View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19382_low_2 (Length: 688)

Name: NF19382_low_2
Description: NF19382
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19382_low_2
NF19382_low_2
[»] chr5 (113 HSPs)
chr5 (359-678)||(18000037-18000376)
chr5 (108-384)||(31803286-31803563)
chr5 (54-308)||(18000377-18000625)
chr5 (123-384)||(37306694-37306955)
chr5 (108-384)||(37809721-37809998)
chr5 (106-384)||(12722937-12723216)
chr5 (106-384)||(12784421-12784699)
chr5 (108-374)||(37633648-37633915)
chr5 (125-333)||(32388999-32389208)
chr5 (105-341)||(39893786-39894023)
chr5 (108-385)||(4175460-4175738)
chr5 (108-368)||(34261290-34261551)
chr5 (109-384)||(28024240-28024516)
chr5 (110-377)||(2133890-2134156)
chr5 (123-326)||(7466202-7466406)
chr5 (107-379)||(14793769-14794042)
chr5 (108-384)||(39073006-39073283)
chr5 (108-342)||(36239462-36239697)
chr5 (111-384)||(12664820-12665094)
chr5 (111-368)||(12869882-12870140)
chr5 (108-384)||(6072414-6072691)
chr5 (108-384)||(8825019-8825296)
chr5 (108-384)||(16124240-16124517)
chr5 (108-384)||(42911512-42911788)
chr5 (108-347)||(9076070-9076310)
chr5 (108-342)||(4985155-4985390)
chr5 (108-384)||(7579647-7579925)
chr5 (123-384)||(24074833-24075095)
chr5 (105-384)||(5842970-5843250)
chr5 (115-355)||(18020755-18020996)
chr5 (108-384)||(25343922-25344199)
chr5 (108-384)||(26854075-26854351)
chr5 (108-378)||(13703063-13703336)
chr5 (114-368)||(3892791-3893044)
chr5 (105-381)||(4098296-4098573)
chr5 (108-384)||(18794745-18795022)
chr5 (115-384)||(7403816-7404084)
chr5 (108-386)||(9127331-9127610)
chr5 (123-385)||(10359230-10359493)
chr5 (108-342)||(38017257-38017492)
chr5 (108-384)||(38363153-38363428)
chr5 (176-368)||(7735132-7735325)
chr5 (108-384)||(38702103-38702380)
chr5 (108-384)||(38910236-38910512)
chr5 (123-376)||(12637942-12638189)
chr5 (108-384)||(18437303-18437580)
chr5 (108-384)||(40198750-40199027)
chr5 (106-333)||(1087911-1088139)
chr5 (107-384)||(6007845-6008125)
chr5 (107-349)||(6754158-6754401)
chr5 (493-678)||(18007065-18007253)
chr5 (146-385)||(19831560-19831798)
chr5 (108-384)||(28463365-28463642)
chr5 (105-347)||(2673955-2674198)
chr5 (108-384)||(8229784-8230060)
chr5 (108-384)||(28446965-28447241)
chr5 (108-384)||(1297717-1297995)
chr5 (108-368)||(4017392-4017653)
chr5 (105-337)||(7408340-7408573)
chr5 (115-342)||(6689603-6689831)
chr5 (108-384)||(38502784-38503057)
chr5 (108-384)||(4427385-4427663)
chr5 (107-384)||(38297595-38297874)
chr5 (200-378)||(4688871-4689048)
chr5 (111-384)||(18465663-18465933)
chr5 (123-339)||(37303102-37303319)
chr5 (143-342)||(4694768-4694968)
chr5 (115-334)||(24228960-24229180)
chr5 (119-342)||(4962179-4962402)
chr5 (176-346)||(31802788-31802958)
chr5 (195-384)||(5144066-5144255)
chr5 (133-385)||(32439917-32440170)
chr5 (145-384)||(21606275-21606515)
chr5 (117-319)||(3243823-3244026)
chr5 (242-384)||(42394243-42394385)
chr5 (247-379)||(25027844-25027976)
chr5 (112-384)||(1795101-1795374)
chr5 (114-342)||(5119182-5119411)
chr5 (260-384)||(9959010-9959134)
chr5 (173-342)||(38160296-38160463)
chr5 (247-385)||(425090-425228)
chr5 (108-237)||(25027555-25027685)
chr5 (108-299)||(22582519-22582710)
chr5 (277-382)||(10889244-10889349)
chr5 (117-340)||(13461016-13461240)
chr5 (113-342)||(26906495-26906724)
chr5 (200-334)||(38297875-38298007)
chr5 (108-233)||(30368115-30368241)
chr5 (283-379)||(21157600-21157696)
chr5 (103-166)||(10889163-10889226)
chr5 (108-342)||(38308106-38308341)
chr5 (247-342)||(40209088-40209183)
chr5 (225-384)||(40927115-40927274)
chr5 (108-233)||(3686803-3686929)
chr5 (283-379)||(21150459-21150555)
chr5 (225-384)||(25785869-25786028)
chr5 (118-164)||(13957150-13957196)
chr5 (129-210)||(31546000-31546082)
chr5 (127-384)||(31985049-31985307)
chr5 (546-611)||(18029704-18029769)
chr5 (248-386)||(18676536-18676672)
chr5 (114-188)||(38297511-38297586)
chr5 (123-177)||(4688816-4688870)
chr5 (286-384)||(13957319-13957417)
chr5 (123-211)||(6330956-6331045)
chr5 (108-211)||(9958863-9958967)
chr5 (112-172)||(31803112-31803172)
chr5 (113-342)||(18392956-18393186)
chr5 (270-384)||(30368257-30368372)
chr5 (247-384)||(3686356-3686492)
chr5 (122-211)||(10734154-10734243)
chr5 (108-172)||(7734764-7734828)
chr5 (105-189)||(8849115-8849199)
[»] chr1 (101 HSPs)
chr1 (106-384)||(32168290-32168569)
chr1 (106-384)||(51613391-51613670)
chr1 (108-384)||(37735119-37735396)
chr1 (108-368)||(12721436-12721697)
chr1 (108-384)||(35531275-35531552)
chr1 (108-374)||(43500496-43500763)
chr1 (108-384)||(30686391-30686668)
chr1 (108-384)||(31588720-31588996)
chr1 (108-384)||(37609284-37609558)
chr1 (106-384)||(13566656-13566938)
chr1 (106-384)||(21927676-21927953)
chr1 (108-381)||(42800091-42800363)
chr1 (108-384)||(50825553-50825829)
chr1 (123-385)||(28679000-28679263)
chr1 (105-342)||(4100886-4101124)
chr1 (107-384)||(13507750-13508028)
chr1 (107-384)||(13514938-13515216)
chr1 (108-384)||(45368068-45368345)
chr1 (111-379)||(48174656-48174924)
chr1 (108-379)||(32347963-32348234)
chr1 (108-384)||(32994450-32994730)
chr1 (108-384)||(13699154-13699431)
chr1 (108-384)||(38648437-38648714)
chr1 (106-381)||(19349357-19349633)
chr1 (107-377)||(35483760-35484029)
chr1 (106-384)||(1024536-1024815)
chr1 (123-377)||(35255473-35255728)
chr1 (106-384)||(35700353-35700632)
chr1 (108-384)||(10675882-10676159)
chr1 (114-368)||(43808894-43809155)
chr1 (108-387)||(20605604-20605884)
chr1 (114-384)||(44182740-44183009)
chr1 (123-384)||(49908174-49908439)
chr1 (111-385)||(51974154-51974429)
chr1 (111-384)||(19929449-19929723)
chr1 (108-384)||(1429264-1429541)
chr1 (142-384)||(19455414-19455655)
chr1 (106-342)||(37437031-37437268)
chr1 (176-384)||(1039417-1039624)
chr1 (176-384)||(1046323-1046530)
chr1 (108-384)||(40926733-40927000)
chr1 (112-380)||(52649713-52649982)
chr1 (111-385)||(9361952-9362227)
chr1 (179-376)||(1038071-1038269)
chr1 (179-376)||(1044977-1045175)
chr1 (108-384)||(18344306-18344583)
chr1 (108-299)||(12231051-12231243)
chr1 (123-384)||(15660567-15660829)
chr1 (118-373)||(7782942-7783197)
chr1 (118-342)||(9127689-9127916)
chr1 (108-289)||(29830828-29831010)
chr1 (107-299)||(1677263-1677456)
chr1 (123-379)||(45226572-45226829)
chr1 (100-384)||(51972253-51972538)
chr1 (123-342)||(30702285-30702505)
chr1 (106-384)||(36318333-36318611)
chr1 (108-384)||(18033806-18034083)
chr1 (108-299)||(33720582-33720774)
chr1 (126-379)||(43952773-43953017)
chr1 (108-331)||(12124677-12124901)
chr1 (115-377)||(49497139-49497402)
chr1 (115-384)||(52748997-52749265)
chr1 (108-292)||(2059792-2059977)
chr1 (108-267)||(8464237-8464397)
chr1 (107-385)||(38597569-38597849)
chr1 (123-384)||(48508113-48508375)
chr1 (107-332)||(10506845-10507069)
chr1 (105-313)||(31487756-31487964)
chr1 (105-384)||(31570614-31570894)
chr1 (107-384)||(52759008-52759286)
chr1 (200-309)||(24781807-24781916)
chr1 (117-291)||(39412500-39412675)
chr1 (203-378)||(44818440-44818615)
chr1 (108-384)||(1427660-1427935)
chr1 (263-384)||(8464585-8464706)
chr1 (108-384)||(8973432-8973708)
chr1 (269-381)||(19093251-19093363)
chr1 (115-274)||(5598145-5598295)
chr1 (108-336)||(17013450-17013683)
chr1 (269-387)||(35605435-35605553)
chr1 (200-342)||(38817998-38818140)
chr1 (118-319)||(2572016-2572217)
chr1 (269-342)||(5597845-5597918)
chr1 (118-189)||(45230693-45230764)
chr1 (171-389)||(48265080-48265298)
chr1 (247-321)||(42787406-42787480)
chr1 (105-237)||(35605725-35605858)
chr1 (301-384)||(1428199-1428282)
chr1 (283-342)||(50152455-50152514)
chr1 (228-377)||(11248767-11248917)
chr1 (223-384)||(38569716-38569877)
chr1 (108-200)||(1859255-1859347)
chr1 (117-172)||(1039061-1039116)
chr1 (117-172)||(1045967-1046022)
chr1 (260-387)||(37296858-37296985)
chr1 (111-166)||(42787136-42787191)
chr1 (276-342)||(36850667-36850731)
chr1 (117-198)||(36850803-36850885)
chr1 (108-162)||(48264756-48264810)
chr1 (108-189)||(10630586-10630667)
chr1 (277-333)||(3684820-3684876)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (105-377)||(31815052-31815322)
chr7 (107-384)||(42841851-42842129)
chr7 (111-381)||(24283565-24283833)
chr7 (118-384)||(35746641-35746907)
chr7 (105-384)||(18194197-18194477)
chr7 (108-387)||(12838064-12838344)
chr7 (188-384)||(22382141-22382337)
chr7 (123-384)||(7477199-7477461)
chr7 (106-385)||(31430538-31430818)
chr7 (106-384)||(31398916-31399194)
chr7 (108-374)||(33173797-33174064)
chr7 (98-384)||(34368636-34368924)
chr7 (106-384)||(32528312-32528591)
chr7 (108-384)||(33099821-33100096)
chr7 (108-379)||(33257866-33258138)
chr7 (101-384)||(41675166-41675449)
chr7 (203-384)||(17896605-17896786)
chr7 (108-375)||(41891258-41891527)
chr7 (108-315)||(5732059-5732267)
chr7 (108-342)||(7312639-7312874)
chr7 (107-385)||(8264926-8265207)
chr7 (111-385)||(22950807-22951082)
chr7 (123-384)||(35112409-35112671)
chr7 (108-384)||(33921760-33922037)
chr7 (112-375)||(36922228-36922493)
chr7 (118-384)||(18470287-18470554)
chr7 (113-342)||(26723946-26724177)
chr7 (119-342)||(36298171-36298395)
chr7 (108-374)||(10227246-10227513)
chr7 (179-378)||(17354084-17354283)
chr7 (108-383)||(30866722-30866998)
chr7 (111-384)||(32966038-32966312)
chr7 (200-384)||(20035028-20035212)
chr7 (200-384)||(20045439-20045623)
chr7 (114-367)||(29497526-29497780)
chr7 (143-337)||(36648026-36648221)
chr7 (108-384)||(3310196-3310462)
chr7 (200-334)||(26632259-26632393)
chr7 (136-384)||(44480156-44480405)
chr7 (114-349)||(3837877-3838113)
chr7 (106-381)||(29722289-29722564)
chr7 (111-384)||(36406730-36407008)
chr7 (106-384)||(28608575-28608853)
chr7 (105-274)||(8381916-8382086)
chr7 (195-384)||(46285919-46286108)
chr7 (176-384)||(41889372-41889580)
chr7 (108-304)||(38168774-38168972)
chr7 (108-250)||(47408227-47408370)
chr7 (108-384)||(3177910-3178187)
chr7 (98-237)||(41409844-41409984)
chr7 (111-340)||(44820596-44820816)
chr7 (108-384)||(1553495-1553770)
chr7 (225-342)||(45324050-45324163)
chr7 (142-291)||(37353890-37354040)
chr7 (247-384)||(8966026-8966163)
chr7 (205-332)||(6799155-6799283)
chr7 (108-164)||(6799620-6799676)
chr7 (249-321)||(22057544-22057616)
chr7 (242-349)||(42880982-42881089)
chr7 (106-287)||(8380576-8380758)
chr7 (302-384)||(13431312-13431394)
chr7 (108-166)||(17896477-17896535)
chr7 (124-281)||(22785963-22786120)
chr7 (115-384)||(9601886-9602156)
chr7 (115-384)||(9829457-9829727)
chr7 (97-201)||(41408767-41408872)
chr7 (175-384)||(46563177-46563386)
chr7 (287-379)||(2408827-2408919)
chr7 (118-201)||(19327787-19327871)
chr7 (294-375)||(36339372-36339453)
chr7 (196-237)||(41409697-41409738)
chr7 (108-172)||(41888980-41889044)
chr7 (276-331)||(41409765-41409820)
chr7 (225-299)||(30586780-30586854)
chr7 (225-346)||(32049431-32049552)
chr7 (286-376)||(33071894-33071984)
chr7 (114-164)||(35860166-35860216)
chr7 (253-385)||(48981511-48981644)
chr7 (223-299)||(46715404-46715480)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (108-384)||(30676-30953)
[»] chr4 (138 HSPs)
chr4 (108-384)||(9220025-9220302)
chr4 (108-384)||(30939138-30939415)
chr4 (106-385)||(53599768-53600048)
chr4 (112-384)||(19093141-19093414)
chr4 (105-384)||(43887966-43888244)
chr4 (107-384)||(44217689-44217967)
chr4 (106-387)||(44013895-44014177)
chr4 (120-384)||(3436063-3436328)
chr4 (108-384)||(44069014-44069291)
chr4 (108-368)||(8735389-8735649)
chr4 (106-368)||(353965-354228)
chr4 (122-384)||(29295337-29295600)
chr4 (98-384)||(50623397-50623682)
chr4 (111-384)||(33809070-33809344)
chr4 (108-384)||(13629177-13629454)
chr4 (108-384)||(22828385-22828662)
chr4 (108-384)||(46871904-46872180)
chr4 (105-384)||(21044729-21045008)
chr4 (108-377)||(42513009-42513280)
chr4 (108-384)||(42133020-42133297)
chr4 (108-384)||(16464766-16465043)
chr4 (108-384)||(35232282-35232558)
chr4 (108-384)||(47251396-47251673)
chr4 (108-384)||(56576088-56576364)
chr4 (97-384)||(38617280-38617568)
chr4 (98-384)||(42099691-42099978)
chr4 (123-384)||(36408706-36408968)
chr4 (123-384)||(36422872-36423134)
chr4 (107-384)||(22678292-22678571)
chr4 (118-378)||(38542270-38542531)
chr4 (108-382)||(55147044-55147320)
chr4 (108-342)||(6195049-6195284)
chr4 (147-384)||(34361039-34361276)
chr4 (148-378)||(53691678-53691909)
chr4 (105-349)||(26620332-26620577)
chr4 (108-384)||(31861970-31862247)
chr4 (111-378)||(35231679-35231947)
chr4 (200-384)||(52677222-52677406)
chr4 (123-342)||(35381418-35381634)
chr4 (124-384)||(37502004-37502266)
chr4 (128-384)||(16664224-16664481)
chr4 (105-384)||(48782183-48782462)
chr4 (115-384)||(33084461-33084726)
chr4 (108-384)||(39683698-39683975)
chr4 (108-379)||(23719768-23720040)
chr4 (110-384)||(5374336-5374611)
chr4 (108-361)||(42629323-42629577)
chr4 (108-384)||(12252083-12252352)
chr4 (105-384)||(39671308-39671588)
chr4 (126-384)||(53125240-53125499)
chr4 (106-384)||(55935090-55935369)
chr4 (105-384)||(4201311-4201579)
chr4 (142-384)||(26933790-26934032)
chr4 (106-384)||(52061546-52061820)
chr4 (111-368)||(52257778-52258036)
chr4 (115-347)||(26906380-26906613)
chr4 (108-384)||(19527204-19527469)
chr4 (229-381)||(23623601-23623753)
chr4 (114-368)||(34464276-34464531)
chr4 (108-384)||(47428512-47428779)
chr4 (142-311)||(36292672-36292842)
chr4 (105-342)||(52057433-52057670)
chr4 (109-342)||(55702945-55703179)
chr4 (108-340)||(40411970-40412203)
chr4 (108-355)||(36659411-36659659)
chr4 (106-332)||(19399569-19399795)
chr4 (225-382)||(27492344-27492502)
chr4 (200-385)||(8741701-8741886)
chr4 (200-384)||(41414991-41415174)
chr4 (225-384)||(32239383-32239541)
chr4 (106-291)||(33755013-33755197)
chr4 (225-384)||(36750160-36750319)
chr4 (173-384)||(47093795-47094006)
chr4 (110-299)||(54231607-54231797)
chr4 (111-311)||(44176576-44176777)
chr4 (225-384)||(37551767-37551926)
chr4 (242-384)||(51347240-51347387)
chr4 (171-321)||(17978115-17978258)
chr4 (176-274)||(19731425-19731523)
chr4 (264-384)||(33755223-33755343)
chr4 (126-332)||(18781514-18781721)
chr4 (108-342)||(44549668-44549902)
chr4 (107-384)||(18091225-18091503)
chr4 (225-385)||(9834246-9834406)
chr4 (105-211)||(29511199-29511306)
chr4 (242-377)||(38617806-38617941)
chr4 (125-314)||(47884988-47885179)
chr4 (242-384)||(34603607-34603749)
chr4 (123-385)||(18135049-18135312)
chr4 (123-384)||(39308914-39309175)
chr4 (115-379)||(47596604-47596869)
chr4 (108-228)||(49089045-49089166)
chr4 (123-385)||(49122259-49122522)
chr4 (270-390)||(37394306-37394426)
chr4 (108-342)||(30151697-30151932)
chr4 (107-333)||(31369835-31370062)
chr4 (143-377)||(36750539-36750774)
chr4 (108-385)||(47751519-47751790)
chr4 (106-384)||(48509852-48510130)
chr4 (115-321)||(23237673-23237883)
chr4 (224-332)||(41955775-41955883)
chr4 (108-166)||(9834482-9834540)
chr4 (242-340)||(29833045-29833143)
chr4 (283-389)||(41813620-41813726)
chr4 (247-356)||(20087187-20087296)
chr4 (108-340)||(45725563-45725796)
chr4 (106-365)||(14090242-14090502)
chr4 (123-383)||(56499611-56499874)
chr4 (225-384)||(3802143-3802302)
chr4 (293-384)||(17698551-17698642)
chr4 (106-281)||(51654855-51655030)
chr4 (111-339)||(3036413-3036640)
chr4 (123-339)||(27654743-27654961)
chr4 (108-378)||(1180885-1181157)
chr4 (106-186)||(17698643-17698724)
chr4 (108-384)||(38009750-38010027)
chr4 (108-173)||(52677150-52677215)
chr4 (123-230)||(31984151-31984259)
chr4 (242-384)||(48087681-48087823)
chr4 (247-384)||(1391295-1391432)
chr4 (123-384)||(38865887-38866146)
chr4 (108-160)||(38027559-38027611)
chr4 (247-342)||(14949208-14949303)
chr4 (225-384)||(55430405-55430564)
chr4 (242-384)||(27918585-27918726)
chr4 (108-166)||(33751327-33751385)
chr4 (105-151)||(36408969-36409015)
chr4 (105-151)||(36423135-36423181)
chr4 (108-384)||(8456895-8457172)
chr4 (288-385)||(30151994-30152091)
chr4 (248-384)||(6150677-6150813)
chr4 (242-341)||(8752166-8752265)
chr4 (118-188)||(29832354-29832425)
chr4 (302-381)||(37987536-37987615)
chr4 (123-233)||(42645395-42645506)
chr4 (302-384)||(19740718-19740800)
chr4 (106-140)||(23621575-23621609)
chr4 (225-377)||(43086397-43086545)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (123-384)||(9369954-9370216)
chr2 (111-384)||(43077272-43077546)
chr2 (100-387)||(11222293-11222582)
chr2 (108-384)||(32854768-32855043)
chr2 (108-384)||(10812179-10812456)
chr2 (107-384)||(13849700-13849978)
chr2 (108-384)||(34357158-34357435)
chr2 (107-384)||(15182986-15183264)
chr2 (105-342)||(44360456-44360693)
chr2 (108-384)||(14295743-14296020)
chr2 (108-384)||(26342560-26342837)
chr2 (108-382)||(478959-479235)
chr2 (107-349)||(3363599-3363842)
chr2 (108-386)||(15893566-15893845)
chr2 (113-375)||(30264593-30264856)
chr2 (101-384)||(41885605-41885889)
chr2 (107-384)||(13753935-13754213)
chr2 (106-384)||(34399182-34399461)
chr2 (107-384)||(34884523-34884801)
chr2 (117-384)||(14541311-14541579)
chr2 (108-376)||(36375559-36375830)
chr2 (108-379)||(37093435-37093706)
chr2 (105-382)||(25558169-25558444)
chr2 (106-368)||(8443687-8443937)
chr2 (108-384)||(35158337-35158614)
chr2 (107-386)||(4654697-4654977)
chr2 (110-384)||(13965587-13965862)
chr2 (108-386)||(19594329-19594607)
chr2 (107-368)||(9706784-9707045)
chr2 (111-340)||(10263780-10264010)
chr2 (105-384)||(11560030-11560310)
chr2 (107-384)||(15677282-15677554)
chr2 (106-355)||(4883612-4883862)
chr2 (108-384)||(13215373-13215650)
chr2 (114-384)||(36404833-36405105)
chr2 (116-368)||(4952690-4952935)
chr2 (108-342)||(13000897-13001132)
chr2 (117-384)||(28145566-28145835)
chr2 (171-384)||(29041932-29042140)
chr2 (106-384)||(31024924-31025203)
chr2 (108-384)||(14288411-14288686)
chr2 (195-377)||(2012848-2013030)
chr2 (106-384)||(1395544-1395822)
chr2 (242-342)||(25187248-25187348)
chr2 (171-321)||(2991854-2991997)
chr2 (108-342)||(37116589-37116814)
chr2 (108-321)||(14308438-14308650)
chr2 (124-379)||(38186054-38186312)
chr2 (142-342)||(6013497-6013698)
chr2 (106-377)||(38072216-38072482)
chr2 (242-385)||(32674190-32674333)
chr2 (118-342)||(7529700-7529926)
chr2 (247-384)||(14284108-14284245)
chr2 (117-332)||(32543782-32543998)
chr2 (108-310)||(31011704-31011905)
chr2 (108-232)||(25186816-25186941)
chr2 (222-384)||(34309151-34309312)
chr2 (108-379)||(37077155-37077427)
chr2 (106-384)||(928018-928294)
chr2 (111-185)||(3376266-3376341)
chr2 (242-384)||(33947550-33947692)
chr2 (108-211)||(34262808-34262912)
chr2 (108-166)||(14284283-14284340)
chr2 (283-342)||(30544542-30544601)
chr2 (306-384)||(10562473-10562551)
chr2 (247-341)||(42088917-42089011)
chr2 (108-165)||(25787527-25787584)
chr2 (115-160)||(36173264-36173309)
chr2 (286-379)||(37660129-37660222)
chr2 (108-187)||(1259615-1259695)
chr2 (305-365)||(18904095-18904155)
chr2 (286-342)||(45065094-45065150)
chr2 (225-347)||(38148139-38148261)
chr2 (306-355)||(28301684-28301733)
chr2 (307-384)||(37353969-37354046)
chr2 (115-164)||(42263347-42263396)
chr2 (242-342)||(838191-838291)
[»] chr3 (100 HSPs)
chr3 (108-384)||(33874535-33874812)
chr3 (108-384)||(20848713-20848985)
chr3 (114-384)||(47104150-47104421)
chr3 (105-384)||(54106243-54106523)
chr3 (108-342)||(3643185-3643419)
chr3 (98-384)||(52175698-52175986)
chr3 (123-385)||(51064862-51065125)
chr3 (108-367)||(42515163-42515421)
chr3 (99-384)||(52173726-52174011)
chr3 (123-384)||(54898090-54898352)
chr3 (107-383)||(43775378-43775655)
chr3 (106-377)||(13158426-13158700)
chr3 (108-377)||(33491128-33491398)
chr3 (111-384)||(790530-790804)
chr3 (108-384)||(43554370-43554646)
chr3 (108-384)||(53745271-53745547)
chr3 (114-384)||(52663422-52663693)
chr3 (106-384)||(36234347-36234623)
chr3 (120-384)||(28885658-28885922)
chr3 (105-384)||(34266426-34266704)
chr3 (108-384)||(42671879-42672156)
chr3 (108-384)||(47069846-47070123)
chr3 (108-346)||(45101347-45101586)
chr3 (111-384)||(51244604-51244878)
chr3 (108-384)||(19550226-19550503)
chr3 (108-368)||(35315128-35315389)
chr3 (105-384)||(17102734-17103013)
chr3 (107-334)||(39866838-39867065)
chr3 (111-368)||(29697987-29698245)
chr3 (108-384)||(32980620-32980897)
chr3 (108-368)||(29651668-29651925)
chr3 (106-393)||(50091917-50092204)
chr3 (114-383)||(48151966-48152236)
chr3 (108-299)||(32853349-32853539)
chr3 (111-318)||(27992286-27992494)
chr3 (108-379)||(27483777-27484047)
chr3 (108-385)||(48214046-48214312)
chr3 (108-384)||(3376293-3376574)
chr3 (108-379)||(27039595-27039867)
chr3 (123-384)||(46973400-46973665)
chr3 (100-342)||(40139823-40140053)
chr3 (108-384)||(41425609-41425886)
chr3 (108-384)||(52627227-52627504)
chr3 (105-333)||(45145160-45145388)
chr3 (108-384)||(33074267-33074543)
chr3 (108-384)||(40318917-40319194)
chr3 (108-384)||(41351183-41351461)
chr3 (105-340)||(51697547-51697786)
chr3 (123-342)||(54911306-54911525)
chr3 (115-321)||(24981333-24981540)
chr3 (108-349)||(51219082-51219315)
chr3 (123-330)||(24068-24276)
chr3 (108-367)||(40010653-40010913)
chr3 (225-384)||(20105172-20105331)
chr3 (109-384)||(13167996-13168261)
chr3 (179-384)||(7328435-7328640)
chr3 (115-384)||(41168741-41169008)
chr3 (106-331)||(49123556-49123781)
chr3 (118-377)||(11473389-11473649)
chr3 (118-321)||(25983662-25983865)
chr3 (213-373)||(43159855-43160015)
chr3 (108-299)||(43945444-43945636)
chr3 (203-385)||(45513700-45513882)
chr3 (107-347)||(5243924-5244164)
chr3 (142-342)||(32853971-32854172)
chr3 (247-384)||(44544298-44544435)
chr3 (108-342)||(27028004-27028239)
chr3 (115-321)||(45055230-45055437)
chr3 (105-340)||(41926701-41926940)
chr3 (263-384)||(44092174-44092295)
chr3 (117-384)||(54334181-54334448)
chr3 (123-349)||(6902293-6902520)
chr3 (106-368)||(30861531-30861792)
chr3 (118-257)||(29458202-29458342)
chr3 (175-377)||(55141533-55141732)
chr3 (123-385)||(26748332-26748594)
chr3 (247-385)||(35077366-35077504)
chr3 (108-205)||(2858566-2858664)
chr3 (251-385)||(47843971-47844105)
chr3 (247-384)||(23771267-23771404)
chr3 (123-384)||(34750635-34750896)
chr3 (108-297)||(29803727-29803905)
chr3 (263-347)||(2154184-2154268)
chr3 (251-379)||(49168349-49168477)
chr3 (108-288)||(28943523-28943704)
chr3 (283-384)||(2642690-2642791)
chr3 (108-184)||(7329004-7329081)
chr3 (293-342)||(24569572-24569621)
chr3 (251-378)||(28226413-28226540)
chr3 (293-368)||(29803631-29803706)
chr3 (114-172)||(31610081-31610139)
chr3 (108-164)||(35458493-35458549)
chr3 (225-321)||(53282022-53282118)
chr3 (118-267)||(8236894-8237044)
chr3 (247-349)||(22099953-22100055)
chr3 (115-161)||(28226620-28226666)
chr3 (107-164)||(35077588-35077645)
chr3 (108-140)||(20105398-20105430)
chr3 (278-342)||(31610268-31610332)
chr3 (108-164)||(47843832-47843888)
[»] chr8 (114 HSPs)
chr8 (105-384)||(26740117-26740396)
chr8 (108-374)||(23793254-23793525)
chr8 (107-386)||(14263522-14263802)
chr8 (108-330)||(27911655-27911878)
chr8 (108-330)||(27958074-27958297)
chr8 (147-384)||(17718483-17718721)
chr8 (108-384)||(3720660-3720937)
chr8 (108-383)||(33935043-33935319)
chr8 (107-368)||(14511411-14511682)
chr8 (107-385)||(35052032-35052311)
chr8 (108-384)||(18291444-18291720)
chr8 (108-384)||(23429889-23430166)
chr8 (108-343)||(38482775-38483011)
chr8 (108-384)||(9954629-9954906)
chr8 (107-384)||(23848538-23848816)
chr8 (123-384)||(34046831-34047093)
chr8 (108-384)||(14061132-14061409)
chr8 (108-384)||(15596324-15596601)
chr8 (108-384)||(21651729-21652006)
chr8 (112-384)||(43553020-43553292)
chr8 (118-346)||(4057306-4057535)
chr8 (116-384)||(31028634-31028902)
chr8 (108-334)||(14228305-14228531)
chr8 (111-368)||(12342600-12342858)
chr8 (107-384)||(34981809-34982087)
chr8 (108-384)||(39303498-39303776)
chr8 (106-381)||(18842513-18842788)
chr8 (107-321)||(32010066-32010281)
chr8 (106-384)||(36058213-36058491)
chr8 (108-384)||(167460-167737)
chr8 (107-384)||(10180350-10180628)
chr8 (108-382)||(38128530-38128798)
chr8 (109-384)||(26062688-26062963)
chr8 (108-384)||(25812732-25813008)
chr8 (108-382)||(6757388-6757663)
chr8 (205-384)||(13327759-13327938)
chr8 (123-349)||(40228310-40228537)
chr8 (107-385)||(11993872-11994139)
chr8 (108-384)||(12248753-12249031)
chr8 (105-384)||(23855536-23855817)
chr8 (106-350)||(1245326-1245571)
chr8 (108-384)||(25703561-25703837)
chr8 (118-334)||(43641982-43642199)
chr8 (106-384)||(8730810-8731087)
chr8 (106-384)||(13173909-13174188)
chr8 (108-384)||(19972260-19972536)
chr8 (108-384)||(21020297-21020573)
chr8 (225-381)||(16700994-16701150)
chr8 (110-384)||(16656681-16656955)
chr8 (108-384)||(2888451-2888728)
chr8 (201-384)||(40603928-40604111)
chr8 (159-384)||(12763415-12763640)
chr8 (108-384)||(45281361-45281638)
chr8 (222-384)||(40521340-40521503)
chr8 (200-384)||(2335413-2335597)
chr8 (106-384)||(8553997-8554276)
chr8 (200-342)||(11707561-11707703)
chr8 (108-384)||(27518696-27518967)
chr8 (105-334)||(2456095-2456320)
chr8 (107-342)||(8453218-8453452)
chr8 (106-384)||(7483724-7484001)
chr8 (123-342)||(39615451-39615670)
chr8 (195-382)||(6750597-6750784)
chr8 (108-342)||(35296066-35296301)
chr8 (106-274)||(8672584-8672753)
chr8 (111-342)||(17074568-17074800)
chr8 (111-342)||(17573470-17573702)
chr8 (200-331)||(15647475-15647606)
chr8 (123-384)||(33314523-33314786)
chr8 (123-348)||(1202442-1202668)
chr8 (200-321)||(15623687-15623808)
chr8 (266-381)||(8672285-8672400)
chr8 (108-233)||(41308026-41308153)
chr8 (176-338)||(9808026-9808188)
chr8 (108-386)||(29125880-29126158)
chr8 (145-342)||(35498090-35498288)
chr8 (108-384)||(38221793-38222069)
chr8 (251-342)||(41305666-41305757)
chr8 (247-385)||(43553366-43553504)
chr8 (108-379)||(38074261-38074532)
chr8 (277-387)||(35028585-35028693)
chr8 (247-384)||(13132239-13132376)
chr8 (108-287)||(36111926-36112104)
chr8 (179-331)||(3513390-3513542)
chr8 (108-211)||(13328123-13328227)
chr8 (285-384)||(8954860-8954959)
chr8 (225-315)||(17313126-17313216)
chr8 (247-384)||(35051828-35051963)
chr8 (115-187)||(29091075-29091148)
chr8 (286-386)||(6660931-6661031)
chr8 (286-386)||(6741333-6741433)
chr8 (242-386)||(13935194-13935338)
chr8 (286-384)||(45317632-45317730)
chr8 (108-281)||(11727666-11727839)
chr8 (283-376)||(41890510-41890603)
chr8 (108-267)||(35029644-35029803)
chr8 (107-342)||(41701464-41701700)
chr8 (143-355)||(7605917-7606128)
chr8 (114-207)||(31964726-31964820)
chr8 (108-220)||(17313286-17313399)
chr8 (276-341)||(39663772-39663837)
chr8 (248-384)||(11163246-11163382)
chr8 (242-342)||(37998229-37998328)
chr8 (294-342)||(41644334-41644382)
chr8 (116-164)||(45317853-45317901)
chr8 (223-290)||(10013317-10013384)
chr8 (114-188)||(11707443-11707518)
chr8 (118-172)||(1739886-1739940)
chr8 (286-384)||(30205440-30205538)
chr8 (108-181)||(35052305-35052379)
chr8 (108-189)||(41643473-41643555)
chr8 (288-376)||(40608022-40608111)
chr8 (128-211)||(11015868-11015951)
chr8 (111-155)||(17718906-17718950)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (99-382)||(147102-147387)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (108-380)||(17251239-17251513)
chr6 (110-318)||(11128877-11129086)
chr6 (108-384)||(26470707-26470984)
chr6 (108-384)||(31244733-31245010)
chr6 (108-384)||(33260680-33260962)
chr6 (108-386)||(11676599-11676874)
chr6 (105-384)||(22050029-22050308)
chr6 (108-342)||(30416059-30416294)
chr6 (108-384)||(24356038-24356315)
chr6 (106-384)||(17193138-17193417)
chr6 (106-385)||(23777275-23777555)
chr6 (108-374)||(3621580-3621847)
chr6 (111-378)||(17123972-17124239)
chr6 (108-384)||(1751415-1751692)
chr6 (108-384)||(9838106-9838383)
chr6 (108-384)||(17835873-17836150)
chr6 (105-384)||(24663359-24663639)
chr6 (115-384)||(22784659-22784929)
chr6 (108-384)||(23923697-23923974)
chr6 (108-384)||(8176416-8176690)
chr6 (124-384)||(373703-373964)
chr6 (105-349)||(12732191-12732435)
chr6 (98-384)||(8992528-8992816)
chr6 (98-384)||(9016975-9017263)
chr6 (106-384)||(34378839-34379118)
chr6 (145-342)||(7170174-7170372)
chr6 (200-384)||(30388701-30388885)
chr6 (108-377)||(364526-364797)
chr6 (217-384)||(24948223-24948390)
chr6 (107-384)||(34607078-34607356)
chr6 (108-315)||(1249588-1249796)
chr6 (108-383)||(1252147-1252423)
chr6 (106-342)||(7056122-7056361)
chr6 (176-384)||(30236958-30237166)
chr6 (117-331)||(7632030-7632245)
chr6 (108-254)||(26485669-26485816)
chr6 (101-336)||(32359417-32359648)
chr6 (124-332)||(11431157-11431366)
chr6 (107-384)||(31854472-31854752)
chr6 (276-384)||(3849045-3849153)
chr6 (106-384)||(24635688-24635967)
chr6 (98-211)||(24949260-24949374)
chr6 (106-234)||(19645704-19645835)
chr6 (200-342)||(52685-52827)
chr6 (247-385)||(27313479-27313617)
chr6 (107-384)||(34730540-34730817)
chr6 (107-385)||(22400547-22400826)
chr6 (175-368)||(7235435-7235629)
chr6 (123-384)||(11000809-11001070)
chr6 (171-331)||(13597443-13597602)
chr6 (123-347)||(32250951-32251174)
chr6 (110-188)||(53807-53886)
chr6 (125-342)||(1923873-1924092)
chr6 (123-384)||(17601132-17601401)
chr6 (118-299)||(15432736-15432917)
chr6 (108-166)||(30388965-30389023)
chr6 (108-188)||(3850496-3850577)
chr6 (302-384)||(19645851-19645933)
chr6 (248-384)||(19811936-19812072)
chr6 (225-384)||(2381111-2381270)
chr6 (108-152)||(1135165-1135209)
chr6 (108-140)||(27605416-27605448)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (108-385)||(69079-69356)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (108-368)||(7420-7681)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (118-384)||(295-562)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (106-377)||(26109-26381)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (106-377)||(148288-148562)
scaffold0002 (109-384)||(138727-138992)
scaffold0002 (225-379)||(369389-369542)
scaffold0002 (115-164)||(492182-492231)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (108-366)||(8152-8411)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (108-384)||(49127-49403)
scaffold0024 (108-166)||(89369-89427)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (109-375)||(4505-4770)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (108-340)||(77112-77345)
[»] scaffold1213 (1 HSPs)
scaffold1213 (158-384)||(1-232)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (108-332)||(419476-419701)
[»] scaffold0831 (1 HSPs)
scaffold0831 (107-342)||(2829-3067)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (171-384)||(14769-14982)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (111-384)||(184114-184388)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (247-342)||(72071-72166)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (107-384)||(223-500)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (225-368)||(23132-23275)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (269-384)||(195884-195999)
scaffold0014 (115-162)||(195578-195625)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (228-361)||(1036-1169)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (228-361)||(6460-6593)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (108-349)||(573-809)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (108-287)||(1802-1981)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (306-385)||(252573-252652)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (248-342)||(96186-96280)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 113)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 359 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 18000376 - 18000037
Alignment:
Q  359 acagttaaaatggaacggagggagtacatgattttgggcagaattatacatatgcaagcattcaattaagaaacgagttcaaattcaattatca------ 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||          
T  18000376 acagttaaaaaggaacggagggagtacatgtttttggccagaatattacatatgcaagcattcaattaaaaaacaagttcaaattcaattatcactgcaa 18000277  T
Q  453 --------------taaatgaacttcaagatacattattgttgttgaatcttctacttaaaaagttgggaactcaatctcagatccacatttgccatggg 538  Q
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000276 ttccatacatatcataaatgaacttcaagatacattattgttgttgaatcttctacttaaaaagttgggaactcaatctcagatccacatttgccatggg 18000177  T
Q  539 ggaacacaggacagtcaatgaagtttgatccagaagtgtccacacacaaataaacttgatatagttgactgttgccagatgagtccacattacattcaat 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000176 ggaacacaggacagtcaatgaagtttgatccagaagtgtccacacacaaataaacttgatatagttgactgttgccagatgagtccacattacattcaat 18000077  T
Q  639 gaatggagaaaatccaactgcattttgtatagctcctttg 678  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18000076 gaatggagcaaacccaactgcattttgtatagctcctttg 18000037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31803563 - 31803286
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31803563 tactacctccgttcttttttaattgtcactttttgacattttacacaaatcaagacaattaataaatgttactacttttgatacaattatttttactttt 31803464  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  31803463 actaaaacgaccttgttaatttaatatttcaattcatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggataatattagtaaaacatcgtttaatgttgca 31803364  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31803363 ttgaactttgaaagtgatagttaaataagaacaaattttttctctaaaaatgacagttaaaaaggaacggatggagta 31803286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18000625 - 18000377
Alignment:
Q  54 ccaacgaattctcaactgtcattaactatgttttaatttggacgaaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacat 153  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||     
T  18000625 ccaacggattctcaaatgccattaactatgttccaacttggacgaaaaaagaattactacctccgttcctttttaattgttaccttttgacattttacac 18000526  T
Q  154 aaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctct 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18000525 aaaccaaaacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactt------ttatgaccttgttaatttaatatttcaatacatatgtttctct 18000432  T
Q  254 ctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  18000431 ctccacaataaatatctaaggttaatattgataaaacatcatttaatgttgcatt 18000377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Original strand, 37306694 - 37306955
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  37306694 tttttaattgtcactttttaacattttacacaaaccaagacaattaataaatgttactacttttgatacaattgttcttacttttactataatgaccttg 37306793  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  37306794 ttaatttaatatttcaattcatatgtttttctctctgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacatcatttaatgttgcattgaactttaaaagt 37306893  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37306894 gacagttaattaggaac-aaatttttctctaaaagtgacagttaaaaaggaacggatggagta 37306955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37809998 - 37809721
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  37809998 tactacctccgatcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaaccaagacaattaataaatgttactacttttgatgcaattgtttttactttt 37809899  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37809898 actataatgatcttgttaatttaatattttaattcatatgtttctctctctgcaataaatatataagggtaatattggtaaaacatcatttaatgttgca 37809799  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37809798 atgaactttgaaagtgacagttaattaggaacaaattttttctctaaaagtgacagttaaaaaggaacagaggaagta 37809721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 12722937 - 12723216
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12722937 attactacctctgttcctttttaattctcactttttgacattttacacaaaccaagacaatcaataaatattactacttttgatacaattgtttttactt 12723036  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||  |||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||   |||    
T  12723037 ttactaaaatgatcttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatataagggtaatattggtaaaacaacaattagtgttg 12723136  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12723137 cattgaactttaaaagtgacaattaaataggaacaaaatttttctccaaaaatgacagttaaaaaggaacagagggagta 12723216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 12784421 - 12784699
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  12784421 attactacctctgttcctttttaattctcactttttgacattttacacaaaccaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgtttt-actt 12784519  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||  |||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||   |||    
T  12784520 ttactaaaatgatcttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatataagggtaatattggtaaaacaacaattagtgttg 12784619  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12784620 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaaatgacagttaaaaagaaacggagggagta 12784699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 108 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37633915 - 37633648
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37633915 tactacgtccgatcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaaccaagacaattaataaatgttactacttttgatacaattgtttttactttt 37633816  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37633815 actataatgatcttgttaatttaatattttaattcatatgtttctctttctgcaataaatatataagggtaatattggtaaaacatcatttaatgttgca 37633716  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaac 374  Q
     |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  37633715 atgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaattttttctctaaaagtgacggttaaaaaggaac 37633648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 125 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32389208 - 32388999
Alignment:
Q  125 tttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgtt 223  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  32389208 tttaattgtcactttttaacattttacataaaccaagacaatcaataagtgttactacttttgatacaattatttttacttttactataatggccttatt 32389109  T
Q  224 aatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaa 323  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  32389108 aatttaatatttcatttcatatgtttctttctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtga 32389009  T
Q  324 caattaaata 333  Q
    || |||||||    
T  32389008 cagttaaata 32388999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 341
Target Start/End: Original strand, 39893786 - 39894023
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39893786 aattactacatccgttcctttttaattgtcactttttaacattttacacaaaccaaaataatcaataagtgttactacttttgatacaattgtttttact 39893885  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||    
T  39893886 tttactataatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatttaagggtaatattggtaaaacaatatttaatgtt 39893985  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  39893986 gcattgaactttaaaagtgacagttaaataggaacaaa 39894023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 385
Target Start/End: Original strand, 4175460 - 4175738
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| |  | |||||||    
T  4175460 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaagcaagacaataaacaattgatactacttttgatacaataagctatactttt 4175559  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  4175560 actataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattgataaaacaacatttaatgttgca 4175659  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4175660 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagtac 4175738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34261551 - 34261290
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| |  | || ||||    
T  34261551 tactacctctgttcctttttaattgtcatattttgacattttagacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatacaataagctatattttt 34261452  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34261451 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaacgttgca 34261352  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||    
T  34261351 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaattttctgcaaaattgacacttaaaa 34261290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 384
Target Start/End: Original strand, 28024240 - 28024516
Alignment:
Q  109 actacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||| | || ||||||||    
T  28024240 actacctccgttcctttttaattgtcatattttgacattttacaccaaccaagacaatcaataattattactacttttgatgcaataagttatactttta 28024339  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  || |||    
T  28024340 ctataatgaccttattcatttaacatctcattttatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttacat 28024439  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  28024440 tgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagagacacttaaaaaggaacagagagagta 28024516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 377
Target Start/End: Original strand, 2133890 - 2134156
Alignment:
Q  110 ctacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttac 208  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||| | || |||||||||    
T  2133890 ctacctccgtgcctttttaattatcattttt-gacattttacataaaccaagacaatcaataattgttacta-ttttgatgcaataagttatacttttac 2133987  T
Q  209 tattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||    
T  2133988 tataatgaccttattaatttaacatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggcaaaacaacatttaatgttgcatt 2134087  T
Q  309 gaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  2134088 gaactttgaaagtaacaattaaataagaacaaaaaatttctttaaaagagacacttaaaaaggaacgga 2134156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 123 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7466406 - 7466202
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||||| |  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||     
T  7466406 tttttaattgttattttttgatattttacataaatcaagacaattaataaatgttattacttttaatacaattatttttacttttgctataatgacctta 7466307  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  7466306 ttaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacactatttaatgttgcattgaagtttgaaagt 7466207  T
Q  322 aacaa 326  Q
    |||||    
T  7466206 aacaa 7466202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 379
Target Start/End: Original strand, 14793769 - 14794042
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||  |||||| |||||||  ||| | || ||||||    
T  14793769 ttactacctcccttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaatataatcaataattattactatttttgatgcaataagttatacttt 14793868  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||    
T  14793869 tactataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctttccgcaataaataactaaggataatattgataaaacaacatttaatgttgc 14793968  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  14793969 attgaactttgaaagtaacatttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaacagacatttaaaaaggaacggagg 14794042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39073283 - 39073006
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  39073283 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 39073184  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  39073183 actataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctcacttcgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 39073084  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39073083 ttgaactttgaaaatgacagttaaataggaacaaattttttttccaaaattgacacttaaaaaggaacggagggagta 39073006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36239697 - 36239462
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||| | || || ||||    
T  36239697 tactatctccgttcatttttaattgtcacattttgacattttacacatatcaagacaatcaatagttgttactacttttgatgcaataagttatattttt 36239598  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  36239597 actataatgaccttattaatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatttaatgttgca 36239498  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36239497 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 36239462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12665094 - 12664820
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  |||    | ||||||||||    
T  12665094 tacctccgttcctttttaattgtcatattttgacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaatatgatgtacttttact 12664995  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  12664994 ataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaactacatttaatgttgcattg 12664895  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| | ||| |||||| | |||||||||||||    
T  12664894 aactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtaacacttaaaaagaaacggagggagta 12664820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 368
Target Start/End: Original strand, 12869882 - 12870140
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || ||||||||||    
T  12869882 tacctccgttcatttttaattgtcacattttgatattttatacaaaccaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatacttttact 12869981  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||    
T  12869982 ataatgaccttattcatttaatatttcattttatatatttctctctccgcaataaataactaagaacaatattggtaaaacaacatttaatgttgtattg 12870081  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12870082 aactttgaaagtgacagttaaataggaacaaattttttctctaaaagtgacacttaaaa 12870140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6072691 - 6072414
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||  |||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  6072691 tactacctccgttcctttttaattatcacatttaaacattttacacaaattaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 6072592  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  6072591 actataatgaccttattcatttaatatctcatttaatatatttctctctccgtaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 6072492  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||  |||| ||||  |||||| | |||||||||||||    
T  6072491 ttgaactttgaaagtaacagttaaataagaacaaaaattttctccaaaagtgacgcttaaaaagaaacggagggagta 6072414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8825296 - 8825019
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  8825296 tactacctccgttcctttttaattatcacattttgacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatactttt 8825197  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  8825196 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 8825097  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||  |||||||  |||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8825096 ttgaacttcgaaaatgacagttaaatatgaacaaaaaatttctcaaaaaatgacacttaaaaaggaacggaaggagta 8825019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 16124240 - 16124517
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || || ||||    
T  16124240 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaatatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtattttt 16124339  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  16124340 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 16124439  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||| || ||||  ||| || ||||  || | ||||||  ||||||||||||||    
T  16124440 ttaaactttgaaggtaacagttaaatagtaataaaaaatttattcaaaagagatacttaaaaatgaacggagggagta 16124517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42911788 - 42911512
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  42911788 tactacctc-gttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatactttt 42911690  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||  | | || |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  42911689 actataatgatcatattcatttaacatctcatttcatatatttatctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgca 42911590  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  42911589 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagtaacaaaaattttctccaaaagagacacttaaaaagaaacggagggagta 42911512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9076310 - 9076070
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  9076310 tactaccttcgttcctttttaattgtcataatttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaattatactttt 9076211  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  9076210 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattgataaaacaacatttaatgttgca 9076111  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  9076110 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaattttt 9076070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 4985155 - 4985390
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||| | || || ||||    
T  4985155 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacataccaagacaatcaatagttgttactacttttgatgcaataagttatattttt 4985254  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||    
T  4985255 actataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctcctcaataaataattaagggtaatattgataaaacattatttaatgttgca 4985354  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4985355 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 4985390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 7579647 - 7579925
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatag-aattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || ||| | ||||||||||  | | ||| |  | ||||||    
T  7579647 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaaaacaatcaacaattgatactactttttgttgcaataaactatacttt 7579746  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  7579747 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctttccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgc 7579846  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7579847 attgaacttcgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 7579925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Original strand, 24074833 - 24075095
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||  |||     
T  24074833 tttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaaaacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatacttttactataatgaactta 24074932  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24074933 ttcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaagagtaatattgataaaatatcatttaatgttgcattgaactttgaaagt 24075032  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||    
T  24075033 gacagttaaatataaacaaaaaaattctttaaaagagacacttaaaaaggaatggagggagta 24075095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 5842970 - 5843250
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattattttt-ac 202  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  5842970 aattactatatccgttcctttttaattatcactttttgacattttacataaaccaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgttttttac 5843069  T
Q  203 ttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacat 302  Q
    ||||||||| || | ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||  ||||||| ||    
T  5843070 ttttactataatagtcttattgatttaa-atttcacttcatatgtttctcactctgcaataaatatctaaaggtgatattgataaaactacatttaatat 5843168  T
Q  303 tgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||  |||||| ||||| |||||||||    
T  5843169 tgcattgaactttgaaaacgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaagtaacgattaaaaaggaacagagggagta 5843250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 115 - 355
Target Start/End: Original strand, 18020755 - 18020996
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||| | |||||||||| ||  ||| |  | |||||||||||| |    
T  18020755 tccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacagaccaagacaatcaacaattgatactacttttaatgcaataagctatacttttactataa 18020854  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    || |||| || |||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  18020855 tgaccttattcatttgatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaatt 18020954  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaa 355  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18020955 ttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaattttcttcaaaa 18020996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25344199 - 25343922
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || ||| | | |||||||||||  ||| |  | || ||||    
T  25344199 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgtcattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatcctacttttgatgcaataagctatattttt 25344100  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  25344099 actataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 25344000  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  25343999 ttgaaatttgaaagtaacggttaaatagaaacaaaaattttctccaaaagtgacacttacaaaggaacggaaggagta 25343922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 26854075 - 26854351
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  26854075 tactacattcgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagataatcaataattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 26854174  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||  || || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  26854175 actataatgaccttattcatttaatatc-catttcatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 26854273  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26854274 ttgaactttggaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacagagggagta 26854351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13703336 - 13703063
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattattttt-acttt 205  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  13703336 tactatctccgttcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaatcaagacaatcaataaatattactatttttgatacaattgttttttacttt 13703237  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| || | ||| || |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||    
T  13703236 tactataatagtcttattgatttaa-atttcacttcatatgtttctctctccgcaataaatatctaaaggtaatattggtaaaactacatttaatgttgc 13703138  T
Q  306 attgaactttgaaagtaaca--attaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  13703137 attgaactttgaaagcaacagtcttaaatagaaataaaaaatttctctaaaagtgacgattaaaaaggaacggag 13703063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3893044 - 3892791
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    |||||||  ||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  3893044 ctccgtttctttttaattgttattttttgacattttacacaaatcaagtcaatcaataatattattatttttgatacaattgtttttacttttactataa 3892945  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    || |||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  3892944 tgaccttattaatttaatattttattatatatgtttctctctccgcaataaatatttaagggtaatactggtaaaataacatttaacgttgcattgaact 3892845  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    || ||||| | | |||||||| |||||||  |||||  ||||||||| |||||||    
T  3892844 tt-aaagtgatagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacggttaaaa 3892791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4098573 - 4098296
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| ||| | || |||     
T  4098573 aattactatctccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaaaaattgatattacttttgatacaataagttatacc 4098474  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||  ||    
T  4098473 tttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataacaaaggataatattggcaaaacaacatttaatgtt 4098374  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    | | |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| | ||||||||||    
T  4098373 gtactgaactttaaaagtgacagttaaattgaaacaaaaattttctccaaaagtgatacttaaaaagaaacggaggga 4098296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18795022 - 18794745
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | |  ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  18795022 tactacctccgttcctttttaattttcacactttgacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatcatacttttgatgtaataagctatactttt 18794923  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  18794922 actataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 18794823  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  18794822 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaatggagggagta 18794745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7404084 - 7403816
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||| |||||||  ||| | || |||||||||||| |    
T  7404084 tccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacataaaccaagataatcaacaattgatactatttttgatgcaataaattatacttttactataa 7403985  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    || |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7403984 tgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatttctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatattgcattgaact 7403885  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| | | |||||||  |||||||  ||||  | ||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  7403884 ttgaaagtgagagttaaatatgaacaaaaaatttc--tcaaagtgacacttataaaggaacggagggagta 7403816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 386
Target Start/End: Original strand, 9127331 - 9127610
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| || ||||  |||||||||  ||| | || |||||||    
T  9127331 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaaaatagtcaatgattgttatcacttttgatgcaataagttgtactttt 9127430  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||| | |||||||  |||||    
T  9127431 actataatgaccttattcatttaatatcttattttatatatttctctctccgtaataaataattaaagataatattggtaaaataacatttaatgttgca 9127530  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| | ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9127531 ttgaactttaaaagtgacaattaaatacgaacaaaaaatttcatcaaaatagacacttaaaaaggaacggagggagtaca 9127610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 385
Target Start/End: Original strand, 10359230 - 10359493
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||||||| ||| ||||     
T  10359230 tttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaaaacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatacttttactatgatgacctta 10359329  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |    
T  10359330 ttcatttaatatatcatttcatatatttttttctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaaat 10359429  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||| || | ||||||| ||||||    
T  10359430 gacagttaaatagaaacaaaaattttctccaaaagttacagttataaagaaacggagagagtac 10359493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 38017257 - 38017492
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  38017257 tactaccttcgttcttttttaattgtcacattttaacattttacacaaacgaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagctatactttt 38017356  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  38017357 actataatgaccttattcatttaatatcacatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaagataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 38017456  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  38017457 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaa 38017492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38363428 - 38363153
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | |||||||    
T  38363428 tactaccttcgttcctttttaattgtcacaatttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactaattttgatgcaataaactatactttt 38363329  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  38363328 actataatgactttattcatttaatatctcatttcatatatttctctcttcgcaattaataactaagg--aatattggtaaaacaacatttaatgttgca 38363231  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| | ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  38363230 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtaacacttaaaaaggaacggatggagta 38363153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 368
Target Start/End: Original strand, 7735132 - 7735325
Alignment:
Q  176 tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggt 275  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  7735132 tactacttttgatacaattgtttttgcttttactataatagccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatataagga 7735231  T
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa-atttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  7735232 taatgttggtaaaacaacattgaattttgcattgaattttgacagtgacagttaaataaaaacaaatttttttctttaaaagtgacggttaaaa 7735325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38702380 - 38702103
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  38702380 tactatcttcgttcctttttaattgtcatattttaatattttacataaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 38702281  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  38702280 actataatgaccttatttatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaaggacaatattggtaaaacaacatttattgttgca 38702181  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38702180 ttgaacttcgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaattgacacttaaaaaggaacggagggagta 38702103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38910512 - 38910236
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  38910512 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 38910413  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | || || |||||||||  || || |||| ||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  38910412 actataatgactttattcatttaatatc-catttcatatatttatctctccataataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 38910314  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  38910313 ttgaactttaaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaagaacggagagagta 38910236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Original strand, 12637942 - 12638189
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| ||| |        
T  12637942 tttttaattgtcactttttaacattttacataaatcaagacaatcaataaatattactacttttgatacaattgtttttatctttactataatgac---- 12638037  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
       ||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  12638038 ---atttaatatttcatttcatatgtttctctttctgcaataaatatctaaaggtaattttgataaaacaacatttaatgttgcattgaactttaaaagt 12638134  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||    
T  12638135 aacaattaaatacgaacaaattttttctctaaaagtaacaattaaaaaggaacgg 12638189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 18437303 - 18437580
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||  ||| |||||||    
T  18437303 tactacctccgttcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaaccaatacaatcaataaatgttaccatttttgatacaatactttatactttt 18437402  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||| ||| ||| || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  || ||    
T  18437403 actataataaccttatttatttattatctcatttcatatatttctctctccataataaataactaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttaca 18437502  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||| ||||  |||| |||||| | ||| |||||||||    
T  18437503 ttggattttgaaagtgacacttaaattgaaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaagaaacagagggagta 18437580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40199027 - 40198750
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| | | ||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  40199027 tactatctccgttcttttttaattgttactttttgatattttacacagatcaagacaatcaacaattgttactacttttgatgcaataagttatactttt 40198928  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||| || ||| || || | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  40198927 actataatgaccttattcatttaacatctcatttcatttatttctctctccgcaataaataactacggataatattggtaaaacaacatttaatgttgta 40198828  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  ||||  |||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  40198827 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagtaacaaaaaatttctccaaaagagacacttaaaaaggaacagaggaagta 40198750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 333
Target Start/End: Original strand, 1087911 - 1088139
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | || ||    
T  1087911 attactacctccgtttctttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatattt 1088010  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| | | | || || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  1088011 ttactataacgactttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttg 1088110  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaata 333  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1088111 cattgaactttgaaagtgacagttaaata 1088139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6008125 - 6007845
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttc-gacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||    
T  6008125 ttactacctccgttcctttttaattgtcacttttttgatattttacacaaaccaatacaatcaataattgttactacttttgatacaatgatttatattt 6008026  T
Q  205 tta-ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||||||   || || |||| |||||||||| | |||| ||| |||| |  ||||||| ||||||| |||||||   |    
T  6008025 ttaactataatagccttattaatttaataccacatttcatatatttctctctctgtaatatataactaaagacaatattgataaaacaacatttaatgat 6007926  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  6007925 gcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggatggagta 6007845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 349
Target Start/End: Original strand, 6754158 - 6754401
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||  ||| |  | ||||||    
T  6754158 ttactacttccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgatcatacttttgatgcaataagctatacttt 6754257  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||| ||||||| |||||||  |||     
T  6754258 tactataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaaaatgatattgataaaacaacatttaatgttgt 6754357  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  6754358 attgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaacttttct 6754401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 493 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 18007253 - 18007065
Alignment:
Q  493 acttaaaaagttgggaactcaatctcagatccacat---ttgccatgggggaacacaggacagtcaatgaagtttgatccagaagtgtccacacacaaat 589  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  18007253 acttaaaaagatgggaactcaatcttagatccacatgctttgccttttgggaacacagggcagtcaatgaagtctgatccagaagtgtccacacacaagt 18007154  T
Q  590 aaacttgatatagttgactgttgccagatgagtccacattacattcaatgaatggagaaaatccaactgcattttgtatagctcctttg 678  Q
    |||||||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| ||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18007153 aaacttgataaagttggctgtttttggatgaatcaacattgcattcaatgtatggagtatacccaattgcattttgtatagctcctttg 18007065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 385
Target Start/End: Original strand, 19831560 - 19831798
Alignment:
Q  146 ttttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgata 244  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||    
T  19831560 ttttacacaaaccaagacaatcaataaatgttaatatttttgatacaataatttatatgtttactataatgaccttattcatttaatatctcatttaata 19831659  T
Q  245 tgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatt 344  Q
    |  |||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||      
T  19831660 t--ttctctttccacaataaatagttaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgagagttaaatagaaacaaaaaa 19831757  T
Q  345 tttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19831758 tttctctaaaaaagacacttaaaaaggaacagagggagtac 19831798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 28463365 - 28463642
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  ||||||| | || | ||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||||    
T  28463365 tactacctccgtttctttttaactatcgctttttgatattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatactttt 28463464  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||    
T  28463465 actataataaccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgca 28463564  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28463565 ttgaactttgaaagtgacagttaaataaaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 28463642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 347
Target Start/End: Original strand, 2673955 - 2674198
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||||||||  ||| |  | ||||    
T  2673955 aattactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagctatact 2674054  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| |||   || || ||||||||| | | || |||| ||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  2674055 tttactataatgattttattcatttaatatctaatttcatatatttctctcttcgcagtaaataactgaggataatattggtaaaacaacatttaatgtt 2674154  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||| |||||    
T  2674155 gcattgaactttgaaagtggcagttatatacaaacaaatttttt 2674198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 8229784 - 8230060
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||| | || |||||||    
T  8229784 tactaccttcgttcctttttaattgtcactttt-gacatcttacacaaattaagacaatcaataattgttaatacttttgatgcaataagttatactttt 8229882  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    |||||  || |||| || |||||| || ||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  8229883 actatagtgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctctccggaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 8229982  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||| || ||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||| | ||||||    
T  8229983 ttgaacttggaaaatgacagttaaataggaataaaaaatttcttcaaaatagacacttaaaaaggaacgaaaggagta 8230060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 28446965 - 28447241
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||| | || |||||||    
T  28446965 tactatctccgtttctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaagataatcaataattgttactatttttgatacaataagttatactttt 28447064  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| | ||||| | | ||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||||||  |||||    
T  28447065 actataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatatctcttttctcaataaata-ctaaggataatatttataaaataacatttaatgttgca 28447163  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    || |||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  28447164 tttaactttgaaagtgagagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 28447241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 1297717 - 1297995
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactactttt-gatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||   ||||| |||| |||  ||| |  | ||||||    
T  1297717 tactacctccattcctttttaattgttacattttgacattttatataaactaagacaatcaacaattaatactattttttgatgcaataagctatacttt 1297816  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  1297817 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctcttcgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaatatttaatgttgc 1297916  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  1297917 attgaattttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaagaacggagagagta 1297995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4017653 - 4017392
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||  ||||||||||  ||| | || | |||||    
T  4017653 tactacatccattcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaatcaagataatcaataattgtttttacttttgatgcaataagttattctttt 4017554  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  4017553 actataataaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctttccgcaataaataactaaggataatattggtaaatcaacatttaatattgca 4017454  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  4017453 ttgaactttaaaagtgacagttaaataagaacaaaaaatttcttcaaaagagacggttaaaa 4017392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7408573 - 7408340
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||   ||| ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  7408573 aattattaccttcgttcctttttaattgtcatcttttgacattttacacaaaccaaaacaatcaataaacattaatacttttgatacaataatttatact 7408474  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| |||||||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||||  |||||| |||    
T  7408473 tttactataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttttctctccataataaataagtaagagtaatattggtaaaacaatatttaatatt 7408374  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaa 337  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7408373 gctttgaactttgaaagtgacaattaaattgaaa 7408340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6689831 - 6689603
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |  | |||||||||||| |    
T  6689831 tccgttcctttttaattgttatttttttacattttacacaaatcaaaacaattaataattgttactatttttgatacaataagctatacttttactataa 6689732  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    ||  ||| || |||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  6689731 tgatcttattcatttaacatctcattttatatatttctctctccgcaataaataattaagaataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaact 6689632  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  6689631 ttgaaagtgacagataaacagaaacaaaa 6689603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 38502784 - 38503057
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| | | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  38502784 tactacctctgtttctttttaattgttacattttaacattttacacaaaccaaaatagtcaatgattgttactacttttgatgtaataagttgtactttt 38502883  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||     ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||    
T  38502884 actataatgacctc----atttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaatagttaaggataatattggtaaaataatatttaatgttgca 38502979  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  38502980 ttgaattttgaaagtgacagttaaatatgaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 38503057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 4427385 - 4427663
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt--tactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||  || ||||||||| | |||| |  | |||||||||||| ||| | || ||||||    
T  4427385 tactacctccgttcctttttaattgtcactttttgatattttacacgaatcaagacaatcagtaatttattgctacttttgatacaataagttatacttt 4427484  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||   | |||||| || ||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  || |    
T  4427485 tactataatgacctcactcatttaacatctcatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgtttc 4427584  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||  |||||  ||||   ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  4427585 attgaactttgaaagtgacagttgaatatgaacaaaaaatttctccaaaagaaacacttaaaaaggaacggagagagta 4427663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 38297595 - 38297874
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| ||||||    
T  38297595 ttactacctcagttcctttttaaccgtcactttttgacattttacacaaactaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatacttt 38297694  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| || |||||  | || |||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   ||||    
T  38297695 tactataatcgccttaatcatgtaatatcttatttcatatatttctctctccacaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgc 38297794  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaata-gaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38297795 attgaactttgaaagtgacagttaaatatgaacaaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 38297874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Original strand, 4688871 - 4689048
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||| | ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4688871 tacttttactttaatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttttctctctgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaa 4688970  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
      |||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  4688971 tgttgcattgaactttaaaagtgacagttaaatatgaacaaaatttttc-ttcaaaatgacacttaaaaaggaacggag 4689048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18465933 - 18465663
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || ||||||||||    
T  18465933 tacctccattcctttttaattatcatattttgatatttttcagaaaccaaaacaatcaacaattgatactacttttgatgtaataagttatacttttact 18465834  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||    ||||| |||||||    || || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  18465833 ataataattttgttcatttaat----catttcatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgcattg 18465738  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  18465737 aactttgaaagtggcagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggtgggagta 18465663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 339
Target Start/End: Original strand, 37303102 - 37303319
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  | |  || ||  ||||||||||||||  ||| | || || ||||||||| |||  |||     
T  37303102 tttttaattgtcatattttgacattttacataaactaaggtagtcgatgattattactacttttgatgtaataagttgtatttttactataatgatctta 37303201  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  37303202 ttcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtgaaacaacatttaatgttgtattgaattttgaaagt 37303301  T
Q  322 aacaattaaatagaaaca 339  Q
     ||| |||||||||||||    
T  37303302 gacagttaaatagaaaca 37303319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4694968 - 4694768
Alignment:
Q  143 acattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattg 241  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| |||||| | || ||||||||||  ||| | || |||||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||| ||     
T  4694968 acatttttcacaaaccaagataatcaataattgctaatacttttgatgtaataagttatacttttactataatgaccttgttcatttaacatctcatttc 4694869  T
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  4694868 atatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattagtaaaataacatctaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatatgaacaaa 4694769  T
Q  342 a 342  Q
    |    
T  4694768 a 4694768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24229180 - 24228960
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||  || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||| |    
T  24229180 tccgttcatttttaattgtctttttctgatattttacacaaaccaagacattcaataaatgttactacttttgatacaacaatatacacttttactataa 24229081  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    |  |||| || ||| ||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  24229080 taaccttattcattcaatatctaatttcatatatttctctctccgcaataaataagtaaagataatattgataaaacaacatttaatgttgcattgaact 24228981  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatag 334  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  24228980 tcgaaagtaacaattaaatag 24228960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 342
Target Start/End: Original strand, 4962179 - 4962402
Alignment:
Q  119 ttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggc 217  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||||||||  ||| | || |||||||||||| |||      
T  4962179 ttcttttttaattgtca--ttttgacattttacataaaccaagataatcaataaccgttatcacttttgatgcaataagttatacttttactataatgat 4962276  T
Q  218 cttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttga 317  Q
     || || |||||| || ||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  4962277 tttattcatttaacatctcatttcatatatttctttctccgcaataaataactaaagataatatttgtaaaacaacatttaatgttccattgaactttga 4962376  T
Q  318 aagtaacaattaaata-gaaacaaaa 342  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  4962377 aagtgacagttaaataggaaacaaaa 4962402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31802958 - 31802788
Alignment:
Q  176 tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggt 275  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  || ||| |||| |||||||||||| |   || ||||  || ||||||| ||||||||| ||||||     
T  31802958 tactacttttgatacaataatttatacttttatcataatgaccttattaatttaatatcttctttcatataattttctctccacaataaataactaaggg 31802859  T
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||    
T  31802858 taatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaaatgacagttaaattgaaacaaaatttt 31802788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 384
Target Start/End: Original strand, 5144066 - 5144255
Alignment:
Q  195 atttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatca 294  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||  |    
T  5144066 atttatacttttattataatagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaataattaagggtaatgttggtaaaacaaga 5144165  T
Q  295 tttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5144166 tttattgttgcattgaactttgaaagtgacacttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacaattaaaaaggaacggagggagta 5144255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 385
Target Start/End: Original strand, 32439917 - 32440170
Alignment:
Q  133 tcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaat 231  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||  |||||||| ||| || |||||  | |||||||    
T  32439917 tcactttttgacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataattagtacttttattataatagccttagtcatttaat 32440016  T
Q  232 atttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaa 331  Q
    || | | || || | |||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32440017 atcttatttcatgtatttctctctctgcaataaataactaaaggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaa 32440116  T
Q  332 tagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||| ||||||| ||||||   ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  32440117 taggaacaaaaattttctcctaaagtgacacttaaaaaggaacagagggagtac 32440170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 384
Target Start/End: Original strand, 21606275 - 21606515
Alignment:
Q  145 attttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgat 243  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||  || | ||| ||| |||| || ||||||||| ||  |||| || ||||||||||| | || ||    
T  21606275 attttacacaaactaagacacttaataaatattactttttcttatacaataatttatatttttactataatatccttattcatttaatattttatttcat 21606374  T
Q  244 atgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaat 343  Q
    || ||||| |||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  21606375 atatttctttctccgtaataaataattaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaa 21606474  T
Q  344 ttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  21606475 atttctccaaaagagacatttaaaaaggaacggagggagta 21606515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3244026 - 3243823
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatg 215  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||  |||| |||| ||     
T  3244026 cgttcatttttaattgtcattttttgacattttacataaatcaagacaattaataaatgttactattttttatacaataatttttgtttttcctataata 3243927  T
Q  216 gccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaacttt 315  Q
    ||||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||  ||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  3243926 gccttattcatttaatatctcattttatatatttttctctccacaataaataacaaaggacaaatttgataaaacaacatttaatattgcattgattttt 3243827  T
Q  316 gaaa 319  Q
    ||||    
T  3243826 gaaa 3243823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 384
Target Start/End: Original strand, 42394243 - 42394385
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  42394243 atatatttctctctccccaataaatacctaagggtaatgttcataaaacaacatttattgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaa 42394342  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |  |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42394343 aaatttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 42394385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 379
Target Start/End: Original strand, 25027844 - 25027976
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| | |||||||  ||    
T  25027844 tttctctctccgcaataaataactaagggtaatattgataaaacaacatttaaagttgcattgaactttgaaaatgacagttaaattggaacaaaaaatt 25027943  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    |||  |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  25027944 tctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagg 25027976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 384
Target Start/End: Original strand, 1795101 - 1795374
Alignment:
Q  112 acctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    |||||||||| |||||||  || || ||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||||||||    
T  1795101 acctccgttcctttttaacggttactttttgacattttacacaaatcaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatacttttacta 1795200  T
Q  211 ttatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga 310  Q
    | || || ||  | ||||||||| | | ||  ||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||    
T  1795201 taatagctttagtcatttaatatcttatttcgtatatttctctcttcgcaataaataaataagggtaatgttggtaaaacaacatttattgtaacattga 1795300  T
Q  311 actttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||| ||| ||||||   |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1795301 actttgaaagtgacagttaaatgagaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 1795374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5119411 - 5119182
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  | |||||| | |||  || ||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| | || ||||||||||||     
T  5119411 ctccgttcctttttaattgtcattttttaatattttatacaaattaatacaatcaataattgtttctacttttgatgcaataagttatacttttactata 5119312  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    ||  |||| ||||||||| || ||| || |||| ||| |||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||    
T  5119311 ataaccttattaatttaacatctcatttcatatatttttctctcagtaataaataacaaaggataatattggtaaaacaatatttaatgatgcattgaac 5119212  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  5119211 tttgaaagtggcagttaaatagaaacaaaa 5119182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 384
Target Start/End: Original strand, 9959010 - 9959134
Alignment:
Q  260 aataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatga 359  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| ||||  |||    
T  9959010 aataaataggtaaggataatattggtaaaacaacatttgatattgcattgaactttgaaagcgacggttaaatagaaacaaaaattttctctaaatgtga 9959109  T
Q  360 cagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||    
T  9959110 cacgtaaaaaggaacggagggagta 9959134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38160463 - 38160296
Alignment:
Q  173 tgttactacttttgatagaattattttt-acttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatcta 271  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||   ||| || |||||| |||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| ||    
T  38160463 tgttgctacttttgatacaattattttttaattttactataataatcttattgatttaa-atttcacttcatatgt--ctctctccgtaataaatattta 38160367  T
Q  272 aggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  38160366 aggataatattggtaaaactacatttaatgttgcattgaactttgaaagcgacagttaaataggaacaaaa 38160296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 425228 - 425090
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||    
T  425228 tttctctctccgcaataaataactaagagaaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttgaaaatgacagttaaacagaaacaaaaaatt 425129  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||  |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  425128 tctccaaaagtgacacttaaaaatgaacggagggagtac 425090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 237
Target Start/End: Original strand, 25027555 - 25027685
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  25027555 tactacatccgtttctttttaattgtcactttgtgacattttacataaactaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaataattgatactttt 25027654  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttca 237  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  25027655 actataatatccttattcatttaatatttca 25027685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22582710 - 22582519
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||| |    
T  22582710 tactacctccgttcctttttaata-tcacattttgacattttatacaaatcaagacaatcaacaatttatactacttttgatgcaataaactatacttgt 22582612  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||    
T  22582611 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttttctctccgcaataaataactaagaataatattgataaaataacatttaa 22582519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 382
Target Start/End: Original strand, 10889244 - 10889349
Alignment:
Q  277 aatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||    
T  10889244 aatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttaaaaatgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacgg 10889343  T
Q  377 agggag 382  Q
    ||||||    
T  10889344 agggag 10889349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13461240 - 13461016
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatg 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| || ||||| ||| ||     
T  13461240 cgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaatacactcaataaatgttactttttgttatacaataatttatatttttattataata 13461141  T
Q  216 gccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaacttt 315  Q
      ||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||||||| ||||||   ||||||| ||| ||    
T  13461140 atctttttcatttaatatcttattttatatatttctctctccacaataaataattaagagtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattcaacatt 13461041  T
Q  316 gaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||    
T  13461040 aaaagtgacagttaaatagaaacaa 13461016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26906724 - 26906495
Alignment:
Q  113 cctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactat 211  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| |||| | ||||| | ||    
T  26906724 cctctgttcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaaccaaaacattcaataaatcttactacttttgatacaataatttatccttttccaat 26906625  T
Q  212 tatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaa-catcatttaacattgcattga 310  Q
     ||  | |  || ||||||||| |   || |||| |||||||||  | |||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||   ||||||||    
T  26906624 aataacatcattcatttaatatcttgtttcatatatttctctct--gtaataaataactaagggtgatattggtaaaaacaacatttaatgctgcattga 26906527  T
Q  311 actttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26906526 actttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 26906495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 38297875 - 38298007
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||| ||| ||  |||| ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38297875 tacttttagtataataaccttattaatttaacatatcatttcatatatttctctctccgcaataaataacaaaggataatattggtaaaacaacatttaa 38297974  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatag 334  Q
       |||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  38297975 tgatgcat--aactttgaaagtgacagttaaatag 38298007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Original strand, 30368115 - 30368241
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  30368115 tactacctcatttattttttaattgttacattttaacattttacacaaactaagacaatcaataaatgttactatttttgatataataatttttattttt 30368214  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatat 233  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  30368215 actataataaccttatttatttaatat 30368241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21157696 - 21157600
Alignment:
Q  283 ggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  21157696 ggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaattttatgcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagg 21157600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 10889163 - 10889226
Alignment:
Q  103 agaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat 166  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10889163 agaagtactacctccgtttctttttaattgtcacattttaacattttacataaaccaagacaat 10889226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 38308106 - 38308341
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||  |||| ||| ||| |||  |||||||    
T  38308106 tactacctccgttcctttttaacggtcactttttgacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttacttttttttatacaataattcatactttt 38308205  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || |||||  | ||||||||| | | || || | | |||||||   ||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||  ||| ||    
T  38308206 actataatagccttagtcatttaatatcttatttcatgtatgtctctctttacaatatataactaagggtaatgttgataaaacaacatttattattaca 38308305  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
     |||| ||||||||| | | ||||| || |||||||    
T  38308306 atgaattttgaaagtgatagttaaacaggaacaaaa 38308341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Original strand, 40209088 - 40209183
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  40209088 tttctctatccacaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaattttgaaagtgacagttaaataggaacaaaa 40209183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40927274 - 40927115
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    |||||||| |||| || |||| || ||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||   | ||||||| |||||||   ||    
T  40927274 atttaatacttcattttatatattgctctctctgcaataaatatataagagtaatataggtaaaaccacatttaatgatacattgaattttgaaaacgac 40927175  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  40927174 aattaattagaaacaaaatttttatgcaaaagtgacaattataaaggaacggatggagta 40927115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3686929 - 3686803
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||| || ||||    
T  3686929 tactacctccatttatttttaattatcacattttgacgttttatataaaccaaaacaatcaataaatgttgctacttttgatacaataatttctattttt 3686830  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatat 233  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  3686829 actataataaccttatttatttaatat 3686803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21150555 - 21150459
Alignment:
Q  283 ggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||| |  |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  21150555 ggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaatttatgcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagg 21150459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25786028 - 25785869
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||||||||||  |||||||||   |||| ||||| ||  |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  25786028 atttaatatctcatttcatatatttctctctctacaataaataatcaagggtaataatgccaaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgac 25785929  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||| ||||||| |||  |||||  | || ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  25785928 agttaattagaaactaaaaatttctgcagaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 25785869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 164
Target Start/End: Original strand, 13957150 - 13957196
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13957150 gttcttttttaattgtcacattttgactttttacataaaccaagaca 13957196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 31546000 - 31546082
Alignment:
Q  129 attgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||    
T  31546000 attgtcaccttttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatacttttacta 31546082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 384
Target Start/End: Original strand, 31985049 - 31985307
Alignment:
Q  127 taattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaa 225  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| ||| |||| || ||||||||  || | ||| || |    
T  31985049 taattatcactttttgacattttacataaatcaagacaatcaataaatgtcattacttttaatataataatttatatttttactagaatagtcttattca 31985148  T
Q  226 tttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaaca 325  Q
    |||||| | ||  || |||| ||||| | | |   |||||||  ||||| |||||| ||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  31985149 tttaatgtctcgttttatatatttctttgttcaagataaataattaagggtaatatcggtaaaataacttttaatgttgcattgaactttgaaagtgaca 31985248  T
Q  326 attaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     || |||| ||||||||  |||||    ||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  31985249 gttgaatataaacaaaaaatttctccgcaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 31985307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 546 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 18029769 - 18029704
Alignment:
Q  546 aggacagtcaatgaagtttgatccagaagtgtccacacacaaataaacttgatatagttgactgtt 611  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  18029769 aggacactcaatgaaatttgacccagaagtgtccacacacatgtaaacttgataaagttggctgtt 18029704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 386
Target Start/End: Original strand, 18676536 - 18676672
Alignment:
Q  248 ttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    |||||||||  |||||||||   |||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||  |||    
T  18676536 ttctctctctacaataaataatcaaggataataaaggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgaca--taattaaaaacaaaaaattt 18676633  T
Q  348 ctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
     |  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  18676634 atgcaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggaagtaca 18676672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 38297511 - 38297586
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  38297511 ctccgttcctttttaattgtcactttttaacattttacacaaaacaagacaatcaataattgtttctacttttgat 38297586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 177
Target Start/End: Original strand, 4688816 - 4688870
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgtta 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  4688816 tttttaattgtcacattttgacattttccataaatcaagacaatcaataaagtta 4688870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 384
Target Start/End: Original strand, 13957319 - 13957417
Alignment:
Q  286 aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||   |||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  13957319 aaaacaacatttaatgttacattgaactttgagagtgacagttaattggaaacaaaaaaattctgtaaaagtgacagttataaaggaacggagggagta 13957417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6331045 - 6330956
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactat 211  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  6331045 tttttaattatctctttttgacattttacataaacttagacaatcaataaatattactacttttgataaaataatttatatttttactat 6330956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Original strand, 9958863 - 9958967
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||| ||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||    
T  9958863 tactaccttcgttcatttttaattgtcattttttgacaatttacacaaatcaatacattcaataaatgtcactacttttgatacaataatttacactttt 9958962  T
Q  207 actat 211  Q
    |||||    
T  9958963 actat 9958967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31803172 - 31803112
Alignment:
Q  112 acctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  31803172 acctccgttcctttttaattgtcaccttttgatattttacacataccaagacaataaataa 31803112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 18392956 - 18393186
Alignment:
Q  113 cctccgttcttttttaattgtcacatttcgacatttt-acataaaccaagacaattaataatgtt-actacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||  ||  |||  |  |||| |||    
T  18392956 cctccgttcctttttaattgtcactttt-gagatttttacataaaccaagacaacaaatactttttactacttttgatgcaacaattcatctttttccta 18393054  T
Q  211 ttatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga 310  Q
    | ||  ||||  | ||||||||| ||| || || |  |||||||||  |||||||||   |||| |||||  || |||||| |||||||  ||| |||||    
T  18393055 taataaccttcatcatttaatatctcatttcatttacttctctctctacaataaataatcaagggtaataaaggcaaaacaacatttaatgttgtattga 18393154  T
Q  311 actttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  18393155 actttgaaagtgacagttaattagaaacaaaa 18393186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 384
Target Start/End: Original strand, 30368257 - 30368372
Alignment:
Q  270 taaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||| || || ||||| ||| |||||||  |||||||   ||||||||||  |||| ||||||    
T  30368257 taagggtaatattagtaaaataacatttaatgttgcattgatctatgtaaagtgacacttaaataagaacaaaaaaattctttaaaagagacacttaaaa 30368356  T
Q  369 tggaacggagggagta 384  Q
     |||||||||||||||    
T  30368357 aggaacggagggagta 30368372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3686492 - 3686356
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaattt 345  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||       
T  3686492 tttctctctccacaataa-taaataagggtaatattagtaaaataacatttaatgttgcattgaactatgtaaagtgacacttaaataggaacaaaa-aa 3686395  T
Q  346 ttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3686394 atctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 3686356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 211
Target Start/End: Original strand, 10734154 - 10734243
Alignment:
Q  122 ttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactat 211  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||    
T  10734154 ttttttaattgtcactttttg-cattttacttaaaccaagataataagtaaatgttactacttttgagataataatttataattttactat 10734243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 172
Target Start/End: Original strand, 7734764 - 7734828
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa 172  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  |||  | |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7734764 tactacatccgttcctttttaattgtcattttttcaaattttacataaatcaagacaatcaataa 7734828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Original strand, 8849115 - 8849199
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgata 189  Q
    |||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| || |||||  |||| | |||||||||||||||    
T  8849115 aattactctctctgttcctttttaattgtctcattttgactttttacacaaatcatgacaacaaatacttttactacttttgata 8849199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 101)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 32168290 - 32168569
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  32168290 attactacctccgttcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaaccaagacaatcaataaatggtactacttttgatacaattgttattactt 32168389  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||   ||    
T  32168390 ttactataatgaccttgttaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattgataaaacaacatttaatgatg 32168489  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32168490 cattgaactttgaaactgacagttaaatagaaacaaaaattttctctaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 32168569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51613670 - 51613391
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  51613670 attactacctccgttcctttttaattgtcacttttttatattttacacaaaccaagacaatcaataaatgatactacttttgatacaattgttattactt 51613571  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||   ||    
T  51613570 ttactataatgaccttgttaatttaatatttcatttcatatgtttctctatccgcaataaatatctaagagtaatattgataaaacaacatttaatgatg 51613471  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  51613470 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctctaaaagtgacaattaaaaaggaatggagggagta 51613391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 37735119 - 37735396
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||  | |||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  37735119 tactacctccgttcctttttaattatcactttttcaaattttacgcaaaccaagacaatcaataaatgatactacttttgatacaattgtttttgatttt 37735218  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||  |||||    
T  37735219 actataatagccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatataagggtaatgttggtaaaacaatatttaattttgca 37735318  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37735319 ttgaactttgacagtgacagttaaataggaacaaattttttctttaaaagtgacagttaaaaaggaacggagagagta 37735396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12721697 - 12721436
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  12721697 tactacctctgttcctttttaattgtcactttttaacattttacataaaccaagacaataaataaatattactacttttgatacaattgtttttaccttt 12721598  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  12721597 actataatgaccttattaatttaatattttatttcatatgtttctctctctgcaataaatatctaagggaaatcttggtaaaacaacatttaatgttgca 12721498  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||||| | | | |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12721497 ttgaactttgaaaatgatagttaaataggaacaatttttttctctaaaagtgacaattaaaa 12721436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 35531275 - 35531552
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  35531275 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 35531374  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||| ||||   | || |||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  35531375 actataatgaccttattcatttgatatcctatttcatatatttatctctctgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 35531474  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35531475 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 35531552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43500763 - 43500496
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  43500763 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 43500664  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  43500663 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatactgca 43500564  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaac 374  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  43500563 ttgaactttaaaagtgacacttaaataggaacaaatattttctccaaaaatgacacttaaaaaggaac 43500496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30686668 - 30686391
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  30686668 tactacctccgttcctttttaattgtcacgttttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 30686569  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  30686568 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 30686469  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  30686468 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacatagggagta 30686391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 31588720 - 31588996
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||| || |||   |||||||||||||| ||| |  | |||||||    
T  31588720 tactacctacgttcttttttaattgtcacattttagcattttacacaaaccaagataatcaaaaattaatactacttttgatacaataagctatactttt 31588819  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||| ||| ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||    
T  31588820 actatgatgaccttattcattta-tatctcatttcatatatttatctcttcgcaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttaatgttgca 31588918  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31588919 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaattttctctaaaaatgacacttaaaaaggaacggagggagta 31588996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 37609284 - 37609558
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||  |  ||||||||||  ||| |  | ||||||||    
T  37609284 tactatctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaatcaagacaatcaacaat--tgatacttttgatgcaataagctatactttta 37609381  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37609382 ctataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaacgttgcat 37609481  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||  ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  37609482 tgaactttgaaaatgacagttaaataagaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagagagta 37609558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13566938 - 13566656
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | || ||    
T  13566938 attactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatattt 13566839  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatc---taaggttaatattggtaaaacatcatttaaca 301  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||| |||||||      
T  13566838 ttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataataattaaggacaatattggtaaaacaacatttaatg 13566739  T
Q  302 ttgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13566738 ttgcattgaactttgaaagtgacggttaaataaaaataaaatttttctcaaaaaatgacacttaaaaaggaacggagggagta 13566656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 21927676 - 21927953
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||    
T  21927676 attactacatccgttcctttttaattgtcacatt--gacattttacacaaactaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactt 21927773  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||    
T  21927774 ttactataatgaccttattcatttaatatttcattttatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttaatgttg 21927873  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21927874 cattgaactttgaaagtgacagttaaataagaacaaaaaatttctgcaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 21927953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 42800363 - 42800091
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattattttt-acttt 205  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  42800363 tactaccttcattcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaaaacaatcaataaatgttactactcttgatacaattgttttttacttt 42800264  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||  ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  42800263 tactaaaatggcattattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctc--caataaatatataaggataatattggtaaaacaacatttaatattac 42800166  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||  |||||||||| |||||| | |||| |||||    
T  42800165 attgaa-tttgaaagtaacagttaaatataaacaaatcttttctcaaaaaatgacaattaaaaagaaacgaaggga 42800091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 50825553 - 50825829
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| || | || |||||||||||||  ||| | || ||||||||    
T  50825553 tactacctccgtttttttttaattgtcactttttgacatttttcacaaaccaagacaatcaacattgctactacttttgatgcaataagttatactttta 50825652  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  50825653 ctataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatattgcat 50825752  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  50825753 taaactttgaaagtgacagttaagtaagaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 50825829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28679263 - 28679000
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||||||| ||| ||||     
T  28679263 tttttaattatcacattttgacattttatataaattaagacaattaacaatttatactacttttgatgcaataaattatacttttactataatgacctta 28679164  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28679163 ttcatttaatatctcatttgatatatttctctctccgcaataaataactaaagacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagt 28679064  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
     ||| ||||| |  ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28679063 gacagttaaacaagaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagtac 28679000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 342
Target Start/End: Original strand, 4100886 - 4101124
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  4100886 aattactacctccgttcctttttaattattactttttgatattttacacaaactaagacaatcaataaatgttattacttttgatacaattgtttttact 4100985  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||   |    
T  4100986 tttactataatgatcttattaatttaatatttcatttcatatgtttttctctccgcaataaatatataagggtaatattggtaaaacaacatttaatgct 4101085  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
     ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  4101086 acattgaactttaaaagtgacagttaaataggaacaaaa 4101124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13508028 - 13507750
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||  ||| |  | ||||||    
T  13508028 ttactacctccgttcctttttaattatcacattttgacattttacataaatcaagacaatcaataattgatactactttggatgcaataagctatacttt 13507929  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  || |    
T  13507928 tactataatgactttattaatttaatatctcatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttac 13507829  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  13507828 attgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacttagggagta 13507750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13515216 - 13514938
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||  ||| |  | ||||||    
T  13515216 ttactacctccgttcctttttaattatcacattttgacattttacataaatcaagacaatcaataattgatactactttggatgcaataagctatacttt 13515117  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  || |    
T  13515116 tactataatgactttattaatttaatatctcatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttac 13515017  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  13515016 attgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacttagggagta 13514938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45368345 - 45368068
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  45368345 tactacctcagttcttttttaattgtcgcattttgacattttacacaaaccaaaacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 45368246  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||  || ||    
T  45368245 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacattcaatgtttca 45368146  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||   |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  45368145 ttgaactttgaaagtgacagataaatagaaacaaaaattttccccaaaagtgacatttaaaaaggaaaggagggagta 45368068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 379
Target Start/End: Original strand, 48174656 - 48174924
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| |  |||||||||||    
T  48174656 tacctccgttcctttttaattatcactttttgatattttacacaaatcaagacaatcaataaatgatacta-ttttgatacaattgtaattacttttact 48174754  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||||||  |||||||    
T  48174755 ataatgaccttgttaatttaacatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatttaagggtaatattcataaaagagcatttaactatgcattg 48174854  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  48174855 aactttaaaagtgacagttaaataaaaacaaaaaatttctctaaaaataacaattaaaaaggaacggagg 48174924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32348234 - 32347963
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||  ||  |||||||    
T  32348234 tactacctccgttcctttttaattgtcactttt-gacattttacacaaaccaatacaatcaataaatattactacttttgatacaatacttcatactttt 32348136  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||  ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  32348135 actagaataaccttattcatttaatatctcattttatatatttctttctccacaataaataactaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 32348036  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    |||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  32348035 ttgaactttgaaagtggcagttaaattgaaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagg 32347963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 32994450 - 32994730
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  32994450 tactacctccgttcttttt-aattgtctttttttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattattactacttttgatgcaataagttgtactttt 32994548  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  32994549 actataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 32994648  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaaca--aaatt--tttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||  |||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  32994649 ttgaactttgaaagtgacagttaaataagaacaacaaattaatttctttaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 32994730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13699431 - 13699154
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  13699431 tactatctccgttcctttttaattgccatattttgacattttacataaaccaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttatactttt 13699332  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||  |||||    
T  13699331 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggatagtattcgtaaaacaacatttaatgttgca 13699232  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| || ||||  |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  13699231 ttgaactttgaaagtaacagttaaatagaaataaaaaatttattcaaaagcgacacttaaaaaggaacggatggagta 13699154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38648714 - 38648437
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | |||||||    
T  38648714 tactacctccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataagctatactttt 38648615  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||| |||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  38648614 actataatgaccttattcatttgatatctcatttcatatatttctttctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 38648515  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  38648514 ttgaagtttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctcaaaaagtgacatttaaaaaggaatggaggaagta 38648437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 381
Target Start/End: Original strand, 19349357 - 19349633
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||    
T  19349357 attactaccactgttcctttttaattgtcacattctgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactt 19349456  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  19349457 ttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttg 19349556  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  19349557 cattcaactttgaaagtgactgttaaataggaacaaaatttttctccgaaagtgacatttaaaaaggaacggaggga 19349633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 377
Target Start/End: Original strand, 35483760 - 35484029
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| | || || |||||||  ||| |  | ||||||    
T  35483760 ttactacctccgttcttttttaattgtcatattttgacattttacacaaaccaaaacaatcaacaattgatattatttttgatgcaataagctatacttt 35483859  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  35483860 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctct--gcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatattac 35483957  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||  |||||||    
T  35483958 attgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaaatgacacttaaaaatgaacgga 35484029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1024815 - 1024536
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||    
T  1024815 attactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaaaacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatactt 1024716  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||  ||     
T  1024715 ttactataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaacgacaatattggtaaaacaacatttaatgtta 1024616  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||| || |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  1024615 cattgaactttgaaagtaacagttaaataaaaataattttttttttcaaaagtgacacttaaaaaggaacggaaggagta 1024536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35255728 - 35255473
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  ||| | || | |||||||||| ||| |||||    
T  35255728 tttttaattgtcactttttgacattttacataaaccaagacaatcaataattgtttttacttttgatgcaataagttatgcttttactataatgaccttg 35255629  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || |||||| || ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35255628 ttcatttaacatctcatttcatatatttatctcttcgcaataaataactaaggataatattggtaaatcaacatttaatgttgcattgaactttgaaagt 35255529  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||    
T  35255528 gacaattaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacgga 35255473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 35700353 - 35700632
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  || |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  35700353 attactacctccgttcctttttaattgtcattttgtgatattttacacaaatcaagacaatcaataaatgttactacttttgatataataattgatactt 35700452  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  35700453 ttactataatagccttattcatttaatatctcatttcatatatttctttctccgcaataaataactaagggtaatattgataaaacaacatttaaagttg 35700552  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||  ||||| |  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  35700553 cattgaattttgaaagtgacagttaaattggaacaatttttttttccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggagta 35700632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10676159 - 10675882
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | | ||| || |||| ||||||||||  ||| | || |||||||    
T  10676159 tactacctctgttcctttttaattatcacattttgacattttacataaatcaatatagtcaatgattgttattacttttgatgcaataagttgtactttt 10676060  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  10676059 actataataaccttatttatttaatatctcattttatatatttctctctccgcaataaataacttaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 10675960  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  10675959 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaagaacggagggagta 10675882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43809155 - 43808894
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  43809155 ctccgttcctttttaattgtcactttttaacattttacataaattaagacaatcaataagtgttactgcttttgatacaattatttttacttttactata 43809056  T
Q  213 atggccttgttaatttaata-----tttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggt-aaaacatcatttaacattgca 306  Q
    || ||||| |||||||||||     ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||| |    
T  43809055 atagccttattaatttaatacagtatttcatttcatatgtttctctctctgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaaacaacatttaatgttgta 43808956  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| ||||||    
T  43808955 ttgaactttgaaagtgatggttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacaattaaaa 43808894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 387
Target Start/End: Original strand, 20605604 - 20605884
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  20605604 tactacctccattcatttttaattgtcatattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 20605703  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  20605704 attataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataaccaatgataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 20605803  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtacat 387  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||   |||||||| |||||||    
T  20605804 ttgaagtttgaaagtgacagtttaataagaacaaaatttttctccaaaaatgacacttaaaaaaaaacggaggaagtacat 20605884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44183009 - 44182740
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| || ||| | || |||||| |||| ||| |  | ||||||||||||     
T  44183009 ctccgttcctttttaattgtcacattttagcattttacacaaaccaagacaatcaaaaattgatattacttt-gatataataagatatacttttactata 44182911  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    ||| |||| || ||||| ||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  44182910 atgaccttatttattta-tatctcatttcatatatttatctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaac 44182812  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44182811 tttgagagtgacagttaaatagaaacaaattttttctccaaaattgacacttaaaaaggaacggagggagta 44182740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Original strand, 49908174 - 49908439
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattat---ttttacttttactattatggcc 218  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||| |||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |    || || ||||||||| ||| ||    
T  49908174 tttttaattatcacattttgacattttatacgaactaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactattatatttttactataatgacc 49908273  T
Q  219 ttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaa 318  Q
    || ||||||  |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||    
T  49908274 ttattaattcgatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgcattgaactttaaa 49908373  T
Q  319 agtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  49908374 agtgacagttaaatagaaacaaaatttttctttaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 49908439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 385
Target Start/End: Original strand, 51974154 - 51974429
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  51974154 tacctccgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacgaaccaaaacattcaataaatattactacttttgatacaataatgtatacttttact 51974253  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||  |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  51974254 ataataaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctcttcacaataaataagcaaggataatattggtaaaacaatatttaatattgcattg 51974353  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51974354 aacttcgaaaatgacagttaaatggaaacaatttttttttaaaaaaatgacacttaaaaaggaacggagggagtac 51974429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Original strand, 19929449 - 19929723
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| | || ||||||||||    
T  19929449 tacctccgttcctttttaattgtcattttttaacattttacacaaaccaagacaatcaataattgtttctacttttgatgcaataagttatacttttact 19929548  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  19929549 ataatgaccttattaatttaacatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataacaaagaataatattggtaaaacaacatttaatgatgcattg 19929648  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||  |||||  ||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  19929649 aactttgaaagtgacggttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagagacacttaaaaagaaacggagggagta 19929723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1429541 - 1429264
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat-taataatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  1429541 tactaccttcgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaactaagacaatctacaaatgatactacttttgatgcaataagctatactttt 1429442  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  1429441 actataatgaccttattcatttaatatctcattttgtatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 1429342  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  1429341 atgaactttaaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttagaaaagaacggagggagta 1429264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 384
Target Start/End: Original strand, 19455414 - 19455655
Alignment:
Q  142 gacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattg 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||  || | ||| || ||||||||||    ||     
T  19455414 gacattttacacaaaccaagacaatcaataatgttactacttttgatacaataatttatacctttactaaaatagtcttattcatttaatattatgtttc 19455513  T
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19455514 atagatttctctctccgcaataaataattaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacaattaaattgaaacaaa 19455613  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |  |||||  |||| ||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  19455614 a-atttctccaaaagtgacacttataaaggaacagagggagta 19455655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 342
Target Start/End: Original strand, 37437031 - 37437268
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||  ||| |  | |||||    
T  37437031 attactacctctgttcctttttaattgtcatattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgataccacttttgatgcaataagctatactt 37437130  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| | ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  37437131 ttactataatgaccttattcatttaatatctcatttaatatatttttatctccgcaataaataactaagaacaatattggtaaaacaacatttaatgttg 37437230  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  37437231 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaa 37437268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 1039417 - 1039624
Alignment:
Q  176 tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggt 275  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||      
T  1039417 tactacttttgatacaattgtttttacctttactataatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttttctctt-gcaataaatatctaagtg 1039515  T
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||    
T  1039516 taatcttggtaaaacaacatttaatgttgcattaaactttgaaagtgacagttaaataagaacaaattttttctctaaaggtgacaattaaaaaggaacg 1039615  T
Q  376 gagggagta 384  Q
    |||||||||    
T  1039616 gagggagta 1039624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 1046323 - 1046530
Alignment:
Q  176 tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggt 275  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||      
T  1046323 tactacttttgatacaattgtttttacctttactataatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttttctctt-gcaataaatatctaagtg 1046421  T
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||    
T  1046422 taatcttggtaaaacaacatttaatgttgcattaaactttgaaagtgacagttaaataagaacaaattttttctctaaaggtgacaattaaaaaggaacg 1046521  T
Q  376 gagggagta 384  Q
    |||||||||    
T  1046522 gagggagta 1046530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 40926733 - 40927000
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  40926733 tactacctccgttcttttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaatacaatcaataattgttactacttttgatacaataagttatactttt 40926832  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| | | ||||         |||||||  || |||| ||||||||||||| |||||||  ||||  |||||||| ||||||||| ||||   |||||    
T  40926833 actataacgacctt---------atatttcgtttcatatatttctctctccgccataaata-ataagagtaatattgataaaacatcgtttattgttgca 40926922  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||  ||||  |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  40926923 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaggaacagagggagta 40927000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 380
Target Start/End: Original strand, 52649713 - 52649982
Alignment:
Q  112 acctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || | | ||||| | |    
T  52649713 acctccgttcctttttaattgtcactttttgacatttttcactaatcaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaataatatatccttttccaa 52649812  T
Q  211 ttatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga 310  Q
    | || ||||  || ||||||||| |   || |||| |||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  52649813 taatagcctcattcatttaatatcttgtttcatatatttcactctctgtaataaataactaagggtaatattggtaaaacaacatttaatattgctttga 52649912  T
Q  311 actttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggg 380  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  52649913 actttgaaagtgataattaaatataaacaaaacttttctatgaaaaggacatttaaaaaggaacggaggg 52649982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9362227 - 9361952
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| | ||||| | |||||  || | ||| ||| |||| ||||||||||    
T  9362227 tacctccgttcctttttaactgtcactttttgacattttatacaaatcaagacactcaataaattttactttttcttatacaataatttatacttttact 9362128  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  9362127 ataataaccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctcttcgtaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattg 9362028  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9362027 aactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaaatgacacttaaaaaggaacggagggagtac 9361952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1038269 - 1038071
Alignment:
Q  179 tacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaa 278  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||   || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  1038269 tacttttgaaacaattgtttttacttttattataatgattttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgtaataaatattcaaggataa 1038170  T
Q  279 tattggt-aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  1038169 tattggtaaaaacaacatttaatattgcattaaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaattttttctctaaaagtgacaattaaaaaggaacgg 1038071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1045175 - 1044977
Alignment:
Q  179 tacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaa 278  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||   || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  1045175 tacttttgaaacaattgtttttacttttattataatgattttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgtaataaatattcaaggataa 1045076  T
Q  279 tattggt-aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  1045075 tattggtaaaaacaacatttaatattgcattaaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaattttttctctaaaagtgacaattaaaaaggaacgg 1044977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18344583 - 18344306
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||| | |||| |||||||||| |||  ||| |||||||    
T  18344583 tactacctccgttcatttttaattgtcactttttaacattttacacaaatcaatataattaataaatattaccacttttgatacaatactttatactttt 18344484  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| ||  |||| ||| ||| || |||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  || ||    
T  18344483 actataataaccttatttgtttattatctcatttcatatatttctctctgcacaataaataactaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttaca 18344384  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||| ||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  18344383 ttgaattttaaaattgacacttaaattgaaacaaaaattttcgttaaaagagacacttaaaaagaaacggagggagta 18344306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Original strand, 12231051 - 12231243
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  12231051 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctgtactttt 12231150  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||  || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  12231151 actataatgaccttattcatttaatatcccatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaa 12231243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15660829 - 15660567
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||| | |||| ||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |  || | ||| ||| |||| |||||||||||| || | |||     
T  15660829 tttttaactatcactttttgatattttacacaaaccaagacactcaataaatgttattttttcttatacaataatttatacttttactataatagtctta 15660730  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
     | ||||||||||| | || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15660729 gtcatttaatattttatttcatatatttctctctccgtaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttgaaagt 15660630  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  15660629 gacagttaaataggaacaaaatatttctccaaaaatgacacttaaaaaggaacggagagagta 15660567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7783197 - 7782942
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||  |||||  | |||||||||||| |||     
T  7783197 gttcctttttaattgtcacattttgacattttatacaaaccaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaattaactatacttttactataatga 7783098  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
    |||| || |||||| |||| | || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  7783097 ccttattcatttaacattt-atttcatatatttctctctccacaataaataactaagaacaatattgataaaacaacatctaatgttgcattgaactttg 7782999  T
Q  317 aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaa 373  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||||    
T  7782998 aaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaa 7782942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9127916 - 9127689
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| ||      
T  9127916 gttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaagacattcaataaatgttactacttttgatacaataatatatacttttactataataa 9127817  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtt--tctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactt 314  Q
    |||| || ||||||||||||| || |||| ||  ||||||||| ||||||||    |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9127816 ccttattcatttaatatttcacttcatatatttctctctctccacaataaatgagcaaggataatactggaaaaacaacatttaatattgcattgaactt 9127717  T
Q  315 tgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
     |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  9127716 cgaaagtgacaattaaataaacacaaaa 9127689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29831010 - 29830828
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  29831010 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgatattacttttgatgcaataagctatactttt 29830911  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaa 289  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  29830910 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaccaatattggtaaaa 29830828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1677456 - 1677263
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||||| ||  ||| |  | ||||||    
T  1677456 ttactacctccgctcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaatcaataattgatactacttttaatgcaataagctatacttt 1677357  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||||||  || |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1677356 tactatattgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataattaaggataatattggtaaaacaacatttaa 1677263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 379
Target Start/End: Original strand, 45226572 - 45226829
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||| ||| ||| | ||     
T  45226572 tttttaattgtcacattttgacattttatacaaattaagacaatcaacaattgatactacttttgatgtaataagctatacttttattataatgacttta 45226671  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45226672 ttcatttaatatctcatttcatatatttctctttccacaataaataactaaggacaatattgataaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagt 45226771  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
     ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45226772 gacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagg 45226829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 384
Target Start/End: Original strand, 51972253 - 51972538
Alignment:
Q  100 aaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattattt 198  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||||||| |||| | |||||||||||||||  ||| | ||    
T  51972253 aaaaaaattactacctctgttattttttaattgttactttttgacattttacacaaattaagacaatcaatagttgttactacttttgatgcaataagtt 51972352  T
Q  199 ttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcattta 298  Q
     |||||||||||| |||   || || ||||||||| ||| || |||| ||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| |  ||||     
T  51972353 atacttttactataatgatattattcatttaatatctcatttcatatatttatctctctgcaataaatagctaatgataatattggtaaaataatatttc 51972452  T
Q  299 acattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||| | ||||||    
T  51972453 atgttgcattgaattttgaaagtgacaattaaataagaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacgtatggagta 51972538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Original strand, 30702285 - 30702505
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||  | ||     
T  30702285 tttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaatacaatcaataaatgttaccacttttgatacaatattttatacttttactataataacatta 30702384  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||| ||| ||| || |||| ||| | ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30702385 tttatttattatctcattttatatatttttttctctacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaacgttgcattgaactttgaaagt 30702484  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
     | | ||||||  ||||||||    
T  30702485 gagatttaaattaaaacaaaa 30702505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36318611 - 36318333
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||  || |    
T  36318611 attactacctccgttcctttttaattgtcactttttgacaatttacacaaaccaatacattcaataaatgtcactacttttgatacaataatttacacct 36318512  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||  |||| ||  |||||| | ||| || |||  ||| |||||  | ||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  36318511 ttactataataaccttatttgtttaatgtgtcatttcataatttt-tctctttgtaataaataaataaggataatattgataaaacaacatttaatgttg 36318413  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  36318412 cattgaactttgaaagcgacagttaaatagaaacaaaaaatttatctaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggaagta 36318333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 18033806 - 18034083
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| || ||| | ||||  |||||||  ||| |  | || ||||    
T  18033806 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttt-cattttacgcaaaccaagacaatcaacaattgatactcattttgatgcaataagctatattttt 18033904  T
Q  207 -actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
     ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||  |||     
T  18033905 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattgataaaacaatatttaatgttgg 18034004  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  18034005 attgaactttgaaagtgacagttaaataggaataaaaaatttctcaaaaagtgacacttaaaaaggaacggatggagta 18034083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33720774 - 33720582
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattattttt-acttt 205  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  33720774 tactacatccgtttctttttaattgttacattttgatattttacacaaaccaagattatcaataaatgatactatttttgatacaattgttttttacttt 33720675  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33720674 tactataatggtcttattaatttaatatttcatttcatgtttttctctctccgcaat-aatatttaagggtaatattggtaaaacaacatttaa 33720582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43953017 - 43952773
Alignment:
Q  126 ttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaa 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |         |||||||||||  ||| | || |||||||||||| ||| |||| || |    
T  43953017 ttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatca---------ctacttttgatgtaataagttatacttttactataatgaccttattca 43952927  T
Q  226 tttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaaca 325  Q
    ||||| ||  || || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| |||    
T  43952926 tttaacatcgcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaagataatatttgtaaaacaacatttaatgtttcattgaactttgaaagtgaca 43952827  T
Q  326 attaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
     |||||||  |||||||  |||||  |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  43952826 gttaaataagaacaaaaaatttctccaaaaatgacacttaaaaagaaacggagg 43952773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12124901 - 12124677
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||| || ||| | | |||||||||||  ||| | || |||||||    
T  12124901 tactaccttcgttcctttttaattgtcacattttgccattttacacaaatcaagataatcaacaattgatgctacttttgatgcaataagttatactttt 12124802  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||   ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||| |||||||  |||||    
T  12124801 actataataatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatactagtaaaacaacatttaatgttgca 12124702  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaa 331  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  12124701 ttgaactttgaaagtgacacttaaa 12124677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49497402 - 49497139
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| | |||| ||||||||||| ||| | || || |||||||  ||| | || |||||||||||| |    
T  49497402 tccgttcctttttaattgttacattttgatattttatacaaactaagacaattaacaattgatattatttttgatgcaataagttatacttttactataa 49497303  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    || |||| || |||||||||  || || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  49497302 tgaccttattcatttaatatcacatttcatatatttatctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgtttcattgaact 49497203  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    |  ||| ||||| |||||||  |||||||   |||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  49497202 tcaaaaataacagttaaataagaacaaaaaaattctttaaaagtgacacttaaaaaagaacgga 49497139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52749265 - 52748997
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||  || ||||||||| || || || ||||| |||||||  ||| |  | |||||||||||| |    
T  52749265 tccgttcatttttaatcgttatattttgacattttacacgaatcaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataaactatacttttactataa 52749166  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    |   ||| || ||||||||| | | || |||| ||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  52749165 taatcttattcatttaatatcttatttcatatatt--tctctccacaataaataactaaggataatattgatataacatcatttaatattgcattgaact 52749068  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  52749067 ttgaaagtgacagtcaaataggaacaaaaaatttcttcaaaaatgacatttaaaaagaaacggagggagta 52748997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 292
Target Start/End: Original strand, 2059792 - 2059977
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||  ||| | || ||||||     
T  2059792 tactacctccattcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaaaataatcaataattgttactacatttgatgcaataagttatactttc 2059891  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacat 292  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  2059892 actataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttttctctccgcaataaataactaaggataatattgataaaacat 2059977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 8464237 - 8464397
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  8464237 tactacttccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 8464336  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaata 267  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||    
T  8464337 actataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaata 8464397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 38597849 - 38597569
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| ||||||    
T  38597849 ttactatctctgttcctttttaactgtcactttttgacattttacacaaactaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatacttt 38597750  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||   ||||    
T  38597749 tactataataaccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccataataaataactaagggtaatgttggtaaaacaatatttattgttgc 38597650  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgaca-gttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||  |||||  ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  38597649 attgaactttgaaagtgacagttaaataggaacgaaaagtttctccaaaaatgacactttaaaaaggaacagagggagtac 38597569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48508375 - 48508113
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||  ||||     
T  48508375 tttttaattgtcacattttgacattttatacaaaccaaaataatcaataaatgttgttacttttgatacaataatttttatttttactataataacctta 48508276  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg-aaag 320  Q
    || ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | | |||||  |||||||||||| || ||||    
T  48508275 tttatttaatatctcattacatatatttctctctccacaat-aataaataagggtaatattagtaaaataacttttaatgttgcattgaactgtgtaaag 48508177  T
Q  321 taacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||||||||||| |||| ||   ||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  48508176 tgacaattaaataggaacataaaaattcttcaaaatagacacttaaaaaggaacggagggagta 48508113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10507069 - 10506845
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||  ||  || |||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||| |||  |||||     
T  10507069 ttactaactacgttcctttttaattgtcattttgtgatattttacacaaatcaagacaatcaataaatattactacttttgatgcaataattgatacttg 10506970  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| | ||||| | |||||||  ||||    
T  10506969 tactataatagccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctc--cgcaataaataactaagggtaatatcgataaaataacatttaaagttgc 10506872  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaat 332  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10506871 attgaactttgaaagtgacagttaaat 10506845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 313
Target Start/End: Original strand, 31487756 - 31487964
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||| |||| || |    
T  31487756 aattattacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataaatattgctacttttgatacaataatttctatt 31487855  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||| ||| ||  |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||    
T  31487856 tttactataataaccttatttatttaatatctcattacatatatttttctttctacaat-aataaataagggtaatattagtaaaataacatttaatgtt 31487954  T
Q  304 gcattgaact 313  Q
    ||||||||||    
T  31487955 gcattgaact 31487964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 31570614 - 31570894
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||   ||||    
T  31570614 aattactacatccgttcctttttaagtgtcactttaaggcattttacacaaaccaatacattcaataaatgttactacttttgatagaacaatgcatact 31570713  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||  |||| || |||||||   | | || |||  |||||| |||||  |||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||||||  ||    
T  31570714 tttactataataaccttattcatttaatcactaacttcatacatttctcactccgtgataaataagtaaggataatattggtaaaataatatttaatgtt 31570813  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||  |||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  31570814 gcattgaacttcgaaagtgacagttaaatatgaacaaaaaatttctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 31570894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52759286 - 52759008
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| | |||  || | ||||||||| ||| ||| | || |  |||    
T  52759286 ttactccctccgttcttttttaattgtcacattttgactttatacacaaaccaagacactaaatgtatttcactactttttatacaataacttatgtttt 52759187  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
     | ||| ||  ||||  | |||||||||   | || |||| |||||||||| |||||||||  ||||||  | ||| || | ||||||||||||  || |    
T  52759186 aattataatatccttaattatttaatatcatatttcatatatttctctctctgcaataaattactaagggcattataggaagaacatcatttaatgttac 52759087  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  52759086 attgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaaatttctgtaaaagtgacagttataaaggaacggaggtagta 52759008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Original strand, 24781807 - 24781916
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  24781807 tacttttactataatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattgataaaacaacatttaa 24781906  T
Q  300 cattgcattg 309  Q
      ||||||||    
T  24781907 tgttgcattg 24781916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 291
Target Start/End: Original strand, 39412500 - 39412675
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatg 215  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| | || || ||||||||| |||    
T  39412500 cgttcctttttaattgtcactttttaacattttatacaaaccaaaacaatcaataattgtttctacttttgatgcaataagttatatttttactataatg 39412599  T
Q  216 gccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaaca 291  Q
     |||| ||||||||| || ||| || |||| |||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  39412600 accttattaatttaacatctcatttcatatatttctctctctgcaataaataacaaaagataatattggtaaaaca 39412675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44818615 - 44818440
Alignment:
Q  203 ttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacat 302  Q
    ||||||| | ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |    
T  44818615 ttttactgtaatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctatgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgt 44818516  T
Q  303 tgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||||  ||||||  |||| ||||  |||||| |||||||||    
T  44818515 tgcattgaactttgaaaatgaaagttaaataggaacaaagattttctgcaaaagtgacgcttaaaaaggaacggag 44818440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1427935 - 1427660
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca-attaataatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||| |||| | | ||  |||||||||  || | ||| ||| ||||||||||||    
T  1427935 tactacctc-gttcctttttaattatcattttttgacattttacacaaactaagatacactataaatgttactttttcttatacaataatttttactttt 1427837  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || || ||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||    
T  1427836 actataatagcattagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctttgcaataaataactaaggataatgttggtaaaacaacatttattgttgca 1427737  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||  |||||||  |||||  |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  1427736 ttgacctttgaaaatgacagttaaataagaacaaaa-atttctcaaaaaataacacttaaaaaggatcggagggagta 1427660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 384
Target Start/End: Original strand, 8464585 - 8464706
Alignment:
Q  263 aaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacag 362  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| |||||     
T  8464585 aaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacac 8464684  T
Q  363 ttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  8464685 ttaaaaacgaacggagggagta 8464706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 8973432 - 8973708
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| ||| ||  |||| |  ||||     
T  8973432 tacttcctcagttcctttttaattgtcatattttgactttttacataaatcaagacaacaaatacttttactactttttatacaacaatttatctttttc 8973531  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||  | |   | |||||||| |||| || |||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||   | |||    
T  8973532 ctataataacatcaatcatttaatacttcatttcatatatttctctccctacaataaatatataagggtaatataggtaaaatcacatttaatgatacat 8973631  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||  | |||||| |||| ||| || ||||| |||||||||    
T  8973632 tgaactttgaaaacaacagttaattagaaacaaaattttgatgtaaaaaagacaattataaaggaacagagggagta 8973708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19093363 - 19093251
Alignment:
Q  269 ctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  19093363 ctaaggataatattggtaaaataatatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacaggtaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaa 19093264  T
Q  369 tggaacggaggga 381  Q
     ||||||||||||    
T  19093263 aggaacggaggga 19093251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5598295 - 5598145
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||          ||||||||| |    
T  5598295 tccgttcctttttaattgtcatattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattattactacttttgatgcaa----------ttttactataa 5598206  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaagg 274  Q
    || |||| || ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5598205 tgaccttattcatttaatattttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagg 5598145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17013683 - 17013450
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||   |||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |    |||||||    
T  17013683 tactacctccgttcctttttaagtgtcaatttaaaacattttacacaaaccaatacattcaataaatgttactacttttgatagaacaacgcatactttt 17013584  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaat----tgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacat 302  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||  |||| |    | |||  |||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||  ||||||  |    
T  17013583 actataataaccttattcatttaatcattcactaacttcatacatttctctctccgtaataaataagtaaagataatattggtaaaacaatatttaatgt 17013484  T
Q  303 tgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaa 336  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  17013483 tgcattgaacttcaaaagtgacagttaaatagaa 17013450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35605553 - 35605435
Alignment:
Q  269 ctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||    
T  35605553 ctaaggataatattggtaaaacaacatttaattttgcattaaattttgaaagtgacagttaaatttaaacaaaaaatttcttcaaaagtgacacttaaaa 35605454  T
Q  369 tggaacggagggagtacat 387  Q
       |||||||| |||||||    
T  35605453 atcaacggaggaagtacat 35605435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 342
Target Start/End: Original strand, 38817998 - 38818140
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| |  ||||| || ||||||||| | | || | || |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||     
T  38817998 tacttttactataacagccttattcatttaatatattatttcacatatttctctctccgtaataaataactaagggtaatgttgctaaaacaacatttat 38818097  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
      |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  38818098 tgttgcattgaattttaaaagtgacagttaaatagaaataaaa 38818140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2572217 - 2572016
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggc 217  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| | | ||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||| | || |  |||| |||| ||  |    
T  2572217 gttcctttttaattgtctcattttgactttttacacatatcaagataataaatatttttactacttttgatataataaattatcttttttctataataac 2572118  T
Q  218 cttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttga 317  Q
    |||  | ||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||| |  |||||||   | |||||||||||||    
T  2572117 cttaattatttaatatttcatttcatatatttcactctctgcaataaatatataaaggtaatataggtaaagccacatttaatgatacattgaactttga 2572018  T
Q  318 aa 319  Q
    ||    
T  2572017 aa 2572016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5597918 - 5597845
Alignment:
Q  269 ctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  5597918 ctaagggtaatattgataaaacattatttaatgttgcattgaactttggaagtgacagttaaatagaaacaaaa 5597845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45230764 - 45230693
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgata 189  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  45230764 gttcctttttaattgttacattttgactttttacataaaccaagacaacaaatacttttactacttttgata 45230693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 389
Target Start/End: Original strand, 48265080 - 48265298
Alignment:
Q  171 aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatct 270  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||  |||| || ||||||| | ||| |  |||| |||||||||||  ||| ||||  |    
T  48265080 aatgttgctacttttgatacaataatttctatttttactataataaccttatttatttaatgtctcattacatatatttctctctccataat-aataaat 48265178  T
Q  271 aaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaat 369  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||  | ||||| ||| |||||||| |||||||    |||  |||| ||||| ||||||     
T  48265179 aagggtaatattagtaaaataacatttaatgttgcattgaactacgtaaagtgacacttaaataggaacaaaaaaaatctcgaaaagtgacacttaaaaa 48265278  T
Q  370 ggaacggagggagtacatga 389  Q
     |||||||||||||||||||    
T  48265279 agaacggagggagtacatga 48265298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 321
Target Start/End: Original strand, 42787406 - 42787480
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  42787406 tttctctctccgtaataaataactaaggataatattggtaaaagaacagttaatattccattgaattttgaaagt 42787480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35605858 - 35605725
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||| || |||||||| |||  ||  ||||    
T  35605858 aattactatcttcgttcctttttaattgtcactatttgacattttacacaaaccaatacaatcaataaatattattaattttgatataatacttcatact 35605759  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttca 237  Q
    |||||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  35605758 tttactataataaccttattcatttaatatttca 35605725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1428282 - 1428199
Alignment:
Q  301 attgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||| |||| ||||| ||||    
T  1428282 attgcattgaactttgaaagtgacagttgaatagaaacaaaaaatttctctaaaactgatacttaaaaaggaagggaggtagta 1428199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50152514 - 50152455
Alignment:
Q  283 ggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  50152514 ggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtaaaagttaattagaaacaaaa 50152455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11248917 - 11248767
Alignment:
Q  228 taatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaat 327  Q
    |||||| ||| || |||| |||||||||| | ||||||||   |||| ||||| ||  |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||  ||| |    
T  11248917 taatatctcatttcatatatttctctctctgaaataaataatcaagggtaataatgacaaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagcgacact 11248818  T
Q  328 taaatagaaacaa-aatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    ||| |||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  11248817 taattagaaacaattttttttcttcaaaaatgacaattaaaaatgaacgga 11248767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 384
Target Start/End: Original strand, 38569716 - 38569877
Alignment:
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    |||||||||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||  |||||||   |  |||| ||||||||| ||    
T  38569716 taatttaatacttcattccatatatttctctctcggcaataaatatataagggtaatagaggtaaaaccacatttaatgatatattggactttgaaaata 38569815  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | | |||| | |||||||| ||| | | ||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38569816 atatttaattggaaacaaattttgtatgtaaaattgacaattataaaggaacggaaggagta 38569877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1859347 - 1859255
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattattttt 200  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  1859347 tactccctcggttcctttttaattatcacattttaactttttacataaatcaagacaacaaatacttttactactttagataaaataattttt 1859255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 172
Target Start/End: Original strand, 1039061 - 1039116
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa 172  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  1039061 cgttcttttttaattgtcactttttaacattttacacaaatcaagacaatcaataa 1039116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 172
Target Start/End: Original strand, 1045967 - 1046022
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa 172  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  1045967 cgttcttttttaattgtcactttttaacattttacacaaatcaagacaatcaataa 1046022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 387
Target Start/End: Original strand, 37296858 - 37296985
Alignment:
Q  260 aataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatga 359  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||| ||  |||| |||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||  |||||  ||||  ||    
T  37296858 aataaataagtaaggataatattggtaaaataatattcaatgttgcgttgaacttcgaaagtgacagttaaatatgaacaaaaaatttctccaaaagaga 37296957  T
Q  360 cagttaaaatggaacggagggagtacat 387  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||    
T  37296958 cacttaaaaacgaacggagggagtacat 37296985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 166
Target Start/End: Original strand, 42787136 - 42787191
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  42787136 tacctccgttcctttttaattgtcattttttgacattttacctaaatcaagacaat 42787191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36850731 - 36850667
Alignment:
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36850731 taatattggtaaaata-catttaatattgcat-gaactttgaaagtgacggttaaatagaaacaaaa 36850667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36850885 - 36850803
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattattt 198  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36850885 cgttcctttttaattgtcattttttgatattttacacaaatcaagacagtcaataaatgttactacttttgatataataattt 36850803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Original strand, 48264756 - 48264810
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaaga 162  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  48264756 tactacctccgtttctttttaattgtcacattttgacgttttatacaaaccaaga 48264810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10630667 - 10630586
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgata 189  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||  |||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  10630667 tactccctcggttcctttttaattgtttcattttgactttttacataaattaagacaacaaatacttttactacttttgata 10630586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3684876 - 3684820
Alignment:
Q  277 aatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaata 333  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  3684876 aatattagtaaaacaacatttaatattgcattgaattttaaaaataacagttaaata 3684820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 377
Target Start/End: Original strand, 31815052 - 31815322
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31815052 aattattacctccgttcctttttaattgtcattttttaacattttacacaaatcaagataatcaataatgttactacttttgatacaattatttttactt 31815151  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||    
T  31815152 ttactataatggtcttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacaatatttaatgttg 31815251  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31815252 cattgaattttgaaagtaacagttaaatagaaacaaa--ttttctccaaaaatgacagttaaaaaggaacgga 31815322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 42841851 - 42842129
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  42841851 ttactacatccgttcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaaccaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgttattacttt 42841950  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||   |||    
T  42841951 tactataatgaccttgttaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattgataaaataacatttaatgatgc 42842050  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  42842051 attgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaagtgacaattaaaaaggaacggatggagta 42842129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 111 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24283833 - 24283565
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||  || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24283833 tacctccgttcctttttaattgtcatttttttaccttttacacaaactaagacaattaataaatgttactacttttgatataattatttt-acttttact 24283735  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  24283734 ataatgactttgttaatttaatatttcaatttatatgtttctctc--cgcaataaatatctaagggtaatattgataaaacatcatttaatgttgcattg 24283637  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  24283636 aactttgaaagtgacaggtaaataggaacaaattttttctctagaagtgaccgttaaaaaggaacggaggga 24283565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 118 - 384
Target Start/End: Original strand, 35746641 - 35746907
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35746641 gttcctttttaattgtcactttttaacattttacataaattaagacaatcaataaatgttactatttttgatacaattatttttacttttactataatgg 35746740  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  35746741 ccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctttc-gcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgtattgaactttg 35746839  T
Q  317 aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  35746840 aaagtgacatttaaatagaaataaaaattttctccaaaagtgacaattaaaaaggtacggagggagta 35746907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 18194197 - 18194477
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  18194197 aattactacatccgttcctttttaattgtcagtttttcaaattttacacaaaccaagacaatcaataaatgatactacttttgatacaattgtttttgct 18194296  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  18194297 tttactataatagccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatataagggtaatgttggtaaaacaacatttaatttt 18194396  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| ||||||| | | | |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18194397 gcattgaaatttgaaaatgatagttaaataggaacaaattttttctctaaaagtgacagttaaaaaagaacggagggagta 18194477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 387
Target Start/End: Original strand, 12838064 - 12838344
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| ||| |  | ||| |||    
T  12838064 tactacctccgatcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaaaaattgatattacttttgatacaataagctataccttt 12838163  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||    
T  12838164 actataataaccttatttatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggcaaaacaacatttaatgttgca 12838263  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtacat 387  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12838264 ctgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagtacat 12838344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 384
Target Start/End: Original strand, 22382141 - 22382337
Alignment:
Q  188 tagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22382141 tagaattgtttttacttttactataatgaccttgttaatttaatatttcaattcatatgtttctctct--gcaataaatatctaaggataatattggtaa 22382238  T
Q  288 aacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaataga--aacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22382239 aacatcatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaattagaggaacaaattttttctctaaaagtgacggttaaaaaggaacggagggagta 22382337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Original strand, 7477199 - 7477461
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| ||| ||||     
T  7477199 tttttaattgttacattttgacattttacataaactaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttatacttttactataatgacctta 7477298  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7477299 ttaatttaatatctcatttcatatatttctctcttcgtaataaataactaaggataatatcggtaaaacaacatttaatattgcattgaactttgaaagt 7477398  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  7477399 aacagttaaataggaacaaaaattttcttcaaaagagacacttaaaaaggaactgagggagta 7477461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31430818 - 31430538
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||  ||| |  | |||||    
T  31430818 attactacctctgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactatttttcatgcaataagctatactt 31430719  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  31430718 ttactataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttg 31430619  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31430618 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctacaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagtac 31430538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 31398916 - 31399194
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| |  | |||||    
T  31398916 attacaacttccgttgctttttaattgtcacattttagcattttacataaaccaagacaattaaaaattgatactacttttgatataataaactatactt 31399015  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||| ||| ||| || |||| ||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||    
T  31399016 ttactataatgaccttattcattta-tatctcatttcatatatttatctctcctcaataaataactaaagataatattggtaaaacaacatttaatgttg 31399114  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  31399115 cattgaactttgaaagtgacaattaaaaagaaacaaattttttctccaaaaatgatacttaaaaaggaatggagggagta 31399194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33174064 - 33173797
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  33174064 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaaaatagtcaatgattgttactacttttgatacaataagttgtactttt 33173965  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| |||  ||| || |||||| || ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  33173964 aatataatgatcttattcatttaaaatctcatttcatatatttctctctctgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 33173865  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaac 374  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||    
T  33173864 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaac 33173797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 384
Target Start/End: Original strand, 34368636 - 34368924
Alignment:
Q  98 aaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatt 197  Q
    |||||| |||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||    
T  34368636 aaaaaaaaattgctacatcagttcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaattaagaaaattaataatattattacttttgatacaattgtt 34368735  T
Q  198 tttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcattt 297  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||    
T  34368736 tttacttttactgcaatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttttctcttcgcaataaatattcaaaggtaatattggtaaaacaacattt 34368835  T
Q  298 aacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctt--taaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||  ||||||||  ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  34368836 attgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatatgaacaatttttttctttctaaaagtgacagttagaaaggaatggagggagta 34368924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 32528312 - 32528591
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||| || ||| | | |||||||||||  ||| |  | |||||    
T  32528312 attactacctccgttcatttttaattgtcatattttgacattttatacaaatcaagacaatcaacaattgatgctacttttgatgcaataagctatactt 32528411  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||     
T  32528412 ttactataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatattt 32528511  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||  |||||||| |||||    
T  32528512 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttcttcaaaagtaacacttaaaaaagaacggagagagta 32528591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 33099821 - 33100096
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  33099821 tactacctccgttcttttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 33099920  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||  | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  33099921 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctc--cacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaagatttaatgttgca 33100018  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  33100019 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaagaacggagggagta 33100096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33258138 - 33257866
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||  ||  |||||||    
T  33258138 tactacctccgttcctttttaattgtcattttttgacattttacacaaatcaatacaatcaataaatattactacttttgatacaatacttcatactttt 33258039  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  33258038 actataataaccttattcatttaatatctcattttatatatttctctctccataataaataaccaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 33257939  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  33257938 ttgaactttgaaagtgatagttaaattgaaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaactgagg 33257866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 384
Target Start/End: Original strand, 41675166 - 41675449
Alignment:
Q  101 aaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattattttt 200  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||| |||||||  ||| |  | |    
T  41675166 aaagaattactacctctgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagacaatcaataattgatctatttttgatgcaataagctat 41675265  T
Q  201 acttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaac 300  Q
    | ||||||||| | | |||| || ||||||||||| | || |||| ||| | |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  41675266 agttttactataacgaccttattcatttaatattttatttaatatatttatttctttgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaat 41675365  T
Q  301 attgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     || ||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  41675366 gttacattgaactttgaaagtgacagttaaacaagaacaaaaattttctgcaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 41675449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 203 - 384
Target Start/End: Original strand, 17896605 - 17896786
Alignment:
Q  203 ttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacat 302  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17896605 ttttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatat 17896704  T
Q  303 tgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17896705 tgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 17896786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41891527 - 41891258
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| | || |||||||    
T  41891527 tactacctctgtgcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactaattttgatgcaataagttatactttt 41891428  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  41891427 actataatgaccttattcatttaatatatcattttatatatttctctctccgcaataaataactcaggacaatattggtaaaacaacattcaatgttgca 41891328  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa-atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  41891327 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaatttttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacg 41891258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Original strand, 5732059 - 5732267
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  5732059 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtactttt 5732158  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  5732159 actataatgaccttattcatttaaaatctcatttcatatatttctctctccgaaataaataactaaggataatattggtaaaacagcatttaatgttgca 5732258  T
Q  307 ttgaacttt 315  Q
    |||||||||    
T  5732259 ttgaacttt 5732267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7312874 - 7312639
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  7312874 tactaccttcgttcctttgtaattgtcacattttgatattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 7312775  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  7312774 actataatgaccttatttatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 7312675  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7312674 ttgaacttcgaaagtgacacttaaatagaaataaaa 7312639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8265207 - 8264926
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || || || |||| ||||||||  ||| |  | || |||    
T  8265207 ttactacctccgttcttttttaattgtcacattttgaaattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactccttttgatgcaataaactatatttt 8265108  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa----ca 301  Q
    |||||| ||  |||| |||||||||||| |||  | | || | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||          
T  8265107 tactataataaccttattaatttaatatctca--ttacatatctctctctccgcaataaataactaaggataatattagtaaaacaacatttaatgttgg 8265010  T
Q  302 ttgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  8265009 ttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctctaaaagtgacacttaaaaaggaacggaaggagtac 8264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 385
Target Start/End: Original strand, 22950807 - 22951082
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| |  | |||||||| |    
T  22950807 tacctctgttcctttttaattgttatattttgacattttacacaaaccaagacaataaaaaattgatactacttttgatacaataagctatacttttatt 22950906  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| | || || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  22950907 ataatgacattattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgtaataaataactaaggagaatattggtaaaactacatttaatgttgcattg 22951006  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  22951007 aattttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaattttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaagagagggagtac 22951082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35112671 - 35112409
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||  ||  || ||||||||| ||  | ||     
T  35112671 tttttaattgtcactttttgacattttacacaaacaaatacaatcaataaatattactacttttgatacaatacttcatatttttactataataacttta 35112572  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  35112571 tttatttaatatctcattttatatatttttctctccacaataaataactaagggtaatattggtaaaacaatatttaatgttgcaatgaactttgaaagt 35112472  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35112471 gacagttaaattgaaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 35112409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 33921760 - 33922037
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || || ||||    
T  33921760 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacataaactaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataaattatattttt 33921859  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||| ||  |||||    
T  33921860 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctcttcgtaataaataattaaggataatatcggtaaaacaacattcaatgttgca 33921959  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||| ||||  |||| ||||||  |||| |||||||||    
T  33921960 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacacaaattttcttcaaaagagacacttaaaaatgaactgagggagta 33922037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36922493 - 36922228
Alignment:
Q  112 acctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactactttt-gatagaattatttttacttttact 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || ||| | || ||||||| |||  ||| |  | |  |||||||    
T  36922493 acctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttaaataaatcaagacaatcaacaattgatattactttttgatgcaataagctatgtttttact 36922394  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  36922393 ataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctttctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattg 36922294  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  36922293 aactttaaaagtgacagttaaatagaaataaaaattttctctaaaagtgacacttaaaaaggaacg 36922228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18470554 - 18470287
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||| |||||  | |||||||  ||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||  ||| |  | |||||||||||| | |     
T  18470554 gttcctttttaattgtcgcattttaatattttacgcaaaccaagacaatcaacaattgatactactttttatgcaataagctatacttttactataacga 18470455  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
    |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  18470454 ccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttg 18470355  T
Q  317 aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18470354 aaagtgacagttaaataagaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 18470287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26724177 - 26723946
Alignment:
Q  113 cctccgttcttttttaattgtcacatttc-gacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||  ||| | || |||||||||||    
T  26724177 cctccgttcctttttaattgtcacatttttgacattttacacaaaccaagacaatcaatgattattactacttttgatgcaataagttatacttttacta 26724078  T
Q  211 ttatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga 310  Q
    | ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  26724077 taatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccacaataaataattaagggtaatattgataaaatatcatttaatgttgcattga 26723978  T
Q  311 actttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26723977 attttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 26723946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 342
Target Start/End: Original strand, 36298171 - 36298395
Alignment:
Q  119 ttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggc 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || || ||||||||| ||| |    
T  36298171 ttcttttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaaaacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatatttttactataatgac 36298270  T
Q  218 cttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttga 317  Q
     || || ||||||||| | | || |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  36298271 tttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgaaataaataattaagggtaatactgataaaacatcatttaatgttgcattgaacattga 36298370  T
Q  318 aagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  36298371 aagtgacagttaaatagaaacaaaa 36298395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10227513 - 10227246
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||  ||| | || |||||||    
T  10227513 tactacctccgttcctttttaattgtcactttttaacattttacacaaatcaagacaatcaataattatttctacttttgatgcaataagttatactttt 10227414  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| || ||| || |||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| | |||||||   ||||    
T  10227413 actataatgaccttattaatttaacatctcattttatatatttctccctccgcaataaataacaaaggataatattgataaaataacatttaatgatgca 10227314  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaac 374  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||    
T  10227313 ttgaattttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaac 10227246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 378
Target Start/End: Original strand, 17354084 - 17354283
Alignment:
Q  179 tacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaa 278  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  17354084 tacttttgatacaattgtttttacttttcttataatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctcttttcgcaatatatatctaagggtaa 17354183  T
Q  279 tattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| | ||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  17354184 tattcgtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatatgaacatattttttctctaaaagtgacaattataaaggaacggag 17354283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 383
Target Start/End: Original strand, 30866722 - 30866998
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| ||  |||    
T  30866722 tactacctccgttcctttttaactgtcattttttgacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatatgttt 30866821  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || |||||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||   |||||    
T  30866822 actataatagccttagtcatttaatatcttattttatatatttctctctccgtaataaataactaagggtaatgttggtaaaccaacatttattgttgca 30866921  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagt 383  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  30866922 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacacttaaaaaagaacggagggagt 30866998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Original strand, 32966038 - 32966312
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||| || ||| | ||| |||||||||  ||| |  | ||||||||||    
T  32966038 tacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacacaaattaagacaatcaacaattgataccacttttgatgcaataagctatacttttact 32966137  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||||  |||||||     
T  32966138 ataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgtaataaataactaaggacaatattggtaaaccaacatttaatgttgcattt 32966237  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| || ||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32966238 aactttgaaaatgacagttaaataggaataaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 32966312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20035212 - 20035028
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20035212 tacttttactataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaa 20035113  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
      ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  20035112 tgttgcattgaactttgaaagtgccagttaaataggaacaaaaaatttctgcaaaagtgacacttaaaaaggaacggatggagta 20035028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20045623 - 20045439
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20045623 tacttttactataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaa 20045524  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
      ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  20045523 tgttgcattgaactttgaaagtgccagttaaataggaacaaaaaatttctgcaaaagtgacacttaaaaaggaacggatggagta 20045439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 367
Target Start/End: Original strand, 29497526 - 29497780
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || ||| | |||||||||| ||   || |  | ||||||||||||     
T  29497526 ctccgtttctttttaattatcacattttgacattttacacaaaccaggacaatcaacaattgatactactttttatgccataagctatacttttactata 29497625  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| | |||   ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||    
T  29497626 atgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataacgaagaacaatattgataaaacaacatttaatgttgcattgaac 29497725  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaa 367  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  29497726 tttgaaagtgacagttaaataggaataaaatttttctcaaaaagtgacagttaaa 29497780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 337
Target Start/End: Original strand, 36648026 - 36648221
Alignment:
Q  143 acattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattg 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||  ||| | || | |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| ||     
T  36648026 acattttacacaaaccaagacaatcaataattatttttacttttgatgcaataagttatgcttttactataatgaccttgttaatttaacatctcatttc 36648125  T
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaa 337  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36648126 atatatttctctctccgaaataaatagctaaggataatattgataaattaacatttaatattgcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaa 36648221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3310462 - 3310196
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||          |||    
T  3310462 tactacctccgttcctttttaactgtcatattttgacattttacgcaaaccaagacaatcaataatattattacttttgatgcaatt----------tta 3310373  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||  ||||||    
T  3310372 ctataatgaccttattcatttaatattttatatcatatatttctctctccgcaataaataactaagagtaatattgataaaacattatttaatgttgcat 3310273  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||||    |||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  3310272 tgaactttagaagtgacagttaaataaaaacaaaaaaaatctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 3310196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 334
Target Start/End: Original strand, 26632259 - 26632393
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  26632259 tacttttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttaa 26632358  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatag 334  Q
      |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26632359 tgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatag 26632393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 384
Target Start/End: Original strand, 44480156 - 44480405
Alignment:
Q  136 catttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatt 234  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||  ||| |  | || ||||||||| ||| |||| || |||||||||     
T  44480156 cattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactattttttatgcaataagctatatttttactataatgaccttattcatttaatatc 44480255  T
Q  235 tcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatag 334  Q
    ||| || |||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||| ||||| ||  |||||||     
T  44480256 tcatttcatatatttctctcttcacaataaataactaaggataatattgataaaataacatttaatgttgcattgaactttaaaagtgacggttaaataa 44480355  T
Q  335 aaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||| |||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  44480356 gaacaaattttttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 44480405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3838113 - 3837877
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||   || | || ||||||||||||     
T  3838113 ctccattcctttttaattgtcactttttgacattttacgcaaatcaagacaatcaataattgttattacttttgatgccataagttatacttttactata 3838014  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||    
T  3838013 atgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttatctttccgcaataaataactaaagataatattgataaaacaatatttaatgttgcattaaac 3837914  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||    
T  3837913 tttgaaagtgacagttaaataagaacaaattttttct 3837877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 381
Target Start/End: Original strand, 29722289 - 29722564
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||    
T  29722289 attactacctctgttcctttataattgtcacattttaacattttacgcaaaccaagacaatcaacaatcgatactacttttgatgcaataagttatactt 29722388  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| | || || ||||||||| | | || |||| ||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  29722389 ttactataatgac-ttatttatttaatatcttatttcatatatttctatctccgcaataaataattaaggacaatattagtaaaacaacatttaatattg 29722487  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    ||||||| | ||||||| | | |||| || ||||||||  |||||  |||| ||||  |||||| |||| |||||||    
T  29722488 cattgaattatgaaagtgaaagttaagtataaacaaaaaatttctccaaaagtgacgattaaaaaggaatggaggga 29722564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36407008 - 36406730
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaaga---caattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||   || | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||||    
T  36407008 tacctccgtttctttttaactgtcactttttgacattttacacaaaccaagaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatactttt 36406909  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   || ||    
T  36406908 actataataaccttagtcatttaatatcttatttaatatatttctctatccgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttaca 36406809  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagtt-aaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||| |||| ||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  36406808 ttgaactttgaaagtaacagttaaataagaacaaaaaatttcttcaaaagtgacacttaaaaaaggaaaggagggagta 36406730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28608853 - 28608575
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  28608853 attactacatctgttcctttttaattgtcatattttgatattttacacaaatcaagacaatcaataaatgttgctacttttgatacaataatttttattt 28608754  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||  |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||    
T  28608753 ttactataataaccttatttatttaatatatcattacatatatttctctctccacaat-aataaataagggtaatattagtaaaataacatttaatgttg 28608655  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| || ||   ||| |||||||  |||||||   ||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  28608654 cattgaactatgtaaaggacacttaaataagaacaaaaaaattctacaaaagagacatttaaaaaggaacggagggagta 28608575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8382086 - 8381916
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||||||||  ||| |  | ||||    
T  8382086 aattactacctccgttcctttttaattatcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagatatact 8381987  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaagg 274  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8381986 tttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctccccgcaataaataactaagg 8381916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 384
Target Start/End: Original strand, 46285919 - 46286108
Alignment:
Q  195 atttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatca 294  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||  ||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |    
T  46285919 atttatacttttactatattagccttagtaatttaatattttatttcatatatttctctctacgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaata 46286018  T
Q  295 tttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||  |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  46286019 tttattcttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataagaacaaaaaatttctccaaaagtgacagttaaaaaagaacggaggaagta 46286108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Original strand, 41889372 - 41889580
Alignment:
Q  176 tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggt 275  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| || | ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||      
T  41889372 tactacttttgatacaataattgatacttttactataatagtcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctcttcgcaataaataactaagaa 41889471  T
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||||||   |||||||||| ||||| |||||| | ||||    
T  41889472 taatattgataaaacaatatttaaagttgcattgaactttaaaaatgacagttaaattggaacaaaaaaattctttaaaagtgacacttaaaaagaaacg 41889571  T
Q  376 gagggagta 384  Q
    || ||||||    
T  41889572 gatggagta 41889580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 304
Target Start/End: Original strand, 38168774 - 38168972
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat--gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||  ||| | || ||||||    
T  38168774 tactacctccgtttctttttaattgtcactttttaatattttacacaaaccaagacaatcattaatttgttactatttttgatgcaataagttatacttt 38168873  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    || ||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  38168874 tattataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggataatattggtaaaacaacacttaatattg 38168972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 47408370 - 47408227
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  47408370 tactacctccgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaagacattcaataaatgttactacttttgatacaataatatatactttt 47408271  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttc 250  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||||||| || |||| ||||    
T  47408270 actataataaccttattcatttaatatttcatttcatatatttc 47408227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3178187 - 3177910
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||||||||||  | || || ||||||||||||||| ||  |||| |  ||||    
T  3178187 tactccctctgttcctttttaattgtcacttttagatttttgacacaaaccaagacaacaattacattttactacttttgatacaacaatttatcttttt 3178088  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     |||| ||  ||||  | ||||||||| ||  || |||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||||  || |||||| |||||||  ||| |    
T  3178087 tctataataaccttcgtcatttaatatatcttttcatatatttctctctctgcaataaataaccaagggtaataacggcaaaacaacatttaatgttgta 3177988  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3177987 ttgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaaattctgtaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 3177910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Original strand, 41409844 - 41409984
Alignment:
Q  98 aaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattat 196  Q
    |||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |    
T  41409844 aaaaaacaagtactatctccattcattcttaattgtcactttttatcattttacacaaatcaagacaattaataaatgttattaattttgatacaattgt 41409943  T
Q  197 ttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttca 237  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41409944 ttttacttttattataatggccttattaatttaatatttca 41409984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 340
Target Start/End: Original strand, 44820596 - 44820816
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||   |||          |||||    
T  44820596 tacctccgttcatttttaactgtcatattttgacattttatacaaaccaagacaatcaataattattactacttttgatgccatt----------ttact 44820685  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||  |||| || ||||||||||| | || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||   |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  44820686 ataataaccttattcatttaatattttatttcatatatttttctctccgaaataaataactaaatgtaatattgataaaacattatttaatgttgcattg 44820785  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  44820786 aactttaaaaataacagttaaatagaaacaa 44820816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1553770 - 1553495
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||  || |||||| | ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||   || ||||    
T  1553770 tactacatccgttcttttttaagtgtcactttaagatattttatacaaaccaatatatttaataaatgttactacttttgatagaacaatgcatattttt 1553671  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||   | | || |||  |||||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  1553670 actataataaccttattcatttaatcactaacttcatacatttctctct--gtaataaataagtaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgca 1553573  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  ||||  |||  |||||| |||||||||||||||    
T  1553572 ttgaacttcgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagagacgattaaaaaggaacggagggagta 1553495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45324163 - 45324050
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||    
T  45324163 atttaatatcttattttatatatttctctctccgcaataaataattaagagtaatattgataaaacatcattcaa----gcattgaactttgaaagtaac 45324068  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaa 342  Q
    | ||||||||||||||||    
T  45324067 agttaaatagaaacaaaa 45324050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Original strand, 37353890 - 37354040
Alignment:
Q  142 gacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaatt 240  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||  ||| | ||  | ||||||||| ||| |||| || |||||| |||||| ||    
T  37353890 gacattttacatgaatcaaaacaatcaataattgttactacttctgatgcaataagttacatttttactataatgaccttattcatttaacatttcattt 37353989  T
Q  241 gatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaaca 291  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37353990 catatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaaca 37354040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 384
Target Start/End: Original strand, 8966026 - 8966163
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||||||  |||||||||   |||| |||||  |||||||||   |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  8966026 tttctctctctacaataaataatcaagggtaataaaggtaaaacaatgtttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaatttt 8966125  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8966126 tatgcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 8966163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6799283 - 6799155
Alignment:
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaat-atttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||||| || ||| || |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||    
T  6799283 ttactataatggtcttattcatttaattatatcattttatatatttctctctccgtaataaataattaaggataatattgataaaacaacatttaatgtt 6799184  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaat 332  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6799183 gcattgaactttgaaagtgacagttaaat 6799155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6799676 - 6799620
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6799676 tactacctccgttcctttttaattgtcacatgttgacattttacataaaccaagaca 6799620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Original strand, 22057544 - 22057616
Alignment:
Q  249 tctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22057544 tctctctctgtaataaataactaagggtaatattgctaaaacaacatttaatattgcattgaactttgaaagt 22057616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42881089 - 42880982
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||  ||||| | | |||||||||||||||    
T  42881089 atatatttctctctccgcaatcaataaccaaggataatattgataaaacaacatttaatgttgcattgaccttaaaaagtgatagttaaatagaaacaaa 42880990  T
Q  342 atttttct 349  Q
    | ||||||    
T  42880989 aattttct 42880982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 8380576 - 8380758
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||   || | ||| ||| ||||||||||    
T  8380576 attactacctccgttcctttttaactgtccatttttgatattttacacaaaccaagacactcaataaatgttaccttttcttatacaataatttttactt 8380675  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaa 287  Q
    ||||||| ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  8380676 ttactataataaccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctccccgtaataaataactaagggtaatgttggtaa 8380758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Original strand, 13431312 - 13431394
Alignment:
Q  302 ttgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  13431312 ttgcattgaattttgaaagtgacagttaaataggaacaaattttttctctaaaagtgacaattaaaaaagaacggagggagta 13431394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Original strand, 17896477 - 17896535
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17896477 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaat 17896535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22786120 - 22785963
Alignment:
Q  124 ttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgtt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||| ||  |||| |  |||| |||| ||  ||||  |    
T  22786120 ttttaattgtcacattttgactttttacacaaaccaaaacaacaaatacttttactacttttgatacaacaatttatctttttcctataataaccttaat 22786021  T
Q  224 aatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatat 281  Q
    ||||||||| |||| |  |||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  22786020 aatttaatacttcattcaatatatttctctctcagcaaaaaatatataagggtaatat 22785963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 384
Target Start/End: Original strand, 9601886 - 9602156
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||  || | ||||||||||||| ||| | || |  |||   ||| |    
T  9601886 tccgttcctttttaattgtcacattttgactttttacacaaaccaagacattaaatgtatttcactacttttgatacaataacttatggtttgcttataa 9601985  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    |  ||||  | |||||||||   | ||  ||| |||||||||| |||||||||  ||||||  | ||| || |||||| |||||||  || |||||||||    
T  9601986 tatccttaattatttaatatcatatttcttatatttctctctctgcaataaattactaagggcattataggaaaaacaacatttaatgttacattgaact 9602085  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||   || | ||||| |||| | || || |||||||||||||||    
T  9602086 ttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaaaattatgtaaaagtgacgggtataaaggaacggagggagta 9602156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 384
Target Start/End: Original strand, 9829457 - 9829727
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||  || | ||||||||||||| ||| | || |  |||   ||| |    
T  9829457 tccgttcctttttaattgtcacattttgactttttacacaaaccaagacattaaatgtatttcactacttttgatacaataacttatggtttgcttataa 9829556  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    |  ||||  | |||||||||   | ||  ||| |||||||||| |||||||||  ||||||  | ||| || |||||| |||||||  || |||||||||    
T  9829557 tatccttaattatttaatatcatatttcttatatttctctctctgcaataaattactaagggcattataggaaaaacaacatttaatgttacattgaact 9829656  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||   || | ||||| |||| | || || |||||||||||||||    
T  9829657 ttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaaaattatgtaaaagtgacgggtataaaggaacggagggagta 9829727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 41408767 - 41408872
Alignment:
Q  97 gaaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaatta 195  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||     
T  41408767 gaaaaaacaagtactatctccattcatttttaattgtcactttttatcattttacacaaatcaagacaattaataaatgttattaattttgatacaattg 41408866  T
Q  196 ttttta 201  Q
    ||||||    
T  41408867 ttttta 41408872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 384
Target Start/End: Original strand, 46563177 - 46563386
Alignment:
Q  175 ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaagg 274  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||  |||| |||| ||  ||||  | ||||||||| ||| || |||| ||||||||||  |||||||||   ||||    
T  46563177 ttactacttttgatataacaatttttctttttcctataataaccttcctcatttaatatctcatttcatatatttctctctctacaataaataatcaagg 46563276  T
Q  275 ttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaac 374  Q
     ||||| ||  ||||||  ||||||  ||| | |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||    
T  46563277 gtaataatgtcaaaacaatatttaatgttgtactgaactttgaaagtgacagttaattataaacaaaaaatttctgcaaaagtgacaattaaaaaggaac 46563376  T
Q  375 ggagggagta 384  Q
    ||||| ||||    
T  46563377 ggaggtagta 46563386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 379
Target Start/End: Original strand, 2408827 - 2408919
Alignment:
Q  287 aaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||  |||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  2408827 aaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataagaacaaattttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacagagg 2408919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 19327787 - 19327871
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattattttta 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||    
T  19327787 gttcctttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaaaacaatcaataaatattgctacttttgatacaataattttta 19327871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 375
Target Start/End: Original strand, 36339372 - 36339453
Alignment:
Q  294 atttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||  |||| |||||| ||||||    
T  36339372 atttaatattgcattaaactttgaaagtgacacttaaataaaaacaaaacttttctacaaaagagacacttaaaaaggaacg 36339453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 237
Target Start/End: Original strand, 41409697 - 41409738
Alignment:
Q  196 tttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttca 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41409697 tttttacttttactataatggccttattaatttaatatttca 41409738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 172
Target Start/End: Original strand, 41888980 - 41889044
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41888980 tactatctccgttcctttttaattatcactttgtgacattttacacaaaccaagacaatcaataa 41889044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 331
Target Start/End: Original strand, 41409765 - 41409820
Alignment:
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaa 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  41409765 taatattggtaaaacaacatttaatgttgcgttgaactttgaaagttataattaaa 41409820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 299
Target Start/End: Original strand, 30586780 - 30586854
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||| || |||||||    
T  30586780 atttaatatctcatttcatatatttctctctctgcagtaaatatctaagggtaatatagataaatcaacatttaa 30586854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32049552 - 32049431
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaa-acatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaa 323  Q
    |||||||| |||| || || | ||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||| |||||||   | |||||||||||||||   |    
T  32049552 atttaatacttcatttcatgtatttatctctctgcaataaatatataagagtaatataggtaaagaca-catttaatgatacattgaactttgaaaacga 32049454  T
Q  324 caattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  32049453 caattaattagaaacaaaatttt 32049431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33071984 - 33071894
Alignment:
Q  286 aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    |||||| |||||||  || |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||| ||||| ||||||||| || |||||||    
T  33071984 aaaacaacatttaatgttacattaaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaaattctgtaaaagtgacagttataaaggaacgg 33071894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35860216 - 35860166
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  35860216 ctccgttcctttttaattgttacattttgactttttacacaaaccaagaca 35860166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 385
Target Start/End: Original strand, 48981511 - 48981644
Alignment:
Q  253 tctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaag-taacaattaaatagaaacaaaatttttcttt 351  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||  || |||||| |||||||  ||  ||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||   ||||      
T  48981511 tctctgcaataaataactaagggtaataaaggcaaaacaacatttaatgttatattgaactttgaaagttgacaggtaattagaaacaaaaaaattctgc 48981610  T
Q  352 aaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  48981611 aaaagtgacaattaaaaaggaacggagagagtac 48981644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 299
Target Start/End: Original strand, 46715404 - 46715480
Alignment:
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||||||||||||| | |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||  |||||||    
T  46715404 taatttaatattttattccatatatttctctctcagcaataaatatataagggtaatatagataaaaccacatttaa 46715480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 30676 - 30953
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30676 tactacctccgtttctttttaattgtcactttttgaaattttacacaaaacaagacaattaataaatcttactacttttgatacaattgtttttactttt 30775  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  30776 actataaagaccttgctaatttaatatttcaattcatatgtttctctctctgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacatcatttaatgttaca 30875  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30876 ttgaactttgaaagtgacagttaattaggaacaaattttttctctaaaagtgacagttaaaaaagaacggagggagta 30953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 138)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 9220025 - 9220302
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9220025 tactacctccgtttctttttaattgtcactttttgaaattttacacaaaacaagacaattaataaatcttactacttttgatacaattgtttttactttt 9220124  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  9220125 actataaagaccttgctaatttaatatttcaattcatatgtttctctctctgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacatcatttaatgttaca 9220224  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9220225 ttgaactttgaaagtgacagttaattaggaacaaattttttctctaaaagtgacagttaaaaaagaacggagggagta 9220302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30939415 - 30939138
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||  | ||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30939415 tactacctccgttcctttttaattgtcatattttgattttttacacaaaccaagacggtcaataaatggtagtacttttgatacaattgtttttactttt 30939316  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  30939315 actataatgaccttattaatttaatatttcatttcatacgtttctctctccgcaataaatatccaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 30939216  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  30939215 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctctaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggaagta 30939138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 385
Target Start/End: Original strand, 53599768 - 53600048
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| | || |||||    
T  53599768 attactacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagttatactt 53599867  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || |||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||    
T  53599868 ttactataatgaccttattcatttaatatcacatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttg 53599967  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  53599968 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaaatgacacttaaaaaggaacggagggagtac 53600048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 384
Target Start/End: Original strand, 19093141 - 19093414
Alignment:
Q  112 acctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||||||    
T  19093141 acctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagatagtcaataattgttactacttttgatgcaataagttgtacttttacta 19093240  T
Q  211 ttatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga 310  Q
    | ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  19093241 taatgaccttattcatttaatatctcatttcatatattcctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattga 19093340  T
Q  311 actttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  19093341 actttgaaagtgacggttaaatagaaacaaaaaatttctttaaaagagacacttaaaaagaaacggagggagta 19093414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43888244 - 43887966
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||  | |||||    
T  43888244 aattactaccttcgttcctttttaattgtcactttttgatattttacataaaccaagagaatcaataaatgttactacttt-gatacaattgctattact 43888146  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||   |    
T  43888145 tttactataatgaccttgttaatttaatatttcatttcatatgtttctctatccgcaataaatatctaagggtaatattgataaaacaaca-ttaatgat 43888047  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43888046 gtattgaactttgaaagtgacaattaaataggaacaaaaaatttatctaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 43887966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44217967 - 44217689
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||    
T  44217967 ttactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagatatacttt 44217868  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  44217867 tactataatgaccttcttcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 44217768  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  44217767 attgaacttcgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagagagta 44217689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 44013895 - 44014177
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |  |||| |||||||  ||| |  | |||||    
T  44013895 attactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgaaactatttttgatgcaataagctatactt 44013994  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||    
T  44013995 ttactataatgaccttatttatttaatatctcatttcatatatttatctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttg 44014094  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtacat 387  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  44014095 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaattttttctccaaaaatgacacataaaaaggaacggagggagtacat 44014177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 120 - 384
Target Start/End: Original strand, 3436063 - 3436328
Alignment:
Q  120 tcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggcc 218  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||||||  ||| |  | |||||||||||| ||  ||    
T  3436063 tcttttttaattatcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattaatactacttttgatgcaataaactatacttttactataataacc 3436162  T
Q  219 ttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaa 318  Q
    || |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  3436163 ttattaatttaatatttcatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaa 3436262  T
Q  319 agtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3436263 agtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 3436328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44069291 - 44069014
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  44069291 tactacctccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 44069192  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  44069191 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaacaatattgataaaacaacatttaatgttgca 44069092  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44069091 ttgaactttgaaagtgacacttaaataggaacaaaatttttctacaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 44069014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8735649 - 8735389
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  8735649 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 8735550  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  8735549 actataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttttctctccgcaataaataactaagaataatattggtaaaacaatatttaatattgca 8735450  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  8735449 ttgaactttgaaagtgacaattaaatagaaacaaaatttttctct-aaaatgacacttaaaa 8735389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 354228 - 353965
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||| |||||||  ||| | || |||||    
T  354228 attactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagatagtcaatgattgttactatttttgatgcaataagttgtactt 354129  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||    
T  354128 ttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttaatgttg 354029  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| ||||||    
T  354028 cattgaactttgaaagtgacaattaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaa 353965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 122 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29295600 - 29295337
Alignment:
Q  122 ttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggcctt 220  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||  ||| | || |||||||| ||| ||| ||||    
T  29295600 ttttttaattatcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaataattgatactactttcgatgcaataagttatacttttaatataatgacctt 29295501  T
Q  221 gttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaag 320  Q
     || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29295500 attcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaag 29295401  T
Q  321 taacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  29295400 tcacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaaaggagggagta 29295337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 50623682 - 50623397
Alignment:
Q  98 aaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattat 196  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| |     
T  50623682 aaaaaagtaatactacatccgtt-ttttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagacaatcaaaaattgatactacttttgatacaataag 50623584  T
Q  197 ttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatt 296  Q
     | |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  50623583 ctatacttttactataatgaccttattcattta-tatctcatttcatatatttatctctccgcaataaataattaaggataatattggtaaaacaacatt 50623485  T
Q  297 taacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  50623484 taatgttgcattgaactttgaaagtgacaattaaatagaaacaaattttttctcctaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 50623397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33809344 - 33809070
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  || |||    
T  33809344 tacctctgttcctttttaattgtcactttttaacattttacacaaatcaaaacaatcaataaatgttactacttttgatgcaattgtttttatattgact 33809245  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||     
T  33809244 ataatggccttattaatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaatatctaggggtaatattggtaaaacaacatttactattgcatta 33809145  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| || ||| |||||||  ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  33809144 aactttgaatgtgacagttaaataagaacaaaaattttctccaaaagtgacaattaaaaaggaacggagagagta 33809070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 13629177 - 13629454
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||  ||| |  | |||||||    
T  13629177 tactacctctgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactatttttcatgcaataagctatactttt 13629276  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  13629277 actataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 13629376  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13629377 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctacaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 13629454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 22828385 - 22828662
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  22828385 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaaccaataattgctactacttttgatgcaataagttatactttt 22828484  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||    
T  22828485 actataatgaccttattcatttaatatattatttcatatatttctctatctgcaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatgtaatgttgca 22828584  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22828585 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 22828662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46872180 - 46871904
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || | |||||    
T  46872180 tactacctc-gttccttttaaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttattctttt 46872082  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  46872081 actataatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 46871982  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||| |  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  46871981 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttatccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggaagta 46871904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 21044729 - 21045008
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | ||||    
T  21044729 aattactacctccgttccttttta-ttatcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataagctatact 21044827  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  21044828 tttactataatgaccttatttatttaatatctcattgcatatatttctctctccgcaataaataactaaagataatattggtaaaacaacatttaatgtt 21044927  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21044928 gcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctcaaaaagtgacacttaaaaaggaactgagggagta 21045008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Original strand, 42513009 - 42513280
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttc-gacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||| || |||   |||||||||||||  ||| |  | ||||||    
T  42513009 tactacctccgttcatttttaattgtcacatttttgaaattttacacaaatcaagacaatcaacaattaatactacttttgatgcaataagctatacttt 42513108  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || |||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  42513109 tactatcatgaccttattcatttaatatcacattttatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 42513208  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  42513209 attgaactttgaaagtgacacttaaatagtaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacgga 42513280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42133297 - 42133020
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattattttt-acttt 205  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  42133297 tactaccttcgtttctttttaattgtcacttttcaatattttacacaaaccaaaacaatcaataaatgttactatttttgatacaattgttttttacttt 42133198  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| || ||||| || |||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||    
T  42133197 tactataatagccttattgatttaa-atttcacatcatatgtttctcactccgcaataaatatctaaggataatattgataaaactacatttaatgttgc 42133099  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42133098 attgaactttgaaagcgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaagtgacgattaaaaaggaacggagggagta 42133020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 16464766 - 16465043
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | |||||||    
T  16464766 tactacctccgttcctttttagttgtcacattttgacattttacacaaacctagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataagctatactttt 16464865  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  16464866 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgcactaaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 16464965  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  16464966 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagtaacaaaaaatttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacggatggagta 16465043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 35232282 - 35232558
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||  ||| |  | |||||||    
T  35232282 tactacatccgttcttttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactgcttttgatgcaataagatatactttt 35232381  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  35232382 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataagtaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 35232481  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||| || | | |||||||| ||| ||| ||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  35232482 ttgaactttgaacgtgatagttaaataggaaccaaaattttc-tccaaaatgacacttaaaaaggaacggaggaagta 35232558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47251673 - 47251396
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  47251673 tactacctccgtttctttttaattgtcacattttatcattttacataaaccaaaataatcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtactttt 47251574  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  47251573 attataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctctccgcaataaatagctaagaataatattgataaaacaacatttaatattgca 47251474  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  47251473 ttgaactttgaaagtgacagttgaatagaaacaaaaaatttcttcaaaagagacagttaaaaaggaaaggaaggagta 47251396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 56576088 - 56576364
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||| ||||||  ||| |  | |||||||    
T  56576088 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacgttttacacaaaccaagataatcaacaattgatactacctttgatgcaataagctatactttt 56576187  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||  || || |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  56576188 actataatgaccttattcatttaatatc-catttcatatatttttctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgca 56576286  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  56576287 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 56576364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 384
Target Start/End: Original strand, 38617280 - 38617568
Alignment:
Q  97 gaaaaaagaat--tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaat 193  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||| || ||| | |||||||||||||  |||    
T  38617280 gaaaaaagaataatactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaa--caatcaacaattgatactacttttgatgcaat 38617377  T
Q  194 tatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatc 293  Q
     |  | || ||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |    
T  38617378 aagctatatttttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaac 38617477  T
Q  294 atttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38617478 atttaatgttgcattgaactttgaaaatgacagttaaataggaacaaaatatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 38617568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42099978 - 42099691
Alignment:
Q  98 aaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattat 196  Q
    |||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| |     
T  42099978 aaaaaaaaactactaccttcgtttttttttaattgtcacattttgacattaaacacaaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataag 42099879  T
Q  197 ttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatt 296  Q
    || |||||||||| | ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  42099878 ttatacttttactgtaatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctttccgcaataaataattaagggtaatattgataaaacaccatt 42099779  T
Q  297 taacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||   ||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  42099778 taatgttgcattgaactttgaaagtgatagttaaatagaaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 42099691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36408968 - 36408706
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||||  ||| |  | |||||||||||| ||| ||||     
T  36408968 tttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaataaacatttgatactacttttgatgcaataagctatacttttactataatgacctta 36408869  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |    
T  36408868 ttaattcaatatctcatttcatatatttctctctccgctataaataactaaagagaatattgttaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaaat 36408769  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36408768 tacaattaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 36408706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36423134 - 36422872
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||||  ||| |  | |||||||||||| ||| ||||     
T  36423134 tttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaataaacatttgatactacttttgatgcaataagctatacttttactataatgacctta 36423035  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |    
T  36423034 ttaattcaatatctcatttcatatatttctctctccgctataaataactaaagagaatattgttaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaaat 36422935  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36422934 tacaattaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 36422872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 22678292 - 22678571
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| | ||||||| |||||  ||| |  | ||||||    
T  22678292 ttactacctccgttcatttttaattgtcacattttgacattttatataaaccaagataatcaacaattgatactactattgatgcaataagctatacttt 22678391  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22678392 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctctccgcaataaattactaaggataatattggtaaaacaacatttaatattgc 22678491  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttcttt--aaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  ||| || |||||||||  |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22678492 attgaactttgaaagcgacagttaaataagaac-aattttttctttccaaaagtgacacttaaaaaggaactgagggagta 22678571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 378
Target Start/End: Original strand, 38542270 - 38542531
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | ||  ||||||||||| |||     
T  38542270 gttcctttttaattgtcattttttgacattttacataaaccaagacaattaataattgttactacttttgatgcaataagttagacttttactataatga 38542369  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
     ||| || |||||| || ||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||| ||||    
T  38542370 acttattcatttaacatctcatttcatatatttctctcttcgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgcactgaattttg 38542469  T
Q  317 aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||    
T  38542470 aaagtgacatttaaataggaacaaaatttttctccaaaaaagacgattaaaaaggaacggag 38542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 382
Target Start/End: Original strand, 55147044 - 55147320
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcg-acattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |  | ||||||    
T  55147044 tactacctccgttcttttttaattgtcattttttttacattttacataaaccaagacaattaataattgttattacttttgatgcaataagctatacttt 55147143  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||| | ||| |||| || |||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  55147144 tactgtaatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataagtaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 55147243  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||  ||||||| ||||    
T  55147244 attgaactttgaaagtgacagttaaatgaaaacaaaaaatttctccaaaaaagacacttaaaaaagaacggaaggag 55147320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6195284 - 6195049
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  6195284 tactacctctgttcctttttaattgtcactttttgacatttttcacaaaccaagacaatccataattgctactacttttgatgcaataagttatactttt 6195185  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  6195184 actatgatgaccttgtttatttaacatctcatttcatatatttatctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 6195085  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  6195084 ttgaactttgaatgtgacagttaaataggaacaaaa 6195049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34361276 - 34361039
Alignment:
Q  147 tttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatattt--caattgat 243  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  || || ||    
T  34361276 tttacacaaactaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgttttcatttttactataatggtcttattaatttaatatttttcatttcat 34361177  T
Q  244 atgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaat 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  34361176 atgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatatcggtaaaa---catttaatgttgcattgaattttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaa 34361080  T
Q  344 ttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  34361079 atttctctaaaagtgacaattaaaaagaaacggagggagta 34361039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 378
Target Start/End: Original strand, 53691678 - 53691909
Alignment:
Q  148 ttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatg 246  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||    
T  53691678 ttacacaaaccaagacaatcaataaatgatactacttttgatacaattgttattacttttactataatgaccttgttaatttaatattttatttcatatg 53691777  T
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||   || |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||    
T  53691778 tttctctttccacaataaatatttaagggtaatattgataaaacaacatttaatgatgtattgaactttgaaagtgacagttaaattggaacaaaaaatt 53691877  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  53691878 tctctaaaagtgacaattaaaaaggaacggag 53691909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 349
Target Start/End: Original strand, 26620332 - 26620577
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||  || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||    
T  26620332 aattactaactccgttcctttttaattgtcacattttgacattttgcacaaaccaaaacaaacaacaattgatactacttttgatgcaataagctatact 26620431  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||||||| ||| || |||| ||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  26620432 tttattataatgaccttattaatttaatatctcatttcatatatttatttatccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgtt 26620531  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26620532 gcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttct 26620577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 31861970 - 31862247
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||| || |||||||| |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||  | || |||||||    
T  31861970 tactatctccgttcctttttaattgttattttttgaaattttacacaaactaagataatcaataattgttactacttttgatgcaaaaaattatactttt 31862069  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  31862070 actataatgaccttattcatttaacatatcatttcatatatttctttctccgcaataaataaataaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 31862169  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  31862170 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 31862247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35231947 - 35231679
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||||||    
T  35231947 tacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaattaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatacttttact 35231848  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| | || || ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  35231847 ataatgactttattcatttaatattttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattg 35231748  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||  ||||||||    
T  35231747 aactttgaaagtgacggttaaataaaaataaaatttttctccaaaaatgatacttaaaaaagaacggag 35231679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 384
Target Start/End: Original strand, 52677222 - 52677406
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52677222 tacttttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaa 52677321  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
      |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52677322 tgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 52677406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Original strand, 35381418 - 35381634
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| || |||||||||||||||    | | || |||||||| ||| ||| ||||     
T  35381418 tttttaattgtcacattttgacattttacataaattaagatagttaatgattgttactacttttgat----taagttgtacttttattataatgacctta 35381513  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35381514 ttcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattagtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagt 35381613  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  35381614 gacaattaaatagaaacaaaa 35381634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37502266 - 37502004
Alignment:
Q  124 ttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||  |||| |    
T  37502266 ttttgattgtcactttttgacattttatacaaaccaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaataatttatacttttactataataaccttat 37502167  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga-actttgaaagt 321  Q
    | |||||||||| || || |||| ||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  37502166 tcatttaatattacatttcatatatttatctctccataataaataactaagggtaatattgataaaacaacatttaatgttgcattgaccctttgaaagt 37502067  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||  ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37502066 gacggttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 37502004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16664481 - 16664224
Alignment:
Q  128 aattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaat 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||||||| ||| |||| || ||    
T  16664481 aattgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatacttttactataatgaccttattcat 16664382  T
Q  227 ttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaa 326  Q
    ||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||      
T  16664381 ttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatactggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgaccg 16664282  T
Q  327 ttaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16664281 ttaaatagggacaaaatatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 16664224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48782462 - 48782183
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| |    ||||    
T  48782462 aattattacatccgttcatttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataagcaatact 48782363  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  48782362 tttactataatgaccttattcatttaatatct-atttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgtt 48782264  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||| |  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  48782263 gcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttatccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggagta 48782183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33084726 - 33084461
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattat 214  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| |||  ||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| ||    
T  33084726 tccgttcctttttaattgtcactttttgacattttacagaaaccaat-caat-aat--tgttactacttttgatgcaataagttatacttttactataat 33084631  T
Q  215 ggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactt 314  Q
    | |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  33084630 gaccttatttatttaacatctcatttcatatatttctctctccgcaacaaataactaaagataatattggtaaaacaacatttaatgttgtattgaactt 33084531  T
Q  315 tgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  33084530 tgaaagtaacagttaaataagaacaaaaagtttcttcaaaagagacacttaaaaagaaacggagggagta 33084461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 39683698 - 39683975
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | || ||||    
T  39683698 tactacctccgttcctttttaattatcacattttcacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatattttt 39683797  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| | |  ||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||| |||||||  ||||||  |||||    
T  39683798 agtataacgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgtaataaataactaaggacaatattgataaaacaatatttaatgttgca 39683897  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  39683898 ttgaactttaaaagtgacagttaaatagaaacaaaatttttctacaaaaatgacacttaaaaaagaacggaaggagta 39683975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 379
Target Start/End: Original strand, 23719768 - 23720040
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  23719768 tactacctccgttcctttttaattgttattttttgacattttacataaactaagacattcaataaatattactacttttgatacaataatatatactttt 23719867  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||||||  || |||| ||||| ||||| ||||||||    |||  |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  23719868 actataataaccttattcatttaatatttcttttcatatatttctttctccacaataaatgagcaagaataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 23719967  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  23719968 ttgaacttcgaaagtgacagttaaacaggaacaaaaaatttctctaaaagtgacacttaaaaaggaacggagg 23720040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 384
Target Start/End: Original strand, 5374336 - 5374611
Alignment:
Q  110 ctacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | || ||||||    
T  5374336 ctacctccgtttctttttaattgtcatattttgacattttatacaaatcaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatatttttac 5374435  T
Q  209 tattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    ||| |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  5374436 tataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcatt 5374535  T
Q  309 gaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    || |||||||||| ||| ||||| |  |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  5374536 gagctttgaaagtgacagttaaacaagaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggagta 5374611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 42629577 - 42629323
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | |||| ||||| |    
T  42629577 tactacatccgttcgtttttaattgtcattttttgatattttacacaaaccaagacaatcaataaatgttactacttttggtacagtaatttatacttgt 42629478  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||  || ||||| || |||||||||||   || |||  |||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||  |||||    
T  42629477 actaaaatagcctttttcatttaatattttgtttcataaatttctctctccgcattaaataattaagggtaatattgataaaacaaaatttaatgttgca 42629378  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgaca 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  42629377 ttgaactttgaaagtgacaattaaattgaaataaaaaatttctctaaaaatgaca 42629323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12252352 - 12252083
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| | || |||||||    
T  12252352 tactacctccgttcctttttaactgtcatattttgacattttacataaatcaagacaatcaacaattgataatacttttgatgcaataagttatactttt 12252253  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||| | | || |||| ||||          ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  12252252 actataatgactttattcatttaatatcttatttcatatatttcat--------ataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 12252161  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12252160 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 12252083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39671588 - 39671308
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | ||||    
T  39671588 aattactacctccgttcctatttaattgtcacattatgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagctatact 39671489  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||| |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||  |||||||  ||    
T  39671488 tttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctttctctgcaataaataattaaggacaatattggtaaaactacatttaatgtt 39671389  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||  |||| ||||| |||  | ||||||||| |||||    
T  39671388 gcattgaactttgaaagtgacagttaaataagaacaaaaaatttctccaaaagtgacaattatgaaggaacggagagagta 39671308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 384
Target Start/End: Original strand, 53125240 - 53125499
Alignment:
Q  126 ttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgtta 224  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||  ||| | || |||||||||||| ||| |||| ||     
T  53125240 ttaattgtcatattttgacattttacacaaaccaagataatcaataattgttactattttttatgcaataagttatacttttactataatgaccttattc 53125339  T
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||| | | || |||  ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |     
T  53125340 atttaatatcttatttcatacatttctttctccgcaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatttaatgttgcattgaactttgaaagtgaa 53125439  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | ||||||||||||||||   ||||  ||||  |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  53125440 agttaaatagaaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaggaacggatggagta 53125499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 55935369 - 55935090
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||  |||||    
T  55935369 attactacctccgttcctttttaactgtcactttttgatattttacacaaatcaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataattcatactt 55935270  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || |||||  | ||||||||| | | || || | |||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||    
T  55935269 ttactataatagccttagtcatttaatatcttatttcatgtatttctctctccataataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttg 55935170  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  55935169 cattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaaataacacttaaaaaggaacggatggagta 55935090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 4201311 - 4201579
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | |||           |||| ||  ||| | || |||||    
T  4201311 aattactacttccgttcgttttcaattgtcacattttgacattttacataaaccaatatagtcaat-----------tttttatgcaataagttgtactt 4201399  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  4201400 ttactataatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttatctctccgcaataaataattaaggataatattagtaaaacaacatttaatgttg 4201499  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  4201500 aattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 4201579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 384
Target Start/End: Original strand, 26933790 - 26934032
Alignment:
Q  142 gacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaatt 240  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||  |||| ||  |||||||||||| ||    
T  26933790 gacattttacacaaaccaaaacaatcaataaatgttactacttttgacacaataattgatacttttactataatatccttattc-tttaatatttcattt 26933888  T
Q  241 gatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
     |||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||    
T  26933889 catatatttctctctctgcgataaataactaagggtaatattgataaaacaacatttaaagttgcattgaactttaaaaatgacagttaaattgaaacaa 26933988  T
Q  341 aatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||  |||||  |||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  26933989 aaaatttctccaaaaataacgcttaaaaaggaacggagggagta 26934032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52061820 - 52061546
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||    
T  52061820 attactacctccgttcctttttaattgtcatattttgacattttacacaaatcaagacaatcaatcattgttactacttttgatgcaataagttatactt 52061721  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| | || || ||||||||| | | || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||    
T  52061720 ttactataatgactttattcatttaatatcttatttcatatatttttctctccgcaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatttaatgttg 52061621  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |     ||||||||||| | ||||||||| ||  ||||    |||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  52061620 c-----actttgaaagtgataattaaataaaacaaaaaaaaatcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 52061546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 368
Target Start/End: Original strand, 52257778 - 52258036
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |  || | ||| ||| |||| ||||||||||    
T  52257778 tacctccgtttctttttaactgtcactttttgacattttacataaactaagacactcaataaatgttattttttcttatacaataatttatacttttact 52257877  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || || |||||  | ||||||||| | | || |||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  52257878 ataatagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttttctctccgcaataaataactaaagataatgttggtaaaacaacatttattgttgcattg 52257977  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||  |||||||||| ||||||    
T  52257978 aactttgaaagtgacagttaaatagaaataaaaaatttctcaaaaaatgacacttaaaa 52258036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 347
Target Start/End: Original strand, 26906380 - 26906613
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||| || ||||| || ||| | || ||||||| ||  ||| | || |||||||||| | |    
T  26906380 tccgttcatttttaattgtcatattttgatattttacacaaactaaaacaatcaacaattgatattactttttatgcaataagttatacttttactttaa 26906479  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    || |||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||     
T  26906480 tgaccttattaatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaataatattagtaaaacaatatttaatgttgcattgaacc 26906579  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26906580 ttgaaagtgacagttaaataaaaacaaaattttt 26906613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 19527204 - 19527469
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||| ||| |  | || ||||    
T  19527204 tactccctcctttcctttttaattgtcacattttgacgttttacacaaaccaagataatcaacaattgatactacttttgatacaataagctataatttt 19527303  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||| |||| |            |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  19527304 actataatgaccttattcatttcatatat------------ttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 19527391  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  19527392 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggagta 19527469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Original strand, 23623601 - 23623753
Alignment:
Q  229 aatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaatt 328  Q
    ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  23623601 aatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaatacttaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagtt 23623700  T
Q  329 aaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  23623701 aaatagtaacaaaaattttctcaaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggga 23623753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34464531 - 34464276
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| | |||  || ||||| |||||| | || ||||||||||  ||| |  | |||||||| |||     
T  34464531 ctccgttcctttttaattgttacattttgatattttatacaaattaaaacaatcaataattgatattacttttgatgcaataagctatacttttaatata 34464432  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    ||| |||| || ||||||||||| | || |||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34464431 atgaccttattcatttaatattttatttcatatatttatctcttcacaataaataactaatgataatattgataaaacaacatttaatattgcattgaac 34464332  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    | ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  34464331 tatgaaagtgacagttaaataggaacaaattttttcttcaaaaatgacacttaaaa 34464276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47428779 - 47428512
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    |||| ||     || |||||||  ||| | |  ||||||||    
T  47428779 tactacatccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacataaatcaaga----taatcat-----tatttttgatgcaataagtaatactttta 47428689  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||| | || || ||||||||| ||| || |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  47428688 ctataatgacattattcatttaatatctcatttcatatatttatttctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcat 47428589  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  47428588 tgaactttgaaagcgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttataaaggaatggagggagta 47428512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36292842 - 36292672
Alignment:
Q  142 gacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaatt 240  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||||| ||    
T  36292842 gacattttacactaaccaaaacaatcaataaatgttactactttcgatacagttatttttacttttattataattgtcttattaatttaatatttcattt 36292743  T
Q  241 gatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaa 311  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36292742 catatgtttctctctccgcattaaatatctaaaagtaatattgataaaacaacatttaatgttgcattgaa 36292672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 342
Target Start/End: Original strand, 52057433 - 52057670
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||   |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| |||  ||  ||||    
T  52057433 aattactacctcccttcctttttaactgtactattt-gacattttacacaaaccaatccaatcaataaatattactacttttgatacaatacttcatact 52057531  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||   ||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||  ||    
T  52057532 tttactataataatcttatttatttaatatttcattttatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattgataaaataacatttaatttt 52057631  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  52057632 gcattgaactttgaaagtgacagttaaattgaaaaaaaa 52057670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 55703179 - 55702945
Alignment:
Q  109 actacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||| | || || |||||    
T  55703179 actatctccgttcctttttaattgtcatattttgacattttacatataccaagacaatcaataattgttattacttttgatgcaataagttatattttta 55703080  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| | | |||| || ||||| ||| | | || |||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||||  |||||||||  ||||||    
T  55703079 ctataacgaccttattcatttattatcttatttcatatatttctctctctgcaataaataattaagggtaatattaataaattatcatttaatgttgcat 55702980  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  55702979 tgaactttgaaagtgatagttaaataaaaacaaaa 55702945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40412203 - 40411970
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||  |||| | ||||| |||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| | || || ||||    
T  40412203 tactacctatgttcctatttaactgtcattttttgacattttacataaattaagacaattaataattgttactatttttgatgtaataagttatattttt 40412104  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||  || ||    
T  40412103 actataatgaccttattcatttaacatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataattaaggataatattgataaaacaatatttaatgttaca 40412004  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  40412003 ttgaactttgaaaatgacagttaaataggaacaa 40411970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 355
Target Start/End: Original strand, 36659411 - 36659659
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||  || |||| ||  ||| | || | |||||    
T  36659411 tactacctccgttccttcttaattgtcattttttgacattttacacaaatcaagacaatcaataattgtttttatttttaatgcaataagttatgctttt 36659510  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | ||||| || ||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| || |||||||  |||||    
T  36659511 actataatgacattgtttatctaacatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaataatattaataaatcaacatttaatgttgca 36659610  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaa 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  36659611 ttgaactttgaaagtaacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaa 36659659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19399795 - 19399569
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | || | ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||    
T  19399795 attactacctccgtttctttttaactttcgctttttgacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatactt 19399696  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||| ||| || |||||  ||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  19399695 ttaatataatagccttagtaatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaac-tttattattg 19399597  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaat 332  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19399596 cattgaactttgaaagtgacagttaaat 19399569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27492502 - 27492344
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatat-ctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaa 323  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  27492502 atttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaattgactaagcataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtga 27492403  T
Q  324 caattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  27492402 cagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggag 27492344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 385
Target Start/End: Original strand, 8741701 - 8741886
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||| ||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  8741701 tacttttattataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttcactctccacaataaataactaaagataatattggtaaaacaacatttaa 8741800  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| |||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8741801 tgttgtattgaactttgaaaatgacagttaaatatgaaccaaatttttcttcaaaattgacacttaaaaaggaacagagggagtac 8741886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41415174 - 41414991
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| || | |||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  41415174 tacttttactataatagtcttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccataataaatagctaagggtaatgttggtaaaacaacatttat 41415075  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  41415074 tgttgcattgaactttgaaagtgacaattaaatagaaacaaaa-atttcttcaaaaatgacacttaaaaagaaacggagagagta 41414991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32239541 - 32239383
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    |||||||||| || || |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  32239541 atttaatatt-catttcatatatttctttctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgcattgaactttaaaagtgac 32239443  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||||||  ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32239442 agttaaatatgaacaaaatttttctccaaaagtgacatttaaaaaggaacggagggagta 32239383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 291
Target Start/End: Original strand, 33755013 - 33755197
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || || || |||| ||||| ||  ||| |  | |||||    
T  33755013 attactacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacataaactaagacaatcaacaattgatactccttttaatgcaataagctatactt 33755112  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaaca 291  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33755113 ttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatt--tctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaaca 33755197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36750319 - 36750160
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||    
T  36750319 atttaatatttcatttcatatatttgtctctccacaataaataagtaagattaatattggtaaaacaacatttaatattgtattgaacttcgaaagtgac 36750220  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  36750219 agttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacagaggaagta 36750160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47094006 - 47093795
Alignment:
Q  173 tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaa 272  Q
    |||| |||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||  ||| ||||||||| || ||| || |||| ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  47094006 tgtttctacttttgatgcaataagttatacttttactataatgatcttattaatttaacatatcattttatatatttctctcttcgcaataaataacaaa 47093907  T
Q  273 ggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatgga 372  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  47093906 ggataatattggtaaaacaacatataatgatgcattgaactttgaaagtgacggttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagtgacacttaaaaagga 47093807  T
Q  373 acggagggagta 384  Q
    | ||||| ||||    
T  47093806 atggaggaagta 47093795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 54231797 - 54231607
Alignment:
Q  110 ctacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttac 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||||    
T  54231797 ctacctccgttcctttttaattgtcattttttgacattttacacaaatcaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatacttttac 54231698  T
Q  209 tattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  54231697 tataatgaccttattcatttaacatctcatttaatatatttctctttccataataaataactaaggataatattagtaaaataacatttaa 54231607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 311
Target Start/End: Original strand, 44176576 - 44176777
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||| |    
T  44176576 tacctccgtttctttttaattgtcactttttaacattttacataaaccaaaacatttaataaatattactacttttgatacaataatatatacttttatt 44176675  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||  | || || ||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||   |||  ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  44176676 ataataactttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccacaataaataagcaagaataatattggtaaaacaaaatttaattttgcattg 44176775  T
Q  310 aa 311  Q
    ||    
T  44176776 aa 44176777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Original strand, 37551767 - 37551926
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||  || | |||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  37551767 atttaatatttcatttcatatgtttctctctctgcaataaataaccaagggtaataaaggcacaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgac 37551866  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||| |||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37551867 acttaattagaaacaaaaaatttctacaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 37551926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51347387 - 51347240
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  51347387 atatgtttttctctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttacattaaactttgaaagtgacagataaataggaacaaa 51347288  T
Q  342 a-----tttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |     ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  51347287 atattttttttctttaaaagtgataattaaaaaggaacggaaggagta 51347240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17978258 - 17978115
Alignment:
Q  171 aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatct 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||     ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17978258 aatgttactacttttg-taaaattatttttacattcactataatggctttattaatttaatatttca-----tatgtgtctctctccgcattaaatatct 17978165  T
Q  271 aaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  17978164 aagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttg-attcaactttgaaagt 17978115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Original strand, 19731425 - 19731523
Alignment:
Q  176 tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaagg 274  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19731425 tactacttttgatacacttgtttttacttttactataatgaccttattaatttaatatttcatttcaaatgtttctctctccgcaataaatatctaagg 19731523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 384
Target Start/End: Original strand, 33755223 - 33755343
Alignment:
Q  264 aatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagt 363  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| |    
T  33755223 aataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaagagaaataaaaattttctctaaaagtgacact 33755322  T
Q  364 taaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  33755323 taaaaaggaacgaagggagta 33755343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18781721 - 18781514
Alignment:
Q  126 ttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgtta 224  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||  ||| ||||||||||  ||| |  | |||||||| ||| ||  |||| ||     
T  18781721 ttaattgtcatttttcgacattttacacaaattaagataatcaataattattattacttttgatgcaataagatatacttttattataattaccttattc 18781622  T
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    | ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  18781621 aattaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaagataatattggtaaaagaatatttaatattgcattgaaatttgaaagtgac 18781522  T
Q  325 aattaaat 332  Q
    | ||||||    
T  18781521 agttaaat 18781514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44549902 - 44549668
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||  || || |||||| ||||| ||| || || ||||||  ||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  44549902 tactacctccgttcctttt-aattatcactgtttgatattttatataaatcaaaacgatcaataattattactacttttgatacaataagttatactttt 44549804  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  44549803 attataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctcttcgcaataaataactaagaataatattgataaaacagcatttaatgttgca 44549704  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    || |||||||||||  ||| |||||||  |||||||    
T  44549703 ttaaactttgaaagcgacagttaaataataacaaaa 44549668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18091503 - 18091225
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| | |||  || | ||||||||||||  ||| | || |  |||    
T  18091503 ttactccctccgttcttttttaattgtcacattttgactttatacacaaaccaagacactaaatgtatttcactacttttgatgcaataacttatgtttt 18091404  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
     | ||| ||  ||||  | |||||||||   | || |||| |||||||||| |||||||||  ||||||  | ||| || | ||||||||||||  || |    
T  18091403 aattataatatccttaattatttaatatcatatttcatatatttctctctctgcaataaattactaagggcattataggaagaacatcatttaatgttac 18091304  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  18091303 attgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaaatttctgtaaaagtgacagttataaaggaacggaggtagta 18091225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9834406 - 9834246
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||| |  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  9834406 atttaatatctcatttaatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatatatgtaaaataagatttaatgttgcattgaactttaaaagtgac 9834307  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    | |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  9834306 agttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaactgagggagtac 9834246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29511306 - 29511199
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||  || | ||||    
T  29511306 aattactacctccgttcatttttaattgtcaccttttgacattttacataaaccaagaaatttcataaatgttactacttttgatacaacaatgtatact 29511207  T
Q  204 tttactat 211  Q
    ||||||||    
T  29511206 tttactat 29511199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38617941 - 38617806
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  38617941 atatgtttttctctctgcaataaatatataaggataatattgataaaacaatatttaatgttgcattaaactttgaaagtgacaattaaataggaacaga 38617842  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
       ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  38617841 tagtttctctaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 38617806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 314
Target Start/End: Original strand, 47884988 - 47885179
Alignment:
Q  125 tttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  47884988 tttaattgtcacattttgacattttacacgaaccaaaacaatcaataattattattacttttgatgcaataagtttgacttttactataatgaccttatt 47885087  T
Q  224 a-atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactt 314  Q
      ||||||||| | | || |||| ||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  47885088 tcatttaatatcttatttcatatatttctctctctccaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatttaatgttgcattaaactt 47885179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34603749 - 34603607
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||| || ||| |  |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  34603749 atatatttctctctctgcaataaattactaagggtattatagaaaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaa 34603650  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |  ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  34603649 aaatttctgtaaaagtgacagttataaaggaacggagggagta 34603607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 385
Target Start/End: Original strand, 18135049 - 18135312
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttacta-cttttgatagaattatttttacttttactattatggcctt 220  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  18135049 tttttaattgtcatattttgacattttacacaaaccaaaacaatcaataaatattactattttttgatacaataatttttatttttactataataacctt 18135148  T
Q  221 gttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg-aaa 319  Q
     || ||||||||||||| |  |||| ||||||||||   ||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| || |||    
T  18135149 atttatttaatatttcattacatatatttctctctctataat-aataaataagggtaatattagtaaaataacatttaatgttgcattgaactatgtaaa 18135247  T
Q  320 gtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    || ||| |||||| ||||  || ||||| |  ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18135248 gtgacacttaaat-gaaaacaattttttttacaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagtac 18135312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39309175 - 39308914
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||  |||| | |||| |||||| ||| ||| |||| |  |||| |||| ||  ||||      
T  39309175 tttttaattgtcatattttgactttttacataaactaagataacaaatacttttaccacttttaatataataatttatctttttcctataataaccttaa 39309076  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    |||||||||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||   | ||||| ||||| ||| |     
T  39309075 taatttaatacttcatttcatatatttctctctctgcaataaatatataaggataatataggtaaaactacatttaatgatacattgtactttaaaaatt 39308976  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||| |  |||||||| | ||| || |||||  ||||||||    
T  39308975 acagttaattagaaacaaaaattttatgcaaaaatgataattataaaggaacaaagggagta 39308914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 379
Target Start/End: Original strand, 47596604 - 47596869
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| ||| | || | ||||| | || |    
T  47596604 tccgttcctttttaattgtcattttttgacattttacacaaaccaataaagtcaataaatgttactacttttgatacaataaattatccttttccaataa 47596703  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    |  |||| || ||||||||| |   || |  | ||||| |||||| ||||||||  ||||  |||||||| |||||||  | | || |||||||||||||    
T  47596704 taaccttattcatttaatatattgtttcaattatttctgtctccgtaataaataattaagagtaatattgataaaacaatactcaatattgcattgaact 47596803  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| |||||| | ||||||||    
T  47596804 ttgaaaatgacaattaaatagaaacaaaaattttctacaaaagagacacttaaaaagaaacggagg 47596869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49089166 - 49089045
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||   |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  49089166 tactacctccgttcctttttaattgtcactttttgatattttactcgaaccaagacaatcaataaatattactacgtttgatacaattgttattactttt 49089067  T
Q  207 actattatggccttgttaattt 228  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  49089066 actataatgaccttgttaattt 49089045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 385
Target Start/End: Original strand, 49122259 - 49122522
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttacta-cttttgatagaattatttttacttttactattatggcctt 220  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  49122259 tttttaattgtcatattttgacattttacacaaaccaaaacaatcaataaatattactattttttgatacaataatttttatttttactataataacctt 49122358  T
Q  221 gttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg-aaa 319  Q
     || ||||||||||||| |  |||| ||||||||||   ||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| || |||    
T  49122359 atttatttaatatttcattacatatatttctctctctataat-aataaataagggtaatattagtaaaataacatttaatgttgcattgaactatgtaaa 49122457  T
Q  320 gtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    || ||| |||||| ||||  || ||||| |  ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49122458 gtgacacttaaat-gaaaacaattttttttacaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagtac 49122522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 390
Target Start/End: Original strand, 37394306 - 37394426
Alignment:
Q  270 taaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaat 369  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||| ||     
T  37394306 taagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaaatgacatttagaaa 37394405  T
Q  370 ggaacggagggagtacatgat 390  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  37394406 ggaacggagagagtatatgat 37394426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30151932 - 30151697
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| | |||  | |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||  || |   |||||    
T  30151932 tactactttcgttcatttttaattgtctctttttaatattttacacaaaccaagacattcaataaatgttactgcttttgatacaacaatatactctttt 30151833  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || ||||| || ||| ||||||| | || |||| ||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||     
T  30151832 actataatagccttattcattcaatatttaatttcatatatttctctatgcgcaataaataagtaaggataatattgataaaacaacatttaatgttgcg 30151733  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||| |||| | ||| |||||||  |||||||    
T  30151732 ttgaacttcgaaaatgacagttaaataagaacaaaa 30151697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31370062 - 31369835
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   ||||||    
T  31370062 ttactacctccgtttctttttaagtgtcactttaagacattttacacaaaccaatacattcaataaatgttattacttttgatagaacaatgcatacttt 31369963  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||  |||| ||  ||||||   | | || |||  |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  31369962 tactataataaccttatttgtttaatcactaacttcatacatttctctctccgtaataaataagtaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgc 31369863  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaata 333  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  31369862 attgaacttcgaaaatgacagttaaata 31369835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36750774 - 36750539
Alignment:
Q  143 acattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattg 241  Q
    |||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| || || |||||| || |||||  | ||||||||| | | ||     
T  36750774 acattttacacaaactaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatatttgtactataatagccttaatcatttaatatattatttt 36750675  T
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||     
T  36750674 atatatttctctctccgcaataaataattaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttgtaagtgacagttaaataagaacaat 36750575  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
     ||||| |  |||||| ||| |||||| ||||||||    
T  36750574 ttttttttccaaaaataacacttaaaaaggaacgga 36750539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47751790 - 47751519
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||| |||||||| ||| |||  |||||||    
T  47751790 tactacctcagttcctttttaattgtcactttgtgacattttacacaaaccaaaataatttataaatgttactatttttgatacaataattgatactttt 47751691  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || |  || || ||||||||| ||| || | || |||||||||||||   ||||| |||||| ||| |||| |||||   |||||||  |||||    
T  47751690 actataatagttttattcatttaatatctcatttcagatatttctctctccgc---aaataactaagggtaacattgataaaa---catttaaagttgca 47751597  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||| || || ||| | ||| |||||| | |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  47751596 ttg-accttaaaaatgacagttaaattggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaaggagtac 47751519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 48509852 - 48510130
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||  |||| |  |||    
T  48509852 attactccctctattcctttttaattgtcacattttgactttttacataaatcaagacaacaaatatttttactacttttgatacaaaaatttatcattt 48509951  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    | |||| ||   |||  | |||||||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||| ||||  |||||| |||||| |  |||||||   | |    
T  48509952 ttctataatattcttaatcatttaatacttcatttcatatatttctctctatgcaataaatatataagagtaatataggtaaagccacatttaatgatac 48510051  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||   ||| |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||||| ||| || | |||||||||||||    
T  48510052 attgaactttgaaaacgacagttaattaaaaacaaaatctttatgcaaaagtgacaattataaagaaacggagggagta 48510130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23237883 - 23237673
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |  ||||| || ||| | |||||||||||||   || |  | |||||||||||| |    
T  23237883 tccgttcctttttaattgttacattttaacattttacacaaactagaacaatcaacaattgatactacttttgatgcgataagctatacttttactataa 23237784  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttct---ctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga 310  Q
    || |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| |   ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  23237783 tgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttataatctctccgcaataaataattaaggacaatattggtaaaataacatttaatgttgcattga 23237684  T
Q  311 actttgaaagt 321  Q
    |||||||||||    
T  23237683 actttgaaagt 23237673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 332
Target Start/End: Original strand, 41955775 - 41955883
Alignment:
Q  224 aatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaa 323  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  41955775 aatttaatatttcatttcatatttttctctctctgcaataaatatctaaggataatattgataaaattatatttaatgttgcattgaactttaaaagtga 41955874  T
Q  324 caattaaat 332  Q
    || ||||||    
T  41955875 cagttaaat 41955883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9834540 - 9834482
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9834540 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaat 9834482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 340
Target Start/End: Original strand, 29833045 - 29833143
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  29833045 atatatttctctctccgcaataaataaccaacgataacattggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttaaaagtaacagttaaataggaacaa 29833143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 41813726 - 41813620
Alignment:
Q  283 ggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |  |||| | ||| |||||| |||||||||| ||    
T  41813726 ggtaaaacaacatttaatattgcattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaattttatgcaaaagtaacaattaaaaaggaacggaggtag 41813627  T
Q  383 tacatga 389  Q
    || ||||    
T  41813626 tatatga 41813620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20087296 - 20087187
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||  ||||    
T  20087296 tttctctctccgcaataaataaataagaataacattaataaaacaacatttaacattgcattaaactttataagtaacagttaaataggaacaatttttt 20087197  T
Q  347 tctttaaaaa 356  Q
    | ||||||||    
T  20087196 tttttaaaaa 20087187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45725796 - 45725563
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| || | | | ||||| ||||||||||||||||| ||| | || |  ||||    
T  45725796 tactacctccgttcctttttaattgtcattttttgacattttacacaaacaaataaagtcaataaatgttactacttttgatacaataaattatcatttt 45725697  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     | || ||  |||  || ||||||||| |   || |  | |||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||| ||||| |  |||||| ||||||    
T  45725696 ccaataataacctcattcatttaatatcttgtttcaattatttctctctctgtaataaataattaaggataatattgataaaataatatttaatattgca 45725597  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  45725596 ttgaactttaaaaatgacaattaaatagaaacaa 45725563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14090502 - 14090242
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| | |||  || | ||||| ||||||| ||| | || |  ||    
T  14090502 attactccctctgttcttttttaattgtcacattttgattttttacacaaactaagacactaaatgtatttcactacatttgatacaataacttgtgttt 14090403  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    |  |||| ||  ||||  | |||||||||   | || |||| |||||||||| |||||||||  |||||| || ||| |  |||||| |||||||  ||     
T  14090402 tgcctataatatccttaattatttaatatcatatttcatatatttctctctctgcaataaattactaagggtattatagaaaaaacaacatttaatgtta 14090303  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagtta 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  14090302 cattgaactttgaaagtaacagttaattataaacaaaaaatttctataaaagtgacagtta 14090242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 383
Target Start/End: Original strand, 56499611 - 56499874
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||| || |||||| |||||||| ||  |||| |  |||| |||| || ||| |     
T  56499611 tttttaattgtcaccttttgactttttacacaaaccaagacaacaaatacattttactatttttgatacaacaatttatctttttcctataatagcccta 56499710  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgttt--ctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaa 319  Q
     | ||||||||| ||| || |||| |||  ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||  | |||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  56499711 atcatttaatatctcatttcatatatttttctctctctgcaataaataaataagggtaatataagaaaaacaacatttaatgttgtattaaactttgaaa 56499810  T
Q  320 gtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagt 383  Q
    || ||| |||| |||||||||||  |||||  |||| ||| | |||||| ||||| || |||||    
T  56499811 gtgacagttaattagaaacaaaaaatttctgcaaaagtgaaaattaaaagggaacagaaggagt 56499874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3802302 - 3802143
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||||| | || ||||  |||||||||  |||||||||   |||| |||||  |||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  3802302 atttaatattttatttcatatacttctctctctacaataaataatcaagggtaataaaggtaaaacaatatttaatgttacattgaactttgaaagtgac 3802203  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
      |||| |||||||||||  ||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3802202 ggttaattagaaacaaaaaatttatgcaaaaatgacaattaaaaaggaacggagggagta 3802143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17698642 - 17698551
Alignment:
Q  293 catttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||||    
T  17698642 catttaatgttgcattgaactttaaaagtgacaattaaatagaaacaaaaaatttcttcaaaaacgacactaaaaaaggaacagagggagta 17698551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 281
Target Start/End: Original strand, 51654855 - 51655030
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||| |||| | || |||||||||||| ||  |||| |  |||    
T  51654855 attacttcctctgttcctttttaatcgtcacattttgactttttacacaaaccaaaataataaatactttttctacttttgatacaacaatttatctttt 51654954  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatat 281  Q
    |||| | ||  ||||  |||||||||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51654955 tactgtaataaccttaataatttaatagttcattccatatatttctctctcagcaataaatatataagggtaatat 51655030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3036640 - 3036413
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |   ||| |     
T  3036640 tacctccgttcctttttaattgtcatatttttacattttacataaatcataacaatcaataaatgttattacttttgatacaatgatttatctctttcca 3036541  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || || |  |  || ||||||||| | | || |||| |||||||||    |||||||  |||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||     
T  3036540 ataatagtttcattcatttaatatcttatttcatatatttctctct--ataataaattactaagggtaatatcggtaaaataacatttaatattacatta 3036443  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaaca 339  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3036442 aactttgaaagtgacaattaaatataaaca 3036413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 339
Target Start/End: Original strand, 27654743 - 27654961
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||  |||  || ||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||  |||| |  |||| |||| || || ||     
T  27654743 tttttaattgtcattttttaactttttacacaaactaagacaactaataaattttactacttttgatacaacaatttatcatttttctataatagctttc 27654842  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt-gcattgaactttgaaag 320  Q
     | ||||||||||||| || |||| ||| ||  || |||||||||| |||||| |||||| | ||| |||| |||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  27654843 atcatttaatatttcatttcatatatttatcaatctgcaataaataactaagggtaatatagataacacataatttaatatttgtgttgaactttgaaag 27654942  T
Q  321 taacaattaaatagaaaca 339  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  27654943 tgacaattaaaaagaaaca 27654961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 378
Target Start/End: Original strand, 1180885 - 1181157
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||    
T  1180885 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttaggttttttacacaaaccaagacaacaaatgcattttactacttttgatacaacaatttttcttttt 1180984  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaat-atctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
     |||| ||  ||||  | ||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| | ||  |||||| |||||||  |||     
T  1180985 cctataataacctttctcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgcaataaataatcaaagg-taagaatgccaaaacaacatttaatgttgt 1181083  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaac-aaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    ||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  1181084 attaaactttgaaagtgacaggtaattagaaacaaaaaaatttctgcaaaagtgacaattaaaaaggaacggag 1181157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17698724 - 17698643
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttg 186  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||    
T  17698724 attactaccttcgttcctttttaattgtcatattttgacattttacataaaccaagatagtcaatgattgttactacttttg 17698643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 38009750 - 38010027
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||  || | ||||||||||||| ||| | || |  |||     
T  38009750 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgactttttacacaaaccaagacactaaatgtatttcactacttttgatacaataacttatgttttg 38009849  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     |||| ||  | ||| | |||||||||   | || ||||  || ||||||  ||||||||  ||||||    ||| || |||||| |||||||  || ||    
T  38009850 cctataatatcattgattatttaatatcatatttcatatacttttctctctccaataaattactaagggctttataggaaaaacaacatttaaagttaca 38009949  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||   || | ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  38009950 ttgaactttgaaagtgacagttaattggaaacaaaaaaattatgtaaaagtgacagttataaaggaacggagggagta 38010027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Original strand, 52677150 - 52677215
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat 173  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  52677150 tactacctccattcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaaaacaatcaataat 52677215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 31984151 - 31984259
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | || |||||||||| | ||| ||||     
T  31984151 tttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaacacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatacttttactgtaatgacctta 31984250  T
Q  222 ttaatttaa 230  Q
    || ||||||    
T  31984251 ttcatttaa 31984259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48087823 - 48087681
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||  |||||| || ||| || |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| | | |||| || |||||||    
T  48087823 atatatttttctctctgcaataaattactaagggtattataggaaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgagagttaattaaaaacaaa 48087724  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |  |||   ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  48087723 aaatttaagtaaaagtgacagttataaaggaacggagggagta 48087681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 384
Target Start/End: Original strand, 1391295 - 1391432
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||||  | ||| || |||||| ||||||   || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||    
T  1391295 tttctctctctacaataaattactaaggacattataggaaaaacaacatttagtgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaatttttt 1391394  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | | ||||| |||| |||| || |||||||||||||||    
T  1391395 tttgtaaaagtgacggttataaaggaacggagggagta 1391432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38866146 - 38865887
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||  |||| | ||||||||||||||  ||  |||| |  |||| |||| ||  ||||      
T  38866146 tttttaattgtcatattttgactttttacataaattaagacaacaaatatt-ttactacttttgatgcaacaatttatcttttttctataataaccttaa 38866048  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    | ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||| |||||| || |||||||   || |||| ||||||||| |     
T  38866047 tcatttaatatctcattacatatatttctctctctacaacaaatatccaagggtaatataggtaaa-caacatttaatgatgtattggactttgaaaatg 38865949  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| | || |||||||||||||||| |  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38865948 acagtgaattagaaacaaaatttttatacaaaagtgacaattataaaggaacggaaggagta 38865887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Original strand, 38027559 - 38027611
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaa 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  38027559 tactacctccgttcctttttaattgtcactttttgatattttacataaaccaa 38027611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Original strand, 14949208 - 14949303
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||  | ||| || |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  14949208 tttctctctctgcaataaattactaagggcattataggaaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaaa 14949303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Original strand, 55430405 - 55430564
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    |||||||| || | || |||| ||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||   | || ||||||||||||   ||    
T  55430405 atttaatacttaatttcatatatttatctcttcacaataagtatctaaggataatataggtaaaaccacatttaatgatacaatgaactttgaaaacgac 55430504  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||| |||||||||| ||||| |  |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  55430505 agttaattagaaacaaattttttatgcaaaagtgacaattataaaggaacggagggagta 55430564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27918726 - 27918585
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||| |||| | |||||||| |||| || ||||||| |||  |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  27918726 atatatttctctctttgcaatatataactaatggtaatattgataaa-caacatttaatatttgattgaactttgaaagtgacagctaaatagaaacaaa 27918628  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |  |||||  ||||  || | |||||| |||||||| ||||||    
T  27918627 acatttctacaaaagagatacttaaaaaggaacggaaggagta 27918585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Original strand, 33751327 - 33751385
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat 166  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  33751327 tactatctccgttcctttttaattgttacattttgacattttacacaaactaagacaat 33751385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36409015 - 36408969
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttac 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36409015 aattactacctccgttcctttttaattgtcatattttgacattttac 36408969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 36423181 - 36423135
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttac 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36423181 aattactacctccgttcctttttaattgtcatattttgacattttac 36423135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 8456895 - 8457172
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| | |||  || | ||||||||||||| ||| | || |  |||     
T  8456895 tactccctccgttcctttttaattgtcacattttgactttctacacaaaccaagacactaaatgtatttcactacttttgatacaataacttatgttttg 8456994  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     |||| ||  ||||  | |||||||||   | || |||| |||||||||| |||||||||  ||||||  | |||  | | |||| | |||||  || ||    
T  8456995 cctataatatccttaattatttaatatcatatttcatatatttctctctctgcaataaattactaagggcattataagaagaacaccctttaatgttaca 8457094  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||   |||| ||||| |||| |||| || |||||||||| ||||    
T  8457095 ttgaactttgaaagtgacacttaataagaaacaaaaaaattctgtaaaagtgacggttataaaggaacggaggtagta 8457172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 385
Target Start/End: Original strand, 30151994 - 30152091
Alignment:
Q  288 aacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||| | ||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||    
T  30151994 aacaccatttaatgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaaatttatgtaaaagtgacagttataaaggaatggaggtagtac 30152091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6150813 - 6150677
Alignment:
Q  248 ttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    |||||||||  |||||||||   |||| |||||  || |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||    
T  6150813 ttctctctctacaataaataatcaagggtaataaaggcaaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaaatt 6150714  T
Q  348 ctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |  |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  6150713 atgcaaaagtgacaattaaaaaggaatggagggagta 6150677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8752265 - 8752166
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||  |||| || || ||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  8752265 atatatttctctctccttaataaataactaagggtaatattgctaaaataacatttaatgttgctttaaaatttgaaattgacaatcaaataggaacaaa 8752166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 188
Target Start/End: Original strand, 29832354 - 29832425
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgat 188  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  29832354 gttcctttttaattgtctccttttgacattttacttataccaagacaatcaataattgttacaacttttgat 29832425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37987615 - 37987536
Alignment:
Q  302 ttgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    |||||||||||||| ||| | ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | ||||||||||    
T  37987615 ttgcattgaactttaaaaatgacggttaaataggaacaaaatttttcttcaaaaataacacttagaaagaaacggaggga 37987536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42645506 - 42645395
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | || ||||||||| || |||  |||     
T  42645506 tttttaattatcacattttgacattttacatatactaagataatcaataattgttattacttttgatgcaataagttatacttttaccataatgatctta 42645407  T
Q  222 ttaatttaatat 233  Q
    || |||||||||    
T  42645406 ttcatttaatat 42645395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Original strand, 19740718 - 19740800
Alignment:
Q  302 ttgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||   |||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  19740718 ttgcattgaactttgatagtgacagttaaataagaacaattgttttctctaaaagtgacaattaaaaaggaatggagggagta 19740800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 140
Target Start/End: Original strand, 23621575 - 23621609
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacattt 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23621575 attactacctccgttcctttttaattgtcacattt 23621609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43086545 - 43086397
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||||||  || |||| |||||||||  ||| ||||||   |||| |||||  || |||||| |||||||  ||  |||||||||||||||| ||    
T  43086545 atttaatatttcttttcatatatttctctct--gcagtaaataatcaagggtaataaaggaaaaacaacatttaatgttatattgaactttgaaagtcac 43086448  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    | |||| || ||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43086447 agttaattaaaaataaaaatt--ctgtaaaaatgacaattaaaatggaacgga 43086397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9370216 - 9369954
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||     
T  9370216 tttttaattgtcactttttgacattttacataaaccaagaccattaataagtgttactacttttgatacaattgtttttacttttactataatgacctta 9370117  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  9370116 ttaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatttaagggtaatattgataaaacaacacttaatattgcattgaactttgaaagt 9370017  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  9370016 gacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaaatgacaattaaaaagaaactgagggagta 9369954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43077546 - 43077272
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  43077546 tacctccgttcctttttaattgtcattttttaacattttacacaaaccaagacaatcaataagtgttattacttttgatacaattgttattacttttact 43077447  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  43077446 atattggccttattaatttaatattttatttcatatgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacaatatttaatgttgcattg 43077347  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  43077346 aactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagtgacaattaaaaaggaatagagggagta 43077272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 387
Target Start/End: Original strand, 11222293 - 11222582
Alignment:
Q  100 aaaagaat-tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | |    
T  11222293 aaaagaatatactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagt 11222392  T
Q  198 tttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcattt 297  Q
    | |||||||| ||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11222393 tgtacttttaatataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacattt 11222492  T
Q  298 aacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtacat 387  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11222493 aatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagtacat 11222582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 32854768 - 32855043
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||  ||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32854768 tactacctccgttcctttttaactgtcactttttaacattttaca--aactaagataatcaataaatgttattacttttgatacaattgtttttactttt 32854865  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  32854866 actacaatggccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaacatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 32854965  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  32854966 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaagtgacaattataaatgaacggagggagta 32855043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10812456 - 10812179
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||   || |  | |||||||    
T  10812456 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgccataagctatactttt 10812357  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  10812356 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataattaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 10812257  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10812256 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 10812179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 13849700 - 13849978
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||  | |||||||    
T  13849700 ttactacctccgttcctttttaattgtcattttttgatattttatataaaccaaaacaatcaataaatattattagttttgatacaattgctattacttt 13849799  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||   |||    
T  13849800 tactataatgaccttgttaatttaatatttcatttcatatgtttctctctctgcaataaatatctaaaggtaatattgataaaacaacatttaatgatgc 13849899  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  13849900 attgaactttgaaagtgacagttaaataagaacaaaaaatttctttaaaagtgacaattaaaaagaaacggagggagta 13849978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34357435 - 34357158
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| | ||||| |||||||  ||| | || || ||||    
T  34357435 tactacctccgttcctttttaattgtcacatttcgacattttacacaaaccaagataatcaacaatttatactatttttgatgcaataagttatattttt 34357336  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||| ||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  34357335 actataatgaccttattcatttaatatctcattttatatatttctctttccacagtaaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 34357236  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34357235 ttgaactttgaaagtgacaattaaataggaacaaattttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 34357158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 15182986 - 15183264
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | || |||    
T  15182986 ttactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatatttt 15183085  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  15183086 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgc 15183185  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  15183186 attgaacttcgaaagtgacaattaaatagaaacaaaaaatttctcaaaaagtgacacttaaaaaggaacgaagggagta 15183264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44360693 - 44360456
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||    
T  44360693 aattactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatact 44360594  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||| ||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||  ||    
T  44360593 tttattataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaatatttaagggt-atattgataaaacatcatttaatgtt 44360495  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44360494 gcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 44360456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 14295743 - 14296020
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  14295743 tactacctcaattcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaggtatactttt 14295842  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  14295843 actataatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctcttcgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgta 14295942  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14295943 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 14296020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26342837 - 26342560
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  26342837 tactacctccgttcctttttaattgtcacgttttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 26342738  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  26342737 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 26342638  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26342637 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaaccaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 26342560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 382
Target Start/End: Original strand, 478959 - 479235
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  478959 tactatctctgttcttttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagataatcaataattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 479058  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  479059 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattgataaaacaacatttaatgttgca 479158  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagtt-aaaatggaacggagggag 382  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||    
T  479159 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaaggaacggagggag 479235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3363842 - 3363599
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||    
T  3363842 ttactacctccgttcctttttaattgtcgcattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgatactacttttgatgcaataagctatacttt 3363743  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  3363742 tactataatgaccttattgatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 3363643  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  3363642 attgaactttgaaagtgacagttaaataagaacaaaacttttct 3363599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 386
Target Start/End: Original strand, 15893566 - 15893845
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  15893566 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 15893665  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  15893666 actataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 15893765  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| || || |  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15893766 ttgaactttgaaaatgacagttaaataggaacaaatttattttccaaaattgacacttaaaaaggaacggagggagtaca 15893845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 113 - 375
Target Start/End: Original strand, 30264593 - 30264856
Alignment:
Q  113 cctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactat 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||||||||    
T  30264593 cctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatacttttactat 30264692  T
Q  212 tatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaa 311  Q
     ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  30264693 aatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgtattgaa 30264792  T
Q  312 ctttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  30264793 ctttgaaaatgacagttaaataagaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacg 30264856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 101 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41885889 - 41885605
Alignment:
Q  101 aaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttt 199  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  |     
T  41885889 aaagaaatactacctccgttcctttttcattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctg 41885790  T
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||| | ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  41885789 tacttttactgtaatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaataacatttaa 41885690  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
      |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  41885689 tgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacctaaaaaggaacggagggagta 41885605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13754213 - 13753935
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttt-tactt 204  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||    
T  13754213 ttactacttccgttcctttttaattgtcactttt-gacattttacacaaaccaagacaatcattaaatgttactacttttgatacaataatttactactt 13754115  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  13754114 ttactataatagccttattcatttaatatttcatgtcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatattgataaaacaacatttaatgttg 13754015  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | ||||  ||||  |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13754014 tattgaactttgaaagtgacagttaaattggaacaaaaatgttctccaaaagagacacttaaaaaggaacgaagggagta 13753935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34399461 - 34399182
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||    
T  34399461 attactacctccgttcctttttaattatcacattttgacactttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatactt 34399362  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||    
T  34399361 ttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttg 34399262  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34399261 cattgaactttgaaagtgatggttaaataggaataaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 34399182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 34884523 - 34884801
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||| ||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34884523 ttactaccttcgttcattttaaactgtcactttttgacattttacacaaaccaagataatcaataaatattactacttttgatacaattgtttttacttt 34884622  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| ||| | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||  ||||    
T  34884623 tactataatgaccttattaatttaatgttttatttcatatgtttttctttccgcaataaacatctaaaggtaatattgataaaacaacatttaatgttgc 34884722  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||||||| ||||| | | |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  34884723 aatgaactttaaaagtgaaagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaagtgacagttaaaaaggaacagaggtagta 34884801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 117 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14541579 - 14541311
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatg 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||  ||  ||  |||||||||||| ||     
T  14541579 cgttcctttttaattgtcactttttgacattttatacaaaccaatacaatcaataaatattactacttttgatacgatacttcatacttttactataata 14541480  T
Q  216 gccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaacttt 315  Q
     |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||    
T  14541479 accttattcatttaatatctcattttatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacgtttaatgttgcattgaacttt 14541380  T
Q  316 gaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14541379 gaaagtgacagttaaattgaaacaatatttttctccaaaagtgacatttaaaaaggaacggagggagta 14541311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36375830 - 36375559
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||  ||| |  | || ||||    
T  36375830 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacctttgatgcaataagctataatttt 36375731  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggt--taatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |  || ||||| ||||||| |||||||  |||    
T  36375730 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataaccaagataatactattgataaaacaacatttaatgttg 36375631  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  36375630 cattgaactttgaaagtgacagtcaaataggaacaaaatttttctccaaaaatgacacttaaaaaggaacgg 36375559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37093706 - 37093435
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  37093706 tactccctccgtacctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaattaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 37093607  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||| ||| || |||| ||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  37093606 actataatgac-ttattcatttaatatctcatttcatatatttctctttctgcaataaataactaaggacaatattgataaaacaacatttaatattgta 37093508  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  37093507 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagg 37093435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 382
Target Start/End: Original strand, 25558169 - 25558444
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||| |  |  |||    
T  25558169 aattactacctccgttctttcttgattgttacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaaaaattgatactacttttgatacaataagctagact 25558268  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||  | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||    
T  25558269 tttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcata--tatatctctccgcaataaataactaaggataatattgataaaacaacatttaatgtt 25558366  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  25558367 gcatt-aactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggag 25558444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8443937 - 8443687
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||            |||| ||||||||||    
T  8443937 attactacctctgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaagacaatcaataagtgtac------------aattgtttttacttt 8443850  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggt-aaaacatcatttaacattg 304  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||    
T  8443849 tactataatgaccttattaatttaatatttcatttcatttgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaaacaacatttaa-tttg 8443751  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  8443750 cattgaactttgaaagtgacagttaaatagggacaaaaaatttcttcaaaaatgacaattaaaa 8443687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 35158337 - 35158614
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  35158337 tactacctccgtttctttttaattgtcactttttgacattttacatgaaccaagacattcaataaatattactacttttgatacaataatatatactttt 35158436  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||| | ||  |||| || ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||| || ||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35158437 actgtaataaccttattcatttactatttcatttcatatatttctttctccacagtaaataagcaaggataatattggtaaaacaacatttaatattgca 35158536  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  35158537 ttgaatttcgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacagagggagta 35158614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4654977 - 4654697
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |  |||    
T  4654977 ttactacctccgttcctttttaattgtctcattttgacattttacataaaccaaaatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtgtttt 4654878  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||  ||||    
T  4654877 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatacatttctctctccgctataaataactaaggataatattggtaaaataatatttaatgttgc 4654778  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4654777 attgaactttgcaagtgacagttaaatagaaacgaaaaatttcttcaaaaaagacacgtaagaaggaacggagggagtaca 4654697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13965862 - 13965587
Alignment:
Q  110 ctacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttac 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||  ||| | || | |||||||    
T  13965862 ctacctccgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgtttttacatttgatccaataagttatgcttttac 13965763  T
Q  209 tattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || |||||||  |||||||    
T  13965762 tataatgaccttgttcatttaacatctcatttaatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtatatcaacatttaatgttgcatt 13965663  T
Q  309 gaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||  |||||  ||||  |||| |||||| | || ||||||||||    
T  13965662 gaactttaaaagtaacagttaaatatgaacaaaaaatttctccaaaagagacatttaaaaagtaatggagggagta 13965587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19594607 - 19594329
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | || ||||    
T  19594607 tactacctccgttactttttaattgtcacattttgacattttacacaaacaaagataatcaacaattgatattacttttgatgcaataagctatattttt 19594508  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  19594507 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactatggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 19594408  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19594407 ttgaa-tttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagtaca 19594329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9707045 - 9706784
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||  ||  ||||||    
T  9707045 ttactacccccgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaatacaatcaataaatattactacttttgatacaatatttcatacttt 9706946  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||  |||| || |||| |||| ||| || |||| ||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  9706945 tactataataaccttattcatttgatatctcattttatatatttatctctccataataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 9706846  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9706845 attgaactttaaaagtgacagttaaattaaaac-aaatttttcttcaaaaatgacacttaaaa 9706784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10264010 - 10263780
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  || | || |||||||||||||  ||| |  | |||||||||||    
T  10264010 tacctccgttccttttaaattgtcatattttgacattttacacaaaccaagacaaccaaaattgatactacttttgatgcaataaactatacttttacta 10263911  T
Q  211 ttatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatat-ctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    | ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10263910 taatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataaactaaggataatattggtaaaacaacatttaatattgcattg 10263811  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
    || ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  10263810 aaatttgaaagtgacagttaaataggaacaa 10263780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 11560030 - 11560310
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | ||||    
T  11560030 aattactatctctgttactttttaattatcacattttgacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgtaataagctgtact 11560129  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||   ||| || ||||||||| ||| |  |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  11560130 tttactataattatcttattcatttaatatctcattgcatatatttctctcttcacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgtt 11560229  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| | | |||||||||||||    
T  11560230 gcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaattttctccaaaactgacacttaagaagaaacggagggagta 11560310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 15677282 - 15677554
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||    || ||||||||||||| || | || |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  15677282 ttactaccttcgttcctttt-aattgtcacattttgacat----cacaaaccaagacaatcaacattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 15677376  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| ||| |||| || |||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |  ||||||  |||||    
T  15677377 attataatgaccttattcatttaatatcacatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattgataaaataatatttaatgttgca 15677476  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  15677477 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaaatgacacttaaaaaataacggagggagta 15677554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4883862 - 4883612
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |   ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||    
T  4883862 attactacatccattcctttttaattgtcacattttgacattttacataaactaatatagccaatgattgttactacttttgatgtaataagttgtactt 4883763  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||    
T  4883762 ttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgcaataaataactaaagataatattggtaaaacaacatttaatgttg 4883663  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaa 355  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  4883662 cattgaactttgaaaatgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaa 4883612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13215650 - 13215373
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| || | || ||||    
T  13215650 tactacctccgttcctttttaattgttactttttgacattttacacaaaccaatacactcaataaatgttactacttttgatacaatgatatgtattttt 13215551  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  || | ||||||||| || | | || |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  || ||    
T  13215550 actataataaccctattaatttaaaatctaatttcatatatttctctctccgtaataaataagtaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttaca 13215451  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| |||||  |||| |||||| || || |||||||||    
T  13215450 ttgaacttcgaaagtgacagttaaataggaacaaaataattctctaaaagagacacttaaaaaggtacagagggagta 13215373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 384
Target Start/End: Original strand, 36404833 - 36405105
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || || |||||||||     
T  36404833 ctccattcatttttaattgtcacattttgatattttacatgaaccaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttatatttttactata 36404932  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaa-taaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaa 311  Q
    ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  36404933 ataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctatccgtaaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttaatattgcattgaa 36405032  T
Q  312 ctttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  36405033 ctttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaattttcttcaaaagagacacttaaaaatgaacggaaggagta 36405105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 368
Target Start/End: Original strand, 4952690 - 4952935
Alignment:
Q  116 ccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattat 214  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| |     
T  4952690 ccgttcctttttaattgtcactttttgacattttacataaaccaaaatgatcaataaatgttactacttttaatactattgtttttacttttactataac 4952789  T
Q  215 ggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaat-aaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||         ||||||||  ||||||||||||    
T  4952790 ggccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccacaataaaatatttaagggtaatatt---------tcatttaatgttgcattgaact 4952880  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||| | ||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  4952881 ttgaaaatgacagttaaataagaacaaaaaatttctctaaaaatgacaattaaaa 4952935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 13000897 - 13001132
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| || |||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||  || ||||    
T  13000897 tactacatctgttcttttttaattgttactttgtgacattttacacaaattaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaataattaatattttt 13000996  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     |||| || ||||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||  ||||||  |||||    
T  13000997 gctataatagccttatttatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatactgataaaacaagatttaaagttgca 13001096  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  13001097 ttgaactttgaaagtgacagttaaattggaacaaaa 13001132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 384
Target Start/End: Original strand, 28145566 - 28145835
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacatttt--acataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||| ||||| |    
T  28145566 cgttcctttttaattgtcacattttgatattttttatataaatcaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatacttt-actataa 28145664  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    || | || || ||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  28145665 tgacattattcatttaatatctcatttcatataattctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaact 28145764  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  28145765 ttgaaagtgacagttaaataggaagaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggaagta 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29042140 - 29041932
Alignment:
Q  171 aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatct 270  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||| | || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29042140 aatgttactatttttgatacaattgtttttacttttacaataatgacgttattaatttaat-tttcatttcatatgtttctctct--gcaataaatatct 29042044  T
Q  271 aaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatg 370  Q
    | || ||||||||||||||||  || |||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| |||||| |    
T  29042043 acgggtaatattggtaaaacaatatctaatgttgcattggactttgaaagtgacagttaaatagaaaaaaaatttatc--taaaagtgacaattaaaaag 29041946  T
Q  371 gaacggagggagta 384  Q
    |||||||| |||||    
T  29041945 gaacggagcgagta 29041932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 31024924 - 31025203
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||  |||||    
T  31024924 attactacatccgttcctttttaactgtaactttttgatattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataattcatactt 31025023  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || |||||  | ||||||||| | | || |||| ||| |||||||  |||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||   |||    
T  31025024 ttactataatagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttatctctccataataaataactaagggtaatgttggtaaaacaagatttattgttg 31025123  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31025124 cattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctcccaaaatgacacttaaaaaggaacggagggagta 31025203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14288686 - 14288411
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||  |||||||| |||||| | |||||||||| ||  ||| |  | |||||||    
T  14288686 tactacttccgttcctttttaattgtcacattttgatattttatacaaa--aagacaatcaataattgatactactttttatgcaataagctatactttt 14288589  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||| ||||||| |||||||  ||  |    
T  14288588 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcgataaataattaaggacaatattgataaaacaacatttaatgttata 14288489  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  14288488 ttgaactttgaaaatgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggagta 14288411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2013030 - 2012848
Alignment:
Q  195 atttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatca 294  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||    
T  2013030 atttatacttttactataataaccttagtaatttaatatcttatttcatatatttctctctccacaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaaca 2012931  T
Q  295 tttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  2012930 tttattgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacacttaaaaaggaacgga 2012848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1395822 - 1395544
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||  || | ||| ||| |||| || ||    
T  1395822 attactacctccgttcctttttaactgt-actttttgacattttacacaaaccaatacacttaataaatgttactttttcttatacaataatttatattt 1395724  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || | |||  |  |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| | ||||||   |||    
T  1395723 ttactataatagtcttagtcttttaatattttatttcatatatttctctctccgcaataattaactaagggtaatgttggtaaaa-aacatttattgttg 1395625  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaac-aaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||||  |||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1395624 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacgaaaaaatttctacaaatgtgacacttaaaaaggaacggagggagta 1395544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Original strand, 25187248 - 25187348
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  25187248 atatgtttctctctccgcaataaatatttaagagtaatattggtaaaataacatttaatattgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaa 25187347  T
Q  342 a 342  Q
    |    
T  25187348 a 25187348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2991997 - 2991854
Alignment:
Q  171 aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatct 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||     ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2991997 aatgttactacttttg-taaaattatttttacattcactataatggctttattaatttaatatttca-----tatgtgtctctctccgcattaaatatct 2991904  T
Q  271 aaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  2991903 aagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttg-attcaactttgaaagt 2991854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 37116589 - 37116814
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||      
T  37116589 tactatctccgttcctttttaattgtcattctctgacattttacacaaaccaagacaaccaataaatgttactatttttgatacaattgtttttactt-- 37116686  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
            || ||| || ||||||||||| | ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||  |||||    
T  37116687 --------ggtcttatttatttaatattttatttcttgtgtttttctctccgtaataattatctaagggtaagattgataaaacaacatttaatgttgca 37116778  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  37116779 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagatacaaaa 37116814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14308650 - 14308438
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  14308650 tactacatccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 14308551  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||| |||||||||  ||||  ||  |||| ||||||   ||||||  |||||    
T  14308550 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctctcctcaataaataattaag--tacaattgataaaacgatatttaatgttgca 14308453  T
Q  307 ttgaactttgaaagt 321  Q
    |||||||||||||||    
T  14308452 ttgaactttgaaagt 14308438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 379
Target Start/End: Original strand, 38186054 - 38186312
Alignment:
Q  124 ttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| || ||| | || || |||||||  ||| |  | || ||||||||| ||| |||| |    
T  38186054 tttttattgtcacattttgatattttacacaaactaagacaatcaacaattgatattatttttgatgtaataaactatatttttactataatgaccttat 38186153  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    | ||||||||| ||| || |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |     
T  38186154 tcatttaatatctcatttcatatatttctttctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaaatg 38186253  T
Q  323 acaattaaatagaaacaa--aatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||| |||||||  |||||    |||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  38186254 acagttaaataagaacaatttttttttctccaaaaataacacttaaaaaggaacggagg 38186312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6013698 - 6013497
Alignment:
Q  142 gacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaatt 240  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||||| ||| || | |||  | ||||||||| | | ||    
T  6013698 gacattttacacaaatcaagacattcaataaatgttactttttcttatacaatcatttatacttttattataatagtcttagtcatttaatatcttattt 6013599  T
Q  241 gatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  6013598 catatatttctctttccgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaa 6013499  T
Q  341 aa 342  Q
    ||    
T  6013498 aa 6013497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 377
Target Start/End: Original strand, 38072216 - 38072482
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | || |     
T  38072216 attactacctccgttcctttttatttgtcatattttaacattttacacaaaccaaaacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatatt- 38072314  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
         || |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  38072315 -----ataatgaacttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaagacaatattggtaaaacaacatttaatgttg 38072409  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| || ||| ||||||||    
T  38072410 cattgaacttcaaaaatgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttgaaaaggaacgga 38072482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32674333 - 32674190
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |   |||||| | ||||||    
T  32674333 atatatttttctctccgcaataaataactacgggtaatattgataaaacaacatttaaagttgcattgaactttgaaagtgattgttaaattggaacaaa 32674234  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32674233 aaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagtac 32674190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 7529700 - 7529926
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||||  ||| | | ||||||| |||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||  |||| |  |||| |||| || |    
T  7529700 gttcctttttaattgtcattttttgtctttttacacaaatgaagacaactaataaattttactacttttgatacaacaatttatcattttcctataatag 7529799  T
Q  217 ccttgttaatttaatattt-caattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaacttt 315  Q
    ||||  | ||||||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  7529800 ccttcatcatttaatattttcatttcatatatttctctctctgcaataaataactaagggtaatataggtaacacatcatttaatattgtgttgaacttt 7529899  T
Q  316 gaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||| | | |||  |||||||||||    
T  7529900 gaaagtgaaacttatttagaaacaaaa 7529926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14284245 - 14284108
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||  ||    
T  14284245 tttctctctccgcaataaataattaaggacaatattggtaaaataacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacaactaaacaggaataaaaaatt 14284146  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  14284145 tcttcaaaagtgacacttaaaaagaaacggatggagta 14284108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 332
Target Start/End: Original strand, 32543782 - 32543998
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatg 215  Q
    ||||| |||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||| ||| ||| |||  |||||||| ||| ||     
T  32543782 cgttcctttttaattgtcattttataacattttacataaaccaaaacaatcaataaatattactaatttttatacaataattgatacttttaatataata 32543881  T
Q  216 gccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaacttt 315  Q
    |  || || ||||||||| ||| || |||| ||| | |||| | |||||||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32543882 gttttattcatttaatatctcatttcatatatttttttctctgtaataaataactaaaggtaatattgataaaacaacatttaaagttgcattgaacttt 32543981  T
Q  316 gaaagtaacaattaaat 332  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  32543982 gaaagtgacagttaaat 32543998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 310
Target Start/End: Original strand, 31011704 - 31011905
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || || || ||||    
T  31011704 tactacctccgttcctttttaattgttacattttgacattttatacaaaccaagacaatcaataaatgttgctacttttgatacaa-taattctattttt 31011802  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||| | | |  |||  ||||||||||| |||| ||||  ||| | ||||||| |||||| | |||||||  |||||    
T  31011803 actataataaccttgtttatttaatatcttattacatacatttctctctccacaat-aataaataaaggtaatattagtaaaataacatttaatgttgca 31011901  T
Q  307 ttga 310  Q
    ||||    
T  31011902 ttga 31011905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Original strand, 25186816 - 25186941
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  25186816 tactacttccgttcctttttaaccgtcactttttgacattttacacaaaccaagataatcaatatatgttactacttttgatacaattgtttttactttc 25186915  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaata 232  Q
    || ||  || |||| |||||||||||    
T  25186916 accatagtgtccttattaatttaata 25186941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 384
Target Start/End: Original strand, 34309151 - 34309312
Alignment:
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||   || | ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  34309151 ttaatttaatatttcatttcatatatttctctctccacaatgaataagcaatgataacattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaacttcgaaagt 34309250  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| |||||||| || ||||   ||||| |||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  34309251 gacagttaaataggaa-aaaaaaattcttcaaaagtgacacttaaaaaggaatggaaggagta 34309312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37077427 - 37077155
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||     ||||||| ||||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||| ||| |||| |  ||||    
T  37077427 tactccctccattcctttttaattgtcacttttgagtcttttacacaaaccaagataacaaatacattttactactttttatacaataatttatcttttt 37077328  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     |||| ||  ||||  ||||||||||| ||| || |||| ||||||| || |||||||||| | || | ||||| ||  |||| | |||||||  ||| |    
T  37077327 tctataataaccttcataatttaatatctcatttcatatatttctctatctgcaataaataaccaatggtaataatgacaaaataacatttaatgttgta 37077228  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  37077227 ttgaactttgaaaatgacacttaaataaaaacaaaaaatttcttcaaaagtgacaattaaaaatgaacggagg 37077155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 928018 - 928294
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||  |||| | |||||| |||||||  ||  |||| |  |||    
T  928018 attacttcccccgttcttttttaattgtcatattttgactttttacataaactaagataacaaatacttttactatttttgatgtaacaatttatctttt 928117  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    | |||| ||  ||||  | |||||||| |||| || |||| |||||||||   |||||||||| ||||  ||||||  |||||||| |||||||   ||     
T  928118 tcctataataaccttaatcatttaatacttcatttaatatatttctctct--acaataaatatttaagaataatatatgtaaaacaacatttaatgatgt 928215  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||  |||||||||   ||| |||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  928216 attagactttgaaaacgacagttaattagaaacaaaaattttatgcaaaagtgacaattataaaggaacggagggagta 928294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Original strand, 3376266 - 3376341
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactactttt 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  3376266 tacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaatcaataattgatactactttt 3376341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 384
Target Start/End: Original strand, 33947550 - 33947692
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||  ||||||  | ||| || | |||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  33947550 atatatttctctctctacaataaattactaaggacattataggaagaacaccatttaatgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaa 33947649  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |  ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  33947650 aaatttctgtaaaagtgacagttataaaggaacggaggtagta 33947692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Original strand, 34262808 - 34262912
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||  | |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| || | || ||||    
T  34262808 tactacctccgttcctttttaattgtcaattttttatattttacacaaaccaagacattcaataattgttactacttttgatataataatatatattttt 34262907  T
Q  207 actat 211  Q
    |||||    
T  34262908 actat 34262912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14284340 - 14284283
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  14284340 tactacctcagttcttttttaattgtcacattttgaca-tttacacaaaccaagacaat 14284283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30544601 - 30544542
Alignment:
Q  283 ggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  30544601 ggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaa 30544542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 384
Target Start/End: Original strand, 10562473 - 10562551
Alignment:
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10562473 attgaacattgaaaacgacaaataaatagaaacaaaatatttccaaaaaaatgacagttaaaaaggaaaggagggagta 10562551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42089011 - 42088917
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||  | ||| || |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  42089011 tttctctctctgcaataaattactaagggcattataggaaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaa 42088917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25787584 - 25787527
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaa 165  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  25787584 tactccctctgttcctttttaattgtcacattttgactttttacacaaaccaagacaa 25787527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36173309 - 36173264
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  36173309 tccgttcttttttaattgtcacattttgactttttacacaaaccaa 36173264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37660222 - 37660129
Alignment:
Q  286 aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  37660222 aaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaatttctgcaaaagtgacaattaaaaatgaacggagg 37660129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 1259615 - 1259695
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttga 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||| || || || ||||||||||||    
T  1259615 tactacctccgtttctttttaattgttacattttgatattttacacaaaccaagagaatcaacaattgatactacttttga 1259695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 365
Target Start/End: Original strand, 18904095 - 18904155
Alignment:
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagtta 365  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  18904095 cattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaattttctataaaagtgacggtta 18904155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45065150 - 45065094
Alignment:
Q  286 aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  45065150 aaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtaacacttaattagaaacaaaa 45065094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Original strand, 38148139 - 38148261
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||| ||| || ||||  |||||||||  |||||||||   |||| |||||  || |||| | |||||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  38148139 atttaatatctcatttcatatacttctctctctacaataaataatcaagggtaataaaggaaaaataacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgac 38148238  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    | |||| |||||||||| |||||    
T  38148239 agttaattagaaacaaatttttt 38148261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 355
Target Start/End: Original strand, 28301684 - 28301733
Alignment:
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaa 355  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28301684 attgatctttgaaagtgacatttaaattgaaacaaaatttttcttcaaaa 28301733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37354046 - 37353969
Alignment:
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||  ||||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  37354046 ttgaactttgaaagtgacagttaattaaaaacaatttttttttataaaagtgacagttataaaggaacagagggagta 37353969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 164
Target Start/End: Original strand, 42263347 - 42263396
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||    
T  42263347 tccgttcttttttaattgtcacattttaactttttgcataaatcaagaca 42263396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Original strand, 838191 - 838291
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||||  |  || || |||||| |||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  838191 atatatttctctctctgcaataaattactaaggacataataggaaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaaatgacagttaattagaaacaaa 838290  T
Q  342 a 342  Q
    |    
T  838291 a 838291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 100)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 33874535 - 33874812
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||    
T  33874535 tactacctccgttcctttttaattgtcattttttgacattttacacaaaccaaaacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgttttacctttt 33874634  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  33874635 actataatggccttattaatttaatatttcatttcatacgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacactatttaatgttgca 33874734  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  33874735 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaagtgacagataaaaaggaacggtgggagta 33874812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 20848713 - 20848985
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20848713 tactacctccgttcctttttaactgtcacattttgacattttacacaaaccaaaataatcaataaatgttactacttttgatacaattgtttttactttt 20848812  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||     |||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  20848813 actataatggccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctttccgcaa-----atctaagagtaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 20848907  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  20848908 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaattttttctctaaaagtgacaattataaaggaacggagggagta 20848985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 384
Target Start/End: Original strand, 47104150 - 47104421
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||     
T  47104150 ctccgttcctttttaattgccactttttgacattttacataaatcaaaacaatcaataaatgttactatttttgatataattgattttacttttactata 47104249  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    ||| | || |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  47104250 atgactttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctcttcacaataaatatctaatgataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaac 47104349  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  47104350 tttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 47104421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 54106523 - 54106243
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | ||||    
T  54106523 aattactacctccgttcctttttaattgttacattttgacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataaactatact 54106424  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  54106423 tttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctatgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgtt 54106324  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  54106323 gcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaatggagggagta 54106243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 3643185 - 3643419
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3643185 tactacctccattcctttttaagtgtcactttttgacattttacacaaatcaatacaatcaagaaatgttactacttttgatacaattatttttactttt 3643284  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  3643285 actataatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattgataaaacaacatttaa-gttgca 3643383  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3643384 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaa 3643419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52175986 - 52175698
Alignment:
Q  98 aaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatt 197  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  52175986 aaaaaaaaattgctacatccgttcctttttaattatgacattttgacattttacacaaaccaagacaattaacaatgttattacttttgatacaattgtt 52175887  T
Q  198 tttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcattt 297  Q
    |||||||||||| | ||| | || |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||    
T  52175886 tttacttttactgtaatgactttattaatttaatatttcatttcatatgtttttctctccgcaataaatattcaaagataatattggtaaaacaacattt 52175787  T
Q  298 aacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatt--tttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||  | ||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  52175786 attgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaattttctctctctaaaagtgacagttagaaaggaacggtgggagta 52175698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 123 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51065125 - 51064862
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||  |||     
T  51065125 tttttaattatcactttttaacattttacacaaaccaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgtttttactttcactataatgatctta 51065026  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51065025 ttaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggataatattggtataataacatttaatattgtattgaactttgaaagt 51064926  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
     ||| ||||  || |||||||   ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51064925 gacagttaatcaggaacaaaaaaattctccaaaaatgacaattaaaaaggaacggagggagtac 51064862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 42515163 - 42515421
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  42515163 tactacatccgttcctttttaattgtaactttttaacattttacacaaaccaagacaatcaataa-gttactatttttgatacaattgtttttactttta 42515261  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| | |||||||| |||||||  ||||||    
T  42515262 ctataatcgccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccgtaatagatatctaaaggtaataattgtaaaacaacatttaatgttgcat 42515361  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaa 367  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||    
T  42515362 tgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctcaaaaagtgacaattaaa 42515421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 99 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52174011 - 52173726
Alignment:
Q  99 aaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattattt 198  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  52174011 aaaaaaaattgctacatccgttcctttttaattgtcactttttgatattt-acacaaaccaagacaattaataatgttattacttttgatataattgttt 52173913  T
Q  199 ttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcattta 298  Q
    |||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||    
T  52173912 ttacttttactgcaatgaccttattagtttaatatttcatttcatatgtttttctctctgcaataaatattcaaaggtaatattggtaaaacaacattta 52173813  T
Q  299 acattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctt-taaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
       |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||  |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  52173812 ttgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatatgaacaatttttttcttctaaaagtgacagttagaaaggaacggagggagta 52173726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Original strand, 54898090 - 54898352
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||| ||| ||| ||||     
T  54898090 tttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatacttttattataatgacctta 54898189  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54898190 ttcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagt 54898289  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     | | |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  54898290 gatagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacagagggagta 54898352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 383
Target Start/End: Original strand, 43775378 - 43775655
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || ||||||    
T  43775378 ttactacctccgttcctttttaattttcacattttgacattttacataaaccaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtacttt 43775477  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  43775478 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaatagctaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgc 43775577  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagt 383  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||  |||||| ||||  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  43775578 attgaactttgaaagtgacagttaaatgaaaacaaaaaatttcttcaaaagagacagttaaaaaggaacagaaggagt 43775655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 377
Target Start/End: Original strand, 13158426 - 13158700
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| | || |||||    
T  13158426 attactacctccgttcctttttaattgttatattttgacattttacataaaccaagacaataaaaaattgatactacttttgatataataagttatactt 13158525  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||  |||    
T  13158526 ttactataatgaccttattcatttaatatatcatttcttatatttctctctccgcaataaataactaaggattatattggtaaaacaacatttaatgttg 13158625  T
Q  305 cattgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaa-aatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  13158626 cattgaactttgaaaaatgacagttaaatagaaacaattttttttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacgga 13158700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Original strand, 33491128 - 33491398
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  33491128 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacataaactaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttatactttt 33491227  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| |||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  33491228 actataataaccttatttatttaatatctcatttcatatatttcactctccgtaataaataattaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 33491327  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||    
T  33491328 ttgaactttgaaagtaacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacgga 33491398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 790804 - 790530
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||||||    
T  790804 tacctccgttcctttttaatgatcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatacttttact 790705  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| || |||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  790704 ataatgaccttattcatttaatatcccagttcatataattctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattg 790605  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  790604 aactttgaaagtgacagttaaatagaaacataaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 790530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43554646 - 43554370
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  43554646 tactacctccgttactttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatcatacttttgatgcaataagctatactttt 43554547  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  43554546 actataatgaccttattcatttaatatt-catttcatatatttctctttccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 43554448  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  43554447 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggatggagta 43554370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 53745271 - 53745547
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  53745271 tactacatccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 53745370  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||  || || |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  53745371 actataatgaccttattcatttaatatc-catttcatatatttctctctccacaagaaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 53745469  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  53745470 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 53745547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52663693 - 52663422
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||| ||||     
T  52663693 ctccgttcatttttaattgtcatattttgacatttcacacaaaccaagacaatcaataattgatactacttttgatgcaataagctatacttttgctata 52663594  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  52663593 atgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacgtttaatattgctttgaac 52663494  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  52663493 tttgaaaatgacaattaaatagtaacaaaaaatttctccaaaactgacacttaaaaatgaacggagagagta 52663422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36234623 - 36234347
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||| || || || | ||||||||||| ||| |  | ||||||    
T  36234623 attactacatccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaattaagacaatcaaaaa-gtga-tacttttgatacaataagctatacttt 36234526  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||| | |||  ||| || |||||||||   | || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36234525 tactgtaatgatcttattcatttaatatcctatttcatatatttctctctccgcaaaaaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaacgttgc 36234426  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  36234425 attgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaattttcttcataagtgacacttacaaaggaacggagggagta 36234347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28885922 - 28885658
Alignment:
Q  120 tcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggcc 218  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||| ||||| ||| ||    
T  28885922 tcttttttaattgtcacattttaacattttacataaaccaagatagtcaattattgttactacttttgatgcaataagttgtacttt-actataatgacc 28885824  T
Q  219 ttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaa 318  Q
    || || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  28885823 ttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttaaa 28885724  T
Q  319 agtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| ||  |||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  28885723 agtgacggttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaatgaacggaaggagta 28885658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 34266426 - 34266704
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || ||||    
T  34266426 aattactacctccgttcctttttaatcgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatact 34266525  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||| |   |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||  ||    
T  34266526 tttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctcgca--gcaataaataactaaggacaatattgataaaacaacatttaatgtt 34266623  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||   |||| |||||||||    
T  34266624 gcattgaactttgaaaatgacagttaaatagaaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaagaagaacagagggagta 34266704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 42671879 - 42672156
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  42671879 tactacctccgttcttttttaattgtcacattttgacattttatataaactaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataaactatactttt 42671978  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  42671979 actataataaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctttctgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatattaca 42672078  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  42672079 ttgaactttaaaagtgacagttgaataggaacaaaaattttctccaaaaatgacgcttaaaaaggaatggagggagta 42672156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 47069846 - 47070123
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  47069846 tactacatccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 47069945  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||    || || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  47069946 actataataattttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 47070045  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||  |||||   ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  47070046 ttgaactttgaaagtgacggttaaataggaacaaaaaatttctacgaaagtgacacttaaaaaggaatggagggagta 47070123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 346
Target Start/End: Original strand, 45101347 - 45101586
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |  || | |||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  45101347 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacagctgatgctacttttgatgcaataagctatactttt 45101446  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     |||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  || ||    
T  45101447 cctataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgtttca 45101546  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  45101547 tggaactttcaaagtgacagttaaataggaacaaaatttt 45101586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51244878 - 51244604
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||  |||||| |||| | |||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| |    || ||||| |    
T  51244878 tacctccgtttctttttacttgtaatattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactagttttgatgcaataagccatatttttatt 51244779  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  51244778 ataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatattgcattg 51244679  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  51244678 aactttgaaagtgacagttaaataagaacaaaatttttcttcaaaagtgacatttaaaaaggaacagagggagta 51244604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19550503 - 19550226
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | || ||||    
T  19550503 tactacccccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaactaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagctatattttt 19550404  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  19550403 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaacaatattgataaaacaacatttaattttgca 19550304  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| | ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  19550303 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtaacatttaaaaaggaacggatggagta 19550226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 35315389 - 35315128
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  35315389 tactaactccgttcctttttaattgtcattttttgacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgttactacttttgatgcaataagttatactttt 35315290  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| ||| ||||||| |||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  35315289 attataatgaccttgttcatttaacatctcatttcatatatttatctctccgcaataaataactaaagataatattggtaaaacaacatttaaggttgta 35315190  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||   ||||| ||||| |||| ||||||    
T  35315189 ttgaactttgaaaatgacaattaaatagaaaaaaaaaaattcttaaaaaaagacacttaaaa 35315128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17103013 - 17102734
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  17103013 aattattacttccgtt-ttttttaattgttattttttgacattttacacaaattaaaacaattaataattgttactacttttgatgcaataatttatact 17102915  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||| ||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  17102914 tttattataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctttccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgtt 17102815  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  ||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  17102814 gtattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagagacacttaaaaaagaacggagggagta 17102734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 334
Target Start/End: Original strand, 39866838 - 39867065
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  ||| | || | ||||    
T  39866838 ttactaccttcgttcttttt-aattgtcactttttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgtttttacttttgatgcaataagttatgcttt 39866936  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  39866937 tactataatgaccttgttaatttaacatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaataatattggtaaatcaacatttaatgttgc 39867036  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatag 334  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  39867037 attgaactttaaaagtgacagttaaatag 39867065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29698245 - 29697987
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | ||||||||||    
T  29698245 tacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaattaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataagctatacttttact 29698146  T
Q  210 attatggcct-tgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    || ||| ||| | || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  29698145 ataatgacctctattcatttaatatctca-ttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattgataaaacaacatttaatattgcatt 29698047  T
Q  309 gaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||| ||||||    
T  29698046 gaactttgaaaatgacaattaaataggaacaaaaactttctcaaaaaatgacacttaaaa 29697987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32980897 - 32980620
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||| | || |||||||    
T  32980897 tactacatctgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgttaatacttttgatgcaataagttatactttt 32980798  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | |||  || |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| |    
T  32980797 attatactgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctctacaataaataactaagggtaatattgataaaacattatttaatgttgta 32980698  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||  ||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  32980697 ttgaattttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaagaacggagggagta 32980620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29651925 - 29651668
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| || | | | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  29651925 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttttacattttacacaaaccaaaacaatcaacagttgatactacttttgatgcaataagctatactttt 29651826  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||  |||||    
T  29651825 actataatgactttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattgataaaataacatttaatgttgca 29651726  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||||||||    |||| ||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||    
T  29651725 ttgaactttga----aacagttaaataaaaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaa 29651668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 50092204 - 50091917
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |  || | ||| ||| |||| |||||    
T  50092204 attactacctccgttcctttttaactgtcgctttttgacattttacacaaaccaagacactaaataaatgttattttttcttatacaataatttatactt 50092105  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||   |||    
T  50092104 ttactataataaccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggaaaatattggtaaaacaacatttattgttg 50092005  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtacatgatttt 393  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||  |||||  |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50092004 cattgaactttgaaagtgacagttaagtaggaacaaaaagtttctccaaaaataacacttaaaaaggaacgga-ggagtacatgatttt 50091917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 48152236 - 48151966
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactatt 212  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  | |||||||| ||| ||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||  ||  ||||||||||||     
T  48152236 ctccgttcctttttaattgtcatttttttatattttacacaaatcaatacaatcaataaatattattacttttgatacaatacttcatacttttactata 48152137  T
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    ||  |||| || |||| |||| ||| || |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  48152136 ataaccttattcatttgatatctcattttatatatttctctttcaacaataaataactaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaac 48152037  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagt 383  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  48152036 tttgaaagtgacagttaaattgaaacaaattttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagt 48151966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Original strand, 32853349 - 32853539
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32853349 tactatctccattcctttttaattgtaactttttgacattttacacaaactaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgtttttactttt 32853448  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||||| | | |||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  32853449 actataacgaccttattaatttaatatttcattt--catgtttctctctctgcaataaatatttaaaggtaatattggtaaaacaacatttaa 32853539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27992494 - 27992286
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||||||    
T  27992494 tacctctgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaacccaatacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatacttttact 27992395  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| || ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27992394 ataatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctcggcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattg 27992295  T
Q  310 aactttgaa 318  Q
    |||||||||    
T  27992294 aactttgaa 27992286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 379
Target Start/End: Original strand, 27483777 - 27484047
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||| | ||| || |||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || || ||||    
T  27483777 tactacctctgttcctttttaattgtcatattttaacattttatacaaatcaggacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatattttt 27483876  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  27483877 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctc--tccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 27483974  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  27483975 ttgaactttaaaagtgacagttaaataggaacaaaaactttcttaaaaagtaacacttaaaaaggaacggagg 27484047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 48214312 - 48214046
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||  ||  |||||||    
T  48214312 tactacatctgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacacaccaatacaatcaataaatattactacttttgatacaatacttcatactttt 48214213  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || | ||| || |||| |||| |            |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  48214212 actataatagtcttattcattttatatat------------ttctctctccacaataaataactaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 48214125  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  48214124 ttgaactttgaaagtgacagttaaattgaaacaaattttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagtac 48214046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 3376293 - 3376574
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||  ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||||| |||| ||  ||| | || || ||||    
T  3376293 tactacctcaattcctttttatctgtcacattttgacattttacataaactaagataatcaatgattgttactattttttatgtaataagttgtattttt 3376392  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgttt----ctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacat 302  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||  |    
T  3376393 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttttctctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttaatgt 3376492  T
Q  303 tgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||  || |||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3376493 tgcattggactttgaaactgacagttaaatagaaacaaatattatctttaaaagagacacttaaaaaggaacagagggagta 3376574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 379
Target Start/End: Original strand, 27039595 - 27039867
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||  |||||||    
T  27039595 tactacctctgttcctttttaaccgtcactttttgacattttacacaaaccaagacattcaataaatgttactttttcttatacaataattagtactttt 27039694  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||    
T  27039695 actataatagccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataatcaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgca 27039794  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||   ||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  27039795 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctcctaaagtgacacttaaaaaggaacagagg 27039867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46973665 - 46973400
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||  |||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||| ||| ||| ||||     
T  46973665 tttttaattgttacattttgatattttacacaaaccaaagcaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatacttttattataatgacctta 46973566  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  46973565 ttcatttaatatatcatttcatatatttctttctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttgatgttgtattgaactttgaaagt 46973466  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaa---atgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| |||||||  ||||||||||||||  ||||   | |||| |||||| |||||||||||||||    
T  46973465 gacagttaaataagaacaaaatttttctccaaaagtgaagacacttaaaaaggaacggagggagta 46973400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 342
Target Start/End: Original strand, 40139823 - 40140053
Alignment:
Q  100 aaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattattt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | ||    
T  40139823 aaaagaaatactacctccgttcctttttaattgtcacattt--------tacacaaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagtt 40139914  T
Q  199 ttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcattta 298  Q
     |||||||||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  40139915 atacttttactataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaagggtaatattgataaaatatcattta 40140014  T
Q  299 acattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |  ||||||||||     ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40140015 atgttgcattgaa-----aaagtgacagttaaatagaaacaaaa 40140053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41425886 - 41425609
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||    
T  41425886 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagacaatcaataaatgttgctacttttgatacaataatttctattttt 41425787  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||| | ||  |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  41425786 actttaataaccttatttatttaatatctcattacatatatttctctctccacaat-aataaataagggtaatattagtaaagtaacatttaatgttgca 41425688  T
Q  307 ttgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||   ||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  41425687 ttgaactatgtaaagtgacacttaaataggaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 41425609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 52627227 - 52627504
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| ||||||  || | || ||||||||||  ||| | || |||||||    
T  52627227 tactatctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttcctcataccaagataattaacgattgatattacttttgatgcaataagttatactttt 52627326  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | || || |||||||||  || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  52627327 actataatgactttattcatttaatatc-catttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 52627425  T
Q  307 ttgaac-tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||  |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  52627426 ttgaacttttaaaagtgacaattaaatagaaacaaaaaacttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaaggagta 52627504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45145388 - 45145160
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||| | || ||||    
T  45145388 aattactacctcctttcctttttaattgtcattttttgatattttacacaaaccaagacaatcaataattattattacttttgctgcaataagttatact 45145289  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| |||  ||| || |||||| || ||| || |||| | ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45145288 tttactataatgatcttattcatttaacatctcatttcatatatatctctttccgcaataaataa-taaggataatattggtaaaacaacatttaatatt 45145190  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaata 333  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45145189 gcattgaactttgaaagtgacagttaaata 45145160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 33074267 - 33074543
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  33074267 tactatctacgttcctttttatttgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataaatgctgctacttttgatacaataatttttattttt 33074366  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||| |||||| | |||||||  |||||    
T  33074367 actataataaccttatttatttaatatctcattacatatatttctctctccgcaat-aataaataagagtaatattagtaaaataacatttaatgttgca 33074465  T
Q  307 ttgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| || ||||| | | |||||||| || ||||   ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33074466 ttgaactatgtaaagtgatacttaaataggaataaaa-aattctttaaaagagacacttaaaatggaatggagggagta 33074543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 40318917 - 40319194
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||    
T  40318917 tactacctccgttcatttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagataatcaataaatgttgctacttttgatacaataatttctattttt 40319016  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||| | ||  |||| || ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  40319017 actttaataaccttatttatttaatatctcattagatatatttctctctccacaat-aataaataagggtaatattagtaaagtaacatttaatgttgca 40319115  T
Q  307 ttgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||   ||||  ||||  |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  40319116 ttgaactatgtaaagtgacacttaaataggaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaggaacggatggagta 40319194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 41351183 - 41351461
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  41351183 tactacctccgttcctttttaattgtcactttctgatattttacataaatcaagacattcaattaatgttactacttttgatataataatatatactttt 41351282  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||     || | ||||||||||||||||  ||||||   ||||    
T  41351283 actataataaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctcttcacaataaacgaacaaagataatattggtaaaacaatatttaatgatgca 41351382  T
Q  307 ttgaactt-tgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||   ||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  41351383 ttgaacttcaaaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaagaacggagggagta 41351461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 340
Target Start/End: Original strand, 51697547 - 51697786
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttt--taattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattattttta 201  Q
    ||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || || || ||||| |||||||  ||| |  | ||    
T  51697547 aattactacctcgttcctttttactaattgtcatattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataagctata 51697646  T
Q  202 c-ttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaac 300  Q
    | ||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||     
T  51697647 ctttttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctccccgcaataaataactaaggacaatattcgtaaaacaacatttaat 51697746  T
Q  301 attgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
     || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51697747 gttacattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaa 51697786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Original strand, 54911306 - 54911525
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| ||| ||||     
T  54911306 tttttaattgtcacattttaaaattttacatatat-aagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatacttttactataatgacctta 54911404  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| | | || |||| |||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  54911405 ttcatttaatatcttatttcatatatttctcactccacaataaataattaaaggtaatattgataaaacatcatttaatgttacattgaactttgaaagt 54911504  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
     ||| ||||||| ||||||||    
T  54911505 gacagttaaatataaacaaaa 54911525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24981540 - 24981333
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||||||| |    
T  24981540 tccgttcttttttaattgtcacattttgacattttgcacaaactaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatacttttactataa 24981441  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    || |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||    
T  24981440 tgaccttattcatttaatatatcatttcatatatttctctctctgcaataaataactaaagacaatattggtaaaacaatatttaatgttgcatcgaact 24981341  T
Q  314 ttgaaagt 321  Q
    ||||||||    
T  24981340 ttgaaagt 24981333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 349
Target Start/End: Original strand, 51219082 - 51219315
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa----tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || ||    || |||||||||||||  ||| | || ||||    
T  51219082 tactacctccgttcctttttaattgtcacatattgacattttacacaaaccaagacaatcaacaacaattgatactacttttgatgcaataagttatact 51219181  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| |||  ||| || |||| |||| |            |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||    
T  51219182 tttactataatgatcttattcatttcatatat------------ttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgtt 51219269  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  51219270 gcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttct 51219315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 330
Target Start/End: Original strand, 24068 - 24276
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| ||  ||||     
T  24068 tttttaagtgtcactttgtgacattttacataaaccaagacatttaataaatattactacttttgatacaataatatatacttttactataataacctta 24167  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||| |||||  |||||||    || | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  24168 ttcatttaatatttcatttcatatatttctttctccaaaataaattagcaaagataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaacttcgaaagt 24267  T
Q  322 aacaattaa 330  Q
     ||| ||||    
T  24268 gacagttaa 24276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 40010653 - 40010913
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || ||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||  |||||||    
T  40010653 tactacctccgttcctttttaagtgttactttttgatattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataattagtactttt 40010752  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||   |||||    
T  40010753 actataataaccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatgtcggtaaaacaacatttattgttgca 40010852  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaa 367  Q
    ||||||||||||| | | | |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  40010853 ttgaactttgaaaatgaaagttaaatatgaacaaaatttttctcttaaagtgacacttaaa 40010913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20105331 - 20105172
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    |||||||||  || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  20105331 atttaatatcccatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgac 20105232  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  20105231 agttaaagaggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggtagta 20105172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13168261 - 13167996
Alignment:
Q  109 actacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttac 208  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| || |||           ||||  ||| | || |||||||||    
T  13168261 actacatccgttcctttttaattgtcacatttttacattttatacaaaccaagacaatcaacaat-----------tgatgcaataagttatacttttac 13168173  T
Q  209 tattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    ||| ||   ||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13168172 tatgattagcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgtaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcatt 13168073  T
Q  309 gaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||  ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13168072 gaactttgaaaaatgacagttaaataagaacaataattttctctaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 13167996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7328640 - 7328435
Alignment:
Q  179 tacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaa 278  Q
    ||||||||||  ||| | || |||||| | ||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7328640 tacttttgatgcaataagttatactttcattataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataa 7328541  T
Q  279 tattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||  |||||  ||||  |||| |||||| ||||||||     
T  7328540 tattagtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgatagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagagacacttaaaaaggaacggaa 7328441  T
Q  379 ggagta 384  Q
    ||||||    
T  7328440 ggagta 7328435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41169008 - 41168741
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt----tactacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||      |||||||||||||  ||| |  | ||||      |    
T  41169008 tccgttcttttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactactacttttgatgcaataagctatact------a 41168915  T
Q  211 ttatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga 310  Q
    | ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  41168914 taatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaagataatattggtaaaacaacatttattgttgcattga 41168815  T
Q  311 actttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | ||||||| | ||| |||||||| |||||  ||||| |  | || ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  41168814 agtttgaaaatgacagttaaataggaacaatttttttttgcagaagtgacacttaaaaaggaacggatggagta 41168741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 49123781 - 49123556
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttac--t 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||  || |||||| ||||||  ||| |  | |||  |    
T  49123781 attactacctccgttcctttttaatagtcacattttgacattttacacaaatcaagataatcaat--tgatactacatttgatgcaataaactatacact 49123684  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||  ||||||  ||    
T  49123683 tttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaacaatattagtaaaacaatatttaatgtt 49123584  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaa 331  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  49123583 gcattgatctttgaaagtgacacttaaa 49123556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11473649 - 11473389
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||||||||| ||      
T  11473649 gttcctttttaattgtcgctttttgacattttacacaaactaagacattcaataaatgttactttttcttatacaataatttatacttttactataataa 11473550  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
    ||||  | ||||||||| | | || ||||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  11473549 ccttagtcatttaatatcttatttcatatacttctctttccgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaactttg 11473450  T
Q  317 aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    ||||| | | ||||| || |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  11473449 aaagtgaaagttaaacaggaacaaaaaatttctccaaaagtgacatttaaaaaggaacgga 11473389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 321
Target Start/End: Original strand, 25983662 - 25983865
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||  |||| |||  | ||| ||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||| |||     
T  25983662 gttcttttttaattgtcagtttttgacattttacacaaattaagataatctacaattgttactatttttgat-gaataagttatacttttactataatga 25983760  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
    | ||||| ||||||  | ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25983761 ctttgttcatttaacttctcattttatatatttatctcttcgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttg 25983860  T
Q  317 aaagt 321  Q
    |||||    
T  25983861 aaagt 25983865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 373
Target Start/End: Original strand, 43159855 - 43160015
Alignment:
Q  213 atggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaac 312  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||  ||||||||||     
T  43159855 atggccttattaatttaatattttattttatatgtttttctctctgcaataaatatttaagggtaatattgataaatcaacatttaatgttgcattgaat 43159954  T
Q  313 tttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaa 373  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||| | |||||| ||||    
T  43159955 tttgaaagtgacagttaaataaaaacaatttttttctctaaaagtgataattaaaaaggaa 43160015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43945636 - 43945444
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| |||||||  ||| |  | |||||||    
T  43945636 tactacctccgttcctttttagttgtcacattttgacattttatataaaccaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataaactatactttt 43945537  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||| | |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  43945536 actgtaatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctcttcgcaataaataactaaggacaatattgataaaacaacatttaa 43945444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 385
Target Start/End: Original strand, 45513700 - 45513882
Alignment:
Q  203 ttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacat 302  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||  |    
T  45513700 ttttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattgataaaacaacatttaatgt 45513799  T
Q  303 tgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    || |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| | ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  45513800 tgtattgaactttaaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtaacacttaaaaaagaacggaggaagtac 45513882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 347
Target Start/End: Original strand, 5243924 - 5244164
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| || |||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| ||||||    
T  5243924 ttactacctctgttcctttttaactgtcattttt-gacattttacataaatcaggacactcaataaatgttactttttcttatacaatcatttatacttt 5244022  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||  ||||  | ||||||||| | | |  |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   ||||    
T  5244023 tactataataaccttagtcatttaatatcttattccatatatttctctctctgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgc 5244122  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||    
T  5244123 attgaactttgaaagtgatagttaaataggaacaaaaatttt 5244164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 342
Target Start/End: Original strand, 32853971 - 32854172
Alignment:
Q  142 gacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaatt 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| || | |||||||||||| ||  ||||  | ||||||||||| | ||    
T  32853971 gacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatgtatacttttactataataaccttagtcatttaatattttattt 32854070  T
Q  241 gatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||||||   || ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  32854071 catatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatgttgataaaacaacatttattgttacattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaa 32854170  T
Q  341 aa 342  Q
    ||    
T  32854171 aa 32854172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 384
Target Start/End: Original strand, 44544298 - 44544435
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  44544298 tttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttaatgttgcattgaattttgaaagtgacagttaaatagaaacaatttttt 44544397  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | || ||||  |||| |||||| |||||| || |||||    
T  44544398 ttttcaaaagagacacttaaaaaggaacgaagagagta 44544435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 27028004 - 27028239
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||  ||| ||||||||||| | ||||| ||| | ||||| |||||||  || | ||| ||  |||  |||||||    
T  27028004 tactacctccgttcctttttaaccgtcattttttgacattttacacataccaatacattaaataaatgttactttttcttatacaaaaattagtactttt 27028103  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| || | ||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||  |||||   |||||    
T  27028104 attataatagtcttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataaccaagggtaatgttggtaaaacaatatttattgttgca 27028203  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27028204 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 27028239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 45055437 - 45055230
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||| |    
T  45055437 tccgttcttttttaattgtcaatttttaatattttacataaatcaagacaatcaataattatttttacttttgatacaataagttatacttttactataa 45055338  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    || | || ||||||||| || ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||   || | ||||||| |||||||| |||||||   |||||| ||||    
T  45055337 tgacattattaatttaacatctcatttcttatatttctctctccgcaataaataataaaagataatattagtaaaacaacatttaatgatgcattaaact 45055238  T
Q  314 ttgaaagt 321  Q
    ||||||||    
T  45055237 ttgaaagt 45055230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41926940 - 41926701
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactact---tttgatagaattattttt 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||  ||| | || |    
T  41926940 aattactacctctgttcctttttaattgtcacttttt-acattttacacaaaccaagacaatcaataattgttactactacttttgatgcaataagttat 41926842  T
Q  201 acttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctc-tctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    ||||||||||| |||  ||| || |||||| || ||| || |||| ||| |  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  41926841 acttttactatgatgatcttattcatttaacatctcatttcatattttttttatctccgcaataaataactaacgataatattggtaaaacaacatttaa 41926742  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
      || |||  |||||||||||| | | |||||||| |||||    
T  41926741 tgttacatgaaactttgaaagtgatagttaaataggaacaa 41926701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 263 - 384
Target Start/End: Original strand, 44092174 - 44092295
Alignment:
Q  263 aaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacag 362  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||     
T  44092174 aaatatttaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttaaaagtaacagttaaatatgaacaaaattcttctctaaaagtgacaa 44092273  T
Q  363 ttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| ||||| |||| ||||    
T  44092274 ttaaaaaggaacagaggtagta 44092295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 384
Target Start/End: Original strand, 54334181 - 54334448
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatg 215  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||||| ||| ||     
T  54334181 cgttcctttttaactatcactttttgacatttaactcaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatacttttattataata 54334280  T
Q  216 gccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaacttt 315  Q
    |||||  | ||||||||| | |  | |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  54334281 gccttagttatttaatatcttatgtcatatatttttctctccgcgataaataaataagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgcattgaacttt 54334380  T
Q  316 gaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |  ||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  54334381 gaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttc-tccaaaatgacacttaaaaaggaattgagggagta 54334448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6902520 - 6902293
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| || || ||| | |||||| ||||||  ||| |  | || ||||||||| ||| ||||     
T  6902520 tttttaactgtcacattttgatattttacacaaaccaagaccatcaacaattgatactacatttgatgcaataagctataattttactataatgacctta 6902421  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||| | |||||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||||  ||  |||||||||| ||||     
T  6902420 tttatttaatatttcatttcatatatttctctctctgtaataaataactaagaacaatattgataaaacaaaatttaatgttaaattgaactttaaaagg 6902321  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6902320 gacagttaaatagaaacaaaaattttct 6902293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 368
Target Start/End: Original strand, 30861531 - 30861792
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||| ||| || |||||||| |||||||||||    | ||||||| |  || | ||| ||| |||| ||||||    
T  30861531 attactacctccgttcctttttaacgttcactttttgatattttacacaaaccaagacacaaca-aatgttattttttcttatacaataatttatacttt 30861629  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| || | |||  | ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   ||||    
T  30861630 tactataatagtcttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaatagctaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgc 30861729  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||| || ||||  |||||  |||| ||||| ||||||    
T  30861730 attgaactttgataatgacagttaaataggaataaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaa 30861792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 257
Target Start/End: Original strand, 29458202 - 29458342
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||      
T  29458202 gttcatttttaatcgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataaatgttgctacttttgatacaataatttctatttttactataataa 29458301  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctcc 257  Q
    |||| || ||||||||| ||| |  |||| |||||||||||    
T  29458302 ccttatttatttaatatctcattacatatatttctctctcc 29458342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 377
Target Start/End: Original strand, 55141533 - 55141732
Alignment:
Q  175 ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaagg 274  Q
    |||||| |||||||| |||  ||  |||||||||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||| ||  ||||||||| ||||||    
T  55141533 ttactatttttgatataatacttcatacttttactataataaccttattcatttaatatctcattttatatatttatctttcaacaataaataactaagg 55141632  T
Q  275 ttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaac 374  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    | |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| | |||    
T  55141633 gtaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaag---gagttaaattgaaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaagaaac 55141729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26748594 - 26748332
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||  |||  | ||||||||||||||| ||  |||| |  |||| |||| ||  ||||      
T  26748594 tttttaattgtcacattttgactttttacacaaatcaagacaacaaatgcttttactacttttgatacaacaatttatcttttttctataataaccttaa 26748495  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    |||||||||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||   | ||||| |||||||||       
T  26748494 taatttaatacttcattccatatatttctctctcagcaataaatatataagggtaatataggtaaaaccacatttaatgatacattggactttgaaaacg 26748395  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||| |||| |  ||||||| ||| | |  |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  26748394 acagttaattgaaaacaaattttgtatgcaaaagtgacaattataaaggaacggagggagtac 26748332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35077504 - 35077366
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||  | ||| || |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   |    
T  35077504 tttctctctctgcaataaattactaaggacattataggaaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaaat 35077405  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35077404 tctgtaaaagtgacagttataaaggaacggagggagtac 35077366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Original strand, 2858566 - 2858664
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  2858566 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacacagaccaagacaatcaataaaggttgctacttttgatacaataatttctacttt 2858664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 385
Target Start/End: Original strand, 47843971 - 47844105
Alignment:
Q  251 tctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctt 350  Q
    |||||| |||||||||  |||| | || ||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  ||| |     
T  47843971 tctctctgcaataaattactaacggtattataggaaaaacaacatttaatattacattgaactttgaaagtgacagttaattagaaataaaaaatttatg 47844070  T
Q  351 taaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47844071 taaaagtgacagttataaaggaacggagggagtac 47844105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23771404 - 23771267
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||||||  |||||||||   |||| |||||  |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||    
T  23771404 tttctctctctacaataaataatcaagggtaataaaggtaaaacaatatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaattt 23771305  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  23771304 tatgcaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggaagta 23771267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34750896 - 34750635
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||| ||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||  | || |  |||| |||| ||  ||||      
T  34750896 tttttaattgtctcattttgtctttttacacaaatcaagacaacaaatacttttactacttttgatacaacaaattatctttttcctataataaccttaa 34750797  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    | |||||||  |||| || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||| |  |||||||   | |||||||||||||||       
T  34750796 ttatttaatgcttcatttcatatatttctctctctgcaataaatatataagggtaatataggcaaagccacatttaatgatacattgaactttgaaaacg 34750697  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  34750696 acagttaattagaaacaaaatttttatgcaaaagtgacaattataaaggaacggaaggagta 34750635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29803905 - 29803727
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| || || || ||||| | |||||  ||| | || |||||||    
T  29803905 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacgaaccaagacaatcaacaattgatactattattgatgcaataagttatactttt 29803806  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcattt 297  Q
    ||||| |||  ||| || |||||            |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29803805 actataatgatcttattcattta------------atatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacattt 29803727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 347
Target Start/End: Original strand, 2154184 - 2154268
Alignment:
Q  263 aaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  2154184 aaatatctaagagtaatattgataagacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaatattttt 2154268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49168477 - 49168349
Alignment:
Q  251 tctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctt 350  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||  |||||   |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||  |||||     
T  49168477 tctctcctcaataaataactaagagtaatgttggtaaaacaatatttattgttgcattgaactttaaaattgacaattaaatagaaacagaaaatttctc 49168378  T
Q  351 taaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
     |||||||| | ||||||  |||||||||    
T  49168377 caaaaatgatacttaaaaaagaacggagg 49168349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Original strand, 28943523 - 28943704
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaa-gacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||| ||| ||| | || | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| ||||||    
T  28943523 tactacctccgttcttttttaacggtcactttta-acattttacacaaatcaaaggcactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatacttt 28943621  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaa 288  Q
    |||||| || | |||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28943622 tactataatagtcttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggataatattggtaaa 28943704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2642791 - 2642690
Alignment:
Q  283 ggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||| |  |||  ||||| |||||| |||||||||| ||    
T  2642791 ggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaatttatgcaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggaag 2642692  T
Q  383 ta 384  Q
    ||    
T  2642691 ta 2642690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7329081 - 7329004
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttt 184  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7329081 tactacctccatttctttttaattgtcacattttaacattttacacaaactaagacaatcaataattgttactacttt 7329004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24569621 - 24569572
Alignment:
Q  293 catttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24569621 catttaatattacattgaactttgaaagtaacaattaattagaaacaaaa 24569572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28226540 - 28226413
Alignment:
Q  251 tctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctt 350  Q
    |||||| |||||||||  ||||||  | ||| || |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||| |     
T  28226540 tctctctgcaataaattactaagggcattataggaaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaatttatg 28226441  T
Q  351 taaaaatgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    |||||  |||||||| || |||||||||    
T  28226440 taaaagcgacagttataaaggaacggag 28226413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29803706 - 29803631
Alignment:
Q  293 catttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||  |||| ||||| ||||||    
T  29803706 catttaatgttgcattgaactttgaaagtgacaattaaatatgaacaaattttttctccaaaagtgacacttaaaa 29803631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Original strand, 31610081 - 31610139
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31610081 ctccgttcttttataattgtcactttttgatattttacataaatcaagacaatcaataa 31610139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Original strand, 35458493 - 35458549
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  35458493 tactacctccgtttctttttaattgtcacattttaactttttacacaaaccaagaca 35458549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 53282118 - 53282022
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    ||||||||| | | || |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||    |||||||||| ||||||||    
T  53282118 atttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaataattaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgctgcattgaaccttgaaagt 53282022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 8236894 - 8237044
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||| | | |  |||| ||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||||| ||      
T  8236894 gttcctttttaactgacacattttgacattttatataaatcaaaaaagtccataaatgtaactacttttgttataataatttatacttttactataataa 8236993  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaata 267  Q
    ||||||| ||||||||| | | || |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  8236994 ccttgttcatttaatatctaatttcatatatttttctctcggtaataaata 8237044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 349
Target Start/End: Original strand, 22099953 - 22100055
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||| |||  ||||||||  ||||| ||||||| |||||  |  ||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| |||    
T  22099953 tttctctttccataataaataagtaaggataatattagtaaagtaatatttaatgttgcattgaacttcgaaaataacagttaaataaaaacaaaaattt 22100052  T
Q  347 tct 349  Q
    |||    
T  22100053 tct 22100055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28226666 - 28226620
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaag 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  28226666 tccgttcctttttaattgtcacattttgactttttacacaaaccaag 28226620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35077645 - 35077588
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  35077645 ttactccctctgttcctttttaattgtcatattttgactttttacacaaaccaagaca 35077588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20105430 - 20105398
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacattt 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20105430 tactacctccgttcctttttaattgtcacattt 20105398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Original strand, 31610268 - 31610332
Alignment:
Q  278 atattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  31610268 atattggtaaaataacatttaatattgtattaaactttgaaaatgacacttaaatagaaagaaaa 31610332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 164
Target Start/End: Original strand, 47843832 - 47843888
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  47843832 tactccctctgttcctttttaattgtcacattttgattttttacataaatcaagaca 47843888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 114)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 26740117 - 26740396
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26740117 aattactaccttcgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaagacaatcaataagtgttactacttttgatacaattgtttttact 26740216  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  26740217 tttactataatagccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctttctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgtt 26740316  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||||||  || ||||| || |||||| ||| ||||||  |||||||| |||||    
T  26740317 gcattgaactttaaaagtgagagttaaatagaaa-taatttttttttcaaaaataacaattaaaaatgaacggagcgagta 26740396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 108 - 374
Target Start/End: Original strand, 23793254 - 23793525
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-----tgttactacttttgatagaattatttttac 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23793254 tactacctctgttcctttttaattgtcattttttaacattttacacaaaccaagacaattaataaataaatgttactatttttgatacaattatttttac 23793353  T
Q  203 ttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacat 302  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  |    
T  23793354 ttttactataatgaccttattaatttaatatttcattttatatgtttttctctccgtaataaatatctaaggataatattggtaaaacaacattcaatgt 23793453  T
Q  303 tgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaac 374  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  23793454 tacattgaactttgaaaatgacaattaaatagaaacaaaatatttttttaaaaatgacaattaaaaaggaac 23793525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 107 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14263802 - 14263522
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| | || ||||||    
T  14263802 ttactaactccgttcttttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagttatacttt 14263703  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  14263702 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 14263603  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14263602 attgaacttttaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagtaca 14263522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Original strand, 27911655 - 27911878
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27911655 tactacctccgtacctttttaagtgttattttttgacattttacacaaatcaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgtttttactttt 27911754  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27911755 actataatggccttattaatttaatatttcattttatatgtttctctctccgcaataaatatctaagggcaatattggtaaaacaacatttaatattgca 27911854  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaa 330  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  27911855 tggaactttgaaagtgacaattaa 27911878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 330
Target Start/End: Original strand, 27958074 - 27958297
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |  ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27958074 tactacctccgtacctttttaagtgttattttttgacattttacacaaatcaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgtttttactttt 27958173  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27958174 actataatggccttattaatttaatatttcattttatatgtttctctctccgcaataaatatctaagggcaatattggtaaaacaacatttaatattgca 27958273  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaa 330  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  27958274 tggaactttgaaagtgacaattaa 27958297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17718721 - 17718483
Alignment:
Q  147 tttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatat 245  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  17718721 tttacacaaaccaagacaatcaataattgttactatttttgatacaattgtttttacttttactataatggccttattaatttaatatttcatttcatat 17718622  T
Q  246 gtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattt 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |    
T  17718621 gtttctttctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacaacgtttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaat 17718522  T
Q  346 ttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    || |  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17718521 ttatccaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 17718483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3720937 - 3720660
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgtt-actacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| || ||||| |||||  || ||| ||||||||| ||||  ||||||||||    
T  3720937 tactatctccgttcctttttaattgtcactttttaacattttacacaaactaaaacaatcaataagtttgactgcttttgatacaattgcttttactttt 3720838  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  3720837 actataatagccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctctgcaataaatatcttagagtaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 3720738  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3720737 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttattcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 3720660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 383
Target Start/End: Original strand, 33935043 - 33935319
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| |  | || ||||    
T  33935043 tactaccttcgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgatactacttttgatgcaataagctataatttt 33935142  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  33935143 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgca 33935242  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagt 383  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  33935243 ttaaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttcttcaaaagtaacacttaaaaaggaacggagggagt 33935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 368
Target Start/End: Original strand, 14511411 - 14511682
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttc-ttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14511411 ttactatctccgttccttttttaattgtcactttttgaaattttacacaaaccaagacaattaataaatgttactatttttgatacaattgtttttactt 14511510  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt- 303  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||     
T  14511511 ttactataatgaccttattaatttaatatttcattttatatgcttctctctccgcaataaatatctaagggtaatattagtaaaacaacatttaatatta 14511610  T
Q  304 -------gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
           | |||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14511611 cattgaagtattgaactttgaaaatgacagttaaataagaacaaaatttttctctaaaagtgacaattaaaa 14511682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35052311 - 35052032
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | ||||||    
T  35052311 ttactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataagctatacttt 35052212  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  35052211 tactataatgaccttatttatttaatatctcatttcatatatttctctctccacaataaataaataaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 35052112  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||  |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  35052111 attgaactttgaaagtgacagttaaatatgaacaaattttttctccaaaagtgacaaataaaaaggaacggagggagtac 35052032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18291720 - 18291444
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  18291720 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacaaaaatcaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttatactttt 18291621  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18291620 actataatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggataata-tggtaaaacaatatttaatattgca 18291522  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| |||   |||| |||||| |||||||||||||||    
T  18291521 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagcaacaaaaaatttcttcaaaggagacacttaaaaaggaacggagggagta 18291444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23430166 - 23429889
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  23430166 tactacctccattcctttttaatcgtcacattttaacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 23430067  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  23430066 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 23429967  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23429966 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 23429889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 38482775 - 38483011
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  38482775 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 38482874  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  38482875 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 38482974  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaat 343  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  38482975 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaat 38483011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9954906 - 9954629
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| | || |||||||    
T  9954906 tactaccttcattcctttttaattgtcatattttaacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagttatactttt 9954807  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    || || ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  9954806 accataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 9954707  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  9954706 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaactaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggaagta 9954629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 23848538 - 23848816
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| |  | || |||    
T  23848538 ttactacctctgttcctttttaattgtcacattttgacatttgacacaaaccaagacaatcaataattgatactacttttgatgcaataaactatatttt 23848637  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    || ||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  23848638 tattataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataaccaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 23848737  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  23848738 attaaattttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggtagta 23848816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34047093 - 34046831
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | |||||||||||| ||| ||||     
T  34047093 tttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagaatatcaacaattgatactatttttgatgcaataaactatacttttactataatgacctta 34046994  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34046993 ttcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaatatttaatgttgcattgaactttgaaagt 34046894  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34046893 gacagttaaatagaaacaaaaaatttctctaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 34046831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 14061132 - 14061409
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  14061132 tactacctccgttcctttttaattgtcactttttaacattttacacaaaccaagacaatcaataaatattactacttttgatacaataatttatactttt 14061231  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || || ||  | |||||||||| || || || | |||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||| ||||||| | |||||  |||||    
T  14061232 actataatagctttagtcatttaatattacattttatttatttctctctctgtaataaataactaagggcaatattgataaaacaacttttaatgttgca 14061331  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  14061332 ttgacctttgaaagtgacagttaaacagaaacaaaatttttttcaaaaaatgacacttaaaaaggaacggagagagta 14061409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15596601 - 15596324
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||  ||| | || |||||||    
T  15596601 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagataatcaataattgttattactttttatgcaataagttatactttt 15596502  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||  || ||    
T  15596501 actataataaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaaaggtaatattgataaaacatcatttaattttaca 15596402  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  15596401 ttgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 15596324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 21651729 - 21652006
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  21651729 tactaactccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagatagccaatgatcgttactacttttgatgcaataacttgtactttt 21651828  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  21651829 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctttccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 21651928  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| |||||  |  |||||||| |||||||  |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  21651929 ttgaactttaaaagtggcggttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaaaagacacttaaaaaggaacggagagagta 21652006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 112 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43553292 - 43553020
Alignment:
Q  112 acctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttacta 210  Q
    |||||||||  |||||||||||| | ||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  43553292 acctccgtttctttttaattgtcgctttgtgacattttacgcaaaccaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaataattgatacttttacta 43553193  T
Q  211 ttatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattga 310  Q
    | ||  |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||  |||||||||    
T  43553192 taatatccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatattgataaaacaacgtttaaagttgcattga 43553093  T
Q  311 actttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||| |  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43553092 actttgaaagtgacagttaaattgaaac-aattttttttccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 43553020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4057535 - 4057306
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||   || |  | |||||||||||| |||     
T  4057535 gttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaattaacaattgatactactttttatgccataagctatacttttactataatga 4057436  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
     ||| |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4057435 tcttattaatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataattaaggacaatattggtaaaacaacatttaatattgcattgaactttg 4057336  T
Q  317 aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  4057335 aaagtgacagttaaataggaacaaaatttt 4057306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 116 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31028902 - 31028634
Alignment:
Q  116 ccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttacttttactattat 214  Q
    |||||| |||||||  || || ||| ||||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  31028902 ccgttcctttttaacggttactttttgacattttatacaaaccaagataatcaatatatgttatta-ttttaatacaattgtttttacttttactataat 31028804  T
Q  215 ggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactt 314  Q
    | |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31028803 gaccttattaatttaatgtttcatttcatatgtttctctctccgcaataaacatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactt 31028704  T
Q  315 tgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||| ||| || | ||||||| |||||    
T  31028703 ttaaagtgacagttaaataaaaacaaaaattttccctaaaagtgacaattataaagaaacggagagagta 31028634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 334
Target Start/End: Original strand, 14228305 - 14228531
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||   || |  | |||||||    
T  14228305 tactacctccgttcatttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgtcataagctatactttt 14228404  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  14228405 actataatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataac-aaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgta 14228503  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatag 334  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14228504 ttgaactttgaaagtgacagttaaatag 14228531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 368
Target Start/End: Original strand, 12342600 - 12342858
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || ||||||||||    
T  12342600 tacctctgttcctttttaattgtcatattttgacattttacataaaccaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtacttttact 12342699  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  12342700 ataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaatagttaaagataatattggtaaaacaatatttaatgttgcattg 12342799  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||| ||||  || ||||||||    
T  12342800 aactttgaaagtgatagttaaatagaaacaaaaaatttcttcaaaagagagagttaaaa 12342858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34982087 - 34981809
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || |||   |||||||||||||  ||| |  | ||||||    
T  34982087 ttactacctccgttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaaaacaatcaacaattaatactacttttgatgcaataagctatacttt 34981988  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  34981987 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatgtatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgc 34981888  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||  |||||  ||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  34981887 attgaactttgaaagtgacagttaagtaggaacaaaaaatttctccaaaagcgacacttaaaaagtaacggagggagta 34981809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 39303498 - 39303776
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaatt-gtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||    
T  39303498 tactacctccgttcctttttaatttgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatacttt 39303597  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| | |  | |||| ||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  39303598 tactataatgaccttattcatttaatatcttatatcatatatttctctctccgcaataaaaaactaaagacaatattggtaaaacaacatttaatgttgc 39303697  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39303698 attgaacttcgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacacttaaaaaggaacggagggagta 39303776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18842788 - 18842513
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  18842788 attactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagataatcaataaatgttactacttttgatacaataatttttattt 18842689  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||  |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  18842688 ttactataataaccttatttatttaatatctcattacatatatttctctctccacaat-aataaataagggtaatattagtaaaataacatttaatattg 18842590  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    |||||||||   ||||| ||| |||||||| |||||||   ||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  18842589 cattgaactagtaaagtgacacttaaataggaacaaaaaaattctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggga 18842513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 321
Target Start/End: Original strand, 32010066 - 32010281
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  32010066 ttactacttccgttcatttttaattgtcactttttaacatttttcacaaaccaagacaatcaataattgctactacttttgatgcaataatttatacttt 32010165  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  32010166 tactataatgaccttgttcatttaacatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 32010265  T
Q  306 attgaactttgaaagt 321  Q
    |||||| |||||||||    
T  32010266 attgaaatttgaaagt 32010281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36058491 - 36058213
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  || | | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || |||||    
T  36058491 attactatctccgttcctttttaattgtcgcattttgacattttacataaattaaaatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtactt 36058392  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  36058391 ttactataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctcagcaataaataactaaggataatattg-taaaacaacatttaatgttg 36058293  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  36058292 cattgaactttgaaagtgatagttaaatagaaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagtgagta 36058213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 167460 - 167737
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcga-cattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||  | ||||| ||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | ||  |||||    
T  167460 tactacctctgttcctttttaattgtcacttttttaacatttcacacaaaccaatataatcaataaatattactacttttgatacaat-acttcaacttt 167558  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||  |||| |||||||||||| ||| || |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  167559 tactataataaccttattaatttaatatctcattttatatatttatctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgc 167658  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  167659 attgaactttgaaagtgacagttaaattaaaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggagta 167737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10180628 - 10180350
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || ||||||    
T  10180628 ttactacatccgtttctttttaattgtcatattttgacattttacataaatcaagatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtacttt 10180529  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | | |||||  ||||    
T  10180528 tactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctttctccgcaataaataactaaagataatattggtaaaataacgtttaatgttgc 10180429  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  10180428 attaaactttgaaagtgacaattaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaatggaggaagta 10180350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 382
Target Start/End: Original strand, 38128530 - 38128798
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  38128530 tactacctccgttcctttttaattgttacattttgacattttatacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatactttt 38128629  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  38128630 actataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctatctccgtagtaaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 38128729  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
           |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  38128730 -------ttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggag 38128798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26062963 - 26062688
Alignment:
Q  109 actacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | || |||||    
T  26062963 actacctccattcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataagctatattttta 26062864  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || ||||  ||||||    
T  26062863 ctataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaaca-ttaatgttgcat 26062765  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||   || | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  26062764 tgaacttcgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaaattttctaaaaatgacacttaaaaaggaacggagagagta 26062688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 25812732 - 25813008
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| || |||   |||||||||| ||  ||| |  | |||||||    
T  25812732 tactacctccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaacaagataatcaacaattaatactactttttatgcaataagctatactttt 25812831  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||  ||| || |||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||   ||||    
T  25812832 actataatgaacttattcatttaatatt-catttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgctgca 25812930  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25812931 ttgaactttgaaaatgccagttaaataggaacaaaatatttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 25813008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6757663 - 6757388
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||||    
T  6757663 tactacctccgttccttttttactgtcactttttgacattttacacaaatcaagacactcaataaatgttactttttcttatataataatttatactttt 6757564  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || | |||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||    
T  6757563 actataatagtcttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgca 6757464  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  6757463 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacaattaaaaaggaacagagggag 6757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13327938 - 13327759
Alignment:
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||  |||    
T  13327938 ttactataatgaccttatttatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaagataatattggcaaaacaacatttaatgttg 13327839  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  13327838 cattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggatggagta 13327759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 40228537 - 40228310
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | |||||||||||| ||| ||||     
T  40228537 tttttaattgtcacattttgacgttttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataagctgtacttttactataatgacctta 40228438  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||    
T  40228437 ttcatttaatatgtcatttcatatatttctctctccacaataaataactaagaataatattggtaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagt 40228338  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
     ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  40228337 gacagttaaataggaacaaattttttct 40228310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11994139 - 11993872
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | ||||||    
T  11994139 ttactacatccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaataaacaattgatactacttttgatgcaataagctatacttt 11994040  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| |            |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  11994039 tactataatgaccttattcatttaatatat------------ttctctctccgctataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgc 11993952  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  11993951 attaaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaatggatggagtac 11993872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 12248753 - 12249031
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  12248753 tactacctccgttcctttttaattgacagtttttgacattttacacgaaccaagacattcaataaatattactacttttgatacaataatatatactttt 12248852  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12248853 actataataaccttattcatttaatatttcattttatatatttctttctccacaataaataagcaaggataatattggtaaaacaacatttaatattgca 12248952  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaat-agaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||  |   |||||||| ||||  |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  12248953 ttgaacttcgaaagtgacagttaaatgagaacaattttttttcttcaaaagcgacacttaaaaaagaacggagggagta 12249031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23855817 - 23855536
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||   |  ||||    
T  23855817 aattactacctccgttcctttttaatcgtcattttttgacattttacataaaccaatacaatcaataaatattactacttttgatacaatacgtcatact 23855718  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||  ||    
T  23855717 tttactataataaccttatttatttaatatctcattttatatatttatctctccacaataaataactaagggtaatattgat-aaacaacatttaatgtt 23855619  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa-atttttcttt-aaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| | |||||||||||| ||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  23855618 gcaataaactttgaaagtgacggttaaattgaaacaaatttttttctttcaaaaatgacacttaaaaaagaacggagggagta 23855536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1245571 - 1245326
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || |||||    
T  1245571 attattacatccgttcctttttaattgtcactttttgacattttacataaatcaagacaatcaataattgttactacttttgattcaataagttatactt 1245472  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||  | ||| || |||| ||| || |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||||||  |||    
T  1245471 ttactataatgaccttattcatttaaattctcatttcatatatttttcactccacaataaataattaaggataatattggtaaaataacatttaatgttg 1245372  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctt 350  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||  ||||||||    
T  1245371 cattgaactttgaaaatgacaattaaataagaacaatttttttctt 1245326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 25703561 - 25703837
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgt-tactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| || |||   |||||||||| ||  ||| |  | |||||||    
T  25703561 tactacctccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaacaagataatcaacaattaatactactttttatgcaataagctatactttt 25703660  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||  ||| || |||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  25703661 actataatgatcttattcatttaatatt-catttcatatatttctctctccacaataaataactaaggacaatattggtaaaataacatttaatgctgca 25703759  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25703760 ttgaactttgaaaatgccagttaaataggaacaaaatatttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 25703837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 334
Target Start/End: Original strand, 43641982 - 43642199
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||     
T  43641982 gttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaactaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataaattatacttttactataatga 43642081  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
    |||| ||  ||||| || | | || |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  43642082 ccttattcttttaacatctaatttcatatatttctctccccgcaataaataactaaggataatattggtaaaataacatttaatgttgcattgaactttg 43642181  T
Q  317 aaagtaacaattaaatag 334  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  43642182 aaagtgacagttaaatag 43642199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 8730810 - 8731087
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| |||||    
T  8730810 attactacctccattcctttttaagtgccactttttaacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatactt 8730909  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || |||||  | ||||| ||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||    
T  8730910 ttactataatagccttaatcatttattatctta-ttcatatatttctctctccgcaataaata-ctaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttg 8731007  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  8731008 cattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacacttagaaaggaacggagggagta 8731087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13174188 - 13173909
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||  |||||    
T  13174188 attactccctccgttcctttttaactgtcactttttgacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataattagtactt 13174089  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || |||||  | ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||   |||    
T  13174088 ttactataatagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatgttagtaaaacaacatttattgttg 13173989  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  13173988 cattgaactttaaaagtgacagttaaataggaacaaaaactttctcttaaagtgacacttaaaaaggaacatagggagta 13173909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19972536 - 19972260
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||   || | ||| ||| |||| |||||||    
T  19972536 tactacctccgttcctttttaacggtcactttttgacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttacattttcttatacaataatttatactttt 19972437  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || |||||  |  |||||||| | | || |||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||    
T  19972436 actataatagccttagtcgtttaatatcttatttaatatatttctctctctgtaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgca 19972337  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  19972336 ttgaattttgaaagtgacagttaaatagaaac-aaatttttttttaaaagtgatacttaaaaaagaacggagggagta 19972260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 21020297 - 21020573
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||   || | ||| ||| |||| |||||||    
T  21020297 tactacctccgttcctttttaacggtcactttttgacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttacattttcttatacaataatttatactttt 21020396  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || |||||  |  |||||||| | | || |||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||    
T  21020397 actataatagccttagtcgtttaatatcttatttaatatatttctctctctgtaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttgca 21020496  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  21020497 ttgaattttgaaagtgacagttaaatagaaac-aaatttttttttaaaagtgatacttaaaaaagaacggagggagta 21020573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 381
Target Start/End: Original strand, 16700994 - 16701150
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  16700994 atttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatattgtattgaactttaaaagtgac 16701093  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggga 381  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16701094 agttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggaggga 16701150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16656955 - 16656681
Alignment:
Q  110 ctacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttac 208  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||| | ||||| |||||||  ||| |  | |||||||||    
T  16656955 ctacatccgtttctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacactcaacaattgatactaattttgatgcaataaactatacttttac 16656856  T
Q  209 tattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    ||| |||  ||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  16656855 tataatgaacttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataa-taactaagaataatattgctaaaacaacatttaattttgcatt 16656757  T
Q  309 gaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||   |||||| |||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  16656756 gaactttgaaagtgacagttaaatgagaacaaattttttctccaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggagta 16656681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 2888451 - 2888728
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||    
T  2888451 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagacaatcaataaatgttgctacttttgatacaataatttctattttt 2888550  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||| | ||  |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||  | |||||||  |||||    
T  2888551 actttaataaccttatttatttaatatctcattacatatatttctctctccacaat-aataaataagggtaatattagtaaagtaacatttaatgttgca 2888649  T
Q  307 ttgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||||| |||||||   ||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  2888650 ttgaactatgtaaagtgacacttaaataggaacaaaaaaattctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 2888728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 384
Target Start/End: Original strand, 40603928 - 40604111
Alignment:
Q  201 acttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaac 300  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||||||     
T  40603928 acttttactatgatgaccttattcatttaatatttcatttcatatatttatctctccgcaataaataattaaggataatattggtaaaataacatttaat 40604027  T
Q  301 attgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| |  |  | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40604028 gttgcattgaactttgaaaatgacagttaaataggaacaaaatttttatccatcagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 40604111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12763640 - 12763415
Alignment:
Q  159 aagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctcc 257  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||||| ||  | || || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  12763640 aagacaatcaataaatgttactgtttttgatacaataattgatacttttactataatatcattattcatttaatatctcatttcatatatttctctctcc 12763541  T
Q  258 gcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaat 357  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||  |||||  |||| |    
T  12763540 gcaataaataactaagggtaatattgataaaacaacatttaaagttgcattgaactttgaaagtgacggttaaattgaaacaaaa-atttctccaaaagt 12763442  T
Q  358 gacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  12763441 gacacttaaaaaggaacggaaggagta 12763415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 45281361 - 45281638
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  45281361 tactagctccgttcccttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatactttt 45281460  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||  || || |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||    
T  45281461 actataatcaccttattcatttaatatc-catttcatatatttccctctccacaataaataactaaggataatattggcaaaacaacatttaatgttgca 45281559  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa-atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||  |||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  45281560 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaagaaatttttttctccaaaagtgacacttaaaaaagaatggagggagta 45281638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 222 - 384
Target Start/End: Original strand, 40521340 - 40521503
Alignment:
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatat--gtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaa 319  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40521340 ttaatttaatatttcatttcatatatgtttctctctccgcaataaatatttaaaggtaatattggtaaaacaacatttaatattgcattgaactttgaaa 40521439  T
Q  320 gtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    || ||| |||||||| || ||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  40521440 gtgacagttaaataggaa-aaaaaatttctccaaaagtgacaattaaaaaggaacggggggagta 40521503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2335597 - 2335413
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| || | |||  | ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  2335597 tacttttactataatagtcttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttat 2335498  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
      |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  2335497 tgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacacttaaaaaggaacggatggagta 2335413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 8553997 - 8554276
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  8553997 attactaccttcgttccttttcaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaatcaataaatgttgctacttttgatacaataatttttattt 8554096  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||  |||| || |||||| || ||| |  |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||    
T  8554097 ttactataataaccttatttatttaacatctcattacatatatttctctctccacaat-aataaataaggataatattagtaaaataacatttaatgttg 8554195  T
Q  305 cattgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| || ||||| ||| |||||||  |||||||   ||||  || |  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  8554196 cattgaactatgtaaagtgacacttaaataagaacaaaaaaattctacaagagagacacttaaaaaggaacggagggagta 8554276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 342
Target Start/End: Original strand, 11707561 - 11707703
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| ||| | || || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11707561 tacttttactataatgactttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatttaa 11707660  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
      |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11707661 tgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 11707703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 27518696 - 27518967
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||| ||  ||| | || |||| ||    
T  27518696 tactaccttctttcttttttaatagttacattttgacattttacataaaccaatatagtcaatgattgttactactttttatgcaataagttgtactgtt 27518795  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||      ||||| | |||||||  ||| |    
T  27518796 actataatgactttatttatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggataa------taaaataacatttaatgttgta 27518889  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  27518890 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagagagta 27518967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 2456095 - 2456320
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | | ||| || |||||||||||||||  ||| | || ||||    
T  2456095 aattactacctccgattctttttaatcgtcacattttgacattttacataaatcaatatagtcaatgattgttactacttttgatgcaataagttgtact 2456194  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||||| | || |||| ||||||||  |||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  2456195 tttactataatgaccttattcatttaatattttattttatatatttctctc--cgcaattaat---taaagataatattggtaaaacaacatttaatgtt 2456289  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatag 334  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2456290 gcattgaactttgaaagtgacagttaaatag 2456320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 342
Target Start/End: Original strand, 8453218 - 8453452
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||||    
T  8453218 ttactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaactaagataatcaataattgttactacttttgatgcaataaattatacttt 8453317  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    || ||| ||| | || || ||||||||| | | || |||| ||  | ||||| |||||||||    ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  8453318 tattataatgacattattcatttaatatcttatttcatatatt--tatctccacaataaataatcgagggtaatattgataaaacatcatttaatgttgc 8453415  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||    
T  8453416 attgaactttaaaattgacagttaaatagaagcaaaa 8453452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7484001 - 7483724
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||  |||||    
T  7484001 attactacctccgttcctttttaactgtcactttttgatattttacacaaactaagacactaaataaatgttactttttcttatacaataattcatactt 7483902  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || |||||  | ||||||||| | | || |||| ||||||||  |  ||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||    
T  7483901 ttactataatagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctc--cataataaataattaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttg 7483804  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  7483803 cattgaactttgaaagtgacagtgaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacacttaaaaaggaacggatggagta 7483724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Original strand, 39615451 - 39615670
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||  |||| |    
T  39615451 tttttaattgtcacattttgatattttacataaaccaagacaattaataatgttgttacttttgatacaataatttttatttttactataataaccttat 39615550  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg-aaagt 321  Q
    | ||||||||| ||| |  |||| ||||||  | | |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||  || |||||    
T  39615551 ttatttaatatctcattatatatatttctcatttcacaat-aataaataaggataatattagtaaaataacatttaatgttgcattgaacgatgtaaagt 39615649  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
     ||| |||||||| |||||||    
T  39615650 gacacttaaatagcaacaaaa 39615670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6750784 - 6750597
Alignment:
Q  195 atttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatca 294  Q
    |||| |||||||||||| || | |||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||    
T  6750784 atttatacttttactataatagtcttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaaca 6750685  T
Q  295 tttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  6750684 tttattgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaaatgacaattaaaaaggaacagagggag 6750597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35296301 - 35296066
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |  || | ||| ||| |||  |||||||    
T  35296301 tactacctccgttcctttttaactgtcactttttgatattttacacaaaccaagacactcaataaatgttattttttcttatacaataattagtactttt 35296202  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || |||||  | ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| | |||||||||  |||||   |||||    
T  35296201 actataatagccttaatcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaaggtaatgtcggtaaaacaatatttattgttgca 35296102  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  35296101 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaa 35296066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8672753 - 8672584
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  8672753 attactacttccgttcctttttaattgtcattttttgatattttacacaaaccaaaataatcaataaatgttattatttttgatacaattgtttttactt 8672654  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaagg 274  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8672653 ttactataatgaccttatttatttactatttcattttttatgtttctctctcggcaataattatctaagg 8672584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 17074568 - 17074800
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  17074568 tacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagacaatcaataaatattgctacttttgatgcaataatttttatttttact 17074667  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||  |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||| ||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| ||||||   |||||||  ||||||||    
T  17074668 ataataaccttatttatttaatatctcattacatatatttttctctccacaat-aataaataaggataatattagtaaaattacatttaatgttgcattg 17074766  T
Q  310 aactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||| || ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  17074767 aactatgtaaagtgacatttaaataggaacaaaa 17074800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17573702 - 17573470
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  17573702 tacctccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacacaaaccaagacaatcaataaatattgctacttttgatgcaataatttttatttttact 17573603  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||  |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||| ||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| ||||||   |||||||  ||||||||    
T  17573602 ataataaccttatttatttaatatctcattacatatatttttctctccacaat-aataaataaggataatattagtaaaattacatttaatgttgcattg 17573504  T
Q  310 aactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||| || ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  17573503 aactatgtaaagtgacatttaaataggaacaaaa 17573470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 331
Target Start/End: Original strand, 15647475 - 15647606
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| ||| | || || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15647475 tacttttactataatgacattattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatttaa 15647574  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaa 331  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15647575 tattgcattgaactttgaaagtgacagttaaa 15647606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33314786 - 33314523
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| || ||||||| |||| ||  ||| | || | |||||||||| ||| | ||     
T  33314786 tttttaattgtcgcattttgacattttacataaaccaatatagtcaatgattgttactattttttatgcaataagttgtccttttactataatgacttta 33314687  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| | ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33314686 ttcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgtaataaataattaaggatcatactagtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagt 33314587  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaa-tgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||| | |||| |||||||||  |||||| |||||   ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  33314586 gacagtcaaatggaaacaaaaaatttcttcaaaaagaaacacttaaaaaggaacggacggagta 33314523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 348
Target Start/End: Original strand, 1202442 - 1202668
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttg 221  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| || ||| | ||||| |||||||  ||| | || |||||||||||| ||| ||||     
T  1202442 tttttaattgtcacattttaacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatactatttttgatgcaataagttatacttttactataatgacctta 1202541  T
Q  222 ttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagt 321  Q
    || ||||||||| | | || |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  1202542 ttcatttaatatcttattttatatatttctctttccgcaataaataactaaagacaatattgataaaacaatatttaatgttgcattaaactttaaaagt 1202641  T
Q  322 aacaattaaatagaaacaaaatttttc 348  Q
     ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  1202642 gacagttaaatatgaacaaaaattttc 1202668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Original strand, 15623687 - 15623808
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| ||| | || || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15623687 tacttttactataatgacattattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatttaa 15623786  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagt 321  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  15623787 tattgcattgaactttgaaagt 15623808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8672400 - 8672285
Alignment:
Q  266 tatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagtta 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||| |||    
T  8672400 tatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatagatacaaattttttttctaaaagtgacaatta 8672301  T
Q  366 aaatggaacggaggga 381  Q
    ||| | ||||||||||    
T  8672300 aaaagaaacggaggga 8672285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41308153 - 41308026
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatag-aattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | || ||||||    
T  41308153 tactacctccgtttctttttaattgtcatattttgacattttacatataccaagacaattaataattgttactacttttgattgcaataagttatacttt 41308054  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatat 233  Q
    |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  41308053 tactataatgaccttattcatttaatat 41308026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 338
Target Start/End: Original strand, 9808026 - 9808188
Alignment:
Q  176 tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggt 275  Q
    |||||||||||||  ||| | || |||||||| ||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  9808026 tactacttttgatgcaataagttatacttttattataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaatga 9808125  T
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaac 338  Q
     |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||    
T  9808126 caatattagtaaaacaacatttaatattgtattgaactttgaaaatgagagttaaatagaaac 9808188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29126158 - 29125880
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||| |||| |||| ||||| | ||||||||||   | ||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||  |||| |  ||||     
T  29126158 tactccctctgttcctttttcactgtcacattttagctttttacacaaaccaagacaacaaatacttttactacttttgatacaacaatttatctttttc 29126059  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||  ||||  | |||||||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  ||||||| | |||||    
T  29126058 ctatgataaccttaatcatttaatacttcatttcatatatttctctctctgcaataaatatataagcgtaatataggtaaaaccacatttaataatgcat 29125959  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
    || |||||||||   ||| |||| || ||||||| ||||| |  |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  29125958 tggactttgaaaacgacagttaattaaaaacaaattttttatgcaaaagtgacatttataaaggaacggagggagtaca 29125880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Original strand, 35498090 - 35498288
Alignment:
Q  145 attttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgat 243  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || | ||| || ||| |||||  ||  | ||    
T  35498090 attttacacaaaccaagacaattcataaatgttactacttttgatataataatttatacttttactataatagtcttatttattcaatatcacatatcat 35498189  T
Q  244 atgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    || ||||| |||| | |||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| |||  ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35498190 atatttctatctctgtaataaataactaaggacaatattgataaaactacatctaatgttgcattaaactttaaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 35498288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38222069 - 38221793
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |  || | ||| ||| |||| |||||||    
T  38222069 tactaactccgttcctttttaacggtcactttttgacactttacacaaaccaagacattcaataaatgttattttttcttatataataatttatactttt 38221970  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || |||||  | ||||||||| | | || |||| ||||| |||||   |||||||  ||||| |||| || |||||||| ||||||   ||  |    
T  38221969 actataatagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctttctccatgataaataattaagggtaatgtttgtaaaacaacatttattgttata 38221870  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  38221869 ttgaactttgaaagtgacaattaaatag-gacaaaaaatttctctaaaaatgacacttaaaaagaaacggagagagta 38221793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41305757 - 41305666
Alignment:
Q  251 tctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  41305757 tctctccgcaataaataattaagggtaatattgataaaacatcatttaatgttgcattgaactttaaaagtgacagttaaataaaaacaaaa 41305666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 385
Target Start/End: Original strand, 43553366 - 43553504
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||| |||| | ||| |||||||| |||||||  ||    
T  43553366 tttctctctccgtaataaataagtaaggataatattggtaaaataatatttaatgttgcattgaacttcgaaaatgacagttaaataggaacaaaaaatt 43553465  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||  ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43553466 tctccaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagtac 43553504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38074532 - 38074261
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |   ||||| | ||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||    
T  38074532 tactccctccgttcttttttaattgtcactttaagtt-ttttatacaaatcaagacaacaaatatattttactacttttgatacaacaatttttcttttt 38074434  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     |||| ||   |||| | ||||||||| ||| || |||| ||| |||||| ||||||||||   |||| ||||| ||  |||||| |||||||  ||| |    
T  38074433 cctataataatcttgctcatttaatatctcatttcatatatttatctctctgcaataaataatcaagggtaataatgtcaaaacaacatttaatgttgta 38074334  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    || |||||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  38074333 ttaaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaatttctacaaaagtgacaattaaaaaggaacggagg 38074261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35028693 - 35028585
Alignment:
Q  277 aatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| | |||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  35028693 aatattggtaaaacaatatttaatgttgcattgaactttaaaattgaca--taaattgaaacaaaatttttcttcaaaagtgacatttaaaaaggaacgg 35028596  T
Q  377 agggagtacat 387  Q
    | |||||||||    
T  35028595 aaggagtacat 35028585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 384
Target Start/End: Original strand, 13132239 - 13132376
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||  | ||| || |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   |    
T  13132239 tttctctctctgcaataaattactaaggacattataggaaaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaaat 13132338  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||    
T  13132339 tctgtaaaagtgacagttataaaggaacggagcgagta 13132376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 287
Target Start/End: Original strand, 36111926 - 36112104
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| || | |||||||    
T  36111926 tactacctccgttcctttttaactgtcacttt--gacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatctatactttt 36112023  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaa 287  Q
    ||||| ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  36112024 actataataaccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaataactaagggtaatgttggtaa 36112104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3513542 - 3513390
Alignment:
Q  179 tacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaa 278  Q
    ||||||||||| ||| |  | ||| |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||| |||||| | |||||||| |||| | |||    
T  3513542 tacttttgatacaataagctatacatttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttatctctctgtaataaataactaatgataa 3513443  T
Q  279 tattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaa 331  Q
    ||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  3513442 tataggtaaaacaacatttaatgttgcattaaactttgaaagtgacagttaaa 3513390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13328227 - 13328123
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || || || |||||||||| ||| ||| | || |||||||    
T  13328227 tactatctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaactaagacaatcaaaaattgatactacttttaatacaataagttatactttt 13328128  T
Q  207 actat 211  Q
    |||||    
T  13328127 actat 13328123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 384
Target Start/End: Original strand, 8954860 - 8954959
Alignment:
Q  285 taaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||  |||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  8954860 taaaacaacatttaatattgtattgaactttgaaagtaacagttaattagaaacaaaaaaattctacaaaaatgacaattaaaaagaaacggaaggagta 8954959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17313216 - 17313126
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaacttt 315  Q
    ||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||  |||| |||||||||    
T  17313216 atttaatatctcatttaatatatttctcactccgcaataaataactaaggttaatatttgtaaaataacatttaatgttgcgttgaacttt 17313126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35051963 - 35051828
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||  || |||    
T  35051963 tttctctctccgtaataaataagtaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgcattgaacttcgaaagtgacagttaaagaggaac--aacttt 35051866  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | || ||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  35051865 ttttcaaaagagacacttaaaaagaaacggagggagta 35051828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 29091075 - 29091148
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttga 187  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  29091075 tccgttcttttttaattgtcactttttgacattttacacaaatcaagacaatcaataaatattactacttttga 29091148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6661031 - 6660931
Alignment:
Q  286 aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   || | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6661031 aaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaaaattatgtaaaagtgacagttataaaggaacggagggagtac 6660932  T
Q  386 a 386  Q
    |    
T  6660931 a 6660931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6741433 - 6741333
Alignment:
Q  286 aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   || | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6741433 aaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaaaattatgtaaaagtgacagttataaaggaacggagggagtac 6741334  T
Q  386 a 386  Q
    |    
T  6741333 a 6741333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 386
Target Start/End: Original strand, 13935194 - 13935338
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||  || || |||||||||||||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  13935194 atatatttctctctccataataaataagtagggataatattggtaaaataatatttaatgttgtattgaacttcgaaagtaacagttaaatatgaacaaa 13935293  T
Q  342 atttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
    ||| |||   ||||   ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13935294 attattcaccaaaagaaacacttaaaaaggaacggagggagtaca 13935338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45317730 - 45317632
Alignment:
Q  286 aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||   |||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  45317730 aaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacagttaattggaaacaaaaaaattctgtaaaagtgacagttataaaggaacggagggagta 45317632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11727839 - 11727666
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||||  |||| |  |||||||||||||| ||  |||| |  ||||     
T  11727839 tacttcctctgttcctttttaattgtcgcattttaactttttacacaaaccaagacaacaaatacttctactacttttgatacaaaaatttatctttttt 11727740  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatat 281  Q
    |||| ||   |||  |||||||||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11727739 ctataataatcttaataatttaatacttcattccatatatttctctctcagcaataaatatataagggtaatat 11727666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41890603 - 41890510
Alignment:
Q  283 ggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||| |  |||| ||||| |||||| |||||||    
T  41890603 ggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaatttatgcaaaagtgacaattaaaaaggaacgg 41890510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35029803 - 35029644
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||| | ||| ||| | |||  |||| | | ||||||||||||| |||  ||  |||||||    
T  35029803 tactacctccgttcctttttaattgtcattttttaacattttatacaaatcaatataatccataaatatcactacttttgatacaatacttcatactttt 35029704  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaata 267  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  35029703 actataataaccttattcatttaatatttc-atttatatatttctctctccacaataaata 35029644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 342
Target Start/End: Original strand, 41701464 - 41701700
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| ||| ||||||| | ||||| | |||||  || |  || ||| |||| || |||    
T  41701464 ttactacctccgttcctttttaactgtcactttttaatattttacacaaatcaagacactcaataaatattactttttcttgtacaataatttatatttt 41701563  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| || | |||  | ||||||||||| | || |||| ||||||| || |||||||||| ||||   |||| ||||||||| | ||||||   ||||    
T  41701564 tactataatagtcttagtcatttaatattttatttcatatatttctctttctgcaataaataactaaaagtaatgttggtaaaagaacatttattgttgc 41701663  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||  |||||||    
T  41701664 attgaactttaaaagtgtcagttaaatacgaacaaaa 41701700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 355
Target Start/End: Original strand, 7605917 - 7606128
Alignment:
Q  143 acattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattg 241  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||  ||| | || |||||||||||| |||  ||| || |||||| || | | ||     
T  7605917 acattttacacaaatcaagacaatcaataatcattattacttttaatgcaataagttatacttttactataatgatcttatttatttaacatctaatttc 7606016  T
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| ||||||||| |   |||||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| |||||||  ||||||    
T  7606017 atatatttctctctacc--ataaataattaaggataatattggtaaaataacatttaatattgtattgaacttgaaaagtgacagttaaataagaacaaa 7606114  T
Q  342 atttttctttaaaa 355  Q
    |  |||||| ||||    
T  7606115 aaatttcttcaaaa 7606128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31964820 - 31964726
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||    
T  31964820 ctccgttcctctttaattgtcattttatgacattttacacaaaccaagacaatcaataaatgttactatttttgatacaataattgatactttta 31964726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17313399 - 17313286
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaa-taatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| | | || || ||||| ||||||||||  ||| | || |||||||    
T  17313399 tactacctccgttcccttttaattgttacattttgacatcttacataaacgaagatagtcaattattgttattacttttgatgcaataagttctactttt 17313300  T
Q  207 actattatggcctt 220  Q
    ||||| ||| ||||    
T  17313299 actataatgacctt 17313286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39663837 - 39663772
Alignment:
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39663837 taattttggtaaaacaacatttaatattgtattaaaatttgaaaataataattaaatagaaacaaa 39663772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11163382 - 11163246
Alignment:
Q  248 ttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    |||||||||  |||||||||   |||| |||||  || |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||    
T  11163382 ttctctctctacaataaataatcaagggtaataaaggcaaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaaatt 11163283  T
Q  348 ctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |  |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  11163282 atgcaaaagtgacaattaaaaaggaacagagggagta 11163246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 342
Target Start/End: Original strand, 37998229 - 37998328
Alignment:
Q  242 atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa 341  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||  || ||| || || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  37998229 atatatttctctctctgcaataaattactaagaatattatagg-aagacaacatttaatattacattgaactttgaaagtaacagttaattaaaaacaaa 37998327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 342
Target Start/End: Original strand, 41644334 - 41644382
Alignment:
Q  294 atttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41644334 atttaatattgcattgaattttgaaaatgacaattaaatagaaacaaaa 41644382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45317901 - 45317853
Alignment:
Q  116 ccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  45317901 ccgttcctttttaattgtcacattttgactttttacacaaaccaagaca 45317853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10013384 - 10013317
Alignment:
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaac 290  Q
    |||||||||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10013384 taatttaatacttcattccatatatttctctctcagcaataaatatataagggtaatataggtaaaac 10013317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 11707443 - 11707518
Alignment:
Q  114 ctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgat 188  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11707443 ctccgtttctttttaattgtcatatttttacattttacataaattaagacaatcaataattattactacttttgat 11707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1739940 - 1739886
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa 172  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  1739940 gttcctttttaattgtcactttttgacattttacataaatcaacacaatcaataa 1739886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30205538 - 30205440
Alignment:
Q  286 aaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||   || | ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  30205538 aaaacaacatttaatgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaataaaaaaattatgtaaaagtgacagttataaaggaacggggggagta 30205440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35052379 - 35052305
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactac 181  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||| ||| ||| | ||| |||||||||||    
T  35052379 tactacctccgttcttttttaagtgtcactttaagacattttacacaaatcaatacattcaataaatgttactac 35052305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Original strand, 41643473 - 41643555
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgata 189  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||    
T  41643473 tactatctccgttcatttttaattgtaattttttgacattttacacaaaccaataaagtcaataaatgttactacttttgata 41643555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40608111 - 40608022
Alignment:
Q  288 aacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaac-aaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgg 376  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||| || |||||||    
T  40608111 aacaccatttaatgttacattgaactttgaaagtgacacttaattagaaacaaaaaatttcctgtaaaagtgacagttataaaggaacgg 40608022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Original strand, 11015868 - 11015951
Alignment:
Q  128 aattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactat 211  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  11015868 aattgtcacgttttgacatttaacataaaccaaaacaattattaaatgctactac-tttgatgggataatttttactattactat 11015951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17718950 - 17718906
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataa 155  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17718950 taccttcgttcctttttaattgtcactttttgacattttacataa 17718906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 382
Target Start/End: Original strand, 147102 - 147387
Alignment:
Q  99 aaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatt 197  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  147102 aaaaaaaaatactacctccgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaatcaaaacaattaataaatgttactacttttgatacaattgtt 147201  T
Q  198 tttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattg-atatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatt 296  Q
    || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  147202 ttcatttttactataatggccttattaatttaatatttttatttcatatgtttctctcttcacaataaatatctaagggtaatattgataaaacaacatt 147301  T
Q  297 taacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggag 382  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  147302 taatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatatgaacaaaaaatttctctaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggag 147387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 108 - 380
Target Start/End: Original strand, 17251239 - 17251513
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa--tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  17251239 tactacctccgttcctttttaattgtcactttttaacattttacacaaaccaagacaatcaattaagtgttactacttttgatacaattgcttttacttt 17251338  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  17251339 tactataatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctttgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatgttgc 17251438  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggaggg 380  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||  |||||| |||| ||| | ||||||  ||||||||||    
T  17251439 attgaactttgaaagtgacggttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagtgataattaaaaaagaacggaggg 17251513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11129086 - 11128877
Alignment:
Q  110 ctacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttac 208  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  11129086 ctacctctgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaatcaagacaattaataaatgttactacttttgatacaattgtttttatttttac 11128987  T
Q  209 tattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  11128986 tataatgaccttattaatttaatatttcaattcatatgtatctctctccgcaataaatatctaagggtaatattggtaaaacatcatttaatgttgaatt 11128887  T
Q  309 gaactttgaa 318  Q
    ||||||||||    
T  11128886 gaactttgaa 11128877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 26470707 - 26470984
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  26470707 tactaccccctttcctttttaattgtcactttttgacattttacataaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatactttt 26470806  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||    
T  26470807 actataatgaccttgttcatttaacatctcatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggcaaaacaacatttaatgttgca 26470906  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  26470907 ttgaactttgaaagtgacaattaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 26470984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 31244733 - 31245010
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31244733 tactacatccgttcctttttaattgtcacattttgattttttacacaaaccaagacaatcaataaatggtagtacttttgatacaattgtttttactttt 31244832  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||  |||||    
T  31244833 actataatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctctccacaataaatatctaagaataatattgataaaacaagaattaatgttgca 31244932  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  31244933 ttgaactttgaaagtgacagttaaatacaaacaaaaaatttctctaaaaatgacaattaaaaatgaacggagagagta 31245010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33260962 - 33260680
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa------tgttactacttttgatagaattattttta 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33260962 tactacctccgttcctttataactgtcactttttgacattttacacaaaccaagataatcaataaatataatgttactacttttgatacaattgttttta 33260863  T
Q  202 cttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaaca 301  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||      
T  33260862 ctttcactataatgaccttattaatttaatgtttcatttcatatgtttctctctccgcaataaacatctaagggtaatattggtaaaacaacatttaatg 33260763  T
Q  302 ttgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||  ||| || ||||| |||||||||    
T  33260762 ttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaactgaccattataaaggaacagagggagta 33260680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 386
Target Start/End: Original strand, 11676599 - 11676874
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11676599 tactacctccattcatttttaattgttactttttgatattttacacaaaccaagacaatcaataaatattactacttttgatacaattgtttttactttt 11676698  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||  |||||    
T  11676699 actataatgaccttattaatttaatatttcatttcatatgtttctctct--gcaataaatatctaagagtaatattggtaaaataacatttaatgttgca 11676796  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtaca 386  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  11676797 ttgaactttg-aagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctttaaaagttaca-ataaaaaggaacggagggagtaca 11676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22050308 - 22050029
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| | || ||||    
T  22050308 aattactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatact 22050209  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||| ||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||  ||    
T  22050208 tttattataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaatatttaagggt-atattgataaaacatcatttaatgtt 22050110  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||  ||||  |||  |||||| |||||||||||||||    
T  22050109 gcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaaattctccaaaagagacgattaaaaaggaacggagggagta 22050029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 30416059 - 30416294
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  30416059 tactacctccgttcctttttaattatcatatgttgacattttacataaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatacaataagttatactttt 30416158  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||||    || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  30416159 actataataaccttattcatttaatattctgtttcatatatttctctctccgccataaataactaagggtaatattgataaaacatcatttaatgttgca 30416258  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30416259 ttgaactttgaaagtaacagttaaatagaaacaaaa 30416294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 24356038 - 24356315
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| ||| || ||||||   ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||  |  |||||||    
T  24356038 tactacatccgtttctttttaattgtcactttttgatattttatccaaaccaaaacaatcaataaatgttactacttttgataccattgctaatactttt 24356137  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||   ||||    
T  24356138 actataatgaccttgttgatttaatatttcatttcatatgtttctctctccggaataaatatctaagggtaatattgataaaacaacatttaatgatgca 24356237  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24356238 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaataaatttctctaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 24356315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17193417 - 17193138
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| | | |||||||||||  ||| | || |  ||    
T  17193417 attactacctccgttcctttttaattgtcacgttttgacattttatataaaccaagacaatcaacaattgatcctacttttgatgcaataagttattatt 17193318  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  17193317 ttactataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatatctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttg 17193218  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17193217 cattgaactttgaaagtgacatttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 17193138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23777555 - 23777275
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||    
T  23777555 attattaccttcgttcctttttaattgtcactttttgacattttacacaaaccaagacattaaataaatgttactacttttgatacaataatatatactt 23777456  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||  |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||| |||||||  |||    
T  23777455 ttactataataaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccacaataaatgagcaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttg 23777356  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||||||| |||||| | | |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23777355 cattgaacttcgaaagtgatagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaattgacacttaaaaaggaacggagggagtac 23777275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3621847 - 3621580
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  3621847 tactacctctgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 3621748  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  3621747 actataatgacattattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgcaataaataactaaggataatattggtagaacaatatttaatgttgca 3621648  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaac 374  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  3621647 ttgaactttgaaagtgatagttaaatagaaataaattttttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaac 3621580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 378
Target Start/End: Original strand, 17123972 - 17124239
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||||||  ||| | || ||||||||||    
T  17123972 tacctccattcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaactaagacaatcaataattgatactacttttgatgcaataagttatacttttact 17124071  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  17124072 ataatgaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctc--tccgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattg 17124169  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaa-tgacagttaaaatggaacggag 378  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  17124170 aactttgaaagtgacagttaaataaaaacaaaacttttctccaaaaagtgacatctaaaaaggaacggag 17124239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 1751415 - 1751692
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  1751415 tactacctccgttcttttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagataatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 1751514  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||  || |||| ||||| |||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  1751515 actataatgaccttattcatttaatatctcttttcatatatttctttctctgcaataaataattaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 1751614  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| |||||| | | |||||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1751615 ttgaacttcgaaagtgaaagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 1751692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 9838106 - 9838383
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||  ||  || |||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  9838106 tactacctctgttcctttttaattgtcattttgtgatattttacacaaatcaaaacaatcaataaatgttactacttttgatacaataattgatactttt 9838205  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  9838206 actataatagccttattcatttaatatctcatttcatatatttccctctccgcaataaataactaagggtaatattgataaaacaacatttaaagttgca 9838305  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9838306 ttgaactttgaaagtgacagttaaattggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 9838383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17836150 - 17835873
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| || ||| | | |||||||| ||  ||| |  | |||||||    
T  17836150 tactacatccgttcctttttaattgtcacatattgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgattctacttttaatgcaataagctatactttt 17836051  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||    
T  17836050 actataatgaccttattcatttaatatatcatttcatatatttctctctccgcaataaataattaaggataatattggtaaaaaaacatttaatgttgca 17835951  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17835950 ttaaaatttgaaagtaacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 17835873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24663639 - 24663359
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | ||||    
T  24663639 aattactacatccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagctatact 24663540  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| ||| | || || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  24663539 tttactataatgacattattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagaacaatattggtaaaacaacatttaatgtt 24663440  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||| ||||||  |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  24663439 gcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaataaaaattttctccaaaagtgatacttaaaaaggaacggatggagta 24663359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 384
Target Start/End: Original strand, 22784659 - 22784929
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactatta 213  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |    
T  22784659 tccgttcctttttaattgtcactttttaacattttacataaaccaagatattcaataaatgatactacttttgatacaataatgtatacttttactataa 22784758  T
Q  214 tggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaact 313  Q
    | ||||| || |||||||| || | || |||| ||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22784759 tagccttattcatttaataatttatttaatatatttttctctccacaataaataagtaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaact 22784858  T
Q  314 ttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||| ||||  |||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  22784859 ttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaaattcttcaaaagagacacttaaaaaggaaaggaaggagta 22784929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Original strand, 23923697 - 23923974
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||  ||| |  | |||||||    
T  23923697 tactacatccattcctttttaattgtcacattttgacattttgcacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttaatgtaataagctatactttt 23923796  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| || | ||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  23923797 actataatgaccttattcagttaatatctcatttcatatatttttctctccgcaataaataactaaggataatattgataaaacagcatttaacgttgta 23923896  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23923897 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatctctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 23923974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8176690 - 8176416
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| | || |||||||    
T  8176690 tactatctctgttcttttttaattgtcactttttaacattttacacaaatcaagacaatcaataattgtttctacttttgatgcaataagttatactttt 8176591  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||   ||||   ||||    
T  8176590 actataatgaccttattaatttaacatatcatttcatatatttctctctccgcaataaataacaaaagataatattggtaaaacat---ttaatgatgca 8176494  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  8176493 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacgaagggagta 8176416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 124 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 373964 - 373703
Alignment:
Q  124 ttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||||||| |||  ||| |    
T  373964 ttttaattgtcacattttgacattttacataaaccaagacaatcagcaattgatactacttttgatgcaataaactatacttttactataatgatcttat 373865  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    | ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  373864 tcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataaataatgacaatattggtaaaacaacatttaaaattgcattgaactttgaaagtg 373765  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| |||||||  |||||||  |||||  |||| ||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  373764 acagttaaatatgaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaatgaacggagagagta 373703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12732435 - 12732191
Alignment:
Q  105 aattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||  ||| |  | ||||    
T  12732435 aattactacttccgttcctttttaattgtcacattttaacattttacacaaaacaagacaattaacaattgatactacttttgatgcaataagctatact 12732336  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||||| |||   || || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||  ||    
T  12732335 tttactataatgatattattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataact-aggataatagtggtaaaacaacatttaatgtt 12732237  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
     |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12732236 acattaaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttct 12732191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8992816 - 8992528
Alignment:
Q  98 aaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat--gttactacttttgatagaatta 195  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||  ||| |    
T  8992816 aaaatagaattaatacatcccttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagataatcagtaatttgttactacttttgatgcaataa 8992717  T
Q  196 tttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcat 295  Q
     || |||||||||||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  8992716 gttatacttttactataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttatctctccgtaataaataactaaggataatattagtaaaacaacat 8992617  T
Q  296 ttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  8992616 ttaatgttgcattgaactttgaaagtgatagttaaatatgaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacagaggaagta 8992528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9017263 - 9016975
Alignment:
Q  98 aaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat--gttactacttttgatagaatta 195  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||  ||| |    
T  9017263 aaaatagaattaatacatcccttcctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagataatcagtaatttgttactacttttgatgcaataa 9017164  T
Q  196 tttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcat 295  Q
     || |||||||||||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  9017163 gttatacttttactataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttatctctccgtaataaataactaaggataatattagtaaaacaacat 9017064  T
Q  296 ttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||  |||||| ||||  |||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  9017063 ttaatgttgcattgaactttgaaagtgatagttaaatatgaacaaaaaatttcttcaaaagagacacttaaaaaggaacagaggaagta 9016975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34379118 - 34378839
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||  |||||    
T  34379118 attactacctccgttcctttttaactgtcactttttgatattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataattcatactt 34379019  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| |  |||||  | ||||||||| | | || |||| |||| ||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||    
T  34379018 ttactataaaagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttcactctccataataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacatttattgttg 34378919  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  34378918 cattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaacaaattttttttccaaaaatgacacttaaaaaggaacggatggagta 34378839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7170372 - 7170174
Alignment:
Q  145 attttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgat 243  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||  |||| | |||||||||||||| || ||    
T  7170372 attttacacaaattaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaattgtttttacttttattataataaccttataaatttaatatttcattttat 7170273  T
Q  244 atgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  7170272 atgtttctctctccgcaataaatatttaggggtaataatggtaaaacaacatttaatgttgcattgaattttgaaagtgacagttaaatataaagaaaa 7170174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30388885 - 30388701
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| |||  ||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  30388885 tacttttactataatgatcttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagcataatattggtaaaacaacatttaa 30388786  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
      || ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30388785 tgtttcattgaactttgaaagtgacagttaattaggaacaaaaattttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 30388701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Original strand, 364526 - 364797
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  364526 tactacctccgtttctttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatcttacttttgatgcaataagctatactttt 364625  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggt-aaaacatcatttaacattgc 305  Q
    ||||| |||   || || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||| |||||| |||||||  ||||    
T  364626 actataatgattttcttcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataattaatgacaatattggtaaaaacaacatttaatgttgc 364725  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  364726 attgaattttgaaaatgacagttaaatagtaacaaaaattttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacgga 364797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24948390 - 24948223
Alignment:
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||| ||||    
T  24948390 ccttattaatttaatatttcatttcatacgtttctctctccgcaataaatatccaagggtaatattagtaaaacactatttaatgttgcattgaattttg 24948291  T
Q  317 aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  24948290 aaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctctaaaagtgacatataaaacggaacggagcgagta 24948223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34607356 - 34607078
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||  || | ||||||    
T  34607356 ttactacctccgttcctttttaattgttaatttttgacattttatacaaaccaagacattcaatgaatgttactacttttgatacaacaatgtatacttt 34607257  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||   ||| ||  |||||||| | | || |||| | |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  34607256 tactataataatcttattcgtttaatatctaatttcatatatgtctctctctgcaataaataagtaaggataatattggtaaaacaccatttaatattac 34607157  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||| ||| || ||||   ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  34607156 attgaactttaaaagtgacagttaaattggaacaaaatatttgttcaaaagaaacacttaaaaaggaacggagcgagta 34607078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1249796 - 1249588
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||  || ||||    
T  1249796 tactacattcgttcctttttaattgtcactttatgatattttatataaactaagacaatcaataaatgttactatttttgatacaataattgatattttt 1249697  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| || | ||  || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  1249696 actataattgtctcattcatttaatatttcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaagggtaatattgataaaacaacatttaaaattgaa 1249597  T
Q  307 ttgaacttt 315  Q
    |||||||||    
T  1249596 ttgaacttt 1249588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1252423 - 1252147
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | || ||||    
T  1252423 tactatctccgttcatttttaattatcacattttgacattttatataaactaagacaatcaacaattgatactacttttgatgtaataaactatattttt 1252324  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaat-atctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| |||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  1252323 actataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaaacaactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgc 1252224  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagt 383  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||| || ||||| |  |||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  1252223 attgaactttgaaaaagacaattaaataggaac-aattttttttccaaaaatgacacttaaaaaggaatagagggagt 1252147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 342
Target Start/End: Original strand, 7056122 - 7056361
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||  ||  ||||||||||  ||| | || | |||    
T  7056122 attactacctccgtacctttttaattgtcactttttgacattttacacaaatcaagataatcaataattatttttacttttgatgcaataagttattctt 7056221  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||  ||||| | ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| || |||||||  |||    
T  7056222 ttactataataaccttggtcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaagataatattgataaatcaacatttaatgttg 7056321  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaac--aattaaatagaaacaaaa 342  Q
     |||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  7056322 gattgaattttgaaagtgacagagttaaatagaaacaaaa 7056361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30237166 - 30236958
Alignment:
Q  176 tactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggt 275  Q
    |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||     
T  30237166 tactacttttgatacaatacttcatacttttactataataaccttattaatttaatatctcattttatatatttctctttcaacaataaataactaaggg 30237067  T
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||  |||| | ||| |||||| |||| |    
T  30237066 taatattggtaaaacaacgtttaatgttgcattgaattttgaaagtgacagttaaattgaaacaaattttttctccaaaagtaacatttaaaaaggaatg 30236967  T
Q  376 gagggagta 384  Q
    || ||||||    
T  30236966 gaaggagta 30236958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 331
Target Start/End: Original strand, 7632030 - 7632245
Alignment:
Q  117 cgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatg 215  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||  ||| | || |||||||||||| |||    
T  7632030 cgttcctttttaataatcactttttgacattttatataaatcaagacaatcaataattattactatttttgatgcaataagttatacttttactataatg 7632129  T
Q  216 gccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaacttt 315  Q
     |||| || |||||| || ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||    
T  7632130 accttatttatttaacatctcatttcatatatttatctcttcgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgctttgaacttt 7632229  T
Q  316 gaaagtaacaattaaa 331  Q
    |||||| ||| |||||    
T  7632230 gaaagtgacagttaaa 7632245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 254
Target Start/End: Original strand, 26485669 - 26485816
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  26485669 tactacctctgttcctttttaattgtcactttttgacattttacataaaccaagacattcaataaatgttactacttttgatacaataatatatactttt 26485768  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctc 254  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  26485769 actataataaccttattcatttaatatttcatttcatatatttctctc 26485816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 336
Target Start/End: Original strand, 32359417 - 32359648
Alignment:
Q  101 aaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttt 199  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||  ||| |  |     
T  32359417 aaagaaatactacctccgttcctttttaattgttacattttgatattttatacaaaccaagacaattaataattgacacttcttttgatgcaataagcta 32359516  T
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||||||| |||  ||| || ||| ||||| ||| || |||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||  ||||||    
T  32359517 tacttttactataatgatcttattcattaaatatctcatttcata--tatctctctccgcaataaataactaaggata--attggtaaaaca-aatttaa 32359611  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaa 336  Q
      |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32359612 tgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaa 32359648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 332
Target Start/End: Original strand, 11431157 - 11431366
Alignment:
Q  124 ttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||||  | || |||||||||||| ||| | || ||||||||| || ||  | ||      
T  11431157 ttttaattgtcacatttttacatgttacacaaatcaagacaatcaatagctattcctacttttgatacaataacttatacttttacgataataactttac 11431256  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    ||||||||||| | | ||  ||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||     
T  11431257 taatttaatatcttatttcctatatttatctctcgacaataaataactaaggttaatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtg 11431356  T
Q  323 acaattaaat 332  Q
    ||||||||||    
T  11431357 acaattaaat 11431366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 31854472 - 31854752
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||  ||| || |||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||  ||   ||| ||  |||| ||| ||    
T  31854472 ttactacctcctatcttttttaactgtcatcttttgatattttacacaaattaagacatttaataaatgttactttttcgtatacaaaaatttatacctt 31854571  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctcc--gcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||||| || |||||  | ||||||||| | | || |||| ||| ||||||   |||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||   ||    
T  31854572 tactataatagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttatctctctttgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaataacatttattgtt 31854671  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  31854672 gcattgaactttgaaagtgacaattaaataaaaacaaaatttttctccaaaagtaacacttaaaaaggaacggagggagta 31854752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3849153 - 3849045
Alignment:
Q  276 taatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  3849153 taatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaatttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacg 3849054  T
Q  376 gagggagta 384  Q
    |||||||||    
T  3849053 gagggagta 3849045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24635967 - 24635688
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||| |||||||||  | ||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| ||| |    
T  24635967 attaccacctccgtttctctttaaatgtcactttttaacattttacacaaaccaagataatcaataaatgttactttttcttatacaataatttatacat 24635868  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| || |||||  | ||||||||| | |  | | || |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |   ||     
T  24635867 ttactataatagccttagtcatttaatatcttatatcacatatttctctctctgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaacattcattgtta 24635768  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  24635767 cattgaactttgaaaatgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagggacacttaaaaaggaacggagggagta 24635688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24949374 - 24949260
Alignment:
Q  98 aaaaaagaattactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattat 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24949374 aaaaaggaattactacctccgttcctttttaattgttattttttgatattttacacaaaccaaaacaatcaataaatgttactacttttgatacaattat 24949275  T
Q  197 ttttacttttactat 211  Q
    |||||||||||||||    
T  24949274 ttttacttttactat 24949260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 19645704 - 19645835
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaata-atgttactacttttg--atagaattatttttac 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||  ||| |||    
T  19645704 attactacttccgttcttttttaattgtcactttttgacattttacacaaactaagacaatcaatagatgttactacttttgatatacaatactttatac 19645803  T
Q  203 ttttactattatggccttgttaatttaatatt 234  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  19645804 ttttactataatagccttgttcatttaatatt 19645835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52827 - 52685
Alignment:
Q  200 tacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||||||| ||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  52827 tacttttattataatgaccttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccacaataaataattaagggtaatattgataaaacataatttaa 52728  T
Q  300 cattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
      |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52727 tgttgcattgaactttaaaagtgacagttaaatagaaacaaaa 52685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27313617 - 27313479
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||    
T  27313617 tttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaatcaacatttaatgttgcaatgaactttgaaagtgacatttaaataggaacaaaaaatt 27313518  T
Q  347 tctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||  ||||  |||| ||||||   ||||||||||||||    
T  27313517 tctccaaaagagacacttaaaaaaaaacggagggagtac 27313479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34730817 - 34730540
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| || |||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||  || | || |||    
T  34730817 ttactacctccgttcctttttaattatca-tttttgatattttatacaaaccaagacattcaatgaatgttactacttttgatacaacaatgtatatttt 34730719  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||  |||| || ||| ||||| | | || |||| ||| |||||  ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |    
T  34730718 tactataataaccttattcattcaatatctaatttcatatatttatctctttgcaataaataagtaaggataatattgataaaacaccatttaatgttac 34730619  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| ||| || ||||   ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  34730618 gttgaactttaaaagtgacagttaaattgaaacaaaatatttgttcaaaagaaacacttaaaaaggaacggagcgagta 34730540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 385
Target Start/End: Original strand, 22400547 - 22400826
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||  ||   ||||||    
T  22400547 ttactacctccgttcttgtttaagtgtcactttaagacattttacacaaaccaatacattcaataaatgttactacttttgatagaacaatgcatacttt 22400646  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||  | || || |||||||   | | || |||  ||||||||  |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  22400647 tactataataacattattcatttaatcactaacttcatacatttctctcctcataataaataagtaaggataatattggtaaaacaatatttaatgttgc 22400746  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||||||  |||||||  |||||  ||||  |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  22400747 attgaacttcaaaagtgacagttaaataagaacaaaaaatttctccaaaagagacacttaaaaaggaacggaggtagtac 22400826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7235629 - 7235435
Alignment:
Q  175 ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaagg 274  Q
    ||||||||||||||| |||    | |||||||||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| |  |||||||| ||||||||| ||||||    
T  7235629 ttactacttttgatacaatacaatatacttttactataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatccctctctccacaataaataactaagg 7235530  T
Q  275 ttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaa-atttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  7235529 gtaatattagtaaaacaacatttaatattacattaaactttgaaagtgacagttaaattaaaataaatttttttcttcaaaaatgacacttaaaa 7235435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Original strand, 11000809 - 11001070
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||  |||| | |||||| |||||||| ||  |||| |  |||| |||| ||  ||||      
T  11000809 tttttaattgtcacattttgattttttacacaaactaagacaacaaatacttttactatttttgatacaacaatttatctttttcctataatatccttaa 11000908  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    | |||||||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||   | |||||||||||||||       
T  11000909 tcatttaatacttcatttcatatatttctctctatgcaataaatatataagggtaatataggtaaaaccacatttaatgatacattgaactttgaaaacg 11001008  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||| |  |||| ||||| ||| || |||| ||| ||||||    
T  11001009 acagttaattagaaacaaaatctttatgcaaaagtgacaattataaaggaatggatggagta 11001070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13597602 - 13597443
Alignment:
Q  171 aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatct 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||  |||| |  ||||||||| ||| || |||  ||||| ||||||||||||||| ||    
T  13597602 aatgttactacttttgatataataatttatatttttactataataaccttttacatttaatatctcatttcataaatttctttctccgcaataaataact 13597503  T
Q  271 aaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaa 331  Q
    |||  |||||||| ||||| | || ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13597502 aagaataatattgataaaataaca-ttaattttacattaaactttgaaagtaacaattaaa 13597443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 347
Target Start/End: Original strand, 32250951 - 32251174
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgt 222  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||  ||  |||| |  |||| |||| ||  ||||      
T  32250951 tttttaattatcacattttgactttttacacaaaccaagacaacaaatacttttactacttttgatgcaagaatttatctttttcctataataaccttaa 32251050  T
Q  223 taatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
    | ||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||   || |||| |||||||||       
T  32251051 tcatttaatacctcatttcatatatttctctctctgcaataa-tatctaagggtaatataggtaaaacaacatttaatgatgtattggactttgaaaacg 32251149  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  32251150 acagttaattagaaacaaaaatttt 32251174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 53886 - 53807
Alignment:
Q  110 ctacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgat 188  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  53886 ctacctccgtttctttttaattgtcacattttgatattttacatataccaagacaatcaataattgttactacttttgat 53807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1924092 - 1923873
Alignment:
Q  125 tttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgtt 223  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||| |  |  || ||    
T  1924092 tttaattgtcactttttcacattttatataaaccaagataatcaataaatgttattaattttgatgaaataatttatacttttactataacagtattatt 1923993  T
Q  224 aatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaa-catcatttaacattgcattgaactttgaaagta 322  Q
     ||||||||| ||| || |||| ||| ||||   |||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||||| || ||| |||||     
T  1923992 catttaatatctcatttcatatatttatctcattgcaataaataactaaaggtaatattgataaaaacaatatttaaggttgcattaaaatttaaaagtg 1923893  T
Q  323 acaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1923892 acaattaaatagaaacaaaa 1923873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Original strand, 17601132 - 17601401
Alignment:
Q  123 tttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaat------tatttt-tacttttactattat 214  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||      |||||| || ||||||||| ||    
T  17601132 tttttaattgtcacattttgacgttttacacaaactaagacaatcaataaatgttgctacttttgatacaataatttatattttctatttttactataat 17601231  T
Q  215 ggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactt 314  Q
      |||| || ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||     
T  17601232 aaccttatttatttaatatctcattacatatatttctctctccacaat-aataaataagggtaatattagtaaaataacatttaatgttgcattgaacta 17601330  T
Q  315 tg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    || ||||| ||| |||||||  |||||||    |||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  17601331 tgtaaagtgacacttaaataagaacaaaaaaaatctccaaaagtgacacttaaaaaggaatggagggagta 17601401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15432917 - 15432736
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggc 217  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| || |||| |||| |||||||  |||| | ||||||||||||||| ||  |||| |  |||| |||| ||  |    
T  15432917 gttcctttttaattgtcatattttgactttctacacaaactaagacaacaaatacttttactacttttgatacaacaatttatctttttcctataataac 15432818  T
Q  218 cttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaa 299  Q
    |||  ||||||||||||||| || |||| ||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  15432817 cttaataatttaatatttcatttcatatatttatctctcagtaataaatatataagggtaatataggtaaaaccacatttaa 15432736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30389023 - 30388965
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30389023 tactacctccgttcctttttaattatcacattttgacattttacacaaaccaagacaat 30388965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3850577 - 3850496
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgat 188  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  3850577 tactacctccgttactttttaattgtcacattttgatattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgat 3850496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Original strand, 19645851 - 19645933
Alignment:
Q  302 ttgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  19645851 ttgcattgacctttgaaagtgacagttaaatagaaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacagagggagta 19645933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19812072 - 19811936
Alignment:
Q  248 ttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaattttt 347  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||| |||||  || |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||    
T  19812072 ttctctctctacaataaataattaagggtaataaaggcaaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaaatt 19811973  T
Q  348 ctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     |  |||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19811972 atgcaaacgtgacaattaaaaaggaacggagggagta 19811936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 384
Target Start/End: Original strand, 2381111 - 2381270
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    |||||||  |||| || |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |  ||||||| | | |||||||||||||||   ||    
T  2381111 atttaatgcttcatttcatatatttctctctttgcaataaatatataagggtaatataggtaaagccacatttaataatacattgaactttgaaaacgac 2381210  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    | |||| |  ||||||||||||| |  |||| ||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  2381211 agttaattgaaaacaaaatttttatgcaaaagtgacaattataaaggaacggagagagta 2381270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 152
Target Start/End: Original strand, 1135165 - 1135209
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttaca 152  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1135165 tactaccttcgttcctttttaattgtcactttttgacattttaca 1135209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 140
Target Start/End: Original strand, 27605416 - 27605448
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacattt 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27605416 tactacctccgttcctttttaattgtcacattt 27605448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 69356 - 69079
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||| |||||||  ||| |  | ||||||||    
T  69356 tactacctccgttccttttcaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattatactatttttgatgcaataagctatactttta 69257  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| |||  ||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  69256 ctataatgaacttattcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatattgcat 69157  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  69156 tgaactttgaaagtgacaattaaataggaacaaaaattttcttcaaaagtgacacttaaaaagaaacggagggagtac 69079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7681 - 7420
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  7681 tactaccttcgttcctttttaattgtcactttttgatattttacacaaatcaagacaatcaataaatattactacttttgatacaattgttattactttt 7582  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||   ||||    
T  7581 actataatgaccttgttaatttaagatttcatttcgtatgtttctctccccgcaataaatatctaagggtaatattgataaaataacatttaatgatgca 7482  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  7481 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctctaaaaatgacaattaaaa 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 118 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 562 - 295
Alignment:
Q  118 gttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatgg 216  Q
    |||| |||||||||||||  |||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  562 gttcctttttaattgtcattttttaacattttacgtaaactaagacaatcaataaatattattacttttgatacaattgtttttacctttactataatgg 463  T
Q  217 ccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttg 316  Q
     ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  462 tcttattaatttaatatttcatttcatatgtttccctctctgcaataaatatctaaaagtaattttggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttg 363  T
Q  317 aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  362 aaagtgacaattaaatagtaacaaattttttctctaaaagtgacaattaaaaagaaacggagggagta 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 377
Target Start/End: Original strand, 26109 - 26381
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | |||||    
T  26109 attactacctctgttcgtttttaattgtcatattttgacattttacataaaccaagacaatcaacaattgatattacttttgatgcaataagctatactt 26208  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||| ||| ||| |||| || ||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||    
T  26209 ttattataatgaccttattcatttaatattcaatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaggacaatattggtaaaacaacatttaatgttg 26308  T
Q  305 cattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  26309 cattgaactttaaaagtgacaattaaatagaaacaaattttttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacgga 26381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 148562 - 148288
Alignment:
Q  106 attactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| | || |||||    
T  148562 attactacctccgttcctttttaattgttatattttgacattttacataaaccaagacaataaaaaattgatactacttttgatataataagttatactt 148463  T
Q  205 ttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattg 304  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||  |||    
T  148462 ttactataatgaccttattcatttaatatatcatttcttatatttctctctccgcaataaataactaaggattatattggtaaaacaacatttaatgttg 148363  T
Q  305 cattgaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaa-aatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacgga 377  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  148362 cattgaactttgaaaaatgacagttaaatagaaacaattttttttcttcaaaagtgacacttaaaaaggaacgga 148288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 384
Target Start/End: Original strand, 138727 - 138992
Alignment:
Q  109 actacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataatgttactacttttgatagaattatttttacttttac 208  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| || |||           ||||  ||| | || |||||||||    
T  138727 actacatccgttcctttttaattgtcacatttttacattttatacaaaccaagacaatcaacaat-----------tgatgcaataagttatacttttac 138815  T
Q  209 tattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcatt 308  Q
    ||| ||   ||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  138816 tatgattagcttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctctgtaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcatt 138915  T
Q  309 gaactttg-aaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||  ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  138916 gaactttgaaaaatgacagttaaataagaacaataattttctctaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 138992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 369542 - 369389
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||| | |||| ||||| ||  |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  369542 atttaatatttcatttcatatatttctctct--gcaataaataaccaagggtaataatgacaaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtcac 369445  T
Q  325 aattaaatagaaac-aaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagg 379  Q
    | |||| ||||||| ||||  |||||| |||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  369444 acttaactagaaacaaaaaaatttcttcaaaagtgacaattaagaaggaacggagg 369389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 164
Target Start/End: Original strand, 492182 - 492231
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||    
T  492182 tccgttcttttttaattgtcacattttaactttttgcataaatcaagaca 492231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8411 - 8152
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||    
T  8411 tactacctccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataagttatactttt 8312  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| |||  ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||| |||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  8311 actataatgatcttattcatttaatatctcatttcatatatttctttctctgcaataaataactaagaagaatattggtaaaacaacatttaatgttgca 8212  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaa 366  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||    
T  8211 ttgaactttgaaaatgacagttaaatagaaacaaaaaatttcttcaaaagtgacacttaa 8152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 49403 - 49127
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  49403 tactacatccgttcctttttaattgtcacattttgacattttacgcaaaccaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatactttt 49304  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    | ||| ||| |||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  49303 attataatgaccttattcatttaat-tttcatttcatatatttctctctccacaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgca 49205  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  49204 ttgaactttgaaagtgacagttaaataggaacaaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaactgatggagta 49127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 89427 - 89369
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaat 166  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  89427 tactacattcgttcttttttaattgtcacattttgacattttacacaaatcaagacaat 89369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4770 - 4505
Alignment:
Q  109 actacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttta 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| | || || |||||    
T  4770 actacctccgttcctttttaattgtcacatttggt-attttacataaaccaagacaatcaataattgttactacttttgatgcaataagttatattttta 4672  T
Q  208 ctattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcat 307  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||  ||||||    
T  4671 ctataatgaccttatttatttaatatcttatttcatatatttctctctccacaataaataactaagggta-tattaataaaacatcatttaatgttgcat 4573  T
Q  308 tgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacg 375  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   ||||| ||||| |||  |||||| ||||||    
T  4572 tgaactttgaaagtgacagttaaataaaaacaaaaaaattcttcaaaaaagacgcttaaaaaggaacg 4505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 77345 - 77112
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataat-gttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  77345 tactacctccgttccttcttaattgtcacattttaacattttacacaaatcaagacaatcaacaattgatactacttttgatgcaataaactatactttt 77246  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  77245 actataataaccttattcatttaatatctcatttcatatatttctctctccgcaataaataactaaagataatattagtaaaacaacatttaatattgca 77146  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaa 340  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  77145 ttggactttgaaagtgacagttaaataggaacaa 77112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1213 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1213
Description:

Target: scaffold1213; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 384
Target Start/End: Original strand, 1 - 232
Alignment:
Q  158 caagacaattaataatg-ttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctc 256  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| ||| |||| || |||||| || ||| || |||| ||||||||||    
T  1 caagacaatcaataattattactacttttgatgcaataagttgtacttttactataatgaccttattcatttaacatctcatttcatatatttctctctc 100  T
Q  257 cgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaaca--aaatt--tttcttta 352  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||  |||||  ||||||||    
T  101 cgcaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacagttaaataagaacaacaaattaatttcttta 200  T
Q  353 aaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  201 aaagagacacttaaaaaggaacggagggagta 232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 332
Target Start/End: Original strand, 419476 - 419701
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  419476 tactacctctgtttctttttaattgtcactttgtgacattttacataaaccaagacaatcaataaatgttactacttttgatacaataattgatactttt 419575  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
    ||||| ||   ||| || ||||||||| ||| || |||| ||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  419576 actataataatcttatttatttaatatctcatttcatatatttctctttccgtaataaataactaagagtaatattgataaaacaacatttaaagttgca 419675  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaat 332  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  419676 ttgaattttgaaagtgacaaataaat 419701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0831 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0831
Description:

Target: scaffold0831; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 2829
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcg-acattttacataaaccaagacaattaataat--gttactacttttgatagaattatttttact 203  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||   | |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||  ||| | || ||||    
T  3067 ttactccctccgttcctttttaattgtcactttttttatattttacacaaaccaagacaatcagtaatttgttactacttttgatgcaataagttatact 2968  T
Q  204 tttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacatt 303  Q
    |||| ||| ||| |||| || |||||| |  ||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  2967 tttattataatgaccttattcatttaacaactcatttcatatatttctctctccgtaataaataactaaggataatattggtaaaacaacatttaatgtt 2868  T
Q  304 gcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2867 gcattgaactttgaaagtgacagttaaatagaaataaaa 2829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 384
Target Start/End: Original strand, 14769 - 14982
Alignment:
Q  171 aatgttactacttttgatagaattatttttacttttactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatct 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| || | ||| || ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14769 aatgttactacttttgatacaataattgatacttttactataatagacttattcatttaatatctcatgtcatatatttctctctccgcaataaataact 14868  T
Q  271 aaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatg 370  Q
    | || |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  |||||   ||| ||||| |||||| |    
T  14869 aggggtaatattgataaaacaacatttaaagttgcattgaactttgaaagtgacagttaaattggaacaaaaagtttctccgaaagtgacacttaaaaag 14968  T
Q  371 gaacggagggagta 384  Q
    ||||||||||||||    
T  14969 gaacggagggagta 14982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Original strand, 184114 - 184388
Alignment:
Q  111 tacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttttact 209  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||  |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| |||| ||||||||||    
T  184114 tacctcctttcttttttaagtgtcattttttaacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatttatacttttact 184213  T
Q  210 attatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattg 309  Q
    || || |||||  | ||||||||| | | || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||   ||||||||    
T  184214 ataatagccttagtcatttaatatcttatttcatatatttatctctccgcaataaataactaagggtaatgttggtaaaacaatatttattgttgcattg 184313  T
Q  310 aactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| || ||||  |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  184314 aactttgaaagcgacagttaaataggaataaaaaatttctccaaaagtgacacttaaaaaggaacggagggagta 184388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Original strand, 72071 - 72166
Alignment:
Q  247 tttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  72071 tttctctctccgcaataaataactaaggataatattggtaaatcaacatttaatgttgcattgaactttgaaagtgacaattaaataagaacaaaa 72166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 384
Target Start/End: Original strand, 223 - 500
Alignment:
Q  107 ttactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| || |||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||  || | || |||    
T  223 ttactacctccgttcctttttaattatca-tttttgatattttatacaaaccaagacattcaatgaatgttactacttttgatacaacaatgtatatttt 321  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgc 305  Q
    |||||| ||  |||| || ||| ||||| | | || |||| ||| |||||  ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |    
T  322 tactataataaccttattcattcaatatctaatttcatatatttatctctttgcaataaataagtaaggataatattgataaaacaccatttaatgttac 421  T
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagta 384  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| ||| || ||||   ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  422 gttgaactttaaaagtgacagttaaattgaaacaaaatatttgttcaaaagaaacacttaaaaaggaacggagcgagta 500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23275 - 23132
Alignment:
Q  225 atttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaac 324  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||| |||||| |||||||||| | |||| ||||| ||  |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  23275 atttaatatctcattttatatatttttctctcggcaataaataaccaagggtaataatgacaaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgac 23176  T
Q  325 aattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  23175 acttaattagaaacaaaaattttcttcaaaaatgacaattaaaa 23132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Original strand, 195884 - 195999
Alignment:
Q  269 ctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaa 368  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  195884 ctaaggataatattgataaaacaacatttaatgttgcattgaactttaaaagtgacagttaaataagaacaaaaattttctccaaaaatgacacttaaaa 195983  T
Q  369 tggaacggagggagta 384  Q
     |||||||||||||||    
T  195984 aggaacggagggagta 195999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 162
Target Start/End: Original strand, 195578 - 195625
Alignment:
Q  115 tccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaaga 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  195578 tccgttcttttttaattgtcacattttgacattttacacaaaccaaga 195625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1036
Alignment:
Q  228 taatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaat 327  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||| |||||||||||||| | ||| |    
T  1169 taatatttcatttcatatatttatctttctgtaataaataactaaggttaatattggtaaaataatatttaatgttgtattgaactttgaaaatgacagt 1070  T
Q  328 taaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgaca 361  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1069 taaattgaaacaaaattattctttaaaaaagaca 1036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 361
Target Start/End: Original strand, 6460 - 6593
Alignment:
Q  228 taatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaat 327  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||| |||||||||||||| | ||| |    
T  6460 taatatttcatttcatatatttatctttctgtaataaataactaaggttaatattggtaaaataatatttaatgttgtattgaactttgaaaatgacagt 6559  T
Q  328 taaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgaca 361  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6560 taaattgaaacaaaattattctttaaaaaagaca 6593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 809 - 573
Alignment:
Q  108 tactacctccgttcttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaat-aatgttactacttttgatagaattatttttactttt 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||| |||| |   |||    
T  809 tactacctccgttcctttttaattttcactttttaacattttacataaatcaatacaatcaataaatataactacttctgatacaataatttatcaattt 710  T
Q  207 actattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgca 306  Q
     | || || ||||  || ||||||||| |   || |||| |||||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  709 ccaataatagcctcattcatttaatatattgtttcatatatttctctctttgtaataaataattaagggtaatattgaaaaaacaacatttaatattgca 610  T
Q  307 ttgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttct 349  Q
    ||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||    
T  609 ttgaactttgatag------ttaaatagaaacaaaattattct 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 287
Target Start/End: Original strand, 1802 - 1981
Alignment:
Q  108 tactacctccgttc-ttttttaattgtcacatttcgacattttacataaaccaagacaattaataa-tgttactacttttgatagaattatttttacttt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || | ||| ||| || | ||||||    
T  1802 tactacctccgttccttttttaactgtcacttt--gacattttacacaaaccaagacactcaataaatgttactttttcttatacaataatctatacttt 1899  T
Q  206 tactattatggccttgttaatttaatatttcaattgatatgtttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaa 287  Q
    |||||| ||  ||||  | ||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  1900 tactataataaccttagtcatttaatatcttatttcatatatttctctctccgtaataaataactaagggtaatgttggtaa 1981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 252652 - 252573
Alignment:
Q  306 attgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaatttttctttaaaaatgacagttaaaatggaacggagggagtac 385  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   || |  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  252652 attgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaaaaattatgcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagtac 252573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 342
Target Start/End: Original strand, 96186 - 96280
Alignment:
Q  248 ttctctctccgcaataaatatctaaggttaatattggtaaaacatcatttaacattgcattgaactttgaaagtaacaattaaatagaaacaaaa 342  Q
    |||||||||  |||||||||   |||| |||||  || |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  96186 ttctctctctacaataaataatcaagggtaataaaggcaaaacaacatttaatgttgtattgaactttgaaagtgacagttaattagaaacaaaa 96280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University