View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19358_high_17 (Length: 520)

Name: NF19358_high_17
Description: NF19358
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19358_high_17
NF19358_high_17
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (8-520)||(28466-28978)
scaffold0150 (8-58)||(21637-21687)
[»] chr3 (105 HSPs)
chr3 (8-520)||(47784567-47785064)
chr3 (44-520)||(39656492-39656966)
chr3 (58-513)||(3576249-3576705)
chr3 (30-501)||(12952915-12953388)
chr3 (56-517)||(11328774-11329230)
chr3 (56-501)||(17191519-17191965)
chr3 (56-520)||(17139486-17139949)
chr3 (66-520)||(16880111-16880565)
chr3 (56-520)||(14059021-14059482)
chr3 (36-507)||(17960131-17960602)
chr3 (44-437)||(9590643-9591035)
chr3 (56-520)||(15876046-15876503)
chr3 (45-475)||(17204667-17205078)
chr3 (35-392)||(12488659-12489017)
chr3 (141-437)||(30207279-30207575)
chr3 (36-520)||(38810820-38811297)
chr3 (58-451)||(14080489-14080882)
chr3 (56-520)||(12560042-12560505)
chr3 (58-437)||(14814653-14815032)
chr3 (39-519)||(11060814-11061293)
chr3 (230-520)||(11882025-11882313)
chr3 (55-520)||(14295415-14295879)
chr3 (55-516)||(55440668-55441119)
chr3 (36-313)||(34559857-34560134)
chr3 (35-324)||(6228626-6228916)
chr3 (55-520)||(14301042-14301506)
chr3 (230-519)||(13301278-13301564)
chr3 (230-519)||(13311934-13312220)
chr3 (56-474)||(4162057-4162474)
chr3 (48-368)||(31412289-31412610)
chr3 (35-368)||(50313144-50313478)
chr3 (58-333)||(41661545-41661820)
chr3 (35-288)||(1990759-1991012)
chr3 (58-439)||(54423993-54424371)
chr3 (176-368)||(15517728-15517921)
chr3 (35-474)||(33368780-33369199)
chr3 (35-377)||(43427460-43427805)
chr3 (365-520)||(15520336-15520488)
chr3 (44-437)||(3578057-3578445)
chr3 (61-444)||(17100636-17101016)
chr3 (61-444)||(17101321-17101701)
chr3 (55-439)||(14298399-14298780)
chr3 (55-439)||(14304026-14304407)
chr3 (39-436)||(17522781-17523176)
chr3 (67-520)||(50111858-50112309)
chr3 (343-520)||(48421843-48422018)
chr3 (35-333)||(10912842-10913141)
chr3 (55-437)||(35123674-35124052)
chr3 (55-213)||(14528124-14528282)
chr3 (103-439)||(12349427-12349761)
chr3 (184-348)||(4145791-4145954)
chr3 (394-520)||(12487583-12487709)
chr3 (8-205)||(19946629-19946826)
chr3 (8-115)||(7853913-7854019)
chr3 (8-115)||(33341812-33341918)
chr3 (55-434)||(22144165-22144542)
chr3 (58-275)||(11638337-11638554)
chr3 (294-519)||(14527887-14528111)
chr3 (55-434)||(317403-317778)
chr3 (8-115)||(54685519-54685625)
chr3 (8-157)||(9303276-9303425)
chr3 (39-270)||(17938535-17938766)
chr3 (63-434)||(16995954-16996321)
chr3 (55-434)||(19570584-19570957)
chr3 (340-442)||(34560130-34560231)
chr3 (230-333)||(8604977-8605080)
chr3 (55-434)||(13817492-13817864)
chr3 (58-433)||(8631769-8632143)
chr3 (55-434)||(16181840-16182215)
chr3 (59-324)||(19260840-19261105)
chr3 (58-216)||(38167894-38168051)
chr3 (354-433)||(51961030-51961107)
chr3 (43-205)||(16934101-16934263)
chr3 (56-205)||(11477318-11477467)
chr3 (59-152)||(51961310-51961403)
chr3 (56-205)||(8268872-8269020)
chr3 (56-205)||(8275972-8276120)
chr3 (91-304)||(11402602-11402816)
chr3 (56-205)||(14284940-14285089)
chr3 (242-324)||(38375697-38375779)
chr3 (335-439)||(6146657-6146759)
chr3 (401-509)||(15550922-15551030)
chr3 (401-439)||(6154219-6154257)
chr3 (102-324)||(15859041-15859262)
chr3 (399-436)||(40939445-40939482)
chr3 (260-324)||(11196320-11196384)
chr3 (43-324)||(13838861-13839140)
chr3 (295-474)||(38527945-38528121)
chr3 (30-148)||(30152893-30153012)
chr3 (92-199)||(38375804-38375911)
chr3 (55-205)||(6146866-6147015)
chr3 (397-500)||(12031826-12031932)
chr3 (43-148)||(17956169-17956274)
chr3 (43-152)||(18910960-18911068)
chr3 (410-474)||(18970255-18970318)
chr3 (240-324)||(51158035-51158118)
chr3 (58-205)||(53898575-53898721)
chr3 (275-309)||(21167097-21167131)
chr3 (240-305)||(15936663-15936727)
chr3 (240-305)||(15938505-15938569)
chr3 (488-520)||(8632197-8632229)
chr3 (240-324)||(12030164-12030247)
chr3 (488-520)||(14080902-14080934)
chr3 (240-324)||(14842578-14842661)
chr3 (491-519)||(55192439-55192467)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (8-513)||(43645824-43646331)
chr2 (39-520)||(67952-68433)
chr2 (54-520)||(31145985-31146451)
chr2 (56-520)||(25305423-25305874)
chr2 (36-520)||(3052-3529)
chr2 (36-503)||(722353-722813)
chr2 (45-501)||(19666495-19666950)
chr2 (56-520)||(24294328-24294792)
chr2 (58-520)||(19668915-19669376)
chr2 (141-476)||(22775064-22775389)
chr2 (141-476)||(22780442-22780767)
chr2 (35-344)||(24884643-24884952)
chr2 (44-520)||(24571098-24571572)
chr2 (8-209)||(19433448-19433649)
chr2 (44-436)||(22579754-22580140)
chr2 (259-499)||(23821467-23821705)
chr2 (259-499)||(23830546-23830784)
chr2 (55-520)||(28974026-28974489)
chr2 (35-377)||(9636701-9637045)
chr2 (43-519)||(25601989-25602466)
chr2 (56-437)||(24277739-24278120)
chr2 (230-519)||(19660032-19660319)
chr2 (176-419)||(24087295-24087537)
chr2 (55-520)||(27261783-27262245)
chr2 (58-439)||(36890574-36890952)
chr2 (55-439)||(271148-271528)
chr2 (55-437)||(4448023-4448402)
chr2 (141-368)||(16292757-16292985)
chr2 (35-257)||(6094672-6094895)
chr2 (39-200)||(23821730-23821892)
chr2 (39-200)||(23830809-23830971)
chr2 (35-333)||(25594980-25595275)
chr2 (401-520)||(7321841-7321960)
chr2 (8-205)||(25212977-25213176)
chr2 (55-369)||(32465835-32466149)
chr2 (58-213)||(22138140-22138295)
chr2 (141-324)||(18536818-18537002)
chr2 (35-205)||(25265525-25265695)
chr2 (8-205)||(24826846-24827044)
chr2 (55-434)||(23836599-23836975)
chr2 (56-205)||(28031366-28031516)
chr2 (56-205)||(15633193-15633341)
chr2 (81-205)||(33128045-33128172)
chr2 (240-324)||(43642974-43643057)
chr2 (382-501)||(24884943-24885062)
chr2 (295-434)||(25875814-25875950)
chr2 (92-189)||(24560867-24560964)
chr2 (241-324)||(25265407-25265489)
chr2 (242-288)||(20279575-20279621)
chr2 (43-152)||(12636049-12636157)
chr2 (110-324)||(36982458-36982671)
chr2 (240-324)||(19794721-19794804)
chr2 (43-127)||(22283921-22284004)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (43-520)||(21197958-21198434)
chr8 (43-520)||(23837163-23837641)
chr8 (36-501)||(5854572-5855036)
chr8 (36-501)||(15933256-15933721)
chr8 (36-520)||(26011452-26011931)
chr8 (56-520)||(39446572-39447034)
chr8 (36-520)||(38533607-38534091)
chr8 (36-476)||(22735697-22736127)
chr8 (35-501)||(33528383-33528848)
chr8 (185-517)||(25296265-25296598)
chr8 (44-501)||(33610877-33611334)
chr8 (197-517)||(17285323-17285644)
chr8 (185-517)||(25758285-25758618)
chr8 (35-513)||(23225891-23226368)
chr8 (35-520)||(23149736-23150218)
chr8 (171-520)||(22981366-22981710)
chr8 (111-501)||(29306450-29306842)
chr8 (58-520)||(23151643-23152100)
chr8 (35-520)||(23158118-23158597)
chr8 (35-373)||(18261423-18261762)
chr8 (58-437)||(38635536-38635915)
chr8 (43-520)||(31194129-31194606)
chr8 (35-437)||(22742717-22743123)
chr8 (53-449)||(15969794-15970190)
chr8 (35-377)||(33172184-33172527)
chr8 (35-437)||(45558824-45559228)
chr8 (35-377)||(18041479-18041823)
chr8 (58-364)||(45465088-45465393)
chr8 (35-333)||(22497201-22497500)
chr8 (56-437)||(21680980-21681361)
chr8 (58-434)||(20481585-20481957)
chr8 (55-437)||(20573082-20573461)
chr8 (44-432)||(24552462-24552851)
chr8 (44-324)||(37653617-37653895)
chr8 (35-437)||(19331204-19331606)
chr8 (171-437)||(20561521-20561785)
chr8 (44-233)||(27233159-27233348)
chr8 (253-474)||(27232943-27233162)
chr8 (55-443)||(41246635-41247019)
chr8 (401-520)||(21259303-21259422)
chr8 (55-272)||(20647882-20648099)
chr8 (55-277)||(20653953-20654175)
chr8 (93-310)||(16002013-16002230)
chr8 (43-134)||(17285232-17285323)
chr8 (55-434)||(37611645-37612022)
chr8 (43-152)||(3431462-3431570)
chr8 (302-434)||(22234698-22234827)
chr8 (178-278)||(18118336-18118437)
chr8 (55-152)||(20567331-20567427)
chr8 (55-152)||(20573524-20573620)
chr8 (56-152)||(18612386-18612480)
chr8 (56-152)||(18619291-18619385)
chr8 (335-439)||(20529741-20529843)
chr8 (335-434)||(25122699-25122795)
chr8 (43-161)||(24717034-24717152)
chr8 (43-152)||(13721109-13721217)
chr8 (368-432)||(16404900-16404965)
chr8 (56-157)||(21494625-21494725)
chr8 (55-148)||(41506994-41507087)
chr8 (240-324)||(16193733-16193816)
chr8 (240-324)||(16404992-16405075)
chr8 (55-130)||(20567194-20567268)
chr8 (70-157)||(22886320-22886406)
chr8 (262-333)||(22887945-22888016)
chr8 (396-434)||(19992950-19992988)
chr8 (55-205)||(19993174-19993324)
chr8 (43-93)||(24929037-24929087)
chr8 (30-111)||(29759893-29759975)
chr8 (487-520)||(21191412-21191445)
chr8 (240-324)||(24928808-24928891)
chr8 (35-126)||(25296137-25296229)
chr8 (35-126)||(25758157-25758249)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (39-520)||(6622-7104)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (43-520)||(17223741-17224220)
chr7 (35-520)||(13377485-13377972)
chr7 (36-501)||(48356602-48357066)
chr7 (36-501)||(16914752-16915217)
chr7 (56-520)||(49047481-49047943)
chr7 (36-501)||(9838838-9839302)
chr7 (36-501)||(9611266-9611731)
chr7 (8-432)||(14271793-14272203)
chr7 (56-520)||(13274765-13275217)
chr7 (58-474)||(20583406-20583821)
chr7 (36-501)||(34241031-34241477)
chr7 (35-470)||(31501126-31501563)
chr7 (35-474)||(38424175-38424614)
chr7 (35-474)||(14935319-14935757)
chr7 (35-474)||(15362912-15363350)
chr7 (55-520)||(11287394-11287856)
chr7 (35-373)||(4484683-4485021)
chr7 (55-437)||(12248010-12248391)
chr7 (58-474)||(15358777-15359191)
chr7 (58-439)||(26070154-26070531)
chr7 (58-439)||(26093941-26094318)
chr7 (44-520)||(16569812-16570287)
chr7 (44-520)||(16595375-16595850)
chr7 (171-474)||(28722203-28722505)
chr7 (35-319)||(4446168-4446453)
chr7 (58-368)||(28390292-28390603)
chr7 (35-341)||(14940709-14941015)
chr7 (120-297)||(16919601-16919778)
chr7 (58-368)||(13448783-13449094)
chr7 (58-439)||(13862821-13863197)
chr7 (35-341)||(15368302-15368608)
chr7 (86-319)||(17947598-17947831)
chr7 (8-432)||(7283956-7284376)
chr7 (55-474)||(12758965-12759383)
chr7 (171-377)||(8267675-8267882)
chr7 (58-439)||(12369728-12370107)
chr7 (55-434)||(15822325-15822701)
chr7 (86-324)||(9723808-9724046)
chr7 (141-368)||(33559710-33559938)
chr7 (48-374)||(46473971-46474299)
chr7 (58-434)||(3895005-3895378)
chr7 (176-324)||(4438881-4439029)
chr7 (55-439)||(45452056-45452435)
chr7 (221-310)||(9319578-9319667)
chr7 (439-520)||(9080965-9081045)
chr7 (91-333)||(8563339-8563582)
chr7 (242-333)||(45149748-45149839)
chr7 (359-475)||(16919811-16919928)
chr7 (416-520)||(13389693-13389797)
chr7 (354-433)||(25124406-25124483)
chr7 (59-216)||(3049564-3049720)
chr7 (35-149)||(4438777-4438893)
chr7 (55-205)||(39046743-39046893)
chr7 (43-152)||(371055-371163)
chr7 (35-199)||(45149559-45149723)
chr7 (238-434)||(44865391-44865584)
chr7 (295-434)||(39046521-39046658)
chr7 (35-132)||(8267905-8268003)
chr7 (55-439)||(47289758-47290141)
chr7 (171-434)||(143732-143993)
chr7 (68-152)||(25124120-25124204)
chr7 (55-434)||(35094794-35095168)
chr7 (30-118)||(126366-126455)
chr7 (269-310)||(9250630-9250671)
chr7 (36-152)||(9321209-9321326)
chr7 (43-152)||(18980202-18980310)
chr7 (235-324)||(13321173-13321262)
chr7 (240-305)||(18253871-18253935)
chr7 (240-324)||(11580756-11580839)
chr7 (240-324)||(13037031-13037114)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (36-520)||(102730-103211)
scaffold0022 (56-520)||(109568-110024)
scaffold0022 (55-520)||(112353-112812)
scaffold0022 (194-430)||(131931-132166)
scaffold0022 (35-310)||(67972-68248)
scaffold0022 (58-181)||(131816-131939)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (35-520)||(15044784-15045269)
chr4 (43-520)||(41165761-41166228)
chr4 (35-520)||(15109155-15109640)
chr4 (36-501)||(7964536-7965000)
chr4 (8-501)||(7185669-7186159)
chr4 (43-478)||(14901197-14901630)
chr4 (36-501)||(18276392-18276856)
chr4 (59-517)||(13809320-13809776)
chr4 (58-520)||(52265314-52265775)
chr4 (36-501)||(37956849-37957314)
chr4 (56-520)||(27960950-27961412)
chr4 (35-436)||(41256259-41256660)
chr4 (58-474)||(15013136-15013549)
chr4 (36-520)||(19821582-19822065)
chr4 (43-513)||(47534891-47535328)
chr4 (44-393)||(40904865-40905214)
chr4 (55-503)||(18494152-18494598)
chr4 (58-474)||(38764689-38765103)
chr4 (58-377)||(18238104-18238424)
chr4 (58-439)||(30232384-30232763)
chr4 (58-368)||(13442632-13442946)
chr4 (55-437)||(16732146-16732525)
chr4 (58-377)||(50219890-50220207)
chr4 (35-310)||(41916741-41917017)
chr4 (86-324)||(54398391-54398629)
chr4 (56-434)||(12837094-12837468)
chr4 (141-368)||(47468304-47468532)
chr4 (86-324)||(13590075-13590313)
chr4 (343-474)||(34177501-34177629)
chr4 (55-439)||(44055892-44056273)
chr4 (55-520)||(23269740-23270204)
chr4 (8-205)||(16522748-16522946)
chr4 (43-439)||(34395222-34395616)
chr4 (55-439)||(21959352-21959733)
chr4 (8-205)||(9295624-9295822)
chr4 (55-434)||(53704627-53705003)
chr4 (235-433)||(40885458-40885659)
chr4 (30-433)||(55376493-55376893)
chr4 (81-439)||(45458744-45459099)
chr4 (234-439)||(20813435-20813638)
chr4 (55-434)||(30457880-30458257)
chr4 (56-205)||(14996107-14996255)
chr4 (56-205)||(19697500-19697648)
chr4 (56-205)||(19708085-19708233)
chr4 (56-152)||(8044920-8045016)
chr4 (67-434)||(44346816-44347179)
chr4 (259-439)||(819819-819997)
chr4 (295-434)||(8872366-8872502)
chr4 (55-148)||(53907873-53907966)
chr4 (240-324)||(54118261-54118344)
chr4 (102-205)||(15675224-15675327)
chr4 (30-111)||(14951713-14951795)
chr4 (102-216)||(31115654-31115767)
chr4 (44-118)||(47468536-47468610)
chr4 (396-434)||(53907602-53907640)
chr4 (242-303)||(21417471-21417532)
chr4 (240-324)||(122052-122135)
chr4 (56-132)||(32460878-32460953)
chr4 (241-324)||(15675106-15675188)
chr4 (43-93)||(5682767-5682817)
chr4 (241-307)||(10104284-10104349)
chr4 (43-148)||(25119392-25119498)
chr4 (55-152)||(7132246-7132342)
chr4 (243-307)||(31115795-31115858)
chr4 (457-520)||(40885370-40885434)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (36-519)||(7728378-7728861)
chr5 (35-520)||(3673818-3674303)
chr5 (35-520)||(5450647-5451134)
chr5 (55-473)||(19862186-19862604)
chr5 (35-520)||(432419-432903)
chr5 (141-520)||(28902254-28902632)
chr5 (141-520)||(28938649-28939027)
chr5 (36-501)||(37983325-37983787)
chr5 (36-513)||(21616974-21617452)
chr5 (58-520)||(23493899-23494363)
chr5 (36-520)||(32965955-32966436)
chr5 (56-520)||(16595486-16595948)
chr5 (36-513)||(21222420-21222897)
chr5 (178-501)||(21297000-21297322)
chr5 (180-478)||(21310557-21310854)
chr5 (35-474)||(6456580-6457016)
chr5 (44-470)||(29917931-29918356)
chr5 (44-520)||(19405503-19405980)
chr5 (35-389)||(23981451-23981806)
chr5 (35-437)||(24084034-24084437)
chr5 (104-368)||(22885668-22885932)
chr5 (55-520)||(11336992-11337455)
chr5 (44-368)||(26559771-26560096)
chr5 (86-333)||(21109758-21110005)
chr5 (30-318)||(1168211-1168500)
chr5 (35-333)||(16835291-16835590)
chr5 (58-444)||(20712056-20712440)
chr5 (194-519)||(23466552-23466875)
chr5 (35-377)||(23234432-23234776)
chr5 (280-501)||(24225171-24225391)
chr5 (9-432)||(11583982-11584405)
chr5 (35-324)||(23417198-23417488)
chr5 (171-437)||(24183022-24183286)
chr5 (8-205)||(108960-109158)
chr5 (8-205)||(16105573-16105771)
chr5 (55-439)||(21397066-21397451)
chr5 (55-434)||(28261498-28261869)
chr5 (251-333)||(19873934-19874016)
chr5 (354-437)||(22662572-22662652)
chr5 (56-205)||(7528879-7529028)
chr5 (171-333)||(11763496-11763659)
chr5 (9-211)||(24225431-24225634)
chr5 (234-434)||(4865418-4865615)
chr5 (55-205)||(21906697-21906844)
chr5 (343-433)||(25005082-25005170)
chr5 (55-161)||(23466434-23466540)
chr5 (43-152)||(9730564-9730672)
chr5 (102-205)||(22053968-22054071)
chr5 (55-148)||(24475560-24475653)
chr5 (110-205)||(18531202-18531297)
chr5 (58-161)||(19873824-19873927)
chr5 (56-205)||(17909485-17909633)
chr5 (55-148)||(2031787-2031880)
chr5 (44-108)||(22882391-22882455)
chr5 (240-324)||(23507128-23507211)
chr5 (241-324)||(18531084-18531166)
chr5 (275-309)||(5621810-5621844)
chr5 (30-111)||(11342635-11342717)
chr5 (405-434)||(1168098-1168127)
chr5 (43-152)||(10778151-10778259)
chr5 (401-434)||(21646634-21646667)
chr5 (102-159)||(34939303-34939360)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (43-520)||(35444-35921)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (43-520)||(21623133-21623610)
chr6 (59-519)||(25367043-25367503)
chr6 (36-475)||(22361617-22362054)
chr6 (58-520)||(16887597-16888059)
chr6 (43-359)||(18381649-18381965)
chr6 (30-520)||(18398890-18399378)
chr6 (47-497)||(33538198-33538647)
chr6 (44-500)||(18629433-18629892)
chr6 (104-520)||(21410856-21411270)
chr6 (58-520)||(35135818-35136279)
chr6 (8-475)||(17083050-17083496)
chr6 (58-520)||(33324673-33325134)
chr6 (36-520)||(25919571-25920055)
chr6 (83-480)||(17556866-17557258)
chr6 (39-302)||(25651197-25651461)
chr6 (56-520)||(15740207-15740662)
chr6 (89-520)||(15079517-15079944)
chr6 (35-373)||(29605406-29605744)
chr6 (35-377)||(34966823-34967167)
chr6 (58-368)||(19854135-19854446)
chr6 (173-474)||(22848110-22848409)
chr6 (56-317)||(28195101-28195362)
chr6 (35-310)||(22462112-22462386)
chr6 (35-285)||(29160343-29160594)
chr6 (35-333)||(23222703-23223006)
chr6 (171-368)||(17013595-17013793)
chr6 (35-310)||(23221870-23222148)
chr6 (304-501)||(25654350-25654546)
chr6 (55-439)||(32898767-32899149)
chr6 (55-278)||(31628245-31628468)
chr6 (58-323)||(19672275-19672531)
chr6 (141-368)||(32352110-32352338)
chr6 (61-439)||(18432626-18433001)
chr6 (8-129)||(18583264-18583384)
chr6 (171-434)||(18570372-18570632)
chr6 (123-439)||(16106561-16106875)
chr6 (83-439)||(16086022-16086376)
chr6 (8-205)||(4991002-4991200)
chr6 (8-205)||(18823515-18823712)
chr6 (8-157)||(18839419-18839567)
chr6 (242-377)||(31467544-31467680)
chr6 (58-324)||(18777126-18777392)
chr6 (171-324)||(21931296-21931450)
chr6 (171-333)||(19175243-19175406)
chr6 (102-205)||(35009574-35009677)
chr6 (60-205)||(19629314-19629458)
chr6 (55-434)||(22440911-22441287)
chr6 (401-501)||(14152632-14152733)
chr6 (242-333)||(16136427-16136518)
chr6 (401-439)||(18777450-18777488)
chr6 (56-205)||(32276891-32277039)
chr6 (43-148)||(35015342-35015447)
chr6 (401-435)||(25640453-25640487)
chr6 (43-152)||(16231859-16231967)
chr6 (43-152)||(18087004-18087112)
chr6 (43-148)||(19983476-19983581)
chr6 (55-148)||(25744390-25744483)
chr6 (240-324)||(23153610-23153693)
chr6 (295-434)||(13014601-13014740)
chr6 (84-197)||(16300116-16300230)
chr6 (488-520)||(18570686-18570718)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (43-520)||(20177140-20177618)
chr1 (141-520)||(16656701-16657079)
chr1 (141-507)||(16645975-16646341)
chr1 (61-520)||(36356098-36356557)
chr1 (36-501)||(17608886-17609351)
chr1 (36-513)||(37233672-37234149)
chr1 (36-515)||(19603055-19603529)
chr1 (44-519)||(51627472-51627945)
chr1 (36-520)||(38033478-38033962)
chr1 (36-501)||(20955265-20955728)
chr1 (44-474)||(21194980-21195409)
chr1 (70-520)||(22143169-22143616)
chr1 (37-520)||(22829232-22829712)
chr1 (36-520)||(27674755-27675238)
chr1 (43-520)||(13376663-13377122)
chr1 (35-474)||(8537762-8538200)
chr1 (35-474)||(8603001-8603439)
chr1 (39-474)||(52400591-52401026)
chr1 (58-474)||(49997133-49997548)
chr1 (35-333)||(40436261-40436560)
chr1 (58-368)||(5768125-5768436)
chr1 (35-324)||(33397308-33397598)
chr1 (79-439)||(27329654-27330001)
chr1 (55-437)||(21718206-21718583)
chr1 (43-168)||(41229096-41229221)
chr1 (141-324)||(25093922-25094105)
chr1 (58-439)||(35054736-35055115)
chr1 (141-433)||(9783958-9784245)
chr1 (56-439)||(22402998-22403379)
chr1 (55-205)||(35522439-35522588)
chr1 (260-520)||(35522159-35522417)
chr1 (55-434)||(49967628-49968004)
chr1 (194-374)||(20194140-20194323)
chr1 (43-205)||(21650167-21650329)
chr1 (55-425)||(41212046-41212415)
chr1 (92-218)||(76480-76606)
chr1 (102-324)||(20445704-20445925)
chr1 (49-188)||(9784237-9784377)
chr1 (30-148)||(22366970-22367089)
chr1 (30-127)||(15861630-15861728)
chr1 (43-152)||(17148534-17148642)
chr1 (401-434)||(20346345-20346378)
chr1 (241-318)||(37844473-37844549)
chr1 (240-324)||(41394385-41394468)
chr1 (488-520)||(9783872-9783904)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (43-519)||(76652-77129)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (35-509)||(2134-2607)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (36-501)||(43622-44087)
scaffold0080 (35-474)||(23525-23963)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (36-501)||(69415-69880)
[»] scaffold0162 (4 HSPs)
scaffold0162 (43-513)||(6835-7307)
scaffold0162 (102-184)||(8333-8415)
scaffold0162 (61-157)||(11730-11824)
scaffold0162 (251-324)||(8197-8269)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (36-501)||(2483-2948)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (36-474)||(30978-31415)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (56-520)||(33534-33996)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (39-504)||(270-721)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (58-520)||(11074-11534)
[»] scaffold0025 (5 HSPs)
scaffold0025 (36-432)||(53305-53699)
scaffold0025 (35-380)||(85489-85834)
scaffold0025 (58-276)||(146581-146799)
scaffold0025 (240-324)||(148884-148967)
scaffold0025 (241-307)||(9013-9078)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (36-501)||(197078-197545)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (36-501)||(97023-97487)
scaffold0031 (44-437)||(31010-31402)
scaffold0031 (122-437)||(70657-70969)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (62-520)||(7994-8451)
scaffold0123 (355-520)||(11153-11317)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (58-501)||(104448-104889)
scaffold0032 (36-371)||(93726-94061)
scaffold0032 (488-520)||(93657-93689)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (56-520)||(3297-3760)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (82-520)||(1352-1790)
scaffold0456 (82-520)||(8497-8935)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (171-520)||(1154-1502)
scaffold0409 (171-520)||(9409-9757)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (55-437)||(8771-9152)
scaffold0480 (55-434)||(5141-5516)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (58-433)||(79519-79892)
scaffold0028 (8-205)||(130486-130684)
scaffold0028 (240-324)||(89471-89554)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (58-519)||(10642-11101)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (35-501)||(22246-22713)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (35-474)||(6500-6939)
scaffold0077 (171-520)||(15278-15625)
scaffold0077 (240-324)||(36930-37013)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (8-439)||(21442-21869)
scaffold0120 (8-439)||(31141-31568)
scaffold0120 (335-439)||(47438-47539)
[»] scaffold0016 (5 HSPs)
scaffold0016 (177-520)||(116363-116700)
scaffold0016 (43-151)||(116687-116795)
scaffold0016 (55-434)||(164192-164567)
scaffold0016 (43-111)||(162401-162469)
scaffold0016 (43-127)||(166463-166547)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (55-520)||(11664-12130)
scaffold0021 (223-520)||(16044-16342)
scaffold0021 (223-520)||(25575-25873)
scaffold0021 (55-439)||(132137-132520)
scaffold0021 (126-431)||(88323-88626)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (62-520)||(22235-22681)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (35-437)||(27453-27857)
scaffold0004 (35-368)||(86313-86648)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (35-417)||(2411-2795)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (35-377)||(7622-7966)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (58-474)||(4585-4999)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (56-520)||(33640-34103)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (58-474)||(3232-3647)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (62-516)||(70116-70569)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (55-520)||(159279-159740)
scaffold0014 (55-520)||(85309-85772)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (188-520)||(7915-8246)
scaffold0589 (56-152)||(7812-7908)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (58-470)||(818-1213)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (55-437)||(466-846)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (59-520)||(1897-2356)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (55-437)||(117852-118233)
scaffold0035 (55-437)||(109351-109732)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (8-434)||(75-498)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (55-520)||(8964-9428)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (58-368)||(29944-30254)
scaffold0165 (58-368)||(21979-22290)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (58-368)||(37538-37848)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (35-318)||(7358-7642)
scaffold0253 (35-318)||(16783-17067)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (58-434)||(4543-4915)
scaffold0447 (58-434)||(9157-9529)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (58-387)||(5920-6251)
scaffold0342 (399-520)||(12588-12710)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (35-437)||(107967-108369)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (44-437)||(9903-10294)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (58-434)||(7151-7524)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (238-520)||(89671-89950)
scaffold0026 (35-132)||(90037-90135)
scaffold0026 (240-305)||(107910-107974)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (82-439)||(40662-41017)
scaffold0034 (58-439)||(46145-46524)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (43-324)||(4906-5187)
scaffold0075 (241-324)||(34477-34559)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (58-439)||(24616-24995)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (8-432)||(10-430)
scaffold0310 (8-84)||(6603-6679)
scaffold0310 (171-432)||(6304-6562)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (8-324)||(24890-25204)
scaffold0158 (102-433)||(25235-25564)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (30-432)||(1332-1732)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (171-368)||(25439-25637)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (43-389)||(252924-253271)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (141-368)||(14099-14326)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (8-186)||(3230-3407)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (55-439)||(22668-23050)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (55-439)||(11457-11837)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (55-436)||(60784-61163)
scaffold0001 (55-324)||(70622-70892)
scaffold0001 (43-206)||(171872-172034)
scaffold0001 (43-206)||(177575-177737)
scaffold0001 (295-439)||(79778-79920)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (51-434)||(715-1096)
scaffold0673 (55-439)||(6736-7118)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (194-377)||(8606-8790)
scaffold0153 (35-189)||(1791-1944)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (61-439)||(1300-1674)
scaffold0359 (238-434)||(11546-11740)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (92-333)||(872-1107)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (314-439)||(5565-5689)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (55-439)||(38275-38657)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (55-437)||(11598-11977)
scaffold0396 (488-520)||(11514-11546)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (58-276)||(1-219)
scaffold0160 (55-152)||(3496-3593)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (208-377)||(67844-68014)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (86-310)||(2787-3014)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (343-520)||(372-546)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (261-474)||(5595-5806)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (55-199)||(644-788)
scaffold0195 (102-324)||(19231-19452)
scaffold0195 (102-324)||(21315-21536)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (343-430)||(1406-1490)
[»] scaffold0390 (3 HSPs)
scaffold0390 (58-213)||(15953-16108)
scaffold0390 (58-213)||(2969-3124)
scaffold0390 (58-147)||(5162-5251)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (11-276)||(12782-13048)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (39-199)||(5714-5875)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (102-434)||(7593-7924)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (264-474)||(26843-27051)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (55-434)||(48124-48498)
scaffold0068 (55-434)||(61572-61946)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (58-213)||(4436-4591)
scaffold0786 (58-147)||(1574-1663)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (58-149)||(5937-6028)
scaffold0327 (441-520)||(6030-6109)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (35-324)||(33414-33704)
scaffold0049 (180-432)||(20274-20524)
scaffold0049 (240-305)||(48350-48414)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (55-434)||(14854-15226)
scaffold0083 (55-148)||(14194-14287)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (55-434)||(254708-255084)
scaffold0011 (55-205)||(261540-261690)
scaffold0011 (240-324)||(123181-123264)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (56-137)||(147531-147612)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (242-318)||(1349-1424)
scaffold0081 (44-92)||(1304-1352)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (8-225)||(12694-12912)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (102-205)||(13531-13634)
scaffold0132 (241-324)||(13670-13752)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (102-205)||(41673-41776)
scaffold0125 (241-324)||(41812-41894)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (61-131)||(3317-3387)
scaffold0090 (8-43)||(3392-3427)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (58-127)||(1655-1724)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (56-205)||(49975-50124)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (56-205)||(17680-17826)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (56-205)||(5201-5349)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (104-205)||(17441-17542)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (55-148)||(24374-24467)
scaffold0122 (213-432)||(24154-24371)
scaffold0122 (238-432)||(19850-20041)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (43-148)||(30056-30161)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (104-205)||(61354-61455)
scaffold0023 (240-324)||(48761-48844)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (295-434)||(2959-3095)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (295-434)||(4501-4637)
scaffold0740 (55-129)||(4284-4358)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (56-205)||(6343-6492)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (55-161)||(32180-32286)
scaffold0091 (55-161)||(42017-42123)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (43-148)||(6268-6373)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (401-434)||(8668-8701)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (240-324)||(551-634)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (58-198)||(10101-10241)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (240-324)||(6081-6164)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (240-324)||(3599-3682)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (240-324)||(973-1056)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (56-132)||(34595-34670)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (43-93)||(1364-1414)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (58-216)||(17522-17679)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (43-148)||(31465-31570)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (43-148)||(41274-41379)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (81-118)||(51393-51430)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (244-324)||(12280-12359)


Alignment Details
Target: scaffold0150 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28978
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
28466 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaag 28565  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
28566 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttg 28665  T
208 agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
28666 agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatca 28765  T
308 taattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
28766 taattagagcacgaatgataacaactttggacaattaatcatttactcaattaagaacttattcatacaacaattgaaaatttaaactaaaaatgattat 28865  T
408 gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctc 507  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
28866 gatgaattctaaccccgttaccttagttagatcaaatccctagcccaagcttcactttagttcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctc 28965  T
508 ttctctctaaccc 520  Q
    |||||||||||||    
28966 ttctctctaaccc 28978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Original strand, 21637 - 21687
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcacc 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
21637 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc 21687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 105)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 47785064 - 47784567
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
47785064 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaag 47784965  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
47784964 ccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataa------------ 47784877  T
208 agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
47784876 -------ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatca 47784784  T
308 taattagagcacaaattataacaactt----tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatga 403  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47784783 taattagagcacgaattataacaacttcctttgaacaataaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatga 47784684  T
404 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
47784683 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatattcaggtt 47784584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 39656492 - 39656966
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
39656492 tttttcaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaa 39656591  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    | ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
39656592 ccacatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttg 39656691  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||| | |||||||||    
39656692 aacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaatt 39656791  T
344 aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
39656792 aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcact--aaatgattatgatcaattctaactcccttaccttagttagatcaat 39656889  T
444 tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
39656890 tccctagctcaagcttcattttaactcctaggttctatcatcttcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 39656966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 58 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576249
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||   ||    
3576705 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaa 3576606  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
3576605 catgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataattcaatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttca 3576506  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3576505 ccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 3576406  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||||||||||     
3576405 ttaagcacttattcgtacaacaattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacaaattcctagcccaag 3576307  T
457 cttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctct 513  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||||| |||||| || ||||||||    
3576306 cttcactttacctcctaggatctcttccaattcttgaatattcaagctcttcttctct 3576249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 30 - 501
Target Start/End: Original strand, 12952915 - 12953388
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
12952915 tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaat 12953014  T
129 atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca 228  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
12953015 atctcttagcaacaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataaca 12953114  T
229 ctttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataa 328  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
12953115 ctttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaattctaa 12953214  T
329 caact-ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaaccccctt 426  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
12953215 caactaatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacagtaattgaaaaattacact-aaattgattatgattgaattctaatcccctt 12953313  T
427 accttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
12953314 accttagttagatcaattccctagcccaaacttcaatttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaag 12953388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 56 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 11329230 - 11328774
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
11329230 accaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 11329131  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
11329130 atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt 11329031  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| || ||| |     |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
11329030 cactaacaacaattcaattattaacaactttatgca-----acatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc 11328936  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||    
11328935 aattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaatttcctagatcaa 11328836  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaa 517  Q
     |||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||    
11328835 gcttcactttagctcctaggtcctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaa 11328774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 56 - 501
Target Start/End: Original strand, 17191519 - 17191965
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |     
17191519 accaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaatta 17191618  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
17191619 aacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacataaatcactttctcatactttgaacatgaaattt 17191718  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || || |||||||||||||||||||||    
17191719 caccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatcatttactc 17191818  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccca 454  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | | |||||||||    
17191819 aattaagcaattgttcatacaacaattgaaaaattacact-aaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagccca 17191917  T
455 aacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||    
17191918 aacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag 17191965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 17139486 - 17139949
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
17139486 accaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 17139585  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
17139586 atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatatttcaacatataccattttctcatagtttgaacatgaaattt 17139685  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||| ||||||| ||||||    
17139686 caccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacacttaatcaattactc 17139785  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
17139786 aattaagcacttattcatacaacaattg-aaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagcccaa 17139884  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||||| |||| ||||||| |   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
17139885 gcttcaatttacctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 17139949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 66 - 520
Target Start/End: Original strand, 16880111 - 16880565
Alignment:
66 actcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttc 165  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||    
16880111 actcatttatcaccaataattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatc 16880210  T
166 ttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac 265  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
16880211 ttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagcatattctaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattttactaacaac 16880310  T
266 aattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcac 365  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||    
16880311 aattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaattactcaattaaacac 16880410  T
366 ttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcacttt 465  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
16880411 ttgttcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagcttcacttt 16880510  T
466 agctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| |||||| || |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16880511 agcttctaggtcctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 16880565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 14059482 - 14059021
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||    
14059482 accaacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattg 14059383  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    ||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
14059382 aacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcatatttcaacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaattt 14059283  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    | | || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||   |||||||||| ||| ||| ||    
14059282 ctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaattagtc 14059183  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  |     
14059182 aattaagcacttattcatacaataattgaaaa-ttgcact-aaaatgattatgatgaattataaccccctta-cttagttagattaattccctagcttag 14059086  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
14059085 acttcactttagctcctaggttcttctctccacttgaatcttcaagctcctattctctcgaaccc 14059021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 36 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17960602 - 17960131
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
17960602 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtcatgaattattaataacaacatcactt 17960503  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    ||||||||  ||||||| |||| |||  ||| |  | ||||||||| ||||||| || || |   || || |||||||||   |||||||||| ||||      
17960502 agcagcaaacacatcaattgaatatgaatctcagcataattcaacatcaacataacacaaattgtcatttagagcataatatgacatatatcattttcat 17960403  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||||  |||||| |||| |||| |   |    
17960402 atactttgatcattcaatttcacccacaaaaaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacataaaatcataataggagcacgaattctaaccatcat 17960303  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17960302 gaacaattaattaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 17960203  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctc 507  Q
    || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
17960202 agatcaattccctagctcaagtttcactttagctcctaggttctctcctcttcttcaatcttcaagttcctc 17960131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 44 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590643
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
9591035 ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 9590936  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||    
9590935 caacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcataattcatatcataccactttcacatactttg 9590836  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
9590835 aacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaacaatt 9590736  T
344 aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaa-ttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
9590735 aaccacttattcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaatccccttaccttagttag 9590643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 15876046 - 15876503
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||| ||    
15876046 accaacaccaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattg 15876145  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    ||||||  |||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
15876146 aacatgaatcttatcacaattcaacaacaacttatgataatccaacaatttgagtatcattcaagatatatcactttctcatacttggaacataaaattt 15876245  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | || || |||||||||||        ||    
15876246 catcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaa--------tc 15876337  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa-cccccttaccttagtta-ggtcaattccctagccc 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
15876338 aattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccccttaccttaattatcgtcaatt-cctagccc 15876436  T
454 aaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    || |||||||||| |||||| | ||| |||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
15876437 aagcttcactttaactcctaagatctctccaactcttgaatcttcaagctcctcatctctctaaccc 15876503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 45 - 475
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17205078
Alignment:
45 tttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaac 144  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
17204667 tttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaac 17204766  T
145 aacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttga 244  Q
    |||||| | | |||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
17204767 aacatccattaaacatgattcctatcacaattcaacaacaatatagca-------------------taattcaacatatatcactttctcatactttga 17204847  T
245 acatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || || ||||||||||    
17204848 acatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaatta 17204947  T
345 atcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgat-gaattctaacccccttaccttagttaggtcaat 443  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   | |     
17204948 atcatttactcaattaagcacttgttcgtaccacaattgaaaaattacact-aaaatgattatgatggaattctaacccccttaccttaattatcaccaa 17205046  T
444 tccctagcccaaacttcactttagctcctagg 475  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||    
17205047 ttcctagcccaagcttcactttagctcctagg 17205078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12489017 - 12488659
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||    
12489017 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcac 12488918  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
12488917 ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttc 12488818  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |  |||||||||||||||  |||| |||||| |    
12488817 tcatactttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaatt 12488718  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac 392  Q
     |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12488717 atgaacaattaattaatgactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac 12488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 141 - 437
Target Start/End: Original strand, 30207279 - 30207575
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    ||||||| |||| ||||| ||  |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
30207279 caacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatact 30207378  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | | |||| |    
30207379 ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaata 30207478  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
30207479 attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttaccttagttag 30207575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38810820
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
38811297 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt 38811198  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||  ||| || |||||||||   |||||||||| ||||      
38811197 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataatatgacatatatcattttcat 38811098  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
     || ||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |  || |||| | | |||||||||| |||||| |||| ||||||   |    
38811097 gtattttgatcattcaatttcaccaacaacaaattaattatcatcaattccttacatacaaaaagaacatcataattggagcacgaattctaacaatcat 38810998  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    |||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38810997 gaacaattaatca--------attaagcacttattcatgcaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 38810906  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |   | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
38810905 atcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccagttcttgaatcttcaagctcctcttctatctaaccc 38810820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 451
Target Start/End: Original strand, 14080489 - 14080882
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||    
14080489 caacaacaactcatttctcatcaccaaatcatgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaattgaa 14080588  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | ||||||||||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||  |  || |||||   ||||||||||||||| || ||||    
14080589 catggttctcatcataattcaacaacaatatagcacaattcacccaattgagcataattcataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattca 14080688  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||  |||    
14080689 ctaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatctatgcacaattaatcatttatccaa 14080788  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagc 451  Q
    |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
14080789 ttaaacacttattcataccatagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttacattaattccctagc 14080882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12560505 - 12560042
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  ||||||||| |||| |  | | |||||||||||||||| |||||||||| | ||    
12560505 accaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattg 12560406  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
12560405 atcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt 12560306  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    | | ||||| ||||||| |||||  || |||| | |||||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
12560305 ctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc 12560206  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagccca 454  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |  |    
12560205 aattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagttagattaatctccctaactta 12560108  T
455 aacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
12560107 agcttcaatttagctcata-gttctcttccaatccttgattcttcaagttccccttctctctaaccc 12560042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14815032 - 14814653
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| | |||||| | || |||||||| ||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
14815032 caacaacaacttatttctcatcatcaaattatgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 14814933  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
14814932 catgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 14814833  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||    
14814832 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagcaaataatcacttattcaa 14814733  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
14814732 ttaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttag 14814653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11061293 - 11060814
Alignment:
39 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
11061293 acccattttcaccaaatcaacaacaataacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 11061194  T
138 cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctca 236  Q
    || |||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| || |||||||    
11061193 caccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctca 11061094  T
237 tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttg 336  Q
    |||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||    || |||||  ||| ||| || | |||||||||||||||| ||||  | || |  |     
11061093 tactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccatt 11060995  T
337 aacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 436  Q
    ||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |   ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
11060994 aacaaataattaattatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aattatgattatgatgaattccaacccccttaccttagtta 11060898  T
437 ggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    | | ||| ||||||||  || ||||| ||| |||||||| |   |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
11060897 gattaatctccctagcttaagcttcagttttgctcctagctctcttccactccttgattcttcaagttccccttctctctaacc 11060814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 230 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11882313 - 11882025
Alignment:
230 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac 329  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |  |||    
11882313 tttcacatactatgaacattcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcatgaaattcaac 11882214  T
330 aactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 429  Q
    | ||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
11882213 atctaagaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaa--tgattatgatgaattctaacccccttacc 11882116  T
430 ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
11882115 ttagttagatcaattccctaggtcaagcttcactttagctcctaggatctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 11882025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 14295415 - 14295879
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||| |    
14295415 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt 14295514  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
14295515 gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaatt 14295614  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || |    
14295615 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 14295714  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    | || || ||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
14295715 cccattttagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctaga 14295810  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      |   |||| |||||||||||| |     ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
14295811 ttagggttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 14295879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 55 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 55441119 - 55440668
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
55441119 caccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatcaatt 55441020  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
55441019 gatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatactttgaacatgaaat 55440920  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    | ||| ||||||||||||||||||   || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
55440919 tccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 55440820  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||          | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
55440819 cccaattaagcacttattcat---acaattg----------caataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc 55440733  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctcta 516  Q
    | |  ||||| ||| |||||||| |   ||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
55440732 ctaggcttcaattttgctcctagctctcttccaatccttgattcttcaagttcctcttctttcta 55440668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34560134
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
34559857 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 34559956  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||  ||| |  | ||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||| ||| |    
34559957 agcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaacaactacataacataattcaaaatttagagcataattcaacatgtaacacattcac 34560056  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataatta 313  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
34560057 atattttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattataatta 34560134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6228916 - 6228626
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |    
6228916 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatttc 6228817  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||| | |  |  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| ||||    
6228816 ttagcaacaacaacatcaattaaacatgatccacatcataattcgacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttc 6228717  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
6228716 acatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaatt 6228626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 14301042 - 14301506
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  || ||| ||||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||| |    
14301042 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt 14301141  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
14301142 gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaatt 14301241  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || |    
14301242 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 14301341  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    | || || ||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||     
14301342 cccattttagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctaga 14301437  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      |   |||| |||||||||||| |     ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
14301438 ttagggttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 14301506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 13301564 - 13301278
Alignment:
230 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac 329  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||    
13301564 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaac 13301465  T
330 aactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 429  Q
    | ||  |||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
13301464 atctaagaaccaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacact--aaatgattatgatgaattctaacccccttacc 13301367  T
430 ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    ||| ||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
13301366 ttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacatcttcttgaatcttcaag--cctcttctctctaacc 13301278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 13312220 - 13311934
Alignment:
230 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac 329  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||    
13312220 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaac 13312121  T
330 aactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 429  Q
    | ||  |||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
13312120 atctaagaaccaataatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacact--aaatgattatgatgaattctaacccccttacc 13312023  T
430 ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    ||| ||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
13312022 ttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacatcttcttgaatcttcaag--cctcttctctctaacc 13311934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 4162474 - 4162057
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    ||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||| |     
4162474 accaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatagttcttagcaacaacaacatcaatta 4162375  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    |||||| |||     |  |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| ||||| || |||||    
4162374 aacatgattcacgtcatcattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacttgtaattt 4162275  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
4162274 caccaacagcaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaacaaataatcacttattc 4162175  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccc 453  Q
    ||||||||||||| |||| |    | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||   || | ||||||||    
4162174 aattaagcacttaatcatgcctttaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaactctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctagccc 4162078  T
454 aaacttcactttagctcctag 474  Q
    |||||||| ||||||||||||    
4162077 aaacttcaatttagctcctag 4162057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31412610 - 31412289
Alignment:
48 acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac 147  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||    
31412610 acaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaac 31412511  T
148 atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaaca 247  Q
    ||||| | ||| |  |||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||    
31412510 atcaattaaacctaattctcatcacaattcaacaacaacatatcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaaca 31412411  T
248 tgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaat 346  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | || ||||    
31412410 tgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataat 31412311  T
347 catttactcaattaagcactta 368  Q
    || ||| |||||||||||||||    
31412310 cacttattcaattaagcactta 31412289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 50313144 - 50313478
Alignment:
35 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact 134  Q
    ||||||| ||||||||||| || | || |||||| |||||||| |  |||||||| | |||||||  | ||| | ||||||||| |||||||| ||| ||    
50313144 atcaacctattttacaaaaccaaccacgacaacttatttctcatcgtcaaatcataatttatgaatactcaaactatgaatcatcaacaacaatatctct 50313243  T
135 tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct 234  Q
    || || |||||||||||| | |||||| |||  |  ||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||| ||||     
50313244 taacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacatatcacaatccaacatttagagcacaattcacaatatatcattttca 50313343  T
235 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt 334  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||     
50313344 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttcaacaacta 50313443  T
335 tgaac-aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    ||| | || |||||| |||||||||||||||||||    
50313444 tgagcaaaataatcacttactcaattaagcactta 50313478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 333
Target Start/End: Original strand, 41661545 - 41661820
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||| ||| || ||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| || | || |||||||||||| | ||    
41661545 caacaacaacttatttatcatcatcaattcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctctcaacaacaacaacatcaattaaa 41661644  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
41661645 catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 41661744  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||    
41661745 ccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattttaacaact 41661820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 288
Target Start/End: Original strand, 1990759 - 1991012
Alignment:
35 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaac-tcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| |    
1990759 atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc 1990858  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||  | |||||| |||| |  ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
1990859 ttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattc-acaatttgagcataattcacaatatatcattttc 1990957  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat 288  Q
       |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
1990958 atctactatgaacatgcaatttcacaaacaataattcaattattaccaatttcat 1991012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Original strand, 54423993 - 54424371
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||     
54423993 caacaacaacttatttctcat-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatcaattgat 54424091  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      
54424092 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttgaacatgtaattca 54424190  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc 355  Q
    || ||| ||||||||||||||   || |||||  ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| || |    
54424191 actaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccc 54424290  T
356 aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54424291 aattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattga---aataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 54424371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 176 - 368
Target Start/End: Original strand, 15517728 - 15517921
Alignment:
176 tcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatt 274  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||  ||||| |  ||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
15517728 tcaacaacaacttagcacaattcatcaatttaagcacaattcacaatatacccatttatacataccatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt 15517827  T
275 atcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
15517828 atcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcactta 15517921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 33369199 - 33368780
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||  |    
33369199 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattcc 33369100  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || ||| |||||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||        || ||||            || ||||    
33369099 ttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcac-------agtataa------------cattttc 33369019  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||  |||||||    
33369018 acatactatgaacatgcaatttcaccaaccacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccacaattaaagcacgaatttcaacaact 33368919  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacctta 432  Q
     ||||||| |||| | ||| |||| |||||||||| |||| |||  | ||||||||   |||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||     
33368918 atgaacaaataattaattattcaaataagcacttaatcatgcaattaatgaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttt 33368821  T
433 gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    |||||  ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
33368820 gttagcacaaat-cctagccaaaacttcaatttagctcctag 33368780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43427805 - 43427460
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||  | ||  || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||| |    
43427805 atcaacccattttcacaaaaccaacatcaacaacttatttcatatcacaaactcatgatttatgaacaccaaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 43427706  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
      | || |||||||||||| | | |||| |||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |  |||||||| ||||    
43427705 --aacaacaacaacatcaattaatcatgattctcatcacaactcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttc 43427608  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaa---ttcaaacatatcatcataattagagcacaaattataaca 330  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||| |||||  ||||||| ||||  ||||    
43427607 acatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcatcaaacatatcaccataacaagagcacgaatttcaaca 43427508  T
331 actttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
    |||  || | || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
43427507 actaagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttatgcatacaa 43427460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 365 - 520
Target Start/End: Original strand, 15520336 - 15520488
Alignment:
365 cttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactt 464  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
15520336 cttaatcatacaacaat-gaaaaattacactaaaa-tgattatgatgaattataacccc-ttatcttagttaggtcaattccctagcccaagcttcaatt 15520432  T
465 tagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
15520433 aagctcctaggttctctcctcttcttaaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 15520488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 437
Target Start/End: Original strand, 3578057 - 3578445
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaa-caacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| ||| |  || ||||||   ||  |||| ||||||||| |||||||| ||    
3578057 ttttaccaaaacaccaacaacctctcattcctccacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagcca---atttttaatcaacaacatgacttagcaaca 3578153  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactt 241  Q
    |||| ||||| ||| ||||   ||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||    
3578154 acaa-atcaattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatatactattttctcatactt 3578252  T
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaa 341  Q
    |||||||||||||  || || |||||||||||||||   || |||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |  |||   | ||  | |||||||    
3578253 tgaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacattc-aacatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaa 3578351  T
342 ttaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
3578352 ttaatcaatttacccaattaagcacttattcctacaataattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttaccttagttag 3578445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 444
Target Start/End: Original strand, 17100636 - 17101016
Alignment:
61 caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat 160  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||    
17100636 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat 17100735  T
161 gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc 259  Q
    |   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  | | |||||||||||||||| ||||  ||     
17100736 gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaact 17100834  T
260 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaat 358  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | || |||||||||| ||| || ||||    
17100835 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaat 17100934  T
359 taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt 444  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||     | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17100935 taagcactt-ttcatacaaaaattgaaaat---agcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatt 17101016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 444
Target Start/End: Original strand, 17101321 - 17101701
Alignment:
61 caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat 160  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||    
17101321 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat 17101420  T
161 gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc 259  Q
    |   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  | | |||||||||||||||| ||||  ||     
17101421 gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattcaact 17101519  T
260 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaat 358  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | || |||||||||| ||| || ||||    
17101520 aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaat 17101619  T
359 taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt 444  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||     | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
17101620 taagcactt-ttcatacaaaaattgaaaat---agcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatt 17101701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 14298399 - 14298780
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||| |    
14298399 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaatt 14298497  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||  || |  | ||  | |||||||||||| |||    
14298498 gatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaat 14298596  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a 352  Q
    |  || ||| ||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||||||||| || |    
14298597 tcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 14298696  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    | ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14298697 cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 14298780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 14304026 - 14304407
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || ||  |  ||||||||||| |    
14304026 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaatt 14304124  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||  || |  | ||  | |||||||||||| |||    
14304125 gatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaat 14304223  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a 352  Q
    |  || ||| ||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||||||||| || |    
14304224 tcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 14304323  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    | ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14304324 cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 14304407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17523176 - 17522781
Alignment:
39 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatc-actta 136  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||| ||  |||||    
17523176 acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgactta 17523078  T
137 gcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctc 235  Q
    ||| |||||||||||| ||  ||||   ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||| |     
17523077 gcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccattttgtt 17522979  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||  |||||  || ||||  | |||||||||||||||||| || |  | ||  | |    
17522978 atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttat 17522879  T
336 gaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||| ||||| ||| || ||| |||||||||  |||||||| ||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17522878 gaacaaataatcaattcacccaaataagcactt-ctcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 17522783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 50112309 - 50111858
Alignment:
67 ctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttct 166  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||| |  | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||||| ||| ||||   ||    
50112309 ctcatttctcaaaaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaact 50112210  T
167 tactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac 265  Q
    ||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||    
50112209 tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaac 50112111  T
266 aattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagca 364  Q
    |||||||||||    || |||||  ||  ||||||  ||||||||||||||||  ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
50112110 aattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca 50112011  T
365 cttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcac 462  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |  |||||     
50112010 ctt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaa 50111915  T
463 tttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||| ||||||| | ||| | | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
50111914 ttttgctccta-gctctcttcacaccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 50111858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 520
Target Start/End: Original strand, 48421843 - 48422018
Alignment:
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
48421843 taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaa--tgattatgatgaattctaactctcttaccttagttagatcaa 48421940  T
443 ttccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||| | | |||||||||| |||||||     ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
48421941 ttccctagctctagcttcactttaactcctagccctcttccaatccttgaatcttcaagctccttttctctctaaccc 48422018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 10912842 - 10913141
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  ||  ||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||| ||| ||| |    
10912842 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctgtgaatcatcaacatcaatatctc 10912940  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt 232  Q
     |  || |||||||||||| | ||||||  ||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| | | |||    
10912941 atgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttt 10913040  T
233 ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaac 332  Q
    | |||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||    
10913041 cacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaac 10913140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Original strand, 35123674 - 35124052
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  ||||| |||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
35123674 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 35123772  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||||  | ||||| |||||| |||    
35123773 gatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccttttcatacacttt-aacatgtaat 35123870  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   ||||||||  || ||||||  |||||||||||| || || ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
35123871 tcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 35123970  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
35123971 cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccctttaccttagttag 35124052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14528282 - 14528124
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
14528282 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 14528183  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 213  Q
    || ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
14528182 gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcata 14528124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12349761 - 12349427
Alignment:
103 ccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaaca 202  Q
    ||||||||||| | || | | ||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
12349761 ccaagccatgatttatcatctacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcacca 12349662  T
203 atttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacata 301  Q
    ||| ||||||| || ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || || ||  ||  ||||||     
12349661 att-gagcatattttcaacatataacaacttctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatg 12349563  T
302 tcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaa 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | ||  | || |||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    | | ||    
12349562 tcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaattaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataa 12349467  T
400 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12349466 gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 12349427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4145954 - 4145791
Alignment:
184 aacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaat 283  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
4145954 aacatagcacaattcaacatttagagcacagttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaa- 4145856  T
284 ttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatca 348  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||| ||||||    
4145855 ttcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaatttcaacaactatgaacaaataatca 4145791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 394 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12487709 - 12487583
Alignment:
394 ctaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaa 493  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |   ||||  | ||||||    
12487709 ctaaaaacgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcattttagctcttagctctcttccaatccttgaa 12487610  T
494 tcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
12487609 tcttcaagttcctcttctctctaaccc 12487583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 19946629 - 19946826
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
19946629 acatcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 19946727  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
19946728 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataaatcatcaatt 19946826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Original strand, 7853913 - 7854019
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |  ||||||    
7853913 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgattcatgcaaacccaag 7854011  T
108 ccatgaat 115  Q
    ||||||||    
7854012 ccatgaat 7854019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Original strand, 33341812 - 33341918
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
33341812 acataatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 33341910  T
108 ccatgaat 115  Q
    ||||||||    
33341911 ccatgaat 33341918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22144542 - 22144165
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| || || | |||||||||  |||| || |||||||| ||| |    
22144542 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaacaacaacaatt 22144443  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaa 252  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | ||||  | |||||||||||| ||    
22144442 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa 22144344  T
253 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt- 351  Q
    ||  || |||| ||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | |||||| ||||||| ||     
22144343 ttcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacagttaatcaattc 22144245  T
352 actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22144244 acccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 22144165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 275
Target Start/End: Original strand, 11638337 - 11638554
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| |||||| ||||  |  || | || ||||||||| |||| ||| ||| || |  | |||||||||||| | ||    
11638337 caacaacaactcatttcttatcatcaattcatgatttatacatacctaggctatgaatcatcaacaccaatatctctgaataacaacaacatcaattaaa 11638436  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    ||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||    
11638437 catgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca 11638536  T
258 ccaacaacaattcaatta 275  Q
    ||||||||||||||||||    
11638537 ccaacaacaattcaatta 11638554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 14528111 - 14527887
Alignment:
294 caaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |    
14528111 caaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc 14528013  T
393 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttg 491  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |  ||||| ||| |||||||| |     ||  | ||||    
14528012 aataaa--tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctctcccccaatccttg 14527915  T
492 aatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
14527914 attcttcaagttcctcttctctctaacc 14527887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 317778 - 317403
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||  |  | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| |    
317778 caccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 317679  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    || ||||   | ||  |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||  ||| ||| |  ||| |||||||||||||||  ||||    
317678 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattt-agcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaatt 317580  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttact 354  Q
      || |||||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  |    
317579 caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcat 317480  T
355 c-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
317479 ccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 317403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 54685625 - 54685519
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |   |||||    
54685625 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaatccaag 54685527  T
108 ccatgaat 115  Q
    ||||||||    
54685526 ccatgaat 54685519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9303425 - 9303276
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||| |||||    
9303425 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatggtatatgaacacccaa 9303327  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||| | ||||   |||||||||  || |||| |||||||||||| ||||    
9303326 gccataattcatagtcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 9303276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 270
Target Start/End: Original strand, 17938535 - 17938766
Alignment:
39 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcat-ttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| |  ||| |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||     
17938535 acccatttt-caaaaacaacaacaacaactcatcttttcatctccaattcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatat 17938633  T
138 cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctca 236  Q
    || |||||||||||| ||| ||||    | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| || ||||||||||||  ||||||    
17938634 caacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaacaaagcataattcatcaatta-agcatattttcaacatatatcaacttctca 17938732  T
237 tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc 270  Q
    ||||||||||||| ||||  || |||||||||||    
17938733 tactttgaacatgcaattcaactaacaacaattc 17938766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16996321 - 16995954
Alignment:
63 acaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgt 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |  | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| ||| ||||     
16996321 acaactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatga 16996222  T
163 ttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaac 262  Q
      | ||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| ||| |  ||| |||||||||||||||  ||||  |  |||    
16996221 aacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaattcaagtaac 16996123  T
263 aacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatc-atttactcaatta 360  Q
    ||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||  |||| | || |||| |||| |||||||| ||| |  ||||||    
16996122 aacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatt-tcaccacttatgaataattaatcaattcatccaatta 16996024  T
361 agcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16996023 agcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 16995954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19570957 - 19570584
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||| |  | |||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| |    
19570957 caccaacaacatctcatttctcaacaacaac-caagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 19570859  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||  | |||||||||||| |||    
19570858 gatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttccacatatactcattttcatacactttgaacatgtaat 19570760  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||| |||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||  | |||| |||||||| ||| |    
19570759 tcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaaattaatcaattca 19570661  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
19570660 tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagt 19570584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 340 - 442
Target Start/End: Original strand, 34560130 - 34560231
Alignment:
340 aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttagg 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
34560130 aattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgatcatgattgaattctaacccccttaccttaattagc 34560227  T
439 tcaa 442  Q
    ||||    
34560228 tcaa 34560231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 333
Target Start/End: Original strand, 8604977 - 8605080
Alignment:
230 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac 329  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||    
8604977 tttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattattaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaac 8605076  T
330 aact 333  Q
    ||||    
8605077 aact 8605080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 13817492 - 13817864
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| |||    | |||||||| ||| |    
13817492 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgact---aaacaacaacaacaatt 13817588  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||  || ||||  | |||||||||||| |||    
13817589 gatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttccacatatacccattttcatacactttgaacatgtaat 13817687  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||| | |||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | || |||||||||| ||| |    
13817688 tcaactaac-ataattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtacaattaatcaattca 13817786  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13817787 tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 13817864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 433
Target Start/End: Original strand, 8631769 - 8632143
Alignment:
58 caacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactga 156  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||| || ||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |      
8631769 caacaacaactcattttctcatcttcaattcgtgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttg 8631868  T
157 acatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
      |||   ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||  || |  |||||| || ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||     
8631869 ttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaaagcataattcactaaata-agcatattttcaacatataccaacttctcaaactttgaacatgtaattc 8631967  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcatttact 354  Q
     || ||||||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  |  |||||||||| | ||| |      
8631968 aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatc 8632067  T
355 caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    | | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8632068 caattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttaccttag 8632143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16182215 - 16181840
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| |  | |||||||| ||| |    
16182215 caccaccaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaatt 16182116  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || |||    ||||  |||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||| ||| | | ||||  | |||||||||||| |||    
16182115 gatcattaaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttg-gcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat 16182017  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac 353  Q
    || || |||| ||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||      
16182016 ttaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca 16181918  T
354 tc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16181917 tccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 16181840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19261105 - 19260840
Alignment:
59 aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac 158  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  |   | ||||||| ||| || |||||||||| | ||| |    
19261105 aacaacaacttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatc 19261006  T
159 atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||   ||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||  |    
19261005 atgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaa 19260907  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    | ||||||||||||||||||   || |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
19260906 ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatt 19260840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 216
Target Start/End: Original strand, 38167894 - 38168051
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | |||     
38167894 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 38167993  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt 216  Q
    ||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
38167994 catgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcataatt 38168051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 51961107 - 51961030
Alignment:
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
51961107 tcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 51961030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16934263 - 16934101
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||    
16934263 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca 16934165  T
143 acaacatcaactgaa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    |||||||||| |||| | || |||| ||   ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
16934164 acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 16934101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11477467 - 11477318
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||    
11477467 accaacaacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattg 11477369  T
156 -aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
11477368 aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt 11477318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 51961403 - 51961310
Alignment:
59 aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||||    
51961403 aacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaa 51961310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8269020 - 8268872
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- 154  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||| |||||||| |     
8269020 accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaatta 8268923  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
8268922 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 8268872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8276120 - 8275972
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- 154  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||| |||||||| |     
8276120 accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaatta 8276023  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
8276022 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 8275972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 304
Target Start/End: Original strand, 11402602 - 11402816
Alignment:
91 aattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatag 190  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||| |   |  |||| ||||||||||| ||     
11402602 aattatgaacatccaaggtatgaatcatcaacaacaacatatcataacaacaacaacatcaattaaacatgtattcaatcacaaatcaacaacaacctaa 11402701  T
191 cataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatg 289  Q
    || |||||| | ||||||||| ||||||  ||||| |  ||| | ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||     
11402702 cacaattcatccatttgagcacaattcacaatatacctatttatacaccccatgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcata 11402801  T
290 aattcaaacatatca 304  Q
     | ||||||||||||    
11402802 tactcaaacatatca 11402816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 14284940 - 14285089
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| ||    
14284940 accaacaacatctcaattcacaccaacat-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctgagcaacaacaacatcaattg 14285038  T
156 -aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
14285039 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 14285089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38375779 - 38375697
Alignment:
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
38375779 tgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 38375697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 6146759 - 6146657
Alignment:
335 tgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
6146759 tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 6146664  T
433 gttaggt 439  Q
    |||||||    
6146663 gttaggt 6146657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 509
Target Start/End: Original strand, 15550922 - 15551030
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   | | | |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||   ||||||||||||||    
15550922 tgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactcgtaggatctctccaactcttgaatcttcaa 15551021  T
501 gttcctctt 509  Q
    | |||||||    
15551022 gctcctctt 15551030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 6154257 - 6154219
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6154257 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 6154219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15859262 - 15859041
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||| |  || ||   ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
15859262 cccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc 15859163  T
202 aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaaca 299  Q
    |||| ||||| ||||  ||  |  ||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||    
15859162 aatt-gagcacaattttcacaacttatcatttgttcata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca 15859066  T
300 tatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||| | || |||||| ||||    
15859065 tatcatcacagttggagcacgaatt 15859041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 436
Target Start/End: Original strand, 40939445 - 40939482
Alignment:
399 aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40939445 aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 40939482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11196384 - 11196320
Alignment:
260 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
11196384 aacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatt 11196320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 324
Target Start/End: Original strand, 13838861 - 13839140
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||| | |||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||     
13838861 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat-atgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcc 13838959  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatact 240  Q
    | |||||||| |||||| |  || ||   |||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||  ||  |  ||||| ||  || || |    
13838960 ataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatt-gagcacaattttcacaacttatcatttgttccta-t 13839057  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
13839058 ttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 13839140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 474
Target Start/End: Original strand, 38527945 - 38528121
Alignment:
295 aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaacaa-ttgaaaatttac 392  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||       
38527945 aaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaatagttgaaaatt--- 38528040  T
393 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  || ||||| ||| ||||||||    
38528041 ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaagcttcaattttgctcctag 38528121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 30152893 - 30153012
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||  ||||| | ||||||     
30152893 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 30152992  T
129 atcacttagcagcaacaaca 148  Q
    || ||| | || ||||||||    
30152993 atgactaaacaacaacaaca 30153012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38375911 - 38375804
Alignment:
92 attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagc 191  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| | |  || |||||||||||| | ||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||    
38375911 attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacagtatctcatgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacatagc 38375812  T
192 ataattca 199  Q
    | ||||||    
38375811 acaattca 38375804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6147015 - 6146866
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||| |    
6147015 caccaacaacatctcatttctccatacaaaatcatgaatcatgaaa-cccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaatt 6146917  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||    
6146916 gaccatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaatt 6146866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 500
Target Start/End: Original strand, 12031826 - 12031932
Alignment:
397 aaaatgattatgat-gaattctaa-cccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaa 493  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||   | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||    
12031826 aaaatgattatgattgaattctaaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaa 12031925  T
494 tcttcaa 500  Q
    |||||||    
12031926 tcttcaa 12031932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17956274 - 17956169
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| ||||| | |||||| || ||| | || ||    
17956274 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 17956175  T
143 acaaca 148  Q
    ||||||    
17956174 acaaca 17956169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 18910960 - 18911068
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||   ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| ||    
18910960 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18911058  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
18911059 acaacatcaa 18911068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 474
Target Start/End: Original strand, 18970255 - 18970318
Alignment:
410 tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
18970255 tgaaatctaacccccttaccttagttagcacaaat-cctagcccaaacatcaatttagctcctag 18970318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 51158118 - 51158035
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
51158118 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 51158035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 53898721 - 53898575
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  || |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||||||| || |||     
53898721 caacaacatctcatttctcaacat-aaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgat 53898623  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||   ||||  ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||    
53898622 catgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaatt 53898575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21167131 - 21167097
Alignment:
275 atcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcata 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
21167131 atcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata 21167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15936727 - 15936663
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
15936727 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat 15936663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15938569 - 15938505
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
15938569 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgattacaaacatatcat 15938505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Original strand, 8632197 - 8632229
Alignment:
488 cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
8632197 cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 8632229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12030247 - 12030164
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
12030247 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 12030164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Original strand, 14080902 - 14080934
Alignment:
488 cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
14080902 cttgaatcttcaagttcctcttctctccaaccc 14080934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14842661 - 14842578
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
14842661 tttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 14842578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 491 - 519
Target Start/End: Original strand, 55192439 - 55192467
Alignment:
491 gaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
55192439 gaatcttcaagttcctcttctctctaacc 55192467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 513
Target Start/End: Original strand, 43645824 - 43646331
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |  || || ||||||||||||||||||| ||||||    
43645824 acatcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcaaatgacatca-caaatcatgaattatgaacacccaag 43645922  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
43645923 tcatgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 43646022  T
208 agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
43646023 agcataattcaacatatatcactttctcatactttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaaca 43646122  T
308 taattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat 407  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
43646123 taattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaaacacttattcatacaacaattggaaatttacactaaaaatgattat 43646222  T
408 ga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttc 504  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||   | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| |||    
43646223 gactgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttc 43646322  T
505 ctcttctct 513  Q
     ||||||||    
43646323 ttcttctct 43646331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 39 - 520
Target Start/End: Original strand, 67952 - 68433
Alignment:
39 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
67952 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 68051  T
138 cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat 237  Q
    || |||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
68052 caacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcat 68151  T
238 actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||    
68152 actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga 68251  T
338 acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
68252 acaattaatctattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat 68351  T
438 gtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||   ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
68352 attaattccctagctcaagcttcactttagcttctagg-tctctccaactcttgaatcttcaacctcatcttctctctaaccc 68433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 54 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31146451 - 31145985
Alignment:
54 tcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac 153  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || | ||||||| | || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||     
31146451 tcaccaacaataactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaat 31146352  T
154 tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
31146351 tgaacaggaatcttattacaattcaacaaca-catagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatactttgaacataaaat 31146253  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac 353  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||| | || ||||||||||| ||||    
31146252 ttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaattac 31146153  T
354 tcaattaagcacttattcatacaacaa-ttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcc 452  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
31146152 tcagttaagcacttattcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattctctagcc 31146053  T
453 caaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
31146052 caagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagctcctgttctctctaaccc 31145985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 25305423 - 25305874
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
25305423 accaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattg 25305522  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaa-caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
25305523 aacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacacatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 25305622  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttact 354  Q
    ||| ||||||               ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25305623 tcatcaacaa---------------caacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact 25305707  T
355 caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | | | ||||||    
25305708 caattaagcacttattcatacaacaattgtaaaattatact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcatagccc 25305806  T
454 aaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
25305807 aagcttcactttaactcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcctattctctctaaccc 25305874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3052
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
3529 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaa-tcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt 3431  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||   || |  | |||||||||      || || || |  ||| || ||| |||||   |||||||||| ||||      
3430 agcaacaacaacatcaattgaacatgaacctaagcataattcaaca------tatcacaaattgacatttagagaataatatgacatatatcattttcat 3337  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  || |||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||   |    
3336 atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattctaacaatcat 3237  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3236 gaacaattaatcaattactcaattaagcacataatcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 3137  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3136 agatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctcttctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 3052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 36 - 503
Target Start/End: Original strand, 722353 - 722813
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
722353 tcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactt 722452  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||  ||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||  ||| || ||||||||    |||||||||| ||||      
722453 agcagcaactacttcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataa----acatatatcattttcat 722548  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||||| | |    
722549 atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataatatcataattggagcacgaattttaacaattat 722648  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
722649 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgcaaa-ttgcact--aaatgattatgatgaattctaacccctttaccttagtt 722745  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt 503  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
722746 agttcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctctcatcttcttgaatcttcaagtt 722813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 45 - 501
Target Start/End: Original strand, 19666495 - 19666950
Alignment:
45 tttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaac 144  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||    
19666495 tttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaac 19666594  T
145 aacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttga 244  Q
    |||||||| |||||||| |||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  || |||||   ||||||||||    
19666595 aacatcaattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacacttatacatactttga 19666694  T
245 acatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatta 344  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||    
19666695 acatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaatta 19666794  T
345 atcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt 444  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
19666795 atcacttattcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaat 19666892  T
445 ccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
19666893 tcctagcccaaacttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag 19666950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24294792 - 24294328
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    ||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
24294792 accaacaattacttatttctcatccacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattg 24294693  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    ||||||  ||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| |||  |||||    
24294692 aacatgaatctcagcataattcaacatcaacatatcacaatttgacatttggagcataatataacatatatcattttcatatactttgatcattcaattt 24294593  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||    || |||  ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||   |||||||||||||| ||||||    
24294592 caccaacaacaaatcaattatcatcaatttctcacatacaattataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactc 24294493  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
24294492 aattaagaatttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaactttaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaa 24294393  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
24294392 acttcaatttagctcctaggttctctcctcctcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 24294328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19669376 - 19668915
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
19669376 caacaacaactcatttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 19669277  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||  |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||  |  || ||||| | ||||||| ||||||| |||||||    
19669276 catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcatgattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttca 19669177  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||   ||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||    
19669176 ccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaa 19669077  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac 457  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
19669076 ttaatcacttattcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaaccccgttaccttagttagattaattccctagctcaagc 19668978  T
458 ttcactttagctcctaggt-tctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19668977 ttcactttagctcctagctctcttt-caatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 19668915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 141 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22775389 - 22775064
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
22775389 caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaattcaacatatataactttctcatact 22775290  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||             
22775289 ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaa--------- 22775199  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc 440  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
22775198 -ttaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattcttacccccttaccttagttagatc 22775100  T
441 aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggt 476  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
22775099 aattccctacctcaagattcactttagctcctaggt 22775064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 141 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22780767 - 22780442
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
22780767 caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaattcaacatatataactttctcatact 22780668  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||             
22780667 ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaa--------- 22780577  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc 440  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
22780576 -ttaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattcttacccccttaccttagttagatc 22780478  T
441 aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggt 476  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
22780477 aattccctacctcaagattcactttagctcctaggt 22780442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 344
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884952
Alignment:
35 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact 134  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||  |    
24884643 atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctat 24884742  T
135 tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct 234  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||     
24884743 tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataactcacaatatatcactttca 24884842  T
235 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
24884843 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacaacta 24884942  T
335 tgaacaatta 344  Q
    |||| |||||    
24884943 tgaaaaatta 24884952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24571572 - 24571098
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |   |||||| |||| | || | ||||||||||||||| || |||    
24571572 ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaacaa 24571474  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||| ||| ||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
24571473 caacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatatttcaacatatatcattttctcataccttg 24571374  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt 343  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||  | || || |||||||||    
24571373 aacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctatgaacaatt 24571274  T
344 aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat 443  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
24571273 aatcaattacccaattaagcatttattcatacaataattgaaacattgc---aataatgattatgatgaattctaaccccctaaccttagttagattaat 24571177  T
444 -tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt-cctcttctctctaaccc 520  Q
     |||||| |  |||||||| |||||||||||| |   ||||  || |||| |||||||||| || ||||||||||||||    
24571176 ctccctatcttaaacttcaatttagctcctagctctcttccaatttttgattcttcaagttcccccttctctctaaccc 24571098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19433649 - 19433448
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
19433649 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaag 19433550  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
19433549 ccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatttg 19433450  T
208 ag 209  Q
    ||    
19433449 ag 19433448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22580140 - 22579754
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||     
22580140 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcag 22580041  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatacttt 242  Q
    ||||||||| ||| ||||   ||||  |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||    
22580040 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa---agcataattcaaccaattgagcatatttcaacatataacatttttctcatacctt 22579944  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||||||  || |||||  || ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||    
22579943 gatcataaagtttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat 22579845  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 436  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22579844 taatcaattacacaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aatagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 22579754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 259 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23821705 - 23821467
Alignment:
259 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaat 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
23821705 caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttactcaat 23821606  T
359 taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaact 458  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
23821605 taagcacttaagcatgcaataattgaaaaattacact--aaatgattataatgaaatctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagct 23821508  T
459 tcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttca 499  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23821507 tcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttca 23821467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 259 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23830784 - 23830546
Alignment:
259 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaat 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
23830784 caacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttactcaat 23830685  T
359 taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaact 458  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
23830684 taagcacttaagcatgcaataattgaaaaattacact--aaatgattataatgaaatctaacccccttaccttagttagatcaattccctagctcaagct 23830587  T
459 tcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttca 499  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23830586 tcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttca 23830546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 28974026 - 28974489
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
28974026 caccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 28974125  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
28974126 gatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaa-atgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaat 28974224  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  |  ||||||||||| ||||||   || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
28974225 tcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 28974324  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
28974325 ccaaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaatt---gaaataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc 28974420  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      | |||||| ||| |||||||| |   | ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
28974421 ttagacttcaattttgctcctagctctctcccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 28974489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 9636701 - 9637045
Alignment:
35 atcaacccatttta-caaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| || ||  || |||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |    
9636701 atcaacccattttaacaaaaccaacaacaacaagttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctc 9636800  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
9636801 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcataattcacaatatatcattttc 9636900  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||    
9636901 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacaaatttcaacaact 9637000  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
      || | || |||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||    
9637001 aagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaa 9637045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 519
Target Start/End: Original strand, 25601989 - 25602466
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  || ||||||||| | || |  |||||||| || ||||| ||    
25601989 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaaca 25602088  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactt 241  Q
    |||||||||| ||| ||||   ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
25602089 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaa-ttgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactt 25602187  T
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaa 341  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| ||||||||||||||| || ||||  | || |  |||||||    
25602188 tgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatgaacaa 25602287  T
342 ttaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc 440  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
25602288 ttaatcaattcacccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatt 25602385  T
441 aat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctc--ttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    ||| ||||||||  |  ||||| ||| |||| || | |||| || |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
25602386 aatctccctagcttaggcttcaattttgctcata-gctcttcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaacc 25602466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 437
Target Start/End: Original strand, 24277739 - 24278120
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||  |     
24277739 accaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcattta 24277838  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    |||||| |||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
24277839 aacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaattt 24277938  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaattaatcatttact 354  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||  || | || |||||| ||| |    
24277939 caccaacaacaattcaattgtcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt-tcacaactaagagaaaaataatcacttatt 24278037  T
355 caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||||||  ||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
24278038 caattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaaatctaacccccttaccttaattag 24278120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 519
Target Start/End: Original strand, 19660032 - 19660319
Alignment:
230 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac 329  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |  |||    
19660032 tttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaac 19660131  T
330 aactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacc 429  Q
    | ||  |||||| |||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
19660132 atctaagaacaaataatcacttattccattaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact-aaagtgattatgatgaattctaa-ccccttacc 19660229  T
430 ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    ||| |||   | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
19660230 ttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctccaactcttgaatcttcatgatcctcttctctctaacc 19660319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24087537 - 24087295
Alignment:
176 tcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatt 274  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||  ||||| |  ||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
24087537 tcaacaacaacttagcacaattcatcaatttaagcacaattcataatatacccatttatacataccatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt 24087438  T
275 atcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcata 374  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
24087437 atcaccaatttcatgtgctcaaacatatcatcataattagagcccgaattttaacatttatgaataattaatcacttactcaattaagcacttaatcata 24087338  T
375 caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa 419  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
24087337 caacaa-tgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaa 24087295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 27261783 - 27262245
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||| ||||| |    
27261783 caccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaatatcaatt 27261882  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||   |||||   ||       ||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
27261883 gatcatgaaacttat--caatttctcatactttgagcataattcaccaat--gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat 27261978  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac 353  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || || ||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || |  |||||||||||||| ||      
27261979 tgaactaacaacaattcaattatccataactttatacatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca 27262078  T
354 tc-aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
27262079 tccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaataaa--tgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaatctccctagc 27262176  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      |  ||||| |||||||||||| ||    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
27262177 ttaggcttcaatttagctcctagctttcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 27262245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 36890952 - 36890574
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||     
36890952 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaacaattgat 36890853  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||      
36890852 catgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatattccattttctcatactttgaacatgtaattca 36890754  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc 355  Q
    || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| || |    
36890753 actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccc 36890654  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    || ||||||||| ||||||| | ||||||||||    || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36890653 aaataagcactt-ttcataccataattgaaaat---aacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 36890574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 271148 - 271528
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| ||| |  ||||||| |||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
271148 caccaacaacatctcattcctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 271246  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||||  | |||||||||||| |||    
271247 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaat 271345  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    ||  | |||| |||||||| ||| |    
271346 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattca 271445  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
271446 cccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 271528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4448402 - 4448023
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
4448402 caccaacaacatctcatttttcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 4448304  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| || ||||| | | |  ||||  | |||||||||||| |||    
4448303 gatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaatt-gaacatattttcaacacaaacccatttcatacactttgaacatgtaat 4448205  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
4448204 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 4448105  T
353 ctcaattaagcacttattcata-caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4448104 ctcaattaagcactt-ttcatataaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 4448023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16292985 - 16292757
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |  ||||| || |||| ||||||    
16292985 caacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagtacaattcaacaattaaagcacaattgacaatataccattttcgcatact 16292886  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- 339  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||  || |     
16292885 atgaacatgcaatttcaccaacaacagttcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaatagcacaaatttcaacaactaagagca 16292786  T
340 aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||    
16292785 aaataatcacttacttaattaagcactta 16292757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 257
Target Start/End: Original strand, 6094672 - 6094895
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| | || ||  || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
6094672 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattccacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 6094771  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
6094772 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc 6094871  T
234 tcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
     |||||| |||||||| |||||||    
6094872 acatactatgaacatgcaatttca 6094895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23821892 - 23821730
Alignment:
39 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
23821892 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23821793  T
138 cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaa 200  Q
    || |||||||||||| ||||||||  ||| |  | |||||||||| ||||||||| |||||||    
23821792 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattcaa 23821730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23830971 - 23830809
Alignment:
39 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
23830971 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23830872  T
138 cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaa 200  Q
    || |||||||||||| ||||||||  ||| |  | |||||||||| ||||||||| |||||||    
23830871 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattcaa 23830809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 25594980 - 25595275
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  ||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   ||||||  || |    
25594980 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcat---caacaatctctc 25595075  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  ||||| || ||||    
25595076 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaaaaacaacatagcacaattcaacaattagagtacaattcacaatataccattttc 25595175  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||    
25595176 acatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcatttatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcccaaatttcaacaact 25595275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Original strand, 7321841 - 7321960
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaa 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||    
7321841 tgattataatgaattctaacccccttaccttagttagattaattcccaagctcaaacttcaatttagctcctagatctcttccaatccttgaatcttcaa 7321940  T
501 gttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||||||||    
7321941 gttcctcttctctctaaccc 7321960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 25212977 - 25213176
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca--tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactccca 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
25212977 acatcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaac-aatcatgatatatgaacaccca 25213075  T
106 agccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaat 204  Q
    |||||| | |||||| |||||||||  || |||| |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
25213076 agccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaat 25213175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 369
Target Start/End: Original strand, 32465835 - 32466149
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||||| |    
32465835 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt 32465934  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| |||||  ||| |||||||||||||||  ||||    
32465935 gatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatatccatttttcatactttgaacatacaatt 32466033  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac 353  Q
      || |||||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |     
32466034 caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcat 32466133  T
354 tcaattaagcacttat 369  Q
    |||| |||||||||||    
32466134 tcaaataagcacttat 32466149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 213
Target Start/End: Original strand, 22138140 - 22138295
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
22138140 caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa 22138239  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 213  Q
    |||| ||||    | ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
22138240 catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 22138295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 324
Target Start/End: Original strand, 18536818 - 18537002
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatac 239  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||| || ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| |  ||||| | | |||| ||||     
18536818 caacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaatttaacaattagagcacaatttacaatatacccattttcacatat 18536917  T
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    | |||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
18536918 tatgaacatgcaatttcatctacagcaatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 18537002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25265695 - 25265525
Alignment:
35 atcaacccattttaca-aaatcaccaacaacaactcat-ttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| |||||||| ||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
25265695 atcaacccattt-acataaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaat-atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatca 25265598  T
133 cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||||||||||| |||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
25265597 attaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaatt 25265525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24827044 - 24826846
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||   |||| | |||||    
24827044 acatcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaac-aatcatgataaatgagcacccaa 24826946  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||| | |||| | ||||||| |  || |||| |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
24826945 gccataattcataatcaacaacgtatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 24826846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23836975 - 23836599
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||| || | |||||| || ||| | || |||||||| ||| |    
23836975 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaacaacaacaacaacaatt 23836876  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa 252  Q
    || ||||   | ||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  ||  ||| |||  || ||||  | |||||||||||| ||    
23836875 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatatttttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa 23836777  T
253 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattta 352  Q
    || ||| ||| |||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||     
23836776 ttccactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc 23836678  T
353 ctc-aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
     || ||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23836677 atctaattaagcactta-tcattcaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 23836599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28031516 - 28031366
Alignment:
56 accaacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || | || |||||||||||| |    
28031516 accaacaacatctcattttctcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcaacaacaacaacatcaatt 28031418  T
155 g-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    | ||| || |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
28031417 gaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatatcataattcatcaatt 28031366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 15633193 - 15633341
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| |||||||||||| ||    
15633193 accaacaacatcttatttctcactaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcat-agcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 15633290  T
156 aa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    || | ||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
15633291 aaacttgtttctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 15633341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 205
Target Start/End: Original strand, 33128045 - 33128172
Alignment:
81 acaaatcatgaattatgaactcc---caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattc 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||||| | |||||| |||| |  |||||||    
33128045 acaaatcatgagttatgaacaccacccaagccatgaatcattaacaacaatatctcttaaccacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattc 33128144  T
178 aacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||||    
33128145 aacaacaacatgtcataagtcatcaatt 33128172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43643057 - 43642974
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||    
43643057 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatt 43642974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 501
Target Start/End: Original strand, 24884943 - 24885062
Alignment:
382 tgaaaatttacactaaaaatgattatgat-gaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctag-cccaaacttcactttagctcctaggttct 479  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
24884943 tgaaaaattacactaaa--tgattatgattgaattataacccccttaccttagtaagcacaatt-cctagccccaaacttcaatttagctcctaggatct 24885039  T
480 -ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
     | ||  ||||||||||||||||    
24885040 ctaccagttcttgaatcttcaag 24885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25875950 - 25875814
Alignment:
295 aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttac 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||       
25875950 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttat-catacaaataattgaaaatt--- 25875855  T
393 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25875854 ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 25875814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24560964 - 24560867
Alignment:
92 attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacata 189  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||| | ||||||  ||| || ||| |||||||||||||||    
24560964 attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacata 24560867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25265489 - 25265407
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
25265489 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatt 25265407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 288
Target Start/End: Original strand, 20279575 - 20279621
Alignment:
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat 288  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
20279575 tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcat 20279621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12636157 - 12636049
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||   ||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||  || |||| ||    
12636157 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaatccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 12636059  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
12636058 acaacatcaa 12636049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36982671 - 36982458
Alignment:
110 atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag 209  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||| |  || ||   ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||    
36982671 atgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaatt-gag 36982573  T
210 cataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
    || ||||  ||  |  ||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||| |||   | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
36982572 cacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaatt-catgaatacaaacatatcatca 36982475  T
308 taattagagcacaaatt 324  Q
     | || |||||| ||||    
36982474 cagttggagcacgaatt 36982458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19794804 - 19794721
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
19794804 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 19794721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 127
Target Start/End: Original strand, 22283921 - 22284004
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa 127  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| | ||||||    
22283921 atttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgca-acccaagccatgtatcatcatcaacaa 22284004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21197958
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
21198434 attttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaaca 21198335  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21198334 acaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 21198235  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || || ||||||||    
21198234 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaat 21198135  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||   | |    
21198134 taatcaattactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattataatgaattctaacccccttatcttaattatcacca 21198036  T
443 ttccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21198035 attcctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 21197958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837641
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
23837163 atttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 23837262  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
23837263 acaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagttcaacatatatcactttctcatacttt 23837362  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || || ||||||||    
23837363 gaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaat 23837462  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |     
23837463 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatctata-ttaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc 23837561  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      | ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
23837562 gattcctagcccaaggttcactttatctcctaggatctcttcaaattcttgaatcttcaagctactcttctctctaaccc 23837641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5855036
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
5854572 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 5854671  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||      
5854672 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcataattcaacatataacactttcat 5854771  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
5854772 atactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat 5854871  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
5854872 gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaat 5854969  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
5854970 tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 5855036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 15933256 - 15933721
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
15933256 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 15933355  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| |    
15933356 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatttaacactttcac 15933455  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
15933456 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactat 15933555  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
15933556 gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaat 15933653  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
15933654 tagcacaatttcctagcccaggcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 15933721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011931
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
26011452 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 26011551  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |    
26011552 agcaacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac 26011651  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
26011652 atactttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat 26011751  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |    
26011752 gaacaattaatcacttactcaattaaacacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaa---taacccccttaccttaat 26011846  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
26011847 tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttacctcctatgatctctaccacttcttgaatcttcaagcttct-ttctctctaaccc 26011931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 39447034 - 39446572
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
39447034 accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 39446936  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||     
39446935 atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatatttcaacatataacacttcttcatactttaaacatgaaattc 39446836  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
39446835 cactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc 39446736  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
39446735 aattaagcatttattcatacaacaattg-aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaa 39446637  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||||| |||||||| ||| |   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
39446636 gcttcaatttagctcatagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 39446572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38534091
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||| |    
38533607 tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacct 38533706  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
38533707 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcatatttcaacatataccattttctc 38533806  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||| | |    
38533807 atactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattat 38533906  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |    |    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
38533907 gaacaattagtcaattacttaattaagcacttattcatacaataattcatacaacaattcataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtc 38534006  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |  |||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |   ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
38534007 aaatcaatttcctagctctagcttcactttagctcctagctctcttccaatctttgaatcttcaagttcttcttctctctaaccc 38534091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 36 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22735697
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||    
22736127 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagtt 22736028  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca-ctttct 234  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |    
22736027 agcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgatcataattcaacatatatcattttttt 22735928  T
235 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt 334  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | | |||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |            
22735927 tatactttgaacatgaagttttaccaacaacaactcaattatcaaccacttcatgcattc-aacatattatcataattggagcacgaattct-------- 22735837  T
335 tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
22735836 --aacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacattaaaaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagt 22735739  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggt 476  Q
    ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
22735738 tagataaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggt 22735697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 35 - 501
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528848
Alignment:
35 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
33528383 atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaa-aatatctct 33528481  T
135 tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct 234  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||     
33528482 tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcaacatatatcattttca 33528581  T
235 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt 334  Q
     |||||  ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||| ||     
33528582 tatactaagaagatacaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatcta 33528681  T
335 tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttag 433  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
33528682 agaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag 33528779  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcct-cttcttgaatcttcaag 501  Q
    ||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
33528780 ttagcacaaattcctagctcaaacttcactttagctcctaggatctctactacttcttgaatcttcaag 33528848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 185 - 517
Target Start/End: Original strand, 25296265 - 25296598
Alignment:
185 acatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatt 284  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
25296265 acatagaacaattcaacaatttgagcataattcaacatatatcattttcacaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatt 25296364  T
285 tcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattga 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||  | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
25296365 tcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaacaattaattacttactcaattaaacacttattcatacaacaatcaa 25296464  T
385 aaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||     
25296465 aaatttacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcttaggttctctct 25296564  T
484 tcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaa 517  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
25296565 tcttcttgaatcttcaagctcttcttctctctaa 25296598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 33611334 - 33610877
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
33611334 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatatctcatcatcaaatcatgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaa 33611235  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
33611234 caacatcaattaaacatggttctcaacacaattcaacaacaacatagcataattcaatatttatagcataattctcaatatatcactttcacatactttg 33611135  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
33611134 aacatgaattttcaccaacaacaatctaatgatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcatagttagagcacaaattttaacaactatgaacaatt 33611035  T
344 aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||    
33611034 aatcacttattcaattaatcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagctag--caa 33610939  T
443 tt--ccctagcccaaacttcactttagctccta-ggttctttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    ||   ||||||||||  || ||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||    
33610938 ttaatcctagcccaagtttaactttagctcctatgatcctcaccacttcttgaatcttcaag 33610877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 197 - 517
Target Start/End: Original strand, 17285323 - 17285644
Alignment:
197 tcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||    
17285323 tcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaa 17285422  T
297 acatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacacta 396  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
17285423 acatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattattcaattattcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaatttacacta 17285522  T
397 aaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatc 495  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||    
17285523 aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctcctaggatctctccaattcttgaatc 17285622  T
496 ttcaagttcctcttctctctaa 517  Q
    |||||| || ||||||||||||    
17285623 ttcaagctcttcttctctctaa 17285644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 185 - 517
Target Start/End: Original strand, 25758285 - 25758618
Alignment:
185 acatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatt 284  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
25758285 acatagaacaattcaacaatttgagcataattcaacatatatcattttcaaaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatt 25758384  T
285 tcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattga 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||  | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
25758385 tcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaacaattaattacttactcaattaaacacttattcatacaacaatcaa 25758484  T
385 aaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
25758485 aaatttacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctct 25758584  T
484 tcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaa 517  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
25758585 tctttttgaatcttcaagctcttcttctctctaa 25758618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23226368 - 23225891
Alignment:
35 atcaacccattt--tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
23226368 atcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcataatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatca 23226269  T
133 cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt 232  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |  || |||||     
23226268 cttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaatcatttgagcataattcataagttaacactta 23226169  T
233 ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaac 332  Q
      ||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
23226168 tacatacttttgacatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacatc 23226069  T
333 tttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    | ||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
23226068 tatgaacaattaatcatt---ccaattaaacactttttcatacaataattgaaaaattgcact-aaaatgattatgatgaattctaacccctttacctta 23225973  T
433 gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctct 513  Q
     | ||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||    
23225972 atgagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaagcttctcttctct 23225891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 23149736 - 23150218
Alignment:
35 atcaacccattt--tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||    
23149736 atcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23149835  T
133 cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt 232  Q
    ||||||| ||| |||| | | |||||||| |||| |  | ||||   ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    ||| ||||||    
23149836 cttagcaacaaaaacaactattgaacatgattctcatcataatt---caacaacttagcataattcaaccaattgagcataattcataccataccacttt 23149932  T
233 ctcatactttgaa-catgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaa 331  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
23149933 cacatattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattttaacaa 23150032  T
332 ctttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa-cccccttacct 430  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
23150033 ttatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttactcatacaacaa-tgaaaa-ttaaact--aaatgattatgatgaattataaccccccttacct 23150128  T
431 tagttaggtcaatt--ccctagcccaaa-cttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||  |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
23150129 tagttag--caattaatcctagcccaaagcttcactttagctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag--cttcttctctctaaccc 23150218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 171 - 520
Target Start/End: Original strand, 22981366 - 22981710
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
22981366 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattc 22981465  T
271 aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatt 370  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
22981466 aattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcatca--tctgaacaattaatcaattacccaattaagcacttatt 22981563  T
371 catacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc 470  Q
    ||||||| ||||||||| || ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||    
22981564 catacaa-aattgaaaaattgca--atatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccccagctcaagcttcaatttagctc 22981660  T
471 ctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| |   ||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
22981661 ctagatctcttccaatctttgaatcatcaagttcctcttctctctaaccc 22981710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 501
Target Start/End: Original strand, 29306450 - 29306842
Alignment:
111 tgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagc 210  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
29306450 tgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagc 29306549  T
211 ataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||     
29306550 ataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatag 29306649  T
311 ttagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga- 409  Q
    ||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
29306650 ttagagcacgaatattaacatctatgaacaatcaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact-aaaatgattatgat 29306748  T
410 tgaattctaacccc-cttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| | |  |||||||||||||||||    
29306749 tgaattctaacccctcttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcagtttagctcctaagatctctacgacttcttgaatcttcaag 29306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23152100 - 23151643
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||  ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
23152100 caacaacttctcatttatcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaattgaa 23152001  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    || | |||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||    ||| |||||||  | | ||||||||||||||||||    
23152000 cacggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattgggcaaaattcacttcataccactttcatacaatttgaacatgaaatttca 23151901  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||    
23151900 ccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaacaattaatcatttactgaa 23151801  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa-cccccttaccttagttag--gtcaattccctagccca 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||  |||||||||    
23151800 ttaagcacttattcacacaacaa-tgaaaa--tacact--aaatgattatgatgaattctaaccccccttaccttagttagtaatcaat--cctagccca 23151708  T
455 aacttcactttagctccta-ggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | ||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
23151707 agcttcactttagctcctacgatcctcacctcttcttgaatcttcaag--cttcttctctctaaccc 23151643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 23158118 - 23158597
Alignment:
35 atcaacccattt--tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
23158118 atcaacccatttcgtacaaaaccaacaagaacaactcatttttcattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcat---caacaacatca 23158214  T
133 cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt 232  Q
    ||||| | |||||||| | | |||||||| |||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    ||| ||||||    
23158215 cttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcataattcatatcataccacttt 23158314  T
233 ctcatactttgaa-catgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaa 331  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||    
23158315 cacgtattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcatgaattttaacaa 23158414  T
332 ctttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 431  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||    
23158415 ttatgaacaattaatcatttactcaaataagcacttattcatacaacaa--gaaaa-ttacact--aaatgattataatgaattataactcccttatctt 23158509  T
432 agttaggtcaatt--ccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||  ||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||    
23158510 agtta--tcaattaatcctagcccaagcttcactttaactcctaggatcctcacctcttctggaatcttcaag--cttcttctctctaaccc 23158597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18261762 - 18261423
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
18261762 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 18261663  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
18261662 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc 18261563  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||    
18261562 acatactatgaagatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaact 18261463  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcat 373  Q
     |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
18261462 atgaacaaagaatcacttattcaattaaacacttaatcat 18261423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 38635915 - 38635536
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
38635915 caacaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 38635816  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||    
38635815 catgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtataattcacaatatatcattttcgcatattatgaacatgcaatttca 38635716  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||| ||| ||||    
38635715 ccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaagattcacttattcaa 38635616  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
38635615 ttaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttag 38635536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31194606 - 31194129
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||    
31194606 attttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaaca 31194507  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| ||||||||  |   |  | ||||||||||||||||| ||    |  ||| || |||||||||   ||||||||||  |||  | |||||    
31194506 acaacatcaattgaacatggataacaacataattcaacaacaacataacacccattgacatttagagcataatatgacatatatcatcttcatacacttt 31194407  T
243 gaa-catgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaa 341  Q
    ||  |||  ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||   |||||||    
31194406 gatgcattcaattttacccacaacaac-caattatcaccaatttcttacatacaaacagaacatcgtaattagagcacgaattctaacaatcatgaacaa 31194308  T
342 ttaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |    
31194307 ttaatcaattactcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttgcactaaaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttagttagatta 31194208  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| |||||  || ||||||||| ||||||| | |  |||   |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
31194207 attcactagcttaagcttcacttttgctcctatgattcttcaaatctttgaatcctcaagttcttcttctctctaaccc 31194129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Original strand, 22742717 - 22743123
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||  |    
22742717 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaacaaaccaagatttatgaacacccaagccacgaatcatcaacaacaatattcc 22742816  T
134 ttagcagcaac---aacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcact 230  Q
    | | || ||||   |||||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |    
22742817 tcaacaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcatt 22742916  T
231 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataaca 330  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| ||||  ||||    
22742917 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttcaaca 22743016  T
331 actttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttac 428  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||||||||||||||||||    
22743017 actatgaacaaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttac 22743114  T
429 cttagttag 437  Q
    |||| ||||    
22743115 cttaattag 22743123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 53 - 449
Target Start/End: Original strand, 15969794 - 15970190
Alignment:
53 atcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || || | |||||||||||| || |||| ||| |||    
15969794 atcaccaacaacaactcatttctcctctacaa-tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagcaacatcacttaacaacaactacaccaa 15969892  T
153 ctgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaa---catatatcactttctcatactttgaacatg 249  Q
     ||||||||  ||| |  | ||||||||  || |||| || || |  ||| || |||||||||   |   ||||||||| ||||  ||||||||| |||     
15969893 ttgaacatgaatctcagcataattcaacctcatcatatcacaaattgacatttagagcataataatatgacatatatcattttcatatactttgatcatt 15969992  T
250 aaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcat 349  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
15969993 caatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttctttcgtacaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcat 15970092  T
350 ttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattcccta 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
15970093 ttactcaattaagcatttattcatacaataattgaaaaattgcact--aaatgattatgatgaattccaacccccttaccttagttatatcaattcccta 15970190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 33172184 - 33172527
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||| | ||| |    
33172184 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacgcaagctatgaatcatcaacaaccatatctc 33172283  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||   | |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
33172284 tttataacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc 33172383  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||     
33172384 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagtacaaatttcaacaac- 33172482  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
    | || | || |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
33172483 tagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaa 33172527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 45559228 - 45558824
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  || |||||| |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
45559228 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaccacccaagctatgaatcatcaacaacaatatccc 45559129  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
45559128 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc 45559029  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||  ||||  |||||||    
45559028 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcatgaatttcaacaact 45558929  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 430  Q
      || | || |||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
45558928 aagagcaaaataatcacttattcaaataatcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaacccccttacct 45558831  T
431 tagttag 437  Q
    || ||||    
45558830 taattag 45558824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18041823 - 18041479
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||  |    
18041823 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttatgaacacctaagctatgaatcatcaacaacaatatatc 18041724  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||    
18041723 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagtacaattcacaatatatcattttc 18041624  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||  | |||||    
18041623 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtactcaaacatatcgtcataacaagagcacgaatttcagcaact 18041524  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
      || | || |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
18041523 aagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaa 18041479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45465393 - 45465088
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
45465393 caacaacaactcatttcccatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 45465294  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||||||||||| ||||||||  |||||||||  | ||||||||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||    
45465293 catgattctcatcacaattcaacaataacatagctcaattcaacatctagagcataattcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaatttca 45465194  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||   |||||| ||||  |||||||  | | || |||||| ||||||||    
45465193 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacgaatttcaacaactaagca-aaataatcacttactcaa 45465095  T
358 ttaagca 364  Q
    |||||||    
45465094 ttaagca 45465088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22497500 - 22497201
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  || |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | | |    
22497500 atcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcattaacaacaatacctc 22497401  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
22497400 ttatcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc 22497301  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
22497300 acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 22497201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 437
Target Start/End: Original strand, 21680980 - 21681361
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||| || ||| ||||||||||| ||    
21680980 accaacaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattg 21681079  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    | ||||   || |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||    
21681080 atcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatgaaatt 21681179  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac 353  Q
      || ||||| ||||||||||||   ||  | ||  ||||||| || |||||||||||||| ||| |||| || ||  | ||||||||||||| ||| |     
21681180 caactaacaataattcaattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcaa 21681279  T
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
21681280 caaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttatttag 21681361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 20481585 - 20481957
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||     
20481585 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat 20481684  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataat-tcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||      
20481685 catgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaa-ttgagcatattatcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattca 20481783  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca 356  Q
    || |||||||||||||||||    || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | || |  ||||||| |||||| |||  ||    
20481784 actaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaaataatcaattatcca 20481883  T
357 attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20481884 attaagcacttattcatacattaattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattttaacccccttaccttagt 20481957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20573461 - 20573082
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
20573461 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 20573363  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||||  | |||||||||||| |||    
20573362 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccttttcatacactttgaacatgtaat 20573264  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
20573263 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 20573164  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20573163 cccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 20573082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24552851 - 24552462
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||| || || ||| |||||| | || ||| | |||||  | |||||| |||||| | ||| |||| || |||    
24552851 ttttacaaaaccaacgacaacaacttatttcacatcaccaactcatgattcattaacactcaagctctaaatcatcaacaaccatatctcttaacaacaa 24552752  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||| | |||||| |||| |  |||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| ||    
24552751 caacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatg 24552652  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||   | | ||     
24552651 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaaaagcaaaa 24552552  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta 432  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||  ||| |||  | |||||| |||||   ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
24552551 taatcacttattcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattaca-acaaagtgattatgattgaaatctaacccccttacctta 24552462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37653895 - 37653617
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| || |||    
37653895 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatcaaatcatga--tatgaacacccaagccataaatcatcaacaacaatattccttaacaacaa 37653798  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||| | |||||| |||| |  | ||||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| ||    
37653797 caacatcaattaaacatgattctcaacagaattcaacaacaatataaaacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatg 37653698  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
37653697 aacatgcaatttcagcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgcatacaaacacatcaccataattaaagcacgaatt 37653617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19331606 - 19331204
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaa-caacatca 132  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  || |||||| | |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||| |||     
19331606 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgattcatgaacacctaagctatgaatcatcaacaaacaatatct 19331507  T
133 cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt 232  Q
    || |  | |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
19331506 ctcaataacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacaatttgagcataattcacaatatatcatttt 19331407  T
233 ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaac 332  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||  ||||||    
19331406 cacatactatgaacatgcaatttcacca---acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatagtcataacaagagcacgaatttcaacaac 19331310  T
333 tttga-acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacc 429  Q
       || | || |||||| ||| |||| ||||||||||  ||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||| |||| ||||||||||||||     
19331309 caagagaaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaact--aagtgattatgattgaaatctaacccccttaca 19331212  T
430 ttagttag 437  Q
    ||||||||    
19331211 ttagttag 19331204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 171 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20561785 - 20561521
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
20561785 acaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaa-cataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatt 20561687  T
270 caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcactta 368  Q
    ||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||||||||| || || |||||||||||||     
20561686 caattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 20561588  T
369 ttcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    |||||||||  ||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20561587 ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 20561521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233159
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||    
27233348 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 27233249  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
27233248 caacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacattttgagcataattcacaatatatcattttc 27233159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 253 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27233162 - 27232943
Alignment:
253 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattta 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| | |||||| |||    
27233162 tttcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaactaataatcactta 27233063  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctag 450  Q
     |||||||||||||||  ||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   || | |||||    
27233062 ttcaattaagcacttaaccatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaa-ccccttaccttagttagcaaaaat-cctag 27232967  T
451 cccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    ||||||||||| |||| |||||||    
27232966 cccaaacttcaatttatctcctag 27232943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 443
Target Start/End: Original strand, 41246635 - 41247019
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| |    
41246635 caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 41246734  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| || |||||| |||| |||||| |  ||| || |||||| |||||| ||||    
41246735 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttaagcatatttcatcatatacccatttttcctacttttaacatgtaatt 41246833  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac 353  Q
      ||||||||||||| ||||||    || |||||  ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||| |||||||| ||| |     
41246834 caaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcat 41246933  T
354 tcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat 443  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
41246934 ccaattaagcactt-ttcatacaactaattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaactctaacccccttaccttag-taggtcaat 41247019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21259422 - 21259303
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||| |||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||    
21259422 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagcttaagcttcaatttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaa 21259323  T
501 gttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||||||||    
21259322 gttcctcttctctctaaccc 21259303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20648099 - 20647882
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| || |  | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| |    
20648099 caccaacaaaatctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaatt 20648000  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
20647999 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat 20647901  T
254 ttcaccaacaacaattcaa 272  Q
    |  || |||||||||||||    
20647900 tcaactaacaacaattcaa 20647882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20654175 - 20653953
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||| |  | ||||||||| || ||||| |||| ||||||| |    
20654175 caccaacaaaatctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaatt 20654076  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||    
20654075 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaat 20653977  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatc 277  Q
    |  || ||||||||||||||||||    
20653976 tcaactaacaacaattcaattatc 20653953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Original strand, 16002013 - 16002230
Alignment:
93 ttatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagca 192  Q
    |||||||| ||||||   ||||| || |||||||||||| | || || |||||||||||| | ||||||  ||  || |||| |||||||||||||||||    
16002013 ttatgaacacccaagatgtgaataatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatggatcc-accacaaatcaacaacaacatagca 16002111  T
193 taattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaa 291  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |  ||||| ||| |||| ||||   |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||  |    
16002112 caattcaacaattagagcacaatttacaatatactcattttcacatatcatgaacatacaatttcatcaacaacaattaaattatcatcaaattcatata 16002211  T
292 ttcaaacatatcatcataa 310  Q
     ||||||||||||||||||    
16002212 ctcaaacatatcatcataa 16002230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 134
Target Start/End: Original strand, 17285232 - 17285323
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact 134  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
17285232 attttgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcctcaagtcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcact 17285323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 37611645 - 37612022
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac 153  Q
    |||||||||||  |||||||||   |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||||||| |||     
37611645 caccaacaacatttcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat 37611743  T
154 tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaa 251  Q
    ||| ||||   |||   |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | ||||  | |||||||||||| |    
37611744 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgta 37611842  T
252 atttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt 351  Q
    |||  || |||| ||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||    
37611843 attcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt 37611941  T
352 actc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||   |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37611942 catctaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---ataataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 37612022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3431570 - 3431462
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||    
3431570 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca 3431472  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
3431471 acaacatcaa 3431462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22234827 - 22234698
Alignment:
302 tcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaa 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || ||||    
22234827 tcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcattcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaa 22234733  T
400 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22234732 gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 22234698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18118437 - 18118336
Alignment:
178 aacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattat 276  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||| || ||| | ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
18118437 aacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcacaattcaccatataccaatttatgcatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattat 18118338  T
277 ca 278  Q
    ||    
18118337 ca 18118336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20567427 - 20567331
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||||||||||    
20567427 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 20567331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20573620 - 20573524
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||||||||||    
20573620 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 20573524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Original strand, 18612386 - 18612480
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||    
18612386 accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacactcaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaa 18612480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Original strand, 18619291 - 18619385
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||    
18619291 accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacactcaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaa 18619385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20529843 - 20529741
Alignment:
335 tgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
20529843 tgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattg---caataagtgattatgatgaattataacccccttacctta 20529748  T
433 gttaggt 439  Q
    |||||||    
20529747 gttaggt 20529741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Original strand, 25122699 - 25122795
Alignment:
335 tgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25122699 tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatta----taataatgattatgatgaattctaacccccttacctta 25122793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24717152 - 24717034
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||| ||| |  ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || ||    
24717152 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca 24717053  T
143 acaacatcaactgaacatg 161  Q
    |||||| | | ||||||||    
24717052 acaacaaccattgaacatg 24717034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13721217 - 13721109
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||   ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| ||    
13721217 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 13721119  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
13721118 acaacatcaa 13721109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16404965 - 16404900
Alignment:
368 attcatacaacaattgaaaatttacac-taaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
16404965 attcatacaacatttgaaaatttacaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21494725 - 21494625
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||  || |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| ||    
21494725 accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgatatatgcacacccaagttataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 21494627  T
156 aa 157  Q
    ||    
21494626 aa 21494625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41507087 - 41506994
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca 148  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || ||||||||    
41507087 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaaca 41506994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16193816 - 16193733
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||    
16193816 tttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 16193733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16405075 - 16404992
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
16405075 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 16404992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20567268 - 20567194
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacat 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||    
20567268 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacat 20567194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Original strand, 22886320 - 22886406
Alignment:
70 atttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| ||||    
22886320 atttctcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 22886406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 333
Target Start/End: Original strand, 22887945 - 22888016
Alignment:
262 caacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||    
22887945 caacaattcaaatatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaact 22888016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19992988 - 19992950
Alignment:
396 aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19992988 aaaagtgattatgatgaattataacccccttaccttagt 19992950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19993324 - 19993174
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||| |  ||| |||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| |    
19993324 caccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 19993225  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||  |||    |||  |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
19993224 gatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt 19993174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24929087 - 24929037
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat 93  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
24929087 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat 24929037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 29759893 - 29759975
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat 111  Q
    |||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
29759893 tcataatcaacccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat 29759975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21191445 - 21191412
Alignment:
487 tcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21191445 tcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 21191412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24928891 - 24928808
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |||| | || |||||| ||||    
24928891 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatt 24928808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 25296137 - 25296229
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca 126  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| || | ||||||||  ||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
25296137 atcaaccaattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatctaatcatgatatatgaacacctaagtcatgaatcatcaacaaca 25296229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Original strand, 25758157 - 25758249
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca 126  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| || | ||||||||  ||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
25758157 atcaaccaattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttttcatcatctaatcatgatatatgaacacctaagtcatgaatcatcaacaaca 25758249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 39 - 520
Target Start/End: Original strand, 6622 - 7104
Alignment:
39 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagc 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
6622 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttagg 6721  T
139 agcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcata 238  Q
    || ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
6722 agtaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaacatatatcactttctcata 6821  T
239 ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
6822 ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaattataacaac-ttgaa 6920  T
339 caattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||     
6921 caattaatcatttacacatttaagcatttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattcaattctaacccccttaccataattat 7020  T
438 gtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
7021 caccaattcctagcccaaccttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagctccttttctctctaaccc 7104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17223741
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
17224220 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaaca 17224121  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
17224120 acaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatacttt 17224021  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
17224020 gaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaat 17223921  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |     
17223920 taattatttactcaattaagcacttaatcataaaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc 17223821  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | | | |||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
17223820 aattcttagcccaagcttcactttacctcgtaggatctcttccaattcttgaattttcaagttcttcttctctctaaccc 17223741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377972
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
13377485 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac 13377584  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
13377585 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataattcaacatatatcactttc 13377684  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |    
13377685 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt 13377784  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
     |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
13377785 atgaacaattaatcgattactcaatgaatcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaa 13377884  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||   | | | |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
13377885 ttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaagatctcttccaattcttaaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 13377972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48357066
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
48356602 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 48356701  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |    
48356702 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac 48356801  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
48356802 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactat 48356901  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
48356902 gaacaattaatcacttactcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 48356999  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
48357000 tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 48357066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 16915217 - 16914752
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
16915217 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgactt 16915118  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |    
16915117 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcataattcaacatataacactttcac 16915018  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
16915017 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat 16914918  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |    
16914917 gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaagttacact--aaatgattgtgattgaattctaacccctttaccttaat 16914820  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||    
16914819 taggacaaattcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttcaatcttcaag 16914752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 49047943 - 49047481
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
49047943 accaacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 49047844  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
49047843 atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcatatttcaacatataccactctctcatactttgaacatgaaattt 49047744  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
49047743 caccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattctgaacaattaatcaattactc 49047644  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
49047643 aattaagcacttattcatataacaattgaaaaatggca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagttcaa 49047546  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||||| |||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
49047545 gcttcaatttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 49047481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 9838838 - 9839302
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  | ||| || |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
9838838 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt 9838936  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |    
9838937 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac 9839036  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
9839037 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat 9839136  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
9839137 gaacaattaatcacgtactcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaat 9839234  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||   || | ||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
9839235 tagcaaaaattcctcgccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 9839302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 9611266 - 9611731
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  | ||| || |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
9611266 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaactttcatcatcaaatcatgatttatgaacacc-aagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt 9611364  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttga-gcataattcaacatatatcactttct 234  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||     
9611365 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataattcaacatataacactttca 9611464  T
235 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
9611465 catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta 9611564  T
335 tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
9611565 tgaacaattaatcacgtactcaattaagcacttaatgatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaa 9611662  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    ||||   || | ||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
9611663 ttagcaaaaattcctcgccgaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 9611731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14272203 - 14271793
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||    
14272203 acatcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaag 14272104  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||             ||||||||| | ||||||||| |    
14272103 ccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaata-------------acatagcatgaatcaacaattgg 14272017  T
208 agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
14272016 agcatagttcaacatatatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcacca 14271917  T
308 taattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat 407  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
14271916 taattagagcacgaatt-tgacaactatgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattat 14271819  T
408 ga-tgaattctaacccccttacctta 432  Q
    || ||||||||||  |||||||||||    
14271818 gattgaattctaattcccttacctta 14271793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 13274765 - 13275217
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
13274765 accaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 13274864  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||    
13274865 atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcata----------taccactttctcatactttgaacatgaaattt 13274954  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
     || |||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
13274955 tactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc 13275054  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||    
13275055 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaaatggca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctaactcaa 13275152  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      ||||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
13275153 gattcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctcgaaccc 13275217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20583821 - 20583406
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
20583821 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaattaaa 20583722  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
20583721 catgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 20583622  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
20583621 tcaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcttcataattagggcaaaaatttcaacaactatgaacaaataatcacttattcaa 20583522  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    ||| ||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   || | |||| |||||    
20583521 ttaggcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctaccccaa 20583425  T
456 acttcactttagctcctag 474  Q
     || |||||||||||||||    
20583424 gctacactttagctcctag 20583406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 34241477 - 34241031
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
34241477 tcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcactt 34241378  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    | || |||||||||||| | |||||| |||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||                   ||||||| |||||| |    
34241377 atcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa-------------------catatattactttcac 34241297  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||| || ||||| |    
34241296 atacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattataacacgaattttatcaactat 34241197  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
34241196 gaacaattaatcacttactcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 34241099  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||| | | || ||||| |||||||||||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
34241098 tagcacaaattcttaacccaagcttcactttagctcataggatctctaccacttcttgaatcttcaag 34241031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 470
Target Start/End: Original strand, 31501126 - 31501563
Alignment:
35 atcaacccattt-tacaaaatcaccaacaacaa---ctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacat 130  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||   || |||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
31501126 atcaacccatttgtacaaaaacaacaacaacaataacttatttctcatcatcaaatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatat 31501225  T
131 cacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcact 230  Q
    | | || || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    
31501226 ctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcattattcacaatatatcatt 31501325  T
231 ttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataaca 330  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||  | ||    
31501326 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatca 31501425  T
331 actttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatta-tgatgaattctaacccccttacc 429  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||   |||  || |||||| || ||||||||||||||||||||    
31501426 actatgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaattacaact--aattgattattgttgaattctaacccccttacc 31501523  T
430 ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc 470  Q
    ||||||||   || | |||||||||| ||||| ||||||||    
31501524 ttagttagcaaaaat-cctagcccaagcttcaatttagctc 31501563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 38424175 - 38424614
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |    
38424175 atcaacccatttttacaaaacccacaacaacaacttatttttcaccatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctc 38424274  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||  | |||||  |||| |  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
38424275 ttaacaacaacaacatcacttaaacataattctcatcataattcaacaacaacatagaacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc 38424374  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
38424375 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataaccagagcacgaatttcaacaact 38424474  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacctt 431  Q
     |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || || |||| | |||| ||||||| |||||||||    
38424475 atgaacaaagaatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgtttatggttgaaatctaacctccttacctt 38424572  T
432 agttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    ||||||   || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
38424573 agttagcaaaaat-cctagcccaaacttcaatttagctcctag 38424614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 14935319 - 14935757
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||| |    
14935319 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctc 14935418  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| ||   |||||||||  | || ||| |||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
14935419 ttaaca---acaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc 14935515  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||    
14935516 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttcaacaact 14935615  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaac--ccccttacc 429  Q
     ||| |||  | ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||||||||||  |||||||||    
14935616 gtgaccaaagattcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacggccccttacc 14935713  T
430 ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    ||| ||||   || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
14935714 ttaattagcaaaaat-cctagcccaaacttcaatttagctcctag 14935757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 15362912 - 15363350
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||| |    
15362912 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatctc 15363011  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| ||   |||||||||  | || ||| |||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
15363012 ttaaca---acaacatcatttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc 15363108  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||    
15363109 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttcaacaact 15363208  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaac--ccccttacc 429  Q
     ||| |||  | ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||||||||||  |||||||||    
15363209 gtgaccaaagattcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacggccccttacc 15363306  T
430 ttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    ||| ||||   || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
15363307 ttaattagcaaaaat-cctagcccaaacttcaatttagctcctag 15363350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 11287394 - 11287856
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
11287394 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaact 11287493  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
11287494 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat 11287592  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||| |||||| ||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
11287593 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 11287692  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
11287693 cccaattaaacactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc 11287788  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      | |||||| ||| ||||||| | ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
11287789 ttagacttcaattttgctccta-gctctctccactccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 11287856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Original strand, 4484683 - 4485021
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
4484683 atcaacccatttttacaaaaccaagcacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 4484782  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
4484783 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc 4484882  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||  |||||||    
4484883 acatacaatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcat-attaggacacgaatttcaacaact 4484981  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcat 373  Q
     ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
4484982 atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcat 4485021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12248391 - 12248010
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| || || | | |||||||||||||||| |||||||||| | |    
12248391 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatccatt 12248292  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||    
12248291 gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatactttaaacatgaaat 12248192  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac 353  Q
    |  || || |||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||| |||||| |||     
12248191 tcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaattat 12248092  T
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12248091 ccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--atatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 12248010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Original strand, 15358777 - 15359191
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |   |||| || |||||||||||| | ||    
15358777 caacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaa 15358876  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||  |  ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
15358877 catgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 15358976  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
15358977 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcagttattcaa 15359075  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaattta-cactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
     |||| ||||| |||| |||  | |||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||    
15359076 ctaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaat-cctagcccaa 15359172  T
456 acttcactttagctcctag 474  Q
     ||||| ||||| ||||||    
15359173 gcttcaatttagatcctag 15359191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26070531 - 26070154
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
26070531 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 26070432  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||      
26070431 catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattca 26070333  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca 356  Q
    || ||||||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| |||| ||    
26070332 actaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattacaca 26070233  T
357 attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
26070232 attaagcacttattcataccataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttaggt 26070154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26094318 - 26093941
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
26094318 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 26094219  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||      
26094218 catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattca 26094120  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca 356  Q
    || ||||||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| |||| ||    
26094119 actaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattacaca 26094020  T
357 attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
26094019 attaagcacttattcataccataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttaggt 26093941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16570287 - 16569812
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | | || ||||||||||||| |||    
16570287 ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa 16570188  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    ||||||||| ||| ||||   ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| | ||||| || |||||||||||||    
16570187 caacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatacttt 16570088  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  | ||  | ||| |||     
16570087 gaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaa 16569988  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
16569987 taatcaattatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaa 16569891  T
443 t-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | ||||||||  |  ||||| |||||||||||| |     ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
16569890 tctccctagcttatgcttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 16569812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 16595375 - 16595850
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | | || ||||||||||||| |||    
16595375 ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa 16595474  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    ||||||||| ||| ||||   ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| | ||||| || |||||||||||||    
16595475 caacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatacttt 16595574  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  | ||  | ||| |||     
16595575 gaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaa 16595674  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
16595675 taatcaattatccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaa 16595771  T
443 t-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | ||||||||  |  ||||| |||||||||||| |     ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
16595772 tctccctagcttatgcttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 16595850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 474
Target Start/End: Original strand, 28722203 - 28722505
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
28722203 acaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattc 28722302  T
271 aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatt 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||| ||| ||||||||||| ||| |    
28722303 aattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaagattcacttattcaattaagcatttaat 28722402  T
371 catacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttag 467  Q
    ||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||   || |||||||||||||||||||    
28722403 catgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagtta--acaataatccaagcccaaacttcactttag 28722498  T
468 ctcctag 474  Q
    |||||||    
28722499 ctcctag 28722505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 319
Target Start/End: Original strand, 4446168 - 4446453
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcatt-aacaacaacatca 132  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||     
4446168 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatct 4446267  T
133 cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt 232  Q
    |||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||| |||    
4446268 cttatcaacaacaacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagcacaatacataatatatcatttt 4446366  T
233 ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcac 319  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
4446367 cacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtgtgcaaacatatcatcataactagagcac 4446453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Original strand, 28390292 - 28390603
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
28390292 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 28390391  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| || | |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||    
28390392 catgattatcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca 28390491  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | || |||||| |||||||    
28390492 ccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttgaacaactaagagcaaaataatcacttactca 28390591  T
357 attaagcactta 368  Q
    ||||||||||||    
28390592 attaagcactta 28390603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 14940709 - 14941015
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaa--caacaacatc 131  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | | ||  ||    
14940709 atcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaaaactc 14940808  T
132 acttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt 231  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
14940809 tcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattt 14940908  T
232 tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaa 331  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||    
14940909 tcacatactatgaacatgcaatttcac---caacaatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaa 14941005  T
332 ctttgaacaa 341  Q
    || |||||||    
14941006 ctatgaacaa 14941015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 120 - 297
Target Start/End: Original strand, 16919601 - 16919778
Alignment:
120 aacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaa 219  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
16919601 aacaacaatattacttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaa 16919700  T
220 catatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
16919701 catatatcactttctcatattttgaacatgaaatttcaccaataacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaa 16919778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13449094 - 13448783
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
13449094 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatcaacacccaagctacgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 13448995  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
13448994 catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 13448895  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaattaatcatttactca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||  |||||||  ||   || |||||| |||||||    
13448894 ccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatgataacaagagcatgaatttcaacaactaagagtaaaataatcacttactca 13448795  T
357 attaagcactta 368  Q
    ||||||||||||    
13448794 attaagcactta 13448783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 13863197 - 13862821
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||    
13863197 caacaacaacttatttcacattatcaaatcattgattatgaacacccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaa 13863098  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
13863097 catgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 13862998  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc 355  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | || |||||||||| ||| || |    
13862997 accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatctattcaccc 13862898  T
356 aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||||||     ||||||| || |||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13862897 aattaagc-----ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 13862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 15368302 - 15368608
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaa--caacaacatc 131  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | | ||  ||    
15368302 atcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaattctaaaaactc 15368401  T
132 acttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt 231  Q
     |||| || |||||||||||  | |||||| |||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||    
15368402 tcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcattaatttgagcataattcacaatatatcattt 15368501  T
232 tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaa 331  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||    
15368502 tcacatactatgaacatgcaatttcac---caacaatttaattatcacaaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaa 15368598  T
332 ctttgaacaa 341  Q
    || |||||||    
15368599 ctatgaacaa 15368608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17947831 - 17947598
Alignment:
86 tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaa 185  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| ||||||||||    
17947831 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa 17947732  T
186 catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt 285  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |  |||||||| |||| |||||| || ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
17947731 catagcacaattcaacaattagagcacaatttacaatatatcattttcacatactatgcacattcagtttaaccaacaacaattcaattatcaccaattt 17947632  T
286 catgaattcaaacatatcatcataattagagcac 319  Q
    |||| | ||||||||||||||||||  |||||||    
17947631 catgcactcaaacatatcatcataacaagagcac 17947598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7284376 - 7283956
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  | ||||    
7284376 acatcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaactcaag 7284278  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||     
7284277 ccatgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaa-tta 7284179  T
208 agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc 306  Q
    ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||  || || ||||||||||| |||   || ||||   ||  |||||| |||||    
7284178 agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatacaattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatc 7284079  T
307 ataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcata-caacaattgaaaatttacactaaaaatga 403  Q
    |||||||||| || |||| | || |||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||   |||| |||    
7284078 ataattagagtacgaatt-tcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatataaataattgaaaa-ttac---aaaagtga 7283985  T
404 ttatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
7283984 ttatgatgaaaactaacccccttacctta 7283956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 474
Target Start/End: Original strand, 12758965 - 12759383
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||  || |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| ||| |    
12758965 caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcataaatcctgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaatt 12759063  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | |||| ||| | |||||||||| |||    
12759064 gatcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccctttttcacattttgaacatgtaat 12759162  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a 352  Q
    |  |||||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||  | |||||||||||||| || |    
12759163 tcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 12759262  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctag 450  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| || || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
12759263 cccaattaaacactt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctccctag 12759359  T
451 cccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    |  | |||||| ||| ||||||||    
12759360 cttagacttcaattttgctcctag 12759383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 171 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8267882 - 8267675
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc 270  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
8267882 acaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattc 8267783  T
271 aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttat 369  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  |  | || |||||| ||| |||| |||||||||||    
8267782 aattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaactaagtgcaaaataatcacttattcaaataagcacttat 8267683  T
370 tcatacaa 377  Q
     |||||||    
8267682 gcatacaa 8267675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12370107 - 12369728
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| |  || ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||| | |     
12370107 caactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttagcaacaacaacatcaattaat 12370008  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||    |||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
12370007 catgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaatt-gagcatattttcaacagatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 12369909  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcatttactc 355  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||| | ||| || |    
12369908 accaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatgaacaattaattaattcaccc 12369809  T
356 aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||    | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12369808 aattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataaatgataatgatgaaatctaacccccttaccttagttaggt 12369728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15822701 - 15822325
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
15822701 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 15822602  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| || ||||  | | |||||||||| |||    
15822601 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattc-accatttgagcatattttcaacatataccattttcatacattttgaacatgtaat 15822503  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || ||||| |  || ||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
15822502 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcat-acatccaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 15822404  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    | ||||||||||||| ||||||| || || ||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15822403 cccaattaagcactt-ttcatacaaataactgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 15822325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9724046 - 9723808
Alignment:
86 tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaa 185  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||| ||||||||||    
9724046 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaa 9723947  T
186 catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt 285  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||| | |||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
9723946 catagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcagtttcatcaacatcaattgaattatcaccaattt 9723847  T
286 catgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||| |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
9723846 catgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 9723808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 368
Target Start/End: Original strand, 33559710 - 33559938
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||  ||||||  |||||||| |||||||||||    
33559710 caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcccaattcacaatatatcattttctcatact 33559809  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- 339  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||| || ||||  |||| || |||||     
33559810 atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattttaacatatcatcatagcaagaggacgaatttcaacagctatgaaca 33559909  T
340 aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||    
33559910 aaataatcacttattcaattaagcactta 33559938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 374
Target Start/End: Original strand, 46473971 - 46474299
Alignment:
48 acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac 147  Q
    |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||    
46473971 acaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaac 46474070  T
148 atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaac 246  Q
    ||||| | ||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |  |||||  || || | |||| | |||||    
46474071 atcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattaacaatatacacatttccacatattatgaac 46474170  T
247 atgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaattaa 345  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  ||   || |||    
46474171 atgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagtaaaataa 46474270  T
346 tcatttactcaattaagcacttattcata 374  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
46474271 tcacttactcaattaaacacttatgcata 46474299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 3895005 - 3895378
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | |||     
3895005 caacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 3895104  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
3895105 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgcaattca 3895203  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc- 355  Q
    || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||  ||||  | ||| | |||||||||||||| ||  ||     
3895204 actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaattcatcc 3895303  T
356 aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3895304 aattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 3895378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 324
Target Start/End: Original strand, 4438881 - 4439029
Alignment:
176 tcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatta 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
4438881 tcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagcacaattcacaatatatcattttaacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaatta 4438980  T
276 tcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
4438981 tcaccaatttcatgtgtgcaaacatattatcataactatagcacgaatt 4439029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 45452435 - 45452056
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||  ||| |    
45452435 caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaatt 45452337  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| |||    
45452336 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcatg--tca-caaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat 45452240  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-a 352  Q
    |  || ||||||||| ||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || |    
45452239 tcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca 45452140  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45452139 cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattg---caataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 45452056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9319667 - 9319578
Alignment:
221 atatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa 310  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
9319667 atatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataa 9319578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 520
Target Start/End: Original strand, 9080965 - 9081045
Alignment:
439 tcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
9080965 tcaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagtttctcct-tctctaaccc 9081045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8563582 - 8563339
Alignment:
91 aattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatag 190  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| | ||||| | |   |  |||| ||||||||||| ||     
8563582 aattatgaacacccaaggtgtgaatcatcaacaacaacatctcataacaacaacaacatcaattaaacatatattcaatcacaaatcaacaacaacctaa 8563483  T
191 cataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatg 289  Q
    || |||||| | |||||||||||| |||  ||||| ||| ||    |||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||     
8563482 cacaattcatccatttgagcataactcacaatatactcatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcata 8563383  T
290 aattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
8563382 tactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact 8563339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 333
Target Start/End: Original strand, 45149748 - 45149839
Alignment:
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||    
45149748 tgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttcaacaact 45149839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 359 - 475
Target Start/End: Original strand, 16919811 - 16919928
Alignment:
359 taagcacttattcatacaacaattg-aaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||   | | | ||||||||||     
16919811 taagcacttattcatacaacaattgaaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattttaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaag 16919909  T
457 cttcactttagctcctagg 475  Q
    |||||||||||||||||||    
16919910 cttcactttagctcctagg 16919928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 520
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389797
Alignment:
416 ctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctct 515  Q
    ||||||||||||||||| |||   | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctct 13389792  T
516 aaccc 520  Q
    |||||    
13389793 aaccc 13389797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 433
Target Start/End: Original strand, 25124406 - 25124483
Alignment:
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
25124406 tcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 25124483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Original strand, 3049564 - 3049720
Alignment:
59 aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac 158  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| |    
3049564 aacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatc 3049663  T
159 atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt 216  Q
    |||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
3049664 atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcataatt 3049720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Original strand, 4438777 - 4438893
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcatt-aacaacaacatca 132  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||     
4438777 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaagtcatttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatct 4438876  T
133 cttagcagcaacaacat 149  Q
    |||| || |||||||||    
4438877 cttatcaacaacaacat 4438893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39046893 - 39046743
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| |    
39046893 caccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 39046794  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    || ||||   | ||  |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
39046793 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt 39046743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 371055 - 371163
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||  ||| ||    
371055 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcggcaaca 371153  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
371154 acaacatcaa 371163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 199
Target Start/End: Original strand, 45149559 - 45149723
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||  || |||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
45149559 atcaacccattttcacaaaatcaacaacaacaacttaattcacatcacaaactcatgg-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 45149657  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca 199  Q
    ||| || |||||||||||| | ||||||  ||| |  ||||  |||||||| ||||||| ||||||    
45149658 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaaccaacaacatcatagcacaattca 45149723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 434
Target Start/End: Original strand, 44865391 - 44865584
Alignment:
238 actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga 337  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    || |||||  ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||    
44865391 actttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga 44865490  T
338 acaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||   || | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
44865491 acaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaat-ctaacccccttaccttagt 44865584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39046658 - 39046521
Alignment:
295 aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttac 392  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||    
39046658 aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaaataac 39046560  T
393 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39046559 a---aaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 39046521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8268003 - 8267905
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||    
8268003 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaaatcatgatttatgaacatccaagctatgaatcctcaacaacaacatca 8267905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 47289758 - 47290141
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||| || | || |||||| ||||| |||||||| || |||     
47289758 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cacaagccatgaattatcatcatcaacatgacttaacagcaacagcaacaat 47289856  T
154 tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaa 251  Q
    ||| ||||   |||   |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | ||||  | |||||||||||| |    
47289857 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgta 47289955  T
252 atttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt 351  Q
    |||  || |||| ||||||||||||    || |||||  ||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||  | ||  | |||||||||||||| ||    
47289956 attcaactaaca-caattcaattattcataacttcatatatctaaacatggcatcataattagagctcgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt 47290054  T
352 actc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
      || ||||||||| || |||||||||  ||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
47290055 catccaattaagcattt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattaggt 47290141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 434
Target Start/End: Original strand, 143732 - 143993
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaat 268  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | ||||  | |||||||||||| ||||  || |||| ||||    
143732 acaattcatcaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caat 143829  T
269 tcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcactt 367  Q
    ||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
143830 tcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt 143929  T
368 attcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
     || ||||||  |||||||||||    | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
143930 ttt-atacaaataattgaaaattg---caataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 143993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Original strand, 25124120 - 25124204
Alignment:
68 tcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    |||| ||||| || |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||||    
25124120 tcatatctcatcatcaaatcatgatttgtgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaa 25124204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 35094794 - 35095168
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| | || | ||||||||| ||| | || ||||| || | | |    
35094794 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgactaaacaacaacagcaac-att 35094892  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   | |   |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| |||  || ||||  |||||||||||||| |||    
35094893 gatcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccattttcatatactttgaacatgtaat 35094991  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||| |||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| | |||| ||||||||||  ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
35094992 tcaactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattca 35095090  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35095091 tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 35095168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Original strand, 126366 - 126455
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttta-caaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcat 118  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||    
126366 tcataatcaacccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcat 126455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 310
Target Start/End: Original strand, 9250630 - 9250671
Alignment:
269 tcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa 310  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
9250630 tcaattatcaccaatttcttgtattcaaacatatcatcataa 9250671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9321326 - 9321209
Alignment:
36 tcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact 134  Q
    |||| ||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  || |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  |    
9321326 tcaatccattttcacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcacaaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcattaacaacaatatctat 9321227  T
135 tagcagcaacaacatcaa 152  Q
    || || ||||||||||||    
9321226 tatcaacaacaacatcaa 9321209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18980310 - 18980202
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||  ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| ||    
18980310 atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18980212  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
18980211 acaacatcaa 18980202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 324
Target Start/End: Original strand, 13321173 - 13321262
Alignment:
235 catactttgaa-catgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
13321173 catactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt 13321262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18253935 - 18253871
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
18253935 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat 18253871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11580839 - 11580756
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |||| | || |||||| ||||    
11580839 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatt 11580756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13037114 - 13037031
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
13037114 tttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 13037031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 102730
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||    
103211 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcactt 103112  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||| |||||||||    
103111 agaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattccaccatataccactttctc 103012  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |    
103011 atactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattat 102912  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
102911 gaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttaccttagtt 102812  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
102811 agatcaatcccctagctcaagcttcactttagcttctaggttct---ctcttcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 102730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 109568 - 110024
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || |  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
109568 accaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaactg 109667  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
109668 atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttaaacatgaaattt 109767  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||| | | | |||||||        ||    
109768 cattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcatacttggatcacgaattctaacaattatcatcaattaa--------tc 109859  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  |     
109860 aattaagcatttattcatacaacaattgataatttacacaaaagatgattatgatgaattctaaccaccttaccttagttagattaattccctagcttag 109959  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
109960 gcttcactttagctcctaagttcttctctccacttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc 110024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 112812 - 112353
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||   |||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |    
112812 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatga---attatcaacaacatgacttaacaacaacaacataaatt 112716  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||| |||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
112715 gatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattc-actaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaat 112617  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||| |    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
112616 tcaactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 112517  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    | ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
112516 cccaaataagtactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc 112421  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      |  ||||| ||| ||||||| | ||| | | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
112420 ttaggcttcaattttgctccta-gctctcttcaccccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 112353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 430
Target Start/End: Original strand, 131931 - 132166
Alignment:
194 aattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaatt 293  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
131931 aattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactacgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtact 132030  T
294 caaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac- 392  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||  | |||||| ||||     
132031 caaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaac-tagagaaaataatcacttactcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattaca 132129  T
393 actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 430  Q
    |||  || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
132130 act--aattgattatgattgaaatctaacccccttacct 132166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 68248 - 67972
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  ||  ||||| ||||||||  |||||| ||||||||| || ||||| ||| |    
68248 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacaaccaagctatgaatcatcaaaaacaatatctc 68150  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt 232  Q
     |  || |||||||||||| | ||||||  ||| || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| | | |||    
68149 atgacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttt 68050  T
233 ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa 310  Q
    | |||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||    
68049 cacatattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcaccaaattcatgtacttaaacatatcatcataa 67972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 181
Target Start/End: Original strand, 131816 - 131939
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||  |||| || |||||||| ||| | |     
131816 caacaagaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaaaaatatttcttaacaacaacaacaacaattaag 131915  T
158 catgtttcttactacaattcaaca 181  Q
    |||| |||| |  |||||||||||    
131916 catgattctcatcacaattcaaca 131939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 15044784 - 15045269
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
15044784 atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac 15044883  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15044884 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttc 15044983  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |    
15044984 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatt 15045083  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
15045084 atgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgagaatttaaact-aaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttag 15045182  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
15045183 ttagattaattccctagctcaagcttcaccttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctctcctctctaaccc 15045269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41165761
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
41166228 atttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaaca 41166129  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41166128 acaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 41166029  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |          ||||||    
41166028 gaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaatatattatcataattggagcacaaattct----------aacaat 41165939  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   | |    
41165938 taatcaattactcaattaagcacttattcataccacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcacca 41165839  T
443 ttccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
41165838 attcctagcccaagcttcactttagctcctaggaactctccaattcttgaatcttcaagctcctcttttctctaaccc 41165761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15109640 - 15109155
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
15109640 atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac 15109541  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
15109540 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataattcaacatatatcactttc 15109441  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||| | |    
15109440 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactatt 15109341  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
15109340 atgaataattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgagaatttaaact-aaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttag 15109242  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
15109241 ttagattaattccctagctcaagcttcaccttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctctcctctctaaccc 15109155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964536
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
7965000 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 7964901  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |    
7964900 agcaacaacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac 7964801  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |    
7964800 atactt-gaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactat 7964702  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
7964701 gaacaattactcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 7964604  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
7964603 tagcacaaattccttgcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 7964536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7186159 - 7185669
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| ||| |||||    
7186159 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaaca---acaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaa 7186063  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt 206  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| || ||     
7186062 gccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcattta 7185963  T
207 gagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc 306  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
7185962 gtgcacaattcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatc 7185863  T
307 ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatta 406  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
7185862 ataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgatta 7185765  T
407 tgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||    
7185764 tgatgaattctaacctccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctcataggatcctcaccacttcttgaatcttcaag 7185669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 43 - 478
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901630
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
14901197 attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaaca 14901296  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
14901297 acaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcatatttaaacatatatcactttctcatacttc 14901396  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
14901397 aaacatgaaatttcaccaacaacaa-tcaattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaat 14901495  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
14901496 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgcaat-aaaatgattatgatgaaatttaacccccttaccttagttagatcaa 14901594  T
443 ttccctagcccaaacttcactttagctcctaggttc 478  Q
    | ||| |||  || |||||||||| |||||||||||    
14901595 tccccaagcttaagcttcactttaactcctaggttc 14901630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 18276392 - 18276856
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
18276392 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatactcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactt 18276491  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |    
18276492 tgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac 18276591  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |    
18276592 atgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactat 18276691  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
18276692 gaacaattaatcacatactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaatcgcact--aaatgattatgattgaattctaaccccgttaccttaat 18276789  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
18276790 tagtacaatt-cctagctcaagcttcactttagctcctaggatctgtaccacttcttgaatcttcaag 18276856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 59 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 13809776 - 13809320
Alignment:
59 aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac 158  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |   ||||||||||||| || | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
13809776 aacaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatc 13809677  T
159 atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcac 258  Q
    |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
13809676 atgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcatatttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaaatctcac 13809577  T
259 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaat 358  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
13809576 caacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactcaat 13809477  T
359 taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaact 458  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||    
13809476 taagcacttattcatacaataattgaaaaatggca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagct 13809379  T
459 tcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaa 517  Q
    ||| |||||| ||||| |   | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
13809378 tcaatttagcccctagctctctcccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaa 13809320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 52265775 - 52265314
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
52265775 caacatcaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 52265676  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    ||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
52265675 catgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacataaaatttct 52265576  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | || || |||||||||||||| |||| |||    
52265575 ctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaattacccaa 52265476  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaa 456  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||  |      
52265475 ttaaacacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtcagattaatctccctagcttagg 52265378  T
457 cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||| |||||||||||| |   ||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
52265377 cttcaatttagctcctagctctcttccaatctttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 52265314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37956849
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||    
37957314 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcactt 37957215  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |  | ||||||||| |||||||    || |  ||| || |||||||||   |||||||||| ||||      
37957214 agcagcaaccacatcaattgaacatgaatctcagcataattcaacatcaacatattccaaattgacatttagagcataatatgacatatatcattttcat 37957115  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||  |||||   |    
37957114 atactttgatcattcaatttcaccaacaactaatcaattaccaccaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattccaacaatcat 37957015  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37957014 gaacaattaatcaattactcaattaaacaaataatcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 37956915  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
37956914 agatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttggatcttcaag 37956849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 27960950 - 27961412
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |  ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
27960950 accaacaatatctcatttctcaacaataaatcat-aatcatgcatacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattg 27961048  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||     
27961049 atcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaatttagcatatttcaacatataccacttcttcatactttgaacatgaaattc 27961148  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    ||| |||||||||||||||||    || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
27961149 cactaacaacaattcaattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaattatgaacaattaatcaattactc 27961248  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
27961249 aattaagcacttattcatacaacaattg-aaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaa 27961347  T
456 acttcactttagctcctaggt-tctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||||||||| |||||||| | ||||| |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
27961348 gcttcacttttgctcctagctctcttt-caatccttgaatcttcaagttccccttctctctaaccc 27961412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 35 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256259
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |    
41256660 atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctc 41256561  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
41256560 ttaacaacaacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc 41256461  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||    
41256460 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattc-aacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaact 41256362  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctt 431  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
41256361 atgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 41256264  T
432 agtta 436  Q
    |||||    
41256263 agtta 41256259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 15013549 - 15013136
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||| ||||| | ||    
15013549 caacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaa 15013450  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
15013449 catgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaatttca 15013350  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
15013349 ccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattc-aacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaacaattaatcacttattcaa 15013251  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa 456  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||     
15013250 ttaagcacttaaacatacaacaaatgaaaattacaact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaat-cctagctcaag 15013154  T
457 cttcactttagctcctag 474  Q
    ||||||||||||||||||    
15013153 cttcactttagctcctag 15013136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821582
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
19822065 tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacat 19821966  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| |  | |||||||||| |||||| || |||| | || || |||||||||   |||||||||| ||||      
19821965 agcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaataacatatcacaatt-atcatttagagcataatatgacatatatcattttcat 19821867  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    | ||||||| ||   |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    || |||||||| |||||||||  |||||| || | ||| ||   |    
19821866 acactttgatcactcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacatacaaacataacatcataataggagcacgaactctaataatcat 19821767  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19821766 gatcaattaatcaattactcaattaagcacttattcataaaacaattgaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 19821667  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    || ||||||| ||||  | | |||||||||||||||||| |     ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19821666 agatcaattctctagttctagcttcactttagctcctagatctcccccaatccttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 19821582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 43 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 47535328 - 47534891
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||           
47535328 attttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacgtcaatt------- 47535236  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
                ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
47535235 ------------gaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatatttcaacatatatcactttctcatacttt 47535148  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  | ||||||||    
47535147 gaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat 47535048  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    |||||||                ||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |     
47535047 taatcat----------------ttaatcatacaataatggaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc 47534965  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttcctcttctct 513  Q
    | | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
47534964 aattcctcgcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttcttcttctct 47534891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 40905214 - 40904865
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||| |||    
40905214 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaacaa 40905115  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  ||  |||| |||| |||||| ||    
40905114 caacatcaatt-aacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattggagtacaattcacaatgcatcattttcacatactatg 40905016  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||     
40905015 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaag 40904916  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttaca 393  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||    
40904915 taatcatttattcaattaagcacttaaccatgcaattattgaaaaattaca 40904865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18494598 - 18494152
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |  |||||||||||| | |  | ||||||||||||||| || ||||| || ||| |    
18494598 caccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaacaatt 18494499  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| |    
18494498 gatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcacatttcaacatataccatttttctcatactttgatcatgaagt 18494399  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||| ||||    
18494398 ttcaccaacaacaattcaattatcat-aacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatcaattac 18494300  T
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcc 452  Q
     ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||     
18494299 acaattaagcacctattcataccataattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagct 18494203  T
453 caaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt 503  Q
     || | ||| |||||||||||| ||  ||||  | ||||| ||||||||||    
18494202 taagcctcaatttagctcctagatttcttccaatccttgattcttcaagtt 18494152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Original strand, 38764689 - 38765103
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || |||||||||||| | ||    
38764689 caacaacaacttatttctcatcttcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaattaaa 38764788  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||    
38764789 catgattctcatcataattgaacaacaacatcgcataattcaacaatttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatgtaatttca 38764888  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||||||| |||| || |||||| ||| ||||    
38764889 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaacaactatgaa-aaataatcaattattcaa 38764987  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
     |||||||||  |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | | ||||||||    
38764988 ctaagcactttatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaaccctcttaccttaattagcacaaat-catagcccaa 38765084  T
456 acttcactttagctcctag 474  Q
    |||||| ||||||||||||    
38765085 acttcaatttagctcctag 38765103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18238424 - 18238104
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
18238424 caacaacaacttatttcacatcactaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 18238325  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
18238324 catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 18238225  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | || ||||||  || |||    
18238224 ccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacctattca 18238125  T
357 attaagcacttattcatacaa 377  Q
    ||||||||||||  |||||||    
18238124 attaagcacttaagcatacaa 18238104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30232763 - 30232384
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | |||     
30232763 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat 30232664  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||   |||||| | |||||||||| |||||| ||||    
30232663 catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttc 30232565  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||  || ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||    
30232564 accaacaacaattcaattatcat-aacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattacaca 30232466  T
357 attaagcacttattcatacaacaattg-aaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
30232465 attaagcacttattcataccataattgaaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaaccctcttaccttagttaggt 30232384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13442946 - 13442632
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca---tcaact 154  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||   |||| |    
13442946 caacaacaactcatttctcatcatcaattcataatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaaaatctcttaacaacaacaacaacatcaatt 13442847  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
     |||||| |||| |  |||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||    
13442846 aaacatgattctcatcacaattcaacaataacataacacaattcaacatttagagcataattcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaatt 13442747  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttac 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | || |||||| ||||    
13442746 tcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttac 13442647  T
354 tcaattaagcactta 368  Q
    |||||||||||||||    
13442646 tcaattaagcactta 13442632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Original strand, 16732146 - 16732525
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |    
16732146 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaatt 16732245  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
16732246 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat 16732344  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
16732345 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 16732444  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| || |   || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
16732445 cccaattaagcactt-ttcatacactaattaaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacctctttaccttagttag 16732525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50220207 - 50219890
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
50220207 caacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 50220108  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||| |||||||||||| | || ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
50220107 catgattctcatcacaaatcaacaacaacacaacacaattcaacatttagagcacaattcaaaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 50220008  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||   ||| || |||||| ||| |||    
50220007 ccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcgtaacaagagcacaaatttcaacaact---aacaaaataatcacttattca 50219911  T
357 attaagcacttattcatacaa 377  Q
    ||||||||||||  |||||||    
50219910 attaagcacttaagcatacaa 50219890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41917017 - 41916741
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
41917017 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttttgaacactcaagcaatgaatcatcaacaacaatatctc 41916918  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||  | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||    
41916917 ttaacaacaacaacatcagttaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaactcacaatatatcatcttc 41916818  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa 310  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
41916817 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattatattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataa 41916741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 324
Target Start/End: Original strand, 54398391 - 54398629
Alignment:
86 tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaa 185  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| ||||||||||    
54398391 tcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa 54398490  T
186 catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt 285  Q
    |||| || |||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
54398491 cataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatattattttcatatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattt 54398590  T
286 catgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||| | |||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
54398591 catgtactcaaacatatcaacataacaagagcacgaatt 54398629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12837468 - 12837094
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||    
12837468 accaacaacaacttatttctcac-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattg 12837370  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    | ||||   ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
12837369 accatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaatt 12837271  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac 353  Q
      || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| |||   | ||  | || |||||||||| ||| ||    
12837270 caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcac 12837171  T
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
     ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||     | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12837170 ccaattaagcactt-ttcattcaaaaattgaaaat---agcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 12837094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 141 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47468532 - 47468304
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||| ||||||    
47468532 caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacactatatcattttcacatact 47468433  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- 339  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||  || |     
47468432 atgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattacaacagctaagagca 47468333  T
340 aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||    
47468332 aaataatcacttattcaattaagcactta 47468304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13590313 - 13590075
Alignment:
86 tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaa 185  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||| ||||||||||    
13590313 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaa 13590214  T
186 catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt 285  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||| | |||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
13590213 catagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcagtttcatcaacatcaattgaattatcaccaattt 13590114  T
286 catgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||| |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
13590113 catgtacccaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 13590075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 343 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 34177629 - 34177501
Alignment:
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
34177629 taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttagatcaa 34177533  T
443 ttccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||    
34177532 ttccctagctctagcttcactttagctcctag 34177501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 44055892 - 44056273
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||  || | |  |||||||||||| |    
44055892 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaacaacatcaatt 44055991  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||| |  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||   ||| |||||||||||||||| |||    
44055992 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttgaacatgtaat 44056090  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || |||||||||||||   |||  || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
44056091 tcaactaacaacaattcaaaattca-taacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 44056189  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
      ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44056190 tccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 44056273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23270204 - 23269740
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| |    
23270204 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 23270105  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa 252  Q
    || |||| | ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||  ||||||| |||  || ||||  | |||||||||||| ||    
23270104 gatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaa-ttgagtatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa 23270006  T
253 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attt 351  Q
    ||  || ||| |||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| |||     
23270005 ttcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc 23269907  T
352 actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tcccta 449  Q
    |  ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
23269906 atccaattaaacactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctcta 23269811  T
450 gcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||  |  ||||| ||| |||||||| |    |||  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
23269810 gcttaggcttcaattttgctcctagctcaactccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctgaccc 23269740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 16522748 - 16522946
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
16522748 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 16522846  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||| | |||| | |||||||||  || |||| |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
16522847 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 16522946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 439
Target Start/End: Original strand, 34395222 - 34395616
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| || | ||||||||| || ||||| ||    
34395222 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaaca 34395321  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatact 240  Q
    |||||||||| ||| ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||  || ||||  | |||    
34395322 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttcatacact 34395420  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||     | |||||  ||  |||||| ||||||||||||||| || ||||  | ||  | ||||||    
34395421 ttgaacatgtaattcaactaac-acaattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaaca 34395519  T
341 attaatca-tttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagg 438  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    | | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
34395520 attaatcagttcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataagtgataatgatgaattctaacccccttaccttagttagg 34395615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21959733 - 21959352
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||||||  | |||||||| | |||||  |||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||||| |    
21959733 caccaacaacatttaatttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt 21959634  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||| | ||| |||    
21959633 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg-agatgtaat 21959536  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcattta 352  Q
    |  | |||||||||||||| ||||   || |||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | |||||||| || | ||| |    
21959535 tcaatcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattca 21959436  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    | ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21959435 cccaaataagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 21959352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 9295624 - 9295822
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
9295624 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 9295722  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||| | |||||| |||||||||  || |||| |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
9295723 gccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 9295822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 53705003 - 53704627
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| |    
53705003 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 53704904  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    || ||||   | ||  |||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| ||| |  ||| |||||||||||||||  ||||    
53704903 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccatttttcatactttgaacatacaatt 53704805  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac 353  Q
      || |||||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |     
53704804 caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcat 53704705  T
354 tcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
     |||||||||||||| |||||| || ||||||||| | ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
53704704 ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaaataac---aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 53704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 40885659 - 40885458
Alignment:
235 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||| || || | || ||| || |||| || |||       
40885659 catactttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaa-ttcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattttagcaaaca 40885561  T
335 tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaa----aatgattatgatgaattctaacccccttacct 430  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||| || |  ||| |||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
40885560 tgaacaattatccaattattcaattaatcacttattcatacaagaaatagaaaattactctaaataatcatgattatgatgaattctaacccccttacct 40885461  T
431 tag 433  Q
    |||    
40885460 tag 40885458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 55376893 - 55376493
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||    
55376893 tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac 55376794  T
129 atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca 228  Q
    || | ||| || |||||||| ||| ||| ||||   ||||  |||||||| ||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||| ||  ||| ||| |     
55376793 ataatttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaa-ttgagtatattttcacacataccc 55376695  T
229 ctttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataa 328  Q
     ||| |||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  |     
55376694 atttttcatacttagaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcat 55376595  T
329 caactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctt 426  Q
    ||  | ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||     |||| |||||||||||||  |||||||||||    
55376594 cacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattt----caaaagtgattatgatgaagactaaccccctt 55376500  T
427 accttag 433  Q
    |||||||    
55376499 accttag 55376493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 45459099 - 45458744
Alignment:
81 acaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaac 180  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||||| || ||   ||||||||| || || || |||||||||||| ||  ||||   ||||  ||||||||||    
45459099 acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaac 45459000  T
181 aacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcac 279  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||||  |  |||||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||      
45458999 aacagcaaagcataattcaccaatt-gaacatatctttaacatatacaaacttctcatattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatcta 45458901  T
280 caatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aa 377  Q
      | |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||    
45458900 tcacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaa 45458802  T
378 caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
     |||||||||||    | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
45458801 taattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattataa-ccccttaccttagttaggt 45458744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20813638 - 20813435
Alignment:
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  |    
20813638 tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt 20813539  T
334 ttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 431  Q
     ||||||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||| || |||| ||||||    | | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
20813538 atgaacaattaatcaattcacccaattaagca-tttttcatacaaataatttaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 20813443  T
432 agttaggt 439  Q
    ||||||||    
20813442 agttaggt 20813435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 30457880 - 30458257
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||||||| |  |||||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||||||| |||     
30457880 caccaacaacatctcatttctctataacaaaataatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat 30457978  T
154 tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaa 252  Q
    ||| ||||   ||||  |||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| |  |||  ||||||||||||||| ||    
30457979 tgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgtaa 30458077  T
253 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attt 351  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||   || |||||  ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| |||     
30458078 ttcaaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattc 30458177  T
352 actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||   || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
30458178 atccaattaagcactt-ttcatacaaataattcaaaatt---acaataagtaattatgatgaattctaacccccttaccttagt 30458257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 14996107 - 14996255
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- 154  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| |     
14996107 accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta 14996204  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
14996205 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 14996255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19697648 - 19697500
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- 154  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| |     
19697648 accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta 19697551  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
19697550 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 19697500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19708233 - 19708085
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- 154  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| |     
19708233 accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta 19708136  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
19708135 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 19708085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Original strand, 8044920 - 8045016
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||||||||||||||||    
8044920 accaacaacatcttatttctcatcaacaattcatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcagcaacaacatcaa 8045016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 434
Target Start/End: Original strand, 44346816 - 44347179
Alignment:
67 ctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttct 166  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | |||| |||||||| | || |||||||| ||  ||| ||||   |     
44346816 ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca 44346915  T
167 tactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaac 265  Q
    ||  ||||||||  |||||||  | |||||||| ||||| ||||||| ||  ||| ||| | | ||||| | |||||||||||| ||||  || |||| |    
44346916 tatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccattttcttacactttgaacatgtaattcaactaaca-c 44347013  T
266 aattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagca 364  Q
    |||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||||||    
44347014 aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagca 44347113  T
365 cttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
44347114 cttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaactcccttaccttagt 44347179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 819997 - 819819
Alignment:
259 caacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||| |||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || || |||    
819997 caacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaa 819898  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||||| || |||||||||  | | |||| || || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
819897 ttaagcattt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 819819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8872502 - 8872366
Alignment:
295 aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaattta 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||      
8872502 aaacatgtcatcataattagagcacgaatt-tcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt-- 8872407  T
392 cactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
8872406 -ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttactttagt 8872366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 53907966 - 53907873
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||||    
53907966 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaacaacaaca 53907873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 54118344 - 54118261
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
54118344 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatt 54118261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15675327 - 15675224
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||  || ||   ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
15675327 cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc 15675228  T
202 aatt 205  Q
    ||||    
15675227 aatt 15675224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 14951713 - 14951795
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat 111  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
14951713 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat 14951795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Original strand, 31115654 - 31115767
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||  || ||   ||||||||||||||| ||| | |||||| |    
31115654 cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcacc 31115753  T
202 aatttgagcataatt 216  Q
    || ||||||||||||    
31115754 aa-ttgagcataatt 31115767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 47468610 - 47468536
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcat 118  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
47468610 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcat 47468536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 53907640 - 53907602
Alignment:
396 aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
53907640 aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 53907602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 303
Target Start/End: Original strand, 21417471 - 21417532
Alignment:
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatc 303  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||    
21417471 tgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatattcaaacatatc 21417532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 122052 - 122135
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||||||||    
122052 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatt 122135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32460953 - 32460878
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| || |||||| ||| |||||| |||||||||||||    
32460953 accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgatatatgcacacccaagtcataaatcataaacaacaacatca 32460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15675188 - 15675106
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
15675188 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 15675106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5682817 - 5682767
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat 93  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
5682817 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat 5682767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10104349 - 10104284
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
10104349 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 10104284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25119498 - 25119392
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaac-aaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagc 141  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||| ||| |  ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| | || |    
25119498 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaac 25119399  T
142 aacaaca 148  Q
    |||||||    
25119398 aacaaca 25119392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7132342 - 7132246
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||   ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| ||||||||||||    
7132342 caccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa 7132246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 307
Target Start/End: Original strand, 31115795 - 31115858
Alignment:
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
31115795 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 31115858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 457 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 40885434 - 40885370
Alignment:
457 cttcactttagctcctaggttctttcctcttc-ttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
40885434 cttcactttagctcctagattcactccaaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 40885370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 36 - 519
Target Start/End: Original strand, 7728378 - 7728861
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || ||| || | ||||||||||||||    
7728378 tcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcactt 7728477  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
7728478 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatatcactttctc 7728577  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||| || |||| |||||| | |    
7728578 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaattctaacaattat 7728677  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7728678 gaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 7728777  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttc-ttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    || |||||||||| || | | ||||||||||||||||| | ||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
7728778 agatcaattccctggctctagcttcactttagctccta-gctctcttctaatctttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 7728861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 3673818 - 3674303
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| || || |    
3673818 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgc 3673917  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
3673918 ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatataccactttc 3674017  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
3674018 tcatactttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaatt 3674117  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3674118 atgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaa-ttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 3674216  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
3674217 ttagattaattccctagctcaagcttcactttagctcctagatcctctcctcttcttgaatcttcaagctcctcttctctataaccc 3674303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5451134 - 5450647
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||| | ||||||||||||    
5451134 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatcac 5451035  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
5451034 ttagcaacaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcactttc 5450935  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||| |    
5450934 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaatt 5450835  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
5450834 atgaacaattaatcaattactcaattaagcatttatttatgcaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaa 5450735  T
434 tta-ggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
5450734 ttattatcaatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 5450647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 55 - 473
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862604
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
19862186 caccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaatt 19862285  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19862286 gcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 19862385  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttact 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
19862386 tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcacttact 19862485  T
355 caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | |   |||||     
19862486 caattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaatttttagcct 19862584  T
454 aaacttcactttagctccta 473  Q
    ||||||||||||||||||||    
19862585 aaacttcactttagctccta 19862604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 35 - 520
Target Start/End: Original strand, 432419 - 432903
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
432419 atcaacccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttctcatgatcaaatcataaattatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcac 432518  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
432519 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataattcaacatatatcattttc 432618  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |    
432619 tcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaatt 432718  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
432719 atgatcaattaatcatttactcaattaagcacttattcatgcaacaattgaaaaattgcagt--aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 432816  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |   ||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||    
432817 ttagatcaattccctagctctagcttcactttagctcctagctctcttccaattcttgaatcttcaagcttctattctctctaaccc 432903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 141 - 520
Target Start/End: Original strand, 28902254 - 28902632
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28902254 caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 28902353  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||    
28902354 ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca 28902453  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
28902454 attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatc 28902553  T
441 aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
28902554 aattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagcttctctt-tctctaaccc 28902632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 141 - 520
Target Start/End: Original strand, 28938649 - 28939027
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28938649 caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 28938748  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||    
28938749 ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca 28938848  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
28938849 attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatc 28938948  T
441 aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
28938949 aattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagcttctctt-tctctaaccc 28939027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 37983325 - 37983787
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
37983325 tcaacccattttacaaaa---ccaacaacaactcatttttcatcatcaaatcctgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcactt 37983421  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    | || |||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |    
37983422 aacaacaacaacatcaattaaacatgattctcattacaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcataattcacaatatatcactttcac 37983521  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |    
37983522 atactttgaatatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatagagcacaaattttaacaactat 37983621  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
37983622 gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 37983719  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
37983720 tagcacaaatttctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 37983787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 36 - 513
Target Start/End: Original strand, 21616974 - 21617452
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
21616974 tcaacccattttacaaaaccaaccacaacagctcacttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcactt 21617073  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||      
21617074 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcatagttcaacatataacactttcat 21617173  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact-t 334  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
21617174 atacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaa 21617273  T
335 tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
21617274 tgaacaattaatcccttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaa 21617371  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttcctcttctct 513  Q
    ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
21617372 ttagcacaatt-cctagcccaaccttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttcttctct 21617452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Original strand, 23493899 - 23494363
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
23493899 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23493998  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  |||||||||| |  ||  ||||||||||||||| ||||| ||    
23493999 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcatatctcaacatatacctattcttcatactttgaacataaaattcca 23494098  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    | || |||||||||||| ||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||||| | ||||||||||||   ||||||||    
23494099 ctaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaattatgaacaattaattgattactcaa 23494198  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
23494199 ttaagcacttattcatacaacaattg-aaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagc 23494297  T
458 ttcactttagctcctaggttct---ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
23494298 ttcactttagctcctaggttctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 23494363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 32966436 - 32965955
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| || || ||||||| |||||    
32966436 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctcaagccatgaattatcaataacaacaccactt 32966337  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||  ||| |  | ||||||||| ||||||| || ||     || || |||||||||  | ||||||| | ||||      
32966336 agaagcaattacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacatatcacaagatgtcatttagagcataat--atcatatattattttcat 32966239  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |    
32966238 atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcttacattccaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattat 32966139  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32966138 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttatttatacaacaattgaaaattcacactaaaaatgattatgatgaattctaaccctcttaccttagtt 32966039  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
32966038 agatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctcct-tctctaaccc 32965955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 16595486 - 16595948
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |||||| ||||||| || || |||| ||||| ||| || || | ||||||| ||    
16595486 accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg 16595585  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    ||||||  ||| |  | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16595586 aacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattca-caatttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaattt 16595684  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    | | | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||    
16595685 ctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaattactc 16595784  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||    
16595785 aattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaagattaattccatagctcaa 16595883  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      ||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16595884 gtttcactttagctcctaggtcctctccaactcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 16595948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 36 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21222897 - 21222420
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||| ||| |||||| ||  |||||||||| | |||||| || ||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
21222897 tcaacccttttcacaaaaccaataacaacaactgaattctcatcatcaagtcatgatttatgaacactcaatccatgaatcatcaacaacaatatcactt 21222798  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||      
21222797 agcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcataattcaacatataacactttcat 21222698  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
21222697 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat 21222598  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
21222597 gaacaattaatca-atactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaataattatgattgaactctaacccccataccttaat 21222501  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttcctcttctct 513  Q
    ||   | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
21222500 tatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttcttcttctct 21222420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 178 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 21297322 - 21297000
Alignment:
178 aacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatc 277  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
21297322 aacaacaacttagcacaattcaacaattttgacataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatc 21297223  T
278 accaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
21297222 accaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaa 21297123  T
378 caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggtt 477  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
21297122 caaatgaaaaattacact-aaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctatcccaagcttcactttagctcctaggtt 21297024  T
478 ctttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    || |||||||||||||||||||||    
21297023 ctctcctcttcttgaatcttcaag 21297000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 180 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21310854 - 21310557
Alignment:
180 caacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcac 279  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
21310854 caacaacttagcacaatttaacaattttagcataattcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcac 21310755  T
280 caatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaaca 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
21310754 caatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaaca 21310655  T
380 attgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttc 478  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
21310654 aatgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagttggatcaattccctagcccaagcttcactttatctcctaggttc 21310557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 6456580 - 6457016
Alignment:
35 atcaacccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |    
6456580 atcaacccgtttgtacaaaaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctc 6456679  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
6456680 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttc 6456779  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
6456780 acatactatgaacatgcaatttcac---caacaattcaattatcgccaatttcatgtattcaaacgtatcttcataattagagcacgaatttcaacaact 6456876  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacctt 431  Q
     ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||| ||||||||||||| |||    
6456877 atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaaatctaacccccttatctt 6456974  T
432 agttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    ||||||   || | |||| ||||| ||||| ||||||||||||    
6456975 agttagcaaaaat-cctaacccaagcttcaatttagctcctag 6457016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 470
Target Start/End: Original strand, 29917931 - 29918356
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| || | |||| || | |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||    
29917931 ttttacaaaaccaacgacaataatttatttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaa 29918030  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||  | |||||| |||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||  |||||||   ||| |||||| ||    
29918031 caacatcagttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataattcacaatatatcctgttcacatactatg 29918130  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||      
29918131 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttcaacaactatgaacaaaa 29918230  T
344 aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |    
29918231 aatcacttattcaattaagcatttaatcatgcaattaatgaaaagttacaact--aattgattatggttgaaatctaacccccttaccttagtta-gtga 29918327  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctc 470  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||||    
29918328 acatcctagcccaaacttcaatttagctc 29918356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 520
Target Start/End: Original strand, 19405503 - 19405980
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||||||| || ||| ||    
19405503 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaa 19405602  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    ||| ||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||    
19405603 caatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatacttt 19405702  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||   || |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||  | ||||||||    
19405703 gaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaacaat 19405802  T
343 taatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
19405803 taatcaattcacccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatta 19405900  T
442 at-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    || ||||||||  |  ||||| |||||||||||| |     ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
19405901 atctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 19405980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23981806 - 23981451
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
23981806 atcaacccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatca-caaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcac 23981708  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |  || || ||      
23981707 ttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacatttat 23981608  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||  |    
23981607 acatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcactt 23981508  T
334 ttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatt 389  Q
     ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
23981507 atgaacaattaatcaatgcactaaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt 23981451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Original strand, 24084034 - 24084437
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||  |    
24084034 atcaacccatttttacaaaaccaaccacaacaacttattt-tcatcatcaaatcatgatttactaacacccaagccatgaatcttcaacaacaatatttc 24084132  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| ||||    
24084133 ttagcaacaacaacatcaattaaacatgattcacatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttc 24084232  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||   | ||| |    
24084233 acatactatgaacatgtaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagggcacgaatgtcaccaatt 24084332  T
334 -ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacct 430  Q
      ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
24084333 aatgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaatccccttacct 24084430  T
431 tagttag 437  Q
    |||||||    
24084431 tagttag 24084437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 368
Target Start/End: Original strand, 22885668 - 22885932
Alignment:
104 caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||| ||    
22885668 caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcaacataattcaacaacaacataacacaattcaataa 22885767  T
204 tttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatc 303  Q
    |||||||| ||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22885768 tttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatc 22885867  T
304 atcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||||  ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||    
22885868 atcataattaaagcacgaatttcaacaaccatgaacaaattatcaattattcaattaagcactta 22885932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11336992
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||| || | |||| |||| |||||||| |||||||||||| |    
11337455 caccaacaacatctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaatt 11337357  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||    
11337356 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaa-atgagcatattttcaacatttaccatattctcatactttgaacatgtaat 11337258  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || |||||||||||||||||    || |||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||| | ||| |    
11337257 tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaaccaattca 11337158  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
11337157 tccaattaagcacttattcatacaataattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc 11337061  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||| ||||| ||| |||||||| |     ||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
11337060 tcaagcttcaattttgctcctagctctcccccaatccttgattcttcaatttcctcttctctctaaccc 11336992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26560096 - 26559771
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||  || ||| || |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||| |||    
26560096 ttttacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaattcacgatttatgaacacccaagccaagaatcatcaccaacaatatctcttagcaacaa 26559997  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||| | |||||  |||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| ||    
26559996 caacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatg 26559897  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaat 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||| ||||  ||||||| |||   ||     
26559896 aacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaatttcaacaactatgattaaaa 26559797  T
343 taatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
26559796 taatcatttattcaattaagcactta 26559771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Original strand, 21109758 - 21110005
Alignment:
86 tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaa 185  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| ||||||||||    
21109758 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaataacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaa 21109857  T
186 catagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt 285  Q
    |||| || |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
21109858 cataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattattaccaattt 21109957  T
286 catgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||  |||||||    
21109958 catgtactcaaacatatcatcagaacaagagcacgaatttcaacaact 21110005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1168500 - 1168211
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||||    
1168500 tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac 1168401  T
129 atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatc 227  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||| ||||   ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
1168400 atgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatatc 1168302  T
228 actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca 318  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||| ||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
1168301 attttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagca 1168211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16835590 - 16835291
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||| || | ||| || ||  || |||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
16835590 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacagcttaattcacatcacaaactcatgatttatgaacatccaagctatgaatcatcaacaacaacatctc 16835491  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || ||||||||| || | ||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||  | ||||    
16835490 ttaacaacaacaacattaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcgacaattagagcacaattcacaatatactattttc 16835391  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
16835390 acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaaatcaattatcaccaatttcatgtacccaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact 16835291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 444
Target Start/End: Original strand, 20712056 - 20712440
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||     
20712056 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgat 20712155  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataat-tcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
20712156 catgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattatcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 20712254  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc 355  Q
    | ||||||||||||| |||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| |||| | |  | | ||||||||||||| ||| ||||    
20712255 atcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatt-tcatcattatgaacaattaatcaattcactc 20712353  T
356 aattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt 444  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||   |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
20712354 aattaagcactt-ttcatacaagtaattgaaaattgcaa--ataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatt 20712440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 519
Target Start/End: Original strand, 23466552 - 23466875
Alignment:
194 aattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaat 292  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  ||    
23466552 aattcaaccaattgagcatatttcaacatacaccatttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatca-taacttcttacat 23466650  T
293 tcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac 392  Q
     ||||||| |   ||||||| |||||| |||| ||| || | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||       
23466651 acaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaacaattaatcaattacacaattaatcacttattcatacaataattgaaaatt--- 23466747  T
393 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttg 491  Q
     | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |  ||||| ||| |||||||| |   |||| || ||||    
23466748 gcaataattgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctctcttccactccttg 23466847  T
492 aatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||    
23466848 attcttcaaattccccttctctctaacc 23466875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23234776 - 23234432
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||||| || ||  || |||||| |||||||  | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
23234776 atcaacctattttcacaaaaccaacaacaacaatttatttcacatcacaaactcatgatttatgaaaactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 23234677  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| ||  ||||||||||| | |||||| |||| |  || | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
23234676 ttaacaataacaacatcaattaaacatgattctcatcactaatcaacaacaaaatagcacaattcaataattagagcacaattcacaatatatcattttc 23234577  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
23234576 acatactataaacatgcaattacaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtacttaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 23234477  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
      || | || |||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||    
23234476 aagagcaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaa 23234432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 280 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 24225391 - 24225171
Alignment:
280 caatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaaca 379  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||     
24225391 caatttcatatatacaaacatatcaccataattaaggcacgaaattcaacatctaagaacaattaatcacttaatcaattaagcacttaaccatacaact 24225292  T
380 attgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttc 478  Q
    | |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
24225291 agtgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaactcccttaccttagttagcacaatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatc 24225195  T
479 t-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    | | || |||||||||||||||||    
24225194 tctaccacttcttgaatcttcaag 24225171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 432
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584405
Alignment:
9 catcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatg-aactcccaag 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||  ||||||    
11583982 catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaaacccaag 11584080  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaatt---caacaacaacatagcataattcaacaat 204  Q
    |||||||| || | |||| | || ||| | || |||||||| | | ||| ||||   | ||  ||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||     
11584081 ccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaa- 11584179  T
205 ttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatc 303  Q
    |||||||||  ||||||||||| |  ||||  | ||||  |||||||| ||  || |||||||||||||||||    || |||||  || |||| || ||    
11584180 ttgagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtc 11584279  T
304 atcataattagagcacaaattataacaact-ttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaa 400  Q
    ||||||| |||||||| |||| | || |||  ||||||||||| | ||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   ||||     
11584280 atcataaatagagcacgaatt-tcaccactcatgaacaattaattaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaag 11584373  T
401 tgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
11584374 tgattatgatgaattctaacccccttacctta 11584405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 324
Target Start/End: Original strand, 23417198 - 23417488
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | | |    
23417198 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatacctc 23417296  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt 232  Q
     || || |||||||||||| | ||||||  | | || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| | | |||    
23417297 ataacaacaacaacatcaattaaacatgaatgtcaccacaaatcaacaacaacatagcacaattcagcaattagagcacaattcacaatataccaatttt 23417396  T
233 ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    | |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
23417397 cacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaatcatcaccaaattcatgtactcaaacaaatcatcataacaagagcacgaatt 23417488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24183286 - 24183022
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |  ||||  | |||||||||||| ||||  || ||||||||||    
24183286 acaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatacccttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaatt 24183188  T
270 caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcactta 368  Q
    ||||||||    | |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || || |||||||||||||     
24183187 caattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 24183089  T
369 ttcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    |||||||||  ||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24183088 ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 24183022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 109158 - 108960
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
109158 acatcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 109060  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||| | |||| | |||||||||  || |||| |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
109059 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 108960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 16105573 - 16105771
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||    
16105573 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacctaa 16105671  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||| | |||| | |||||||||  || |||| |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
16105672 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 16105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 21397066 - 21397451
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac- 153  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||| |||| ||||     
21397066 caccaagaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaaca 21397165  T
154 --tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatg 249  Q
      ||| ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | ||||  | ||||||||||||    
21397166 attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatg 21397264  T
250 aaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcat 349  Q
     ||||  || |||| ||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||||     
21397265 taattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa 21397363  T
350 ttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||  || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21397364 ttcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 21397451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 28261498 - 28261869
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | || |||||| ||| | || |||||||| ||| |    
28261498 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 28261597  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    || |||    | ||  |||||| | ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||  ||| ||||    || |||||||||||||||  ||||    
28261598 gatcataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatat----ttttcatactttgaacatacaatt 28261692  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatcatttac 353  Q
      || |||||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| ||||||||| |||||||| |||| | || |||| |||||||||||||| ||      
28261693 caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatt-tcaccacttatgaacaattaatcaattca 28261791  T
354 tc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28261792 tccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 28261869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 333
Target Start/End: Original strand, 19873934 - 19874016
Alignment:
251 aatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
19873934 aatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 19874016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22662652 - 22662572
Alignment:
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
22662652 tcaattaaacacttattcatacaacaaatgaaaact-acactaaa--tgattatgatgaattctatcccccttaccttagttag 22662572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 7528879 - 7529028
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| ||    
7528879 accaacaacatctcaattcacaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 7528977  T
156 -aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
7528978 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 7529028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11763659 - 11763496
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactt--tgaacatgaaatttcaccaacaacaat 268  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |  ||| | | || |  |||||||||||||||| ||||| |||     
11763659 acaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatacccatttat-acacctcatgaacatgaaatttcatcaacatcaac 11763561  T
269 tcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    |||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||    
11763560 tcaattatcatcaaattcatctactcaaacatatcatcgtaacaagagcacaaatttcaacaact 11763496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24225634 - 24225431
Alignment:
9 catcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-ac-aaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaat-catgaattatgaactccca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |  || || | |||||| |||| ||||||||| ||||    
24225634 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaatcctcaacaacaacttaaatcacatc-acaaatccatg-attatgaacaccca 24225537  T
106 agccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||  ||||||||| |||||||| ||| | || || ||| |||||||| | ||||||  |   || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
24225536 agttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaataacatcaattaaacatgaattccaccacaaatcaacaacaaaatagcacaattcaacaatt 24225437  T
206 tgagca 211  Q
     |||||    
24225436 agagca 24225431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 434
Target Start/End: Original strand, 4865418 - 4865615
Alignment:
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    |||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  |    
4865418 tcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccattt 4865517  T
334 ttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 431  Q
     |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
4865518 atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctt 4865612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Original strand, 21906697 - 21906844
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||||   | |||||||||||| |    
21906697 caccaacaacatttcatttctcagccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactt---aacaacaacatcaatt 21906793  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
21906794 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcatcaatt 21906844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 433
Target Start/End: Original strand, 25005082 - 25005170
Alignment:
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
25005082 taatcacttattcaattgagcacttattcatacaacaattgaaaaactaaact--aaatgattatgatgaagactaacccccttactttag 25005170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 161
Target Start/End: Original strand, 23466434 - 23466540
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||  || | ||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
23466434 caccaacaacatatcattcctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaatt 23466533  T
155 gaacatg 161  Q
    || ||||    
23466534 gatcatg 23466540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9730672 - 9730564
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  || |||| ||    
9730672 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaatatgtctcagcaaca 9730574  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
9730573 acaacatcaa 9730564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22054071 - 22053968
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||  || ||   ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
22054071 cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc 22053972  T
202 aatt 205  Q
    ||||    
22053971 aatt 22053968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 24475560 - 24475653
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||||    
24475560 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 24475653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18531297 - 18531202
Alignment:
110 atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||  || ||   ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
18531297 atgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaatt 18531202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 19873824 - 19873927
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| | ||| || ||  || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
19873824 caacaacaacttaattcacatcacaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 19873923  T
158 catg 161  Q
    ||||    
19873924 catg 19873927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 17909485 - 17909633
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact- 154  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |  | ||||||||||||||| |     
17909485 accaacaacatcttatttctcacc-accaatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtcgcatcagcaacaacatcaatta 17909582  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
17909583 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 17909633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 2031787 - 2031880
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca 148  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || ||||||||    
2031787 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaaca 2031880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 22882391 - 22882455
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagc 108  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||    
22882391 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcaacatcaattcatgatttatgaacacccaagc 22882455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 23507128 - 23507211
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| || | |||||| ||||    
23507128 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatt 23507211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18531166 - 18531084
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
18531166 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 18531084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5621844 - 5621810
Alignment:
275 atcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcata 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
5621844 atcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcata 5621810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 11342635 - 11342717
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat 111  Q
    |||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
11342635 tcataatcaacccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat 11342717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1168127 - 1168098
Alignment:
405 tatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
1168127 tatgatgaattctaacccccttaccttagt 1168098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10778259 - 10778151
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||   ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| ||    
10778259 atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 10778161  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
10778160 acaacatcaa 10778151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21646667 - 21646634
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
21646667 tgattatgatgaattttaacccccttaccttagt 21646634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 159
Target Start/End: Original strand, 34939303 - 34939360
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaaca 159  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
34939303 cccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaaca 34939360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Original strand, 35444 - 35921
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
35444 attttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 35542  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    | |||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
35543 aaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataattcaacatatatcactttctcatacttt 35642  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
35643 gaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataagaactttgaacaat 35742  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |     
35743 taatcttttactcaattaagcacctattcatacaacaattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc 35841  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
35842 aattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc 35921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Original strand, 21623133 - 21623610
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
21623133 attttaccaaactaccaacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaaca 21623232  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21623233 acaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 21623332  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||  | ||||||||    
21623333 gaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaat 21623432  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |     
21623433 taatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgagaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc 21623531  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
21623532 aattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttcaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc 21623610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 59 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 25367503 - 25367043
Alignment:
59 aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac 158  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
25367503 aacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaac 25367404  T
159 atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcac 258  Q
    |||  |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
25367403 atgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcatatttcaacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctc 25367304  T
259 caacaacaattcaattatc-accaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
     ||||||||||| |||||| |  || |||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| || |||||    
25367303 taacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgctcaa 25367204  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||      
25367203 ttaagcacttattcatacaataattgaaaatttacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagctagatcaattctctagccaaaga 25367105  T
458 ttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25367104 ttcactttagcttataggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 25367043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 36 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361617
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
22362054 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 22361955  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
22361954 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacttatgtcactttctc 22361855  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |    
22361854 atactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctat 22361755  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
22361754 gaacaattaatcatttgctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattac---taaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 22361658  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg 475  Q
    ||   | | | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
22361657 tatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctcctagg 22361617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16888059 - 16887597
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||| ||||| ||||    
16888059 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaa 16887960  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||  |  || |||||   || |||||||||||| || ||||    
16887959 catggttctcatcataattcaacaacaacataacataattcacccaattgagcataattcacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca 16887860  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||    
16887859 ccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttattcaa 16887760  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac 457  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |    
16887759 ttaatcacttattcatacaataattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattccctagttcaagc 16887660  T
458 ttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
16887659 ttcactttagctcctatgttctctcctcttcttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 16887597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381649
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
18381965 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 18381866  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18381865 acaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 18381766  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18381765 gaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 18381666  T
343 taatcatttactcaatt 359  Q
    ||||||||||| |||||    
18381665 taatcatttacacaatt 18381649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 520
Target Start/End: Original strand, 18398890 - 18399378
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||    
18398890 tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaac 18398988  T
129 atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
18398989 atcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatatttcaacatatacta 18399088  T
229 ctttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataa 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||    
18399089 ttttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaa 18399188  T
329 caactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttac 428  Q
    ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18399189 caattatgaacaattagtcaattactcaattaagcacttattcatacaataattg-aaatttacact-aaaatgattatgaagaattctaacccccttac 18399286  T
429 cttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||| | ||| | | |  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
18399287 cttagttagattaatctccctagcttagacttcaattttgctccta-gctctcttcaccccttgatttttcaagttcatcttctctctaaccc 18399378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 33538647 - 33538198
Alignment:
47 tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaa 146  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||    
33538647 tacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaa 33538548  T
147 catcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaac 246  Q
    |||||| | |||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
33538547 catcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacctttagagcataattcacaacatatcactttcacatactttgaac 33538448  T
247 atgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaat 346  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
33538447 atgcaatttcaccaacaacaattcaatt-tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaat 33538349  T
347 catttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattc 445  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |     
33538348 cacttactcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttcgcacaaatt 33538251  T
446 cctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatctt 497  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||    
33538250 cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatctt 33538198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 44 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18629892 - 18629433
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
18629892 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 18629793  T
144 caaca---tcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    |||||   |||| | |||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
18629792 caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcaacattcagagcataattcacaatataccactttcacatact 18629693  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
18629692 ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca 18629593  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
18629592 attaatcacttattcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagca 18629495  T
440 caattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaa 500  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
18629494 caaattcctagcccaagcttcactttacctcctaggatctataccacttcttgaatcttcaa 18629433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 104 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21411270 - 21410856
Alignment:
104 caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 203  Q
    |||||||||||| || || |||| ||||| ||| || || | ||||||| || |||||  ||| |  | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
21411270 caagccatgaattataaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattgcacatgaatctcagcataatccaacatcaacatagcataattca-caa 21411172  T
204 tttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatc 303  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |    
21411171 tttgagcatatttcaacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttcatgcattcatacataac 21411072  T
304 atcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatga 403  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
21411071 atcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcctcaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttacactaaaa-tga 21410973  T
404 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagtt 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
21410972 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaagcttcactttagctcctagattctctcctcttcttgaatcttcaagtt 21410873  T
504 cctcttctctctaaccc 520  Q
    ||| |||||||||||||    
21410872 ccttttctctctaaccc 21410856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35135818
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
35136279 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa 35136180  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | |||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  || |||||   || |||||||||||| || ||||    
35136179 catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattcacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca 35136080  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||   ||    
35136079 c-aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaattatctaa 35135981  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattg-aaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa 456  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||     
35135980 ttaatcacttattcatacaataattgaaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaag 35135882  T
457 cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
35135881 cttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctctcctctctaaccc 35135818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17083496 - 17083050
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |||||    
17083496 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaa 17083397  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||                   ||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
17083396 gccatgaatcatcaacaacaacatcaatta-------------------aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacattta 17083316  T
207 gagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc 306  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
17083315 gagcacaattcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatc 17083217  T
307 ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatta 406  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
17083216 ataattagagcacgaatattaacaactatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgatta 17083119  T
407 tgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt--ccctagcccaaacttcactttagctcctagg 475  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||| || |||||||||||||||||||    
17083118 aaatgaattctaacccccttaccttagttag--caattaatcctagccgaagcttcactttagctcctagg 17083050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33325134
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
33324673 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa 33324772  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | |||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  || |||||   || |||||||||||| || ||||    
33324773 catggttctcatcataattcaaccacaatatagcataattcatccaattgagcataattcataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattca 33324872  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||  |||    
33324873 c-aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaattatccaa 33324971  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaa-atttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa 456  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||     
33324972 ttaatcacttattcatacattaattgaaataattacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatgaattccctagctcaag 33325070  T
457 cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
33325071 cttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatctttaagttcctctcctctctaaccc 33325134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Original strand, 25919571 - 25920055
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
25919571 tcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatat 25919670  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||||||||| || || | | || || ||| |||||   |||||||||| ||||      
25919671 agcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcacaaattatcatttagagtataatatgacatatatcattttcat 25919770  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    | |||| || ||   |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||     | |||| ||| |||||||||  |||||| |||| ||| ||   |    
25919771 acacttggatcactcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacgtacaaatataacatcataataggagcacgaattctaataatcat 25919870  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25919871 gaccaattaatcaattactcaattaagcacttattcattcaacaaatgaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 25919970  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |     ||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
25919971 agatcaattccctagttctaacttcactttagctcctagctctcccccaatccttgaatcttcaagctcctctactctctaaccc 25920055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17557258 - 17556866
Alignment:
83 aaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaa 182  Q
    ||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |  ||||||||||||    
17557258 aaatcatgatttatgaacacctaaactatgaatgattaacaacaatattagttagcaacaacaacatcaattaaatatgattataatcacaattcaacaa 17557159  T
183 caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa 282  Q
    |||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
17557158 caacatagca-aattcaacatctatagcataattcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa 17557060  T
283 tttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaatt 382  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | || |||  | |    
17557059 tttcatgca-tcaaacatatcatcataattagagcacgaatt-taacaactatgaacaaataatcaattattcaattaagcacttaataatgcaattaat 17556962  T
383 gaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctt 480  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||    
17556961 gaaaaattacact--agatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagctcaaat-cctagcctaagcttcactttatctcctagattctt 17556866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 302
Target Start/End: Original strand, 25651197 - 25651461
Alignment:
39 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
25651197 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 25651296  T
138 cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat 237  Q
    || |||||||||||| ||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
25651297 caacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcacat 25651396  T
238 actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatat 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
25651397 actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatat 25651461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 15740207 - 15740662
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||| || || | ||||||| ||    
15740207 accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattattaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg 15740306  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    ||||||  ||| | || ||||||||| ||||||| || || |  |||  | |||||||||   |||||||||| |||   ||||||||| |||  |||||    
15740307 aacatgaatctcagtataattcaacatcaacatatcacaaattgacatatagagcataatatgacatatatcatttttatatactttgatcattcaattt 15740406  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||   |||||||||||||| ||||||    
15740407 caccaacaaccaatcaattatcaccaatttcttacatacaaacatagcatcataattggagcacgaaatctaacaatcatgaacaattaatcaattactc 15740506  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         | || |||||||||||   |||    
15740507 aattaagtacttattcatacaaaaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaactccc---------taagatcaattccctaattcaa 15740597  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||||||||| ||||||| || || |||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
15740598 gcttcactttcgctcctaagtcctctccaactcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc 15740662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15079944 - 15079517
Alignment:
89 tgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacat 188  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||||| ||    
15079944 tgaattatgaatacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatat 15079845  T
189 agcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcat 288  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||  |  || ||||    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||    
15079844 agcataattcacccaattgagcataattcacaagttagcactcatacacactttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcat 15079746  T
289 gaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaat 388  Q
    | || ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| || |||||||||     
15079745 gcatacaa-catatcatcctagttagagcacgaatt-taacatctatgaataattaatcaattatccaattaatcccttattcataaaataattgaaaaa 15079648  T
389 ttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattcc-ctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctctt 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||  || ||||||||| |||||||| |   ||||  |     
15079647 ttacact-aaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttagattaatccctctagcttaagcttcacttttgctcctagctctcttccaatc 15079550  T
488 cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
15079549 cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 15079517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Original strand, 29605406 - 29605744
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||  | ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |    
29605406 atcaacccatttttacaaaaccaacaagaacaacttatttctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatttc 29605505  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||| |||  |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||| ||||    
29605506 ttagcaacaacaacatcaattaagcatgattcacatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacattttgagcacaattcacaatatttcattttc 29605605  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||    
29605606 acatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaact 29605704  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcat 373  Q
     ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
29605705 atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcat 29605744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Original strand, 34966823 - 34967167
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
34966823 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 34966922  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||  ||||    
34966923 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaattagagtacaattcacaatatatctttttc 34967022  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
34967023 acatactatgaacatgcaatttcacgaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 34967122  T
334 ttga-acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
      || | || |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
34967123 aagagaaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaa 34967167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Original strand, 19854135 - 19854446
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||    
19854135 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattaaa 19854234  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||  | || ||||| || |||  ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||    
19854235 catgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcattatttagagcacaactcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca 19854334  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||| ||  || | || |||||| |||||||    
19854335 ccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacagctaagagcaaaataatcacttactca 19854434  T
357 attaagcactta 368  Q
    ||||||||||||    
19854435 attaagcactta 19854446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 474
Target Start/End: Original strand, 22848110 - 22848409
Alignment:
173 aattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaa 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
22848110 aattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaattcacaatataacattttcacatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaa 22848209  T
273 ttatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattca 372  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||  ||    
22848210 ttatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcaattattcaactaagcacttaaaca 22848308  T
373 tacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc 470  Q
    | |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| | ||||| |||| ||||| ||||||||    
22848309 tgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaattcccttaccttaaatagcacaaat-cctagtccaagcttcaatttagctc 22848405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28195362 - 28195101
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||    
28195362 accaacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattg 28195264  T
156 aacatgtt-tcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    | |||    ||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
28195263 atcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacatttcatcatataccattttctcatactatgaacatgaaatt 28195164  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagc 317  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
28195163 ttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataattggagc 28195101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22462386 - 22462112
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||| | |||||| ||  || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
22462386 atcaacctattttcacaaaaccaacaacaactacttaattctcatcacaaactcatga-ttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 22462288  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||  | ||||||  ||| |  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||    
22462287 ttaacaacaacaacatcatttaaacatgaatctcatcacaac-caacaacatcatagcacaattcaacaattagagcaaaattcacaatataccactttc 22462189  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa 310  Q
     |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
22462188 acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataa 22462112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29160594 - 29160343
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
29160594 atcaacccattttcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 29160495  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||  |||||||| ||||    
29160494 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcgcaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaactcacaatatatcattttc 29160395  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattt 285  Q
     |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
29160394 acataccatgaacatgcaatttcactaacaacaattcaattatcaccaattt 29160343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 23222703 - 23223006
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaaca--acatc 131  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||  | |||    
23222703 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacatgatatc 23222802  T
132 acttag--cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcac 229  Q
     ||||   || |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||     
23222803 tcttataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaataaacaacaacatagtacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcat 23222902  T
230 tttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataac 329  Q
    |||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||    
23222903 tttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataaaaagagcacgaatttcaac 23223002  T
330 aact 333  Q
    ||||    
23223003 aact 23223006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17013793 - 17013595
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc 270  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
17013793 acaaatcaacaagaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattc 17013694  T
271 aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | || |||||| |||||||||||||||||||    
17013693 aattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcactta 17013595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Original strand, 23221870 - 23222148
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |    
23221870 atcaatccattttcacaaaaccaacaacaacaacttagttcacatcagaaactcatgatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctc 23221969  T
134 ttag--cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt 231  Q
    |||   || |||||| ||||| | ||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||    
23221970 ttataacaacaacaatatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataatacaattcaacaattagagcataattcacaatataccattt 23222069  T
232 tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataa 310  Q
    || |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
23222070 tcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactctaacatatcatcataa 23222148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 304 - 501
Target Start/End: Original strand, 25654350 - 25654546
Alignment:
304 atcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatga 403  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||    
25654350 atcataattagagcacgaattttaacaactctgaacaattaatcacctactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatga 25654447  T
404 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||| ||||  ||  | |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
25654448 ttagcacaaattctaacccccttaccttaattagcacagattcctagcgcaagtttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 25654546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 32898767 - 32899149
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||| ||| || | ||||||||| ||| | || ||||||| |||| |    
32898767 caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacttcaatt 32898866  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||| |  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| |||    
32898867 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat 32898965  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || |||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
32898966 tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 32899065  T
353 ctcaattaagcacttattcata-caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |  |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32899066 ccaaattaagcactt-ttcataccaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 32899149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 278
Target Start/End: Original strand, 31628245 - 31628468
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
31628245 caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 31628344  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
31628345 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat 31628443  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatca 278  Q
    |  || |||||||||||||||||||    
31628444 tcaactaacaacaattcaattatca 31628468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 323
Target Start/End: Original strand, 19672275 - 19672531
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||||||| ||| ||        |||||||||| | ||    
19672275 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgatttatgaacaccgaagttatgaatcatcaacaacaatatctct--------acaacatcaattaaa 19672366  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| | || |   ||||||||||| || |||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||    
19672367 catgat-ctcatcgcaattcaacaataagatagcacaattcaacatttggagcacaattcacaatatatcattttcacatattatgaacatgcaatttca 19672465  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaat 323  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
19672466 ttaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataataagagcacaaat 19672531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 368
Target Start/End: Original strand, 32352110 - 32352338
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||  |||||||| |||| ||||||    
32352110 caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacataattcaacatttagaacacaattcacaatatatcattttcacatact 32352209  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- 339  Q
     |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||  ||||  ||||||| ||| |     
32352210 atgaacatacaatttcaccataaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaatataccatcatagaaagagcatgaatttcaacaactatgagca 32352309  T
340 aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||    
32352310 aaataatcacttattcaattaagcactta 32352338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 439
Target Start/End: Original strand, 18432626 - 18433001
Alignment:
61 caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat 160  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || ||||| |||||| ||| |||    
18432626 caacatctcatttttcaacaataaaccattaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcat 18432725  T
161 gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc 259  Q
    |   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| | |  ||| ||||||||| |||||| ||||  | |    
18432726 gaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatta-agcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatgtaattcaatc 18432824  T
260 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaat 358  Q
    ||||||||||||| |||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||  ||||  | ||  | ||||||| |||||| || || ||||    
18432825 aacaacaattcaagtattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaat 18432924  T
359 taagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18432925 taagctctt-ttcatacaataattgaaaatttgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 18433001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 18583264 - 18583384
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
18583264 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 18583362  T
108 ccatgaatcattaacaacaaca 129  Q
    |||||||| || | ||||||||    
18583363 ccatgaattatcatcaacaaca 18583384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 434
Target Start/End: Original strand, 18570372 - 18570632
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt 269  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
18570372 acaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaatttaactaataacaatt 18570470  T
270 caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcactta 368  Q
    ||||||||   ||  ||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
18570471 caattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 18570570  T
369 ttcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    | |||||||  |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18570571 t-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaattgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 18570632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 439
Target Start/End: Original strand, 16106561 - 16106875
Alignment:
123 aacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caaca 221  Q
    |||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||   ||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||||  |||||| || |||||    
16106561 aacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaatta-agcatattttcaaca 16106659  T
222 tata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcaca 320  Q
     ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||    
16106660 catactcatttt-tcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcaca 16106758  T
321 aattataacaactttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatacaa-caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattcta 418  Q
    ||||  | ||  |  |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    | | || ||||||||||||||||||    
16106759 aatttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagcactt-ttcatacaattaattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattcta 16106854  T
419 acccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||||||||||||||||    
16106855 acccccttaccttagttaggt 16106875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 439
Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086376
Alignment:
83 aaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaa 182  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||| ||||||| || |  |||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||   ||||  | ||||||||||    
16086022 aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa 16086121  T
183 caacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcacca 281  Q
    |||||  | |||||||| |||||  |||||| || ||||| ||| |  ||| || ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   |    
16086122 caacaaggtataattcaccaatta-agcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccata 16086220  T
282 atttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatacaa-ca 379  Q
    | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||  |    
16086221 acttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcactt-ttcatacaatta 16086319  T
380 attgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||||||||    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16086320 attgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 16086376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 4991002 - 4991200
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
4991002 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 4991100  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||  | |||| | |||||||||  || |||| |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
4991101 gccaaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 4991200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18823712 - 18823515
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
18823712 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 18823614  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
18823613 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 18823515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18839567 - 18839419
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
18839567 acatcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 18839469  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||| || || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||||    
18839468 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 18839419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31467680 - 31467544
Alignment:
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-a 340  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||  || | |    
31467680 tgaacatgcaatttcattaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataataagagcatgaatttcaacaactaagagcaa 31467581  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
31467580 aataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaa 31467544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 324
Target Start/End: Original strand, 18777126 - 18777392
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||  | |||     
18777126 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattcattgat 18777225  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
18777226 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 18777324  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
18777325 actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatt 18777392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 21931296 - 21931450
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct-catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt 269  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||  ||||| |  ||| | ||||   |||||||| ||||||| |||||||||||    
21931296 acaaatcaacaacaacataacacaactcatcaatttaagcataattcacaatatacccatttatacatatcatgaacatgcaatttcatcaacaacaatt 21931395  T
270 caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
21931396 caattatcatcaatttcatatattcaaacatatcatcttaacaagagtacaaatt 21931450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 333
Target Start/End: Original strand, 19175243 - 19175406
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt 269  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||  ||||| ||| ||   ||||   |||||||| ||||| | |||||||||||    
19175243 acaaatcaacaacaacatagtacaattcatcaatttaagcacaattcacaatatactcatttatacatatcatgaacatgcaattttatcaacaacaatt 19175342  T
270 caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
19175343 caattatcatcaattttatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact 19175406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35009677 - 35009574
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||| |    
35009677 cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcacc 35009578  T
202 aatt 205  Q
    ||||    
35009577 aatt 35009574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 19629314 - 19629458
Alignment:
60 acaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa-c 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| | || |    
19629314 acaacaactcatttctcaccaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatc 19629411  T
159 atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     || |||| ||  |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
19629412 ttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 19629458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 22440911 - 22441287
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| |||     
22440911 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaat 22441009  T
154 tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaa 252  Q
    ||| ||||   ||||  |||| |||  |||||||  |||||||||| ||||| ||||||| || ||||  ||| |  ||| ||||||||| |||||| ||    
22441010 tgatcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgtaa 22441108  T
253 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt- 351  Q
    ||   || |  |||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||| |||||||| || ||||  | ||  | |||||||||||||| ||     
22441109 ttcaccccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattc 22441208  T
352 actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22441209 actcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattgc----aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 22441287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 501
Target Start/End: Original strand, 14152632 - 14152733
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttc-tttcctcttcttgaatcttca 499  Q
    |||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||    
14152632 tgattatgatgaagaataacccccttgccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatcatctcctcttcttgattcttca 14152731  T
500 ag 501  Q
    ||    
14152732 ag 14152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 333
Target Start/End: Original strand, 16136427 - 16136518
Alignment:
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  |||||||    
16136427 tgaacatgcaatttcatcaaaaactattcaattatcatcaatttcatatattcaaacatattatcataacaagagcacgaatttcaacaact 16136518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 439
Target Start/End: Original strand, 18777450 - 18777488
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18777450 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 18777488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32277039 - 32276891
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| ||    
32277039 accaacagcatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 32276942  T
156 -aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  ||||||||||| |||||  || |||||| |||||    
32276941 aaacttgattctcacctcaattcaacaataacatgtcacaattcatcaatt 32276891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 35015447 - 35015342
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || ||    
35015447 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 35015348  T
143 acaaca 148  Q
    ||||||    
35015347 acaaca 35015342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25640487 - 25640453
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25640487 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 25640453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 16231859 - 16231967
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||   ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| ||    
16231859 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 16231957  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
16231958 acaacatcaa 16231967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18087112 - 18087004
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||  ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| ||    
18087112 atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18087014  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
18087013 acaacatcaa 18087004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19983581 - 19983476
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| | || ||    
19983581 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 19983482  T
143 acaaca 148  Q
    ||||||    
19983481 acaaca 19983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25744483 - 25744390
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||||    
25744483 caccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 25744390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 23153610 - 23153693
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
23153610 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 23153693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13014740 - 13014601
Alignment:
295 aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaac---aattgaaaattt 390  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||    |||||||||||     
13014740 aaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaatttagcactt-ttcatacaaacataattgaaaatt- 13014643  T
391 acactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      || | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
13014642 --acaataagtgattatgataaattctaacccccttaccttagt 13014601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16300230 - 16300116
Alignment:
84 aatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaa 182  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  || |||| |||||||||||| || ||| || |||| ||  ||||||||| |    
16300230 aatcatgatatatgaacacccaagccataaatcatatacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacca 16300131  T
183 caacatagcataatt 197  Q
    ||||||  |||||||    
16300130 caacatgtcataatt 16300116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Original strand, 18570686 - 18570718
Alignment:
488 cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
18570686 cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 18570718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177618
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
20177140 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 20177239  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20177240 acaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 20177339  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||    
20177340 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat 20177439  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||   |     
20177440 taatcaattactcaattaagcacttaaacatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaaccccattaccttaattatcacc 20177538  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
20177539 aattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaattcttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc 20177618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 141 - 520
Target Start/End: Original strand, 16656701 - 16657079
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16656701 caacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 16656800  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||    
16656801 ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca 16656900  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
16656901 attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatc 16657000  T
441 aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
16657001 aattccctagcccaagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagcttctctt-tctctaaccc 16657079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 141 - 507
Target Start/End: Original strand, 16645975 - 16646341
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
16645975 caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataattcaacatatatcactttctcatact 16646074  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaaca 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||    
16646075 ttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca 16646174  T
341 attaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtc 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
16646175 attaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatc 16646274  T
441 aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctc 507  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||    
16646275 aattccctagctcaagcttcactttagttcctaggttctctcattctcttgaatcttcaagttcctc 16646341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 61 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 36356557 - 36356098
Alignment:
61 caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat 160  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
36356557 caacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacat 36356458  T
161 gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacca 260  Q
    |  ||| |  | || |||||| ||||||| || ||||  ||| || |||||||||   |||||||||| ||||  ||||||||| | |  ||||||||||    
36356457 gaatctcagcataaatcaacatcaacatatcacaatttgacatttagagcataatatgacatatatcattttcatatactttgatccttcaatttcacca 36356358  T
261 acaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaatta 360  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |  || |||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
36356357 acaacatttcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactcaatta 36356258  T
361 agcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttc 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
36356257 agcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttactttagttagatcaattccctagctcaagcttc 36356158  T
461 actttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36356157 actttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 36356098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 17608886 - 17609351
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
17608886 tcaacccattttccaaaaccaacaacaacaactcaattctcataatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 17608985  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    | || |||||||| ||| ||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||      
17608986 aacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcat 17609085  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
17609086 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat 17609185  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
17609186 gatcaactaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt 17609283  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
17609284 tagcacaaattcctaacccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 17609351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 36 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37234149 - 37233672
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| |||||| || ||| || |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
37234149 tcaacccattttacaaaaccaaccacaaaaactcaattttcatcatcaaatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt 37234050  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||      
37234049 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatatatcactttcat 37233950  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |    
37233949 atactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaactat 37233850  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
37233849 taacaattactcacttactcaattaagcacttaataatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 37233752  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttcctcttctct 513  Q
    |||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
37233751 tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttacctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaagcttcttcttctct 37233672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 36 - 515
Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603529
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || || ||| |||||||||    
19603055 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacacccaagtcatgaattatcaataaccacatcactt 19603154  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  | | |  | ||||||||| ||||||| || ||    ||| || |||||||||   |||||||||| ||||      
19603155 agcagcaactacatcaattgaacatgaatttcagcataattcaacatcaacatatcacaagatgacatttagagcataatatgacatatatcattttcat 19603254  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |    
19603255 atactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattat 19603354  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
19603355 gaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgaaaatttgcact--aaatgattatgatgaattctagcccccttaccttagtt 19603452  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctct 515  Q
    || |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
19603453 agatcaattc---agcccaagcttcactttagctcctaggttttctcctcttcttgaatcttcaagctcctcttctctct 19603529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 44 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627472
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||    
51627945 ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaacaa 51627846  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    ||||||||| ||| ||||  |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
51627845 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacatatttcaacatataccattttctcatactttg 51627746  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt 343  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||| |    
51627745 aacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaaat 51627646  T
344 aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
51627645 aatcaattactcaattaagcacttattcatgcaacaattg-aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaac 51627547  T
444 tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||||||| | ||  |||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
51627546 tccctagcttaagcttcaatttagctccta-gctccctccaatccttgaatcttcaagttccccttctctctaacc 51627472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 38033962 - 38033478
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||| || |||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
38033962 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaacttatttctcatcaacaa-tcgtgaactatgcacacccaagccatgaattaacaacagcaacatcactt 38033864  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||  ||| |  | ||||||||| ||| ||| || || |  ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||      
38033863 agcagcaatcacatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaatatatcacaacttgacatttagagcataatataacatatatcattttcat 38033764  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||| |||||||||  |||||| |||| ||| ||   |    
38033763 atactttgatcattcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcttacatacaaacataacatcataataggagcacgaattctaataatcat 38033664  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccc-ttaccttagt 434  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
38033663 taacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctttaccttagt 38033564  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||  ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38033563 tatatcaattccctagttcgagcttcactttagctcctaggttctctcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 38033478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 20955728 - 20955265
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || || ||||||||||| || || |||||||||||||    
20955728 tcaaccccttttacaaagtcacccacaacaactcatttcacaccaacaattcacgaattattcacaccgaagccatgaattatcaataacaacatcactt 20955629  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  | | |  | ||||||||| ||||||| || ||    ||| || |||||||||   |||||||||| | ||      
20955628 agcagcaactacatcaattgaacatgaatttcagcataattcaacatcaacatatcacaagatgacatttagagcataatatgacatatatcattctcat 20955529  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |    
20955528 atactttgatcattcaatttcaccaacaacagatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacaaattctaacaattat 20955429  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
20955428 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttgcact--aaatgattatgatgaattataacccccttaccttagtt 20955331  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
20955330 agatcaattccctagctcaagcttcactttagctcctaggttctctccttttcttgaatcttcaag 20955265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 44 - 474
Target Start/End: Original strand, 21194980 - 21195409
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||    
21194980 ttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 21195079  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttg 243  Q
    |||||| || | |||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||    
21195080 caacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataattcacaatatatcattttcacatactatg 21195179  T
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaatt 343  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
21195180 aacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaatt 21195279  T
344 aatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||    
21195280 aatcacttattcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaact--aaatgattatgattgaattctaaaccccttaccttagttagcaca 21195377  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||    
21195378 aat-cctagcccaagcttcactttagctcctag 21195409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 70 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22143616 - 22143169
Alignment:
70 atttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttac 169  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |     
22143616 atttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgagcatggttctcat 22143517  T
170 tacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt 269  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  || || ||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
22143516 cataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataattcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaatt 22143417  T
270 caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttat 369  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
22143416 caattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttat 22143317  T
370 tcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt--ccctagcccaaacttcactttag 467  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||   |||||||||| |||||||||||    
22143316 tcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttag--caattaatcctagcccaagcttcactttag 22143221  T
468 ctcctagg-ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
22143220 ctcctaggatcctcacctcttcttgaatcttcaag--cttcttctctctaaccc 22143169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 37 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22829712 - 22829232
Alignment:
37 caacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactta 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |  || ||||||||    
22829712 caacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagaaaaatcactta 22829613  T
137 gcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctca 236  Q
     || |||  |||||||  |||||||   || |  | ||||||||  ||||||| || |||| | || || |||||||||   |||||||||| ||||  |    
22829612 acaacaattacatcaatggaacatgaaactcaacataattcaacctcaacatatcacaattga-catttagagcataatatgacatatatcattttcata 22829514  T
237 tactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttg 336  Q
    | |||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | ||    
22829513 tgctttgaccattcaatttcactaacaacaaatcaattatcaccagtttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatg 22829414  T
337 aacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 436  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
22829413 aataattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcactaaa--tgattatgatgaattctaacccccttactttagtta 22829316  T
437 ggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
22829315 gatcaattccctagcccaagcttcactttagctcctaggatccttcctcttcttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 22829232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 520
Target Start/End: Original strand, 27674755 - 27675238
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
27674755 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaa-aaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactt 27674853  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    | || |||| ||| ||| ||||||||  ||| |  | ||||||||  ||||||| || || |  ||| || |||||| ||   |||||||||| || |      
27674854 aacaacaactacaccaattgaacatgaatctcagcataattcaacctcaacatatcacaaattgacatttagagcatgatatgacatatatcatttccat 27674953  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||    |    
27674954 atactttgatcattcaatttcaccaataacaaatcaattatcaccaatttcttacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacagtcat 27675053  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
27675054 gaacaaataatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaacgattatgataaattctaacccccttaccttaatt 27675153  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |  || | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |   ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
27675154 atctccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctcttccaatcttgaatcttcaagctcttcttttctctaaccc 27675238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13377122 - 13376663
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||    
13377122 atttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaaca 13377023  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| ||| ||||  | | || | ||||||||||||||||| |||||||                   ||||||||| |||||  |||||||||    
13377022 acaacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataatt-------------------caacatataccacttcttcatacttt 13376942  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   | || || ||||||||    
13376941 gaacatgaaatttcaacgacaacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcatctatgaacaat 13376842  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |     
13376841 taatcaattactaaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc 13376743  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttcttt-cctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||| || |||||||||||||||    
13376742 aattcctagcccaaacttcactttagctcctaggatctttaccaattgttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc 13376663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8538200 - 8537762
Alignment:
35 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact 134  Q
    |||||||||||||   ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||    
8538200 atcaacccatttttacaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct 8538101  T
135 tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct 234  Q
    || || |||||||||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||| ||||||  ||||| || ||||     
8538100 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaattcacaatataacattttca 8538001  T
235 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt 334  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||      
8538000 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca 8537901  T
335 tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta 432  Q
    ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
8537900 tgaacgaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaactcccttacctta 8537803  T
433 gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    |||||  ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
8537802 gttagcacaaat-cctagcccaagcttcactttaactcctag 8537762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8603439 - 8603001
Alignment:
35 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcact 134  Q
    |||||||||||||   ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||    
8603439 atcaacccatttttacaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattcct 8603340  T
135 tagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttct 234  Q
    || || |||||||||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||| ||||||  ||||| || ||||     
8603339 taacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataagacatttcaacaatttaagcacaattcacaatataacattttca 8603240  T
235 catactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt 334  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||      
8603239 catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca 8603140  T
335 tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta 432  Q
    ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
8603139 tgaacgaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaactcccttacctta 8603042  T
433 gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    |||||  ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
8603041 gttagcacaaat-cctagcccaagcttcactttaactcctag 8603001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 474
Target Start/End: Original strand, 52400591 - 52401026
Alignment:
39 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || || ||| |||||| ||||||||    | || ||||||||| |||||||||||| || ||    
52400591 acccattttcacaaaatcaaccacaacaacttatttcacatcaccaactcatgatttatgaacatttacgctatgaatcatcaacaacaacatctctcag 52400690  T
138 cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcat 237  Q
    || ||||||| |||| | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||  |||||||| |||| |||    
52400691 caacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttcacat 52400790  T
238 actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga 337  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||| |||    
52400791 actatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaactatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaaagtcaacaactatga 52400890  T
338 acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagtt 435  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
52400891 acaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaaccctcttaccttagtt 52400988  T
436 aggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    ||   || | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
52400989 agcaaaaat-cctagcccaagcttcaatttagctcctag 52401026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 49997548 - 49997133
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactta-gcagcaacaacatcaactga 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||  | |    
49997548 caacaacaacttatttctcatcaacaac-catgatttatgaacaccaaatccatgaatgatcaacaacaatatctcttaagcaacaacaacatcagttaa 49997450  T
157 acatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||| |||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| | ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||    
49997449 acatgattctcaccttaattcaacaacaacatagcacaattcaaaatttagagtacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttc 49997350  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||   ||||||| |||||| ||| |||    
49997349 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatcatgaacaaataatcacttattca 49997250  T
357 attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatg-atgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccca 454  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||| ||    
49997249 attaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgtttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctagctca 49997153  T
455 aacttcactttagctcctag 474  Q
    ||||||| ||||||||||||    
49997152 aacttcaatttagctcctag 49997133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40436560 - 40436261
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
40436560 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcataaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 40436461  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||  | |||||||||||| | |||||  |||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
40436460 ttaaaaacaacaacatcaattaaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc 40436361  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
40436360 acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 40436261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5768436 - 5768125
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  || |||| | |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
5768436 caacaacaacttatttcacatcacaaactcataatttatgaacacccaatctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 5768337  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||    
5768336 catgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatacaatttca 5768237  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | || |||||| ||| |||    
5768236 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttattca 5768137  T
357 attaagcactta 368  Q
    ||||||||||||    
5768136 attaagcactta 5768125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 324
Target Start/End: Original strand, 33397308 - 33397598
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
33397308 atcaacccattttcacaaaaccaacaaccacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacacaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 33397407  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||| ||||| | |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||    
33397408 ttaacaacaacaagatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatattattttc 33397507  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
     |||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
33397508 acatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaactcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 33397598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27330001 - 27329654
Alignment:
79 caacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattca 178  Q
    |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||   ||||  |||||| |    
27330001 caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta 27329902  T
179 acaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt-ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatc 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||   |||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
27329901 acaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattatc 27329803  T
278 accaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
    |  || |||||  || ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |          |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |    
27329802 a-taacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattct----------aacaattaatcaattacacaattaaacacttattcatacca 27329714  T
378 caattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
     ||||||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27329713 taattgaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 27329654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Original strand, 21718206 - 21718583
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
21718206 caccaacaacatctcatttctcaagaacaac-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 21718304  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||    
21718305 gatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatgtaat 21718403  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | || |  ||||||||||||| ||| |    
21718404 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca 21718503  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |   || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
21718504 cccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatattgaattctaa-tcccttaccttagttag 21718583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41229221 - 41229096
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
41229221 attttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaaca 41229122  T
143 acaacatcaactgaacatgtttctta 168  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
41229121 acaacatcaattgaacatgattctta 41229096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 324
Target Start/End: Original strand, 25093922 - 25094105
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||| |  |||| |||||||||||||| || |||||||||||| || || ||||||  |||||||| ||||||||| |    
25093922 caacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaattagaacacaattcacaatatatcattttctcatatt 25094021  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
     || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
25094022 atggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 25094105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Original strand, 35054736 - 35055115
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | |||     
35054736 caacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat 35054835  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
35054836 catgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 35054934  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc 355  Q
    || |||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||  | ||||||||||| | ||| || |    
35054935 actaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaattcaccc 35055034  T
356 aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
35055035 aattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaataga---aataagtgattatgatgaattttaacccccttaccttagttaggt 35055115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9784245 - 9783958
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatac 239  Q
    |||||||||||| ||| ||||   ||||  |||||||||||||||   ||||||||||| |||||  |||||| || ||||||||| ||  |||||||||    
9784245 caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa---agcataattcaccaatta-agcatattttcaacatataccaacttctcatac 9784150  T
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac 339  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||  ||||  | ||  | |||||    
9784149 tttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaac 9784050  T
340 aattaatc-atttactcaattaagcacttattcata-caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    |||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
9784049 aatttatcaattcacccaattaagcactt-ttcataccaataattgaaaa-ttgcagt--aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag 9783958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22403379 - 22402998
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||| ||  |    
22403379 accaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgaaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagtt 22403281  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaa 252  Q
     | ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||| | | ||||  | |||||||||||| ||    
22403280 aatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa 22403182  T
253 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt- 351  Q
    ||  || |||| ||||| ||||||    || |||||  ||  | |||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||     
22403181 ttcaactaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattc 22403083  T
352 actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22403082 acccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 22402998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35522588 - 35522439
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
35522588 caccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaatt 35522490  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    || ||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
35522489 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 35522439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 35522417 - 35522159
Alignment:
260 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcattt-actcaat 358  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| || || ||||    
35522417 aacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaat 35522318  T
359 taagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaa 456  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| ||||  |      
35522317 taagccctt-ttcatacaaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaatctccttagcttagg 35522222  T
457 cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||| | | |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
35522221 cttcaattttgctccta-gctctcttcaccccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 35522159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 49967628 - 49968004
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||| ||| |  || |||| |||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| |    
49967628 caccaacaacatctcattcctcaacaacaac-catgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 49967726  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   | ||  |||||||| ||||||||  | |||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||| | ||| |||||||||| |||    
49967727 gatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaat 49967825  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || |||||||||||||||||    || |||||  ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||  |  |  ||||||||||||||| ||| |    
49967826 tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattca 49967925  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||   || | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
49967926 tccaattaagcactt-ttcatgcaaataattgaaaatt---acaataagtgattacgatgaattctaacccccttaccttagt 49968004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 20194140 - 20194323
Alignment:
194 aattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactt-tctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaat 292  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |  || || |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |     
20194140 aattcaacaattagagcacaattcacaatatacccattatcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatatac 20194239  T
293 tc-aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcata 374  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  |  | || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
20194240 tcaaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagtgcaaaataatcatttattcaaataagcacttatgcata 20194323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21650329 - 21650167
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || | || ||    
21650329 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaaca 21650231  T
143 acaacatcaactgaa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    |||||||||| |||| | || |||| ||   ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
21650230 acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 21650167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 425
Target Start/End: Original strand, 41212046 - 41212415
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac- 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||||     
41212046 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca 41212145  T
154 --tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaa 251  Q
      ||| ||||   | ||  |||||||| ||||||||  ||||||||| || | ||||||||| ||  ||| ||| |  ||| |||||||||||||||  |    
41212146 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattc-actaattgagcatatttttacacatacccatttttcatactttgaacataca 41212244  T
252 atttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-att 350  Q
     ||  || |||||||||||||||||    || |||||   |  |||||  |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| |||    
41212245 gttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt 41212344  T
351 tactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccct 425  Q
     |  ||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
41212345 catccaattaaacactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaattctaaccccct 41212415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 76606 - 76480
Alignment:
92 attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagc 191  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||  | |||||| ||||| | ||||||  ||| ||  || |||||||||||||||||    
76606 attatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataataacaacaatatcaattaaacatgaatctcaccgcatttcaacaacaacatagc 76507  T
192 ataattcaacaatttgagcataattca 218  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||    
76506 acaattcaacaattagagcacaattca 76480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Original strand, 20445704 - 20445925
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||||||| ||| || |  || ||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
20445704 cccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcacc 20445803  T
202 aatttgagcataatt--caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaaca 299  Q
    |||| ||||| ||||  || ||  ||||| ||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||    
20445804 aatt-gagcacaattttcaccacttatcatttgttcctactt-gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca 20445900  T
300 tatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||    
20445901 tatcatcacaattggagcacgaatt 20445925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9784377 - 9784237
Alignment:
49 caaaatcaccaacaacaactcattt-ctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac 147  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||    
9784377 caaaaacatcaacaacaactcattttctcaccttcaaatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaac 9784278  T
148 atcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacat 188  Q
    ||||| ||| | ||   ||||  ||||||||||||||||||    
9784277 atcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaacaacat 9784237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 22366970 - 22367089
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| ||||| | ||||||     
22366970 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaat 22367069  T
129 atcacttagcagcaacaaca 148  Q
    || ||| | || ||||||||    
22367070 atgactaaacaacaacaaca 22367089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15861728 - 15861630
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa 127  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| ||||| | ||||||    
15861728 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaa 15861630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 152
Target Start/End: Original strand, 17148534 - 17148642
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||  ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| ||    
17148534 atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 17148632  T
143 acaacatcaa 152  Q
    ||||||||||    
17148633 acaacatcaa 17148642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 434
Target Start/End: Original strand, 20346345 - 20346378
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20346345 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 20346378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37844549 - 37844473
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| || |||||    
37844549 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagca 37844473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 41394385 - 41394468
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| || |||||||||||  || ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||    
41394385 tttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaattt-atgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt 41394468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9783904 - 9783872
Alignment:
488 cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
9783904 cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 9783872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 43 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76652
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
77129 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaaca 77030  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
77029 acaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataattcaacatatatcactttctcatacttt 76930  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | || || ||||||||    
76929 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaacaat 76830  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagtta-ggtc 440  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    |    
76829 tactcaattactcaattaagtacttaatcatacaataattgaaaaattacact-aaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcagc 76731  T
441 aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttcttt-cctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
76730 aatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctttaccaattgttgtatcttcaagctcttcttctctctaacc 76652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 35 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2134
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
2607 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac 2508  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2507 ttaggaacaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataattcaacatatgtcactttc 2408  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| || |    
2407 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataatt 2308  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
     |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2307 atgattaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaacaatt-aaaaattgcact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 2210  T
434 ttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctctt 509  Q
    |||| ||||||| || || ||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||||||    
2209 ttagatcaattctcttgctcaagcttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctctt 2134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 44087 - 43622
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
44087 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 43988  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||||  ||| || || |  |||||||||||||||||||||      
43987 agcaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaatttgacatttagaacccaattcaacatatatcactttcat 43888  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |    
43887 atcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactat 43788  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
43787 gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 43690  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||    
43689 tagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttaaatcttcaag 43622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23963 - 23525
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||| ||| || ||||| ||||  || |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  |    
23963 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttttcatcatcaaattatgatatacgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatattcc 23864  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || ||||||| |||| | |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| ||||    
23863 ttaacaacaacaacgtcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttc 23764  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||    
23763 acatactatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaaaaatttcatgtatacaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaact 23664  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta 432  Q
     ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||  | |||||| |||||  |  ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
23663 atgaacaaataatcaattattcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattaca--actaatcattatgattgaattctaacccccttatctta 23566  T
433 gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
     ||||   || | |||||||||| ||||||||||||||||||    
23565 attagcaaaaat-cctagcccaagcttcactttagctcctag 23525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 69415 - 69880
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
69415 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 69514  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |    
69515 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac 69614  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
69615 atactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat 69714  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
69715 gaacaattaatcactttctcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaat 69812  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
69813 tagcacaaattcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 69880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 43 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 6835
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
7307 attttacaaaaccatcattcacaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagca 7208  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7207 acaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatacttt 7108  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | |||||||     
7107 gaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaac 7008  T
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtca 441  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||   |     
7007 aaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattaca-ttaaaatgattataattgaattctaacccccttaccttaattatcacc 6909  T
442 attccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag-ttcctcttctct 513  Q
    | | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
6908 aattcctagcccaagcttcactttaactcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaagcttcttcttctct 6835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8415 - 8333
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaaca 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||||    
8415 cccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaaca 8333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 157
Target Start/End: Original strand, 11730 - 11824
Alignment:
61 caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| ||||    
11730 caacatcttatttctcaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcat-aacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattgaa 11824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8269 - 8197
Alignment:
251 aatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt 8197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2948
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
2483 tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactt 2582  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||      
2583 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcat 2682  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
2683 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactat 2782  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  || || |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
2783 gaacaattaatcacttactgaattaatcatctaatcttacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccgcttaccttagt 2880  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||   || | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
2881 tagcaaaaattcctagctcaaacttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 2948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 36 - 474
Target Start/End: Original strand, 30978 - 31415
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
30978 tcaacccattttacaaaagcaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcttgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatcactt 31077  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |    
31078 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcataattcaacatataacactttcac 31177  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
31178 atactatgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactat 31277  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
31278 gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat 31375  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    |||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
31376 tagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctcctag 31415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 33996 - 33534
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
33996 accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 33898  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||     
33897 atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatatttcaacatataacacttcttcatactttaaacatgaaattc 33798  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
33797 cactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc 33698  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
33697 aattaagcatttattcatacaacaattg-aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctagctcaa 33599  T
456 acttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||||| |||||||| ||| |   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
33598 gcttcaatttagctcatagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 33534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 39 - 504
Target Start/End: Original strand, 270 - 721
Alignment:
39 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagc 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||    
270 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagc 369  T
139 agcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcata 238  Q
    | |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                   
370 aacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatttgagcaaaattcaacata--------------- 454  T
239 ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaa 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||    
455 ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattataggacgaattataacaactt-gaa 553  T
339 caattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||     
554 caattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattcaattctaacccccttaccataattat 653  T
438 gtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttc 504  Q
      | | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||| |||||    
654 cactaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttctagttc 721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Original strand, 11074 - 11534
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
11074 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaa 11173  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
11174 catggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcataattcaacatatatcactttcacacactttgaacatgaaatttca 11273  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca-caaattataacaactttgaacaattaatcatttactca 356  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  || || |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
11274 caaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggaacatgaatttttaacaattatgaacaattaatcatctactca 11373  T
357 attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |     
11374 attaagcacttattcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattataa-ccccttaccttagttagattaattccctagctctag 11470  T
457 cttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||||| ||||||| |   ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||    
11471 cttcactttacctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc 11534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 5)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 432
Target Start/End: Original strand, 53305 - 53699
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  ||| |||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
53305 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacgtcaattctcatcatcaaatcatgattaatga-ctcccaagccatgaatcattaacaacaatgtcactt 53403  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||  ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| |    
53404 agcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataattcaacatataacaccttcac 53503  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| |    
53504 atactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactat 53603  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
53604 gaacaattaatcacttactcaattaagcacttaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 53699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 380
Target Start/End: Original strand, 85489 - 85834
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |    
85489 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacctatttttcatcaacaaaccatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctc 85588  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||| ||||  | |||||| |||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
85589 ttagcaacaacaatatcacttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcattaatttgagcataattcacaatatatcattttc 85688  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
85689 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatt-aaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaact 85787  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaa 380  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
85788 atgaacaattaatcacttattcaattaagcatttaaacatacaacaa 85834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 276
Target Start/End: Original strand, 146581 - 146799
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  |   | ||||||||||| || |||||||||| | |||     
146581 caacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 146680  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
146681 catgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 146779  T
257 accaacaacaattcaattat 276  Q
    || ||||||| |||||||||    
146780 actaacaacagttcaattat 146799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 148884 - 148967
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||||||||    
148884 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatt 148967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 307
Target Start/End: Original strand, 9013 - 9078
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
9013 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatca 9078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 197545 - 197078
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaat---caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    ||||||||||||||||||    || ||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
197545 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaattctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatca 197446  T
133 cttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcacttt 232  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
197445 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataattcaacttataacacttt 197346  T
233 ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaac 332  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |  |||| |    
197345 cacatactttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatc 197246  T
333 tttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctt 431  Q
    |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
197245 taagaacaattaatcacttatccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 197148  T
432 agttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    | ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
197147 aattagcacaatt-cctagcccaagcttcactttagctcctaggatctctaccacttcttgaatcttcaag 197078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 36 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 97487 - 97023
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||| || |||| ||    
97487 tcaacccattttacaaaaccaataacaacaactcaattcttatcatcaaatcatgatttatgaaaacccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaatt 97388  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    || | |||||| ||||| ||||||||  ||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |    
97387 agtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataattcaacatataacactttcac 97288  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt 335  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |    
97287 atactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaactat 97188  T
336 gaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
97187 gaacaattaatcactcactcaattaaacactaaatcatacaataattgaaaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttcat 97090  T
435 taggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| | ||  ||||||||||||||||    
97089 tagcacaatt-cctagcccaagcttcactttacctcctacgatctctaccatttcttgaatcttcaag 97023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 437
Target Start/End: Original strand, 31010 - 31402
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| ||| || | ||| ||| |||| || ||||||    
31010 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaa 31109  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    ||||||||| | | ||||   ||||  ||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||    
31110 caacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactaca-aacataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccattttcttatacttt 31208  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    ||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||  | |||||||     
31209 gaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaaa 31307  T
343 taatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa--cccccttaccttagttag 437  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||  |  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
31308 taatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgca--atgaatgattatgatgaattctaacccccccttaccttagttag 31402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 437
Target Start/End: Original strand, 70657 - 70969
Alignment:
122 caacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaac 220  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||  ||||||    
70657 caacaacatcatatatcagcaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaac 70756  T
221 atatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcaca 320  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  || |||||||  |||||||||||||||||     
70757 atattccattttctcatactttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacg 70855  T
321 aattataacaactttgaacaattaa-tcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaa 419  Q
    ||||  | ||  | | ||| ||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||   || | ||||||||||||||||||||||    
70856 aatttcatcatttataaactattaattaattcacccaattaagcactt-ttcatacaataactgaaaatt---acaataaatgattatgatgaattctaa 70951  T
420 cccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||||||||||    
70952 cccccttaccttagttag 70969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 62 - 520
Target Start/End: Original strand, 7994 - 8451
Alignment:
62 aacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatg 161  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
7994 aacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg 8093  T
162 tttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaa 261  Q
     |||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||  |  || |||||   ||||||||||||||| || ||||||||    
8094 gttctcatcataattccacaacaacatagcataattcacccaattgagcataaatcataagttagcacttatacatactttgaacatgcaaattcaccaa 8193  T
262 caacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaa 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
8194 caacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaa 8293  T
362 gcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag--gtcaattccctagcccaaactt 459  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||  | || ||||| |||    
8294 tcacttattcatacaataattgaaaaattaca-ttaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaggttgtagttaat--cttaacccaagctt 8390  T
460 cactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||||| |   ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
8391 cactttagctcctagctctcttccaatccttgaatattcaagttcctcttctctctaaccc 8451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 355 - 520
Target Start/End: Original strand, 11153 - 11317
Alignment:
355 caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaatt--ccctagcc 452  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |   ||||   | || ||    
11153 caattaatcacttattcatacaataattgaaaaattacattaaaa-tgattatgatgacttctaacccccttaccttaggttg--taattaatcttaacc 11249  T
453 caaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||| |||||||||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
11250 caagcttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 11317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 58 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 104889 - 104448
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
104889 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt-aa 104791  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| || | |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |  || || ||   |||||||||||| || || ||||    
104790 catggttatcatcataattcaacaacaacataacataattcaaccatttgagcataattcataagttagcatttatacatactttgaacctgcaaattca 104691  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
104690 ccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatctatgaacaattaatcacttactcaa 104591  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | | |||||||| |    
104590 ttaagcaattattcatacaacaattgaaaaattacact--aaatgattatgatgaattctaacccacttaccttaattagcacaaattcttagcccaagc 104493  T
458 ttcactttagctcctag-gttctttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||    
104492 ttcactttagctcctagtatcctcacctcttcttgaatcttcaag 104448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93726
Alignment:
36 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcactt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||| || | ||||||||||||||    
94061 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcactt 93962  T
136 agcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctc 235  Q
    |  |  ||||||||||| ||||||||  | | |  |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
93961 attaataacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaatttaacaaca-catagcatacttcaataatttgagcatatttcaacaaataccattttctc 93863  T
236 atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcac-aaattataacaactt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  || |||||| || || |||||||||||||||| |||||| || || |||||  |     
93862 atactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagtta 93763  T
335 tgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattc 371  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
93762 tgaacaattaataatttacccaattaagcacttattc 93726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 93689 - 93657
Alignment:
488 cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
93689 cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 93657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 3297 - 3760
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | |||||||||||||||| || ||||||||| ||    
3297 accaactacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattg 3396  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
3397 atcatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttcacatataccactttctcatactttgaacattaaattt 3496  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc 355  Q
    | | ||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
3497 ctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc 3596  T
356 aattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagccca 454  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |  |    
3597 aattaagcacttattcatacaataattgtaaaattgca--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctatctta 3694  T
455 aacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    | ||||| |||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
3695 agcttcaatttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctcactaaccc 3760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1790 - 1352
Alignment:
82 caaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag-cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaac 180  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  || |  || ||||||| |||| ||| |||| |||| |  | ||||||||    
1790 caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagcatggttctcatcataattcaac 1691  T
181 aacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |  || || ||   |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||     
1690 aacaacatagcataattcacccatttgaacataattcataaattagcatttatacatacttttaacaagcaaattcaccaacaacaattcaattatcact 1591  T
281 aatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaa 380  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
1590 aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataa 1491  T
381 ttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctt 480  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |   |    
1490 ttgaaaatttacact-aaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttagatagattaattccctagctcaagcttcactttagctcctagctctct 1392  T
481 tcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
1391 tccaatccttgaatcttcaagctcctcttctccctaaccc 1352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8935 - 8497
Alignment:
82 caaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag-cagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaac 180  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  || |  || ||||||| |||| ||| |||| |||| |  | ||||||||    
8935 caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatatctaattcaacaacaacttcaattgagcatggttctcatcataattcaac 8836  T
181 aacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |  || || ||   |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||     
8835 aacaacatagcataattcacccatttgaacataattcataaattagcatttatacatacttttaacaagcaaattcaccaacaacaattcaattatcact 8736  T
281 aatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaa 380  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
8735 aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttattcatacaataa 8636  T
381 ttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctt 480  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |   |    
8635 ttgaaaatttacact-aaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttagatagattaattccctagctcaagcttcactttagctcctagctctct 8537  T
481 tcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
8536 tccaatccttgaatcttcaagctcctcttctccctaaccc 8497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 171 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1502 - 1154
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc 270  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
1502 acaatccaacagtaacatagcacaatacaacatttagagcatgattcatcatatatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatcc 1403  T
271 aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatt 370  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
1402 aattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttatt 1303  T
371 catacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc 470  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
1302 catacaataattgaaaaattacact-aatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagattaattccctagatcaagcttcactttagctc 1204  T
471 ctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| |   ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
1203 ctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctcctcttctctgtaaccc 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 171 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9757 - 9409
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc 270  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
9757 acaatccaacagtaacatagcacaatacaacatttagagcatgattcatcatatatcattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatcc 9658  T
271 aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttatt 370  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
9657 aattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcatttatccaattaagcacttatt 9558  T
371 catacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctc 470  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
9557 catacaataattgaaaaattacact-aatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagattaattccctagatcaagcttcactttagctc 9459  T
471 ctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||| |   ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
9458 ctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctcctcttctctgtaaccc 9409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9152 - 8771
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
9152 caccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 9053  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    || ||||   ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
9052 gatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatatcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaatt 8953  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac 353  Q
      || ||||||||||||||||||   || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| |||| |    
8952 caactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttc 8853  T
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
8852 ccaattaagcacttattcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttaccttagttag 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5516 - 5141
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
5516 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 5417  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   | ||  |||||||| ||||||||  || ||||||| ||| ||||||||| ||   || ||| | | ||||  | |||||||||||| |||    
5416 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaa-ttgagcatattttcgcacatacctattttcatacactttgaacatgtaat 5318  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||| |||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
5317 tcaactaac-acaattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca 5219  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      |||||||||||||| |||||| || |||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5218 tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt----agaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 433
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79892
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
79519 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 79618  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||  |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||  |  || ||||| | ||||||| ||||||| |||||||    
79619 catggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttca 79718  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| |||| || || || ||||||||||||||||||  |||    
79719 ccaccaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaacaattaatcatttatccaa 79818  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
79819 ttaatcacttattcatacaataattgaaaaattacact-aaaataattatgatgaattctaa-ccccttaccttag 79892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 130486 - 130684
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
130486 acatcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 130584  T
107 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    ||||| | |||| | |||||||||  || | || |||||||||||| || ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
130585 gccataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 130684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 89554 - 89471
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||| | || |||||| ||||    
89554 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatt 89471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 519
Target Start/End: Original strand, 10642 - 11101
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
10642 caacaacaattcatttttcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattgaa 10741  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  | ||||| |||||||| || |||||| |||| | || |||||||||||  |  || |||||   ||||||||||||||| || |||     
10742 catggttctcatcataattcgacaacaacgtatcataatccaaccaattaagcataattcacaagttaacacttatacatactttgaacatgcaaattct 10841  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||  |||    
10842 ccgacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattatttatccaa 10941  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaac 457  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| | | |    
10942 ttaatcacttattcatacaataattgaaaa-ttatact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatcctctagctctagc 11039  T
458 ttcactttagctcctaggttctttcctcttc-ttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    |||||||| ||||||| | ||| |||   || ||||  |||||||||||||||||||||||||    
11040 ttcacttttgctccta-gctctctcccaatctttgatccttcaagttcctcttctctctaacc 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22713 - 22246
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||| | | |||||| ||||| | ||||||| | |||||||| ||||     
22713 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcataattcatgaacacccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaa 22614  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||  |   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |  || || ||      
22613 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaattcaataatttgagcataattcataagttagcatttat 22514  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
22513 acatattttgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaact 22414  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacctta 432  Q
     |||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22413 atgaacaattattcacttattctattaagcatttattaatacaacaaatgagaaattacact--aaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 22316  T
433 gttag--gtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaag 501  Q
    |||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||    
22315 gttagcagttaat--cctagcccaaacttcactttagctcctaggatctctaccaattcttgaatcttcaag 22246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 474
Target Start/End: Original strand, 6500 - 6939
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |    
6500 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatctc 6599  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||    
6600 ttagcaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagtataactcacaatatatcattttc 6699  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||    
6700 acatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaattccatgtatttaaacatatcaccataattagaacacaaatttcatcaact 6799  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacctta 432  Q
     ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||| ||||||   || || |||| | | |||||||||||||||||||||    
6800 atgaacaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacac-ctaattggttatggttaaattctaacccccttacctta 6898  T
433 gttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctag 474  Q
    |||||   || | | |||||||| ||||| ||||||||||||    
6899 gttagcaaaaat-catagcccaagcttcaatttagctcctag 6939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15278
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt 269  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||  ||| ||| | | ||| | |||||||||||||  ||||  || ||||||||||    
15625 acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccatttttttatactttgaacatacaattcaactaacaacaatt 15527  T
270 caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactt-tgaacaattaatcatttactc-aattaagcactt 367  Q
    ||||| ||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
15526 caattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatt-tcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt 15428  T
368 attcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcacttta 466  Q
    || |||||||  |||| ||||||   || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |     |||||||| |||||||||     
15427 at-catacaaataatttaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcactttt 15333  T
467 gctcctaggttctttcctcttcttgaa-tcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||| | |  |||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
15332 gctcctatgattcttcaaacccttgaattcttcaagttcctcttctctctaaccc 15278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37013 - 36930
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
37013 tttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 36930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 439
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21869
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |  ||||||    
21442 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 21541  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
21542 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttg 21640  T
208 agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc 306  Q
    ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||  || |||||  || ||||||| |||||    
21641 agcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatca-taacttcatacatccaaacatgtcatc 21739  T
307 ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatt 405  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| |||  | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |   || |||||||    
21740 ataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagc-ctttttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgatt 21835  T
406 atgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
21836 atgatgaattataacccccttaccttagttaggt 21869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 439
Target Start/End: Original strand, 31141 - 31568
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |  ||||||    
31141 acatcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 31240  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||  |||   ||||  |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||    
31241 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaa-ttg 31339  T
208 agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc 306  Q
    ||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||||  || |||||  || ||||||| |||||    
31340 agcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattatca-taacttcatacatccaaacatgtcatc 31438  T
307 ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgatt 405  Q
    ||||||||| ||  ||||  | ||  | ||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |   || |||||||    
31439 ataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgatt 31534  T
406 atgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31535 atgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 31568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 47539 - 47438
Alignment:
335 tgaacaattaatcattta-ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
47539 tgaacaattaatcaattcgcccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgcaataa---tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 47444  T
434 ttaggt 439  Q
    ||||||    
47443 ttaggt 47438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 177 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 116700 - 116363
Alignment:
177 caacaacaacatagcataattcaacaatttgagca-taattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaatta 275  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| ||| |||||||||||    
116700 caacaacaacat--cataaatcatccatttgagcaatatttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaa----acccaca-caattcaatta 116608  T
276 tcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatac 375  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
116607 tcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgagcaattaataatttactcaattaagcacttattcatac 116508  T
376 aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttcactttagctcctagg 475  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   | | | |||||||||| |||||||||||||||||||    
116507 aaccattcaaaatttacactaaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctagg 116408  T
476 ttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||| |||  || ||||||||||||| || |||||||||||||||    
116407 atctctccaattattgaatcttcaagctcttcttctctctaaccc 116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 116795 - 116687
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
116795 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca 116696  T
143 acaacatca 151  Q
    |||||||||    
116695 acaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 164192 - 164567
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |  | ||||||||| ||| | || |||||||| ||  |    
164192 caccaacaccatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacattt 164291  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   | ||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  |  ||| ||| | | ||||  | |||||||||||| |||    
164292 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatatcttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat 164390  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac 353  Q
    |  || |||| ||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||  ||||  | ||  | |||| ||||||||| ||      
164391 tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaaaattaatcaattca 164489  T
354 tc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || |||||||||||||  |||||||  |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
164490 tccaattaagcacttac-catacaattaattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 164567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 162469 - 162401
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccat 111  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
162469 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat 162401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 166547 - 166463
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa 127  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| | ||||||    
166547 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaa 166463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 11664 - 12130
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
11664 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatcaatt 11763  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcat-aattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
11764 gatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacatgaaat 11863  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| || |  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
11864 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatcaattga 11963  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||    
11964 cccaattaagcacttattcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttaccttagttagattaatctccctagc 12061  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      |  ||||| |||| ||||||| |  | |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
12062 ttaggcttcaatttaactcctagctcttctccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 12130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 223 - 520
Target Start/End: Original strand, 16044 - 16342
Alignment:
223 atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |    
16044 atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgga 16143  T
323 ttataacaactttgaacaa-ttaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac 420  Q
    ||  | ||  | ||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
16144 tttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaac 16241  T
421 ccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||| |     ||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
16242 ccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctattctctctaacc 16341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 223 - 520
Target Start/End: Original strand, 25575 - 25873
Alignment:
223 atatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||  |    
25575 atatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacatgtcatcataattagagcacgga 25674  T
323 ttataacaactttgaacaa-ttaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaac 420  Q
    ||  | ||  | ||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
25675 tttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatacaataattgaaa--ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaac 25772  T
421 ccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaacc 519  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||| |     ||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
25773 ccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctctcccccaatccttgattcttcaagttcctattctctctaacc 25872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 132520 - 132137
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| |    
132520 caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 132421  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||   |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||  |||    
132420 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatataat 132322  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
132321 tcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 132222  T
353 ctcaattaagcacttattcata-caacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    | ||||||||||||| ||||||  || ||||||||| || ||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
132221 cccaattaagcactt-ttcatagaaataattgaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattccaacccccttaccttagttaggt 132137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 431
Target Start/End: Original strand, 88323 - 88626
Alignment:
126 aacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatat 224  Q
    ||||||||||| || || ||||||| | ||| ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||    
88323 aacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgatcatattttcaacacat 88421  T
225 atcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    | |  ||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||    
88422 acccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacattttaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatt 88521  T
325 ataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccc 422  Q
      | ||  | || |||||||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||     | | || ||||||||||||||||||||||    
88522 tcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaaacactt-ttcatacaaataattgaaaat---agcaataagtgattatgatgaattctaaccc 88617  T
423 ccttacctt 431  Q
    |||||||||    
88618 ccttacctt 88626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 62 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22681 - 22235
Alignment:
62 aacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatg 161  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||           |    
22681 aacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacat-----------g 22593  T
162 tttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaa 261  Q
     |||| |  | |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||  |  || |||||   || |||||||||||| || ||||||||    
22592 gttctcatcataattcaacaacaacttagcataattcacccaattgagcataattcacaagttaacacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaa 22493  T
262 caacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaa 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| | |  |||||||    
22492 caacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaatcaatcaatcatccaattaa 22393  T
362 gcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttca 461  Q
     ||||||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||    
22392 tcacttattcatacaataattaaaaaataacact-aaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaattccctacctcaagcttca 22294  T
462 ctttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
22293 ctttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctcctctcctctctaaccc 22235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27857
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
27453 atcaacccatttttacaaaaccgacaacaacaactcatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 27552  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || ||||| |||||| | |||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||| ||||||  |||||||| ||||    
27553 ttaacaacaacatcatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagggcacaattcacaatatatcattttc 27652  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
27653 acatactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact 27752  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttacct 430  Q
     ||| | || |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
27753 atgagcaaaataatcatttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaaatctaacccccttacct 27850  T
431 tagttag 437  Q
    || ||||    
27851 taattag 27857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 86313 - 86648
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
86313 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttacttcacatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 86412  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || ||| |||||||| | |||||| || | |  |||||| ||| | ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  ||||| || ||||    
86413 ttaacaacaaaaacatcaattaaacatgattatcatcacaattgaactataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataacattttc 86512  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||  |||||||  |||  |||||||    
86513 acatactatgaacatccaatttcaccaacaaaaattcaattatcacaaatttcatgtactcaaacatatcaacataacaagagcacggatttcaacaact 86612  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
      || | || |||||| ||| |||||||||||||||    
86613 aagagcaaaataatcacttattcaattaagcactta 86648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 417
Target Start/End: Original strand, 2411 - 2795
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
2411 atcaacctattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac 2510  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||||||||| ||||| | | || || |||||||||  ||||||||||| ||||    
2511 ttagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataaattatcatttagagcataatataacatatatcattttc 2610  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
      | ||||||| |||  |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    || |||||||| |||||||||  |||||| |||| ||| ||      
2611 atacactttgatcattcaatttctccaacaaccaaccaattatcaccaatttctcacatacaaacataccatcataataggagcacgaattctaataatc 2710  T
334 ttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattg-aaaatttacactaaaaatgattatgatgaattct 417  Q
     ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
2711 atgaccaattaatcaattactcaataaagcacttactcatacaacaattgaaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattct 2795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7966 - 7622
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||  || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
7966 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 7867  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
7866 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaattcacaatatatcattttc 7767  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
7766 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtagtcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaact 7667  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
      |||| || |||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||    
7666 aagaacaaaataatcacttattcaaataagcacttaagcatacaa 7622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Original strand, 4585 - 4999
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |   |||| || |||||||||||| | ||    
4585 caacaacaacttatttttcatcatcaaatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaa 4684  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||  |  ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
4685 catgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 4784  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
4785 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattaaaacacgaatttcaacaactatgaacaa-taatcagttattcaa 4883  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaattta-cactaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
     |||| ||||| |||| |||  | |||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||    
4884 ctaagtacttaatcatgcaattaatgaaaaattaccact--aaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaat-cctagcccaa 4980  T
456 acttcactttagctcctag 474  Q
     ||||| ||||| ||||||    
4981 gcttcaatttagatcctag 4999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 33640 - 34103
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
33640 accaacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 33739  T
156 aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt 254  Q
    | ||||   ||||  | |||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
33740 atcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaatt 33838  T
255 tcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttac 353  Q
      || ||||||||||||||||||   || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  |  |||||||||||| ||| |     
33839 caactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcat 33938  T
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcc 452  Q
     |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||     
33939 ccaattaagcacttaatcatacagtaattgaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattctaatccccttaccttagttagattaatctccctagct 34035  T
453 caaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     |  ||||| |||||||||||| ||    ||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
34036 taggcttcaatttagctcctagctttcccccaatccttgattcttcaagttccttttctctctaaccc 34103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 474
Target Start/End: Original strand, 3232 - 3647
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
3232 caacaacaacttatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 3331  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| || | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
3332 catgatt-tcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcccaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 3430  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||  ||||||| ||| | || |||||| ||| |||    
3431 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagcgcacgaatttcaacaactatgagcaaaataatcacttattca 3530  T
357 attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagccca 454  Q
    ||||||||||||  |||  ||  |  ||||| |||| |||  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||||    
3531 attaagcacttaagcatgaaattagggaaaaattacaact--aattgattatgattgaattctaacccccttgccttaattagctcaaat-cctagccca 3627  T
455 aacttcactttagctcctag 474  Q
    | |||||||||| |||||||    
3628 agcttcactttaactcctag 3647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 70569 - 70116
Alignment:
62 aacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatg 161  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
70569 aacaacccatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatg 70470  T
162 tttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaa 261  Q
     | || |  | ||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||  |  || ||||    || |||||||||||| || ||||| ||    
70469 gtcctcatcataattcaacaacaatataacataattcacccaattgagcataattcacaagttagcactcatacacactttgaacatgcaaattcac-aa 70371  T
262 caacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattat-aacaactttgaacaattaatcatttactcaatta 360  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| || ||| || |||| | |||| || |||||||||||||| |||  || |||    
70370 caataattgaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaatttttaacatctatgaacaattaatcaattatacattta 70271  T
361 agcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaactt 459  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||  || |||    
70270 atcacttattcatacaataattgaaaattt-cac-aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagctt 70173  T
460 cactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctcta 516  Q
    || ||| |||||||| |   ||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||    
70172 catttttgctcctagctctcttccaatccttgattcttcaagttcctctactctcta 70116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 159279 - 159740
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||| ||   || ||||||||||||||| |||||||||||| |    
159279 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattat---catcaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 159375  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataa-ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
159376 gatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaat 159475  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||| | ||||||   || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
159476 tcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 159575  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
159576 cccaattaagcactt-ttcgtacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagc 159671  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
      |  ||||| ||| ||||| || |   |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
159672 ttaggcttcaattttgctccaagctctcttccactccttgattcttcaagttccccttctctctaaccc 159740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 85309 - 85772
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
85309 caccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 85408  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||    
85409 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaa-ttaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaat 85507  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | | ||||||||||| ||| |    
85508 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaattaatcaattca 85607  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagc 451  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
85608 cccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaagattaatctccctagc 85703  T
452 ccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttc-ctcttctctctaaccc 520  Q
      | |||||| ||| |||||| | || | ||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
85704 ttagacttcaattttgctccttgctt-tctccactccttgattcttcaagttctcccttctctctaaccc 85772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 188 - 520
Target Start/End: Original strand, 7915 - 8246
Alignment:
188 tagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttca 287  Q
    ||||||||||  || | ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||    
7915 tagcataattggaccaattgagcatattttcacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttca 8014  T
288 tgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaa 387  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
8015 tgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaattactcaattaagcacttattcatacaataattgtaaa 8114  T
388 tttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctct 486  Q
     || ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||  || ||||| |||||||||||| |   ||||  |    
8115 attgca--ataaatgattacgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagcttcaatttagctcctagctctcttccaat 8212  T
487 tcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
8213 ccttgaatcgtcaagttcctcttctcactaaccc 8246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Original strand, 7812 - 7908
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | |||||||||||||||| ||||||||||||    
7812 accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaa 7908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1213 - 818
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||    
1213 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttagcaacaacaacatcaattaaa 1114  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| ||                |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||   |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
1113 catgatt----------------aacaacatagcacaattcaacatttagagcacaattcccaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 1030  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||| | ||    
1029 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattttaacaactatgaacaaataatcacttatttaa 930  T
358 ttaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattatga-tgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaa 455  Q
    ||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||    
929 ttaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatgattgaaatctaacccccttaccttagttagaaaaaat-cctagcccaa 833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 846 - 466
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
846 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 747  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
746 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaat-gagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaat 648  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  |  ||||||||||| ||||||   ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
647 tcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 548  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
547 cccaattaagcacttattcatacaataattgaaaaatagca--ataaatga-tatgatgaattctaacccccttaccttagttag 466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 520
Target Start/End: Original strand, 1897 - 2356
Alignment:
59 aacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaac 158  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  | ||||||| |||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
1897 aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatc 1996  T
159 atgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||  |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |    
1997 atgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatataccattttcgcatactttgaacatgaaattcaa 2095  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactca 356  Q
    | ||||||||||||||||||   || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||| ||||||||| ||| || ||    
2096 ctaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagcaattaatcaattcaccca 2195  T
357 attaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaa 455  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||  |     
2196 attaagcactt-ttcatacaataattgaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttactttagttagattaatctccctagcttag 2291  T
456 acttcactttagctcctaggttct-ttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     ||||| ||||||||||| |||||   ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
2292 gcttcaatttagctccta-gttctcccccaatccttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 2356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 118233 - 117852
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
118233 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaact 118134  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
118133 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgaacatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat 118035  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
118034 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 117935  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattg--aaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
      ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
117934 gccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 117852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 109732 - 109351
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
109732 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 109633  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||    
109632 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattt-atcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaat 109534  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
109533 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 109434  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattg--aaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
      ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
109433 gccaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaaaattgc---aataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 109351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 434
Target Start/End: Original strand, 75 - 498
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
75 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 173  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    |||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
174 ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttg 272  T
208 agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc 306  Q
    ||||||  ||||||||||| |  ||||  | ||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    || |||||  || ||||||| |||||    
273 agcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatc 372  T
307 ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgat 404  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    | | || ||||    
373 ataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataagtgat 468  T
405 tatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
469 tatgattaattctaacccccttaccttagt 498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Original strand, 8964 - 9428
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |  |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
8964 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaagt 9063  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || | ||   ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
9064 gatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaat 9162  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||| |||||||| ||| |    
9163 tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattca 9262  T
353 ctcaattaagcacttattcatacaacaattg-aaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctag 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| || |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
9263 ctcaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaaaattgc---aataatgattatgataaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctag 9358  T
451 cccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |  | |||||| ||| |||||||| |     ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
9359 cttagacttcaattttgctcctagctcaaccccaattcttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 9428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Original strand, 29944 - 30254
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||     ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
29944 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacgtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcgcttaacaacaacaacatcaattaaa 30043  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| |||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||    
30044 catgattctcatcacaattcaacaaaaacatagcacaattcaacaattagagcaaaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttca 30143  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca 356  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| || | || | || |||||| |||||||    
30144 cctacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcatagtaagagcacgaattttaactac-tagagcaaaataatcacttactca 30242  T
357 attaagcactta 368  Q
    ||||||||||||    
30243 attaagcactta 30254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Original strand, 21979 - 22290
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||  |  |||||||  |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
21979 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatacatacccaagctgtgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 22078  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    ||||  ||| |  |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||    
22079 catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcccaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca 22178  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga-acaattaatcatttactca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||   ||||||| ||||  ||||||| ||| | || |||||| ||| |||    
22179 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatactcaaacataacatcatagcaagagcacgaatttcaacaactatgagaaaaataatcacttattca 22278  T
357 attaagcactta 368  Q
    ||||||||||||    
22279 attaagcactta 22290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Original strand, 37538 - 37848
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||| | ||    
37538 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa 37637  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttca 257  Q
    |||| ||||     ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||    
37638 catgattctcgtctcaattcaacaataacatagcacaattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatttca 37737  T
258 ccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactca 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| | || | || |||||| |||||||    
37738 ccaacaacaattcaattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattttaacaac-tagagcaaaataatcacttactca 37836  T
357 attaagcactta 368  Q
    ||||||||||||    
37837 attaagcactta 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 318
Target Start/End: Original strand, 7358 - 7642
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
7358 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctc 7457  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||  |||||||| ||||    
7458 ttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttc 7557  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca 318  Q
     |||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
7558 acatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagca 7642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 318
Target Start/End: Original strand, 16783 - 17067
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
16783 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatctc 16882  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||| |||| |  | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||  |||||||| ||||    
16883 ttagcaacaccaacatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacagcatagcacaattcaacatttatagcacaattcacaatatatcattttc 16982  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca 318  Q
     |||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
16983 acatactatgagaatgcaatttcaccaacaataattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagca 17067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 4543 - 4915
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
4543 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 4642  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
     |||  | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
4643 aatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 4742  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc 355  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |  |    
4743 accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatcc 4842  T
356 aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||      || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4843 aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat------tacaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 4915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 9157 - 9529
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
9157 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 9256  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
     |||  | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
9257 aatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 9356  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc 355  Q
    ||||||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |  |    
9357 accaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatcc 9456  T
356 aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||      || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9457 aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat------tacaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 9529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 387
Target Start/End: Original strand, 5920 - 6251
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
5920 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 6019  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatca-ctttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    ||||  | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||     
6020 catgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttctcatactttgaacatgaaattc 6119  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttact 354  Q
     |||||||||||| ||||||||   || |||||  |||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| ||     
6120 taccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc 6219  T
355 caattaagcacttattcatacaacaattgaaaa 387  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
6220 aaattaagcactt-ttcatacaataattgaaaa 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 520
Target Start/End: Original strand, 12588 - 12710
Alignment:
399 aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatctt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |  ||||| |||  |||||||||   |||| || ||||| ||||    
12588 aatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcctaggtctcttccactccttgattctt 12687  T
498 caagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
12688 caagttccccttctctctaaccc 12710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 437
Target Start/End: Original strand, 107967 - 108369
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||  |    
107967 atcaacccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcaa-aattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatc 108065  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttc 233  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||| |  | |  |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| || ||||    
108066 ttaacaacaacaacatcaattaaacatgatcttcatcacaattcaacaataaca-agcataattcaacatttagagcataattcataatataccattttc 108164  T
234 tcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  ||||  |    
108165 acatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaacatgt 108264  T
334 ttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttacct 430  Q
      || | || |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
108265 aagagcaaaataatcacttattcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttacct 108362  T
431 tagttag 437  Q
    |||||||    
108363 tagttag 108369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 437
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10294
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaa 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||    
9903 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaa 10002  T
144 caacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatacttt 242  Q
    ||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| |  ||||  |  ||||    
10003 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatacccttttcatactcttt 10101  T
243 gaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaat 342  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||  | ||||||||    
10102 gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaat 10201  T
343 taatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
10202 taatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaagaattgaaaatttgc---aataatgattattatgaattctaacccccttaccttagttag 10294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 434
Target Start/End: Original strand, 7151 - 7524
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacat-caactga 156  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||    
7151 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattga 7250  T
157 acatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaattt 255  Q
    | |||  | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||     
7251 aaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc 7350  T
256 caccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttact 354  Q
     ||||||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |      
7351 aaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatc 7450  T
355 caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||      || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7451 caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat------tacaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 7524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 238 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 89950 - 89671
Alignment:
238 actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga 337  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |||    
89950 actttgaacatacaaattcac-aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatt-taacatctatga 89853  T
338 acaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
89852 acaattaatcaattatccaattaatcacttattcatacaataattgaaaa-ttacactaaaaa-gattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 89755  T
438 gtcaat-tccctagcccaaacttcactttagctcctaggt-tctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     | ||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||| | ||||| |  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
89754 attaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctctcttt-caatccttgattcttcaagttccacttctctctaaccc 89671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 90135 - 90037
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
90135 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaacatca 90037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 107910 - 107974
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
107910 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat 107974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 439
Target Start/End: Original strand, 40662 - 41017
Alignment:
82 caaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaaca 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||   ||||  |||||  ||||    
40662 caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaaca 40761  T
182 acaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcac-tttctcatactttgaacatgaaatttc-accaacaacaattcaattatcac 279  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||   ||| |||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||      
40762 acaatatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatcca 40860  T
280 caatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaac 378  Q
     || |||||  ||  |||||| ||||||||||||||| || ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||     
40861 taacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcac-tattcatacaat 40959  T
379 aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||| ||||||    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
40960 aattaaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattataacccccttaccttagttaggt 41017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Original strand, 46145 - 46524
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||     
46145 caacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgat 46244  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcac-tttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||   ||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
46245 catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatattttcacataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttc 46343  T
257 -accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttact 354  Q
     || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||| |||||||| || ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| ||     
46344 aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc 46443  T
355 caattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
46444 caattaagcactt-ttcatacaataattaaaaatt---gcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaattaggt 46524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 324
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5187
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||    
4906 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca 5005  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactt 241  Q
    |||||||||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||     
5006 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaa-ttaagcatattttcaacatataccaacttctcatactg 5104  T
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
5105 tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatt 5187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34559 - 34477
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
34559 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt 34477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 24995 - 24616
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | |||     
24995 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 24896  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||      
24895 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaa-ttgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattca 24797  T
257 accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactc 355  Q
    || |||||||||| ||||||||  || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | || |||||||||| ||| ||      
24796 actaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacct 24697  T
356 aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||   | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24696 aattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaattt---caataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 24616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 10
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
430 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 332  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    | |||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| |||    ||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || | ||     
331 ctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattc-acgaatta 233  T
208 agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc 306  Q
    ||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||    
232 agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatc 133  T
307 ataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgat 404  Q
    |||| || ||||| ||||  | ||  | | |||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| ||||    
132 ataaatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgat 38  T
405 tatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
37 tatgatgaacactaacccccttacctta 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6603
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaa 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||    
6679 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactcaattctcaacaacaa 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6562 - 6304
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaatt 269  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||  |||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||     
6562 acaattcaacaacaacaaaacataattcacgaatta-agcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatc 6464  T
270 caattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcactta 368  Q
    ||||||||   || |||||  || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||  | ||  | |||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||    
6463 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcactta 6364  T
369 ttcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
     |||||| || ||||||||| ||||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
6363 -tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 6304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Original strand, 24890 - 25204
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
24890 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgca-acccaag 24987  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttg 207  Q
    |||||||| || | |||||||||  | || || |||||||| ||| ||| | ||   ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||    
24988 ccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaa-ttg 25086  T
208 agcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatc 306  Q
    ||||||  ||||||||||| |  ||||  | ||||  |||||||| ||  || |||||||||||||||||    || |||||  || ||||||| |||||    
25087 agcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatc 25186  T
307 ataattagagcacaaatt 324  Q
    |||| |||||||||||||    
25187 ataaatagagcacaaatt 25204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 433
Target Start/End: Original strand, 25235 - 25564
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||  | || || |||||||| ||| ||| | ||   ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |    
25235 cccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacc 25334  T
202 aatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacat 300  Q
    || |||||||||  ||||||||||| |  ||||  | ||||  |||||||| ||  || |||||||||||||||||    || |||||  || |||||||    
25335 aa-ttgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacat 25433  T
301 atcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaa 398  Q
     ||||||||| |||||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    | | |    
25434 gtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaata 25529  T
399 aatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 433  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
25530 agtgattatgatgaagactaacccccttaccttag 25564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 432
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1732
Alignment:
30 tcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| | || | |||||||    
1332 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaac 1431  T
129 atcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatc 227  Q
    || || ||||| || ||||||  | ||| ||||   ||||  |||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |    
1432 atgacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaa-ttgagcatattttcaacatatacc 1530  T
228 actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattata 327  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  |    
1531 aatttctcatactttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttca 1630  T
328 acaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccct 425  Q
     ||  |  |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||    
1631 tcacataggaacaattaatcaattcacccaattaagcactta-tcatccaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaaccccct 1725  T
426 tacctta 432  Q
    |||||||    
1726 tacctta 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 368
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25637
Alignment:
171 acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattc 270  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
25439 acaaatcaacaagaacatagcacaattcaacaattaaagcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacaggcaatttcaccaacaacaattc 25538  T
271 aattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||  || | || |||||| |||||||||||||||||||    
25539 aattttcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaaataatcacttactcaattaagcactta 25637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 253271 - 252924
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||  |    
253271 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaa 253172  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactt 241  Q
    |||||| ||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
253171 acaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaatttctcatactt 253073  T
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaa 341  Q
    |||| ||| ||||  || |||||||||||||||||| | || |||||  || ||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||  | || ||||    
253072 tgaaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgcacaa 252973  T
342 ttaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatt 389  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
252972 ttaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt 252924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 368
Target Start/End: Original strand, 14099 - 14326
Alignment:
141 caacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatact 240  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||| || |||| ||||||    
14099 caacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaataacgtagtataattcaacatttagagcacaattcacaatataccattttcacatact 14198  T
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac- 339  Q
     |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||| | || |     
14199 atgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattttaacaac-tagagca 14297  T
340 aattaatcatttactcaattaagcactta 368  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
14298 aaataatcacttactcaattaagcactta 14326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3407
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  ||||||    
3230 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 3328  T
108 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaac 186  Q
    |||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||   ||||  |||||||| |||||||    
3329 ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 22668 - 23050
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||  | || |||||||||||| |    
22668 caccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaatt 22767  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||| |  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| |||    
22768 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat 22866  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || |||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
22867 tcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 22966  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
      ||||||||||||| || |||| || |||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22967 tccaattaagcactt-ttgatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 23050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11457
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| || | ||||||||| || || || ||||||||| || |    
11837 caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaatt 11739  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| || ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||| |||    
11738 gatcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatta-agcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat 11640  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac 353  Q
    |  | |||||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||      
11639 tcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 11540  T
354 tcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
     ||||||| ||||| |||||||||  | | |||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
11539 acaattaaacactt-ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccataccttagttaggt 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 436
Target Start/End: Original strand, 60784 - 61163
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| ||| |  |||||| ||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
60784 caccaacaacatctcatttctccaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 60882  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || |||  || |||| ||| |  ||| |||||||||||||||| |||    
60883 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagtatatttttaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaat 60981  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  ||||||||||||||||||||    ||  ||||  ||  |||||| | |||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
60982 tcaaccaacaacaattcaattattcataacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca 61081  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 436  Q
    | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
61082 cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 61163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 70892 - 70622
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||| ||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||||| | |    
70892 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatccaat 70793  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaa 252  Q
    || ||||   ||||  |||||||| |||||| |  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||    
70792 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacctacttt-tcatactttgaacatgtaa 70695  T
253 tttcaccaacaacaattcaatta-tcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||  || ||||| || ||||||| |||  || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
70694 ttcaactaacaataaatcaattattcattaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatt 70622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 171872 - 172034
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||| |  || |||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||     
171872 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaacaacaaatcatgaa-tatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcc 171970  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt 206  Q
    | |||||||| |||||| |  || ||   ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
171971 ataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaattt 172034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 177575 - 177737
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||| |  || |||| |||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||     
177575 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaacaacaaatcatgaa-tatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcc 177673  T
143 acaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaattt 206  Q
    | |||||||| |||||| |  || ||   ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
177674 ataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaattt 177737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 79920 - 79778
Alignment:
295 aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttac 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||       
79920 aaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt--- 79825  T
393 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    || |  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
79824 acaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagcttagttaggt 79778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1096 - 715
Alignment:
51 aaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatc 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||| |    
1096 aaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaac 997  T
151 aactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg 249  Q
    || ||| ||||   ||||  |||| ||| ||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||| || ||||  ||| |  ||| ||||||||||||||||    
996 aattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcaactcatacccatttttcatactttgaacatg 898  T
250 aaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcat 349  Q
     ||||   | ||||||||| |||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||| |||||     
897 taattcatctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatcaatcaa 798  T
350 tt-actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
797 ttcactcaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7118 - 6736
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac- 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||||     
7118 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca 7019  T
154 --tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatata-tcactttctcatactttgaacatga 250  Q
      ||| ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| |||  || ||||  | ||| ||||||||     
7018 attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcacacatacccattttcatacactctgaacatgt 6920  T
251 aatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-at 349  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||    || |||||  ||  |||||| || || |||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||    
6919 aattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat 6820  T
350 ttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    | || |||||||||||| | |||||| || |||||||||||    | | || |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
6819 tcacccaattaagcactga-tcatacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccc---accttagttaggt 6736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 377
Target Start/End: Original strand, 8606 - 8790
Alignment:
194 aattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaatt 293  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
8606 aattcaacaattagagcacaattcataatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtact 8705  T
294 caaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||  || ||||  |||| || |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
8706 caaacatatcatcacaacaagagcacgaatttcaataactaagaacaaaataatcacttattcaattaagcacttaagcatacaa 8790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 1791 - 1944
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| || || ||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||| |    
1791 atcaacccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttcacatcatcaattcatgatttatg-acacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctc 1889  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacata 189  Q
    ||| || || ||||||||| | |||||| |||| |  ||||||| |||||||||||    
1890 ttaacaacatcaacatcaattaaacatgattctcatcacaattc-acaacaacata 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 439
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1674
Alignment:
61 caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacat 160  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| ||| |||    
1300 caacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcat 1399  T
161 gtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacc 259  Q
    |   ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||| |  ||| |||||||||||||||| ||||  |||    
1400 gaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaa-ttaagcatattttcatcacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaacc 1498  T
260 aacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaat 358  Q
    | ||||||||||||||||   || |||||  ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||  | ||  | |  |||||||||| ||| | |||||    
1499 accaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaattcattcaat 1598  T
359 taagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    ||| ||||| ||||||| || |||||||   || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
1599 taaccactt-ttcatacaaataattgaa---ttgca--ataagtgattatgatgaattctaacccccttgccttagttaggt 1674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11740 - 11546
Alignment:
238 actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga 337  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    || |||||  ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||    
11740 actttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga 11641  T
338 acaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11640 acaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1107 - 872
Alignment:
92 attatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagc 191  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| | ||||||  |||  | ||| |||||||||||||||||    
1107 attatgaacacacaagctatgaatcattaacaacgatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaatctccccacatttcaacaacaacatagc 1008  T
192 ataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaa 291  Q
    | |||||||||||| ||||| ||| || |      || |||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |    
1007 acaattcaacaattagagcacaatacacc------cattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcattta 914  T
292 ttcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaact 333  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||    
913 ctcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaacaact 872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 314 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 5689 - 5565
Alignment:
314 gagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaa 413  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
5689 gagcacaagttttaacatctatgaacaattaatcacttattcaattaagcacttattcatataataattgaaaaattacact-aaaatgattatcatgaa 5591  T
414 ttctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
5590 ttataacccccttatcttagttaggt 5565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 439
Target Start/End: Original strand, 38275 - 38657
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  ||||||  |||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||| |||| |    
38275 caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaatt 38374  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||| |  |||||| | ||||||||||| |||    
38375 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaa-ttgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttgaacatgtaat 38473  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaa-tcattta 352  Q
    |  |||||||| |||||||||||    || ||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |  |||  | ||  | ||||||||||| | ||| |    
38474 tcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaattaattaattca 38573  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 439  Q
    | ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38574 cccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 38657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11977 - 11598
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||  ||| |  | |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
11977 caccaaaaacatctcatttctcaacaccaa-tcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 11879  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   ||||  | |||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||  ||| |  ||| |||||||||||||||| |||    
11878 gatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaactaatacccatttttcatactttgaacatgtaat 11780  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |   |||||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||| |||||||| |||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
11779 tcatccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaattaatcaattca 11680  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 437  Q
      |||||||||||||| |||||| || |||||||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
11679 tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaataagtgattatgatgaattctaacccccttagcttagttag 11598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 488 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11546 - 11514
Alignment:
488 cttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
11546 cttgattcttcaagttcctcttctctctaaccc 11514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 276
Target Start/End: Original strand, 1 - 219
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||  ||| |  |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||||||| |||     
1 caacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgat 100  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc 256  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||| || ||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||      
101 catgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaatt-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattca 199  T
257 accaacaacaattcaattat 276  Q
    ||||||||||||||||||||    
200 accaacaacaattcaattat 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 152
Target Start/End: Original strand, 3496 - 3593
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaa 152  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||  ||| |  |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| ||||||||||||    
3496 caccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaa 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 68014 - 67844
Alignment:
208 agcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatca 307  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
68014 agcacaattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcacgtactcaaacatatcatca 67915  T
308 taattagagcacaaattataacaactttgaac-aattaatcatttactcaattaagcacttattcatacaa 377  Q
    |||  ||||||| ||||  |||||||  || | || |||||| ||| |||||||| ||||||  |||||||    
67914 taacaagagcacgaatttcaacaactaagagcaaagtaatcacttattcaattaatcacttaagcatacaa 67844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3014 - 2787
Alignment:
86 tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatca---actgaacatgtttcttactacaattcaacaa 182  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||| || |||||||| ||   | | ||||||  ||| |  |||| |||||||    
3014 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcttttaacaacaacaacaacataaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaa 2915  T
183 caacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa 282  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| || |||| |||| | |||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
2914 caacataatacaattcaacaattagagcacaattcacaatataccattttcacatattatgaaaatgcaattttatcaacaacgattcaattatcaccaa 2815  T
283 tttcatgaattcaaacatatcatcataa 310  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
2814 tttcatgtactcaaacatatcatcataa 2787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 343 - 520
Target Start/End: Original strand, 372 - 546
Alignment:
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaa 442  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||   | |    
372 taatcacttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaa-ctacact--aaatgattacaatgaattctaacccccttacctcagttatcacca 468  T
443 ttccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||||||||     ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
469 attcctagctcaagcttcactttagctcctagccctcttccaatccttgaatcttcaagctcctcttctctctaaccc 546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 474
Target Start/End: Original strand, 5595 - 5806
Alignment:
261 acaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaatta 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||   ||||||| |||||| ||| |||||||    
5595 acaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaaaaatgatgaacaaataatcacttattcaatta 5694  T
361 agcacttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaact 458  Q
    ||||||||  |||  ||  | | |||| |||| |||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||| ||    
5695 agcactta-acatggaattaataaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctagcccaagct 5790  T
459 tcactttagctcctag 474  Q
    ||| ||||||||||||    
5791 tcaatttagctcctag 5806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 788 - 644
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    |||||||||||||| || | ||||||||| |||||| | |||||||||||| |    
788 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaatt 689  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca 199  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
688 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattca 644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19452
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |  || ||   ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
19231 cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc 19330  T
202 aatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaaca 299  Q
    || ||||||| ||  ||||  |  ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||    
19331 aa-ttgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca 19427  T
300 tatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||| | || |||||| ||||    
19428 tatcatcacagttggagcacgaatt 19452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Original strand, 21315 - 21536
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |  || ||   ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
21315 cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcacc 21414  T
202 aatttgagcataa--ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaaca 299  Q
    || ||||||| ||  ||||  |  ||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||||| || ||||||    
21415 aa-ttgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaaca 21511  T
300 tatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||| | || |||||| ||||    
21512 tatcatcacagttggagcacgaatt 21536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1490 - 1406
Alignment:
343 taatcatttactcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacct 430  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
1490 taatcatttattcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaa-ctacact--aaatgattatgatgaattctaacccccttacct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16108 - 15953
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
16108 caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa 16009  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 213  Q
    |||| ||||    | ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
16008 catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3124 - 2969
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||  |||| | ||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
3124 caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccatgtcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa 3025  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 213  Q
    |||| ||||    | ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
3024 catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 2969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Original strand, 5162 - 5251
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac 147  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||    
5162 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacatagcaacaacaac 5251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13048 - 12782
Alignment:
11 tcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagcc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |  |  || ||  ||  |||| ||||||||| ||||||      
13048 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaacttaaattacatcataaatccatg-attatgaacacccaagtt 12950  T
110 atgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgag 209  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||  | ||||||  |   || |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
12949 atgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcatttaaacatgaattccaccacacatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagag 12850  T
210 cataattcaacatatat-cactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattat 276  Q
    || ||||||  | |||| || |||  |||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
12849 cacaattcacaacatatccattttaacatattatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattat 12782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5875 - 5714
Alignment:
39 acccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||  || ||    
5875 acccatttatacaaaacaaccaacaacatctcatttctcaccaacaa-tcatgacatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcag 5777  T
138 cagcaacaacatcaactg-aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca 199  Q
    || |||||||||||| || ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||    
5776 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattca 5714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 434
Target Start/End: Original strand, 7593 - 7924
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||   ||||  | |||| | ||||||||  |||||||||| |    
7593 cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcacc 7692  T
202 aatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacat 300  Q
    |||| ||||||| || || |||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    || |||||  ||  ||||||    
7693 aatt-gagcatattttcatcatatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcatacatctaaacat 7791  T
301 a-tcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaa 397  Q
    |  ||||||||||||| ||  ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||   || |     
7792 aggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-ttcatacaaataattgaaaatt---acaat 7887  T
398 aaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
7888 aagtaattatgatgaattctaacccccttaccttagt 7924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 264 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 27051 - 26843
Alignment:
264 acaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactcaattaagc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||  |||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
27051 acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattatagcacgattttcaacaatgatgaacaaataatcacttattcaattaagc 26952  T
364 acttattcatacaacaattgaaaatttac-actaaaaatgattat-gatgaattctaacccccttaccttagttaggtcaattccctagcccaaacttca 461  Q
    |||||  |||  ||  | |||||| |||| |||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||| ||| |||||    
26951 actta-acatggaattaatgaaaaattacaact--aattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttagcaaaaat-cctagcacaagcttca 26856  T
462 ctttagctcctag 474  Q
     ||||||||||||    
26855 atttagctcctag 26843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 48124 - 48498
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| || | |||||||||  |||| || ||| || | |||     
48124 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat 48222  T
154 tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    ||| ||||   |||   |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||    
48223 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaatt-gagcatattttaacacatacccatttttcatactttgaacataaaat 48321  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || |||||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
48322 tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca 48421  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
48422 tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttagt 48498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 61572 - 61946
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaa-tcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaac 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| || | |||||||||  |||| || ||| || | |||     
61572 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat 61670  T
154 tgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    ||| ||||   |||   |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||    
61671 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaatt-gagcatattttaacacatacccatttttcatactttgaacataaaat 61769  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attta 352  Q
    |  || |||||||||||||| ||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| ||| |    
61770 tcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca 61869  T
353 ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
      |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
61870 tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttagt 61946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4591 - 4436
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||  |||||  ||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
4591 caacaataactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaaatcataaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattaaa 4492  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata 213  Q
    |||| ||||    | ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
4491 catggttctcttcataattcaaaaacatcatagcataattcaaccaattgagcata 4436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Original strand, 1574 - 1663
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaac 147  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
1574 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 149
Target Start/End: Original strand, 5937 - 6028
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacat 149  Q
    |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||    
5937 caacaacaactcatttttcatcgccaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaacatcacttagcaacaaaaacat 6028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 520
Target Start/End: Original strand, 6030 - 6109
Alignment:
441 aattccctagcccaaacttcactttagctcctaggttctttcctcttcttgaatcttcaagttcctcttctctctaaccc 520  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
6030 aattccctagctcaagcttcactttagctcctagctctcttccaatccttgaatcttcaagctccttttctctctaaccc 6109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33704 - 33414
Alignment:
35 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcac 133  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| || ||  ||  ||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||| || ||| |    
33704 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattcacatcacaaacccatga-ttatgaacacccaagctataaatcatcaacaataatatctc 33606  T
134 ttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-acttt 232  Q
     |  || |||||||||||| | ||  ||  ||| || ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| |  ||||| | | |||    
33605 atgacaacaacaacatcaattaaatgtgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaatttaacaattagagcacaatttataatatacctatttt 33506  T
233 ctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||| | |||||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
33505 ctcatattatgaacattcaatttcatctacatcaatttaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatt 33414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 432
Target Start/End: Original strand, 20274 - 20524
Alignment:
180 caacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatc 277  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||  | |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||     
20274 caacaacaaagcataattaaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt 20372  T
278 accaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcataca 376  Q
       || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||||    
20373 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-cataca 20471  T
377 ac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    |  |||||||||||   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
20472 aataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 48350 - 48414
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcat 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
48350 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcat 48414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Original strand, 14854 - 15226
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||||   | |    
14854 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca---att 14950  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaat 253  Q
    || ||||   | ||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||  ||| ||| | | ||||  | |||||||||||| |||    
14951 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt-gagcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaat 15049  T
254 ttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttac 353  Q
     | || |||| ||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||      
15050 ctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca 15148  T
354 tc-aattaagcacttattcataca-acaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15149 tccaattaagcacttat-catacatataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 15226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 14194 - 14287
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || ||||||||    
14194 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 14287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 255084 - 254708
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  | |||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
255084 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 254985  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacatata-tcactttctcatactttgaacatgaaa 252  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||  || ||||  | |||||||||||| ||    
254984 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaa 254886  T
253 tttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatc-attt 351  Q
     |||| | ||||||||||||||||    || |||||  ||  || ||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | ||||||||||||| |||     
254885 -ttcaactacaacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattc 254787  T
352 actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    |  ||||||| |||||| |||||| || ||||||||  |||||  | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
254786 atccaattaaacactta-tcatacaaataattgaaa--ttaca--ataagtgattatgatgaattatatcccccttaccttagt 254708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 261690 - 261540
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  | |||||||||||| || | ||||||||| || || || |||||||||||| |    
261690 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 261591  T
155 gaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    || ||||   ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
261590 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt 261540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 123264 - 123181
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
123264 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatt 123181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 147531 - 147612
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttag 137  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
147531 accaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 147612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 318
Target Start/End: Original strand, 1349 - 1424
Alignment:
242 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagca 318  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
1349 tgaacatgcaatttccccaacaacaactcaattatcactaatttcatgta-tcaaacatatcatcataattagagca 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1352
Alignment:
44 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaa 92  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
1304 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaa 1352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 12694 - 12912
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaacccatttta-caaaatcac-caacaacaactcatttctcaccaacaaatc-atgaattatgaactccc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |  || || || |||||| |||| |||||||| |||    
12694 acatcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccattttaacaaaaaccctcaacaacaacttaaatcacatca-caaatccatga-ttatgaacaccc 12791  T
105 aagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaat 204  Q
    |||  ||||||||| |||||||| ||| | || || |||||||||||| | ||||||  |   || |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
12792 aagttatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgaattccaccacaaatcaacaacaacatagcacaattaaacaat 12891  T
205 ttgagcataattcaacatata 225  Q
    | ||||| || |||| |||||    
12892 tagagcacaaatcaaaatata 12912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 13531 - 13634
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||| |    
13531 cccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatc 13630  T
202 aatt 205  Q
    ||||    
13631 aatt 13634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13752
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
13670 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatt 13752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 41673 - 41776
Alignment:
102 cccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaac 201  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||||| |    
41673 cccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcacc 41772  T
202 aatt 205  Q
    ||||    
41773 aatt 41776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Original strand, 41812 - 41894
Alignment:
241 ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
41812 ttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatt 41894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3387 - 3317
Alignment:
61 caacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatc 131  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
3387 caacaactcatttcacaataaaaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 3427 - 3392
Alignment:
8 acatcatcaaaatcaaacttcttcatcatcaaccca 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
3427 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Original strand, 1655 - 1724
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
1655 caacaacatctcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcataaacaacaa 1724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 50124 - 49975
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| ||    
50124 accaacaacatcttatttttcatcaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 50026  T
156 -aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
50025 aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaatt 49975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 17680 - 17826
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |  ||   ||||||||||||||| ||    
17680 accaacaacatcttatttctcaccaac-aatcatgatatatgagcacccaagccataaatcataaacaacaacttgtct---cagcaacaacatcaattg 17775  T
156 -aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
17776 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 17826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 5201 - 5349
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| |     
5201 accaacaacatcttatttcttaccaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aatcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatta 5298  T
156 aa-catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
    || | || |||| ||  |||||||||||||||||  || |||||| |||||    
5299 aatcttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17542 - 17441
Alignment:
104 caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  |||||||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||    
17542 caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa 17443  T
204 tt 205  Q
    ||    
17442 tt 17441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24467 - 24374
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaaca 148  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||| || | ||||||||| || ||||| ||||||||    
24467 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaaca 24374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24371 - 24154
Alignment:
213 aattcaacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataat 311  Q
    ||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||| |||    
24371 aattcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaat 24272  T
312 tagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatga 409  Q
    |||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| |||||||||    
24271 tagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatga 24177  T
410 tgaattctaacccccttacctta 432  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
24176 tgaacactaacccccttacctta 24154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19850
Alignment:
238 actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttga 337  Q
    |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||    || |||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | |||    
20041 actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga 19942  T
338 acaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 432  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
19941 acaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 19850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Original strand, 30056 - 30161
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || | |||||| || ||| | || ||    
30056 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaaca 30155  T
143 acaaca 148  Q
    ||||||    
30156 acaaca 30161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 61455 - 61354
Alignment:
104 caagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaa 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  |||||||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||    
61455 caagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa 61356  T
204 tt 205  Q
    ||    
61355 tt 61354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 48761 - 48844
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
48761 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 48844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3095 - 2959
Alignment:
295 aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttac 392  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||       
3095 aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttat-catacaaataattgaaaatt--- 3000  T
393 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2999 ac-aaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 2959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Original strand, 4501 - 4637
Alignment:
295 aaacatatcatcataattagagcacaaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttac 392  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||  | ||  | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||       
4501 aaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt--- 4596  T
393 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4597 ac-aaacgtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 4637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 129
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4358
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaaca 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| || | ||||||||    
4284 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca 4358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6492 - 6343
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactg 155  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| | ||||  ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||  || |||| |||||||||||| ||    
6492 accaacaacatcttatttctcatcaacaatt-atgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcatcaacaacatcaattg 6394  T
156 -aacatgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 205  Q
     ||| || |||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
6393 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 6343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 161
Target Start/End: Original strand, 32180 - 32286
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| |    
32180 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 32279  T
155 gaacatg 161  Q
    || ||||    
32280 gatcatg 32286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42123 - 42017
Alignment:
55 caccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaact 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||| ||| | || |||||||| ||| |    
42123 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 42024  T
155 gaacatg 161  Q
    || ||||    
42023 gatcatg 42017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6373 - 6268
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||| |||| ||||| | |||||| || ||| | || ||    
6373 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaaca 6274  T
143 acaaca 148  Q
    ||||||    
6273 acaaca 6268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 434
Target Start/End: Original strand, 8668 - 8701
Alignment:
401 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8668 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 8701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 634 - 551
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
634 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10241 - 10101
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | |||     
10241 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgat 10142  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattc 198  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||  ||||||||||    
10141 catgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattc 10101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6164 - 6081
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
6164 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 6081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3682 - 3599
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
3682 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 3599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1056 - 973
Alignment:
240 tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||    
1056 tttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatt 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34670 - 34595
Alignment:
56 accaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatca 132  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||    
34670 accaacaacatctcaattctcaccaacaa-tcatgttatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatca 34595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 93
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1414
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaat 93  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
1364 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17679 - 17522
Alignment:
58 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagcaacaacatcaactgaa 157  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||| |  |||||||||||||| |  | | | ||||||||||| || |||||||||| | |||     
17679 caacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 17580  T
158 catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt 216  Q
    ||||   ||||  |||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
17579 catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagcataatt 17522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31570 - 31465
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||| |  || |||||||| ||||| | |||||| || ||| | || ||    
31570 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 31471  T
143 acaaca 148  Q
    ||||||    
31470 acaaca 31465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 148
Target Start/End: Original strand, 41274 - 41379
Alignment:
43 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcagca 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||| |  || |||||||| ||||| | |||||| || ||| | || ||    
41274 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 41373  T
143 acaaca 148  Q
    ||||||    
41374 acaaca 41379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 51430 - 51393
Alignment:
81 acaaatcatgaattatgaactcccaagccatgaatcat 118  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
51430 acaaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcat 51393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Original strand, 12280 - 12359
Alignment:
244 aacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgaattcaaacatatcatcataattagagcacaaatt 324  Q
    |||||| | ||||||||||||  || ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaatt-catgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatt 12359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University