
T  33336187 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagtaaaaacc 33336088  T
Q  112 acacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||| ||||| || ||| ||| |||||||||| |  |  |||| |||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33336087 acactaagagctaacaa-gcataacaagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtgacctaat 33335991  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  33335990 ctgggggagagagca 33335976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757524
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 5757524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44312879 - 44312658
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||    
T  44312879 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgt 44312780  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44312779 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatat 44312681  T
Q  201 ggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44312680 ggcctaatctgggggagagagca 44312658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39812244 - 39812022
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||    
T  39812244 caatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtg 39812145  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaat 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39812144 tatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgaaccagttcagccaat 39812047  T
Q  199 atggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39812046 atggcctaatctgggggagagagca 39812022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9296658 - 9296447
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||    
T  9296658 aaacaaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaa 9296560  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296559 accacacaaagagataacaaagcaaaacaagaaaagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaat 9296462  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
     ||||||||||||||    
T  9296461 ttgggggagagagca 9296447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11099183 - 11098973
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  11099183 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaa 11099086  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11099085 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataaggaagaaagg-aagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 11098988  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  11098987 ctgggggagagagca 11098973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 14291328 - 14291539
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||    
T  14291328 aaacaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaa 14291426  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291427 accacacaaagagataacaaagcaaaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaat 14291524  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  14291525 ctgggggagagagca 14291539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 32246613 - 32246839
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||    
T  32246613 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtg 32246712  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc---ggtaaaggaaagaacaaaacaccg-agaagatttgttgacccagttcagc 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||      ||| | ||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||    
T  32246713 tatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaaga-ttgttgaccttgttcagc 32246810  T
Q  195 caatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246811 caatatggcctaatctgggggagagagca 32246839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19344249 - 19344472
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||    
T  19344249 caatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatg 19344348  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19344349 tatagcaaaaccacactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagcca 19344445  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||    
T  19344446 atgtggcctaatctaggggagagagca 19344472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19349107 - 19349330
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||    
T  19349107 caatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatg 19349206  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19349207 tatagcaaaaccacactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagcca 19349303  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||    
T  19349304 atgtggcctaatctaggggagagagca 19349330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 25398337 - 25398546
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  25398337 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaa 25398433  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25398434 caccacacaa-gagaatacaaagcaaa-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatgaccta 25398529  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  25398530 atctgggggagagagca 25398546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 25403475 - 25403684
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  25403475 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaa 25403571  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25403572 caccacacaa-gagaatacaaagcaaa-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgactcagttcagccaatatgaccta 25403667  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  25403668 atctgggggagagagca 25403684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 3491755 - 3491801
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491755 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 3491801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 8040064 - 8040111
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8040064 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagca 8040111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 215
Target Start/End: Original strand, 40738848 - 40738886
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40738848 ttgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg 40738886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569379
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 13569379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699053
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 14699053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 17865207 - 17865254
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17865207 ttgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagca 17865254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 20522224 - 20522271
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20522224 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 20522271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43592108 - 43592330
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43592108 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 43592207  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43592208 atagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaata 43592306  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43592307 tggcctaatctgggggagagagca 43592330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1457417 - 1457196
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  1457417 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 1457318  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  1457317 atagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagg-aagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaatg 1457220  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1457219 tggcctaatctgggggagagagca 1457196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43598553 - 43598775
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43598553 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 43598652  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  43598653 atagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttggtccagttcagccaata 43598751  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43598752 tggcctaatctgggggagagagca 43598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43604045 - 43604267
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43604045 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 43604144  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  43604145 atagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttggtccagttcagccaata 43604243  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43604244 tggcctaatctgggggagagagca 43604267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 43609537 - 43609759
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43609537 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 43609636  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  43609637 atagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttggtccagttcagccaata 43609735  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43609736 tggcctaatctgggggagagagca 43609759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27444799 - 27445021
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  27444799 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgt 27444898  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27444899 atagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcaggcaata 27444997  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  27444998 tagcctaatctgggggagagagca 27445021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27449643 - 27449865
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  27449643 caatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgt 27449742  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27449743 atagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaata 27449841  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  27449842 tagcctaatctgggggagagagca 27449865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 15044527 - 15044737
Alignment:
Q  12 acaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacc 111  Q
    ||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15044527 acaatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaacc 15044626  T
Q  112 acacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 210  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15044627 acac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatat 15044724  T
Q  211 gggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||    
T  15044725 gggggagagagca 15044737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 30631238 - 30631457
Alignment:
Q  2 aatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30631238 aatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgta 30631336  T
Q  102 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatat 200  Q
    |||||||| |||| | | ||||| ||||||| ||||||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  30631337 tagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaagg-aagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgactcagttcagccaatgt 30631434  T
Q  201 ggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30631435 ggcctaatctgggggagagagca 30631457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37556863 - 37556656
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacaca 116  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     
T  37556863 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacact 37556764  T
Q  117 aagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 213  Q
    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37556763 aagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctggg 37556666  T
Q  214 ggagagagca 223  Q
    ||||||||||    
T  37556665 ggagagagca 37556656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37561685 - 37561478
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacaca 116  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     
T  37561685 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacact 37561586  T
Q  117 aagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 213  Q
    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37561585 aagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctggg 37561488  T
Q  214 ggagagagca 223  Q
    ||||||||||    
T  37561487 ggagagagca 37561478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28807831 - 28807606
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  28807831 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 28807733  T
Q  100 tatagcaaaa--ccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagc 194  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28807732 tatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagatt-gttgacccagttcagc 28807635  T
Q  195 caatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28807634 caatgtggcctaatctgggggagagagca 28807606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 223
Target Start/End: Original strand, 31180140 - 31180265
Alignment:
Q  97 gtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagcc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31180140 gtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagcc 31180237  T
Q  196 aatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180238 aatatggcctaatctgggggagagagca 31180265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 24135699 - 24135899
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacaca 116  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||      
T  24135699 gatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagtaaaga--gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccaca-- 24135794  T
Q  117 aagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 215  Q
     ||| |   ||||||||| ||||||||||   ||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135795 -agataatacaaagcaaa-caagataagctagaaaaggaagaacaaacacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 24135891  T
Q  216 agagagca 223  Q
    ||||||||    
T  24135892 agagagca 24135899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 2785217 - 2785426
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  2785217 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 2785316  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | |||| | ||||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2785317 cactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 2785412  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  2785413 tgggggagagagca 2785426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 38192015 - 38192224
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  38192015 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaa 38192111  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192112 caccacacaa-gagaatacaaagcaaa-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggccta 38192207  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  38192208 atctgggggagagagca 38192224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 38219240 - 38219449
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  38219240 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaa 38219336  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219337 caccacacaa-gagaatacaaagcaaa-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggccta 38219432  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  38219433 atctgggggagagagca 38219449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31402093 - 31401884
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||| ||||||||||    
T  31402093 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtaaagcaaaacca 31401994  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | |||| | ||||||||| || |||| ||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  31401993 cactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaata 31401898  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  31401897 tgggggagagagca 31401884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 33791158 - 33791367
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  33791158 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 33791257  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    || | |||| || | |||| | ||||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33791258 catatagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 33791353  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||| ||||||    
T  33791354 tgggggaaagagca 33791367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31397236 - 31397027
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  || ||  |||| ||||||||||    
T  31397236 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagcaaaacca 31397137  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaaca-aaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 210  Q
    ||| ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31397136 cactaagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 31397040  T
Q  211 gggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||    
T  31397039 gggggagagagca 31397027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 33768021 - 33768230
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  33768021 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 33768120  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    || | |||| || ||| ||| | || ||||| || |||| |  |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33768121 catatagagctaacaa-gcata-caggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 33768216  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    |||||| |||||||    
T  33768217 tgggggggagagca 33768230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 35387667 - 35387713
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387667 ttgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 35387713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353378
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 9353378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17004006
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 17004006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932396
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 36932396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 15464375 - 15464415
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatg 49  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15464375 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatcaatg 15464415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7290182 - 7289960
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  7290182 caatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 7290083  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7290082 atagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaata 7289984  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7289983 tggcctaatctgggggagagagca 7289960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6311127 - 6311348
Alignment:
Q  1 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  6311127 caatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgt 6311226  T
Q  101 atagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaata 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6311227 atagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaata 6311324  T
Q  200 tggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6311325 tggcctaatctgggggagagagca 6311348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39785080 - 39784856
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || |||    
T  39785080 caatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtg 39784981  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39784980 tatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagcca 39784883  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  39784882 atatggcctaatctgggggagagagca 39784856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25328534 - 25328312
Alignment:
Q  1 caatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||    
T  25328534 caatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacccta-actagtg 25328436  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagg-aaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaa 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25328435 tatagcaaaaccacac-aagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccagttcagccaa 25328338  T
Q  198 tatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25328337 tatggcctaatctgggggagagagca 25328312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18853425 - 18853214
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca-gccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| || ||||||    
T  18853425 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaa 18853327  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853326 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 18853229  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  18853228 ctgggggagagagca 18853214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 36979218 - 36979428
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  36979218 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaa 36979315  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979316 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 36979413  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  36979414 ctgggggagagagca 36979428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33038063 - 33037852
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaa--aacagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  33038063 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaa 33037966  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037965 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaaag-aagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 33037868  T
Q  208 tctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  33037867 tctgggggagagagca 33037852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18870816 - 18870608
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||    
T  18870816 aaacaaagatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaa 18870720  T
Q  110 ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18870719 ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcatccaatatggcctaatc 18870622  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  18870621 tgggggagagagca 18870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4760332 - 4760121
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  4760332 aaacaaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaa 4760235  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760234 accacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacatcaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaa 4760137  T
Q  208 tctgggggagagagca 223  Q
    | ||||||||||||||    
T  4760136 tatgggggagagagca 4760121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10689399 - 10689189
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||  | ||||| ||||||    
T  10689399 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaa 10689302  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689301 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagtaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaat 10689204  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  10689203 ctgggggagagagca 10689189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 30655481 - 30655697
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa--cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  30655481 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaa 30655578  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaac----aaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatgg 202  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30655579 aaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaaaaaacaccaagaaga-ttgttgacccagttcagccaatatgg 30655676  T
Q  203 cctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30655677 cctaatctgggggagagagca 30655697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 35745233 - 35745442
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  35745233 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 35745332  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | |||| | ||||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35745333 cactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 35745428  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  35745429 tgggggagagagca 35745442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10684504 - 10684298
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  10684504 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 10684406  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10684405 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 10684309  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  10684308 gggagagagca 10684298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 26287745 - 26287952
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||    
T  26287745 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaa 26287841  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||  |  | |||| |||||||  ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287842 caccaca--agcaaatac-aaagcaac-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggccta 26287935  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  26287936 atctgggggagagagca 26287952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 26312996 - 26313203
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||    
T  26312996 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaa 26313092  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggccta 206  Q
     ||||||  |  | |||| |||||||  ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313093 caccaca--agcaaatac-aaagcaac-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggccta 26313186  T
Q  207 atctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  26313187 atctgggggagagagca 26313203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 26301163 - 26301209
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301163 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 26301209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1262205 - 1262000
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccatagacttgtgtatagcaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||     
T  1262205 aaacaaagatgtgtggagtaaaagggagtggtaatctatgagta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaac 1262109  T
Q  109 accacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaa 207  Q
    |||||| | ||| ||||  ||||||| |||||||||    ||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1262108 accaca-agaga-atac--aagcaaa-caagataagatagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcaaccaatatgacctaa 1262016  T
Q  208 tctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  1262015 tctgggggagagagca 1262000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696642
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagca 4696642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765865
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 9765865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403276
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 26403276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 223
Target Start/End: Original strand, 4456050 - 4456079
Alignment:
Q  194 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456050 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 4456079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44024129 - 44023907
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  44024129 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 44024031  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44024030 tatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagatt-gttgacccagttcagccaa 44023933  T
Q  198 tatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44023932 tatggcctaatctgggggagagagca 44023907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25445346 - 25445123
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  25445346 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 25445248  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25445247 tatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagatt-gttgacccagttcagccaa 25445149  T
Q  198 tatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25445148 tatggcctaatctgggggagagagca 25445123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 39445328 - 39445551
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  39445328 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 39445426  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39445427 tatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagcca 39445524  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  39445525 atatggcctaatctgggggagagagca 39445551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 41398066 - 41398287
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagca---aacaacaacaaaacagccatagactt 96  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||     
T  41398066 caatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagcccta-acta 41398164  T
Q  97 gtgtatagc--aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcag 193  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41398165 gtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aagg-aagaacaaaacaccgagaaga-ttgttgacccaggtcag 41398257  T
Q  194 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398258 ccaatatggcctaatctgggggagagagca 41398287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24787624 - 24787410
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa--acaacaacaaaa--cagccatagacttgtgtatagc 105  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||    
T  24787624 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagc 24787526  T
Q  106 aaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcct 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24787525 aaaaccacacaaagagataacaaagcaaa-caagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcct 24787428  T
Q  206 aatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24787427 aatctgggggggagagca 24787410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1055268 - 1055045
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  1055268 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 1055170  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1055169 tatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagatt-gttgacccagttcagcca 1055072  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1055071 atatggcctaatctgggggagagagca 1055045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Original strand, 41390483 - 41390632
Alignment:
Q  69 caaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaa--ccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaac 165  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     |||||| |||||||||    
T  41390483 caaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaa-gaacaaaac 41390575  T
Q  166 accgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390576 atcgagaagatt-gttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 41390632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24203021 - 24202815
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |    
T  24203021 aaacaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaaca 24202924  T
Q  110 ccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    |||||   |||||   ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202923 ccaca---agagaatacaaagcaaa-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcctaat 24202830  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  24202829 ctgggggagagagca 24202815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43988709 - 43988498
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||||||||| |||||    
T  43988709 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 43988610  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcg---gtaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaat 208  Q
    ||| ||||| || ||| ||| | ||||||||      | |||| ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43988609 cactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagatt-gtttacccagttcagccaatgtggcctaat 43988513  T
Q  209 ctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  43988512 ctgggggagagagca 43988498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 41386577 - 41386650
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 73  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386577 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19358935 - 19358889
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19358935 ttgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagca 19358889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19361524 - 19361478
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19361524 ttgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagca 19361478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19380164 - 19380118
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19380164 ttgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagca 19380118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598449
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 13598449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19072979
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 19072979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120869
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 19120869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644943
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 26644943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 37069774 - 37069821
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37069774 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 37069821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703982
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 47703982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Original strand, 3281715 - 3281759
Alignment:
Q  180 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3281715 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 3281759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Original strand, 29651818 - 29651862
Alignment:
Q  180 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29651818 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 29651862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9896 - 9676
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||     
T  9896 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagta 9797  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaat 198  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9796 tatagcaaaaccacacaa-gagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagatt-gttgacccagttcagccaat 9701  T
Q  199 atggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9700 atggcctaatctgggggagagagca 9676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 137 - 28
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||      ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || |||    
T  137 caattaaataaaccaatgatgtgtggagcaa------gtgataatcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtg 44  T
Q  100 tatagcaaaaccacac 115  Q
    ||||||||||||||||    
T  43 tatagcaaaaccacac 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 191 - 414
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtg 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  191 caatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtg 289  T
Q  100 tatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagcca 196  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  290 tatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagcca 387  T
Q  197 atatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  388 atatggcctaatctgggggagagagca 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 494 - 300
Alignment:
Q  10 aaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa--cagccatagacttgtgtatagcaa 107  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| || ||| |||   |||||    
T  494 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaa 396  T
Q  108 aaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcct 205  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  395 aaccacacaaagagataataaagcaaaacaagataagctagaaa-gaaagaacaaaacaccaagaaga-ttgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 149199 - 148992
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  149199 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 149100  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | |||| | ||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  149099 cactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 149004  T
Q  210 tgggggagagag 221  Q
    ||||||||||||    
T  149003 tgggggagagag 148992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2494 - 2287
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||  | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  2494 caatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 2395  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2394 cactaagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 2299  T
Q  210 tgggggagagag 221  Q
    ||||||||||||    
T  2298 tgggggagagag 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19408 - 19199
Alignment:
Q  13 caatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaacca 112  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||    
T  19408 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaacca 19309  T
Q  113 cacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 209  Q
    ||| ||||| || | |||| | ||||||||| || |||| ||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19308 cactaagagctaac-aagc-atacaagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaaga-ttgttgacccagttcagccattgtggcctaatc 19213  T
Q  210 tgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  19212 tgggggagagagca 19199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14549 - 14343
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  14549 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 14451  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14450 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 14354  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  14353 gggagagagca 14343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18206 - 17998
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa--cagccatagacttgtgtatagca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||    
T  18206 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagca 18110  T
Q  107 aaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcct 205  Q
    | ||||||   |||||   ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18109 acaccaca---agagaatacaaagcaaa-caagataagcaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcct 18016  T
Q  206 aatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18015 aatctgggggagagagca 17998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24299 - 24091
Alignment:
Q  9 taaacaatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa--cagccatagacttgtgtatagca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | |  ||  |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||    
T  24299 taaacaaagatgtgtggagcaaaaggaagtggtaatctatgtgta--aagtgtctccaagcaa-caacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagca 24203  T
Q  107 aaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaagaacaaa-acaccgagaagatttgttgacccagttcagccaatatggcct 205  Q
    | ||||||   |||||   ||||| |||||||||||||    ||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24202 acaccaca---agagaatacaaag-aaaacaagataagaaagaaaggaa-gaacaaacacaccaaaaagatt-gttgacccagttcagccaatatggcct 24109  T
Q  206 aatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24108 aatctgggggagagagca 24091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 182204 - 181998
Alignment:
Q  17 gatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacagccatagacttgtgtatagcaaaaccacac 115  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||    
T  182204 gatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacac 182106  T
Q  116 aaagagataccaaagcaaaacaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgag-aagatttgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 212  Q
     ||||| || ||| ||| | |||||||| || |||| ||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  182105 taagagctaacaa-gcata-caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagatt-gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 182009  T
Q  213 gggagagagca 223  Q
    |||||||||||    
T  182008 gggagagagca 181998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 34205 - 34132
Alignment:
Q  1 caatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaataggtagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 73  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34205 caatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 85687 - 85733
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagc 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85687 ttgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagc 85733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8465
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 8465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5734
Alignment:
Q  177 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 5734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University