View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19291_high_18 (Length: 275)

Name: NF19291_high_18
Description: NF19291
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19291_high_18
NF19291_high_18
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-265)||(13792-14056)
scaffold0277 (1-265)||(4831-5100)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (1-265)||(28780902-28781166)
chr6 (1-264)||(27725005-27725267)
chr6 (1-265)||(27718539-27718803)
chr6 (1-265)||(28786041-28786305)
chr6 (1-265)||(27228997-27229259)
chr6 (1-265)||(26655752-26656016)
chr6 (1-265)||(26761723-26761987)
chr6 (1-245)||(27611162-27611406)
chr6 (1-265)||(26802201-26802469)
chr6 (2-265)||(27604866-27605135)
chr6 (1-254)||(27698654-27698906)
chr6 (1-243)||(28792184-28792426)
chr6 (1-265)||(27338225-27338482)
chr6 (1-265)||(27398965-27399222)
chr6 (1-238)||(31284078-31284315)
chr6 (1-147)||(27531357-27531503)
chr6 (1-265)||(27678717-27678973)
chr6 (1-196)||(27593180-27593375)
chr6 (1-199)||(26622805-26623003)
chr6 (1-199)||(26728783-26728981)
chr6 (1-168)||(26884023-26884190)
chr6 (1-196)||(27677774-27677969)
chr6 (1-265)||(27706562-27706818)
chr6 (1-202)||(26646299-26646506)
chr6 (1-202)||(26752267-26752474)
chr6 (7-198)||(26861446-26861637)
chr6 (30-260)||(27427792-27428020)
chr6 (8-245)||(26823629-26823860)
chr6 (1-134)||(25481636-25481769)
chr6 (1-134)||(25579613-25579746)
chr6 (5-134)||(26055820-26055949)
chr6 (5-134)||(26075790-26075919)
chr6 (1-134)||(26142759-26142892)
chr6 (3-134)||(26048739-26048870)
chr6 (3-134)||(26069908-26070039)
chr6 (1-134)||(25538434-25538567)
chr6 (170-264)||(25538338-25538431)
chr6 (169-264)||(26055724-26055818)
chr6 (170-264)||(25481540-25481633)
chr6 (170-264)||(26048643-26048736)
chr6 (170-264)||(26069812-26069905)
chr6 (170-264)||(26075694-26075787)
chr6 (170-264)||(26142663-26142756)
chr6 (3-97)||(29825958-29826052)
chr6 (1-133)||(28234459-28234591)
chr6 (3-96)||(26848592-26848685)
chr6 (170-214)||(25579566-25579610)
chr6 (5-109)||(27214336-27214440)
chr6 (5-109)||(27234788-27234892)
chr6 (68-194)||(28098596-28098725)
chr6 (3-166)||(28325343-28325506)
chr6 (78-194)||(26342171-26342290)
chr6 (3-88)||(26617266-26617351)
chr6 (3-88)||(26723194-26723279)
chr6 (3-98)||(25071589-25071684)
chr6 (3-82)||(26635636-26635715)
chr6 (3-82)||(26741602-26741681)
chr6 (3-82)||(26959111-26959190)
chr6 (3-82)||(27665279-27665358)
chr6 (3-84)||(26811453-26811534)
chr6 (3-98)||(26949591-26949686)
chr6 (124-190)||(26018770-26018836)
chr6 (124-190)||(26139474-26139540)
chr6 (76-133)||(28226845-28226902)
chr6 (34-130)||(28242702-28242798)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (1-264)||(3582-3844)
scaffold0349 (1-254)||(14515-14767)
scaffold0349 (101-265)||(8061-8225)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (1-265)||(77-334)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-265)||(7295-7552)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-263)||(18699547-18699807)
chr4 (1-265)||(18731651-18731913)
chr4 (1-265)||(18655624-18655886)
chr4 (1-265)||(18679714-18679976)
chr4 (1-199)||(18724232-18724430)
chr4 (30-260)||(17989226-17989454)
chr4 (30-260)||(18073535-18073763)
chr4 (34-124)||(5091147-5091237)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (3-227)||(28164511-28164735)
chr1 (1-207)||(268504-268711)
chr1 (36-222)||(28127862-28128042)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (7-194)||(29273936-29274123)
chr8 (1-146)||(31903733-31903878)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (30-260)||(59343-59571)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (1-133)||(34620-34752)
scaffold0038 (3-166)||(116658-116821)
scaffold0038 (76-133)||(27343-27400)
scaffold0038 (34-130)||(42864-42960)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-166)||(58442-58607)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (3-85)||(17993846-17993928)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (1-95)||(16688944-16689038)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (124-190)||(5916-5982)


Alignment Details
Target: scaffold0277 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 13792 - 14056
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13792 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtg 13891  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  13892 gcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgag 13991  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13992 agaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 14056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 4831 - 5100
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4831 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 4930  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  4931 gcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgag 5030  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatg-----aatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  5031 agaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatttaatgaataagtttttgtggtctgtg 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28781166 - 28780902
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28781166 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtg 28781067  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  28781066 gcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgag 28780967  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28780966 agaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28780902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 27725005 - 27725267
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27725005 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 27725104  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  27725105 ccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgag 27725204  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  27725205 agaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 27725267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 27718539 - 27718803
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  27718539 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtg 27718638  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27718639 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 27718738  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  27718739 agaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 27718803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28786305 - 28786041
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28786305 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 28786206  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  28786205 gcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgag 28786106  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28786105 agaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27229259 - 27228997
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27229259 atggtgtgatttcgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtg 27229160  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  27229159 ccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgagacttgag 27229060  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  27229059 agaaattggatg--aaaagagttttagaatgcagaatatgaatgagtatgtttttgtggtatgtg 27228997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26656016 - 26655752
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26656016 atggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtg 26655917  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26655916 ccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 26655817  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26655816 agaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26655752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26761987 - 26761723
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26761987 atggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtg 26761888  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  26761887 ccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 26761788  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26761787 agaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26761723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27611162 - 27611406
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27611162 atggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 27611261  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||     
T  27611262 gcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaagaagaggaagctaattgcatagccatgaaaattgag 27611361  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatga 245  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27611362 agaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 27611406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26802469 - 26802201
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26802469 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgta 26802370  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||      
T  26802369 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtg 26802270  T
Q  201 agaaattggatgaa----aaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||||||||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26802269 agaaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26802201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 27604866 - 27605135
Alignment:
Q  2 tggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  27604866 tggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtat 27604965  T
Q  102 cgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaa------gaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaa 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27604966 cgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagaggatgaggatgaggaaggtaattgcatagccatgagaa 27605065  T
Q  196 ttgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27605066 ttgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27605135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27698654 - 27698906
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27698654 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 27698753  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27698754 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 27698853  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttt 254  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27698854 agaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttt 27698906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28792426 - 28792184
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28792426 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 28792327  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  28792326 gcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgag 28792227  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaat 243  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  28792226 agaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 27338225 - 27338482
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27338225 atggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgta 27338324  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||   | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27338325 aagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgag 27338424  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||||  |||||||||| ||| ||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27338425 agaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27338482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 27398965 - 27399222
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27398965 atggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgta 27399064  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||   | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27399065 aagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgag 27399164  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||||  |||||||||| ||| ||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27399165 agaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27399222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31284315 - 31284078
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  31284315 atggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccata 31284216  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  31284215 ccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaagaggaagatgattgcatagccatgagatttgag 31284116  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaata 238  Q
    ||||  |||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  31284115 agaatatggatgaagaaagaatttgagaatgcagaata 31284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 27531357 - 27531503
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27531357 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 27531456  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatg 147  Q
     ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531457 gcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatg 27531503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27678973 - 27678717
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||     
T  27678973 atggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgta 27678874  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  27678873 ccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagattttag 27678774  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27678773 agaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatg-agaagtttttgtggtctgtg 27678717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27593180 - 27593375
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  27593180 atggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgta 27593279  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 196  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593280 ccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26623003 - 26622805
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  26623003 atggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgta 26622904  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattga 199  Q
    |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26622903 ccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26728981 - 26728783
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  26728981 atggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgta 26728882  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattga 199  Q
    |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26728881 ccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26728783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26884190 - 26884023
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  26884190 atggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccata 26884091  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaag 168  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26884090 ccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 26884023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27677774 - 27677969
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  27677774 atggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgta 27677873  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 196  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||  || |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677874 ccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 27706562 - 27706818
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||     
T  27706562 atggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgta 27706661  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    ||||||||||   || || ||||||||||| ||||||||  || |   |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  27706662 ccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagagaaaggtgattgcatagccatgagattttag 27706761  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27706762 agaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatg-agaagtttttgtggtctgtg 27706818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26646506 - 26646299
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  26646506 atggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtc 26646407  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaaga------ggaaggtgattgcatagccatgaga 194  Q
     ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||   ||||||| | ||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||    
T  26646406 acgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaataggaaggagattgcatagccatgaga 26646307  T
Q  195 attgaaag 202  Q
    ||||||||    
T  26646306 attgaaag 26646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26752474 - 26752267
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  26752474 atggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtc 26752375  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaaga------ggaaggtgattgcatagccatgaga 194  Q
     ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||   ||||||| | ||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||    
T  26752374 acgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaataggaaggagattgcatagccatgaga 26752275  T
Q  195 attgaaag 202  Q
    ||||||||    
T  26752274 attgaaag 26752267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26861637 - 26861446
Alignment:
Q  7 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  26861637 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagt 26861538  T
Q  107 gtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattg 198  Q
    |||| | || || ||||||||||| || |||||  |||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26861537 gtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 26861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 27427792 - 27428020
Alignment:
Q  30 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgagga 129  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || || ||||||    
T  27427792 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 27427891  T
Q  130 acacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaa 229  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||| || |||    
T  27427892 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 27427989  T
Q  230 tgcagaatatgaatgaataagtttttgtggt 260  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  27427990 tgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 27428020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26823860 - 26823629
Alignment:
Q  8 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtg 107  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||    
T  26823860 gattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtg 26823761  T
Q  108 tcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaatt 207  Q
    |||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||   ||| |||| |||||||      |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26823760 tcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaactgaagag------gaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaatt 26823667  T
Q  208 ggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatga 245  Q
    ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26823666 ggacgaagaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 26823629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25481769 - 25481636
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||  ||     
T  25481769 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgtt 25481670  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 134  Q
     ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25481669 gcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25579746 - 25579613
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||  ||     
T  25579746 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtgtt 25579647  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 134  Q
     ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  25579646 gcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26055949 - 26055820
Alignment:
Q  5 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  |||    
T  26055949 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcga 26055850  T
Q  105 gtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 134  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26055849 gtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26075919 - 26075790
Alignment:
Q  5 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  |||    
T  26075919 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcga 26075820  T
Q  105 gtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 134  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26075819 gtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26142892 - 26142759
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||   ||     
T  26142892 atggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgtt 26142793  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 134  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26142792 gcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26048870 - 26048739
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgcc 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||  ||  |    
T  26048870 ggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgc 26048771  T
Q  103 gagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 134  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26048770 gagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26070039 - 26069908
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgcc 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||||||  ||  |    
T  26070039 ggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgc 26069940  T
Q  103 gagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 134  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26069939 gagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25538567 - 25538434
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||   ||     
T  25538567 atggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgtt 25538468  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 134  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25538467 gcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25538431 - 25538338
Alignment:
Q  170 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  25538431 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgattaa-tttgtgtggtctgt 25538338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26055818 - 26055724
Alignment:
Q  169 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26055818 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26055724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25481633 - 25481540
Alignment:
Q  170 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  25481633 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 25481540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26048736 - 26048643
Alignment:
Q  170 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26048736 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26048643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26069905 - 26069812
Alignment:
Q  170 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26069905 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26069812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26075787 - 26075694
Alignment:
Q  170 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26075787 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26075694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26142756 - 26142663
Alignment:
Q  170 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26142756 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26142663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29826052 - 29825958
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaacc 97  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29826052 ggtgtgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28234591 - 28234459
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||  | |||||||| |     
T  28234591 atggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccata 28234492  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 133  Q
     ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28234491 gcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 28234459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 26848685 - 26848592
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaac 96  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  26848685 ggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagattaccagtgaaac 26848592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25579610 - 25579566
Alignment:
Q  170 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25579610 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaa 25579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27214440 - 27214336
Alignment:
Q  5 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccga 104  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| || || |||||||| |||    
T  27214440 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27214341  T
Q  105 gtgtc 109  Q
    |||||    
T  27214340 gtgtc 27214336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 27234788 - 27234892
Alignment:
Q  5 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccga 104  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| || || |||||||| |||    
T  27234788 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27234887  T
Q  105 gtgtc 109  Q
    |||||    
T  27234888 gtgtc 27234892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 194
Target Start/End: Original strand, 28098596 - 28098725
Alignment:
Q  68 aagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaa 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| | || ||||| |  || ||||||  ||| || ||||||||| ||    
T  28098596 aagagctttgtagagatttccagtaaaaccataccgagtgtcggtgcccctaaaattaagaaacacgtcataggtgaatccataagagaatgaagagaaa 28098695  T
Q  168 gaggaaggtgatt---gcatagccatgaga 194  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  28098696 gaggaagatgattggagcatagccatgaga 28098725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28325506 - 28325343
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgcc 102  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  28325506 ggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataac 28325407  T
Q  103 gagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagagga 166  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  28325406 gagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 28325343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 194
Target Start/End: Original strand, 26342171 - 26342290
Alignment:
Q  78 tagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtg 177  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||  ||| || ||||||||| ||||||| | ||    
T  26342171 tagatattgccagtaaaaccatagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacacatcatatgtgaatccatatgagaatgaagagaaagaggacgatg 26342270  T
Q  178 att---gcatagccatgaga 194  Q
    |||   ||||||||||||||    
T  26342271 attggagcatagccatgaga 26342290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617266
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 88  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || |||||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgcc 26617266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723194
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 88  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || |||||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgcc 26723194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25071684 - 25071589
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccg 98  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| || |||||||||    
T  25071684 ggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagctttataaagattaccggtaaaaccg 25071589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26635715 - 26635636
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 82  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26635715 ggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26635636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26741681 - 26741602
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 82  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26741681 ggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26741602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26959190 - 26959111
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 82  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26959190 ggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26959111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 27665279 - 27665358
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 82  Q
    ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27665279 ggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagag 27665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26811534 - 26811453
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 84  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||    
T  26811534 ggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26949686 - 26949591
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccg 98  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| || |||||||| || || ||||||    
T  26949686 ggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccggtgaaaccg 26949591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Original strand, 26018770 - 26018836
Alignment:
Q  124 tgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 190  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26018770 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagacgaaggtgattgaatagccat 26018836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Original strand, 26139474 - 26139540
Alignment:
Q  124 tgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 190  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26139474 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccat 26139540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28226902 - 28226845
Alignment:
Q  76 tgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  28226902 tgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 28226845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 28242798 - 28242702
Alignment:
Q  34 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaa 130  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| | |  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  28242798 tgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 3582 - 3844
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3582 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 3681  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  3682 ccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgag 3781  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 264  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  3782 agaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 3844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 14515 - 14767
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14515 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtg 14614  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14615 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 14714  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttt 254  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14715 agaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttt 14767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Original strand, 8061 - 8225
Alignment:
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8061 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 8160  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  8161 agaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 77 - 334
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  77 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtg 176  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  177 gcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgag 276  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  277 agaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7552 - 7295
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7552 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtg 7453  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  7452 gcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgag 7353  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7352 agaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 18699547 - 18699807
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  18699547 atggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtc 18699646  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18699647 acgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgag 18699746  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctg 263  Q
    ||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  18699747 agaaactagatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--ggttaagtttttgtggtctg 18699807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 18731651 - 18731913
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||     
T  18731651 atggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtc 18731750  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  18731751 acgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatcgag 18731850  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||    
T  18731851 agaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttgtggtatgtg 18731913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 18655624 - 18655886
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||     
T  18655624 atggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgtt 18655723  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  18655724 acgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccatgaaaattgag 18655823  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||    
T  18655824 agaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttgtggtatgtg 18655886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 18679714 - 18679976
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  18679714 atggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgtt 18679813  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 200  Q
     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  18679814 acgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatagag 18679913  T
Q  201 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||    
T  18679914 agaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttgtggtatgtg 18679976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 18724232 - 18724430
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  18724232 atggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgtt 18724331  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattga 199  Q
     ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18724332 acgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattga 18724430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 17989226 - 17989454
Alignment:
Q  30 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgagga 129  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || || ||||||    
T  17989226 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 17989325  T
Q  130 acacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaa 229  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||| || |||    
T  17989326 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 17989423  T
Q  230 tgcagaatatgaatgaataagtttttgtggt 260  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17989424 tgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 17989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18073763 - 18073535
Alignment:
Q  30 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgagga 129  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || || ||||||    
T  18073763 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 18073664  T
Q  130 acacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaa 229  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||| || |||    
T  18073663 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 18073566  T
Q  230 tgcagaatatgaatgaataagtttttgtggt 260  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  18073565 tgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 18073535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 5091147 - 5091237
Alignment:
Q  34 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaact 124  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||| |  |||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||    
T  5091147 tgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Original strand, 28164511 - 28164735
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgcc 102  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||| || || |||||||||||   ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  |    
T  28164511 ggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcac 28164610  T
Q  103 gagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaag 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||    
T  28164611 gagtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacag 28164710  T
Q  203 aaattggatgaaaaaagagtctggg 227  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  28164711 aaattggatgagaaaagagtttggg 28164735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 268504 - 268711
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |     
T  268504 atggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccctc 268603  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattga- 199  Q
     |||||||||  ||| || ||  ||||||| || ||||| |  |||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  268604 acgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaactgag 268703  T
Q  200 aagaaatt 207  Q
    ||||||||    
T  268704 aagaaatt 268711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Original strand, 28127862 - 28128042
Alignment:
Q  36 tcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacactt 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  28127862 tcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacactt 28127961  T
Q  136 ggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagt 222  Q
    |||| ||||||  |||||||| |      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28127962 ggtatgtgaatccataggaaatt------gaagaggaatgtgattgcatagccatgagaattgacaaaaattggatgagaaaagagt 28128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 194
Target Start/End: Original strand, 29273936 - 29274123
Alignment:
Q  7 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||    
T  29273936 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagt 29274035  T
Q  107 gtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 194  Q
    ||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29274036 gtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 29274123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31903878 - 31903733
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  31903878 atggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaaccata 31903779  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 146  Q
     |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  31903778 gcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaat 31903733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 59571 - 59343
Alignment:
Q  30 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgagga 129  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || || ||||||    
T  59571 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 59472  T
Q  130 acacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaa 229  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||| || |||    
T  59471 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 59374  T
Q  230 tgcagaatatgaatgaataagtttttgtggt 260  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  59373 tgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 59343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34752 - 34620
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||  | |||||||| |     
T  34752 atggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccata 34653  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 133  Q
     ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  34652 gcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 34620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 116821 - 116658
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgcc 102  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  116821 ggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataac 116722  T
Q  103 gagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagagga 166  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  116721 gagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 116658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27400 - 27343
Alignment:
Q  76 tgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27400 tgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 27343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42960 - 42864
Alignment:
Q  34 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaa 130  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| | |  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  42960 tgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 58442 - 58607
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtg 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||| |     
T  58442 atggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagtaaaaccata 58541  T
Q  101 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagagga 166  Q
     |||||||||   || ||||| || |||||||| || || ||||||  |||||| || ||||||||    
T  58542 gcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccataggagaaggaagagga 58607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Original strand, 17993846 - 17993928
Alignment:
Q  3 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 85  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  17993846 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagatt 17993928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16689038 - 16688944
Alignment:
Q  1 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaa 95  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16689038 atggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtcacatagagctttgtacagattaccagtaaaa 16688944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5916
Alignment:
Q  124 tgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 190  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5982 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccat 5916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University