View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19304_high_4 (Length: 344)

Name: NF19304_high_4
Description: NF19304
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19304_high_4
NF19304_high_4
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (2-316)||(2041-2355)
scaffold0234 (2-316)||(10932-11246)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (2-316)||(17684189-17684503)
chr6 (2-316)||(27380972-27381286)
chr6 (2-316)||(27471355-27471669)
chr6 (2-316)||(11651896-11652210)
chr6 (2-316)||(17691160-17691474)
chr6 (2-316)||(29309063-29309377)
chr6 (2-316)||(29316023-29316336)
chr6 (2-316)||(188697-189011)
chr6 (77-316)||(27296877-27297116)
chr6 (43-316)||(16394165-16394438)
chr6 (75-312)||(25536915-25537152)
chr6 (94-315)||(16559193-16559414)
chr6 (2-299)||(13359010-13359303)
chr6 (2-99)||(16566257-16566354)
chr6 (12-306)||(2669476-2669768)
chr6 (9-316)||(16789071-16789373)
chr6 (9-316)||(22859888-22860190)
chr6 (9-316)||(27508347-27508649)
chr6 (9-316)||(1586108-1586410)
chr6 (9-302)||(27527947-27528235)
chr6 (9-316)||(14074480-14074782)
chr6 (9-272)||(18019885-18020143)
chr6 (2-294)||(10359073-10359358)
chr6 (9-316)||(8612915-8613221)
chr6 (10-138)||(27925935-27926062)
chr6 (10-213)||(17850321-17850521)
chr6 (79-231)||(20736413-20736562)
chr6 (27-132)||(28172754-28172859)
chr6 (2-133)||(20553492-20553621)
chr6 (62-247)||(8510155-8510338)
chr6 (203-316)||(33317055-33317167)
chr6 (77-316)||(17120505-17120740)
chr6 (9-104)||(13995151-13995245)
chr6 (77-219)||(21994655-21994794)
chr6 (7-219)||(19218427-19218630)
chr6 (23-144)||(19347092-19347212)
chr6 (8-188)||(22560311-22560487)
chr6 (2-47)||(25537148-25537193)
chr6 (175-238)||(28172899-28172963)
chr6 (160-299)||(28756145-28756283)
chr6 (84-231)||(5758565-5758709)
chr6 (7-219)||(4073574-4073781)
chr6 (9-45)||(20736594-20736630)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (2-316)||(24695186-24695500)
chr5 (2-316)||(19714218-19714532)
chr5 (2-316)||(19706939-19707252)
chr5 (2-316)||(18569581-18569897)
chr5 (25-316)||(17298621-17298912)
chr5 (10-194)||(39538769-39538953)
chr5 (25-316)||(17285470-17285759)
chr5 (2-229)||(18806843-18807068)
chr5 (154-320)||(27347252-27347417)
chr5 (209-316)||(24701950-24702057)
chr5 (9-316)||(20941027-20941329)
chr5 (9-316)||(25805385-25805687)
chr5 (9-316)||(31899-32201)
chr5 (9-316)||(12789663-12789965)
chr5 (9-316)||(22941250-22941552)
chr5 (9-316)||(23545922-23546224)
chr5 (6-140)||(22546912-22547046)
chr5 (9-316)||(24933306-24933608)
chr5 (11-304)||(20100255-20100543)
chr5 (9-316)||(31096816-31097118)
chr5 (9-316)||(12764990-12765296)
chr5 (9-316)||(5097651-5097953)
chr5 (9-316)||(7865430-7865736)
chr5 (9-316)||(9811733-9812039)
chr5 (9-316)||(12703874-12704180)
chr5 (91-229)||(18806483-18806619)
chr5 (91-229)||(18806663-18806799)
chr5 (2-89)||(27347425-27347512)
chr5 (231-320)||(28719471-28719558)
chr5 (67-316)||(18829281-18829530)
chr5 (9-316)||(26245102-26245404)
chr5 (77-320)||(26129689-26129928)
chr5 (235-316)||(39538954-39539035)
chr5 (12-141)||(33477193-33477321)
chr5 (10-54)||(39535465-39535509)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (2-316)||(18262385-18262699)
chr4 (2-316)||(18269246-18269560)
chr4 (2-316)||(55612856-55613170)
chr4 (2-316)||(26963813-26964127)
chr4 (2-316)||(26970636-26970950)
chr4 (2-316)||(868770-869084)
chr4 (2-316)||(19926480-19926794)
chr4 (2-316)||(5707493-5707807)
chr4 (2-316)||(5714121-5714435)
chr4 (2-316)||(8858340-8858654)
chr4 (2-316)||(10621053-10621367)
chr4 (2-316)||(10628132-10628446)
chr4 (2-316)||(28392854-28393168)
chr4 (2-316)||(8845376-8845690)
chr4 (2-316)||(4426336-4426638)
chr4 (2-316)||(35223733-35224047)
chr4 (5-316)||(5667849-5668156)
chr4 (2-320)||(20311465-20311781)
chr4 (84-316)||(10677303-10677534)
chr4 (84-316)||(10890943-10891174)
chr4 (9-316)||(15461497-15461799)
chr4 (9-316)||(34975551-34975853)
chr4 (9-316)||(2677013-2677315)
chr4 (9-316)||(15815021-15815323)
chr4 (9-316)||(18111043-18111345)
chr4 (9-316)||(3369023-3369325)
chr4 (9-316)||(17299959-17300261)
chr4 (9-316)||(18163162-18163464)
chr4 (9-316)||(20243937-20244239)
chr4 (9-316)||(26531613-26531915)
chr4 (9-316)||(4675983-4676285)
chr4 (5-141)||(56516232-56516368)
chr4 (10-316)||(5870419-5870720)
chr4 (65-215)||(21453961-21454110)
chr4 (9-300)||(19365519-19365806)
chr4 (9-316)||(1941724-1942026)
chr4 (30-316)||(32646523-32646807)
chr4 (77-299)||(19362477-19362695)
chr4 (84-316)||(9487625-9487853)
chr4 (9-214)||(32636484-32636685)
chr4 (77-300)||(5528495-5528714)
chr4 (2-300)||(5616388-5616681)
chr4 (13-91)||(24700213-24700291)
chr4 (96-316)||(30040489-30040705)
chr4 (84-300)||(9538033-9538244)
chr4 (9-231)||(4546080-4546298)
chr4 (99-316)||(11421096-11421309)
chr4 (188-238)||(24701361-24701411)
chr4 (65-219)||(33888594-33888743)
chr4 (56-183)||(34777850-34777975)
chr4 (10-53)||(10677538-10677581)
chr4 (10-53)||(10891178-10891221)
chr4 (207-288)||(9937745-9937826)
chr4 (2-67)||(9937933-9937998)
chr4 (86-177)||(9937830-9937923)
chr4 (9-45)||(11421016-11421052)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (2-316)||(6110237-6110551)
chr3 (2-316)||(16482203-16482517)
chr3 (2-316)||(10579075-10579389)
chr3 (2-316)||(15600604-15600918)
chr3 (2-316)||(15607149-15607463)
chr3 (2-316)||(10572312-10572626)
chr3 (5-316)||(15341939-15342250)
chr3 (1-312)||(18522835-18523146)
chr3 (10-316)||(8490676-8490982)
chr3 (2-316)||(18520148-18520462)
chr3 (5-316)||(15357306-15357617)
chr3 (2-316)||(17780838-17781152)
chr3 (2-316)||(13211475-13211789)
chr3 (2-316)||(13248780-13249094)
chr3 (2-316)||(32056619-32056934)
chr3 (2-320)||(17199900-17200218)
chr3 (2-316)||(13516984-13517294)
chr3 (2-316)||(1647241-1647555)
chr3 (5-316)||(17136535-17136840)
chr3 (2-316)||(29925144-29925458)
chr3 (2-316)||(29974297-29974611)
chr3 (26-316)||(16200627-16200917)
chr3 (9-316)||(21034238-21034540)
chr3 (9-316)||(15846536-15846838)
chr3 (9-316)||(20147554-20147856)
chr3 (9-316)||(21398792-21399094)
chr3 (2-298)||(24253130-24253422)
chr3 (9-316)||(14890391-14890693)
chr3 (9-316)||(55427021-55427323)
chr3 (9-316)||(12299911-12300212)
chr3 (77-316)||(25978728-25978963)
chr3 (2-218)||(14147014-14147226)
chr3 (84-282)||(15526827-15527021)
chr3 (158-316)||(28088251-28088408)
chr3 (77-316)||(11787654-11787889)
chr3 (12-316)||(15317176-15317472)
chr3 (48-177)||(28953965-28954093)
chr3 (50-242)||(32280313-32280507)
chr3 (5-47)||(19089734-19089776)
chr3 (6-94)||(9504460-9504548)
chr3 (5-120)||(8251933-8252048)
chr3 (163-278)||(30464147-30464261)
chr3 (26-68)||(16200321-16200363)
chr3 (155-219)||(36138033-36138097)
chr3 (88-140)||(4189223-4189275)
chr3 (155-219)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (2-316)||(18252203-18252517)
chr1 (2-316)||(18532234-18532548)
chr1 (2-316)||(27131130-27131443)
chr1 (2-316)||(27310297-27310611)
chr1 (2-316)||(16358755-16359069)
chr1 (2-316)||(3855639-3855953)
chr1 (2-316)||(36816354-36816667)
chr1 (35-316)||(22641594-22641871)
chr1 (2-316)||(27277278-27277591)
chr1 (2-188)||(21171081-21171267)
chr1 (9-316)||(19706439-19706741)
chr1 (9-316)||(43802365-43802667)
chr1 (9-316)||(28134723-28135025)
chr1 (25-316)||(23507096-23507385)
chr1 (9-316)||(9456116-9456418)
chr1 (123-316)||(9916497-9916689)
chr1 (9-316)||(20391239-20391541)
chr1 (9-316)||(20779645-20779947)
chr1 (9-316)||(22670257-22670559)
chr1 (9-316)||(42816989-42817291)
chr1 (10-238)||(12014084-12014310)
chr1 (2-149)||(22657108-22657255)
chr1 (9-316)||(22612492-22612794)
chr1 (9-296)||(633934-634216)
chr1 (2-118)||(9917837-9917952)
chr1 (9-316)||(8727667-8727969)
chr1 (9-316)||(47667485-47667776)
chr1 (77-300)||(29096789-29097008)
chr1 (9-141)||(35930582-35930713)
chr1 (25-114)||(12006461-12006550)
chr1 (203-316)||(28145723-28145835)
chr1 (84-216)||(21881475-21881604)
chr1 (64-229)||(24301691-24301855)
chr1 (17-143)||(26923553-26923678)
chr1 (84-137)||(51997353-51997406)
chr1 (169-249)||(12006332-12006413)
chr1 (155-214)||(10852402-10852461)
chr1 (98-177)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (2-315)||(21940838-21941151)
chr8 (2-316)||(22171660-22171974)
chr8 (2-316)||(6094296-6094610)
chr8 (6-316)||(24642826-24643135)
chr8 (53-316)||(15326422-15326685)
chr8 (53-316)||(15506791-15507054)
chr8 (175-316)||(28548393-28548534)
chr8 (1-249)||(14983710-14983955)
chr8 (9-316)||(21969333-21969635)
chr8 (2-316)||(8371253-8371562)
chr8 (4-201)||(24797224-24797419)
chr8 (9-316)||(12562123-12562425)
chr8 (9-316)||(27007517-27007819)
chr8 (9-316)||(27014660-27014962)
chr8 (9-316)||(27880487-27880789)
chr8 (9-316)||(28020668-28020970)
chr8 (9-316)||(22130609-22130911)
chr8 (9-316)||(25611195-25611497)
chr8 (2-300)||(38232115-38232411)
chr8 (10-316)||(22659494-22659795)
chr8 (9-316)||(21916676-21916978)
chr8 (9-316)||(45534273-45534575)
chr8 (9-316)||(26240484-26240786)
chr8 (2-219)||(18835343-18835556)
chr8 (77-316)||(6430953-6431188)
chr8 (2-136)||(32872741-32872875)
chr8 (85-231)||(8781959-8782102)
chr8 (32-118)||(2375214-2375300)
chr8 (209-306)||(24796731-24796826)
chr8 (154-300)||(20535226-20535371)
chr8 (77-316)||(2962932-2963171)
chr8 (12-106)||(29645537-29645631)
chr8 (203-321)||(36970439-36970556)
chr8 (203-320)||(2375411-2375528)
chr8 (9-116)||(36970265-36970371)
chr8 (167-289)||(29645675-29645797)
chr8 (56-108)||(10920427-10920479)
chr8 (28-83)||(24535514-24535569)
chr8 (255-316)||(8968015-8968076)
chr8 (2-30)||(28555056-28555084)
chr8 (256-304)||(41368106-41368154)
chr8 (256-304)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (2-316)||(7280-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (2-316)||(6654-6968)
scaffold0390 (2-316)||(13670-13984)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (2-312)||(15152616-15152926)
chr7 (2-316)||(29327957-29328271)
chr7 (2-316)||(11535782-11536096)
chr7 (2-316)||(11542700-11543014)
chr7 (2-316)||(12750999-12751313)
chr7 (2-316)||(12738709-12739023)
chr7 (2-316)||(18561180-18561485)
chr7 (5-316)||(13392326-13392637)
chr7 (4-322)||(18257559-18257874)
chr7 (9-316)||(2204552-2204854)
chr7 (9-316)||(8464999-8465301)
chr7 (9-316)||(18400104-18400406)
chr7 (9-316)||(18407088-18407390)
chr7 (9-316)||(48808496-48808798)
chr7 (9-316)||(15729751-15730053)
chr7 (9-316)||(18139338-18139640)
chr7 (9-316)||(19230888-19231190)
chr7 (9-304)||(30254138-30254428)
chr7 (76-316)||(2365169-2365407)
chr7 (77-316)||(41680968-41681203)
chr7 (9-316)||(10668901-10669204)
chr7 (9-304)||(47166871-47167161)
chr7 (10-294)||(24443349-24443628)
chr7 (84-316)||(34128647-34128875)
chr7 (2-231)||(19388545-19388774)
chr7 (9-316)||(28130561-28130863)
chr7 (28-118)||(10235361-10235451)
chr7 (7-294)||(25845498-25845780)
chr7 (7-294)||(25845917-25846199)
chr7 (9-278)||(19393462-19393726)
chr7 (77-316)||(18259124-18259359)
chr7 (10-118)||(47833875-47833983)
chr7 (168-305)||(39112138-39112275)
chr7 (2-50)||(15148315-15148363)
chr7 (9-109)||(19859122-19859221)
chr7 (4-142)||(3132849-3132986)
chr7 (14-132)||(7662569-7662686)
chr7 (84-316)||(14591924-14592153)
chr7 (84-316)||(16011515-16011744)
chr7 (91-230)||(31190524-31190660)
chr7 (2-87)||(7396362-7396450)
chr7 (84-216)||(22969024-22969153)
chr7 (167-242)||(22948499-22948574)
chr7 (128-316)||(15169290-15169474)
chr7 (74-132)||(7396469-7396527)
chr7 (43-98)||(29983179-29983234)
chr7 (6-109)||(39111989-39112092)
chr7 (5-47)||(2365070-2365112)
chr7 (162-226)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (2-316)||(18461-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (2-320)||(25706-26024)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (2-316)||(21329968-21330282)
chr2 (2-316)||(18796679-18796993)
chr2 (2-322)||(18619977-18620296)
chr2 (10-316)||(36270347-36270650)
chr2 (6-316)||(22183206-22183513)
chr2 (45-316)||(20978091-20978360)
chr2 (4-302)||(6991847-6992146)
chr2 (25-304)||(18822279-18822556)
chr2 (9-316)||(30174377-30174679)
chr2 (9-316)||(24250032-24250334)
chr2 (9-316)||(24229215-24229517)
chr2 (2-141)||(19279461-19279600)
chr2 (10-118)||(18851977-18852085)
chr2 (77-304)||(15342014-15342237)
chr2 (10-318)||(29800468-29800775)
chr2 (153-316)||(17241034-17241196)
chr2 (15-118)||(36801899-36802003)
chr2 (9-231)||(19616435-19616653)
chr2 (169-249)||(36799745-36799826)
chr2 (84-218)||(40301034-40301164)
chr2 (11-118)||(28741220-28741326)
chr2 (249-316)||(41661694-41661761)
chr2 (86-291)||(41316305-41316506)
chr2 (84-219)||(21626824-21626955)
chr2 (155-231)||(28740910-28740986)
chr2 (80-143)||(28718943-28719006)
chr2 (5-45)||(12098609-12098649)
chr2 (2-118)||(24763751-24763866)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (2-297)||(1166-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (2-320)||(5702-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (60-316)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (9-316)||(183-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (9-316)||(3675-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (9-316)||(119730-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (9-304)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (9-278)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (9-316)||(67374-67676)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (9-316)||(39988-40290)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (9-219)||(8305-8511)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (77-316)||(26609-26844)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (2-118)||(90033-90150)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (126-316)||(102-288)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (86-288)||(8807-9005)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (84-316)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (84-219)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (10-316)||(53766-54066)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (48-139)||(45956-46051)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2355 - 2041
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2355 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 2256  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2255 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 2156  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2155 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 2056  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  2055 actccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11246 - 10932
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11246 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 11147  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11146 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 11047  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11046 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10947  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  10946 actccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17684503 - 17684189
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684503 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 17684404  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684403 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 17684304  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684303 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 17684204  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  17684203 actccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27381286 - 27380972
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381286 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 27381187  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381186 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 27381087  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381086 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 27380987  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  27380986 actccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27471669 - 27471355
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471669 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 27471570  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471569 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 27471470  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471469 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 27471370  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  27471369 actccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 11651896 - 11652210
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651896 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 11651995  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11651996 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccaccctt 11652095  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652096 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 11652195  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  11652196 actccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17691474 - 17691160
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691474 aagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 17691375  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691374 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 17691275  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691274 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 17691175  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  17691174 actccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 29309063 - 29309377
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309063 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29309162  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309163 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 29309262  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309263 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 29309362  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  29309363 actccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 29316023 - 29316336
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316023 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29316122  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316123 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 29316222  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316223 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 29316321  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  29316322 actccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 189011 - 188697
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189011 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 188912  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188911 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 188812  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  188811 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggat 188712  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    ||||||| |||||||    
T  188711 actccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 43 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394165
Alignment:
Q  43 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 142  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  143 aaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  243 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 75 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  75 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  175 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  275 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 94 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  94 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  194 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  294 tgatgggtactccatgaatcat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13359303 - 13359010
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||     
T  13359303 aagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtag 13359204  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccaccct 200  Q
    ||||||||||| ||||   |  |||||  ||||||||| | |||  ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13359203 tatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 13359109  T
Q  201 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13359108 tcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16566354 - 16566257
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566354 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  12 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 111  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  112 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 210  Q
     ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  211 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 306  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 16789071 - 16789373
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789071 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 16789169  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  16789170 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 16789266  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16789267 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 16789365  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  16789366 gaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22860190 - 22859888
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860190 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22860092  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22860091 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22859995  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22859994 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22859896  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  22859895 gaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27508649 - 27508347
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27508649 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27508551  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27508550 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27508454  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  27508453 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgat 27508355  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  27508354 gaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1586410 - 1586108
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1586410 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 1586312  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  1586311 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 1586215  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1586214 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 1586116  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  1586115 gaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27528235 - 27527947
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27528235 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27528137  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27528136 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27528040  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 302  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528039 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 14074480 - 14074782
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14074480 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttat 14074578  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | ||| ||||||    
T  14074579 aatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctg 14074675  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  14074676 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 14074774  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  14074775 gaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18020143 - 18019885
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020143 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18020045  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18020044 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18019948  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 272  Q
    ||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019947 aaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10359358 - 10359073
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||||    
T  10359358 aagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggtaa 10359261  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||| ||||| || ||  | ||| ||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||    
T  10359260 tatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctt 10359165  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 294  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359164 agacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 8612915 - 8613221
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8612915 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 8613013  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 205  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  8613014 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 8613111  T
Q  206 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 305  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  8613112 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 8613210  T
Q  306 catgaatcatg 316  Q
     ||||||||||    
T  8613211 gatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 138
Target Start/End: Original strand, 27925935 - 27926062
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  27925935 agactattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttata 27926033  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactaca 138  Q
    ||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  27926034 ttgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17850521 - 17850321
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17850521 agactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatata 17850422  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    ||||||||| ||  | | |||||||||||| |     ||| ||   |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17850421 ttggattgaccctccttaagaatactacattg----ggttttatgtaagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctg 17850326  T
Q  209 aaacc 213  Q
    |||||    
T  17850325 aaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  79 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatag 178  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | ||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  179 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 231  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172859
Alignment:
Q  27 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcat 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  127 gagaat 132  Q
    ||||||    
T  28172854 gagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20553621 - 20553492
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || |||    
T  20553621 aagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaataa 20553523  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaata 133  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20553522 tatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  62 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 160  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  || |||||  || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  161 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 247  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  203 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 302  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  303 ctccatgaatcatg 316  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||| ||| ||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | |||    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13995245 - 13995151
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995245 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 219
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 219  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218630
Alignment:
Q  7 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| || | ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  107 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 206  Q
    ||     ||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 at-----attgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tttcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  207 tgaaaccactatg 219  Q
    |||||||||||||    
T  19218618 tgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  23 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 122  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  123 tcatgagaatactacatagtaa 144  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  8 agagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 107  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  108 tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 188  Q
    || || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 25537193 - 25537148
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 47  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537193 aagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 238
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  175 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  160 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  260 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 299  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758565
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||  | |||||  | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 231  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073781
Alignment:
Q  7 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 106  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  107 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 206  Q
    ||||| |||||| |   | |||||||||||||||  | | ||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacc 4073768  T
Q  207 tgaaaccactatg 219  Q
    | |||||||||||    
T  4073769 taaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 20736630 - 20736594
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 45  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20736630 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 20736594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24695500 - 24695186
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695500 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 24695401  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695400 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 24695301  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695300 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 24695201  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  24695200 actccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19714532 - 19714218
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714532 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 19714433  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19714432 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctt 19714333  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714332 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 19714233  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    ||| |||||||||||    
T  19714232 actacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19707252 - 19706939
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19707252 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaa 19707153  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19707152 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccaccctt 19707053  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19707052 cgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggt 19706954  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  19706953 actccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18569897 - 18569581
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 99  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569897 aagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 18569798  T
Q  100 aatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18569797 aatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccaccc 18569698  T
Q  200 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569697 ttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgg 18569598  T
Q  300 gtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18569597 gtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17298912 - 17298621
Alignment:
Q  25 tagactgatgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 122  Q
    ||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17298912 tagactgatgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgaccca 17298813  T
Q  123 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta 221  Q
     |||||||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17298812 ccatgagaatactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgta 17298716  T
Q  222 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298715 ccctaggtttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 39538769 - 39538953
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538769 agactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 39538868  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 194  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538869 ttggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17285759 - 17285470
Alignment:
Q  25 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||       
T  17285759 tagactgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaca 17285660  T
Q  125 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 223  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  17285659 atgagaatactacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtacc 17285563  T
Q  224 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||| | | ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285562 ctaggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18807068 - 18806843
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18807068 aagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaa 18806969  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 200  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18806968 tgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagtt-ttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccaccct 18806872  T
Q  201 tcgacctgaaaccactatgtaccctagat 229  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806871 tcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 154 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27347417 - 27347252
Alignment:
Q  154 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347417 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgttttgtcacc 27347318  T
Q  254 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 320  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347317 attcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 20941027 - 20941329
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941027 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20941125  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20941126 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20941222  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20941223 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 20941321  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  20941322 gaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25805687 - 25805385
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805687 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25805589  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  |||||    
T  25805588 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctg 25805492  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  25805491 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 25805393  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  25805392 gaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 31899 - 32201
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 31997  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31998 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 32094  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 32193  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  32194 gaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12789965 - 12789663
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12789965 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 12789867  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| ||||||    
T  12789866 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctg 12789770  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12789769 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12789671  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  12789670 gaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 22941250 - 22941552
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941250 gagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22941348  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22941349 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22941445  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  22941446 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 22941544  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  22941545 gaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 23545922 - 23546224
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545922 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 23546020  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  23546021 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 23546117  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23546118 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 23546216  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  23546217 gaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546912
Alignment:
Q  6 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 105  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  106 tatattggattgatccgtcatgagaatactacata 140  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata 22546912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24933608 - 24933306
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24933608 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 24933510  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  24933509 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 24933413  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  24933412 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 24933314  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  24933313 gaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  11 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  111 tggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 210  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  211 accactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 31096816 - 31097118
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31096816 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttat 31096914  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31096915 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 31097011  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  31097012 aaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 31097110  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  31097111 gaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12765296 - 12764990
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12765296 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12765198  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 205  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||   |  || |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12765197 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12765100  T
Q  206 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 305  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12765099 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12765001  T
Q  306 catgaatcatg 316  Q
     ||||||||||    
T  12765000 gatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 5097651 - 5097953
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5097651 gagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttat 5097749  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||| | ||  | |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  5097750 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 5097846  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||   ||    
T  5097847 aaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtacatgat 5097945  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  5097946 gaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7865736 - 7865430
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7865736 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 7865638  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 205  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||||||||   ||||| | |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  7865637 actggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 7865540  T
Q  206 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 305  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  7865539 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 7865441  T
Q  306 catgaatcatg 316  Q
     ||||||||||    
T  7865440 gatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9812039 - 9811733
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9812039 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 9811941  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 205  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  9811940 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 9811843  T
Q  206 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 305  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  9811842 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 9811744  T
Q  306 catgaatcatg 316  Q
     ||||||||||    
T  9811743 gatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12704180 - 12703874
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12704180 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12704082  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 205  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12704081 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12703984  T
Q  206 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 305  Q
    ||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |||||||||||||||||     
T  12703983 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12703885  T
Q  306 catgaatcatg 316  Q
     ||||||||||    
T  12703884 gatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  91 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 189  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  190 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  91 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 189  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  190 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27347512 - 27347425
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 89  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347512 aagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  231 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  67 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataag 166  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  ||||||||   ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttat-gtaagttccataag 18829434  T
Q  167 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 265  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  266 tccgtaacaggatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 26245102 - 26245404
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26245102 gagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26245200  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | | |||||||||    | |||||||| ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | ||| ||||||    
T  26245201 acttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctcttagacctg 26245297  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||  ||    
T  26245298 aaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgggtacttgat 26245396  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  26245397 gaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 320  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 316
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  235 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33477321 - 33477193
Alignment:
Q  12 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 111  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||      
T  33477321 actattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcatggatat-gaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttataca 33477223  T
Q  112 ggattgatccgtcatgagaatactacatag 141  Q
      ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  33477222 taattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Original strand, 39535465 - 39535509
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatg 54  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39535465 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcataggtcatg 39535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 18262385 - 18262699
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262385 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18262484  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262485 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18262584  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262585 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18262684  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18262685 actccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 18269246 - 18269560
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269246 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18269345  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269346 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18269445  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269446 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18269545  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18269546 actccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 55612856 - 55613170
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612856 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 55612955  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612956 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 55613055  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613056 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 55613155  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  55613156 actccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 26963813 - 26964127
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26963813 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaa 26963912  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963913 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 26964012  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964013 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 26964112  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  26964113 actccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 26970636 - 26970950
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26970636 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaa 26970735  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970736 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 26970835  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970836 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 26970935  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  26970936 actccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 868770 - 869084
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868770 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 868869  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  868870 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccaccctt 868969  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868970 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 869069  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  869070 actccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19926794 - 19926480
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19926794 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaa 19926695  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926694 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 19926595  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926594 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 19926495  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  19926494 actccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 5707493 - 5707807
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5707493 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaa 5707592  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5707593 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatcctt 5707692  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707693 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 5707792  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  5707793 actccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 5714121 - 5714435
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5714121 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaa 5714220  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5714221 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatcctt 5714320  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714321 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 5714420  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  5714421 actccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 8858340 - 8858654
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8858340 aagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaa 8858439  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858440 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 8858539  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858540 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 8858639  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  8858640 actccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10621367 - 10621053
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621367 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaa 10621268  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621267 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccaccctt 10621168  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621167 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10621068  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  10621067 actccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10628446 - 10628132
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628446 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 10628347  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10628346 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccctt 10628247  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628246 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10628147  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  10628146 actccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28393168 - 28392854
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28393168 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaa 28393069  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393068 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 28392969  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28392968 caacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagt 28392869  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  28392868 actccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 8845376 - 8845690
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8845376 aagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaa 8845475  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8845476 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatcctt 8845575  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8845576 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggt 8845675  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  8845676 actccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4426638 - 4426336
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426638 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 4426539  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426538 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 4426451  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426450 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggt 4426351  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  4426350 actccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 35223733 - 35224047
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  35223733 aagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaa 35223832  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35223833 tatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctt 35223932  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35223933 tgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgt 35224032  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||| ||||||||    
T  35224033 actccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667849
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 104  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatat 5668059  T
Q  105 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 204  Q
    ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5668058 ttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttaga 5667959  T
Q  205 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667958 cctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 5667861  T
Q  305 ccatgaatcatg 316  Q
    ||| ||||||||    
T  5667860 ccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 320
Target Start/End: Original strand, 20311465 - 20311781
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20311465 aagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaa 20311564  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 200  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||   || | |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20311565 tttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttat-gtaactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 20311661  T
Q  201 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 300  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||    
T  20311662 tctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcgg 20311761  T
Q  301 tactccatgaatcatgatga 320  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  20311762 tactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 283  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  284 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 283  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  284 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 15461497 - 15461799
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461497 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15461595  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15461596 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15461692  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15461693 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15461791  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  15461792 gaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 34975551 - 34975853
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975551 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 34975649  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  34975650 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 34975746  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  34975747 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 34975845  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  34975846 gaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 2677013 - 2677315
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677013 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2677111  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2677112 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2677208  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2677209 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2677307  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  2677308 gaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 15815021 - 15815323
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15815119  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15815120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15815216  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15815217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 15815315  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  15815316 gaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18111345 - 18111043
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111345 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18111247  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18111246 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18111150  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18111149 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18111051  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  18111050 gaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3369325 - 3369023
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3369325 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 3369227  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3369226 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3369130  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  3369129 aaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 3369031  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  3369030 gaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17300261 - 17299959
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300261 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 17300163  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  17300162 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 17300066  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| | |||  ||    
T  17300065 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgat 17299967  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  17299966 gaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 18163162 - 18163464
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163162 gagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 18163260  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||| | ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  18163261 attggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 18163357  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18163358 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 18163456  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  18163457 gaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 20243937 - 20244239
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20243937 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 20244035  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  20244036 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 20244132  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20244133 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20244231  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  20244232 gaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 26531613 - 26531915
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26531613 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttat 26531711  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  26531712 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 26531808  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  26531809 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 26531907  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  26531908 gaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4676285 - 4675983
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4676285 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 4676187  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  4676186 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 4676090  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  4676089 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 4675991  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  4675990 gaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  105 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 141  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 316
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870720
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 209  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  210 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 309  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T
Q  310 aatcatg 316  Q
    |||||||    
T  5870714 aatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  65 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 164  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  165 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 215  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365806
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 207  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacct 19365714  T
Q  208 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 300  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365715 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 1941724 - 1942026
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1941724 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 1941822  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  1941823 attggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 1941919  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1941920 aaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 1942018  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  1942019 gaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646523
Alignment:
Q  30 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgag 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  130 aatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaga 228  Q
    ||| |||||||  ||| |||||  | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctgga 32646611  T
Q  229 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646610 tgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 299
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgg 299  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 283  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  284 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Original strand, 32636484 - 32636685
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32636484 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagtaatatttat 32636582  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| || |||| ||    
T  32636583 attggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctccgacgtg 32636679  T
Q  209 aaacca 214  Q
    ||||||    
T  32636680 aaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  277 atgactataaagttggttgatggg 300  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 5616388 - 5616681
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| |||||    
T  5616388 aagcattgagactattatgtatgtagattgatgaccacatctcatgggtcataaatat-gagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagtaa 5616486  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||| |||||||| |   | ||||||||||||| |||  |  |||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  |||    
T  5616487 tatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatgaaa-gtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatctt 5616583  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 300  Q
     || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616584 agatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  13 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 91  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  96 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 195  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  196 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 295  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  296 atgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 300
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttat-gaaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 283  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  284 taaagttggttgatggg 300  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 4546080 - 4546298
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4546080 gagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 4546178  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | ||||  || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||     
T  4546179 actggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctctttgaccta 4546275  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgt 231  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  4546276 aaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  99 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  199 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 298  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  299 ggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  188 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 219
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  65 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| ||  ||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  165 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 219  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  56 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 155  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |   | ||||  ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  156 agtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10677581 - 10677538
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 53  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10677581 agactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10891221 - 10891178
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 53  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10891221 agactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  207 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9937998 - 9937933
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 67  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9937998 aagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  86 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca---tagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 177  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    |||||  | |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 45
Target Start/End: Original strand, 11421016 - 11421052
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 45  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421016 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 6110237 - 6110551
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110237 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 6110336  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110337 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 6110436  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110437 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 6110536  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  6110537 actccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16482517 - 16482203
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482517 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 16482418  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482417 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 16482318  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482317 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 16482218  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  16482217 actccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10579389 - 10579075
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579389 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 10579290  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579289 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 10579190  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579189 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10579090  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  10579089 actccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15600918 - 15600604
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600918 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 15600819  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600818 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 15600719  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600718 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 15600619  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    || ||||||||||||    
T  15600618 accccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15607463 - 15607149
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607463 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 15607364  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607363 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 15607264  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607263 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 15607164  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    || ||||||||||||    
T  15607163 accccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10572626 - 10572312
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572626 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 10572527  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572526 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 10572427  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572426 cgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 10572327  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  10572326 actccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15342250 - 15341939
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15342250 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatat 15342151  T
Q  105 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342150 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 15342051  T
Q  205 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342050 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 15341951  T
Q  305 ccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||    
T  15341950 ccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 18522835 - 18523146
Alignment:
Q  1 taagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522835 taagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 18522934  T
Q  101 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18522935 atatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccct 18523034  T
Q  201 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523035 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 18523134  T
Q  301 tactccatgaat 312  Q
    ||||||||||||    
T  18523135 tactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 10 - 316
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490982
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  210 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  310 aatcatg 316  Q
    |||||||    
T  8490976 aatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 18520148 - 18520462
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520148 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18520247  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520248 tatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18520347  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520348 cgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggt 18520447  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18520448 actccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15357617 - 15357306
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15357617 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatat 15357518  T
Q  105 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 204  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357517 ttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 15357418  T
Q  205 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357417 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 15357318  T
Q  305 ccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||    
T  15357317 ccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17781152 - 17780838
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781152 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 17781053  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781052 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 17780953  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780952 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggt 17780853  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  17780852 actccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 13211475 - 13211789
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211475 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 13211574  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211575 tatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 13211674  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211675 cgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 13211774  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  13211775 actccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 13248780 - 13249094
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248780 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 13248879  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248880 tatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 13248979  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248980 cgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 13249079  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  13249080 actccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32056934 - 32056619
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagta 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32056934 aagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagta 32056835  T
Q  101 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056834 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 32056735  T
Q  201 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32056734 tcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgga 32056635  T
Q  301 tactccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  32056634 tactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17200218 - 17199900
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17200218 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtag 17200119  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200118 tatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 17200019  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200018 cgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggt 17199919  T
Q  302 actccatgaatcatgatga 320  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17199918 actccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 13516984 - 13517294
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516984 aagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 13517083  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  13517084 tatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccaccctt 13517179  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13517180 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggt 13517279  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  13517280 actccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1647555 - 1647241
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1647555 aagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaa 1647456  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    | |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647455 tgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccctt 1647356  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1647355 cgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagt 1647256  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  1647255 actccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 17136535 - 17136840
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  17136535 catagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatat 17136628  T
Q  105 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 204  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136629 ttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 17136728  T
Q  205 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17136729 cttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatact 17136828  T
Q  305 ccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||    
T  17136829 ccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 29925144 - 29925458
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925144 aagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29925243  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29925244 tatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatt 29925343  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  29925344 tgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggat 29925443  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||| ||||||||    
T  29925444 actccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 29974297 - 29974611
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974297 aagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29974396  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29974397 tatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatt 29974496  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  29974497 tgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggat 29974596  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||| ||||||||    
T  29974597 actccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Original strand, 16200627 - 16200917
Alignment:
Q  26 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtca 125  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  16200627 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccacca 16200726  T
Q  126 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 225  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16200727 tgagaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccct 16200826  T
Q  226 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200827 agatgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 21034238 - 21034540
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034238 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21034336  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21034337 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21034433  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21034434 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 21034532  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  21034533 gaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15846838 - 15846536
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846838 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15846740  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15846739 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15846643  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15846642 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15846544  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  15846543 gaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20147856 - 20147554
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147856 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20147758  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20147757 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20147661  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20147660 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20147562  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  20147561 gaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399094
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  21399087 gaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24253422 - 24253130
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| |    
T  24253422 aagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtta 24253323  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  24253322 tatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-catt 24253227  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 298  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| |||||||    
T  24253226 cgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890693
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  14890686 gaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 55427021 - 55427323
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55427021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 55427119  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  55427120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 55427216  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  55427217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 55427315  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  55427316 gaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 12299911 - 12300212
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12299911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagtaatatttat 12300008  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12300009 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12300105  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12300106 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12300204  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  12300205 gaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 14147014 - 14147226
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| ||    
T  14147014 aagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggaggaa 14147112  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| |||    
T  14147113 tatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactctt 14147209  T
Q  202 cgacctgaaaccactat 218  Q
     ||||||||||||||||    
T  14147210 agacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 282
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527021
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 282  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 316
Target Start/End: Original strand, 28088251 - 28088408
Alignment:
Q  158 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 257  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || || |||||||  ||||||    
T  28088251 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagggctttgttgccattc 28088349  T
Q  258 aaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
     ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088350 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gatattttcataagatattctcac 11787750  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317176
Alignment:
Q  12 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 111  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  112 ggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 211  Q
     ||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaa 15317277  T
Q  212 ccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 311  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  15317276 ccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaa 15317181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 177
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  48 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 146  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  147 gttataaaaagtgtcataagatattctcata 177  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 242
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  50 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 149  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  150 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctagatgttggagtcgagt 242  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 19089776 - 19089734
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089776 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Original strand, 9504460 - 9504548
Alignment:
Q  6 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 94  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  9504460 atagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaatatta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 104  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  105 ttatattggattgatc 120  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 278
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  163 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 262  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  263 ttgtccgtaacaggat 278  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 68
Target Start/End: Original strand, 16200321 - 16200363
Alignment:
Q  26 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 68  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200321 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  155 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 219  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 140
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189275
Alignment:
Q  88 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacata 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata 4189275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  155 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 219  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 18252203 - 18252517
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252203 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18252302  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252303 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18252402  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252403 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18252502  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18252503 actccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18532548 - 18532234
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532548 aagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18532449  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532448 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18532349  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532348 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18532249  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18532248 actccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27131443 - 27131130
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131443 aagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 27131344  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131343 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 27131244  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131243 cgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 27131145  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  27131144 actccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27310611 - 27310297
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27310611 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaa 27310512  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27310511 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctt 27310412  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310411 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 27310312  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  27310311 actccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16359069 - 16358755
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16359069 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaa 16358970  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358969 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 16358870  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16358869 cgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggt 16358770  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  16358769 actccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3855953 - 3855639
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3855953 aagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaa 3855854  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3855853 tatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccatt 3855754  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3855753 cgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggt 3855654  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  3855653 actccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36816667 - 36816354
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36816667 aagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaa 36816568  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36816567 tatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctt 36816469  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  36816468 tgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggt 36816369  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    ||||||  |||||||    
T  36816368 actccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641594
Alignment:
Q  35 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatac 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  135 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  235 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27277591 - 27277278
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27277591 aagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaa 27277492  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||| | |||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27277491 tatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctt 27277393  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  27277392 tgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggt 27277293  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    ||||||| |||||||    
T  27277292 actccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21171267 - 21171081
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171267 aagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 21171168  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171167 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19706741 - 19706439
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706741 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19706643  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19706642 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19706546  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19706545 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 19706447  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  19706446 gaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43802667 - 43802365
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802667 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 43802569  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  43802568 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 43802472  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  43802471 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 43802373  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  43802372 gaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28135025 - 28134723
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135025 gagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28134927  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28134926 attggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28134830  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28134829 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 28134731  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  28134730 gaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 316
Target Start/End: Original strand, 23507096 - 23507385
Alignment:
Q  25 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  23507096 tagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccacc 23507195  T
Q  125 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 223  Q
    || ||||| ||||| || |     | |||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23507196 attagaatgctacagagaacgttgtgtaaaaag---cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtacc 23507292  T
Q  224 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507293 ctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 9456116 - 9456418
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456116 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 9456214  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  9456215 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 9456311  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  9456312 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 9456410  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  9456411 gaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916497
Alignment:
Q  123 tcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgt 220  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgt 9916593  T
Q  221 accctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916592 accctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20391541 - 20391239
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20391541 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttat 20391443  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| ||||||    
T  20391442 attggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctg 20391346  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20391345 aaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20391247  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  20391246 gaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20779947 - 20779645
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779947 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20779849  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20779848 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20779752  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20779751 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20779653  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  20779652 gaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22670559 - 22670257
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670559 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22670461  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22670460 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22670364  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22670363 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22670265  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  22670264 gaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42817291 - 42816989
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817291 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 42817193  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  42817192 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 42817096  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  42817095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 42816997  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  42816996 gaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12014310 - 12014084
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  12014310 agaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaata 12014211  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | ||||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||     
T  12014210 ttggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaaccta 12014114  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtc 238  Q
    ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014113 aaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22657255 - 22657108
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22657255 aagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaa 22657156  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 149  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22657155 tatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 22612492 - 22612794
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22612492 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatattttt 22612590  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22612591 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22612687  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||    
T  22612688 aaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgat 22612786  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  22612787 gaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 296
Target Start/End: Original strand, 633934 - 634216
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  633934 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 634032  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | |||||| | ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  634033 actggattaacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 634129  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 296  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  634130 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9917952 - 9917837
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9917952 aagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcacatctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaa 9917854  T
Q  102 tatttatattggattga 118  Q
    |||||||||||||||||    
T  9917853 tatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 8727667 - 8727969
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8727667 gagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagtaatatttat 8727765  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| ||| ||||||    
T  8727766 actggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactcttagacctg 8727862  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
     ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||| | |||||||||  ||    
T  8727863 gaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgggtacttgat 8727961  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  8727962 gaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47667776 - 47667485
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47667776 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttat 47667678  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||           |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  47667677 attggattgacccaccgtga-----------agt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 47667592  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  47667591 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 47667493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 300
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29097008
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaatagg 29096984  T
Q  277 atgactataaagttggttgatggg 300  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  29096985 ataaccataacgttggttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Original strand, 35930582 - 35930713
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35930582 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 35930680  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatag 141  Q
    |||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930681 attggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12006550 - 12006461
Alignment:
Q  25 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 114  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006550 tagactgatgatcacaacttacgaatcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  203 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 302  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  303 ctccatgaatcatg 316  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 216  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301691
Alignment:
Q  64 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 162  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  163 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  17 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 116  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  117 gatccgtcatgagaatactacatagta 143  Q
    || ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 137
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactac 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  169 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 249  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  155 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 214  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  98 gtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 177  Q
    |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttat-gaaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Original strand, 21940838 - 21941151
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940838 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 21940937  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940938 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 21941037  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941038 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 21941137  T
Q  302 actccatgaatcat 315  Q
    ||||||||||||||    
T  21941138 actccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 22171660 - 22171974
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22171660 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaa 22171759  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171760 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 22171859  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171860 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 22171959  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  22171960 actccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 6094296 - 6094610
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094296 aagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 6094395  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094396 tatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 6094495  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6094496 cgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggt 6094595  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  6094596 actccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 316
Target Start/End: Original strand, 24642826 - 24643135
Alignment:
Q  6 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642826 atagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 24642925  T
Q  106 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 205  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24642926 tatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaa 24643024  T
Q  206 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643025 ctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 24643124  T
Q  306 catgaatcatg 316  Q
    |||||||||||    
T  24643125 catgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 53 - 316
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  53 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  153 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  253 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 53 - 316
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  53 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttata 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  153 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  253 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 175 - 316
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  175 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  275 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14983955 - 14983710
Alignment:
Q  1 taagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14983955 taagaatagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagta 14983856  T
Q  101 atatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 199  Q
    ||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  14983855 ata-ttatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtcc 14983760  T
Q  200 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983759 ttcgacctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969635
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21969431  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21969432 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21969528  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21969529 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21969627  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  21969628 gaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8371562 - 8371253
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  8371562 aagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagtaa 8371464  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||    
T  8371463 tatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctctt 8371367  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  8371366 agacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgggt 8371268  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||  ||||||||||    
T  8371267 acttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  4 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 103  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  104 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 12562123 - 12562425
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562123 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 12562221  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12562222 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12562318  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12562319 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 12562417  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  12562418 gaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27007819 - 27007517
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007819 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27007721  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27007720 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27007624  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27007623 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27007525  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  27007524 gaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27014962 - 27014660
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014962 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27014864  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27014863 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27014767  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27014766 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27014668  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  27014667 gaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27880789 - 27880487
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880789 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27880691  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27880690 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27880594  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27880593 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27880495  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  27880494 gaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28020970 - 28020668
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020970 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28020872  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28020871 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28020775  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  28020774 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 28020676  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  28020675 gaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22130911 - 22130609
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22130813  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22130812 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 22130716  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22130715 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22130617  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  22130616 gaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 25611195 - 25611497
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611195 gagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25611293  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| ||||||    
T  25611294 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctg 25611390  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||    
T  25611391 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgat 25611489  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  25611490 gaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38232411 - 38232115
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||    
T  38232411 aagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaa 38232312  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||    
T  38232311 tatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcct 38232215  T
Q  201 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 300  Q
      ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232214 cagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659494
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 209  Q
     |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  210 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 309  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T
Q  310 aatcatg 316  Q
    |||||||    
T  22659500 aatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 21916676 - 21916978
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916676 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttat 21916774  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21916775 attggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21916871  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||  ||    
T  21916872 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgat 21916970  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  21916971 gaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45534575 - 45534273
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45534575 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 45534477  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  45534476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 45534380  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  45534379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 45534281  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  45534280 gaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 26240484 - 26240786
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26240484 gagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26240582  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | ||| |||||     
T  26240583 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctcttagaccta 26240679  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  26240680 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 26240778  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  26240779 gaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 18835343 - 18835556
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  18835343 aagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagtaa 18835441  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |||    
T  18835442 tatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaa-tgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactctt 18835538  T
Q  202 cgacctgaaaccactatg 219  Q
     |||||||||||| ||||    
T  18835539 agacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32872875 - 32872741
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||    
T  32872875 aagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataa 32872776  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatacta 136  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32872775 tatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781959
Alignment:
Q  85 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  185 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 231  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Original strand, 2375214 - 2375300
Alignment:
Q  32 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 118  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2375214 atgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattga 2375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  154 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 253  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  254 attcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaa---agtgtcataagatattct 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  |||| | |   | ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  174 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 273  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  274 aggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  12 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 106  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 321
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  203 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 302  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  303 ctccatgaatcatgatgat 321  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 320
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  203 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 302  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  303 ctccatgaatcatgatga 320  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  109 attggatt 116  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 289
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  167 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  267 ccgtaacaggatgactataaagt 289  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  56 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Original strand, 24535514 - 24535569
Alignment:
Q  28 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 83  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535514 actgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  255 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 30
Target Start/End: Original strand, 28555056 - 28555084
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagact 30  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555056 aagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  256 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  256 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 7280 - 7594
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7280 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 7379  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7380 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 7479  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480 cgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 7579  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  7580 actccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6968 - 6654
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6968 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 6869  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6868 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 6769  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6768 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggt 6669  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  6668 actccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13984 - 13670
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13984 aagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaa 13885  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13884 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 13785  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13784 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggtt 13685  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  13684 actccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 312
Target Start/End: Original strand, 15152616 - 15152926
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152616 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 15152715  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152716 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 15152815  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152816 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 15152915  T
Q  302 actccatgaat 312  Q
    |||||||||||    
T  15152916 actccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 29327957 - 29328271
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327957 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 29328056  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328057 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 29328156  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29328157 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggt 29328256  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  29328257 actccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11536096 - 11535782
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11536096 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaa 11535997  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  11535996 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacatt 11535897  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535896 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 11535797  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  11535796 actccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11543014 - 11542700
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543014 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 11542915  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542914 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaccctt 11542815  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542814 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 11542715  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  11542714 actccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 12750999 - 12751313
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12750999 aagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaa 12751098  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751099 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 12751198  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751199 cgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggat 12751298  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  12751299 actccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 12738709 - 12739023
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  12738709 aagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataa 12738808  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12738809 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgtt 12738908  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738909 cgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 12739008  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  12739009 actccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 18561180 - 18561485
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561180 aagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18561279  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  18561280 tatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccaccctt 18561370  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18561371 cgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggt 18561470  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    ||| || ||||||||    
T  18561471 actgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 13392326 - 13392637
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 104  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  13392326 catagagactattgtattggtagatcgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatat 13392425  T
Q  105 ttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 204  Q
    ||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13392426 ttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttga 13392525  T
Q  205 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13392526 cctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtact 13392625  T
Q  305 ccatgaatcatg 316  Q
    ||||||||||||    
T  13392626 ccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18257874 - 18257559
Alignment:
Q  4 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 103  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257874 gcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 18257775  T
Q  104 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcg 203  Q
    ||||||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||  | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |    
T  18257774 tttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttag 18257677  T
Q  204 acctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtac 303  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257676 acctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtac 18257578  T
Q  304 tccatgaatcatgatgatg 322  Q
    |  | |||||||| |||||    
T  18257577 ttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 2204552 - 2204854
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204552 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2204650  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2204651 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2204747  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2204748 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2204846  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  2204847 gaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465301
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  8465294 gaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 18400104 - 18400406
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400104 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18400202  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18400203 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18400299  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18400300 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18400398  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  18400399 gaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 18407088 - 18407390
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407088 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18407186  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18407187 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18407283  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18407284 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18407382  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  18407383 gaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48808798 - 48808496
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808798 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 48808700  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  48808699 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 48808603  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  48808602 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 48808504  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  48808503 gaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 15729751 - 15730053
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15729751 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 15729849  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  15729850 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 15729946  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15729947 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 15730045  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  15730046 gaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18139640 - 18139338
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18139640 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 18139542  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18139541 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18139445  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18139444 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgat 18139346  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  18139345 gaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 19230888 - 19231190
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230888 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19230986  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19230987 actggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19231083  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19231084 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 19231182  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  19231183 gaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 30254138 - 30254428
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254138 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 30254236  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| ||    
T  30254237 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttg 30254333  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254334 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 316
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  76 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||   |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  176 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 274  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  275 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10669204 - 10668901
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10669204 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 10669106  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 207  Q
    | | |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | | ||| |||||    
T  10669105 actagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacct 10669009  T
Q  208 gaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcca 307  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |    
T  10669008 gaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttga 10668910  T
Q  308 tgaatcatg 316  Q
    |||||||||    
T  10668909 tgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47167161 - 47166871
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47167161 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagtaatatttat 47167063  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  47167062 actagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 47166966  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  47166965 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 209  Q
     | |||| | ||  | ||||| ||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  210 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 294  Q
    ||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||   ||||| | |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 283  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  284 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 19388545 - 19388774
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || ||||||||||||||||||    
T  19388545 aagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagtaa 19388643  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 199  Q
    |||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |    
T  19388644 tatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttat-gaaagtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccactc 19388742  T
Q  200 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 231  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388743 ttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 28130561 - 28130863
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28130561 gagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagtaatatttat 28130659  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | |||||||| ||    |||||||| |||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||    
T  28130660 actggattgacccactgtgagaatattacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattcttagacctg 28130756  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    ||| |||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28130757 aaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttaat 28130855  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  28130856 gaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235451
Alignment:
Q  28 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattga 10235451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  7 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 106  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  107 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 206  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  207 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 294  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  7 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 106  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  107 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 206  Q
    ||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  207 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 294  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19393726 - 19393462
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19393726 gagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19393628  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | | |||||| |   | |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19393627 actagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctg 19393531  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 278  Q
    || ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393530 aatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  110 ttggattga 118  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 305
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  168 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  268 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 305  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 15148315 - 15148363
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148315 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Original strand, 19859122 - 19859221
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859122 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19859220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 3132849 - 3132986
Alignment:
Q  4 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 103  Q
    ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||    
T  3132849 gcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taata 3132947  T
Q  104 tttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 142  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132948 tttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  14 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 113  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  114 attgatccgtcatgagaat 132  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592153
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 283  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 14592120  T
Q  284 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  14592121 taacgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011744
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgacta 283  Q
     |  |||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 16011711  T
Q  284 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||| ||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  16011712 taatgttggctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190524
Alignment:
Q  91 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 190  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||   ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  191 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 230  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Original strand, 7396362 - 7396450
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgta---ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatata 87  Q
    ||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396362 aagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 216
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 216  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  167 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 242  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  128 agaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 227  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  228 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 132
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  74 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 132  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 98
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  43 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Original strand, 39111989 - 39112092
Alignment:
Q  6 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 105  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39111989 atagagactattataagggtagactaatggtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatt 39112088  T
Q  106 tata 109  Q
    ||||    
T  39112089 tata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 47
Target Start/End: Original strand, 2365070 - 2365112
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 47  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365070 catagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  162 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 226  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 18461 - 18774
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18560  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 18660  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18661 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggt 18759  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18760 actccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26024 - 25706
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024 aagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaa 25925  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25924 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 25825  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25824 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 25725  T
Q  302 actccatgaatcatgatga 320  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  25724 actccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21330282 - 21329968
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21330282 aagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaa 21330183  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330182 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 21330083  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  21330082 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatgggg 21329983  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  21329982 actccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 18796679 - 18796993
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796679 aagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18796778  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18796779 tatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccaccctt 18796878  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796879 cgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggt 18796978  T
Q  302 actccatgaatcatg 316  Q
    || ||||||||||||    
T  18796979 acaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 18619977 - 18620296
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18619977 aagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaa 18620076  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    |||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  18620077 tatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttat-gaaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctt 18620175  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 301  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18620176 tgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggt 18620275  T
Q  302 actccatgaatcatgatgatg 322  Q
    ||||||  ||||||| |||||    
T  18620276 actccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 316
Target Start/End: Original strand, 36270347 - 36270650
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36270347 agactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttata 36270446  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||  || |||||||||  |||||||  ||| ||||  |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  36270447 ttggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-cacccttcgaccta 36270542  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  36270543 aaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaat 36270642  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  36270643 gaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22183513 - 22183206
Alignment:
Q  6 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 105  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22183513 atagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-t 22183415  T
Q  106 tatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcga 204  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||   || |||||  |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22183414 tatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttga 22183318  T
Q  205 cctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    ||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  22183317 cctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatt 22183218  T
Q  305 ccatgaatcatg 316  Q
      ||||||||||    
T  22183217 tgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 316
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978360
Alignment:
Q  45 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  145 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 243  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  244 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  4 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattat-gtaagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  201 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 299  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 304
Target Start/End: Original strand, 18822279 - 18822556
Alignment:
Q  25 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtc 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |    
T  18822279 tagactgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgcc 18822378  T
Q  125 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacc 223  Q
    |||||| |  ||||||  ||| |||||  ||||  ||  |||  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18822379 atgagattgttacata--aaacgttatgtaaag-atctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtacc 18822475  T
Q  224 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822476 ctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 30174377 - 30174679
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174377 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 30174475  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  30174476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 30174572  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  30174573 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 30174671  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  30174672 gaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24250334 - 24250032
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250334 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 24250236  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  24250235 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 24250139  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  24250138 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 24250040  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  24250039 gaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24229517 - 24229215
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229517 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 24229419  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| | | ||    
T  24229418 actggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttg 24229322  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||    
T  24229321 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgat 24229223  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  24229222 gaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 19279461 - 19279600
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19279461 aagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaa 19279560  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 141  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279561 tatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18852085 - 18851977
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18852085 agactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttata 18851986  T
Q  110 ttggattga 118  Q
    |||||||||    
T  18851985 ttggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800775
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  107 atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 206  Q
    ||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| |||     
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagact 29800664  T
Q  207 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 306  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||      
T  29800665 tgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatgggcacttg 29800763  T
Q  307 atgaatcatgat 318  Q
    | ||||||||||    
T  29800764 acgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  153 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  253 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  15 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 113  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  114 attga 118  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616653
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
      || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctg 19616630  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgt 231  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  19616631 aaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  169 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa--gtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactat 218  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  11 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  111 tggattga 118  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 316
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  249 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  86 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  186 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 285  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  286 aagttg 291  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||   ||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 219  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  155 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  80 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 12098649 - 12098609
Alignment:
Q  5 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 45  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098649 catagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24763866 - 24763751
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  24763866 aagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagtaa 24763768  T
Q  102 tatttatattggattga 118  Q
    |||||||| ||||||||    
T  24763767 tatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Original strand, 1166 - 1461
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  1166 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaa 1265  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 201  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266 tatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 1365  T
Q  202 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1366 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 320
Target Start/End: Original strand, 5702 - 6013
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5702 aagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 5801  T
Q  102 tatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca-ccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| ||     
T  5802 tatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcct 5892  T
Q  200 ttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5893 ttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 5992  T
Q  300 gtactccatgaatcatgatga 320  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5993 gtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 60 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  60 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  160 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  260 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 183 - 485
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 gagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 281  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  282 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 378  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 477  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  478 gaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3675
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 3879  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3878 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3782  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  3781 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 3683  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  3682 gaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 119730 - 120032
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119730 gagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 119828  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  119829 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 119925  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  119926 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 120024  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  120025 gaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13251 - 12961
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13251 gagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 13153  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  13152 accggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctg 13056  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 304  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13055 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 130526 - 130262
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130526 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 130428  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  130427 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 130331  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 278  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130330 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 67676 - 67374
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67676 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 67578  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  67577 attggattgacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 67481  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  67480 aaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 67382  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  67381 gaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39988
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |  ||||||| ||    ||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  209 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 308  Q
    |||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  309 gaatcatg 316  Q
    ||||||||    
T  39995 gaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 8305 - 8511
Alignment:
Q  9 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8403  T
Q  109 attggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 208  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8404 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8500  T
Q  209 aaaccactatg 219  Q
    |||||||||||    
T  8501 aaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 316
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  77 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  177 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 276  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  277 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 90150 - 90033
Alignment:
Q  2 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||    
T  90150 aagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtata 90051  T
Q  101 atatttatattggattga 118  Q
    | ||||||||||||||||    
T  90050 acatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 316
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  126 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 225  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  226 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 288
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  86 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| |||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  186 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactata 285  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||   |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  181 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatga 280  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  281 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 316  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  84 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 183  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaag-gtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  184 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 219  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 316
Target Start/End: Original strand, 53766 - 54066
Alignment:
Q  10 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 109  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  110 ttggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 209  Q
     ||| |||| ||  | ||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||   || || | || |||    | ||| |||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcaacatgttaatagtttatattgctcttagacctga 53961  T
Q  210 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 309  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  53962 aaccactatgatccctaggtgt-ggactcaagtgctttatg-ccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 54059  T
Q  310 aatcatg 316  Q
    |||||||    
T  54060 aatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 139
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  48 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataa----atattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 139  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University