View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19305_low_25 (Length: 389)

Name: NF19305_low_25
Description: NF19305
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19305_low_25
NF19305_low_25
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (20-278)||(43302454-43302712)
chr8 (22-323)||(31449634-31449931)
chr8 (20-246)||(4238108-4238330)
chr8 (20-246)||(4242847-4243069)
chr8 (69-323)||(17025965-17026220)
chr8 (69-323)||(17556457-17556712)
chr8 (36-323)||(1910746-1911034)
chr8 (69-323)||(40125696-40125950)
chr8 (22-323)||(44925687-44925988)
chr8 (22-323)||(19166664-19166966)
chr8 (22-323)||(33416577-33416878)
chr8 (22-323)||(36683609-36683911)
chr8 (122-323)||(1807502-1807704)
chr8 (22-323)||(23548393-23548697)
chr8 (37-286)||(15951333-15951584)
chr8 (169-323)||(18876278-18876432)
chr8 (169-323)||(34118496-34118650)
chr8 (89-323)||(2965660-2965895)
chr8 (22-323)||(28559429-28559719)
chr8 (36-323)||(38182033-38182302)
chr8 (36-323)||(15875461-15875733)
chr8 (36-245)||(28564598-28564807)
chr8 (36-245)||(28572221-28572430)
chr8 (44-287)||(10933497-10933747)
chr8 (81-192)||(25367808-25367915)
chr8 (85-192)||(34818531-34818634)
chr8 (191-323)||(17953806-17953938)
chr8 (81-192)||(8331185-8331292)
chr8 (81-192)||(37771871-37771978)
chr8 (20-116)||(14035670-14035766)
chr8 (89-323)||(24090657-24090887)
chr8 (51-153)||(29220550-29220649)
chr8 (331-378)||(43302920-43302967)
chr8 (219-322)||(12820370-12820472)
chr8 (22-246)||(24673097-24673320)
chr8 (255-323)||(43302716-43302784)
chr8 (57-220)||(17020470-17020635)
chr8 (57-220)||(17550907-17551072)
chr8 (36-131)||(18876166-18876258)
chr8 (256-323)||(2470005-2470070)
chr8 (72-116)||(12820560-12820604)
chr8 (256-323)||(2355458-2355524)
chr8 (191-286)||(7902629-7902724)
chr8 (20-75)||(17953735-17953790)
chr8 (178-260)||(5884080-5884162)
chr8 (36-102)||(27415753-27415819)
chr8 (22-111)||(5884209-5884298)
chr8 (174-286)||(27415577-27415689)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (20-323)||(32461314-32461614)
chr5 (20-323)||(12044905-12045204)
chr5 (20-323)||(36937278-36937576)
chr5 (20-323)||(36942032-36942330)
chr5 (20-323)||(41996695-41996988)
chr5 (20-323)||(42001464-42001757)
chr5 (20-323)||(556725-557023)
chr5 (20-323)||(561497-561795)
chr5 (20-323)||(6155179-6155484)
chr5 (68-323)||(7451788-7452039)
chr5 (69-323)||(39523079-39523333)
chr5 (36-323)||(29167750-29168038)
chr5 (69-323)||(39518440-39518694)
chr5 (150-323)||(3665962-3666134)
chr5 (22-323)||(26667302-26667604)
chr5 (22-323)||(26938899-26939201)
chr5 (22-323)||(35679639-35679940)
chr5 (22-306)||(37248567-37248843)
chr5 (68-323)||(12103055-12103310)
chr5 (22-307)||(36428755-36429041)
chr5 (69-286)||(4871988-4872207)
chr5 (115-323)||(12501752-12501964)
chr5 (22-323)||(36423667-36423969)
chr5 (22-323)||(40147925-40148227)
chr5 (68-323)||(10759631-10759885)
chr5 (169-323)||(41587073-41587225)
chr5 (125-323)||(12041795-12041997)
chr5 (69-323)||(11981090-11981343)
chr5 (22-323)||(20180826-20181128)
chr5 (65-318)||(9911188-9911433)
chr5 (115-323)||(6514453-6514666)
chr5 (36-323)||(15414658-15414946)
chr5 (20-323)||(16116009-16116314)
chr5 (81-192)||(13301310-13301417)
chr5 (20-116)||(3666143-3666239)
chr5 (115-246)||(9726541-9726676)
chr5 (84-192)||(21323797-21323901)
chr5 (81-192)||(31731703-31731810)
chr5 (22-116)||(7086596-7086690)
chr5 (68-318)||(12102639-12102891)
chr5 (20-83)||(23977357-23977420)
chr5 (169-233)||(34707449-34707513)
chr5 (72-192)||(1429814-1429929)
chr5 (255-323)||(37652828-37652895)
chr5 (255-307)||(37550030-37550081)
chr5 (37-114)||(14013306-14013383)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (23-323)||(23866098-23866394)
chr7 (20-323)||(9650729-9651032)
chr7 (20-323)||(44510438-44510742)
chr7 (21-323)||(8076080-8076373)
chr7 (22-323)||(44422900-44423202)
chr7 (20-308)||(9008208-9008484)
chr7 (68-323)||(4930263-4930518)
chr7 (69-292)||(26286956-26287180)
chr7 (59-307)||(12799456-12799705)
chr7 (36-323)||(13314014-13314301)
chr7 (22-323)||(27238272-27238574)
chr7 (155-288)||(25543260-25543393)
chr7 (20-323)||(4579538-4579846)
chr7 (34-288)||(30258164-30258420)
chr7 (22-268)||(42626354-42626602)
chr7 (20-192)||(19640458-19640626)
chr7 (23-323)||(8268323-8268625)
chr7 (22-322)||(26341230-26341537)
chr7 (69-323)||(3880027-3880280)
chr7 (22-323)||(21671225-21671527)
chr7 (81-192)||(27256402-27256509)
chr7 (22-285)||(10388131-10388395)
chr7 (169-295)||(12254136-12254262)
chr7 (87-323)||(13142729-13142966)
chr7 (126-323)||(6590843-6591048)
chr7 (83-192)||(40865183-40865288)
chr7 (191-323)||(23246867-23246998)
chr7 (22-228)||(3045679-3045887)
chr7 (169-323)||(3284757-3284912)
chr7 (98-295)||(3357470-3357670)
chr7 (36-116)||(23246728-23246808)
chr7 (155-245)||(23318092-23318181)
chr7 (180-262)||(45748562-45748647)
chr7 (38-116)||(2628876-2628954)
chr7 (198-323)||(29150964-29151088)
chr7 (85-114)||(13344884-13344913)
chr7 (37-155)||(15642379-15642495)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (24-323)||(10160495-10160789)
chr2 (20-323)||(35601952-35602251)
chr2 (123-323)||(30658293-30658492)
chr2 (36-323)||(9189584-9189868)
chr2 (22-323)||(9180491-9180789)
chr2 (22-323)||(1934756-1935058)
chr2 (22-291)||(25497089-25497359)
chr2 (69-323)||(30650959-30651213)
chr2 (69-306)||(29677814-29678052)
chr2 (36-323)||(12796955-12797243)
chr2 (20-242)||(17453346-17453564)
chr2 (69-323)||(7737661-7737916)
chr2 (36-323)||(25478075-25478362)
chr2 (22-307)||(31326785-31327081)
chr2 (22-323)||(19892231-19892531)
chr2 (138-290)||(30631641-30631797)
chr2 (180-323)||(29677411-29677554)
chr2 (22-323)||(18344461-18344754)
chr2 (20-192)||(19538545-19538713)
chr2 (22-323)||(28603328-28603635)
chr2 (20-191)||(28855166-28855332)
chr2 (20-307)||(19094254-19094544)
chr2 (158-306)||(19578316-19578462)
chr2 (169-323)||(21523636-21523785)
chr2 (22-323)||(40847362-40847660)
chr2 (212-323)||(42926714-42926824)
chr2 (33-323)||(17545073-17545363)
chr2 (81-192)||(6297714-6297821)
chr2 (23-116)||(30629088-30629181)
chr2 (217-323)||(35638957-35639062)
chr2 (23-70)||(30619145-30619192)
chr2 (36-109)||(13291309-13291382)
chr2 (172-288)||(13291455-13291571)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (20-323)||(13521754-13522057)
chr4 (20-268)||(8649396-8649641)
chr4 (20-268)||(8661203-8661448)
chr4 (22-323)||(37259640-37259942)
chr4 (22-323)||(37264327-37264629)
chr4 (36-323)||(19102007-19102295)
chr4 (20-193)||(47574816-47574986)
chr4 (22-322)||(16421060-16421361)
chr4 (22-323)||(31729154-31729452)
chr4 (69-323)||(33463166-33463421)
chr4 (69-315)||(48276459-48276701)
chr4 (69-323)||(8030286-8030541)
chr4 (71-323)||(55251749-55252003)
chr4 (22-323)||(47244278-47244580)
chr4 (22-323)||(5927982-5928284)
chr4 (22-323)||(5271186-5271484)
chr4 (115-323)||(31269064-31269276)
chr4 (22-322)||(12823664-12823959)
chr4 (115-323)||(31273551-31273763)
chr4 (22-323)||(13059440-13059741)
chr4 (53-322)||(19540955-19541225)
chr4 (36-307)||(8693757-8694029)
chr4 (68-323)||(51697947-51698201)
chr4 (20-192)||(31298155-31298323)
chr4 (69-323)||(12878269-12878523)
chr4 (69-323)||(33468783-33469038)
chr4 (36-323)||(42758528-42758820)
chr4 (134-307)||(47574671-47574838)
chr4 (69-306)||(19906298-19906535)
chr4 (22-240)||(19106720-19106940)
chr4 (20-192)||(41816944-41817111)
chr4 (162-321)||(12874571-12874729)
chr4 (81-192)||(7902934-7903041)
chr4 (170-314)||(4551036-4551180)
chr4 (81-190)||(34560588-34560693)
chr4 (193-322)||(32082027-32082154)
chr4 (20-251)||(40840429-40840662)
chr4 (81-192)||(3997885-3997992)
chr4 (240-323)||(31765916-31765998)
chr4 (22-154)||(32081895-32082024)
chr4 (155-213)||(55810176-55810234)
chr4 (22-155)||(31766012-31766142)
chr4 (58-221)||(15134283-15134449)
chr4 (173-323)||(2819874-2820024)
chr4 (36-113)||(6943009-6943086)
chr4 (196-290)||(16948063-16948157)
chr4 (153-306)||(32545141-32545295)
chr4 (81-191)||(39319735-39319841)
chr4 (20-108)||(55073485-55073573)
chr4 (164-267)||(40408284-40408389)
chr4 (37-99)||(32545357-32545419)
chr4 (172-221)||(55073389-55073438)
chr4 (169-212)||(1151211-1151254)
chr4 (20-59)||(30054765-30054804)
chr4 (188-227)||(55073320-55073359)
chr4 (59-113)||(13065617-13065670)
chr4 (72-114)||(16954546-16954588)
chr4 (31-116)||(39217182-39217268)
chr4 (73-193)||(42316527-42316644)
chr4 (20-116)||(52690889-52690986)
chr4 (36-99)||(2820040-2820106)
chr4 (255-307)||(16953131-16953182)
chr4 (280-323)||(20513137-20513178)
chr4 (58-155)||(23093303-23093398)
chr4 (175-207)||(55149765-55149797)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (20-323)||(8069708-8070005)
chr3 (20-323)||(8883198-8883497)
chr3 (20-323)||(3672614-3672913)
chr3 (20-323)||(3692646-3692945)
chr3 (20-315)||(8887966-8888257)
chr3 (20-323)||(3033672-3033970)
chr3 (20-288)||(6596123-6596388)
chr3 (22-323)||(758131-758433)
chr3 (22-323)||(23665886-23666188)
chr3 (22-323)||(24038134-24038436)
chr3 (22-321)||(23661227-23661527)
chr3 (22-323)||(14438462-14438760)
chr3 (22-323)||(18467253-18467555)
chr3 (22-323)||(27708964-27709262)
chr3 (22-323)||(7570981-7571283)
chr3 (22-323)||(29350268-29350570)
chr3 (36-323)||(20520082-20520370)
chr3 (73-317)||(12965687-12965932)
chr3 (69-323)||(12971443-12971698)
chr3 (22-321)||(18472037-18472337)
chr3 (36-323)||(55431343-55431631)
chr3 (36-323)||(3657017-3657305)
chr3 (22-323)||(39775491-39775793)
chr3 (155-323)||(49971322-49971489)
chr3 (22-265)||(2207512-2207757)
chr3 (57-323)||(3419023-3419288)
chr3 (69-242)||(28125251-28125420)
chr3 (115-323)||(32474532-32474745)
chr3 (20-246)||(25726551-25726777)
chr3 (22-278)||(55325848-55326106)
chr3 (85-323)||(46964043-46964282)
chr3 (155-323)||(12112539-12112706)
chr3 (81-192)||(10586011-10586118)
chr3 (220-323)||(29715672-29715774)
chr3 (49-227)||(16013826-16014005)
chr3 (81-192)||(31002856-31002963)
chr3 (29-116)||(13166911-13166998)
chr3 (22-207)||(10708440-10708629)
chr3 (81-160)||(45904366-45904442)
chr3 (81-160)||(45904822-45904898)
chr3 (20-116)||(47566909-47567005)
chr3 (153-234)||(47567091-47567172)
chr3 (22-318)||(19276683-19276980)
chr3 (196-323)||(20507681-20507807)
chr3 (169-291)||(17026018-17026139)
chr3 (153-244)||(9113175-9113267)
chr3 (58-116)||(13156200-13156258)
chr3 (69-113)||(53358337-53358381)
chr3 (226-322)||(28125145-28125242)
chr3 (69-102)||(1640789-1640822)
chr3 (69-102)||(1640943-1640976)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (20-322)||(18784323-18784613)
chr1 (20-246)||(3094194-3094416)
chr1 (22-323)||(19798776-19799078)
chr1 (69-323)||(23192628-23192882)
chr1 (89-323)||(33301010-33301245)
chr1 (36-323)||(40166010-40166298)
chr1 (22-289)||(25843819-25844088)
chr1 (22-323)||(26927485-26927787)
chr1 (22-323)||(16035638-16035939)
chr1 (36-323)||(39588144-39588432)
chr1 (85-291)||(28434400-28434608)
chr1 (68-323)||(10140119-10140377)
chr1 (36-307)||(38620738-38621010)
chr1 (20-192)||(33055198-33055367)
chr1 (115-295)||(8137996-8138181)
chr1 (155-318)||(16649511-16649673)
chr1 (69-246)||(16833590-16833769)
chr1 (172-323)||(10135486-10135637)
chr1 (115-323)||(51041316-51041527)
chr1 (36-323)||(47451003-47451290)
chr1 (124-295)||(11806416-11806592)
chr1 (81-192)||(41097780-41097887)
chr1 (81-227)||(8267658-8267802)
chr1 (69-323)||(12260026-12260274)
chr1 (224-323)||(47455353-47455451)
chr1 (29-111)||(32626343-32626425)
chr1 (164-226)||(46696734-46696796)
chr1 (22-95)||(39037454-39037527)
chr1 (68-217)||(23280701-23280853)
chr1 (257-323)||(27761839-27761903)
chr1 (22-132)||(16649400-16649507)
chr1 (36-100)||(39200543-39200607)
chr1 (256-323)||(2493817-2493882)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (23-307)||(8747828-8748108)
chr6 (20-323)||(24588949-24589229)
chr6 (22-323)||(17964322-17964624)
chr6 (69-323)||(14509014-14509269)
chr6 (36-323)||(16835937-16836221)
chr6 (36-323)||(6407638-6407925)
chr6 (157-323)||(20748184-20748349)
chr6 (22-323)||(11570512-11570814)
chr6 (85-323)||(2699933-2700171)
chr6 (22-307)||(12689017-12689303)
chr6 (37-323)||(29892039-29892326)
chr6 (68-278)||(11534521-11534732)
chr6 (33-267)||(9751582-9751818)
chr6 (68-278)||(11560031-11560242)
chr6 (20-276)||(15991500-15991759)
chr6 (20-276)||(15999162-15999421)
chr6 (22-237)||(11428124-11428341)
chr6 (22-295)||(12406116-12406391)
chr6 (20-217)||(2863227-2863429)
chr6 (86-323)||(33687430-33687668)
chr6 (20-197)||(6112722-6112894)
chr6 (22-293)||(19995166-19995439)
chr6 (204-317)||(11614039-11614151)
chr6 (22-155)||(5856209-5856339)
chr6 (36-192)||(25314234-25314391)
chr6 (36-192)||(26201728-26201885)
chr6 (36-212)||(2882547-2882728)
chr6 (36-267)||(4157146-4157379)
chr6 (223-323)||(21309061-21309160)
chr6 (170-278)||(22609642-22609750)
chr6 (191-323)||(25316498-25316631)
chr6 (191-323)||(26203992-26204125)
chr6 (195-323)||(13736616-13736743)
chr6 (212-323)||(22695226-22695336)
chr6 (85-154)||(11613591-11613657)
chr6 (257-329)||(32551519-32551589)
chr6 (85-143)||(17913811-17913866)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (20-323)||(9648-9952)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (48-295)||(83123-83364)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (69-322)||(4105-4358)
scaffold0002 (22-323)||(443709-444008)
scaffold0002 (29-116)||(139990-140077)
scaffold0002 (58-116)||(150730-150788)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (22-323)||(7134-7436)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (168-323)||(165997-166151)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (20-325)||(255845-256153)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (169-306)||(25446-25583)
scaffold0054 (72-288)||(29219-29440)
scaffold0054 (22-155)||(25645-25775)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (204-323)||(35664-35782)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (65-233)||(4092-4262)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (81-192)||(45944-46051)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (81-192)||(152736-152843)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (36-155)||(148182-148299)
scaffold0009 (169-323)||(164934-165094)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (183-295)||(1197-1309)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (169-323)||(401-561)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (81-192)||(52728-52835)
scaffold0060 (82-192)||(47686-47792)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (173-295)||(13329-13451)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (118-192)||(1088-1161)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (22-116)||(146193-146287)
scaffold0011 (225-283)||(155486-155544)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (196-295)||(8947-9046)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (170-232)||(5410-5473)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (196-329)||(2333-2464)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Original strand, 43302454 - 43302712
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43302454 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtggt 43302553  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43302554 ctcaacaccataatagagtggtcatagtaccatattggtttcaatattaaaagagtagtcttagtaccacattgaaggtgtaattctcgaacgattttct 43302653  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43302654 acagtgcagtagttaaccgcacaggtgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgt 43302712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 31449634 - 31449931
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  31449634 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tc 31449729  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttcta 220  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31449730 tcaacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttcta 31449829  T
Q  221 cagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  31449830 cagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacga 31449928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 4238108 - 4238330
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  4238108 agaatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---t 4238203  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4238204 ctcaacatcataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 4238303  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttg 246  Q
    |||||||||||||||| || |||||||    
T  4238304 acagtgcagtagttaatcgaacagttg 4238330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 4242847 - 4243069
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  4242847 agaatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---t 4242942  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4242943 ctcaacatcataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 4243042  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttg 246  Q
    |||||||||||||||| || |||||||    
T  4243043 acagtgcagtagttaatcgaacagttg 4243069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17026220 - 17025965
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |     
T  17026220 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataatagagtggtaatagtaccatattaaagtggtttcaa 17026124  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||    
T  17026123 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctagacttgtttta 17026024  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  17026023 tcctggaggcgacgtgattgatagtctgtc-ttgcacaatgttgggcagtgccacgaaac 17025965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17556712 - 17556457
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |     
T  17556712 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataatagagtggtaatagtaccatattaaagtggtttcaa 17556616  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||    
T  17556615 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctagacttgtttta 17556516  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  17556515 tcctggaggcgacgtgattgatagtctgtc-ttgcacaatgttgggcagtgccacgaaac 17556457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 1910746 - 1911034
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | |  |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  1910746 catatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactttggagaaattaaag-tcagaatggtggtaacatcatatttgagtggt---ctcagcaccataaca 1910841  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| |||||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1910842 gagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttaataccatatttgaatgtgtaaatctcgaatggttttctacagtgcag 1910940  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1910941 tagttaaccgcacagttgtagttgagcttgttttatactggaggcagcgtggttgatagtctg-ctttgcacaattttgactagtgccacgaaac 1911034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Original strand, 40125696 - 40125950
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||     ||||| ||    
T  40125696 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcag 40125791  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||    
T  40125792 tattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgtttt 40125890  T
Q  263 atcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40125891 atcttggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 40125950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 44925687 - 44925988
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||   |    
T  44925687 aatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaaaaccatatttgagtggt---c 44925782  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44925783 tcgacaccataacagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggttttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 44925881  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  44925882 tttctacagtgca-tagttaaccgcatagttgtagatgaccttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 44925979  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  44925980 ccacgaaac 44925988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19166966 - 19166664
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattg-atatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||   |    
T  19166966 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattgtagttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatatgagtggt---c 19166871  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||     | ||| ||| ||||| || || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19166870 tcaacaccataatagagtggtaaccacaccatattaaagtgatttaagttttaaa-gaatgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 19166772  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  19166771 tttctatagtgcagtagttaacagcacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-gtgcacaattttgggcagtg 19166673  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  19166672 ccacgaaac 19166664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33416878 - 33416577
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||   |    
T  33416878 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacatcatatttgagtggt---c 33416783  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| ||| || ||| | || ||||||     ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  33416782 tcaacaccataacagaatgataacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaa-gagcggtcttagtaccgtatttgagggtgtaattctcgaacggt 33416684  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  33416683 tttctacagtgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtg 33416586  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  33416585 ccacgaaac 33416577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36683911 - 36683609
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||   |    
T  36683911 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatcttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaagaccatatttgagtggt---c 36683816  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||||||||     | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |    
T  36683815 tcaacaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcaaacgat 36683717  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  36683716 tttctacagtgcagtagttaatcgcacagatgtagctgaccttgttttatcctggaggcagcgtggttgatagtctgcc-ttacacaattttgggcagtg 36683618  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  36683617 ccacgaaac 36683609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1807704 - 1807502
Alignment:
Q  122 caacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1807704 caacaccataatagagtggttacaatatcataggtggtttcagtattaaa-gagtgatcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttct 1807606  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttg-ttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||    
T  1807605 acagtgcactagttaaccgcacagttgtagctggacttgtttttatcctagaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgtcac 1807507  T
Q  319 gaaac 323  Q
    |||||    
T  1807506 gaaac 1807502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 23548393 - 23548697
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatt-tggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||   | | | ||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |   |    
T  23548393 aatggtggtatcatcatatttgagtggtcatagtgcgatattgatattatggagaacttaaag-ttcgaatggtggtaacaccatatttgagtgat---c 23548488  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtatta-aaagagtggtcttagtaccatattgaagg-tgtaattctcgaacgg 213  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||     | ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| || || ||| ||||||    
T  23548489 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattataaatagtggtcttagtatcatatttaagggtgaaaatcttgaacgg 23548588  T
Q  214 ttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagt 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||    
T  23548589 ttttctacaatgcagtagttaaccgcgcagttgtagctgaacttgttttatcctagaggcgacgtggttgatagtccgcc-ttgcacaattttacacagt 23548687  T
Q  314 gccacgaaac 323  Q
    ||||||||||    
T  23548688 gccacgaaac 23548697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Original strand, 15951333 - 15951584
Alignment:
Q  37 atatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatag 135  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||| |||||||| ||    
T  15951333 atatttgagtggtcgtagtaccaaattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataacag 15951428  T
Q  136 agtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctac--agtgcag 228  Q
    |||||||| | |||||||||     | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15951429 agtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatcgaacgtgtaaatctcgaacggttttctacagagtgcag 15951527  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgata 286  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  15951528 tagttaactgcacagttgtagctgggcttgttttat-ctggaggcggcgtggttgata 15951584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Original strand, 18876278 - 18876432
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  18876278 aaagagtggtattagtatcatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatgagtttgttttatcct 18876377  T
Q  268 gaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18876378 ggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 18876432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34118650 - 34118496
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  34118650 aaagagtggccttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcgaacagttttctacggtgcagtagttaacagcacagttgtagctgggcttgttttatcct 34118551  T
Q  268 gaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
     |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||    
T  34118550 aaaggcgacgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccatgaaac 34118496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2965895 - 2965660
Alignment:
Q  89 aatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattg-----gttttagtattaaaagagtggtcttag 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||      |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2965895 aatggtggtaacatcatatttgagtagt---ctcaacaccataacagagtggtaacaatactatattaaagtagttttagtattaaa-gagtggtcttag 2965800  T
Q  184 taccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagtt 282  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  2965799 taccatatttgagggtgtaaatctcaaatggttttctacagtgcagtagttaactgcatagttgtagctggacttgttttatcctagaggcggtgtggtt 2965700  T
Q  283 gatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||| || | ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  2965699 gatagtgtgtc-ttgcacaattttaggcagtgccacgaaac 2965660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 28559429 - 28559719
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |  ||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  28559429 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggagaatt--aaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---c 28559523  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttcta 220  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||    |  || | |     ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28559524 tcagcaccataagagagtggtaacaataccatattaaagtg-gtttca-----gtggtcttactaccgtattgaaggtgtaattctcgaacggtttttta 28559617  T
Q  221 cagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacga 320  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||  |  ||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28559618 cagtgcaatagttaatcgaacagttctaactgggcttattttatcctgcagacggcgtggttgatagtttgcc-ttgcacaattttggacagtgccacga 28559716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 38182033 - 38182302
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  38182033 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttt-gaatagtggtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataaca 38182128  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagtt 233  Q
    ||||||||| | || ||||||               | |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38182129 gagtggtaacaatatcatatt---------------aaagtggttttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttttatagtgcagtagtt 38182213  T
Q  234 aaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||| ||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  38182214 aacagcacagttgtagctgtgcttgttttatcctggaggcggcgtggttgataatctgcc-ttgcacaatcttgggaagtgccacgaaac 38182302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 15875461 - 15875733
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatag 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||   ||||  ||||||||||    
T  15875461 catatttgagtagttgaaataccatattgacatttgaagatgttaaaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggt---ctcagtaccataatag 15875557  T
Q  136 agtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagta-ccatattgaag-gtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagtt 233  Q
    | |||| | ||||||||||             || ||| ||| |||| || |||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15875558 aatggtcacagtaccatat-------------aatagaatggccttaatagccatatttgagagtgtaattcttgaacggttttctatagtgcagtagtt 15875644  T
Q  234 aaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    || || ||| ||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15875645 aatcgtacaattgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 15875733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 28564598 - 28564807
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  28564598 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaatt--aaagttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataaga 28564692  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 229  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| |  |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  28564693 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaacattaaa-gagtggtcttactatcatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacactgcaat 28564791  T
Q  230 agttaaccgcacagtt 245  Q
    |||||| || ||||||    
T  28564792 agttaatcgaacagtt 28564807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 28572221 - 28572430
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  28572221 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaatt--aaagttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataaga 28572315  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 229  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| |  |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  28572316 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaacattaaa-gagtggtcttactatcatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacactgcaat 28572414  T
Q  230 agttaaccgcacagtt 245  Q
    |||||| || ||||||    
T  28572415 agttaatcgaacagtt 28572430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10933747 - 10933497
Alignment:
Q  44 agtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||      |  |||||  |||| |||| |    
T  10933747 agtggttgaaatatcatattgatatttggagatgttaaatactagaacggtggtaacaccatattttagtggtcacaatactaccatggtagaatggtca 10933648  T
Q  144 tagtaccata-----ttggttttagtattaaaa---gagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaa 235  Q
    ||||||||||     ||| ||||||| ||||||   ||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  10933647 tagtaccataattgattgattttagtgttaaaatatgagtcattttagtatcatattgaaggtgtaattctcgaacaattctctacagtgcagtagttaa 10933548  T
Q  236 ccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatag 287  Q
     | |||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  10933547 tcacacagttgtagttgg-tttgttttatcatggaggcgacgtggttgatag 10933497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 25367808 - 25367915
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||    
T  25367808 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattgatttcagtatt-aaagagtggact 25367903  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  25367904 tagtaccatatt 25367915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 192
Target Start/End: Original strand, 34818531 - 34818634
Alignment:
Q  85 ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagt 184  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34818531 ttagaatggtggtagcaccatatttgagtggt---cacaacaccataatagaatggtaacagtaccatattggtttcagtatt-aaagagtggtcttagt 34818626  T
Q  185 accatatt 192  Q
    ||||||||    
T  34818627 accatatt 34818634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 323
Target Start/End: Original strand, 17953806 - 17953938
Alignment:
Q  191 ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacag-ttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtc 289  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  17953806 ttgagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcacacagtttgtaggtgagcttgttttatcttggaggcggcgtggttgatattc 17953905  T
Q  290 tgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    || | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17953906 tgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 17953938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 8331185 - 8331292
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| | |||||||||||| |||||| | || |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  8331185 aaaattagaatggtggtaacaccatatttga---gtggtcttaccaccataatagaatggtaacaataacatatttgtttcagtatt-aaagagtggtct 8331280  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  8331281 tagtaccatatt 8331292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37771978 - 37771871
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  37771978 aaaattagaatggtggtaatatcatatttgagtggt---ctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattggtttcagtatt-aaagagtagtct 37771883  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    | ||||||||||    
T  37771882 tggtaccatatt 37771871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 14035766 - 14035670
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  14035766 agaatggtggtagcaccatatttgagcggttgaaataccatattgatatttggagatgttaaatgttagaatggtggtgacatcatatttgagtggt 14035670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24090887 - 24090657
Alignment:
Q  89 aatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttag 183  Q
    |||||||||| ||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||     |||||| | |||| |||||||||||||||    
T  24090887 aatggtggtatcaccatatttgag---tggtctcagcaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatatt-aaagagtggtcttag 24090792  T
Q  184 taccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagtt 282  Q
    ||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||     || |||||||||||||||||| || |   ||||||||||| || ||||| |||  ||    
T  24090791 tacaatatttgaggatgtaaatctcgaacggttttcta-----caatagttaaccgcacagttgtagataagcttgttttatcttggaggcgacgtgatt 24090697  T
Q  283 gatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  24090696 gatattctgcc-ttgcacaactttgggcagtgccacgaaac 24090657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29220649 - 29220550
Alignment:
Q  51 gaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtacc 150  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||   ||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||||    
T  29220649 gaaatatcatattgatattttgagatattaaaagttagaatggtggtaacatcatatttgag---tggtcacaatagcataatagagtggtcataatacc 29220553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 378
Target Start/End: Original strand, 43302920 - 43302967
Alignment:
Q  331 attggataggacagacagagatcatcgctgcactgcttcacattgatg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43302920 attggataggacagacagagatcatcgctgcactgcttcactttgatg 43302967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12820472 - 12820370
Alignment:
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||   |||||||||    
T  12820472 tacagtgcagtagttagtcgcacagttgtacctgaacttgttttatcctggaggcggtgtgattgatagtttg-ctttgcacaattttaggcagtgccac 12820374  T
Q  319 gaaa 322  Q
    ||||    
T  12820373 gaaa 12820370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 246
Target Start/End: Original strand, 24673097 - 24673320
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttgga-gaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| || ||| |||||  || |||||||| |||||  |||||||||||||   |    
T  24673097 aatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgttattttgaagaacttaaaggttggaatggtgataacatcatatttgagtggt---c 24673193  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggtt 215  Q
    | | |||||  |||||||| | |||||||||||||     ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |     
T  24673194 ttagcaccactatagagtg-tcatagtaccatattagagtggtttcaacattaaaa-agtggtcttagtaccatattggaggtgtaaatcttgaac--tc 24673289  T
Q  216 ttctacagtgcagtagttaaccgcacagttg 246  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24673290 ttttacagtgtagtggttaaccgcacagttg 24673320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 323
Target Start/End: Original strand, 43302716 - 43302784
Alignment:
Q  255 cttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaa-ttttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43302716 cttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctacc-ttgcacaatttttggacagtgccacgaaac 43302784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17020635 - 17020470
Alignment:
Q  57 ccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat- 154  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||   |||| | |||||| ||| | |||| | || |||||     
T  17020635 ccatattgatactttgaagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatgtttgagtggt---ctcagcgccataagagaattgtaacaatatcatatg 17020540  T
Q  155 ----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttcta 220  Q
        |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  17020539 aaagtggtttcaatattaaa-gagtggtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatctcaaacggttttcta 17020470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17551072 - 17550907
Alignment:
Q  57 ccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat- 154  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||   |||| | |||||| ||| | |||| | || |||||     
T  17551072 ccatattgatactttgaagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatgtttgagtggt---ctcagcgccataagagaattgtaacaatatcatatg 17550977  T
Q  155 ----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttcta 220  Q
        |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  17550976 aaagtggtttcaatattaaa-gagtggtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatctcaaacggttttcta 17550907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Original strand, 18876166 - 18876258
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccata 131  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||   |||||||||||||||||    
T  18876166 catatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaacatatttga---gtggtctcaacaccata 18876258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2470070 - 2470005
Alignment:
Q  256 ttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2470070 ttgttttatcctggggacgtcgtagttgatagtctgc--ttgcacaattttgagcagtgccacaaaac 2470005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 12820604 - 12820560
Alignment:
Q  72 gagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  12820604 gagaaattaaaaattagaatggcgataacaccatatttgagtggt 12820560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 323
Target Start/End: Original strand, 2355458 - 2355524
Alignment:
Q  256 ttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2355458 ttgttttatctttgaggcggcgtggttgatagtctgtctt-gcacaattttgaaaagtgtcacgaaac 2355524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7902724 - 7902629
Alignment:
Q  191 ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgata 286  Q
    |||||| |||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||  || |||||| |||||||    
T  7902724 ttgaagttgtaattctcgaatagttagatacagtgtagtagttaatcgcacaattgttgatggacttgttttatcctagagacggcgtggttgata 7902629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 75
Target Start/End: Original strand, 17953735 - 17953790
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggaga 75  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17953735 agaatggtggtagcacaatatttgagtggttcaaataccatattgacatttggaga 17953790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5884162 - 5884080
Alignment:
Q  178 tcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtt 260  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  | ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||    
T  5884162 tcttattagcatattgaaggtgtaattctcgaacgattagctacaacgtagtagttaatcgcataattgcaataggacttgtt 5884080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 27415819 - 27415753
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacac 102  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||  |||||  ||||||| ||||||||||    
T  27415819 catatttgagtggttgtagtatcatattgatatttgaagatgttaaaggttagaatagtggtaacac 27415753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 5884298 - 5884209
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttga 111  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| || | |||| ||||| |||||| |||  |||||  ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5884298 aatggtggtaacaccatatttgagtggatgtagtaccgtattgttatttgaagatgttaaaggttagagtggtggtaacaacatatttga 5884209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27415689 - 27415577
Alignment:
Q  174 gtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggc 273  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||| ||  ||||  |||| || |||| |||||| ||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  27415689 gtggtcttagtaccatagtggatgtgtaatttttgaacgattagctacgatgcaatatttaatcgcacaattgtagttatgcttgttttattctgaaggc 27415590  T
Q  274 ggcgtagttgata 286  Q
    | ||| |||||||    
T  27415589 gacgtggttgata 27415577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 32461314 - 32461614
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||       
T  32461314 agaatggtcgtaacaccatattttagcggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg--- 32461410  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32461411 tctcaacaccataatagagtggtcatagtaccatattggtttcagcattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 32461510  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  32461511 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgaacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccac 32461609  T
Q  319 gaaac 323  Q
     ||||    
T  32461610 aaaac 32461614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 12044905 - 12045204
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||       
T  12044905 agaatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaattagaaaggtggtaacaccatatttgattggt--- 12045001  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12045002 ctcaacaccataatagagtggccatagtaccatattggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggtagtct 12045101  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  12045102 acagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctatgcttgttttatcctggaggcggcgtggtcgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacg 12045200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 36937278 - 36937576
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  36937278 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---t 36937373  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36937374 ctcaacatcataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 36937473  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  36937474 acagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccatg 36937572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 36942032 - 36942330
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  36942032 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---t 36942127  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36942128 ctcaacatcataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 36942227  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  36942228 acagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccatg 36942326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41996988 - 41996695
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  41996988 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt--- 41996893  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41996892 ctcaacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 41996793  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    |     ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||    
T  41996792 a-----cagtagttaaccgcacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttacacaattttgggcagtgccacg 41996699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42001757 - 42001464
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  42001757 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt--- 42001662  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42001661 ctcaacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 42001562  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    |     ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||    
T  42001561 a-----cagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttacacaattttgggcagtgccacg 42001468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 557023 - 556725
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  557023 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt--- 556928  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  556927 ctcaacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattata-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttc 556829  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  556828 tacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccac 556730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 561795 - 561497
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  561795 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt--- 561700  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  561699 ctcaacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattata-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttc 561601  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  561600 tacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccac 561502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 6155179 - 6155484
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaatta-aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||    
T  6155179 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttagaaaattaaaatgttggtaacaccatatttga---gtgg 6155275  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6155276 tctcaacaccataacagagtggtaacaataccaaattaaagtggtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacg 6155374  T
Q  213 gttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | ||| | ||||||| ||||    
T  6155375 gttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggtgtggttgatagtctgtc-ttgtaaaattttggacag 6155473  T
Q  313 tgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||    
T  6155474 tgccacgaaac 6155484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7452039 - 7451788
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtat 166  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||| |||||    
T  7452039 tttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataacagagtggttacaataccataggtggtttcagtat 7451944  T
Q  167 taaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatc 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  7451943 taaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatc 7451845  T
Q  266 ctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7451844 ctggaggcagcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttggacagtgccacgaaac 7451788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39523333 - 39523079
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||     ||||| ||    
T  39523333 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcag 39523238  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39523237 tattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgtttt 39523139  T
Q  263 atcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  39523138 atcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcggtgccacgaaac 39523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 29167750 - 29168038
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||| |||||||| |    
T  29167750 catatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagcggt---ctcagcaccataaca 29167845  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29167846 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcag 29167944  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29167945 tagttaatcgaacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 29168038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39518694 - 39518440
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||     ||||| ||    
T  39518694 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcag 39518599  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39518598 tattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacactgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgtttt 39518500  T
Q  263 atcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  39518499 atcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-atgcacaattttgggcggtgccacgaaac 39518440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3666134 - 3665962
Alignment:
Q  150 catattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcag 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3666134 catattggtttcagtattaaaagagtggtattagtaccatattgaaggtgtaattcccgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtag 3666035  T
Q  250 ttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3666034 ttggacttgttttatcctagaggtggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 3665962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26667604 - 26667302
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||   |||||| ||| || |||| |||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |    
T  26667604 aatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttgtagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---c 26667509  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  26667508 tcagcaccataacagagtgataacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 26667410  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26667409 tttctagagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 26667311  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  26667310 ccacgaaac 26667302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26939201 - 26938899
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||   |||||| ||| || |||| |||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |    
T  26939201 aatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttgtagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---c 26939106  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  26939105 tcagcaccataacagagtgataacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 26939007  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26939006 tttctagagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 26938908  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  26938907 ccacgaaac 26938899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 35679639 - 35679940
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  35679639 aatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---c 35679734  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    | |||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  35679735 tgaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgat 35679833  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  35679834 tttctacaatgca-tagttaactgcacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaatttttgacagtg 35679931  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  35679932 ccacgaaac 35679940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 37248567 - 37248843
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |    
T  37248567 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---c 37248662  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||    | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  37248663 tcagcaccataacagagtggtaatattaa---agtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttct 37248758  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaatttt 306  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37248759 atagtacagta-ttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaatttt 37248843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12103310 - 12103055
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggtttta 162  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||     ||||| |    
T  12103310 tttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---ctcaataccataacagagtggtaacaataccattttaaagtggtttca 12103215  T
Q  163 gtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaagg-tgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  12103214 gtattaaa-gagtgatcttagtaccatatttaagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgcacatttgtagttgggcttgttt 12103116  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12103115 tatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 12103055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36429041 - 36428755
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||   |    
T  36429041 aatggtggtatcaccatatttgagttgtcgtattaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacatcatatttgagtggt---c 36428946  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  36428945 tcaacactataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagaaccatatttggaggtgtaattctcgagcgat 36428847  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36428846 tttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttg 36428755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4872207 - 4871988
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||| |     
T  4872207 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---cttagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcat 4872111  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||    
T  4872110 tattaaaagaatggtctttgtaccatattgaaggtataattctcaaacggttttctacagtacagtagttaatcgaacagttgtagttgagcttgtttta 4872011  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgata 286  Q
    || || ||||||||| |||||||    
T  4872010 tcatggaggcggcgtggttgata 4871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 115 - 323
Target Start/End: Original strand, 12501752 - 12501964
Alignment:
Q  115 gtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcg 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     |||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  12501752 gtggtctcaacaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcggtattaaat-agtggtcttagtatcatatttggaggtgtaattctcg 12501850  T
Q  209 aacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttga 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||     
T  12501851 aacgattttctacagtgcagtagttaaccgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctg-ttttgcacaattttgg 12501949  T
Q  309 acagtgccacgaaac 323  Q
     ||||||||||||||    
T  12501950 gcagtgccacgaaac 12501964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36423969 - 36423667
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||   |    
T  36423969 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaataccatatttgagtggt---c 36423874  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  36423873 tcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagcaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 36423775  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||| | || ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  36423774 tttctacagtgcattagttaatcaaacagtagtagctgggcttgttttattctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 36423676  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    || ||||||    
T  36423675 ccgcgaaac 36423667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40148227 - 40147925
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||| ||||||   |    
T  40148227 aatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatgggggcaacaccatatttaagtggt---c 40148132  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40148131 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcgtagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggt 40148033  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||| |||||||||  | ||| ||| || ||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  40148032 tttctacagtgtagtagttaattgaacaattgaagctgagcttattttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtg 40147934  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  40147933 ccacgaaac 40147925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 323
Target Start/End: Original strand, 10759631 - 10759885
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggtttta 162  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||     ||||| |    
T  10759631 tttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacatcatatttgagtggt---ctcaacaccataacagagtggtaacaataccacattaaagtggtttca 10759726  T
Q  163 gtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  10759727 gtatgaca-gagtggtcttagtaccatatttgagggtataattctcgaacggttttctaccgtgca-tagttaaccgcacagttgtaaatgggcttgttt 10759824  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  10759825 tatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacaaaac 10759885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Original strand, 41587073 - 41587225
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  41587073 aaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattc--gaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcct 41587170  T
Q  268 gaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41587171 ggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgaacagtgtcacgaaac 41587225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 323
Target Start/End: Original strand, 12041795 - 12041997
Alignment:
Q  125 caccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  12041795 caccataatagagtggtaacagtaccatattaatgtggtttcagtattaaaagaatgtacttggtaccatattggaggtgtaattctcgaacagtttttt 12041894  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    | |||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||  ||||||||||    
T  12041895 atagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtttgcc-ttgcatatttttgggcagtgccacg 12041993  T
Q  320 aaac 323  Q
    ||||    
T  12041994 aaac 12041997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Original strand, 11981090 - 11981343
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||     |||||  |    
T  11981090 ttggagaagttaataactagaatgatggtaacaccatatttgagtggt---ctcatcaccacaatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcgg 11981186  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||  |||||||||    
T  11981187 tattaaaagaatggtcttggtaccatattagaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcaatagttaatcgaacagttgtagatgtgcttgtttta 11981286  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    | ||| ||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  11981287 ttctggaggcggcgtggttgat--tctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacaaaac 11981343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 20180826 - 20181128
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  20180826 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---c 20180921  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| ||| |||||  | |||| ||||     ||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||||| ||    
T  20180922 tcagcaccataacagaatggtagcaataccgtattaaagtggtttcaatattaaa-gagtggtcttggtatcatatttgagggtgtaaatctcgaacagt 20181020  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||| ||    
T  20181021 tttctacagtgcagtagttaaccgcacaattgtagttgagcttgttttatcatggaggtggcgtggttaatagtctgtc-ttgcataattttggacaatg 20181119  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  20181120 ccacgaaac 20181128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9911433 - 9911188
Alignment:
Q  65 atatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagt 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   || | ||||||| || ||| || | | |||||||||| ||| |||    
T  9911433 atatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggt---cttagcaccata-taaagttgtcacaataccatattgatttcagt 9911338  T
Q  165 attaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||   | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  9911337 attaaaagagtggtcttagtaccatatttaatgtgt--cttttgaacggttttctacagtgcagtaattaaccgcacaattgtagttgaacttgttttat 9911240  T
Q  265 cctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
     || |  |||||||  ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9911239 -cttagagcggcgtgattggtagtctgcc-ccgcacaattttgaacagtgccac 9911188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 323
Target Start/End: Original strand, 6514453 - 6514666
Alignment:
Q  115 gtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcg 208  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||     |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6514453 gtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatacaatatcaaagtggtttcaatattaaaagagtggttttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcg 6514552  T
Q  209 aacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttga 308  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  6514553 aatgattttctacaatgcagtagttaaccacacagttgtagctaagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcaaaattttgg 6514651  T
Q  309 acagtgccacgaaac 323  Q
     ||||||||||||||    
T  6514652 gcagtgccacgaaac 6514666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 15414658 - 15414946
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatatttgga-gaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||  |   |||||||||| |    
T  15414658 catatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttgaagaacttaaatgttagaatggtgataacaccatattttagtggtcat---aacaccataaca 15414754  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatattgg-----ttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 229  Q
    ||||||| |  |||||||||| |     || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  15414755 gagtggtcaaggtaccatattagagtgattctagtattaaa-gattggtcttagtagcatattggaggtgtaaatttcgaaaggttttctatagtgcagt 15414853  T
Q  230 agttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  15414854 agttaaccgcacatttacatgtggacttgcattatcctggaggcggcgtggttgatattctgcc-tcacacaattttgggcagtgccacaaaac 15414946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 16116009 - 16116314
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||  | ||||||||| |||||  |||||||||||||      
T  16116009 agaatggtggtatcatcatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttgaagaacttaaaggt-agaatggtgataacatcatatttgagtggt-- 16116105  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggta--atagtaccatatt-------ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcga 209  Q
     || |||||||||||||||||||   | | |||||||||       ||||| ||||||||| ||||| |  ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  16116106 -cttaacaccataatagagtggtgtcacaataccatattagaaagcggtttcagtattaaa-gagtgat--tagtatcatattggatgtgtaattctcga 16116201  T
Q  210 acggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaa 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||      
T  16116202 acggttttctatagtgcagtagttaacagtactgttgtagttgaacttgttttatctaggaggtggcgtggttgatagtttgtc-ttgcacaattttggg 16116300  T
Q  310 cagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||||||||    
T  16116301 cagtgtcacgaaac 16116314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 13301310 - 13301417
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13301310 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataatagaatggtaccaataccatattggtttcagtatt-aaagagtggtct 13301405  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  13301406 tagtaccatatt 13301417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3666239 - 3666143
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3666239 agaatggttgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttagatgttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt 3666143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 9726541 - 9726676
Alignment:
Q  115 gtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||     |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||  || ||    
T  9726541 gtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatatgaaaatggtttcagtattaaa-gaatggtcttaataccatatttaaagtgtaaaccttga 9726639  T
Q  210 acggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9726640 acggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttg 9726676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 192
Target Start/End: Original strand, 21323797 - 21323901
Alignment:
Q  84 attagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttag 183  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21323797 attagaacggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattggtttcagtatt-aaagactggtcttag 21323892  T
Q  184 taccatatt 192  Q
    |||||||||    
T  21323893 taccatatt 21323901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31731810 - 31731703
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  31731810 aaaattagaatggtggtaataccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattggtttaagtatt-aaagagtagtct 31731715  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    | ||||||||||    
T  31731714 tggtaccatatt 31731703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 7086690 - 7086596
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7086690 aatggtggtagcatcatatttgagtgattgtaataccatattgatatttggagatgttaaaggttagaatggtgataacaccatatttgagtggt 7086596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 318
Target Start/End: Original strand, 12102639 - 12102891
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaaca-ccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggtttt 161  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||| | |||||| |||||||||| | |  ||||||     |||||     
T  12102639 tttggagaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttaagtggt---ctcaaaaaccataacagagtggtaacaatgtcatattaaagtggtttc 12102734  T
Q  162 agtattaaaagagtggtcttagtac----catatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggact 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    |||||| || |||| || || | |||||||||||||   | |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12102735 agtattaaa-gagtggtcttagtacataccatatttgagggtgaaaatcccaaacggttttctac---gtagtagttaaccgcacagttgtagttggtct 12102830  T
Q  257 tgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||  | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  12102831 tgttttatcctggtgacggtgtggttgatagtcttcc-ttgcacaattttggccagtgccac 12102891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Original strand, 23977357 - 23977420
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaa 83  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23977357 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgatatttggagaagttaaaa 23977420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Original strand, 34707449 - 34707513
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagtt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  34707449 aaagagtggtcttagtaccatatttaaggtgtaaatctcgaacggttttctatggtgcaatagtt 34707513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 1429814 - 1429929
Alignment:
Q  72 gagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaa 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||| | | |||| | | ||||| |||||||| | |||||||     
T  1429814 gagatattaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataa-ataatggtcacaataccacattggtttcaatattaaa- 1429908  T
Q  172 gagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  1429909 gaatggtcttagtaccatatt 1429929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 323
Target Start/End: Original strand, 37652828 - 37652895
Alignment:
Q  255 cttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  37652828 cttgttttatcctggaggtggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttggacaatgtcacgaaac 37652895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 307
Target Start/End: Original strand, 37550030 - 37550081
Alignment:
Q  255 cttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37550030 cttgttttatcctggaggtggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttg 37550081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14013383 - 14013306
Alignment:
Q  37 atatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtg 114  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||  || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14013383 atatttgagtggttgtagtcgcatattgatatttcgagatgttcaaggttaaaatggtggtaacaccatatttgagtg 14013306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23866394 - 23866098
Alignment:
Q  23 atggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtct 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||     |||||||    
T  23866394 atggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatattta----gtggtct 23866299  T
Q  122 caacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctac 221  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23866298 caacacaataatagagtggtcatagtaccatattggtttcagcattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctac 23866199  T
Q  222 agtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  23866198 agtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaa 23866100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 9650729 - 9651032
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||       
T  9650729 agaatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtgg--- 9650825  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9650826 tctcaacaccataatagagtggtcatagtaccatattggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattaaaagtgtaattctcgaacggttttc 9650925  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagtt---gcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgc 315  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||    
T  9650926 tacagtgcagtagtcaaccgtacagttgcagcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgc 9651024  T
Q  316 cacgaaac 323  Q
    ||||||||    
T  9651025 cacgaaac 9651032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 44510438 - 44510742
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  44510438 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt--- 44510534  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| | |  ||||||     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44510535 ctcaacaacataacagaatggtaacaatgtcatattaaagtggtttcagtattaaaagtgtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggt 44510634  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  44510635 tttctacagtgcagaagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttggacagtg 44510733  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||| ||||    
T  44510734 ccacaaaac 44510742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8076373 - 8076080
Alignment:
Q  21 gaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||       
T  8076373 gaatgatcataacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaaattagaacggtggtaacaccatatttgagtggt--- 8076277  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8076276 ctcaacaccgtaatagagtggtcatagtaccatattggtttcaacattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaa-tctcgaacagttttct 8076178  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    |     |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||    
T  8076177 a-----cagtagttaatcgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcagcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttaggcagtgccacg 8076084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 44422900 - 44423202
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | ||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||  ||||| |||||||| ||||        
T  44422900 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccacattgatgttttggagaaattaaag-ttagaattgtgacaacaccatatttgattggtt--- 44422995  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattg-----gttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44422996 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 44423094  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  44423095 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatggacttgttttatcctggaggcggcgtagttgatagtctgcc-ttgaacaattttggtcagtg 44423193  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  44423194 ccacgaaac 44423202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9008484 - 9008208
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||       
T  9008484 agaatgatcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatccggagatgttaaaaattagaatggtggtagcaccatatttgagtggt--- 9008388  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    | ||||||||| ||||||||||     |||   |||| |||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9008387 cccaacaccattatagagtggt-----tac---attgatttcggtattaaaagagtgattttagtatcatattgaaggtgtaattctcgaacgattttct 9008296  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttga 308  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | |  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9008295 acagtgcagtagttaatcacacagttgtagttggacttgttttatcctggaggcttcatgattgatagcctgcc-ttgcacaattttga 9008208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4930518 - 4930263
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggtttta 162  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  | ||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| |    
T  4930518 tttggagaaattaaag-ttagaatggtgacagcaccatatttgagtggt---ctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggtttca 4930423  T
Q  163 gtattaaaagagtggtcttagtaccatat-tgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4930422 gtattaaa-gagtggtcttagtaccatatatgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgggcttgttt 4930324  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  4930323 tatcctggaggcggcgtggttgatagtatgac-ttacacaattttgggcagtgccacgaaac 4930263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Original strand, 26286956 - 26287180
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||     ||||| ||    
T  26286956 ttggagaagttaaaaatttgaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctca-cacgataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcag 26287051  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||    
T  26287052 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaaagctcgaacgattttctatagtgcagtagttaactgcacagttgtagctggatttgtttta 26287151  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgc 292  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26287152 tcctggaggcggcgtggttgatagtctgc 26287180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12799705 - 12799456
Alignment:
Q  59 atattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-- 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||| | |||||||||      
T  12799705 atattgatattttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataacaaagtggtaacaataccatattaa 12799610  T
Q  156 ---ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagtt 251  Q
       | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  12799609 agtgatttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctgcaatgcagtagttaaccgcacagttgtagct 12799511  T
Q  252 ggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12799510 ggacttattttatcctggatgtggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttg 12799456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 13314014 - 13314301
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  13314014 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatagtggtaacacaatatttgagtggt---ctcaacaccataaca 13314109  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13314110 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaa--gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 13314207  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||  | ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  13314208 tagttaattgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcgacgtggctgatagtctacc-ttgcacaattttgggcagtaccacgaaac 13314301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27238574 - 27238272
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||   |||||    
T  27238574 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaaattacaa-ttagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtc 27238479  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| | |||||||| | || |||||     |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |    
T  27238478 tcagcaccataacaaagtggtaacattatcatattaaagtggtttcagaatt-aaagagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaaatctcgaacgat 27238380  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27238379 tttctacagtgcagtagttaagcacgcagttgtagctggacttgttttatcttgcaggcggcgtgattgatagtctgcc-ttacacaattttgagcagtg 27238281  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||| ||||    
T  27238280 ccacaaaac 27238272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 288
Target Start/End: Original strand, 25543260 - 25543393
Alignment:
Q  155 tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttgga 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  25543260 tggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctaga 25543359  T
Q  255 cttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagt 288  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  25543360 cttgttttatcctggaggcgatgtggttgatagt 25543393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4579846 - 4579538
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||  |||       
T  4579846 agaatggtggtagcatcatatttaagtgctggaaataccatattgacatttggagatgttaaatgttagaatggtggtaacaccatatttgaacggt--- 4579750  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaa--gagtggtcttagta-ccatatt-gaaggtgtaattctcgaa 210  Q
    || |  || |||||||| |||| | | ||||||||     |||||| | ||||||    |||||| |||| || ||||||| || ||||||||||| |||    
T  4579749 cttagtactataatagaatggtcacaataccatataatcgtggtttcattattaatttcgagtggccttaatagccatatttgagggtgtaattcttgaa 4579650  T
Q  211 cggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  4579649 cggttttctacagtgcagtagttaatcgcacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggc 4579551  T
Q  311 agtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||    
T  4579550 agtgccacgaaac 4579538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30258420 - 30258164
Alignment:
Q  34 atcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataa 132  Q
    |||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||    
T  30258420 atcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttaaagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataa 30258325  T
Q  133 tagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgc 226  Q
     | |||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  30258324 catagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatttcgaacaattttctacagtgc 30258226  T
Q  227 agtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagt 288  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  30258225 agtagttaaccgcactgttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtgattgatagt 30258164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Original strand, 42626354 - 42626602
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| | | ||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  42626354 aatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattaatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---c 42626449  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  42626450 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggttttaatattaaa-gagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgat 42626548  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctg 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  42626549 tttctacagtgcagtaattaaccgcacagttgtagctggacttattttatcctg 42626602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19640626 - 19640458
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||    
T  19640626 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtatcatattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatattt---tagtggt 19640530  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19640529 ctcagcaccataatagagtgttcacaataccatattggttttagtatt-aaagagtggtgttagtaccatatt 19640458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8268625 - 8268323
Alignment:
Q  23 atggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtct 121  Q
    ||||| ||| || ||||||||| |||| | | |||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||   ||    
T  8268625 atggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatatagatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaacatatttgagtggt---ct 8268530  T
Q  122 caacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacgg-t 214  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||     |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |    
T  8268529 caacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtact-aaagagtgatcttagtaccatatttggaggtgtaattatcgaacggtt 8268431  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  8268430 tttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttatcatggaggtggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttggacagtg 8268332  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||| ||||    
T  8268331 ccacaaaac 8268323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26341537 - 26341230
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatt--tgagtg-gtg 117  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  |||||| |||||  |   || |||    
T  26341537 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcggagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatgatattaacaccatattgatatttgagtg 26341439  T
Q  118 gtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaac 211  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| | || ||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||     
T  26341438 gtctcagcatcataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaat 26341340  T
Q  212 ggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaaca 311  Q
    | |||||||||||| ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  26341339 gattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggca 26341241  T
Q  312 gtgccacgaaa 322  Q
    |||||||||||    
T  26341240 gtgccacgaaa 26341230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3880280 - 3880027
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttag 163  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||     |||||| |     
T  3880280 ttggagaagttaataattagaatggtgataacaccatatttgag---tggtctcagcaccataatagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcaa 3880184  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |   ||||    
T  3880183 tatt-aaagagtggtcttagtatcatatttgagagtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccacatagttgtagtggggc---tttt 3880088  T
Q  263 atcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcac-aattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  3880087 atcctggaggcggcgtggttgatagtcttcc-ttacacaaattttgaacagtgtcacaaaac 3880027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21671527 - 21671225
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |  ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  |   |    
T  21671527 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggaaaaattaaag-ttataatggtggtaacaccatatttgagttat---c 21671432  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggtt 215  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||     ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  21671431 tcaacaccatattaaagtggtaataataccatattaaagtggtttcattattaaaagaatggtctttgtcccatattggaggtttaaatctcgaacgatt 21671332  T
Q  216 ttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgc 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||| | |||  || |||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  21671331 ttctacactgcagtagttaaccgcacagttgtaggtgagcttgttttattctggatgcgaagttgttgattgtctgcc-ttgcacaactttgggcagtgc 21671233  T
Q  316 cacgaaac 323  Q
    ||| ||||    
T  21671232 cactaaac 21671225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27256509 - 27256402
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  27256509 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagaatggtaataataccatattggtttcagtatt-aaatagtggtct 27256414  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  27256413 tagtaccatatt 27256402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 285
Target Start/End: Original strand, 10388131 - 10388395
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||  ||| | | |||||||||| | |||||||||||   |    
T  10388131 aatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaag-ttaaagttgtggtaacacca-atttgagtggt---c 10388225  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||| ||||||||  |    
T  10388226 tcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtattagtaccttatttgagggtgtaaatctcgaacaat 10388324  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgat 285  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10388325 tttttagagtgcagtagttaatcgcacagttgtagttgagtttgttttatcctggaggcggcgttgttgat 10388395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12254262 - 12254136
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctg 268  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  12254262 aaagactggacttagtaccatatttgaggtgtaaatctcaaacggttttctacacagcattagttaaccgcacagttgtagctgaacttgttttatcctg 12254163  T
Q  269 aaggcggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
     |||||||||  |||||||||||||||    
T  12254162 taggcggcgtgattgatagtctgcctt 12254136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 323
Target Start/End: Original strand, 13142729 - 13142966
Alignment:
Q  87 agaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtctt 181  Q
    |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||| |||||||| | |||||||| | ||||||||     |||||| | |||| |||||||| ||||    
T  13142729 agaatggtggtaacaccatatttaa---gtggtctcagcaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatatt-aaagagtgatctt 13142824  T
Q  182 agtaccatattgaa-ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtag 280  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| || || |||||||||||||||  |||||||| |    
T  13142825 agtaccatatttaacggtgtaaatctcgaacagttttctatagtgcaatagttagccttacagttgtagctgaacttgttttatcctggtggcggcgttg 13142924  T
Q  281 ttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||| |||||| |  ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  13142925 ttgaaagtctgtc-atgcacaactttgactagtgccacgaaac 13142966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 323
Target Start/End: Original strand, 6590843 - 6591048
Alignment:
Q  126 accataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaa--gagtggtcttagta-ccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttt 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||     |||||| |||||||||   |||||| |||| || ||||||| || |||||||||||| |||| |||    
T  6590843 accataatagaatggttatagtaccatataataatggtttcagtattaaattcgagtggccttaatagccatatttgagggtgtaattctcaaacgattt 6590942  T
Q  217 tctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgcc 316  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6590943 tctacaatgtagtagttaatcacacagttataactgaacttgttttatcctgaaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttagacagtgcc 6591041  T
Q  317 acgaaac 323  Q
    || ||||    
T  6591042 acaaaac 6591048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 192
Target Start/End: Original strand, 40865183 - 40865288
Alignment:
Q  83 aattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtctta 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40865183 aattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---cttaacaccataatagaatggtaacaataccatattggtttcagtatt-aaagagtggtctta 40865278  T
Q  183 gtaccatatt 192  Q
    ||||||||||    
T  40865279 gtaccatatt 40865288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 323
Target Start/End: Original strand, 23246867 - 23246998
Alignment:
Q  191 ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtct 290  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23246867 ttgagggtgtaattttggaacggttttctataaaacagtagttaatcgcacagttgtaggtgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtct 23246966  T
Q  291 gcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23246967 gcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 23246998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3045887 - 3045679
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtct 121  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |  |||||||||||||    ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||    
T  3045887 aatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttagaaaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtct 3045791  T
Q  122 caacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggtt 215  Q
    || |||||||| |||||||||| | ||||||||     |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||    
T  3045790 cagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttcaatatt-aaagagcggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaacgatt 3045692  T
Q  216 ttctacagtgcag 228  Q
    |||||||||||||    
T  3045691 ttctacagtgcag 3045679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3284912 - 3284757
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttg-ttttatcc 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| || ||   ||| |||||||     
T  3284912 aaagagtggtctcagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctattgtgcggtagttaaccgcacggttgtagctgagtttgtttttatca 3284813  T
Q  267 tgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  3284812 tgaagacggtgtggttgatagtctgtc-ttgcacaagtttgaacagtagcacgaaac 3284757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 295
Target Start/End: Original strand, 3357470 - 3357670
Alignment:
Q  98 aacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||     |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3357470 aacactatatttgagtggt---ctcagcaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcggtattaaa-gagtgatcttagtaccatatt 3357565  T
Q  193 gaagg-tgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttg-ttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtct 290  Q
      ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||   ||| ||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  3357566 ttagggtgtaaatcttgaacgattttctacagtgcaatggttaaccacacaattgtagttgtgtttgtttttatcatggagacggcgtggttgatagtct 3357665  T
Q  291 gcctt 295  Q
    |||||    
T  3357666 gcctt 3357670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 116
Target Start/End: Original strand, 23246728 - 23246808
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  23246728 catatttaagtggttgaaataccatattaacatttggagatgttaaaagttagaatagtgataacaccatatttgaatggt 23246808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23318181 - 23318092
Alignment:
Q  155 tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagtt 245  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||| |||   ||| |||||||||||||||||    
T  23318181 tggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatattggaggtgtaaatctcgaccatttttgtacgaagcaatagttaaccgcacagtt 23318092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 262
Target Start/End: Original strand, 45748562 - 45748647
Alignment:
Q  180 ttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacgg---ttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  45748562 ttagtaccatatttgaagtataattctcgaacgacgattttctacagtgcagtagttaatcgcatagttgtagttgaacttgtttt 45748647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2628954 - 2628876
Alignment:
Q  38 tatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||  |||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  2628954 tatttgagtggttgtagtaccatattgatttttgaagatgttaaaagttagattgatggtaacatcatatttgagtggt 2628876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29151088 - 29150964
Alignment:
Q  198 tgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttg 297  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| | ||||  |||||| |||  ||||| || || |||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||| |||||| |    
T  29151088 tgtaaatctcaaacggtcttctataatgcaaaagttaagcgcgtagttgtagctgaacttattttatcttggaggcgacgtggttgatagtttgcctt-g 29150990  T
Q  298 cacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29150989 cacaattttgagcagtgtcacgaaac 29150964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13344913 - 13344884
Alignment:
Q  85 ttagaatggtggtaacactatatttgagtg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13344913 ttagaatggtggtaacactatatttgagtg 13344884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15642495 - 15642379
Alignment:
Q  37 atatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatag 135  Q
    ||||||||||||| | | |||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||| || |||| ||| ||||   || | |||||||| ||    
T  15642495 atatttgagtggtcgtagtaccatcttgatattttggagaacttaaaggttagaatggtgataataccatatctgaatggt---cttagcaccataagag 15642399  T
Q  136 agtggtaatagtaccatatt 155  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  15642398 agtggtcacagtaccatatt 15642379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 323
Target Start/End: Original strand, 10160495 - 10160789
Alignment:
Q  24 tggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctca 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||    
T  10160495 tggtcgtaacaccatatttgagtagttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaataccatatttgagtgg---tctca 10160591  T
Q  124 acaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacag 223  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160592 acaccaaaatagagtggtcatagtaccatattgatttcagtattaaaagaatggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacag 10160691  T
Q  224 tgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10160692 tgca-tagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 10160789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35602251 - 35601952
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||   ||||    
T  35602251 agaatggttttaacaccatatttgagtggttgaaataccatattggtatttggagaagttaaaaattagaattttggtaacaccatatttgag---tggt 35602155  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35602154 ctcaacaccataatagagtggtcatagtaccatattggtttcaatatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggatgtgtaattctcgaacggttttc 35602056  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||| || |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  35602055 tacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctgggtttgttttatcctggaggcggcgtggttgatactctgtc-ttgcacaattttggacagtgccac 35601957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 123 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30658492 - 30658293
Alignment:
Q  123 aacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctaca 222  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30658492 aacaccatatttgagtggtcatagtaccatattggtttcagtattaaaaaagttgtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctaca 30658393  T
Q  223 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30658392 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgagtagtgccacgaaa 30658294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 9189584 - 9189868
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  9189584 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataaca 9189679  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagt 232  Q
    ||||||| | | |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9189680 gagtggttacaataccataggtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagt 9189778  T
Q  233 taaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||| |  ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9189779 taatcaaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttggacagtgccacgaaac 9189868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 9180491 - 9180789
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | | |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  9180491 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgctatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---c 9180586  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    |||||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  9180587 tcaacaccataacagagtggttacaataccataggtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttc 9180685  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9180686 tacagtgcagtagttaatcaaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttggacagtgccac 9180784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 1934756 - 1935058
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||| | | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||   ||||| |||||||||||||   |    
T  1934756 aatggtggtatcaccatatatgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtatgaacaccatatttgagtggt---c 1934851  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||  ||| ||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1934852 tcagaaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 1934950  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  1934951 tttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtg 1935049  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  1935050 ccacgaaac 1935058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 291
Target Start/End: Original strand, 25497089 - 25497359
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  25497089 aatggtggtatcaccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tc 25497184  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||     |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25497185 tcaacaccataacagagtggtaataataccatattaaagtggtttcaatatt-aaagagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaattctcgaacggt 25497283  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctg 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25497284 tttctacagtgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctg 25497359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30651213 - 30650959
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||     ||||| ||    
T  30651213 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcag 30651118  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||    
T  30651117 tattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgtttt 30651019  T
Q  263 atcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30651018 atcttggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 30650959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29678052 - 29677814
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     ||| | |     
T  29678052 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtatcaa 29677956  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||    
T  29677955 tattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgtgggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttttttt 29677857  T
Q  263 atcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaatttt 306  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29677856 atcctgtaggcggcttggttgatagtttgcc-ttgcacaatttt 29677814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12797243 - 12796955
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  12797243 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaata-ttagaatggtggcaataccatatttgagtggt---ctcaacaccataaca 12797148  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||| | | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12797147 gagtggttacaataccatattaaggtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacggtgcag 12797049  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  12797048 tagttaaccgcacagttgtagccggacttgttttatcctggagacggcgtggttgatagtctgtc-ttgaacaattttgggcagtgccacaaaac 12796955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Original strand, 17453346 - 17453564
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaat--taaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtg 117  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||     
T  17453346 agaatggtcgtatcaccatatttgagtggttgaaatattatattgatatttttagagatgttaaaaattagaatgatgataacaccatatttgagtggt- 17453444  T
Q  118 gtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggtttt 217  Q
      |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17453445 --ctcaacaccataatagagtggttacaataccatattagtttca--attata-gaatggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggtttt 17453539  T
Q  218 ctacagtgcagtagttaaccgcaca 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17453540 ctacagtgcagtagttaaccgcaca 17453564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Original strand, 7737661 - 7737916
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||| | | || ||||||     | ||| ||    
T  7737661 ttggagaagttaataattagcatggtggtaacaccatgtttgagtggt---ctcaacaccataatagagtggtgacaatatcatattaaagtgatttcag 7737757  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||    
T  7737758 tattaaaagaatggttttggtatcatattggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcaatagttaatcgaacaattgtagttgggcttgtttta 7737857  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  7737858 tcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacaaaac 7737916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 25478075 - 25478362
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||| |    
T  25478075 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacatcatatttgagtagt---ctcaacaccataaca 25478170  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25478171 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtactatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgca- 25478268  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||  |||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  25478269 tagttattcgcacagttgtagctgggcttgttttattctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgtcacgaaac 25478362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31327081 - 31326785
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt---- 116  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||        
T  31327081 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggttgta 31326983  T
Q  117 ----ggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattct 206  Q
        |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||     ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31326982 gaacggtggcaacaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaat-agtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattct 31326884  T
Q  207 cgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaatttt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31326883 cgaacggttttcta-agtgcagtagttaatcgcacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggtggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaatttt 31326786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 19892231 - 19892531
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||  ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||   |    
T  19892231 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccat--tgatagtttggagaatttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggt---c 19892324  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    | | |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  19892325 ttagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 19892423  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  19892424 tttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctg-tgttgcacaattttggacagtg 19892522  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    ||| |||||    
T  19892523 ccaggaaac 19892531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30631797 - 30631641
Alignment:
Q  138 tggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgt-aattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaac 236  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30631797 tggtcatagtaccatattggtttcaatattaaaagagttgtcttagtaccatattgaaggtgtaaattctcgaacggttttctacagtgcagtagataac 30631698  T
Q  237 cgc---acagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtct 290  Q
    |||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  30631697 cgcacaacagttgcagttgggcttgttttatcctggaggtggcgtggttgatagtct 30631641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29677554 - 29677411
Alignment:
Q  180 ttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgt 278  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29677554 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttattttatcctggaggcggcgt 29677455  T
Q  279 agttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29677454 ggttgatagtctg-ctttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 29677411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18344754 - 18344461
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||   |    
T  18344754 aatggtggtatcaccatatctgagaggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggt---c 18344659  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    ||| | |||||| |||||||||| |     |||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  18344658 tcagcgccataacagagtggtaaca-----atatgtggtttcagtattaaat-agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 18344565  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  18344564 tacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggagccggcgtggttaatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccac 18344466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19538713 - 19538545
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||   |||||    
T  19538713 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagtaaaaaattagaatggtagtaacaccataataga---gtggt 19538617  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    || | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  19538616 cttagcaccataatagagtggtcacattaccatattggtttcagtatt-aaagagtgatcttaataccatatt 19538545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28603635 - 28603328
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||   |    
T  28603635 aatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtaccatattaatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttaagtggt---c 28603540  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  28603539 tcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatattaaaa-agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacggt 28603441  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttg-ttttatcct----gaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaa 309  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||| || || ||||| |||||||||    | |||  |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  28603440 tttttacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaacttgtttttatcctggaggtaggtagcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgga 28603342  T
Q  310 cagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||||||||    
T  28603341 cagtgtcacgaaac 28603328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28855332 - 28855166
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  28855332 agaatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaagtaccatattgatattttgagaagttcaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggttg- 28855234  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatat 191  Q
      || ||||||| |||| |||| | | |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28855233 --cagcaccatagtagaatggtcacaataccatattggtttcagtatt--aagagtgatcttagtaccatat 28855166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 19094254 - 19094544
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |    ||||    
T  19094254 agaatggtggtagcaccatatttgagtgattgaaataccatattgacatttggagatattaaaagttagaatggtggtaacatcatatttaa---atggt 19094350  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaa--agagtggtcttagta-ccata-ttgaaggtgtaattctcgaa 210  Q
    |||   |||   ||||| |||| ||||||||||||     |||||| |||||||||   |||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  19094351 ctcgttacc---atagaatggtcatagtaccatataataatggtttcagtattaaattggagtggccttaatagccatatttgagggtgtaattctcgaa 19094447  T
Q  211 cggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttg-ttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||  |||| |||||||||| |||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  19094448 cggttttctacagtgcagtaattaatcgcacagttgtagctgagcttgtttttatcctggaggcggtgtggttgatattttgcc-ttgcacaattttg 19094544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 306
Target Start/End: Original strand, 19578316 - 19578462
Alignment:
Q  158 ttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggactt 257  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  19578316 ttttagtattaaa-gagtgattttaataccatattgaaggtgtaaatctcgaacgattttctacagtgcaatagttaaccgcccaattgtagttggactt 19578414  T
Q  258 gttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaatttt 306  Q
    |||||| |||| |||| || | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  19578415 gttttaccctggaggcagcatggttgatagtcttcc-ttgcacaatttt 19578462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Original strand, 21523636 - 21523785
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||| || || |||||||||| |||    
T  21523636 aaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttctacagt-----agttaaccgcacagttgtagctgaacttgttttaacct 21523730  T
Q  268 gaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
      | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21523731 agaagcggcgtggttgatagtct-cccttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 21523785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 40847362 - 40847660
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | || ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||  |||||||||||||   |    
T  40847362 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatcttgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggacgtaacatcatatttgagtggt---c 40847457  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagta-ccatattgaag-gtgtaattctcgaacgg 213  Q
    |||||||||| | | |||||||| | || ||||||     ||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||  || |||||| ||||||||||    
T  40847458 tcaacaccattacaaagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaa-gagtggtcttggtaaccatatttgagagtgtaaatctcgaacgg 40847556  T
Q  214 ttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagt 313  Q
    |||||||      ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  40847557 ttttcta-----tagtagttaaccacacagttgtagttggacttgttttatccaggaggtggcgtggttgatagtttgcc-ttgcacaactttgaacagt 40847650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Original strand, 42926714 - 42926824
Alignment:
Q  212 ggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaaca 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||    
T  42926714 ggttttctacggtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagcttgtattatcctggaggcggcgtggttgatagtctacc-ttgcacaattttgggca 42926812  T
Q  312 gtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||||||    
T  42926813 gtgccacgaaac 42926824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 323
Target Start/End: Original strand, 17545073 - 17545363
Alignment:
Q  33 catcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccata 131  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||| |||||||    
T  17545073 catcatatttgagtgttcgtaataccatattgatagtttagagaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatattttagtggt---ctcagcaccata 17545168  T
Q  132 atagagtggtaatagtacc----atattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgc 226  Q
    | | |||||||| | ||      | | ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  17545169 acaaagtggtaacaatatagattaaagtggtttccgtattaaa-gagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaaatctcgaatgattttctacaatgc 17545267  T
Q  227 agtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
      ||||||||||||| |||| || ||  |||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  17545268 gttagttaaccgcactgttgtagatgtgcttgttttatcctcgaggtggcgtggttgatagtct-tttttgcacaactttgaaaagtgtcacgaaac 17545363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 6297714 - 6297821
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  6297714 aaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtgg---tctcaacaacataatagaatggtaacaataccatattggtttcagtatt-aaagaatggtct 6297809  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||| ||||||    
T  6297810 tagtaacatatt 6297821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 30629181 - 30629088
Alignment:
Q  23 atggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30629181 atggtggtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattggtattttgagatgttaaatgttacaatggtggtaacaccatatttgagtggt 30629088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 323
Target Start/End: Original strand, 35638957 - 35639062
Alignment:
Q  217 tctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgcc 316  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  35638957 tctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatacgctgtc-ttgcacaattttgggcagtgcc 35639055  T
Q  317 acgaaac 323  Q
    |||||||    
T  35639056 acgaaac 35639062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 30619192 - 30619145
Alignment:
Q  23 atggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt 70  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30619192 atggtggtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgatattt 30619145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Original strand, 13291309 - 13291382
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatattt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  13291309 catatttgagtggttgaaataccaaattaatactaggagatgttaaatgttagaatggtggtaacaccatattt 13291382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Original strand, 13291455 - 13291571
Alignment:
Q  172 gagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaag 271  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||| || || |||| || |||| |   |    
T  13291455 gagtggttttagtacgatattggaggtttaattatcgaacggttttctactgagcaatagttaatcgcatagttgtagctgaacttattctatcatagtg 13291554  T
Q  272 gcggcgtagttgatagt 288  Q
    ||||||| |||||||||    
T  13291555 gcggcgtggttgatagt 13291571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 13521754 - 13522057
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||       
T  13521754 agaatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaacatatttgagtgg--- 13521850  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13521851 tctcaacaccataatagagtggtcatagtaccatattggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattaaaagtgtaattctcgaacggttttc 13521950  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagtt---gcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgc 315  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||    
T  13521951 tacagtgcagtagtcaaccgtacagttgcagcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgc 13522049  T
Q  316 cacgaaac 323  Q
    ||||||||    
T  13522050 cacgaaac 13522057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Original strand, 8649396 - 8649641
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||| | |    ||||    
T  8649396 agaatggtgataacatcatagttgagtggttgaaatatcatattgatatttggagatgttaaaaattagactagtggtaacaccatatctaa---atggt 8649492  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8649493 ctcaacatcataatagagtggtcacagtaccatattggtttcagtattaaaagagtggtgttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacagttttct 8649592  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctg 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  8649593 acagtgtagtagttaaccgcacagttgtagttaggcttgttttatcctg 8649641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Original strand, 8661203 - 8661448
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||| | |    ||||    
T  8661203 agaatggtgataacatcatagttgagtggttgaaatatcatattgatatttggagatgttaaaaattagactagtggtaacaccatatctaa---atggt 8661299  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8661300 ctcaacatcataatagagtggtcacagtaccatattggtttcagtattaaaagagtggtgttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacagttttct 8661399  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctg 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  8661400 acagtgtagtagttaaccgcacagttgtagttaggcttgttttatcctg 8661448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 37259640 - 37259942
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |    
T  37259640 aatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---c 37259735  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37259736 tcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 37259834  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  37259835 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgagtagtg 37259933  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  37259934 ccacgaaac 37259942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 37264327 - 37264629
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |    
T  37264327 aatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---c 37264422  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37264423 tcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 37264521  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  37264522 tttctacagtgcagtagttaaccgcacaattgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcataattttgggcagtg 37264620  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  37264621 ccacgaaac 37264629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19102295 - 19102007
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | |   |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  19102295 catatttgagtggtcgtatggccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacatcatatttgagtggt---ctcaacaccataaca 19102200  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19102199 gagtggtaacaataccatattaaaatggttttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 19102101  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19102100 tagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcctggaggcgacgtggttgatagtctg-ttttgcacaattttgagtagtgccacgaaac 19102007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47574986 - 47574816
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  47574986 agaatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgag---tggt 47574890  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattg 193  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47574889 ctcaacaccataatagagtggtcatagtaccatattggtttcagtattaaaagagtggtcatagtaccatattg 47574816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16421361 - 16421060
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||   |||||    
T  16421361 aatggtcgtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtc 16421266  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||| ||| | ||| ||||     |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16421265 tcagcaccataacagagtgataacaatacaatattaaagtggtttcaatatt-aaagagtggtcttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcggacggt 16421167  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16421166 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctgtaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 16421068  T
Q  315 ccacgaaa 322  Q
    ||||||||    
T  16421067 ccacgaaa 16421060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 31729154 - 31729452
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||   |    
T  31729154 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaag-ttagaatggttgcaacaccatatttgagtggt---c 31729249  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    |||||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31729250 tcaacaccataacagagtggttacaataccataggtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttc 31729348  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  31729349 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttatcctggaggcggcgtgattgattgtctgcc-ttgcacaattttgggtagtgccac 31729447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Original strand, 33463166 - 33463421
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     ||||| ||    
T  33463166 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagagttgtaatagtacaatattaaagtggtttcag 33463262  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||    
T  33463263 tattaaaagaatggttttggtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagttgtgcttgtttta 33463362  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||||||||  ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33463363 tcctggaggcggcggggttgacaatctgcc-ttgcacaactttggacagtgccacgaaac 33463421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 315
Target Start/End: Original strand, 48276459 - 48276701
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||| ||    
T  48276459 ttggagatgttaataattagaatggtggtaacaccatattcgagtggt---ctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcag 48276555  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||    
T  48276556 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattctcgaatggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaacttgtttta 48276655  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgc 315  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  48276656 tcctggaggcggcgtggttgatag------tttgcacaattttgaacagtgc 48276701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Original strand, 8030286 - 8030541
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||    
T  8030286 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaaatggttttag 8030382  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || ||| |||||||||    
T  8030383 tattaaaagaatgatcttggtatcatattggaggtgtaattttcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacatttgtagctgggcttgtttta 8030482  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  8030483 tcctggaggcagcgttgttgatagtctatc-ttgcacaattttgggcagtgccacaaaac 8030541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 55252003 - 55251749
Alignment:
Q  71 ggagaaattaaaaattagaa-tggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagt 164  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| |||    
T  55252003 ggagaaattaaaaagtggaaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagt 55251907  T
Q  165 attaaaagagtggtcttagtaccatattgaa-ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  55251906 attaaa-gagtggtcttagtaccatattcaaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgtacagttgtagttgggcttgtttta 55251808  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55251807 tcctggaggtggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttggacagtgccacgaaac 55251749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 47244580 - 47244278
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||| | |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  47244580 aatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---c 47244485  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  47244484 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgggggtttaattctcgaacggt 47244386  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||  | ||||||||||||||    
T  47244385 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgtgcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctttc-ttcaataattttgaacagtg 47244287  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  47244286 ccacgaaac 47244278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 5927982 - 5928284
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtct 121  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| |   |||||| |||||| || || ||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||   ||    
T  5927982 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtggtaccattttgatagtttgaaaaacttaaaattagaacggtgttaacaccatatttgagtggt---ct 5928078  T
Q  122 caacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtt 215  Q
    || |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||    
T  5928079 cagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttaagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacgatt 5928177  T
Q  216 ttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgc 315  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5928178 ttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggtgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgagcagtgc 5928276  T
Q  316 cacgaaac 323  Q
    ||| ||||    
T  5928277 cactaaac 5928284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 5271186 - 5271484
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  5271186 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---c 5271281  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    | |||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  5271282 tgaacaccataacagagtggttacaataccataggtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagcaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 5271380  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||| |||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  5271381 tacagtgcaatagtgaatcaaacagttgtagttggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccac 5271479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 115 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31269276 - 31269064
Alignment:
Q  115 gtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcg 208  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31269276 gtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcg 31269178  T
Q  209 aacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttga 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||      
T  31269177 aacggttttctacagtgcagtagttaaccacacggttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttag 31269079  T
Q  309 acagtgccacgaaac 323  Q
     ||||||||||||||    
T  31269078 gcagtgccacgaaac 31269064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 12823664 - 12823959
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  12823664 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---c 12823759  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||| ||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12823760 tcagcaccataacagagtggtaacaataccattttaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcgaacggt 12823858  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||       || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||  |||||    
T  12823859 tttctacagtgcagtagttagccgca------tagatggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtttgtc-ttgcacaattttgggcagtg 12823951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31273763 - 31273551
Alignment:
Q  115 gtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcg 208  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31273763 gtggtctcagcaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcg 31273665  T
Q  209 aacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttga 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||     
T  31273664 aacggttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgg 31273566  T
Q  309 acagtgccacgaaac 323  Q
     ||||||||||||||    
T  31273565 gcagtgccacgaaac 31273551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13059741 - 13059440
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||   |    
T  13059741 aatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggt---c 13059646  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||     |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13059645 tcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatatt-aaagagtggtcttagaaccatatttgaaggtgtaa-tctcgaacggt 13059548  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||| ||  |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||   |||||    
T  13059547 tttctacaatgcagtagttaaccacacagttgtagctgagcttgttttattctagaggcggagtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttatgcagtg 13059449  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  13059448 ccacgaaac 13059440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 322
Target Start/End: Original strand, 19540955 - 19541225
Alignment:
Q  53 aataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtacca 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| | || ||    
T  19540955 aataccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatagtgttaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccatagcagagtggtaacaatatca 19541050  T
Q  152 tat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagtt 245  Q
    |||     |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  19541051 tattaaagtggtttcaatatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaactgtt 19541149  T
Q  246 gcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaa 322  Q
    | || |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  19541150 gtagctggacttgttttatcctataggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgtacaattttaaacaatgccacgaaa 19541225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8694029 - 8693757
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||   ||||  ||||||| |    
T  8694029 catatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggt---ctcagaaccataaca 8693934  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8693933 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcag 8693835  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    ||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  8693834 tagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatccttgaggcggcgtggttgatagtatgtc-ttgcacaattttg 8693757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51698201 - 51697947
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattg-----gtttta 162  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||      |||| |    
T  51698201 tttggagaaattaaag-ttaggatggtggtaaaaccatatttgagtggt---ctcaacaccctaacagagtggtgacaataccatattaaagtagtttca 51698106  T
Q  163 gtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||    
T  51698105 atattaaa-gagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca-tagttaaccgcacaattgtagttgagcttgttt 51698008  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  51698007 tatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgagcagtgtcatgaaac 51697947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 31298155 - 31298323
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||    
T  31298155 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaaaaccatatttga---gtggt 31298251  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  31298252 ctcaacaccatagtagagtggtcacaataccatattggtttcaatatt-aaagagtggttatagtaccatatt 31298323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12878523 - 12878269
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattgg-----ttttag 163  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||  ||||||| |  |||||||| | |     ||| |     
T  12878523 ttggagaagttacaaattaaaatggtggtaacaccatatttgagtgtt---ctcaacaccataactgagtggtcaccgtaccatactagagtcgtttcaa 12878427  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| || || ||||||||||    
T  12878426 cattaaaagagtggtcttagtatcatattggaggtgtaattctcgaacggttttctac-gtgcagtaattaacaacacagttgtagctgaacttgtttta 12878328  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    | ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12878327 ttctggaggtggcgtgattgatagtctg-ctttgcacaattttgaaaagtgtcacgaaac 12878269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Original strand, 33468783 - 33469038
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     ||||| ||    
T  33468783 ttggagaagttaataattagaatgatggtaacaccaaatttgagtggt---ctcaacatcataatagagttgtaatagtaccatattaaagtggtttcag 33468879  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||| || ||| ||| || ||  |||||||||    
T  33468880 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattctcaaaccttattcaacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctgagcttgtttta 33468979  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    || || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  33468980 tcatggaggtggcgtggttgacagtctgcc-ttgcacaactttgggcagtgccacaaaac 33469038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 42758528 - 42758820
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatag 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||   ||||  ||||||||||    
T  42758528 catatttgagtgattgaaataccatattgacatttggagatgttaaaagttagaatggtggtaacaccatatttaaatggt---ctcagtaccataatag 42758624  T
Q  136 agtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaa--agagtggtcttagta-ccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgc 226  Q
    | |||| | ||||| ||||     |||  | ||||| |||  | |||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42758625 aatggtcacagtacgatataatagtggggtcagtatcaaattaaagtggctttaatagccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgc 42758724  T
Q  227 agtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42758725 agtagttaatcgcacagttgtttttggactagttttattctggaggcgacgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 42758820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 47574838 - 47574671
Alignment:
Q  134 agagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagtt 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  47574838 agagtggtcatagtaccatattggtttcagtattaaaagagttgtcttagtac-----tgaaggtgtaattctcgaacagttttctacatggcagtagtt 47574744  T
Q  234 aaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| | || | |||||||||||||    
T  47574743 aaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctggatgcggcgtgattgatattttgtc-ttgcacaattttg 47574671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19906535 - 19906298
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| | || ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |   |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||     ||||| ||    
T  19906535 ttggagaagtaaataattagaatggtgatagcaccatatttgagtgat---ctcggcaccataatagagtggtaacaataccatattagagtggtttaag 19906439  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| | |  ||||||| |||||  |||||||||    
T  19906438 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattttcgaacggttttctaaagcgcagtagtt-atcaaacagttgtagttgagcttgtttta 19906340  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaatttt 306  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19906339 tcctggaggcggcggagttgatagtctgtc-ttgcacaatttt 19906298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19106940 - 19106720
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |   |    
T  19106940 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgtt---c 19106845  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||     |||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19106844 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttctgtattaaa-gagtgatcttaataccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 19106746  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19106745 tttctacagtgcagtagttaaccgca 19106720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41817111 - 41816944
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   |  ||||    
T  41817111 agaatggttgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgatacttggagaagttaaaaatt-gaatgatggtaacatcatattt---taatggt 41817016  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41817015 ctcaacaccataatagagtggtaataacaccacattggtttcaacatt-aaagagtggtcttagtaccatatt 41816944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12874729 - 12874571
Alignment:
Q  162 agtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || ||  |||||||    
T  12874729 agtattaaaagggtggtcttactaccatattggaagtgtaattcattaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacaattttagctgagcttgttt 12874630  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaa 321  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12874629 tatcctggaggcggcgtgattgatggtctg-ctttgcacaattttagacagtgccacgaa 12874571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 7902934 - 7903041
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7902934 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattggtttcagtatt-aaagagtggtct 7903029  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  7903030 tagtaccatatt 7903041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4551180 - 4551036
Alignment:
Q  170 aagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctg 268  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||   |||||||||||||    
T  4551180 aagaatggtcttagtaccatatttgatggtgtaaatcttaaacggttttctacagtgcagtagttaatcgcagagttgtaattgagtttgttttatcctg 4551081  T
Q  269 aaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  4551080 gaggcggcgtagttgatagtctgtc-ttgcacaactttgagcagtg 4551036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34560693 - 34560588
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  34560693 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattggtttcaatatt-aaagagtggtct 34560598  T
Q  181 tagtaccata 190  Q
    ||||||||||    
T  34560597 tagtaccata 34560588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Original strand, 32082027 - 32082154
Alignment:
Q  193 gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgc 292  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  32082027 gaaggtgtaaatctcgaatggttttctacactgcagtagttaaccgcacaattgtaactgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagt-tgc 32082125  T
Q  293 ctttgcacaattttgaacagtgccacgaaa 322  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32082126 c-ttgcacaattttggacagtgccatgaaa 32082154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40840662 - 40840429
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| || |||||||| |  |||||| |||||||||   ||||    
T  40840662 agaatggttgtagcatcatatttgagtggttgaaatattacattgatatttggagatgttacaagttagaatgatcctaacaccatatttgag---tggt 40840566  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccat-----attggttttagtattaaaagagtggtcttagta-ccatattgaaggtgtaattctcgaacgg 213  Q
    | ||| | |||| ||| ||||| ||||||||||     |||||||| ||| |||||||||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  40840565 cacaaaatcatagtagggtggtcatagtaccataattgattggtttcagttttaaaagagtgacattaatagtcatattggaggtgtaattctcgaacga 40840466  T
Q  214 ttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagtt 251  Q
    ||||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  40840465 ttttct-tagtgcagtggttaatcgcacagttgtagtt 40840429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 3997885 - 3997992
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |    
T  3997885 aaaattagaatggtggtaacaccatatttga---gtggtctcaacaccataataaaatggtagcaataccatattggtttcagtatt-aaagaatggttt 3997980  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  3997981 tagtaccatatt 3997992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31765998 - 31765916
Alignment:
Q  240 acagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31765998 acagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 31765916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 154
Target Start/End: Original strand, 32081895 - 32082024
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  32081895 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttga---gtggtc 32081990  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat 154  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  32081991 tcagcaccataatagagcggtaacaataccatat 32082024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 213
Target Start/End: Original strand, 55810176 - 55810234
Alignment:
Q  155 tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacgg 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55810176 tggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaacgtgtaattctcgaacgg 55810234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31766142 - 31766012
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||   |    
T  31766142 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggt---c 31766047  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt 155  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31766046 tcagcaccataatagagtggtaacaataccatatt 31766012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15134449 - 15134283
Alignment:
Q  58 catattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-- 154  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||| || | | ||| ||||      
T  15134449 catattgatattttggagaacttaaatgttagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtcttaacaccataatagagtagtcacaatacgatatta 15134353  T
Q  155 ---tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaa-ggtgtaattctcgaacggttttctac 221  Q
       ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  15134352 gagtggttttagtatt-aaagaatagccttagtaccatatttaagggtataaatctcgaacagttttctac 15134283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2820024 - 2819874
Alignment:
Q  173 agtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaag 271  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  ||| ||||| || |  ||||||||||||||| |     
T  2820024 agtggtcttagtgtcatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttctatagtgcaacagttaattgcatagttgtagctaaacttgttttatcctggac 2819925  T
Q  272 gcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| | || |||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2819924 gcggcatggtagatagtctacc-ttgcacaattttggacagtaccacgaaac 2819874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6943086 - 6943009
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagt 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6943086 catatttgagtggttgtagtaccatattgatagttttgagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagt 6943009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16948157 - 16948063
Alignment:
Q  196 ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtct 290  Q
    ||||||||||| ||| | ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16948157 ggtgtaattctagaatgattagctacagtgtagtagttaatcgcacagttgtcaatgaacttgttttatcctggaggcggcgtagttgatagtct 16948063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32545295 - 32545141
Alignment:
Q  153 attggttttagtattaaa-agagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagtt 251  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  32545295 attggtttcagtattaaatagagcagtcttagtaacatattggagttgtaattctcgaacgattaattacagtgcagtagttagtcgcacaattgtagtt 32545196  T
Q  252 ggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaatttt 306  Q
    |  ||||||||||| || |  |  ||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  32545195 gagcttgttttatcatggatacaacgtggttgatagtctgtcttgacacaatttt 32545141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39319841 - 39319735
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| |||||||||||| |||| | | ||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||    
T  39319841 aaaattaaaatggtggtaacaccatatttga---gtgttctcagcaccataatagaatggtcacaatactatattggtttcagtatt-gaagagtgatct 39319746  T
Q  181 tagtaccatat 191  Q
    |||||||||||    
T  39319745 tagtaccatat 39319735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 55073573 - 55073485
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatt 108  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  55073573 agaatggtggtagcaccatatttgagaggttgaaataccacatttatatttggagatgctaaaatttagaatggtggcaacaccatatt 55073485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40408389 - 40408284
Alignment:
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaag-gtgtaattct--cgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtt 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  40408389 tattaaaa-agtggtcttagtaccatatttaagaatgtaaatcttgagaacggttttctacagtacagtaattaaccacacaattgtagttgaacttgtt 40408291  T
Q  261 ttatcct 267  Q
    |||||||    
T  40408290 ttatcct 40408284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32545419 - 32545357
Alignment:
Q  37 atatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaa 99  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  32545419 atatttgagtggttagaataccatattgatatttggaggtcttaaaagttagaatggtggtaa 32545357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55073438 - 55073389
Alignment:
Q  172 gagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctac 221  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  55073438 gagtggtcttaatactatattggatgtgtaattctcgaacggttttctac 55073389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 212
Target Start/End: Original strand, 1151211 - 1151254
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacg 212  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1151211 aaagagtgattttagtaccatactgaaggtgtaattctcgaacg 1151254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 59
Target Start/End: Original strand, 30054765 - 30054804
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaatacca 59  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30054765 agaatggtggtagcatcatatttgagtggttgaaatacca 30054804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55073359 - 55073320
Alignment:
Q  188 atattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 227  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55073359 atattggatgtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 55073320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 113
Target Start/End: Original strand, 13065617 - 13065670
Alignment:
Q  59 atattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagt 113  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13065617 atattgatattttgagaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagt 13065670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16954588 - 16954546
Alignment:
Q  72 gagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtg 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16954588 gagaagttaaaagttagaatggtggaaacactatatttgagtg 16954546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 116
Target Start/End: Original strand, 39217182 - 39217268
Alignment:
Q  31 aacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  39217182 aacaccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaagttaaaattcagaatgatcgaaacaccatatttgagtggt 39217268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 193
Target Start/End: Original strand, 42316527 - 42316644
Alignment:
Q  73 agaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaag 172  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |  | | || |||||||  || ||||||||||     
T  42316527 agaagttaaaaattaaaatggtgataataccatatttga---gtggtatcagcaccataatagagttgccacaataacatattgaattcagtattaaaat 42316623  T
Q  173 agtggtcttagtaccatattg 193  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  42316624 agtagtcttagtatcatattg 42316644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 116
Target Start/End: Original strand, 52690889 - 52690986
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||| | | |||||||| |||| |||||| || |||||  |||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  52690889 agaatggtggtagcatcgtatttgagtggtcgtagtaccatatcgatattttggaaaagttaaatgttagaatgatgataacacaataattgagtggt 52690986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2820106 - 2820040
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt---ggagaaattaaaaattagaatggtggtaa 99  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  2820106 catatttgagtggttgtagtaccatatagatattttgcggagaacttaaatgttagaatggtggtaa 2820040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16953182 - 16953131
Alignment:
Q  255 cttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16953182 cttgttttatcctggaggcgttgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttg 16953131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20513178 - 20513137
Alignment:
Q  280 gttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20513178 gttgatagtctgc--ttgcacaattttgagcagtgccacgaaac 20513137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23093398 - 23093303
Alignment:
Q  58 catattgatatttg-gagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt 155  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  23093398 catattgatattttagagaacttaaaggttagaatgatgataacactatattc---tggtggtcttagcaccataatagagtggttacaataccatatt 23093303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55149797 - 55149765
Alignment:
Q  175 tggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctc 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55149797 tggtctcagtaccatattgaaggtgtaattctc 55149765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8070005 - 8069708
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  8070005 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt--- 8069910  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8069909 ctcaacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttatct 8069810  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
T  8069809 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaa-tttggacagtgccacg 8069712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8883497 - 8883198
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  8883497 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt-- 8883401  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
     |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8883400 -ctcaacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaatattggtctttgtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 8883302  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  8883301 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcagcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccac 8883203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3672913 - 3672614
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  3672913 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt-- 3672817  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
     ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3672816 -ctcaacatcataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 3672718  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  3672717 tacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccat 3672619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3692945 - 3692646
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  3692945 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt-- 3692849  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
     ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692848 -ctcaacatcataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 3692750  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  3692749 tacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccat 3692651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8888257 - 8887966
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  8888257 agaatggtcgtagcaccatatttgagttgttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt-- 8888161  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
     |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8888160 -ctcaacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttc 8888062  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgc 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||    
T  8888061 tacagtgtagtagttaaccgcacagttgcagctggatttgttttatcctggaggcggcgtggttgataatctgtc-ttgcacaattttggacagtgc 8887966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3033970 - 3033672
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  3033970 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt--- 3033875  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3033874 ctcaacatcataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattgatcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 3033775  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  3033774 acagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatccttgaggcggtgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccatg 3033676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 288
Target Start/End: Original strand, 6596123 - 6596388
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  6596123 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatactatattgacatttggagaagttagatgttagaatggtggtaacacaatatttgagtggt--- 6596219  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6596220 ctcagcaccataatagagtggtcacagcaccatattggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 6596319  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagt 288  Q
    ||| |||||||||||||| || | ||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6596320 acaatgcagtagttaaccacataattgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagt 6596388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 758131 - 758433
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |    
T  758131 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---c 758226  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  758227 tcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 758325  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  758326 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggtagtg 758424  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  758425 ccacgaaac 758433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 23665886 - 23666188
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||   ||||| |||||||||||||   |    
T  23665886 aatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtatgaacaccatatttgagtggt---c 23665981  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23665982 tcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 23666080  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  23666081 tttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 23666179  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  23666180 ccacgaaac 23666188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 24038134 - 24038436
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||   ||||| |||||||||||||   |    
T  24038134 aatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtatgaacaccatatttgagtggt---c 24038229  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24038230 tcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 24038328  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  24038329 tttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 24038427  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  24038428 ccacgaaac 24038436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 23661227 - 23661527
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||   ||||| |||||||||||||   |    
T  23661227 aatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtatgaacaccatatttgagtggt---c 23661322  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23661323 tcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 23661421  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  23661422 tttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 23661520  T
Q  315 ccacgaa 321  Q
    |||||||    
T  23661521 ccacgaa 23661527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 14438462 - 14438760
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||| | || || |||||||||||||   |    
T  14438462 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaag-ttagaatggtagcaaaaccatatttgagtggt---c 14438557  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
    |||||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14438558 tcaacaccataacagagtggttacaataccataggtggtttcaatattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttc 14438656  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  14438657 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgattgtctgcc-ttgcacaattttgggtagtgccac 14438755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18467555 - 18467253
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||   |    
T  18467555 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggt---c 18467460  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |    
T  18467459 tcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaagtgtaattctcgaacgat 18467361  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18467360 tttctacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagttggacttgttttatcctggaggcggcgtggttaatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 18467262  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  18467261 ccacgaaac 18467253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27709262 - 27708964
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |      
T  27709262 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcg-- 27709166  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc 218  Q
     |||||||||||||||||||| | | ||| |||  |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27709165 -caacaccataatagagtggttacaatactataggtggtttcagtattgaa-gagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttc 27709068  T
Q  219 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||     
T  27709067 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgaagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctacc-ttgcataattttgggcagtgccat 27708969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 7570981 - 7571283
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||   |    
T  7570981 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttataatggtattaacaccatatttgagtggt---c 7571076  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7571077 tcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gcgtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggt 7571175  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  7571176 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtgattgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtg 7571274  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  7571275 ccacgaaac 7571283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29350570 - 29350268
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |   |    
T  29350570 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaaa-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgct---c 29350475  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||||||| |||| |||||||||| | || ||||||     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29350474 tcaacactataacagagtggtaacaatatcatattaaagtgattttagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 29350376  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  29350375 tttctacagtgcagtaattaaccacacagttgtagttgagcttgttttatcctggaggcggcatggtagatggtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 29350277  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  29350276 ccacgaaac 29350268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20520370 - 20520082
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | | ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||| |||||||| |    
T  20520370 catatttgagtggtcgtagtgcaatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatattttagtggtt---tcagcaccataaca 20520275  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  20520274 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtactatatttgaaggtgtaaatctcgaacagttttctacagtacag 20520176  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  20520175 tagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcttggaggcggcgtggttgatagtct-cccttgcacaatcttgggcagtgccacgaaac 20520082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 317
Target Start/End: Original strand, 12965687 - 12965932
Alignment:
Q  73 agaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtatt 167  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||     ||||| ||||||    
T  12965687 agaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagttgt---ctcagttccataatagagtggtaatattaccatattaaagtggtttcagtatt 12965783  T
Q  168 aaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12965784 aaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattcttgaacagttttctacagtgcattagttaatcgaacaattgtagttggacttgttttatcct 12965883  T
Q  268 gaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgcca 317  Q
    | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  12965884 ggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgcca 12965932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Original strand, 12971443 - 12971698
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||    
T  12971443 ttggagaagttaataattagaatagtagtaagacaatatttgagtggt---ctcagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggttttag 12971539  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||    
T  12971540 tattaaaagattagtcttggtaccatattggaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaattgaacagttgtagttgggcttgtttta 12971639  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||  |||||||||  |||||| |||| | |||||||||||||  || |||||||||||    
T  12971640 tcctagaggcggcgtgattgataatctgtc-ttgcacaattttgggcaatgccacgaaac 12971698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18472337 - 18472037
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  |||||| |||||||||||||   |    
T  18472337 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatgatattaacaccatatttgagtggt---c 18472242  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| | |||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  18472241 tcagcaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 18472143  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  18472142 tttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttaggcagtg 18472044  T
Q  315 ccacgaa 321  Q
    |||||||    
T  18472043 ccacgaa 18472037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 55431631 - 55431343
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | |  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  55431631 catatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataaca 55431536  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||| ||| | | ||||||     |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55431535 gagtgataacaatgccatattaaggtggtttaagta-tcaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgcaattctcgaacagttttctacagtgcag 55431437  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  55431436 tagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcataatttttgacagtgtcacgaaac 55431343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 3657017 - 3657305
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    |||||||| |||| ||| |    
T  3657017 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacatcatatttga---ttggtctcagcaccgtaaca 3657112  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaa-ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | || |||||     |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3657113 gagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagcatt-aaagagtggtcttagtaccatatttaagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcag 3657211  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3657212 tagttaatctaacagttgtagctggacttgttttatcttggaggtggcatggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 3657305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 39775491 - 39775793
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||    
T  39775491 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaactt-aaagttagaatggtattaacaccatatttga---gtggtc 39775586  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| || ||||| ||||| |||| | ||||||||     |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |    
T  39775587 tcagcatcataacagagtagtaacaataccatattaaagtggtttcagtagt-aaagagttgtcttagtaccatatttggaggtgtaattttcgaacgat 39775685  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  39775686 tttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 39775784  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  39775785 ccacgaaac 39775793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 323
Target Start/End: Original strand, 49971322 - 49971489
Alignment:
Q  155 tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttgg 253  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  49971322 tggtttcagtattaaa-gagtggtctcagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgaagtagttaactgcacagttgcagctgg 49971420  T
Q  254 acttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  49971421 acttgttttatcctggaggcggcgtgattgatagtctgcc-ttgcacaattttggatagtgccacgaaac 49971489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 2207512 - 2207757
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttgga-gaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||| ||| || |||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  2207512 aatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttgaagaaattaaag-ttagaacggtggcaacaccatatttgagtggt---c 2207607  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||     |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  2207608 tcaacaccataatagagtggtaacaataccatataaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaagggt 2207706  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatc 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  2207707 tttctacagtacagtagttaaccgcacaattgtagatgggcttgttttatc 2207757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3419288 - 3419023
Alignment:
Q  57 ccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||   | || | |||||| |||| ||||| | ||| |||||    
T  3419288 ccatattgatattttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatt-gagtggt---cacagcgccataacagagcggtaacaatacaatatt 3419194  T
Q  156 -----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcag 249  Q
         ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  3419193 aaagtggtttcagtattaa--gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacgatgcaatagttaaccgcacagttgcag 3419096  T
Q  250 ttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3419095 ttgagcttgttttatcctgaaggtggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 3419023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28125420 - 28125251
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtatta 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||| | |||||    
T  28125420 ttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtt---tcaacactataatagagtggtcacagtaccatatgagtttcaatatta 28125324  T
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcaca 242  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28125323 aaagagttgtcttaataccatattggaggtgtaatactcgaactgttttctacagt-cagtagttgaccgcaca 28125251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 323
Target Start/End: Original strand, 32474532 - 32474745
Alignment:
Q  115 gtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtc-ttagtaccatattga-aggtgtaattctc 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||     |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  32474532 gtggtctcagcaccataatagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtatt-aaagagtggtctttagtaccatatttagaggtataattctc 32474630  T
Q  208 gaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  32474631 gaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggagacggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttg 32474729  T
Q  308 aacagtgccacgaaac 323  Q
      ||||||||||||||    
T  32474730 ggcagtgccacgaaac 32474745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 25726551 - 25726777
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||      
T  25726551 agaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacaccatatttgagtggt-- 25726648  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattgg-----ttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacgg 213  Q
     || |||||||||||||  |||| | | ||||||||| |     ||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25726649 -cttaacaccataatag--tggtcacaataccatattagaatgatttcagtatttaa-gagtggtcttagtaccatattggaggtgtaaatctcgaacgg 25726744  T
Q  214 ttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25726745 ttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttg 25726777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 55326106 - 55325848
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  55326106 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggaaaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---c 55326011  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaagg-tgtaattctcgaacgg- 213  Q
    |||||||||||| ||| || ||| | || ||||||     ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||     
T  55326010 tcaacaccataacagaatgataacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccgtatttaagggtgtaattctcgatcggg 55325912  T
Q  214 ttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgt 278  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  55325911 ttttctacagtgca-tagttaaccgcacagttgtaactgggcttgttttatcctggaggcggcgt 55325848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 46964282 - 46964043
Alignment:
Q  85 ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtc 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||     |||||| ||||||||| ||||||||    
T  46964282 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataacagagtggtaacaataccatatcaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtc 46964187  T
Q  180 ttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgt 278  Q
    ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |  ||   ||||||||||||  ||| ||| |    
T  46964186 ttaataccatatttgagggtgtaaatctcgaacggttttctatagtgcaatagttaaccacatagttgtatctgagtttgttttatcctagaggtggcat 46964087  T
Q  279 agttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
     | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  46964086 gggtgatagtctg-cattgcacaattttaaacagtgccatgaaac 46964043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 323
Target Start/End: Original strand, 12112539 - 12112706
Alignment:
Q  155 tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttgga 254  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || ||| |||||      
T  12112539 tggtttaagtattaaaagaatagtctttgcaccatattggaggtgtaaatctcgaatggttttctacagtgtagcagttaaccacccatttgtagttgag 12112638  T
Q  255 cttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12112639 cttgttttatcctggaggcggtgtggttgatagtctgtc-ttgcacaactttggacagtgccacgaaac 12112706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 10586011 - 10586118
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  10586011 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccaaaatagaatggtaacaataccatattggtttcagtatt-aaagaatggtct 10586106  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  10586107 tagtaccatatt 10586118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29715774 - 29715672
Alignment:
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||||    
T  29715774 acagtgcaatagttaaccgcacagctgtagctggacttgttttatcctagaggcggcgtggttgatagtcttcc-tagcacaattttggacagtgtcacg 29715676  T
Q  320 aaac 323  Q
    ||||    
T  29715675 aaac 29715672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16014005 - 16013826
Alignment:
Q  49 ttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagta 148  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16014005 ttgaaataccatattaacgtttgcagatgttaaaatttagaatggtggtaacatcatatttga---atggtcacaataccataatagagtggtcatagta 16013909  T
Q  149 ccat-----attggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 227  Q
    ||||     |||||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||    
T  16013908 ccataattgattggtttcaatattaaaata-tggtgttactaccatattggaggtgtaattctcgaatgattttcaatagtgca 16013826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31002963 - 31002856
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||  || || ||||||||||||    
T  31002963 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtctcaataccataatagaatggtaacaatatcatattggtttcggtgtt-aaagagtggtct 31002868  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||| ||||||    
T  31002867 tagtaacatatt 31002856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Original strand, 13166911 - 13166998
Alignment:
Q  29 gtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13166911 gtaacaccctatttaagtggttgaaataccatactgacatttggagatgttaaaagttagaatagtggtaacaccatatttgagtggt 13166998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 207
Target Start/End: Original strand, 10708440 - 10708629
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | | | ||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  10708440 aatggtggtatcaccatatttgagtgctcgtagtaccatattgatagttcggagaacttaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttga---gtggtc 10708535  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-------tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctc 207  Q
    ||| |||||||| |||||| ||| | || || ||       |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  10708536 tcagcaccataacagagtgttaacaatatcacatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttagtcccatatagaaagtgtaattctc 10708629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Original strand, 45904366 - 45904442
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttt 160  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||    
T  45904366 aaaattagaatggtggtaacaccatatttga---gtggtctcaacaccataatagaatagtaacaataccatattggttt 45904442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Original strand, 45904822 - 45904898
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttt 160  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  45904822 aaaattagaatggtggtaacaccatatttga---gtggtctcaacaccataataggatggtaacaataccatattggttt 45904898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 116
Target Start/End: Original strand, 47566909 - 47567005
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||| | |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47566909 agaatggtggtagcacgatatttgagtaattgaaagatcatattgatatttggatatattaaattttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt 47567005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 47567091 - 47567172
Alignment:
Q  153 attggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagtta 234  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  47567091 attggtttcggtattaaaatagtgctcttagtatcatattggagatgtaattctcgaaggattttctacagtgcaatagtta 47567172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Original strand, 19276683 - 19276980
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt--ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  | || | |||||  |||||| | || |||||| | |||||||||||       
T  19276683 aatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccatattgatatttttgaaggatttaaaggttagaacgatgataacaccaaatttgagtggt--- 19276779  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
     | | |||||||||||||| || |||||| ||||||     ||| ||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||  |    
T  19276780 -ttagcaccataatagagtagtcatagtatcatattagactggtgttagtat-aaaagagatgtcttcgtatcatattagaggtgtaaatctcgaacaat 19276877  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||  | |||  |||||||||| ||  ||||  ||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||||    
T  19276878 tttcaacattgcagtagctaaccgcatagttttaattgagcttgttttattctagaggcaacgtggttgatagtctgtc-ttacacaattttcgacagtg 19276976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20507807 - 20507681
Alignment:
Q  196 ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
    ||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||||||| ||||||  |   ||||| |||||||||||||  ||| || || |||||||||||||| |    
T  20507807 ggtgtaagtctcaaccggttggctagagtgcagtagttaatcgcacaactattgttggtcttgttttatcctagaggtggtgtggttgatagtctgcc-t 20507709  T
Q  296 tgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20507708 tgcacaattttgagcagtgccaccaaac 20507681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Original strand, 17026018 - 17026139
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctg 268  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  | || ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||     
T  17026018 aaagagtggtattaggaccatattaaaggtgtatgtgtcaaattgttttctaccgtgcagtagtta-ccgcacaattgtagctgaacttgttttatccta 17026116  T
Q  269 aaggcggcgtagttgatagtctg 291  Q
    ||| |  ||| ||||||||||||    
T  17026117 aagacaacgttgttgatagtctg 17026139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 9113175 - 9113267
Alignment:
Q  153 attggttttagtattaaaagagtggtcttagta-ccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagt 244  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||| | |||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9113175 attggtttcagtattaaaagactgattttagtaaccatataggaggtgtaattgtcgagcagttagctacagtgcagtagttaatcgcacagt 9113267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 116
Target Start/End: Original strand, 13156200 - 13156258
Alignment:
Q  58 catattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13156200 catattgacatttgaagatgttaaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt 13156258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 53358381 - 53358337
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagt 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  53358381 ttggagaagttaaaaattagaatgttggtaacaccatatttgagt 53358337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28125242 - 28125145
Alignment:
Q  226 cagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt--atcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaa 322  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||| |||| | || ||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  28125242 cagtagttgaccgcacaattgtagttgaacttgtttttaatcctggaggcagtgtggttaatagtctgtctt-gcacaattttaagcagtgccacgaaa 28125145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Original strand, 1640789 - 1640822
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacac 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1640789 ttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacac 1640822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Original strand, 1640943 - 1640976
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacac 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1640943 ttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacac 1640976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 18784323 - 18784613
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||       
T  18784323 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttgaagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccagatttgagtggt--- 18784419  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18784420 ctcaataccataatagagtggctacagtaccatatttgtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 18784519  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    ||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  18784520 acagtgcagtagttaacc--------gcagctggacttgttttattctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttaggcagtgccacg 18784610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3094416 - 3094194
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  3094416 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt--- 3094321  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3094320 ctcaacatcataattgagtggttacaataccatattggtttcagtattaaaagattggtcttaataccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 3094221  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttg 246  Q
    |||||||||||||||| || |||||||    
T  3094220 acagtgcagtagttaatcgaacagttg 3094194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 19798776 - 19799078
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||   |    
T  19798776 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatgggggtaacaccatatttgagttgt---c 19798871  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19798872 tcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggttttagtattaaa-gagtggtcttagtgccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggt 19798970  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  19798971 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttggatagtg 19799069  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  19799070 ccacgaaac 19799078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Original strand, 23192628 - 23192882
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     ||||| ||    
T  23192628 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacattatattcgagtggt---ctcaacaccataatagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcag 23192724  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || ||| |||||||||    
T  23192725 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctgg-cttgtttta 23192823  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  23192824 tcctggaggaggcgtggttgatagtctgcc-ttgtacaattttgggcagtgccacgaaac 23192882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 323
Target Start/End: Original strand, 33301010 - 33301245
Alignment:
Q  89 aatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttag 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| | || |||||     |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  33301010 aatggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttaagtatt-aacgagtggtcttag 33301105  T
Q  184 taccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagtt 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33301106 taccatatttgaaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatgaaattgttttatcctggaggcggcgtggtt 33301205  T
Q  283 gatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33301206 gatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 33301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40166298 - 40166010
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||| |    
T  40166298 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtctcaataccataaga 40166203  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | || |||||     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40166202 gagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatttcgaacggttttctacagtgcag 40166104  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| || | ||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40166103 tagttaatcgtatagttgtagttgtgcttgttttatcctagaggcggcgttgttgttagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 40166010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25844088 - 25843819
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||  | ||  |||||||||||||   |    
T  25844088 aatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtgacagcatcatatttgagtggt---c 25843993  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatat-tgaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25843992 tcaacaccataagagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatatgagggtgtaattctcgaacggt 25843894  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  25843893 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatactggaggcggcgtggttgatagtc 25843819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 26927485 - 26927787
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||   |    
T  26927485 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggt---c 26927580  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| | |||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  26927581 tcagcgccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 26927679  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| || ||| ||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  26927680 tttctacagtgcagtagttaagtgtacagttgtagctgggcttgttttattttagaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcaatg 26927778  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  26927779 ccacgaaac 26927787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16035939 - 16035638
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |    
T  16035939 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgataacaccatatttgagtggt---c 16035844  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattgg-----ttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggtt 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||       ||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  16035843 tcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtcattttaatattaacataatggtcttggtaccatattggaggtgtaat-ctcgaatggtt 16035745  T
Q  216 ttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgc 315  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||    
T  16035744 ttctaaagtgcagtagttaaccacacatttgtagatgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgataatctgtc-ttgcacaactttggacagtgc 16035646  T
Q  316 cacgaaac 323  Q
    ||||||||    
T  16035645 cacgaaac 16035638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 39588144 - 39588432
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  39588144 catatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataaca 39588239  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39588240 gagtggtaacaataccatattaaagtggttttagtattaaa-gattggtctcagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacactgcag 39588338  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| || ||| ||| || ||  |||| ||||||||| ||  ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39588339 tagttaatcgaacaattgtagatgagcttgctttatcctggagtaggcgtggtagatagtctgtc-ttgcacaattttggacagtgccacgaaac 39588432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 291
Target Start/End: Original strand, 28434400 - 28434608
Alignment:
Q  85 ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtc 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||| |||||||||||| || ||    
T  28434400 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatgatc 28434496  T
Q  180 ttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgta 279  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||       
T  28434497 tttgtaccatattggaggtgtaaatctcgaacggttttctatagtaaagtagttaactgcacaattgtagttgaacttgttttatcctggagacggcaag 28434596  T
Q  280 gttgatagtctg 291  Q
    ||||||||||||    
T  28434597 gttgatagtctg 28434608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10140377 - 10140119
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-tggttttagtat 166  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| | |||||| | | |||||||  |||||| | |||    
T  10140377 tttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataacaaagtggttacaataccataggtggtttcaatat 10140282  T
Q  167 taaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttc-------tacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttg 258  Q
    |||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10140281 taaa-gaatggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttcggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttg 10140183  T
Q  259 ttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10140182 ttttatcctagaggtggcgtggttgattgtctgcc-ttgcacaattttgagtagtgccacgaaac 10140119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38621010 - 38620738
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||   || |||| ||||| |    
T  38621010 catatttgagtgatcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaag-ttagaatggtgaaaacaccatatttgagtggt---cttaacatcataaca 38620915  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaagg-tgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||| |   |||||||||     | ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  38620914 gagtggtgacgataccatattaaagtgatttcagtattaaa-gagtggtcttaataccatattttagggtgtaaatctcaaacagttttctacaatgcag 38620816  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38620815 tagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcttggaggcggcgtagttgatagtctgcc-ttgcacaattttg 38620738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33055367 - 33055198
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaa-taccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||    
T  33055367 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaagtacgatattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgag---tgg 33055271  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  33055270 tctcaacaccatagtagagtggtcacaataccatattagttttagtatt-aaagagtggcattagtaccatatt 33055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8138181 - 8137996
Alignment:
Q  115 gtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8138181 gtggtctcaacaccataatagagtggtaagagtatcatattaaagtggtttcagtattaaagg-gtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcg 8138083  T
Q  209 aacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  8138082 aacggttttctacattgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcgatatggttgatagtctgcctt 8137996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 318
Target Start/End: Original strand, 16649511 - 16649673
Alignment:
Q  155 tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttgg 253  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  16649511 tggtttcagtattaaa-gagtggtattagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctgg 16649609  T
Q  254 acttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccac 318  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||    
T  16649610 acttgttttatcccggaggcggcgtggttgatagtctatc-ttgcacaattttggacagtgccac 16649673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16833769 - 16833590
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||| |||||| | |||||||||     ||||| ||    
T  16833769 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtt---tcaacaccaaaatagaatggtaacaataccatattaaagtggtttcag 16833673  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttg 246  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  16833672 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattttcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaacagttg 16833590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 172 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10135637 - 10135486
Alignment:
Q  172 gagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaa 270  Q
    |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |    
T  10135637 gagtggtcgtagtgccatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcaactgggcttgttttatcctaga 10135538  T
Q  271 ggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||    
T  10135537 ggcggcgtggttgattgtctgcc-ttgcacaattttaggtagtgccacgaaac 10135486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 323
Target Start/End: Original strand, 51041316 - 51041527
Alignment:
Q  115 gtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcg 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||     |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||    
T  51041316 gtggtctcaacaccataacagagtggtaacaattccatattaaagtggtttcaatatt-aaagagtgatcttagtaccatatttggaggtatagttctcg 51041414  T
Q  209 aacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttga 308  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  51041415 aacgattttctacagtgcagtaattaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcttggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaa-tttgg 51041512  T
Q  309 acagtgccacgaaac 323  Q
     ||||||||||||||    
T  51041513 gcagtgccacgaaac 51041527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 47451003 - 47451290
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||| |  |||||||||||||   |||| |  ||||| |    
T  47451003 catatttgagtggttgtaatatcatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggagttaatatcatatttgagtggt---ctcagcgtcataaca 47451098  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| |||||||||| |   |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  47451099 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaaaaa--gaattagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctgcagtacag 47451196  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||   |||||||| |||||    
T  47451197 tagttaatcgaacagttgtagttgagcttgttttatcttggaggcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaatttttggcagtgccatgaaac 47451290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11806592 - 11806416
Alignment:
Q  124 acaccataatagagtggtaatagtaccatattg-----gttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||      | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||    
T  11806592 acaccataaaagagtggtaataataccatattaaagttgcttaagtattaaa-gagtgatcttagtgccatatttgaaagtgtaaatctcaaacgatttt 11806494  T
Q  218 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
    || || ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11806493 ctgcactgcagtatttaaccgcacaattgtagttgaacttcttttattctgaaggcggcgtggttgatagtctgcctt 11806416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 41097780 - 41097887
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41097780 aaaattagaatggtggtaataccatatttgcgtgg---tctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattggtttcagtatt-aaagagtggtct 41097875  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  41097876 tagtaccatatt 41097887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 227
Target Start/End: Original strand, 8267658 - 8267802
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  8267658 aaaattagaatggtgataacaacatatttgagtgg---tctcaacaccataatagagtgatcacaataccatattggtttcagtatt-taagagtggtct 8267753  T
Q  181 tagtaccatatt-gaaggtg-taattctcgaacggttttctacagtgca 227  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||||| || | |||||||||    
T  8267754 tagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgattatttacagtgca 8267802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12260274 - 12260026
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattg-----gttttag 163  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||      |||| ||    
T  12260274 ttggagaagttaaaacttagaatgatggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcacaataatagagtggtcacaataccatattataatagtttcag 12260178  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    ||||||  ||||||||||||||     ||| |||||||||| || ||  ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |  ||   ||||||||    
T  12260177 tattaa--gagtggtcttagta-----ttggaggtgtaattttcaaattgttttctattatgcagtagttaaccgcatagttgtacatgtgtttgtttta 12260085  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  12260084 tcctaaagacggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgggcagtgtcacgaaac 12260026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 323
Target Start/End: Original strand, 47455353 - 47455451
Alignment:
Q  224 tgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||| || ||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47455353 tgcagtagttaatcgaacagttgtagctaggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgataatctgtc-ttgcacaattttggacattgccacgaaac 47455451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 32626425 - 32626343
Alignment:
Q  29 gtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttga 111  Q
    |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32626425 gtaacaccatatttgagtgattgtagtaccatattgatagttggagatgttaagggttagaatggtggtaaaactatatttga 32626343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46696796 - 46696734
Alignment:
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgc 226  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  46696796 tattaaaagaatgatcttattaacatattggaggtgtaattcttgaacggttttctacggtgc 46696734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Original strand, 39037454 - 39037527
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtg 95  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  39037454 aatggtggtagcaccatatttaagtggttgaaatactatattcacatttggagatattaaaatttaaaatggtg 39037527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 23280701 - 23280853
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattgg------tttt 161  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| ||| ||||||||||| |||| || |||  ||||| |      |||     
T  23280701 tttggagaagttaaagattaaaatggtggtaacac-atatttga---gtggtcacaataccataatagactggtcattgtattatatttgactgatttta 23280796  T
Q  162 agtattaaaagagtggtcttag-taccatattgaaggtgtaattctcgaacggtttt 217  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  23280797 agtattaaaatcgtggtcttagacaccataatgtaggtgtaattcttgaacggtttt 23280853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 323
Target Start/End: Original strand, 27761839 - 27761903
Alignment:
Q  257 tgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||||||  | || ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27761839 tgttttatcctggggacgtcgtggttgatagtctgc--ttgcacaattttggacagtgccacgaaac 27761903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 132
Target Start/End: Original strand, 16649400 - 16649507
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||   |||||     
T  16649400 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtctcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatcgtggtaacaccatatttga---gtggtt 16649495  T
Q  121 tcaacaccataa 132  Q
    ||||||||||||    
T  16649496 tcaacaccataa 16649507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Original strand, 39200543 - 39200607
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaac 100  Q
    |||||||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39200543 catatttgagtgatcgtaatgccatattgatactttggagaaatt-aaagttagaatggtggtaac 39200607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 323
Target Start/End: Original strand, 2493817 - 2493882
Alignment:
Q  256 ttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||  |||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2493817 ttgttttatcctgggggcgccgtggttgatagtttgc--ttgcacaattttgggcagtgccacgaaac 2493882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8748108 - 8747828
Alignment:
Q  23 atggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctc 122  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||    
T  8748108 atggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagatgctaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggt---ctc 8748012  T
Q  123 aacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctaca 222  Q
    ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8748011 aacaccataattgagtggttacaataccatattggtttcagtaataaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattttcgaacggttttctaca 8747912  T
Q  223 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  8747911 gtgcagtagttaaccacatagttgcagctgagcttgttttatcctggaggcggcgttgttgatagcctgtc-ttgcacaattttg 8747828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 24588949 - 24589229
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||                      ||||||    
T  24588949 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagatgttaaaaattagaat----------------------ggtggt 24589026  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589027 ctcaacaccataatagagtggttacattaccatattggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttct 24589126  T
Q  220 acagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacg 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  | ||||||||||||| | |||| ||||    
T  24589127 acaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttatcctggagacggcgtggttgatagtctatc-ttgcacaattttggaaagtgtcacg 24589225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 17964322 - 17964624
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |    
T  17964322 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggt---c 17964417  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |  ||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17964418 tcagcaccataacagagtggtaacaatttcatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaattctcgaacggt 17964516  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  17964517 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttggatagtg 17964615  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  17964616 ccacgaaac 17964624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14509269 - 14509014
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     ||||| ||    
T  14509269 ttggagaaattaataattagaaaagtggtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagagtgataacagtaccatattaaagtggtttcag 14509173  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttta 263  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||    
T  14509172 tattaaaagaatggtcttggtaccatattggaggtgtaattctcgaacgattttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagatgagcttgtttta 14509073  T
Q  264 tcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    || || | ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14509072 tcttggaagcggcgtggttgataatctgtc-ttgcacaattttgaacagtgacacgaaac 14509014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 16835937 - 16836221
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||| || ||| |||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  16835937 catatttgagtggtcgtagtgccatattaatgttttggagaagttaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataaca 16836032  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatat-tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatat-tgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagt 232  Q
    | ||||| | | |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16836033 gtgtggttacaataccataggtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccaaatatgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtaac 16836131  T
Q  233 taaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  16836132 taaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgtacaattttgggcagtgccacgaaac 16836221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 6407638 - 6407925
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||| || |||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  6407638 catatttgagtggtcgtagtaccgtattgatagtttggaaaacttaaag-ttagaatggtattaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataaca 6407733  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6407734 gagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacagtg-ag 6407831  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  6407832 tagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctg-ctttgtacaattttgggcagtgccacgaaac 6407925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 157 - 323
Target Start/End: Original strand, 20748184 - 20748349
Alignment:
Q  157 gttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggact 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20748184 gttttagtattaaaagagtggttttagtaccatatttaaggtgtaattctcgaaccgttttctacggtgcagtagttaaccgcacagttgtagatggact 20748283  T
Q  257 tgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  20748284 tgttttattctggaggcggcgtggttgatagtcggcc-ttgcacaattttggacagtaccatgaaac 20748349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 11570512 - 11570814
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||| | |||  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  11570512 aatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgacatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---c 11570607  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    | |||||||||| |||||||| | | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  11570608 ttaacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtataattctggaacggt 11570706  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  11570707 tttctacagcggagtagttcaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgattgtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 11570805  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  11570806 ccacgaaac 11570814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 323
Target Start/End: Original strand, 2699933 - 2700171
Alignment:
Q  85 ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtc 179  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||   |||| |||||||| | |||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  2699933 ttagaatggtggcaacaccgtatttgagtggt---ctcagcaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtgatc 2700028  T
Q  180 ttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgt 278  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  2700029 ttagtaccatatttggaggtgtaattctcga-cgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagttgggcttgttttatcctggaagcggcgt 2700127  T
Q  279 agttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2700128 ggttgatagtctgtc-ttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 2700171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12689303 - 12689017
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||   | |  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  12689303 aatggtggtaccatcatatttgagtggtcatagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggt---c 12689208  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccat-attgaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||     |||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  12689207 tcaacaccataacagagtggtaacaatacgatattaaagtggtttcaatatt-aaagagtcgtcttaataccataattgagggtgtaattgtcgaacggt 12689109  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttg 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12689108 tttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggagacggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttg 12689017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Original strand, 29892039 - 29892326
Alignment:
Q  37 atatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatag 135  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |   || |  ||||||| ||    
T  29892039 atatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaat-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtgct---cttagtaccataacag 29892134  T
Q  136 agtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 229  Q
    |||||||| | |||||||||     | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |    
T  29892135 agtggtaacaataccatattaaagcgatttcagtattaaa-gagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaaatatcgaaaggttttctacaatgcaat 29892233  T
Q  230 agttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| || | |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  29892234 agttaaccacacagttgtagctggacttgttttatcctggaggaggtgtggttgatagtttgtc-ttgcacaattttgggcagtgccaccaaac 29892326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Original strand, 11534521 - 11534732
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggtttta 162  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||     |||||| |    
T  11534521 tttggagaaactaaag-ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttca 11534616  T
Q  163 gtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  11534617 atatt-aaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctggaacggttttctacaatgcagtagttcaccgcacagttgtagttgagcttgttt 11534715  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgt 278  Q
    ||||||| |||||||||    
T  11534716 tatcctggaggcggcgt 11534732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 267
Target Start/End: Original strand, 9751582 - 9751818
Alignment:
Q  33 catcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataa 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||   |  || | ||||     
T  9751582 catcatatttaagtggttgaaattacatattgatatttggagttgttaaatgttagaatgatggtaacatcatatttgagtggt---caaaatatcatag 9751678  T
Q  133 tagagtggtaatagtaccata-----ttggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca 227  Q
    ||||||||| |||||||||||     |||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9751679 tagagtggtcatagtaccataattgattggtttcgctattaaaatagtggtcttagtgccatattggaggtgtaattctcgaatggtgttctacagtgca 9751778  T
Q  228 gtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  9751779 gtagttaatcgcacaattgtagttagacttattttatcct 9751818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Original strand, 11560031 - 11560242
Alignment:
Q  68 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat-----tggtttta 162  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||     |||||| |    
T  11560031 tttggagaaactaaag-ttagaatggtgacaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttca 11560126  T
Q  163 gtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  11560127 atatt-aaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctggaacggttttctacaatgcagtagttcaccgcacagttgtagttgagcttgttt 11560225  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgt 278  Q
    ||||||| |||||||||    
T  11560226 tatcctggaggcggcgt 11560242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Original strand, 15991500 - 15991759
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |    
T  15991500 agaatgatcgtagcaccatatttaagtggtt-aaataccatattgacatttggagatgttaaaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtcat 15991598  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccata-----ttggttttagtattaaaagagtggtcttagtacc-atatt-gaaggtgtaattctcgaacg 212  Q
       || |||||| ||||||||| |||||||||||     ||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||| ||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  15991599 ---aataccatagtagagtggtcatagtaccataattgattggtttcagttttaaaagagtggcattaatacccatatttgattgtgtaattctcaaacg 15991695  T
Q  213 gttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggc 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  15991696 gttttcgacagtgcagtagttaactgcacaattgcagctgaacttgttttatcctagaggcggc 15991759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Original strand, 15999162 - 15999421
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |    
T  15999162 agaatgatcgtagcaccatatttaagtggtt-aaataccatattgacatttggagatgttaaaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtcat 15999260  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccata-----ttggttttagtattaaaagagtggtcttagtacc-atatt-gaaggtgtaattctcgaacg 212  Q
       || |||||| ||||||||| |||||||||||     ||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||| ||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  15999261 ---aataccatagtagagtggtcatagtaccataattgattggtttcagttttaaaagagtggcattaatacccatatttgattgtgtaattctcaaacg 15999357  T
Q  213 gttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggc 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  15999358 gttttcgacagtgcagtagttaactgcacaattgcagctgaacttgttttatcctagaggcggc 15999421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11428341 - 11428124
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  11428341 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaatgaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---c 11428246  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  11428245 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-gagtagtcttagtaccatatttgatggtgtaaatctcgaacggt 11428147  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaacc 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  11428146 tttctacagtgcagtacttaacc 11428124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 12406116 - 12406391
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||  |||||||||||||        
T  12406116 aatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaag-ttaaaatagtggtaacatcatatttgagtggta--- 12406211  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||| ||| ||||  |||||    
T  12406212 tcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaa-agtgattttagtatcatatttgagggtataaatctctcacggt 12406310  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  12406311 tttctacggtgcagtagttaaccacacagttgtagttgagcatgttttatcatgaaggcggcgtgattgatagtcttcctt 12406391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Original strand, 2863227 - 2863429
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||   |||||    
T  2863227 agaatggtgataacaccatatttgagtggttgaaatttcatattgatatttggagatgttaaaagttagaatggtggtaacatcatatttga---gtggt 2863323  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccat-----attggttttagtattaaaa---gagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaac 211  Q
    | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||     |||||||| |||| |||||   |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  2863324 cacaataccatagtagagtggtcatagtaccataattgattggtttcagtactaaaatatgagtggccttagtatcatattggaggtgtaattttcgaac 2863423  T
Q  212 ggtttt 217  Q
    | ||||    
T  2863424 gttttt 2863429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Original strand, 33687430 - 33687668
Alignment:
Q  86 tagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||  |||||||| |||||||| | | || ||||||     ||||| | ||||||| ||||||| |    
T  33687430 tagaatggtggtaacatcatatttgagtggt---ctcggcaccataacagagtggtgacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaa-gagtggttt 33687525  T
Q  181 tagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgta 279  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| || |||| |     
T  33687526 tagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaaggattttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagtttgttttatcctggagacggcatg 33687625  T
Q  280 gttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33687626 gttgatagtctgtc-ttgcacaattttggccagtgccacgaaac 33687668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 6112722 - 6112894
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||    
T  6112722 agaatggtcgtagcactatatttgaatgcttgaagtaccatattgatatttggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttga---gtggt 6112818  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaagg 197  Q
    || |||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||| | |||||||| | | |||||||||||||||| ||||    
T  6112819 cttaaca-cataatagagtggtaacaatattatattggtttcaatattaaaa-attagtcttagtaccatattaaagg 6112894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Original strand, 19995166 - 19995439
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||||||||  || ||||| |||   |    
T  19995166 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaag-ttagaatgatggtaacaccgtagttgaggggt---c 19995261  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||  ||||||| | |||||||| | |||||||||     ||||| |||||||||  |||| | ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||    
T  19995262 tcataaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaat-agtgtttttagtacgatatttgagggtgtaaatctcgaaaggt 19995360  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcc 293  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  19995361 tttctacggtgtagtagttaaccgcatagttgtagctgggcttgttttatcccgaaggtgccgtggttgatagtctgcc 19995439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 317
Target Start/End: Original strand, 11614039 - 11614151
Alignment:
Q  204 tctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaat 303  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11614039 tctcaaacagttttctaaagtgcattagttaaccgcacaattgtaattgtgcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaat 11614137  T
Q  304 tttgaacagtgcca 317  Q
    ||||| ||||||||    
T  11614138 tttgagcagtgcca 11614151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5856339 - 5856209
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||   |||||    
T  5856339 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattgatactttggaaaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtc 5856244  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt 155  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5856243 ttaacaccataatagagtggtaacaataccatatt 5856209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Original strand, 25314234 - 25314391
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  25314234 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataaca 25314329  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    ||||||||| | ||||||||     || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25314330 gagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatt 25314391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Original strand, 26201728 - 26201885
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  26201728 catatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataaca 26201823  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatat-----tggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    ||||||||| | ||||||||     || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26201824 gagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatt 26201885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Original strand, 2882547 - 2882728
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatag 135  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||   |||||| ||| |||||| |||    
T  2882547 catatttgagtggttgaaatttcatattggtatttggatttgttaaaagttagaatggtggtaacatcatatttga---gtggtcacaataccatagtag 2882643  T
Q  136 agtggtaatagtaccat-----attggttttagtattaaaa---gagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacg 212  Q
    |||||| |||| |||||     |||||||| |||| |||||   |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2882644 agtggtcatagcaccataattgattggtttcagtactaaaatatgagtggccttagtatcatattggaggtgtaattttcgaacg 2882728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 267
Target Start/End: Original strand, 4157146 - 4157379
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||||||   |||| |||||||| |    
T  4157146 catatttgagtggtggtagtatcatattgatgttttggagaaattaaagttt-gaatggtggtgacaccatatttgagtggt---ctcagcaccataaca 4157241  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaagg-tgtaattctcgaacggttttctacagtgcag 228  Q
    ||| ||||| | || ||||||     | ||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  4157242 gagcggtaacaataacatattaaagtgatttcagtattaaa-gagtgatattagcaccatatttaagggtgtaaatttcgaacgattttctacagtgcag 4157340  T
Q  229 tagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    ||||||||||||| |||| || ||   ||||||||||||    
T  4157341 tagttaaccgcaccgttgtagctgagtttgttttatcct 4157379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21309160 - 21309061
Alignment:
Q  223 gtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  21309160 gtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctg-cattgcacaattttgggcagtgccatgaaa 21309062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22609750 - 22609642
Alignment:
Q  170 aagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctga 269  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| | | |||||| |||||  ||||||||||||||     
T  22609750 aagagtggtcatattaccatattggaggtgtaattctcgaatagttttctaccgtgcagttgttaatcacgcagttgtagttgagcttgttttatcctgg 22609651  T
Q  270 aggcggcgt 278  Q
    |||||||||    
T  22609650 aggcggcgt 22609642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 323
Target Start/End: Original strand, 25316498 - 25316631
Alignment:
Q  191 ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct---gaaggcggcgtagttgatag 287  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||   || |||||||| ||| ||||    
T  25316498 ttgagggtgcaattctcgaacagttttctacagtgca-tagttaaccgcacggttgtagatgaacttgttttatcctggagacggcggcgtggttcatag 25316596  T
Q  288 tctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    | || |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25316597 tttg-ctttgcacaattttgggcagtgccacaaaac 25316631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 323
Target Start/End: Original strand, 26203992 - 26204125
Alignment:
Q  191 ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct---gaaggcggcgtagttgatag 287  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||   || |||||||| ||| ||||    
T  26203992 ttgagggtgcaattctcgaacagttttctacagtgca-tagttaaccgcacggttgtagatgaacttgttttatcctggagacggcggcgtggttcatag 26204090  T
Q  288 tctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    | || |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26204091 tttg-ctttgcacaattttgggcagtgccacaaaac 26204125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 323
Target Start/End: Original strand, 13736616 - 13736743
Alignment:
Q  195 aggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcct 294  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||  |||||||||||||| |||| | || |||| |||||| ||     
T  13736616 aggtgtaaatctcgaacagttttctacagtgcagtagttattcgcacatttgtagatgtgcttgttttatcctggaggcagtgtggttggtagtcttcc- 13736714  T
Q  295 ttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  13736715 ttgcacaattttaggcagtgccacgaaac 13736743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Original strand, 22695226 - 22695336
Alignment:
Q  212 ggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaaca 311  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||| ||  ||||| || || | |||||||||||||| ||    
T  22695226 ggttttctacaatgcagtggttaaccgcacagttgtagctgtacttgttttatcgtggaggcggtgtgattgattgtatgtc-ttgcacaattttgagca 22695324  T
Q  312 gtgccacgaaac 323  Q
     || ||||||||    
T  22695325 atgtcacgaaac 22695336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 11613591 - 11613657
Alignment:
Q  85 ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatat 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||   || | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11613591 ttagaatggtggtaacaccatatttgagaggt---cttagcaccataatagagtggtaataataccatat 11613657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 329
Target Start/End: Original strand, 32551519 - 32551589
Alignment:
Q  257 tgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaacctatta 329  Q
    ||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  32551519 tgttttatcatgagggcgttgtggttgatagtctgc--ttgcacaattttgaacagtttcacgaaacgtatta 32551589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17913866 - 17913811
Alignment:
Q  85 ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaa 143  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  17913866 ttagaatggtaataacactatatttaagtggt---ctcaacaccataacagagtggtaa 17913811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 323
Target Start/End: Original strand, 9648 - 9952
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaa-ttagaatggtggtaacactatatttgagtggtgg 118  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  9648 agaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgatatttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt-- 9744  T
Q  119 tctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacg 212  Q
     ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9745 -ctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattata-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacg 9842  T
Q  213 gttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  9843 gttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcag 9941  T
Q  313 tgccacgaaac 323  Q
    |||||||||||    
T  9942 tgccacgaaac 9952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 83364 - 83123
Alignment:
Q  48 gttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagt 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  83364 gttgaattaccatattgatatttggagatgttaaaaattagaatggtagtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagagtggttatagt 83268  T
Q  148 accatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgc 247  Q
    |  |||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83267 attatattggtttcagtat---aagagtgatcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaaaggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgc 83171  T
Q  248 agttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
    || ||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  83170 agctgagcttgttttatcctggaggcggcatggttgatagtctgcctt 83123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4105
Alignment:
Q  69 ttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttag 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||     ||||| ||    
T  4358 ttggagaagttaataattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagcaccata-tagagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcag 4263  T
Q  164 tattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||    
T  4262 tattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgtttt 4164  T
Q  263 atcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaa 322  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  4163 atcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtgccacgaaa 4105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 443709 - 444008
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||| | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||   |    
T  443709 aatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggaaacaccatattttagtggt---c 443804  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || ||||||     | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  443805 tcaacaccataatagagtggttacaatatcatattaaggtgatttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 443903  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  443904 tttctatagtgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttatcctg-agacggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttg-gcagtg 443999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 140077 - 139990
Alignment:
Q  29 gtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  140077 gtaacaccctatttaagtggttgaaataccatactgacatttggagatgttaaaagttagaatagtggtaacaccatatttgagtggt 139990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 150788 - 150730
Alignment:
Q  58 catattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  150788 catattgacatttgaagatgttaaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt 150730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7436 - 7134
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatattt-ggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||        
T  7436 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag-ttagaatggtggcaacacaatatttaagtggta--- 7341  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  7340 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaa-gagtggtcttaatacaatatttgagggcgtaattctcgaacggt 7242  T
Q  215 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  7241 tttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaattttgggcagtg 7143  T
Q  315 ccacgaaac 323  Q
    |||||||||    
T  7142 ccacgaaac 7134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 323
Target Start/End: Original strand, 165997 - 166151
Alignment:
Q  168 aaaagagtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  165997 aaaagattggtcttagtaccatagtaaaggtgtaattctcgaacggttttttacagtgcagtaattaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcct 166096  T
Q  268 gaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    | ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  166097 ggaggcggcgtggttgatagtatgtc-ttgcacaatttttggcagtgccacgaaac 166151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 256153 - 255845
Alignment:
Q  20 agaatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggt 119  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||  |    
T  256153 agaatggtgataacactatatttgagtggtt-aaataccatattgacatttggagattttaaaagttagaatggtgctaacatcatatttgaatggtcat 256055  T
Q  120 ctcaacaccataatagagtggtaatagtaccata-----ttggttttagtattaaaa-gagtggtcttagtac-catatt-gaaggtgtaattctcgaac 211  Q
       || |||||| ||| ||||| |||||||||||     ||| ||| | | |||||| ||||||  ||| ||  |||||| || |||||||| |||||||    
T  256054 ---aataccatagtagtgtggtcatagtaccatacttgattgatttcatttttaaaaagagtggcattaatagtcatatttgagggtgtaatcctcgaac 255958  T
Q  212 ggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaaca 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||   |    
T  255957 ggttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcatagttgatagtatgtc-ttgcacaattttgggta 255859  T
Q  312 gtgccacgaaacct 325  Q
    ||||||||||||||    
T  255858 gtgccacgaaacct 255845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25583 - 25446
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcct 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25583 aaagagtggtcttagtaccatatttgaagatgtaagtctcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgtagttgggcttgttttatcct 25484  T
Q  268 gaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaatttt 306  Q
    | | ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  25483 ggacgcggcgtggttgatagtctgtc-ttgcacaatttt 25446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29440 - 29219
Alignment:
Q  72 gagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt-----ggttttagtat 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||  ||||||| |||||||||| | ||| ||| |     ||||| |||||    
T  29440 gagaaattaaag-ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcagaaccataacagagtggtaacaatactatactaaaatggtttcagtat 29345  T
Q  167 taaaagagtggtctta----gtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgtttt 262  Q
    |||||||  | |||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  29344 taaaagaacgatcttaattagtatcatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaaccgcacagttatagttagacttatttt 29245  T
Q  263 atcctgaaggcggcgtagttgatagt 288  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  29244 atcctgaagacggcgtggttgatagt 29219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25775 - 25645
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtc 120  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | | |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||    
T  25775 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactttggagaaattaaaa-ttagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtc 25680  T
Q  121 tcaacaccataatagagtggtaatagtaccatatt 155  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  25679 tcagaaccataacagagtggtaataatatcatatt 25645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35782 - 35664
Alignment:
Q  204 tctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaat 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35782 tctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttatcctggaggcggcgtggttgatagtctgcc-ttgcacaat 35684  T
Q  304 tttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||  ||||| ||||||||    
T  35683 tttggccagtgtcacgaaac 35664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4092
Alignment:
Q  65 atatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccat-----attggtt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||     | || ||    
T  4262 atatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgag---tggtctcagtaccataatagagtggtaacattaccataaaaaagtgatt 4166  T
Q  160 ttagtattaaaagagtggtcttagtaccatattgaa-ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagtt 233  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4165 taagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttaagggtataaatctcgaatggttttctacaatgcagtagtt 4092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45944
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46051 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggt---ctcaacaccataatagaatggtaacagtaccgtattggtttcagtatt-aaagagtggtct 45956  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  45955 tagtaccatatt 45944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 152736 - 152843
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  152736 aaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtgg---tctcaacaccataatagaatggtaacagtaccgtattggtttcagtatt-aaagagtggtct 152831  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  152832 tagtaccatatt 152843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 155
Target Start/End: Original strand, 148182 - 148299
Alignment:
Q  36 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataata 134  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  148182 catattagagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaaagttagaatggtggtaacactatatttga---gtggtctcaacatcataata 148278  T
Q  135 gagtggtaatagtaccatatt 155  Q
    ||||| ||| | |||||||||    
T  148279 gagtgataacaataccatatt 148299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Original strand, 164934 - 165094
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaac------cgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| || ||  |||||||    
T  164934 aaagagtggtcttagtaccgtatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcgcgcgcacagttgtagctgagcttgttt 165033  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  165034 tatcctggaggcgacgtggttgatagtgtgtc-ttgcacaactttggacaatgccatgaaac 165094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1309 - 1197
Alignment:
Q  183 gtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||  |||| |||| |||| |||    
T  1309 gtaccatattgaaggtgtaaatctcgaacgattttctatagtgcagtagttaaccgcacagtcgtagctgaacttgtttttgcctggaggcagcgtggtt 1210  T
Q  283 gatagtctgcctt 295  Q
     |||||| |||||    
T  1209 tatagtccgcctt 1197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 561 - 401
Alignment:
Q  169 aaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaac------cgcacagttgcagttggacttgttt 261  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| || ||  |||||||    
T  561 aaagagtggtcttagtaccgtatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcgcgcgcacagttgtagctgagcttgttt 462  T
Q  262 tatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctttgcacaattttgaacagtgccacgaaac 323  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||| || | |||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  461 tatcctggaggcgacgtggttgatagtgtgtc-ttgcacaactttggacaatgccatgaaac 401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 52728 - 52835
Alignment:
Q  81 aaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtct 180  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52728 aaaattagaatggtggtaaaaccatatttgagcggt---ctcaacaccataatagaatgataaaaatatcatattggtttcagtatt-aaagagtggtct 52823  T
Q  181 tagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||    
T  52824 tagtaccatatt 52835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 192
Target Start/End: Original strand, 47686 - 47792
Alignment:
Q  82 aaattagaatggtggtaacactatatttgagtggtggtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtctt 181  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  47686 aaatttgaatggtggtaacaccatatttga---gtggtctcaacaccataatagaaaaataacaataccatattggtttcagtatt-aaagagtggtctt 47781  T
Q  182 agtaccatatt 192  Q
    |||||||||||    
T  47782 agtaccatatt 47792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13451 - 13329
Alignment:
Q  173 agtggtcttagtaccatattgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaagg 272  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || |||    
T  13451 agtggtcttagtaccatattagaggtgtaaattgcgaaccattttctacagtgaagtagttaaccgcacagttgtagttgaacttgttgtatcttggagg 13352  T
Q  273 cggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
    |  | | ||||||||||| ||||    
T  13351 caccatggttgatagtctacctt 13329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 192
Target Start/End: Original strand, 1088 - 1161
Alignment:
Q  118 gtctcaacaccataatagagtggtaatagtaccatattggttttagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1088 gtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattggtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatt 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Original strand, 146193 - 146287
Alignment:
Q  22 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgatatttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacactatatttgagtggt 116  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  146193 aatggtggtagcaccatatttgagtggttgtactaccttattgacatttggagatgttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggt 146287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 155486 - 155544
Alignment:
Q  225 gcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttg 283  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  155486 gcagtagttaatcgcacagttgtagctgaacttgttttatcctagaggcggcgtggttg 155544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9046 - 8947
Alignment:
Q  196 ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  9046 ggtgtaattcttgaatgattttgtacaatgcagtagttaatcgcatagttacagctagacttgttttatcctgaaggcgacgtgattgatagtcttcctt 8947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5473 - 5410
Alignment:
Q  170 aagagtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5473 aagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcaaacagttttctacggtgcaatagt 5410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2464 - 2333
Alignment:
Q  196 ggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagttggacttgttttatcctgaaggcggcgtagttgatagtctgcctt 295  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |  ||   ||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||| | |    
T  2464 ggtgtaattctccaacaattttctacggtgcagtagttaatctcacagttgtacctgagtttgttttatactagaggcggcgtggttgata-tctgtc-t 2367  T
Q  296 tgcacaattttgaacagtgccacgaaacctatta 329  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||| |||||    
T  2366 tgcacaattttaaacaatggcacaaaacgtatta 2333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University