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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF19358_high_17 (Length: 520)
Name: NF19358_high_17
Description: NF19358
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19358_high_17 |
 |  |
|
| [»] scaffold0150 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (105 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr8 (72 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (70 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (6 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr4 (65 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (61 HSPs) |
 |  |
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| [»] chr1 (45 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0162 (4 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0025 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0032 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (3 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0016 (5 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |
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| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |
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| [»] scaffold0004 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0970 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0670 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0193 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |
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| [»] scaffold0598 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0165 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0148 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0253 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0342 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0034 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0310 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0133 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0406 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0153 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0601 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0065 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0561 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1295 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0634 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0390 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0231 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0335 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0130 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0786 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0327 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0081 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1311 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0029 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0207 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0173 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0367 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0740 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0615 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0260 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0118 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0150 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28978
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28466 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaag |
28565 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28566 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttg |
28665 |
T |
 |
| Q |
208 |
agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28666 |
agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatca |
28765 |
T |
 |
| Q |
308 |
taattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat |
407 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28766 |
taattagagcacgaatgataacaactttggacaattaatcatttactcaattaagaacttattcatacaacaattgaaaatttaaactaaaaatgattat |
28865 |
T |
 |
| Q |
408 |
gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctc |
507 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28866 |
gatgaattctaaccccgttaccttagttagatcaaatccctagcccaagcttcactttagttcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc |
28965 |
T |
 |
| Q |
508 |
ttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
28966 |
ttctctctaaccc |
28978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Original strand, 21637 - 21687
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcacc |
58 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21637 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc |
21687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 105)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 47785064 - 47784567
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47785064 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaag |
47784965 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47784964 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataa------------ |
47784877 |
T |
 |
| Q |
208 |
agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47784876 |
-------ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca |
47784784 |
T |
 |
| Q |
308 |
taattagagcacaaattataacaactt----tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatga |
403 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47784783 |
taattagagcacgaattataacaacttcctttgaacaataaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatga |
47784684 |
T |
 |
| Q |
404 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt |
503 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
47784683 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatattcaggtt |
47784584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 39656492 - 39656966
Alignment:
| Q |
44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
143 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39656492 |
tttttcaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaa |
39656591 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
243 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656592 |
ccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg |
39656691 |
T |
 |
| Q |
244 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt |
343 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
39656692 |
aacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaatt |
39656791 |
T |
 |
| Q |
344 |
aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat |
443 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39656792 |
aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcact--aaatgattatgatcaattctaactcccttaccttagttagatcaat |
39656889 |
T |
 |
| Q |
444 |
tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656890 |
tccctagctcaagcttcattttaactcctaggttctatcatcttcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
39656966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 58 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576249
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
3576705 |
caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaa |
3576606 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3576605 |
catgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataattcaatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttca |
3576506 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3576505 |
ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
3576406 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa |
456 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
3576405 |
ttaagcacttattcgtacaacaattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacaaattcctagcccaag |
3576307 |
T |
 |
| Q |
457 |
cttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctct |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||| |
|
|
| T |
3576306 |
cttcactttacctcctaggatctcttccaattcttgaatattcaagctcttcttctct |
3576249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 30 - 501
Target Start/End: Original strand, 12952915 - 12953388
Alignment:
| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac |
128 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
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| T |
12952915 |
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228 |
Q |
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T |
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328 |
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426 |
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12953313 |
T |
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501 |
Q |
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| T |
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Target: chr3; HSP #5
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Target Start/End: Complemental strand, 11329230 - 11328774
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T |
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255 |
Q |
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| T |
11329130 |
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11329031 |
T |
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355 |
Q |
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11328936 |
T |
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455 |
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T |
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517 |
Q |
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11328835 |
gcttcactttagctcctaggtcctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaa |
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Target: chr3; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 17191519 - 17191965
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Q |
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| T |
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17191618 |
T |
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| Q |
156 |
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255 |
Q |
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| T |
17191619 |
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17191718 |
T |
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| Q |
256 |
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355 |
Q |
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| T |
17191719 |
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17191818 |
T |
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| Q |
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454 |
Q |
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| T |
17191819 |
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17191917 |
T |
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501 |
Q |
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aacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag |
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Target: chr3; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 17139486 - 17139949
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Q |
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T |
 |
| Q |
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255 |
Q |
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| T |
17139586 |
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17139685 |
T |
 |
| Q |
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355 |
Q |
| |
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| T |
17139686 |
caccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacacttaatcaattactc |
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T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
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| T |
17139786 |
aattaagcacttattcatacaacaattg-aaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagcccaa |
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T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
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Target: chr3; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 16880111 - 16880565
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| |
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| T |
16880111 |
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16880210 |
T |
 |
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ttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac |
265 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
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| T |
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ttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagcatattctaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaac |
16880310 |
T |
 |
| Q |
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aattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcac |
365 |
Q |
| |
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| T |
16880311 |
aattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaaacac |
16880410 |
T |
 |
| Q |
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ttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcacttt |
465 |
Q |
| |
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| T |
16880411 |
ttgttcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagcttcacttt |
16880510 |
T |
 |
| Q |
466 |
agctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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16880511 |
agcttctaggtcctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
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T |
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Target: chr3; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14059482 - 14059021
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |
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14059383 |
T |
 |
| Q |
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aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
|
|||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcatatttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaattt |
14059283 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
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| | || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||| || |
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| T |
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14059183 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
|
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| T |
14059182 |
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14059086 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
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|
|
| T |
14059085 |
acttcactttagctcctaggttcttctctccacttgaatcttcaagctcctattctctcgaaccc |
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T |
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Target: chr3; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 17960602 - 17960131
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17960503 |
T |
 |
| Q |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
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| T |
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agcagcaaacacatcaattgaatatgaatctcagcataattcaacatcaacataacacaaattgtcatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
17960403 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||| |||| |||| | | |
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| T |
17960402 |
atactttgatcattcaatttcacccacaaaaaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacgaattctaaccatcat |
17960303 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
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|
| T |
17960302 |
gaacaattaattaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
17960203 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctc |
507 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17960202 |
agatcaattccctagctcaagtttcactttagctcctaggttctctcctcttcttcaatcttcaagttcctc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
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Q |
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ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa |
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T |
 |
| Q |
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caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
243 |
Q |
| |
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| T |
9590935 |
caacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcataattcatatcataccactttcacatactttg |
9590836 |
T |
 |
| Q |
244 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt |
343 |
Q |
| |
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| T |
9590835 |
aacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaacaatt |
9590736 |
T |
 |
| Q |
344 |
aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaa-ttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
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|
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| T |
9590735 |
aaccacttattcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaatccccttaccttagttag |
9590643 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 15876046 - 15876503
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56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| || |
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|
| T |
15876046 |
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T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
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| T |
15876146 |
aacatgaatcttatcacaattcaacaacaacttatgataatccaacaatttgagtatcattcaagatatatcactttctcatacttggaacataaaattt |
15876245 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
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Q |
| |
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|| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | || || ||||||||||| || |
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| T |
15876246 |
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T |
 |
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aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa-cccccttaccttagtta-ggtcaattccctagccc |
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Q |
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| T |
15876338 |
aattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccccttaccttaattatcgtcaatt-cctagccc |
15876436 |
T |
 |
| Q |
454 |
aaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
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| T |
15876437 |
aagcttcactttaactcctaagatctctccaactcttgaatcttcaagctcctcatctctctaaccc |
15876503 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 45 - 475
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17205078
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Q |
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17204667 |
tttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaac |
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T |
 |
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aacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttga |
244 |
Q |
| |
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aacatccattaaacatgattcctatcacaattcaacaacaatatagca-------------------taattcaacatatatcactttctcatactttga |
17204847 |
T |
 |
| Q |
245 |
acatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatta |
344 |
Q |
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| T |
17204848 |
acatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaatta |
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T |
 |
| Q |
345 |
atcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgat-gaattctaacccccttaccttagttaggtcaat |
443 |
Q |
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| T |
17204948 |
atcatttactcaattaagcacttgttcgtaccacaattgaaaaattacact-aaaatgattatgatggaattctaacccccttaccttaattatcaccaa |
17205046 |
T |
 |
| Q |
444 |
tccctagcccaaacttcactttagctcctagg |
475 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
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ttcctagcccaagcttcactttagctcctagg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12489017 - 12488659
Alignment:
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133 |
Q |
| |
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| T |
12489017 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcac |
12488918 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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| T |
12488917 |
ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
12488818 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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| T |
12488817 |
tcatactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaatt |
12488718 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac |
392 |
Q |
| |
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| T |
12488717 |
atgaacaattaattaatgactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac |
12488659 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 141 - 437
Target Start/End: Original strand, 30207279 - 30207575
Alignment:
| Q |
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Q |
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caacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatact |
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T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
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| T |
30207379 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaata |
30207478 |
T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
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| T |
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attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttaccttagttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38810820
Alignment:
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135 |
Q |
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| T |
38811297 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt |
38811198 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
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| T |
38811197 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
38811098 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
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| T |
38811097 |
gtattttgatcattcaatttcaccaacaacaaattaattatcatcaattccttacatacaaaaagaacatcataattggagcacgaattctaacaatcat |
38810998 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
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| T |
38810997 |
gaacaattaatca--------attaagcacttattcatgcaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
38810906 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
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| T |
38810905 |
atcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccagttcttgaatcttcaagctcctcttctatctaaccc |
38810820 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 451
Target Start/End: Original strand, 14080489 - 14080882
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Q |
| |
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| T |
14080489 |
caacaacaactcatttctcatcaccaaatcatgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaattgaa |
14080588 |
T |
 |
| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
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| T |
14080589 |
catggttctcatcataattcaacaacaatatagcacaattcacccaattgagcataattcataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattca |
14080688 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
14080689 |
ctaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatctatgcacaattaatcatttatccaa |
14080788 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagc |
451 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14080789 |
ttaaacacttattcataccatagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttacattaattccctagc |
14080882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12560505 - 12560042
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||| |||| | | | |||||||||||||||| |||||||||| | || |
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|
| T |
12560505 |
accaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattg |
12560406 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
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| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
12560405 |
atcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt |
12560306 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
|
| | ||||| ||||||| ||||| || |||| | |||||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
12560305 |
ctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
12560206 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagccca |
454 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12560205 |
aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagttagattaatctccctaactta |
12560108 |
T |
 |
| Q |
455 |
aacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| || ||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12560107 |
agcttcaatttagctcata-gttctcttccaatccttgattcttcaagttccccttctctctaaccc |
12560042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14815032 - 14814653
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| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
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| T |
14815032 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaattatgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
14814933 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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| T |
14814932 |
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14814833 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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|
| T |
14814832 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagcaaataatcacttattcaa |
14814733 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
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| T |
14814732 |
ttaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttag |
14814653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11061293 - 11060814
Alignment:
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acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
137 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11061293 |
acccattttcaccaaatcaacaacaataacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
11061194 |
T |
 |
| Q |
138 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctca |
236 |
Q |
| |
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| T |
11061193 |
caccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctca |
11061094 |
T |
 |
| Q |
237 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttg |
336 |
Q |
| |
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|
| T |
11061093 |
tactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccatt |
11060995 |
T |
 |
| Q |
337 |
aacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta |
436 |
Q |
| |
|
||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
11060994 |
aacaaataattaattatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aattatgattatgatgaattccaacccccttaccttagtta |
11060898 |
T |
 |
| Q |
437 |
ggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
| | ||| |||||||| || ||||| ||| |||||||| | |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
11060897 |
gattaatctccctagcttaagcttcagttttgctcctagctctcttccactccttgattcttcaagttccccttctctctaacc |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 230 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11882313 - 11882025
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tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac |
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Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| |
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|
| T |
11882313 |
tttcacatactatgaacattcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcatgaaattcaac |
11882214 |
T |
 |
| Q |
330 |
aactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc |
429 |
Q |
| |
|
| || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
11882213 |
atctaagaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaa--tgattatgatgaattctaacccccttacc |
11882116 |
T |
 |
| Q |
430 |
ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
11882115 |
ttagttagatcaattccctaggtcaagcttcactttagctcctaggatctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
11882025 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 14295415 - 14295879
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55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
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Q |
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| T |
14295415 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt |
14295514 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
| |
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|| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |
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| T |
14295515 |
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14295614 |
T |
 |
| Q |
254 |
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352 |
Q |
| |
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| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || | |
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| T |
14295615 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
14295714 |
T |
 |
| Q |
353 |
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451 |
Q |
| |
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| || || ||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |
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| T |
14295715 |
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14295810 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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| |||| |||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
14295811 |
ttagggttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
14295879 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 55 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 55441119 - 55440668
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
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| T |
55441119 |
caccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatcaatt |
55441020 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
| |
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|| |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
55441019 |
gatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatactttgaacatgaaat |
55440920 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
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| T |
55440919 |
tccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
55440820 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc |
451 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
55440819 |
cccaattaagcacttattcat---acaattg----------caataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc |
55440733 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctcta |
516 |
Q |
| |
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| | ||||| ||| |||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
55440732 |
ctaggcttcaattttgctcctagctctcttccaatccttgattcttcaagttcctcttctttcta |
55440668 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34560134
Alignment:
| Q |
36 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
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|
| T |
34559857 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
34559956 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| T |
34559957 |
agcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaacaactacataacataattcaaaatttagagcataattcaacatgtaacacattcac |
34560056 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataatta |
313 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34560057 |
atattttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattataatta |
34560134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6228916 - 6228626
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
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| T |
6228916 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatttc |
6228817 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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|
| T |
6228816 |
ttagcaacaacaacatcaattaaacatgatccacatcataattcgacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttc |
6228717 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
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|
|
| T |
6228716 |
acatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaatt |
6228626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 14301042 - 14301506
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
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|
| T |
14301042 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt |
14301141 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14301142 |
gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaatt |
14301241 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a |
352 |
Q |
| |
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| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || | |
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| T |
14301242 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
14301341 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc |
451 |
Q |
| |
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| || || ||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |
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|
| T |
14301342 |
cccattttagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctaga |
14301437 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14301438 |
ttagggttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
14301506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 13301564 - 13301278
Alignment:
| Q |
230 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac |
329 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
13301564 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaac |
13301465 |
T |
 |
| Q |
330 |
aactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc |
429 |
Q |
| |
|
| || |||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13301464 |
atctaagaaccaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacact--aaatgattatgatgaattctaacccccttacc |
13301367 |
T |
 |
| Q |
430 |
ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13301366 |
ttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacatcttcttgaatcttcaag--cctcttctctctaacc |
13301278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 13312220 - 13311934
Alignment:
| Q |
230 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac |
329 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |
|
|
| T |
13312220 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaac |
13312121 |
T |
 |
| Q |
330 |
aactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc |
429 |
Q |
| |
|
| || |||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13312120 |
atctaagaaccaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacact--aaatgattatgatgaattctaacccccttacc |
13312023 |
T |
 |
| Q |
430 |
ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13312022 |
ttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacatcttcttgaatcttcaag--cctcttctctctaacc |
13311934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 4162474 - 4162057
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
4162474 |
accaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatagttcttagcaacaacaacatcaatta |
4162375 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
4162374 |
aacatgattcacgtcatcattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacttgtaattt |
4162275 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
4162274 |
caccaacagcaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaacaaataatcacttattc |
4162175 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccc |
453 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| | | |||||| |||| ||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |
|
|
| T |
4162174 |
aattaagcacttaatcatgcctttaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaactctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctagccc |
4162078 |
T |
 |
| Q |
454 |
aaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4162077 |
aaacttcaatttagctcctag |
4162057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31412610 - 31412289
Alignment:
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acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac |
147 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
31412610 |
acaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaac |
31412511 |
T |
 |
| Q |
148 |
atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaaca |
247 |
Q |
| |
|
||||| | ||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
31412510 |
atcaattaaacctaattctcatcacaattcaacaacaacatatcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaaca |
31412411 |
T |
 |
| Q |
248 |
tgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaat |
346 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || | || |||| |
|
|
| T |
31412410 |
tgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataat |
31412311 |
T |
 |
| Q |
347 |
catttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31412310 |
cacttattcaattaagcactta |
31412289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 50313144 - 50313478
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact |
134 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| || | || |||||| |||||||| | |||||||| | ||||||| | ||| | ||||||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
50313144 |
atcaacctattttacaaaaccaaccacgacaacttatttctcatcgtcaaatcataatttatgaatactcaaactatgaatcatcaacaacaatatctct |
50313243 |
T |
 |
| Q |
135 |
tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
234 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
50313244 |
taacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacatatcacaatccaacatttagagcacaattcacaatatatcattttca |
50313343 |
T |
 |
| Q |
235 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt |
334 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
50313344 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttcaacaacta |
50313443 |
T |
 |
| Q |
335 |
tgaac-aattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50313444 |
tgagcaaaataatcacttactcaattaagcactta |
50313478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 333
Target Start/End: Original strand, 41661545 - 41661820
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| || ||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| || | || |||||||||||| | || |
|
|
| T |
41661545 |
caacaacaacttatttatcatcatcaattcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctctcaacaacaacaacatcaattaaa |
41661644 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
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| T |
41661645 |
catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
41661744 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
41661745 |
ccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattttaacaact |
41661820 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 288
Target Start/End: Original strand, 1990759 - 1991012
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35 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |
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| T |
1990759 |
atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc |
1990858 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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||| || ||||||||||| | |||||| |||| | ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
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| T |
1990859 |
ttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattc-acaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
1990957 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat |
288 |
Q |
| |
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|||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
1990958 |
atctactatgaacatgcaatttcacaaacaataattcaattattaccaatttcat |
1991012 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
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Target Start/End: Original strand, 54423993 - 54424371
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
54423993 |
caacaacaacttatttctcat-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatcaattgat |
54424091 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
54424092 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttgaacatgtaattca |
54424190 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc |
355 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| || | |
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|
| T |
54424191 |
actaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccc |
54424290 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424291 |
aattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattga---aataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
54424371 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 176 - 368
Target Start/End: Original strand, 15517728 - 15517921
Alignment:
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274 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
15517728 |
tcaacaacaacttagcacaattcatcaatttaagcacaattcacaatatacccatttatacataccatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt |
15517827 |
T |
 |
| Q |
275 |
atcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15517828 |
atcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcactta |
15517921 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 33369199 - 33368780
Alignment:
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||||| || | |
|
|
| T |
33369199 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattcc |
33369100 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||| || ||| |||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||| |
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|
| T |
33369099 |
ttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcac-------agtataa------------cattttc |
33369019 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
33369018 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaaccacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccacaattaaagcacgaatttcaacaact |
33368919 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
||||||| |||| | ||| |||| |||||||||| |||| ||| | |||||||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33368918 |
atgaacaaataattaattattcaaataagcacttaatcatgcaattaatgaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttt |
33368821 |
T |
 |
| Q |
433 |
gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33368820 |
gttagcacaaat-cctagccaaaacttcaatttagctcctag |
33368780 |
T |
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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43427805 - 43427460
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| Q |
35 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| | || || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
43427805 |
atcaacccattttcacaaaaccaacatcaacaacttatttcatatcacaaactcatgatttatgaacaccaaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
43427706 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| | | |||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| |
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|
| T |
43427705 |
--aacaacaacaacatcaattaatcatgattctcatcacaactcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttc |
43427608 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaa---ttcaaacatatcatcataattagagcacaaattataaca |
330 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
43427607 |
acatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcatcaaacatatcaccataacaagagcacgaatttcaaca |
43427508 |
T |
 |
| Q |
331 |
actttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
||| || | || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43427507 |
actaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttatgcatacaa |
43427460 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 365 - 520
Target Start/End: Original strand, 15520336 - 15520488
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cttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactt |
464 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
15520336 |
cttaatcatacaacaat-gaaaaattacactaaaa-tgattatgatgaattataacccc-ttatcttagttaggtcaattccctagcccaagcttcaatt |
15520432 |
T |
 |
| Q |
465 |
tagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15520433 |
aagctcctaggttctctcctcttcttaaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
15520488 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 437
Target Start/End: Original strand, 3578057 - 3578445
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44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaa-caacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| | || |||||| || |||| ||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
3578057 |
ttttaccaaaacaccaacaacctctcattcctccacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagcca---atttttaatcaacaacatgacttagcaaca |
3578153 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactt |
241 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
3578154 |
acaa-atcaattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatatactattttctcatactt |
3578252 |
T |
 |
| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaa |
341 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||| | || | ||||||| |
|
|
| T |
3578253 |
tgaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacattc-aacatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaa |
3578351 |
T |
 |
| Q |
342 |
ttaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3578352 |
ttaatcaatttacccaattaagcacttattcctacaataattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttaccttagttag |
3578445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 444
Target Start/End: Original strand, 17100636 - 17101016
Alignment:
| Q |
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caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat |
160 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
17100636 |
caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat |
17100735 |
T |
 |
| Q |
161 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc |
259 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | | | |||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
17100736 |
gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaact |
17100834 |
T |
 |
| Q |
260 |
aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaat |
358 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | || |||||||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
17100835 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaat |
17100934 |
T |
 |
| Q |
359 |
taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt |
444 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17100935 |
taagcactt-ttcatacaaaaattgaaaat---agcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatt |
17101016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 444
Target Start/End: Original strand, 17101321 - 17101701
Alignment:
| Q |
61 |
caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat |
160 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
17101321 |
caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat |
17101420 |
T |
 |
| Q |
161 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc |
259 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | | | |||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
17101421 |
gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaact |
17101519 |
T |
 |
| Q |
260 |
aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaat |
358 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | || |||||||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
17101520 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaat |
17101619 |
T |
 |
| Q |
359 |
taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt |
444 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17101620 |
taagcactt-ttcatacaaaaattgaaaat---agcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatt |
17101701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 55 - 439
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || | ||||||||||| | |
|
|
| T |
14298399 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaatt |
14298497 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| || | | || | |||||||||||| ||| |
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|
| T |
14298498 |
gatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaat |
14298596 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a |
352 |
Q |
| |
|
| || ||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
14298597 |
tcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
14298696 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14298697 |
cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
14298780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 14304026 - 14304407
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || | ||||||||||| | |
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|
| T |
14304026 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaatt |
14304124 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| || | | || | |||||||||||| ||| |
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| T |
14304125 |
gatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaat |
14304223 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a |
352 |
Q |
| |
|
| || ||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| || | |
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|
| T |
14304224 |
tcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
14304323 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304324 |
cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
14304407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17523176 - 17522781
Alignment:
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39 |
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136 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || ||||| |
|
|
| T |
17523176 |
acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgactta |
17523078 |
T |
 |
| Q |
137 |
gcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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||| |||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||| | |
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|
| T |
17523077 |
gcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccattttgtt |
17522979 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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|
| T |
17522978 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttat |
17522879 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
17522878 |
gaacaaataatcaattcacccaaataagcactt-ctcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
17522783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 50112309 - 50111858
Alignment:
| Q |
67 |
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166 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||||| ||| |||| || |
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|
| T |
50112309 |
ctcatttctcaaaaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaact |
50112210 |
T |
 |
| Q |
167 |
tactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac |
265 |
Q |
| |
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|| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
50112209 |
tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaac |
50112111 |
T |
 |
| Q |
266 |
aattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagca |
364 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |||||||||| |
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| T |
50112110 |
aattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca |
50112011 |
T |
 |
| Q |
365 |
cttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcac |
462 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||| |
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| T |
50112010 |
ctt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaa |
50111915 |
T |
 |
| Q |
463 |
tttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50111914 |
ttttgctccta-gctctcttcacaccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
50111858 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 520
Target Start/End: Original strand, 48421843 - 48422018
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| Q |
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442 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48421843 |
taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaa--tgattatgatgaattctaactctcttaccttagttagatcaa |
48421940 |
T |
 |
| Q |
443 |
ttccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48421941 |
ttccctagctctagcttcactttaactcctagccctcttccaatccttgaatcttcaagctccttttctctctaaccc |
48422018 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 10912842 - 10913141
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||| | |
|
|
| T |
10912842 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctgtgaatcatcaacatcaatatctc |
10912940 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt |
232 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| | |||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | ||| |
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|
| T |
10912941 |
atgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttt |
10913040 |
T |
 |
| Q |
233 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaac |
332 |
Q |
| |
|
| |||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
10913041 |
cacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaac |
10913140 |
T |
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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Original strand, 35123674 - 35124052
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
35123674 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
35123772 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | |||| | ||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
35123773 |
gatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccttttcatacacttt-aacatgtaat |
35123870 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| || || |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
35123871 |
tcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
35123970 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35123971 |
cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccctttaccttagttag |
35124052 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14528282 - 14528124
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
14528282 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt |
14528183 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
213 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
14528182 |
gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata |
14528124 |
T |
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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12349761 - 12349427
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| Q |
103 |
ccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaaca |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || | | ||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
12349761 |
ccaagccatgatttatcatctacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcacca |
12349662 |
T |
 |
| Q |
203 |
atttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacata |
301 |
Q |
| |
|
||| ||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || || || || |||||| |
|
|
| T |
12349661 |
att-gagcatattttcaacatataacaacttctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatg |
12349563 |
T |
 |
| Q |
302 |
tcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaa |
399 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | || | || |||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
12349562 |
tcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaattaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataa |
12349467 |
T |
 |
| Q |
400 |
atgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349466 |
gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
12349427 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4145954 - 4145791
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283 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || ||||| | |||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4145954 |
aacatagcacaattcaacatttagagcacagttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaa- |
4145856 |
T |
 |
| Q |
284 |
ttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatca |
348 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
4145855 |
ttcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaacaaataatca |
4145791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 394 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12487709 - 12487583
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ctaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaa |
493 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| | |||| | |||||| |
|
|
| T |
12487709 |
ctaaaaacgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcattttagctcttagctctcttccaatccttgaa |
12487610 |
T |
 |
| Q |
494 |
tcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12487609 |
tcttcaagttcctcttctctctaaccc |
12487583 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
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acatcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
19946727 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||||| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
19946728 |
ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataaatcatcaatt |
19946826 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
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Query Start/End: Original strand, 8 - 115
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acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| | |||||| |
|
|
| T |
7853913 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgattcatgcaaacccaag |
7854011 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
7854012 |
ccatgaat |
7854019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 8 - 115
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8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
33341812 |
acataatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
33341910 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
33341911 |
ccatgaat |
33341918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22144542 - 22144165
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| || || | ||||||||| |||| || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
22144542 |
caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaacaacaacaatt |
22144443 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaa |
252 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
22144442 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
22144344 |
T |
 |
| Q |
253 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt- |
351 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||| || |
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|
| T |
22144343 |
ttcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacagttaatcaattc |
22144245 |
T |
 |
| Q |
352 |
actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
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|
| T |
22144244 |
acccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
22144165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 275
Target Start/End: Original strand, 11638337 - 11638554
Alignment:
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58 |
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157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| | || | || ||||||||| |||| ||| ||| || | | |||||||||||| | || |
|
|
| T |
11638337 |
caacaacaactcatttcttatcatcaattcatgatttatacatacctaggctatgaatcatcaacaccaatatctctgaataacaacaacatcaattaaa |
11638436 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
|
|||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11638437 |
catgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
11638536 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaatta |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11638537 |
ccaacaacaattcaatta |
11638554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 14528111 - 14527887
Alignment:
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294 |
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392 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |
|
|
| T |
14528111 |
caaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc |
14528013 |
T |
 |
| Q |
393 |
actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttg |
491 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| | || | |||| |
|
|
| T |
14528012 |
aataaa--tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctctcccccaatccttg |
14527915 |
T |
 |
| Q |
492 |
aatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14527914 |
attcttcaagttcctcttctctctaacc |
14527887 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 317778 - 317403
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| | | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
317778 |
caccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
317679 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
317678 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattt-agcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaatt |
317580 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttact |
354 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||| ||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
317579 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcat |
317480 |
T |
 |
| Q |
355 |
c-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
317479 |
ccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
317403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 54685625 - 54685519
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
54685625 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaatccaag |
54685527 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
54685526 |
ccatgaat |
54685519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9303425 - 9303276
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
9303425 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatggtatatgaacacccaa |
9303327 |
T |
 |
| Q |
107 |
gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||| | |||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9303326 |
gccataattcatagtcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa |
9303276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 270
Target Start/End: Original strand, 17938535 - 17938766
Alignment:
| Q |
39 |
acccattttacaaaatcaccaacaacaactcat-ttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
137 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| || || |
|
|
| T |
17938535 |
acccatttt-caaaaacaacaacaacaactcatcttttcatctccaattcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatat |
17938633 |
T |
 |
| Q |
138 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctca |
236 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17938634 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaacaaagcataattcatcaatta-agcatattttcaacatatatcaacttctca |
17938732 |
T |
 |
| Q |
237 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
17938733 |
tactttgaacatgcaattcaactaacaacaattc |
17938766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16996321 - 16995954
Alignment:
| Q |
63 |
acaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgt |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
16996321 |
acaactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatga |
16996222 |
T |
 |
| Q |
163 |
ttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaac |
262 |
Q |
| |
|
| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
16996221 |
aacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaagtaac |
16996123 |
T |
 |
| Q |
263 |
aacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatc-atttactcaatta |
360 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||| |||| |||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
16996122 |
aacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatt-tcaccacttatgaataattaatcaattcatccaatta |
16996024 |
T |
 |
| Q |
361 |
agcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996023 |
agcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
16995954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19570957 - 19570584
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
19570957 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaac-caagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
19570859 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19570858 |
gatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttccacatatactcattttcatacactttgaacatgtaat |
19570760 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| | || | |||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
19570759 |
tcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaaattaatcaattca |
19570661 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19570660 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagt |
19570584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 340 - 442
Target Start/End: Original strand, 34560130 - 34560231
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| Q |
340 |
aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagg |
438 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34560130 |
aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgatcatgattgaattctaacccccttaccttaattagc |
34560227 |
T |
 |
| Q |
439 |
tcaa |
442 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
34560228 |
tcaa |
34560231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 333
Target Start/End: Original strand, 8604977 - 8605080
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| Q |
230 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac |
329 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
8604977 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattattaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac |
8605076 |
T |
 |
| Q |
330 |
aact |
333 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
8605077 |
aact |
8605080 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 13817492 - 13817864
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||| | |
|
|
| T |
13817492 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgact---aaacaacaacaacaatt |
13817588 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13817589 |
gatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttccacatatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
13817687 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||| | ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| | || | || |||||||||| ||| | |
|
|
| T |
13817688 |
tcaactaac-ataattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtacaattaatcaattca |
13817786 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13817787 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 433
Target Start/End: Original strand, 8631769 - 8632143
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| Q |
58 |
caacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactga |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| | ||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
8631769 |
caacaacaactcattttctcatcttcaattcgtgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttg |
8631868 |
T |
 |
| Q |
157 |
acatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8631869 |
ttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaaagcataattcactaaata-agcatattttcaacatataccaacttctcaaactttgaacatgtaattc |
8631967 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcatttact |
354 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
8631968 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatc |
8632067 |
T |
 |
| Q |
355 |
caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8632068 |
caattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttaccttag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16182215 - 16181840
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | | |||||||| ||| | |
|
|
| T |
16182215 |
caccaccaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaatt |
16182116 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||| | | |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16182115 |
gatcattaaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttg-gcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
16182017 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
16182016 |
ttaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
16181918 |
T |
 |
| Q |
354 |
tc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16181917 |
tccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
16181840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19261105 - 19260840
Alignment:
| Q |
59 |
aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | ||||||| ||| || |||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
19261105 |
aacaacaacttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatc |
19261006 |
T |
 |
| Q |
159 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
19261005 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaa |
19260907 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19260906 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
19260840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 216
Target Start/End: Original strand, 38167894 - 38168051
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
38167894 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
38167993 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38167994 |
catgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcataatt |
38168051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 51961107 - 51961030
Alignment:
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51961107 |
tcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttag |
51961030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16934263 - 16934101
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
16934263 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca |
16934165 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | || |||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
16934164 |
acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
16934101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11477467 - 11477318
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| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11477467 |
accaacaacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattg |
11477369 |
T |
 |
| Q |
156 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11477368 |
aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt |
11477318 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 51961403 - 51961310
Alignment:
| Q |
59 |
aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |
|
|
| T |
51961403 |
aacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaa |
51961310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8269020 - 8268872
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| | |
|
|
| T |
8269020 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaatta |
8268923 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8268922 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
8268872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8276120 - 8275972
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| | |
|
|
| T |
8276120 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaatta |
8276023 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8276022 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
8275972 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 304
Target Start/End: Original strand, 11402602 - 11402816
Alignment:
| Q |
91 |
aattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatag |
190 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||||| | ||||||| | | |||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
11402602 |
aattatgaacatccaaggtatgaatcatcaacaacaacatatcataacaacaacaacatcaattaaacatgtattcaatcacaaatcaacaacaacctaa |
11402701 |
T |
 |
| Q |
191 |
cataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatg |
289 |
Q |
| |
|
|| |||||| | ||||||||| |||||| ||||| | ||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
11402702 |
cacaattcatccatttgagcacaattcacaatatacctatttatacaccccatgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcata |
11402801 |
T |
 |
| Q |
290 |
aattcaaacatatca |
304 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |
|
|
| T |
11402802 |
tactcaaacatatca |
11402816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 14284940 - 14285089
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
14284940 |
accaacaacatctcaattcacaccaacat-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctgagcaacaacaacatcaattg |
14285038 |
T |
 |
| Q |
156 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14285039 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
14285089 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38375779 - 38375697
Alignment:
| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
38375779 |
tgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
38375697 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 6146759 - 6146657
Alignment:
| Q |
335 |
tgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146759 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
6146664 |
T |
 |
| Q |
433 |
gttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
6146663 |
gttaggt |
6146657 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
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Target Start/End: Original strand, 15550922 - 15551030
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| Q |
401 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaa |
500 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | | |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15550922 |
tgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactcgtaggatctctccaactcttgaatcttcaa |
15551021 |
T |
 |
| Q |
501 |
gttcctctt |
509 |
Q |
| |
|
| ||||||| |
|
|
| T |
15551022 |
gctcctctt |
15551030 |
T |
 |
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| Q |
401 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6154257 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
6154219 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #84
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| Q |
102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||| | || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
| T |
15859262 |
cccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
15859163 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || | ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
15859162 |
aatt-gagcacaattttcacaacttatcatttgttcata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
15859066 |
T |
 |
| Q |
300 |
tatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
15859065 |
tatcatcacagttggagcacgaatt |
15859041 |
T |
 |
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| Q |
399 |
aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta |
436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40939445 |
aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta |
40939482 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #86
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| Q |
260 |
aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196384 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatt |
11196320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
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Query Start/End: Original strand, 43 - 324
Target Start/End: Original strand, 13838861 - 13839140
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| | |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
13838861 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat-atgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcc |
13838959 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatact |
240 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||| | || || |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| || | ||||| || || || | |
|
|
| T |
13838960 |
ataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gagcacaattttcacaacttatcatttgttccta-t |
13839057 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
13839058 |
ttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
13839140 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
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295 |
aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaacaa-ttgaaaatttac |
392 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
38527945 |
aaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaatagttgaaaatt--- |
38528040 |
T |
 |
| Q |
393 |
actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
38528041 |
ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaagcttcaattttgctcctag |
38528121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
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Query Start/End: Original strand, 30 - 148
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| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac |
128 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
30152893 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat |
30152992 |
T |
 |
| Q |
129 |
atcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
|| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
30152993 |
atgactaaacaacaacaaca |
30153012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
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Query Start/End: Original strand, 92 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38375911 - 38375804
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| Q |
92 |
attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagc |
191 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | | || |||||||||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38375911 |
attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacagtatctcatgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacatagc |
38375812 |
T |
 |
| Q |
192 |
ataattca |
199 |
Q |
| |
|
| |||||| |
|
|
| T |
38375811 |
acaattca |
38375804 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #91
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||| | |
|
|
| T |
6147015 |
caccaacaacatctcatttctccatacaaaatcatgaatcatgaaa-cccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaatt |
6146917 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
6146916 |
gaccatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaatt |
6146866 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #92
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| Q |
397 |
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493 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
12031826 |
aaaatgattatgattgaattctaaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaa |
12031925 |
T |
 |
| Q |
494 |
tcttcaa |
500 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
12031926 |
tcttcaa |
12031932 |
T |
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Target: chr3; HSP #93
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142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
| T |
17956274 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
17956175 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
17956174 |
acaaca |
17956169 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #94
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Target Start/End: Original strand, 18910960 - 18911068
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
18910960 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
18911058 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18911059 |
acaacatcaa |
18911068 |
T |
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Target: chr3; HSP #95
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Target Start/End: Original strand, 18970255 - 18970318
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| Q |
410 |
tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18970255 |
tgaaatctaacccccttaccttagttagcacaaat-cctagcccaaacatcaatttagctcctag |
18970318 |
T |
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
51158118 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
51158035 |
T |
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Target: chr3; HSP #97
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| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
53898721 |
caacaacatctcatttctcaacat-aaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgat |
53898623 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
53898622 |
catgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaatt |
53898575 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21167131 - 21167097
Alignment:
| Q |
275 |
atcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21167131 |
atcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata |
21167097 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15936727 - 15936663
Alignment:
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
15936727 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat |
15936663 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15938569 - 15938505
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
15938569 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgattacaaacatatcat |
15938505 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Original strand, 8632197 - 8632229
Alignment:
| Q |
488 |
cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8632197 |
cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
8632229 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12030247 - 12030164
Alignment:
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
12030247 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
12030164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
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Target Start/End: Original strand, 14080902 - 14080934
Alignment:
| Q |
488 |
cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14080902 |
cttgaatcttcaagttcctcttctctccaaccc |
14080934 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14842661 - 14842578
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
14842661 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
14842578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 491 - 519
Target Start/End: Original strand, 55192439 - 55192467
Alignment:
| Q |
491 |
gaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55192439 |
gaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
55192467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 513
Target Start/End: Original strand, 43645824 - 43646331
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| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43645824 |
acatcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcaaatgacatca-caaatcatgaattatgaacacccaag |
43645922 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43645923 |
tcatgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
43646022 |
T |
 |
| Q |
208 |
agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
43646023 |
agcataattcaacatatatcactttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaaca |
43646122 |
T |
 |
| Q |
308 |
taattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat |
407 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43646123 |
taattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaaacacttattcatacaacaattggaaatttacactaaaaatgattat |
43646222 |
T |
 |
| Q |
408 |
ga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttc |
504 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43646223 |
gactgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttc |
43646322 |
T |
 |
| Q |
505 |
ctcttctct |
513 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
43646323 |
ttcttctct |
43646331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 39 - 520
Target Start/End: Original strand, 67952 - 68433
Alignment:
| Q |
39 |
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137 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
67952 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag |
68051 |
T |
 |
| Q |
138 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat |
237 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
68052 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat |
68151 |
T |
 |
| Q |
238 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
68152 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
68251 |
T |
 |
| Q |
338 |
acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
68252 |
acaattaatctattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
68351 |
T |
 |
| Q |
438 |
gtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
68352 |
attaattccctagctcaagcttcactttagcttctagg-tctctccaactcttgaatcttcaacctcatcttctctctaaccc |
68433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 54 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31146451 - 31145985
Alignment:
| Q |
54 |
tcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || | ||||||| | || | |||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
31146451 |
tcaccaacaataactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaat |
31146352 |
T |
 |
| Q |
154 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31146351 |
tgaacaggaatcttattacaattcaacaaca-catagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacataaaat |
31146253 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||| | || ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31146252 |
ttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaattac |
31146153 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaa-ttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcc |
452 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
31146152 |
tcagttaagcacttattcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattctctagcc |
31146053 |
T |
 |
| Q |
453 |
caaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31146052 |
caagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagctcctgttctctctaaccc |
31145985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 25305423 - 25305874
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56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
25305423 |
accaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattg |
25305522 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaa-caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25305523 |
aacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacacatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
25305622 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttact |
354 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25305623 |
tcatcaacaa---------------caacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact |
25305707 |
T |
 |
| Q |
355 |
caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccc |
453 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | | | |||||| |
|
|
| T |
25305708 |
caattaagcacttattcatacaacaattgtaaaattatact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcatagccc |
25305806 |
T |
 |
| Q |
454 |
aaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25305807 |
aagcttcactttaactcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcctattctctctaaccc |
25305874 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3052
Alignment:
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36 |
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135 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
3529 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaa-tcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt |
3431 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| || | | ||||||||| || || || | ||| || ||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
3430 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaacctaagcataattcaaca------tatcacaaattgacatttagagaataatatgacatatatcattttcat |
3337 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
3336 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattctaacaatcat |
3237 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3236 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacataatcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
3137 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3136 |
agatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctcttctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
3052 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 36 - 503
Target Start/End: Original strand, 722353 - 722813
Alignment:
| Q |
36 |
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135 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
722353 |
tcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactt |
722452 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
722453 |
agcagcaactacttcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataa----acatatatcattttcat |
722548 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
722549 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataatatcataattggagcacgaattttaacaattat |
722648 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
722649 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgcaaa-ttgcact--aaatgattatgatgaattctaacccctttaccttagtt |
722745 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt |
503 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
722746 |
agttcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctctcatcttcttgaatcttcaagtt |
722813 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 45 - 501
Target Start/End: Original strand, 19666495 - 19666950
Alignment:
| Q |
45 |
tttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaac |
144 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19666495 |
tttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaac |
19666594 |
T |
 |
| Q |
145 |
aacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttga |
244 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
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| T |
19666595 |
aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacacttatacatactttga |
19666694 |
T |
 |
| Q |
245 |
acatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatta |
344 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19666695 |
acatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaatta |
19666794 |
T |
 |
| Q |
345 |
atcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt |
444 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
19666795 |
atcacttattcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaat |
19666892 |
T |
 |
| Q |
445 |
ccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19666893 |
tcctagcccaaacttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag |
19666950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24294792 - 24294328
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
24294792 |
accaacaattacttatttctcatccacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattg |
24294693 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | | ||||||||| ||||||| || |||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
24294692 |
aacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttggagcataatataacatatatcattttcatatactttgatcattcaattt |
24294593 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24294592 |
caccaacaacaaatcaattatcatcaatttctcacatacaattataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactc |
24294493 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24294492 |
aattaagaatttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaactttaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaa |
24294393 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24294392 |
acttcaatttagctcctaggttctctcctcctcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
24294328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19669376 - 19668915
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19669376 |
caacaacaactcatttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
19669277 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
|
|||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||| | || ||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19669276 |
catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcatgattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttca |
19669177 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19669176 |
ccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaa |
19669077 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac |
457 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
19669076 |
ttaatcacttattcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaaccccgttaccttagttagattaattccctagctcaagc |
19668978 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcactttagctcctaggt-tctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19668977 |
ttcactttagctcctagctctcttt-caatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
19668915 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 141 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22775389 - 22775064
Alignment:
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caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
240 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22775389 |
caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaattcaacatatataactttctcatact |
22775290 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
22775289 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaa--------- |
22775199 |
T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22775198 |
-ttaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattcttacccccttaccttagttagatc |
22775100 |
T |
 |
| Q |
441 |
aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggt |
476 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22775099 |
aattccctacctcaagattcactttagctcctaggt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 141 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22780767 - 22780442
Alignment:
| Q |
141 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
240 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22780767 |
caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaattcaacatatataactttctcatact |
22780668 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
22780667 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaa--------- |
22780577 |
T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc |
440 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22780576 |
-ttaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattcttacccccttaccttagttagatc |
22780478 |
T |
 |
| Q |
441 |
aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggt |
476 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22780477 |
aattccctacctcaagattcactttagctcctaggt |
22780442 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 344
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884952
Alignment:
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35 |
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134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
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atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctat |
24884742 |
T |
 |
| Q |
135 |
tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24884743 |
tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataactcacaatatatcactttca |
24884842 |
T |
 |
| Q |
235 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24884843 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacaacta |
24884942 |
T |
 |
| Q |
335 |
tgaacaatta |
344 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
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tgaaaaatta |
24884952 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24571572 - 24571098
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| Q |
44 |
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143 |
Q |
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T |
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243 |
Q |
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24571374 |
T |
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343 |
Q |
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T |
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443 |
Q |
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24571177 |
T |
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| Q |
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520 |
Q |
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24571176 |
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24571098 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 19433649 - 19433448
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8 |
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107 |
Q |
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19433550 |
T |
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108 |
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207 |
Q |
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| T |
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19433450 |
T |
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| Q |
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209 |
Q |
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19433449 |
ag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
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Target Start/End: Complemental strand, 22580140 - 22579754
Alignment:
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44 |
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143 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
144 |
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242 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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342 |
Q |
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| T |
22579943 |
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22579845 |
T |
 |
| Q |
343 |
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436 |
Q |
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| T |
22579844 |
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22579754 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 259 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23821705 - 23821467
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358 |
Q |
| |
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| T |
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23821606 |
T |
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| Q |
359 |
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458 |
Q |
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| T |
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23821508 |
T |
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| Q |
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499 |
Q |
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23821507 |
tcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 259 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23830784 - 23830546
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358 |
Q |
| |
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caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttactcaat |
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T |
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| Q |
359 |
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458 |
Q |
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| T |
23830684 |
taagcacttaagcatgcaataattgaaaaattacact--aaatgattataatgaaatctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagct |
23830587 |
T |
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| Q |
459 |
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499 |
Q |
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| T |
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tcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 28974026 - 28974489
Alignment:
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Q |
| |
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28974026 |
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28974125 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
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| T |
28974126 |
gatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaa-atgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaat |
28974224 |
T |
 |
| Q |
254 |
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352 |
Q |
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| T |
28974225 |
tcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
28974324 |
T |
 |
| Q |
353 |
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451 |
Q |
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| T |
28974325 |
ccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaatt---gaaataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc |
28974420 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
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| |||||| ||| |||||||| | | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28974421 |
ttagacttcaattttgctcctagctctctcccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 9636701 - 9637045
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133 |
Q |
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| T |
9636701 |
atcaacccattttaacaaaaccaacaacaacaagttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctc |
9636800 |
T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
| |
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| T |
9636801 |
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9636900 |
T |
 |
| Q |
234 |
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333 |
Q |
| |
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| T |
9636901 |
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9637000 |
T |
 |
| Q |
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377 |
Q |
| |
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|| | || |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |
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| T |
9637001 |
aagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaa |
9637045 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 519
Target Start/End: Original strand, 25601989 - 25602466
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Q |
| |
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|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||| | || | |||||||| || ||||| || |
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|
| T |
25601989 |
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25602088 |
T |
 |
| Q |
143 |
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241 |
Q |
| |
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| T |
25602089 |
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25602187 |
T |
 |
| Q |
242 |
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341 |
Q |
| |
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| T |
25602188 |
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25602287 |
T |
 |
| Q |
342 |
ttaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc |
440 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25602288 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt |
25602385 |
T |
 |
| Q |
441 |
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519 |
Q |
| |
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| T |
25602386 |
aatctccctagcttaggcttcaattttgctcata-gctcttcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 437
Target Start/End: Original strand, 24277739 - 24278120
Alignment:
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Q |
| |
|
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| T |
24277739 |
accaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcattta |
24277838 |
T |
 |
| Q |
156 |
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255 |
Q |
| |
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| T |
24277839 |
aacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaattt |
24277938 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaattaatcatttact |
354 |
Q |
| |
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| T |
24277939 |
caccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt-tcacaactaagagaaaaataatcacttatt |
24278037 |
T |
 |
| Q |
355 |
caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
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|
| T |
24278038 |
caattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaaatctaacccccttaccttaattag |
24278120 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Original strand, 19660032 - 19660319
Alignment:
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230 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac |
329 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || | ||| |
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| T |
19660032 |
tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaac |
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T |
 |
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330 |
aactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc |
429 |
Q |
| |
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| || |||||| |||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
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| T |
19660132 |
atctaagaacaaataatcacttattccattaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact-aaagtgattatgatgaattctaa-ccccttacc |
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T |
 |
| Q |
430 |
ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
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Q |
| |
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| T |
19660230 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24087537 - 24087295
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atcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcata |
374 |
Q |
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24087437 |
atcaccaatttcatgtgctcaaacatatcatcataattagagcccgaattttaacatttatgaataattaatcacttactcaattaagcacttaatcata |
24087338 |
T |
 |
| Q |
375 |
caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa |
419 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24087337 |
caacaa-tgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaa |
24087295 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 27261783 - 27262245
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154 |
Q |
| |
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caccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaatatcaatt |
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T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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|| |||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
27261883 |
gatcatgaaacttat--caatttctcatactttgagcataattcaccaat--gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
27261978 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
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| T |
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tgaactaacaacaattcaattatccataactttatacatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca |
27262078 |
T |
 |
| Q |
354 |
tc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc |
451 |
Q |
| |
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| T |
27262079 |
tccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaa--tgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaatctccctagc |
27262176 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27262177 |
ttaggcttcaatttagctcctagctttcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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T |
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Target: chr2; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 36890952 - 36890574
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157 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
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caacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaacaattgat |
36890853 |
T |
 |
| Q |
158 |
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256 |
Q |
| |
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| T |
36890852 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatattccattttctcatactttgaacatgtaattca |
36890754 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc |
355 |
Q |
| |
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| T |
36890753 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccc |
36890654 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||| | |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36890653 |
aaataagcactt-ttcataccataattgaaaat---aacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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T |
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Target: chr2; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 55 - 439
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154 |
Q |
| |
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|
| T |
271148 |
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T |
 |
| Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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| T |
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaat |
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T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
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| || |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||| |||||||| ||| | |
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| T |
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tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattca |
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T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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T |
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Target: chr2; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 4448402 - 4448023
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| Q |
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154 |
Q |
| |
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|
| T |
4448402 |
caccaacaacatctcatttttcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
4448304 |
T |
 |
| Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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|| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| || ||||| | | | |||| | |||||||||||| ||| |
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|
| T |
4448303 |
gatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaatt-gaacatattttcaacacaaacccatttcatacactttgaacatgtaat |
4448205 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
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| || |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
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| T |
4448204 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
4448105 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcata-caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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ctcaattaagcactt-ttcatataaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
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Target Start/End: Complemental strand, 16292985 - 16292757
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240 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| | ||||| || |||| |||||| |
|
|
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caacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagtacaattcaacaattaaagcacaattgacaatataccattttcgcatact |
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T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- |
339 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
16292885 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacagttcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaatagcacaaatttcaacaactaagagca |
16292786 |
T |
 |
| Q |
340 |
aattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16292785 |
aaataatcacttacttaattaagcactta |
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T |
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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 257
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| | || || || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
6094772 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
6094871 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6094872 |
acatactatgaacatgcaatttca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23821892 - 23821730
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Q |
| |
|
||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |
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|
| T |
23821892 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
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T |
 |
| Q |
138 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaa |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23821792 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattcaa |
23821730 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23830971 - 23830809
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Q |
| |
|
||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23830971 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
23830872 |
T |
 |
| Q |
138 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaa |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23830871 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattcaa |
23830809 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 25594980 - 25595275
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
25594980 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcat---caacaatctctc |
25595075 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
25595076 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaaaaacaacatagcacaattcaacaattagagtacaattcacaatataccattttc |
25595175 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
25595176 |
acatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcatttatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcccaaatttcaacaact |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Original strand, 7321841 - 7321960
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |
|
|
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7321841 |
tgattataatgaattctaacccccttaccttagttagattaattcccaagctcaaacttcaatttagctcctagatctcttccaatccttgaatcttcaa |
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T |
 |
| Q |
501 |
gttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7321941 |
gttcctcttctctctaaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
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105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |
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|
| T |
25212977 |
acatcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaac-aatcatgatatatgaacaccca |
25213075 |
T |
 |
| Q |
106 |
agccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaat |
204 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |
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|
| T |
25213076 |
agccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 369
Target Start/End: Original strand, 32465835 - 32466149
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||||| | |
|
|
| T |
32465835 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt |
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T |
 |
| Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
32465935 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatatccatttttcatactttgaacatacaatt |
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T |
 |
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255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac |
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Q |
| |
|
|| |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
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T |
 |
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tcaattaagcacttat |
369 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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tcaaataagcacttat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 213
Target Start/End: Original strand, 22138140 - 22138295
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Q |
| |
|
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| T |
22138140 |
caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa |
22138239 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
213 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
22138240 |
catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata |
22138295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 324
Target Start/End: Original strand, 18536818 - 18537002
Alignment:
| Q |
141 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatac |
239 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| | ||||| | | |||| |||| |
|
|
| T |
18536818 |
caacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaatttaacaattagagcacaatttacaatatacccattttcacatat |
18536917 |
T |
 |
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
18536918 |
tatgaacatgcaatttcatctacagcaatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
18537002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25265695 - 25265525
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccattttaca-aaatcaccaacaacaactcat-ttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
132 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||| || ||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25265695 |
atcaacccattt-acataaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatca |
25265598 |
T |
 |
| Q |
133 |
cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
25265597 |
attaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaatt |
25265525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24827044 - 24826846
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
24827044 |
acatcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaac-aatcatgataaatgagcacccaa |
24826946 |
T |
 |
| Q |
107 |
gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||||| | |||| | ||||||| | || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
24826945 |
gccataattcataatcaacaacgtatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
24826846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23836975 - 23836599
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| || | |||||| || ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
23836975 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaacaacaacaacaacaatt |
23836876 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa |
252 |
Q |
| |
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||| || |||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
23836875 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
23836777 |
T |
 |
| Q |
253 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattta |
352 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
23836776 |
ttccactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc |
23836678 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctc-aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23836677 |
atctaattaagcactta-tcattcaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
23836599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28031516 - 28031366
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || | || |||||||||||| | |
|
|
| T |
28031516 |
accaacaacatctcattttctcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcaacaacaacaacatcaatt |
28031418 |
T |
 |
| Q |
155 |
g-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
| ||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28031417 |
gaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatatcataattcatcaatt |
28031366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 15633193 - 15633341
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
15633193 |
accaacaacatcttatttctcactaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcat-agcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
15633290 |
T |
 |
| Q |
156 |
aa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15633291 |
aaacttgtttctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
15633341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 205
Target Start/End: Original strand, 33128045 - 33128172
Alignment:
| Q |
81 |
acaaatcatgaattatgaactcc---caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattc |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| | |||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
33128045 |
acaaatcatgagttatgaacaccacccaagccatgaatcattaacaacaatatctcttaaccacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattc |
33128144 |
T |
 |
| Q |
178 |
aacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
33128145 |
aacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
33128172 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43643057 - 43642974
Alignment:
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43643057 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatt |
43642974 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 501
Target Start/End: Original strand, 24884943 - 24885062
Alignment:
| Q |
382 |
tgaaaatttacactaaaaatgattatgat-gaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctag-cccaaacttcactttagctcctaggttct |
479 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24884943 |
tgaaaaattacactaaa--tgattatgattgaattataacccccttaccttagtaagcacaatt-cctagccccaaacttcaatttagctcctaggatct |
24885039 |
T |
 |
| Q |
480 |
-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24885040 |
ctaccagttcttgaatcttcaag |
24885062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25875950 - 25875814
Alignment:
| Q |
295 |
aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttac |
392 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25875950 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttat-catacaaataattgaaaatt--- |
25875855 |
T |
 |
| Q |
393 |
actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875854 |
ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
25875814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24560964 - 24560867
Alignment:
| Q |
92 |
attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24560964 |
attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacata |
24560867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25265489 - 25265407
Alignment:
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
25265489 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatt |
25265407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 288
Target Start/End: Original strand, 20279575 - 20279621
Alignment:
| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat |
288 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
20279575 |
tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcat |
20279621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12636157 - 12636049
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
12636157 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaatccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
12636059 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12636058 |
acaacatcaa |
12636049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36982671 - 36982458
Alignment:
| Q |
110 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag |
209 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||| | || || ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
36982671 |
atgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaatt-gag |
36982573 |
T |
 |
| Q |
210 |
cataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
|
|| |||| || | ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36982572 |
cacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaatt-catgaatacaaacatatcatca |
36982475 |
T |
 |
| Q |
308 |
taattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
| || |||||| |||| |
|
|
| T |
36982474 |
cagttggagcacgaatt |
36982458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19794804 - 19794721
Alignment:
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
19794804 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
19794721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 127
Target Start/End: Original strand, 22283921 - 22284004
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa |
127 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
22283921 |
atttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgca-acccaagccatgtatcatcatcaacaa |
22284004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21197958
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21198434 |
attttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaaca |
21198335 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21198334 |
acaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
21198235 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || || |||||||| |
|
|
| T |
21198234 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaat |
21198135 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa |
442 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| | | |
|
|
| T |
21198134 |
taatcaattactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattataatgaattctaacccccttatcttaattatcacca |
21198036 |
T |
 |
| Q |
443 |
ttccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21198035 |
attcctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
21197958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
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Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837641
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Q |
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23837163 |
atttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
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T |
 |
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143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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acaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagttcaacatatatcactttctcatacttt |
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T |
 |
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243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
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| T |
23837363 |
gaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaat |
23837462 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca |
441 |
Q |
| |
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|
| T |
23837463 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatctata-ttaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc |
23837561 |
T |
 |
| Q |
442 |
attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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|
|
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23837562 |
gattcctagcccaaggttcactttatctcctaggatctcttcaaattcttgaatcttcaagctactcttctctctaaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5855036
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
5854572 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
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T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| T |
5854672 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcataattcaacatataacactttcat |
5854771 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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|
| T |
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atactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
5854871 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
5854872 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaat |
5854969 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5854970 |
tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 15933256 - 15933721
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135 |
Q |
| |
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tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
15933355 |
T |
 |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| T |
15933356 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatttaacactttcac |
15933455 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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| T |
15933456 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactat |
15933555 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
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| T |
15933556 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaat |
15933653 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
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||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15933654 |
tagcacaatttcctagcccaggcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
15933721 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011931
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135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
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T |
 |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
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| T |
26011552 |
agcaacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
26011651 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
26011652 |
atactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
26011751 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26011752 |
gaacaattaatcacttactcaattaaacacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaa---taacccccttaccttaat |
26011846 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
26011847 |
tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttacctcctatgatctctaccacttcttgaatcttcaagcttct-ttctctctaaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 39447034 - 39446572
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
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T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
|
| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39446935 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatatttcaacatataacacttcttcatactttaaacatgaaattc |
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T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39446835 |
cactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
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T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39446735 |
aattaagcatttattcatacaacaattg-aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaa |
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T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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39446636 |
gcttcaatttagctcatagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38534091
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||| | |
|
|
| T |
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38533706 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
38533707 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcatatttcaacatataccattttctc |
38533806 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||| | | |
|
|
| T |
38533807 |
atactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattat |
38533906 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38533907 |
gaacaattagtcaattacttaattaagcacttattcatacaataattcatacaacaattcataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtc |
38534006 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| | | |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
38534007 |
aaatcaatttcctagctctagcttcactttagctcctagctctcttccaatctttgaatcttcaagttcttcttctctctaaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 36 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22735697
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
22736127 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagtt |
22736028 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca-ctttct |
234 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
22736027 |
agcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgatcataattcaacatatatcattttttt |
22735928 |
T |
 |
| Q |
235 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | | |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
22735927 |
tatactttgaacatgaagttttaccaacaacaactcaattatcaaccacttcatgcattc-aacatattatcataattggagcacgaattct-------- |
22735837 |
T |
 |
| Q |
335 |
tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22735836 |
--aacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacattaaaaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagt |
22735739 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggt |
476 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22735738 |
tagataaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggt |
22735697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 35 - 501
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528848
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atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact |
134 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| || |
|
|
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atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaa-aatatctct |
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T |
 |
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tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
234 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
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tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcaacatatatcattttca |
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T |
 |
| Q |
235 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt |
334 |
Q |
| |
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||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |
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|
| T |
33528582 |
tatactaagaagatacaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatcta |
33528681 |
T |
 |
| Q |
335 |
tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33528682 |
agaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
33528779 |
T |
 |
| Q |
434 |
ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcct-cttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
|||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
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33528780 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 185 - 517
Target Start/End: Original strand, 25296265 - 25296598
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285 |
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384 |
Q |
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| T |
25296365 |
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25296464 |
T |
 |
| Q |
385 |
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483 |
Q |
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25296564 |
T |
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484 |
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517 |
Q |
| |
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| T |
25296565 |
tcttcttgaatcttcaagctcttcttctctctaa |
25296598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 33611334 - 33610877
Alignment:
| Q |
44 |
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143 |
Q |
| |
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| T |
33611334 |
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33611235 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
243 |
Q |
| |
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| T |
33611234 |
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33611135 |
T |
 |
| Q |
244 |
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343 |
Q |
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| T |
33611134 |
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33611035 |
T |
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| Q |
344 |
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442 |
Q |
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| T |
33611034 |
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33610939 |
T |
 |
| Q |
443 |
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501 |
Q |
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| T |
33610938 |
ttaatcctagcccaagtttaactttagctcctatgatcctcaccacttcttgaatcttcaag |
33610877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 197 - 517
Target Start/End: Original strand, 17285323 - 17285644
Alignment:
| Q |
197 |
tcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaa |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
17285323 |
tcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaa |
17285422 |
T |
 |
| Q |
297 |
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396 |
Q |
| |
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| T |
17285423 |
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17285522 |
T |
 |
| Q |
397 |
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495 |
Q |
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| T |
17285523 |
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17285622 |
T |
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| Q |
496 |
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517 |
Q |
| |
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| T |
17285623 |
ttcaagctcttcttctctctaa |
17285644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 185 - 517
Target Start/End: Original strand, 25758285 - 25758618
Alignment:
| Q |
185 |
acatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatt |
284 |
Q |
| |
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| T |
25758285 |
acatagaacaattcaacaatttgagcataattcaacatatatcattttcaaaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatt |
25758384 |
T |
 |
| Q |
285 |
tcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattga |
384 |
Q |
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| T |
25758385 |
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25758484 |
T |
 |
| Q |
385 |
aaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcc |
483 |
Q |
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| T |
25758485 |
aaatttacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctct |
25758584 |
T |
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| Q |
484 |
tcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaa |
517 |
Q |
| |
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| T |
25758585 |
tctttttgaatcttcaagctcttcttctctctaa |
25758618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23226368 - 23225891
Alignment:
| Q |
35 |
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132 |
Q |
| |
|
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| T |
23226368 |
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23226269 |
T |
 |
| Q |
133 |
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232 |
Q |
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| T |
23226268 |
cttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaatcatttgagcataattcataagttaacactta |
23226169 |
T |
 |
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
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| T |
23226168 |
tacatacttttgacatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacatc |
23226069 |
T |
 |
| Q |
333 |
tttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
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| T |
23226068 |
tatgaacaattaatcatt---ccaattaaacactttttcatacaataattgaaaaattgcact-aaaatgattatgatgaattctaacccctttacctta |
23225973 |
T |
 |
| Q |
433 |
gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctct |
513 |
Q |
| |
|
| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
23225972 |
atgagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaagcttctcttctct |
23225891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 23149736 - 23150218
Alignment:
| Q |
35 |
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132 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23149736 |
atcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatca |
23149835 |
T |
 |
| Q |
133 |
cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt |
232 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||| | | |||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||| |
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|
| T |
23149836 |
cttagcaacaaaaacaactattgaacatgattctcatcataatt---caacaacttagcataattcaaccaattgagcataattcataccataccacttt |
23149932 |
T |
 |
| Q |
233 |
ctcatactttgaa-catgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaa |
331 |
Q |
| |
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| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |
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|
| T |
23149933 |
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23150032 |
T |
 |
| Q |
332 |
ctttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa-cccccttacct |
430 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23150033 |
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23150128 |
T |
 |
| Q |
431 |
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520 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23150129 |
tagttag--caattaatcctagcccaaagcttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag--cttcttctctctaaccc |
23150218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 171 - 520
Target Start/End: Original strand, 22981366 - 22981710
Alignment:
| Q |
171 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc |
270 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22981366 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattc |
22981465 |
T |
 |
| Q |
271 |
aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatt |
370 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
22981466 |
aattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcatca--tctgaacaattaatcaattacccaattaagcacttatt |
22981563 |
T |
 |
| Q |
371 |
catacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc |
470 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
22981564 |
catacaa-aattgaaaaattgca--atatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccccagctcaagcttcaatttagctc |
22981660 |
T |
 |
| Q |
471 |
ctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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|||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22981661 |
ctagatctcttccaatctttgaatcatcaagttcctcttctctctaaccc |
22981710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 501
Target Start/End: Original strand, 29306450 - 29306842
Alignment:
| Q |
111 |
tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
29306450 |
tgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagc |
29306549 |
T |
 |
| Q |
211 |
ataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa |
310 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29306550 |
ataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatag |
29306649 |
T |
 |
| Q |
311 |
ttagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga- |
409 |
Q |
| |
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||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |
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| T |
29306650 |
ttagagcacgaatattaacatctatgaacaatcaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact-aaaatgattatgat |
29306748 |
T |
 |
| Q |
410 |
tgaattctaacccc-cttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||| |
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|
| T |
29306749 |
tgaattctaacccctcttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcagtttagctcctaagatctctacgacttcttgaatcttcaag |
29306842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23152100 - 23151643
Alignment:
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
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||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |
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|
| T |
23152100 |
caacaacttctcatttatcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaattgaa |
23152001 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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| T |
23152000 |
cacggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattgggcaaaattcacttcataccactttcatacaatttgaacatgaaatttca |
23151901 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
23151900 |
ccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaacaattaatcatttactgaa |
23151801 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa-cccccttaccttagttag--gtcaattccctagccca |
454 |
Q |
| |
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| T |
23151800 |
ttaagcacttattcacacaacaa-tgaaaa--tacact--aaatgattatgatgaattctaaccccccttaccttagttagtaatcaat--cctagccca |
23151708 |
T |
 |
| Q |
455 |
aacttcactttagctccta-ggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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|
| T |
23151707 |
agcttcactttagctcctacgatcctcacctcttcttgaatcttcaag--cttcttctctctaaccc |
23151643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 23158118 - 23158597
Alignment:
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35 |
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132 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
23158118 |
atcaacccatttcgtacaaaaccaacaagaacaactcatttttcattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcat---caacaacatca |
23158214 |
T |
 |
| Q |
133 |
cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt |
232 |
Q |
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| T |
23158215 |
cttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcataattcatatcataccacttt |
23158314 |
T |
 |
| Q |
233 |
ctcatactttgaa-catgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaa |
331 |
Q |
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431 |
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23158597 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 18261762 - 18261423
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233 |
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333 |
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T |
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Target: chr8; HSP #21
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Target Start/End: Complemental strand, 38635915 - 38635536
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Q |
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257 |
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| T |
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437 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31194606 - 31194129
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Q |
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341 |
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441 |
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| T |
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520 |
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T |
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Target: chr8; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 22742717 - 22743123
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230 |
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| Q |
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330 |
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Target: chr8; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 15969794 - 15970190
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 |
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249 |
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15969992 |
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15970190 |
T |
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Target: chr8; HSP #25
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Target Start/End: Original strand, 33172184 - 33172527
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Q |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 45559228 - 45558824
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233 |
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430 |
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45558831 |
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| T |
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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18041823 - 18041479
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
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Q |
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18041724 |
T |
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| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
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| T |
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T |
 |
| Q |
234 |
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333 |
Q |
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18041524 |
T |
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377 |
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18041523 |
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18041479 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45465393 - 45465088
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Q |
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257 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22497500 - 22497201
Alignment:
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35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | | | |
|
|
| T |
22497500 |
atcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcattaacaacaatacctc |
22497401 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
22497400 |
ttatcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
22497301 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
22497300 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact |
22497201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 437
Target Start/End: Original strand, 21680980 - 21681361
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||||||||| || ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
21680980 |
accaacaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattg |
21681079 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
|
| |||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21681080 |
atcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatgaaatt |
21681179 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac |
353 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||||| || | || ||||||| || |||||||||||||| ||| |||| || || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
21681180 |
caactaacaataattcaattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcaa |
21681279 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21681280 |
caaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttatttag |
21681361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 20481585 - 20481957
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20481585 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat |
20481684 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataat-tcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
20481685 |
catgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaa-ttgagcatattatcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattca |
20481783 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
20481784 |
actaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaaataatcaattatcca |
20481883 |
T |
 |
| Q |
357 |
attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481884 |
attaagcacttattcatacattaattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattttaacccccttaccttagt |
20481957 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20573461 - 20573082
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
20573461 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
20573363 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20573362 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccttttcatacactttgaacatgtaat |
20573264 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
20573263 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
20573164 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573163 |
cccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
20573082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24552851 - 24552462
Alignment:
| Q |
44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | ||||||||| ||||| || || ||| |||||| | || ||| | ||||| | |||||| |||||| | ||| |||| || ||| |
|
|
| T |
24552851 |
ttttacaaaaccaacgacaacaacttatttcacatcaccaactcatgattcattaacactcaagctctaaatcatcaacaaccatatctcttaacaacaa |
24552752 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||| | |||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
24552751 |
caacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatg |
24552652 |
T |
 |
| Q |
244 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aat |
342 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | | || |
|
|
| T |
24552651 |
aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaaaagcaaaa |
24552552 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||| | |||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24552551 |
taatcacttattcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattaca-acaaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctta |
24552462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37653895 - 37653617
Alignment:
| Q |
44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || |||| || ||| |
|
|
| T |
37653895 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatcaaatcatga--tatgaacacccaagccataaatcatcaacaacaatattccttaacaacaa |
37653798 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
37653797 |
caacatcaattaaacatgattctcaacagaattcaacaacaatataaaacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatg |
37653698 |
T |
 |
| Q |
244 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
37653697 |
aacatgcaatttcagcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgcatacaaacacatcaccataattaaagcacgaatt |
37653617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19331606 - 19331204
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaa-caacatca |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| | |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
19331606 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgattcatgaacacctaagctatgaatcatcaacaaacaatatct |
19331507 |
T |
 |
| Q |
133 |
cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt |
232 |
Q |
| |
|
|| | | |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
19331506 |
ctcaataacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacaatttgagcataattcacaatatatcatttt |
19331407 |
T |
 |
| Q |
233 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaac |
332 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
19331406 |
cacatactatgaacatgcaatttcacca---acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatagtcataacaagagcacgaatttcaacaac |
19331310 |
T |
 |
| Q |
333 |
tttga-acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacc |
429 |
Q |
| |
|
|| | || |||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19331309 |
caagagaaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaact--aagtgattatgattgaaatctaacccccttaca |
19331212 |
T |
 |
| Q |
430 |
ttagttag |
437 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
19331211 |
ttagttag |
19331204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 171 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20561785 - 20561521
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| Q |
171 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt |
269 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
20561785 |
acaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaa-cataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatt |
20561687 |
T |
 |
| Q |
270 |
caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
20561686 |
caattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- |
20561588 |
T |
 |
| Q |
369 |
ttcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561587 |
ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233159
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143 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||| |
|
|
| T |
27233348 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa |
27233249 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
27233248 |
caacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacattttgagcataattcacaatatatcattttc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 253 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27233162 - 27232943
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| Q |
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tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattta |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| ||| |
|
|
| T |
27233162 |
tttcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaactaataatcactta |
27233063 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctag |
450 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
27233062 |
ttcaattaagcacttaaccatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaa-ccccttaccttagttagcaaaaat-cctag |
27232967 |
T |
 |
| Q |
451 |
cccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
27232966 |
cccaaacttcaatttatctcctag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 443
Target Start/End: Original strand, 41246635 - 41247019
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
41246635 |
caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
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T |
 |
| Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| | ||| || |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
41246735 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttaagcatatttcatcatatacccatttttcctacttttaacatgtaatt |
41246833 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | || | |||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
41246834 |
caaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcat |
41246933 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat |
443 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41246934 |
ccaattaagcactt-ttcatacaactaattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaactctaacccccttaccttag-taggtcaat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21259422 - 21259303
Alignment:
| Q |
401 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaa |
500 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
21259422 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagcttaagcttcaatttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaa |
21259323 |
T |
 |
| Q |
501 |
gttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21259322 |
gttcctcttctctctaaccc |
21259303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
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Target Start/End: Complemental strand, 20648099 - 20647882
Alignment:
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55 |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || | | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
20648099 |
caccaacaaaatctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaatt |
20648000 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20647999 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
20647901 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaa |
272 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
20647900 |
tcaactaacaacaattcaa |
20647882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20654175 - 20653953
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| | | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
20654175 |
caccaacaaaatctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaatt |
20654076 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20654075 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
20653977 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatc |
277 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20653976 |
tcaactaacaacaattcaattatc |
20653953 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Target Start/End: Original strand, 16002013 - 16002230
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| Q |
93 |
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192 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| | || || |||||||||||| | |||||| || || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16002013 |
ttatgaacacccaagatgtgaataatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatggatcc-accacaaatcaacaacaacatagca |
16002111 |
T |
 |
| Q |
193 |
taattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaa |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |
|
|
| T |
16002112 |
caattcaacaattagagcacaatttacaatatactcattttcacatatcatgaacatacaatttcatcaacaacaattaaattatcatcaaattcatata |
16002211 |
T |
 |
| Q |
292 |
ttcaaacatatcatcataa |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16002212 |
ctcaaacatatcatcataa |
16002230 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 134
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| Q |
43 |
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134 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17285232 |
attttgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcctcaagtcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcact |
17285323 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
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Target Start/End: Original strand, 37611645 - 37612022
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||||||| ||| |
|
|
| T |
37611645 |
caccaacaacatttcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat |
37611743 |
T |
 |
| Q |
154 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaa |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
37611744 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgta |
37611842 |
T |
 |
| Q |
252 |
atttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt |
351 |
Q |
| |
|
||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
37611843 |
attcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
37611941 |
T |
 |
| Q |
352 |
actc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37611942 |
catctaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---ataataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
37612022 |
T |
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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3431570 - 3431462
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
3431570 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca |
3431472 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
3431471 |
acaacatcaa |
3431462 |
T |
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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22234827 - 22234698
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| Q |
302 |
tcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaa |
399 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
22234827 |
tcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcattcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaa |
22234733 |
T |
 |
| Q |
400 |
atgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234732 |
gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
22234698 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
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178 |
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276 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||| || ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18118437 |
aacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcacaattcaccatataccaatttatgcatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattat |
18118338 |
T |
 |
| Q |
277 |
ca |
278 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
18118337 |
ca |
18118336 |
T |
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Target: chr8; HSP #49
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |
|
|
| T |
20567427 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa |
20567331 |
T |
 |
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |
|
|
| T |
20573620 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa |
20573524 |
T |
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Target: chr8; HSP #51
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152 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18612386 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacactcaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaa |
18612480 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18619291 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacactcaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaa |
18619385 |
T |
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335 |
tgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20529843 |
tgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattg---caataagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
20529748 |
T |
 |
| Q |
433 |
gttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
20529747 |
gttaggt |
20529741 |
T |
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Target: chr8; HSP #54
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tgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25122699 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatta----taataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
 |
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
| T |
24717152 |
attttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca |
24717053 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatg |
161 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
24717052 |
acaacaaccattgaacatg |
24717034 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #56
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
13721217 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
13721119 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
13721118 |
acaacatcaa |
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T |
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432 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16404965 |
attcatacaacatttgaaaatttacaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
16404900 |
T |
 |
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| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||||| || |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
21494725 |
accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgatatatgcacacccaagttataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
21494627 |
T |
 |
| Q |
156 |
aa |
157 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
21494626 |
aa |
21494625 |
T |
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
41507087 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaaca |
41506994 |
T |
 |
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240 |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
16193816 |
tttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
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Target Start/End: Complemental strand, 16405075 - 16404992
Alignment:
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240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
16405075 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
16404992 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacat |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |
|
|
| T |
20567268 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat |
20567194 |
T |
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Target: chr8; HSP #63
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70 |
atttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22886320 |
atttctcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa |
22886406 |
T |
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Target: chr8; HSP #64
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| Q |
262 |
caacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
22887945 |
caacaattcaaatatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaact |
22888016 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
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396 |
aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19992988 |
aaaagtgattatgatgaattataacccccttaccttagt |
19992950 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
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55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| | ||| |||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
19993324 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
19993225 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19993224 |
gatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt |
19993174 |
T |
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Target: chr8; HSP #67
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat |
93 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24929087 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat |
24929037 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
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Target Start/End: Original strand, 29759893 - 29759975
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| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat |
111 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
29759893 |
tcataatcaacccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
29759975 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #69
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| Q |
487 |
tcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21191445 |
tcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
21191412 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24928891 - 24928808
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
24928891 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatt |
24928808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
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Target Start/End: Original strand, 25296137 - 25296229
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| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca |
126 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| || | |||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25296137 |
atcaaccaattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatctaatcatgatatatgaacacctaagtcatgaatcatcaacaaca |
25296229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 25758157 - 25758249
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca |
126 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| || | |||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25758157 |
atcaaccaattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatctaatcatgatatatgaacacctaagtcatgaatcatcaacaaca |
25758249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 39 - 520
Target Start/End: Original strand, 6622 - 7104
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| Q |
39 |
acccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagc |
138 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6622 |
acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttagg |
6721 |
T |
 |
| Q |
139 |
agcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcata |
238 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6722 |
agtaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaacatatatcactttctcata |
6821 |
T |
 |
| Q |
239 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaa |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6822 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaattataacaac-ttgaa |
6920 |
T |
 |
| Q |
339 |
caattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
6921 |
caattaatcatttacacatttaagcatttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattcaattctaacccccttaccataattat |
7020 |
T |
 |
| Q |
438 |
gtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7021 |
caccaattcctagcccaaccttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctccttttctctctaaccc |
7104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17223741
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17224220 |
attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaaca |
17224121 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17224120 |
acaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatacttt |
17224021 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17224020 |
gaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaat |
17223921 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca |
441 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
17223920 |
taattatttactcaattaagcacttaatcataaaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc |
17223821 |
T |
 |
| Q |
442 |
attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| | | |||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17223820 |
aattcttagcccaagcttcactttacctcgtaggatctcttccaattcttgaattttcaagttcttcttctctctaaccc |
17223741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377972
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
13377485 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac |
13377584 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13377585 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataattcaacatatatcactttc |
13377684 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
13377685 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
13377784 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13377785 |
atgaacaattaatcgattactcaatgaatcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaa |
13377884 |
T |
 |
| Q |
434 |
ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13377885 |
ttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaagatctcttccaattcttaaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
13377972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48357066
Alignment:
| Q |
36 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48356602 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
48356701 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
48356702 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
48356801 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
48356802 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactat |
48356901 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
48356902 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
48356999 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48357000 |
tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
48357066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 16915217 - 16914752
Alignment:
| Q |
36 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |
|
|
| T |
16915217 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgactt |
16915118 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
16915117 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcataattcaacatataacactttcac |
16915018 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
16915017 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
16914918 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
16914917 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaagttacact--aaatgattgtgattgaattctaacccctttaccttaat |
16914820 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
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taggacaaattcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttcaatcttcaag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
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Target Start/End: Complemental strand, 49047943 - 49047481
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T |
 |
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156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
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| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
49047843 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcatatttcaacatataccactctctcatactttgaacatgaaattt |
49047744 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
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| T |
49047743 |
caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattctgaacaattaatcaattactc |
49047644 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
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| T |
49047643 |
aattaagcacttattcatataacaattgaaaaatggca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagttcaa |
49047546 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
49047545 |
gcttcaatttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 9838838 - 9839302
Alignment:
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135 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
9838838 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt |
9838936 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| T |
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agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
9839036 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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| T |
9839037 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat |
9839136 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
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| T |
9839137 |
gaacaattaatcacgtactcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaat |
9839234 |
T |
 |
| Q |
435 |
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501 |
Q |
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| T |
9839235 |
tagcaaaaattcctcgccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 9611266 - 9611731
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135 |
Q |
| |
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| T |
9611266 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt |
9611364 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttga-gcataattcaacatatatcactttct |
234 |
Q |
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| T |
9611365 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataattcaacatataacactttca |
9611464 |
T |
 |
| Q |
235 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt |
334 |
Q |
| |
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| T |
9611465 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
9611564 |
T |
 |
| Q |
335 |
tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
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| T |
9611565 |
tgaacaattaatcacgtactcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaa |
9611662 |
T |
 |
| Q |
434 |
ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
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| T |
9611663 |
ttagcaaaaattcctcgccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
9611731 |
T |
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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14272203 - 14271793
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Q |
| |
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| T |
14272203 |
acatcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaag |
14272104 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
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| T |
14272103 |
ccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaata-------------acatagcatgaatcaacaattgg |
14272017 |
T |
 |
| Q |
208 |
agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
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| T |
14272016 |
agcatagttcaacatatatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcacca |
14271917 |
T |
 |
| Q |
308 |
taattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat |
407 |
Q |
| |
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|
| T |
14271916 |
taattagagcacgaatt-tgacaactatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattat |
14271819 |
T |
 |
| Q |
408 |
ga-tgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
14271818 |
gattgaattctaattcccttacctta |
14271793 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 13274765 - 13275217
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155 |
Q |
| |
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|
| T |
13274765 |
accaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
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T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
|
| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13274865 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata----------taccactttctcatactttgaacatgaaattt |
13274954 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13274955 |
tactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
13275054 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
13275055 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaaatggca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctaactcaa |
13275152 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13275153 |
gattcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctcgaaccc |
13275217 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20583821 - 20583406
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
| T |
20583821 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaa |
20583722 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
|
|||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20583721 |
catgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
20583622 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
20583621 |
tcaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcttcataattagggcaaaaatttcaacaactatgaacaaataatcacttattcaa |
20583522 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| |
|
|
| T |
20583521 |
ttaggcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctaccccaa |
20583425 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20583424 |
gctacactttagctcctag |
20583406 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 34241477 - 34241031
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135 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
34241477 |
tcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcactt |
34241378 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| | |
|
|
| T |
34241377 |
atcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa-------------------catatattactttcac |
34241297 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
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|
| T |
34241296 |
atacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattataacacgaattttatcaactat |
34241197 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34241196 |
gaacaattaatcacttactcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt |
34241099 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
||| ||| | | || ||||| |||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34241098 |
tagcacaaattcttaacccaagcttcactttagctcataggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
34241031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 35 - 470
Target Start/End: Original strand, 31501126 - 31501563
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130 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |
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| T |
31501126 |
atcaacccatttgtacaaaaacaacaacaacaataacttatttctcatcatcaaatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatat |
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T |
 |
| Q |
131 |
cacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcact |
230 |
Q |
| |
|
| | || || |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |
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|
| T |
31501226 |
ctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcattattcacaatatatcatt |
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T |
 |
| Q |
231 |
ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataaca |
330 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| | || |
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|
| T |
31501326 |
ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatca |
31501425 |
T |
 |
| Q |
331 |
actttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatta-tgatgaattctaacccccttacc |
429 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
31501426 |
actatgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaattacaact--aattgattattgttgaattctaacccccttacc |
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T |
 |
| Q |
430 |
ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc |
470 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
31501524 |
ttagttagcaaaaat-cctagcccaagcttcaatttagctc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 38424175 - 38424614
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| |
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| T |
38424175 |
atcaacccatttttacaaaacccacaacaacaacttatttttcaccatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctc |
38424274 |
T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
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| T |
38424275 |
ttaacaacaacaacatcacttaaacataattctcatcataattcaacaacaacatagaacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
38424374 |
T |
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| Q |
234 |
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333 |
Q |
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| T |
38424375 |
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T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacctt |
431 |
Q |
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| T |
38424475 |
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38424572 |
T |
 |
| Q |
432 |
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474 |
Q |
| |
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| T |
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agttagcaaaaat-cctagcccaaacttcaatttagctcctag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 14935319 - 14935757
Alignment:
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133 |
Q |
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| T |
14935319 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctc |
14935418 |
T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
234 |
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333 |
Q |
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| T |
14935516 |
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14935615 |
T |
 |
| Q |
334 |
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429 |
Q |
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| T |
14935616 |
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T |
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| Q |
430 |
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474 |
Q |
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| T |
14935714 |
ttaattagcaaaaat-cctagcccaaacttcaatttagctcctag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 15362912 - 15363350
Alignment:
| Q |
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133 |
Q |
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| T |
15362912 |
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T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
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| T |
15363012 |
ttaaca---acaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
15363108 |
T |
 |
| Q |
234 |
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333 |
Q |
| |
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| T |
15363109 |
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15363208 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaac--ccccttacc |
429 |
Q |
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| T |
15363209 |
gtgaccaaagattcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacggccccttacc |
15363306 |
T |
 |
| Q |
430 |
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474 |
Q |
| |
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| T |
15363307 |
ttaattagcaaaaat-cctagcccaaacttcaatttagctcctag |
15363350 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 11287394 - 11287856
Alignment:
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154 |
Q |
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| T |
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caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaact |
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T |
 |
| Q |
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253 |
Q |
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| T |
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gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
11287592 |
T |
 |
| Q |
254 |
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352 |
Q |
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| T |
11287593 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
11287692 |
T |
 |
| Q |
353 |
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451 |
Q |
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| T |
11287693 |
cccaattaaacactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc |
11287788 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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| |||||| ||| ||||||| | ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
11287789 |
ttagacttcaattttgctccta-gctctctccactccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
11287856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Original strand, 4484683 - 4485021
Alignment:
| Q |
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133 |
Q |
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| T |
4484683 |
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4484782 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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| T |
4484783 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
4484882 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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| T |
4484883 |
acatacaatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcat-attaggacacgaatttcaacaact |
4484981 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcat |
373 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4484982 |
atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcat |
4485021 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12248391 - 12248010
Alignment:
| Q |
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154 |
Q |
| |
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| T |
12248391 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatccatt |
12248292 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12248291 |
gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatactttaaacatgaaat |
12248192 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
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| T |
12248191 |
tcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaattat |
12248092 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12248091 |
ccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--atatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
12248010 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Original strand, 15358777 - 15359191
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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||||||||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||| | || |
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|
| T |
15358777 |
caacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaa |
15358876 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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|||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
15358877 |
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15358976 |
T |
 |
| Q |
258 |
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357 |
Q |
| |
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| T |
15358977 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcagttattcaa |
15359075 |
T |
 |
| Q |
358 |
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455 |
Q |
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| T |
15359076 |
ctaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaat-cctagcccaa |
15359172 |
T |
 |
| Q |
456 |
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474 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |
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| T |
15359173 |
gcttcaatttagatcctag |
15359191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26070531 - 26070154
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
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|
| T |
26070531 |
caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat |
26070432 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
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| T |
26070431 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattca |
26070333 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
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| T |
26070332 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattacaca |
26070233 |
T |
 |
| Q |
357 |
attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26070232 |
attaagcacttattcataccataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttaggt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26094318 - 26093941
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157 |
Q |
| |
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| T |
26094318 |
caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat |
26094219 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
26094218 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattca |
26094120 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
26094119 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattacaca |
26094020 |
T |
 |
| Q |
357 |
attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26094019 |
attaagcacttattcataccataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttaggt |
26093941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16570287 - 16569812
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44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
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Q |
| |
|
|||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | | || ||||||||||||| ||| |
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| T |
16570287 |
ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa |
16570188 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
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16570187 |
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16570088 |
T |
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| Q |
243 |
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342 |
Q |
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| T |
16570087 |
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16569988 |
T |
 |
| Q |
343 |
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442 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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443 |
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520 |
Q |
| |
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| |||||||| | ||||| |||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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Target: chr7; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 16595375 - 16595850
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Q |
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T |
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| Q |
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242 |
Q |
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16595574 |
T |
 |
| Q |
243 |
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342 |
Q |
| |
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| T |
16595575 |
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16595674 |
T |
 |
| Q |
343 |
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442 |
Q |
| |
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| T |
16595675 |
taatcaattatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaa |
16595771 |
T |
 |
| Q |
443 |
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520 |
Q |
| |
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| |||||||| | ||||| |||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
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Target: chr7; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 28722203 - 28722505
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Q |
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T |
 |
| Q |
271 |
aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatt |
370 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
371 |
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467 |
Q |
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| T |
28722403 |
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28722498 |
T |
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| Q |
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Q |
| |
|
||||||| |
|
|
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ctcctag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 35 - 319
Target Start/End: Original strand, 4446168 - 4446453
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
133 |
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232 |
Q |
| |
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| T |
4446268 |
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4446366 |
T |
 |
| Q |
233 |
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319 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4446367 |
cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatatcatcataactagagcac |
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T |
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Target: chr7; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 28390292 - 28390603
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
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| T |
28390292 |
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28390391 |
T |
 |
| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
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|||| || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
28390392 |
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28390491 |
T |
 |
| Q |
258 |
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356 |
Q |
| |
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| T |
28390492 |
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28390591 |
T |
 |
| Q |
357 |
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368 |
Q |
| |
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| T |
28390592 |
attaagcactta |
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T |
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Target: chr7; HSP #27
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Q |
| |
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14940709 |
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14940808 |
T |
 |
| Q |
132 |
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231 |
Q |
| |
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| T |
14940809 |
tcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattt |
14940908 |
T |
 |
| Q |
232 |
tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaa |
331 |
Q |
| |
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| T |
14940909 |
tcacatactatgaacatgcaatttcac---caacaatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaa |
14941005 |
T |
 |
| Q |
332 |
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341 |
Q |
| |
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| T |
14941006 |
ctatgaacaa |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16919601 |
aacaacaatattacttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaa |
16919700 |
T |
 |
| Q |
220 |
catatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaa |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16919701 |
catatatcactttctcatattttgaacatgaaatttcaccaataacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaa |
16919778 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
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Target Start/End: Complemental strand, 13449094 - 13448783
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157 |
Q |
| |
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|
| T |
13449094 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatcaacacccaagctacgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
13448995 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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|||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
13448994 |
catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
13448895 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
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| T |
13448894 |
ccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatgataacaagagcatgaatttcaacaactaagagtaaaataatcacttactca |
13448795 |
T |
 |
| Q |
357 |
attaagcactta |
368 |
Q |
| |
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|||||||||||| |
|
|
| T |
13448794 |
attaagcactta |
13448783 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 13863197 - 13862821
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Q |
| |
|
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|
| T |
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caacaacaacttatttcacattatcaaatcattgattatgaacacccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaa |
13863098 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
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|||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
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catgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
13862998 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | || |||||||||| ||| || | |
|
|
| T |
13862997 |
accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatctattcaccc |
13862898 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| || ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13862897 |
aattaagc-----ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaa--caacaacatc |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || | | || || |
|
|
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atcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaaaactc |
15368401 |
T |
 |
| Q |
132 |
acttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt |
231 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
15368402 |
tcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcattaatttgagcataattcacaatatatcattt |
15368501 |
T |
 |
| Q |
232 |
tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaa |
331 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |
|
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| T |
15368502 |
tcacatactatgaacatgcaatttcac---caacaatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaa |
15368598 |
T |
 |
| Q |
332 |
ctttgaacaa |
341 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |
|
|
| T |
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ctatgaacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17947831 - 17947598
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||| |
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|
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tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa |
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T |
 |
| Q |
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catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt |
285 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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catagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttcacatactatgcacattcagtttaaccaacaacaattcaattatcaccaattt |
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T |
 |
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286 |
catgaattcaaacatatcatcataattagagcac |
319 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17947631 |
catgcactcaaacatatcatcataacaagagcac |
17947598 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
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Q |
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|
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acatcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaactcaag |
7284278 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
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|||||||| |||| ||||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |
|
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| T |
7284277 |
ccatgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaa-tta |
7284179 |
T |
 |
| Q |
208 |
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306 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||| || |||| || |||||| ||||| |
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| T |
7284178 |
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7284079 |
T |
 |
| Q |
307 |
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403 |
Q |
| |
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|||||||||| || |||| | || |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||| ||| |
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|
| T |
7284078 |
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7283985 |
T |
 |
| Q |
404 |
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432 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7283984 |
ttatgatgaaaactaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 55 - 474
Target Start/End: Original strand, 12758965 - 12759383
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154 |
Q |
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T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
| |
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|| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | |||| ||| | |||||||||| ||| |
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| T |
12759064 |
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12759162 |
T |
 |
| Q |
254 |
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352 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
12759163 |
tcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
12759262 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctag |
450 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
12759263 |
cccaattaaacactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctccctag |
12759359 |
T |
 |
| Q |
451 |
cccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
| | |||||| ||| |||||||| |
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cttagacttcaattttgctcctag |
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T |
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Target: chr7; HSP #35
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270 |
Q |
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| T |
8267882 |
acaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattc |
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T |
 |
| Q |
271 |
aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttat |
369 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | || |||||| ||| |||| ||||||||||| |
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| T |
8267782 |
aattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttat |
8267683 |
T |
 |
| Q |
370 |
tcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
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| T |
8267682 |
gcatacaa |
8267675 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12370107 - 12369728
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157 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |
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| T |
12370107 |
caactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttagcaacaacaacatcaattaat |
12370008 |
T |
 |
| Q |
158 |
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256 |
Q |
| |
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| T |
12370007 |
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12369909 |
T |
 |
| Q |
257 |
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355 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| | ||| || | |
|
|
| T |
12369908 |
accaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatgaacaattaattaattcaccc |
12369809 |
T |
 |
| Q |
356 |
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439 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Target: chr7; HSP #37
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Target Start/End: Complemental strand, 15822701 - 15822325
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
15822701 |
caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
15822602 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||| | | |||||||||| ||| |
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| T |
15822601 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-accatttgagcatattttcaacatataccattttcatacattttgaacatgtaat |
15822503 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| || ||||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
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|
| T |
15822502 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcat-acatccaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
15822404 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cccaattaagcactt-ttcatacaaataactgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
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Target Start/End: Complemental strand, 9724046 - 9723808
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185 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt |
285 |
Q |
| |
|
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| T |
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catagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcagtttcatcaacatcaattgaattatcaccaattt |
9723847 |
T |
 |
| Q |
286 |
catgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
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|||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |
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|
| T |
9723846 |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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33559809 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- |
339 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
33559810 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattttaacatatcatcatagcaagaggacgaatttcaacagctatgaaca |
33559909 |
T |
 |
| Q |
340 |
aattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
33559910 |
aaataatcacttattcaattaagcactta |
33559938 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
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Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
46473971 |
acaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaac |
46474070 |
T |
 |
| Q |
148 |
atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaac |
246 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||| || || | |||| | ||||| |
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|
| T |
46474071 |
atcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattaacaatatacacatttccacatattatgaac |
46474170 |
T |
 |
| Q |
247 |
atgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaattaa |
345 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || || ||| |
|
|
| T |
46474171 |
atgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagtaaaataa |
46474270 |
T |
 |
| Q |
346 |
tcatttactcaattaagcacttattcata |
374 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
46474271 |
tcacttactcaattaaacacttatgcata |
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T |
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Target: chr7; HSP #41
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Q |
| |
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||||||||||| |||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
3895005 |
caacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
3895104 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
3895105 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgcaattca |
3895203 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc- |
355 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||| || || |
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|
| T |
3895204 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaattcatcc |
3895303 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895304 |
aattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
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|
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T |
 |
| Q |
276 |
tcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
4438981 |
tcaccaatttcatgtgtgcaaacatattatcataactatagcacgaatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 55 - 439
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Q |
| |
|
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|
|
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caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaatt |
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T |
 |
| Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
45452336 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcatg--tca-caaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
45452240 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a |
352 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
45452239 |
tcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
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T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattg---caataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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Target: chr7; HSP #44
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|||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 520
Target Start/End: Original strand, 9080965 - 9081045
Alignment:
| Q |
439 |
tcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
9080965 |
tcaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagtttctcct-tctctaaccc |
9081045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8563582 - 8563339
Alignment:
| Q |
91 |
aattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatag |
190 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| | ||||| | | | |||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
8563582 |
aattatgaacacccaaggtgtgaatcatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatatattcaatcacaaatcaacaacaacctaa |
8563483 |
T |
 |
| Q |
191 |
cataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatg |
289 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
8563482 |
cacaattcatccatttgagcataactcacaatatactcatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcata |
8563383 |
T |
 |
| Q |
290 |
aattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8563382 |
tactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact |
8563339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 333
Target Start/End: Original strand, 45149748 - 45149839
Alignment:
| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
45149748 |
tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttcaacaact |
45149839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 359 - 475
Target Start/End: Original strand, 16919811 - 16919928
Alignment:
| Q |
359 |
taagcacttattcatacaacaattg-aaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| | | | |||||||||| |
|
|
| T |
16919811 |
taagcacttattcatacaacaattgaaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattttaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaag |
16919909 |
T |
 |
| Q |
457 |
cttcactttagctcctagg |
475 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16919910 |
cttcactttagctcctagg |
16919928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 520
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389797
Alignment:
| Q |
416 |
ctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctct |
515 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
13389693 |
ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctct |
13389792 |
T |
 |
| Q |
516 |
aaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13389793 |
aaccc |
13389797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 433
Target Start/End: Original strand, 25124406 - 25124483
Alignment:
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25124406 |
tcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttag |
25124483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Original strand, 3049564 - 3049720
Alignment:
| Q |
59 |
aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
3049564 |
aacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc |
3049663 |
T |
 |
| Q |
159 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt |
216 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3049664 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcataatt |
3049720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Original strand, 4438777 - 4438893
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcatt-aacaacaacatca |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
| T |
4438777 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaagtcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatct |
4438876 |
T |
 |
| Q |
133 |
cttagcagcaacaacat |
149 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||| |
|
|
| T |
4438877 |
cttatcaacaacaacat |
4438893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39046893 - 39046743
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
39046893 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
39046794 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39046793 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt |
39046743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 371055 - 371163
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| || |
|
|
| T |
371055 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcggcaaca |
371153 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
371154 |
acaacatcaa |
371163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 199
Target Start/End: Original strand, 45149559 - 45149723
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
45149559 |
atcaacccattttcacaaaatcaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgg-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
45149657 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
199 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
45149658 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaaccaacaacatcatagcacaattca |
45149723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 434
Target Start/End: Original strand, 44865391 - 44865584
Alignment:
| Q |
238 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | || | ||| |
|
|
| T |
44865391 |
actttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga |
44865490 |
T |
 |
| Q |
338 |
acaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44865491 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaat-ctaacccccttaccttagt |
44865584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39046658 - 39046521
Alignment:
| Q |
295 |
aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttac |
392 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
39046658 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaaataac |
39046560 |
T |
 |
| Q |
393 |
actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39046559 |
a---aaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
39046521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8268003 - 8267905
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
8268003 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaaatcatgatttatgaacatccaagctatgaatcctcaacaacaacatca |
8267905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 47289758 - 47290141
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| || | || |||||| ||||| |||||||| || ||| |
|
|
| T |
47289758 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cacaagccatgaattatcatcatcaacatgacttaacagcaacagcaacaat |
47289856 |
T |
 |
| Q |
154 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaa |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
47289857 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgta |
47289955 |
T |
 |
| Q |
252 |
atttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt |
351 |
Q |
| |
|
||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||| | |||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
47289956 |
attcaactaaca-caattcaattattcataacttcatatatctaaacatggcatcataattagagctcgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
47290054 |
T |
 |
| Q |
352 |
actc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47290055 |
catccaattaagcattt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattaggt |
47290141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 434
Target Start/End: Original strand, 143732 - 143993
Alignment:
| Q |
171 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| |||| || |||| |||| |
|
|
| T |
143732 |
acaattcatcaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caat |
143829 |
T |
 |
| Q |
269 |
tcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcactt |
367 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
143830 |
tcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt |
143929 |
T |
 |
| Q |
368 |
attcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
143930 |
ttt-atacaaataattgaaaattg---caataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
143993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Original strand, 25124120 - 25124204
Alignment:
| Q |
68 |
tcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |
|
|
| T |
25124120 |
tcatatctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaa |
25124204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 35094794 - 35095168
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||| ||| | || ||||| || | | | |
|
|
| T |
35094794 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgactaaacaacaacagcaac-att |
35094892 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| | | |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||| || |||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35094893 |
gatcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccattttcatatactttgaacatgtaat |
35094991 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||| |||||||||| || || ||||| || |||||| | |||| |||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
35094992 |
tcaactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattca |
35095090 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35095091 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
35095168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Original strand, 126366 - 126455
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| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttta-caaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcat |
118 |
Q |
| |
|
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| T |
126366 |
tcataatcaacccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcat |
126455 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
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Target Start/End: Original strand, 9250630 - 9250671
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269 |
tcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa |
310 |
Q |
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|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
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| T |
9250630 |
tcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataa |
9250671 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
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Target Start/End: Complemental strand, 9321326 - 9321209
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| Q |
36 |
tcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact |
134 |
Q |
| |
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|||| ||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |
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| T |
9321326 |
tcaatccattttcacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcacaaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcattaacaacaatatctat |
9321227 |
T |
 |
| Q |
135 |
tagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
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|| || |||||||||||| |
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| T |
9321226 |
tatcaacaacaacatcaa |
9321209 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
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Target Start/End: Complemental strand, 18980310 - 18980202
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
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| T |
18980310 |
atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
18980212 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18980211 |
acaacatcaa |
18980202 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
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Target Start/End: Original strand, 13321173 - 13321262
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| Q |
235 |
catactttgaa-catgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
13321173 |
catactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
13321262 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
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Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18253935 - 18253871
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
18253935 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat |
18253871 |
T |
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Target: chr7; HSP #69
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Target Start/End: Complemental strand, 11580839 - 11580756
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240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |||| | || |||||| |||| |
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| T |
11580839 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatt |
11580756 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13037114 - 13037031
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
13037114 |
tttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
13037031 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 102730
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| Q |
36 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
135 |
Q |
| |
|
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| T |
103211 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcactt |
103112 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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|| | ||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||||||| |
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| T |
103111 |
agaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattccaccatataccactttctc |
103012 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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|
|
| T |
103011 |
atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattat |
102912 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
102911 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttaccttagtt |
102812 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
102811 |
agatcaatcccctagctcaagcttcactttagcttctaggttct---ctcttcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
102730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 109568 - 110024
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
109568 |
accaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaactg |
109667 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
|
| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
109668 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttaaacatgaaattt |
109767 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||| | | | ||||||| || |
|
|
| T |
109768 |
cattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcatacttggatcacgaattctaacaattatcatcaattaa--------tc |
109859 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | |
|
|
| T |
109860 |
aattaagcatttattcatacaacaattgataatttacacaaaagatgattatgatgaattctaaccaccttaccttagttagattaattccctagcttag |
109959 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
109960 |
gcttcactttagctcctaagttcttctctccacttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc |
110024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 112812 - 112353
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || | |
|
|
| T |
112812 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga---attatcaacaacatgacttaacaacaacaacataaatt |
112716 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
112715 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattc-actaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
112617 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||| | || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
112616 |
tcaactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
112517 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc |
451 |
Q |
| |
|
| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
112516 |
cccaaataagtactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc |
112421 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| ||||||| | ||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
112420 |
ttaggcttcaattttgctccta-gctctcttcaccccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
112353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 430
Target Start/End: Original strand, 131931 - 132166
Alignment:
| Q |
194 |
aattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaatt |
293 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
131931 |
aattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactacgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtact |
132030 |
T |
 |
| Q |
294 |
caaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac- |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||| |
|
|
| T |
132031 |
caaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaac-tagagaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattaca |
132129 |
T |
 |
| Q |
393 |
actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct |
430 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
132130 |
act--aattgattatgattgaaatctaacccccttacct |
132166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 68248 - 67972
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||| | |
|
|
| T |
68248 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacaaccaagctatgaatcatcaaaaacaatatctc |
68150 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt |
232 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| | |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | ||| |
|
|
| T |
68149 |
atgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttt |
68050 |
T |
 |
| Q |
233 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa |
310 |
Q |
| |
|
| |||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
68049 |
cacatattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcaccaaattcatgtacttaaacatatcatcataa |
67972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Original strand, 131816 - 131939
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || |||| || |||||||| ||| | | |
|
|
| T |
131816 |
caacaagaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaaaaatatttcttaacaacaacaacaacaattaag |
131915 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaaca |
181 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
131916 |
catgattctcatcacaattcaaca |
131939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 15044784 - 15045269
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
15044784 |
atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac |
15044883 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15044884 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
15044983 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
15044984 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt |
15045083 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15045084 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgagaatttaaact-aaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttag |
15045182 |
T |
 |
| Q |
434 |
ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15045183 |
ttagattaattccctagctcaagcttcaccttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctctcctctctaaccc |
15045269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41165761
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41166228 |
atttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
41166129 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
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| T |
41166128 |
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41166029 |
T |
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243 |
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342 |
Q |
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41165939 |
T |
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442 |
Q |
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41165839 |
T |
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520 |
Q |
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| T |
41165838 |
attcctagcccaagcttcactttagctcctaggaactctccaattcttgaatcttcaagctcctcttttctctaaccc |
41165761 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15109640 - 15109155
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
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| T |
15109540 |
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T |
 |
| Q |
234 |
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333 |
Q |
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| T |
15109440 |
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15109341 |
T |
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| Q |
334 |
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433 |
Q |
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| T |
15109340 |
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15109242 |
T |
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| Q |
434 |
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520 |
Q |
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| T |
15109241 |
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T |
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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964536
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135 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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136 |
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235 |
Q |
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| T |
7964900 |
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7964801 |
T |
 |
| Q |
236 |
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335 |
Q |
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| T |
7964800 |
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7964702 |
T |
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| Q |
336 |
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434 |
Q |
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| T |
7964701 |
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T |
 |
| Q |
435 |
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501 |
Q |
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| T |
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tagcacaaattccttgcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7186159 - 7185669
Alignment:
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8 |
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Q |
| |
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| T |
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7186063 |
T |
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| Q |
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206 |
Q |
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| T |
7186062 |
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7185963 |
T |
 |
| Q |
207 |
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306 |
Q |
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| ||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
7185962 |
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7185863 |
T |
 |
| Q |
307 |
ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatta |
406 |
Q |
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| T |
7185862 |
ataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgatta |
7185765 |
T |
 |
| Q |
407 |
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501 |
Q |
| |
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| T |
7185764 |
tgatgaattctaacctccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctcataggatcctcaccacttcttgaatcttcaag |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 43 - 478
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901630
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Q |
| |
|
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| T |
14901197 |
attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaaca |
14901296 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14901297 |
acaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcatatttaaacatatatcactttctcatacttc |
14901396 |
T |
 |
| Q |
243 |
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342 |
Q |
| |
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| T |
14901397 |
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14901495 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa |
442 |
Q |
| |
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| T |
14901496 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaat-aaaatgattatgatgaaatttaacccccttaccttagttagatcaa |
14901594 |
T |
 |
| Q |
443 |
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478 |
Q |
| |
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| ||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
14901595 |
tccccaagcttaagcttcactttaactcctaggttc |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 18276392 - 18276856
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Q |
| |
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|||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
18276392 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatactcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactt |
18276491 |
T |
 |
| Q |
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235 |
Q |
| |
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| T |
18276492 |
tgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
18276591 |
T |
 |
| Q |
236 |
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335 |
Q |
| |
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| T |
18276592 |
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18276691 |
T |
 |
| Q |
336 |
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434 |
Q |
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| T |
18276692 |
gaacaattaatcacatactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaatcgcact--aaatgattatgattgaattctaaccccgttaccttaat |
18276789 |
T |
 |
| Q |
435 |
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501 |
Q |
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|
| T |
18276790 |
tagtacaatt-cctagctcaagcttcactttagctcctaggatctgtaccacttcttgaatcttcaag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 59 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 13809776 - 13809320
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| T |
13809776 |
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13809677 |
T |
 |
| Q |
159 |
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258 |
Q |
| |
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| T |
13809676 |
atgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcatatttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaaatctcac |
13809577 |
T |
 |
| Q |
259 |
caacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaat |
358 |
Q |
| |
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|
| T |
13809576 |
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13809477 |
T |
 |
| Q |
359 |
taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaact |
458 |
Q |
| |
|
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| T |
13809476 |
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13809379 |
T |
 |
| Q |
459 |
tcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaa |
517 |
Q |
| |
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|
| T |
13809378 |
tcaatttagcccctagctctctcccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaa |
13809320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 52265775 - 52265314
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157 |
Q |
| |
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||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |
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| T |
52265775 |
caacatcaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
52265676 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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| T |
52265675 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacataaaatttct |
52265576 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||| |||| ||| |
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| T |
52265575 |
ctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaattacccaa |
52265476 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaa |
456 |
Q |
| |
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| T |
52265475 |
ttaaacacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtcagattaatctccctagcttagg |
52265378 |
T |
 |
| Q |
457 |
cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
52265377 |
cttcaatttagctcctagctctcttccaatctttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
52265314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37956849
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36 |
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135 |
Q |
| |
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| T |
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tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcactt |
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T |
 |
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136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| T |
37957214 |
agcagcaaccacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatattccaaattgacatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
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T |
 |
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atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
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| T |
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atactttgatcattcaatttcaccaacaactaatcaattaccaccaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattccaacaatcat |
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T |
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| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37957014 |
gaacaattaatcaattactcaattaaacaaataatcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
37956915 |
T |
 |
| Q |
436 |
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501 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37956914 |
agatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttggatcttcaag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 27960950 - 27961412
Alignment:
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Q |
| |
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| T |
27960950 |
accaacaatatctcatttctcaacaataaatcat-aatcatgcatacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattg |
27961048 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
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| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
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| T |
27961049 |
atcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaatttagcatatttcaacatataccacttcttcatactttgaacatgaaattc |
27961148 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
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| T |
27961149 |
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27961248 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
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|
| T |
27961249 |
aattaagcacttattcatacaacaattg-aaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaa |
27961347 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggt-tctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27961348 |
gcttcacttttgctcctagctctcttt-caatccttgaatcttcaagttccccttctctctaaccc |
27961412 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 35 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256259
Alignment:
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Q |
| |
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| T |
41256660 |
atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctc |
41256561 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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| T |
41256560 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
41256461 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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| T |
41256460 |
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41256362 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctt |
431 |
Q |
| |
|
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| T |
41256361 |
atgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt |
41256264 |
T |
 |
| Q |
432 |
agtta |
436 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
41256263 |
agtta |
41256259 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 15013549 - 15013136
Alignment:
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157 |
Q |
| |
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| T |
15013549 |
caacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaa |
15013450 |
T |
 |
| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
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| T |
15013449 |
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15013350 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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|
| T |
15013349 |
ccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattc-aacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaacaattaatcacttattcaa |
15013251 |
T |
 |
| Q |
358 |
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456 |
Q |
| |
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| T |
15013250 |
ttaagcacttaaacatacaacaaatgaaaattacaact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaat-cctagctcaag |
15013154 |
T |
 |
| Q |
457 |
cttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
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|
| T |
15013153 |
cttcactttagctcctag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821582
Alignment:
| Q |
36 |
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135 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
19822065 |
tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacat |
19821966 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||| |||||| || |||| | || || ||||||||| |||||||||| |||| |
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|
| T |
19821965 |
agcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaataacatatcacaatt-atcatttagagcataatatgacatatatcattttcat |
19821867 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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| ||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| || | ||| || | |
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|
| T |
19821866 |
acactttgatcactcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacatacaaacataacatcataataggagcacgaactctaataatcat |
19821767 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19821766 |
gatcaattaatcaattactcaattaagcacttattcataaaacaattgaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
19821667 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19821666 |
agatcaattctctagttctagcttcactttagctcctagatctcccccaatccttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
19821582 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 43 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 47535328 - 47534891
Alignment:
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142 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
47535328 |
attttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacgtcaatt------- |
47535236 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47535235 |
------------gaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatacttt |
47535148 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || | |||||||| |
|
|
| T |
47535147 |
gaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
47535048 |
T |
 |
| Q |
343 |
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441 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
47535047 |
taatcat----------------ttaatcatacaataatggaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc |
47534965 |
T |
 |
| Q |
442 |
attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttcctcttctct |
513 |
Q |
| |
|
| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
47534964 |
aattcctcgcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttcttcttctct |
47534891 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40905214 - 40904865
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ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
40905214 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaacaa |
40905115 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
243 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| || |||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
40905114 |
caacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagtacaattcacaatgcatcattttcacatactatg |
40905016 |
T |
 |
| Q |
244 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aat |
342 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| || |
|
|
| T |
40905015 |
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40904916 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttaca |
393 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
40904915 |
taatcatttattcaattaagcacttaaccatgcaattattgaaaaattaca |
40904865 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18494598 - 18494152
Alignment:
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| | | | ||||||||||||||| || ||||| || ||| | |
|
|
| T |
18494598 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaacaatt |
18494499 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
18494498 |
gatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcacatttcaacatataccatttttctcatactttgatcatgaagt |
18494399 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
18494398 |
ttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatcaattac |
18494300 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcc |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
18494299 |
acaattaagcacctattcataccataattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagct |
18494203 |
T |
 |
| Q |
453 |
caaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt |
503 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18494202 |
taagcctcaatttagctcctagatttcttccaatccttgattcttcaagtt |
18494152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Original strand, 38764689 - 38765103
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| | || |
|
|
| T |
38764689 |
caacaacaacttatttctcatcttcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaa |
38764788 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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|||| |||| | | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
38764789 |
catgattctcatcataattgaacaacaacatcgcataattcaacaatttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatgtaatttca |
38764888 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
38764889 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaacaactatgaa-aaataatcaattattcaa |
38764987 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
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||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | | |||||||| |
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| T |
38764988 |
ctaagcactttatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaaccctcttaccttaattagcacaaat-catagcccaa |
38765084 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38765085 |
acttcaatttagctcctag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18238424 - 18238104
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
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Q |
| |
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| T |
18238424 |
caacaacaacttatttcacatcactaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
18238325 |
T |
 |
| Q |
158 |
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257 |
Q |
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| T |
18238324 |
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18238225 |
T |
 |
| Q |
258 |
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356 |
Q |
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| T |
18238224 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacctattca |
18238125 |
T |
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| Q |
357 |
attaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
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attaagcacttaagcatacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
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Target Start/End: Complemental strand, 30232763 - 30232384
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Q |
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| T |
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30232664 |
T |
 |
| Q |
158 |
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256 |
Q |
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| T |
30232663 |
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30232565 |
T |
 |
| Q |
257 |
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356 |
Q |
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| T |
30232564 |
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30232466 |
T |
 |
| Q |
357 |
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439 |
Q |
| |
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| T |
30232465 |
attaagcacttattcataccataattgaaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaaccctcttaccttagttaggt |
30232384 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13442946 - 13442632
Alignment:
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154 |
Q |
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| T |
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caacaacaactcatttctcatcatcaattcataatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaaaatctcttaacaacaacaacaacatcaatt |
13442847 |
T |
 |
| Q |
155 |
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254 |
Q |
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| T |
13442846 |
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13442747 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttac |
353 |
Q |
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| T |
13442746 |
tcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttac |
13442647 |
T |
 |
| Q |
354 |
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368 |
Q |
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| T |
13442646 |
tcaattaagcactta |
13442632 |
T |
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Target: chr4; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 16732146 - 16732525
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154 |
Q |
| |
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| T |
16732146 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaatt |
16732245 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
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| T |
16732246 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
16732344 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
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| T |
16732345 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
16732444 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
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| T |
16732445 |
cccaattaagcactt-ttcatacactaattaaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacctctttaccttagttag |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50220207 - 50219890
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157 |
Q |
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| T |
50220207 |
caacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
50220108 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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| T |
50220107 |
catgattctcatcacaaatcaacaacaacacaacacaattcaacatttagagcacaattcaaaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
50220008 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
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| T |
50220007 |
ccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcgtaacaagagcacaaatttcaacaact---aacaaaataatcacttattca |
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T |
 |
| Q |
357 |
attaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||| |
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50219910 |
attaagcacttaagcatacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41917017 - 41916741
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
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|
| T |
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atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttttgaacactcaagcaatgaatcatcaacaacaatatctc |
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T |
 |
| Q |
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ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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||| || ||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||| |
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| T |
41916917 |
ttaacaacaacaacatcagttaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaactcacaatatatcatcttc |
41916818 |
T |
 |
| Q |
234 |
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310 |
Q |
| |
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|
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41916817 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattatattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataa |
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T |
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Q |
| |
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|||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||| |
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| T |
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tcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa |
54398490 |
T |
 |
| Q |
186 |
catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt |
285 |
Q |
| |
|
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| T |
54398491 |
cataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatattattttcatatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattt |
54398590 |
T |
 |
| Q |
286 |
catgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
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|
| T |
54398591 |
catgtactcaaacatatcaacataacaagagcacgaatt |
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T |
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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12837468 - 12837094
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | || |
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|
| T |
12837468 |
accaacaacaacttatttctcac-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattg |
12837370 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
|
| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
12837369 |
accatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaatt |
12837271 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac |
353 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| | || | || |||||||||| ||| || |
|
|
| T |
12837270 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcac |
12837171 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12837170 |
ccaattaagcactt-ttcattcaaaaattgaaaat---agcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
12837094 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 47468532 - 47468304
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240 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |
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|
| T |
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caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacactatatcattttcacatact |
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T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- |
339 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || || | |
|
|
| T |
47468432 |
atgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattacaacagctaagagca |
47468333 |
T |
 |
| Q |
340 |
aattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
47468332 |
aaataatcacttattcaattaagcactta |
47468304 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 86 - 324
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185 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
13590313 |
tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaa |
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T |
 |
| Q |
186 |
catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt |
285 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| | |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13590213 |
catagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcagtttcatcaacatcaattgaattatcaccaattt |
13590114 |
T |
 |
| Q |
286 |
catgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
13590113 |
catgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 343 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 34177629 - 34177501
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taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa |
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Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
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taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttagatcaa |
34177533 |
T |
 |
| Q |
443 |
ttccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34177532 |
ttccctagctctagcttcactttagctcctag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 44055892 - 44056273
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || | | |||||||||||| | |
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|
| T |
44055892 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaacaacatcaatt |
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T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44055992 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttgaacatgtaat |
44056090 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
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|
| T |
44056091 |
tcaactaacaacaattcaaaattca-taacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
44056189 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056190 |
tccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
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caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
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T |
 |
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155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa |
252 |
Q |
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| T |
23270104 |
gatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaa-ttgagtatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
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T |
 |
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253 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attt |
351 |
Q |
| |
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|
| T |
23270005 |
ttcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc |
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T |
 |
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352 |
actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tcccta |
449 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |
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|
| T |
23269906 |
atccaattaaacactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctcta |
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T |
 |
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450 |
gcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
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T |
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205 |
Q |
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Q |
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T |
 |
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240 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
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| T |
34395421 |
ttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaaca |
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T |
 |
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Q |
| |
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T |
 |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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T |
 |
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ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcattta |
352 |
Q |
| |
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tcaatcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattca |
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T |
 |
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439 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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| |
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T |
 |
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| |
|
||||| | |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
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Q |
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|
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T |
 |
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254 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac |
353 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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T |
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Q |
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|
|||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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|
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|
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T |
 |
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atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca |
228 |
Q |
| |
|
|| | ||| || |||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||| ||| || ||| ||| | |
|
|
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ataatttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaa-ttgagtatattttcacacataccc |
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T |
 |
| Q |
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ctttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataa |
328 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
55376694 |
atttttcatacttagaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcat |
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T |
 |
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caactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctt |
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Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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| |
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||||||| |
|
|
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|
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T |
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Q |
| |
|
| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| || |
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|
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T |
 |
| Q |
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caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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|
||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 14996107 - 14996255
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
14996107 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta |
14996204 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14996205 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
14996255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19697648 - 19697500
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
19697648 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta |
19697551 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19697550 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
19697500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19708233 - 19708085
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
19708233 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta |
19708136 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19708135 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
19708085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Original strand, 8044920 - 8045016
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8044920 |
accaacaacatcttatttctcatcaacaattcatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcagcaacaacatcaa |
8045016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 44346816 - 44347179
Alignment:
| Q |
67 |
ctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttct |
166 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | |||| |||||||| | || |||||||| || ||| |||| | |
|
|
| T |
44346816 |
ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca |
44346915 |
T |
 |
| Q |
167 |
tactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac |
265 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||| || ||| ||| | | ||||| | |||||||||||| |||| || |||| | |
|
|
| T |
44346916 |
tatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccattttcttacactttgaacatgtaattcaactaaca-c |
44347013 |
T |
 |
| Q |
266 |
aattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagca |
364 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
44347014 |
aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca |
44347113 |
T |
 |
| Q |
365 |
cttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44347114 |
cttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaactcccttaccttagt |
44347179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 819997 - 819819
Alignment:
| Q |
259 |
caacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaa |
357 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
819997 |
caacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaa |
819898 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||| | | |||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
819897 |
ttaagcattt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
819819 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8872502 - 8872366
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| Q |
295 |
aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaattta |
391 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8872502 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatt-tcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt-- |
8872407 |
T |
 |
| Q |
392 |
cactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8872406 |
-ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttactttagt |
8872366 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 53907966 - 53907873
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
53907966 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaacaacaaca |
53907873 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #50
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Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 54118344 - 54118261
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
54118344 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatt |
54118261 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
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Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15675327 - 15675224
Alignment:
| Q |
102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
| T |
15675327 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
15675228 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatt |
205 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
15675227 |
aatt |
15675224 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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Target Start/End: Original strand, 14951713 - 14951795
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| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
14951713 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
14951795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
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Target Start/End: Original strand, 31115654 - 31115767
Alignment:
| Q |
102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||| | |||||| | |
|
|
| T |
31115654 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcacc |
31115753 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatttgagcataatt |
216 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |
|
|
| T |
31115754 |
aa-ttgagcataatt |
31115767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 47468610 - 47468536
Alignment:
| Q |
44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47468610 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcat |
47468536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 434
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Alignment:
| Q |
396 |
aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53907640 |
aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
53907602 |
T |
 |
Back To:
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| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatc |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21417471 |
tgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatattcaaacatatc |
21417532 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #57
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
122052 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatt |
122135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
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| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
132 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32460953 |
accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgatatatgcacacccaagtcataaatcataaacaacaacatca |
32460878 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #59
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Alignment:
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
15675188 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
15675106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat |
93 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682817 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat |
5682767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
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| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
10104349 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
10104284 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaac-aaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagc |
141 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| | || | |
|
|
| T |
25119498 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaac |
25119399 |
T |
 |
| Q |
142 |
aacaaca |
148 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25119398 |
aacaaca |
25119392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7132342 |
caccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa |
7132246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
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| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
31115795 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
31115858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
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Target Start/End: Complemental strand, 40885434 - 40885370
Alignment:
| Q |
457 |
cttcactttagctcctaggttctttcctcttc-ttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40885434 |
cttcactttagctcctagattcactccaaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
40885370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 7728378 - 7728861
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T |
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136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
 |
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atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
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| T |
7728578 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaattctaacaattat |
7728677 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
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|
| T |
7728678 |
gaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
7728777 |
T |
 |
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436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttc-ttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
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Target: chr5; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 3673818 - 3674303
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T |
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233 |
Q |
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T |
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tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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tcatactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaatt |
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T |
 |
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ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3674118 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaa-ttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
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T |
 |
| Q |
434 |
ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5451134 - 5450647
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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| T |
5450934 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaatt |
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T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
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|
| T |
5450834 |
atgaacaattaatcaattactcaattaagcatttatttatgcaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaa |
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T |
 |
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434 |
tta-ggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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Q |
| |
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|
|
| T |
5450734 |
ttattatcaatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
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Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862604
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Q |
| |
|
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|
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caccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaatt |
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T |
 |
| Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
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|
| T |
19862286 |
gcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
19862385 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttact |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19862386 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcacttact |
19862485 |
T |
 |
| Q |
355 |
caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccc |
453 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19862486 |
caattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaatttttagcct |
19862584 |
T |
 |
| Q |
454 |
aaacttcactttagctccta |
473 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19862585 |
aaacttcactttagctccta |
19862604 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 432419 - 432903
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
432519 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcattttc |
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T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| | |
|
|
| T |
432619 |
tcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaatt |
432718 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
432719 |
atgatcaattaatcatttactcaattaagcacttattcatgcaacaattgaaaaattgcagt--aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
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T |
 |
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520 |
Q |
| |
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|
|
| T |
432817 |
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T |
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Target: chr5; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 141 - 520
Target Start/End: Original strand, 28902254 - 28902632
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Q |
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|
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|
|
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28902254 |
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T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
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T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc |
440 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28902454 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatc |
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T |
 |
| Q |
441 |
aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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Q |
| |
|
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|
|
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28902554 |
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T |
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Target: chr5; HSP #7
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|
||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
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|
| T |
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ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
28938848 |
T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc |
440 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatc |
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T |
 |
| Q |
441 |
aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28938949 |
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Target: chr5; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 36 - 501
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
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tcaacccattttacaaaa---ccaacaacaactcatttttcatcatcaaatcctgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcactt |
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T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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| T |
37983522 |
atactttgaatatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatagagcacaaattttaacaactat |
37983621 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
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37983622 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt |
37983719 |
T |
 |
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435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
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Q |
| |
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|
| T |
37983720 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 36 - 513
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| |
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T |
 |
| Q |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| T |
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agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcatagttcaacatataacactttcat |
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T |
 |
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atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact-t |
334 |
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| T |
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atacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaa |
21617273 |
T |
 |
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tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttag |
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| T |
21617274 |
tgaacaattaatcccttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa |
21617371 |
T |
 |
| Q |
434 |
ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttcctcttctct |
513 |
Q |
| |
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| T |
21617372 |
ttagcacaatt-cctagcccaaccttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttcttctct |
21617452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Original strand, 23493899 - 23494363
Alignment:
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157 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
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23493899 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
23493998 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| || |
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| T |
23493999 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcatatctcaacatatacctattcttcatactttgaacataaaattcca |
23494098 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
23494099 |
ctaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaattatgaacaattaattgattactcaa |
23494198 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac |
457 |
Q |
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| T |
23494199 |
ttaagcacttattcatacaacaattg-aaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagc |
23494297 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcactttagctcctaggttct---ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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| T |
23494298 |
ttcactttagctcctaggttctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 32966436 - 32965955
Alignment:
| Q |
36 |
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135 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctcaagccatgaattatcaataacaacaccactt |
32966337 |
T |
 |
| Q |
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agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| T |
32966336 |
agaagcaattacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacatatcacaagatgtcatttagagcataat--atcatatattattttcat |
32966239 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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| T |
32966238 |
atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcttacattccaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattat |
32966139 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
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|
|
| T |
32966138 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttatttatacaacaattgaaaattcacactaaaaatgattatgatgaattctaaccctcttaccttagtt |
32966039 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32966038 |
agatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctcct-tctctaaccc |
32965955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 16595486 - 16595948
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
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|
| T |
16595486 |
accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg |
16595585 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16595586 |
aacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattca-caatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt |
16595684 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
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| | | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||| ||| |||||| |
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| T |
16595685 |
ctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaattactc |
16595784 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16595785 |
aattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaagattaattccatagctcaa |
16595883 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16595884 |
gtttcactttagctcctaggtcctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
16595948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 36 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21222897 - 21222420
Alignment:
| Q |
36 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
135 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| || |||||||||| | |||||| || ||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21222897 |
tcaacccttttcacaaaaccaataacaacaactgaattctcatcatcaagtcatgatttatgaacactcaatccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
21222798 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21222797 |
agcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcataattcaacatataacactttcat |
21222698 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
21222697 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat |
21222598 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
21222597 |
gaacaattaatca-atactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaataattatgattgaactctaacccccataccttaat |
21222501 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttcctcttctct |
513 |
Q |
| |
|
|| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
21222500 |
tatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttcttcttctct |
21222420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 178 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 21297322 - 21297000
Alignment:
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Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297322 |
aacaacaacttagcacaattcaacaattttgacataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc |
21297223 |
T |
 |
| Q |
278 |
accaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21297222 |
accaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaa |
21297123 |
T |
 |
| Q |
378 |
caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggtt |
477 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297122 |
caaatgaaaaattacact-aaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctatcccaagcttcactttagctcctaggtt |
21297024 |
T |
 |
| Q |
478 |
ctttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297023 |
ctctcctcttcttgaatcttcaag |
21297000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 180 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21310854 - 21310557
Alignment:
| Q |
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Q |
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|
||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21310854 |
caacaacttagcacaatttaacaattttagcataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcac |
21310755 |
T |
 |
| Q |
280 |
caatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaaca |
379 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21310754 |
caatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaaca |
21310655 |
T |
 |
| Q |
380 |
attgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttc |
478 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21310654 |
aatgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagttggatcaattccctagcccaagcttcactttatctcctaggttc |
21310557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 6456580 - 6457016
Alignment:
| Q |
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atcaacccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
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|
| T |
6456580 |
atcaacccgtttgtacaaaaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctc |
6456679 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
6456680 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
6456779 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
6456780 |
acatactatgaacatgcaatttcac---caacaattcaattatcgccaatttcatgtattcaaacgtatcttcataattagagcacgaatttcaacaact |
6456876 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacctt |
431 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6456877 |
atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaaatctaacccccttatctt |
6456974 |
T |
 |
| Q |
432 |
agttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
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|||||| || | |||| ||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6456975 |
agttagcaaaaat-cctaacccaagcttcaatttagctcctag |
6457016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 470
Target Start/End: Original strand, 29917931 - 29918356
Alignment:
| Q |
44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | |||| || | |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
29917931 |
ttttacaaaaccaacgacaataatttatttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaa |
29918030 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
243 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29918031 |
caacatcagttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcacaatatatcctgttcacatactatg |
29918130 |
T |
 |
| Q |
244 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt |
343 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29918131 |
aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttcaacaactatgaacaaaa |
29918230 |
T |
 |
| Q |
344 |
aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtca |
441 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || | |
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|
| T |
29918231 |
aatcacttattcaattaagcatttaatcatgcaattaatgaaaagttacaact--aattgattatggttgaaatctaacccccttaccttagtta-gtga |
29918327 |
T |
 |
| Q |
442 |
attccctagcccaaacttcactttagctc |
470 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29918328 |
acatcctagcccaaacttcaatttagctc |
29918356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 19405503 - 19405980
Alignment:
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44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
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Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||||||||| || ||| || |
|
|
| T |
19405503 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaa |
19405602 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
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| T |
19405603 |
caatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatacttt |
19405702 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
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| T |
19405703 |
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19405802 |
T |
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343 |
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441 |
Q |
| |
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19405803 |
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19405900 |
T |
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442 |
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520 |
Q |
| |
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| T |
19405901 |
atctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
19405980 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23981806 - 23981451
Alignment:
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133 |
Q |
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23981806 |
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T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
| |
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| T |
23981707 |
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23981608 |
T |
 |
| Q |
234 |
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333 |
Q |
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| T |
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23981508 |
T |
 |
| Q |
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389 |
Q |
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| T |
23981507 |
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23981451 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Original strand, 24084034 - 24084437
Alignment:
| Q |
35 |
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133 |
Q |
| |
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| T |
24084034 |
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24084132 |
T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
| |
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| T |
24084133 |
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24084232 |
T |
 |
| Q |
234 |
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333 |
Q |
| |
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| T |
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24084332 |
T |
 |
| Q |
334 |
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430 |
Q |
| |
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| T |
24084333 |
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24084430 |
T |
 |
| Q |
431 |
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437 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
24084431 |
tagttag |
24084437 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 368
Target Start/End: Original strand, 22885668 - 22885932
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203 |
Q |
| |
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| T |
22885668 |
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22885767 |
T |
 |
| Q |
204 |
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303 |
Q |
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| T |
22885768 |
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22885867 |
T |
 |
| Q |
304 |
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368 |
Q |
| |
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| T |
22885868 |
atcataattaaagcacgaatttcaacaaccatgaacaaattatcaattattcaattaagcactta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11336992
Alignment:
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154 |
Q |
| |
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|
| T |
11337455 |
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11337357 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
| |
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| T |
11337356 |
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T |
 |
| Q |
254 |
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352 |
Q |
| |
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| T |
11337257 |
tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaaccaattca |
11337158 |
T |
 |
| Q |
353 |
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451 |
Q |
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| T |
11337157 |
tccaattaagcacttattcatacaataattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc |
11337061 |
T |
 |
| Q |
452 |
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520 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11337060 |
tcaagcttcaattttgctcctagctctcccccaatccttgattcttcaatttcctcttctctctaaccc |
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T |
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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26560096 - 26559771
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
144 |
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243 |
Q |
| |
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| T |
26559996 |
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26559897 |
T |
 |
| Q |
244 |
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342 |
Q |
| |
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| T |
26559896 |
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26559797 |
T |
 |
| Q |
343 |
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368 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26559796 |
taatcatttattcaattaagcactta |
26559771 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Original strand, 21109758 - 21110005
Alignment:
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185 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||| |
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|
| T |
21109758 |
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21109857 |
T |
 |
| Q |
186 |
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285 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
21109858 |
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21109957 |
T |
 |
| Q |
286 |
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333 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
21109958 |
catgtactcaaacatatcatcagaacaagagcacgaatttcaacaact |
21110005 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1168500 - 1168211
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128 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
1168500 |
tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac |
1168401 |
T |
 |
| Q |
129 |
atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatc |
227 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1168400 |
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1168302 |
T |
 |
| Q |
228 |
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318 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168301 |
attttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagca |
1168211 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16835590 - 16835291
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || |||||||| || | ||| || || || |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | |
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|
| T |
16835590 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacagcttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacatccaagctatgaatcatcaacaacaacatctc |
16835491 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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| T |
16835490 |
ttaacaacaacaacattaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcgacaattagagcacaattcacaatatactattttc |
16835391 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
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| T |
16835390 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaaatcaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 444
Target Start/End: Original strand, 20712056 - 20712440
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |
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| T |
20712056 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat |
20712155 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataat-tcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
|
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| T |
20712156 |
catgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattatcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
20712254 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc |
355 |
Q |
| |
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| T |
20712255 |
atcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatt-tcatcattatgaacaattaatcaattcactc |
20712353 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt |
444 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20712354 |
aattaagcactt-ttcatacaagtaattgaaaattgcaa--ataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatt |
20712440 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 519
Target Start/End: Original strand, 23466552 - 23466875
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194 |
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292 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |
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| T |
23466552 |
aattcaaccaattgagcatatttcaacatacaccatttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatca-taacttcttacat |
23466650 |
T |
 |
| Q |
293 |
tcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac |
392 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||| |||||| |||| ||| || | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
23466651 |
acaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaacaattaatcaattacacaattaatcacttattcatacaataattgaaaatt--- |
23466747 |
T |
 |
| Q |
393 |
actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttg |
491 |
Q |
| |
|
| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| | |||| || |||| |
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| T |
23466748 |
gcaataattgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctctcttccactccttg |
23466847 |
T |
 |
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492 |
aatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| ||||||||||||| |
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|
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23466848 |
attcttcaaattccccttctctctaacc |
23466875 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23234776 - 23234432
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||||| || || || |||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
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| T |
23234776 |
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23234677 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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||| || ||||||||||| | |||||| |||| | || | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
23234676 |
ttaacaataacaacatcaattaaacatgattctcatcactaatcaacaacaaaatagcacaattcaataattagagcacaattcacaatatatcattttc |
23234577 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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|||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |
|
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| T |
23234576 |
acatactataaacatgcaattacaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtacttaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact |
23234477 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
|| | || |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23234476 |
aagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaa |
23234432 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 280 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 24225391 - 24225171
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280 |
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379 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| || | |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
24225391 |
caatttcatatatacaaacatatcaccataattaaggcacgaaattcaacatctaagaacaattaatcacttaatcaattaagcacttaaccatacaact |
24225292 |
T |
 |
| Q |
380 |
attgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttc |
478 |
Q |
| |
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| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24225291 |
agtgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaactcccttaccttagttagcacaatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatc |
24225195 |
T |
 |
| Q |
479 |
t-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24225194 |
tctaccacttcttgaatcttcaag |
24225171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 432
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584405
Alignment:
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9 |
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107 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
11583982 |
catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaaacccaag |
11584080 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaatt---caacaacaacatagcataattcaacaat |
204 |
Q |
| |
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|||||||| || | |||| | || ||| | || |||||||| | | ||| |||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |
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| T |
11584081 |
ccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaa- |
11584179 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatc |
303 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| || || |
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| T |
11584180 |
ttgagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtc |
11584279 |
T |
 |
| Q |
304 |
atcataattagagcacaaattataacaact-ttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaa |
400 |
Q |
| |
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||||||| |||||||| |||| | || ||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |
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|
| T |
11584280 |
atcataaatagagcacgaatt-tcaccactcatgaacaattaattaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaag |
11584373 |
T |
 |
| Q |
401 |
tgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11584374 |
tgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11584405 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 324
Target Start/End: Original strand, 23417198 - 23417488
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | | | |
|
|
| T |
23417198 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatacctc |
23417296 |
T |
 |
| Q |
134 |
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232 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| | |||||| | | || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||| | | ||| |
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|
| T |
23417297 |
ataacaacaacaacatcaattaaacatgaatgtcaccacaaatcaacaacaacatagcacaattcagcaattagagcacaattcacaatataccaatttt |
23417396 |
T |
 |
| Q |
233 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
23417397 |
cacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaatcatcaccaaattcatgtactcaaacaaatcatcataacaagagcacgaatt |
23417488 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24183286 - 24183022
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| Q |
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269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| | |||| | |||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
24183286 |
acaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatacccttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaatt |
24183188 |
T |
 |
| Q |
270 |
caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
24183187 |
caattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- |
24183089 |
T |
 |
| Q |
369 |
ttcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183088 |
ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
24183022 |
T |
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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 109158 - 108960
Alignment:
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8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
109158 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa |
109060 |
T |
 |
| Q |
107 |
gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||||| | |||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
109059 |
gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
108960 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 16105573 - 16105771
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| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| || || |
|
|
| T |
16105573 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacctaa |
16105671 |
T |
 |
| Q |
107 |
gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||||| | |||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
16105672 |
gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
16105771 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 21397066 - 21397451
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac- |
153 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||| |||| |||| |
|
|
| T |
21397066 |
caccaagaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaaca |
21397165 |
T |
 |
| Q |
154 |
--tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatg |
249 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
21397166 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatg |
21397264 |
T |
 |
| Q |
250 |
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349 |
Q |
| |
|
|||| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
21397265 |
taattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa |
21397363 |
T |
 |
| Q |
350 |
ttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397364 |
ttcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
21397451 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 28261498 - 28261869
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | || |||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
28261498 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
28261597 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
|
|| ||| | || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28261598 |
gatcataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatat----ttttcatactttgaacatacaatt |
28261692 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||| | || |||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
28261693 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatt-tcaccacttatgaacaattaatcaattca |
28261791 |
T |
 |
| Q |
354 |
tc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261792 |
tccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
28261869 |
T |
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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
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aatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
19873934 |
aatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact |
19874016 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22662652 - 22662572
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tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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22662652 |
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22662572 |
T |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
7528879 |
accaacaacatctcaattcacaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
7528977 |
T |
 |
| Q |
156 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7528978 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
7529028 |
T |
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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 333
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171 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactt--tgaacatgaaatttcaccaacaacaat |
268 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
11763659 |
acaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttat-acacctcatgaacatgaaatttcatcaacatcaac |
11763561 |
T |
 |
| Q |
269 |
tcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11763560 |
tcaattatcatcaaattcatctactcaaacatatcatcgtaacaagagcacaaatttcaacaact |
11763496 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 211
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9 |
catcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-ac-aaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaat-catgaattatgaactccca |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | || || | |||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
24225634 |
catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaatcctcaacaacaacttaaatcacatc-acaaatccatg-attatgaacaccca |
24225537 |
T |
 |
| Q |
106 |
agccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||| ||| | || || ||| |||||||| | |||||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
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|
| T |
24225536 |
agttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaataacatcaattaaacatgaattccaccacaaatcaacaacaaaatagcacaattcaacaatt |
24225437 |
T |
 |
| Q |
206 |
tgagca |
211 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
24225436 |
agagca |
24225431 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 234 - 434
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| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |
|
|
| T |
4865418 |
tcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccattt |
4865517 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
431 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4865518 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt |
4865612 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #44
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55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |||| | |||||||||||| | |
|
|
| T |
21906697 |
caccaacaacatttcatttctcagccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactt---aacaacaacatcaatt |
21906793 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21906794 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcatcaatt |
21906844 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
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343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25005082 |
taatcacttattcaattgagcacttattcatacaacaattgaaaaactaaact--aaatgattatgatgaagactaacccccttactttag |
25005170 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #46
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Target Start/End: Original strand, 23466434 - 23466540
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
23466434 |
caccaacaacatatcattcctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaatt |
23466533 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatg |
161 |
Q |
| |
|
|| |||| |
|
|
| T |
23466534 |
gatcatg |
23466540 |
T |
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Target: chr5; HSP #47
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || || |||| || |
|
|
| T |
9730672 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaatatgtctcagcaaca |
9730574 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
9730573 |
acaacatcaa |
9730564 |
T |
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| Q |
102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
| T |
22054071 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
22053972 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatt |
205 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
22053971 |
aatt |
22053968 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #49
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
24475560 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca |
24475653 |
T |
 |
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110 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
18531297 |
atgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt |
18531202 |
T |
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58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
| T |
19873824 |
caacaacaacttaattcacatcacaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
19873923 |
T |
 |
| Q |
158 |
catg |
161 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
19873924 |
catg |
19873927 |
T |
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Target: chr5; HSP #52
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56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
17909485 |
accaacaacatcttatttctcacc-accaatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtcgcatcagcaacaacatcaatta |
17909582 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
17909583 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
17909633 |
T |
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
2031787 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaaca |
2031880 |
T |
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44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagc |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22882391 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcaacatcaattcatgatttatgaacacccaagc |
22882455 |
T |
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Target: chr5; HSP #55
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240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| || | |||||| |||| |
|
|
| T |
23507128 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatt |
23507211 |
T |
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Target: chr5; HSP #56
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| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
18531166 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
18531084 |
T |
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| Q |
275 |
atcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcata |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5621844 |
atcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata |
5621810 |
T |
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Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
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Target Start/End: Original strand, 11342635 - 11342717
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| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
11342635 |
tcataatcaacccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
11342717 |
T |
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Target: chr5; HSP #59
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| Q |
405 |
tatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168127 |
tatgatgaattctaacccccttaccttagt |
1168098 |
T |
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Target: chr5; HSP #60
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
10778259 |
atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
10778161 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
10778160 |
acaacatcaa |
10778151 |
T |
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| Q |
401 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21646667 |
tgattatgatgaattttaacccccttaccttagt |
21646634 |
T |
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Target: chr5; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 102 - 159
Target Start/End: Original strand, 34939303 - 34939360
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| Q |
102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaaca |
159 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34939303 |
cccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaaca |
34939360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Original strand, 35444 - 35921
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35444 |
attttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
35542 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35543 |
aaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatacttt |
35642 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35643 |
gaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataagaactttgaacaat |
35742 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca |
441 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
35743 |
taatcttttactcaattaagcacctattcatacaacaattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc |
35841 |
T |
 |
| Q |
442 |
attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35842 |
aattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc |
35921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Original strand, 21623133 - 21623610
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21623133 |
attttaccaaactaccaacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaaca |
21623232 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21623233 |
acaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
21623332 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
21623333 |
gaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaat |
21623432 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca |
441 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
21623433 |
taatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgagaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc |
21623531 |
T |
 |
| Q |
442 |
attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
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| T |
21623532 |
aattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttcaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc |
21623610 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 59 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 25367503 - 25367043
Alignment:
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59 |
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158 |
Q |
| |
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| T |
25367503 |
aacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaac |
25367404 |
T |
 |
| Q |
159 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcac |
258 |
Q |
| |
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| T |
25367403 |
atgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcatatttcaacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctc |
25367304 |
T |
 |
| Q |
259 |
caacaacaattcaattatc-accaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
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| T |
25367303 |
taacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgctcaa |
25367204 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac |
457 |
Q |
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| T |
25367203 |
ttaagcacttattcatacaataattgaaaatttacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagctagatcaattctctagccaaaga |
25367105 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
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| T |
25367104 |
ttcactttagcttataggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 36 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361617
Alignment:
| Q |
36 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
135 |
Q |
| |
|
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| T |
22362054 |
tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
22361955 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
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| T |
22361954 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacttatgtcactttctc |
22361855 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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|
| T |
22361854 |
atactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctat |
22361755 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
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|
| T |
22361754 |
gaacaattaatcatttgctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattac---taaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
22361658 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg |
475 |
Q |
| |
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|| | | | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22361657 |
tatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctcctagg |
22361617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16888059 - 16887597
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
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| T |
16888059 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaa |
16887960 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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| T |
16887959 |
catggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcacccaattgagcataattcacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca |
16887860 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
16887859 |
ccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttattcaa |
16887760 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac |
457 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |
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| T |
16887759 |
ttaatcacttattcatacaataattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagttcaagc |
16887660 |
T |
 |
| Q |
458 |
ttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16887659 |
ttcactttagctcctatgttctctcctcttcttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
16887597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381649
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18381965 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca |
18381866 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18381865 |
acaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
18381766 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18381765 |
gaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
18381666 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaatt |
359 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18381665 |
taatcatttacacaatt |
18381649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 18398890 - 18399378
Alignment:
| Q |
30 |
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128 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
18398890 |
tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaac |
18398988 |
T |
 |
| Q |
129 |
atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
18398989 |
atcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatacta |
18399088 |
T |
 |
| Q |
229 |
ctttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataa |
328 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18399089 |
ttttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaa |
18399188 |
T |
 |
| Q |
329 |
caactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac |
428 |
Q |
| |
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||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18399189 |
caattatgaacaattagtcaattactcaattaagcacttattcatacaataattg-aaatttacact-aaaatgattatgaagaattctaacccccttac |
18399286 |
T |
 |
| Q |
429 |
cttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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|
| T |
18399287 |
cttagttagattaatctccctagcttagacttcaattttgctccta-gctctcttcaccccttgatttttcaagttcatcttctctctaaccc |
18399378 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 33538647 - 33538198
Alignment:
| Q |
47 |
tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaa |
146 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |
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|
| T |
33538647 |
tacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaa |
33538548 |
T |
 |
| Q |
147 |
catcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaac |
246 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33538547 |
catcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacctttagagcataattcacaacatatcactttcacatactttgaac |
33538448 |
T |
 |
| Q |
247 |
atgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaat |
346 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33538447 |
atgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaat |
33538349 |
T |
 |
| Q |
347 |
catttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattc |
445 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
33538348 |
cacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttcgcacaaatt |
33538251 |
T |
 |
| Q |
446 |
cctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatctt |
497 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
33538250 |
cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatctt |
33538198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 44 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18629892 - 18629433
Alignment:
| Q |
44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |
|
|
| T |
18629892 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa |
18629793 |
T |
 |
| Q |
144 |
caaca---tcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
240 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
18629792 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacattcagagcataattcacaatataccactttcacatact |
18629693 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
18629692 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
18629593 |
T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
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| T |
18629592 |
attaatcacttattcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagca |
18629495 |
T |
 |
| Q |
440 |
caattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaa |
500 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18629494 |
caaattcctagcccaagcttcactttacctcctaggatctataccacttcttgaatcttcaa |
18629433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 104 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21411270 - 21410856
Alignment:
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104 |
caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa |
203 |
Q |
| |
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|||||||||||| || || |||| ||||| ||| || || | ||||||| || ||||| ||| | | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |
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| T |
21411270 |
caagccatgaattataaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattgcacatgaatctcagcataatccaacatcaacatagcataattca-caa |
21411172 |
T |
 |
| Q |
204 |
tttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatc |
303 |
Q |
| |
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| T |
21411171 |
tttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataac |
21411072 |
T |
 |
| Q |
304 |
atcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatga |
403 |
Q |
| |
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| T |
21411071 |
atcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcctcaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaa-tga |
21410973 |
T |
 |
| Q |
404 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt |
503 |
Q |
| |
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|
| T |
21410972 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcactttagctcctagattctctcctcttcttgaatcttcaagtt |
21410873 |
T |
 |
| Q |
504 |
cctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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| T |
21410872 |
ccttttctctctaaccc |
21410856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35135818
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
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| T |
35136279 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa |
35136180 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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| T |
35136179 |
catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattcacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca |
35136080 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
35136079 |
c-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaattatctaa |
35135981 |
T |
 |
| Q |
358 |
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456 |
Q |
| |
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| T |
35135980 |
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35135882 |
T |
 |
| Q |
457 |
cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
35135881 |
cttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctctcctctctaaccc |
35135818 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17083496 - 17083050
Alignment:
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8 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
17083496 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaa |
17083397 |
T |
 |
| Q |
107 |
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206 |
Q |
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| T |
17083396 |
gccatgaatcatcaacaacaacatcaatta-------------------aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacattta |
17083316 |
T |
 |
| Q |
207 |
gagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc |
306 |
Q |
| |
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| T |
17083315 |
gagcacaattcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatc |
17083217 |
T |
 |
| Q |
307 |
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406 |
Q |
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| T |
17083216 |
ataattagagcacgaatattaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgatta |
17083119 |
T |
 |
| Q |
407 |
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475 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17083118 |
aaatgaattctaacccccttaccttagttag--caattaatcctagccgaagcttcactttagctcctagg |
17083050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33325134
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33324673 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa |
33324772 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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| T |
33324773 |
catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattcataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca |
33324872 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||| |
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| T |
33324873 |
c-aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaattatccaa |
33324971 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaa-atttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa |
456 |
Q |
| |
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| T |
33324972 |
ttaatcacttattcatacattaattgaaataattacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatgaattccctagctcaag |
33325070 |
T |
 |
| Q |
457 |
cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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| T |
33325071 |
cttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatctttaagttcctctcctctctaaccc |
33325134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Original strand, 25919571 - 25920055
Alignment:
| Q |
36 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
135 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
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|
| T |
25919571 |
tcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatat |
25919670 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| T |
25919671 |
agcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcacaaattatcatttagagtataatatgacatatatcattttcat |
25919770 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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| T |
25919771 |
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25919870 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
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| T |
25919871 |
gaccaattaatcaattactcaattaagcacttattcattcaacaaatgaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
25919970 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25919971 |
agatcaattccctagttctaacttcactttagctcctagctctcccccaatccttgaatcttcaagctcctctactctctaaccc |
25920055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17557258 - 17556866
Alignment:
| Q |
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182 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||| |
|
|
| T |
17557258 |
aaatcatgatttatgaacacctaaactatgaatgattaacaacaatattagttagcaacaacaacatcaattaaatatgattataatcacaattcaacaa |
17557159 |
T |
 |
| Q |
183 |
caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa |
282 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17557158 |
caacatagca-aattcaacatctatagcataattcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa |
17557060 |
T |
 |
| Q |
283 |
tttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaatt |
382 |
Q |
| |
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|
| T |
17557059 |
tttcatgca-tcaaacatatcatcataattagagcacgaatt-taacaactatgaacaaataatcaattattcaattaagcacttaataatgcaattaat |
17556962 |
T |
 |
| Q |
383 |
gaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctt |
480 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
17556961 |
gaaaaattacact--agatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagctcaaat-cctagcctaagcttcactttatctcctagattctt |
17556866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 302
Target Start/End: Original strand, 25651197 - 25651461
Alignment:
| Q |
39 |
acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
137 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25651197 |
acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
25651296 |
T |
 |
| Q |
138 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat |
237 |
Q |
| |
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|
| T |
25651297 |
caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat |
25651396 |
T |
 |
| Q |
238 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatat |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25651397 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatat |
25651461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 15740207 - 15740662
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||| || || | ||||||| || |
|
|
| T |
15740207 |
accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattattaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg |
15740306 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
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|||||| ||| | || ||||||||| ||||||| || || | ||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
15740307 |
aacatgaatctcagtataattcaacatcaacatatcacaaattgacatatagagcataatatgacatatatcatttttatatactttgatcattcaattt |
15740406 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15740407 |
caccaacaaccaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacatagcatcataattggagcacgaaatctaacaatcatgaacaattaatcaattactc |
15740506 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15740507 |
aattaagtacttattcatacaaaaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaactccc---------taagatcaattccctaattcaa |
15740597 |
T |
 |
| Q |
456 |
acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15740598 |
gcttcactttcgctcctaagtcctctccaactcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc |
15740662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15079944 - 15079517
Alignment:
| Q |
89 |
tgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacat |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
15079944 |
tgaattatgaatacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatat |
15079845 |
T |
 |
| Q |
189 |
agcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||||||||| | || |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
15079844 |
agcataattcacccaattgagcataattcacaagttagcactcatacacactttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcat |
15079746 |
T |
 |
| Q |
289 |
gaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaat |
388 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| || ||||||||| |
|
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| T |
15079745 |
gcatacaa-catatcatcctagttagagcacgaatt-taacatctatgaataattaatcaattatccaattaatcccttattcataaaataattgaaaaa |
15079648 |
T |
 |
| Q |
389 |
ttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattcc-ctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctctt |
487 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||| |||||||| | |||| | |
|
|
| T |
15079647 |
ttacact-aaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttagattaatccctctagcttaagcttcacttttgctcctagctctcttccaatc |
15079550 |
T |
 |
| Q |
488 |
cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15079549 |
cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
15079517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Original strand, 29605406 - 29605744
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | |
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| T |
29605406 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaagaacaacttatttctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatttc |
29605505 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | | |||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||| |
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|
| T |
29605506 |
ttagcaacaacaacatcaattaagcatgattcacatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacattttgagcacaattcacaatatttcattttc |
29605605 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
|
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| T |
29605606 |
acatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaact |
29605704 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcat |
373 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29605705 |
atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcat |
29605744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 34966823 - 34967167
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
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|
| T |
34966823 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
34966922 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
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| T |
34966923 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaattagagtacaattcacaatatatctttttc |
34967022 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
34967023 |
acatactatgaacatgcaatttcacgaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact |
34967122 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttga-acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
|| | || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34967123 |
aagagaaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaa |
34967167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Original strand, 19854135 - 19854446
Alignment:
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157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | || |
|
|
| T |
19854135 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaa |
19854234 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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|||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||| |
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| T |
19854235 |
catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcattatttagagcacaactcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
19854334 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| || || | || |||||| ||||||| |
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| T |
19854335 |
ccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacagctaagagcaaaataatcacttactca |
19854434 |
T |
 |
| Q |
357 |
attaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
19854435 |
attaagcactta |
19854446 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
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Target Start/End: Original strand, 22848110 - 22848409
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173 |
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272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22848110 |
aattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaa |
22848209 |
T |
 |
| Q |
273 |
ttatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattca |
372 |
Q |
| |
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|||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| || |
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|
| T |
22848210 |
ttatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcaattattcaactaagcacttaaaca |
22848308 |
T |
 |
| Q |
373 |
tacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc |
470 |
Q |
| |
|
| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
22848309 |
tgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaattcccttaccttaaatagcacaaat-cctagtccaagcttcaatttagctc |
22848405 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28195362 - 28195101
Alignment:
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155 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | | |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |
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|
| T |
28195362 |
accaacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattg |
28195264 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtt-tcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
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| ||| ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
28195263 |
atcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacatttcatcatataccattttctcatactatgaacatgaaatt |
28195164 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagc |
317 |
Q |
| |
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| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28195163 |
ttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataattggagc |
28195101 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22462386 - 22462112
Alignment:
| Q |
35 |
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133 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||| | |||||| || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
22462386 |
atcaacctattttcacaaaaccaacaacaactacttaattctcatcacaaactcatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
22462288 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
22462287 |
ttaacaacaacaacatcatttaaacatgaatctcatcacaac-caacaacatcatagcacaattcaacaattagagcaaaattcacaatataccactttc |
22462189 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa |
310 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22462188 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa |
22462112 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29160594 - 29160343
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| || || || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
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|
| T |
29160594 |
atcaacccattttcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
29160495 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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||| || |||||||||||| | |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||| |
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|
| T |
29160494 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcgcaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaactcacaatatatcattttc |
29160395 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt |
285 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29160394 |
acataccatgaacatgcaatttcactaacaacaattcaattatcaccaattt |
29160343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 23222703 - 23223006
Alignment:
| Q |
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca--acatc |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| | ||| |
|
|
| T |
23222703 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacatgatatc |
23222802 |
T |
 |
| Q |
132 |
acttag--cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcac |
229 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||| | |||||| ||| | |||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23222803 |
tcttataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaataaacaacaacatagtacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcat |
23222902 |
T |
 |
| Q |
230 |
tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac |
329 |
Q |
| |
|
|||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |
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|
| T |
23222903 |
tttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataaaaagagcacgaatttcaac |
23223002 |
T |
 |
| Q |
330 |
aact |
333 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
23223003 |
aact |
23223006 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17013793 - 17013595
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270 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17013793 |
acaaatcaacaagaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattc |
17013694 |
T |
 |
| Q |
271 |
aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || | || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17013693 |
aattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcactta |
17013595 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 23221870 - 23222148
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| Q |
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
23221870 |
atcaatccattttcacaaaaccaacaacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctc |
23221969 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttag--cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt |
231 |
Q |
| |
|
||| || |||||| ||||| | |||||| ||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
23221970 |
ttataacaacaacaatatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataatacaattcaacaattagagcataattcacaatataccattt |
23222069 |
T |
 |
| Q |
232 |
tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa |
310 |
Q |
| |
|
|| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23222070 |
tcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataa |
23222148 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 304 - 501
Target Start/End: Original strand, 25654350 - 25654546
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304 |
atcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatga |
403 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
25654350 |
atcataattagagcacgaattttaacaactctgaacaattaatcacctactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatga |
25654447 |
T |
 |
| Q |
404 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25654448 |
ttagcacaaattctaacccccttaccttaattagcacagattcctagcgcaagtttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 32898767 - 32899149
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||| || | ||||||||| ||| | || ||||||| |||| | |
|
|
| T |
32898767 |
caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacttcaatt |
32898866 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32898867 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
32898965 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
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|
| T |
32898966 |
tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
32899065 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcata-caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32899066 |
ccaaattaagcactt-ttcataccaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
32899149 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 278
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
31628245 |
caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
31628344 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
31628345 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat |
31628443 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatca |
278 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628444 |
tcaactaacaacaattcaattatca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | || |
|
|
| T |
19672275 |
caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgatttatgaacaccgaagttatgaatcatcaacaacaatatctct--------acaacatcaattaaa |
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T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
|
|||| | || | ||||||||||| || |||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19672367 |
catgat-ctcatcgcaattcaacaataagatagcacaattcaacatttggagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcaatttca |
19672465 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaat |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19672466 |
ttaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataataagagcacaaat |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 141 - 368
Target Start/End: Original strand, 32352110 - 32352338
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141 |
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Q |
| |
|
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|
| T |
32352110 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacataattcaacatttagaacacaattcacaatatatcattttcacatact |
32352209 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- |
339 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||| | |
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|
| T |
32352210 |
atgaacatacaatttcaccataaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaatataccatcatagaaagagcatgaatttcaacaactatgagca |
32352309 |
T |
 |
| Q |
340 |
aattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
32352310 |
aaataatcacttattcaattaagcactta |
32352338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 439
Target Start/End: Original strand, 18432626 - 18433001
Alignment:
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160 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| ||| ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||| |||||| ||| ||| |
|
|
| T |
18432626 |
caacatctcatttttcaacaataaaccattaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcat |
18432725 |
T |
 |
| Q |
161 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc |
259 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||| | | |
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|
| T |
18432726 |
gaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatta-agcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatgtaattcaatc |
18432824 |
T |
 |
| Q |
260 |
aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaat |
358 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | || | ||||||| |||||| || || |||| |
|
|
| T |
18432825 |
aacaacaattcaagtattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaat |
18432924 |
T |
 |
| Q |
359 |
taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18432925 |
taagctctt-ttcatacaataattgaaaatttgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
18433001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 18583264 - 18583384
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8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
18583264 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
18583362 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaaca |
129 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||| |
|
|
| T |
18583363 |
ccatgaattatcatcaacaaca |
18583384 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 434
Target Start/End: Original strand, 18570372 - 18570632
Alignment:
| Q |
171 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt |
269 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
18570372 |
acaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaatttaactaataacaatt |
18570470 |
T |
 |
| Q |
270 |
caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
18570471 |
caattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
18570570 |
T |
 |
| Q |
369 |
ttcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570571 |
t-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaattgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
18570632 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 439
Target Start/End: Original strand, 16106561 - 16106875
Alignment:
| Q |
123 |
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221 |
Q |
| |
|
|||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
16106561 |
aacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaatta-agcatattttcaaca |
16106659 |
T |
 |
| Q |
222 |
tata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcaca |
320 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106660 |
catactcatttt-tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcaca |
16106758 |
T |
 |
| Q |
321 |
aattataacaactttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattcta |
418 |
Q |
| |
|
|||| | || | |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106759 |
aatttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagcactt-ttcatacaattaattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattcta |
16106854 |
T |
 |
| Q |
419 |
acccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106855 |
acccccttaccttagttaggt |
16106875 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 439
Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086376
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182 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || | |||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
16086022 |
aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa |
16086121 |
T |
 |
| Q |
183 |
caacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcacca |
281 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||| ||||| |||||| || ||||| ||| | ||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16086122 |
caacaaggtataattcaccaatta-agcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccata |
16086220 |
T |
 |
| Q |
282 |
atttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatacaa-ca |
379 |
Q |
| |
|
| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
16086221 |
acttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcactt-ttcatacaatta |
16086319 |
T |
 |
| Q |
380 |
attgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16086320 |
attgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 4991002 - 4991200
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| Q |
8 |
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106 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
4991002 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa |
4991100 |
T |
 |
| Q |
107 |
gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|||| | |||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
4991101 |
gccaaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
4991200 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18823712 - 18823515
Alignment:
| Q |
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acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
18823712 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
18823614 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||||| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
18823613 |
ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
18823515 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18839567 - 18839419
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| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
18839567 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
18839469 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18839468 |
ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa |
18839419 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31467680 - 31467544
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| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-a |
340 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || | | |
|
|
| T |
31467680 |
tgaacatgcaatttcattaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataataagagcatgaatttcaacaactaagagcaa |
31467581 |
T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31467580 |
aataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaa |
31467544 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Original strand, 18777126 - 18777392
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| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
18777126 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattcattgat |
18777225 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18777226 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
18777324 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
18777325 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatt |
18777392 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
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Target Start/End: Original strand, 21931296 - 21931450
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acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt |
269 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21931296 |
acaaatcaacaacaacataacacaactcatcaatttaagcataattcacaatatacccatttatacatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaatt |
21931395 |
T |
 |
| Q |
270 |
caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
21931396 |
caattatcatcaatttcatatattcaaacatatcatcttaacaagagtacaaatt |
21931450 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
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269 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
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acaaatcaacaacaacatagtacaattcatcaatttaagcacaattcacaatatactcatttatacatatcatgaacatgcaattttatcaacaacaatt |
19175342 |
T |
 |
| Q |
270 |
caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19175343 |
caattatcatcaattttatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
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102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
35009677 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcacc |
35009578 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatt |
205 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
35009577 |
aatt |
35009574 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
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158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | || | |
|
|
| T |
19629314 |
acaacaactcatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatc |
19629411 |
T |
 |
| Q |
159 |
atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| |||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
19629412 |
ttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
19629458 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 22440911 - 22441287
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55 |
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153 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| ||| |
|
|
| T |
22440911 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaat |
22441009 |
T |
 |
| Q |
154 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaa |
252 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
22441010 |
tgatcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgtaa |
22441108 |
T |
 |
| Q |
253 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt- |
351 |
Q |
| |
|
|| || | ||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||| || |||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
22441109 |
ttcaccccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattc |
22441208 |
T |
 |
| Q |
352 |
actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22441209 |
actcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattgc----aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
22441287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
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Target Start/End: Original strand, 14152632 - 14152733
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401 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttc-tttcctcttcttgaatcttca |
499 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14152632 |
tgattatgatgaagaataacccccttgccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcatctcctcttcttgattcttca |
14152731 |
T |
 |
| Q |
500 |
ag |
501 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
14152732 |
ag |
14152733 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 242 - 333
Target Start/End: Original strand, 16136427 - 16136518
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| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
16136427 |
tgaacatgcaatttcatcaaaaactattcaattatcatcaatttcatatattcaaacatattatcataacaagagcacgaatttcaacaact |
16136518 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #50
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Target Start/End: Original strand, 18777450 - 18777488
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| Q |
401 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777450 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
18777488 |
T |
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Target: chr6; HSP #51
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| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
32277039 |
accaacagcatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
32276942 |
T |
 |
| Q |
156 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
32276941 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaataacatgtcacaattcatcaatt |
32276891 |
T |
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Target: chr6; HSP #52
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Target Start/End: Complemental strand, 35015447 - 35015342
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43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
| T |
35015447 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
35015348 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
35015347 |
acaaca |
35015342 |
T |
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Target: chr6; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 401 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25640487 - 25640453
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| Q |
401 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25640487 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
25640453 |
T |
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Target: chr6; HSP #54
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Target Start/End: Original strand, 16231859 - 16231967
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
16231859 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
16231957 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16231958 |
acaacatcaa |
16231967 |
T |
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Target: chr6; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18087112 - 18087004
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
18087112 |
atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
18087014 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18087013 |
acaacatcaa |
18087004 |
T |
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Target: chr6; HSP #56
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Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19983581 - 19983476
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
| T |
19983581 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
19983482 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
19983481 |
acaaca |
19983476 |
T |
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Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25744483 - 25744390
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
25744483 |
caccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca |
25744390 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #58
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Target Start/End: Original strand, 23153610 - 23153693
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
23153610 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
23153693 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
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| Q |
295 |
aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaac---aattgaaaattt |
390 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13014740 |
aaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaatttagcactt-ttcatacaaacataattgaaaatt- |
13014643 |
T |
 |
| Q |
391 |
acactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13014642 |
--acaataagtgattatgataaattctaacccccttaccttagt |
13014601 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16300230 - 16300116
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| Q |
84 |
aatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| || ||| || |||| || ||||||||| | |
|
|
| T |
16300230 |
aatcatgatatatgaacacccaagccataaatcatatacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacca |
16300131 |
T |
 |
| Q |
183 |
caacatagcataatt |
197 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |
|
|
| T |
16300130 |
caacatgtcataatt |
16300116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Original strand, 18570686 - 18570718
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| Q |
488 |
cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570686 |
cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
18570718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177618
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20177140 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca |
20177239 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20177240 |
acaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
20177339 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
20177340 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
20177439 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca |
441 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
20177440 |
taatcaattactcaattaagcacttaaacatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaaccccattaccttaattatcacc |
20177538 |
T |
 |
| Q |
442 |
attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20177539 |
aattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc |
20177618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 141 - 520
Target Start/End: Original strand, 16656701 - 16657079
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| Q |
141 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
240 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16656701 |
caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
16656800 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
16656801 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16656900 |
T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16656901 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatc |
16657000 |
T |
 |
| Q |
441 |
aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16657001 |
aattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagcttctctt-tctctaaccc |
16657079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 141 - 507
Target Start/End: Original strand, 16645975 - 16646341
Alignment:
| Q |
141 |
caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16645975 |
caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataattcaacatatatcactttctcatact |
16646074 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
16646075 |
ttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16646174 |
T |
 |
| Q |
341 |
attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc |
440 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16646175 |
attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatc |
16646274 |
T |
 |
| Q |
441 |
aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctc |
507 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16646275 |
aattccctagctcaagcttcactttagttcctaggttctctcattctcttgaatcttcaagttcctc |
16646341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 61 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 36356557 - 36356098
Alignment:
| Q |
61 |
caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36356557 |
caacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacat |
36356458 |
T |
 |
| Q |
161 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacca |
260 |
Q |
| |
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36356358 |
T |
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360 |
Q |
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36356258 |
T |
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460 |
Q |
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T |
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520 |
Q |
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actttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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Target: chr1; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 17608886 - 17609351
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T |
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235 |
Q |
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T |
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335 |
Q |
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T |
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434 |
Q |
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| T |
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T |
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435 |
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501 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 36 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37234149 - 37233672
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T |
 |
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235 |
Q |
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T |
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| Q |
236 |
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335 |
Q |
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| T |
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37233850 |
T |
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| Q |
336 |
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434 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttacctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttcttctct |
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T |
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Target: chr1; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603529
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235 |
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| T |
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| Q |
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335 |
Q |
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| T |
19603255 |
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19603354 |
T |
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435 |
Q |
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T |
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T |
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Target: chr1; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 44 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627472
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243 |
Q |
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| T |
51627845 |
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T |
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| Q |
244 |
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343 |
Q |
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| Q |
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443 |
Q |
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| T |
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51627547 |
T |
 |
| Q |
444 |
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519 |
Q |
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tccctagcttaagcttcaatttagctccta-gctccctccaatccttgaatcttcaagttccccttctctctaacc |
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Target: chr1; HSP #9
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Target Start/End: Complemental strand, 38033962 - 38033478
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T |
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| Q |
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235 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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335 |
Q |
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| T |
38033763 |
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38033664 |
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 |
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434 |
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| T |
38033663 |
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38033564 |
T |
 |
| Q |
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520 |
Q |
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38033563 |
tatatcaattccctagttcgagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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Target: chr1; HSP #10
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T |
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| Q |
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235 |
Q |
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| T |
20955628 |
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T |
 |
| Q |
236 |
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335 |
Q |
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| T |
20955528 |
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20955429 |
T |
 |
| Q |
336 |
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435 |
Q |
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| T |
20955428 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttgcact--aaatgattatgatgaattataacccccttaccttagtt |
20955331 |
T |
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| Q |
436 |
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501 |
Q |
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| T |
20955330 |
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Target: chr1; HSP #11
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ttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa |
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T |
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| Q |
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caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg |
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Q |
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caacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacatactatg |
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T |
 |
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aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt |
343 |
Q |
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| T |
21195180 |
aacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaatt |
21195279 |
T |
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aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca |
441 |
Q |
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| T |
21195280 |
aatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaact--aaatgattatgattgaattctaaaccccttaccttagttagcaca |
21195377 |
T |
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442 |
attccctagcccaaacttcactttagctcctag |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 70 - 520
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atttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgagcatggttctcat |
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T |
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tacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt |
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| T |
22143516 |
cataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaatt |
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T |
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caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttat |
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Q |
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| T |
22143416 |
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22143317 |
T |
 |
| Q |
370 |
tcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt--ccctagcccaaacttcactttag |
467 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22143316 |
tcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttag--caattaatcctagcccaagcttcactttag |
22143221 |
T |
 |
| Q |
468 |
ctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
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| T |
22143220 |
ctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag--cttcttctctctaaccc |
22143169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 37 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22829712 - 22829232
Alignment:
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136 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || | || |||||||| |
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| T |
22829712 |
caacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagaaaaatcactta |
22829613 |
T |
 |
| Q |
137 |
gcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctca |
236 |
Q |
| |
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|| ||| ||||||| ||||||| || | | |||||||| ||||||| || |||| | || || ||||||||| |||||||||| |||| | |
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| T |
22829612 |
acaacaattacatcaatggaacatgaaactcaacataattcaacctcaacatatcacaattga-catttagagcataatatgacatatatcattttcata |
22829514 |
T |
 |
| Q |
237 |
tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttg |
336 |
Q |
| |
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| |||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | || |
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| T |
22829513 |
tgctttgaccattcaatttcactaacaacaaatcaattatcaccagtttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatg |
22829414 |
T |
 |
| Q |
337 |
aacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta |
436 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22829413 |
aataattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcactaaa--tgattatgatgaattctaacccccttactttagtta |
22829316 |
T |
 |
| Q |
437 |
ggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22829315 |
gatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggatccttcctcttcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Original strand, 27674755 - 27675238
Alignment:
| Q |
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135 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
27674755 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaa-aaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactt |
27674853 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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| || |||| ||| ||| |||||||| ||| | | |||||||| ||||||| || || | ||| || |||||| || |||||||||| || | |
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|
| T |
27674854 |
aacaacaactacaccaattgaacatgaatctcagcataattcaacctcaacatatcacaaattgacatttagagcatgatatgacatatatcatttccat |
27674953 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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| T |
27674954 |
atactttgatcattcaatttcaccaataacaaatcaattatcaccaatttcttacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacagtcat |
27675053 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
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|
| T |
27675054 |
gaacaaataatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaacgattatgataaattctaacccccttaccttaatt |
27675153 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| || | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
27675154 |
atctccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaatcttgaatcttcaagctcttcttttctctaaccc |
27675238 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13377122 - 13376663
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
|||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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13377023 |
T |
 |
| Q |
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acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
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|
| T |
13377022 |
acaacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataatt-------------------caacatataccacttcttcatacttt |
13376942 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
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| T |
13376941 |
gaacatgaaatttcaacgacaacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcatctatgaacaat |
13376842 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca |
441 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13376841 |
taatcaattactaaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc |
13376743 |
T |
 |
| Q |
442 |
attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttcttt-cctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13376742 |
aattcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctttaccaattgttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc |
13376663 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8538200 - 8537762
Alignment:
| Q |
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134 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |
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|
| T |
8538200 |
atcaacccatttttacaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct |
8538101 |
T |
 |
| Q |
135 |
tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
234 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
8538100 |
taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaattcacaatataacattttca |
8538001 |
T |
 |
| Q |
235 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt |
334 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
8538000 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8537901 |
T |
 |
| Q |
335 |
tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8537900 |
tgaacgaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
8537803 |
T |
 |
| Q |
433 |
gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8537802 |
gttagcacaaat-cctagcccaagcttcactttaactcctag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8603439 - 8603001
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |
|
|
| T |
8603439 |
atcaacccatttttacaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct |
8603340 |
T |
 |
| Q |
135 |
tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct |
234 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
8603339 |
taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaattcacaatataacattttca |
8603240 |
T |
 |
| Q |
235 |
catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt |
334 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
8603239 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8603140 |
T |
 |
| Q |
335 |
tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8603139 |
tgaacgaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
8603042 |
T |
 |
| Q |
433 |
gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8603041 |
gttagcacaaat-cctagcccaagcttcactttaactcctag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 474
Target Start/End: Original strand, 52400591 - 52401026
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| Q |
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acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
137 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||| || || |
|
|
| T |
52400591 |
acccattttcacaaaatcaaccacaacaacttatttcacatcaccaactcatgatttatgaacatttacgctatgaatcatcaacaacaacatctctcag |
52400690 |
T |
 |
| Q |
138 |
cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat |
237 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
52400691 |
caacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttcacat |
52400790 |
T |
 |
| Q |
238 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga |
337 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |
|
|
| T |
52400791 |
actatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaactatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaaagtcaacaactatga |
52400890 |
T |
 |
| Q |
338 |
acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagtt |
435 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
52400891 |
acaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaaccctcttaccttagtt |
52400988 |
T |
 |
| Q |
436 |
aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
|| || | |||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
52400989 |
agcaaaaat-cctagcccaagcttcaatttagctcctag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 49997548 - 49997133
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactta-gcagcaacaacatcaactga |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| | | |
|
|
| T |
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caacaacaacttatttctcatcaacaac-catgatttatgaacaccaaatccatgaatgatcaacaacaatatctcttaagcaacaacaacatcagttaa |
49997450 |
T |
 |
| Q |
157 |
acatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
|
||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| | |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| |
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|
| T |
49997449 |
acatgattctcaccttaattcaacaacaacatagcacaattcaaaatttagagtacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc |
49997350 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||| |
|
|
| T |
49997349 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatcatgaacaaataatcacttattca |
49997250 |
T |
 |
| Q |
357 |
attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatg-atgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccca |
454 |
Q |
| |
|
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|
| T |
49997249 |
attaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgtttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctagctca |
49997153 |
T |
 |
| Q |
455 |
aacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
49997152 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40436560 - 40436261
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
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|
| T |
40436560 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
40436461 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
40436460 |
ttaaaaacaacaacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
40436361 |
T |
 |
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234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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|||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |
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|
| T |
40436360 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact |
40436261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5768436 - 5768125
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157 |
Q |
| |
|
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| T |
5768436 |
caacaacaacttatttcacatcacaaactcataatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
5768337 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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|||| |||| | |||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| |
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| T |
5768336 |
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5768237 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || | || |||||| ||| ||| |
|
|
| T |
5768236 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattca |
5768137 |
T |
 |
| Q |
357 |
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368 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
5768136 |
attaagcactta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 33397308 - 33397598
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35 |
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133 |
Q |
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33397308 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaaccacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacacaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
33397407 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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||| || |||||| ||||| | |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||| |
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| T |
33397408 |
ttaacaacaacaagatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatattattttc |
33397507 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
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33397508 |
acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaactcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
33397598 |
T |
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Target: chr1; HSP #23
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Target Start/End: Complemental strand, 27330001 - 27329654
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178 |
Q |
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|
|||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |||| |||| |||||| | |
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|
| T |
27330001 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
27329902 |
T |
 |
| Q |
179 |
acaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatc |
277 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27329901 |
acaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatc |
27329803 |
T |
 |
| Q |
278 |
accaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
| || ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |
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|
| T |
27329802 |
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27329714 |
T |
 |
| Q |
378 |
caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27329713 |
taattgaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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T |
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Target: chr1; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 21718206 - 21718583
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
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|
| T |
21718206 |
caccaacaacatctcatttctcaagaacaac-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
21718304 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
21718305 |
gatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
21718403 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
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| T |
21718404 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca |
21718503 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatattgaattctaa-tcccttaccttagttag |
21718583 |
T |
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142 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41229221 |
attttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaaca |
41229122 |
T |
 |
| Q |
143 |
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168 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
41229121 |
acaacatcaattgaacatgattctta |
41229096 |
T |
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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
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Target Start/End: Original strand, 25093922 - 25094105
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240 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
25093922 |
caacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagaacacaattcacaatatatcattttctcatatt |
25094021 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
25094022 |
atggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
25094105 |
T |
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
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|
| T |
35054736 |
caacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat |
35054835 |
T |
 |
| Q |
158 |
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256 |
Q |
| |
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|||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
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| T |
35054836 |
catgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
35054934 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc |
355 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||| | || | ||||||||||| | ||| || | |
|
|
| T |
35054935 |
actaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaattcaccc |
35055034 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || |||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 9784245 - 9783958
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239 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac |
339 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | || | ||||| |
|
|
| T |
9784149 |
tttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaac |
9784050 |
T |
 |
| Q |
340 |
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433 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatttatcaattcacccaattaagcactt-ttcataccaataattgaaaa-ttgcagt--aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
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Target Start/End: Complemental strand, 22403379 - 22402998
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| || | |
|
|
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22403281 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaa |
252 |
Q |
| |
|
| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
22403280 |
aatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
22403182 |
T |
 |
| Q |
253 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt- |
351 |
Q |
| |
|
|| || |||| ||||| |||||| || ||||| || | |||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
22403181 |
ttcaactaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc |
22403083 |
T |
 |
| Q |
352 |
actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
35522588 |
caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaatt |
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T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt |
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T |
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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 520
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358 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||| |
|
|
| T |
35522417 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaat |
35522318 |
T |
 |
| Q |
359 |
taagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaa |
456 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||| | |
|
|
| T |
35522317 |
taagccctt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaatctccttagcttagg |
35522222 |
T |
 |
| Q |
457 |
cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||| | ||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522221 |
cttcaattttgctccta-gctctcttcaccccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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T |
 |
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||| | || |||| |||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
49967628 |
caccaacaacatctcattcctcaacaacaac-catgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
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T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| | ||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
49967727 |
gatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaat |
49967825 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
49967826 |
tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattca |
49967925 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| || | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967926 |
tccaattaagcactt-ttcatgcaaataattgaaaatt---acaataagtgattacgatgaattctaacccccttaccttagt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
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Q |
| |
|
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|
| T |
20194140 |
aattcaacaattagagcacaattcacaatatacccattatcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatatac |
20194239 |
T |
 |
| Q |
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tc-aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcata |
374 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | | || |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20194240 |
tcaaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcatttattcaaataagcacttatgcata |
20194323 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21650329 - 21650167
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || | || || |
|
|
| T |
21650329 |
atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaaca |
21650231 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | || |||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
21650230 |
acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
21650167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 425
Target Start/End: Original strand, 41212046 - 41212415
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55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac- |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |||| |
|
|
| T |
41212046 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca |
41212145 |
T |
 |
| Q |
154 |
--tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaa |
251 |
Q |
| |
|
||| |||| | || |||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||||| || ||| ||| | ||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41212146 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattc-actaattgagcatatttttacacatacccatttttcatactttgaacataca |
41212244 |
T |
 |
| Q |
252 |
atttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-att |
350 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41212245 |
gttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt |
41212344 |
T |
 |
| Q |
351 |
tactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccct |
425 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41212345 |
catccaattaaacactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaaccccct |
41212415 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 76606 - 76480
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| Q |
92 |
attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagc |
191 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | || | |||||| ||||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76606 |
attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataataacaacaatatcaattaaacatgaatctcaccgcatttcaacaacaacatagc |
76507 |
T |
 |
| Q |
192 |
ataattcaacaatttgagcataattca |
218 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
76506 |
acaattcaacaattagagcacaattca |
76480 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Original strand, 20445704 - 20445925
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| Q |
102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||||||| ||| || | || || |||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
| T |
20445704 |
cccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
20445803 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
20445804 |
aatt-gagcacaattttcaccacttatcatttgttcctactt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
20445900 |
T |
 |
| Q |
300 |
tatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
20445901 |
tatcatcacaattggagcacgaatt |
20445925 |
T |
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Target: chr1; HSP #38
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| Q |
49 |
caaaatcaccaacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac |
147 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||||| |
|
|
| T |
9784377 |
caaaaacatcaacaacaactcattttctcaccttcaaatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaac |
9784278 |
T |
 |
| Q |
148 |
atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacat |
188 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784277 |
atcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaacaacat |
9784237 |
T |
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Target: chr1; HSP #39
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Target Start/End: Original strand, 22366970 - 22367089
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| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac |
128 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
22366970 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaat |
22367069 |
T |
 |
| Q |
129 |
atcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
|| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
22367070 |
atgactaaacaacaacaaca |
22367089 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15861728 - 15861630
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| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa |
127 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
15861728 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaa |
15861630 |
T |
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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 17148534 - 17148642
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
17148534 |
atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca |
17148632 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
17148633 |
acaacatcaa |
17148642 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 434
Target Start/End: Original strand, 20346345 - 20346378
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| Q |
401 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20346345 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
20346378 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37844549 - 37844473
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| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca |
318 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
37844549 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagca |
37844473 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 41394385 - 41394468
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
41394385 |
tttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaattt-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt |
41394468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9783904 - 9783872
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| Q |
488 |
cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9783904 |
cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
9783872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 43 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76652
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
77129 |
atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaaca |
77030 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77029 |
acaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataattcaacatatatcactttctcatacttt |
76930 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | || || |||||||| |
|
|
| T |
76929 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaacaat |
76830 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagtta-ggtc |
440 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
76829 |
tactcaattactcaattaagtacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcagc |
76731 |
T |
 |
| Q |
441 |
aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttcttt-cctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
76730 |
aatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctttaccaattgttgtatcttcaagctcttcttctctctaacc |
76652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2134
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| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
2607 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac |
2508 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
2507 |
ttaggaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatgtcactttc |
2408 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| || | |
|
|
| T |
2407 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataatt |
2308 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2307 |
atgattaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaatt-aaaaattgcact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
2210 |
T |
 |
| Q |
434 |
ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctctt |
509 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || || ||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2209 |
ttagatcaattctcttgctcaagcttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctctt |
2134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 44087 - 43622
Alignment:
| Q |
36 |
tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44087 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt |
43988 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43987 |
agcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaatttgacatttagaacccaattcaacatatatcactttcat |
43888 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
43887 |
atcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactat |
43788 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
43787 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
43690 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43689 |
tagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttaaatcttcaag |
43622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23963 - 23525
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||| ||| || ||||| |||| || |||| | ||||||||||||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
23963 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttttcatcatcaaattatgatatacgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatattcc |
23864 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
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23764 |
T |
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234 |
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333 |
Q |
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23664 |
T |
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334 |
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432 |
Q |
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23566 |
T |
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433 |
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474 |
Q |
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T |
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Target: scaffold0009 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
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Target Start/End: Original strand, 69415 - 69880
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135 |
Q |
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| T |
69415 |
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69514 |
T |
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| Q |
136 |
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235 |
Q |
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69515 |
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69614 |
T |
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335 |
Q |
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| T |
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69714 |
T |
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434 |
Q |
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| T |
69715 |
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69812 |
T |
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| Q |
435 |
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501 |
Q |
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| T |
69813 |
tagcacaaattcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
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T |
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Target: scaffold0162 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 43 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 6835
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Q |
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| T |
7307 |
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7208 |
T |
 |
| Q |
143 |
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242 |
Q |
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7207 |
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7108 |
T |
 |
| Q |
243 |
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342 |
Q |
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| T |
7107 |
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7008 |
T |
 |
| Q |
343 |
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441 |
Q |
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| T |
7007 |
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6909 |
T |
 |
| Q |
442 |
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513 |
Q |
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| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |
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| T |
6908 |
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T |
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Target: scaffold0162; HSP #2
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184 |
Q |
| |
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|
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| T |
8415 |
cccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaaca |
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T |
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157 |
Q |
| |
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||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |
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| T |
11730 |
caacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcat-aacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattgaa |
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T |
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Target: scaffold0162; HSP #4
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324 |
Q |
| |
|
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T |
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Target: scaffold0700 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
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Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
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Target Start/End: Original strand, 2483 - 2948
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135 |
Q |
| |
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| T |
2483 |
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2582 |
T |
 |
| Q |
136 |
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235 |
Q |
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| T |
2583 |
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2682 |
T |
 |
| Q |
236 |
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335 |
Q |
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| T |
2683 |
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2782 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
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| T |
2783 |
gaacaattaatcacttactgaattaatcatctaatcttacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccgcttaccttagt |
2880 |
T |
 |
| Q |
435 |
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501 |
Q |
| |
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||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2881 |
tagcaaaaattcctagctcaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
2948 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
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Target Start/End: Original strand, 30978 - 31415
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135 |
Q |
| |
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| T |
30978 |
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31077 |
T |
 |
| Q |
136 |
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235 |
Q |
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| T |
31078 |
agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcataattcaacatataacactttcac |
31177 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
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||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
31178 |
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31277 |
T |
 |
| Q |
336 |
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434 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31278 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
31375 |
T |
 |
| Q |
435 |
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474 |
Q |
| |
|
||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31376 |
tagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctag |
31415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
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Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
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Target Start/End: Complemental strand, 33996 - 33534
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
33996 |
accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
33898 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
| |
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| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |
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| T |
33897 |
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33798 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33797 |
cactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc |
33698 |
T |
 |
| Q |
356 |
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455 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |
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|
| T |
33697 |
aattaagcatttattcatacaacaattg-aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaa |
33599 |
T |
 |
| Q |
456 |
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520 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33598 |
gcttcaatttagctcatagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
33534 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
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Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
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Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
270 |
acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagc |
369 |
T |
 |
| Q |
139 |
agcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcata |
238 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
370 |
aacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaacata--------------- |
454 |
T |
 |
| Q |
239 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaa |
338 |
Q |
| |
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| T |
455 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattataggacgaattataacaactt-gaa |
553 |
T |
 |
| Q |
339 |
caattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
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|
| T |
554 |
caattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattcaattctaacccccttaccataattat |
653 |
T |
 |
| Q |
438 |
gtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttc |
504 |
Q |
| |
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| | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||| |
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| T |
654 |
cactaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttctagttc |
721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0521 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:
Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Original strand, 11074 - 11534
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
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Q |
| |
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| T |
11074 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaa |
11173 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
| |
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| T |
11174 |
catggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcataattcaacatatatcactttcacacactttgaacatgaaatttca |
11273 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca-caaattataacaactttgaacaattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
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| T |
11274 |
caaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggaacatgaatttttaacaattatgaacaattaatcatctactca |
11373 |
T |
 |
| Q |
357 |
attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa |
456 |
Q |
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| T |
11374 |
attaagcacttattcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattataa-ccccttaccttagttagattaattccctagctctag |
11470 |
T |
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457 |
cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11471 |
cttcactttacctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc |
11534 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0025
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Target: scaffold0025; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 53305 - 53699
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135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
53305 |
tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacgtcaattctcatcatcaaatcatgattaatga-ctcccaagccatgaatcattaacaacaatgtcactt |
53403 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
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|||| |||||||||| | |||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| | |
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| T |
53404 |
agcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataattcaacatataacaccttcac |
53503 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
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| T |
53504 |
atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactat |
53603 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
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53604 |
gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
53699 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
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Target Start/End: Original strand, 85489 - 85834
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35 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| | |
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| T |
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atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacctatttttcatcaacaaaccatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctc |
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T |
 |
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134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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|||||| |||||| |||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |
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| T |
85589 |
ttagcaacaacaatatcacttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcattaatttgagcataattcacaatatatcattttc |
85688 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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|
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| T |
85689 |
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85787 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaa |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
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85788 |
atgaacaattaatcacttattcaattaagcatttaaacatacaacaa |
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T |
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Target: scaffold0025; HSP #3
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
146581 |
caacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
146680 |
T |
 |
| Q |
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catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
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|
| T |
146681 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
146779 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattat |
276 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||| |
|
|
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146780 |
actaacaacagttcaattat |
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T |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #5
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| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
9013 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca |
9078 |
T |
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Target: scaffold0006 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
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Target Start/End: Complemental strand, 197545 - 197078
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132 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
197545 |
tcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaattctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatca |
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T |
 |
| Q |
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cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt |
232 |
Q |
| |
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|
|
| T |
197445 |
cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataattcaacttataacacttt |
197346 |
T |
 |
| Q |
233 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaac |
332 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| | |
|
|
| T |
197345 |
cacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatc |
197246 |
T |
 |
| Q |
333 |
tttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctt |
431 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197245 |
taagaacaattaatcacttatccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt |
197148 |
T |
 |
| Q |
432 |
agttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aattagcacaatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag |
197078 |
T |
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Target: scaffold0031 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
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Target Start/End: Complemental strand, 97487 - 97023
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135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||| || |
|
|
| T |
97487 |
tcaacccattttacaaaaccaataacaacaactcaattcttatcatcaaatcatgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaatt |
97388 |
T |
 |
| Q |
136 |
agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc |
235 |
Q |
| |
|
|| | |||||| ||||| |||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
97387 |
agtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac |
97288 |
T |
 |
| Q |
236 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
335 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
97287 |
atactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaactat |
97188 |
T |
 |
| Q |
336 |
gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
97187 |
gaacaattaatcactcactcaattaaacactaaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttcat |
97090 |
T |
 |
| Q |
435 |
taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag |
501 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
97089 |
tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttacctcctacgatctctaccatttcttgaatcttcaag |
97023 |
T |
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Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 437
Target Start/End: Original strand, 31010 - 31402
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143 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||| || | ||| ||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
31010 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaa |
31109 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |
|
|
| T |
31110 |
caacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactaca-aacataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccattttcttatacttt |
31208 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| || || | ||||||| |
|
|
| T |
31209 |
gaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaaa |
31307 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa--cccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31308 |
taatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgca--atgaatgattatgatgaattctaacccccccttaccttagttag |
31402 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 70657 - 70969
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220 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||||| |
|
|
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70657 |
caacaacatcatatatcagcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaac |
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T |
 |
| Q |
221 |
atatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcaca |
320 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70757 |
atattccattttctcatactttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacg |
70855 |
T |
 |
| Q |
321 |
aattataacaactttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa |
419 |
Q |
| |
|
|||| | || | | ||| ||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70856 |
aatttcatcatttataaactattaattaattcacccaattaagcactt-ttcatacaataactgaaaatt---acaataaatgattatgatgaattctaa |
70951 |
T |
 |
| Q |
420 |
cccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cccccttaccttagttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
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Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
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Target Start/End: Original strand, 7994 - 8451
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
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aacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg |
8093 |
T |
 |
| Q |
162 |
tttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaa |
261 |
Q |
| |
|
|||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
8094 |
gttctcatcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcataaatcataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattcaccaa |
8193 |
T |
 |
| Q |
262 |
caacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaa |
361 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8194 |
caacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaa |
8293 |
T |
 |
| Q |
362 |
gcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag--gtcaattccctagcccaaactt |
459 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8294 |
tcacttattcatacaataattgaaaaattaca-ttaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaggttgtagttaat--cttaacccaagctt |
8390 |
T |
 |
| Q |
460 |
cactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8391 |
cactttagctcctagctctcttccaatccttgaatattcaagttcctcttctctctaaccc |
8451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 355 - 520
Target Start/End: Original strand, 11153 - 11317
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| | || || |
|
|
| T |
11153 |
caattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacattaaaa-tgattatgatgacttctaacccccttaccttaggttg--taattaatcttaacc |
11249 |
T |
 |
| Q |
453 |
caaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11250 |
caagcttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
11317 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0032 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
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Target: scaffold0032; HSP #1
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| |
|
|||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
|
|
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104889 |
caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt-aa |
104791 |
T |
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| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
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|||| || | | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || || || |||||||||||| || || |||| |
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| T |
104790 |
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104691 |
T |
 |
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258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
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| T |
104690 |
ccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatctatgaacaattaatcacttactcaa |
104591 |
T |
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| Q |
358 |
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457 |
Q |
| |
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| T |
104590 |
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104493 |
T |
 |
| Q |
458 |
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501 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
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| T |
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ttcactttagctcctagtatcctcacctcttcttgaatcttcaag |
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T |
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Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
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Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93726
Alignment:
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
94061 |
tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcactt |
93962 |
T |
 |
| Q |
136 |
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235 |
Q |
| |
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| | ||||||||||| |||||||| | | | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |
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| T |
93961 |
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93863 |
T |
 |
| Q |
236 |
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334 |
Q |
| |
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| T |
93862 |
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93763 |
T |
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| Q |
335 |
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371 |
Q |
| |
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| T |
93762 |
tgaacaattaataatttacccaattaagcacttattc |
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T |
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Target: scaffold0032; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 93689 - 93657
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488 |
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520 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
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Target Start/End: Original strand, 3297 - 3760
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Q |
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| T |
3297 |
accaactacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattg |
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T |
 |
| Q |
156 |
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255 |
Q |
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| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
3397 |
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3496 |
T |
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| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc |
355 |
Q |
| |
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| | ||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |
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| T |
3497 |
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3596 |
T |
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| Q |
356 |
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454 |
Q |
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| T |
3597 |
aattaagcacttattcatacaataattgtaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctatctta |
3694 |
T |
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| Q |
455 |
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520 |
Q |
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| T |
3695 |
agcttcaatttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctcactaaccc |
3760 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1790 - 1352
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180 |
Q |
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| T |
1790 |
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1691 |
T |
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| Q |
181 |
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280 |
Q |
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| T |
1690 |
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1591 |
T |
 |
| Q |
281 |
aatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaa |
380 |
Q |
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| T |
1590 |
aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataa |
1491 |
T |
 |
| Q |
381 |
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480 |
Q |
| |
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| T |
1490 |
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1392 |
T |
 |
| Q |
481 |
tcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
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| T |
1391 |
tccaatccttgaatcttcaagctcctcttctccctaaccc |
1352 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8935 - 8497
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180 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8935 |
caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagcatggttctcatcataattcaac |
8836 |
T |
 |
| Q |
181 |
aacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcacc |
280 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8835 |
aacaacatagcataattcacccatttgaacataattcataaattagcatttatacatacttttaacaagcaaattcaccaacaacaattcaattatcact |
8736 |
T |
 |
| Q |
281 |
aatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaa |
380 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
8735 |
aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataa |
8636 |
T |
 |
| Q |
381 |
ttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctt |
480 |
Q |
| |
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| T |
8635 |
ttgaaaatttacact-aaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttagatagattaattccctagctcaagcttcactttagctcctagctctct |
8537 |
T |
 |
| Q |
481 |
tcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8536 |
tccaatccttgaatcttcaagctcctcttctccctaaccc |
8497 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
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Target Start/End: Complemental strand, 1502 - 1154
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270 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1502 |
acaatccaacagtaacatagcacaatacaacatttagagcatgattcatcatatatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatcc |
1403 |
T |
 |
| Q |
271 |
aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatt |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1402 |
aattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttatt |
1303 |
T |
 |
| Q |
371 |
catacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc |
470 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1302 |
catacaataattgaaaaattacact-aatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagattaattccctagatcaagcttcactttagctc |
1204 |
T |
 |
| Q |
471 |
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520 |
Q |
| |
|
|||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1203 |
ctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctcctcttctctgtaaccc |
1154 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 171 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9757 - 9409
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270 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9757 |
acaatccaacagtaacatagcacaatacaacatttagagcatgattcatcatatatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatcc |
9658 |
T |
 |
| Q |
271 |
aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatt |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9657 |
aattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttatt |
9558 |
T |
 |
| Q |
371 |
catacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc |
470 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
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| T |
9557 |
catacaataattgaaaaattacact-aatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagattaattccctagatcaagcttcactttagctc |
9459 |
T |
 |
| Q |
471 |
ctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
|||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9458 |
ctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctcctcttctctgtaaccc |
9409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
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Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
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Target Start/End: Complemental strand, 9152 - 8771
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154 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
9152 |
caccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt |
9053 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
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|
|
| T |
9052 |
gatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatatcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaatt |
8953 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac |
353 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| |||| | |
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| T |
8952 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttc |
8853 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8852 |
ccaattaagcacttattcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttaccttagttag |
8771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 55 - 434
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
5516 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
5417 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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|| |||| | || |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||| || || ||| | | |||| | |||||||||||| ||| |
|
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| T |
5416 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaa-ttgagcatattttcgcacatacctattttcatacactttgaacatgtaat |
5318 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
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| || ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
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| T |
5317 |
tcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
5219 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5218 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt----agaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
5141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 58 - 433
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79892
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157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
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| T |
79519 |
caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
79618 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
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| T |
79619 |
catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttca |
79718 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
79719 |
ccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaacaattaatcatttatccaa |
79818 |
T |
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| Q |
358 |
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433 |
Q |
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|
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| T |
79819 |
ttaatcacttattcatacaataattgaaaaattacact-aaaataattatgatgaattctaa-ccccttaccttag |
79892 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 130486 - 130684
Alignment:
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8 |
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106 |
Q |
| |
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| T |
130486 |
acatcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa |
130584 |
T |
 |
| Q |
107 |
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205 |
Q |
| |
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||||| | |||| | ||||||||| || | || |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
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| T |
130585 |
gccataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
130684 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 89554 - 89471
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240 |
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324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
89554 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatt |
89471 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 519
Target Start/End: Original strand, 10642 - 11101
Alignment:
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58 |
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157 |
Q |
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| T |
10642 |
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10741 |
T |
 |
| Q |
158 |
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257 |
Q |
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| T |
10742 |
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10841 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
10842 |
ccgacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattatttatccaa |
10941 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac |
457 |
Q |
| |
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| T |
10942 |
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11039 |
T |
 |
| Q |
458 |
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519 |
Q |
| |
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| T |
11040 |
ttcacttttgctccta-gctctctcccaatctttgatccttcaagttcctcttctctctaacc |
11101 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0151 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:
Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22713 - 22246
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133 |
Q |
| |
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|
| T |
22713 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcataattcatgaacacccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaa |
22614 |
T |
 |
| Q |
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ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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| T |
22613 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaattcaataatttgagcataattcataagttagcatttat |
22514 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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|
| T |
22513 |
acatattttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaact |
22414 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
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|
| T |
22413 |
atgaacaattattcacttattctattaagcatttattaatacaacaaatgagaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
22316 |
T |
 |
| Q |
433 |
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501 |
Q |
| |
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||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22315 |
gttagcagttaat--cctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag |
22246 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 6500 - 6939
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6500 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatctc |
6599 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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|
| T |
6600 |
ttagcaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagtataactcacaatatatcattttc |
6699 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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|
| T |
6700 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaattccatgtatttaaacatatcaccataattagaacacaaatttcatcaact |
6799 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6800 |
atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacac-ctaattggttatggttaaattctaacccccttacctta |
6898 |
T |
 |
| Q |
433 |
gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6899 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15278
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269 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||| | | ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||| |
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|
| T |
15625 |
acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccatttttttatactttgaacatacaattcaactaacaacaatt |
15527 |
T |
 |
| Q |
270 |
caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatcatttactc-aattaagcactt |
367 |
Q |
| |
|
||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
15526 |
caattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatt-tcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt |
15428 |
T |
 |
| Q |
368 |
attcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcacttta |
466 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15427 |
at-catacaaataatttaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcactttt |
15333 |
T |
 |
| Q |
467 |
gctcctaggttctttcctcttcttgaa-tcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15332 |
gctcctatgattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
15278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37013 - 36930
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
37013 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
36930 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 439
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21869
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
21442 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag |
21541 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
21542 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttg |
21640 |
T |
 |
| Q |
208 |
agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc |
306 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
21641 |
agcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatca-taacttcatacatccaaacatgtcatc |
21739 |
T |
 |
| Q |
307 |
ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatt |
405 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || | || ||||||| |
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|
| T |
21740 |
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21835 |
T |
 |
| Q |
406 |
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439 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21836 |
atgatgaattataacccccttaccttagttaggt |
21869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 439
Target Start/End: Original strand, 31141 - 31568
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8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
31141 |
acatcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag |
31240 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31241 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaa-ttg |
31339 |
T |
 |
| Q |
208 |
agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc |
306 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
31340 |
agcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattatca-taacttcatacatccaaacatgtcatc |
31438 |
T |
 |
| Q |
307 |
ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatt |
405 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31439 |
ataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgatt |
31534 |
T |
 |
| Q |
406 |
atgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31535 |
atgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
31568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 47539 - 47438
Alignment:
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335 |
tgaacaattaatcattta-ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47539 |
tgaacaattaatcaattcgcccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
47444 |
T |
 |
| Q |
434 |
ttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
47443 |
ttaggt |
47438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 177 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 116700 - 116363
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| Q |
177 |
caacaacaacatagcataattcaacaatttgagca-taattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatta |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |
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|
| T |
116700 |
caacaacaacat--cataaatcatccatttgagcaatatttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaa----acccaca-caattcaatta |
116608 |
T |
 |
| Q |
276 |
tcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatac |
375 |
Q |
| |
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||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
116607 |
tcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgagcaattaataatttactcaattaagcacttattcatac |
116508 |
T |
 |
| Q |
376 |
aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg |
475 |
Q |
| |
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||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
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| T |
116507 |
aaccattcaaaatttacactaaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctagg |
116408 |
T |
 |
| Q |
476 |
ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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|
|
| T |
116407 |
atctctccaattattgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc |
116363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 116795 - 116687
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
116795 |
attttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca |
116696 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatca |
151 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
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| T |
116695 |
acaacatca |
116687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 164192 - 164567
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
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| T |
164192 |
caccaacaccatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacattt |
164291 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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| T |
164292 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatatcttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
164390 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
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| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | || | |||| ||||||||| || |
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| T |
164391 |
tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaaaattaatcaattca |
164489 |
T |
 |
| Q |
354 |
tc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164490 |
tccaattaagcacttac-catacaattaattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
164567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 162469 - 162401
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat |
111 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
162469 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
162401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 166547 - 166463
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa |
127 |
Q |
| |
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|
|
| T |
166547 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaa |
166463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 11664 - 12130
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11664 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatcaatt |
11763 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcat-aattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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|
| T |
11764 |
gatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacatgaaat |
11863 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || | | || | ||||||||||||| ||| | |
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|
| T |
11864 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatcaattga |
11963 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc |
451 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
11964 |
cccaattaagcacttattcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttaccttagttagattaatctccctagc |
12061 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| ||||||| | | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12062 |
ttaggcttcaatttaactcctagctcttctccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
12130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 223 - 520
Target Start/End: Original strand, 16044 - 16342
Alignment:
| Q |
223 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16044 |
atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgga |
16143 |
T |
 |
| Q |
323 |
ttataacaactttgaacaa-ttaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac |
420 |
Q |
| |
|
|| | || | ||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16144 |
tttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaac |
16241 |
T |
 |
| Q |
421 |
ccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16242 |
ccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctattctctctaacc |
16341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 223 - 520
Target Start/End: Original strand, 25575 - 25873
Alignment:
| Q |
223 |
atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25575 |
atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacatgtcatcataattagagcacgga |
25674 |
T |
 |
| Q |
323 |
ttataacaactttgaacaa-ttaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac |
420 |
Q |
| |
|
|| | || | ||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25675 |
tttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaac |
25772 |
T |
 |
| Q |
421 |
ccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc |
519 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25773 |
ccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctattctctctaacc |
25872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 132520 - 132137
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| | |
|
|
| T |
132520 |
caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt |
132421 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
132420 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatataat |
132322 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
132321 |
tcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
132222 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcata-caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| || || | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
132221 |
cccaattaagcactt-ttcatagaaataattgaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattccaacccccttaccttagttaggt |
132137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 431
Target Start/End: Original strand, 88323 - 88626
Alignment:
| Q |
126 |
aacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatat |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || ||||||| | ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| || |
|
|
| T |
88323 |
aacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgatcatattttcaacacat |
88421 |
T |
 |
| Q |
225 |
atcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
| | ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||| || ||||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
88422 |
acccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacattttaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatt |
88521 |
T |
 |
| Q |
325 |
ataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccc |
422 |
Q |
| |
|
| || | || |||||||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
88522 |
tcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaaacactt-ttcatacaaataattgaaaat---agcaataagtgattatgatgaattctaaccc |
88617 |
T |
 |
| Q |
423 |
ccttacctt |
431 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
88618 |
ccttacctt |
88626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 62 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22681 - 22235
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| Q |
62 |
aacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatg |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| | |
|
|
| T |
22681 |
aacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacat-----------g |
22593 |
T |
 |
| Q |
162 |
tttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaa |
261 |
Q |
| |
|
|||| | | |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
22592 |
gttctcatcataattcaacaacaacttagcataattcacccaattgagcataattcacaagttaacacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaa |
22493 |
T |
 |
| Q |
262 |
caacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaa |
361 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| | | ||||||| |
|
|
| T |
22492 |
caacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaatcaatcaatcatccaattaa |
22393 |
T |
 |
| Q |
362 |
gcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttca |
461 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
22392 |
tcacttattcatacaataattaaaaaataacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctacctcaagcttca |
22294 |
T |
 |
| Q |
462 |
ctttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22293 |
ctttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctcctctcctctctaaccc |
22235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27857
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
27453 |
atcaacccatttttacaaaaccgacaacaacaactcatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
27552 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
|
||| || ||||| |||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
27553 |
ttaacaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagggcacaattcacaatatatcattttc |
27652 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27653 |
acatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact |
27752 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct |
430 |
Q |
| |
|
||| | || |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27753 |
atgagcaaaataatcatttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaaatctaacccccttacct |
27850 |
T |
 |
| Q |
431 |
tagttag |
437 |
Q |
| |
|
|| |||| |
|
|
| T |
27851 |
taattag |
27857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 86313 - 86648
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
86313 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
86412 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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|
| T |
86413 |
ttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattatcatcacaattgaactataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataacattttc |
86512 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
86513 |
acatactatgaacatccaatttcaccaacaaaaattcaattatcacaaatttcatgtactcaaacatatcaacataacaagagcacggatttcaacaact |
86612 |
T |
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| Q |
334 |
ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
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|| | || |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
86613 |
aagagcaaaataatcacttattcaattaagcactta |
86648 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0970 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
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Target: scaffold0970; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 2411 - 2795
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35 |
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133 |
Q |
| |
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| T |
2411 |
atcaacctattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac |
2510 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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| T |
2511 |
ttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataaattatcatttagagcataatataacatatatcattttc |
2610 |
T |
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| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
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| T |
2611 |
atacactttgatcattcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacatacaaacataccatcataataggagcacgaattctaataatc |
2710 |
T |
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| Q |
334 |
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417 |
Q |
| |
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| T |
2711 |
atgaccaattaatcaattactcaataaagcacttactcatacaacaattgaaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattct |
2795 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0670 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:
Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7966 - 7622
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
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| T |
7966 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc |
7867 |
T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
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| T |
7866 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc |
7767 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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| T |
7766 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtagtcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact |
7667 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
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|||| || |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |
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|
| T |
7666 |
aagaacaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaa |
7622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0193 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:
Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Original strand, 4585 - 4999
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| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
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| T |
4585 |
caacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaa |
4684 |
T |
 |
| Q |
158 |
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257 |
Q |
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| T |
4685 |
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4784 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa |
357 |
Q |
| |
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| T |
4785 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcagttattcaa |
4883 |
T |
 |
| Q |
358 |
ttaagcacttattcatacaacaattgaaaattta-cactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa |
455 |
Q |
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| T |
4884 |
ctaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaat-cctagcccaa |
4980 |
T |
 |
| Q |
456 |
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474 |
Q |
| |
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||||| ||||| |||||| |
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| T |
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gcttcaatttagatcctag |
4999 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 33640 - 34103
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Q |
| |
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|
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| T |
33640 |
accaacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg |
33739 |
T |
 |
| Q |
156 |
aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
254 |
Q |
| |
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| T |
33740 |
atcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaatt |
33838 |
T |
 |
| Q |
255 |
tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac |
353 |
Q |
| |
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| T |
33839 |
caactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcat |
33938 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcc |
452 |
Q |
| |
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| T |
33939 |
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34035 |
T |
 |
| Q |
453 |
caaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
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| ||||| |||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
34036 |
taggcttcaatttagctcctagctttcccccaatccttgattcttcaagttccttttctctctaaccc |
34103 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0598 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:
Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Original strand, 3232 - 3647
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
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| T |
3232 |
caacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
3331 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca |
257 |
Q |
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| T |
3332 |
catgatt-tcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcccaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca |
3430 |
T |
 |
| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca |
356 |
Q |
| |
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| T |
3431 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagcgcacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattca |
3530 |
T |
 |
| Q |
357 |
attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccca |
454 |
Q |
| |
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|
| T |
3531 |
attaagcacttaagcatgaaattagggaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaacccccttgccttaattagctcaaat-cctagccca |
3627 |
T |
 |
| Q |
455 |
aacttcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
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| |||||||||| ||||||| |
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| T |
3628 |
agcttcactttaactcctag |
3647 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 70569 - 70116
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161 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
70569 |
aacaacccatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatg |
70470 |
T |
 |
| Q |
162 |
tttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaa |
261 |
Q |
| |
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| || | | ||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||| | || |||| || |||||||||||| || ||||| || |
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| T |
70469 |
gtcctcatcataattcaacaacaatataacataattcacccaattgagcataattcacaagttagcactcatacacactttgaacatgcaaattcac-aa |
70371 |
T |
 |
| Q |
262 |
caacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattat-aacaactttgaacaattaatcatttactcaatta |
360 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
70370 |
caataattgaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaatttttaacatctatgaacaattaatcaattatacattta |
70271 |
T |
 |
| Q |
361 |
agcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaactt |
459 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
70270 |
atcacttattcatacaataattgaaaattt-cac-aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagctt |
70173 |
T |
 |
| Q |
460 |
cactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctcta |
516 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
70172 |
catttttgctcctagctctcttccaatccttgattcttcaagttcctctactctcta |
70116 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 159279 - 159740
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
159279 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattat---catcaacatcacttagcaacaacaacatcaatt |
159375 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
159376 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaat |
159475 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
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|
| T |
159476 |
tcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
159575 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc |
451 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
159576 |
cccaattaagcactt-ttcgtacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc |
159671 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| ||||| || | |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
159672 |
ttaggcttcaattttgctccaagctctcttccactccttgattcttcaagttccccttctctctaaccc |
159740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 85309 - 85772
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
85309 |
caccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
85408 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
85409 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaat |
85507 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||| | || | | ||||||||||| ||| | |
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|
| T |
85508 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaattaatcaattca |
85607 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc |
451 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |
|
|
| T |
85608 |
cccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaagattaatctccctagc |
85703 |
T |
 |
| Q |
452 |
ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttc-ctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||||| | || | ||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
85704 |
ttagacttcaattttgctccttgctt-tctccactccttgattcttcaagttctcccttctctctaaccc |
85772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 188 - 520
Target Start/End: Original strand, 7915 - 8246
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188 |
tagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttca |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
7915 |
tagcataattggaccaattgagcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttca |
8014 |
T |
 |
| Q |
288 |
tgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaa |
387 |
Q |
| |
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| T |
8015 |
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8114 |
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486 |
Q |
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T |
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Q |
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8213 |
ccttgaatcgtcaagttcctcttctcactaaccc |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 7812 - 7908
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7908 |
T |
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Name: scaffold0387
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Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
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Target Start/End: Complemental strand, 1213 - 818
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
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| T |
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Q |
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T |
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Name: scaffold0610
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Target: scaffold0610; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 846 - 466
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Q |
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253 |
Q |
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746 |
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648 |
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254 |
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352 |
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548 |
T |
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353 |
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437 |
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547 |
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466 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:
Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
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Target Start/End: Original strand, 1897 - 2356
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158 |
Q |
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| T |
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T |
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257 |
Q |
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| T |
1997 |
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2095 |
T |
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258 |
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356 |
Q |
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| T |
2096 |
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2195 |
T |
 |
| Q |
357 |
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455 |
Q |
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| T |
2196 |
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520 |
Q |
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| T |
2292 |
gcttcaatttagctccta-gttctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
2356 |
T |
 |
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Target: scaffold0035 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
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Target: scaffold0035; HSP #1
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154 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
155 |
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253 |
Q |
| |
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| T |
118133 |
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118035 |
T |
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352 |
Q |
| |
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| T |
118034 |
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117935 |
T |
 |
| Q |
353 |
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437 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
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Target: scaffold0035; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 109732 - 109351
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154 |
Q |
| |
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| T |
109732 |
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109633 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
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| T |
109632 |
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109534 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
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| T |
109533 |
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109434 |
T |
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353 |
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437 |
Q |
| |
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|
|
| T |
109433 |
gccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
109351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
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Target Start/End: Original strand, 75 - 498
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Q |
| |
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| T |
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207 |
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| T |
174 |
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272 |
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208 |
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306 |
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273 |
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372 |
T |
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307 |
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404 |
Q |
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373 |
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468 |
T |
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434 |
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| T |
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498 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
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Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
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Q |
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| T |
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9063 |
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253 |
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9064 |
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9162 |
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254 |
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352 |
Q |
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| T |
9163 |
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9262 |
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353 |
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450 |
Q |
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9263 |
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9358 |
T |
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451 |
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520 |
Q |
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| T |
9359 |
cttagacttcaattttgctcctagctcaaccccaattcttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
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Q |
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257 |
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| T |
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T |
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258 |
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356 |
Q |
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30242 |
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357 |
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368 |
Q |
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| T |
30243 |
attaagcactta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Original strand, 21979 - 22290
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22078 |
T |
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Q |
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22079 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcccaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
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T |
 |
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ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaattaatcatttactca |
356 |
Q |
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| T |
22179 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatactcaaacataacatcatagcaagagcacgaatttcaacaactatgagaaaaataatcacttattca |
22278 |
T |
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| Q |
357 |
attaagcactta |
368 |
Q |
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|
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| T |
22279 |
attaagcactta |
22290 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0148 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:
Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Original strand, 37538 - 37848
Alignment:
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Q |
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| T |
37538 |
caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
37637 |
T |
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| Q |
158 |
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257 |
Q |
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| T |
37638 |
catgattctcgtctcaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca |
37737 |
T |
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| Q |
258 |
ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca |
356 |
Q |
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| T |
37738 |
ccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaac-tagagcaaaataatcacttactca |
37836 |
T |
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| Q |
357 |
attaagcactta |
368 |
Q |
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| T |
37837 |
attaagcactta |
37848 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0253 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:
Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 318
Target Start/End: Original strand, 7358 - 7642
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Q |
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| T |
7358 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctc |
7457 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
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| T |
7458 |
ttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttc |
7557 |
T |
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| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca |
318 |
Q |
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| T |
7558 |
acatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagca |
7642 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 318
Target Start/End: Original strand, 16783 - 17067
Alignment:
| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
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| T |
16783 |
atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctc |
16882 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
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| T |
16883 |
ttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttc |
16982 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca |
318 |
Q |
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| T |
16983 |
acatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagca |
17067 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 4543 - 4915
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| Q |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
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| T |
4543 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
4642 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
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| T |
4643 |
aatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
4742 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc |
355 |
Q |
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| T |
4743 |
accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatcc |
4842 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
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|
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| T |
4843 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat------tacaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
4915 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 9157 - 9529
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
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| T |
9157 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
9256 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
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| T |
9257 |
aatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
9356 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc |
355 |
Q |
| |
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| T |
9357 |
accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatcc |
9456 |
T |
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| Q |
356 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
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|
|
| T |
9457 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat------tacaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
9529 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 387
Target Start/End: Original strand, 5920 - 6251
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157 |
Q |
| |
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| T |
5920 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa |
6019 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatca-ctttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
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| T |
6020 |
catgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttctcatactttgaacatgaaattc |
6119 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttact |
354 |
Q |
| |
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| T |
6120 |
taccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
6219 |
T |
 |
| Q |
355 |
caattaagcacttattcatacaacaattgaaaa |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6220 |
aaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaa |
6251 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 520
Target Start/End: Original strand, 12588 - 12710
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
12588 |
aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcctaggtctcttccactccttgattctt |
12687 |
T |
 |
| Q |
498 |
caagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12688 |
caagttccccttctctctaaccc |
12710 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0020 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:
Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Original strand, 107967 - 108369
Alignment:
| Q |
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atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
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Q |
| |
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| T |
107967 |
atcaacccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaa-aattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatc |
108065 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc |
233 |
Q |
| |
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| T |
108066 |
ttaacaacaacaacatcaattaaacatgatcttcatcacaattcaacaataaca-agcataattcaacatttagagcataattcataatataccattttc |
108164 |
T |
 |
| Q |
234 |
tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
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| T |
108165 |
acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacatgt |
108264 |
T |
 |
| Q |
334 |
ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacct |
430 |
Q |
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| T |
108265 |
aagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttacct |
108362 |
T |
 |
| Q |
431 |
tagttag |
437 |
Q |
| |
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||||||| |
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| T |
108363 |
tagttag |
108369 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 437
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10294
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ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa |
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Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||| |
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| T |
9903 |
ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaa |
10002 |
T |
 |
| Q |
144 |
caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt |
242 |
Q |
| |
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| T |
10003 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatacccttttcatactcttt |
10101 |
T |
 |
| Q |
243 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat |
342 |
Q |
| |
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| T |
10102 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat |
10201 |
T |
 |
| Q |
343 |
taatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
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|
| T |
10202 |
taatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaagaattgaaaatttgc---aataatgattattatgaattctaacccccttaccttagttag |
10294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 7151 - 7524
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156 |
Q |
| |
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| T |
7151 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattga |
7250 |
T |
 |
| Q |
157 |
acatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt |
255 |
Q |
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| T |
7251 |
aaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
7350 |
T |
 |
| Q |
256 |
caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttact |
354 |
Q |
| |
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| T |
7351 |
aaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatc |
7450 |
T |
 |
| Q |
355 |
caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
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|
| T |
7451 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat------tacaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
7524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 238 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 89950 - 89671
Alignment:
| Q |
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actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga |
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Q |
| |
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| T |
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actttgaacatacaaattcac-aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt-taacatctatga |
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T |
 |
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acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
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Q |
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| T |
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acaattaatcaattatccaattaatcacttattcatacaataattgaaaa-ttacactaaaaa-gattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
89755 |
T |
 |
| Q |
438 |
gtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggt-tctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
89754 |
attaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctctcttt-caatccttgattcttcaagttccacttctctctaaccc |
89671 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 90135 - 90037
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35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
90135 |
atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaacatca |
90037 |
T |
 |
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Target: scaffold0026; HSP #3
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
107910 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat |
107974 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
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Target Start/End: Original strand, 40662 - 41017
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82 |
caaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaaca |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| |||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
40662 |
caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaaca |
40761 |
T |
 |
| Q |
182 |
acaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcac-tttctcatactttgaacatgaaatttc-accaacaacaattcaattatcac |
279 |
Q |
| |
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| T |
40762 |
acaatatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatcca |
40860 |
T |
 |
| Q |
280 |
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378 |
Q |
| |
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|| ||||| || |||||| ||||||||||||||| || |||| | || | ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40861 |
taacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcac-tattcatacaat |
40959 |
T |
 |
| Q |
379 |
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439 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40960 |
aattaaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattataacccccttaccttagttaggt |
41017 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Original strand, 46145 - 46524
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58 |
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
46145 |
caacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgat |
46244 |
T |
 |
| Q |
158 |
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256 |
Q |
| |
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|||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
46245 |
catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttc |
46343 |
T |
 |
| Q |
257 |
-accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttact |
354 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
46344 |
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46443 |
T |
 |
| Q |
355 |
caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46444 |
caattaagcactt-ttcatacaataattaaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaattaggt |
46524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 324
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5187
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| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
4906 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca |
5005 |
T |
 |
| Q |
143 |
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241 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
5006 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctcatactg |
5104 |
T |
 |
| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5105 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatt |
5187 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34559 - 34477
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| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
34559 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
34477 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 24995 - 24616
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| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
24995 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
24896 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
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|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24895 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca |
24797 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc |
355 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||| ||| || |
|
|
| T |
24796 |
actaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacct |
24697 |
T |
 |
| Q |
356 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24696 |
aattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattt---caataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
24616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 10
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
430 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
332 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
|
| |||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| || | || |
|
|
| T |
331 |
ctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattc-acgaatta |
233 |
T |
 |
| Q |
208 |
agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc |
306 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
232 |
agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatc |
133 |
T |
 |
| Q |
307 |
ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgat |
404 |
Q |
| |
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|||| || ||||| |||| | || | | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||| |
|
|
| T |
132 |
ataaatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgat |
38 |
T |
 |
| Q |
405 |
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432 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37 |
tatgatgaacactaacccccttacctta |
10 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6603
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| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaa |
84 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
6679 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactcaattctcaacaacaa |
6603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6562 - 6304
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| Q |
171 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt |
269 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| | || || ||||||||| |
|
|
| T |
6562 |
acaattcaacaacaacaaaacataattcacgaatta-agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatc |
6464 |
T |
 |
| Q |
270 |
caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| |||| | || | |||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
6463 |
caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcactta |
6364 |
T |
 |
| Q |
369 |
ttcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6363 |
-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
6304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 24890 - 25204
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8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
24890 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgca-acccaag |
24987 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||| | || || |||||||| ||| ||| | || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
24988 |
ccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaa-ttg |
25086 |
T |
 |
| Q |
208 |
agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc |
306 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
25087 |
agcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatc |
25186 |
T |
 |
| Q |
307 |
ataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25187 |
ataaatagagcacaaatt |
25204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 433
Target Start/End: Original strand, 25235 - 25564
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102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | ||||||||| | || || |||||||| ||| ||| | || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | |
|
|
| T |
25235 |
cccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacc |
25334 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacat |
300 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
25335 |
aa-ttgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacat |
25433 |
T |
 |
| Q |
301 |
atcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaa |
398 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | | | |
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|
| T |
25434 |
gtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaata |
25529 |
T |
 |
| Q |
399 |
aatgattatgatgaattctaacccccttaccttag |
433 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25530 |
agtgattatgatgaagactaacccccttaccttag |
25564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1732
Alignment:
| Q |
30 |
tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac |
128 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || | ||||||| |
|
|
| T |
1332 |
tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaac |
1431 |
T |
 |
| Q |
129 |
atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatc |
227 |
Q |
| |
|
|| || ||||| || |||||| | ||| |||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
1432 |
atgacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaa-ttgagcatattttcaacatatacc |
1530 |
T |
 |
| Q |
228 |
actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattata |
327 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | |
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|
| T |
1531 |
aatttctcatactttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttca |
1630 |
T |
 |
| Q |
328 |
acaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccct |
425 |
Q |
| |
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|| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |
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| T |
1631 |
tcacataggaacaattaatcaattcacccaattaagcactta-tcatccaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
1725 |
T |
 |
| Q |
426 |
tacctta |
432 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
1726 |
tacctta |
1732 |
T |
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Name: scaffold0133
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Target: scaffold0133; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 25439 - 25637
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Q |
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|
|||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25439 |
acaaatcaacaagaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattc |
25538 |
T |
 |
| Q |
271 |
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368 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || | || |||||| ||||||||||||||||||| |
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|
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aattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcactta |
25637 |
T |
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Name: scaffold0012
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Target: scaffold0012; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 253271 - 252924
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142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
253271 |
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253172 |
T |
 |
| Q |
143 |
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241 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |
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| T |
253171 |
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253073 |
T |
 |
| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaa |
341 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| || |||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||| |||||||||| | ||||| |||| || || | || |||| |
|
|
| T |
253072 |
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252973 |
T |
 |
| Q |
342 |
ttaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatt |
389 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
252972 |
ttaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt |
252924 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0406 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
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Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
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Target Start/End: Original strand, 14099 - 14326
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caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
14099 |
caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacgtagtataattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatact |
14198 |
T |
 |
| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- |
339 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14199 |
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14297 |
T |
 |
| Q |
340 |
aattaatcatttactcaattaagcactta |
368 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14298 |
aaataatcacttactcaattaagcactta |
14326 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0833 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
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Target: scaffold0833; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
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acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag |
3328 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaac |
186 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||| |
|
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| T |
3329 |
ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
3407 |
T |
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Target: scaffold0008 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
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Target: scaffold0008; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 22668 - 23050
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || | || |||||||||||| | |
|
|
| T |
22668 |
caccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaatt |
22767 |
T |
 |
| Q |
155 |
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253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22768 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
22866 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
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| T |
22867 |
tcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
22966 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| || ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22967 |
tccaattaagcactt-ttgatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
23050 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
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Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11457
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||| || | ||||||||| || || || ||||||||| || | |
|
|
| T |
11837 |
caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaatt |
11739 |
T |
 |
| Q |
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gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
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|| |||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11738 |
gatcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatta-agcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
11640 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
11639 |
tcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
11540 |
T |
 |
| Q |
354 |
tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||| | | |||| || || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11539 |
acaattaaacactt-ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccataccttagttaggt |
11457 |
T |
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Target: scaffold0001 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Original strand, 60784 - 61163
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
60784 |
caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
60882 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||| || |||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
60883 |
gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagtatatttttaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
60981 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| || |||| || |||||| | |||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
60982 |
tcaaccaacaacaattcaattattcataacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
61081 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta |
436 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
61082 |
cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta |
61163 |
T |
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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||| | | |
|
|
| T |
70892 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatccaat |
70793 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaa |
252 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
70792 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacctacttt-tcatactttgaacatgtaa |
70695 |
T |
 |
| Q |
253 |
tttcaccaacaacaattcaatta-tcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|| || ||||| || ||||||| ||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
70694 |
ttcaactaacaataaatcaattattcattaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatt |
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T |
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Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
171872 |
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171970 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt |
206 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||| | || || ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
171971 |
ataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaattt |
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T |
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
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Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
177575 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaacaacaaatcatgaa-tatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcc |
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T |
 |
| Q |
143 |
acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt |
206 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||| | || || ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
177674 |
ataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaattt |
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T |
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Target: scaffold0001; HSP #5
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
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aaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt--- |
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T |
 |
| Q |
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actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
79824 |
acaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagcttagttaggt |
79778 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
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Target: scaffold0673; HSP #1
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aaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatc |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||| | |
|
|
| T |
1096 |
aaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaac |
997 |
T |
 |
| Q |
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aactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg |
249 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||| |||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| | ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
996 |
aattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaactcatacccatttttcatactttgaacatg |
898 |
T |
 |
| Q |
250 |
aaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcat |
349 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
897 |
taattcatctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatcaatcaa |
798 |
T |
 |
| Q |
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tt-actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
797 |
ttcactcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
715 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 55 - 439
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55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac- |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |||| |
|
|
| T |
7118 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca |
7019 |
T |
 |
| Q |
154 |
--tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatga |
250 |
Q |
| |
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|
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| T |
7018 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccattttcatacactctgaacatgt |
6920 |
T |
 |
| Q |
251 |
aatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-at |
349 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||| || || |||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| || |
|
|
| T |
6919 |
aattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
6820 |
T |
 |
| Q |
350 |
ttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6819 |
tcacccaattaagcactga-tcatacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccc---accttagttaggt |
6736 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0153 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:
Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 8606 - 8790
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aattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaatt |
293 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
8606 |
aattcaacaattagagcacaattcataatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtact |
8705 |
T |
 |
| Q |
294 |
caaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||| |||| || |||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8706 |
caaacatatcatcacaacaagagcacgaatttcaataactaagaacaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaa |
8790 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 1791 - 1944
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| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| || || ||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
1791 |
atcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttcacatcatcaattcatgatttatg-acacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctc |
1889 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacata |
189 |
Q |
| |
|
||| || || ||||||||| | |||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1890 |
ttaacaacatcaacatcaattaaacatgattctcatcacaattc-acaacaacata |
1944 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
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Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
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Target Start/End: Original strand, 1300 - 1674
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| Q |
61 |
caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
1300 |
caacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcat |
1399 |
T |
 |
| Q |
161 |
gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc |
259 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
1400 |
gaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcatcacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaacc |
1498 |
T |
 |
| Q |
260 |
aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaat |
358 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |||| | || | | |||||||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
1499 |
accaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaattcattcaat |
1598 |
T |
 |
| Q |
359 |
taagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| || ||||||| || || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1599 |
taaccactt-ttcatacaaataattgaa---ttgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttgccttagttaggt |
1674 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11740 - 11546
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| Q |
238 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| | || | ||| |
|
|
| T |
11740 |
actttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga |
11641 |
T |
 |
| Q |
338 |
acaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11640 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
11546 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0601 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:
Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1107 - 872
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| Q |
92 |
attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagc |
191 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| | |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1107 |
attatgaacacacaagctatgaatcattaacaacgatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctccccacatttcaacaacaacatagc |
1008 |
T |
 |
| Q |
192 |
ataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaa |
291 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||| ||| || | || |||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
1007 |
acaattcaacaattagagcacaatacacc------cattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcattta |
914 |
T |
 |
| Q |
292 |
ttcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
913 |
ctcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact |
872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:
Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 314 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 5689 - 5565
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| Q |
314 |
gagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaa |
413 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5689 |
gagcacaagttttaacatctatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttattcatataataattgaaaaattacact-aaaatgattatcatgaa |
5591 |
T |
 |
| Q |
414 |
ttctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5590 |
ttataacccccttatcttagttaggt |
5565 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 38275 - 38657
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||| |||| | |
|
|
| T |
38275 |
caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaatt |
38374 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38375 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaa-ttgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttgaacatgtaat |
38473 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcattta |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | || | ||||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
38474 |
tcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaattaattaattca |
38573 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
439 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38574 |
cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt |
38657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11977 - 11598
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
11977 |
caccaaaaacatctcatttctcaacaccaa-tcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt |
11879 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| | |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11878 |
gatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaactaatacccatttttcatactttgaacatgtaat |
11780 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
11779 |
tcatccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaattaatcaattca |
11680 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag |
437 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11679 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttagcttagttag |
11598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11546 - 11514
Alignment:
| Q |
488 |
cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11546 |
cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc |
11514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 276
Target Start/End: Original strand, 1 - 219
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| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1 |
caacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgat |
100 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
256 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
101 |
catgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaatt-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattca |
199 |
T |
 |
| Q |
257 |
accaacaacaattcaattat |
276 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
200 |
accaacaacaattcaattat |
219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 152
Target Start/End: Original strand, 3496 - 3593
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3496 |
caccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaa |
3593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0065 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:
Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 68014 - 67844
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| Q |
208 |
agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca |
307 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
68014 |
agcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcacgtactcaaacatatcatca |
67915 |
T |
 |
| Q |
308 |
taattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa |
377 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| ||||||| || | || |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
67914 |
taacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaagtaatcacttattcaattaatcacttaagcatacaa |
67844 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0561 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:
Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3014 - 2787
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| Q |
86 |
tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatca---actgaacatgtttcttactacaattcaacaa |
182 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||| || | | |||||| ||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
3014 |
tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcttttaacaacaacaacaacataaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaa |
2915 |
T |
 |
| Q |
183 |
caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa |
282 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||| | |||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2914 |
caacataatacaattcaacaattagagcacaattcacaatataccattttcacatattatgaaaatgcaattttatcaacaacgattcaattatcaccaa |
2815 |
T |
 |
| Q |
283 |
tttcatgaattcaaacatatcatcataa |
310 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2814 |
tttcatgtactcaaacatatcatcataa |
2787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1295 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:
Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 343 - 520
Target Start/End: Original strand, 372 - 546
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343 |
taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa |
442 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
372 |
taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaa-ctacact--aaatgattacaatgaattctaacccccttacctcagttatcacca |
468 |
T |
 |
| Q |
443 |
ttccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
469 |
attcctagctcaagcttcactttagctcctagccctcttccaatccttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc |
546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0634 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:
Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 474
Target Start/End: Original strand, 5595 - 5806
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| Q |
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acaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaatta |
360 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||| ||| ||||||| |
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| T |
5595 |
acaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaaaaatgatgaacaaataatcacttattcaatta |
5694 |
T |
 |
| Q |
361 |
agcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaact |
458 |
Q |
| |
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|||||||| ||| || | | |||| |||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| || |
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|
| T |
5695 |
agcactta-acatggaattaataaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctagcccaagct |
5790 |
T |
 |
| Q |
459 |
tcactttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5791 |
tcaatttagctcctag |
5806 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 788 - 644
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154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||| | |||||||||||| | |
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|
| T |
788 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaatt |
689 |
T |
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| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
199 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
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688 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattca |
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T |
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Target: scaffold0195; HSP #2
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201 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19231 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
19330 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaaca |
299 |
Q |
| |
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| T |
19331 |
aa-ttgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
19427 |
T |
 |
| Q |
300 |
tatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| | || |||||| |||| |
|
|
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tatcatcacagttggagcacgaatt |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 21315 - 21536
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cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| | || || ||||||||||||||| ||||| |||||| | |
|
|
| T |
21315 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc |
21414 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaaca |
299 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || |||| | ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || |||||| |
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|
| T |
21415 |
aa-ttgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca |
21511 |
T |
 |
| Q |
300 |
tatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
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tatcatcacagttggagcacgaatt |
21536 |
T |
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Target: scaffold0507; HSP #1
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taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacct |
430 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1490 |
taatcatttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaa-ctacact--aaatgattatgatgaattctaacccccttacct |
1406 |
T |
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Target: scaffold0390; HSP #1
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157 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
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|
| T |
16108 |
caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa |
16009 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
213 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
16008 |
catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata |
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T |
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
|
|
| T |
3124 |
caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccatgtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa |
3025 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
213 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
3024 |
catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata |
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T |
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Target: scaffold0390; HSP #3
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58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
5162 |
caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacatagcaacaacaac |
5251 |
T |
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Target: scaffold0231 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:
Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
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109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | | || || || |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13048 |
tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaacttaaattacatcataaatccatg-attatgaacacccaagtt |
12950 |
T |
 |
| Q |
110 |
atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag |
209 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||| | || || ||||||||||| | |||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12949 |
atgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcatttaaacatgaattccaccacacatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagag |
12850 |
T |
 |
| Q |
210 |
cataattcaacatatat-cactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattat |
276 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||| || ||| |||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12849 |
cacaattcacaacatatccattttaacatattatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattat |
12782 |
T |
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Target: scaffold0335; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || |
|
|
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5875 |
acccatttatacaaaacaaccaacaacatctcatttctcaccaacaa-tcatgacatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcag |
5777 |
T |
 |
| Q |
138 |
cagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
199 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| || ||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5776 |
caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattca |
5714 |
T |
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Target: scaffold0240; HSP #1
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201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| | |||| | |||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
7593 |
cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcacc |
7692 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacat |
300 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| || || |||||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |
|
|
| T |
7693 |
aatt-gagcatattttcatcatatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcatacatctaaacat |
7791 |
T |
 |
| Q |
301 |
a-tcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaa |
397 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| || |||| | || | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || | |
|
|
| T |
7792 |
aggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaat |
7887 |
T |
 |
| Q |
398 |
aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7888 |
aagtaattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
7924 |
T |
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Target: scaffold0130; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
27051 |
acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattatagcacgattttcaacaatgatgaacaaataatcacttattcaattaagc |
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T |
 |
| Q |
364 |
acttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttca |
461 |
Q |
| |
|
||||| ||| || | |||||| |||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
26951 |
actta-acatggaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctagcacaagcttca |
26856 |
T |
 |
| Q |
462 |
ctttagctcctag |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |||| || ||| || | ||| |
|
|
| T |
48124 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat |
48222 |
T |
 |
| Q |
154 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48223 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaatt-gagcatattttaacacatacccatttttcatactttgaacataaaat |
48321 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
48322 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
48421 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48422 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttagt |
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T |
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caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| |||| || ||| || | ||| |
|
|
| T |
61572 |
caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat |
61670 |
T |
 |
| Q |
154 |
tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
61671 |
tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaatt-gagcatattttaacacatacccatttttcatactttgaacataaaat |
61769 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta |
352 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
61770 |
tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
61869 |
T |
 |
| Q |
353 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
61870 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttagt |
61946 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0786; HSP #1
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157 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |
|
|
| T |
4591 |
caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaaatcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa |
4492 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata |
213 |
Q |
| |
|
|||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4491 |
catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata |
4436 |
T |
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Q |
| |
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|
|
| T |
1574 |
caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac |
1663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0327 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:
Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 149
Target Start/End: Original strand, 5937 - 6028
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacat |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
5937 |
caacaacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacat |
6028 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 520
Target Start/End: Original strand, 6030 - 6109
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| Q |
441 |
aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6030 |
aattccctagctcaagcttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctccttttctctctaaccc |
6109 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33704 - 33414
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| Q |
35 |
atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||| || ||| | |
|
|
| T |
33704 |
atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctataaatcatcaacaataatatctc |
33606 |
T |
 |
| Q |
134 |
ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt |
232 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||| | || || ||| || ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| | ||||| | | ||| |
|
|
| T |
33605 |
atgacaacaacaacatcaattaaatgtgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaatttaacaattagagcacaatttataatatacctatttt |
33506 |
T |
 |
| Q |
233 |
ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
33505 |
ctcatattatgaacattcaatttcatctacatcaatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt |
33414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 432
Target Start/End: Original strand, 20274 - 20524
Alignment:
| Q |
180 |
caacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatc |
277 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20274 |
caacaacaaagcataattaaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt |
20372 |
T |
 |
| Q |
278 |
accaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcataca |
376 |
Q |
| |
|
|| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20373 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-cataca |
20471 |
T |
 |
| Q |
377 |
ac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20472 |
aataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
20524 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 48350 - 48414
Alignment:
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
48350 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat |
48414 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 14854 - 15226
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| | | |
|
|
| T |
14854 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca---att |
14950 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat |
253 |
Q |
| |
|
|| |||| | || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||| | | |||| | |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14951 |
gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat |
15049 |
T |
 |
| Q |
254 |
ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac |
353 |
Q |
| |
|
| || |||| |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
15050 |
ctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
15148 |
T |
 |
| Q |
354 |
tc-aattaagcacttattcataca-acaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15149 |
tccaattaagcacttat-catacatataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
15226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 14194 - 14287
Alignment:
| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
14194 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca |
14287 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 255084 - 254708
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
255084 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
254985 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa |
252 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || |||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
254984 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa |
254886 |
T |
 |
| Q |
253 |
tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attt |
351 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||| || ||||| || || ||| |||||| ||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
254885 |
-ttcaactacaacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattc |
254787 |
T |
 |
| Q |
352 |
actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
254786 |
atccaattaaacactta-tcatacaaataattgaaa--ttaca--ataagtgattatgatgaattatatcccccttaccttagt |
254708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 261690 - 261540
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| | |
|
|
| T |
261690 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt |
261591 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
261590 |
gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt |
261540 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 123264 - 123181
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
123264 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatt |
123181 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 147531 - 147612
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| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
147531 |
accaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag |
147612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0081 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:
Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 318
Target Start/End: Original strand, 1349 - 1424
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| Q |
242 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca |
318 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1349 |
tgaacatgcaatttccccaacaacaactcaattatcactaatttcatgta-tcaaacatatcatcataattagagca |
1424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
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| Q |
44 |
ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaa |
92 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
1304 |
ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaa |
1352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 12694 - 12912
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| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttta-caaaatcac-caacaacaactcatttctcaccaacaaatc-atgaattatgaactccc |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| | || || || |||||| |||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
12694 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccattttaacaaaaaccctcaacaacaacttaaatcacatca-caaatccatga-ttatgaacaccc |
12791 |
T |
 |
| Q |
105 |
aagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaat |
204 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
12792 |
aagttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaattccaccacaaatcaacaacaacatagcacaattaaacaat |
12891 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttgagcataattcaacatata |
225 |
Q |
| |
|
| ||||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
12892 |
tagagcacaaatcaaaatata |
12912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 13531 - 13634
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| Q |
102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
13531 |
cccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatc |
13630 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatt |
205 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
13631 |
aatt |
13634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13752
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| Q |
241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
13670 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatt |
13752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 41673 - 41776
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| Q |
102 |
cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac |
201 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
41673 |
cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcacc |
41772 |
T |
 |
| Q |
202 |
aatt |
205 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
41773 |
aatt |
41776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Original strand, 41812 - 41894
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241 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
41812 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt |
41894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:
Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3387 - 3317
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61 |
caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatc |
131 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3387 |
caacaactcatttcacaataaaaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc |
3317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 3427 - 3392
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| Q |
8 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaaccca |
43 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3427 |
acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca |
3392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1311 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:
Target: scaffold1311; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 1655 - 1724
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58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa |
127 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1655 |
caacaacatctcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcataaacaacaa |
1724 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target Start/End: Complemental strand, 50124 - 49975
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| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
50124 |
accaacaacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg |
50026 |
T |
 |
| Q |
156 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
50025 |
aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt |
49975 |
T |
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Target: scaffold0207; HSP #1
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155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17680 |
accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgagcacccaagccataaatcataaacaacaacttgtct---cagcaacaacatcaattg |
17775 |
T |
 |
| Q |
156 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17776 |
aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
17826 |
T |
 |
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accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
5201 |
accaacaacatcttatttcttaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta |
5298 |
T |
 |
| Q |
156 |
aa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
|| | || |||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
5299 |
aatcttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt |
5349 |
T |
 |
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Target: scaffold0367; HSP #1
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104 |
caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
17542 |
caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa |
17443 |
T |
 |
| Q |
204 |
tt |
205 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
17442 |
tt |
17441 |
T |
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| Q |
55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||| |
|
|
| T |
24467 |
caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaaca |
24374 |
T |
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213 |
aattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
24371 |
aattcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaat |
24272 |
T |
 |
| Q |
312 |
tagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatga |
409 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
24271 |
tagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatga |
24177 |
T |
 |
| Q |
410 |
tgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24176 |
tgaacactaacccccttacctta |
24154 |
T |
 |
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Target: scaffold0122; HSP #3
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| Q |
238 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||| | || | ||| |
|
|
| T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
| Q |
338 |
acaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19941 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
19850 |
T |
 |
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Target: scaffold0116; HSP #1
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43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || || |
|
|
| T |
30056 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaaca |
30155 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
30156 |
acaaca |
30161 |
T |
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Target: scaffold0023 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
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Target: scaffold0023; HSP #1
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| Q |
104 |
caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
61455 |
caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa |
61356 |
T |
 |
| Q |
204 |
tt |
205 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
61355 |
tt |
61354 |
T |
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| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
48761 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
48844 |
T |
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392 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3095 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttat-catacaaataattgaaaatt--- |
3000 |
T |
 |
| Q |
393 |
actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2999 |
ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
2959 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
295 |
aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttac |
392 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4501 |
aaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt--- |
4596 |
T |
 |
| Q |
393 |
actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4597 |
ac-aaacgtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
4637 |
T |
 |
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55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaaca |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||||| || | |||||||| |
|
|
| T |
4284 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca |
4358 |
T |
 |
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56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
6492 |
accaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcatcaacaacatcaattg |
6394 |
T |
 |
| Q |
156 |
-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
205 |
Q |
| |
|
||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
6393 |
aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt |
6343 |
T |
 |
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55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
32180 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
32279 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatg |
161 |
Q |
| |
|
|| |||| |
|
|
| T |
32280 |
gatcatg |
32286 |
T |
 |
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55 |
caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||| | |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| | |
|
|
| T |
42123 |
caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt |
42024 |
T |
 |
| Q |
155 |
gaacatg |
161 |
Q |
| |
|
|| |||| |
|
|
| T |
42023 |
gatcatg |
42017 |
T |
 |
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attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
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Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
| T |
6373 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaaca |
6274 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
6273 |
acaaca |
6268 |
T |
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tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8668 |
tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt |
8701 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
634 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0465; HSP #1
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caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
10241 |
caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat |
10142 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattc |
198 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10141 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattc |
10101 |
T |
 |
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Target: scaffold0413 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
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Target: scaffold0413; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 6164 - 6081
Alignment:
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
6164 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
6081 |
T |
 |
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Target: scaffold0266 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0266; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 3682 - 3599
Alignment:
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
3682 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
3599 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
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Target: scaffold0175; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1056 - 973
Alignment:
| Q |
240 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
1056 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt |
973 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0118 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:
Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34670 - 34595
Alignment:
| Q |
56 |
accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca |
132 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34670 |
accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgttatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatca |
34595 |
T |
 |
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Target: scaffold1734 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:
Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 93
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1414
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat |
93 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1364 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat |
1414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17679 - 17522
Alignment:
| Q |
58 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||| | |||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
17679 |
caacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat |
17580 |
T |
 |
| Q |
158 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17579 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt |
17522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31570 - 31465
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
| T |
31570 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
31471 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
31470 |
acaaca |
31465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Original strand, 41274 - 41379
Alignment:
| Q |
43 |
attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca |
142 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||| ||||| | |||||| || ||| | || || |
|
|
| T |
41274 |
atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca |
41373 |
T |
 |
| Q |
143 |
acaaca |
148 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
41374 |
acaaca |
41379 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0018 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 51430 - 51393
Alignment:
| Q |
81 |
acaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcat |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51430 |
acaaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcat |
51393 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Original strand, 12280 - 12359
Alignment:
| Q |
244 |
aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt |
324 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
12280 |
aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatt |
12359 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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