View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19301_low_18 (Length: 405)

Name: NF19301_low_18
Description: NF19301
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19301_low_18
NF19301_low_18
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (14-390)||(16657311-16657687)
chr2 (15-390)||(16661787-16662162)
chr2 (14-355)||(43625445-43625786)
chr2 (14-388)||(12234689-12235063)
chr2 (14-390)||(7542224-7542600)
chr2 (14-325)||(14703471-14703782)
chr2 (114-390)||(12258475-12258751)
chr2 (14-334)||(12245200-12245520)
chr2 (14-304)||(11999478-11999768)
chr2 (14-153)||(17716487-17716626)
chr2 (190-220)||(17704013-17704043)
chr2 (183-220)||(273279-273316)
chr2 (190-226)||(17648005-17648041)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (14-390)||(13333250-13333626)
chr7 (14-390)||(8659361-8659737)
chr7 (14-390)||(10494168-10494544)
chr7 (14-390)||(8667417-8667793)
chr7 (15-364)||(1301484-1301837)
chr7 (21-390)||(8654448-8654817)
chr7 (15-331)||(8585501-8585817)
chr7 (15-309)||(8628611-8628905)
chr7 (12-331)||(17267996-17268315)
chr7 (14-390)||(8646875-8647251)
chr7 (15-390)||(17260239-17260614)
chr7 (30-386)||(27830685-27831041)
chr7 (14-390)||(3147262-3147646)
chr7 (14-196)||(8671424-8671606)
chr7 (25-331)||(8636148-8636454)
chr7 (15-335)||(6789565-6789885)
chr7 (14-325)||(8602037-8602348)
chr7 (28-306)||(8576408-8576686)
chr7 (27-334)||(8609971-8610278)
chr7 (25-324)||(29581646-29581945)
chr7 (180-390)||(8545631-8545841)
chr7 (21-334)||(8382677-8382990)
chr7 (25-388)||(8570311-8570674)
chr7 (36-304)||(8538120-8538388)
chr7 (25-325)||(8581763-8582063)
chr7 (30-325)||(29577479-29577777)
chr7 (14-98)||(8640341-8640425)
chr7 (14-325)||(39985709-39986020)
chr7 (14-358)||(7877527-7877871)
chr7 (14-309)||(8590717-8591012)
chr7 (14-139)||(8017207-8017332)
chr7 (14-335)||(8559386-8559707)
chr7 (14-154)||(8102901-8103041)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (21-358)||(4678359-4678696)
chr1 (30-334)||(34466603-34466907)
chr1 (15-390)||(15595032-15595414)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (14-358)||(9335685-9336029)
chr4 (27-382)||(30775258-30775613)
chr4 (14-382)||(35132454-35132822)
chr4 (14-156)||(23587527-23587669)
chr4 (14-146)||(54396665-54396797)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (25-325)||(12528567-12528867)
chr8 (14-240)||(43744997-43745221)
chr8 (270-390)||(43744814-43744934)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (14-240)||(28220099-28220325)
chr5 (261-390)||(28219916-28220045)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (42-320)||(28910650-28910928)
chr6 (71-153)||(11200123-11200205)
chr6 (71-145)||(11170813-11170887)
chr6 (71-145)||(11209635-11209709)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 16657311 - 16657687
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16657311 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccatcgctggccttaatgtcattcgaattatc 16657410  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657411 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtcttgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 16657510  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657511 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 16657610  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16657611 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaactcaagagccttgaggaggttga 16657687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Original strand, 16661787 - 16662162
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |  | || ||||    
T  16661787 aatgcagttgtcactgttcctgcttattttaacgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggccttaacgttgtgaggataatca 16661886  T
Q  115 atgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttt 214  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16661887 atgaacccactgcagcagctattgcatatggccttgacaaaagaagtaattgtgatggtgaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttt 16661986  T
Q  215 tgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtg 314  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16661987 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccacttctggaaacactcacctcgggggagaggactttgataacagaatgttg 16662086  T
Q  315 aactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    |||||||||||  | || ||| | | |||||| || ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16662087 aactactttgtgaaagaatttaataggaagaacaaagtggatatcactaggaatccaagagccttgaggaggttga 16662162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43625786 - 43625445
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| || ||| | |||    
T  43625786 gaatgcagttgttaccgtgcctgcttacttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgttggtgtcattgtcggccttaatgttttacgagtaatc 43625687  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||  || ||||||||| | |||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  43625686 aatgaaccaacagctgctgctctagcatacggccttaacaagagaattaattgtgttggagaacgaaatattttcatctttgaccttggtggtggtactt 43625587  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||   | || ||    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||    
T  43625586 ttgatgtgtctatacttacaattaaggacaaggtcttccgtgttaaagccactgctggaaacactcaccttggaggagaggactttgatgatagaatggt 43625487  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtgga 355  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | |||||||| || |||||    
T  43625486 gaactactttgcagaagaatttgagaagaagaacaatgtgga 43625445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12235063 - 12234689
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |  |  | ||     
T  12235063 gaatgcagttgttaccgtgcctgcttatttcaatgattctcaacgaaaagcaactatagatgctggtgtcattgctggcctcaatgttatgagggtaatg 12234964  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    || ||||| |  || || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  12234963 aacgaacccatggcagccgctgttgcatatggtcttgacaagagaactgattgtgttggagaacgaaatatttttgtttttgatctcggcggtggcactt 12234864  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12234863 ttgatgtgtctctcctaacaatcaaaggtaatgtcttccaagttaaagccacagccggaaacactcacctcgggggagaggactttgataacagaatggt 12234764  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggtt 388  Q
     |||||| |||   | ||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12234763 aaactaccttgctcaagag-ttcaatagaaagaaaaaagtggacatgagtggaaatccaaaagccttgaggaggtt 12234689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7542600 - 7542224
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |  |    ||     
T  7542600 gaatgcagttgttactgtacctgcttattttaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcgggtgccattgctggcctcaatgttatgagggcaatg 7542501  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7542500 aatgaacctactgccgcagctgttgcatatggccttgacaagagaactgattatgatggagagcgaaatatttttgtttttgatcttggcggtggcactt 7542401  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| | || || ||||||||  |    ||  | || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||     
T  7542400 ttgatgtgtctttactaacgattaagggcaacaacttccaagttaaggccactgctggcaacactcaccttggtggagaagactttgataatagaatggc 7542301  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7542300 gaactactttgtacaagag-ttcaagagaaagaacaaagtggacattagtgggaatccaaaagccttgaggaggttga 7542224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14703782 - 14703471
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||  |||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| |||||  |  |  | ||     
T  14703782 gaatgcagttgttacggtgcctgcttattttagtgattctcaaagaaaagccactatggatgctggtgttattgccggcctcaatgttatgagggtaatg 14703683  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14703682 aatgaacctacagctgcagctattgcatatggccttgacaagagaactgattatggtggagaacgtaatatatttgtctttgatcttggtggtggtactt 14703583  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||    || ||  |  | || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14703582 ttgacgtgtctctcctaacaattaagggcaccgtcttccaaattaaggctactgctggaaacactcacctcgggggagaggacttcgataacagaatggt 14703483  T
Q  314 gaactactttgt 325  Q
    ||||||||||||    
T  14703482 gaactactttgt 14703471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 390
Target Start/End: Original strand, 12258475 - 12258751
Alignment:
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| | ||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12258475 aatgaacctactgctgcagcttttgcatatggccttgacaaaagaattaattgtgtcgaaaaacggaatatttttgtctttgatcttggtggtggcactt 12258574  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| | || || ||||||| | |||| ||| | || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  12258575 ttgatgtgtctctactaaccattaaggataatgtctttcaagttaaggctacagctggaaacacgcaccttggaggagaggactttgataatagaatggt 12258674  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  12258675 gagttactttgtagaagag-ttcaagagaaagaacaaagtagatataagtggaaatccaagagctttgaggagattga 12258751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 12245200 - 12245520
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| || |||||  |  |  | ||     
T  12245200 gaatgctgttgttactgtacctgcttattttagtgattctcagcgaaaagcaacgatagatgctggctcaattgctggtctcaatgttatgagggtaatg 12245299  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  |||||||| |||  || | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  12245300 aatgaacccactgctgcagctgttgcatatggccttgaaaagagagctgattgtgttggagaaagaaacatttttgtgtttgatcttggtggtggcactt 12245399  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    |||| || |||||||| || ||||||| | |  | ||  | || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||    
T  12245400 ttgacgtttctatcctaactattaaggataacatcttccaagttaaggccactgctggaaacactcaccttggaggagaggattttgataatagaatggt 12245499  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtt 334  Q
     |||||||||| | |||||||    
T  12245500 aaactactttgcacaggagtt 12245520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11999768 - 11999478
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||  |  |  | ||     
T  11999768 gaatgttgttgttactgtaccagcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgccggtgcaattgctggcatcaatgttataagggtaatg 11999669  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||  || | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11999668 aatgaacccactgctgcaactgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttggagaaagaaacattttagtctttgatcttggcggtggcactt 11999569  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataa 304  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||   |||| ||  | || || ||||| || |||||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  11999568 ttgatttgtctatactaacaattaaggacaatgtcttccaagttaaggccacagctggaaacactcacttcggaggagaggattttgataa 11999478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 17716487 - 17716626
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||  ||| ||| || |||| || |   |||||||||| |||||||| |||||| || |  |||||||     
T  17716487 gaatgccgttgttactgtccctgcttactttaatttttctcagagacaagctactaagcatgctggtgctattgctggtcttaatttcatgagaattatt 17716586  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgaca 153  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  17716587 aatgagcccactgctgcagccattgcttatggttttgaca 17716626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 220
Target Start/End: Original strand, 17704013 - 17704043
Alignment:
Q  190 tctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17704013 tctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 17704043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 220
Target Start/End: Original strand, 273279 - 273316
Alignment:
Q  183 atttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  273279 attttggtctttgaccttggaggtggtacttttgatgt 273316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Original strand, 17648005 - 17648041
Alignment:
Q  190 tctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17648005 tctttgaccttggcggtggtacttttgacgtctctat 17648041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 13333250 - 13333626
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  13333250 gaatgccgttgttactgtgccggcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtgctattgctggccttaatatcattcgaataatc 13333349  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  13333350 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagacgtgattgtgatggtaagcgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtactt 13333449  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  13333450 ttgatgtgtctatccttacaattatgggtgatgtctttgaagtaaaagccaccgcaggaaacactcaccttgggggagaagacttcgataacagaatggt 13333549  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || || || |||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  13333550 gaactattttgttgaggagttcaaaaagaagaataacgtcgatatcagtgggaacccaaaatccttaaggaggttga 13333626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8659737 - 8659361
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  || ||     
T  8659737 gaatgctgttgttacagtgcctgcatagttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagattccggtgccattgctggccttaatgtcattcagataatt 8659638  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  8659637 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaggtgactgtgatggtaaacaaaatattttggtctttgatcttggtggtggtactt 8659538  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  8659537 ttgatgtgtctatccttacaatgaagggtgatgtctttgaagtaaaagccacttctggaaacactcaccttggaggagaggactttgatagcagaatggt 8659438  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| | |||| ||||||||||    
T  8659437 gaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggacattagtggtaacccaaaatccttaaggaggttga 8659361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 10494168 - 10494544
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  10494168 gaatgctgttgttactgtgccggcttacttcaacgattctcaacgaaaggctactattgatgctggtgctattgctggccttaatgtcattcggataatc 10494267  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  10494268 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagaagtgattgtgagggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtactt 10494367  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10494368 ttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatgtctttgaagtaaaagccactgcaggtaacactcaccttgggggagaggacttcgataacagaatggt 10494467  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    ||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  10494468 gaattattttgttgaggagttcaaaaagaagaataacgtggacatcagtgggaatccaaaatccttaaggaggttga 10494544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8667793 - 8667417
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| || |||    
T  8667793 gaatgccgttgttactgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataatc 8667694  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || || || || ||||    
T  8667693 aatgaacctactgcggcagctattgcatatggccttgacaagagaaatgactgtgatggtagccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcgggactt 8667594  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  8667593 ttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatgtctttgaagtgaaagccactgcaggaaacactcaccttgggggcgaggacttcgataacagaatggt 8667494  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||| | |||| ||||||||||    
T  8667493 gaactattttgttgaggagttaaaaaagaagaataaagtggacatcagtcagaacccaaaatccttaaggaggttga 8667417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1301837 - 1301484
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  || || |    
T  1301837 aatgctgttgttactgtgcctgcacatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgccggtgcaattgctggccttaatgtcattcagataatta 1301738  T
Q  115 atgaaccta----ctgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggta 210  Q
    |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1301737 atgaacctagctactgctgcagctattgcgtatggttttgacaagagaagtgactgtgatggtaaacggaatattttggtctttgaccttggcggtggta 1301638  T
Q  211 cttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaac 310  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  1301637 cttttgatgtgtctatccttaccatcaagggcgatgtctttgaagtaaaagccactggtggaaatactcaccttggaggagaggactttgataatagaat 1301538  T
Q  311 ggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgg 364  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||    
T  1301537 ggtgagctactttgtagaggagttcagaaagaagaataaagtggacattagtgg 1301484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8654817 - 8654448
Alignment:
Q  21 gttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaac 120  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  |||||||||    
T  8654817 gttgttactgtgccggcatacttcaatgactctcagcgaaaagcaaccatagatgctggtgccattgctggacttaacgtcattcggatactcaatgaac 8654718  T
Q  121 ctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8654717 ctactgccgcagctattgcatatggccttgacaagcgaagtaactatgatggtaaacggaatattttggtatttgatcttggtggtggtacttttgatgt 8654618  T
Q  221 gtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactac 320  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  8654617 gtctatactcacaattaagggtgatgtctttgacgtaaaagccactgctggaaacacgcacctagggggagaagactttgataacagaatggtgtactac 8654518  T
Q  321 tttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || || || || |||| | |||| ||||||||||    
T  8654517 tttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggaaattagcggtaacccaaaatccttaaggaggttga 8654448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 8585501 - 8585817
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||    
T  8585501 aatgcagttgtgactgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatca 8585600  T
Q  115 atgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttt 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | || | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  8585601 atgaacccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaactgtgatggtgaacgaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttt 8585700  T
Q  215 tgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtg 314  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  8585701 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagcaaccgctggaaatactcaccttgggggaggggactttgataacagaatgttg 8585800  T
Q  315 aactactttgtagagga 331  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8585801 aactactttgttgagga 8585817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8628905 - 8628611
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |  | || ||||    
T  8628905 aatgcagttgtcaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatgaatgctggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatca 8628806  T
Q  115 atgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttt 214  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  8628805 atgaccccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaggtgtgatggtgaacgaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttt 8628706  T
Q  215 tgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaa 309  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8628705 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccactgctggaaatactcaccttggtggagaggactttgataacagaa 8628611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17268315 - 17267996
Alignment:
Q  12 atgaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta 111  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     | |    
T  17268315 atgaatgctgtcattactgtcccggcttacttcaacgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgtcattgctggccttaatgtattgaaggtaa 17268216  T
Q  112 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | | |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17268215 tcaatgaaccaactgctgcagctattgcatatggccttggcaagagaactaactgtgttgaagaacggaatatttttgtctttgaccttggtggtgggac 17268116  T
Q  212 ttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacg 311  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | | || || || || || ||||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  17268115 ttttgatgtgtctctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatcttgggggtgaggactttgataatagaatg 17268016  T
Q  312 gtgaactactttgtagagga 331  Q
    ||  |||| ||||| |||||    
T  17268015 gtatactattttgttgagga 17267996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8647251 - 8646875
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || | || || |||    
T  8647251 gaatgcagttgttactgtgcctgcatacttcaatgattatcagcgaaaagccactatagatgccggggccattgctggccttaatatcatccggataatc 8647152  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||| || ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||   |||||| ||   |||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  8647151 aatgaaccaacagctgctgctctcgcatatggccttgacaagagaacaaattgtgctgaagaacgaaatatattcatcttcgaccttggtggtggaactt 8647052  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||| | || |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||    
T  8647051 ttgatgtgtctctccttacaattaaggataaggtctttcatgttaaagccaccgctggaaacactcacctcggaggagaggactttgatagtagaatggt 8646952  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    | || |||||| | | || ||| | |||||||| ||||||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  8646951 ggaccactttgcacaagaatttaacaagaagaacaaggtggacattactggaaactcaagagccttaaggaggttga 8646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17260614 - 17260239
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaatta-tc 113  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||  | ||| |     
T  17260614 aatgttgttattactgttcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgttattgctggcctttatgt-tttgaagttaatt 17260516  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||| |     ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  17260515 aatgaacctattgctgcagctattgcatatggccttgtcaagagaactaattgtgtttaagtacggaatatttttgtctttgaccttggtggggggactt 17260416  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | | || || || || || ||||| |  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  17260415 ttgatgtgtctctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatcttgggggtgaggactttgataatagaatggt 17260316  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaa-gaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||  ||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  17260315 gtactattttgtagaggag-atcaaaagaacgaaaaaattggacattattgggaacccaaaagccttaaggaggttga 17260239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 27830685 - 27831041
Alignment:
Q  30 gtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctg 129  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||  | || || || |  || ||||||||||    
T  27830685 gtgccagcttatttcaatgactctcaacgaaaagccactgtagattccggtgccattgctggccttaatgttatgcggataataagcgagcctactgctg 27830784  T
Q  130 cagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatcct 229  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | |||   | | |  |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |    
T  27830785 cagctattgcatatggccttgacacgggaacaaaatatactggagaacggaatatttttgtgtttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctcttgt 27830884  T
Q  230 tacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagag 329  Q
    ||||||||||| | | || ||  | || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||    
T  27830885 tacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactattttgtggag 27830984  T
Q  330 gagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggagg 386  Q
    | |||  | |||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27830985 gtgttcaagaagaagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggagg 27831041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3147646 - 3147262
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |  | || || |||    
T  3147646 gaatgcagttgttaccgtacctgcttatttcaatgatgctcagcggaaagcgacaatagatgctggtgttattgctggccttaatattatgcggataatc 3147547  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtg--atggtaaa------cggaatatttttgtctttgaccttggcgg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| | ||||||  || ||  |      || ||||||||| |||||||| | || ||    
T  3147546 aatgaacctactgctgcagctattgcgtatggactggacaagagaactaattgtgtaattgtgtagaggagcgtaatatttttatctttgacttgggtgg 3147447  T
Q  206 tggtacttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataac 305  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | | || ||| | || || ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  3147446 tgggacttttgatgtgtctcttcttacaattaaggataaggtctttcaagttaaggccatcgcaggaaacacccaccttgggggagaggactttgataat 3147347  T
Q  306 agaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    || | |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  3147346 aggatggtgaactactttgcacgggagtttaagaagaagaacaaggtagacattagtgagaactcaagagccttaaggaggttga 3147262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 8671424 - 8671606
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| || |||    
T  8671424 gaatgccgttgttaccgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaacggccaccattgatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataatc 8671523  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttga 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  8671524 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagaaatgaccgtgaaggtaaccgaaatatttttgtctttga 8671606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Original strand, 8636148 - 8636454
Alignment:
Q  25 ttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctac 124  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||    
T  8636148 ttactgtgcccgcttatttcaatgattctcagcgtaaatccaccaaagatgctggtgccattgccggccttaatgtaattcggataatcaatgaaccaac 8636247  T
Q  125 tgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtct 224  Q
    |||||||||| |||| |||||  || | |||||| || | |||| |    |  | || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  8636248 tgctgcagcttttgcgtatggacttcaaaagagaggtaactgtgttaaagagagaaacattttcgtatttgatcttggtggtggtacattcgacgtgtct 8636347  T
Q  225 atccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttg 324  Q
    || || | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || ||||    
T  8636348 atactcaaaattaaaggtgaagtctttgaagttaaagccactgccggagacacacaccttggaggagaggactttgataacagaatggtggaatattttg 8636447  T
Q  325 tagagga 331  Q
    |||||||    
T  8636448 tagagga 8636454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6789885 - 6789565
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||    
T  6789885 aatgcagttattactgtgcctgcttatttcaatgattctcaacggaaagccactttagatgctggtgccattgctggtcttaatgttatacgaataatca 6789786  T
Q  115 atgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttt 214  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||| | |||  | |||  ||   |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6789785 atgaaccaacagctgctgctcttgcatatggccttgataagagaactaattacggtggagaaaaaaatattttcgtcttcgaccttggtggtggcacttt 6789686  T
Q  215 tgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtg 314  Q
     |||||||||||| | ||||| || | | | || ||  | || || ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  |||     
T  6789685 cgatgtgtctatcttaacaatcaaagataaggtcttccaagttaaggccaccggtggaaacactcacctcggaggagaggactttgataaccgattggta 6789586  T
Q  315 aactactttgtagaggagttt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  6789585 aactactttgcagaggagttt 6789565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8602348 - 8602037
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||  | || || |||    
T  8602348 gaatgcagttgttactgtgccggcttattttaatgattctcagcgaaaagccacaaaagatgctggtgccattgctggtctcaatgtaatgcggataatc 8602249  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||| || ||||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | |||||| ||   |  | ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  8602248 aatgagccaactgcagctgctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaatattttcatatttgatcttggtggtggaactt 8602149  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||| ||| | || |||||||||  | || | ||||| || || |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  8602148 ttgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagacacacaccttggaggagaggactttgataaccgaatggt 8602049  T
Q  314 gaactactttgt 325  Q
    |||| |||||||    
T  8602048 gaaccactttgt 8602037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8576686 - 8576408
Alignment:
Q  28 ctgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgc 127  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||| |||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||| | |  || ||||||||||| |||||    
T  8576686 ctgtgcctgcttattttaatgattcccaacgaagagccactaaagatgcaggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgc 8576587  T
Q  128 tgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatc 227  Q
     |||||| |||| |||||  || | ||||||  | |||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8576586 ggcagctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaaagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctatt 8576487  T
Q  228 cttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataaca 306  Q
    || ||| |||||    |||| || || || || |||||||||||| |||||||||| || ||  | |||||||||||||    
T  8576486 ctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctaggaggccaagactttgataaca 8576408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8610278 - 8609971
Alignment:
Q  27 actgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactg 126  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| || |    
T  8610278 actgtgcctgcttattttaatgattctcagcggaaagccacaaaagatgctggtgtcatttctggccttaatgtaatccggattatcaatgaaccaacgg 8610179  T
Q  127 ctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaa-cggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtcta 225  Q
    |||| ||| ||||||||||| || | ||||||  | |||||| ||| |||  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  8610178 ctgcggctcttgcatatggtcttcagaagagagctaattgtg-tggaaaatagaaatatttttatctttgatcttggtggtgggactttcgatgtgtctg 8610080  T
Q  226 tccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgt 325  Q
    | || ||||||||     ||| ||| || || || || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||    
T  8610079 ttctcacaattaaaaacaatgctttcgatgtcaaggctactgctggagatactcaccttggaggagaggactttgatcacagaatggttaatcactttgt 8609980  T
Q  326 agaggagtt 334  Q
      |||||||    
T  8609979 gaaggagtt 8609971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 324
Target Start/End: Original strand, 29581646 - 29581945
Alignment:
Q  25 ttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctac 124  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    || |||||||| |||||  |  | || ||||| ||||| ||    
T  29581646 ttaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccaaagatgctggcattatagctggcctcaatgtaatgaggataatcaacgaaccaac 29581745  T
Q  125 tgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtct 224  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| | ||| || || ||| || ||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29581746 tgctgctgcacttgcatatggtattcaaaagggaggtaattttgttggaaaacgaaatatattcatctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtct 29581845  T
Q  225 atccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttg 324  Q
     | || ||| | |||| ||||   ||||| || || |||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  29581846 cttctcacactcaaggatgataagtttgaagtgaaggccactgctggcgatactcacctaggaggagaggactttgataaccgaatggtgaattactttg 29581945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8545841 - 8545631
Alignment:
Q  180 aatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactc 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   | | || ||||| || || |||||||| ||| |||||     
T  8545841 aatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattcttacaattaaaaataaggtctttgatgtcaaggccactgctggagacactt 8545742  T
Q  280 accttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagcctt 379  Q
    |||| || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||  | | |||||| || | ||| || ||| |||| |||  ||||||    
T  8545741 acctaggcggtgaagactttgataacagaatggtgaattactttgtgaaggagttcaagaggaagaacaatgaggatattagtcggaacccagaagcctt 8545642  T
Q  380 gaggaggttga 390  Q
    |||||||||||    
T  8545641 gaggaggttga 8545631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 334
Target Start/End: Original strand, 8382677 - 8382990
Alignment:
Q  21 gttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaac 120  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  | || || |||||||| |    
T  8382677 gttgttaccgtgcctgcatatttcaatgattctcaacggaaagccacaaaagatgctggtgcgattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgagc 8382776  T
Q  121 ctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    | ||||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | |||||  ||   |  | ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  8382777 caactgccgctgctcttgcatatggccttcagaagagagctaattgtcttgaagagagaaatattttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgt 8382876  T
Q  221 gtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactac 320  Q
    |||| |||| |||||||||  | |||| ||||  || || |||||||||||| ||||||| || || || || ||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  8382877 gtctctcctcacaattaagaataatgtctttgttgtgaaggccactgccggagacactcatctaggaggtgaagacttagataacagaatcgtgaagtac 8382976  T
Q  321 tttgtagaggagtt 334  Q
    ||||| || |||||    
T  8382977 tttgttgacgagtt 8382990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8570674 - 8570311
Alignment:
Q  25 ttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctac 124  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| || |||| |||||| | |||||| ||||  |||||||| || |||||  | || || ||||||||||| ||    
T  8570674 ttactgtacctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgctggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgac 8570575  T
Q  125 tgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtct 224  Q
    ||| |||||| ||||||||||  || | ||||||  | ||| || || |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8570574 tgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattttgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtct 8570475  T
Q  225 atccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttg 324  Q
    || || ||| |||||| | |    | ||| || || |||||||| ||| |||||||||| || || || || ||||||||||||| | |||   ||||||    
T  8570474 attctcacagttaaggataacaactatgaagtcaaggccactgctggagacactcacctgggaggtgaagattttgataacagaatgttgactcactttg 8570375  T
Q  325 tagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggtt 388  Q
    |  || ||||  | |||||||| || | ||| || ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  8570374 tgaagaagttcaagaagaagaacaacgaggatattagtaggaacccaaaagccttgaggaggtt 8570311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8538388 - 8538120
Alignment:
Q  36 gcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagcta 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  | || || |||||||||||||| ||||| |||     
T  8538388 gcttatttcaatgattcacagcgaagagccaccaaagatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaacctacagctgctgctc 8538289  T
Q  136 ttgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttacaat 235  Q
    ||||||| ||  || | ||||||  | |||||| ||   |  | ||  ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  8538288 ttgcatacggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaaagttttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgtatctctccttacatt 8538189  T
Q  236 taagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataa 304  Q
     |||  | |||  |||   || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8538188 gaagaataatgcctttacagtcaaggccactgccggagatactcaccttggaggagaggactttgataa 8538120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8582063 - 8581763
Alignment:
Q  25 ttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctac 124  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| || |||| |||||| | |||||| ||||  ||||| || || |||||  | || || ||||||||||| ||    
T  8582063 ttactgtacctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgcaggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgac 8581964  T
Q  125 tgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtct 224  Q
    ||| |||||| ||||||||||  || | ||||||  | |||||| || |||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8581963 tgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggaggtggaacttttgatgtgtct 8581864  T
Q  225 atccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttg 324  Q
    || || ||| |||||  | | |  | ||| || || |||||||| ||| |||||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  8581863 attctcacagttaagaataacgactatgaagtcaaggccactgctggagacactcacctgggaggggaagattttgataacagaatggtgaatcactttg 8581764  T
Q  325 t 325  Q
    |    
T  8581763 t 8581763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 325
Target Start/End: Original strand, 29577479 - 29577777
Alignment:
Q  30 gtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctg 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    ||||||||||| |||||  | || || ||||||||||| |||||||    
T  29577479 gtgccagcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccaaagatgccggcattattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccaactgctg 29577578  T
Q  130 cagctattgcatatggtattgacaagagaagtgatt---gtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctat 226  Q
    | ||  |||||||||| ||| | |||||| || |||    || ||| || || ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  29577579 ctgcacttgcatatggaattcaaaagagaggtaattttgttgttggaaagcgaaatgtattcatctttgatcttggtggtggcacctttgatgtgtctct 29577678  T
Q  227 ccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgt 325  Q
     || ||| |||||| ||||  |||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || ||||||||||| ||||| | || ||||| | |||||||    
T  29577679 tctcacacttaaggatgatagttttgaagtaaaggccactgctggtgatactcacctaggaggagaggacttcgataataaaatggtgagccactttgt 29577777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 98
Target Start/End: Original strand, 8640341 - 8640425
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaat 98  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8640341 gaatgcagttgttactatgcctgcttacttcaatgattatcagcaaaaagccaccatagatgccggggccattgctggccttaat 8640425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39986020 - 39985709
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| ||||  |||||||| |  ||||| || ||||||||| | |||||||||    
T  39986020 gaatgctgttgttactgtccctgcttactttaatgactcccagcgtcaagctaccaaggatgctggagttattgccggtcttaatgtcatgcgaattatc 39985921  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtga-ttgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtact 212  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||  |   ||| |||  |   |||| | ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  39985920 aatgagcccactgctgctgccattgcttatggtcttgacaaga-aagcaaccagtgttggagagaagaatgtcttgatctttgaccttggtggtggtact 39985822  T
Q  213 tttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacgg 312  Q
    |||||||| ||| | || || ||| | |  | | | |||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||| ||    
T  39985821 tttgatgtctctttgctaactattgaagagggtatctttgaggtgaaagccacagccggagacacccatcttggaggtgaggattttgacaacagaatgg 39985722  T
Q  313 tgaactactttgt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  39985721 tgaaccactttgt 39985709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 358
Target Start/End: Original strand, 7877527 - 7877871
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||| |||||  | || || ||     
T  7877527 gaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattctcaacgaaaagccacaaaagatgctggtgcagttgccggcctcaatgttatgcggataatt 7877626  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgat-ggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtact 212  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||||||  || | ||||||| | | |   || || ||||| ||| | ||  || |||| ||||| ||||| |||    
T  7877627 aatgaaccaactgctgctgcccttgcatatggccttcaaaagagaa-taaataacatcggaaaacgaaatgtgttcatcattgatcttggtggtggcact 7877725  T
Q  213 tttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacgg 312  Q
    || ||||||||| | || ||| | || | ||||   ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||| |     
T  7877726 ttcgatgtgtctcttctcacactaaaagatgatagctttgatgtaatagctactgccggagatactcacctaggtggagaggactttgataacagaatgt 7877825  T
Q  313 tgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacat 358  Q
    ||||| | || ||   ||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  7877826 tgaaccatttagtgatggagtttaagaggaagaataaagtggacat 7877871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8591012 - 8590717
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | |||||  | || || ||     
T  8591012 gaatgcagttgttactgtgccagcttattttaatgattctcagaggaaagctaccaaagatgctggtgtcattgctggcttgaatgtaatgcggataatt 8590913  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgat-ggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtact 212  Q
    |||||||| ||||| || |   ||||||||||  || | |||||| |  | |   || || ||||| ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  8590912 aatgaaccaactgccgctggccttgcatatggccttcaaaagaga-gaaagtaacatcggaaaacgaaatgtgttcatctttgatcttggtggtggcact 8590814  T
Q  213 tttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaa 309  Q
    |||||||||||| | || ||| | || ||||||   ||||| |||||||||||| ||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8590813 tttgatgtgtctcttctcacactcaaaggtgatagctttgatgtaaaagccacttccggagatacccacctaggaggagaggactttgataacagaa 8590717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 8017207 - 8017332
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| |||| |||||| || || ||||| ||  ||||||||    
T  8017207 gaatgccgttgttacagttccagcttacttcaatgattcgcagcgtcaagccacaaaggatgccggtgtcattgcaggactcaatgttttgagaattatc 8017306  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgc 139  Q
    || || || || ||||||||||||||    
T  8017307 aacgagccaacagctgcagctattgc 8017332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8559707 - 8559386
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||||||  |||| || || ||||| || |||||||| ||  ||| |||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||  | |  || |||    
T  8559707 gaatgctgtgattaccgtacctgcttattttaatgattctcaaagaagagccaccaaagatgcaggtgaaattgctggtcttaatgtaatgcagataatc 8559608  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | |||||| |    |  | ||||||||  ||||||| || || ||||| ||||    
T  8559607 aatgaaccaactgcagctgctcttgcatatggacttcaaaagagatctaattgtgttaaagagagaaatattttcatctttgatctcggtggtggaactt 8559508  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||| ||| | || |||||||||  | || | ||||| || || |||||| ||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  8559507 ttgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagacacacacctcggaggagaggactttgataacagaatggt 8559408  T
Q  314 gaactactttgtagaggagttt 335  Q
    |||  |||||||| | ||||||    
T  8559407 gaaacactttgtaaaagagttt 8559386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8103041 - 8102901
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||||||||  || |||||  | ||||| ||  |||||||     
T  8103041 gaatgccgtcgtcactgtccctgcttacttcaatgattctcagcgtcaagcaactaaagatgctggtgttatcgctggtttaaatgttttgagaattatt 8102942  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaa 154  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  8102941 aatgagccaactgctgctgctattgcctacggtcttgacaa 8102901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Original strand, 4678359 - 4678696
Alignment:
Q  21 gttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaac 120  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  4678359 gttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcaacgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaac 4678458  T
Q  121 ctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgt 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4678459 ctactgttgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgattgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgt 4678558  T
Q  221 gtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactac 320  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4678559 gtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacactcacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactac 4678658  T
Q  321 tttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacat 358  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4678659 tttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacat 4678696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 34466603 - 34466907
Alignment:
Q  30 gtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctg 129  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||    
T  34466603 gtgcctgcttattttaatgattctcagcgaaaagctactgtggatgctggtactattgctggccttaatgttttgcaaataatcaatgaacccactgctg 34466702  T
Q  130 cagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaa-tatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatcc 228  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | || ||| | | |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  34466703 cagctattgcatatggacttgacaagagagctgactttg-tggaagaaggaaatattttcgtctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctctcc 34466801  T
Q  229 ttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtaga 328  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| || || |||||| | || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| | |    
T  34466802 ttacaattaaggataatgtctttgaagttaaggccacttctggtaacactcacctcggacgagaggactttgataatagaatggcgaaccactttgcaaa 34466901  T
Q  329 ggagtt 334  Q
    ||||||    
T  34466902 ggagtt 34466907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15595414 - 15595032
Alignment:
Q  15 aatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatca 114  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||    
T  15595414 aatgcagttgttaccgtgcctgcttatctcaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcaggtgccattgctggccttaatgttatacgggtaatca 15595315  T
Q  115 atgaacctactgctg-------cagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtg 207  Q
    ||||||| || ||||       ||||||||||||||||  |||||||||| | | | |||| |||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15595314 atgaaccgacagctgacagctgcagctattgcatatggccttgacaagaggattaactgtgttggagaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtg 15595215  T
Q  208 gtacttttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacag 307  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||   | || ||  | || || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15595214 gcacttttgatgtgtctatcctaacaattaaggacaaggtcttccaagttaaggccacaggcggaaacactcaccttggaggagaggactttgataacag 15595115  T
Q  308 aacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
    || ||| ||||||||||   |||| ||  | | |||||| || ||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15595114 aatggtcaactactttgcgcaggaattcaagacgaagaacaaagtggatattactgggaacccaagggccttgaggagattga 15595032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 358
Target Start/End: Original strand, 9335685 - 9336029
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  9335685 gaatgccgttgttaccgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggccttaatgtcattcggataatc 9335784  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  9335785 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgataagagaaatgactgtgatggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcggtactt 9335884  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  9335885 ttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatctatttgaagtaaaagccaccgcaggaaacacgcaccttggaggcgaggactttgataacagaatggt 9335984  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacat 358  Q
     ||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9335985 taactattttgtggaagagttaaaaaagaagaataaagtggacat 9336029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30775613 - 30775258
Alignment:
Q  27 actgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactg 126  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| || ||||| || ||||    
T  30775613 actgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactg 30775514  T
Q  127 ctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctat 226  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||||| ||   ||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  30775513 cagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 30775414  T
Q  227 ccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgta 326  Q
     || || ||||  | |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  30775413 tctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaactgctggaaacactcacatcgggggagaggactttgataacagaatgttgaattactttgta 30775314  T
Q  327 gaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgag 382  Q
    ||||| ||| | | |||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  30775313 gaggaatttaagacgaagaacaacgtggacattaccgggaatccaagagctttgag 30775258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35132822 - 35132454
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||  |  || | ||     
T  35132822 gaatgcagttgttactgtgcctgcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgctggtgctattgctggtcccaatgttatgagagtaatg 35132723  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||  |||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  35132722 aatgaacctactgccgcagcggttgcatatggccttgacaagagatctgattgtgctggagaacaaaatatttttgtcttcgatcttggtggtggcactt 35132623  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggt 313  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||| | |||| ||  | || || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||    
T  35132622 ttgatgtttcaatacttactattaaggataatgtcttccaagttaaggccactgccggaaacactcatctcggtggagaggactttgataacagaatggt 35132523  T
Q  314 gaactactttgtagaggagtttcaaaag-aagaataaggtggacataagtgggaatccaagagccttgag 382  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  35132522 gaactactttgtacaagag-ttcaagagaaagaacaaagtagacattagtgggaattcaaaagccttgag 35132454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 23587527 - 23587669
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| || | |||||| |||| |||| |||| || ||||| ||  |||||||     
T  23587527 gaatgccgttgtaactgtgcctgcttacttcaacgattcacaacgtcaagctacaaaagatgccggtgtcatttctggactcaatgtgttgagaattatt 23587626  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaaga 156  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||    
T  23587627 aatgaacctaccgctgctgctattgcttatggtcttgataaga 23587669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54396797 - 54396665
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||  |||| || | |||||||||||| ||| | ||  | ||||| ||  | |||||     
T  54396797 gaatgctgttgttactgttcctgcttatttcaatgattctcaacgtcaagctacgaaagatgctggtgctatttcgggtttgaatgtgttgaggattatt 54396698  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggt 146  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  54396697 aatgagcctactgctgctgcaattgcttatggt 54396665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12528867 - 12528567
Alignment:
Q  25 ttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctac 124  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||  | || || ||||| ||||| ||    
T  12528867 ttacggtgccagcgtatttcaatgattcgcagcgacgagccaccaaggatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatacggataatcaacgaaccaac 12528768  T
Q  125 tgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtct 224  Q
    ||| || ||| |||||||||| ||| | ||||||  | |||||  ||   |  | |  |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12528767 tgcagctgctcttgcatatggcattcaaaagagagctaattgtcttgaagagagaaggatttttatttttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtct 12528668  T
Q  225 atccttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttg 324  Q
     | |||||| | |||  | |||| || || || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||    
T  12528667 cttcttacagtaaagaataatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcaccttggaggagaggactttgataatcgaatggtgaatcactttg 12528568  T
Q  325 t 325  Q
    |    
T  12528567 t 12528567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43745221 - 43744997
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |    || |||    
T  43745221 gaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccac--tagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatc 43745124  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtactt 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | | | ||   |   | | ||||||||  |||||||||| || ||||| ||||    
T  43745123 aatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggaagaaatattttcatctttgacctgggtggtgggactt 43745024  T
Q  214 ttgatgtgtctatccttacaattaagg 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43745023 ttgatgtgtctctccttacaattaagg 43744997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43744934 - 43744814
Alignment:
Q  270 ggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataagtgggaatc 369  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||| || |    
T  43744934 ggaaacactcacctcggaggagaggattttgataataggatggtgaactacttcgcagaggagtttaagaagaagaacaaggtggacattactggaaacc 43744835  T
Q  370 caagagccttgaggaggttga 390  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  43744834 caagagcattaaggaggttga 43744814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28220325 - 28220099
Alignment:
Q  14 gaatgctgttgttactgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatc 113  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||  |  | ||  ||    
T  28220325 gaatgcagttattactgtgcctgcttatttcaatgattatcagcggaaagccaccatagatgcaggtaccattgctggtctaaatgttctaaggatagtc 28220226  T
Q  114 aatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgacaagagaagtgattgtgatggta-aacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtact 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||| | | ||  |||| | |||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |||    
T  28220225 aatgaacccactgctgctgctattgcatatggattggacaaaagaactaactg-catgggagaacgaaatattttcatctttgacctgggtggtgggact 28220127  T
Q  213 tttgatgtgtctatccttacaattaagg 240  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  28220126 tttgatgtgtctctccttagaataaagg 28220099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28220045 - 28219916
Alignment:
Q  261 gccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttcaaaagaagaataaggtggacataa 360  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  28220045 gccaccgctggaaacactcacctcgggggagaggactttgatagtaggatggtgaactacttcgcagaggagtttaagaagaagaacaaggtggacatta 28219946  T
Q  361 gtgggaatccaagagccttgaggaggttga 390  Q
     ||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  28219945 ctggaaactcaagagccttaaggaggttga 28219916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28910928 - 28910650
Alignment:
Q  42 ttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcat 141  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||  | || || |||||||| |  ||||||| ||||||| |||    
T  28910928 ttcaatgattcttagaggaaagccaccatagatgctggtgccattgtcaggcttaatgttatgcggataatcaatgagctcactgctgtagctatttcat 28910829  T
Q  142 atggtattgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttacaattaaggg 241  Q
    ||||  | |||||||||  ||| |||| |||  |||| |||| |||  |||| ||||| ||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  28910828 atggcctcgacaagagagctgagtgtgctggagaacgaaatactttcatcttcgacctgggtagtgggacttttgatgtttctctccttacaattcagga 28910729  T
Q  242 tgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactac 320  Q
    | | || ||  | || || ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  28910728 taaggtcttccaagttaaggccaccgctggaaacactcacctcggggtcgaggacattgataataggatggtgaactac 28910650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11200205 - 11200123
Alignment:
Q  71 agatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggtattgaca 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| || || |||||||||||| ||||||    
T  11200205 agatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaataatcaatgagccttctgcagctgcaattgcatatggtcttgaca 11200123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11170887 - 11170813
Alignment:
Q  71 agatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatgg 145  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  11170887 agatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaatactcaatgagcctactgcagctgcaattgcatatgg 11170813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11209709 - 11209635
Alignment:
Q  71 agatgctggtgccattgctggccttaatgtctttcgaattatcaatgaacctactgctgcagctattgcatatgg 145  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  11209709 agatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaatactcaatgagcctactgcagctgcaattgcatatgg 11209635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University