View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19341_high_11 (Length: 371)

Name: NF19341_high_11
Description: NF19341
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19341_high_11
NF19341_high_11
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (28-349)||(2041-2362)
scaffold0234 (28-349)||(10932-11253)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (28-349)||(17684189-17684510)
chr6 (28-349)||(27380972-27381293)
chr6 (28-349)||(27471355-27471676)
chr6 (28-349)||(11651889-11652210)
chr6 (28-349)||(17691160-17691481)
chr6 (28-349)||(29309056-29309377)
chr6 (28-349)||(29316016-29316336)
chr6 (28-349)||(188697-189018)
chr6 (28-301)||(16394165-16394438)
chr6 (28-267)||(27296877-27297116)
chr6 (32-269)||(25536915-25537152)
chr6 (29-250)||(16559193-16559414)
chr6 (45-353)||(13359010-13359314)
chr6 (245-349)||(16566257-16566361)
chr6 (38-332)||(2669476-2669768)
chr6 (28-335)||(16789071-16789373)
chr6 (28-335)||(22859888-22860190)
chr6 (28-335)||(27508347-27508649)
chr6 (28-335)||(1586108-1586410)
chr6 (42-335)||(27527947-27528235)
chr6 (28-335)||(14074480-14074782)
chr6 (72-335)||(18019885-18020143)
chr6 (212-317)||(28172754-28172859)
chr6 (50-343)||(10359073-10359359)
chr6 (207-334)||(27925935-27926061)
chr6 (28-335)||(8612915-8613221)
chr6 (206-343)||(20553487-20553622)
chr6 (131-334)||(17850321-17850521)
chr6 (113-265)||(20736413-20736562)
chr6 (297-349)||(25537148-25537200)
chr6 (28-141)||(33317055-33317167)
chr6 (28-267)||(17120505-17120740)
chr6 (244-335)||(13995155-13995245)
chr6 (115-169)||(28172899-28172954)
chr6 (97-189)||(8510246-8510338)
chr6 (125-267)||(21994655-21994794)
chr6 (45-184)||(28756145-28756283)
chr6 (232-337)||(19218427-19218531)
chr6 (200-321)||(19347092-19347212)
chr6 (156-336)||(22560311-22560487)
chr6 (299-335)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (28-349)||(18262378-18262699)
chr4 (28-349)||(18269239-18269560)
chr4 (28-349)||(55612849-55613170)
chr4 (28-349)||(26963806-26964127)
chr4 (28-349)||(26970629-26970950)
chr4 (28-349)||(868763-869084)
chr4 (28-349)||(19926480-19926801)
chr4 (28-349)||(5707486-5707807)
chr4 (28-349)||(5714114-5714435)
chr4 (28-349)||(8858333-8858654)
chr4 (28-349)||(10621053-10621374)
chr4 (28-343)||(10628132-10628447)
chr4 (28-349)||(28392854-28393175)
chr4 (28-349)||(8845369-8845690)
chr4 (28-349)||(4426336-4426645)
chr4 (28-343)||(35223732-35224047)
chr4 (28-339)||(5667849-5668156)
chr4 (24-349)||(20311458-20311781)
chr4 (28-260)||(10677303-10677534)
chr4 (28-260)||(10890943-10891174)
chr4 (28-335)||(15461497-15461799)
chr4 (28-335)||(34975551-34975853)
chr4 (28-335)||(2677013-2677315)
chr4 (28-335)||(15815021-15815323)
chr4 (28-335)||(18111043-18111345)
chr4 (28-335)||(3369023-3369325)
chr4 (28-335)||(17299959-17300261)
chr4 (226-339)||(56516232-56516345)
chr4 (28-335)||(18163162-18163464)
chr4 (28-335)||(20243937-20244239)
chr4 (28-335)||(26531613-26531915)
chr4 (28-335)||(4675983-4676285)
chr4 (129-279)||(21453961-21454110)
chr4 (28-334)||(5870419-5870720)
chr4 (44-335)||(19365519-19365806)
chr4 (28-335)||(1941724-1942026)
chr4 (28-314)||(32646523-32646807)
chr4 (45-267)||(19362477-19362695)
chr4 (253-331)||(24700213-24700291)
chr4 (44-267)||(5528495-5528714)
chr4 (44-335)||(32636484-32636769)
chr4 (28-260)||(9487625-9487853)
chr4 (44-343)||(5616387-5616681)
chr4 (28-248)||(30040489-30040705)
chr4 (44-260)||(9538033-9538244)
chr4 (56-137)||(9937745-9937826)
chr4 (291-343)||(10677538-10677590)
chr4 (291-343)||(10891178-10891230)
chr4 (113-156)||(24701361-24701404)
chr4 (277-347)||(9937933-9938003)
chr4 (125-190)||(33888678-33888743)
chr4 (207-288)||(34777894-34777975)
chr4 (299-335)||(11421016-11421052)
chr4 (299-343)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (28-349)||(6110230-6110551)
chr3 (28-349)||(16482203-16482524)
chr3 (28-349)||(10579075-10579396)
chr3 (28-349)||(15600604-15600925)
chr3 (28-349)||(15607149-15607470)
chr3 (28-349)||(10572312-10572633)
chr3 (28-349)||(15341939-15342260)
chr3 (28-349)||(18520141-18520462)
chr3 (28-334)||(8490676-8490982)
chr3 (32-342)||(18522836-18523146)
chr3 (28-349)||(15357306-15357627)
chr3 (28-349)||(17780838-17781159)
chr3 (28-349)||(13211468-13211789)
chr3 (28-343)||(13248779-13249094)
chr3 (28-349)||(32056619-32056941)
chr3 (24-349)||(17199900-17200225)
chr3 (28-349)||(13516977-13517294)
chr3 (28-343)||(1647241-1647556)
chr3 (28-349)||(17136525-17136840)
chr3 (28-349)||(29925137-29925458)
chr3 (28-349)||(29974290-29974611)
chr3 (28-318)||(16200627-16200917)
chr3 (28-335)||(21034238-21034540)
chr3 (28-335)||(15846536-15846838)
chr3 (28-335)||(20147554-20147856)
chr3 (46-343)||(24253130-24253423)
chr3 (28-335)||(21398792-21399094)
chr3 (28-335)||(14890391-14890693)
chr3 (28-335)||(55427021-55427323)
chr3 (28-335)||(12299911-12300212)
chr3 (28-267)||(25978728-25978963)
chr3 (126-343)||(14147013-14147226)
chr3 (62-260)||(15526827-15527021)
chr3 (28-186)||(28088251-28088408)
chr3 (28-267)||(11787654-11787889)
chr3 (297-349)||(19089734-19089786)
chr3 (250-343)||(9504455-9504548)
chr3 (167-296)||(28953965-28954093)
chr3 (276-349)||(16200291-16200363)
chr3 (113-181)||(30464147-30464215)
chr3 (28-332)||(15317176-15317472)
chr3 (102-294)||(32280313-32280507)
chr3 (125-189)||(36138033-36138097)
chr3 (125-189)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (28-349)||(18252196-18252517)
chr1 (28-349)||(18532234-18532555)
chr1 (28-349)||(27131130-27131450)
chr1 (28-349)||(27310297-27310618)
chr1 (28-349)||(16358755-16359076)
chr1 (28-343)||(3855639-3855954)
chr1 (28-343)||(36816354-36816668)
chr1 (28-309)||(22641594-22641871)
chr1 (28-343)||(27277278-27277592)
chr1 (156-349)||(21171081-21171274)
chr1 (28-319)||(23507096-23507385)
chr1 (28-335)||(19706439-19706741)
chr1 (28-335)||(43802365-43802667)
chr1 (195-349)||(22657108-22657262)
chr1 (28-221)||(9916497-9916689)
chr1 (28-335)||(28134723-28135025)
chr1 (113-343)||(12014091-12014319)
chr1 (28-335)||(9456116-9456418)
chr1 (28-335)||(20391239-20391541)
chr1 (28-335)||(20779645-20779947)
chr1 (28-335)||(22670257-22670559)
chr1 (28-335)||(42816989-42817291)
chr1 (226-342)||(9917837-9917952)
chr1 (28-335)||(22612492-22612794)
chr1 (48-344)||(633925-634216)
chr1 (28-335)||(8727667-8727969)
chr1 (28-335)||(47667485-47667776)
chr1 (230-319)||(12006461-12006550)
chr1 (28-141)||(28145723-28145835)
chr1 (226-335)||(35930582-35930690)
chr1 (115-267)||(29096789-29096938)
chr1 (204-260)||(51997353-51997409)
chr1 (115-189)||(24301691-24301765)
chr1 (128-260)||(21881475-21881604)
chr1 (130-189)||(10852402-10852461)
chr1 (113-175)||(12006350-12006413)
chr1 (201-327)||(26923553-26923678)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (29-349)||(21940831-21941151)
chr8 (28-349)||(22171653-22171974)
chr8 (28-349)||(6094289-6094610)
chr8 (28-349)||(24642815-24643135)
chr8 (28-291)||(15326422-15326685)
chr8 (28-291)||(15506791-15507054)
chr8 (28-169)||(28548393-28548534)
chr8 (95-338)||(14983710-14983950)
chr8 (143-340)||(24797224-24797419)
chr8 (28-343)||(8371253-8371563)
chr8 (28-335)||(21969333-21969635)
chr8 (28-335)||(12562123-12562425)
chr8 (28-335)||(27007517-27007819)
chr8 (28-335)||(27014660-27014962)
chr8 (28-335)||(27880487-27880789)
chr8 (28-335)||(28020668-28020970)
chr8 (44-343)||(38232115-38232412)
chr8 (28-335)||(22130609-22130911)
chr8 (28-335)||(25611195-25611497)
chr8 (28-334)||(22659494-22659795)
chr8 (28-335)||(21916676-21916978)
chr8 (28-335)||(45534273-45534575)
chr8 (125-343)||(18835342-18835556)
chr8 (28-335)||(26240484-26240786)
chr8 (208-347)||(32872741-32872880)
chr8 (28-267)||(6430953-6431188)
chr8 (113-259)||(8781959-8782102)
chr8 (226-312)||(2375214-2375300)
chr8 (38-135)||(24796731-24796826)
chr8 (44-190)||(20535226-20535371)
chr8 (28-186)||(2962932-2963089)
chr8 (23-141)||(36970439-36970556)
chr8 (24-141)||(2375411-2375528)
chr8 (261-316)||(24535514-24535569)
chr8 (314-349)||(28555049-28555084)
chr8 (228-335)||(36970265-36970371)
chr8 (115-177)||(29645675-29645737)
chr8 (28-89)||(8968015-8968076)
chr8 (236-288)||(10920427-10920479)
chr8 (40-88)||(41368106-41368154)
chr8 (40-88)||(41375077-41375125)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (28-343)||(24695186-24695501)
chr5 (28-349)||(19714218-19714539)
chr5 (28-349)||(19706939-19707259)
chr5 (28-349)||(18569581-18569904)
chr5 (28-319)||(17298621-17298912)
chr5 (150-349)||(39538754-39538953)
chr5 (95-343)||(18806823-18807069)
chr5 (28-319)||(17285470-17285759)
chr5 (24-190)||(27347252-27347417)
chr5 (28-135)||(24701950-24702057)
chr5 (28-335)||(20941027-20941329)
chr5 (28-335)||(25805385-25805687)
chr5 (207-338)||(22546915-22547046)
chr5 (28-335)||(31899-32201)
chr5 (28-335)||(12789663-12789965)
chr5 (28-335)||(22941250-22941552)
chr5 (28-335)||(23545922-23546224)
chr5 (28-335)||(24933306-24933608)
chr5 (40-333)||(20100255-20100543)
chr5 (28-335)||(31096816-31097118)
chr5 (28-335)||(12764990-12765296)
chr5 (28-335)||(5097651-5097953)
chr5 (255-343)||(27347425-27347513)
chr5 (28-335)||(7865430-7865736)
chr5 (95-186)||(18806463-18806555)
chr5 (95-186)||(18806643-18806735)
chr5 (24-110)||(28719471-28719555)
chr5 (28-335)||(9811733-9812039)
chr5 (28-335)||(12703874-12704180)
chr5 (28-277)||(18829281-18829530)
chr5 (28-109)||(39538954-39539035)
chr5 (28-335)||(26245102-26245404)
chr5 (24-267)||(26129689-26129928)
chr5 (290-334)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (28-349)||(7273-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (28-349)||(6654-6975)
scaffold0390 (28-349)||(13670-13991)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (32-349)||(15152609-15152926)
chr7 (28-349)||(29327950-29328271)
chr7 (28-349)||(11535782-11536103)
chr7 (28-349)||(11542700-11543021)
chr7 (28-354)||(12750987-12751313)
chr7 (28-349)||(12738702-12739023)
chr7 (28-349)||(18561173-18561485)
chr7 (28-339)||(13392326-13392637)
chr7 (22-340)||(18257559-18257874)
chr7 (28-335)||(2204552-2204854)
chr7 (28-335)||(8464999-8465301)
chr7 (28-335)||(18400104-18400406)
chr7 (28-335)||(18407088-18407390)
chr7 (28-335)||(48808496-48808798)
chr7 (28-335)||(15729751-15730053)
chr7 (28-335)||(18139338-18139640)
chr7 (28-335)||(19230888-19231190)
chr7 (40-335)||(30254138-30254428)
chr7 (28-268)||(2365169-2365407)
chr7 (28-267)||(41680968-41681203)
chr7 (28-335)||(10668901-10669204)
chr7 (40-335)||(47166871-47167161)
chr7 (226-316)||(10235361-10235451)
chr7 (113-343)||(19388544-19388774)
chr7 (50-334)||(24443349-24443628)
chr7 (28-260)||(34128647-34128875)
chr7 (294-349)||(15148308-15148363)
chr7 (28-335)||(28130561-28130863)
chr7 (250-334)||(47833899-47833983)
chr7 (66-335)||(19393462-19393726)
chr7 (235-344)||(19859113-19859221)
chr7 (50-337)||(25845498-25845780)
chr7 (50-337)||(25845917-25846199)
chr7 (257-343)||(7396361-7396450)
chr7 (212-330)||(7662569-7662686)
chr7 (28-186)||(18259124-18259281)
chr7 (202-340)||(3132849-3132986)
chr7 (125-260)||(14591924-14592056)
chr7 (125-260)||(16011515-16011647)
chr7 (113-177)||(22948510-22948574)
chr7 (114-253)||(31190524-31190660)
chr7 (128-260)||(22969024-22969153)
chr7 (39-338)||(39111989-39112275)
chr7 (246-301)||(29983179-29983234)
chr7 (297-339)||(2365070-2365112)
chr7 (212-270)||(7396469-7396527)
chr7 (118-182)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (28-349)||(18454-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (24-349)||(25706-26031)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (28-349)||(21329968-21330289)
chr2 (28-349)||(18796672-18796993)
chr2 (22-343)||(18619976-18620296)
chr2 (28-343)||(36270338-36270650)
chr2 (28-343)||(22183206-22183518)
chr2 (28-299)||(20978091-20978360)
chr2 (42-340)||(6991847-6992146)
chr2 (40-349)||(18822249-18822556)
chr2 (28-335)||(30174377-30174679)
chr2 (28-335)||(24250032-24250334)
chr2 (28-335)||(24229215-24229517)
chr2 (210-343)||(19279460-19279593)
chr2 (226-334)||(18851977-18852085)
chr2 (40-267)||(15342014-15342237)
chr2 (28-191)||(17241034-17241196)
chr2 (26-334)||(29800468-29800775)
chr2 (226-329)||(36801899-36802003)
chr2 (113-335)||(19616435-19616653)
chr2 (28-95)||(41661694-41661761)
chr2 (95-175)||(36799745-36799826)
chr2 (113-189)||(28740910-28740986)
chr2 (226-333)||(28741220-28741326)
chr2 (126-189)||(40301034-40301097)
chr2 (125-190)||(21626890-21626955)
chr2 (53-190)||(41316305-41316441)
chr2 (299-339)||(12098609-12098649)
chr2 (207-264)||(28718949-28719006)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (47-349)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (24-349)||(5695-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (28-284)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (28-335)||(183-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (28-335)||(3675-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (28-335)||(119730-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (40-335)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (66-335)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-335)||(67374-67676)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (125-335)||(8305-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-335)||(39988-40290)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (28-267)||(26609-26844)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (226-343)||(90033-90151)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (56-343)||(8723-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (28-218)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (28-186)||(11526-11683)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (125-260)||(83111-83243)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (235-337)||(92345-92447)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (28-141)||(53955-54066)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (299-343)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2362
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 2340  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  2341 atagtctctatgctttaatgat 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11253
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11231  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11232 atagtctctatgctttaatgat 11253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684510
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17684488  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17684489 atagtctctatgctttaatgat 17684510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381293
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27381271  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27381272 atagtctctatgctttaatgat 27381293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471676
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27471654  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27471655 atagtctctatgctttaatgat 27471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651889
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 11651911  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11651910 atagtctctatgctttaatgat 11651889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691481
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17691459  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  17691460 atagtctttatgctttaatgat 17691481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309056
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29309078  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29309077 atagtctctatgctttaatgat 29309056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316016
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29316038  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29316037 atagtctctatgctttaatgat 29316016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 188697 - 189018
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 188996  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  188997 atagtctctatgctttaatgat 189018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394438
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296877
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 269
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  232 caatataaatactactcctaatatttatatctatgtga 269  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  29 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatca 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  229 atccaatataaatactactcct 250  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 353
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359314
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  145 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatac 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||  ||| | | |||||||  |||||  |   |||| ||||||||||||    
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataa--ttttcaatgtagtat--tcatggtgagacaattcaatataaatac 13359204  T
Q  244 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  13359205 tacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgcttt 13359304  T
Q  344 gatgatgtcc 353  Q
     ||| |||||    
T  13359305 aatgttgtcc 13359314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 349
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566361
Alignment:
Q  245 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  345 atgat 349  Q
    |||||    
T  16566357 atgat 16566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669476
Alignment:
Q  38 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttca 137  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||  |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  138 ggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaata 236  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  ||| |||||||| |||||| |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  237 taaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagatgtgatcatcaatctacccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789071
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16789177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 16789079  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  16789078 atagtctc 16789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860190
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || || | ||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 22859986  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22860084 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22860182  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  22860183 atagtctc 22860190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508649
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27508543 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27508641  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    | ||||||    
T  27508642 acagtctc 27508649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586410
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 1586206  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  1586304 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 1586402  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  1586403 atagtctc 1586410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 335
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528235
Alignment:
Q  42 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  142 gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 241  Q
     ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||    || ||||||||||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T
Q  242 actactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27528143 attactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctc 27528235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074480
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 14074684  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14074586 aatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14074488  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  14074487 atagtctc 14074480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 335
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020143
Alignment:
Q  72 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatga 171  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  172 gaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaag 271  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18019984 gaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatag 18020080  T
Q  272 acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18020081 acttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 18020143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172754
Alignment:
Q  212 attctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 311  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  312 tcagtc 317  Q
    ||||||    
T  28172759 tcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 343
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359359
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| || | |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcc 249  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||   ||||| |||||||| ||| |  || || ||||| |||||||| |||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  250 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  10359268 taatatttatatctatgtatagacttaatatctc-acattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatatataatagtctctacgcttt 10359359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27926061 - 27925935
Alignment:
Q  207 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgt 306  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  27926061 gtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatga 27925963  T
Q  307 gatcatcagtctacctacataatagtct 334  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||    
T  27925962 gatcatcagtttatccacataatagtct 27925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612915
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || || | |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   ||||| |  |||| |||||||||||| |  ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8613024 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8612926  T
Q  325 ataatagtctc 335  Q
    |||||||||||    
T  8612925 ataatagtctc 8612915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 343
Target Start/End: Original strand, 20553487 - 20553622
Alignment:
Q  206 cgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 305  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  20553487 cgtaatattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatg 20553584  T
Q  306 tgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  20553585 tgatcatcagtctaccaacataaaaatctttatgcttt 20553622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 334
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850521
Alignment:
Q  131 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-tataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaa 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||   || |||     | | |||||||||| | |  || ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatacttacataaaacc----caatgtagtattcttaaggagggtcaa 17850416  T
Q  230 tccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 329  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  17850417 tccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataat 17850516  T
Q  330 agtct 334  Q
    |||||    
T  17850517 agtct 17850521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 265
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736562
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagta 212  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |  | || ||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  213 ttctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctat 265  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 349
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537200
Alignment:
Q  297 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 25537200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||  ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtc-cacatctagggatcat 33317069  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120740
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||  |||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtc-cacatatagggatcat 17120603  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||  ||| |||||||    || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17120701 aatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 335
Target Start/End: Original strand, 13995155 - 13995245
Alignment:
Q  244 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13995155 tactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 13995245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28172954 - 28172899
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 169  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172954 atctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510246
Alignment:
Q  97 aaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacactt 8510246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||   |||||  |||||||||||||  ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  145 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 184  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19218531 - 19218427
Alignment:
Q  232 caatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 331  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||| | || ||||| |  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19218531 caatataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctcat-attcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatacataatag 19218433  T
Q  332 tctcta 337  Q
    ||||||    
T  19218432 tctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  200 ttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 299  Q
    |||||| |||||||||| ||| | | |||||||| || ||||| || || |||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  300 gagatgtgatcatcagtctacc 321  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 336
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  156 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatat 255  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||| |||||||    | ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  256 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 336  Q
    ||| | ||||||  | |||| ||| ||| | |||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctcat-atccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 335
Target Start/End: Original strand, 20736594 - 20736630
Alignment:
Q  299 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20736594 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 20736630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262378
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18262400  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18262399 atagtctctatgctttaatgat 18262378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269239
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18269261  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18269260 atagtctctatgctttaatgat 18269239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612849
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 55612871  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  55612870 atagtctctatgctttaatgat 55612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963806
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26963828  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26963827 atagtctctatgctttaatgat 26963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970629
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26970651  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26970650 atagtctctatgctttaatgat 26970629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868763
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 868785  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  868784 atagtctctatgctttaatgat 868763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926801
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 19926779  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19926780 atagtctctatgctttaatgat 19926801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707486
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5707508  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5707507 atagtctctatgctttaatgat 5707486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714114
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5714136  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5714135 atagtctctatgctttaatgat 5714114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858333
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8858355  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8858354 atagtctctatgctttaatgat 8858333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621374
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10621352  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10621353 atagtctctatgctttaatgat 10621374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628447
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10628431  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||||||||    
T  10628432 atagtctctatgcttt 10628447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393175
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 28393153  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  28393154 atagtctctatgctttaatgat 28393175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845369
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8845391  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8845390 atagtctctatgctttaatgat 8845369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426645
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 4426623  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4426624 atagtctctatgctttaatgat 4426645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223732
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctacccacata 35223748  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35223747 atagtctatatgcttt 35223732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 339
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668156
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgacc--aacatctagggtacat 5667946  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| | |||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatccacata 5668144  T
Q  328 atagtctctatg 339  Q
    ||||||||||||    
T  5668145 atagtctctatg 5668156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311458
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgac 222  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||   |||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgatagttac-ataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  223 ggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 322  Q
     | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||     
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctaccc 20311485  T
Q  323 acataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20311484 acaaaatagtctctatgctttaatgat 20311458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677534
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||   || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10677502 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891174
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||   || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10891142 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461497
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15461603 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15461505  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  15461504 atagtctc 15461497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975551
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 34975755  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  34975657 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 34975559  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  34975558 atagtctc 34975551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677013
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2677217  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  2677119 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2677021  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  2677020 atagtctc 2677013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815021
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15815225  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15815127 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15815029  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  15815028 atagtctc 15815021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111345
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18111141  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18111239 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18111337  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  18111338 atagtctc 18111345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369325
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcat 3369121  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3369219 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3369317  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  3369318 atagtctc 3369325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300261
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 17300057  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  17300155 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 17300253  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  17300254 atagtctc 17300261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 56516345 - 56516232
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  56516345 tcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgagatttgatcattaatctacctaca 56516246  T
Q  326 taatagtctctatg 339  Q
    ||||||||||||||    
T  56516245 taatagtctctatg 56516232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163162
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18163366  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18163268 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacata 18163170  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  18163169 atagtctc 18163162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20243937
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20244141  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20244043 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20243945  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  20243944 atagtctc 20243937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531613
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 26531817  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  26531719 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 26531621  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  26531620 atagtctc 26531613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676285
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 4676081  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  4676179 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 4676277  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  4676278 atagtctc 4676285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 279
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||  || || ||||||||||||||  || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  229 atccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 279  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870419
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || || | ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  5870524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 5870426  T
Q  328 atagtct 334  Q
    |||||||    
T  5870425 atagtct 5870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365519
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || || | |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 242  Q
    || |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||| |||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  243 ctactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
     ||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  ||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttatacctatgtatagatttaatatctc-atactcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacgtatataatagtctc 19365519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941724
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || ||  ||||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtc-cacatctagggatcat 1941928  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  |||||| |||||||||||| |  || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  1941830 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacata 1941732  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  1941731 atagtctc 1941724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646807
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||  | |  ||||| |||  || |||| ||||| |||   | |    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggt 32646719  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatca 314  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32646720 caatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatca 32646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | || | |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  145 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatact 244  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||| |||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  245 actcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  19362499 actcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  253 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528714
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || || | |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatac 243  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  | |||||||| ||||||||| |  || | ||| |||||||||||     
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  244 tactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  5528691 cactcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32636769 - 32636484
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||| ||||||  ||||||||||||||   | |||||||| || |||| | | |||||  |||| |||||||| ||||     
T  32636769 cccattaaccaacgttatggttatcatgttacaaacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcta-cgtatagggatcata-tggtttcacgtcgg 32636672  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatac 243  Q
    || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||     
T  32636671 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaatccaatataaatat 32636575  T
Q  244 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    ||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32636574 tactcataatatttatacctatgcatggacttaatatctc-gtattcatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 32636484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487625
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || || | |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||| |||||||||||| || || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9487657 tatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616387
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || || | |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatac 243  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||  |  |||  |||||||||||| |   | |||||||| ||||||||     
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacac-tttcataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  244 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||  | |||| | | |||  |||  |||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5616485 tacttctaatatttatacctacgtatatacttaacatctc-atatttatgacccatgagatgtggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgcttt 5616387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||||| |||||||  || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  228 aatccaatataaatactactc 248  Q
    |||| | |||||||| |||||    
T  30040685 aatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || ||  ||||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtc-cacatccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatac 243  Q
    ||  ||| | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||   | ||| |||||||||||| |  || |||||||| ||||||||     
T  9538145 agactgg-acacgccattatcattgtgagaatatcttatgacac-tttcataac--atgctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||| |||||||    
T  9538049 tactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  56 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttca 137  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 291 - 343
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677590
Alignment:
Q  291 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10677590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 291 - 343
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891230
Alignment:
Q  291 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10891230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24701404 - 24701361
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 156  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701404 acatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9938003
Alignment:
Q  277 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 347  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgcttcgatg 9938003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888678
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 190  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacacttt 33888678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 288
Target Start/End: Original strand, 34777894 - 34777975
Alignment:
Q  207 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 288  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| ||| | ||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777894 gtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttatacatatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11421052 - 11421016
Alignment:
Q  299 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11421052 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 11421016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Original strand, 30040740 - 30040784
Alignment:
Q  299 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30040740 tgagatgtggtcatcagtctatatacataatagtctcgatgcttt 30040784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110230
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6110252  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6110251 atagtctctatgctttaatgat 6110230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482524
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 16482502  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16482503 atagtctctatgctttaatgat 16482524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579396
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10579374  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10579375 atagtctctatgctttaatgat 10579396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600925
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15600903  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15600904 atagtctctatgctttaatgat 15600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607470
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15607448  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15607449 atagtctctatgctttaatgat 15607470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572633
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10572611  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10572612 atagtctctatgctttaatgat 10572633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342260
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15342238  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  15342239 atagtctctatgttttaatgat 15342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520141
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18520163  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18520162 atagtctctatgctttaatgat 18520141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490676
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 8490683  T
Q  328 atagtct 334  Q
    || ||||    
T  8490682 atcgtct 8490676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 32 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522836
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  232 caatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522946 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 18522847  T
Q  332 tctctatgctt 342  Q
    |||||||||||    
T  18522846 tctctatgctt 18522836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357627
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15357605  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  15357606 atagtctctatgttttaatgat 15357627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781159
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17781137  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17781138 atagtctctatgctttaatgat 17781159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211468
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13211490  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13211489 atagtctctatgctttaatgat 13211468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248779
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13248795  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||||||||    
T  13248794 atagtctctatgcttt 13248779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056941
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 326  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacat 32056918  T
Q  327 aatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  32056919 aatagtctctatgctttaatgat 32056941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200225
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  224 gatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 323  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccca 17200199  T
Q  324 cataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  17200200 cataatagtctctatgctttaatgat 17200225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13516977
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 13516999  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  13516998 atagtctctgtgctttaatgat 13516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647556
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 1647540  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||||||||    
T  1647541 atagtctctatgcttt 1647556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136525
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacata 17136547  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  17136546 atagtctctatgttttaatgat 17136525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925137
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |  || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29925159  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||| ||| ||||||| |||||    
T  29925158 atagcctccatgctttaatgat 29925137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974290
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |  || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29974312  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||| ||| ||||||| |||||    
T  29974311 atagcctccatgctttaatgat 29974290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200627
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||  || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtct 318  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtct 16200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034238
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21034442  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21034344 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21034246  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  21034245 atagtctc 21034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846838
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || || | |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15846732 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15846830  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  15846831 atagtctc 15846838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147856
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20147652  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20147750 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20147848  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  20147849 atagtctc 20147856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253423
Alignment:
Q  46 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 145  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaat 24253229  T
Q  146 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatacta 245  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||| | | ||||||||||  || |||| ||||||||||||  |    
T  24253230 g-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataa 24253325  T
Q  246 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253326 ctcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcattagtctaccgacataatagtctctatgcttt 24253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398792
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  21398898 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacata 21398800  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  21398799 atagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890391
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||| ||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14890497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14890399  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  14890398 atagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427021
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 55427225  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  55427127 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 55427029  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  55427028 atagtctc 55427021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299911
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || || | ||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcat 12300114  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12300016 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12299919  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  12299918 atagtctc 12299911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978963
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||  ||||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtc-cacatctagggatcat 25978826  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||| |||||||||||| |  || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978924 tatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147013
Alignment:
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacgga 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |  |||| |||| ||||||| | | |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 325  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||| | |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctcat-atccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  326 taatagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttt 14147013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  62 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || || | ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  162 atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||| ||| |   |||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088251
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || || | |||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcat 28088310  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 28088251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787654
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || | | | ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattat-agatctagggatcat 11787791  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  | | |||||  |||||| |||||||||||| |  || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatga-aaatatcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11787693 tatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 349
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089786
Alignment:
Q  297 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgat 19089786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504455
Alignment:
Q  250 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatccttt 9504455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  167 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatat-aaatactactcctaatatttatatctat 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  || ||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||| |||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  266 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200291
Alignment:
Q  276 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgat 16200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30464215 - 30464147
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatctta 181  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  30464215 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatcattatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317472
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || || | |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||   ||||| |||||||||||| |  || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  15317369 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcaatctacatacata 15317467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  102 actcgactctaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  198 ttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 294  Q
      | |||| ||| |||||||||   || |||| | | | |||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 189
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252196
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18252218  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18252217 atagtctctatgctttaatgat 18252196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532555
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctacata 18532533  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18532534 atagtctctatgctttaatgat 18532555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131450
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27131428  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  27131429 atagtctttatgctttaatgat 27131450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310618
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 27310596  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27310597 atagtctctatgctttaatgat 27310618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359076
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 16359054  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16359055 atagtctctatgctttaatgat 16359076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgta 3855938  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    |||||||| |||||||    
T  3855939 atagtctccatgcttt 3855954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816668
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 36816652  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||||||||    
T  36816653 atagtctctatgcttt 36816668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 309
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641871
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 309  Q
    |||| | |||||||| || ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277592
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | | |||||| |||  || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctacccacata 27277576  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||||||||    
T  27277577 atagtctctatgcttt 27277592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 156 - 349
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171274
Alignment:
Q  156 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  256 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgat 21171274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507096
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||| ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |     | ||  |||| ||||| |||  || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg---ctttttacacaacgttctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 319  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagtcta 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706741
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19706635 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19706733  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  19706734 atagtctc 19706741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802667
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  43802561 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 43802659  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  43802660 atagtctc 43802667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 349
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657262
Alignment:
Q  195 aacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 294  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  295 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgat 22657262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916689
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  128 agtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatga 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatga 9916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28135025
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28134919 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28135017  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    || |||||    
T  28135018 attgtctc 28135025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Original strand, 12014091 - 12014319
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagt 211  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||||| |  || | ||| |||      
T  12014091 acatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttctatgtaac 12014187  T
Q  212 attctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 311  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12014188 attctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagatgtgatca 12014287  T
Q  312 tcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| || |||||    
T  12014288 tcattctacccacataatggtctttacgcttt 12014319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456116
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 9456320  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  9456222 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 9456124  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  9456123 atagtctc 9456116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391541
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||  |||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtc-cacatctagagatcat 20391337  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||  |||||| ||||||||||||    || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20391435 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20391533  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  20391534 atagtctc 20391541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779947
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20779743  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20779841 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20779939  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  20779940 atagtctc 20779947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670559
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22670355  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22670453 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22670551  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  22670552 atagtctc 22670559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817291
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 42817087  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  42817185 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 42817283  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  42817284 atagtctc 42817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 342
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917952
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  326 taatagtctctatgctt 342  Q
    || || |||||||||||    
T  9917936 tagtattctctatgctt 9917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612492
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22612598 aatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22612500  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  22612499 atagtctc 22612492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 633925
Alignment:
Q  48 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 147  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  148 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactact 247  Q
     |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||| |||||||||||| |  || | |||||| |||||||| ||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  248 cctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 344  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  || | |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  634020 cctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttg 633925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727667
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||   |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||   ||||| |||||||||||| |  |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||  |||||||||||| || |||    
T  8727773 aatccagtataaatattacttctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatagata 8727675  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  8727674 atagtctc 8727667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667776
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 47667583  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||           ||| |  || ||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--act-----------tcacggtgggtc 47667669  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  47667670 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 47667768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 319
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006550
Alignment:
Q  230 tccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 319  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtcta 12006550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||  ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtc-cacatctagggatcat 28145821  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35930690 - 35930582
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||  ||||    
T  35930690 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctatataca 35930592  T
Q  326 taatagtctc 335  Q
    ||||||||||    
T  35930591 taatagtctc 35930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29096938 - 29096789
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtatt 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||| ||||||||    
T  29096938 atctagggatcatagtggtttcatgtctaagagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtatt 29096842  T
Q  215 ctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||| ||||||    
T  29096841 cacacggtggatcaatctagtataaatattattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51997409 - 51997353
Alignment:
Q  204 tacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51997409 tacgtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 189
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301765
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatactt 24301765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||||||||||| |  || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
    ||||   |||||| | |||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Original strand, 12006350 - 12006413
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 175  Q
    |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006350 acatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 327
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  201 tactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||| |||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  301 agatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940831
Alignment:
Q  29 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacata 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  229 atccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 21940852  T
Q  329 tagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  21940851 tagtctctatgctttaatgat 21940831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171653
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctacata 22171675  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22171674 atagtctctatgctttaatgat 22171653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094289
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctacccatata 6094311  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6094310 atagtctctatgctttaatgat 6094289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642815
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 24642837  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  24642836 atagtctctatactttaatgat 24642815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 338
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983950
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttta 193  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  194 taacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 293  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatg 14983905  T
Q  294 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 338  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14983906 atccgtgagatatgatcattagtctacccacataatagtccctat 14983950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  143 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  243 ctactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 340  Q
     ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371563
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 8371351  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8371449 aatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8371547  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    |||||||| |||||||    
T  8371548 atagtctcgatgcttt 8371563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969333
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21969439 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21969341  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  21969340 atagtctc 21969333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562123
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12562229 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12562131  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  12562130 atagtctc 12562123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007819
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27007615  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27007713 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27007811  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  27007812 atagtctc 27007819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014962
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27014758  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27014856 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27014954  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  27014955 atagtctc 27014962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880789
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27880585  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27880683 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27880781  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  27880782 atagtctc 27880789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020970
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 28020766  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28020864 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28020962  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  28020963 atagtctc 28020970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 343
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232412
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| ||||||||   ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  144 agggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 242  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||  ||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T
Q  243 ctactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 342  Q
     ||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  38232312 ttacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgctt 38232411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130911
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22130707  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22130805 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22130903  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  22130904 atagtctc 22130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611195
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagtttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  25611301 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 25611203  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  25611202 atagtctc 25611195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659795
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || ||  ||||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtc-cacatctagggatcat 22659592  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||| |||||||||||| |  || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  22659690 aatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 22659788  T
Q  328 atagtct 334  Q
    |||||||    
T  22659789 atagtct 22659795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916676
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21916880  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  || | ||||||||||||    || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21916782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21916684  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  21916683 atagtctc 21916676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534575
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 45534371  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  45534469 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 45534567  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  45534568 atagtctc 45534575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835342
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||| |||||||||||| |  ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  325 ataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttt 18835342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240484
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  |||||  |  |||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||| | ||||||    
T  26240590 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatatacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtcttcatacata 26240492  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  26240491 atagtctc 26240484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 347
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872880
Alignment:
Q  208 tagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  308 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 347  Q
    ||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatg 32872880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430953
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||  ||||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtc-cacatctagggatcat 6431090  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||| |||||||||  || | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||| |||||||||||| |  || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6430992 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||| ||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  213 ttctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttat 259  Q
    |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2375300 - 2375214
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 312  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375300 tcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  38 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggttt 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535371
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || || |  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 190  Q
    || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963089
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||  || |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtc-cacgtctagggatcat 2963030  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgaca 2963089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  23 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctaggg 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || ||  ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtc-cacatctaggg 36970458  T
Q  123 tacatagtggtttcaggtc 141  Q
      |||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggt 123  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  124 acatagtggtttcaggtc 141  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535514
Alignment:
Q  261 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 316  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagt 24535514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555049
Alignment:
Q  314 agtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 28555049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970265
Alignment:
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacatg 36970273  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  36970272 atagtctc 36970265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29645737 - 29645675
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 177  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  29645737 atctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagtacatcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  236 ataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 288  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 88  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 88  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695501
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 24695485  T
Q  328 atagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||||||||||||    
T  24695486 atagtctctatgcttt 24695501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714539
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19714517  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19714518 atagtctctatgctttaatgat 19714539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707259
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19707237  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19707238 atagtctctatgctttaatgat 19707259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569904
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaaca 18569880  T
Q  326 taatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  18569881 taatagtctttatgctttaatgat 18569904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298912
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||  | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||  || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatcagtcta 319  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 150 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538754
Alignment:
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  250 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgat 39538754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 95 - 343
Target Start/End: Original strand, 18806823 - 18807069
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttta 193  Q
    |||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   |    
T  18806823 acaaagtacacgactctcatatctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagttacaa 18806922  T
Q  194 taacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 293  Q
     ||||||  ||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806923 -aacttt--ctatgtatcattctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18807019  T
Q  294 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18807020 atatatgaaatgtgatcatcagtctacccgcataatagtctctatgcttt 18807069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285759
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||  | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | |  ||||||||  ||| |||||||||||||   || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 319  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17285667 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagtcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347417
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 190  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttt 27347417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  128 agtggttt 135  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941027
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20941133 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20941035  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  20941034 atagtctc 20941027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805687
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  25805581 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 25805679  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  25805680 atagtctc 25805687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 207 - 338
Target Start/End: Original strand, 22546915 - 22547046
Alignment:
Q  207 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgt 306  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22546915 gtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgagatgt 22547014  T
Q  307 gatcatcagtctacctacataatagtctctat 338  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22547015 gatcatcggtctatccacataatagtctctat 22547046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31899
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 32103  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  32005 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31907  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  31906 atagtctc 31899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789965
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 12789761  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12789859 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12789957  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  12789958 atagtctc 12789965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941250
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  22941356 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatacata 22941258  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  22941257 atagtctc 22941250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23545922
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 23546126  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  23546028 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 23545930  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  23545929 atagtctc 23545922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933608
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 24933404  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24933502 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24933600  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  24933601 atagtctc 24933608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100543
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || || | ||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| ||||| |||||| |  || |||| ||| |||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataa 20100450  T
Q  240 atactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 333  Q
     || ||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20100451 gtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatacataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096816
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||  ||||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattc-cacatctagggatcat 31097020  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||| |||||||||||| |  || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  31096922 aatccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31096824  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  31096823 atagtctc 31096816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765296
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | |||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12765088  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| ||  |   |||||||  |||| |||||||||||| |  ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12765187 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12765285  T
Q  325 ataatagtctc 335  Q
    |||||||||||    
T  12765286 ataatagtctc 12765296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097651
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcat 5097855  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| |||  ||||| |  |||| |||||||||||| |  || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaatttc-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  5097757 aatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacata 5097659  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  5097658 atagtctc 5097651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 343
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347513
Alignment:
Q  255 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgcttt 27347513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865736
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || || | |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   ||||| |  |||| |||||||||||| |  ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  7865627 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 7865725  T
Q  325 ataatagtctc 335  Q
    |||||||||||    
T  7865726 ataatagtctc 7865736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 186
Target Start/End: Original strand, 18806463 - 18806555
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    |||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18806463 acaaagtacacgactctcatatctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca 18806555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 186
Target Start/End: Original strand, 18806643 - 18806735
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    |||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18806643 acaaagtacacgactctcatatctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca 18806735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 110
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719555
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactc 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactc 28719555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9812039
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | |||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 9811831  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  |||| |||||||||||| |  ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  9811930 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 9812028  T
Q  325 ataatagtctc 335  Q
    ||| |||||||    
T  9812029 atagtagtctc 9812039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704180
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | |||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12703972  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  |||| |||||||||||| |  ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12704071 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12704169  T
Q  325 ataatagtctc 335  Q
    ||| |||||||    
T  12704170 atagtagtctc 12704180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 18829281 - 18829530
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaa---ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggta 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||  ||  || |||| | |   |||||| || ||||||| ||||| || |||    
T  18829281 catgatccatggagtacccatcaataaccaactttatagtcatcattttatagatgacatttgtacgacaacaaagtacacgactctcacatc-agtgta 18829379  T
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacg 223  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  || ||  ||||||||  ||| |||  |||||||||  |    
T  18829380 catagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaac-ttacataacttt--ctatgtatcattctcatggtg 18829476  T
Q  224 gatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 277  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829477 ggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 109  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245102
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | || |  |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcat 26245306  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||| | || || | |||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||| | |||||||| |    |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26245208 aatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacata 26245110  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  26245109 atagtctc 26245102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129928
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || || | ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacg 223  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||   ||||| || ||||| ||| |  |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataac--atactatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  224 gatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39535509 - 39535465
Alignment:
Q  290 catgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 334  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39535509 catgacctatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 39535465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7273
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 7295  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  7294 atagtctctatgctttaatgat 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6975
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6953  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6954 atagtctctatgctttaatgat 6975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13991
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 13969  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  13970 atagtctttatgctttaatgat 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152609
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  232 caatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152726 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 15152627  T
Q  332 tctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15152626 tctctatgctttaatgat 15152609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327950
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29327972  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29327971 atagtctctatgctttaatgat 29327950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536103
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11536081  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11536082 atagtctctatgctttaatgat 11536103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11543021
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11542999  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11543000 atagtctctatgctttaatgat 11543021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 28 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12750987
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 12751014  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgatgtcca 354  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12751013 atagtctctatgctttaatgatatcca 12750987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738702
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctacccacata 12738724  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12738723 atagtctctatgctttaatgat 12738702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561173
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18561294 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18561195  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18561194 atagtctctatgctttaatgat 18561173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392326
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||  || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | | |    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctaccaataca 13392338  T
Q  328 atagtctctatg 339  Q
    ||||||||||||    
T  13392337 atagtctctatg 13392326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257874
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || || | ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatga 221  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || || |  |||| ||| |||||| | |     
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  222 cggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 321  Q
     || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatc 18257855  T
Q  322 tacataatagtctctatgc 340  Q
     |||||||||||| |||||    
T  18257856 cacataatagtctttatgc 18257874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204552
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2204756  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  2204658 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2204560  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  2204559 atagtctc 2204552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8464999
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || || | |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8465105 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8465007  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  8465006 atagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400104
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18400308  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18400210 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18400112  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  18400111 atagtctc 18400104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407088
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18407292  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18407194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18407096  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  18407095 atagtctc 18407088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808798
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 48808594  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  48808692 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 48808790  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  48808791 atagtctc 48808798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729751
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15729955  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15729857 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15729759  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  15729758 atagtctc 15729751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139640
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 18139436  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18139534 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18139632  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  18139633 atagtctc 18139640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230888
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || || | ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  || |||||||||||| |  || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19230994 aatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19230896  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  19230895 atagtctc 19230888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254138
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| ||   |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  240 atactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30254232 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 30254138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365169
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||  || ||| |||| ||| |||||  || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataac--ttcctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtg 268  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681203
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681164 aatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669204
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || || | ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat-gagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 326  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  10669097 caatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacat 10669195  T
Q  327 aatagtctc 335  Q
    |||||||||    
T  10669196 aatagtctc 10669204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 335
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167161
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || || | |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||| |||||||||||| |  || || ||| | |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  240 atactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47167067 atattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 47167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10235451 - 10235361
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 316  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10235451 tcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgagatgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388544
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactacgtag 210  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |   || ||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacac-tttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  211 tattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 310  Q
    |||||||||||  |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || ||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggtc 19388577  T
Q  311 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19388576 atcaatctatatacataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 334
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443628
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || || | |||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcc 249  Q
      |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||| ||||| |  || | |||| | |||||||| ||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  250 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 334  Q
    ||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24443545 taatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||  ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtc-cacatctagggatcat 34128777  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | | |||||   ||||| ||||||||||||  | |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148308
Alignment:
Q  294 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15148308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130561
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||  ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtc-cacatctacggatcat 28130765  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||| ||||||||| |||  ||  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||| ||| ||||||||    || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||| | |||||||||||| | ||||    
T  28130667 aatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatgcata 28130569  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  28130568 atagtctc 28130561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 334
Target Start/End: Original strand, 47833899 - 47833983
Alignment:
Q  250 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 334  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  47833899 taatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacgtaatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 335
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393726
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 165  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  166 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctat 265  Q
     | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  |||| |||||||||||| |   | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctat 19393657  T
Q  266 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19393658 gtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgaaatgtggtcattagtctacatacataatagtctc 19393726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859113
Alignment:
Q  235 tataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T
Q  335 ctatgctttg 344  Q
    | | ||||||    
T  19859122 cgacgctttg 19859113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 337
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845780
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || || | |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcc 249  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   ||||| |||||||||||| |  |  |||||||| |||||||| ||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  250 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 337  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25845694 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 337
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846199
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || || | |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcc 249  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   ||||| |||||||||||| |  |  |||||||| |||||||| ||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  250 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 337  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25846113 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396361
Alignment:
Q  257 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgcttt 7396361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 330
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  212 attctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 311  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  312 tcagtctacctacataata 330  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259281
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||  ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtc-cacatctagggatcat 18259222  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    |  ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 18259281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  202 actacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 301  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  302 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 340  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||  |||||||||||| |  ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||   |||||||||||||  ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Original strand, 22948510 - 22948574
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 177  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948510 acatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  114 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtat 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||   ||| | |||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  214 tctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaat 253  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||||||||||| |  || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
    ||||   |||||| | |||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39111989
Alignment:
Q  39 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcag 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  139 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatata 238  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    || ||   || ||||||  |  ||| ||||| ||||||||| || |     |  ||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata----atcac---ttgtataacact--ctatgtagttttctcatgatgggtt----cggtata 39112089  T
Q  239 aatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  39112088 aataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtctctat 39111989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  246 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 301  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365070
Alignment:
Q  297 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatg 2365070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7396527 - 7396469
Alignment:
Q  212 attctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaa 270  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396527 attcttatgacgggttaatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  118 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 182  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18454
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18476  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18475 atagtctctatgctttaatgat 18454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Original strand, 25706 - 26031
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  224 gatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 26005  T
Q  324 cataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||    
T  26006 cataatagtcgctatgctttaatgat 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330289
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctacata 21330267  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21330268 atagtctctatgctttaatgat 21330289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796672
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18796694  T
Q  328 atagtctctatgctttgatgat 349  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  18796693 atagtctcaatgctttaatgat 18796672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18619976
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatga 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacactttc-ataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  222 cggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 321  Q
     || |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctacc 18619998  T
Q  322 tacataatagtctctatgcttt 343  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  18619997 cacataatagtctatatgcttt 18619976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270338
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||  ||||  ||| ||| |||  ||||||||| ||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggt-gaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataa--ttttctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| |||     
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagtctacccacac 36270355  T
Q  327 aatagtctctatgcttt 343  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  36270354 aatagtctttatacttt 36270338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 343
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183518
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||  ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  |||  ||||| ||   || |||  ||| ||||| ||| |    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggt 22183402  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 326  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  22183403 caatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgt 22183501  T
Q  327 aatagtctctatgcttt 343  Q
    |||||||||||| ||||    
T  22183502 aatagtctctatacttt 22183518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978091
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggat 226  Q
    ||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||   ||  ||  ||||||||| ||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataattttccata--taaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  227 caatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 299  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 340
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992146
Alignment:
Q  42 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  141 cgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   |||| |||  ||| ||||  |||| |||  |||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcacttac-ataatttt--ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  240 atactactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 337  Q
    ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||    
T  6992044 atattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcattagtctacccatataataatcttta 6992143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822249
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatata 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  ||||  ||||| |||  || |||  | ||||||| | |||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  239 aatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 338  Q
    |||| |||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| | |    
T  18822359 aatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagtctattgacataataatctatct 18822260  T
Q  339 gctttgatgat 349  Q
    ||||| |||||    
T  18822259 gctttaatgat 18822249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174377
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30174581  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  30174483 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 30174385  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  30174384 atagtctc 30174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250334
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || || | ||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 24250130  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24250228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24250326  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  24250327 atagtctc 24250334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229517
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24229411 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24229509  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  24229510 atagtctc 24229517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19279593 - 19279460
Alignment:
Q  210 gtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 309  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19279593 gtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgagatgtgat 19279494  T
Q  310 catcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||| |||| ||   ||||||||||| ||||||||    
T  19279493 cattagtcaactcgcataatagtctttatgcttt 19279460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 334
Target Start/End: Original strand, 18851977 - 18852085
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  18851977 tcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagatgggatcattagtctaccgaca 18852076  T
Q  326 taatagtct 334  Q
    |||||||||    
T  18852077 taatagtct 18852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342237
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagt-tcacatctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| |  |||| |||||||| ||| |  || | |||||| |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  240 atactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15342210 atattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||  |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 191  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaagg-tgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800468
Alignment:
Q  26 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtac 125  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || || | |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacgga 225  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  |||| |||||||||||| |  ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt---atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 322  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||  | |||| || | | | |   |||||||| |  || ||||||||||||||||||| |    
T  29800579 tcaatccagtataaatattactcctaatatttatacccatgtatatacttaattaatatctcacatccatgacccatgggatgtgatcatcagtctacat 29800480  T
Q  323 acataatagtct 334  Q
    ||||||||||||    
T  29800479 acataatagtct 29800468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 329
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  325 ataat 329  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616435
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    ||||| ||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  213 ttctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 312  Q
    |||||| |  || ||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||   |||  ||||    ||||||||| ||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct-aatatttatgactcatgagatgtggtcat 19616458  T
Q  313 cagtctacctacataatagtctc 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19616457 cagtctacatacataatagtctc 19616435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 95  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 175  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 333
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 325  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| ||| | || |||||    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcat-attcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  326 taatagtc 333  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 189
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301097
Alignment:
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacactt 40301097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626890
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 190  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacacttt 21626890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316441
Alignment:
Q  53 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||  | || | |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  153 tacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 190  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacacttt 41316441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 339
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098649
Alignment:
Q  299 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 339  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatg 12098649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 264
Target Start/End: Original strand, 28718949 - 28719006
Alignment:
Q  207 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatcta 264  Q
    |||||||||||| || |  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28718949 gtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 47 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1159
Alignment:
Q  47 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 146  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  147 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  247 tcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgat 346  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1261 tcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 1162  T
Q  347 gat 349  Q
    |||    
T  1161 gat 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5695
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt-ataacttttactacgtagtattctcatga 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  222 cggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacc 5723  T
Q  322 tacataatagtctctatgctttgatgat 349  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5722 cacataatagtctttatgctttaatgat 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 284
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230367
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 183
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  289 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacata 191  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  190 atagtctc 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3977
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 3773  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3871 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3969  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  3970 atagtctc 3977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119730
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | ||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 119934  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  119836 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacata 119738  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  119737 atagtctc 119730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 335
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13251
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || || | |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||| |||||||||||| |  || |||||||  |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  240 atactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13157 atattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctc 13251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 335
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130526
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 165  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || || | |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  166 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctat 265  Q
     | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T
Q  266 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 335  Q
    ||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  130458 gtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 130526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67676
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||  ||||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtc-cacatctagggatcat 67472  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  |||||| |||||||||||| |  || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  67570 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacata 67668  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  67669 atagtctc 67676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8305
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||||||||||| |  ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  325 ataatagtctc 335  Q
    |||||||||||    
T  8315 ataatagtctc 8305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40290
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || || |  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| ||||||||||||    || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 327  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40184 aatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatacata 40282  T
Q  328 atagtctc 335  Q
    ||||||||    
T  40283 atagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26609
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| || | ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||  ||||||||||| |  || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  228 aatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgt 267  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26648 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 343
Target Start/End: Original strand, 90033 - 90151
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt-atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 324  Q
    ||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  90033 tcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgattatcagtctatctac 90132  T
Q  325 ataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  90133 atagtagtctttatgcttt 90151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8723
Alignment:
Q  56 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 155  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||| | ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  156 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatactactcctaatat 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||| |||||||||||||   || |||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T
Q  256 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||| |  ||||   |  ||| ||| |||  |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  8809 ttacacatatgcatatccttaatatctc-atatctatgacatgtgagacgtgatcatcaatctacatacatattagtctctacgcttt 8723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || || | |||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcag 190  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctca 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11683
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||  ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtc-cacatctagggatcaa 11624  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    |||||||||||||| ||| | |   |||||   ||||| | ||||||||||||||||||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgaca 11683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactacgtagtattctcatgacgg 224  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||   ||||| |||||||||||||   ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacac-cttcgtaac--atactatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  225 atcaatccaatataaatactactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 92447 - 92345
Alignment:
Q  235 tataaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 334  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| | || || |||||||||| || ||||||||||   |||| |||| |||||||||||| | | |||||||| |    
T  92447 tataattactacccttaatatttatatatgtgcgatgacttgataattccttatccatgactcgtgacatgtaatcatcagtctagccatataatagttt 92348  T
Q  335 cta 337  Q
    |||    
T  92347 cta 92345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53955
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactctaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||  ||| ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtc-cacacctagggatcat 53969  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  53968 agtggtttcaggtc 53955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Original strand, 15089 - 15133
Alignment:
Q  299 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 343  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15089 tgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttt 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University