View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1936_low_3 (Length: 696)

Name: NF1936_low_3
Description: NF1936
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1936_low_3
NF1936_low_3
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (1-686)||(15645951-15646636)
chr2 (1-658)||(15655103-15655760)
chr2 (1-678)||(15625556-15626230)
chr2 (1-606)||(15534772-15535367)
chr2 (47-606)||(15518000-15518549)
chr2 (1-373)||(15494170-15494539)
chr2 (1-454)||(15605619-15606057)
chr2 (432-659)||(15494724-15494951)
chr2 (500-654)||(15607844-15607999)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 662; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 662; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 686
Target Start/End: Original strand, 15645951 - 15646636
Alignment:
Q  1 ctaattttgcagccaagtgcaatagtgtgtttctgtcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15645951 ctaattttgcagccaagtgcaatagtgtgtttctgtcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaa 15646050  T
Q  101 gatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15646051 gatactagcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgat 15646150  T
Q  201 aagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15646151 aagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaa 15646250  T
Q  301 gaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15646251 gaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaa 15646350  T
Q  401 agaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggc 500  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15646351 agaattttaaaaaaataaaagttaatgtaaggatttaccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggc 15646450  T
Q  501 attcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15646451 attcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctattaacatttttaaggctaagtctg 15646550  T
Q  601 caattggagaaaattatattgatcaatatttctgcaaatgagaagttctggaaatatcctttgttatctatggtggactgatgatg 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15646551 caattggagaaaattatattgatcaatatttctgcaaatgagaagttgtggaaatatcctttgttatctatggtggactgatgatg 15646636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 658
Target Start/End: Original strand, 15655103 - 15655760
Alignment:
Q  1 ctaattttgcagccaagtgcaatagtgtgtttctgtcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15655103 ctaattttgcagccaagtgcaataaagtgtttctgtcattatcatcttcatatgttactatgatacccttaatatgccctatttgatgtacgagattgaa 15655202  T
Q  101 gatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655203 gatactagcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatagtttgatttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgat 15655302  T
Q  201 aagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15655303 aagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcattaatgattttatttagctcctcctttgatgagtagtgtttttcaa 15655402  T
Q  301 gaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655403 gaatcgtggtccaaagaaatttaaccaattggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgagatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaa 15655502  T
Q  401 agaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggc 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655503 agaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggc 15655602  T
Q  501 attcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15655603 attcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctattagcatttttaaggctaagtctg 15655702  T
Q  601 caattggagaaaattatattgatcaatatttctgcaaatgagaagttctggaaatatc 658  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15655703 caattggagaaaattatatcgatcaatatttttgcaaatgagaaaatctggaaatatc 15655760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 678
Target Start/End: Original strand, 15625556 - 15626230
Alignment:
Q  1 ctaattttgcagccaagtgcaatagtgtgtttctgtcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |    
T  15625556 ctaattttgcagccaagtgcaataaagtgtttctgtcatcatc---ttcaaatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtataacattgta 15625652  T
Q  101 gatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgat 200  Q
    ||||  | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  15625653 gatagcaacataccgatgcaatacagctatgtgtaatatagttcgatttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactaataagctccgat 15625752  T
Q  201 aagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15625753 aagaatccaaaatttccaacttctgcagcatcaaatattacctgagaaggttcatttatgattttatttaactccacctttgatgagtagtgtttttcaa 15625852  T
Q  301 gaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaa 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15625853 gaatggtggtccaaagaaatttaactaattggaaaacaatgtgacttttcatgcctgaaatacgaattatggttaattaagttaatgaaaccaatgtaaa 15625952  T
Q  401 agaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggc 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  15625953 agaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccgggattggtcattatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccagaatttaaaggc 15626052  T
Q  501 attcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctg 600  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15626053 aatccattttgagccaagatatgcaaagctgtctcttcattcacatcacgtgcaaaagctagtgcatttctatctcttaccatttttaaggctaagtctg 15626152  T
Q  601 caattggagaaaattatattgatcaatatttctgcaaatgagaagttctggaaatatcctttgttatctatggtggac 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| |  |||| || |||||||||    
T  15626153 caattggagaaaattatattgatcaatatttttgcaaataagaagttatgtaaatattccatgttgtccatggtggac 15626230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 606
Target Start/End: Original strand, 15534772 - 15535367
Alignment:
Q  1 ctaattttgcagccaagtgcaatagtgtgtttctgtcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||||    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  15534772 ctaattttgcagccaagtgcaataaagtgtttcctttatcatcaa---catatgtcgctatgatatcctttatgtgccctatttgatgtacgacattgaa 15534868  T
Q  101 gatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||||||| |||||  |||| | |||||| |||    
T  15534869 gatactagcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatcgttcgattttcgccatccacctcccatatcaagcttggatag-cactaataagctccgat 15534967  T
Q  201 aagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaa 300  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||| ||||||||| | || |    
T  15534968 aaaaaccaaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcatttatgatttcatttaactcct---ttgatgagtagtgtctgtcta 15535064  T
Q  301 gaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15535065 gaatcgtggtccaaagaaatttaacgaattgaaaaaccatatgatttttcaggcctgcaatacaaaatttggtta-ttaagttaatgaaaccaatgtaaa 15535163  T
Q  401 agaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggc 500  Q
    | |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||| |||    
T  15535164 aaaattaataaaatataaa-gttaatgtaagg-tttaccaggattggtcatgatgtgattatgatcatgttctggataatgacaagaagaatccaatggc 15535261  T
Q  501 attcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctg 600  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| |  ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  15535262 atttgatcttgagccaagagatgcaaagctgtttctttattcacatcgcgtgcaaaagatagttctttcttgtctcttgccattttgaaggccaagtctg 15535361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 47 - 606
Target Start/End: Original strand, 15518000 - 15518549
Alignment:
Q  47 ttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaagatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcgg 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15518000 ttcaaatgtcactatgatatcctttatatgccctatttgatgtatgacattgaagatactggcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatagttcga 15518099  T
Q  147 tttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgataagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgag 246  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||| ||||   |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15518100 ttttcgcaatccacctcccatatcaagcttggatgggcactaataagctccgataagaacccaaaatttccaatttcagcagcatcaaatattagttgag 15518199  T
Q  247 aaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaagaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatt 346  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  15518200 aaggtttatttatgatttcatttaactccttctttgatgagtagtatctttctagaatcgtggtccagagaaatttaaccaattggaaaaccatatgatt 15518299  T
Q  347 tttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaaagaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattg 446  Q
    ||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||     |||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15518300 tttcaggcctgcgatacaaaatttggttac-taagttaatgaaaccaatgtaaataaatt-----aat---aaagttaatgtaagg-tttaccaggattg 15518389  T
Q  447 gtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacat 546  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | || |||| |||    
T  15518390 gtgatgatgtgattatgatcatgttctggacaatgacaagaagaatccaatggcatttgatttttagccaagagatgtaaagctgttttttcattctcat 15518489  T
Q  547 cacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattg 606  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15518490 cacgtgcaaaagctagttctttcttgtctcttaccattttgaaggccaagtctgcaattg 15518549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 15494170 - 15494539
Alignment:
Q  1 ctaattttgcagccaagtgcaatagtgtgtttctgtcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15494170 ctaattttgcagccaagtgtaatatagtgtttctgtcttcatc---ttcaaatgtcactatgacatcctttatatgccctatttgatgtacgagattgaa 15494266  T
Q  101 gatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgat 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||| | |||||| |||    
T  15494267 tatactagcatgccgatgcaaaacagctatgtgtaatatagttcgatttttgctatccatctcccatatcaagcttggatgggcactaataagctccgat 15494366  T
Q  201 aagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| | || |    
T  15494367 aagaacccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggtttatttatgatttcgtttaactcatcctttgatgtgtagtgtctgtcta 15494466  T
Q  301 gaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggt 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15494467 gaatcgttgtccaaagaaatttaaccaattggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggt 15494539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 15605619 - 15606057
Alignment:
Q  1 ctaattttgcagccaagtgcaatagtgtgtttctgtcatcatcattttcatatgtcactatgataccctttatatgccctatttgatgtaccagattgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  15605619 ctaattttgcagccaagtgcaataaagtgtttctgtcttcatcattttcatatgtcaatatgaaaccctttatatgccccatttgatgtatgaaattgaa 15605718  T
Q  101 gatactagcatgccgatacaaaacagctatgtgtaatatagttcggtttttgctatccacatcccatatcaagctaggataaacactgagaagctctgat 200  Q
    |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15605719 gatactataatgccgattcaagacagctatgtgtaatatagttcgatttttgcaatccacatcccatatcaagctaggataaacactgataagctctgat 15605818  T
Q  201 aagaatccaaaatttccaacttcagcagcatcaaatattagttgagaaggttcatttaggattttgtttaactcctcctttgaggagtagtgtttttcaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||  | |||| ||||||||  || |    
T  15605819 aagaatccataatttccaacttctgcagcatcaaaaatcagttgagaaggttgatttatgattttatgtaactcctc--tggagg-gtagtgttggtcca 15605915  T
Q  301 gaatcgtggtccaaagaaatttaaccaactggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacgaaatatggttacttaagttaacgaaaccaatgtaaa 400  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| |            || |||    
T  15605916 aaatcgttgtccaaagaaatttaaccaattggaaaaccacgtgatttttcatgcctgcaatacaaaatttggtgatttaatt------------tggaaa 15606003  T
Q  401 agaatttaaaaaatataaaagttaatgtaaggatttaccaggattggtcatgat 454  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15606004 agaattaataaaatataaaatataatgcaaggatttaccaggattggtcatgat 15606057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 432 - 659
Target Start/End: Original strand, 15494724 - 15494951
Alignment:
Q  432 gatttaccaggattggtcatgatgggattatgatcatgttcaggacaatgacaaccggaatccaaaggcattcgattttgagccaagagatgcaaagctg 531  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15494724 gatttaccaggattagtcatgatgggatgatgatcatgttccagacaatgacaacaagaatccaatggcatttgattttgagccaagagatgcaaagctg 15494823  T
Q  532 tctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtctgcaattggagaaaattatattgatcaatattt 631  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||    
T  15494824 tctcttcattcacatcacgtgcaaaagcaagtgcatttctgcctcttgccattttcaaggccaagtctgcaattgggaaaaaatattatgatcaatattt 15494923  T
Q  632 ctgcaaatgagaagttctggaaatatcc 659  Q
     ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  15494924 ttgcaattgcaaagttcttgaaatatcc 15494951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 500 - 654
Target Start/End: Original strand, 15607844 - 15607999
Alignment:
Q  500 cattcgattttgagccaagagatgcaaagctgtctctttattcacatcacgtgcaaaagctagtgcattcctacctcttaccatttttaaggctaagtct 599  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||    
T  15607844 cattagatttcgagccaagagatgcaaagctgtctcttcatttacatcacgtacaaaagctagttcattcctatctcttgccaattttaatgcaaagtct 15607943  T
Q  600 gcaattgg-agaaaattatattgatcaatatttctgcaaatgagaagttctggaaa 654  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||||||||| || || || |||||| ||||||    
T  15607944 gcaattggaagaaaaatattatgatcaatatttttgtaattgcgaagttgtggaaa 15607999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University