View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19372_high_15 (Length: 403)

Name: NF19372_high_15
Description: NF19372
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19372_high_15
NF19372_high_15
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (9-387)||(19020543-19020921)
chr4 (106-387)||(18169027-18169308)
chr4 (104-377)||(7131981-7132254)
chr4 (104-387)||(15287161-15287444)
chr4 (104-387)||(15294270-15294553)
chr4 (104-364)||(20000803-20001063)
chr4 (104-377)||(17145573-17145846)
chr4 (37-377)||(18248285-18248626)
chr4 (18-323)||(22738390-22738695)
chr4 (9-171)||(9795499-9795661)
chr4 (104-309)||(22351980-22352184)
chr4 (104-318)||(26339146-26339359)
chr4 (228-377)||(8374575-8374724)
chr4 (115-230)||(8378365-8378480)
chr4 (9-137)||(16523146-16523274)
chr4 (106-305)||(10644360-10644554)
chr4 (104-276)||(47357822-47357991)
chr4 (18-137)||(8045272-8045391)
chr4 (18-138)||(32460516-32460636)
chr4 (18-137)||(14500025-14500144)
chr4 (230-377)||(40885604-40885750)
chr4 (22-138)||(19697195-19697311)
chr4 (22-138)||(19707780-19707896)
chr4 (37-148)||(8378482-8378594)
chr4 (186-276)||(54118250-54118340)
chr4 (186-276)||(15675095-15675185)
chr4 (230-276)||(10104300-10104346)
chr4 (230-276)||(31115796-31115842)
chr4 (64-138)||(40885418-40885492)
chr4 (230-307)||(122027-122102)
chr4 (230-306)||(13048271-13048345)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (9-387)||(23777866-23778244)
chr2 (104-387)||(12728449-12728732)
chr2 (104-387)||(34824532-34824815)
chr2 (104-377)||(8943913-8944186)
chr2 (104-387)||(16935650-16935933)
chr2 (104-387)||(17006310-17006593)
chr2 (104-377)||(12635784-12636057)
chr2 (104-377)||(42177885-42178158)
chr2 (104-377)||(3798519-3798792)
chr2 (104-377)||(12641558-12641831)
chr2 (106-387)||(11231256-11231537)
chr2 (106-387)||(22513103-22513384)
chr2 (106-387)||(24685699-24685980)
chr2 (106-387)||(28775725-28776006)
chr2 (9-307)||(7507661-7507969)
chr2 (37-370)||(21141969-21142303)
chr2 (37-309)||(5888478-5888750)
chr2 (104-309)||(23774272-23774476)
chr2 (106-276)||(19886576-19886745)
chr2 (18-138)||(28031047-28031167)
chr2 (18-137)||(33128372-33128492)
chr2 (18-137)||(17204659-17204779)
chr2 (63-276)||(25265261-25265486)
chr2 (186-276)||(43642963-43643053)
chr2 (186-307)||(462876-462995)
chr2 (230-306)||(17396702-17396776)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (9-387)||(12901911-12902289)
chr3 (106-387)||(25058796-25059077)
chr3 (106-387)||(22275266-22275547)
chr3 (106-387)||(15468258-15468539)
chr3 (104-377)||(18911060-18911333)
chr3 (106-387)||(49232493-49232774)
chr3 (104-387)||(5228370-5228652)
chr3 (106-377)||(12264710-12264982)
chr3 (106-387)||(1467657-1467938)
chr3 (63-372)||(54651529-54651838)
chr3 (106-347)||(12811938-12812179)
chr3 (9-276)||(15936456-15936723)
chr3 (9-276)||(15938298-15938565)
chr3 (37-370)||(44229059-44229393)
chr3 (106-274)||(18896962-18897130)
chr3 (106-276)||(55316387-55316555)
chr3 (18-137)||(16933782-16933901)
chr3 (106-276)||(41270243-41270411)
chr3 (106-305)||(16821280-16821474)
chr3 (105-306)||(15614973-15615169)
chr3 (63-379)||(11986038-11986365)
chr3 (18-137)||(14285289-14285408)
chr3 (18-138)||(11477008-11477128)
chr3 (9-100)||(9302946-9303036)
chr3 (317-387)||(18897128-18897198)
chr3 (18-137)||(19947026-19947146)
chr3 (186-307)||(51158024-51158143)
chr3 (186-276)||(15859030-15859120)
chr3 (230-307)||(17912532-17912607)
chr3 (104-276)||(13839061-13839233)
chr3 (186-276)||(12030153-12030243)
chr3 (186-307)||(14842567-14842686)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (9-377)||(13620614-13620983)
chr6 (104-387)||(1556062-1556345)
chr6 (104-377)||(16231959-16232232)
chr6 (104-387)||(19610075-19610358)
chr6 (104-377)||(18086739-18087012)
chr6 (104-377)||(23977836-23978109)
chr6 (106-387)||(16376291-16376572)
chr6 (106-387)||(16383615-16383896)
chr6 (114-387)||(22225664-22225937)
chr6 (106-387)||(10488756-10489037)
chr6 (106-387)||(16556057-16556338)
chr6 (106-387)||(16632613-16632894)
chr6 (106-306)||(19299375-19299575)
chr6 (114-270)||(22251492-22251648)
chr6 (63-377)||(29665940-29666255)
chr6 (104-309)||(29869692-29869896)
chr6 (105-276)||(1650021-1650189)
chr6 (9-137)||(18823187-18823315)
chr6 (9-137)||(18839042-18839170)
chr6 (18-138)||(19629647-19629766)
chr6 (117-243)||(16825678-16825803)
chr6 (114-276)||(27653906-27654067)
chr6 (16-137)||(32276570-32276691)
chr6 (106-276)||(25175731-25175901)
chr6 (18-122)||(16299799-16299903)
chr6 (186-307)||(14626124-14626243)
chr6 (67-276)||(35009314-35009535)
chr6 (104-307)||(15862609-15862822)
chr6 (104-307)||(1657660-1657873)
chr6 (18-135)||(15742032-15742150)
chr6 (18-137)||(18002307-18002427)
chr6 (261-309)||(27740973-27741021)
chr6 (63-180)||(27751698-27751816)
chr6 (63-276)||(23153614-23153828)
chr6 (63-137)||(26090059-26090133)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (104-387)||(15760030-15760313)
chr7 (106-375)||(15950709-15950978)
chr7 (104-377)||(18979937-18980210)
chr7 (104-377)||(14250814-14251087)
chr7 (104-377)||(15927635-15927908)
chr7 (104-377)||(13758437-13758710)
chr7 (106-387)||(7822785-7823066)
chr7 (106-387)||(7830096-7830377)
chr7 (106-387)||(27101555-27101836)
chr7 (106-387)||(27108903-27109184)
chr7 (106-387)||(27176490-27176771)
chr7 (106-387)||(38783647-38783928)
chr7 (9-276)||(18253663-18253931)
chr7 (45-312)||(48622522-48622789)
chr7 (18-189)||(15862174-15862345)
chr7 (37-309)||(16418633-16418905)
chr7 (45-324)||(10000226-10000505)
chr7 (106-276)||(2437625-2437794)
chr7 (104-306)||(13572816-13573014)
chr7 (106-276)||(13910939-13911108)
chr7 (63-309)||(13321150-13321408)
chr7 (106-307)||(16478879-16479075)
chr7 (114-276)||(10989577-10989738)
chr7 (25-307)||(47480864-47481156)
chr7 (18-137)||(371417-371537)
chr7 (230-276)||(11580789-11580835)
chr7 (63-137)||(25124450-25124524)
chr7 (180-276)||(295966-296062)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (106-387)||(22006176-22006457)
chr8 (104-377)||(13720844-13721117)
chr8 (104-387)||(13662181-13662464)
chr8 (104-364)||(16872967-16873227)
chr8 (106-387)||(22088712-22088993)
chr8 (106-387)||(271278-271559)
chr8 (106-387)||(644361-644642)
chr8 (106-387)||(830096-830377)
chr8 (104-377)||(16195297-16195571)
chr8 (106-387)||(15319077-15319358)
chr8 (106-387)||(15499446-15499727)
chr8 (9-138)||(16038691-16038819)
chr8 (104-307)||(24549120-24549318)
chr8 (108-306)||(21844490-21844684)
chr8 (106-306)||(21851881-21852077)
chr8 (106-307)||(6774175-6774371)
chr8 (106-276)||(30120890-30121060)
chr8 (104-276)||(16674306-16674476)
chr8 (18-138)||(2545264-2545384)
chr8 (18-138)||(22147755-22147875)
chr8 (18-137)||(3431088-3431208)
chr8 (9-122)||(18612739-18612852)
chr8 (17-137)||(22886654-22886775)
chr8 (18-138)||(21494269-21494389)
chr8 (107-307)||(17345707-17345917)
chr8 (186-276)||(16404981-16405071)
chr8 (230-276)||(24928841-24928887)
chr8 (230-307)||(16193766-16193841)
chr8 (230-307)||(43373518-43373593)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (104-377)||(23514628-23514901)
chr5 (104-387)||(7425381-7425664)
chr5 (106-387)||(17471506-17471787)
chr5 (104-387)||(1219436-1219719)
chr5 (106-377)||(10777888-10778159)
chr5 (104-377)||(35791014-35791288)
chr5 (106-387)||(21932299-21932580)
chr5 (106-387)||(21938469-21938750)
chr5 (106-387)||(35582093-35582374)
chr5 (106-377)||(11211983-11212254)
chr5 (114-387)||(22883010-22883283)
chr5 (106-387)||(36989688-36989969)
chr5 (104-309)||(23328693-23328897)
chr5 (104-309)||(24616297-24616501)
chr5 (104-309)||(24712673-24712877)
chr5 (104-309)||(24745691-24745895)
chr5 (104-306)||(27009981-27010179)
chr5 (106-276)||(12542-12711)
chr5 (106-276)||(4199900-4200069)
chr5 (106-276)||(25426796-25426965)
chr5 (18-307)||(34939415-34939714)
chr5 (106-307)||(29188201-29188397)
chr5 (106-276)||(18777907-18778076)
chr5 (106-276)||(19500067-19500236)
chr5 (106-276)||(21073510-21073679)
chr5 (106-276)||(22366396-22366565)
chr5 (18-137)||(9730190-9730310)
chr5 (63-379)||(32950758-32951086)
chr5 (18-138)||(17909822-17909942)
chr5 (106-276)||(43443312-43443479)
chr5 (18-137)||(7529228-7529347)
chr5 (186-307)||(23507103-23507222)
chr5 (186-276)||(18531073-18531163)
chr5 (64-137)||(25005137-25005210)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (104-387)||(46523446-46523728)
chr1 (106-384)||(18059676-18059954)
chr1 (114-377)||(17148634-17148897)
chr1 (106-387)||(17004695-17004976)
chr1 (106-387)||(38055009-38055290)
chr1 (106-306)||(19962417-19962617)
chr1 (106-307)||(22227947-22228146)
chr1 (106-307)||(22232644-22232843)
chr1 (104-309)||(22035583-22035787)
chr1 (104-309)||(7640850-7641054)
chr1 (106-276)||(5072304-5072472)
chr1 (105-307)||(2116393-2116590)
chr1 (9-138)||(20254630-20254758)
chr1 (105-307)||(45051561-45051758)
chr1 (142-276)||(18601068-18601202)
chr1 (186-276)||(20445846-20445936)
chr1 (186-307)||(20913168-20913287)
chr1 (186-307)||(20931483-20931602)
chr1 (230-276)||(20531611-20531657)
chr1 (230-276)||(37844500-37844546)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (104-387)||(1491-1774)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (104-387)||(153923-154206)
scaffold0023 (8-137)||(61025-61154)
scaffold0023 (109-218)||(169830-169938)
scaffold0023 (106-273)||(36264-36430)
scaffold0023 (63-276)||(48765-48977)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (67-387)||(10218-10538)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (104-377)||(1430-1703)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (104-387)||(2449-2733)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (106-388)||(29218-29500)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (106-387)||(31366-31647)
scaffold0107 (155-387)||(39703-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (106-387)||(39160-39441)
scaffold0076 (106-306)||(43137-43333)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (104-377)||(34074-34347)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (18-377)||(45097-45458)
scaffold0066 (18-377)||(54483-54844)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (106-370)||(7374-7638)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (193-387)||(1-195)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (9-276)||(107914-108181)
scaffold0026 (104-306)||(64437-64640)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (45-313)||(54006-54274)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (104-276)||(3890-4062)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (9-171)||(13172-13333)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (106-307)||(5130-5329)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (104-318)||(6724-6937)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (37-309)||(7345-7617)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (125-313)||(3545-3732)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (18-276)||(34286-34556)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (106-306)||(21031-21228)
scaffold0139 (106-306)||(13977-14173)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (104-276)||(3130-3301)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (106-218)||(10666-10778)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (45-307)||(9204-9462)
scaffold0215 (45-307)||(16102-16360)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (104-309)||(23665-23869)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (106-307)||(13242-13438)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (18-276)||(41815-42084)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (114-276)||(1228-1388)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (109-273)||(31593-31756)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (104-304)||(177-371)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (9-138)||(9315-9445)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (186-379)||(56105-56298)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (18-314)||(3319-3622)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (18-139)||(7008-7129)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (18-138)||(5548-5668)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (18-138)||(49665-49785)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (45-210)||(11983-12149)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (9-122)||(6013-6127)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (9-138)||(48503-48632)
scaffold0049 (230-276)||(48354-48400)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (45-138)||(164811-164904)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (18-137)||(5390-5508)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (18-137)||(18026-18145)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (18-137)||(34221-34340)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (18-138)||(95297-95418)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (18-137)||(4258-4378)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (75-276)||(13673-13886)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (64-272)||(8051-8272)
scaffold0162 (63-151)||(12049-12137)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (186-276)||(123170-123260)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (186-307)||(3588-3707)
scaffold0266 (230-307)||(1262-1337)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (180-306)||(5668-5792)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (186-277)||(12279-12370)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (186-276)||(540-630)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (186-307)||(9016-9135)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (186-276)||(6070-6160)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (186-276)||(962-1052)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (186-276)||(89460-89550)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (186-276)||(9016-9106)
scaffold0025 (230-307)||(148859-148934)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (186-307)||(19344-19463)
scaffold0195 (186-307)||(21428-21547)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (186-276)||(51188-51278)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (230-307)||(36963-37038)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19020921 - 19020543
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020921 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaaagggggaaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 19020822  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 208  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020821 gtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 19020722  T
Q  209 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 308  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020721 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 19020622  T
Q  309 tatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19020621 tatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 19020543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18169308 - 18169027
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18169308 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18169209  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169208 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18169109  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18169108 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 18169027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 7131981 - 7132254
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7131981 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 7132080  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132081 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 7132180  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  7132181 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 7132254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Original strand, 15287161 - 15287444
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||    
T  15287161 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgt 15287260  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287261 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 15287360  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15287361 gaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 15287444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Original strand, 15294270 - 15294553
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||    
T  15294270 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgt 15294369  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15294370 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttat 15294469  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15294470 gaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 15294553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 104 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20001063 - 20000803
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  20001063 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgt 20000964  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000963 gctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 20000864  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatat 364  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20000863 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 17145573 - 17145846
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17145573 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgt 17145672  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17145673 gctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgt 17145772  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||| |||   |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17145773 gaaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 17145846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18248626 - 18248285
Alignment:
Q  37 aaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18248626 aagggggaaacttgaagattgaagcaattaggagttaaagtgaagcttaagttaagattaatcatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatc 18248527  T
Q  136 atgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatg 235  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18248526 ttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 18248427  T
Q  236 aattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatg 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||| ||| |||||    
T  18248426 aattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatg 18248327  T
Q  336 ttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18248326 ttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 18248285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22738695 - 22738390
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||    
T  22738695 gaagaacaagg-ttagagaaagggggaaacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggg 22738597  T
Q  117 gttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtga 216  Q
    ||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  || |||||||||| ||||| |||||    
T  22738596 gtttgtcttcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtga 22738497  T
Q  217 tgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22738496 tgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatgctta 22738397  T
Q  317 atggatg 323  Q
    || ||||    
T  22738396 attgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 9795661 - 9795499
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795661 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttgaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 9795562  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaa 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9795561 gtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatgaaa 9795499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 22351980 - 22352184
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |    
T  22351980 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcat 22352079  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  22352080 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 22352178  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  22352179 gaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 104 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26339359 - 26339146
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  26339359 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 26339260  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |    
T  26339259 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgt 26339161  T
Q  304 gaaattatacttaat 318  Q
    |||||| | ||||||    
T  26339160 gaaattttgcttaat 26339146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374575
Alignment:
Q  228 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaat 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |    
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  328 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    || ||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 8374575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378365
Alignment:
Q  115 gggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgt 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  215 gatgctattttcttgt 230  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378380 gatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16523274 - 16523146
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523274 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttgaagattggagaattatgagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 16523175  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  16523174 gtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10644554 - 10644360
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  10644554 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 10644458  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644457 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47357991 - 47357822
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47357991 ctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 47357895  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||  | |||||| ||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  47357894 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 47357822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8045391 - 8045272
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8045391 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagtctaagtttgaattaatcataacctaaggtaaggggg 8045292  T
Q  118 ttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  8045291 ttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 32460516 - 32460636
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  32460516 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggg 32460615  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  32460616 ttagtcttcttcataatcatg 32460636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 14500025 - 14500144
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  14500025 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattatgagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggg 14500124  T
Q  118 ttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  14500125 ttaggcttcatcataatcat 14500144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 377
Target Start/End: Original strand, 40885604 - 40885750
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaattt 329  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | |||| |||    
T  40885604 tgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt-caaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattatgctcaattggtgaacttt 40885702  T
Q  330 gatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    | || ||| |  ||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  40885703 gctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttg 40885750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Original strand, 19697195 - 19697311
Alignment:
Q  22 aacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttag 121  Q
    |||||||||| |  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19697195 aacaagggtttgagaaagggagaaacttgaagattgaagaattaggaggtaaagtgaagcctaagtgtgaattaatcataacctaaggtaagggggttag 19697294  T
Q  122 ttatcatcataatcatg 138  Q
    |  || |||||||||||    
T  19697295 tgttcttcataatcatg 19697311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Original strand, 19707780 - 19707896
Alignment:
Q  22 aacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttag 121  Q
    |||||||||| |  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19707780 aacaagggtttgagaaagggagaaacttgaagattgaagaattaggaggtaaagtgaagcctaagtgtgaattaatcataacctaaggtaagggggttag 19707879  T
Q  122 ttatcatcataatcatg 138  Q
    |  || |||||||||||    
T  19707880 tgttcttcataatcatg 19707896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8378594 - 8378482
Alignment:
Q  37 aaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||   ||| | ||| | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  8378594 aagggggaaacttgaagattgaagcaattaggagttaaagtgaagcttaagttaagattaaacatcatctaaggtaaggggattagttattatcataatc 8378495  T
Q  136 atgttcaattttt 148  Q
    |||| ||||||||    
T  8378494 atgtacaattttt 8378482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 54118250 - 54118340
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54118250 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 54118340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 15675095 - 15675185
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15675095 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15675185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Original strand, 10104300 - 10104346
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10104300 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 10104346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31115842 - 31115796
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31115842 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 31115796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Original strand, 40885418 - 40885492
Alignment:
Q  64 taggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  40885418 taggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatg 40885492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 122102 - 122027
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  122102 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 306
Target Start/End: Original strand, 13048271 - 13048345
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 306  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||| | |||||||||||    
T  13048271 tgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaaggataagttatgaa 13048345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 387
Target Start/End: Original strand, 23777866 - 23778244
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23777866 gagtgaaaggaacaacaagggttagcaaagggggaaaactagaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaaatttgaattgatcataacctaag 23777965  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23777966 gtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 23778065  T
Q  209 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 308  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778066 tgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 23778165  T
Q  309 tatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23778166 tatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 23778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12728732 - 12728449
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12728732 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 12728633  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728632 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 12728533  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12728532 gaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 12728449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34824815 - 34824532
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34824815 ctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 34824716  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824715 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 34824616  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34824615 gaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 34824532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8944186 - 8943913
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8944186 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 8944087  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944086 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 8943987  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  8943986 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 8943913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16935933 - 16935650
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16935933 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcat 16935834  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935833 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 16935734  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16935733 gaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 16935650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17006593 - 17006310
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  17006593 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcat 17006494  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006493 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 17006394  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17006393 gaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 17006310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 12635784 - 12636057
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12635784 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 12635883  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635884 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 12635983  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  12635984 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 12636057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 42177885 - 42178158
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42177885 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 42177984  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42177985 gctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 42178084  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  42178085 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 42178158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 3798519 - 3798792
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  3798519 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgt 3798618  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798619 gctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 3798718  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3798719 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 3798792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 12641558 - 12641831
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  12641558 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgt 12641657  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641658 gctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 12641757  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  12641758 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 12641831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 11231256 - 11231537
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11231256 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 11231355  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231356 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 11231455  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  11231456 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 11231537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 22513103 - 22513384
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22513103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 22513202  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513203 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22513302  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  22513303 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 22513384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 24685699 - 24685980
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  24685699 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 24685798  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685799 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 24685898  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  24685899 aattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 24685980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 28775725 - 28776006
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  28775725 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 28775824  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775825 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 28775924  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  28775925 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 28776006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 307
Target Start/End: Original strand, 7507661 - 7507969
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507661 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaagcttgaagattggagaattaggagttaaagtgaaactcaagtttgaattgatcataacctaag 7507760  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgagttg----------atgaacaattcttgcta 196  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||          ||||| |||| ||||||    
T  7507761 gtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatgaataattattgcta 7507860  T
Q  197 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |    
T  7507861 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataat 7507958  T
Q  297 aagttatgaaa 307  Q
    |||||||||||    
T  7507959 aagttatgaaa 7507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21142303 - 21141969
Alignment:
Q  37 aaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  21142303 aagggggaaacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatc 21142204  T
Q  136 atgttcaatttttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcat 234  Q
    |  |  ||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142203 aattcaaaaattttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcat 21142105  T
Q  235 gaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatat 334  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||   ||||  |||||||    
T  21142104 gaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatat 21142005  T
Q  335 gttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 370  Q
    ||| |  || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  21142004 gttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccatt 21141969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 309
Target Start/End: Original strand, 5888478 - 5888750
Alignment:
Q  37 aaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  5888478 aagggggaaacttgaagattgacgcaattaggagctaaagtgaagcttaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatc 5888577  T
Q  136 atgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatg 235  Q
    |  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||  || ||| | ||||    
T  5888578 aatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gttgcttatacatg 5888676  T
Q  236 aattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5888677 aattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 5888750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23774476 - 23774272
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  23774476 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 23774377  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  23774376 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 23774278  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  23774277 gaaatt 23774272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 19886576 - 19886745
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19886576 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 19886674  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19886675 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 19886745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 28031047 - 28031167
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  28031047 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaaggggg 28031146  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  28031147 ttagtcttcatcataatcatg 28031167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33128492 - 33128372
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaatt-aggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  33128492 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattaaaggatttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggg 33128393  T
Q  117 gttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  33128392 gttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17204779 - 17204659
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaa-ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||    
T  17204779 gaagaacaagggttagagaaagggcgaaacttgaagattgaagaaattaggagttaaagtgaagtctaagtttggattaatcataacctaaagtaagggg 17204680  T
Q  117 gttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  17204679 gttagtcttcatcataatcat 17204659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 276
Target Start/End: Original strand, 25265261 - 25265486
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--t 160  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||| ||| ||||| | |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |    
T  25265261 ttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaatgtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcattt 25265360  T
Q  161 gttgtatgaaaatgagttg----------atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 250  Q
    |||||||||| ||| ||||          ||| | |||| ||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  25265361 gttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 25265460  T
Q  251 tatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  25265461 tatgattgttggtgaaattacatgtt 25265486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 43642963 - 43643053
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43642963 aattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43643053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 462995 - 462876
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  462995 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 462898  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  462897 gtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 306
Target Start/End: Original strand, 17396702 - 17396776
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 306  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||| |||||||||||    
T  17396702 tgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaataagtaaaaatgataagttatgaa 17396776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 387
Target Start/End: Original strand, 12901911 - 12902289
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901911 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaatttgaagattggagaattaggagttaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 12902010  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12902011 gtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctct 12902110  T
Q  209 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 308  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902111 tgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 12902210  T
Q  309 tatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12902211 tatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattattaa 12902289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25059077 - 25058796
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25059077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 25058978  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058977 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 25058878  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25058877 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 25058796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22275547 - 22275266
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275547 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22275448  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22275447 tcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 22275348  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22275347 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 22275266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 15468258 - 15468539
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15468258 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgc 15468357  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15468358 tcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 15468457  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15468458 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 15468539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18911333 - 18911060
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18911333 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 18911234  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911233 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 18911134  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  18911133 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 18911060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 49232774 - 49232493
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49232774 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 49232675  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232674 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 49232575  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  49232574 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 49232493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5228652 - 5228370
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  5228652 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgt 5228554  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5228553 gctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttat 5228454  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5228453 gagattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 5228370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 106 - 377
Target Start/End: Original strand, 12264710 - 12264982
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12264710 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12264809  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264810 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12264909  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12264910 gattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 12264982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 1467657 - 1467938
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  1467657 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 1467756  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467757 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1467856  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1467857 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 1467938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 63 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 54651838 - 54651529
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 162  Q
    ||||||||| |  ||||||  |||||||  || ||||| | ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54651838 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 54651739  T
Q  163 tgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 262  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  54651738 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgag 54651639  T
Q  263 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcat 362  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  54651638 tgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 54651539  T
Q  363 attccattga 372  Q
     |||||||||    
T  54651538 gttccattga 54651529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 106 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12812179 - 12811938
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  12812179 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 12812080  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812079 tcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12811980  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaa 347  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12811979 atttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Original strand, 15936456 - 15936723
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15936456 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttgaagattggagaattaggagcaaaagtgaagctcaagtttgaattgatcgtagcctaag 15936555  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 208  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  15936556 gtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctcc 15936655  T
Q  209 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
       ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15936656 aactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15936723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Original strand, 15938298 - 15938565
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15938298 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttgaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcatagcctaag 15938397  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 208  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||     
T  15938398 gtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgctcc 15938497  T
Q  209 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
       ||| ||| ||| ||  |   |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15938498 aactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15938565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44229393 - 44229059
Alignment:
Q  37 aaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |  |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  44229393 aagggggaaacttgaagattgaagcaattaggagataaagtgaaacctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatc 44229294  T
Q  136 atgttcaatttttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcat 234  Q
    |  |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44229293 aattcaaattttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcat 44229195  T
Q  235 gaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||   ||||  |||||||    
T  44229194 gaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatat 44229095  T
Q  335 gttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 370  Q
    ||| |  || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  44229094 gttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccatt 44229059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Original strand, 18896962 - 18897130
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18896962 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 18897061  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18897062 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 55316555 - 55316387
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55316555 aaggtaaaggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 55316458  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  55316457 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 55316387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 16933782 - 16933901
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16933782 gaagaacaagggttagagaaaggggaaaacttgaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaaggggg 16933881  T
Q  118 ttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||  | |||||||||||    
T  16933882 ttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41270411 - 41270243
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41270411 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 41270314  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  41270313 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgtt 41270243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16821474 - 16821280
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||| |||||    
T  16821474 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgc 16821378  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16821377 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatga 16821280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15615169 - 15614973
Alignment:
Q  105 taaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtg 204  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  15615169 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtg 15615073  T
Q  205 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 304  Q
    |||||  |||| || ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  15615072 ctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 15614975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 379
Target Start/End: Original strand, 11986038 - 11986365
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcat-- 160  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |      
T  11986038 ttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaacttctccttt 11986137  T
Q  161 gttgtatgaaaatgagttgat------gaac----aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 250  Q
    ||||||||||| || ||||||      |||     |||| ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| || |    
T  11986138 gttgtatgaaa-tgggttgattggaatgaattgataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattg 11986236  T
Q  251 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatga 350  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||    |||| |||| || ||| |  |||||| ||    
T  11986237 tatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgttgttgaaaaga 11986336  T
Q  351 gatgtaattcatattccattgatgttgat 379  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11986337 tatgtgattcatgttccattgatgttgat 11986365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14285408 - 14285289
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  14285408 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggg 14285309  T
Q  118 ttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  14285308 ttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 11477008 - 11477128
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  11477008 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaaggggg 11477107  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  11477108 ttagtcttcttcataatcatg 11477128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Original strand, 9302946 - 9303036
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcat 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9302946 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaa-gggggaaacttgaagattggagaattaggagttaaagtgaagctcaagtttgaattgatcat 9303036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 387
Target Start/End: Original strand, 18897128 - 18897198
Alignment:
Q  317 atggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18897128 atgggtgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 18897198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19947146 - 19947026
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaatt-aggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  19947146 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattgaaggatttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggg 19947047  T
Q  117 gttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  19947046 gttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 51158024 - 51158143
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  51158024 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 51158121  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  51158122 gtaaaaatgataagttgtgaaa 51158143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 15859030 - 15859120
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15859030 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15859120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 17912532 - 17912607
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||||||    
T  17912532 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 17912607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13839233 - 13839061
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgca-ttttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcg 202  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||| ||| || | |||||  ||||||||||||  |   || ||||| |||| ||||||||||||    
T  13839233 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atgaataattgttgctaaattcg 13839135  T
Q  203 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  13839134 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 13839061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 12030153 - 12030243
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12030153 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 12030243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 14842567 - 14842686
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |    
T  14842567 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatg-ttcaaa-tgt 14842664  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  14842665 gtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 377
Target Start/End: Original strand, 13620614 - 13620983
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaa-ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaa 107  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  13620614 gagtgaaaggaaaaacaagggttagagaaaggggaaaacttgaagattgaagaaattaggagctaaagtgaagcctgagtttgaattgatcataacctaa 13620713  T
Q  108 ggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 207  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13620714 ggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 13620813  T
Q  208 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620814 ttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 13620913  T
Q  308 ttatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  13620914 ttatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 13620983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1556345 - 1556062
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1556345 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 1556246  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556245 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 1556146  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1556145 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 1556062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16232232 - 16231959
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232232 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 16232133  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232132 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 16232033  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  16232032 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 16231959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19610358 - 19610075
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610358 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgt 19610259  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19610258 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 19610159  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19610158 aaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatattccattgatgttgttattgttaa 19610075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 18086739 - 18087012
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18086739 ctaaggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 18086838  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086839 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 18086938  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  18086939 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 18087012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23978109 - 23977836
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  23978109 ctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgt 23978010  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23978009 gctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 23977910  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  23977909 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 23977836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 16376291 - 16376572
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16376291 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16376390  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376391 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16376490  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  16376491 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 16376572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 16383615 - 16383896
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16383615 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16383714  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383715 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16383814  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  16383815 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 16383896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 114 - 387
Target Start/End: Original strand, 22225664 - 22225937
Alignment:
Q  114 ggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||    
T  22225664 ggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctg 22225763  T
Q  214 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22225764 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgc 22225863  T
Q  314 ttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  22225864 ttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 22225937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 10489037 - 10488756
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  10489037 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 10488938  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488937 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10488838  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  10488837 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 10488756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 16556057 - 16556338
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16556057 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16556156  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556157 tcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16556256  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  16556257 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 16556338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 16632613 - 16632894
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16632613 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16632712  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632713 tcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16632812  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  16632813 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 16632894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19299575 - 19299375
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  19299575 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 19299476  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299475 tcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19299376  T
Q  306 a 306  Q
    |    
T  19299375 a 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 270
Target Start/End: Original strand, 22251492 - 22251648
Alignment:
Q  114 ggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  22251492 ggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctg 22251591  T
Q  214 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatta 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22251592 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29666255 - 29665940
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcat-g 161  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||  |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  29666255 ttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaacataagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattg 29666156  T
Q  162 ttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgg 261  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  29666155 ttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgg 29666056  T
Q  262 gtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| || ||| |  |||||||||||| | |||||    
T  29666055 gtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattca 29665956  T
Q  362 tattccattgatgttg 377  Q
    | ||| ||||||||||    
T  29665955 tgttcaattgatgttg 29665940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 29869692 - 29869896
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  29869692 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 29869791  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |    
T  29869792 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgt 29869890  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  29869891 gaaatt 29869896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Original strand, 1650021 - 1650189
Alignment:
Q  105 taaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtg 204  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1650021 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtg 1650117  T
Q  205 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||  ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1650118 ctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1650189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 18823187 - 18823315
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18823187 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttaaagattggagaattaggagctaaagtgaagtttaagtttggattaatcataacctaag 18823286  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  18823287 gtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 18839042 - 18839170
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18839042 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttaaagattggagaattagaagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcataacctaag 18839141  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  18839142 gtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19629766 - 19629647
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    |||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19629766 gaagaacaagggttaaagaaagggagaaacttgaagattggagaattaggagctaag-tgaagctcaaatttgaattgatcataacctaaggtaaggggg 19629668  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  19629667 ttagtgttcttcataatcatg 19629647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 243
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825803
Alignment:
Q  117 gttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtga 216  Q
    |||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtga 16825776  T
Q  217 tgctattttcttgtgcatgaattgatg 243  Q
    || ||| ||  | ||||||||||||||    
T  16825777 tgttatgtttgtatgcatgaattgatg 16825803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 276
Target Start/End: Original strand, 27653906 - 27654067
Alignment:
Q  114 ggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttg 213  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  27653906 ggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 27654004  T
Q  214 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| |||  |  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  27654005 tgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 27654067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 32276570 - 32276691
Alignment:
Q  16 atgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgg 115  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||    
T  32276570 atgaagaacaagggttagagaaagggggaagcttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaaggg 32276669  T
Q  116 ggttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  32276670 ggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25175901 - 25175731
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtg 204  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25175901 aaggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataatttt-gcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtg 25175803  T
Q  205 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||| |||| || ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25175802 ctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 25175731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Original strand, 16299799 - 16299903
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16299799 gaagaacaagggttagagaaagggtgaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaaggggg 16299898  T
Q  118 ttagt 122  Q
    |||||    
T  16299899 ttagt 16299903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 14626124 - 14626243
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  14626124 aattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 14626221  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  14626222 gtaaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 276
Target Start/End: Original strand, 35009314 - 35009535
Alignment:
Q  67 gagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--tgttg 164  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| | |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||    
T  35009314 gagctaaagtgaagccaaagtttggattaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttg 35009413  T
Q  165 tatgaaaatgagttg----------atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatg 254  Q
    |||||| ||| ||||          ||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || |||||    
T  35009414 tatgaatatgggttgaattgaagaaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatg 35009513  T
Q  255 tttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  35009514 attgttggtgaaattacatgtt 35009535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15862822 - 15862609
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgagttga----------tgaacaattct 191  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||          || | |||| |    
T  15862822 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgt 15862723  T
Q  192 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 291  Q
    | |||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||||||    
T  15862722 tactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtataa 15862625  T
Q  292 atgttaagttatgaaa 307  Q
    |||| |||||||||||    
T  15862624 atgtgaagttatgaaa 15862609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 307
Target Start/End: Original strand, 1657660 - 1657873
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgagttg----------atgaacaattct 191  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||          ||| | |||| |    
T  1657660 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgt 1657759  T
Q  192 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 291  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||| ||    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaaa 1657857  T
Q  292 atgttaagttatgaaa 307  Q
    |||| |||||||||||    
T  1657858 atgtgaagttatgaaa 1657873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 15742032 - 15742150
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaatt-aggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    |||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15742032 gaagaacaagggttatagaaagggagaaacttgaagattgaaggatttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggg 15742131  T
Q  117 gttagttatcatcataatc 135  Q
    ||||||  | |||||||||    
T  15742132 gttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 18002307 - 18002427
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaatt-aggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  18002307 gaagaacaagggttagagaaaaggagaaacttgaagattgaaggatttaggagctaaagtgaaggctaagtttagattaatcataacctaaggtaagggg 18002406  T
Q  117 gttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||  | |||||||||||    
T  18002407 gttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740973
Alignment:
Q  261 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaatt 27740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27751816 - 27751698
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 162  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||| ||| ||| | | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  27751816 ttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcattt 27751717  T
Q  163 -tgtatgaaaatgagttga 180  Q
     |||||||| ||| |||||    
T  27751716 gtgtatgaatatgggttga 27751698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23153828 - 23153614
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 162  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||| | ||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||    
T  23153828 ttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 23153729  T
Q  163 tgtatgaaaatgagt-tgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgg 261  Q
    ||||||||  |  |  | ||| | |||| || ||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |    
T  23153728 tgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttg 23153629  T
Q  262 gtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||    
T  23153628 gtgaaattacatgtt 23153614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26090133 - 26090059
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  26090133 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattgagcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Original strand, 15760030 - 15760313
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15760030 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgt 15760129  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760130 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 15760229  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15760230 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 15760313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 106 - 375
Target Start/End: Original strand, 15950709 - 15950978
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15950709 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 15950808  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950809 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15950908  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgt 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15950909 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 15950978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 18979937 - 18980210
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18979937 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 18980036  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980037 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 18980136  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  18980137 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 18980210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 14250814 - 14251087
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14250814 ctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 14250913  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250914 gctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 14251013  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  14251014 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 14251087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15927908 - 15927635
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15927908 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgt 15927809  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927808 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 15927709  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  15927708 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 15927635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13758710 - 13758437
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  13758710 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgt 13758611  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758610 gctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 13758511  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  13758510 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 13758437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7823066 - 7822785
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  7823066 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 7822967  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822966 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7822867  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  7822866 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 7822785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7830377 - 7830096
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  7830377 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 7830278  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830277 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7830178  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  7830177 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 7830096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 27101555 - 27101836
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  27101555 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27101654  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101655 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27101754  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  27101755 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 27101836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 27108903 - 27109184
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  27108903 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27109002  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109003 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27109102  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  27109103 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 27109184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27176771 - 27176490
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  27176771 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27176672  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176671 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27176572  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  27176571 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 27176490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 38783647 - 38783928
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  38783647 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 38783746  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783747 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38783846  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  38783847 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 38783928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Original strand, 18253663 - 18253931
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaa-cttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaa 107  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18253663 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaaacttgaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaaatttgaattgatcataacctaa 18253762  T
Q  108 ggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18253763 ggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctc 18253862  T
Q  208 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
        ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18253863 caactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18253931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 312
Target Start/End: Original strand, 48622522 - 48622789
Alignment:
Q  45 aacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaa 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |  ||    
T  48622522 aacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaa 48622621  T
Q  144 tttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48622622 tttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatg 48622721  T
Q  244 attatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  48622722 attatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaaattata 48622789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15862345 - 15862174
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15862345 gaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttgaagattggagaattaggagttaagttgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaaggggg 15862246  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaatt 189  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15862245 ttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16418905 - 16418633
Alignment:
Q  37 aaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||  ||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  16418905 aagggggaaacttgaagattgaaacaattaggagctaaagtgaagctttagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatc 16418806  T
Q  136 atgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatg 235  Q
    |  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||  || ||| | ||||    
T  16418805 aatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gttgcttatacatg 16418707  T
Q  236 aattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16418706 aattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 16418633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 324
Target Start/End: Original strand, 10000226 - 10000505
Alignment:
Q  45 aacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaa 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||  |||||    
T  10000226 aacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaa 10000325  T
Q  144 tttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 243  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| || || | ||| ||| | ||||||||||||    
T  10000326 attttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatg 10000424  T
Q  244 attatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatga 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| |||||    
T  10000425 attatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2437794 - 2437625
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2437794 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgc 2437696  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2437695 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 2437625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13573014 - 13572816
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  13573014 ctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 13572917  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||    
T  13572916 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttat 13572819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 13910939 - 13911108
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||| | || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13910939 aaggtaagggggttattgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 13911037  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13911038 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 13911108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13321408 - 13321150
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcat-- 160  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||      
T  13321408 ttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcattt 13321309  T
Q  161 gttgtatgaaaatgagttga----------tgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 250  Q
    |||||||||| ||| |||||          || | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |    
T  13321308 gttgtatgaatatgggttgaattgaataagtggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 13321209  T
Q  251 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 309  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13321208 tatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaatt 13321150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Original strand, 16478879 - 16479075
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16478879 aaggtaagggggttagtgattatcataatcattt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgc 16478975  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||  || |||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  16478976 tcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 16479073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10989738 - 10989577
Alignment:
Q  114 ggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttg 213  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  10989738 ggggttagtgattatcataatcatgtataatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 10989640  T
Q  214 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10989639 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 10989577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 307
Target Start/End: Original strand, 47480864 - 47481156
Alignment:
Q  25 aagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagtta 124  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||      
T  47480864 aagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggaggtaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtct 47480963  T
Q  125 tcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgagttg----------atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgtt 212  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||          ||| | |||| ||||||||||||||||||   |    
T  47480964 tcatcataatcatattcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaact 47481063  T
Q  213 gtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    |||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  47481064 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 47481156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 371537 - 371417
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  371537 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaatattgaagcaattaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggg 371438  T
Q  117 gttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  371437 gttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Original strand, 11580789 - 11580835
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11580789 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 11580835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25124524 - 25124450
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||  ||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25124524 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 276
Target Start/End: Original strand, 295966 - 296062
Alignment:
Q  180 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||  ||| | || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  295966 atgaataattgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgtt 296062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 22006176 - 22006457
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22006176 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22006275  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006276 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22006375  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22006376 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 22006457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 13720844 - 13721117
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13720844 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 13720943  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720944 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 13721043  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  13721044 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 13721117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Original strand, 13662181 - 13662464
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13662181 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgt 13662280  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662281 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 13662380  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13662381 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 13662464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 104 - 364
Target Start/End: Original strand, 16872967 - 16873227
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  16872967 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgt 16873066  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873067 gctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 16873166  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatat 364  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16873167 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 22088712 - 22088993
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22088712 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 22088811  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088812 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22088911  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  22088912 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 22088993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 271278 - 271559
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  271278 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 271377  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271378 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 271477  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  271478 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 271559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 644642 - 644361
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  644642 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 644543  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644542 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 644443  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  644442 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 644361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 830377 - 830096
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  830377 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 830278  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830277 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 830178  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  830177 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 830096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16195571 - 16195297
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16195571 ctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 16195472  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
     ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195471 tctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 16195372  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    || ||||||||||||  |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16195371 gagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 16195297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 15319077 - 15319358
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15319077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 15319176  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15319177 tcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15319276  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  15319277 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaa 15319358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 15499446 - 15499727
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15499446 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 15499545  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15499546 tcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15499645  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  15499646 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaa 15499727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 16038691 - 16038819
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16038691 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaa-gggggaaacttgaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 16038789  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  16038790 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 16038819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24549318 - 24549120
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549318 ctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 24549222  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |    
T  24549221 gctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgt 24549124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Original strand, 21844490 - 21844684
Alignment:
Q  108 ggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 207  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21844490 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 21844587  T
Q  208 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 306  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21844588 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 306
Target Start/End: Original strand, 21851881 - 21852077
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  21851881 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 21851978  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||  || |||||| ||||| ||||||||||    
T  21851979 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatga 21852076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Original strand, 6774175 - 6774371
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6774175 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 6774271  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  6774272 tcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 6774369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30121060 - 30120890
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30121060 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 30120961  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30120960 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 30120890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Original strand, 16674306 - 16674476
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16674306 ctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgt 16674403  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||||  ||||||| ||| || || |||||||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16674404 gctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16674476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2545384 - 2545264
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2545384 gaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcttaaatttgaattaatcataacctaaggtaaggggg 2545285  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  2545284 ttagtcttcatcataatcatg 2545264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22147875 - 22147755
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    |||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22147875 gaagaataagggttagagaaagggagaaacttgaagattgaagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaaggggt 22147776  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  22147775 ttagtgttcttcataatcatg 22147755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 3431088 - 3431208
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3431088 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcccaagtttggattgatcataacctaaggtaagggg 3431187  T
Q  117 gttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  3431188 gttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18612852 - 18612739
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18612852 gagtgaaaggaagaacaagggttagagaaagggagatacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcccaaatttgaattgatcataacctaag 18612753  T
Q  109 gtaacggggttagt 122  Q
    |||| |||||||||    
T  18612752 gtaagggggttagt 18612739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22886775 - 22886654
Alignment:
Q  17 tgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaa-ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgg 115  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  22886775 tgaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaaattaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattacctaaggtaaggg 22886676  T
Q  116 ggttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||||  | |||||||||||    
T  22886675 ggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 21494269 - 21494389
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  21494269 gaagaacaagggttagagaaaggggtaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggg 21494368  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  21494369 ttagtcttcttcataatcatg 21494389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17345917 - 17345707
Alignment:
Q  107 aggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgagttga----------tgaacaattcttgc 194  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||          || | |||| ||||    
T  17345917 aggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgc 17345818  T
Q  195 taaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 294  Q
     |||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||| |||||    
T  17345817 gaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaaaatg 17345720  T
Q  295 ttaagttatgaaa 307  Q
    | |||||||||||    
T  17345719 tgaagttatgaaa 17345707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 16404981 - 16405071
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16404981 aattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16405071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Original strand, 24928841 - 24928887
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24928841 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 24928887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 16193766 - 16193841
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16193766 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 43373518 - 43373593
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  43373518 tgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 43373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23514901 - 23514628
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23514901 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 23514802  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514801 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 23514702  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  23514701 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 23514628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7425664 - 7425381
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7425664 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgt 7425565  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425564 gctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 7425465  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7425464 gaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 7425381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 17471506 - 17471787
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17471506 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 17471605  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17471606 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatga 17471705  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17471706 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 17471787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Original strand, 1219436 - 1219719
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1219436 ctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 1219535  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219536 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 1219635  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  1219636 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatttcattgatgtggttattgttaa 1219719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 106 - 377
Target Start/End: Original strand, 10777888 - 10778159
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10777888 aaggtaaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 10777987  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777988 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10778087  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  10778088 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 10778159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 35791014 - 35791288
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  35791014 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 35791113  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791114 gctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 35791213  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35791214 gagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 35791288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 21932299 - 21932580
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21932299 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 21932398  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932399 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21932498  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  21932499 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 21932580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 21938469 - 21938750
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21938469 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 21938568  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938569 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21938668  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  21938669 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 21938750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35582374 - 35582093
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  35582374 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 35582275  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582274 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 35582175  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  35582174 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 35582093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 106 - 377
Target Start/End: Original strand, 11211983 - 11212254
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11211983 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 11212082  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11212083 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatga 11212182  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||| ||    |||| ||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11212183 aattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 11212254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 114 - 387
Target Start/End: Original strand, 22883010 - 22883283
Alignment:
Q  114 ggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||    
T  22883010 ggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctg 22883109  T
Q  214 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatac 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22883110 tgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgc 22883209  T
Q  314 ttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  22883210 ttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 22883283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 36989688 - 36989969
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  36989688 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 36989787  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989788 tctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 36989887  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  36989888 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 36989969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23328897 - 23328693
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  23328897 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 23328798  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  23328797 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 23328699  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  23328698 gaaatt 23328693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24616501 - 24616297
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  24616501 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 24616402  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  24616401 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 24616303  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  24616302 gaaatt 24616297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24712877 - 24712673
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  24712877 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 24712778  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  24712777 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 24712679  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  24712678 gaaatt 24712673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24745895 - 24745691
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  24745895 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 24745796  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  24745795 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 24745697  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  24745696 gaaatt 24745691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27010179 - 27009981
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  27010179 ctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 27010082  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||    
T  27010081 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttat 27009984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12711 - 12542
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 12613  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12612 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 12542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 4199900 - 4200069
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||  || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4199900 aaggtaagggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgc 4199998  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4199999 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 4200069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25426965 - 25426796
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25426965 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 25426867  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25426866 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 25426796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34939714 - 34939415
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34939714 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagtctaagtgtgaattaatcataacctaaggtaaggggg 34939615  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgagttg----------atgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    |||||  || ||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||          ||| | || | |||||||||||||||    
T  34939614 ttagtgttcttcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataactgttgctaaattcgtgc 34939515  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    |||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||| |||||| |||||||||    
T  34939514 tctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttatga 34939417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Original strand, 29188201 - 29188397
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29188201 aaggtaagggggttagtgattattataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgc 29188297  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  29188298 tcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 29188395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 18777907 - 18778076
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18777907 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgc 18778005  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18778006 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 18778076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19500236 - 19500067
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19500236 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgc 19500138  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19500137 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 19500067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 21073510 - 21073679
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgc 21073608  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  21073609 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 21073679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 22366396 - 22366565
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22366396 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgc 22366494  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22366495 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 22366565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 9730190 - 9730310
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9730190 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggg 9730289  T
Q  117 gttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  9730290 gttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32951086 - 32950758
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctc--at 160  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||   |    
T  32951086 ttaggagctaaattgaagtctaagtttgaattaatcattatttaaggtaagggggttagtcttcatcataaccatgttcaattattgcaacttctccttt 32950987  T
Q  161 gttgtatgaaaatgagttgat--ga--------acaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 250  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||        | |||| ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| || |    
T  32950986 gttgtatg-aaatgggttgattggaatgaattgataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattg 32950888  T
Q  251 tatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt-taagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatg 349  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | || ||  | |||| |||  |||||| |  |||||| |    
T  32950887 tatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaag 32950788  T
Q  350 agatgtaattcatattccattgatgttgat 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32950787 agatgtgattcatgttccattgatgttgat 32950758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17909942 - 17909822
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17909942 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaaggggg 17909843  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  17909842 ttagtgttcttcataatcatg 17909822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 43443312 - 43443479
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||   |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  43443312 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt---gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgc 43443408  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43443409 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43443479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7529347 - 7529228
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  7529347 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattgggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggg 7529248  T
Q  118 ttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||  || ||||||||||    
T  7529247 ttagtcttcttcataatcat 7529228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23507222 - 23507103
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  23507222 aattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 23507125  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  23507124 gtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 18531073 - 18531163
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18531073 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18531163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25005210 - 25005137
Alignment:
Q  64 taggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| | |||| |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25005210 taggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcat 25005137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 46523728 - 46523446
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  46523728 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 46523630  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523629 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 46523530  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46523529 gaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 46523446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 18059676 - 18059954
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18059676 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 18059775  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059776 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18059875  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgt 384  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18059876 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgt 18059954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 114 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17148897 - 17148634
Alignment:
Q  114 ggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17148897 ggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttg 17148798  T
Q  214 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatac 313  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148797 taatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatac 17148698  T
Q  314 ttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  17148697 ttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 17148634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17004976 - 17004695
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  17004976 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 17004877  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004876 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17004777  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  17004776 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 17004695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 38055009 - 38055290
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  38055009 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 38055108  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    | ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055109 ttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38055208  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  38055209 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 38055290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 306
Target Start/End: Original strand, 19962417 - 19962617
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  19962417 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 19962516  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962517 tcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19962616  T
Q  306 a 306  Q
    |    
T  19962617 a 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227947
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 22227949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232644
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 22232646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22035787 - 22035583
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  22035787 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 22035688  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  22035687 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 22035589  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  22035588 gaaatt 22035583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 7640850 - 7641054
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  7640850 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 7640949  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  7640950 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 7641048  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  7641049 gaaatt 7641054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 5072304 - 5072472
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5072304 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 5072401  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5072402 tcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 5072472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2116590 - 2116393
Alignment:
Q  105 taaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtg 204  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2116590 taaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtg 2116494  T
Q  205 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 304  Q
    || ||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  2116493 cttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 2116396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20254758 - 20254630
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20254758 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaa-gggggaaacttgaagattgaggaattatgagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 20254660  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||| |||||||||  || |||||||||||    
T  20254659 gtaagggggttagtgttcttcataatcatg 20254630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45051758 - 45051561
Alignment:
Q  105 taaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtg 204  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  45051758 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt---gattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtg 45051662  T
Q  205 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 304  Q
     ||||  ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  45051661 ttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 45051564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Original strand, 18601068 - 18601202
Alignment:
Q  142 aatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18601068 aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 18601167  T
Q  242 tgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    || |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18601168 tgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18601202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20445936 - 20445846
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20445936 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20913287 - 20913168
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  20913287 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20913190  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20913189 gtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20931602 - 20931483
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  20931602 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20931505  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20931504 gtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20531657 - 20531611
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20531657 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20531611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Original strand, 37844500 - 37844546
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37844500 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 37844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Original strand, 1491 - 1774
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1491 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgt 1590  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1591 gcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 1690  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||    
T  1691 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatataaaattgatgttgttattgttaa 1774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Original strand, 153923 - 154206
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  153923 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 154022  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154023 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 154122  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  154123 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattccattgatgtggttattgttaa 154206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 61025 - 61154
Alignment:
Q  8 cgagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaa 107  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61025 cgagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaaacttgaagattggagaattatgagctaaagttaagctcaagtttgaattgatcataacctaa 61124  T
Q  108 ggtaacggggttagttatcatcataatcat 137  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  61125 ggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 218
Target Start/End: Original strand, 169830 - 169938
Alignment:
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 208  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  169830 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtataatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 169928  T
Q  209 tgttgtgatg 218  Q
    || |||||||    
T  169929 tgctgtgatg 169938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36430 - 36264
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||| | || |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36430 aaggtaagggggttaatgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 36332  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat 273  Q
    |||||| |||||| ||| ||  | || ||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||    
T  36331 tcttgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat 36264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48977 - 48765
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 162  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||    
T  48977 ttaggagctaaagtaaagcctaagtttagattgagcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgt 48878  T
Q  163 tgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 262  Q
    ||||||||  |   || ||| | |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  48877 tgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 48779  T
Q  263 tgaaattacatgtt 276  Q
    ||||||||||||||    
T  48778 tgaaattacatgtt 48765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 67 - 387
Target Start/End: Original strand, 10218 - 10538
Alignment:
Q  67 gagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgta 166  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |  || ||||| | ||||||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10218 gagctaaagtgaagcctaagttggggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgta 10317  T
Q  167 tgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 266  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10318 tgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 10417  T
Q  267 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10418 attacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattc 10517  T
Q  367 cattgatgttgatattgttaa 387  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  10518 cattgatgttgttgttgttaa 10538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1703
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1430 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 1529  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1530 gctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 1629  T
Q  304 gaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  1630 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatatgtaattgatgttg 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2733 - 2449
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaa-tttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcg 202  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2733 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcg 2634  T
Q  203 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 302  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2633 tgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtca 2534  T
Q  303 tgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2533 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 2449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29500 - 29218
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29500 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 29401  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29400 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatga 29301  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaat 388  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29300 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaat 29218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31647 - 31366
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  31647 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 31548  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31547 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 31448  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  31447 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 31366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 155 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39703
Alignment:
Q  155 tctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  255 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatg 39736  T
Q  355 taattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39735 ttattcatatttcattgatgttgttattgttaa 39703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 39441 - 39160
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  39441 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 39342  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39341 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 39242  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  39241 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 39160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43333 - 43137
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtg 204  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| || |||||   | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  43333 aaggtaagggggttagttactatcacaaacatgt---aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtg 43237  T
Q  205 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 304  Q
    |||||| || |||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43236 ctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 43139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 104 - 377
Target Start/End: Original strand, 34074 - 34347
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcg 202  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34074 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcg 34172  T
Q  203 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 302  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34173 tgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 34272  T
Q  303 tgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |  |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  34273 tgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgttg 34347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45458 - 45097
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaa-ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||||||  ||||||| ||| | ||| | ||||||||| |||    
T  45458 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagagcttaggagcttaattgaagcctaagtttggattaaccattatctaaggtaagggg 45359  T
Q  117 gttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtg 215  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  45358 gttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtg 45259  T
Q  216 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 315  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||     
T  45258 atgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaaattgtactc 45159  T
Q  316 aatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||| | |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45158 aattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 45097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54844 - 54483
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaa-ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||||||| ||||||| ||| | ||| | ||||||||| | |    
T  54844 gaagaacaagggttagagaaagtgggaaacttgaagattgaagagcttaggagcttaattgaagcttaagtttggattaaccattatctaaggtaaggtg 54745  T
Q  117 gttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtg 215  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||| ||||    
T  54744 gttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtg 54645  T
Q  216 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  54644 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtactc 54545  T
Q  316 aatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttg 377  Q
    ||| | |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  54544 aattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttg 54483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 106 - 370
Target Start/End: Original strand, 7374 - 7638
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7374 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgc 7473  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7474 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga 7573  T
Q  306 aattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 370  Q
    ||||||||| |||   ||||  |||||||||| |  || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  7574 aattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccatt 7638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 387
Target Start/End: Original strand, 1 - 195
Alignment:
Q  193 gctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaa 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaa 100  T
Q  293 tgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgatattgttaa 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  101 tgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgtagttattgttaa 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 108181 - 107914
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  108181 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaagggggaaattttgaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgattatagcctaag 108082  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 208  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  108081 gtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctcc 107982  T
Q  209 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
       ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  107981 aactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 107914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Original strand, 64437 - 64640
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  64437 ctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 64534  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatga-----attgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaa 298  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||     ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||    
T  64535 gctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataa 64632  T
Q  299 gttatgaa 306  Q
    ||||||||    
T  64633 gttatgaa 64640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54274 - 54006
Alignment:
Q  45 aacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaa 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||  |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |  ||    
T  54274 aacttgaagattgaagcaattaggagctatagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaa 54175  T
Q  144 tttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54174 tttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatg 54075  T
Q  244 attatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54074 attatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattatac 54006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4062 - 3890
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4062 ctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 3963  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3962 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 171
Target Start/End: Original strand, 13172 - 13333
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13172 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaa-ggggaaaacttgaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaag 13270  T
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaa 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271 gtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaa 13333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Original strand, 5130 - 5329
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5130 aaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgc 5229  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  5230 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 5327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6937 - 6724
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  6937 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 6838  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  6837 gctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 6739  T
Q  304 gaaattatacttaat 318  Q
    |||||| | ||||||    
T  6738 gaaattttgcttaat 6724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7617 - 7345
Alignment:
Q  37 aaggggggaacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatc 135  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||  ||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  7617 aagggggaaacttgaagattgaaacaattaggagctaaagtgaagctttagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatc 7518  T
Q  136 atgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatg 235  Q
    |  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||  || ||| | ||||    
T  7517 aatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gttgcttatacatg 7419  T
Q  236 aattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7418 aattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3732 - 3545
Alignment:
Q  125 tcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattt 224  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||| | |||    
T  3732 tcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttt 3633  T
Q  225 tcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatac 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3632 tcttgtccatgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattatac 3545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 34286 - 34556
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  34286 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattggagaattaggagctaaagtgaagctcaagcttgaattgatcattacctaaggtaagaggg 34385  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgagttg----------atgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||          ||| | |||| |||||||||||||||    
T  34386 ttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattattgctaaattcgtgc 34485  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34486 tctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 34556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 306
Target Start/End: Original strand, 21031 - 21228
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21031 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 21129  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | | ||| |||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  21130 tcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 21227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 306
Target Start/End: Original strand, 13977 - 14173
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13977 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgc 14074  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||| ||||||| ||| |   | |||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||    
T  14075 tcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgtt--gaaatatgtaaaaatgataagttatga 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3301 - 3130
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3301 ctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 3203  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3202 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 10666 - 10778
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10666 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 10765  T
Q  206 tcttgttgtgatg 218  Q
    |||||||||||||    
T  10766 tcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 307
Target Start/End: Original strand, 9204 - 9462
Alignment:
Q  45 aacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaa 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   |    
T  9204 aacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---a 9300  T
Q  144 tttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 243  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  9301 attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 9400  T
Q  244 attatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    || || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  9401 ataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 307
Target Start/End: Original strand, 16102 - 16360
Alignment:
Q  45 aacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaa 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||   ||| | ||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   |    
T  16102 aacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---a 16198  T
Q  144 tttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 243  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  16199 attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 16298  T
Q  244 attatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    || || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16299 ataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 23665 - 23869
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||    
T  23665 ctaagttaagggggttagttattatcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgt 23764  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||| ||| || || | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  23765 gctctggttatgttgttgttt-cttatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgt 23863  T
Q  304 gaaatt 309  Q
    ||||||    
T  23864 gaaatt 23869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Original strand, 13242 - 13438
Alignment:
Q  106 aaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 205  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13242 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt--aattttt-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 13338  T
Q  206 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 305  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  13339 tcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 13436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42084 - 41815
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  42084 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaaggggg 41985  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca-tgttgtatgaaaatgagttg----------atgaacaattcttgctaaattcgtgct 206  Q
    |||||  |||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||||||||| ||| ||||          ||| | |||| ||| ||||||||||||    
T  41984 ttagtcttcatcataatcatgttcatttatttcaatttctcattgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgttaaattcgtgct 41885  T
Q  207 cttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41884 ctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 41815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 276
Target Start/End: Original strand, 1228 - 1388
Alignment:
Q  114 ggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttg 213  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1228 ggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 1325  T
Q  214 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1326 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 273
Target Start/End: Original strand, 31593 - 31756
Alignment:
Q  109 gtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 208  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31593 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 31691  T
Q  209 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat 273  Q
    ||| |||||| ||| ||    |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||    
T  31692 tgtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat 31756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 371 - 177
Alignment:
Q  104 ctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  371 ctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt---aattttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 276  T
Q  204 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 303  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||    
T  275 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttat 178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 9315 - 9445
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaa-ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaa 107  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9315 gagtgaaaggaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaaattaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaa 9414  T
Q  108 ggtaacggggttagttatcatcataatcatg 138  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  9415 ggtaagggggttagtcttcttcataatcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 379
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56298
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaattatacttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgat 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || ||  | |||| |||| || ||| |  |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgat 56298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3319
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  3622 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaag-attaggagctaaagtgaagcctaagtttgaattaatcatcatctaaggtaa-gggg 3525  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttct-catgttgtatgaaaatgagttg---------atgaacaattcttgctaaattcgtgctc 207  Q
    ||| |  || ||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| | || ||||| ||||         ||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  3524 ttattcttcctcataatcatgttcatttattgcaatttctccttgttatgtg-aaatgggttgattgaataaatggataattgatgctaaattcgtgctc 3426  T
Q  208 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    | | ||||||| ||  ||  | |||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3425 tagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtatgtataaatatcaagttatgaaa 3326  T
Q  308 ttatact 314  Q
    || ||||    
T  3325 ttgtact 3319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Original strand, 7008 - 7129
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7008 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcttaaatttgaattaatcataacctaaggtaaggggg 7107  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatgt 139  Q
    |||||  || ||||||||||||    
T  7108 ttagtgttcttcataatcatgt 7129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5668 - 5548
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  5668 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggagctaaaatgaagcccaagtttggattaatcattacctaaggtaaggggg 5569  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  ||||||||||||||    
T  5568 ttagtcttcatcataatcatg 5548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 49665 - 49785
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  49665 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaaggggg 49764  T
Q  118 ttagttatcatcataatcatg 138  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  49765 ttagtcttcttcataatcatg 49785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 11983 - 12149
Alignment:
Q  45 aacttgaagattggag-aattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaa 143  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||  |||| | ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  11983 aacttgaagattgaagcaattaggagctaaagtgaagcctaagttaaaattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaa 12082  T
Q  144 tttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttg 210  Q
     |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  12083 atttttca-tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 6013 - 6127
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaa-ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaa 107  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6013 gagtgaaaggaagagcaagggttagagaaaggggaaaacttgaagattgaagaaattaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaa 6112  T
Q  108 ggtaacggggttagt 122  Q
    ||||| |||||||||    
T  6113 ggtaagggggttagt 6127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 48632 - 48503
Alignment:
Q  9 gagtgagatgaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaa-ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaa 107  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  48632 gagtgaaaggaagaacaagggttagcaaa-gggggaaacttgaagattgaagaaattaggagctaaagtgaagcccaaatttgaattaatcataacctaa 48534  T
Q  108 ggtaacggggttagttatcatcataatcatg 138  Q
     |||| |||||||||  || |||||||||||    
T  48533 tgtaagggggttagtcttcttcataatcatg 48503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48400 - 48354
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48400 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 138
Target Start/End: Original strand, 164811 - 164904
Alignment:
Q  45 aacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatg 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  164811 aacttgaagattgaagaattaggagctaaagtgaagcttaaatttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcatg 164904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 5390 - 5508
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  5390 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttgaagattgaaga-ttaggagctaaagtgaagcctaagattggattaatcattacctaaggtaaggggg 5488  T
Q  118 ttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  5489 ttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18145 - 18026
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  18145 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacatgaagattgaagaattaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggg 18046  T
Q  118 ttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  18045 ttagtcttcatcataatcat 18026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 34221 - 34340
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaattaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  34221 gaagaacaagggttagagaaagggggaaacttaaagattgaagaattaggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggg 34320  T
Q  118 ttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  34321 ttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 95418 - 95297
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaatt-aggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||  | ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||    
T  95418 gaagaacaagggttagagaaagggagaaacttgaagattgaaggatttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattacctaaggtaagggg 95319  T
Q  117 gttagttatcatcataatcatg 138  Q
    ||||||  || |||||||||||    
T  95318 gttagtcttcttcataatcatg 95297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 4258 - 4378
Alignment:
Q  18 gaagaacaagggttagcaaaaggggggaacttgaagattggagaatt-aggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||    
T  4258 gaagaacaagggttagagaaaggggtaaacttgaagattgaaggatttaggagctaaagtgaagcaaaagtttggattaatcattacctaaggtaagggg 4357  T
Q  117 gttagttatcatcataatcat 137  Q
    |||||   | |||||||||||    
T  4358 gttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13886 - 13673
Alignment:
Q  75 gtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--tgttgtatgaaaa 172  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | || ||||| |||||||  ||||||||||| |    
T  13886 gtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaata 13787  T
Q  173 tgagttg----------atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 262  Q
    || ||||          ||| | |||| ||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  13786 tgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 13687  T
Q  263 tgaaattacatgtt 276  Q
    ||||||||||||||    
T  13686 tgaaattacatgtt 13673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Original strand, 8051 - 8272
Alignment:
Q  64 taggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacgggg-ttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctca--t 160  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |    
T  8051 taggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcattt 8150  T
Q  161 gttgtatgaaaatgagttg----------atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgg 250  Q
    |||||||||| ||| ||||          ||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| || |    
T  8151 gttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattg 8250  T
Q  251 tatgtttgtgggtgaaattaca 272  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  8251 tatgattgttggtgaaattaca 8272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12137 - 12049
Alignment:
Q  63 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaacggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgca 151  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12137 ttaggagctaaattgaagccaaagtttggattaatcattatctaagataagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgca 12049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 123170 - 123260
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  123170 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 123260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 3588 - 3707
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  3588 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 3685  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  3686 gtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1337 - 1262
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  1337 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5668
Alignment:
Q  180 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 279  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||      
T  5792 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt-- 5695  T
Q  280 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 306  Q
    || |||||| ||||| ||||| |||||    
T  5694 aaatatgtaaaaatgataagtcatgaa 5668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12370 - 12279
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12370 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgttt 12279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 540 - 630
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  540 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9135 - 9016
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||| |||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  9135 aattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt--caattat 9038  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  9037 gtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6160
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6070 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 962 - 1052
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  962 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 89460 - 89550
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  89460 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 89550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9106 - 9016
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9106 aattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 148934 - 148859
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  148934 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 148859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19463 - 19344
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  19463 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 19366  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  19365 gtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21547 - 21428
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  21547 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 21450  T
Q  286 gtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  21449 gtaaaaatgataagttgtgaaa 21428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Original strand, 51188 - 51278
Alignment:
Q  186 aattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  51188 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 51278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 36963 - 37038
Alignment:
Q  230 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 307  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  36963 tgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 37038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University