View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19326_high_1 (Length: 648)

Name: NF19326_high_1
Description: NF19326
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19326_high_1
NF19326_high_1
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (18-624)||(40794446-40795051)
chr2 (18-624)||(27687352-27687963)
chr2 (45-624)||(26620370-26620951)
chr2 (18-624)||(32236644-32237236)
chr2 (45-231)||(26265700-26265886)
chr2 (18-195)||(37870330-37870507)
chr2 (18-195)||(13065007-13065184)
chr2 (18-194)||(17632435-17632611)
chr2 (18-193)||(39885503-39885678)
chr2 (18-193)||(39901079-39901254)
chr2 (18-195)||(27424100-27424277)
chr2 (18-195)||(27439144-27439321)
chr2 (100-194)||(12650926-12651021)
chr2 (100-194)||(12665847-12665942)
chr2 (100-185)||(34306406-34306491)
chr2 (100-194)||(39757367-39757462)
chr2 (100-194)||(28269507-28269601)
chr2 (100-185)||(34263607-34263692)
chr2 (112-195)||(24045211-24045294)
chr2 (100-184)||(28877595-28877679)
chr2 (100-184)||(28892805-28892889)
chr2 (100-195)||(20831483-20831575)
chr2 (100-180)||(23121413-23121491)
chr2 (90-225)||(4727314-4727444)
chr2 (90-225)||(15713525-15713655)
chr2 (100-225)||(21693146-21693268)
chr2 (100-225)||(21707928-21708050)
chr2 (100-195)||(19446350-19446447)
chr2 (100-195)||(19461159-19461256)
chr2 (100-152)||(27388436-27388489)
chr2 (100-152)||(27399497-27399550)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (18-624)||(16263890-16264493)
chr8 (18-624)||(19650444-19651050)
chr8 (18-624)||(19661489-19662095)
chr8 (18-624)||(29036357-29036960)
chr8 (18-624)||(24461356-24461961)
chr8 (18-624)||(30367206-30367813)
chr8 (46-624)||(22142901-22143461)
chr8 (18-489)||(16272614-16273079)
chr8 (18-551)||(18800661-18801174)
chr8 (18-193)||(14359482-14359657)
chr8 (18-194)||(14552984-14553160)
chr8 (18-194)||(14573808-14573984)
chr8 (18-194)||(555495-555672)
chr8 (18-194)||(19698497-19698674)
chr8 (18-194)||(15210346-15210526)
chr8 (45-195)||(12480033-12480183)
chr8 (18-185)||(19906531-19906698)
chr8 (79-195)||(23079208-23079324)
chr8 (100-193)||(28262893-28262986)
chr8 (100-194)||(16254418-16254512)
chr8 (100-184)||(21337322-21337406)
chr8 (100-184)||(21377283-21377367)
chr8 (100-194)||(2141999-2142094)
chr8 (100-194)||(5516484-5516579)
chr8 (100-194)||(18786539-18786634)
chr8 (100-193)||(27598574-27598665)
chr8 (100-193)||(27613626-27613717)
chr8 (112-194)||(2126842-2126925)
chr8 (100-153)||(33242278-33242331)
chr8 (100-153)||(33271622-33271675)
chr8 (100-153)||(14025297-14025350)
chr8 (100-153)||(15324416-15324469)
chr8 (100-153)||(15504785-15504838)
chr8 (100-180)||(31339637-31339715)
chr8 (100-153)||(15018030-15018084)
chr8 (100-195)||(11342611-11342708)
chr8 (101-195)||(25746825-25746921)
chr8 (100-152)||(21965484-21965537)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (18-624)||(1733101-1733705)
chr3 (27-624)||(26826131-26826728)
chr3 (18-600)||(37184740-37185325)
chr3 (18-628)||(35566419-35567028)
chr3 (24-624)||(16419417-16420009)
chr3 (18-551)||(4786464-4786979)
chr3 (18-551)||(4801302-4801817)
chr3 (18-231)||(16063570-16063783)
chr3 (18-193)||(8346441-8346616)
chr3 (18-194)||(14451689-14451865)
chr3 (18-193)||(9530381-9530556)
chr3 (18-194)||(19928303-19928480)
chr3 (462-624)||(8105970-8106131)
chr3 (32-193)||(11811924-11812085)
chr3 (76-193)||(10414052-10414169)
chr3 (18-194)||(34799636-34799800)
chr3 (100-194)||(4882854-4882948)
chr3 (100-194)||(8279153-8279247)
chr3 (100-194)||(8307963-8308057)
chr3 (100-194)||(11261164-11261258)
chr3 (100-194)||(18046613-18046707)
chr3 (100-194)||(18062676-18062770)
chr3 (100-194)||(22641610-22641704)
chr3 (18-108)||(15104269-15104359)
chr3 (100-184)||(1999619-1999703)
chr3 (100-194)||(4684348-4684443)
chr3 (100-194)||(8226839-8226933)
chr3 (100-194)||(8291314-8291408)
chr3 (100-194)||(15730790-15730884)
chr3 (100-194)||(15745875-15745969)
chr3 (100-185)||(18002970-18003055)
chr3 (100-194)||(4694432-4694527)
chr3 (100-194)||(5647158-5647252)
chr3 (100-185)||(10600618-10600703)
chr3 (100-194)||(5662581-5662674)
chr3 (100-193)||(3392292-3392383)
chr3 (100-180)||(35876128-35876206)
chr3 (100-180)||(4445422-4445500)
chr3 (100-180)||(4449585-4449663)
chr3 (100-153)||(19273859-19273912)
chr3 (100-180)||(35891198-35891276)
chr3 (90-180)||(4888835-4888923)
chr3 (90-180)||(9722109-9722197)
chr3 (18-81)||(10422983-10423046)
chr3 (100-180)||(28012991-28013069)
chr3 (100-180)||(28359789-28359867)
chr3 (90-225)||(18326222-18326352)
chr3 (90-225)||(18341321-18341451)
chr3 (90-225)||(4717182-4717312)
chr3 (90-225)||(4732362-4732492)
chr3 (90-225)||(6187864-6187994)
chr3 (90-225)||(32964174-32964304)
chr3 (100-225)||(14141825-14141947)
chr3 (33-74)||(11812070-11812111)
chr3 (100-225)||(19704778-19704898)
chr3 (100-153)||(15475988-15476042)
chr3 (112-225)||(6212631-6212739)
chr3 (100-225)||(11647087-11647208)
chr3 (100-195)||(23011897-23011991)
chr3 (100-153)||(10929929-10929983)
chr3 (100-153)||(16614953-16615007)
chr3 (100-153)||(22051853-22051907)
chr3 (100-153)||(18525783-18525835)
chr3 (100-152)||(36131463-36131516)
chr3 (165-209)||(28166197-28166241)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (18-628)||(34496988-34497596)
chr5 (27-624)||(30913073-30913654)
chr5 (18-231)||(25504168-25504381)
chr5 (18-231)||(18083771-18083985)
chr5 (24-231)||(35871422-35871630)
chr5 (18-195)||(570804-570981)
chr5 (18-184)||(15494649-15494815)
chr5 (18-193)||(35396503-35396678)
chr5 (18-194)||(23722605-23722782)
chr5 (45-195)||(16682591-16682741)
chr5 (18-193)||(29881927-29882090)
chr5 (100-194)||(24692834-24692929)
chr5 (100-194)||(20193725-20193819)
chr5 (100-185)||(3943850-3943935)
chr5 (100-194)||(18061655-18061750)
chr5 (100-194)||(30930028-30930123)
chr5 (100-194)||(30956911-30957006)
chr5 (100-194)||(32449540-32449634)
chr5 (100-184)||(22445611-22445695)
chr5 (100-184)||(22347536-22347620)
chr5 (90-180)||(11545786-11545874)
chr5 (90-180)||(11559845-11559933)
chr5 (100-180)||(33772951-33773029)
chr5 (100-180)||(33787903-33787981)
chr5 (100-225)||(20580190-20580313)
chr5 (100-180)||(41301536-41301614)
chr5 (90-225)||(22988479-22988609)
chr5 (90-225)||(23003546-23003676)
chr5 (100-180)||(37650954-37651033)
chr5 (100-180)||(23430740-23430817)
chr5 (558-624)||(23901697-23901762)
chr5 (100-225)||(25195469-25195591)
chr5 (100-225)||(22268924-22269046)
chr5 (100-225)||(22898867-22898991)
chr5 (100-222)||(30465794-30465913)
chr5 (100-153)||(21501184-21501238)
chr5 (558-624)||(23887055-23887119)
chr5 (100-225)||(25210831-25210953)
chr5 (100-225)||(25274983-25275105)
chr5 (100-225)||(27285738-27285860)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (24-613)||(6557337-6557926)
chr4 (18-628)||(34271294-34271902)
chr4 (18-624)||(15196207-15196812)
chr4 (18-600)||(40464118-40464700)
chr4 (24-566)||(4865135-4865672)
chr4 (18-195)||(18027694-18027871)
chr4 (18-195)||(40562930-40563107)
chr4 (18-194)||(20308782-20308959)
chr4 (100-194)||(9247838-9247932)
chr4 (100-185)||(13441037-13441122)
chr4 (100-194)||(14657040-14657135)
chr4 (100-194)||(14675474-14675569)
chr4 (104-194)||(19639624-19639714)
chr4 (100-184)||(17009408-17009492)
chr4 (100-185)||(14658802-14658887)
chr4 (100-184)||(17023373-17023457)
chr4 (100-180)||(22111626-22111704)
chr4 (100-225)||(17086928-17087052)
chr4 (90-225)||(5317162-5317292)
chr4 (558-624)||(22728169-22728234)
chr4 (100-209)||(15219409-15219517)
chr4 (100-209)||(17241586-17241694)
chr4 (100-195)||(16281053-16281150)
chr4 (100-225)||(1895655-1895775)
chr4 (100-143)||(30278295-30278338)
chr4 (100-153)||(18465242-18465296)
chr4 (100-195)||(15387170-15387264)
chr4 (100-209)||(15238165-15238273)
chr4 (100-152)||(20757253-20757306)
chr4 (165-225)||(1910463-1910521)
chr4 (165-209)||(14240134-14240178)
chr4 (165-225)||(26407050-26407108)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (18-624)||(31979-32584)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (18-624)||(18597596-18598201)
chr1 (24-624)||(21645349-21645945)
chr1 (18-193)||(20321375-20321550)
chr1 (18-195)||(24654767-24654944)
chr1 (100-194)||(18293501-18293596)
chr1 (100-194)||(21481477-21481571)
chr1 (100-194)||(18289098-18289193)
chr1 (103-153)||(21505743-21505793)
chr1 (90-225)||(47662888-47663018)
chr1 (100-225)||(16197726-16197850)
chr1 (100-225)||(16212735-16212859)
chr1 (100-153)||(16230632-16230686)
chr1 (100-209)||(31447673-31447781)
chr1 (100-152)||(20456536-20456589)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (18-624)||(166207-166812)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (18-624)||(7584648-7585256)
chr6 (270-624)||(22480574-22480927)
chr6 (18-628)||(20216522-20217119)
chr6 (18-628)||(22110544-22111141)
chr6 (361-624)||(26502268-26502530)
chr6 (91-429)||(18940131-18940463)
chr6 (18-193)||(16561934-16562109)
chr6 (18-195)||(31541468-31541645)
chr6 (18-193)||(27646479-27646654)
chr6 (18-184)||(27029740-27029906)
chr6 (18-194)||(24874107-24874284)
chr6 (27-194)||(24852081-24852249)
chr6 (18-184)||(26995418-26995585)
chr6 (18-194)||(16767614-16767790)
chr6 (100-194)||(15402080-15402175)
chr6 (100-194)||(15413867-15413962)
chr6 (100-194)||(15429460-15429555)
chr6 (100-194)||(3043473-3043567)
chr6 (101-194)||(26984507-26984601)
chr6 (101-194)||(27035570-27035664)
chr6 (100-187)||(12621358-12621445)
chr6 (100-194)||(18815035-18815130)
chr6 (100-194)||(19900609-19900704)
chr6 (100-195)||(22923858-22923953)
chr6 (100-195)||(22939570-22939665)
chr6 (100-195)||(23862015-23862110)
chr6 (100-194)||(34471391-34471485)
chr6 (100-184)||(13288704-13288788)
chr6 (100-184)||(13303671-13303755)
chr6 (100-195)||(24295325-24295421)
chr6 (100-195)||(24309343-24309439)
chr6 (18-108)||(29628220-29628310)
chr6 (18-108)||(30969287-30969377)
chr6 (539-613)||(27365917-27365991)
chr6 (539-613)||(27456264-27456338)
chr6 (90-180)||(32781113-32781201)
chr6 (100-225)||(20156136-20156257)
chr6 (100-225)||(22176575-22176696)
chr6 (100-225)||(25179411-25179533)
chr6 (100-195)||(8765332-8765429)
chr6 (100-153)||(924253-924307)
chr6 (18-55)||(27292882-27292919)
chr6 (100-194)||(4112745-4112838)
chr6 (437-471)||(18940100-18940134)
chr6 (90-182)||(1142836-1142928)
chr6 (100-153)||(17086790-17086842)
chr6 (165-209)||(12048318-12048362)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (18-624)||(18429444-18430049)
chr7 (18-624)||(39862229-39862834)
chr7 (18-624)||(39150378-39150982)
chr7 (18-628)||(6178366-6178976)
chr7 (18-624)||(15918748-15919337)
chr7 (24-624)||(14225565-14226150)
chr7 (245-630)||(6223101-6223486)
chr7 (18-225)||(4948245-4948452)
chr7 (18-193)||(30308320-30308495)
chr7 (18-184)||(14929894-14930060)
chr7 (18-194)||(5801970-5802147)
chr7 (18-195)||(35971883-35972060)
chr7 (18-195)||(35993295-35993472)
chr7 (18-185)||(18623085-18623252)
chr7 (18-196)||(18459608-18459786)
chr7 (22-225)||(18137643-18137842)
chr7 (100-194)||(15353421-15353515)
chr7 (100-185)||(11361212-11361297)
chr7 (100-194)||(2149963-2150057)
chr7 (100-194)||(2165174-2165268)
chr7 (100-194)||(4186253-4186347)
chr7 (100-194)||(20592646-20592740)
chr7 (100-193)||(11414454-11414547)
chr7 (100-185)||(13736218-13736303)
chr7 (100-194)||(2968837-2968932)
chr7 (100-194)||(5246182-5246277)
chr7 (100-193)||(11429438-11429531)
chr7 (100-194)||(10921521-10921616)
chr7 (90-180)||(18539097-18539185)
chr7 (90-180)||(18549606-18549694)
chr7 (100-195)||(18626931-18627023)
chr7 (100-153)||(36879208-36879261)
chr7 (90-193)||(5158602-5158702)
chr7 (100-193)||(5123649-5123739)
chr7 (558-624)||(4054683-4054748)
chr7 (558-623)||(15478905-15478969)
chr7 (100-225)||(16439676-16439800)
chr7 (100-225)||(16454577-16454701)
chr7 (100-209)||(7369171-7369279)
chr7 (100-195)||(13895338-13895435)
chr7 (100-195)||(15004785-15004882)
chr7 (100-228)||(30241753-30241878)
chr7 (100-195)||(10851765-10851862)
chr7 (100-209)||(10839442-10839548)
chr7 (100-152)||(4055288-4055337)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (145-624)||(9540-10019)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (27-195)||(18200-18368)
[»] scaffold1704 (1 HSPs)
scaffold1704 (18-195)||(578-755)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (487-624)||(14438-14574)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (100-194)||(11546-11641)
scaffold0089 (100-194)||(51766-51860)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (100-194)||(20593-20687)
[»] scaffold1665 (2 HSPs)
scaffold1665 (100-225)||(104-228)
scaffold1665 (461-558)||(442-539)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (100-193)||(5266-5359)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (18-190)||(25209-25382)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (100-194)||(72864-72958)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (101-184)||(11786-11869)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (100-194)||(13496-13591)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (100-180)||(4908-4987)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (100-225)||(22543-22665)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (100-225)||(50179-50301)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (100-153)||(11119-11173)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (100-225)||(17333-17455)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (100-225)||(7491-7613)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (100-225)||(76922-77044)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (100-195)||(8292-8389)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (100-195)||(16972-17069)
scaffold0109 (100-152)||(31260-31313)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (100-209)||(22657-22763)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (100-209)||(125928-126034)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (100-225)||(99085-99209)
scaffold0021 (100-225)||(180008-180132)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 519; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 40795051 - 40794446
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40795051 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 40794952  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40794951 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 40794852  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40794851 tattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgag 40794752  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40794751 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 40794652  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40794651 tgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 40794552  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40794551 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaa-gaac 40794453  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  40794452 aaattaa 40794446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 27687963 - 27687352
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27687963 taagcattgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 27687864  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaattt-aaaagatgaatttaaactagcctaaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27687863 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaattttaaaagatgaatttaaactagcctaaa 27687764  T
Q  217 atattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaa-ttgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27687763 atattacataaccattggaaatacaaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctattctaatagaaatgagaatgatgaggtgagatgctatgagatg 27687664  T
Q  316 agtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaag 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687663 agtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataaaatggtgaag 27687564  T
Q  415 aaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaac 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27687563 aaatggtgaaaataaccaagatatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaac 27687464  T
Q  515 atcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatga--agaaaaatatggcatgagattcac-aaaattatgccaaaa 611  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||    
T  27687463 atcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaaaatatggcaagaaattcacaaaaattaggtcaaaa 27687364  T
Q  612 aggaacaaattaa 624  Q
    | |||||||||||    
T  27687363 a-gaacaaattaa 27687352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 624
Target Start/End: Original strand, 26620370 - 26620951
Alignment:
Q  45 ctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620370 ctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtgggatgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 26620469  T
Q  145 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26620470 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatagtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaataaaaaa 26620569  T
Q  245 aaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 344  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620570 aaggaaaaattgcaagaaataaaacctatcctaatagaaatgagaatgatgaggtgagatgctatgggatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 26620669  T
Q  345 aacaagatg---aaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataat 441  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26620670 aacaagatgaaaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacatatt 26620769  T
Q  442 gagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatact 541  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26620770 gagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgtatact 26620869  T
Q  542 aattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  26620870 aattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggtcaaaaa-gaacaaattaa 26620951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 32236644 - 32237236
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32236644 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtatgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 32236743  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32236744 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatagtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 32236843  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32236844 tattacataaccattggaaataccaa-aaaggagaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 32236942  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||            |||| |||||||||||||    
T  32236943 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaacacaagatgaaaaatataacatgagtgata-gagaaagtaatc------------aatacaatggtgaagaaa 32237029  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaa-gaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacat 516  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32237030 tggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacat 32237129  T
Q  517 cacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaa 616  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | | |||| |||    
T  32237130 cacatctatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggtcgaaaa-gaa 32237228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 26265700 - 26265886
Alignment:
Q  45 ctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26265700 ctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 26265799  T
Q  145 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26265800 cctttacatcgagtcctaaatacatgttatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccat 26265886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 37870330 - 37870507
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37870330 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 37870429  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37870430 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 37870507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13065184 - 13065007
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13065184 taagcgttctaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 13065085  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13065084 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 13065007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17632611 - 17632435
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17632611 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtatcggtgctcgtgtcg 17632512  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17632511 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 17632435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39885678 - 39885503
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39885678 taagcgttgtaaagcctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 39885579  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39885578 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 39885503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39901254 - 39901079
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39901254 taagcgttgtaaagcctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 39901155  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39901154 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 39901079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 27424100 - 27424277
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27424100 taagcgttgtaaaacctaaacatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 27424199  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  27424200 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatggtatgttcttgcaaggaattaaaag 27424277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 27439144 - 27439321
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27439144 taagcgttgtaaaacctaaacatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 27439243  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  27439244 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatggtatgttcttgcaaggaattaaaag 27439321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12651021 - 12650926
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12651021 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 12650926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12665942 - 12665847
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12665942 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 12665847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 34306406 - 34306491
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34306406 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagcgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 34306491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39757462 - 39757367
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39757462 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaagaatttaaaa 39757367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 28269507 - 28269601
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  28269507 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatatatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 28269601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 34263607 - 34263692
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34263607 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagcgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtctttcaag 34263692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24045294 - 24045211
Alignment:
Q  112 gtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24045294 gtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 24045211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28877679 - 28877595
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28877679 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcccttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 28877595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28892889 - 28892805
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28892889 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcccttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 28892805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20831575 - 20831483
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20831575 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatt---agagtccattgtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 20831483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23121491 - 23121413
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  23121491 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 23121413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 4727314 - 4727444
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  4727314 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 4727410  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  4727411 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 4727444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 15713525 - 15713655
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  15713525 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 15713621  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  15713622 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 15713655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 21693146 - 21693268
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||   | |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  21693146 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtcctttacat-ttgccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 21693242  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21693243 aatttaaacta-cctaaaatattacat 21693268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 21707928 - 21708050
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||   | |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  21707928 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtcctttacat-ttgccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 21708024  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21708025 aatttaaacta-cctaaaatattacat 21708050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 19446350 - 19446447
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19446350 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctaatttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 19446447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 19461159 - 19461256
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19461159 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctaatttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 19461256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27388489 - 27388436
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    
T  27388489 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttaca 27388436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27399550 - 27399497
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    
T  27399550 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttaca 27399497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 515; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 515; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 16264493 - 16263890
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16264493 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtgaggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 16264394  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264393 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 16264294  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264293 tattacataaccattggaaata-aaggaagggaaaattacaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 16264195  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16264194 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatag-aaaaagtaatcaattgaatatgaaatacaatggtgaagaaa 16264096  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16264095 tggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 16263996  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16263995 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaa-gaac 16263897  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  16263896 aaattaa 16263890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 19650444 - 19651050
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19650444 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 19650543  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  19650544 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactaacataaaa 19650643  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaa-cctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19650644 tattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatga 19650743  T
Q  317 gtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19650744 gtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaa 19650843  T
Q  417 atggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19650844 atggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacat 19650943  T
Q  517 cacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaa 616  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||    
T  19650944 cacatctatcataaagttgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggtcaaaaa-gaa 19651042  T
Q  617 caaattaa 624  Q
    ||||||||    
T  19651043 caaattaa 19651050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 19661489 - 19662095
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19661489 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 19661588  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  19661589 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactaacataaaa 19661688  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaa-cctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661689 tattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatga 19661788  T
Q  317 gtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661789 gtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaa 19661888  T
Q  417 atggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19661889 atggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacat 19661988  T
Q  517 cacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaa 616  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||    
T  19661989 cacatctatcataaagttgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggtcaaaaa-gaa 19662087  T
Q  617 caaattaa 624  Q
    ||||||||    
T  19662088 caaattaa 19662095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 29036960 - 29036357
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29036960 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgcgtcggtgctcgtgtcg 29036861  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29036860 gtgtacatcagttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaaggtgaatttaaactagcctaaaa 29036761  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29036760 tattacataaccattggaaatacaaa-aaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 29036662  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29036661 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgata-gagaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 29036563  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29036562 tgatgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgagatacaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 29036463  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| ||    
T  29036462 acatttatcataaaattgcatgctaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggtcaaaaagg-ac 29036364  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  29036363 aaattaa 29036357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 24461356 - 24461961
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24461356 taagcgttataaaatctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 24461455  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24461456 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcccaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 24461555  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24461556 tattacataaccattggaaatacaaa-aaagaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatataaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgag 24461654  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24461655 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagataaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 24461754  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24461755 tgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaaggaacacacaaatcatatcaaaacagtagcacaatcataaaatcagcatc 24461854  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcac-aaaattatgccaaaaaggaa 616  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||| |||    
T  24461855 acatttaacataaaattgcatgctaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaaattagtccaaaaa-gaa 24461953  T
Q  617 caaattaa 624  Q
    ||||||||    
T  24461954 caaattaa 24461961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 30367206 - 30367813
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30367206 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 30367305  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30367306 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgtaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 30367405  T
Q  218 tattacataaccattggaaatac-aaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30367406 tattacataaccattggaaatacaaaaaaaagaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaataggaatgagaatgacgtggtaagatgctatgagatga 30367505  T
Q  317 gtgaaacatgagtcaacaatgttagc-aaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaaga 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  30367506 gtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaacaatcaattgaatatggaatgaaatggtaaaga 30367605  T
Q  416 aatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaaca 515  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30367606 aatgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaaca 30367705  T
Q  516 tcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaagga 615  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | | |||||||    
T  30367706 tcaaacttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaaggaattcacaaaattaggtc-aaaagga 30367804  T
Q  616 acaaattaa 624  Q
    |||||||||    
T  30367805 acaaattaa 30367813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 22143461 - 22142901
Alignment:
Q  46 taaacatacatt-ccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 144  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143461 taaacagacattgccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 22143362  T
Q  145 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22143361 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatactaaa 22143262  T
Q  245 aaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 344  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||                    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143261 aaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaataggaatgagaatgatg--------------------agtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 22143182  T
Q  345 aacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagt--catcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataatg 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  22143181 aacatgatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaaaccatcaattgaatatggaatgaaatggtagagaaatgatgagaatagccaagacataatg 22143082  T
Q  443 agaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatacta 542  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22143081 agaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacacttaacataaaattgcatacta 22142982  T
Q  543 attgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  22142981 attgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagggattcacaaaattaggtc-aaaaggaacaaattaa 22142901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 18 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16273079 - 16272614
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16273079 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtgaggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 16272980  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16272979 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 16272880  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16272879 tattacataaccattggaaata-aaggaagggaaaattacaagaaataaaacctaatctattaaaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgaaatgag 16272781  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  16272780 tgaaacatgagttcacaatgtttgcaaaacaagatgaaaaatataacttgagtgata-gaaaaagtaatcaattgaatattaaatacaagggtgaagaat 16272682  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaa 489  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  16272681 tggtgaaattaacc-agacattttgagaagaaaa-ttgcttaaaatg-aagaaac-ccccaatcataccaaa 16272614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18801174 - 18800661
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18801174 taagcgttgtaaaacctaggcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 18801075  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18801074 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat--tgtcctagttacattctatggtcttgcaaaaaattaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 18800977  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgc-aagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatga 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |   ||||||| || | ||||||||||||||    
T  18800976 tattacataaccattagaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaataaaacctaatctaataggaaag---atgatgtagtaaaatgctatgagatga 18800881  T
Q  317 gtgaaacatgagtcaac-aatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaaga 415  Q
    |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||  |||||||||||  ||| |   |||||||||| ||||||| ||||||| | ||    
T  18800880 gtgaagaataagtcaacaaatgttagcaaaacaagataagaacaatgccatgagtgata--aaaca---atcaattgaacatgaaatgaaatggtaacga 18800786  T
Q  416 aatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaaca 515  Q
    |||| ||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |  ||||||| |||||||  |    
T  18800785 aatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacagcaatacaatcataaaatcagta 18800697  T
Q  516 tcacatttatcataaaattgcatactaattgttcat 551  Q
    |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  18800696 tcacatataccatagaattacatactaattgttcat 18800661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 14359482 - 14359657
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14359482 taagcattataaaacttaagcatgcatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 14359581  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14359582 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 14359657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14553160 - 14552984
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14553160 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 14553061  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14553060 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 14552984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14573984 - 14573808
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14573984 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 14573885  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14573884 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 14573808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 555672 - 555495
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  555672 taagcgttgtaaagcctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 555573  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  555572 gtgtacatcacttatagtgtccataatcctttacattgagtcctaaatacatactatggtcttgcaaggaatttaaaa 555495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19698674 - 19698497
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19698674 taagcgttgtaaaacctaggcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 19698575  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcc-tttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19698574 gtgtacatcacttatagtgtccatagtccttttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 19698497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15210526 - 15210346
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15210526 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 15210427  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgct---atggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  15210426 gtgtacatcgcttatagtgtccatagtcctttacattgactcctagatacatgctatgatggtcttgcaaagaatttaaaa 15210346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Original strand, 12480033 - 12480183
Alignment:
Q  45 ctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480033 ctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 12480132  T
Q  145 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12480133 cctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 12480183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 19906531 - 19906698
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19906531 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacattcattccctaatcatgcatttagaacatccgtgtggggtgtgtgcacgtgtcggtgctcgtgtcg 19906630  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19906631 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcctgcaag 19906698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23079324 - 23079208
Alignment:
Q  79 atccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtc 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23079324 atccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtc 23079225  T
Q  179 ttgcaagaatttaaaag 195  Q
    ||||||| | |||||||    
T  23079224 ttgcaaggaattaaaag 23079208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28262986 - 28262893
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28262986 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 28262893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 16254418 - 16254512
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16254418 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcttttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 16254512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Original strand, 21337322 - 21337406
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21337322 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 21337406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Original strand, 21377283 - 21377367
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21377283 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 21377367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 2141999 - 2142094
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2141999 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcgcttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 2142094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 5516484 - 5516579
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5516484 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttatattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 5516579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 18786539 - 18786634
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18786539 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatctcttatagcgtccatagtcctttacactgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 18786634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 27598574 - 27598665
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27598574 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 27598665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 27613626 - 27613717
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27613626 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 27613717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Original strand, 2126842 - 2126925
Alignment:
Q  112 gtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2126842 gtgtcggtgtacatcgcttatagtgtccatagtcctttacattgagttctagatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 2126925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33242331 - 33242278
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33242331 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 33242278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33271675 - 33271622
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33271675 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 33271622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 14025297 - 14025350
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14025297 gtgtcggtgcttgtgtcagtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 14025350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15324469 - 15324416
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15324469 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 15324416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15504838 - 15504785
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15504838 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 15504785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Original strand, 31339637 - 31339715
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||    
T  31339637 gtgtcggtgcttgtgttggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgttatggtctt 31339715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15018084 - 15018030
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  15018084 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccattgtcctttacat 15018030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 11342611 - 11342708
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11342611 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctaatttacatgctatggtcttgcaataaattaaaag 11342708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25746921 - 25746825
Alignment:
Q  101 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25746921 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctagtttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 25746825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21965537 - 21965484
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    
T  21965537 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttaca 21965484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 508; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 1733101 - 1733705
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733101 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaagatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 1733200  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733201 gtgtacatcatttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 1733300  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733301 tattacataaccattggaaataccaa-aaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 1733399  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1733400 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatatagcatgagtgata-gaaaaagtaatcaattgaatatgaaatacaatggtgaagaaa 1733498  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1733499 tggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttaacatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 1733598  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaag-aaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaa 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  1733599 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaacttatgaagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaa-gaa 1733697  T
Q  617 caaattaa 624  Q
    ||||||||    
T  1733698 caaattaa 1733705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 624
Target Start/End: Original strand, 26826131 - 26826728
Alignment:
Q  27 taaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26826131 taaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatgggatgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatc 26826230  T
Q  127 acttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26826231 acttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacata 26826330  T
Q  227 accattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatg 326  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26826331 accattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatg 26826430  T
Q  327 agtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||    
T  26826431 agtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgtaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaa 26826530  T
Q  427 taaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatc 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26826531 taaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttaac 26826630  T
Q  527 ataaaattgcatactaattgttcataacatgtgcc-aaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26826631 ataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaattaa 26826728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 600
Target Start/End: Original strand, 37184740 - 37185325
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37184740 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtgtggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 37184839  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37184840 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 37184939  T
Q  218 tattacataaccattggaaatac-aaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37184940 tattacataaccattggaaatacaaaaaaaagaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatga 37185039  T
Q  317 gtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatg-aaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaaga 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37185040 gtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaaga 37185139  T
Q  416 aatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaaca 515  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37185140 aatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaaaacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaaca 37185239  T
Q  516 tcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaag-aaaaatatggcatgagattcacaaaa 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  37185240 tcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaa 37185325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 628
Target Start/End: Original strand, 35566419 - 35567028
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35566419 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 35566518  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35566519 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 35566618  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35566619 tattacataaccattggaaatacaaa-aaagaaaaattgcaagaaataaaacctattctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatggg 35566717  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35566718 ggaaacatgagtcaacaatgttagtaaaacaagatgaaaaatataatatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 35566817  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacata-atgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacat 516  Q
    || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35566818 tgatgagaataaccaagacatatttgagaagaaaagttgtttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacat 35566917  T
Q  517 cacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaa 616  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  35566918 cacatttatcataaaattgcatattaattgttcataacatgtgcaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaa-gaa 35567016  T
Q  617 caaattaaccaa 628  Q
    ||||||||||||    
T  35567017 caaattaaccaa 35567028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 624
Target Start/End: Original strand, 16419417 - 16420009
Alignment:
Q  24 ttataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16419417 ttataaaacctaagcatacatctaagcatacatcccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 16419516  T
Q  124 atcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 223  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16419517 atccattatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 16419616  T
Q  224 ataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaac 323  Q
    |||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16419617 ataaccattggaaattaaaa-------aaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtcgtaagatgctatgagatgagtgaaac 16419709  T
Q  324 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtga 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  16419710 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgcaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatga 16419809  T
Q  424 aaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacattt 523  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16419810 gaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaataataaaatcaacatcacattt 16419909  T
Q  524 atcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaatta 623  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16419910 aacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaatta 16420008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 4786464 - 4786979
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4786464 taagcgttgtaaaacctaggcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 4786563  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4786564 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat--tgtcctagttacattctatggtcttgcaaaaaattaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 4786661  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgc---aagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagat 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||   || ||||||||||||||||| ||| || |   ||||||| || | ||||||||||||    
T  4786662 tattacataaccattagaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaaaataaaacctaatctaataggaaag---atgatgtagtaaaatgctatgagat 4786757  T
Q  315 gagtgaaacatgagtcaac-aatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaa 413  Q
    |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||  ||||| |||||  ||| |   |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4786758 gagtgaagaataagtcaacaaatgttagcaaaacaagataagaacaatgccatgactgata--aaaca---atcaattgaacatgaaataaaatggtaaa 4786852  T
Q  414 gaaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaa 513  Q
    |||||| ||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||     
T  4786853 gaaatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacagcaacacaatcataaaatcag 4786941  T
Q  514 catcacatttatcataaaattgcatactaattgttcat 551  Q
     |||| || || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  4786942 tatcatatataccatagaattacatactaattgttcat 4786979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 551
Target Start/End: Original strand, 4801302 - 4801817
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4801302 taagcgttgtaaaacctaggcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 4801401  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4801402 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcatttacat--tgtcctagttacattctatggtcttgcaaaaaattaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 4801499  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgc---aagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagat 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||   || ||||||||||||||||| ||| || |   ||||||| || | ||||||||||||    
T  4801500 tattacataaccattagaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaaaataaaacctaatctaataggaaag---atgatgtagtaaaatgctatgagat 4801595  T
Q  315 gagtgaaacatgagtcaac-aatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaa 413  Q
    |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||  ||||| |||||  ||| |   |||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  4801596 gagtgaagaataagtcaacaaatgttagcaaaacaagataagaacaatgccatgactgata--aaaca---atcaattgaacatgaaatgaaatggtaaa 4801690  T
Q  414 gaaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaa 513  Q
    |||||| ||           || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||     
T  4801691 gaaatgatg-----------gaaataatgagaatgaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacagcaacacaatcataaaatcag 4801779  T
Q  514 catcacatttatcataaaattgcatactaattgttcat 551  Q
     |||| || || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  4801780 tatcatatataccatagaattacatactaattgttcat 4801817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 16063570 - 16063783
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16063570 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatctatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 16063669  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16063670 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 16063769  T
Q  218 tattacataaccat 231  Q
    ||||||||||||||    
T  16063770 tattacataaccat 16063783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8346616 - 8346441
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8346616 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 8346517  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8346516 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacattctatggtcttgcaagaatgtaaa 8346441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 14451689 - 14451865
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14451689 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatctatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 14451788  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14451789 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctctacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 14451865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9530556 - 9530381
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9530556 taagcattatagaacctaagcatacatctaaacatacattgcctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtggtcgtgtcg 9530457  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9530456 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 9530381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19928480 - 19928303
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19928480 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccgtgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 19928381  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19928380 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 19928303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 462 - 624
Target Start/End: Original strand, 8105970 - 8106131
Alignment:
Q  462 atgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgcc 561  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8105970 atgcaagaaacacacaaattataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgcc 8106069  T
Q  562 aaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8106070 aaaacttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaa-gaacaaattaa 8106131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11812085 - 11811924
Alignment:
Q  32 cctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactta 131  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11812085 cctaatcatgcatctaagcatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcactta 11811986  T
Q  132 tagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11811985 tagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 11811924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10414169 - 10414052
Alignment:
Q  76 aatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatg 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10414169 aatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttttgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatg 10414070  T
Q  176 gtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  10414069 gtcttgcaagaatgtaaa 10414052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 34799636 - 34799800
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||            |||||||    
T  34799636 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatatattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgca------------tgtgtcg 34799723  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34799724 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacagtgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 34799800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4882948 - 4882854
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4882948 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 4882854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 8279153 - 8279247
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8279153 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 8279247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 8307963 - 8308057
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8307963 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 8308057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 11261164 - 11261258
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11261164 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 11261258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18046707 - 18046613
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18046707 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 18046613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18062770 - 18062676
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18062770 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 18062676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 22641610 - 22641704
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22641610 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 22641704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15104359 - 15104269
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15104359 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcataaatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtg 15104269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1999703 - 1999619
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1999703 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 1999619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4684443 - 4684348
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4684443 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 4684348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 8226839 - 8226933
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8226839 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 8226933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8291408 - 8291314
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8291408 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 8291314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 15730790 - 15730884
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15730790 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagcgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 15730884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 15745875 - 15745969
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15745875 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagcgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 15745969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18003055 - 18002970
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18003055 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgatatggtcttgcaag 18002970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4694527 - 4694432
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4694527 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgaaaggaatttaaaa 4694432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5647252 - 5647158
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5647252 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacaagctatggtcttgcaaggaattaaaa 5647158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10600703 - 10600618
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10600703 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 10600618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5662674 - 5662581
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  5662674 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggt-ttgcaaggaattaaaa 5662581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3392383 - 3392292
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3392383 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 3392292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35876206 - 35876128
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  35876206 gtgtcggtgcttgtgtcagtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 35876128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4445500 - 4445422
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  4445500 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 4445422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4449663 - 4449585
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  4449663 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 4449585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19273912 - 19273859
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19273912 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 19273859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35891276 - 35891198
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||    
T  35891276 gtgtcggtgcttgtgtcagtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgatatggtctt 35891198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4888923 - 4888835
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||    
T  4888923 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgttatggtctt 4888835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Original strand, 9722109 - 9722197
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  9722109 gtgtgtgcgagtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 9722197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10423046 - 10422983
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatc 81  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10423046 taagcgttgtaaagcctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatc 10422983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28013069 - 28012991
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  28013069 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgttcatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 28012991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28359867 - 28359789
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  28359867 gtgtcggtgcttgtgtcgatgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 28359789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18326352 - 18326222
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  18326352 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 18326256  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18326255 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 18326222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18341451 - 18341321
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  18341451 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 18341355  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18341354 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 18341321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4717312 - 4717182
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  4717312 gtgtgtgcgagtgtcggtgtttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 4717216  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  4717215 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 4717182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4732492 - 4732362
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  4732492 gtgtgtgcgagtgtcggtgtttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 4732396  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  4732395 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 4732362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6187994 - 6187864
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||| || |||     
T  6187994 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgaaaaaatc 6187898  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  6187897 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 6187864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 32964174 - 32964304
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||| |||| |||     
T  32964174 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtctggcaaaaatc 32964270  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  32964271 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 32964304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 14141825 - 14141947
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||   | |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  14141825 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacat-ttgccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 14141921  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14141922 aatttaaacta-cctaaaatattacat 14141947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11812111 - 11812070
Alignment:
Q  33 ctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatcta 74  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11812111 ctaagcatacatctaagcatacattccctaatcatgcatcta 11812070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19704898 - 19704778
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  19704898 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttaaagt--ccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-gg 19704804  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19704803 aatttaaacta-cctaaaatattacat 19704778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 15475988 - 15476042
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  15475988 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactataaagagtccattgtcctttacat 15476042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6212739 - 6212631
Alignment:
Q  112 gtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat-ttaaaagatgaatttaaactag 210  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||     
T  6212739 gtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacattg--tcctagatacattctatggtcttgcaaaaatcttaaaaga--aattaaaacta- 6212646  T
Q  211 cctaaaatattacat 225  Q
     ||||||||||||||    
T  6212645 tctaaaatattacat 6212631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 11647087 - 11647208
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   || |||||| ||||||||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  11647087 gtgtcggtgcttgtgttggtgtacatcatt---agagtccattgtcctttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaaggga 11647182  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||||    
T  11647183 aaattaaacta-cctaaaatattacat 11647208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 23011897 - 23011991
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23011897 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag 23011991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 10929929 - 10929983
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||| |||||||||||    
T  10929929 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagttcattgtcctttacat 10929983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 16614953 - 16615007
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||    
T  16614953 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacat 16615007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22051907 - 22051853
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||    
T  22051907 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacat 22051853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18525835 - 18525783
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||    
T  18525835 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacat 18525783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 36131463 - 36131516
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    
T  36131463 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttaca 36131516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 28166197 - 28166241
Alignment:
Q  165 tacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaacta 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  28166197 tacattctatggtcttgcaagaatttaaaagaaaaattgaaacta 28166241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 507; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 628
Target Start/End: Original strand, 34496988 - 34497596
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34496988 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaattatgcatctagaatatccatgtgaggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 34497087  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34497088 gtgtacatcacttatagtgtccgtagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 34497187  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaa--taaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34497188 tattacataaccattggaaatacaaa--aaggaaaattgcaaaaaaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatg 34497285  T
Q  316 agtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaaga 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34497286 agtgaaacatgagtcaataatgttagcaaaacaagatgaaaa-tataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataaaatggtgaaga 34497384  T
Q  416 aatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaaca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34497385 aatggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagaacaatcataaaatcaaca 34497484  T
Q  516 tcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaagga 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34497485 tcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagagattcacaaaattatgccaaaaa-ga 34497583  T
Q  616 acaaattaaccaa 628  Q
    |||||||||||||    
T  34497584 acaaattaaccaa 34497596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 624
Target Start/End: Original strand, 30913073 - 30913654
Alignment:
Q  27 taaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30913073 taaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccacgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatc 30913172  T
Q  127 acttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30913173 acttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaagggtgaatttaaactagcctaaaatattacata 30913272  T
Q  227 accattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatg 326  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30913273 accattggaaatacaa--aaaggaaaattgcaagaaataaaacttaatctagtagaaatgagaatgatgtgttgagatgctatgagatgagtgaaacatg 30913370  T
Q  327 agtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||            |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30913371 agtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgata-gagaaagtaatc------------aatacaatggtgaagaaatggtgaaaa 30913457  T
Q  427 taaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatc 526  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30913458 taaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaaggaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatctatc 30913557  T
Q  527 ataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  30913558 ataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggtccaaaa-gaacaaattaa 30913654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 25504168 - 25504381
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25504168 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 25504267  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25504268 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 25504367  T
Q  218 tattacataaccat 231  Q
    ||||||||||||||    
T  25504368 tattacataaccat 25504381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18083985 - 18083771
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18083985 taagcgttgtaaaacctaaacatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 18083886  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcct-aaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18083885 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 18083786  T
Q  217 atattacataaccat 231  Q
    |||||||||||||||    
T  18083785 atattacataaccat 18083771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Original strand, 35871422 - 35871630
Alignment:
Q  24 ttataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatgggg-tgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35871422 ttataaaacctaagcatacatctaagcatacatcccctaatcatgcatctagaatatccatgtgggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgta 35871521  T
Q  123 catcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatatta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35871522 catcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactaacctaaaatatta 35871621  T
Q  223 cataaccat 231  Q
    |||||||||    
T  35871622 cataaccat 35871630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 570804 - 570981
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  570804 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgtatgtgtcggtgctcgtgtcg 570903  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  570904 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 570981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15494815 - 15494649
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15494815 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 15494716  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15494715 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 15494649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 35396503 - 35396678
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35396503 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaagcatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 35396602  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35396603 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 35396678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 23722605 - 23722782
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23722605 taagcgttgtaaaacctaagcagacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 23722704  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23722705 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaagaatttaaaa 23722782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16682741 - 16682591
Alignment:
Q  45 ctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682741 ctaagcatacattccctagtcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt 16682642  T
Q  145 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16682641 cctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 16682591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 29881927 - 29882090
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||    
T  29881927 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgca------------tgtgtcg 29882014  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29882015 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcatttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 29882090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 24692834 - 24692929
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24692834 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 24692929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 20193725 - 20193819
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20193725 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 20193819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3943935 - 3943850
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3943935 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 3943850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 18061655 - 18061750
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag-aatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18061655 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaagtaatttaaaa 18061750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30930123 - 30930028
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30930123 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 30930028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30957006 - 30956911
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30957006 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 30956911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 32449540 - 32449634
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32449540 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 32449634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22445695 - 22445611
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22445695 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 22445611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22347620 - 22347536
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22347620 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 22347536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11545874 - 11545786
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  11545874 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 11545786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11559933 - 11559845
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  11559933 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 11559845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33773029 - 33772951
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  33773029 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 33772951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33787981 - 33787903
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  33787981 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 33787903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 20580190 - 20580313
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||    ||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  20580190 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtcctttacactttgtcctagtttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag-gg 20580287  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20580288 aatttaaacta-cctaaaatattacat 20580313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41301614 - 41301536
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41301614 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctaattacattctatggtctt 41301536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 22988479 - 22988609
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  22988479 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 22988575  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  22988576 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 22988609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 23003546 - 23003676
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  23003546 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 23003642  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  23003643 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 23003676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37651033 - 37650954
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcc-tttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||| |||||| ||||||||||    
T  37651033 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatggtccttttacat--tgtcctagatacattctatggtctt 37650954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Original strand, 23430740 - 23430817
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  23430740 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgt-catagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 23430817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 23901762 - 23901697
Alignment:
Q  558 tgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23901762 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaattaa 23901697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25195591 - 25195469
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  25195591 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-gg 25195495  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25195494 aatttaaacta-cctaaaatattacat 25195469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 22268924 - 22269046
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  22268924 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcg-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 22269020  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22269021 aatttaaacta-cctaaaatattacat 22269046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22898991 - 22898867
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||     |||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||      
T  22898991 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccattgtcctttacat-tttccctaatttacattctatggttttgcaagaaattaaaag-g 22898894  T
Q  198 gaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22898893 aaatttaaacta-cctaaaatattacat 22898867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 222
Target Start/End: Original strand, 30465794 - 30465913
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  30465794 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 30465890  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatatta 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  30465891 aatttaaacta-cctaaaatatta 30465913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21501238 - 21501184
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  21501238 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccattgtcctttacat 21501184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 23887119 - 23887055
Alignment:
Q  558 tgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23887119 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaaga-aatcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaattaa 23887055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25210953 - 25210831
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  25210953 gtgtcagtgcttgtgtcagtgtacatca-ttagagagtccattgtccattacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-gg 25210857  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25210856 aatttaaacta-cctaaaatattacat 25210831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25275105 - 25274983
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  25275105 gtgtcagtgcttgtgtcagtgtacatca-ttagagagtccattgtccattacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-gg 25275009  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25275008 aatttaaacta-cctaaaatattacat 25274983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 27285738 - 27285860
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| |||||||||||||||||  ||||||       
T  27285738 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaaataaaag-ga 27285834  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27285835 aatttaaacta-cctaaaatattacat 27285860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 613
Target Start/End: Original strand, 6557337 - 6557926
Alignment:
Q  24 ttataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6557337 ttataaaacctaagcatacatctaaacatacatcccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 6557436  T
Q  124 atcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6557437 atcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 6557536  T
Q  224 ataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaac 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6557537 ataaccattggaaatacaaaaaaagaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgagtgaaac 6557636  T
Q  324 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtga 423  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  6557637 atgagtcaacaatgttagcaagacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgcatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatga 6557736  T
Q  424 aaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacattt 523  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6557737 gaataaccaaaacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacattt 6557836  T
Q  524 atcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaag 613  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  6557837 aacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattagaccaaaaag 6557926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 34271902 - 34271294
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34271902 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 34271803  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271802 gtgtacatcacttatagtgtccatagtccttcacatcgagtcctaaatacatgttatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 34271703  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271702 tattacataaccattggaaatacaaa-aaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 34271604  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34271603 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 34271504  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34271503 tgatgagaataatcaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 34271404  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34271403 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatacggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaa-gaac 34271305  T
Q  618 aaattaaccaa 628  Q
    |||||||||||    
T  34271304 aaattaaccaa 34271294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 15196207 - 15196812
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15196207 taagcgttataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgcgtcggtgcttgtgtca 15196306  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15196307 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttaaatcaagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 15196406  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15196407 tattacataaccattggaaatagaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgag 15196506  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15196507 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 15196606  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15196607 tgatgagaataaccacgacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 15196706  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  15196707 acatttatcataaaattgcatactaattgtacataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattagtccaaaaa-gaac 15196805  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  15196806 aaattaa 15196812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 600
Target Start/End: Original strand, 40464118 - 40464700
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40464118 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 40464217  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40464218 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 40464317  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40464318 tattacataaccattggaaatgcaaaaaagggcaaattgcaagaaataaaacctaatccaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 40464417  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  40464418 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatggaatggtaaagaaa 40464517  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40464518 tgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacacatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 40464617  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  40464618 acatttatcataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaa 40464700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 4865672 - 4865135
Alignment:
Q  24 ttataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865672 ttataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 4865573  T
Q  124 atcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865572 atcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 4865473  T
Q  224 ataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaac 323  Q
    |||| ||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4865472 ataatcattggaaattaaaa------aaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgagtgaaaa 4865379  T
Q  324 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtga 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  4865378 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatgtaacatgagtgataggataaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatga 4865279  T
Q  424 aaataaccaagacataatgagaag-aaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatt 522  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4865278 gaataaccaagacataatgagaagaaaaagttgcttgaaatgcaaaaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatt 4865179  T
Q  523 tatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaat 566  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4865178 taacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaat 4865135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 18027694 - 18027871
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18027694 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 18027793  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18027794 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 18027871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40563107 - 40562930
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40563107 taagcgttgtaaaacctaaacatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccacgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgttcgtgtcg 40563008  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40563007 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 40562930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20308959 - 20308782
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20308959 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaagcatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 20308860  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20308859 gtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaagaatttaaaa 20308782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 9247838 - 9247932
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9247838 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 9247932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13441122 - 13441037
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13441122 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 13441037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14657135 - 14657040
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14657135 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcgaggaatttaaaa 14657040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14675569 - 14675474
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14675569 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcgaggaatttaaaa 14675474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 194
Target Start/End: Original strand, 19639624 - 19639714
Alignment:
Q  104 cggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19639624 cggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 19639714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17009492 - 17009408
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17009492 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 17009408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 14658802 - 14658887
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14658802 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcatgcaag 14658887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17023457 - 17023373
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17023457 gtgtcggtgtttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 17023373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Original strand, 22111626 - 22111704
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  22111626 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 22111704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17087052 - 17086928
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||   | |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||      
T  17087052 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactataaagagtccattgtcctttacat-ttgccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaagga 17086954  T
Q  198 gaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||    
T  17086953 g-atttaaacta-cctaaaatattacat 17086928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5317292 - 5317162
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||| |||| |||     
T  5317292 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtctggcaaaaatc 5317196  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  5317195 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 5317162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 624
Target Start/End: Original strand, 22728169 - 22728234
Alignment:
Q  558 tgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22728169 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaattaa 22728234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15219517 - 15219409
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15219517 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaagaag 15219420  T
Q  199 aatttaaacta 209  Q
    |||| ||||||    
T  15219419 aattaaaacta 15219409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17241694 - 17241586
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17241694 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaagagg 17241597  T
Q  199 aatttaaacta 209  Q
    |||| ||||||    
T  17241596 aattaaaacta 17241586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16281150 - 16281053
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16281150 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctaatttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 16281053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1895775 - 1895655
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| |||||||||||   | ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  1895775 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatt---agagtccattgtcctttacattt-gccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 1895681  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1895680 aatttaaacta-cctaaaatattacat 1895655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30278338 - 30278295
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30278338 gtgtcggtgcttgtgtcggtggacatcccttatagtgtccatag 30278295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 18465242 - 18465296
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  18465242 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccattgtcctttacat 18465296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15387264 - 15387170
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| |  ||     ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15387264 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattggctctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag 15387170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15238273 - 15238165
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| |||| |||| | | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15238273 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagttcattgtccgttacgttg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaagaag 15238176  T
Q  199 aatttaaacta 209  Q
    |||| ||||||    
T  15238175 aattaaaacta 15238165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20757306 - 20757253
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    
T  20757306 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttaca 20757253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1910521 - 1910463
Alignment:
Q  165 tacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1910521 tacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-gaaatttaaacta-cctaaaatattacat 1910463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 14240134 - 14240178
Alignment:
Q  165 tacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaacta 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  14240134 tacattctatggtcttgcaagaatttaaaagagaaattaaaacta 14240178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 26407050 - 26407108
Alignment:
Q  165 tacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26407050 tacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-gaaatttaaacta-cctaaaatattacat 26407108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 31979 - 32584
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctaggatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 32078  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32079 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 32178  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32179 tattacataaccattggaaatacaaaaaagggaaaattgcaagaagtaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 32278  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32279 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 32378  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32379 tgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgtttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 32478  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  32479 acatttattataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaaggaattcacaaaattaggtcaaaaa-gaac 32577  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  32578 aaattaa 32584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 18598201 - 18597596
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598201 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 18598102  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598101 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 18598002  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598001 tattacataaccgttggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaagtaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 18597902  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18597901 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaagaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 18597802  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18597801 tgatgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgacatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 18597702  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  18597701 acatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggtcaaaaa-gaac 18597603  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  18597602 aaattaa 18597596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 624
Target Start/End: Original strand, 21645349 - 21645945
Alignment:
Q  24 ttataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21645349 ttataaaacctaagcacacatctaaacatacatcccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcttgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 21645448  T
Q  124 atcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645449 atcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgctagtatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 21645548  T
Q  224 ataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaac 323  Q
    ||||||||||||||||  || |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21645549 ataaccattggaaataataaaaaa---aaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgggaatgatgtggtaagatgctatgagatgagtgaaac 21645645  T
Q  324 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtga 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||    
T  21645646 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatttaacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtatagaaatgatga 21645745  T
Q  424 aaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacattt 523  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21645746 gaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacattt 21645845  T
Q  524 atcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaatta 623  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21645846 aacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaatta 21645944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 20321375 - 20321550
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20321375 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 20321474  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20321475 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 20321550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24654944 - 24654767
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24654944 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtgggatgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 24654845  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24654844 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 24654767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18293596 - 18293501
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18293596 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 18293501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21481571 - 21481477
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21481571 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 21481477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18289193 - 18289098
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18289193 gtgtcggtgcttctgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagacctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 18289098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21505793 - 21505743
Alignment:
Q  103 tcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21505793 tcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacat 21505743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Original strand, 47662888 - 47663018
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat- 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  47662888 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatc 47662984  T
Q  189 ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  47662985 ttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaatattacat 47663018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 16197726 - 16197850
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaag-aatttaaaagat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  16197726 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaaagag 16197823  T
Q  198 gaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||    
T  16197824 aaattgaaacta-cctaaaatattacat 16197850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 16212735 - 16212859
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaag-aatttaaaagat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  16212735 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaaagag 16212832  T
Q  198 gaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||    
T  16212833 aaattgaaacta-cctaaaatattacat 16212859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16230686 - 16230632
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  16230686 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccattgtcctttacat 16230632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Original strand, 31447673 - 31447781
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  31447673 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatgatcttgcaagaaattaaaagagg 31447770  T
Q  199 aatttaaacta 209  Q
    |||| ||||||    
T  31447771 aattaaaacta 31447781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20456589 - 20456536
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    
T  20456589 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttaca 20456536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 487; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 166812 - 166207
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166812 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 166713  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166712 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 166613  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166612 tattacataaccattggaaattcaaaaaagggtaaattgcaagaattaaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 166513  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  166512 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 166413  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  166412 tgatgagaaataccaagacataatgagaagaaaagttgttttaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 166313  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  166312 acatttattataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaaggaattcacaaaattaggtcaaaaa-gaac 166214  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  166213 aaattaa 166207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 7585256 - 7584648
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7585256 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 7585157  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7585156 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 7585057  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaagg-aaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7585056 tattacataaccattggaaatacaaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctatcctaatagaaatgagaatgatgaggtgagatgctatgagatga 7584957  T
Q  317 gtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatg-aaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaaga 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7584956 gtgaaacatgagtcaacaatgttagtaaaacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataaaatggtgaaga 7584857  T
Q  416 aatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaaca 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7584856 aatggtgaaaataaccaagatatattgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaaca 7584757  T
Q  516 tcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcac-aaaattatgccaaaaagg 614  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||| |    
T  7584756 tcacatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgtcaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaaattaggtcaaaaa-g 7584658  T
Q  615 aacaaattaa 624  Q
    ||||||||||    
T  7584657 aacaaattaa 7584648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 270 - 624
Target Start/End: Original strand, 22480574 - 22480927
Alignment:
Q  270 ctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgag 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22480574 ctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaagacaagatgaaaaatataacatgag 22480673  T
Q  370 tgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaaga 469  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22480674 tgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgctcaaaatacaaga 22480773  T
Q  470 aacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattca 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22480774 aacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcataataattgttcataacatgtgccaaaattta 22480873  T
Q  570 tgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  22480874 tgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaatta-gtctaaaaagaacaaattaa 22480927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 20217119 - 20216522
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20217119 taagcattgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 20217020  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20217019 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaag 20216920  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgc--aagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  || ||||||| |||||||||  ||  || || ||||||| || | |||||||||||||    
T  20216919 tattacataaccattggaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaaataaaccctaatctaaaagggataaggatgatgtagtaaaatgctatgagatg 20216821  T
Q  316 agtgaaacatgagtc-aacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgag-tgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaa 413  Q
    ||||||  |  |||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||||  ||| |   |||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  20216820 agtgaagaacaagtcaaaaaatgttagcaaaacaagataagaaaaatgccatgagttgata--aaaca---atcaattgaacatgaaatgaaatggtaaa 20216726  T
Q  414 gaaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaa 513  Q
    |||||| |||||           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||     
T  20216725 gaaatgatgaaa-----------ataatgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacagcaacacaatcataaaatcag 20216637  T
Q  514 catcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaag 613  Q
     || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||  | ||||||    
T  20216636 tatgacatataccatagaattgcatactaattgttcataacatgtgtctaaatttatgaagaaagatatggcaagaaaatcacaatattagcctaaaaag 20216537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 22111141 - 22110544
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111141 taagcattgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 22111042  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22111041 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaag 22110942  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgc--aagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  || ||||||| |||||||||  ||  || || ||||||| || | |||||||||||||    
T  22110941 tattacataaccattggaaatac-aagagagaaaaattgcaaaaaaaataaaccctaatctaaaagggataaggatgatgtagtaaaatgctatgagatg 22110843  T
Q  316 agtgaaacatgagtc-aacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgag-tgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaa 413  Q
    ||||||  |  |||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |||||  ||| |   |||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  22110842 agtgaagaacaagtcaaaaaatgttagcaaaacaagataagaaaaatgccatgagttgata--aaaca---atcaattgaacatgaaatgaaatggtaaa 22110748  T
Q  414 gaaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaa 513  Q
    |||||| |||||           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||     
T  22110747 gaaatgatgaaa-----------ataatgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaacacctaaaccatacccaaacagcaacacaatcataaaatcag 22110659  T
Q  514 catcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaag 613  Q
     || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||  | ||||||    
T  22110658 tatgacatataccatagaattgcatactaattgttcataacatgtgtctaaatttatgaagaaagatatggcaagaaaatcacaatattagcctaaaaag 22110559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 361 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 26502530 - 26502268
Alignment:
Q  361 taacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaa 460  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26502530 taacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaa 26502431  T
Q  461 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26502430 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaattgttcataacatgtgc 26502331  T
Q  561 caaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26502330 caaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattatgccaaaaa-gaacaaattaa 26502268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18940463 - 18940131
Alignment:
Q  91 tgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaattt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18940463 tgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacattctatggtcttgcaaaaattt 18940364  T
Q  191 aaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaa 290  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| |    
T  18940363 agaagatgaattcaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatac-aagagagaaaaattgcaa-aaataaaccctaacctaaaagaaatgagga 18940266  T
Q  291 tgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtc-aacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaa 389  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||  |  |||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||  ||| |   |||||    
T  18940265 tgatgtagtaaaatgctatgagatgagtgaagaacaagtcaaaaaatgttagcaaaacaagataagaaaaatgccatgagtgata--aaaca---atcaa 18940171  T
Q  390 ttgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataa 429  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18940170 ttgaacatgaaatgaaatggtgaagaaatgatgaaaataa 18940131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16562109 - 16561934
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16562109 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 16562010  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16562009 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 16561934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31541645 - 31541468
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31541645 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 31541546  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31541545 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 31541468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27646654 - 27646479
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27646654 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaagcatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 27646555  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27646554 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 27646479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27029906 - 27029740
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27029906 taagcgttgtaaaacctaggcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 27029807  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27029806 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 27029740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24874284 - 24874107
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  24874284 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgttg 24874185  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttaca-tcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24874184 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatttgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 24874107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24852249 - 24852081
Alignment:
Q  27 taaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24852249 taaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgttggtgtacatc 24852150  T
Q  127 acttatagtgtccatagtcctttaca-tcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24852149 acttatagtgtccatagtcctttacatttgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 24852081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26995585 - 26995418
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaag-catacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtc 116  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26995585 taagcgttgtaaaacctaaggcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtc 26995486  T
Q  117 ggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26995485 ggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 26995418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 16767614 - 16767790
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16767614 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccacgtggggtgtgtgcatgtatcggtgcttgtgtcg 16767713  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16767714 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaa 16767790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 15402080 - 15402175
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15402080 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 15402175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 15413867 - 15413962
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15413867 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 15413962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 15429460 - 15429555
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15429460 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 15429555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3043567 - 3043473
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3043567 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 3043473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26984601 - 26984507
Alignment:
Q  101 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26984601 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaagaatttaaaa 26984507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27035664 - 27035570
Alignment:
Q  101 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27035664 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaagaatttaaaa 27035570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12621445 - 12621358
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12621445 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcttttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaa 12621358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 18815035 - 18815130
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18815035 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 18815130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 19900609 - 19900704
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19900609 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 19900704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 22923858 - 22923953
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22923858 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacattacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 22923953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 22939570 - 22939665
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22939570 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacattacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 22939665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 23862015 - 23862110
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23862015 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacattacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 23862110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 34471391 - 34471485
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34471391 gtgtcgttgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 34471485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Original strand, 13288704 - 13288788
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13288704 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 13288788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 184
Target Start/End: Original strand, 13303671 - 13303755
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13303671 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 13303755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 24295325 - 24295421
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24295325 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaagaatttaaaag 24295421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 24309343 - 24309439
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24309343 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaagaatttaaaag 24309439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 29628310 - 29628220
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtg 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  29628310 taagcattattaaacctaagcatacatctaagcatacattccctaatcatgcatctagaatattcatgtgaggtgtgtgcatgtgtcggtg 29628220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 30969287 - 30969377
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  30969287 taagcattataaatcctaagcatacatctaagcatacattccctaatcatacatctaaaataaccatgtgaggtgtgtgcatgtgtcggtg 30969377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 539 - 613
Target Start/End: Original strand, 27365917 - 27365991
Alignment:
Q  539 actaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27365917 actaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaacatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaag 27365991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 539 - 613
Target Start/End: Original strand, 27456264 - 27456338
Alignment:
Q  539 actaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaag 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27456264 actaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaacatggcaagaaattcacaaaattaggccaaaaag 27456338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Original strand, 32781113 - 32781201
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  32781113 gtgtgtgcgagtgtcggtgctggtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 32781201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20156257 - 20156136
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  20156257 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacatag-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaatttaaaaga-- 20156162  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20156161 aattaaaacta-cctaaaatattacat 20156136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 22176575 - 22176696
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  22176575 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacatag-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaatttaaaaga-- 22176670  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22176671 aattaaaacta-cctaaaatattacat 22176696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25179533 - 25179411
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||   | |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  25179533 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacat-ttgccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 25179437  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25179436 aatttaaacta-cctaaaatattacat 25179411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8765429 - 8765332
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||    | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8765429 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccattgtcctttacactttgccctagtttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 8765332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 924307 - 924253
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  924307 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccattgtcctttacat 924253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 55
Target Start/End: Original strand, 27292882 - 27292919
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacataca 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27292882 taagcattataaaacctaagcatacatctaagcataca 27292919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 4112745 - 4112838
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4112745 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaa 4112838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 437 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18940134 - 18940100
Alignment:
Q  437 ataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaa 471  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18940134 ataatgagaataaaagttgcttaaaatgcaagaaa 18940100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1142928 - 1142836
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgc 182  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  1142928 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagatagtccatggtcctttacatttggtcctaatatacattctaaggtcttgc 1142836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 17086790 - 17086842
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||    
T  17086790 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacat 17086842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 12048318 - 12048362
Alignment:
Q  165 tacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaacta 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  12048318 tacattctatggtcttgcaagaatttaaaagagaaattaaaacta 12048362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 476; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 18430049 - 18429444
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  18430049 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatgcattctctaatcatgcatctagaatatccatgtggggggtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtca 18429950  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18429949 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 18429850  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18429849 tattacataaccattggaaatacaaa-aaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaacgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgag 18429751  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18429750 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgatagaaaaaagtaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaa 18429651  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18429650 tgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 18429551  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcac-aaaattatgccaaaaaggaa 616  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||| |||    
T  18429550 acatttatcatgaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaagaaattcacaaaaattaggtcaaaaa-gaa 18429452  T
Q  617 caaattaa 624  Q
    ||||||||    
T  18429451 caaattaa 18429444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 39862229 - 39862834
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39862229 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 39862328  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39862329 atgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 39862428  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39862429 tattacataaccattggaaatacaaaaaaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaataggaatgagaatgatgtggtaagatgctatgagatgag 39862528  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  39862529 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacatgatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaccatcaattgaatatggaatgaaatggtaaagaaa 39862628  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39862629 tgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcatacaaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 39862728  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | | |||||||||    
T  39862729 acacttaacataaaattgcgtactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaaggaattcacaaaattaggtc-aaaaggaac 39862827  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  39862828 aaattaa 39862834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 39150982 - 39150378
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39150982 taagcgttgtaaaacctaggcatacatctaaacatacattctctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 39150883  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39150882 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 39150783  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39150782 tattacataaccattggaaatacaaa-aaggaaaaattgcaagatataaaacttaacctaatagaaatgagaatgatgtggtaggatgctatgagatgag 39150684  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||    
T  39150683 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaaaccatcaattgaatatggaatgaaatggtagagaaa 39150584  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39150583 tgatgagaatagccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 39150484  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  39150483 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgaggaaaaatatggcaataaattcacaaaattaggtcaaaaa-gaac 39150385  T
Q  618 aaattaa 624  Q
    |||||||    
T  39150384 aaattaa 39150378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 6178976 - 6178366
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178976 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctaggatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 6178877  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178876 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaggtacatgctatggtcttgcaaaaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 6178777  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6178776 tattacataaccaatggaaatacaaa-agagaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtaagatgctataagatgag 6178678  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagat-gaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  6178677 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagataaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaaaatgaaatgaaatggtaaagaa 6178578  T
Q  417 atggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacat 516  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6178577 atgatgagaataaccaagacataatgagaagaaaagttgctaaaaatacaagaaaaacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaaacaacat 6178478  T
Q  517 cacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaa 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  | |||||| |     
T  6178477 cacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaaattatgaagaaaaatatagcaagaaattcacaacattagcctaaaaagaag 6178378  T
Q  617 caaattaaccaa 628  Q
    ||||||||||||    
T  6178377 caaattaaccaa 6178366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 624
Target Start/End: Original strand, 15918748 - 15919337
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15918748 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 15918847  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15918848 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaggatgaatttaaactagcctaaaa 15918947  T
Q  218 tattacataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15918948 tattacataaccattggaaatacaaa-aaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgag 15919046  T
Q  318 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||            |||| |||||||||||||    
T  15919047 tgaaacatgagtcaacaatgttagcaaaataagatgaaaaatataacatgagtgata-gagaaagtaatc------------aatacaatggtgaagaaa 15919133  T
Q  418 tggtgaaaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15919134 tggtgaaaataaccaagacatattgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaa--acacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatc 15919231  T
Q  518 acatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaac 617  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  15919232 aaatttatcataaaattgtatactaattgttcataacatgtgccaaaatttatgagaaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaggtcaaaaa-gaac 15919330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 624
Target Start/End: Original strand, 14225565 - 14226150
Alignment:
Q  24 ttataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||            |||    
T  14225565 ttataaaacctaagcatacatctaagcatacatcccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtg------------tac 14225652  T
Q  124 atcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14225653 atcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattac 14225752  T
Q  224 ataaccattggaaatacaaagaaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaac 323  Q
    |||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14225753 ataaccattggaaataaaaataaat--aaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgaagtggtaagatgctatgagatgagtgaaac 14225850  T
Q  324 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtga 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    |||||||| | |    
T  14225851 atgagtcaacaatgttagcaaaacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaataacaaagaaatgataa 14225950  T
Q  424 aaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacattt 523  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14225951 gaataaccaagacataatgagaagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacattt 14226050  T
Q  524 atcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaatta 623  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14226051 aacataaaattgcatactaattgctcataacatgtgccaaagtttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaatta 14226149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 245 - 630
Target Start/End: Original strand, 6223101 - 6223486
Alignment:
Q  245 aaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6223101 aaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 6223200  T
Q  345 aacaagatgaaaa-atataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataatga 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6223201 aacaagatgaaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtaatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataatga 6223300  T
Q  444 gaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6223301 gaagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaa 6223400  T
Q  544 ttgttcataacatgtgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaaccaaaa 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||    
T  6223401 ttgttcataacatgtgccaaaattcatgaaaaaaaatatggcaagaaattcacaaaatta-gtctaaaaagaacaaattaatcaaaa 6223486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4948452 - 4948245
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948452 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 4948353  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4948352 gtgtacatcacttatagagtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcgaaaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaag 4948253  T
Q  218 tattacat 225  Q
    ||||||||    
T  4948252 tattacat 4948245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30308495 - 30308320
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308495 taagcattataaaacctaagcatgcatataaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 30308396  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30308395 gtgtacatcacttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 30308320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 14929894 - 14930060
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14929894 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 14929993  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14929994 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 14930060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 5801970 - 5802147
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5801970 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 5802069  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgc-aagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5802070 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaagaatttaaaa 5802147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35972060 - 35971883
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35972060 taagcgttgtaaaacctaaacatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 35971961  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35971960 gtgtacatcacttataatgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 35971883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35993472 - 35993295
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35993472 taagcgttgtaaaacctaaacatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 35993373  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35993372 gtgtacatcacttataatgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 35993295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18623252 - 18623085
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18623252 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 18623153  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18623152 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 18623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 18459608 - 18459786
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18459608 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatacatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcgatgcttgtgtcg 18459707  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaaga 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  18459708 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacaacgagtcctaaatacatgctatggtcttgcgagtaattaaaaga 18459786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18137842 - 18137643
Alignment:
Q  22 cattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgc-ttgtgtcggtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18137842 cattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtgaggtgtgtgcatgtgtcggtgctttgtgtctgtg 18137743  T
Q  121 tacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaat-ttaaaagatgaatttaaactagcctaaaata 219  Q
    ||||||| |||  | ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||  ||||||||    
T  18137742 tacatca-ttagggagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaaaaatcttaaaaga--aattaaaacta-tctaaaata 18137649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 15353421 - 15353515
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15353421 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 15353515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11361297 - 11361212
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11361297 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaag 11361212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2150057 - 2149963
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2150057 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 2149963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2165268 - 2165174
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2165268 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 2165174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4186347 - 4186253
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  4186347 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgttatggtcttgcaaggaattaaaa 4186253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20592740 - 20592646
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20592740 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 20592646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 11414454 - 11414547
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11414454 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatgggcttgcaagaatgtaaa 11414547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 13736218 - 13736303
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13736218 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactaatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaag 13736303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2968932 - 2968837
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2968932 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttataatgttcatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 2968837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5246277 - 5246182
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5246277 gtgtcagtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 5246182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 11429438 - 11429531
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11429438 gtgtcggtgattgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatgggcttgcaagaatgtaaa 11429531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 10921521 - 10921616
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10921521 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcgcttatagcgtccatagtcctttacactgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 10921616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18539185 - 18539097
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  18539185 gtgtgtgcgagtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 18539097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18549694 - 18549606
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  18549694 gtgtgtgcgagtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacat--tgtcctagatacatgctatggtctt 18549606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18627023 - 18626931
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18627023 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatt---agagtccattgtcctttacattgagtcctaactacatgctacggtcttgcaaggaattaaaag 18626931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 36879208 - 36879261
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36879208 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttatagtgtccatagtcctttacat 36879261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5158702 - 5158602
Alignment:
Q  90 gtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatt 189  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  5158702 gtgtgtgcgagtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaagaatg 5158606  T
Q  190 taaa 193  Q
    ||||    
T  5158605 taaa 5158602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5123739 - 5123649
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5123739 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatta-ttagagagtccatagtcctttacat--tgtcctagatacattctatggtcttgcaagaatgtaaa 5123649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 4054748 - 4054683
Alignment:
Q  558 tgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4054748 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaattaa 4054683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 15478969 - 15478905
Alignment:
Q  558 tgccaaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaatta 623  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15478969 tgccaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaatta 15478905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 16439676 - 16439800
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| | |||||||||||   | |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||      
T  16439676 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccgttgtcctttacat-ttgccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-g 16439773  T
Q  198 gaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16439774 aaatttaaacta-cctaaaatattacat 16439800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454701
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| | |||||||||||   | |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||      
T  16454577 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactatagagagtccgttgtcctttacat-ttgccctaatttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-g 16454674  T
Q  198 gaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16454675 aaatttaaacta-cctaaaatattacat 16454701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7369279 - 7369171
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7369279 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaagagg 7369182  T
Q  199 aatttaaacta 209  Q
    |||| ||||||    
T  7369181 aattaaaacta 7369171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 13895338 - 13895435
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13895338 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctaatttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 13895435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Original strand, 15004785 - 15004882
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15004785 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctaatttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 15004882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Original strand, 30241753 - 30241878
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||   | |||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||       
T  30241753 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttaaagagtccattgtccgttacat-ttgccctaatttacattctatgatcttgcaagaaattaaaag-ga 30241849  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacataac 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30241850 aatttaaacta-cctaaaatattacataac 30241878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10851862 - 10851765
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaa-atacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10851862 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgcccaaatttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 10851765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Original strand, 10839442 - 10839548
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| |||| |||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  10839442 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatt---agagtccattgtccattacatagac-cctagtttacattctatggtcttgcaagaatttaaaagaga 10839537  T
Q  199 aatttaaacta 209  Q
    |||| ||||||    
T  10839538 aattaaaacta 10839548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4055337 - 4055288
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttaca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  4055337 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca---ttagagtccatagtcctttaca 4055288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 10019 - 9540
Alignment:
Q  145 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10019 cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggatttaaaagatgaatttaaactagcctaaaatattacataaccattggaaatacaaaa 9920  T
Q  245 aaaggaaaattgcaagaaataaaacctaatctagtagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 344  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9919 aaggaaaaattgcaagaaataaaacctaatctaatagaaatgagaatgatgtggtgagatgctatgagatgagtgaaacatgagtcaacaatgttagcaa 9820  T
Q  345 aacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagtcatcaattgaatatgaaataaaatggtgaagaaatggtgaaaataaccaagacataatgag 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9819 aacaagatgaaaaatataacatgagtgataggaaaaagcaatcaattgaatatgaaatgaaatggtaaagaaatgatgagaataaccaagacataatgag 9720  T
Q  445 aagaaaagttgcttaaaatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaat 544  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9719 aagaaaagttgcttgaaatgcaagaaacacacaaatcgtaccaaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttaacataaaattgcatactaat 9620  T
Q  545 tgttcataacatgtgcc-aaaattcatgaagaaaaatatggcatgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9619 tgctcataacatgtgccaaaaatttatgaagaaaaatatggcaagaaattcacaaaattaagccaaaaa-gaacaaattaa 9540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18368 - 18200
Alignment:
Q  27 taaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18368 taaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatgtggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatc 18269  T
Q  127 acttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18268 acttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 18200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1704 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1704
Description:

Target: scaffold1704; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 578 - 755
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgcttgtgtcg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  578 taagcgttgtaaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaacatccatgtggggcgtgtgcatgtgtcggtgctcgtgtcg 677  T
Q  118 gtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  678 gtgtacatcacttataatgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaag 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 487 - 624
Target Start/End: Original strand, 14438 - 14574
Alignment:
Q  487 aaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgtgccaaaattcatgaag-aaaaatatggc 585  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  14438 aaaacagtagcacaatcataaaatcaacatcacatttatcataaaattgcacactaattgtccataacatgtaccaaaatttatgaagaaaaaatatggc 14537  T
Q  586 atgagattcacaaaattatgccaaaaaggaacaaattaa 624  Q
    | || ||||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  14538 aagaaattcacaaaattaggtcaaaa--gaacaaattaa 14574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 11546 - 11641
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa-gaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11546 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaatttaaaa 11641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 51766 - 51860
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51766 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 51860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 20593 - 20687
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20593 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 20687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1665 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold1665
Description:

Target: scaffold1665; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 104 - 228
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |    
T  104 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacaaaacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaaaaaattaaaagggaa 203  T
Q  200 atttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||    
T  204 attgaaacta-cctaaaatattacat 228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1665; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 558
Target Start/End: Original strand, 442 - 539
Alignment:
Q  461 aatgcaagaaacacacaaatcataccaaaacagtagcacaatcaaaaaatcaacatcacatttatcataaaattgcatactaattgttcataacatgt 558  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||| | |||| ||||||    
T  442 aatgcaagaaaccaacaattcatatcaaaacagtagcacaattataaaatcatcatcacattcaacatgaaattgcatattaatcgatcatgacatgt 539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 5266 - 5359
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaa 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5266 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaagaatgtaaa 5359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25382 - 25209
Alignment:
Q  18 taagcattataaaacctaagcatacatctaaacatacattccctaatcatgcatctagaatatccatatggggtgtgtgcatgtgtcggtgctt-gtgtc 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25382 taagcattatgaaacctaagcatacatctaaacatacaccccctaatcatacatctaaaataaccatgtgaggtgtgtgcatgtgtcggtgcttcgtgtc 25283  T
Q  117 ggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaattt 190  Q
    ||||||||| | ||| || ||||||||||||||  |    ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  25282 ggtgtacattatttagagagtccatagtcctttttacattgtcctaggtacattctatggtcttgcaaaaattt 25209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 72864 - 72958
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  72864 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacattgaatcctaaatatatgctatggtcttgcaaggaattaaaa 72958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11869 - 11786
Alignment:
Q  101 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttgcaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11869 tgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagtcctagatacatgctatggtcttgcaa 11786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 13496 - 13591
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtcttg-caagaatttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13496 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcccttataatgtccatagtcctttacattgagccctagatacatgctatggtcttgtaaagaatttaaaa 13591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Original strand, 4908 - 4987
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagt-cctttacatcgagtcctaaatacatgctatggtctt 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||| |||||| ||||||||||    
T  4908 gtgtcggtgctcgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatggtccctttacat--tgtcctagatacattctatggtctt 4987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22665 - 22543
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  22665 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaagttaaaag-ga 22569  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22568 aatttaaacta-cctaaaatattacat 22543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 50179 - 50301
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  50179 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaagttaaaag-ga 50275  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  50276 aatttaaacta-cctaaaatattacat 50301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 11119 - 11173
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  11119 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcactataaagagtccattgtcctttacat 11173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17455 - 17333
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  17455 gtgtcggtgcttgtgccggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 17359  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17358 aatttaaacta-cctaaaatattacat 17333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 7491 - 7613
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  7491 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagggagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 7587  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7588 aatttaaacta-cctaaaatattacat 7613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 77044 - 76922
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||       
T  77044 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagggagtccattgtccgttacattg-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaag-ga 76948  T
Q  199 aatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  76947 aatttaaacta-cctaaaatattacat 76922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8389 - 8292
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8389 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctagtttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 8292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17069 - 16972
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaagaatttaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17069 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttacactttgccctagtttacatgctatggtcttgcaagaaattaaaag 16972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31313 - 31260
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcact-tatagtgtccatagtcctttaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||    
T  31313 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcattatagagagtccattgtcctttaca 31260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22763 - 22657
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| |||| |||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  22763 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatt---agagtccattgtccattacatagac-cctagtttacattctatggtcttgcaagaatttaaaagaga 22668  T
Q  199 aatttaaacta 209  Q
    |||| ||||||    
T  22667 aattaaaacta 22657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125928
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtcctaaat-acatgctatggtcttgcaagaatttaaaagatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| |||| |||||| | | ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  126034 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcatt---agagtccattgtccattacatag-gccctagtttacattctatggtcttgcaagaatttaaaagaga 125939  T
Q  199 aatttaaacta 209  Q
    |||| ||||||    
T  125938 aattaaaacta 125928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 99209 - 99085
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaag-aatttaaaagat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||   | ||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  99209 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacat-ttgccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaaagag 99112  T
Q  198 gaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||    
T  99111 aaattgaaacta-cctaaaatattacat 99085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 180132 - 180008
Alignment:
Q  100 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatcacttatagtgtccatagtcctttacatcgagtccta-aatacatgctatggtcttgcaag-aatttaaaagat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||   | ||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  180132 gtgtcggtgcttgtgtcggtgtacatca-ttagagagtccattgtccgttacat-ttgccctagtttacattctatggtcttgcaagaaattaaaaagag 180035  T
Q  198 gaatttaaactagcctaaaatattacat 225  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||    
T  180034 aaattgaaacta-cctaaaatattacat 180008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University