View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19334_low_2 (Length: 565)

Name: NF19334_low_2
Description: NF19334
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19334_low_2
NF19334_low_2
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (1-565)||(33810460-33811024)
chr5 (1-565)||(33815378-33815942)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (1-565)||(4836439-4837003)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (1-565)||(54968105-54968669)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-565)||(1478-2042)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (1-453)||(22982034-22982486)
chr6 (1-453)||(23805922-23806374)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (89-560)||(25004185-25004652)
chr4 (1-87)||(25003704-25003790)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 521; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 33811024 - 33810460
Alignment:
Q  1 aatagagaacataactttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtactctgc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33811024 aatagagaacataaatttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacagccttcagtgattgcgatgtactctgc 33810925  T
Q  101 ttctgtggtacttaaagcaacgcatttttgtagtcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810924 ttctgtggtacttaaagcaacgcacttttgtagtcgagattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 33810825  T
Q  201 tctacatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacttca 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33810824 tctatatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacctca 33810725  T
Q  301 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatatactcacgactcctactacataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810724 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatctactcacgactcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 33810625  T
Q  401 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctctcggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810624 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctcttgatcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 33810525  T
Q  501 tgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33810524 tgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 33810460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 33815942 - 33815378
Alignment:
Q  1 aatagagaacataactttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtactctgc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33815942 aatagagaacataaatttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacagccttcagtgattgcgatgtactctgc 33815843  T
Q  101 ttctgtggtacttaaagcaacgcatttttgtagtcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815842 ttctgtggtacttaaagcaacgcacttttgtagtcgagattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 33815743  T
Q  201 tctacatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacttca 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33815742 tctatatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacctca 33815643  T
Q  301 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatatactcacgactcctactacataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815642 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatctactcacgactcctacagcataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 33815543  T
Q  401 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctctcggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815542 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctcttgatcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 33815443  T
Q  501 tgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815442 tgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 33815378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 565
Target Start/End: Original strand, 4836439 - 4837003
Alignment:
Q  1 aatagagaacataactttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtactctgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4836439 aatagagaacataactttcttgattctggcataactcttgtagaaacttcttcatccataggatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtattcagc 4836538  T
Q  101 ttctgtggtacttaaagcaacgcatttttgtagtcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 200  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4836539 ttccgtggtactcaaagcaatgcacttttgtaatcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccggatgtagattttcttgaa 4836638  T
Q  201 tctacatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacttca 300  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||   ||||||||||| |||| |||    
T  4836639 tccacatctccggccatatcagtatctacatatccagcgagcatttgatttcccttgccaaaacataaacatttttttaaagttccttttatatacctca 4836738  T
Q  301 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatatactcacgactcctactacataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4836739 gtatccatttcacagcactccagtgttcctttcctgggtttgataggaatctactcacgactcctacaacataaccgatgtctggcctcgtgtagaccat 4836838  T
Q  401 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctctcggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4836839 ggcgtacataaggctacccacagctgaagaatagggaaccttgctcatttcttctttctcttggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 4836938  T
Q  501 tgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 565  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4836939 tgaccaggtagtggaacatgcataggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 4837003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 565
Target Start/End: Original strand, 54968105 - 54968669
Alignment:
Q  1 aatagagaacataactttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtactctgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  54968105 aatagagaacataactttcttgactttggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacaggatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtattcagc 54968204  T
Q  101 ttctgtggtacttaaagcaacgcatttttgtagtcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  54968205 ttctgtggtactcaaagcaatgcacttttgtaatcgtgattgccatgaaacagctccccctgcaaaagtgatcaaatatccggaagtagattttctggaa 54968304  T
Q  201 tctacatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacttca 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||| |||||||||| |  || || | ||||||||||||| |||||||| |||    
T  54968305 tctacatctcctgccatatctgcatctacatgcccaatgagtaattgattttcattgccaaagcgcaaacattgtttggcagttcctcttagatacctca 54968404  T
Q  301 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatatactcacgactcctactacataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 400  Q
     |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| |||||    
T  54968405 atatccatttcacagcattccaatgctcttttcctggattcgacaggaatctactcacaactcctaccgcataagcaatgtctggtcttgtgcaaaccat 54968504  T
Q  401 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctctcggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 500  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54968505 tgcgtacataaggctacccacagctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctcttggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 54968604  T
Q  501 tgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 565  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54968605 tgaccaggtagtggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 54968669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 2042 - 1478
Alignment:
Q  1 aatagagaacataactttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtactctgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  2042 aatagagaacatagctttcttgattttggcctaactcttgtaggaacttcttcatccataggatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtattcagc 1943  T
Q  101 ttctgtggtacttaaagcaacgcatttttgtagtcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 200  Q
    ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  1942 tttcgtggtactcaaagcaatgcacttttgtaatcgtgattgccatgaaacagctccccctgcaaaagtgatcaaatatccggaagtagattttctggaa 1843  T
Q  201 tctacatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacttca 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||| |||||||||| |  || || | ||||||||||||| |||||||| |||    
T  1842 tctacatctcctgccatatctgcatctacatgcccaatgagtaattgattttcattgccaaagctcaaacattgtttggcagttcctcttagatacctca 1743  T
Q  301 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatatactcacgactcctactacataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 400  Q
     ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||  ||||| | |||||||| || ||||| |||||    
T  1742 atatccatttcacatcattccaatgctcttttcctggattcgacaggaatctactcacaactcctaccgcataagcaatgtctggtcttgtgcaaaccat 1643  T
Q  401 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctctcggtcattctcaggacattgtgtcttactgagtttcaaa 500  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1642 tgcgtacataaggcttcccacagctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctcttggtcattctcaggacattgtgtcttattgagtttcaaa 1543  T
Q  501 tgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 565  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1542 tgaccaggtagtggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaactttctt 1478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Original strand, 22982034 - 22982486
Alignment:
Q  1 aatagagaacataactttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtactctgc 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  22982034 aatagagaacatagcttttttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatgatctccttacaaccttcagtgattgtgatgtattcagc 22982133  T
Q  101 ttctgtggtacttaaagcaacgcatttttgtagtcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||    
T  22982134 ttctatggtactcaaagcaacgcatttttgtagtcgtgattgccaagagatagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccttaagtcgattttctggaa 22982233  T
Q  201 tctacatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacttca 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||| | ||||||| |||||||||| || || || | ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  22982234 tctacatctcctgccatatctgcatctacatgcgcaatgagtaattgattttcattgccaaagcacaaacattgtttggcaattcctcttagatacctca 22982333  T
Q  301 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatatactcacgactcctactacataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||| || |||| || |  ||| ||||||| | ||||||  ||||| | |||||||| || ||||| ||||     
T  22982334 gtatccatttcacagcattccaatgctccttttctagattcgacaataatctactcacaattcctaccgcataagcaatgtctggtcttgtgcaaaccaa 22982433  T
Q  401 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttctt 453  Q
     ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22982434 tgcgtacataaggctacccacaacagaagaatagggcaccttgctcatttctt 22982486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23806374 - 23805922
Alignment:
Q  1 aatagagaacataactttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacaaccttcagtgattgcgatgtactctgc 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  23806374 aatagagaacatagcttttttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatgatctccttacaaccttcagtgattgtgatgtattcagc 23806275  T
Q  101 ttctgtggtacttaaagcaacgcatttttgtagtcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgtagattttcttgaa 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||    
T  23806274 ttctatggtactcaaagcaacgcatttttgtagtcgtgattgccaagagatagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccttaagtcgattttctggaa 23806175  T
Q  201 tctacatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgccaaaacataagcactttttggcagttccttttagatacttca 300  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||| | ||||||| |||||||||| || || || | ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  23806174 tctacatctcctgccatatctgcatctacatgcgcaatgagtaattgattttcattgccaaagcacaaacattgtttggcaattcctcttagatacctca 23806075  T
Q  301 gtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatatactcacgactcctactacataaccgatgtctggcctcgtgcagaccat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||| || |||| || |  ||| ||||||| | ||||||  ||||| | |||||||| || ||||| ||||     
T  23806074 gtatccatttcacagcattccaatgctccttttctagattcgacaataatctactcacaattcctaccgcataagcaatgtctggtcttgtgcaaaccaa 23805975  T
Q  401 ggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttctt 453  Q
     ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23805974 tgcgtacataaggctacccacaacagaagaatagggcaccttgctcatttctt 23805922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 560
Target Start/End: Original strand, 25004185 - 25004652
Alignment:
Q  89 gatgtactctgcttctgtggtacttaaagcaacgcatttttgtagtcgcgattgccatgagacagctccccctgcaaaagtaatcaaatatccagatgta 188  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||   |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  25004185 gatgtattatgcttctgtggtacttaaagcaacacacttttgtagtcatgacatccatgagacaactccacctgtaaaagtaatcaaatatccaaatgca 25004284  T
Q  189 gattttcttgaatctacatctccggccatatcagcatctacatatccaacgagcatttgatttccattgcc-aaaacataagcactttttggcagttcct 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25004285 gatttccttgaatctacatctcccgccatatcaacttctacatatccaacaagaatttgatctccattgccaaaaacataagcactttttgcctgttcct 25004384  T
Q  288 tttagatacttcagtatccatttcacagcactccagtgttcttttcctggatttgataggaatatactcacgactcctactacataaccgatgtctggcc 387  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || | || |||  |||| ||||||  || ||||| |||||| |||| | ||| |    
T  25004385 tttagatacctcagtatccatttcatagcactctagtgttcattttctaggttcgatttgaatctactcaaaac-cctacaacataatcgat-tatggtc 25004482  T
Q  388 tcgtgcagaccatggcgtacataaggctacccacggctgaagaatagggcaccttgctcatttcttctttctctcggtcattctcaggacattgtgtctt 487  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||  |||||||| |||| | ||  | |||||||||||| ||| ||||||  || | | ||  | ||||    
T  25004483 tcgtgcaaaccatgacatacgtaagactatccacaactgaagaagagggaaactaacccatttcttctttttcttggtcat--tccgtagatattatctt 25004580  T
Q  488 actgagtttcaaatgaccaggtaatggaacatgcacaggttttgcattatgcatgttgaacctttcaagaact 560  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  25004581 actaagtttcaaatgacca-gtagtggaacatgcacaagtggtgtattttgcacgttgaacatttcaaaaact 25004652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 25003704 - 25003790
Alignment:
Q  1 aatagagaacataactttcttgattctggcctaactcttgcaggaacttcttcatccacatcatctccttacaaccttcagtgattg 87  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||    
T  25003704 aatagggaacataactttgttgattcaggcctgactcttgcatgaacttcttcatccacgggatctccttacaaccgttagtgattg 25003790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University