View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19346_low_16 (Length: 259)

Name: NF19346_low_16
Description: NF19346
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19346_low_16
NF19346_low_16
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (4-256)||(25175563-25175815)
chr6 (4-256)||(27653983-27654235)
chr6 (4-256)||(16825752-16826006)
chr6 (3-252)||(14626129-14626377)
chr6 (1-245)||(23153458-23153701)
chr6 (4-252)||(1650105-1650352)
chr6 (1-245)||(1657757-1657999)
chr6 (1-256)||(35009448-35009702)
chr6 (1-245)||(15862484-15862725)
chr6 (1-188)||(29665941-29666128)
chr6 (5-77)||(27751603-27751675)
chr6 (8-92)||(29605612-29605696)
chr6 (8-90)||(18629608-18629691)
chr6 (10-92)||(17083200-17083282)
chr6 (9-49)||(18399144-18399184)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (4-256)||(25426628-25426880)
chr5 (4-256)||(12374-12626)
chr5 (4-256)||(19499899-19500151)
chr5 (4-256)||(22366481-22366733)
chr5 (7-256)||(18777995-18778244)
chr5 (4-256)||(21073595-21073847)
chr5 (7-256)||(43443398-43443647)
chr5 (4-256)||(4199985-4200237)
chr5 (8-256)||(27009841-27010089)
chr5 (1-256)||(23506965-23507219)
chr5 (1-256)||(27182556-27182810)
chr5 (1-256)||(22053842-22054096)
chr5 (1-256)||(18531076-18531330)
chr5 (4-204)||(29188284-29188483)
chr5 (1-245)||(34939289-34939531)
chr5 (1-139)||(20623085-20623223)
chr5 (1-139)||(21233537-21233675)
chr5 (1-138)||(25900415-25900552)
chr5 (1-139)||(16536313-16536451)
chr5 (1-139)||(37052860-37052998)
chr5 (8-92)||(29918127-29918212)
chr5 (212-252)||(29190482-29190522)
chr5 (8-90)||(21310709-21310792)
chr5 (1-88)||(32950862-32950949)
chr5 (9-90)||(5450844-5450926)
chr5 (215-256)||(17471803-17471844)
chr5 (9-49)||(16595713-16595753)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (4-256)||(19886661-19886913)
chr2 (1-256)||(17396662-17396916)
chr2 (1-251)||(462743-462992)
chr2 (7-256)||(19794719-19794967)
chr2 (1-256)||(8891242-8891496)
chr2 (1-256)||(36982450-36982704)
chr2 (1-256)||(20627322-20627576)
chr2 (1-256)||(43642966-43643220)
chr2 (1-256)||(24341398-24341652)
chr2 (42-256)||(7507894-7508107)
chr2 (1-256)||(25265399-25265653)
chr2 (1-139)||(19689410-19689548)
chr2 (1-139)||(23820187-23820325)
chr2 (1-139)||(14906449-14906587)
chr2 (1-139)||(20015127-20015265)
chr2 (9-90)||(68156-68238)
chr2 (9-90)||(22775206-22775288)
chr2 (9-90)||(22780584-22780666)
chr2 (9-88)||(43646059-43646139)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (4-256)||(47357654-47357906)
chr4 (8-256)||(10644219-10644467)
chr4 (1-248)||(13048230-13048477)
chr4 (1-256)||(13246430-13246684)
chr4 (1-256)||(54118253-54118507)
chr4 (1-256)||(15675098-15675352)
chr4 (19-256)||(31115629-31115865)
chr4 (1-256)||(26680201-26680454)
chr4 (1-156)||(121989-122143)
chr4 (1-188)||(10104259-10104445)
chr4 (1-139)||(10488678-10488816)
chr4 (1-139)||(16327935-16328073)
chr4 (159-256)||(111395-111492)
chr4 (8-188)||(40885570-40885749)
chr4 (1-55)||(33240900-33240954)
chr4 (9-90)||(15044992-15045074)
chr4 (212-256)||(10104450-10104494)
chr4 (9-90)||(15109350-15109432)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (4-256)||(10989410-10989661)
chr7 (3-256)||(2437457-2437710)
chr7 (4-256)||(13911024-13911277)
chr7 (8-256)||(13572676-13572924)
chr7 (1-256)||(18253844-18254098)
chr7 (1-250)||(25292347-25292595)
chr7 (1-256)||(13037023-13037277)
chr7 (1-256)||(47481040-47481294)
chr7 (1-254)||(16211768-16212020)
chr7 (3-251)||(11580750-11580997)
chr7 (1-256)||(3059966-3060220)
chr7 (29-256)||(16478987-16479213)
chr7 (1-256)||(36052667-36052918)
chr7 (1-256)||(7293017-7293270)
chr7 (1-256)||(13321014-13321270)
chr7 (1-139)||(11516343-11516481)
chr7 (1-139)||(15441573-15441711)
chr7 (1-139)||(30262138-30262276)
chr7 (1-113)||(295975-296087)
chr7 (9-90)||(13377693-13377775)
chr7 (8-90)||(16914928-16915011)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (4-256)||(30120722-30120974)
chr8 (66-256)||(222753-222943)
chr8 (66-256)||(736376-736566)
chr8 (66-256)||(860271-860461)
chr8 (4-256)||(16674392-16674644)
chr8 (8-256)||(21844576-21844824)
chr8 (8-256)||(21851969-21852217)
chr8 (1-257)||(16193725-16193980)
chr8 (4-256)||(43373480-43373731)
chr8 (4-252)||(6774258-6774505)
chr8 (4-252)||(24548986-24549233)
chr8 (1-245)||(24928800-24929043)
chr8 (3-256)||(16404986-16405235)
chr8 (1-256)||(22907223-22907476)
chr8 (1-245)||(17345581-17345823)
chr8 (1-139)||(5238203-5238341)
chr8 (1-139)||(24661257-24661395)
chr8 (1-139)||(43685662-43685800)
chr8 (66-128)||(691908-691970)
chr8 (8-90)||(26011658-26011741)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (4-256)||(55316219-55316471)
chr3 (4-256)||(41270075-41270327)
chr3 (29-256)||(16821139-16821366)
chr3 (1-256)||(14842570-14842824)
chr3 (1-256)||(13975731-13975985)
chr3 (1-256)||(45860805-45861059)
chr3 (1-257)||(51158027-51158282)
chr3 (1-256)||(13954899-13955153)
chr3 (1-256)||(15859033-15859287)
chr3 (1-256)||(15936636-15936890)
chr3 (1-256)||(12030156-12030410)
chr3 (1-253)||(15938478-15938729)
chr3 (1-256)||(2049810-2050064)
chr3 (1-245)||(13838905-13839148)
chr3 (4-252)||(15614838-15615085)
chr3 (1-256)||(17912492-17912744)
chr3 (1-139)||(2449247-2449385)
chr3 (1-256)||(16744124-16744377)
chr3 (143-256)||(47984650-47984763)
chr3 (143-256)||(47993937-47994050)
chr3 (143-256)||(48003224-48003337)
chr3 (143-256)||(48012510-48012623)
chr3 (1-55)||(19231981-19232035)
chr3 (8-49)||(14080715-14080756)
chr3 (215-256)||(15468555-15468596)
chr3 (8-92)||(4145814-4145898)
chr3 (1-88)||(11986175-11986262)
chr3 (9-90)||(30207380-30207462)
chr3 (8-92)||(6228625-6228710)
chr3 (215-256)||(22275209-22275250)
chr3 (9-49)||(14059214-14059254)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (4-256)||(5072388-5072640)
chr1 (4-256)||(18601118-18601370)
chr1 (1-256)||(20931345-20931599)
chr1 (1-256)||(20913037-20913284)
chr1 (3-256)||(22227809-22228061)
chr1 (3-256)||(22232506-22232758)
chr1 (1-256)||(20893635-20893889)
chr1 (1-256)||(41394222-41394476)
chr1 (1-256)||(20445679-20445933)
chr1 (4-252)||(2116258-2116506)
chr1 (1-256)||(37844459-37844714)
chr1 (1-256)||(20531444-20531698)
chr1 (4-190)||(45051489-45051674)
chr1 (1-139)||(51452608-51452746)
chr1 (9-49)||(16646118-16646158)
chr1 (212-252)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (29-256)||(36093-36320)
scaffold0023 (1-256)||(48598-48852)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (29-256)||(42997-43224)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (29-256)||(31700-31928)
scaffold0008 (1-256)||(128178-128431)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-232)||(5552-5783)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (8-256)||(35-283)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-254)||(3591-3843)
scaffold0266 (1-256)||(1124-1378)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (8-256)||(64527-64780)
scaffold0026 (1-256)||(107747-108001)
scaffold0026 (7-49)||(89863-89905)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-256)||(6073-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-256)||(965-1218)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-256)||(48187-48441)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (3-256)||(21115-21367)
scaffold0139 (29-256)||(14086-14312)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-256)||(12115-12367)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-256)||(8878-9132)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-256)||(19206-19460)
scaffold0195 (1-256)||(21290-21544)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-256)||(148721-148975)
scaffold0025 (1-256)||(8849-9103)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-256)||(123173-123427)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (42-256)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (42-256)||(3722-3936)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-256)||(36922-37176)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-256)||(5070-5324)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (29-252)||(9374-9596)
scaffold0215 (29-252)||(16272-16494)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-256)||(26424-26678)
scaffold0162 (1-139)||(8189-8327)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-245)||(247451-247694)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-245)||(171916-172159)
scaffold0001 (1-245)||(177619-177862)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (4-150)||(1304-1450)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-252)||(41733-41983)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-256)||(543-797)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-250)||(272031-272277)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (3-256)||(34471-34724)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (3-252)||(2966-3215)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-256)||(37075-37328)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-256)||(41648-41902)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (150-256)||(9-115)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-256)||(13506-13760)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (150-256)||(48514-48620)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-138)||(51191-51328)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (4-160)||(13325-13480)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-138)||(89463-89600)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-139)||(22656-22794)
scaffold0141 (1-139)||(26911-27049)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-139)||(1591-1729)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (159-256)||(9382-9479)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (4-85)||(3360-3441)
scaffold0361 (200-254)||(3210-3264)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (8-90)||(8174-8257)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-88)||(56108-56195)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (9-90)||(2317-2399)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (42-88)||(45198-45244)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (8-49)||(1546-1587)
scaffold0456 (8-49)||(8691-8732)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (8-49)||(70307-70348)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (9-49)||(8011-8051)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (9-49)||(3525-3565)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  102 atgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  202 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 14626129 - 14626377
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14626129 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 14626228  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||    
T  14626229 tgataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattg 14626327  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626328 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23153701 - 23153458
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  23153701 tgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 23153602  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| |    
T  23153601 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaat 23153503  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153502 tgatgttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650352
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 1650303  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650304 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 1657757 - 1657999
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  1657757 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaa 1657856  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| |    
T  1657857 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaat 1657954  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657955 tgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 35009448 - 35009702
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  35009448 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 35009547  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| |    
T  35009548 aatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaat 35009646  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009647 tgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15862725 - 15862484
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | |    
T  15862725 tgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtata 15862626  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||   || || |    
T  15862625 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataat 15862529  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862528 tgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29666128 - 29665941
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgca 98  Q
    ||||| ||||||||||||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  29666128 tgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgca 29666029  T
Q  99 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 188  Q
     |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666028 taaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  5 gctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 77  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 92  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629691
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18629691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083282
Alignment:
Q  10 attcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 92  Q
    |||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcata 17083282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 18399184 - 18399144
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18399184 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 18399144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778244
Alignment:
Q  7 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 106  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  107 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  207 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443647
Alignment:
Q  7 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 106  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  107 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 206  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  207 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200237
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009841
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 107  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  108 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 207  Q
    ||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  208 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23507219 - 23506965
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23507219 tgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 23507120  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  23507119 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 23507021  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507020 tgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 27182556 - 27182810
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |    
T  27182556 tgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaaca 27182655  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  27182656 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 27182754  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182755 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22053842 - 22054096
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  22053842 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 22053941  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  22053942 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaat 22054040  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054041 tgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 18531076 - 18531330
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  18531076 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 18531175  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  18531176 aatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaat 18531274  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531275 tgatgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34939531 - 34939289
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  34939531 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaa 34939432  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| |    
T  34939431 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaat 34939334  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939333 tgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20623223 - 20623085
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  20623223 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 20623124  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623123 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 21233537 - 21233675
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  21233537 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 21233636  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233637 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 25900415 - 25900552
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   |||||  ||    
T  25900415 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaa 25900514  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 138  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900515 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16536451 - 16536313
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  16536451 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 16536352  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536351 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37052998 - 37052860
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||   |    
T  37052998 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgga 37052899  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052898 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 92  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 252
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  212 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310792
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 21310792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 32950949 - 32950862
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 88  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950949 tgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5450926
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 5450926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  215 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16595753 - 16595713
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16595753 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16595713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 17396662 - 17396916
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | |||    
T  17396662 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaa 17396760  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17396761 aatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 17396860  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396861 tgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 462992 - 462743
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  462992 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 462893  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  462892 aatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 462794  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 251  Q
    |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462793 tgatgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19794967
Alignment:
Q  7 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 106  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||    
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgat 19794818  T
Q  107 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 206  Q
    ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| |    
T  19794819 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgt 19794917  T
Q  207 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794918 tatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8891496 - 8891242
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |    
T  8891496 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaaca 8891397  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| |    
T  8891396 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaat 8891298  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891297 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 36982450 - 36982704
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36982450 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 36982549  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  36982550 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaat 36982648  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982649 tgatgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20627322 - 20627576
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  20627322 tgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaa 20627421  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| |    
T  20627422 aatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaat 20627520  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || | || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627521 tggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 43642966 - 43643220
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  43642966 tgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 43643065  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| |    
T  43643066 aatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaat 43643164  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643165 tgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 24341398 - 24341652
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||    
T  24341398 tgttgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaa 24341497  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  24341498 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 24341596  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| ||    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341597 tgatgttcctgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  42 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 141  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  142 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 240  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  241 tcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 25265399 - 25265653
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  25265399 tgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 25265498  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| |    
T  25265499 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaat 25265597  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265598 tgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 19689410 - 19689548
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  19689410 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 19689509  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689510 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23820325 - 23820187
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  23820325 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 23820226  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820225 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 14906449 - 14906587
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  14906449 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 14906548  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906549 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20015265 - 20015127
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  20015265 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 20015166  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015165 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775288
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780666
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646059
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 88  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtt 43646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644219
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 107  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  108 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 207  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  208 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 13048230 - 13048477
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  13048230 tgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaa 13048329  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13048330 aaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 13048429  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 248  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048430 agataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13246684 - 13246430
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  13246684 tgttgttaaattcgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 13246585  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  13246584 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 13246486  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246485 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 54118253 - 54118507
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  54118253 tgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 54118352  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    | ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| |    
T  54118353 attgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaat 54118451  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118452 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15675098 - 15675352
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  15675098 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 15675197  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  15675198 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaat 15675296  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675297 tgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  19 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 118  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  119 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 218  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  219 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26680454 - 26680201
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  26680454 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaa 26680355  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |    
T  26680354 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 26680257  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
     ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680256 agatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 122143 - 121989
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  122143 tgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 122044  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgtta 156  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122043 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 10104259 - 10104445
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  10104259 tgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 10104358  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 188  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104359 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10488816 - 10488678
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  10488816 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 10488717  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488716 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 16327935 - 16328073
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  16327935 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 16328034  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328035 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  159 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885749
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgat 106  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  107 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 188  Q
    |||||||||| ||| |||| ||  |||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885670 aagttatgaa-attatgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 33240954 - 33240900
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240954 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 256
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  212 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109432
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15109432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437457
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911277
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572676
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 107  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  108 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 207  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  208 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 18253844 - 18254098
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  18253844 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 18253943  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  18253944 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 18254042  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254043 tgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 25292347 - 25292595
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  25292347 tgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaa 25292446  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    || |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25292447 aaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 25292545  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 250  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292546 tgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13037023 - 13037277
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |    
T  13037023 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaaca 13037122  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  13037123 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaat 13037221  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037222 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 47481040 - 47481294
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  47481040 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 47481139  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||| |    
T  47481140 aatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaat 47481238  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481239 tgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16212020 - 16211768
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||    
T  16212020 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaa 16211921  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| |    
T  16211920 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaat 16211822  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 254  Q
    |||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211821 tgatgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 251
Target Start/End: Original strand, 11580750 - 11580997
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||    
T  11580750 ttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaa 11580849  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  11580850 tgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattg 11580948  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 251  Q
    || || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580949 atgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3060220 - 3059966
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3060220 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 3060121  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  3060120 aatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaat 3060022  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060021 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  29 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  129 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 228  Q
      ||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  229 gggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36052918 - 36052667
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  36052918 tgttgctaaatttatactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaa 36052819  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |    
T  36052818 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaat 36052723  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052722 tgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7293270 - 7293017
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  7293270 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 7293171  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |    
T  7293170 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 7293073  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
     ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293072 agatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13321270 - 13321014
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| |    
T  13321270 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgta 13321171  T
Q  99 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 197  Q
     |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||    
T  13321170 taaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 13321073  T
Q  198 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    | ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321072 aattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11516481 - 11516343
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  11516481 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 11516382  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516381 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 15441573 - 15441711
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  15441573 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 15441672  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441673 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 30262138 - 30262276
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  30262138 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 30262237  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262238 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 295975 - 296087
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||| || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||    
T  295975 tgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaa 296074  T
Q  101 aatgataagttat 113  Q
    ||||| |||||||    
T  296075 aatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915011
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 16915011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  66 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  166 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  66 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  166 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  66 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  166 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844824
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 107  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  108 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 207  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  208 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852217
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 107  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  108 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 207  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  208 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 16193725 - 16193980
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  16193725 tgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaa 16193824  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  16193825 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 16193923  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 257  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193924 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 43373480 - 43373731
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43373480 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 43373579  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  43373580 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattga 43373678  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373679 tgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24928800 - 24929043
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  24928800 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 24928899  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| |    
T  24928900 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaat 24928998  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24928999 tgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 16404986 - 16405235
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||    
T  16404986 ttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaa 16405085  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| |||    
T  16405086 tgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattg 16405181  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405182 atgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22907223 - 22907476
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  22907223 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 22907322  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |    
T  22907323 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 22907420  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
     ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907421 agatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17345823 - 17345581
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  17345823 tgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaa 17345724  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||   ||||| |    
T  17345723 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaat 17345626  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345625 tgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5238341 - 5238203
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  5238341 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 5238242  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238241 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 24661257 - 24661395
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  24661257 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 24661356  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661357 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43685800 - 43685662
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  43685800 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 43685701  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685700 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 128
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  66 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011658
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 26011658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  29 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  129 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 228  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  229 gggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 14842570 - 14842824
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||    
T  14842570 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaa 14842669  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  14842670 aatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 14842768  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842769 tgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13975731 - 13975985
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||    
T  13975731 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaa 13975829  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975830 aatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 13975929  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975930 tgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45861059 - 45860805
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||    
T  45861059 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaa 45860961  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45860960 aatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 45860861  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860860 tgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 51158027 - 51158282
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  51158027 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 51158126  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  51158127 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 51158225  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 257  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158226 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13954899 - 13955153
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||    
T  13954899 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaa 13954997  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13954998 aatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 13955097  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955098 tgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15859033 - 15859287
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  15859033 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaaca 15859132  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  15859133 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 15859231  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15859232 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15936636 - 15936890
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  15936636 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 15936735  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  15936736 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 15936834  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936835 tgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 12030156 - 12030410
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12030156 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 12030255  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    | ||||||||| ||||  ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  12030256 agtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaat 12030354  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030355 tgatgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 15938478 - 15938729
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  15938478 tgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 15938577  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  15938578 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 15938676  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 253  Q
    |||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938677 tgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2050064 - 2049810
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2050064 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 2049965  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
     ||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  2049964 catgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaat 2049866  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049865 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13839148 - 13838905
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  13839148 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaaca 13839049  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  13839048 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 13838950  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838949 tgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614838
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  15614985 gataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 15614887  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614886 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 17912492 - 17912744
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  17912492 tgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaa 17912590  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||   ||||| |    
T  17912591 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaat 17912688  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912689 tgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 2449247 - 2449385
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  2449247 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 2449346  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449347 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16744124 - 16744377
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||    
T  16744124 tgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaa 16744223  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |    
T  16744224 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 16744321  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
      || || |  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744322 aaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  143 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 242  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  243 atggattgatgatg 256  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  143 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 242  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  243 atggattgatgatg 256  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  143 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 242  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  243 atggattgatgatg 256  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  143 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 242  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  243 atggattgatgatg 256  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 19232035 - 19231981
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232035 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  215 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 92  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 11986175 - 11986262
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 88  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986175 tgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 30207462 - 30207380
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  30207462 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 30207380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228710
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 92  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| || |||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 6228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  215 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 14059214 - 14059254
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  14059214 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 14059254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601370
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    |||||||||| |||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  204 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20931599 - 20931345
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20931599 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaa 20931500  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  20931499 aatgataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 20931401  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931400 tgatgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20913284 - 20913037
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20913284 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaa 20913185  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  20913184 aatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 20913093  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913092 tgatcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22228061 - 22227809
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22228061 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22227962  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22227961 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattg 22227863  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227862 atgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22232758 - 22232506
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22232758 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22232659  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22232658 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattg 22232560  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232559 atgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20893635 - 20893889
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |    
T  20893635 tgttgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaaca 20893734  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  20893735 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaat 20893833  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893834 tgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41394476 - 41394222
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  41394476 tgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaa 41394377  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   |||||||    
T  41394376 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatt 41394278  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394277 tgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20445933 - 20445679
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |    
T  20445933 tgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaaca 20445834  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |    
T  20445833 aatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaat 20445735  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445734 tgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116258
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||| |||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattg 2116308  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116307 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 37844459 - 37844714
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |    
T  37844459 tgttgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaaca 37844558  T
Q  101 aatgataagtta-tgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 199  Q
    ||||||||  || |||| |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  37844559 aatgataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaa 37844657  T
Q  200 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844658 ttgatgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20531698 - 20531444
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |    
T  20531698 tgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaaca 20531599  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |    
T  20531598 aatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaat 20531500  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531499 tgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45051674 - 45051489
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45051674 tgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 45051575  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 190  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051574 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 51452746 - 51452608
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||    
T  51452746 tgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 51452647  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452646 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16646158 - 16646118
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16646158 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16646118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  212 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  29 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  129 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 228  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  229 gggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48852 - 48598
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  48852 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaa 48753  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| |    
T  48752 aatgataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaat 48654  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48653 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  29 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  129 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 228  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  229 gggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  29 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  129 ggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 227  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  228 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 128178 - 128431
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  128178 tgttgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 128277  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
      || |||||| |||| |||||||| ||  || |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  128278 ggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 128375  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
     ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128376 ggatgttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5783 - 5552
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  5783 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaa 5684  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5683 aatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 5584  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggt 232  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5583 tgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 35
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 107  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  108 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 207  Q
    ||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  208 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 3591 - 3843
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3591 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 3690  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  3691 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 3789  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 254  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3790 tgatgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1124
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1378 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 1279  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  1278 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 1180  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1179 tgatattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64780
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    ||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||||     |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 108001 - 107747
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  108001 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaa 107902  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  107901 aatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 107803  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107802 tgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 49
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  7 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 6073 - 6326
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6073 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 6172  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||| ||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  6173 aataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaat 6270  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6271 ttttgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 965 - 1218
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  965 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 1064  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  1065 aataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaat 1162  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1163 ttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48441 - 48187
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  48441 tgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 48342  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| |    
T  48341 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaat 48243  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48242 tgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21367
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||    | || |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttg 21313  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21314 atgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  29 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  129 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 228  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  229 gggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12367 - 12115
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||    
T  12367 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaa 12268  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12267 aatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaat 12171  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12170 tgatgttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9132 - 8878
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  9132 tgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 9033  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  9032 aatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaat 8934  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8933 tgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19460 - 19206
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19460 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 19361  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  19360 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaat 19262  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19261 tgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21544 - 21290
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21544 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 21445  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| |    
T  21444 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaat 21346  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21345 tgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 148975 - 148721
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  148975 tgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 148876  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  148875 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 148777  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148776 tgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9103 - 8849
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  9103 tgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 9004  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| |    
T  9003 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaat 8905  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8904 tgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 123173 - 123427
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  123173 tgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 123272  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  123273 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 123371  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123372 tgatgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  42 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 141  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  142 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 241  Q
     || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  242 catggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  42 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttc 140  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  141 tcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 240  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  241 tcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 36922 - 37176
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  36922 tgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 37021  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| |    
T  37022 aatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaat 37120  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37121 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 5070 - 5324
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  5070 tgttgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaa 5169  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  5170 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 5268  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5269 tgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 252
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  29 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  129 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 228  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  229 gggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 252
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  29 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  129 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 228  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  229 gggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 26424 - 26678
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  26424 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaa 26523  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  26524 aatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 26622  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26623 tgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 8189 - 8327
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||    
T  8189 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaa 8288  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8289 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 247451 - 247694
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |    
T  247451 tgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaaca 247550  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  247551 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaat 247649  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247650 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 172159 - 171916
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  172159 tgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaaca 172060  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  172059 aatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 171961  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171960 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 177862 - 177619
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  177862 tgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaaca 177763  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  177762 aatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 177664  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 245  Q
    |||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177663 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg 150  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41983 - 41733
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  41983 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaa 41884  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  41883 aatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaat 41785  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    || | || |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41784 tgttgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 543 - 797
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  543 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 642  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    |||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||  || || |    
T  643 aatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaat 741  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  742 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 272277 - 272031
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||    
T  272277 ttgctaaatacgtactccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaa 272178  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| |||    
T  272177 tgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattg 272079  T
Q  203 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 250  Q
    || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272078 atgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 34471 - 34724
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||    
T  34471 ttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaa 34570  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 201  Q
    |   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  34571 tatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 34669  T
Q  202 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34670 gatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  103 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 201  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  202 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 252  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 37075 - 37328
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  37075 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 37174  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |    
T  37175 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 37272  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
     ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37273 agatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41902 - 41648
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  41902 tgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 41803  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   |||||      
T  41802 aatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaa 41704  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41703 tgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 256
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  150 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 249  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  250 gatgatg 256  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13760 - 13506
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  13760 tgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 13661  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 200  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| |    
T  13660 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaat 13562  T
Q  201 tgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    |||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13561 tgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  150 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 249  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  250 gatgatg 256  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 51191 - 51328
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  51191 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaa 51290  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 138  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  51291 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13480
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  104 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 160  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 89463 - 89600
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  89463 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 89562  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 138  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  89563 aattataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22794 - 22656
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  22794 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 22695  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22694 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27049 - 26911
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  27049 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 26950  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26949 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1729
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||    
T  1591 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 1690  T
Q  101 aatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 139  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1691 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  159 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 256  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3360
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 85  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3441 tgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  200 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 254  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 56108 - 56195
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 88  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56108 tgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 90  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  42 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 88  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 8011
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  8051 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 3565 - 3525
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  3565 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University