View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19355_low_3 (Length: 494)

Name: NF19355_low_3
Description: NF19355
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19355_low_3
NF19355_low_3
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (17-372)||(5657313-5657669)
chr7 (17-376)||(6546488-6546848)
chr7 (17-367)||(15612591-15612941)
chr7 (17-356)||(25691376-25691717)
chr7 (17-372)||(8861258-8861614)
chr7 (17-367)||(4582897-4583248)
chr7 (17-367)||(18797307-18797656)
chr7 (17-357)||(22687227-22687560)
chr7 (17-356)||(21991625-21991956)
chr7 (17-367)||(32820885-32821236)
chr7 (17-367)||(27283722-27284073)
chr7 (17-367)||(37109850-37110203)
chr7 (17-356)||(9355658-9355998)
chr7 (17-367)||(30055504-30055856)
chr7 (40-356)||(33688117-33688433)
chr7 (17-344)||(12165753-12166072)
chr7 (17-356)||(41764910-41765250)
chr7 (17-367)||(24211719-24212071)
chr7 (17-356)||(23111179-23111521)
chr7 (17-367)||(32432435-32432781)
chr7 (17-367)||(17842416-17842769)
chr7 (54-367)||(43686019-43686332)
chr7 (17-367)||(31578896-31579252)
chr7 (17-354)||(48928129-48928466)
chr7 (17-372)||(10359046-10359402)
chr7 (17-367)||(11071183-11071532)
chr7 (17-356)||(37347011-37347350)
chr7 (17-356)||(7334783-7335122)
chr7 (17-347)||(10481601-10481934)
chr7 (75-356)||(38258534-38258816)
chr7 (17-345)||(29173540-29173851)
chr7 (17-343)||(26980325-26980635)
chr7 (117-367)||(27421313-27421562)
chr7 (19-276)||(44598735-44598994)
chr7 (17-367)||(31520573-31520906)
chr7 (17-284)||(37703330-37703590)
chr7 (17-252)||(15672591-15672830)
chr7 (17-338)||(43925113-43925424)
chr7 (17-367)||(12390481-12390813)
chr7 (98-356)||(48928477-48928735)
chr7 (17-226)||(26587924-26588126)
chr7 (17-237)||(46480961-46481182)
chr7 (17-331)||(35353122-35353437)
chr7 (156-367)||(44413351-44413563)
chr7 (115-261)||(37704241-37704387)
chr7 (221-367)||(26524364-26524510)
chr7 (17-154)||(44411372-44411510)
chr7 (240-372)||(34362205-34362336)
chr7 (19-323)||(32593040-32593327)
chr7 (17-132)||(37704395-37704511)
chr7 (17-133)||(34362010-34362127)
chr7 (176-331)||(38053500-38053647)
chr7 (56-164)||(38053642-38053751)
chr7 (271-342)||(44598367-44598438)
chr7 (322-367)||(3953734-3953779)
chr7 (306-367)||(8299193-8299254)
chr7 (17-54)||(38258871-38258908)
chr7 (322-373)||(23402371-23402422)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (17-367)||(3879769-3880120)
chr6 (17-367)||(4318652-4319004)
chr6 (17-374)||(7234862-7235222)
chr6 (17-356)||(29182177-29182515)
chr6 (37-367)||(8513236-8513562)
chr6 (17-367)||(20768089-20768436)
chr6 (17-372)||(6091012-6091368)
chr6 (17-356)||(21016948-21017282)
chr6 (17-367)||(33892842-33893183)
chr6 (86-367)||(30353257-30353539)
chr6 (37-367)||(6088911-6089237)
chr6 (110-354)||(15491631-15491875)
chr6 (17-356)||(1945847-1946189)
chr6 (17-356)||(5627405-5627746)
chr6 (111-356)||(7055140-7055385)
chr6 (17-356)||(33618848-33619187)
chr6 (239-363)||(18498440-18498565)
chr6 (20-106)||(7054605-7054692)
chr6 (321-372)||(24662189-24662240)
chr6 (322-367)||(19631752-19631797)
chr6 (322-367)||(30338479-30338524)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (17-367)||(5299783-5300134)
chr8 (17-367)||(38643980-38644331)
chr8 (17-356)||(11727037-11727377)
chr8 (17-367)||(9864150-9864501)
chr8 (17-367)||(16446712-16447063)
chr8 (17-356)||(37970356-37970696)
chr8 (17-367)||(27082675-27083026)
chr8 (17-367)||(36694803-36695154)
chr8 (54-367)||(13307625-13307938)
chr8 (17-372)||(6098350-6098711)
chr8 (17-356)||(1204940-1205280)
chr8 (17-367)||(34894969-34895315)
chr8 (17-356)||(465855-466185)
chr8 (17-367)||(12876111-12876463)
chr8 (17-367)||(43643432-43643783)
chr8 (17-356)||(16222876-16223216)
chr8 (17-356)||(23854268-23854608)
chr8 (18-367)||(40862421-40862771)
chr8 (86-367)||(41910895-41911176)
chr8 (17-299)||(1149469-1149752)
chr8 (17-367)||(39098956-39099297)
chr8 (17-367)||(7890794-7891136)
chr8 (17-356)||(10555042-10555379)
chr8 (17-373)||(33906220-33906563)
chr8 (17-356)||(31933723-31934063)
chr8 (19-356)||(30654421-30654760)
chr8 (17-346)||(44869519-44869850)
chr8 (17-293)||(1953825-1954104)
chr8 (17-244)||(4132523-4132750)
chr8 (17-343)||(8803653-8803974)
chr8 (17-286)||(35459548-35459818)
chr8 (166-367)||(1150092-1150293)
chr8 (176-367)||(34952028-34952219)
chr8 (111-331)||(43025740-43025960)
chr8 (17-131)||(35859172-35859287)
chr8 (177-367)||(41362520-41362707)
chr8 (17-175)||(1149757-1149912)
chr8 (17-188)||(24823231-24823395)
chr8 (17-146)||(34951894-34952024)
chr8 (17-132)||(12587819-12587935)
chr8 (17-223)||(18259229-18259432)
chr8 (17-106)||(33198066-33198155)
chr8 (246-380)||(4133077-4133209)
chr8 (176-252)||(7998411-7998488)
chr8 (306-367)||(15009244-15009305)
chr8 (218-271)||(33197947-33198000)
chr8 (17-69)||(41362723-41362775)
chr8 (301-354)||(24823394-24823447)
chr8 (322-370)||(5018010-5018058)
chr8 (306-382)||(35459825-35459901)
chr8 (322-367)||(28220955-28221000)
chr8 (17-70)||(43025974-43026027)
chr8 (144-188)||(12585297-12585341)
chr8 (48-129)||(34463714-34463793)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (17-356)||(34947952-34948294)
chr4 (17-372)||(55240962-55241317)
chr4 (17-367)||(33341398-33341752)
chr4 (17-372)||(28002843-28003199)
chr4 (17-367)||(7703520-7703863)
chr4 (17-367)||(47253752-47254094)
chr4 (17-367)||(29584057-29584406)
chr4 (17-367)||(55477748-55478103)
chr4 (17-353)||(23761089-23761425)
chr4 (17-367)||(17167716-17168067)
chr4 (17-367)||(17173293-17173644)
chr4 (17-367)||(35020888-35021243)
chr4 (17-367)||(37663598-37663947)
chr4 (17-367)||(25184116-25184467)
chr4 (17-367)||(27396619-27396968)
chr4 (17-367)||(19089310-19089661)
chr4 (16-354)||(19440504-19440843)
chr4 (17-356)||(49375980-49376321)
chr4 (17-356)||(30002498-30002821)
chr4 (17-357)||(50764745-50765074)
chr4 (17-369)||(6864036-6864389)
chr4 (17-356)||(4598007-4598336)
chr4 (17-367)||(36493546-36493896)
chr4 (17-356)||(25700913-25701254)
chr4 (17-356)||(37775683-37776012)
chr4 (17-356)||(879405-879745)
chr4 (17-367)||(32912436-32912788)
chr4 (17-367)||(37287736-37288082)
chr4 (17-367)||(34361348-34361699)
chr4 (17-356)||(46888015-46888354)
chr4 (17-367)||(5047823-5048173)
chr4 (17-354)||(33816373-33816728)
chr4 (17-356)||(50697256-50697596)
chr4 (17-356)||(32592107-32592438)
chr4 (17-348)||(32579466-32579800)
chr4 (56-367)||(38011857-38012169)
chr4 (17-262)||(1815409-1815655)
chr4 (16-356)||(42199743-42200086)
chr4 (115-345)||(54499193-54499425)
chr4 (17-270)||(17272068-17272318)
chr4 (17-367)||(3042614-3042973)
chr4 (92-367)||(35025528-35025796)
chr4 (166-372)||(39397916-39398113)
chr4 (18-284)||(4934071-4934327)
chr4 (31-367)||(9139250-9139569)
chr4 (17-173)||(7152061-7152218)
chr4 (17-146)||(39400232-39400362)
chr4 (17-216)||(46883971-46884165)
chr4 (17-172)||(26896285-26896442)
chr4 (17-132)||(4205222-4205338)
chr4 (17-106)||(35025423-35025512)
chr4 (17-92)||(23431834-23431909)
chr4 (265-367)||(4205119-4205221)
chr4 (289-367)||(4396329-4396407)
chr4 (304-367)||(17272014-17272077)
chr4 (289-367)||(7152236-7152314)
chr4 (256-329)||(23518400-23518473)
chr4 (17-65)||(38012568-38012616)
chr4 (312-356)||(52516611-52516655)
chr4 (316-367)||(20097485-20097536)
chr4 (322-380)||(38811803-38811861)
chr4 (289-367)||(53124290-53124368)
chr4 (322-367)||(38812260-38812305)
chr4 (67-129)||(56050171-56050234)
chr4 (322-356)||(2266856-2266890)
chr4 (322-367)||(51959867-51959912)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (17-356)||(16415655-16415996)
chr1 (17-356)||(47279199-47279539)
chr1 (17-367)||(38823213-38823564)
chr1 (19-365)||(27532809-27533155)
chr1 (17-372)||(3309142-3309503)
chr1 (17-367)||(2959747-2960098)
chr1 (17-331)||(32216090-32216405)
chr1 (17-367)||(3534931-3535273)
chr1 (17-354)||(7078889-7079238)
chr1 (17-367)||(15752028-15752379)
chr1 (17-367)||(30326778-30327129)
chr1 (17-356)||(4330289-4330631)
chr1 (17-356)||(39393393-39393734)
chr1 (17-356)||(8222141-8222477)
chr1 (17-372)||(27227311-27227659)
chr1 (17-341)||(51128884-51129209)
chr1 (17-367)||(238339-238689)
chr1 (17-367)||(34012208-34012554)
chr1 (17-367)||(10181833-10182185)
chr1 (17-356)||(14758051-14758382)
chr1 (17-367)||(15382932-15383283)
chr1 (17-283)||(25160715-25160982)
chr1 (17-367)||(1547286-1547621)
chr1 (17-373)||(42721032-42721386)
chr1 (17-356)||(27267026-27267363)
chr1 (17-356)||(28564609-28564947)
chr1 (17-367)||(19899594-19899946)
chr1 (17-356)||(37451296-37451635)
chr1 (17-351)||(9902880-9903215)
chr1 (17-367)||(15168088-15168446)
chr1 (17-367)||(28769652-28770003)
chr1 (17-356)||(32267044-32267384)
chr1 (17-367)||(30254423-30254773)
chr1 (18-356)||(47682321-47682659)
chr1 (17-356)||(10922737-10923077)
chr1 (17-356)||(11742194-11742516)
chr1 (37-367)||(18422650-18422981)
chr1 (17-338)||(40884841-40885163)
chr1 (18-356)||(31621376-31621719)
chr1 (17-270)||(22170807-22171061)
chr1 (17-356)||(23999357-23999698)
chr1 (18-338)||(27563732-27564053)
chr1 (110-367)||(48620636-48620884)
chr1 (17-331)||(46931446-46931760)
chr1 (17-331)||(27763136-27763451)
chr1 (19-367)||(41926162-41926504)
chr1 (63-367)||(33725472-33725777)
chr1 (19-367)||(37618729-37619073)
chr1 (17-174)||(48353735-48353892)
chr1 (60-285)||(38759610-38759840)
chr1 (17-174)||(1359761-1359919)
chr1 (222-356)||(21289675-21289816)
chr1 (17-132)||(21289834-21289950)
chr1 (18-129)||(31962853-31962965)
chr1 (304-367)||(22170753-22170816)
chr1 (322-367)||(43579245-43579290)
chr1 (306-367)||(30254857-30254918)
chr1 (322-370)||(42663785-42663833)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (17-367)||(19119862-19120213)
chr5 (17-367)||(30969145-30969496)
chr5 (17-356)||(5837569-5837909)
chr5 (17-367)||(36866765-36867116)
chr5 (17-374)||(31786467-31786825)
chr5 (17-367)||(8741706-8742059)
chr5 (17-367)||(7693233-7693575)
chr5 (17-367)||(27330309-27330658)
chr5 (17-372)||(40133383-40133739)
chr5 (17-367)||(25500747-25501098)
chr5 (17-367)||(38528058-38528408)
chr5 (17-367)||(39572822-39573165)
chr5 (17-356)||(699164-699504)
chr5 (17-367)||(22980796-22981147)
chr5 (17-356)||(9200247-9200578)
chr5 (17-356)||(33908247-33908586)
chr5 (17-367)||(36860426-36860778)
chr5 (17-372)||(23116051-23116399)
chr5 (17-367)||(12910353-12910709)
chr5 (17-356)||(22019646-22019977)
chr5 (17-356)||(35511303-35511638)
chr5 (17-367)||(31705433-31705783)
chr5 (17-356)||(22255195-22255536)
chr5 (18-356)||(27318311-27318648)
chr5 (17-367)||(32563152-32563494)
chr5 (17-356)||(35933916-35934250)
chr5 (17-286)||(15992361-15992631)
chr5 (17-356)||(7208685-7209025)
chr5 (17-373)||(15724487-15724842)
chr5 (17-367)||(22973903-22974254)
chr5 (102-367)||(26268077-26268343)
chr5 (17-367)||(35826307-35826655)
chr5 (17-367)||(8466748-8467080)
chr5 (58-313)||(6824343-6824599)
chr5 (17-316)||(5829955-5830246)
chr5 (17-356)||(8436980-8437319)
chr5 (17-372)||(14409162-14409503)
chr5 (17-331)||(17157852-17158166)
chr5 (17-356)||(24886116-24886441)
chr5 (20-356)||(1428983-1429306)
chr5 (17-328)||(42342775-42343075)
chr5 (21-356)||(13956187-13956506)
chr5 (17-299)||(35504436-35504719)
chr5 (128-356)||(5112247-5112474)
chr5 (29-367)||(21088599-21088938)
chr5 (18-356)||(43308482-43308813)
chr5 (37-300)||(23954636-23954895)
chr5 (18-333)||(28416373-28416665)
chr5 (112-356)||(14919445-14919690)
chr5 (17-216)||(2888266-2888466)
chr5 (17-223)||(25669733-25669930)
chr5 (218-331)||(25668689-25668801)
chr5 (17-147)||(25889593-25889724)
chr5 (234-356)||(11898016-11898138)
chr5 (17-110)||(26269070-26269163)
chr5 (293-374)||(16004474-16004556)
chr5 (306-367)||(26317795-26317856)
chr5 (17-70)||(43254156-43254209)
chr5 (316-356)||(13380509-13380549)
chr5 (322-367)||(10237417-10237462)
chr5 (289-330)||(22255615-22255656)
chr5 (322-367)||(22616497-22616542)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (17-367)||(11909-12263)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (17-356)||(52040753-52041094)
chr3 (17-367)||(7327313-7327665)
chr3 (17-373)||(4015448-4015804)
chr3 (19-370)||(32373463-32373813)
chr3 (17-367)||(46297593-46297944)
chr3 (17-367)||(34132929-34133280)
chr3 (17-367)||(21193600-21193952)
chr3 (17-356)||(53228983-53229324)
chr3 (30-330)||(2007964-2008264)
chr3 (17-367)||(26941091-26941442)
chr3 (17-367)||(37157702-37158053)
chr3 (17-367)||(37203061-37203413)
chr3 (17-356)||(44891512-44891842)
chr3 (17-367)||(39282647-39282997)
chr3 (17-324)||(42505906-42506214)
chr3 (17-367)||(48354935-48355286)
chr3 (17-367)||(44186348-44186683)
chr3 (37-367)||(11466818-11467142)
chr3 (17-355)||(11357212-11357535)
chr3 (17-356)||(3655031-3655373)
chr3 (17-367)||(22450962-22451313)
chr3 (17-354)||(25579746-25580084)
chr3 (17-356)||(29099360-29099691)
chr3 (17-367)||(40552090-40552441)
chr3 (17-316)||(24707946-24708246)
chr3 (17-354)||(33378616-33378951)
chr3 (49-348)||(45174516-45174819)
chr3 (17-331)||(3362283-3362600)
chr3 (17-249)||(33698265-33698498)
chr3 (17-367)||(4761479-4761833)
chr3 (111-367)||(35844320-35844576)
chr3 (17-356)||(47481527-47481868)
chr3 (54-300)||(43348319-43348565)
chr3 (17-356)||(24488793-24489133)
chr3 (17-356)||(40935996-40936318)
chr3 (17-247)||(22622549-22622780)
chr3 (17-331)||(21009632-21009948)
chr3 (17-311)||(14586511-14586796)
chr3 (17-270)||(46994492-46994746)
chr3 (20-370)||(22445899-22446250)
chr3 (17-356)||(43975723-43976056)
chr3 (37-267)||(29163912-29164134)
chr3 (31-328)||(54828546-54828843)
chr3 (159-367)||(51212955-51213163)
chr3 (17-328)||(38591727-38592043)
chr3 (17-367)||(54505802-54506153)
chr3 (17-253)||(36012245-36012484)
chr3 (17-212)||(1089842-1090038)
chr3 (137-342)||(53176074-53176278)
chr3 (17-372)||(27480189-27480566)
chr3 (189-372)||(20373300-20373483)
chr3 (49-367)||(11835496-11835788)
chr3 (17-152)||(51212602-51212738)
chr3 (30-131)||(50475041-50475143)
chr3 (78-204)||(20373136-20373263)
chr3 (17-175)||(11356989-11357140)
chr3 (288-357)||(2613894-2613963)
chr3 (289-367)||(33698186-33698260)
chr3 (48-127)||(53811596-53811676)
chr3 (221-284)||(53811698-53811767)
chr3 (17-54)||(20373094-20373131)
chr3 (322-367)||(40640634-40640679)
chr3 (306-367)||(55343405-55343466)
chr3 (322-356)||(32180747-32180781)
chr3 (323-368)||(4556542-4556587)
chr3 (321-374)||(42204338-42204391)
chr3 (322-367)||(45879498-45879543)
chr3 (322-370)||(23165838-23165886)
chr3 (322-370)||(38392628-38392676)
chr3 (322-374)||(53811976-53812028)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (17-367)||(4166925-4167276)
chr2 (17-367)||(33660226-33660568)
chr2 (18-367)||(4263926-4264277)
chr2 (17-367)||(31570583-31570934)
chr2 (19-372)||(4478366-4478717)
chr2 (17-356)||(19424491-19424817)
chr2 (17-331)||(33709081-33709396)
chr2 (17-374)||(33550832-33551193)
chr2 (17-367)||(13711467-13711813)
chr2 (17-331)||(43648094-43648409)
chr2 (66-367)||(36641989-36642293)
chr2 (17-356)||(26357591-26357931)
chr2 (17-367)||(3176942-3177293)
chr2 (17-367)||(4763631-4763985)
chr2 (17-367)||(43770697-43771038)
chr2 (32-372)||(19313850-19314186)
chr2 (17-331)||(27349797-27350102)
chr2 (17-367)||(2325227-2325570)
chr2 (17-367)||(11366229-11366581)
chr2 (17-376)||(29241994-29242347)
chr2 (17-331)||(37905747-37906064)
chr2 (35-356)||(44285963-44286285)
chr2 (17-356)||(18494130-18494457)
chr2 (17-356)||(39167218-39167552)
chr2 (19-367)||(41465512-41465853)
chr2 (17-367)||(44913665-44914021)
chr2 (17-270)||(41960940-41961194)
chr2 (17-344)||(19289172-19289500)
chr2 (98-367)||(41463780-41464050)
chr2 (77-367)||(17071646-17071937)
chr2 (17-356)||(5881548-5881883)
chr2 (77-367)||(17054005-17054296)
chr2 (17-300)||(7006787-7007054)
chr2 (17-269)||(31861953-31862206)
chr2 (17-373)||(35958906-35959246)
chr2 (117-372)||(33902066-33902319)
chr2 (66-284)||(45327806-45328025)
chr2 (17-175)||(19500764-19500923)
chr2 (112-229)||(18258232-18258349)
chr2 (225-343)||(41051263-41051382)
chr2 (17-128)||(41051149-41051260)
chr2 (17-83)||(18257387-18257453)
chr2 (187-267)||(19501760-19501839)
chr2 (17-68)||(33902317-33902368)
chr2 (304-367)||(41960886-41960949)
chr2 (17-83)||(41463439-41463505)
chr2 (322-355)||(6177790-6177823)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (17-367)||(137-482)
scaffold0002 (17-316)||(408260-408559)
scaffold0002 (137-349)||(94335-94547)
scaffold0002 (19-129)||(93933-94044)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (17-367)||(7890-8241)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (17-367)||(43960-44310)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (17-367)||(154477-154827)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (56-322)||(267331-267600)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (17-356)||(145846-146187)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (289-356)||(42362-42429)
scaffold0009 (306-367)||(100824-100885)
scaffold0009 (26-92)||(100994-101058)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (321-372)||(12137-12188)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 5657313 - 5657669
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  5657313 atttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatct 5657412  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  5657413 ttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaag 5657512  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5657513 tgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 5657612  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  5657613 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 5657669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6546848 - 6546488
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  6546848 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatct 6546749  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6546748 ttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 6546649  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  6546648 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgct 6546549  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataaca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  6546548 atagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttccaaaaca 6546488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 15612591 - 15612941
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  15612591 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatct 15612690  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15612691 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaag 15612790  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15612791 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataacac-tttgatgtt 15612889  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  15612890 atagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattt 15612941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 25691376 - 25691717
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||  |||||    
T  25691376 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatct 25691475  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  25691476 ttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaa 25691575  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggt-gttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    | |||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||||    
T  25691576 tgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgt 25691675  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25691676 tatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgacttca 25691717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8861614 - 8861258
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgc-atct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |||  ||||    
T  8861614 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatct 8861515  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  8861514 ttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaa 8861415  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  8861414 tgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgct 8861315  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  8861314 atagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 8861258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4583248 - 4582897
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||    
T  4583248 atttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatct 4583149  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  4583148 ttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaa 4583049  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||  |    
T  4583048 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatact 4582949  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  4582948 atagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 4582897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18797656 - 18797307
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | | | |||    
T  18797656 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatct 18797557  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18797556 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaag 18797457  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||     
T  18797456 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgt- 18797358  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18797357 -tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 18797307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22687560 - 22687227
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||     
T  22687560 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcc 22687461  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||        ||| || |||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22687460 ttaaca--------gagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 22687369  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22687368 tgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgtt 22687269  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcat 357  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22687268 atagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcat 22687227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21991956 - 21991625
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    ||| |||||| ||||||||     || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  21991956 atttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatct 21991866  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21991865 ttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 21991766  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  21991765 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgct 21991666  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  21991665 atagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttca 21991625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 32820885 - 32821236
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  32820885 atttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggaatct 32820984  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||     
T  32820985 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaac 32821084  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32821085 tgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgtt 32821184  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  32821185 atattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattt 32821236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27284073 - 27283722
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  27284073 atttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatct 27283974  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27283973 ttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaag 27283874  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  27283873 tatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgtt 27283774  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| | || ||||||  |||||||||    
T  27283773 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattt 27283722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37110203 - 37109850
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  37110203 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatct 37110104  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaag--ataggataaaattagatta 213  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  37110103 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatatta 37110004  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||| |||    
T  37110003 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatg 37109904  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  37109903 ttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattt 37109850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 9355658 - 9355998
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  9355658 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatct 9355757  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9355758 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaag 9355857  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| ||| |||| ||| |    
T  9355858 tgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgct 9355957  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  9355958 atagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttca 9355998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30055856 - 30055504
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  30055856 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatct 30055757  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  30055756 ttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaag 30055657  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  30055656 tgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatatt 30055557  T
Q  316 atagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  30055556 atagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 30055504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 40 - 356
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688433
Alignment:
Q  40 ttaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtg 138  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  139 atatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaa 238  Q
    ||||||| ||||||| || | ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 33688316  T
Q  239 ttgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaa 338  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33688317 ttgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaa 33688415  T
Q  339 gtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  33688416 gtcattctcataacttca 33688433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12166072 - 12165753
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  12166072 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcatct 12165973  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12165972 ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 12165882  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |    
T  12165881 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgct 12165782  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcatt 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12165781 atagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 41764910 - 41765250
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||    
T  41764910 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatct 41765009  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  41765010 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaag 41765109  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| |    
T  41765110 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgct 41765209  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  41765210 atagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttca 41765250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24212071 - 24211719
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| | ||    
T  24212071 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatc 24211972  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| | || || |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  24211971 tttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaa 24211872  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  24211871 gtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgt 24211772  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  24211771 tatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 24211719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23111521 - 23111179
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgc-atct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||  | ||||| ||| ||||||||| |||  ||||    
T  23111521 atttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatct 23111422  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggata--aaattagatta 213  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  || ||||  |||||||||||    
T  23111421 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagatta 23111322  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||| | ||||||||    
T  23111321 agtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatg 23111222  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23111221 ttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgacttca 23111179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32432781 - 32432435
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  32432781 atttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 32432682  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||| |||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||     
T  32432681 ttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaac 32432582  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||         
T  32432581 tgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttg----- 32432487  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||  |||||||||    
T  32432486 atagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattt 32432435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 17842416 - 17842769
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  17842416 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatct 17842515  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaag--ataggataaaattagatta 213  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  17842516 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatatta 17842615  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||| |||    
T  17842616 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatg 17842715  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  17842716 ttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattt 17842769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43686332 - 43686019
Alignment:
Q  54 tgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatag 152  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||    
T  43686332 tgattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatag 43686233  T
Q  153 ttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  43686232 ttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactata 43686133  T
Q  253 aagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgac 352  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||    
T  43686132 gggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgac 43686034  T
Q  353 ttcattatagaattt 367  Q
    ||||  |||||||||    
T  43686033 ttcaccatagaattt 43686019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 31578896 - 31579252
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  31578896 atttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatct 31578995  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| | || || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31578996 ttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaag 31579095  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgta-----caaacagtatggtgttactcacaacacttttg 310  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||      |||||||  |||||||||||  ||| |||||    
T  31579096 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttg 31579195  T
Q  311 atgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||  |||||||||    
T  31579196 atgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattt 31579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Original strand, 48928129 - 48928466
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||| ||| |    
T  48928129 atttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcattt 48928228  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||  ||| ||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48928229 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaag 48928328  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  48928329 tgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgg-gactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgtt 48928427  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48928428 atagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 10359046 - 10359402
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  10359046 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatct 10359145  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattaga-ttaa 214  Q
    ||||||||||||||||| || || | | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  10359146 ttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaa 10359245  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||     
T  10359246 gtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactat-cagactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgc 10359344  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||||   |||| || || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  10359345 tataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttccat 10359402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11071532 - 11071183
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgcatctt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||  ||||    
T  11071532 atttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg--tctt 11071435  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    |||||||| |||| || || |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11071434 taacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagc 11071335  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     || | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| | | | |||||||| ||    
T  11071334 gtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatatttttgatgata 11071235  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagt-cattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||  |||||| || | |||| | |||| |||||||||||  |||||||||    
T  11071234 tagtactaactttaccaaaaaaatacattttcatgacttcaccatagaattt 11071183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37347350 - 37347011
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  37347350 atttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatct 37347251  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  37347250 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaag 37347152  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  | | |||||||| |    
T  37347151 tgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggt 37347052  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  37347051 atagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttca 37347011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7335122 - 7334783
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||  | | | |||    
T  7335122 atttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatct 7335023  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||  || || |||||| || ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7335022 ttaacattcaaact-agttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaag 7334924  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || ||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  |||  ||| |||||    
T  7334923 tgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgtt 7334824  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  7334823 atagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgacttca 7334783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10481934 - 10481601
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||   || ||||||||  ||| | |||    
T  10481934 atttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatct 10481835  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    || ||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  10481834 ttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaag 10481735  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagt-atggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
      || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||   |||||||||||  | | |||| ||||    
T  10481734 cgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgt 10481635  T
Q  315 tatagtgttaacttcact-agaaaagtcattctc 347  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  10481634 tatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattctc 10481601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258534
Alignment:
Q  75 caacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtg 173  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  174 gggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcca 273  Q
    |||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 38258617  T
Q  274 ctgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||    
T  38258616 ttgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttca 38258534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29173851 - 29173540
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| ||| |    
T  29173851 atttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-t 29173753  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| | ||||                 |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29173752 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtaacactt-----------------aaaacaaggtaggataaaattagattaag 29173670  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |    
T  29173669 tgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatact 29173570  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattc 345  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29173569 acagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26980635 - 26980325
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  26980635 atttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatct 26980536  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||                 |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26980535 ttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagaataaaattagattaag 26980453  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  26980452 tgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgct 26980353  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcat 343  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  26980352 ataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421562
Alignment:
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27421412  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  27421413 gtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgtta 27421511  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  27421512 tagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaattt 27421562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44598994 - 44598735
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattact---gattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catc 114  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  44598994 ttttaaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatc 44598897  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44598896 tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaa 44598797  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactg 276  Q
     | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  44598796 atgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgccactg 44598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 31520573 - 31520906
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  31520573 atttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatct 31520672  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||                 |||||||| || |||||||||||||||||    
T  31520673 ttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtatgataaaattagattaag 31520755  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| | | |||||||| |    
T  31520756 tgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggt 31520854  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  31520855 atagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcataaaattt 31520906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Original strand, 37703330 - 37703590
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  37703330 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatct 37703429  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37703430 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaag 37703529  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaaca 284  Q
    | || |||| ||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37703530 tgtagtcttattaatc--------tgatgatactatggagactgaacttttgatgtcactatacaaaca 37703590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Original strand, 15672591 - 15672830
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatatt---ttatccttg-ca 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||   ||||| ||| ||    
T  15672591 atttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggca 15672690  T
Q  113 tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagatt 212  Q
    |||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15672691 tctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 15672790  T
Q  213 aagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatg 252  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15672791 aagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43925424 - 43925113
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||      ||| ||||||||| ||| |||||    
T  43925424 atttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtattattttatcgttggcatct 43925331  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||| ||| || ||||| |||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  43925330 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaag 43925231  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||| |||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    ||  |||||||||||||||| |||| ||  |    
T  43925230 tgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtaca----gtgaggtgttactcacaacattttttatact 43925136  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaa 338  Q
    | | |||||||||||||| ||||    
T  43925135 acaatgttaacttcactaaaaaa 43925113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 12390481 - 12390813
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  12390481 atttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatct 12390580  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||| | ||| || |||||| ||||||  || |||||||||| ||||                 |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  12390581 ttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtga--gtcttaagtgttacactt-----------------aaaagaaggtagaataaaattagattaag 12390661  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  12390662 tgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgtt 12390761  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||  |||||||||    
T  12390762 atagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattt 12390813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 356
Target Start/End: Original strand, 48928477 - 48928735
Alignment:
Q  98 tattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagat 196  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||  ||| ||||| || ||||||||| |||||| ||  |    
T  48928477 tattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgt 48928576  T
Q  197 aggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttac 296  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||| |||    
T  48928577 aggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgg-gactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctac 48928675  T
Q  297 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48928676 tcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 48928735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 26587924 - 26588126
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  26587924 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatct 26588023  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||        ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26588024 ttaaca--------gagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 26588115  T
Q  216 tttattcttgt 226  Q
    | |||||||||    
T  26588116 tgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 46480961 - 46481182
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  46480961 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatct 46481060  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||| || |||    
T  46481061 ttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaag 46481160  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatga 237  Q
    | || |||||||||||| ||||    
T  46481161 tatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35353437 - 35353122
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||    
T  35353437 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatct 35353338  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| | || || |||||| ||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| || |    |  |  | |||     
T  35353337 ttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttacatctagtaa- 35353239  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactg-aacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    |  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||| |||  ||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||     
T  35353238 tgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgc 35353139  T
Q  315 tatagtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||| |||||||    
T  35353138 tatagtgttgacttcac 35353122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413563
Alignment:
Q  156 taagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaag 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  256 actgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcact-agaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    || |||||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactt 44413550  T
Q  355 cattatagaattt 367  Q
     |  |||||||||    
T  44413551 taccatagaattt 44413563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704241
Alignment:
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 37704288  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaa 261  Q
    || || |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||    
T  37704287 gtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 367
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524510
Alignment:
Q  221 tcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagt 320  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |   |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  321 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 26524510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 44411372 - 44411510
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  44411372 atttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatct 44411471  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagtt 154  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  44411472 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtt 44411510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 372
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362336
Alignment:
Q  240 tgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaag 339  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  340 tcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||| ||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaattttccat 34362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 323
Target Start/End: Original strand, 32593040 - 32593327
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catcttt 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||    
T  32593040 ttttaaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatcttt 32593139  T
Q  118 aacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtt 217  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||| |||||| ||||                 |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |     
T  32593140 aacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatg 32593222  T
Q  218 tattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttat 317  Q
     | | ||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||| |||    
T  32593223 cagttttgataatctgatgaattgatgatactgtg-agactgaacttttgataccaccatataaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctat 32593321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 37704511 - 37704395
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| || ||||||    
T  37704511 atttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatct 37704412  T
Q  116 ttaacatgcaaacagag 132  Q
    |||||||||||| ||||    
T  37704411 ttaacatgcaaatagag 37704395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 34362010 - 34362127
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  || ||||||||| |||  || |    
T  34362010 atttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatattt 34362109  T
Q  116 ttaacatgcaaacagaga 133  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34362110 ttaacatgcaaacagaga 34362127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38053647 - 38053500
Alignment:
Q  176 gtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccact 275  Q
    |||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||||| || ||||||||||        ||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |    
T  38053647 gtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcatt 38053556  T
Q  276 gtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcac 331  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  38053555 gtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcac 38053500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053642
Alignment:
Q  56 attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagtt 154  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| | |||||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||||     
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  155 ttaagtgtta 164  Q
    ||||||||||    
T  38053651 ttaagtgtta 38053642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44598438 - 44598367
Alignment:
Q  271 ccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtca 342  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  44598438 ccactgtccaaacagtagagtgttactcacaacatttttgatattatagtattaacttcacgagaagagtca 44598367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3953779 - 3953734
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3953779 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcatcatagaattt 3953734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8299254 - 8299193
Alignment:
Q  306 ttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  8299254 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 8299193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 38258908 - 38258871
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagt 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38258908 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 38258871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 373
Target Start/End: Original strand, 23402371 - 23402422
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  23402371 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcgccatagaattttccata 23402422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 3879769 - 3880120
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  3879769 atttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatct 3879868  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3879869 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataag 3879968  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  3879969 tatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatact 3880068  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  3880069 ataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattt 3880120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 4318652 - 4319004
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||||| ||| ||| |||||    
T  4318652 atttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttgacatct 4318751  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttagattaa 214  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4318752 ttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaa 4318851  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4318852 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgt 4318951  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4318952 tatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 4319004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 374
Target Start/End: Original strand, 7234862 - 7235222
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactg---attaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-ca 112  Q
    ||||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||    
T  7234862 atttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggca 7234961  T
Q  113 tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagatt 212  Q
    | ||||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7234962 tttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 7235061  T
Q  213 aagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgat 312  Q
    ||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  7235062 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatg-agactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgat 7235160  T
Q  313 gttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 374  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  7235161 gttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccataa 7235222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29182515 - 29182177
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||   ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  29182515 atttttaaattgttgattgttgattaatgatcagta---attcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatct 29182419  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg-tgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  29182418 ttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaa 29182319  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29182318 gtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 29182219  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||    
T  29182218 tatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttca 29182177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8513562 - 8513236
Alignment:
Q  37 tgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatg 135  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  8513562 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttg 8513463  T
Q  136 gtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttagattaagtttattcttgttaatctaa 234  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||      ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |    
T  8513462 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtta------aaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatga 8513369  T
Q  235 tgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactag 334  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  8513368 tgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccag 8513269  T
Q  335 aaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8513268 aaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 8513236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20768436 - 20768089
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  20768436 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 20768337  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| ||| |||  | |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20768336 ttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaag 20768237  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatgg-tgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
      || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||     
T  20768236 --taatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccact-aacaaaca--atggatgctactcactacacttttgatgc 20768142  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20768141 tatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 20768089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 6091012 - 6091368
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || | ||||    
T  6091012 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatct 6091111  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagt-tttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6091112 ttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaa 6091211  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||| |   ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  6091212 gtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttttatgt 6091311  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    || | ||||||||| || | |||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  6091312 taca-tgttaactttaccaaaaaaattattttcatgacttcacaatagaatttcccat 6091368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 21016948 - 21017282
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || |||      ||||||||| ||| ||| |    
T  21016948 atttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacgtac------tattttatcgttgacatat 21017041  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  21017042 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaag 21017141  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||||||||| |||| ||  |    
T  21017142 tttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatact 21017241  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    | | |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  21017242 acaatgttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttca 21017282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 33892842 - 33893183
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| |||||    
T  33892842 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatct 33892941  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||         |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33892942 ttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaag 33893032  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||  || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33893033 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 33893131  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |  |||||||||    
T  33893132 atagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattt 33893183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 367
Target Start/End: Original strand, 30353257 - 30353539
Alignment:
Q  86 acttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacat 184  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  30353257 acttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacac 30353356  T
Q  185 ttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaaca 284  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30353357 ttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaaca 30353456  T
Q  285 gtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||  | | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30353457 gtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 30353539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6089237 - 6088911
Alignment:
Q  37 tgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatg 135  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  6089237 tgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttg 6089138  T
Q  136 gtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttagattaagtttattcttgttaatctaa 234  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||      ||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |    
T  6089137 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgtta------aaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctga 6089044  T
Q  235 tgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactag 334  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  6089043 tgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccag 6088944  T
Q  335 aaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  6088943 aaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 6088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15491875 - 15491631
Alignment:
Q  110 gcatctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattag 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  15491875 gcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 15491776  T
Q  210 attaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacactttt 309  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  15491775 attaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacactttt 15491676  T
Q  310 gatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15491675 gatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1946189 - 1945847
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  1946189 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatc 1946090  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  1946089 tttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaa 1945990  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||    
T  1945989 gtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgt 1945890  T
Q  315 tatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  1945889 tatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttca 1945847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5627746 - 5627405
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  5627746 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 5627647  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||   ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  5627646 tttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaa 5627547  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||  |||||||||||  | | |||| ||||    
T  5627546 gtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgt 5627447  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  5627446 tatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttca 5627405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 356
Target Start/End: Original strand, 7055140 - 7055385
Alignment:
Q  111 catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattaga 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| || |||||||||| |    
T  7055140 catctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattata 7055239  T
Q  211 ttaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttg 310  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||  ||||||||| |  | | ||||     
T  7055240 ttaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatatttttt 7055339  T
Q  311 atgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  7055340 atgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttca 7055385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33619187 - 33618848
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgat---taatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-ca 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||    
T  33619187 atttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggca 33619088  T
Q  113 tctttaac-----atgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaatt 207  Q
    ||||||||     ||||||||| || || |||||| ||| |||| | |||||||| | ||||  | |||||||||| |        | ||||||||||||    
T  33619087 tctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcacacttc-tagggtgttacact--------ggtaggataaaatt 33618997  T
Q  208 agattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacactt 307  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |  | || ||||||| ||||||    
T  33618996 agattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctactcactacactt 33618897  T
Q  308 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  33618896 ttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagtatttcccatgacttca 33618848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 239 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498440
Alignment:
Q  239 ttgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatgg-tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaa 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  338 agtcattctcatgacttcattataga 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactataga 18498440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 7054605 - 7054692
Alignment:
Q  20 tttaaattgttgattactgattaatgattaatagt-gattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatc 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  7054605 tttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatc 7054692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 372
Target Start/End: Original strand, 24662189 - 24662240
Alignment:
Q  321 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  24662189 gttaacttcactagaaaagtcattatcatgactttaccatagaattttccat 24662240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19631797 - 19631752
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  19631797 ttaacttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 19631752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30338524 - 30338479
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  30338524 ttaacttcactaaaaaagtcattctcacaacttcatcatagaattt 30338479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 5299783 - 5300134
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgc-atct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||  ||||    
T  5299783 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatct 5299882  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5299883 ttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaag 5299982  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |    
T  5299983 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgct 5300082  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5300083 atagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 5300134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38644331 - 38643980
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  38644331 atttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatct 38644232  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38644231 ttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 38644132  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38644131 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 38644032  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  38644031 atagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattt 38643980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11727377 - 11727037
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  11727377 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatct 11727278  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  11727277 ttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaa 11727178  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11727177 tgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgtt 11727078  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  11727077 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttca 11727037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9864501 - 9864150
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  9864501 atttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggcatct 9864402  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9864401 ttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaag 9864302  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |    
T  9864301 tgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatact 9864202  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9864201 atagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattt 9864150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 16446712 - 16447063
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  16446712 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatct 16446811  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16446812 ttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaag 16446911  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16446912 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgtt 16447011  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  16447012 atagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 16447063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 37970356 - 37970696
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |  | ||||    
T  37970356 atttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatct 37970455  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37970456 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaag 37970555  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  37970556 tgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtt 37970655  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37970656 atagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttca 37970696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 27082675 - 27083026
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  27082675 atttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 27082774  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  27082775 ttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaag 27082874  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |    
T  27082875 tgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgct 27082974  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  27082975 atagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattt 27083026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 36694803 - 36695154
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  36694803 atttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatct 36694902  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36694903 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaag 36695002  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36695003 tgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatatt 36695102  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  36695103 atagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattt 36695154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13307938 - 13307625
Alignment:
Q  54 tgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatag 152  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13307938 tgattcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag 13307840  T
Q  153 ttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatg 252  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  13307839 tcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatg 13307740  T
Q  253 aagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgac 352  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13307739 gggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgac 13307640  T
Q  353 ttcattatagaattt 367  Q
    ||||  |||||||||    
T  13307639 ttcaccatagaattt 13307625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 6098350 - 6098711
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttat-----ccttg- 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||     | |||     
T  6098350 atttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtattgtatcgttgg 6098449  T
Q  111 catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattaga 210  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6098450 catctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattaga 6098549  T
Q  211 ttaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttg 310  Q
    |||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | | |||||    
T  6098550 ttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttg 6098649  T
Q  311 atgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  6098650 atgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttccat 6098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1205280 - 1204940
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||  | |||    
T  1205280 atttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatct 1205181  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1205180 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaag 1205081  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  1205080 tgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgtt 1204981  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1204980 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 1204940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34895315 - 34894969
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| |||||    
T  34895315 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatct 34895216  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||     |||||| | |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34895215 ttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaag 34895121  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  34895120 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgtt 34895021  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34895020 atagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 34894969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 466185 - 465855
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  466185 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatct 466086  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  466085 ttaacatgcaaacagagttgctgatat-atgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaag 465996  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  465995 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 465896  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  465895 atcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttca 465855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12876463 - 12876111
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  12876463 attttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 12876364  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagt-tttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12876363 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaa 12876264  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || |    
T  12876263 gtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatat 12876164  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |  |||||||||    
T  12876163 tatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattt 12876111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 43643432 - 43643783
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | | | | |    
T  43643432 atttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaattt 43643531  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  43643532 ttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaag 43643631  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  43643632 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgtt 43643731  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43643732 atagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattt 43643783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16223216 - 16222876
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  16223216 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattggaatct 16223117  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||| ||||||||| || || |||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16223116 ttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaag 16223017  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||   ||||||| | | |||| |||||    
T  16223016 tgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgtt 16222917  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16222916 atagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttca 16222876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 23854268 - 23854608
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | | | |||    
T  23854268 atttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatct 23854367  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||     
T  23854368 ttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaat 23854467  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||  |||||||||||  ||| |||| |||||    
T  23854468 tgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgtt 23854567  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23854568 atagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttca 23854608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40862771 - 40862421
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  40862771 tttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctt 40862672  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    |||||| |||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  40862671 taacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagt 40862572  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaaca-cttttgatgtt 315  Q
     |||| |||||| | | |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  40862571 gtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatg-agactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatatt 40862473  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  40862472 atagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgacttcactatagaattt 40862421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 86 - 367
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41911176
Alignment:
Q  86 acttacaagtaatattttatccttgcatctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatt 185  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttgcatctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacact 41910994  T
Q  186 taaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacag 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||   || ||    
T  41910995 taaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataatag 41911094  T
Q  286 t-atggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  41911095 tgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaaaaatca-tatcatgacttcatcgtagaattt 41911176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Original strand, 1149469 - 1149752
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  1149469 atttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatct 1149568  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  1149569 ttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaag 1149668  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactca 299  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||    
T  1149669 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactca 1149752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 39098956 - 39099297
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || ||||||||| ||| ||| |    
T  39098956 atttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatat 39099055  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  39099056 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaag 39099155  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||  ||  ||||||||||||    
T  39099156 tgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttacttgca--acttttgatgtt 39099253  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||        |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39099254 atag--------tcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 39099297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 7890794 - 7891136
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  7890794 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatct 7890893  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||  || ||||||| |||||| ||    
T  7890894 ttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgag 7890993  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||         | ||||||||||    
T  7890994 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtt---------atttttgatgtt 7891084  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7891085 atagtgttaacttcacaaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 7891136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 10555042 - 10555379
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg--attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-t 113  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||  | | | |    
T  10555042 atttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 10555138  T
Q  114 ctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagatta 213  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||   ||||||||   |||||| |||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10555139 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagatta 10555236  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||  ||| |||| |||    
T  10555237 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatg 10555336  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10555337 ttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttca 10555379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33906563 - 33906220
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  33906563 atttttaaatt--tgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 33906466  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33906465 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaag 33906366  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            || |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||  |    
T  33906365 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaactt------------tataaacagtggggtgctactcactacacttttaatact 33906278  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 373  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||    
T  33906277 atagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttccata 33906220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 31933723 - 31934063
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||  ||| | ||     
T  31933723 atttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatcc 31933822  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||   ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  31933823 ttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaag 31933922  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||||||  | | ||||||| |     
T  31933923 tgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatc 31934022  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  31934023 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttca 31934063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 30654421 - 30654760
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctt 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | | ||    
T  30654421 ttttaaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttt 30654520  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||  || | |||||||| |||||||    
T  30654521 taacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagt 30654620  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  30654621 gtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgtta 30654720  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||    
T  30654721 tagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttca 30654760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44869850 - 44869519
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||   ||| ||||||||| ||| |||||    
T  44869850 atttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatct 44869751  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggat-aaaattagattaa 214  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44869750 ttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaa 44869652  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcac--aacacttttgat 312  Q
    || |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||||  ||  | ||||||  || |||||| ||    
T  44869651 gtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagt-ggggatcactcacaaaatacttttaat 44869553  T
Q  313 gttatagtgttaacttcactagaaaagtcattct 346  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  44869552 gttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattct 44869519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Original strand, 1953825 - 1954104
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| || ||    
T  1953825 attttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaact 1953924  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg-tgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |    
T  1953925 ttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattta 1954024  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgat-gatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgt 293  Q
    || || || | ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  1954025 gtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Original strand, 4132523 - 4132750
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  4132523 atttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 4132622  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4132623 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacactt-aaacaaggtagaataaaattagattaag 4132721  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatg 244  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||    
T  4132722 tgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 343
Target Start/End: Original strand, 8803653 - 8803974
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  8803653 atttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatc 8803752  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  8803753 tttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaa 8803852  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || || ||||||||||       || |||||||||||||| || | |||||| |||   ||||||||||  ||| |||||||||    
T  8803853 gtgtagtcttgttaacctgataaattgatgat-------aggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgt 8803945  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcat 343  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8803946 tatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat 8803974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Original strand, 35459548 - 35459818
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  | | | |||    
T  35459548 atttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatct 35459647  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  35459648 ttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaag 35459747  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 286  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  35459748 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaatcagt 35459818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Original strand, 1150092 - 1150293
Alignment:
Q  166 actttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttt 265  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1150092 actttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttt 1150191  T
Q  266 tgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaat 365  Q
    ||||| |  ||||||||||||  | |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  1150192 tgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaat 1150291  T
Q  366 tt 367  Q
    ||    
T  1150292 tt 1150293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 176 - 367
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952219
Alignment:
Q  176 gtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccact 275  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  276 gtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  34952128 gtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaattt 34952219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43025960 - 43025740
Alignment:
Q  111 catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattaga 210  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  43025960 catctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattaga 43025861  T
Q  211 ttaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttg 310  Q
    |||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||    ||||||||||| || ||| |||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  43025860 ttaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttg 43025761  T
Q  311 atgttatagtgttaacttcac 331  Q
    ||  ||||  |||||||||||    
T  43025760 atactatatcgttaacttcac 43025740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35859287 - 35859172
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  35859287 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatct 35859188  T
Q  116 ttaacatgcaaacaga 131  Q
    ||||||||||||||||    
T  35859187 ttaacatgcaaacaga 35859172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362520
Alignment:
Q  177 tgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactg 276  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||     
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  277 tacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||| |||  |||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactaca-tttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattt 41362520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 1149757 - 1149912
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || | ||||    
T  1149757 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatct 1149856  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggg 175  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||    || |||||||||| ||||||||||    
T  1149857 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Original strand, 24823231 - 24823395
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  24823231 atttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 24823330  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaa 188  Q
    ||        ||||||| || ||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24823331 tt--------aacagagttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacacttaa 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Original strand, 34951894 - 34952024
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||   ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  34951894 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatct 34951993  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatg 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34951994 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg 34952024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12587935 - 12587819
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  12587935 atttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatct 12587836  T
Q  116 ttaacatgcaaacagag 132  Q
    |||||||||||| ||||    
T  12587835 ttaacatgcaaatagag 12587819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18259432 - 18259229
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |    
T  18259432 atttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacattt 18259333  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||   |  || ||||||| |||||     ||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||| |||||     
T  18259332 ttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga----cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaa 18259237  T
Q  216 tttattct 223  Q
    | ||||||    
T  18259236 tgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33198155 - 33198066
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatc 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||    
T  33198155 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatc 33198066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 380
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133209
Alignment:
Q  246 tactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattc 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |   |||| |||   ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 4133174  T
Q  346 tcatgacttcattatagaatttcccataacataat 380  Q
    | ||||||| |  ||| ||||| |||||| |||||    
T  4133175 tgatgacttgaccataaaattttccataaaataat 4133209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998411
Alignment:
Q  176 gtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatg 252  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatg 7998411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15009305 - 15009244
Alignment:
Q  306 ttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15009305 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 15009244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33198000 - 33197947
Alignment:
Q  218 tattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgc 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33198000 tattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 41362775 - 41362723
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaat 69  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41362775 atttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 354
Target Start/End: Original strand, 24823394 - 24823447
Alignment:
Q  301 aacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  24823394 aacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactt 24823447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5018058 - 5018010
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 370  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  5018058 ttaacttcactaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatttccc 5018010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 382
Target Start/End: Original strand, 35459825 - 35459901
Alignment:
Q  306 ttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataacataatca 382  Q
    |||| || ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||    
T  35459825 tttttatattatagtattaactttacgaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcaataacattatca 35459901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 28220955 - 28221000
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  28220955 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgactttatcatagaattt 28221000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 43026027 - 43025974
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatg 70  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  43026027 atttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12585341 - 12585297
Alignment:
Q  144 atgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaa 188  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  12585341 atgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacacttaa 12585297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 34463793 - 34463714
Alignment:
Q  48 taatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaaca 129  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||   | ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34463793 taatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaaca 34463714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 34947952 - 34948294
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  34947952 atttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatct 34948051  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagt--gttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagatta 213  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34948052 ttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaattagatta 34948151  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34948152 agtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 34948251  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34948252 ttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgacttca 34948294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 55240962 - 55241317
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  55240962 atttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 55241061  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  55241062 ttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaag 55241161  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  |    
T  55241162 tgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataat 55241260  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  55241261 atagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 55241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33341752 - 33341398
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  33341752 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 33341653  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33341652 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaag 33341553  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaa----cacttttga 311  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||    || ||||||    
T  33341552 tatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttga 33341454  T
Q  312 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33341453 tgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaattt 33341398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 28002843 - 28003199
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  28002843 atttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 28002942  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28002943 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 28003042  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||  |||| || |||||||||||| |    
T  28003043 tgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgct 28003142  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  28003143 atagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 28003199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7703863 - 7703520
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  7703863 atttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatct 7703764  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7703763 ttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 7703664  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||        |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7703663 tgtattcttgttaatc--------tgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgtt 7703572  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  7703571 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaacatagaattt 7703520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47254094 - 47253752
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| ||||||||  ||| |||||    
T  47254094 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatct 47253995  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47253994 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaag 47253895  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  47253894 tgtattcttgttaatc--------tgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttttgatgat 47253804  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47253803 atagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 47253752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 29584057 - 29584406
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||  ||| | |||    
T  29584057 atttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatct 29584156  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||| | ||||  |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29584157 ttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 29584256  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  29584257 tgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttact--caacacttttgatgtt 29584354  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  29584355 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattt 29584406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 55477748 - 55478103
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| | |||    
T  55477748 atttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttggaatct 55477847  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  55477848 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaag 55477947  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaaca----gtatggtgttactcacaacacttttga 311  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    ||   |||||||||   ||| ||||||    
T  55477948 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttga 55478047  T
Q  312 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  55478048 tgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 55478103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23761425 - 23761089
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgc-atct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||  |||||||| |||  ||||    
T  23761425 atttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatct 23761326  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23761325 ttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggtag-ataaaattagattaag 23761227  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23761226 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgtt 23761127  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgact 353  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23761126 atagtgttaactttacaagaatagtcattctcatgact 23761089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17168067 - 17167716
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  17168067 atttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatct 17167968  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17167967 ttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaag 17167868  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17167867 tgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatatt 17167768  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||| || | ||||||  |||||||||    
T  17167767 ataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaattt 17167716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17173644 - 17173293
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  17173644 atttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatct 17173545  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17173544 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaag 17173445  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17173444 tgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatatt 17173345  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||| || | ||||||  |||||||||    
T  17173344 ataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaattt 17173293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 35020888 - 35021243
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaata----gtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  || ||||||||| ||| |    
T  35020888 atttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgga 35020987  T
Q  113 -tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagat 211  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35020988 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagat 35021087  T
Q  212 taagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttga 311  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  35021088 taagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttga 35021187  T
Q  312 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  35021188 tgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 35021243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 37663598 - 37663947
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  37663598 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatct 37663697  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  37663698 ttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaag 37663797  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||     
T  37663798 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaatgt- 37663896  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
     ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37663897 -tagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 37663947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25184467 - 25184116
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | | | | |    
T  25184467 atttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaattt 25184368  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  25184367 ttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaag 25184268  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  25184267 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgtt 25184168  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25184167 atagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattt 25184116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27396968 - 27396619
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||  | |||||| ||| |||||    
T  27396968 atttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatct 27396871  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| ||| || |||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  27396870 ttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaag 27396771  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  27396770 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgct 27396671  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27396670 ataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 27396619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 19089310 - 19089661
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  19089310 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatct 19089409  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||   || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  19089410 ttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaag 19089509  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  19089510 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatatt 19089609  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  19089610 atagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattt 19089661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Original strand, 19440504 - 19440843
Alignment:
Q  16 aatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  19440504 aatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatc 19440603  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||   ||||| |||| || ||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  19440604 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaa 19440703  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||| |||  ||| |||||||||    
T  19440704 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgt 19440803  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19440804 tatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactt 19440843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49376321 - 49375980
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  49376321 atttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 49376222  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||| || || |||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||||||   | ||||| ||||  || |||||||||||| |||    
T  49376221 ttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaag 49376122  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
      || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| |    
T  49376121 cgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgct 49376022  T
Q  316 atagtgttaacttcactag-aaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  49376021 ataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgacttca 49375980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 30002498 - 30002821
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||    
T  30002498 atttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatct 30002597  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30002598 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaag 30002688  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  30002689 tgtattcttgttaatc--------tgatgatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgct 30002780  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  30002781 acagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttca 30002821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 50765074 - 50764745
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  50765074 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatct 50764975  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||||  ||||||||||||||||||  ||          |||||||||||||||||     
T  50764974 ttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttacacgta----------ggataaaattagattaaa 50764885  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  50764884 tgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt- 50764786  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcat 357  Q
     ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  50764785 -tagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgacttcat 50764745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6864389 - 6864036
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||    
T  6864389 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatct 6864290  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||||     
T  6864289 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaa 6864190  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |||  | ||||| |||  | | ||||||||||    
T  6864189 tgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgtt 6864090  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcc 369  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  6864089 atagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgacatcaccatacaatttcc 6864036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4598336 - 4598007
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||| ||| |||||    
T  4598336 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatct 4598237  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  4598236 ttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaag 4598147  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4598146 tgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacac-tttgatgtt 4598048  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4598047 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttca 4598007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 36493546 - 36493896
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  36493546 atttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatct 36493645  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  36493646 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaag 36493744  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| | | |||||||| |    
T  36493745 tgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggt 36493844  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||  |||||||||    
T  36493845 atagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattt 36493896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 25700913 - 25701254
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||| |||||  | ||||   || ||||||||| ||| | |||    
T  25700913 atttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttct 25701012  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg-tgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    |||||||||||||| || || |||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25701013 ttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattta 25701112  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25701113 gtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgt 25701212  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  25701213 tataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttca 25701254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37776012 - 37775683
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| || | ||||    
T  37776012 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatct 37775913  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37775912 ttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 37775822  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || ||    
T  37775821 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatatt 37775724  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||| ||||||||| | |||| ||||| | |||||||||    
T  37775723 atagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttca 37775683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 879405 - 879745
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |  | ||||    
T  879405 atttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatct 879504  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  879505 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatg 879604  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  879605 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgtt 879704  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||||||    
T  879705 atagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgacttca 879745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 32912436 - 32912788
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  32912436 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 32912535  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  32912536 tttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaa 32912635  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || || ||||||||||| |||||   |||||||||||||  || | |||||| | || |||||||||||  ||| |||||||||    
T  32912636 gtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgt 32912735  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32912736 tatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 32912788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37288082 - 37287736
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  37288082 atttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 37287983  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgt-ggggtgttacatttaaaacaagataggat-aaaattagatta 213  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  37287982 tcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagatta 37287883  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| ||||||||||||||        | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37287882 agtgtattcttgttaatc--------ttatgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatg 37287791  T
Q  314 ttatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  37287790 ttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcattacttcaccatagaattt 37287736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 34361348 - 34361699
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| | ||    
T  34361348 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatc 34361447  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  34361448 tttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaa 34361547  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || | ||||||| |  |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| || | ||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||    
T  34361548 gtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatg-aggctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgt 34361646  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  34361647 tatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattt 34361699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 46888015 - 46888354
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  46888015 atttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatct 46888114  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||| |||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46888115 ttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtct-aagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaag 46888213  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || | |||||||||| ||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  46888214 tgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgtt 46888313  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  46888314 atagtattaacttcatcagaaaagttattttcttgacttca 46888354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 5047823 - 5048173
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| |||| |||| | ||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| |||||    
T  5047823 atttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatct 5047922  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  5047923 ttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcggg-tattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 5048021  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  5048022 tgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgtt 5048121  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5048122 atagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataacttcattatagaattt 5048173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Original strand, 33816373 - 33816728
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||| |||||    
T  33816373 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatct 33816472  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggg-----------------gtgttacatttaaaacaagatag 198  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||                 |||||||| |||||||||| |||    
T  33816473 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtag 33816572  T
Q  199 gataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactc 298  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||| |||||    
T  33816573 gataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtgaggtgctactc 33816672  T
Q  299 acaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    || |||||||||||| || | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33816673 actacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 33816728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50697596 - 50697256
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  50697596 atttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatct 50697497  T
Q  116 ttaacat-gcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  50697496 ttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaa 50697397  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||   | | |||| ||||    
T  50697396 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgt 50697298  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  50697297 tatagtgtttacttcactaaaaaaatcatttttatgacttca 50697256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32592438 - 32592107
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||    
T  32592438 atttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatct 32592339  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||| |||         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  32592338 ttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaa 32592248  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||  |    
T  32592247 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatact 32592148  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
     ||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||    
T  32592147 gtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttca 32592107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32579800 - 32579466
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |    
T  32579800 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacattt 32579701  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||  |||||| ||||| |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32579700 ttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 32579601  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaa---acagtatggtgttactcacaacacttttgat 312  Q
    |  | || ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||   ||| |  |||| |||||||  ||||||||||    
T  32579600 tacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactgcacttttgat 32579502  T
Q  313 gttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctca 348  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32579501 gttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctca 32579466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011857
Alignment:
Q  56 attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagtt 154  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||     
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  155 ttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaa 254  Q
    ||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||      
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggg 38011970  T
Q  255 gactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38011969 gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgattt 38011870  T
Q  355 cattatagaattt 367  Q
    ||  |||||||||    
T  38011869 caccatagaattt 38011857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1815655 - 1815409
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  1815655 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatct 1815556  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  1815555 ttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaa 1815456  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaac 262  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1815455 tgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42200086 - 42199743
Alignment:
Q  16 aatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaag-taatattttatccttgca- 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |     
T  42200086 aatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaa 42199987  T
Q  113 tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagatt 212  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||| |||||| || |||||||||| |||    
T  42199986 tctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatatt 42199887  T
Q  213 aagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgat 312  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || | |||||| | |  ||| |||||||  ||| |||||||    
T  42199886 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgat 42199787  T
Q  313 gttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||    
T  42199786 gttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttca 42199743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 345
Target Start/End: Original strand, 54499193 - 54499425
Alignment:
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttagatta 213  Q
    ||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  54499193 tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagatta 54499292  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccact-gtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgat 312  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  54499293 agtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgat 54499392  T
Q  313 gttatagtgttaacttcactagaaaagtcattc 345  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54499393 gctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17272318 - 17272068
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| | |||    
T  17272318 atttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatct 17272219  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17272218 ttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 17272119  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 270  Q
    | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  17272118 tgtattctcattaatctgatgaattgatgatact----agactgaacttttgatg 17272068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3042973 - 3042614
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  3042973 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatct 3042874  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||| || |||||||||| ||||||    
T  3042873 ttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaag 3042774  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatg--------atactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacactt 307  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||        ||||| | | ||||||| |||||||| || |||| |||| ||  ||| |||||||  ||| ||    
T  3042773 tgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatactctaatgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattt 3042674  T
Q  308 ttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |  ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||| ||||  |||||||||    
T  3042673 tgtatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgatttcaccatagaattt 3042614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 367
Target Start/End: Original strand, 35025528 - 35025796
Alignment:
Q  92 aagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaa 190  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  35025528 aagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaa 35025627  T
Q  191 caagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatgg 290  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||        ||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||| |||||||  ||    
T  35025628 caagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatc--------tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtgggg 35025719  T
Q  291 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  35025720 tgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcagcatagaattt 35025796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39398113 - 39397916
Alignment:
Q  166 actttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttt 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||  ||||||||||||||    
T  39398113 actttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaacttt 39398023  T
Q  266 tgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaat 365  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  39398022 tgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaat 39397923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 284
Target Start/End: Original strand, 4934071 - 4934327
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctt 116  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||           | ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4934071 ttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcgtgcaacat-----------aggtactattttatcgttgtcatctt 4934159  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    ||||||||||||| || || |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4934160 taacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagt 4934259  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaaca 284  Q
     || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4934260 gtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaaca 4934327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9139569 - 9139250
Alignment:
Q  31 gattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaaca 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9139569 gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 9139470  T
Q  130 gagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaa 229  Q
    ||| |     ||||           |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9139469 gagtt-----tatc-----------ttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 9139386  T
Q  230 tctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 329  Q
    ||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   | |||| ||| ||||  |||||||||    
T  9139385 tctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcac--tattttttatgctataacgttaacttc 9139288  T
Q  330 actagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    || | |||||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  9139287 accaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattt 9139250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 7152061 - 7152218
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |    
T  7152061 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatat 7152160  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtg 173  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7152161 ttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttgtg 7152218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39400362 - 39400232
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||| || ||||||    
T  39400362 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatct 39400263  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatg 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  39400262 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg 39400232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 46883971 - 46884165
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||  || ||||||||| || | || |    
T  46883971 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttggaattt 46884066  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  |  |||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  46884067 ttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatag-tttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaattagattaag 46884164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26896442 - 26896285
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagt-gattcatctagtaatggttgcaacatctt-gaacttacaagtaatattttatccttgcatc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||| |      
T  26896442 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat 26896343  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgt 172  Q
    ||||||||||||| |||  || | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  26896342 tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4205338 - 4205222
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  4205338 atttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 4205239  T
Q  116 ttaacatgcaaacagag 132  Q
    |||||||||||||||||    
T  4205238 ttaacatgcaaacagag 4205222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 35025423 - 35025512
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  35025423 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35025512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23431909 - 23431834
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttaca 92  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23431909 atttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttaca 23431834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205119
Alignment:
Q  265 ttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaa 364  Q
    |||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||  ||||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaa 4205122  T
Q  365 ttt 367  Q
    |||    
T  4205121 ttt 4205119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4396407 - 4396329
Alignment:
Q  289 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4396407 ggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattt 4396329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17272077 - 17272014
Alignment:
Q  304 acttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  17272077 acttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattt 17272014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 367
Target Start/End: Original strand, 7152236 - 7152314
Alignment:
Q  289 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  7152236 ggtgttactcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattt 7152314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 329
Target Start/End: Original strand, 23518400 - 23518473
Alignment:
Q  256 actgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23518400 actgaatttttgatgccactgtattaacagtggggtgttagtcactacagttttaatgttatagtgttaacttc 23518473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 38012616 - 38012568
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctag 65  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38012616 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 52516655 - 52516611
Alignment:
Q  312 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52516655 tgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctcatgacttca 52516611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 20097485 - 20097536
Alignment:
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20097485 atagggttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 20097536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 38811861 - 38811803
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataacataat 380  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  38811861 ttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccatatcataat 38811803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53124368 - 53124290
Alignment:
Q  289 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  53124368 ggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcatcatataattt 53124290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 38812260 - 38812305
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38812260 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 38812305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  67 aatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctttaacatgcaaaca 129  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 2266856 - 2266890
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2266856 ttaacttcactagaaaagtcattatcatgacttca 2266890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51959912 - 51959867
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  51959912 ttaacttcaccagaaaagtcattatcgtgacttcattgtagaattt 51959867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16415996 - 16415655
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  16415996 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 16415897  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||| | | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16415896 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 16415797  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaaca-gtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||     
T  16415796 tgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgc 16415697  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16415696 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 16415655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47279539 - 47279199
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||  ||| |||||    
T  47279539 atttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatct 47279440  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47279439 ttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaag 47279340  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |    
T  47279339 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagt 47279240  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  47279239 ataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttca 47279199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38823564 - 38823213
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  38823564 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatct 38823465  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  38823464 ctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaag 38823365  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  38823364 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgct 38823265  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38823264 atagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 38823213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 27532809 - 27533155
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catcttt 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  27532809 tttttaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttt 27532908  T
Q  118 aacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtt 217  Q
    ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  27532909 aacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtg 27533007  T
Q  218 tattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttat 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||| |||||||||| |||    
T  27533008 tattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctat 27533107  T
Q  318 agtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaat 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  27533108 agtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactttatcatagaat 27533155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3309503 - 3309142
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| |||||    
T  3309503 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatcgttggcatct 3309404  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgg-----ggtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttag 209  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||      |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  3309403 ttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattag 3309304  T
Q  210 attaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacactttt 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3309303 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcacaacactttt 3309205  T
Q  310 gatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  3309204 gatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttccat 3309142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2960098 - 2959747
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  2960098 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatct 2959999  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2959998 ttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaag 2959899  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| || ||| ||||||||||    
T  2959898 tgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgtt 2959799  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  2959798 atagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 2959747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32216405 - 32216090
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| | |||    
T  32216405 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatct 32216306  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32216305 ttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaag 32216206  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32216205 tttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgtt 32216106  T
Q  316 atagtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  32216105 atagtgttaacttcac 32216090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3535273 - 3534931
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||    
T  3535273 atttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatct 3535174  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||         |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  3535173 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgt---------aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaa 3535083  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||| || |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3535082 tgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgtt 3534983  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  3534982 atagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgacttcataatagaattt 3534931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Original strand, 7078889 - 7079238
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  7078889 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatct 7078988  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7078989 ttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 7079088  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaac-----------agtatggtgttactcacaaca 304  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||           |||  ||||||||||||||||    
T  7079089 tgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaaca 7079188  T
Q  305 cttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  7079189 cttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactt 7079238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15752379 - 15752028
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| || ||| | | |    
T  15752379 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaattt 15752280  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15752279 ttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 15752180  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | | |||| |||||    
T  15752179 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgtt 15752080  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15752079 atagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 15752028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 30326778 - 30327129
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| | |||    
T  30326778 atttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaatct 30326877  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30326878 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaag 30326977  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  30326978 tgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgtt 30327077  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  30327078 atagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattt 30327129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4330631 - 4330289
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  4330631 atttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatct 4330532  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4330531 ttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4330432  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagt-atggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    |  | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||     
T  4330431 tgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgc 4330332  T
Q  315 tatagtg-ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  4330331 tatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataacttca 4330289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39393734 - 39393393
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||| || ||||||    
T  39393734 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatct 39393635  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggat-aaaattagattaa 214  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  39393634 ttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaa 39393535  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||     
T  39393534 gtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgc 39393435  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39393434 tatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataacttca 39393393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8222477 - 8222141
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  8222477 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatct 8222379  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8222378 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaag 8222279  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||   ||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  8222278 tgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgtt 8222182  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  8222181 atagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttca 8222141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 27227311 - 27227659
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  27227311 atttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatct 27227410  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27227411 ttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 27227510  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||      |  ||| |||| ||| |    
T  27227511 tgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg------agtacattttttatgct 27227604  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27227605 a--gtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 27227659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51129209 - 51128884
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  51129209 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatct 51129110  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  51129109 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaag 51129010  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||||||  ||| |||| |||||    
T  51129009 tgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgtt 51128910  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtc 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  51128909 atagtgttaacttcactaaaaaagtc 51128884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 238339 - 238689
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  238339 atttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatcgttggcatct 238438  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  238439 ttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 238538  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||  |    
T  238539 tgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatact 238637  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  238638 atagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaattt 238689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 34012208 - 34012554
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  34012208 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatct 34012307  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||     |||||| | |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34012308 ttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaag 34012402  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  34012403 tgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgtt 34012502  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34012503 atagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattt 34012554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 10181833 - 10182185
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaag-taatattttatccttg-catc 114  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||  ||| ||||    
T  10181833 atttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatc 10181932  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10181933 tttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 10182032  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | | |||| ||||    
T  10182033 gtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgt 10182132  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    || ||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  10182133 tacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 10182185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14758382 - 14758051
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  14758382 atttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 14758283  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| ||||         ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14758282 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa---------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 14758192  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14758191 tgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgtt 14758092  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14758091 atagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 14758051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15383283 - 15382932
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  15383283 atttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatct 15383184  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15383183 ttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaag 15383084  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||| ||  | |||||||||  ||| ||||||||||    
T  15383083 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgtt 15382984  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  15382983 atagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattt 15382932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25160982 - 25160715
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  25160982 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatct 25160883  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25160882 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaag 25160783  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaac 283  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25160782 tgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaac 25160715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1547621 - 1547286
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgc-atct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||  ||||    
T  1547621 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatct 1547522  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||        ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1547521 ttaaca--------gagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaag 1547430  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||| ||||||||||        |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||    
T  1547429 tgtatttttgttaatct--------gatgatactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgtt 1547338  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1547337 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 1547286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42721386 - 42721032
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgcatctt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||    
T  42721386 atttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg--tctt 42721289  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    ||||||||||||| || || |||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42721288 taacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagt 42721189  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| | | |||| ||| ||    
T  42721188 gtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgata 42721089  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 373  Q
    ||| | ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  42721088 tagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttccata 42721032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 27267026 - 27267363
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  27267026 atttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatct 27267125  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  27267126 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggtag-attaaattagattaag 27267224  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||| |||      
T  27267225 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatg-- 27267322  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
     ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  27267323 ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttca 27267363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 28564609 - 28564947
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  28564609 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatct 28564708  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||   ||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  28564709 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtt--aagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaag 28564806  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  28564807 tgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgtt 28564906  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||| |||| ||||||    
T  28564907 atagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttca 28564947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 19899594 - 19899946
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  19899594 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatc 19899693  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||  || |||||||||| |||||    
T  19899694 tttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaa 19899793  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||   ||| |||||||||    
T  19899794 gtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgt 19899893  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  19899894 tatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattt 19899946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37451635 - 37451296
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| | |||    
T  37451635 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatct 37451536  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  37451535 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaag 37451436  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  37451435 tgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgtt 37451337  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||    
T  37451336 atagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgacttca 37451296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 351
Target Start/End: Original strand, 9902880 - 9903215
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| |||||    
T  9902880 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatct 9902979  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||    
T  9902980 ttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaag 9903079  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9903080 tgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgtt 9903179  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatga 351  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  9903180 atagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttcatga 9903215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15168446 - 15168088
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  15168446 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatct 15168347  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||  |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15168346 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaac 15168247  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccac-------tgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttt 308  Q
    |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||        |||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  15168246 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttt 15168147  T
Q  309 tgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15168146 tgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaattt 15168088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28770003 - 28769652
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  28770003 atttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatct 28769904  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg-tgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  28769903 ttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaa 28769804  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||||||    
T  28769803 gtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgt 28769705  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
     |||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||  |||||||||    
T  28769704 catagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaattt 28769652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32267384 - 32267044
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||  ||| | | |    
T  32267384 atttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatat 32267285  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32267284 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaag 32267185  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  32267184 tgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtt 32267085  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  32267084 atattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttca 32267044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30254773 - 30254423
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  30254773 atttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatct 30254674  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30254673 ttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaag 30254574  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||||  ||| ||||||||||    
T  30254573 tctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgt-gtattactcattacatttttgatgtt 30254475  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  30254474 atattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattt 30254423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 47682321 - 47682659
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  47682321 tttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctt 47682420  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    ||||||||||||| || || |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||| |    
T  47682421 taacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaat 47682520  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatg-gtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||| |||      
T  47682521 gtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatg-- 47682618  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
     ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  47682619 ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgacttca 47682659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10923077 - 10922737
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  |  | ||||    
T  10923077 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatct 10922978  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||| || |||||||| ||||||||    
T  10922977 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaag 10922878  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||||  ||| |||| |||||    
T  10922877 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgtt 10922778  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  10922777 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgatttca 10922737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 11742194 - 11742516
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  11742194 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 11742293  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||                 |||||||| || |||||||||||||||||    
T  11742294 ttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttacactt-----------------aaaacaaggtaagataaaattagattaag 11742376  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |    
T  11742377 tgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatgg-gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataat 11742475  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11742476 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttca 11742516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18422981 - 18422650
Alignment:
Q  37 tgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctttaacatgcaaacagagatg 135  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||    
T  18422981 tgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtg 18422882  T
Q  136 gtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaat 235  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  18422881 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgat 18422782  T
Q  236 gaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaga 335  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18422781 gaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaa 18422682  T
Q  336 aaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  18422681 aaagtcatttttatgacttcaccatagaattt 18422650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40885163 - 40884841
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||| |||| |||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | | |||||    
T  40885163 atttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatct 40885064  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40885063 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaag 40884964  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40884963 tgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgtt 40884864  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaa 338  Q
    || ||||| ||||||| ||||||    
T  40884863 atggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 31621376 - 31621719
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct- 115  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||     
T  31621376 tttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctt 31621475  T
Q  116 ----ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagat 211  Q
        |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||||| | || || |||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31621476 taacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacac-ttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagat 31621574  T
Q  212 taagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttga 311  Q
    |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||   |||| ||||||  |||| |||||    
T  31621575 taagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttga 31621674  T
Q  312 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31621675 tgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 31621719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22171061 - 22170807
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  22171061 atttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatct 22170962  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22170961 ttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaag 22170862  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 270  Q
    | || | || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22170861 tgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23999698 - 23999357
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  23999698 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 23999599  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  23999598 tttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaa 23999499  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||  ||||||||||   | | |||| ||||    
T  23999498 gtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgt 23999399  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    | ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  23999398 tgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttca 23999357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 338
Target Start/End: Original strand, 27563732 - 27564053
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatctt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| || |||||||    
T  27563732 tttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctt 27563831  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    |||||||||||||||| || ||| || || ||||||| |||||||||   ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27563832 taacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagt 27563931  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     || |||||||||||| |||||||||| ||| |||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| | | |||| | ||||    
T  27563932 gtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatatttttaaagtta 27564031  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaa 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  27564032 tagtgttaacttcactaaaaaa 27564053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48620884 - 48620636
Alignment:
Q  110 gcatctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  48620884 gcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattag 48620794  T
Q  210 attaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacactttt 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48620793 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttt 48620694  T
Q  310 gatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  48620693 gatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattt 48620636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 46931760 - 46931446
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  46931760 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 46931661  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |   |||||| || |||||||||| |||||    
T  46931660 tttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaa 46931563  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  | ||||||||||  ||| |||||||  ||| |||||||||    
T  46931562 gtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgt 46931463  T
Q  315 tatagtgttaacttcac 331  Q
    |||||||||||||||||    
T  46931462 tatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 27763136 - 27763451
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| | ||    
T  27763136 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatc 27763235  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||  ||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  27763236 tttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaa 27763335  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtat-ggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    || || ||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||  ||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  27763336 gtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaac--tatgggtgttactcattacatttttgatg 27763433  T
Q  314 ttatagtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27763434 ttatagtgttaacttcac 27763451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41926504 - 41926162
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catcttt 117  Q
    ||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  41926504 ttttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatcttt 41926406  T
Q  118 aacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || | |||      ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  41926405 aacatgcaaacagagttgatgatattatttaata------agtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtg 41926312  T
Q  218 tattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttat 317  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||||| | | ||||||||||||    
T  41926311 taatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttat 41926212  T
Q  318 agtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||  | |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  41926211 agtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaattt 41926162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 367
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725777
Alignment:
Q  63 tagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtg 161  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |||| ||    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  162 ttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaa 261  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33725572 ttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaa 33725671  T
Q  262 cttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattata 361  Q
    |||||||||||||   | ||| |||  | || ||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  33725672 cttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccata 33725771  T
Q  362 gaattt 367  Q
    ||||||    
T  33725772 gaattt 33725777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37619073
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tcttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  118 aacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || |||         |||||| ||||| |||| |||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattatatga---------gtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtg 37618919  T
Q  218 tattcttgttaatctaatgaattgatg--atactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtg--ttactcacaacacttttgatg 313  Q
    || | |||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| || | ||||||||||  ||||  |||||||  | | ||||||||    
T  37618920 tagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatg 37619019  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  37619020 ttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattt 37619073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48353892 - 48353735
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  48353892 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatct 48353793  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgg 174  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  48353792 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38759840 - 38759610
Alignment:
Q  60 atctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaa 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||  || ||||||||  ||| || |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| | ||    
T  38759840 atctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatagtctcaa 38759741  T
Q  159 gtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaaga-- 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | || | || ||||| | |||||||||||||| || |||||      
T  38759740 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacgaagact 38759641  T
Q  257 --ctgaacttttgatgccactgtacaaacag 285  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38759640 ggctgaacttttgatgtcactgtacaaacag 38759610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 1359761 - 1359919
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||    
T  1359761 atttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatct 1359860  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  1359861 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289675
Alignment:
Q  222 cttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacactt-------ttgatgt 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||       || |||     
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 21289675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21289950 - 21289834
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| || ||||||    
T  21289950 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatct 21289851  T
Q  116 ttaacatgcaaacagag 132  Q
    |||| ||||||||||||    
T  21289850 ttaatatgcaaacagag 21289834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31962965 - 31962853
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctt 116  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||   ||||    
T  31962965 ttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctt 31962866  T
Q  117 taacatgcaaaca 129  Q
    |||||||||||||    
T  31962865 taacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22170816 - 22170753
Alignment:
Q  304 acttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  22170816 acttttgatgttatagtgttaacttcattagaaaagtcattttcatgatttcaccatagaattt 22170753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43579290 - 43579245
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43579290 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 43579245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30254918 - 30254857
Alignment:
Q  306 ttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  30254918 ttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattattatgacttcaccatagaattt 30254857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 370
Target Start/End: Original strand, 42663785 - 42663833
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 370  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  42663785 ttaacttcactaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatttccc 42663833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19120213 - 19119862
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||| ||| |||||    
T  19120213 atttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatct 19120114  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19120113 ttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaag 19120014  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |    
T  19120013 tttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgct 19119914  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19119913 atagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 19119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 30969145 - 30969496
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |  || ||||||||  ||| |||||    
T  30969145 atttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttgacatct 30969244  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30969245 ttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaag 30969344  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30969345 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 30969444  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30969445 atagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgacttcattgtagaattt 30969496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5837909 - 5837569
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||| || ||| |||||    
T  5837909 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatct 5837810  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  5837809 ttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaag 5837710  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  5837709 tgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgct 5837610  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5837609 atagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatgaattca 5837569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36867116 - 36866765
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  36867116 atttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatct 36867017  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  36867016 ttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 36866917  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| ||    
T  36866916 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatatt 36866817  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||  |||||||||    
T  36866816 atagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattt 36866765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 374
Target Start/End: Original strand, 31786467 - 31786825
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  31786467 atttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatct 31786566  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786567 ttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaag 31786666  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||   | ||||| ||| |||| ||| |    
T  31786667 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgct 31786766  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 374  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  31786767 atagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttccataa 31786825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 8741706 - 8742059
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  8741706 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 8741805  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgata-tcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  8741806 ttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaa 8741905  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagt-atggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
     | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  8741906 ttgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatg 8742005  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8742006 ctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 8742059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7693575 - 7693233
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  7693575 atttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatct 7693476  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7693475 ttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaag 7693385  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  7693384 cgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgtt 7693285  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  7693284 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattt 7693233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27330658 - 27330309
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||  ||| | |||    
T  27330658 atttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatct 27330559  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27330558 ttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 27330459  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  27330458 tgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttact--caacacttttgatgtt 27330361  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  27330360 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattt 27330309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40133739 - 40133383
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  40133739 atttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatct 40133640  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  40133639 ttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 40133540  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||  |    
T  40133539 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatact 40133440  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||    
T  40133439 ataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 40133383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 25500747 - 25501098
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  25500747 atttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatct 25500846  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||  ||| | || || ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25500847 ttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaag 25500946  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25500947 tttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgct 25501046  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25501047 atagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 25501098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 38528058 - 38528408
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgc-atct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||    
T  38528058 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatct 38528157  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||| ||| |||  || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  38528158 ttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaag 38528257  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  38528258 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-agactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgtt 38528356  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||  |||||||||    
T  38528357 atagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattt 38528408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39573165 - 39572822
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  39573165 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatct 39573066  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||        ||| || ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39573065 ttaaca--------gagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 39572974  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| || ||    
T  39572973 tgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatatt 39572874  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39572873 atagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 39572822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 699504 - 699164
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  699504 atttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatct 699405  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  699404 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaag 699305  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | | |||| ||| |    
T  699304 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgct 699205  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  699204 atagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataacttca 699164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22981147 - 22980796
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  22981147 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatct 22981048  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22981047 ttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 22980948  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||| ||||||||   | |||||||  |    
T  22980947 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatact 22980848  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  22980847 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcataaaattt 22980796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9200578 - 9200247
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  || ||||||||| ||| |||||    
T  9200578 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatct 9200479  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||         |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  9200478 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 9200388  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9200387 tgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 9200288  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  9200287 atagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttca 9200247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33908586 - 33908247
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  33908586 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 33908488  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||| || ||  ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33908487 ttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaag 33908388  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||| |    
T  33908387 tgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgat 33908288  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33908287 atagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgacttca 33908247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36860778 - 36860426
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  36860778 atttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatct 36860679  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaa-gataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  36860678 ttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaa 36860579  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
     | || |||||||| | | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||      
T  36860578 atgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatac 36860479  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||  |||||||||    
T  36860478 tatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattt 36860426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 23116051 - 23116399
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |        |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  23116051 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatct 23116142  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23116143 ttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaag 23116242  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  23116243 tgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgtt 23116342  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  23116343 ataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttccat 23116399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12910709 - 12910353
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||  ||| |||||    
T  12910709 atttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatct 12910610  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12910609 ttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 12910510  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcc-----actgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttg 310  Q
    | || || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |     ||||||||||||||  |||||||| ||| | | |||||    
T  12910509 tgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttg 12910410  T
Q  311 atgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  12910409 atgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 12910353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22019977 - 22019646
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  22019977 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatct 22019878  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22019877 ttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga---------gtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaag 22019787  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |    
T  22019786 tgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattct 22019687  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22019686 atagttttaacttcaccagaaaagtcattctaataacttca 22019646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 35511303 - 35511638
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  35511303 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatct 35511402  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||     |||||| | |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35511403 ttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaag 35511497  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  35511498 tgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgtt 35511597  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  35511598 ataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgacttca 35511638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 31705433 - 31705783
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| | |||    
T  31705433 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatct 31705532  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||| | |||||| | ||||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  31705533 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaag 31705632  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||   ||| ||||||||||    
T  31705633 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgtt 31705731  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  31705732 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattt 31705783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22255536 - 22255195
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | | |    
T  22255536 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatat 22255437  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22255436 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaag 22255337  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaaca-cttttgatgt 314  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  |||||||||    
T  22255336 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgt 22255237  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  22255236 tataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgacttca 22255195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 27318311 - 27318648
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctt 116  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||| | ||||    
T  27318311 ttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttatcgttgaaatctt 27318408  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27318409 taacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27318508  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     || |||||||||| | |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| |||||     
T  27318509 gtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttt 27318608  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27318609 tagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttca 27318648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32563494 - 32563152
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  32563494 atttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatct 32563395  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||         |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32563394 ataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 32563304  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  32563303 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgtt 32563204  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  32563203 atagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattt 32563152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35934250 - 35933916
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||  ||| |||||    
T  35934250 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatct 35934151  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggat-aaaattagattaa 214  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35934150 ttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaa 35934051  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||        |||  ||||||||||||||||||||||||      
T  35934050 gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccact-------aagtgaggtgttactcacaacacttttgattc 35933958  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  35933957 tatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgacttca 35933916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Original strand, 15992361 - 15992631
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| |||||    
T  15992361 atttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatct 15992460  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||| || | ||| |||| ||| |||||||||||| |||    
T  15992461 ttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaag 15992560  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagt 286  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15992561 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 15992631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 7208685 - 7209025
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  7208685 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatct 7208784  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7208785 ttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaag 7208884  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||    || |||| |||||    
T  7208885 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttttatgtt 7208983  T
Q  316 atagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    | | ||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  7208984 acaatgttaacttcaccaaaaaaagtcatttttatgacttca 7209025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15724842 - 15724487
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||    
T  15724842 atttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttatagttgacatct 15724743  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| |||| || || |||||| || |||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  15724742 ttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaag 15724643  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15724642 tgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgtt 15724545  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 373  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  15724544 atagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccata 15724487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 22973903 - 22974254
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | | | |||    
T  22973903 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatct 22974002  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22974003 ttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaag 22974102  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||||  ||  ||||||||||    
T  22974103 tgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgtt 22974202  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22974203 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattt 22974254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26268343 - 26268077
Alignment:
Q  102 ttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagatagga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  26268343 ttatccttgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatga 26268244  T
Q  201 taaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcac 300  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||     
T  26268243 taaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaa 26268144  T
Q  301 aacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26268143 aacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactgtagaattt 26268077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 35826307 - 35826655
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  35826307 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatct 35826406  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||  ||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  35826407 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatg--ataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaa 35826504  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |  | ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  35826505 tgtggtattgttaatcta-tgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgtt 35826603  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  35826604 atagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattt 35826655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8467080 - 8466748
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgcatctt 116  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || || |||    
T  8467080 atttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgttacacctt 8466981  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||                 ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  8466980 taatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgtta-----------------catttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagt 8466898  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8466897 gtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag-ggggtgttattcacaacacttttgatgtta 8466799  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8466798 cagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaattt 8466748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 313
Target Start/End: Original strand, 6824343 - 6824599
Alignment:
Q  58 tcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgcatctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagtttta 157  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| |||    
T  6824343 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatcttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtctta 6824441  T
Q  158 agtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagac 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6824442 agtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagac 6824541  T
Q  258 tga--acttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  6824542 tgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5830246 - 5829955
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  5830246 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatct 5830147  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||| ||||||||    
T  5830146 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaag 5830047  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||         ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||| |||||    
T  5830046 tgtagtcttgtt---------aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgtt 5829956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8437319 - 8436980
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  8437319 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 8437220  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8437219 ttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaag 8437120  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
      || | |||| ||||| |||  |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||| || | |    
T  8437119 catagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagct 8437021  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  8437020 atagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgacttca 8436980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 14409162 - 14409503
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  14409162 atttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatct 14409261  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| ||||| ||               |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14409262 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagta--------------gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaag 14409347  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||  |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  14409348 tgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacatttttgatgtt 14409446  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  14409447 atagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 14409503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 17157852 - 17158166
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  ||||    
T  17157852 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatct 17157951  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||| ||||||||||||| || | |||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| || |||| ||||| | ||||    
T  17157952 ttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaag 17158051  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||||||  ||| |||| |||||    
T  17158052 tgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgtt 17158150  T
Q  316 atagtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  17158151 atagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24886441 - 24886116
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| | |||    
T  24886441 atttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatct 24886342  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||                 | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  24886341 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------ataataaggtaggataaaattagattaag 24886259  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24886258 tgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgtt 24886159  T
Q  316 atagtgttaacttcac--tagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  24886158 atagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttca 24886116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429306
Alignment:
Q  20 tttaaattgttga---ttactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| | || |  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||                 |||||||| |||||||||||||||||||     
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtaggataaaattagattaaa 1429165  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | | |||||||| |    
T  1429166 tgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgct 1429265  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||    
T  1429266 atagtgttaacttcaccaaaagagtcattttcatgacttca 1429306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42343075 - 42342775
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||| ||| |||||    
T  42343075 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatct 42342976  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||         ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42342975 ttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaag-taagataaaattagattaag 42342886  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||   |  |||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42342885 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga--aattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacatttttgatgtt 42342788  T
Q  316 atagtgttaactt 328  Q
    ||||| |||||||    
T  42342787 atagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 13956187 - 13956506
Alignment:
Q  21 ttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  13956187 ttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaa 13956286  T
Q  120 catgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagttta 219  Q
    |||||||||| |  || |||||| || ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||  |    
T  13956287 catgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaa 13956386  T
Q  220 ttcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatag 319  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||| ||                |||| | ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13956387 gttttgttaatctgatgaattgatgatac-at----------------atgcaagtgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatag 13956469  T
Q  320 tgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  13956470 tgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttca 13956506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35504719 - 35504436
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  35504719 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatct 35504620  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| || | | ||||||||||||| ||||||    
T  35504619 ttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaag 35504520  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactca 299  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||   ||||||| ||  |||||||||||    
T  35504519 tgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactca 35504436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 356
Target Start/End: Original strand, 5112247 - 5112474
Alignment:
Q  128 cagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgtt 227  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  5112247 cagagttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgtt 5112345  T
Q  228 aatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||    
T  5112346 aatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaact 5112445  T
Q  328 tcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  5112446 tcaccaaaaaagtcattttcatgacttca 5112474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Original strand, 21088599 - 21088938
Alignment:
Q  29 ttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaa 127  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| | |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  21088599 ttgattatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaa 21088698  T
Q  128 cagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgtt 227  Q
    || || || |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21088699 catagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgtt 21088798  T
Q  228 aatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 327  Q
    | | | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||  || ||| ||||||    
T  21088799 agtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacattttttatactacagt-ttaact 21088897  T
Q  328 tca-ctagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| | | |||||||||| || |||||||||  ||||||||    
T  21088898 tcaccaaaaaaagtcattttcgtgacttcatcgtagaattt 21088938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 43308482 - 43308813
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctt 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||  | | | ||||    
T  43308482 tttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctt 43308581  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||        ||| |||||||||| |||||   |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  43308582 taacatgcaagaagagttgatgatat--------agtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagt 43308673  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     || | ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  43308674 atagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattcattacatttttgatgtta 43308772  T
Q  317 tagtgttaacttcact-agaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43308773 taatgttaactttactaaaaaaagtcattctcatgacttca 43308813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 300
Target Start/End: Original strand, 23954636 - 23954895
Alignment:
Q  37 tgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatg 135  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |     ||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  23954636 tgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttg 23954729  T
Q  136 gtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaat 235  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||    
T  23954730 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgat 23954829  T
Q  236 gaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccact-gtacaaacagtatggtgttactcac 300  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||    
T  23954830 gaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcac 23954895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 333
Target Start/End: Original strand, 28416373 - 28416665
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctt 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||      
T  28416373 tttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttggcatc-- 28416470  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
                 ||| || |||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  28416471 -------------gagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagt 28416548  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| |||    
T  28416549 gtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatatta 28416648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 112 - 356
Target Start/End: Original strand, 14919445 - 14919690
Alignment:
Q  112 atctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagat 211  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  14919445 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagat 14919544  T
Q  212 taagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttga 311  Q
    ||||| || | |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||  |||||||||||  ||| ||||||    
T  14919545 taagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttga 14919644  T
Q  312 tgttatagtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||| ||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  14919645 tgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttca 14919690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 2888266 - 2888466
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  2888266 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatct 2888365  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| || ||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||| | || ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  2888366 ttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaag 2888465  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  2888466 t 2888466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25669930 - 25669733
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  25669930 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatct 25669831  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||         ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25669830 ttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaag 25669741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25668801 - 25668689
Alignment:
Q  218 tattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25668801 tattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtta- 25668703  T
Q  318 agtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||||||||    
T  25668702 agtgttaacttcac 25668689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25889724 - 25889593
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||| ||||||||  || | ||||    
T  25889724 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatct 25889625  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgt 147  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  25889624 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 25889593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11898138 - 11898016
Alignment:
Q  234 atgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacta 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||| |||| | ||||||| || |    
T  11898138 atgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacca 11898039  T
Q  334 gaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||| ||| |||||||||||    
T  11898038 gaaaagttattatcatgacttca 11898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26269163 - 26269070
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| || || ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  26269163 atttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatccttg 26269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 374
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004556
Alignment:
Q  293 ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtc-attctcatgacttcattatagaatttcccataa 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttccataa 16004556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 26317795 - 26317856
Alignment:
Q  306 ttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26317795 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattt 26317856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 43254209 - 43254156
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatg 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43254209 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 43254156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13380549 - 13380509
Alignment:
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13380549 atagggttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 13380509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10237462 - 10237417
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  10237462 ttaacttcactagaaaagtcattttcatgacttcacaatagaattt 10237417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22255656 - 22255615
Alignment:
Q  289 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 330  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22255656 ggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca 22255615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22616542 - 22616497
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  22616542 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 22616497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12263 - 11909
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  12263 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatct 12164  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12163 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaag 12064  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactg-tacaaacagt-atggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||    
T  12063 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatg 11964  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtca-ttctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  11963 ttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaattt 11909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 52040753 - 52041094
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  52040753 atttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 52040852  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52040853 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 52040952  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaaca-gtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |  || ||||||||| |||||||||||||    
T  52040953 tgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgt 52041052  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52041053 tatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttca 52041094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 7327313 - 7327665
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  7327313 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatct 7327412  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||| || ||||||    
T  7327413 ttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaag 7327512  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  7327513 tgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgtt 7327612  T
Q  316 atagtg-ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  7327613 atagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattt 7327665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4015804 - 4015448
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||| |||||    
T  4015804 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatct 4015705  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||  ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||     
T  4015704 ttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaat 4015606  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  4015605 tatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgct 4015506  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 373  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  4015505 atagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccata 4015448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32373813 - 32373463
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catcttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  32373813 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatcttt 32373714  T
Q  118 aacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtt 217  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  32373713 aatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 32373614  T
Q  218 tattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttat 317  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  32373613 tattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacag--tggagttactcacaacacttttgatgctat 32373516  T
Q  318 agtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 370  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32373515 agtgttaactttattggaaaagtcattctcatgacttcatcatagaatttccc 32373463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 46297593 - 46297944
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| | |||    
T  46297593 atttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatct 46297692  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  46297693 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaag 46297792  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| | | ||||||||||    
T  46297793 tgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgtt 46297892  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  46297893 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 46297944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34133280 - 34132929
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  34133280 atttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 34133181  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34133180 ttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaag 34133081  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |    
T  34133080 tgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatact 34132981  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34132980 atagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattt 34132929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21193952 - 21193600
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |  | ||||    
T  21193952 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatct 21193853  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagt-tttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21193852 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 21193753  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
     | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||      
T  21193752 atgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattc 21193653  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21193652 aacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattt 21193600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 53228983 - 53229324
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  53228983 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatct 53229082  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  53229083 ttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaac 53229182  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagt-atggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||     
T  53229183 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgc 53229282  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  53229283 tatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgacttca 53229324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2008264 - 2007964
Alignment:
Q  30 tgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaac 128  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2008264 tgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaac 2008165  T
Q  129 agagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgtta 228  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2008164 agagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgt-acacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgtta 2008066  T
Q  229 atctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 328  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  2008065 atctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaactt 2007966  T
Q  329 ca 330  Q
    ||    
T  2007965 ca 2007964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 26941091 - 26941442
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  26941091 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatct 26941190  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26941191 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaag 26941290  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||  | | ||||||| ||    
T  26941291 tgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgatttt 26941390  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26941391 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattt 26941442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37158053 - 37157702
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  37158053 atttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatct 37157954  T
Q  116 ttaacatgcaaacag-agatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||| ||||||  |  || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37157953 ttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaa 37157854  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  37157853 gtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgt 37157755  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  37157754 tatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattt 37157702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37203413 - 37203061
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  37203413 atttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatct 37203314  T
Q  116 ttaacatgcaaacag-agatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||| ||||||  |  || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37203313 ttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaa 37203214  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  37203213 gtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgt 37203114  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  37203113 tatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattt 37203061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44891842 - 44891512
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||| ||| |||||    
T  44891842 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatct 44891743  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44891742 ttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 44891643  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||         |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  44891642 tgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgtt 44891552  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  44891551 atagtgttaacttcacca-aaaagtcattttcatgacttca 44891512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39282997 - 39282647
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||  || ||||||||  ||| |||||    
T  39282997 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatct 39282898  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||| ||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39282897 ttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaag 39282798  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  39282797 tgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgtt 39282699  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  39282698 atagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattt 39282647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Original strand, 42505906 - 42506214
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  42505906 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatct 42506005  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  42506006 ttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaag 42506105  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  42506106 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgtt 42506205  T
Q  316 atagtgtta 324  Q
    |||||||||    
T  42506206 atagtgtta 42506214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48355286 - 48354935
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  || ||||||||  | | | |||    
T  48355286 atttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatct 48355187  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48355186 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaag 48355087  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  ||| |||| || ||    
T  48355086 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatatt 48354987  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  48354986 atagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 48354935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 44186348 - 44186683
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||| ||| |||||    
T  44186348 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatct 44186447  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44186448 ttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtt----------------gtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 44186531  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |    
T  44186532 tgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgct 44186631  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  44186632 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctctcgacttcatcatagaattt 44186683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11467142 - 11466818
Alignment:
Q  37 tgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgc-atctttaacatgcaaacagagatg 135  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||       ||||||||||||  |||| || ||| |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||| ||    
T  11467142 tgattaatgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttg 11467050  T
Q  136 gtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaat 235  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11467049 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 11466950  T
Q  236 gaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaga 335  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  |||    
T  11466949 gaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcaga 11466850  T
Q  336 aaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  11466849 aaagtcattctcaagacttcaccatagaattt 11466818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 355
Target Start/End: Original strand, 11357212 - 11357535
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgc-atct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||    
T  11357212 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatct 11357311  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||                 |||| ||| |||||||||||||||||||     
T  11357312 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaataaggtaggataaaattagattaaa 11357394  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagt-atggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||     
T  11357395 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgc 11357494  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttc 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11357495 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 3655031 - 3655373
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcat--ctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-t 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||  || | |    
T  3655031 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaat 3655130  T
Q  114 ctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagatta 213  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3655131 ctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagatta 3655230  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||| |||    
T  3655231 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatg 3655330  T
Q  314 ttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||| | |||||||||    
T  3655331 ttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttca 3655373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22451313 - 22450962
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| |||||    
T  22451313 atttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgacatct 22451214  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||  |||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  22451213 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaag 22451114  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| |    
T  22451113 tgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgct 22451014  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  22451013 atagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 22450962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25580084 - 25579746
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  | ||| | |||   ||||||| ||| |||||    
T  25580084 atttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatct 25579985  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25579984 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaag 25579885  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||   ||||| ||||||||||||||||| |    
T  25579884 tgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgct 25579785  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  25579784 atagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataactt 25579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29099691 - 29099360
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||||    
T  29099691 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatct 29099592  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||         | |||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||| ||||||    
T  29099591 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaagtt---------acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaag 29099501  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  29099500 tgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgtt 29099401  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29099400 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttca 29099360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 40552090 - 40552441
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  40552090 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatct 40552189  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |  ||||||||| || ||||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  40552190 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaag 40552289  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  40552290 tgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgtt 40552389  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40552390 atagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 40552441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Original strand, 24707946 - 24708246
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  24707946 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 24708045  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagat--ta 213  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||   |    
T  24708046 ttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaa 24708145  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||  || ||||||||    
T  24708146 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgttactcactgcagttttgatg 24708243  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  24708244 tta 24708246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Original strand, 33378616 - 33378951
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  33378616 atttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatct 33378715  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || ||| || ||| |||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33378716 ttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 33378815  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| | |  |||  ||||||| |||||||||||  |    
T  33378816 tgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatact 33378915  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgactt 354  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  33378916 atagtgttgacttcac---aaaagtcattctcataactt 33378951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45174819 - 45174516
Alignment:
Q  49 aatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgt 147  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  45174819 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatat 45174720  T
Q  148 gatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgat 246  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45174719 tatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 45174620  T
Q  247 actatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttact--cacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcatt 344  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  45174619 actatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttatt 45174520  T
Q  345 ctca 348  Q
    ||||    
T  45174519 ctca 45174516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3362600 - 3362283
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||  |||||||| ||| |||||    
T  3362600 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatct 3362501  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagatta-- 213  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  3362500 ttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaat 3362401  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| || |||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| | | || |||||    
T  3362400 agtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatg 3362301  T
Q  314 ttatagtgttaacttcac 331  Q
     |||||||||||||||||    
T  3362300 ctatagtgttaacttcac 3362283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33698498 - 33698265
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  33698498 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatct 33698399  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33698398 ttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 33698299  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatact 249  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33698298 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 4761479 - 4761833
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||  | | | |||    
T  4761479 attttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttattgtcggaatct 4761578  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg-tgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    |||||||||||| | || || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4761579 ttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaa 4761678  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||  ||| ||||||| |    
T  4761679 gtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatat 4761778  T
Q  315 tatagtgttaacttcac--tagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||| ||||||||||   | |||||||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  4761779 tatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattt 4761833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35844576 - 35844320
Alignment:
Q  111 catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttag 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||    
T  35844576 catctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattag 35844478  T
Q  210 attaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacactttt 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  35844477 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacattttt 35844378  T
Q  310 gatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  35844377 gttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattt 35844320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47481868 - 47481527
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||    
T  47481868 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatc 47481769  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||| ||||||| |||| |  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||| || ||| ||  ||||||||| |||||    
T  47481768 tttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaa 47481669  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || |||||||||  | |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||    
T  47481668 gtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgt 47481569  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||  |||||||||    
T  47481568 tatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgacttca 47481527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43348565 - 43348319
Alignment:
Q  54 tgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatag 152  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  43348565 tgattcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatag 43348466  T
Q  153 ttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatg 252  Q
    | |||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  43348465 tcttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-a 43348367  T
Q  253 aagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||    
T  43348366 aagactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgttgctcac 43348319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 24488793 - 24489133
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    | ||||||||  ||| |||||    
T  24488793 atttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatct 24488892  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  24488893 ttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaag 24488992  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||    |||||||||||||| |||| ||  |    
T  24488993 tgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatact 24489092  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||| || ||||||||    
T  24489093 atagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgacttca 24489133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40936318 - 40935996
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| ||||||||| ||| |||||    
T  40936318 atttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatct 40936219  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||                 |||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  40936218 ttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaaaaagtt-ggataaaattatattaag 40936137  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  40936136 tgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgct 40936037  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40936036 atagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttca 40935996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Original strand, 22622549 - 22622780
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  22622549 atttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 22622648  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  22622649 ttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaag 22622748  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgata 247  Q
    | || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  22622749 tgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 21009632 - 21009948
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  21009632 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatc 21009731  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |  | || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||   ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  21009732 tttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaa 21009831  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||  |||||||||||  ||| |||||||||    
T  21009832 gtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgt 21009931  T
Q  315 tatagtgttaacttcac 331  Q
    |||||||| || |||||    
T  21009932 tatagtgtcaaattcac 21009948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 14586511 - 14586796
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| |||||    
T  14586511 atttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacc-gtactattttatcgttggcatct 14586609  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||  ||         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14586610 ttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaag 14586700  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttga 311  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||  ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  14586701 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgttactcacaacacttttga 14586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 270
Target Start/End: Original strand, 46994492 - 46994746
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||  | | | |||    
T  46994492 atttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatct 46994591  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||| |||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  46994592 ttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaag 46994691  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 270  Q
    | || |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46994692 tgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 22445899 - 22446250
Alignment:
Q  20 tttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatcttta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||| || | |||||||    
T  22445899 tttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatcttta 22445998  T
Q  119 acatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagttt 218  Q
    | ||||||| | || || |||||| || ||||||| || |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  22445999 atatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt-gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgt 22446097  T
Q  219 attcttgttaatctaatgaattgatgatactatga-agactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttat 317  Q
    | |||| || || | ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | | |||||||| |||    
T  22446098 agtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatat 22446196  T
Q  318 agtgttaacttca-ctagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 370  Q
    | ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  22446197 aatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaatttccc 22446250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 43975723 - 43976056
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  43975723 atttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatct 43975822  T
Q  116 ttaacatgcaaacag---agatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagatt 212  Q
    |||||||| |||||    || || |||||| ||| ||||||       |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43975823 ttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt-------gttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagatt 43975915  T
Q  213 aagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgat 312  Q
    ||||  | | |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||  ||||||| |||   ||| ||||||| |||||||||||    
T  43975916 aagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgat 43976015  T
Q  313 gttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    | ||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  43976016 gctatagtgttgacttc---aaaaaagtcattctcatgacttca 43976056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29164134 - 29163912
Alignment:
Q  37 tgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatctttaacatgcaaacagagatg 135  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29164134 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttg 29164035  T
Q  136 gtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaat 235  Q
     |||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  29164034 ctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgat 29163944  T
Q  236 gaattgatgatactatgaagactgaacttttg 267  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29163943 gaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 328
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828843
Alignment:
Q  31 gattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctttaacatgcaaaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| | | |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  130 gagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaa 229  Q
     || || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttca 54828745  T
Q  230 tctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 328  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |  |||  |||| ||  |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  54828746 tatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattaca-tttttatgttatagtgttaactt 54828843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213163
Alignment:
Q  159 gtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagact 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  259 gaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcatt 358  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||      
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcacc 51213154  T
Q  359 atagaattt 367  Q
    |||||||||    
T  51213155 atagaattt 51213163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38592043 - 38591727
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | || ||||| ||||||||||||| | |||||| || | ||||||| ||| |||||    
T  38592043 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtcatct 38591944  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    || ||||||||| |||  || |||||| |||||||||| |||||||| |   |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591943 ttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaag 38591844  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaa----acagtatggtgttactcacaacacttttga 311  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||    ||| |  | |||||||| | | | ||||||    
T  38591843 tgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaacaatacaatgagatgttactccctataattttga 38591744  T
Q  312 tgttatagtgttaactt 328  Q
    |||||||||||||||||    
T  38591743 tgttatagtgttaactt 38591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 54506153 - 54505802
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || || ||||||||| ||| | ||    
T  54506153 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatc 54506054  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| | ||  | |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||   ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  54506053 tttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaa 54505954  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| |  ||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || | || ||| | |  |||||||||||  ||| |||||||||    
T  54505953 gtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatg-aggctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgt 54505855  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||   |||||||| ||| |||||    
T  54505854 tatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattcttgcgacttcatcataaaattt 54505802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36012484 - 36012245
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||   ||| ||||||||| || ||||||    
T  36012484 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatct 36012385  T
Q  116 ttaacatgcaaac-agagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggat-aaaattagatta 213  Q
    |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36012384 ttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagatta 36012285  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatga 253  Q
     || |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  36012284 ggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatga 36012245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1090038 - 1089842
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| | ||| ||||||||| || ||||||    
T  1090038 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatct 1089940  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg-tgttacatttaaaacaagataggataaaattagatt 212  Q
    |||||||||||| |||| || |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1089939 ttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 1089842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 53176278 - 53176074
Alignment:
Q  137 tgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatg 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  53176278 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatg 53176179  T
Q  237 aattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaa 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||  |   ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  53176178 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagt-ggacattacttacaacatttttgatgttatgatgttaacttcatcagaa 53176080  T
Q  337 aagtca 342  Q
    ||||||    
T  53176079 aagtca 53176074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 372
Target Start/End: Original strand, 27480189 - 27480566
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaa----catcttgaacttacaagtaatattttatccttg-c 111  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||    ||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  27480189 atttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcgttggc 27480288  T
Q  112 atctttaacatgcaaacagagatggt----gatatcatgtgatagttttaagtgttatacttt---gtg----------gggtgttacatttaaaacaag 194  Q
    |||||||||||||||||| | || ||    ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||    |||          |||||||||| |||||||||     
T  27480289 atctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttacacttaaaacaat 27480388  T
Q  195 ataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgtt 294  Q
     |||||||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |  | || |    
T  27480389 gtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattggatgct 27480488  T
Q  295 actcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| |||| || | |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27480489 actcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttcatcatagaattttccat 27480566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373483
Alignment:
Q  189 aacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  289 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcactataaaattttccat 20373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Original strand, 11835496 - 11835788
Alignment:
Q  49 aatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgcatctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtg 148  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  | | |   |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  11835496 aatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgtt--aacat---catgcaaatagagttgatgatatcatgtg 11835590  T
Q  149 atagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaa-attagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgata 247  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||    
T  11835591 atagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgata 11835690  T
Q  248 ctatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctc 347  Q
    |||||                 |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  11835691 ctatg-----------------gggactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttg-----atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 11835768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 51212602 - 51212738
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcct-tgcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |  | ||||    
T  51212602 atttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatct 51212701  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatag 152  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  51212702 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 51212738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 50475143 - 50475041
Alignment:
Q  30 tgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaac 128  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  50475143 tgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaac 50475044  T
Q  129 aga 131  Q
    |||    
T  50475043 aga 50475041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Original strand, 20373136 - 20373263
Alignment:
Q  78 catcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg 176  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  20373136 catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatggga 20373235  T
Q  177 tgttacatttaaaacaagataggataaa 204  Q
    | ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  20373236 tattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 11356989 - 11357140
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||        |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || |||| |    
T  11356989 atttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaatt--------aatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatat 11357080  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggg 175  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  11357081 ttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2613963 - 2613894
Alignment:
Q  288 tggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||    
T  2613963 tggtgttactcacaacacttttggtgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattttaatgacttcat 2613894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33698260 - 33698186
Alignment:
Q  289 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||  |||||||||    
T  33698260 ggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcactagaga----attctcatgacttcaccatagaattt 33698186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 127
Target Start/End: Original strand, 53811596 - 53811676
Alignment:
Q  48 taatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatctttaacatgcaaa 127  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  53811596 taatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaaa 53811676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Original strand, 53811698 - 53811767
Alignment:
Q  221 tcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaag------actgaacttttgatgccactgtacaaaca 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811698 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggttatatactgaacttttgatgccactgtacaaaca 53811767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Original strand, 20373094 - 20373131
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagt 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20373094 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt 20373131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 40640634 - 40640679
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40640634 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 40640679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 55343405 - 55343466
Alignment:
Q  306 ttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  55343405 ttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 55343466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Original strand, 32180747 - 32180781
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32180747 ttaacttcactagaaaagtcattctcataacttca 32180781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4556587 - 4556542
Alignment:
Q  323 taacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttc 368  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4556587 taacttcacgagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttc 4556542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42204391 - 42204338
Alignment:
Q  321 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 374  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  42204391 gttaacttcatcagaaaagtcattctcacgacttcacgatagaattttccataa 42204338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 45879498 - 45879543
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45879498 ttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcagcatagaattt 45879543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 370
Target Start/End: Original strand, 23165838 - 23165886
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 370  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  23165838 ttaacttcactaaaaaaatcattatcatgacttcaccatagaatttccc 23165886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 370
Target Start/End: Original strand, 38392628 - 38392676
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttccc 370  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  38392628 ttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatataatttccc 38392676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 374
Target Start/End: Original strand, 53811976 - 53812028
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 374  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  53811976 ttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccataa 53812028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4167276 - 4166925
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  4167276 atttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatct 4167177  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4167176 ttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 4167077  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||  |    
T  4167076 tgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatact 4166977  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  4166976 ataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 4166925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 33660226 - 33660568
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||  || ||||||||| ||| |||||    
T  33660226 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatct 33660325  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33660326 ttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgg---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 33660416  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33660417 tgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgtt 33660516  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  33660517 atagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattt 33660568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264277
Alignment:
Q  18 tttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgt-gatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4264125  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |    
T  4264126 tgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgct 4264225  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  4264226 atagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattt 4264277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 31570583 - 31570934
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  31570583 atttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatct 31570682  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  31570683 ttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaag 31570782  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31570783 tgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgtt 31570882  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  31570883 atagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattt 31570934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478366
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catcttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   || ||||||||| ||| |||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  118 aacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaa-ttagattaagt 216  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||     ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtg-----ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 4478523  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4478522 gtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgtta 4478423  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctc-atgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  4478422 tagtgttaacttcaccaaaaatatcattttctatgacttcactatagaattttccat 4478366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 19424491 - 19424817
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgcatctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||| |||             |||    
T  19424491 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat-------------ctt 19424577  T
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||     
T  19424578 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagc 19424677  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424678 gtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgtta 19424777  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19424778 tagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgacttca 19424817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 33709081 - 33709396
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  33709081 atttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatct 33709180  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33709181 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 33709280  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
      ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33709281 cgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgtt 33709380  T
Q  316 atagtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  33709381 atagtgttaacttcac 33709396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 374
Target Start/End: Original strand, 33550832 - 33551193
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaat----agtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||| |    
T  33550832 atttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaa 33550931  T
Q  113 -tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagat 211  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||| ||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  33550932 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagat 33551030  T
Q  212 taagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttga 311  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  33551031 taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttga 33551130  T
Q  312 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataa 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  33551131 tgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccataa 33551193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13711813 - 13711467
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatc-cttgcatct 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  13711813 atttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatct 13711714  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||     | ||||||||||||||||     
T  13711713 ttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaac-----atgataaaattagattaaa 13711619  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  13711618 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgct 13711519  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  13711518 ataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattt 13711467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 43648094 - 43648409
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| | |||    
T  43648094 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatct 43648193  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  43648194 ttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaag 43648293  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  43648294 tgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgtt 43648393  T
Q  316 atagtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  43648394 atagtgttaacttcac 43648409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36641989
Alignment:
Q  66 taatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgtta 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  165 tactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaa--ttagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaac 262  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 36642094  T
Q  263 ttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatag 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  36642093 ttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatag 36641994  T
Q  363 aattt 367  Q
    |||||    
T  36641993 aattt 36641989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26357931 - 26357591
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||    
T  26357931 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatct 26357832  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26357831 ttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaag 26357732  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |  |||||||||| | |||||||||| |  |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  26357731 tgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgtt 26357632  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  26357631 atagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttca 26357591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3177293 - 3176942
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| |||||    
T  3177293 attttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatct 3177194  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3177193 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaag 3177094  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||| ||    
T  3177093 tgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatatt 3176994  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| || | ||||||  |||||||||    
T  3176993 atagtattaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaattt 3176942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4763985 - 4763631
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  4763985 atttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatct 4763886  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||| |||  || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4763885 ttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaag 4763786  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || | |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || |    
T  4763785 tgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgat 4763686  T
Q  316 atag---tgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||   |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4763685 atagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattt 4763631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 43770697 - 43771038
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||  ||| |||||    
T  43770697 atttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatct 43770796  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||         |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  43770797 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaag 43770887  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43770888 tatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 43770987  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  43770988 atagtgttaacttcacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaattt 43771038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19313850
Alignment:
Q  32 attactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaa---gtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaa 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||   ||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  128 cagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgtt 227  Q
    || || || |||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19314086 catagttgctgatatcatgtgatagt-------gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgtt 19313994  T
Q  228 aatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19313993 aatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaact 19313895  T
Q  328 tcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  19313894 tcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttccat 19313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 27349797 - 27350102
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  || ||||||||| ||| | |||    
T  27349797 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaatct 27349896  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||         |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27349897 ttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaag 27349987  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27349988 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgct 27350086  T
Q  316 atagtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  27350087 atagtgttaacttcac 27350102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 2325227 - 2325570
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  2325227 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatct 2325326  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2325327 ttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaag 2325426  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || ||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  ||| || |||||||    
T  2325427 tgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgtt 2325518  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  2325519 atattgttaacttcacgagaaaagtcattcacataacttcaccatagaattt 2325570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 11366229 - 11366581
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | ||    
T  11366229 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatc 11366328  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  11366329 tttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaa 11366428  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
     | || ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||  | |||||||||  ||| |||||||||    
T  11366429 atgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgt 11366528  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  11366529 tatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattt 11366581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 29241994 - 29242347
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||        ||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||| |||||    
T  29241994 atttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatt-------catcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatct 29242086  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29242087 ttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 29242186  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| | | |||| |||||    
T  29242187 tgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgtt 29242286  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccataaca 376  Q
    ||||| |||||||||| | ||||  |||| |||||||||||  ||||||||| || |||||    
T  29242287 atagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttccttaaca 29242347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37906064 - 37905747
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||| | |||    
T  37906064 atttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatct 37905965  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg--tgttacatttaaaacaagataggataaaattagatta 213  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37905964 ttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatta 37905865  T
Q  214 agtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatg 313  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||   ||| |||| |||    
T  37905864 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatg 37905765  T
Q  314 ttatagtgttaacttcac 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37905764 ttatagtgttaacttcac 37905747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44286285 - 44285963
Alignment:
Q  35 actgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatctttaacatgcaaacagaga 133  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||  || ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||     
T  44286285 actgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagt 44286186  T
Q  134 tggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatcta 233  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  44286185 tgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctg 44286086  T
Q  234 atgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacta 333  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  44286085 atgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatca 44285986  T
Q  334 gaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||| |||||| ||||||||||    
T  44285985 gaaaaatcattcgcatgacttca 44285963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 18494130 - 18494457
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  18494130 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatct 18494229  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  18494230 ttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaag 18494328  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |            ||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  18494329 tgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------------gtggggtgttactcacaacacttttgatgct 18494416  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18494417 atagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttca 18494457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 39167218 - 39167552
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  39167218 atttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 39167317  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||      |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  39167318 ttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagtt------gttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataag 39167411  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  39167412 tgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatact 39167511  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||  |||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||    
T  39167512 attctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttca 39167552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41465853 - 41465512
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catcttt 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  41465853 ttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttt 41465754  T
Q  118 aacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtt 217  Q
    |||||||||||| |  || |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41465753 aacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtt 41465654  T
Q  218 tattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttat 317  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||  ||        || |||| ||||||| |||| ||||||| |||    
T  41465653 cagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgataccagcgt--------tagggtgctactcactacacctttgatgctat 41465562  T
Q  318 agtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41465561 agtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattt 41465512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44914021 - 44913665
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcat---ctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-ca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||    
T  44914021 atttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggca 44913922  T
Q  113 tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtgggg-tgttacatttaaaacaagataggataaaattagat 211  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  44913921 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagat 44913822  T
Q  212 taagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactat-gaagactgaacttttgatgccactgtacaaac-agtatggtgttactcacaacactttt 309  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||| || | ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  44913821 taagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactcacaacattttt 44913722  T
Q  310 gatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||  || |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  44913721 gatactacagtgttaacttcac-ataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 44913665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41961194 - 41960940
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  41961194 atttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatct 41961095  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41961094 ttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaag 41960995  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 270  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41960994 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 344
Target Start/End: Original strand, 19289172 - 19289500
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||  | | | |||    
T  19289172 atttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatct 19289271  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19289272 ttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaag 19289371  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||  | | ||||||||||    
T  19289372 tgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgtt 19289471  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcatt 344  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  19289472 atagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 367
Target Start/End: Original strand, 41463780 - 41464050
Alignment:
Q  98 tattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagat 196  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||  |    
T  41463780 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagt 41463879  T
Q  197 aggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttac 296  Q
    | |||||||||| |||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41463880 atgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttac 41463979  T
Q  297 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||  |||||||||    
T  41463980 tcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaattt 41464050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 77 - 367
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071937
Alignment:
Q  77 acatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggg 175  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  176 gtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccact 275  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  276 gtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||| | |  | ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  17071846 gtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattt 17071937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5881883 - 5881548
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||  ||| |||||    
T  5881883 atttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttgacatct 5881784  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| |  || |||||||||||||         |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||     
T  5881783 ttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaa 5881694  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacact-----tttg 310  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||     ||||    
T  5881693 tgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgttttg 5881594  T
Q  311 atgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  5881593 atgttataatatcaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttca 5881548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 367
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054296
Alignment:
Q  77 acatcttgaacttacaagtaatattttatccttgcatc-tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggg 175  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  176 gtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccact 275  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||||||||| || |    
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  276 gtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    ||||||||| |  | ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  17054205 gtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattt 17054296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 300
Target Start/End: Original strand, 7006787 - 7007054
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  7006787 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatct 7006886  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||                 |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7006887 ttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaag 7006969  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcac 300  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  7006970 tgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtgggatgttactcac 7007054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31862206 - 31861953
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||| ||||||||  | | | ||     
T  31862206 atttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatcc 31862107  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  || | |||||||||||||||    
T  31862106 ttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaag 31862007  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgat 269  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  31862006 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35959246 - 35958906
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |    ||| ||||||||| ||| | |||    
T  35959246 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacat----gtactattttatcgttgaaatct 35959151  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  35959150 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaag 35959052  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    |  | |||||||||| | |||||||||||            |||||||||| ||| || ||||||||||||  |||||| ||||  ||| |||| |||||    
T  35959051 tgcagtcttgttaatatgatgaattgatg------------ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgtt 35958964  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccata 373  Q
    ||||||  |||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  35958963 atagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcatcatagaattttccata 35958906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 117 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902066
Alignment:
Q  117 taacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagt 216  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaat 33902220  T
Q  217 ttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtta 316  Q
     || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||  ||| |||||||| ||| |||| ||||      
T  33902219 atagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgt-- 33902122  T
Q  317 tagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||    
T  33902121 tagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaacgacttcatcatagaattttccat 33902066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327806
Alignment:
Q  66 taatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgtta 164  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  165 tactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaactt 264  Q
     ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaactt 45327826  T
Q  265 ttgatgccactgtacaaaca 284  Q
    |||||| ||| ||| |||||    
T  45327825 ttgatgtcaccgtataaaca 45327806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 19500764 - 19500923
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||    
T  19500764 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatct 19500863  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggg 175  Q
    |||||||| ||| |||| || | |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  19500864 ttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 18258232 - 18258349
Alignment:
Q  112 atctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagat 211  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18258232 atctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagat 18258331  T
Q  212 taagtttattcttgttaa 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18258332 taagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 343
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  225 gttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccact-gtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtt 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  324 aacttcactagaaaagtcat 343  Q
    | |||||  |||||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 41051149 - 41051260
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatcctt-gcatct 115  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |    
T  41051149 atttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttatccttggcat-t 41051247  T
Q  116 ttaacatgcaaac 128  Q
    |||||||||||||    
T  41051248 ttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 18257387 - 18257453
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatctt 83  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18257387 attttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 267
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  187 aaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttg 267  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| | || | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 33902368 - 33902317
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  33902368 atttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41960949 - 41960886
Alignment:
Q  304 acttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||  |||||||||    
T  41960949 acttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatttctatgacttcaccatagaattt 41960886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 41463439 - 41463505
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatctt 83  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  41463439 atttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatctt 41463505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6177823 - 6177790
Alignment:
Q  322 ttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttc 355  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6177823 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 6177790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 482 - 137
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||      ||||||||| ||| |||||    
T  482 atttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgtac------tattttatcgttggcatct 389  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  388 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaa 289  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||  |    
T  288 tgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatact 189  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  188 acagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Original strand, 408260 - 408559
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  408260 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatct 408359  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  408360 ttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaag 408459  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  || | ||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  408460 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacatttttgatgtt 408558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 349
Target Start/End: Original strand, 94335 - 94547
Alignment:
Q  137 tgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatg 236  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||    
T  94335 tgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatg 94434  T
Q  237 aattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaa 336  Q
    ||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  94435 aattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaa 94534  T
Q  337 aagtcattctcat 349  Q
    |||||||| ||||    
T  94535 aagtcattttcat 94547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Original strand, 93933 - 94044
Alignment:
Q  19 ttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catcttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  93933 ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatcttt 94032  T
Q  118 aacatgcaaaca 129  Q
    ||||||||||||    
T  94033 aacatgcaaaca 94044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8241 - 7890
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  8241 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatct 8142  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    ||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  8141 ttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaag 8042  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  8041 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgtt 7942  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  7941 atagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattt 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44310 - 43960
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  44310 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatct 44211  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||||     
T  44210 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagctt-aagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaa 44112  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    |||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  44111 tgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatatt 44012  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||  |||||||||    
T  44011 atagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaattt 43960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 367
Target Start/End: Original strand, 154477 - 154827
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| | |||    
T  154477 atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatct 154576  T
Q  116 ttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaag 215  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||||     
T  154577 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagctt-aagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaa 154675  T
Q  216 tttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgtt 315  Q
    | || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    |||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  154676 tgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatatt 154775  T
Q  316 atagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||  |||||||||    
T  154776 atagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaattt 154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 267600 - 267331
Alignment:
Q  56 attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttg-catctttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagt- 153  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||     
T  267600 attcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 267501  T
Q  154 tttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaagtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatga 253  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||      
T  267500 tttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatag 267401  T
Q  254 agactgaacttttgatgccactgtac-aaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  267400 agactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Original strand, 145846 - 146187
Alignment:
Q  17 atttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtg-attcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttacaagtaatattttatccttgca-tc 114  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||   | ||||||||| ||| | ||    
T  145846 atttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatc 145945  T
Q  115 tttaacatgcaaacagagatggtgatatcatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacatttaaaacaagataggataaaattagattaa 214  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  145946 tttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaa 146045  T
Q  215 gtttattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtatggtgttactcacaacacttttgatgt 314  Q
    || || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | |  |||||||||||  ||| |||| ||||    
T  146046 gtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacattttttatgt 146145  T
Q  315 tatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    |||| ||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||    
T  146146 tataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgacttca 146187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 289 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42429 - 42362
Alignment:
Q  289 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  42429 ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttca 42362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 100885 - 100824
Alignment:
Q  306 ttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaattt 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  100885 ttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattt 100824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100994
Alignment:
Q  26 ttgttgattactgattaatgattaatagtgattcatctagtaatggttgcaacatcttgaacttaca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttaca 100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 372
Target Start/End: Original strand, 12137 - 12188
Alignment:
Q  321 gttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcattatagaatttcccat 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  12137 gttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcatagaattttccat 12188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University