View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF19381_low_1 (Length: 855)
Name: NF19381_low_1
Description: NF19381
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19381_low_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 546; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 8972583 - 8971879
Alignment:
| Q |
1 |
ctctattttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaa |
100 |
Q |
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| T |
8972583 |
ctctattttcactttcacttggtttaagacaagctattgttgtttcttcagctgaaattgcaaaagaagtattgaaagacaatggtaatgttttttctaa |
8972484 |
T |
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| Q |
101 |
tagacctatattatatggtcaacaaaagttgtcttataatgggtcagaaatcnnnnnnnncacaatacactgatttttggagagaaataagaagaatttg |
200 |
Q |
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| T |
8972483 |
tagacctatattatatggtcaacaaaaattatcttataatgggtcagaaat-ggtattttctcaatatagtgatttttggagagaaataagaaaaatttg |
8972385 |
T |
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| Q |
201 |
tgttgttcatattcttagttccaaacgtgcatcacattattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaatatttcagggcatgctagt |
300 |
Q |
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| T |
8972384 |
tgttgttcatatttttagtgccaaacgtgtatcacattattcctccataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaaaatttcagggcatgttgat |
8972285 |
T |
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| Q |
301 |
tcttcaagtgttacaaatttgagtgagttattgatttctctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgagaatgatggaactg |
400 |
Q |
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| T |
8972284 |
tcttcaagtgttacaaatttgagtgaggtgttgatttctctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgagaatgatggaactg |
8972185 |
T |
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| Q |
401 |
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500 |
Q |
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| T |
8972184 |
agaaaagtagatttcatgaaatgttgcatgagtttcaagctttgcttgcagaattttttgtttgtgattatattccatatatgggttggcttgataagct |
8972085 |
T |
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| Q |
501 |
tagaggattgcatggtcgtgttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaacaaatt |
600 |
Q |
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| T |
8972084 |
tagaggattgcatggtcgtgttgataaaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaacaaatt |
8971985 |
T |
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| Q |
601 |
aaagatgaagaagatattgttgatgttttactccaactcaagaaacatcatttatcttcaattgatctcactttcgatcacatcaaggctgtccttgcgg |
700 |
Q |
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| T |
8971984 |
aaagatgaagaagatattgttgatgttttactccaactcaagaaacatcatttatcttcaattgatctcactttcgatcacatcaaggctgtccttgcgg |
8971885 |
T |
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| Q |
701 |
tatgtt |
706 |
Q |
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| T |
8971884 |
tatgtt |
8971879 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 706
Target Start/End: Original strand, 9027218 - 9027922
Alignment:
| Q |
1 |
ctctattttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaa |
100 |
Q |
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| T |
9027218 |
ctctattttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttcagctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccatttgttttctga |
9027317 |
T |
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| Q |
101 |
tagacctatattatatggtcaacaaaagttgtcttataatgggtcagaaatcnnnnnnnncacaatacactgatttttggagagaaataagaagaatttg |
200 |
Q |
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| T |
9027318 |
tagacctagattatatgctcaacaaaaattgacttataacgggtcggaaat-tatattttcacaatacactgatttttggagagaaataagaaaaatttg |
9027416 |
T |
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| Q |
201 |
tgttgttcatattcttagttccaaacgtgcatcacattattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaatatttcagggcatgctagt |
300 |
Q |
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| T |
9027417 |
tgttgttcatattcttagttccaaacgtgtatcacattattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaaaatttcagggcatgctagt |
9027516 |
T |
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| Q |
301 |
tcttcaagtgttacaaatttgagtgagttattgatttctctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgagaatgatggaactg |
400 |
Q |
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| T |
9027517 |
tcttcaagtgttacaaatttgagtgagttattgatttcgctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgaggatgaaggaactg |
9027616 |
T |
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| Q |
401 |
agaaaagtagatttcatgaaatgttgcatgagtttcaagctttgcttgcagaattttttgtttgtgattatattccatatatgggttggcttgataagct |
500 |
Q |
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| T |
9027617 |
aaagaagtaggtttcatggaatgttgcatgagtttcaagctttacttgcagaaatatttgtttctgattatattcccttcatgagttggattgataaact |
9027716 |
T |
|
| Q |
501 |
tagaggattgcatggtcgtgttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaacaaatt |
600 |
Q |
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| T |
9027717 |
taggggattgcatggtcgtcttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgtacatttggatccaaatagagaacaaatt |
9027816 |
T |
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| Q |
601 |
aaagatgaagaagatattgttgatgttttactccaactcaagaaacatcatttatcttcaattgatctcactttcgatcacatcaaggctgtccttgcgg |
700 |
Q |
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| T |
9027817 |
acagatgaagaagatattgttgatgtcttactccatctcaagaaacatcatttgtcttcaattgatctcactttcaatcacatcaaagctgttctcgtgg |
9027916 |
T |
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| Q |
701 |
tatgtt |
706 |
Q |
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|
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| T |
9027917 |
tatgtt |
9027922 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 9002645 - 9001964
Alignment:
| Q |
1 |
ctctattttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaa |
100 |
Q |
| |
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| T |
9002645 |
ctctattttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttctgccgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaa |
9002546 |
T |
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| Q |
101 |
tagacctatattatatggtcaacaaaagttgtcttataatgggtcagaaatcnnnnnnnncacaatacactgatttttggagagaaataagaagaatttg |
200 |
Q |
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| T |
9002545 |
tagacctatattatatggtcaacaaaagttgtcttataatgggtcagaaatcttttttt-cacaatacactgatttttggagagaaataagaaaaatttg |
9002447 |
T |
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| Q |
201 |
tgttgttcatattcttagttccaaacgtgcatcacattattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaatatttcagggcatgctagt |
300 |
Q |
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| T |
9002446 |
tgttattcatatatttagttccatacgtgtgtcatattattcttctataagaaattttgaggtgaagaaaatgataaaaaaaatttcagggcatgttagt |
9002347 |
T |
|
| Q |
301 |
tcttcaagtgttacaaatttgagtgagttattgatttctctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgagaatgatggaactg |
400 |
Q |
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| T |
9002346 |
tcttcaagtgtttcaaatatgagtgagatattgatatctctttcaagtacgataatttgcaggattgtttttgggagaagctatgaagatgaaggaactg |
9002247 |
T |
|
| Q |
401 |
agaaaagtagatttcatgaaatgttgcatgagtttcaagctttgcttgcagaattttttgtttgtgattatattccatatatgggttggcttgataagct |
500 |
Q |
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| T |
9002246 |
agagaagtaggtttcaaggaatgtttcatgagtgtcaagctttgctggcagaaatatttgtttctgattatattccattcatgagttggattgataaact |
9002147 |
T |
|
| Q |
501 |
tagaggattgcatggtcgtgttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaacaaatt |
600 |
Q |
| |
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| T |
9002146 |
taggggattgcatggtcgtcttgatagaaatttcaaggagtttgatgatttttatcaagagattatagatgaacatttggatccaaatagaaaaca---t |
9002050 |
T |
|
| Q |
601 |
aaagatgaagaagatattgttgatgttttactccaactcaagaaacatcatttatcttcaattgatctcactttcgatcacatcaa |
686 |
Q |
| |
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| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||| |||||| | | || || ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |
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| T |
9002049 |
acagatgaagaggttattgttgatgtcttgcttcaacttaagaaaaagcgttcattttcttttgatatcacttttgatcacatcaa |
9001964 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 645
Target Start/End: Original strand, 8975466 - 8976109
Alignment:
| Q |
1 |
ctctattttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaa |
100 |
Q |
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| T |
8975466 |
ctctattttcacttcaacttggtttaagaccagctattgttgtttgttcagctgaaattgccaaagaagtgttgaaaaacaatgatcatgtgttttctaa |
8975565 |
T |
|
| Q |
101 |
tagacctatattatatggtcaacaaaagttgtcttataatgggtcagaaatcnnnnnnnncacaatacactgatttttggagagaaataagaagaatttg |
200 |
Q |
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|
|
| T |
8975566 |
tagacctaaattatatggtcaacaaaaattatcttataatgggtcagaaat-tgtattttctccatacagtgatatttggagagaaataagaaaaatttc |
8975664 |
T |
|
| Q |
201 |
tgttgttcatattcttagttccaaacgtgcatcacattattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaatatttcagggcatgctagt |
300 |
Q |
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| T |
8975665 |
tgttgtgcatttatttagttccaaacgtgtatcatattattcctctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaagaatttcagggcatgttgat |
8975764 |
T |
|
| Q |
301 |
tcttcaagtgttacaaatttgagtgagttattgatttctctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgagaatgatggaactg |
400 |
Q |
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| T |
8975765 |
tcttcaagtgttacaaatttgagtgagttattgatttcgctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgaggatgaaggaactg |
8975864 |
T |
|
| Q |
401 |
agaaaagtagatttcatgaaatgttgcatgagtttcaagctttgcttgcagaattttttgtttgtgattatattccatatatgggttggcttgataagct |
500 |
Q |
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| T |
8975865 |
aaagaagtaggtttcatggaatgttgcatgagtttcaagctttacttgcagaaatatttgtttctgattatattccattcatgagttggattgataaact |
8975964 |
T |
|
| Q |
501 |
tagaggattgcatggtcgtgttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaacaaatt |
600 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
8975965 |
taggggattgcatggtcgtcttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgaacatttggatccaaatagagaacaaatt |
8976064 |
T |
|
| Q |
601 |
aaagatgaagaagatattgttgatgttttactccaactcaagaaa |
645 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8976065 |
acagatgaagaagttattgttgatatcttactccaattgaagaaa |
8976109 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 686
Target Start/End: Original strand, 8952382 - 8953061
Alignment:
| Q |
6 |
ttttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaatagac |
105 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8952382 |
ttttcacttaaacttggtttaagaccagctattgttgtttcttcagctgaaattgccaaagaagtattcaaaaacaatgatcatgtgttttctaatagac |
8952481 |
T |
|
| Q |
106 |
ctatattatatggtcaacaaaagttgtcttataatgggtcagaaatcnnnnnnnncacaatacactgatttttggagagaaataagaagaatttgtgttg |
205 |
Q |
| |
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|
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| T |
8952482 |
ctatatcatatggtcaaaacatattgtgttataatgggtcagaaat-tgtttttgctccatatggtgatttttggagagaaataagaaaaatttgtgtta |
8952580 |
T |
|
| Q |
206 |
ttcatattcttagttccaaacgtgcatcacattattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaatatttcagggcatgctagttcttc |
305 |
Q |
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| T |
8952581 |
ttcatatttttagctccaaacgtgtatcgtactattcttctataagaatatttgaggtgaagaaaatgatcgaaaaaatttcagggcatgctgattcttc |
8952680 |
T |
|
| Q |
306 |
aagtgttacaaatttgagtgagttattgatttctctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgagaatgatggaactgagaaa |
405 |
Q |
| |
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| T |
8952681 |
aagtgttacaaatttgagtgagttattgatttcactctcaagtactataatttgtagaattgcttttgggaaaagctatgaagatgatgaaattgagaag |
8952780 |
T |
|
| Q |
406 |
agtagatttcatgaaatgttgcatgagtttcaagctttgcttgcagaattttttgtttgtgattatattccatatatgggttggcttgataagcttagag |
505 |
Q |
| |
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||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||| |
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| T |
8952781 |
agtaggtttcatggattgttgcatgagtttcaagctttgcttgcaacaagctttttttctgattatattccattcacgggatggattgataagctcagag |
8952880 |
T |
|
| Q |
506 |
gattgcatggtcgtgttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaacaaattaaaga |
605 |
Q |
| |
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| T |
8952881 |
gattgcatggtcgtgttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgaacatttggatccaaatagagaacatattacaga |
8952980 |
T |
|
| Q |
606 |
tgaagaagatattgttgatgttttactccaactcaagaaacatcatttatcttcaattgatctcactttcgatcacatcaa |
686 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| | | || || |||| ||||| ||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
8952981 |
tgaagaggatattgttgatgtcttgctcgaactcaagaaaaaacgttcattttcatttgatatcaactttgatcacatcaa |
8953061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 8930652 - 8929974
Alignment:
| Q |
4 |
tattttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaatag |
103 |
Q |
| |
|
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| T |
8930652 |
tattttcacttcaactaggtttaagatcagctattgttgtttcttcggctgaaattgcgaaagaaatatttaaaaataatgatcaagtgttttctaatag |
8930553 |
T |
|
| Q |
104 |
acctatattatatggtcaacaaaagttgtcttataatgggtcagaaatcnnnnnnnncacaatacactgatttttggagagaaataagaagaatttgtgt |
203 |
Q |
| |
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|||| | |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |
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| T |
8930552 |
acctgtgttatatggccagcaaaaattatcttataatgggtcagacat-tgcattttctcaatatagtgatttttggagagagataagaaaactttgtgt |
8930454 |
T |
|
| Q |
204 |
tgttcatattcttagttccaaacgtgcatcacattattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaatatttcagggcatgctagttct |
303 |
Q |
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| T |
8930453 |
tattcatatatttagcgccaagcgtgtgtcatattattcttctataagaaagtttgaggtgaagcaaatgataaaaaatatttctaatcatgctgcttct |
8930354 |
T |
|
| Q |
304 |
tcaagtgttacaaatttgagtgagttattgatttctctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgagaatgatggaactgaga |
403 |
Q |
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| T |
8930353 |
tcaaatgttacaaatttgagtgagatattgacttctctatatagtacaatgatttgtaggattgcttttgggaagaggtacgaggaacaagggattgaga |
8930254 |
T |
|
| Q |
404 |
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503 |
Q |
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8930154 |
T |
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603 |
Q |
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| T |
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8930057 |
T |
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686 |
Q |
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| T |
8930056 |
gatggagagtttattgttgatgtcttactcgaattgatgaaacaacgtttgttttcaactgatctcacttttgatcatatcaa |
8929974 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8905936 - 8905602
Alignment:
| Q |
36 |
attgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaatagacctatattatatggtcaacaaaagttgtctt |
135 |
Q |
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| T |
8905936 |
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8905837 |
T |
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| Q |
136 |
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235 |
Q |
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| T |
8905836 |
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8905738 |
T |
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236 |
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335 |
Q |
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| T |
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8905638 |
T |
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336 |
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371 |
Q |
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| T |
8905637 |
ttctctctctagtacaataatttgtaggattgcttt |
8905602 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 8916780 - 8916218
Alignment:
| Q |
36 |
attgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaatagacctatattatatggtcaacaaaagttgtctt |
135 |
Q |
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| T |
8916780 |
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8916681 |
T |
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| Q |
136 |
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235 |
Q |
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| T |
8916680 |
ataatgggtcagaaat-tgtattttctcaatatagtgatttttggagagatataagaaaaatttgtgttattcatatatttagcgcgaagcgtgtgtcat |
8916582 |
T |
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| Q |
236 |
attattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaatatttcagggcatgctagttcttcaagtgttacaaatttgagtgagttattgat |
335 |
Q |
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| T |
8916581 |
attattcttctataagaaagtttgaggtgaagcaaatgataaaaaatatttctaatcatgctgcttcttcaattgttacaaatttgagtgagatattgac |
8916482 |
T |
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| Q |
336 |
ttctctatcaagtactataatttgtaggattgcttttgggagaagctatgagaatgatggaac---tgagaaaagtagatttcatgaaatgttgcatgag |
432 |
Q |
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| T |
8916481 |
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8916382 |
T |
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| Q |
433 |
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532 |
Q |
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| T |
8916381 |
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8916282 |
T |
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| Q |
533 |
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596 |
Q |
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| T |
8916281 |
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8916218 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 760 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 8971826 - 8971759
Alignment:
| Q |
760 |
atatacatattctaccaattaattatgtttttgtcctttacctacacatgttttctgtcgctatagga |
827 |
Q |
| |
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| T |
8971826 |
atatacatattctaccaaataattatgtttttgtcctttgcctacacatgttttctgtcgctatagga |
8971759 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 527 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 8905443 - 8905374
Alignment:
| Q |
527 |
gaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaaca |
596 |
Q |
| |
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| T |
8905443 |
gaaattttaaggagatggatgagttttaccaggaggttattgatgaacatttggatccaaatagacaaca |
8905374 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 9401657 - 9401026
Alignment:
| Q |
4 |
tattttcaattcaacttggattaagaaaagctattgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaatag |
103 |
Q |
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| T |
9401657 |
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9401558 |
T |
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| Q |
104 |
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203 |
Q |
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| T |
9401557 |
acctatcctatatggccaacaaaaattatcttataatggatcagaaat-tgcattttctcaatatagtgatccttggagagatttaagaaaaatttgtaa |
9401459 |
T |
|
| Q |
204 |
tgttcatattcttagttccaaacgtgcatcacattattcatctataagaaagtttgaggtgaagaaaatgatcaaaaatatttcagggcatgctagttct |
303 |
Q |
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| T |
9401458 |
tattcatatatttagtgtcaagcgtgtgtcatcttattcctctataagaaagtttgaggtgaaagaaatgatcaaaaaaatttctaacaatgttacttct |
9401359 |
T |
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| Q |
304 |
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403 |
Q |
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| T |
9401358 |
tcagttgttacaaatttgagtgaattattaatttctctctcaagtaaaataatttgtagggttgcttttgggaggaggtatgaagatgaaggactagaga |
9401259 |
T |
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| Q |
404 |
aaagtagatttcatgaaatgttgcatgagtttcaagctttgcttgcagaattttttgtttgtgattatattccatatatgggttggcttgataagcttag |
503 |
Q |
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| T |
9401258 |
gtagtaaattccatggaatgttgcatgagtttgaggccatgttgacagctttctttgtttctgattatattccatttatgggttggattgataaactaag |
9401159 |
T |
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| Q |
504 |
aggattgcatggtcgtgttgatagaaatttcaaggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaacaaattaaa |
603 |
Q |
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| T |
9401158 |
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9401059 |
T |
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| Q |
604 |
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636 |
Q |
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| T |
9401058 |
agtgaaaaggttattgttgatgtcttactccaa |
9401026 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20075973 - 20075327
Alignment:
| Q |
36 |
attgttgtttcttcggctgaaattgcaaaagaagtattgaaaaccaatgaccaattgttttctaatagacctatattatatggtcaacaaaagttgtctt |
135 |
Q |
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| T |
20075973 |
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20075874 |
T |
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| Q |
136 |
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235 |
Q |
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20075873 |
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20075775 |
T |
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335 |
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| T |
20075774 |
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20075675 |
T |
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| Q |
336 |
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435 |
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| T |
20075674 |
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20075575 |
T |
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436 |
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535 |
Q |
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| T |
20075574 |
gaggccatgataacagctttctttatttctgattatattccattcacgggttggattgataaactatctggacttcgtgcgcgtctcgaacgaaatttta |
20075475 |
T |
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| Q |
536 |
aggagtttgatgaattttatcaagagattattgatgagcatttggatccaaatagagaacaaattaaagatgaagaagatattgttgatgttttactcca |
635 |
Q |
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20075474 |
aggagatggatgagttttaccaagaggttattgatgaacatttggatccaaatagacaacatgaagatgatgaagaggtcattgttgatgtcttactaca |
20075375 |
T |
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| Q |
636 |
actcaagaaacatcatttatcttcaattgatctcactttcgatcacat |
683 |
Q |
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20075374 |
attgaagaaagaacgtttgtttccaattgatcttacttttgatcacat |
20075327 |
T |
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