View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19330_high_3 (Length: 496)

Name: NF19330_high_3
Description: NF19330
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19330_high_3
NF19330_high_3
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (242-478)||(14552897-14553133)
chr3 (1-60)||(14553188-14553247)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (242-478)||(37702208-37702444)
chr5 (242-478)||(37393276-37393512)
chr5 (242-478)||(37711029-37711265)
chr5 (242-478)||(37593729-37593965)
chr5 (242-478)||(37696120-37696356)
chr5 (242-478)||(37532625-37532861)
chr5 (242-478)||(37639271-37639507)
chr5 (243-475)||(37382726-37382958)
chr5 (242-478)||(37401397-37401633)
chr5 (285-478)||(37823429-37823622)
chr5 (243-478)||(37413565-37413800)
chr5 (1-180)||(37400901-37401080)
chr5 (1-180)||(37594282-37594461)
chr5 (1-180)||(37702626-37702805)
chr5 (246-478)||(37435235-37435467)
chr5 (1-181)||(37435664-37435844)
chr5 (1-180)||(37711582-37711761)
chr5 (1-180)||(37392915-37393094)
chr5 (1-180)||(37696673-37696858)
chr5 (1-180)||(37823847-37824032)
chr5 (1-90)||(37533148-37533237)
chr5 (1-176)||(37639828-37640009)
chr5 (186-244)||(37393187-37393245)
chr5 (186-243)||(37696523-37696580)
chr5 (189-245)||(37639537-37639593)
chr5 (189-245)||(37823695-37823751)
chr5 (189-239)||(37401176-37401226)
chr5 (189-243)||(37594132-37594186)
chr5 (189-242)||(37401311-37401364)
chr5 (189-242)||(37711298-37711351)
chr5 (186-241)||(37702478-37702533)
chr5 (189-234)||(37532902-37532947)
chr5 (189-243)||(37639674-37639728)
chr5 (189-243)||(37711432-37711486)
chr5 (186-234)||(37594006-37594054)
chr5 (186-234)||(37696397-37696445)
chr5 (1-102)||(37382358-37382459)
chr5 (1-85)||(37413279-37413363)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (285-475)||(16843438-16843628)
chr4 (245-478)||(24218133-24218366)
chr4 (285-475)||(16846106-16846296)
chr4 (1-176)||(16842899-16843074)
chr4 (186-234)||(16843171-16843219)
chr4 (189-239)||(16843309-16843359)
chr4 (186-234)||(16845970-16846018)
chr4 (186-238)||(24218041-24218093)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14553133 - 14552897
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14553133 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 14553034  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14553033 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 14552934  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14552933 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 14552897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14553247 - 14553188
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatctt 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14553247 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatctt 14553188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37702444 - 37702208
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  37702444 tatgattccacaatgtctgggaacatttcctcatctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttctccaaagga 37702345  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37702344 aatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccgcagtctttggctcaatgttcaaatcttgaagtattggaccttggtg 37702245  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702244 acaacaacatagaggatacatttcccaattggctaga 37702208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Original strand, 37393276 - 37393512
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  37393276 tatgattccacaatgtctaggaacattttcttatctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctgtggaagcattcctggaaccttttccaaagga 37393375  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  37393376 aatatatttgagactataaaattgaatggaaaccaattggaaggaccattaccacaatgtttggcttactgttcatatcttgaagtattggaccttggtg 37393475  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37393476 acaacaacatagaggatacttttcccaattggctaga 37393512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37711265 - 37711029
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  37711265 tatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatgttttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaagga 37711166  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  37711165 aatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggatcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtg 37711066  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37711065 acaacaacgttgaggatacatttcctgattggctaga 37711029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37593965 - 37593729
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  37593965 tatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaaacattcctagaaccttttccaaagaa 37593866  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  37593865 aatgcatttcagactataaagttgaatggaaaccaattggaaggaccattaccacagtctttgtctcactgttcatttcttgaagttttggaccttggtg 37593766  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37593765 acaacaacatagaggacacatttccaaattggctaga 37593729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37696356 - 37696120
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  37696356 tatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaaacattcctagaaccttttccaaagaa 37696257  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  37696256 aatgcatttcagactataaagttgaatggaaaccaattggaaggaccattaccacagtctttgtctcactgttcatttcttgaagttttggaccttggtg 37696157  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37696156 acaacaacatagaggacacatttccaaattggctaga 37696120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37532861 - 37532625
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  37532861 tatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaaacattcctagaaccttttccaaagaa 37532762  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  37532761 aatgcatttcagactataaagttgaatggaaaccaattggaaggaccattaccccagtctttgtctcactgttcatttcttgaagttttggaccttggtg 37532662  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37532661 acaacaacatagaggacacatttccaaattggctaga 37532625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37639507 - 37639271
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  37639507 tatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttactgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttctccaaagga 37639408  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  37639407 aatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtg 37639308  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37639307 acaacaacgttgaggatacatttcctgattggctaga 37639271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 243 - 475
Target Start/End: Original strand, 37382726 - 37382958
Alignment:
Q  243 atgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaa 342  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||    
T  37382726 atgattccacaatgcttgggaacatttccttctctttcggtattggatatgcaaatgaacaacctctatggacacattcctagaaccttctccaaaggaa 37382825  T
Q  343 atgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtga 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| ||    
T  37382826 atgcatttgagacaataaagttgaatggaaaccgattggaaggaccattaccacagtctttggctcactgtacaaaactcgaagttttggaccttggaga 37382925  T
Q  443 caacagcatagaggatacatttcccaattggct 475  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  37382926 caacaacgtagaggatacttttcccaattggct 37382958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Original strand, 37401397 - 37401633
Alignment:
Q  242 tatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaagga 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  37401397 tatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaagga 37401496  T
Q  342 aatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  37401497 aatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtg 37401596  T
Q  442 acaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37401597 acaacaacgttgaggatacatttcctgattggctaga 37401633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 285 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37823622 - 37823429
Alignment:
Q  285 ttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaag 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  37823622 ttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaag 37823523  T
Q  385 gaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtgacaacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    ||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37823522 gaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctaga 37823429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 243 - 478
Target Start/End: Original strand, 37413565 - 37413800
Alignment:
Q  243 atgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaa 342  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  37413565 atgattccacaatgcctaggaacatttccttctctttctatattggatatgcaaatgaacaacttgtatggaagctttcctagaaccttttccaaaggaa 37413664  T
Q  343 atgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtga 442  Q
    || |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||  | |||||||||||    
T  37413665 atacatttgagatgataaagttgaacggaaatcaattggaaggaccattaccacagtctttggcttagtgcataaatcttgaagttctggaccttggtga 37413764  T
Q  443 caacagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37413765 caacaatatagaggatacatttcccaattggctaga 37413800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 37400901 - 37401080
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagcacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  37400901 tcaacattgatagcagtgctgactccatcttacccaacctttttttattagatttatcctctgctaatattaatagttttcctaaattcccagcacgaaa 37401000  T
Q  101 tctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaactcat 180  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37401001 tctgaaaagattatatctctccaataacaacattcgtgggaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaaactcat 37401080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37594461 - 37594282
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagcacaaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  37594461 tcaactttgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttgttgacttagttttatcttattctaatattaatagttttcctaaattccaaacacgaaa 37594362  T
Q  101 tctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaactcat 180  Q
    |||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37594361 tcttcaaagattagatctctccaataacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaaactcat 37594282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37702805 - 37702626
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagcacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37702805 tcaacattgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttgttgacttagatttctcgtctgctaatattaatagttttcctaaattccaagcacaaaa 37702706  T
Q  101 tctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaactcat 180  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  37702705 tctgcaaacattagatctctccaataactacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaaactcttaaactcat 37702626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 37435467 - 37435235
Alignment:
Q  246 attccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaaatg 345  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||| | ||||||||    
T  37435467 attccaaaatgcctgggaacatttccttttctttccgttttggatatgcaaatgaacaaccttaatggaagcatgcctaaaactttttccagaggaaatg 37435368  T
Q  346 catttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtgacaa 445  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| || || |||||||||||| || | ||  || | || ||||||||  ||||    
T  37435367 ccttcgagactataaagttgaatggcaaccaattagaaggaccattacctcaatctttggctcactgtacagaactcaaaattttggaccttggatacaa 37435268  T
Q  446 cagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37435267 caacatagaggatacatttcccaattggctaga 37435235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 37435844 - 37435664
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagcacaaaa 100  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37435844 tcaacactaatagcagtgctgactccatcttacccaaccttgagatgttagatttatcttctgctaatattaatagttttcctaaattccacgcacaaaa 37435745  T
Q  101 tctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaactcatt 181  Q
     ||  ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  37435744 acttcaaacattagatctctccaataacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaaacacatt 37435664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37711761 - 37711582
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagcacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37711761 tcaacattgatagcagtattgactccatcatacccaaccttttttcattagatttatcctctgctaatattaatagttttcctaaattccaagcacgaaa 37711662  T
Q  101 tctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaactcat 180  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  37711661 tctgcaaacattagatctctccaacaacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcatacgaagctcttaaactcat 37711582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 37392915 - 37393094
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagcacaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37392915 tcaacattgatagcagtgttgacaccatcttacctaaccttttttcattagatttatcatatgccaatattaatagttttcctaaattccaagcacgaaa 37393014  T
Q  101 tctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaactcat 180  Q
    |||| |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |  ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37393015 tctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttcataagaagctcttaaactcat 37393094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37696858 - 37696673
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagc------ 94  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||          
T  37696858 tcaacactgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttgttgacttagaattatctaatgctaatattaatagttttcctaaattcctagcgcaact 37696759  T
Q  95 acaaaatctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaactcat 180  Q
    || ||||||| ||   ||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37696758 accaaatctgcaatcgttagatctctccaacaacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaaactcat 37696673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37824032 - 37823847
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagc------ 94  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||          
T  37824032 tcaacactgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttttttcattagatttatcctctgctaatattaatagttttcctaaattcctagcgcaact 37823933  T
Q  95 acaaaatctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaactcat 180  Q
    || ||||||| ||  |||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37823932 accaaatctgcaatcattagatctctccaacaacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaaactcat 37823847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 37533237 - 37533148
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattcc 90  Q
    |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37533237 tcaacattaatagcaatgttgactccatcttacccaaccttgttgacttagaattatctaatgctaatattaatagttttcctaaattcc 37533148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37640009 - 37639828
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagc------ 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |||          
T  37640009 tcaacattgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttgaatcattatatttatcttctgctaatattaaaagttttcccaaattcctagcacgagt 37639910  T
Q  95 acaaaatctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaac 176  Q
    ||| ||| || || | ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37639909 acataatttgcaatggttagatctctccaataacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaaac 37639828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 244
Target Start/End: Original strand, 37393187 - 37393245
Alignment:
Q  186 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttatat 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37393187 aacaacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgcaatgctagttccctttatat 37393245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37696580 - 37696523
Alignment:
Q  186 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttata 243  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37696580 aacaacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttata 37696523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37639593 - 37639537
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttatatg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37639593 aacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatg 37639537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37823751 - 37823695
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttatatg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37823751 aacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatg 37823695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Original strand, 37401176 - 37401226
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctt 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37401176 aacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctt 37401226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37594186 - 37594132
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttata 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37594186 aacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttata 37594132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 242
Target Start/End: Original strand, 37401311 - 37401364
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttat 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37401311 aacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttat 37401364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37711351 - 37711298
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttat 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37711351 aacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttat 37711298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37702533 - 37702478
Alignment:
Q  186 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttcccttta 241  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702533 aacaacaacttcacaggaaatatctcttcaacattctgcaatgcaagttcccttta 37702478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37532947 - 37532902
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagtt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532947 aacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgcaatgcaagtt 37532902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37639728 - 37639674
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttata 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37639728 aacaacttcacaggaaatatttcttcaacattccgcaacgcaagttccctttata 37639674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37711486 - 37711432
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttata 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37711486 aacaacttcacaggaaatatttcttcaacattccgcaacgcaagttccctttata 37711432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37594054 - 37594006
Alignment:
Q  186 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagtt 234  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37594054 aacaacaatttcacaggagatatatcttcaacattctgcaatgcaagtt 37594006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37696445 - 37696397
Alignment:
Q  186 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagtt 234  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37696445 aacaacaatttcacaggagatatatcttcaacattctgcaatgcaagtt 37696397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 37382358 - 37382459
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagcacaaaa 100  Q
    |||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  37382358 tcaatattgaaagcagagttgactccatcttacccaaccttgggatattatatttatcttctagtaatattagtagttttcctaaattcttagcacaaaa 37382457  T
Q  101 tc 102  Q
    ||    
T  37382458 tc 37382459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 37413279 - 37413363
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaa 85  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||     ||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  37413279 tcaacattggtagcagtgttgactccatctcacccaaccttgaatcattatatttatcttctagtaatattaatagttttcctaa 37413363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 285 - 475
Target Start/End: Original strand, 16843438 - 16843628
Alignment:
Q  285 ttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaag 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16843438 ttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctaaaaccttttccaaaggaaatgcatttcagactataaagttgaatggaaaccaattggaag 16843537  T
Q  385 gaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtgacaacagcatagaggatacatttcccaattggct 475  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16843538 gaccattaccacagtctttgtctcactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggatacatttcccagttggct 16843628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 478
Target Start/End: Original strand, 24218133 - 24218366
Alignment:
Q  245 gattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaaat 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  ||||||||    
T  24218133 gattccacaatgcctgggaacatttccttatctttctgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcatgcctaaaacattttcggaaggaaat 24218232  T
Q  345 gcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaaggaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtgaca 444  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||  || | |||||||| || |||||||| ||||    
T  24218233 gcattcgagactataaagttgaatggcaaccaattggagggaccattaccacagtctttggctcactgcacacaacttgaagttttggaccttggagaca 24218332  T
Q  445 acagcatagaggatacatttcccaattggctaga 478  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  24218333 acatcataaacgatacatttcccaattggttaga 24218366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 285 - 475
Target Start/End: Original strand, 16846106 - 16846296
Alignment:
Q  285 ttggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaag 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16846106 ttggatatgcaaatgaacaacctctttggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgtgtttgtcactataaagttgaatggcaaccaattggaag 16846205  T
Q  385 gaccactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtgacaacagcatagaggatacatttcccaattggct 475  Q
    ||||| |||||| ||| || ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16846206 gaccattaccacggtctttagctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggatacatttcccagttggct 16846296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 16842899 - 16843074
Alignment:
Q  1 tcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatcttatgctaatattaatagtttccctaaattccaagcacaaaa 100  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  16842899 tcaacactgatagcattgctgactccatcttacccaaccttttttcattagatttatcttatgctaatattaatagttttcctaaattccaaacacgaaa 16842998  T
Q  101 tctgaaaagattatatctatccaataacaaaattcatggggaaatccttaaatggtttcaaaagaggctcttaaac 176  Q
    |||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16842999 tcttcaaagattagatctctccaataacaacattcatggtaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaaac 16843074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 16843171 - 16843219
Alignment:
Q  186 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagtt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16843171 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagtt 16843219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Original strand, 16843309 - 16843359
Alignment:
Q  189 aacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctt 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16843309 aacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgcaatgcaagtaccctt 16843359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 16845970 - 16846018
Alignment:
Q  186 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagtt 234  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  16845970 aacaacaacttcacagaagatatgtcttccacattctgcagtgcaagtt 16846018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 24218041 - 24218093
Alignment:
Q  186 aacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagttccct 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   || | |||||||||||||||||    
T  24218041 aacaacaacttcacaggagacattgctttgtcactgtgcaatgcaagttccct 24218093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University