View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19388_high_14 (Length: 212)

Name: NF19388_high_14
Description: NF19388
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19388_high_14
NF19388_high_14
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (17-211)||(10281809-10282003)
chr5 (17-211)||(3880357-3880551)
chr5 (17-212)||(17003804-17003999)
chr5 (17-212)||(11916817-11917011)
chr5 (17-212)||(19588804-19588997)
chr5 (17-210)||(12084024-12084214)
chr5 (17-212)||(11181677-11181871)
chr5 (17-212)||(14520288-14520482)
chr5 (17-212)||(15464590-15464786)
chr5 (17-212)||(9353177-9353371)
chr5 (17-212)||(28832317-28832509)
chr5 (17-201)||(42127266-42127449)
chr5 (17-210)||(38219456-38219650)
chr5 (17-211)||(31300441-31300635)
chr5 (17-212)||(36932193-36932389)
chr5 (17-210)||(35387720-35387914)
chr5 (17-182)||(2630289-2630453)
chr5 (127-212)||(24553372-24553457)
chr5 (17-212)||(7160749-7160942)
chr5 (17-136)||(38192231-38192350)
chr5 (17-210)||(24135906-24136101)
chr5 (159-211)||(42127216-42127268)
chr5 (17-183)||(6741910-6742073)
chr5 (129-202)||(30900036-30900108)
chr5 (127-212)||(5611309-5611395)
chr5 (20-65)||(24553499-24553543)
chr5 (17-211)||(33030784-33030979)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (17-212)||(29159861-29160057)
chr7 (17-206)||(56005-56195)
chr7 (17-212)||(49091719-49091915)
chr7 (17-212)||(2647542-2647735)
chr7 (17-212)||(21983342-21983538)
chr7 (17-212)||(46516150-46516349)
chr7 (18-210)||(4796515-4796705)
chr7 (17-211)||(33332296-33332489)
chr7 (21-212)||(35960878-35961069)
chr7 (17-212)||(20284147-20284341)
chr7 (17-210)||(2580448-2580640)
chr7 (17-212)||(9189852-9190047)
chr7 (17-212)||(23402858-23403052)
chr7 (17-212)||(21988964-21989160)
chr7 (18-212)||(2479395-2479588)
chr7 (43-212)||(9185019-9185189)
chr7 (33-212)||(9235427-9235605)
chr7 (17-210)||(21639866-21640060)
chr7 (17-210)||(21646064-21646258)
chr7 (17-212)||(3047313-3047506)
chr7 (17-210)||(18413697-18413890)
chr7 (43-212)||(47263749-47263918)
chr7 (17-212)||(5817115-5817309)
chr7 (17-210)||(18408821-18409014)
chr7 (17-174)||(44848567-44848723)
chr7 (17-210)||(1533286-1533483)
chr7 (17-99)||(28617183-28617264)
chr7 (167-212)||(44847970-44848015)
chr7 (17-136)||(2058023-2058144)
chr7 (39-99)||(23565148-23565209)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (17-212)||(3715836-3716031)
chr3 (17-212)||(36029151-36029345)
chr3 (17-212)||(40592616-40592811)
chr3 (17-212)||(18552719-18552912)
chr3 (17-212)||(48438272-48438468)
chr3 (17-212)||(1736138-1736334)
chr3 (17-212)||(8370323-8370515)
chr3 (18-212)||(24695000-24695192)
chr3 (17-212)||(35925538-35925730)
chr3 (42-212)||(47649652-47649822)
chr3 (17-212)||(25795839-25796032)
chr3 (17-212)||(30709623-30709819)
chr3 (17-212)||(26299046-26299240)
chr3 (18-211)||(40844710-40844906)
chr3 (17-212)||(47923738-47923935)
chr3 (17-212)||(6794549-6794742)
chr3 (17-212)||(16264408-16264601)
chr3 (18-212)||(21711282-21711474)
chr3 (17-212)||(8126688-8126882)
chr3 (17-212)||(27974786-27974981)
chr3 (17-210)||(3328193-3328385)
chr3 (17-212)||(3323525-3323719)
chr3 (17-212)||(1417325-1417519)
chr3 (17-212)||(26928433-26928630)
chr3 (17-210)||(27453016-27453210)
chr3 (17-210)||(32143379-32143573)
chr3 (61-212)||(27986290-27986441)
chr3 (44-210)||(39032390-39032555)
chr3 (43-211)||(33386510-33386680)
chr3 (17-212)||(37466349-37466547)
chr3 (17-210)||(1306006-1306200)
chr3 (72-210)||(25929232-25929370)
chr3 (17-212)||(21353620-21353815)
chr3 (17-210)||(40372638-40372834)
chr3 (159-212)||(37725874-37725927)
chr3 (127-205)||(5366164-5366243)
chr3 (17-99)||(4386875-4386956)
chr3 (127-212)||(21156596-21156682)
chr3 (179-212)||(27026925-27026958)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (17-212)||(47703780-47703975)
chr1 (17-210)||(13598456-13598650)
chr1 (17-212)||(16124359-16124555)
chr1 (17-212)||(29651869-29652065)
chr1 (17-212)||(9476319-9476514)
chr1 (17-212)||(19072986-19073180)
chr1 (17-212)||(19120876-19121070)
chr1 (28-212)||(40816661-40816842)
chr1 (17-212)||(3281766-3281959)
chr1 (17-212)||(26644743-26644936)
chr1 (17-212)||(13604467-13604662)
chr1 (17-212)||(47098670-47098863)
chr1 (17-210)||(21536417-21536608)
chr1 (17-212)||(32889497-32889690)
chr1 (17-210)||(19358688-19358882)
chr1 (17-210)||(19361277-19361471)
chr1 (17-210)||(19379917-19380111)
chr1 (19-212)||(37069830-37070019)
chr1 (17-212)||(47102684-47102880)
chr1 (17-210)||(24202614-24202808)
chr1 (17-212)||(22819487-22819683)
chr1 (128-212)||(27104246-27104330)
chr1 (71-206)||(19366157-19366293)
chr1 (17-99)||(27104337-27104411)
chr1 (127-211)||(9022752-9022834)
chr1 (141-205)||(11031327-11031389)
chr1 (48-171)||(35109423-35109545)
chr1 (127-205)||(8281485-8281563)
chr1 (17-99)||(9023797-9023878)
chr1 (17-69)||(48382468-48382520)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (17-209)||(23799424-23799616)
chr8 (17-212)||(26403074-26403269)
chr8 (17-212)||(6127279-6127475)
chr8 (17-212)||(5702325-5702522)
chr8 (43-212)||(4696453-4696620)
chr8 (17-212)||(7412399-7412592)
chr8 (17-212)||(4456086-4456280)
chr8 (17-212)||(19175599-19175793)
chr8 (17-211)||(19752240-19752433)
chr8 (17-210)||(31071074-31071268)
chr8 (17-212)||(3051178-3051372)
chr8 (17-210)||(1261799-1261993)
chr8 (15-212)||(7493018-7493214)
chr8 (43-210)||(26287974-26288142)
chr8 (43-210)||(26301231-26301399)
chr8 (43-210)||(26313225-26313393)
chr8 (128-212)||(28307730-28307814)
chr8 (153-210)||(9054267-9054324)
chr8 (127-212)||(5990406-5990491)
chr8 (127-206)||(13204634-13204713)
chr8 (17-210)||(4759917-4760114)
chr8 (17-85)||(18853137-18853207)
chr8 (17-85)||(18870531-18870601)
chr8 (17-95)||(6813741-6813818)
chr8 (32-99)||(30291627-30291695)
chr8 (18-99)||(9054795-9054875)
chr8 (113-210)||(33037650-33037749)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (17-212)||(8040118-8040316)
chr2 (17-211)||(10707098-10707291)
chr2 (17-212)||(8389994-8390189)
chr2 (17-212)||(34388916-34389103)
chr2 (17-212)||(21630001-21630197)
chr2 (17-212)||(13569386-13569581)
chr2 (17-212)||(14698854-14699046)
chr2 (17-210)||(34682180-34682373)
chr2 (17-212)||(31056102-31056295)
chr2 (17-212)||(39482989-39483185)
chr2 (17-212)||(17865261-17865457)
chr2 (17-212)||(33528469-33528660)
chr2 (17-209)||(33118194-33118384)
chr2 (17-212)||(20522278-20522474)
chr2 (17-212)||(23078316-23078509)
chr2 (17-212)||(40014983-40015177)
chr2 (17-212)||(28259022-28259216)
chr2 (18-170)||(42039555-42039707)
chr2 (17-212)||(36757607-36757801)
chr2 (17-125)||(10445375-10445483)
chr2 (17-210)||(2869539-2869732)
chr2 (17-210)||(3491808-3492002)
chr2 (145-212)||(10445312-10445379)
chr2 (43-212)||(40738915-40739086)
chr2 (17-212)||(15903735-15903928)
chr2 (127-212)||(2837874-2837960)
chr2 (17-210)||(9296244-9296440)
chr2 (17-173)||(25398553-25398710)
chr2 (17-173)||(25403691-25403848)
chr2 (17-173)||(25407680-25407837)
chr2 (17-66)||(16940199-16940248)
chr2 (17-66)||(17010864-17010913)
chr2 (127-210)||(35397677-35397759)
chr2 (17-210)||(14291546-14291743)
chr2 (109-212)||(18674245-18674347)
chr2 (171-210)||(25409842-25409881)
chr2 (127-205)||(3278167-3278245)
chr2 (127-205)||(28770626-28770704)
chr2 (17-85)||(11098897-11098966)
chr2 (17-144)||(27149207-27149333)
chr2 (17-62)||(2838024-2838069)
chr2 (32-65)||(17490228-17490261)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (17-212)||(3777607-3777801)
chr4 (17-212)||(16623138-16623332)
chr4 (17-212)||(10047437-10047633)
chr4 (17-212)||(24333867-24334063)
chr4 (17-212)||(38152283-38152478)
chr4 (17-212)||(6743260-6743454)
chr4 (43-212)||(5269045-5269215)
chr4 (20-212)||(5147738-5147930)
chr4 (21-212)||(5143321-5143512)
chr4 (17-212)||(36315075-36315268)
chr4 (17-212)||(36329284-36329477)
chr4 (17-212)||(42599419-42599611)
chr4 (43-212)||(25861878-25862046)
chr4 (17-205)||(54867241-54867427)
chr4 (17-212)||(5396516-5396710)
chr4 (17-212)||(5112295-5112489)
chr4 (89-212)||(16628717-16628839)
chr4 (17-212)||(31985478-31985673)
chr4 (43-212)||(8689341-8689509)
chr4 (17-212)||(39774150-39774344)
chr4 (18-117)||(3796458-3796557)
chr4 (20-210)||(18377420-18377609)
chr4 (114-210)||(3793927-3794023)
chr4 (17-94)||(16630642-16630719)
chr4 (17-209)||(1983148-1983339)
chr4 (71-206)||(28468387-28468523)
chr4 (17-205)||(37781920-37782108)
chr4 (17-59)||(39246052-39246094)
chr4 (17-210)||(29760699-29760895)
chr4 (138-205)||(873370-873437)
chr4 (39-99)||(31474171-31474232)
chr4 (17-85)||(18912335-18912402)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (17-210)||(5741-5935)
scaffold0006 (17-212)||(2550-2746)
scaffold0006 (17-212)||(133124-133319)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (17-212)||(10787-10983)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (17-212)||(18232903-18233098)
chr6 (17-212)||(5572088-5572280)
chr6 (17-212)||(21801189-21801383)
chr6 (17-211)||(31086320-31086512)
chr6 (17-198)||(10077027-10077204)
chr6 (17-211)||(31979571-31979763)
chr6 (17-212)||(4630012-4630205)
chr6 (17-212)||(22963757-22963951)
chr6 (17-212)||(23824442-23824636)
chr6 (19-212)||(24435816-24436008)
chr6 (17-212)||(5757323-5757517)
chr6 (43-212)||(31936660-31936827)
chr6 (17-212)||(21356094-21356289)
chr6 (43-212)||(22709091-22709262)
chr6 (43-212)||(5017341-5017493)
chr6 (28-212)||(14521743-14521926)
chr6 (17-210)||(5674612-5674809)
chr6 (126-211)||(31076782-31076867)
chr6 (142-211)||(5385777-5385846)
chr6 (112-188)||(30517998-30518071)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (17-212)||(85741-85935)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (17-212)||(17321-17503)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (17-212)||(43806-44000)
scaffold0087 (21-210)||(36679-36867)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (17-212)||(8262-8458)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (17-210)||(17797-17991)
scaffold0188 (17-210)||(23890-24084)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (138-211)||(45377-45449)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (127-206)||(23698-23778)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 10281809 - 10282003
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10281809 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 10281908  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10281909 cactcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 10282003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 3880357 - 3880551
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3880357 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 3880456  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3880457 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaaaacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcacaacccaatgtgtttacaatgtttc 3880551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17003999 - 17003804
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||| ||    
T  17003999 caatccactatgatgaaagtatttcaaaagagttacaaaaaattaacttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttaatttcactca 17003900  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003899 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 17003804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11917011 - 11916817
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11917011 caatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 11916912  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11916911 ctctcaaacgatgaaccctaagagaaaacacaaaaggaag-tttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 11916817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 19588804 - 19588997
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  19588804 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccctttttgtgtcaccca 19588903  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |  || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19588904 caatctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagatttttgatccttccaatggtgaaatctcactgcccaagatgtttacaatgtttcc 19588997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12084214 - 12084024
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  12084214 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattaacttaaaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtcaccca 12084117  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttcc-aatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  12084116 ctctcacaatatgaatcctaagaaaaaacacaaaaggaagctttt--atccttccaaatggtgaattctcactacccaaggtgtttaaaatgttt 12084024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11181871 - 11181677
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg-tgtcaccc 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||  || | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  11181871 caatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcctaaaagctctcaaatgaacaagacctaatttctacccattttcatgtcaccc 11181772  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11181771 acactcacaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatttcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 11181677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 14520288 - 14520482
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||    
T  14520288 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttaccca 14520385  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14520386 ctctctcaattatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 14520482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 15464590 - 15464786
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||    
T  15464590 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttccc 15464687  T
Q  116 actctcacaata-tgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||| |||| ||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15464688 actctcacaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacgatgtttcc 15464786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9353371 - 9353177
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||  ||||    
T  9353371 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaaaagcttgcaagcttacacaagaacaagatctaatttctacccattt-gtgtttccca 9353274  T
Q  117 ctctcacaata-tgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| ||||| |||| | ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9353273 ctctctcaataatgaaccttaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 9353177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 28832317 - 28832509
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt--gtgtcacc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||  |||||||||||  |||||   | |||||    
T  28832317 caatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataa--gtacaaaagaacaagttctaatttctacccatttttcatatcacc 28832413  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28832414 cacactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 28832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42127449 - 42127266
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt--gtgtcacc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||   | |||||    
T  42127449 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctactttctacccatttttcatatcacc 42127351  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgttt 201  Q
    ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42127350 cacactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgttt 42127266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 38219456 - 38219650
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  38219456 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-cc 38219553  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38219554 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 38219650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31300635 - 31300441
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcac 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||  ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    | ||||    
T  31300635 caatccactaagatgaaagtgttataat-gagttgcaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttctcatatcac 31300537  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31300536 ccacactctcaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagccttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 31300441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36932389 - 36932193
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||  |||    
T  36932389 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaaatagcttgcaagtttacataagaacaagacttaatttctacccattt-gtgtttccc 36932292  T
Q  116 actctcacaata-tgaatcctagga--gaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| ||||| |||| ||||  |  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36932291 actctctcaataatgaaccctaaaacagaagacacaagaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 36932193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 35387720 - 35387914
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  35387720 caatctactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttc-cc 35387817  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35387818 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag-ttttagatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattacaatgttt 35387914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 2630289 - 2630453
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| || | |||||    ||||||    
T  2630289 caatccactatgatgaaagtgatacaaaagggttacaataaattagcttaaaaacacaca-aagaacaaaacctaatttttatacatttttcaagtcacc 2630387  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaat 182  Q
    | | ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2630388 ctcactcacaat--gaatcctaagagaaaacactaaaggaagctttttgatcctttcaatggtgaaat 2630453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24553457 - 24553372
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24553457 atgaattctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttctaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 24553372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7160942 - 7160749
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||  || || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||     
T  7160942 caatccactcagatgaaagtgatacaaaggggttacaaaaaattagatttaaagctcaca-aagaacaagacttaatttctacatattttttaagtcact 7160844  T
Q  115 -cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
     ||||||||    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  7160843 acactctca----atgaatcctaagagaaaacataaaatgaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactgtccaaggtgattacaatgtttcc 7160749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 136
Target Start/End: Original strand, 38192231 - 38192350
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  38192231 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-cc 38192328  T
Q  115 cactctcacaatatgaatccta 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  38192329 cactctcacaatatgaacccta 38192350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 24135906 - 24136101
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||   ||  ||| || ||    
T  24135906 caatgcactaagatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttc-cc 24136003  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||||||||||| |||| ||||   ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24136004 cactctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 24136101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42127268 - 42127216
Alignment:
Q  159 ttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  42127268 ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtatacaatgtttc 42127216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Original strand, 6741910 - 6742073
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt--gtgtcacc 114  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||    ||||||    
T  6741910 caatccattaagatggaagtgatacaaagaagttacaagaaattagcttgcaaactcaca-aagaacaaaacctaatttctactcatttttcaagtcacc 6742008  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatc 183  Q
    ||| ||| ||  |||||||||| || |||||||| |  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6742009 cacactctca--atgaatcctaagaaaaaacacaga--gaatctttttgattctttcaatggtgaaatc 6742073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Original strand, 30900036 - 30900108
Alignment:
Q  129 gaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgttta 202  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30900036 gaatcctag-agaaaacactaaagaaagcttttttatccttcctctaatgaaatctcactacccaaggtgttta 30900108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Original strand, 5611309 - 5611395
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgttta-caatgtttcc 212  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||  ||||||| || || | |||||||||| ||||||||||    
T  5611309 atgattcctaagagaaaacactaaagcaagctttttgatcttttcaataatgaaatctcattaactaaggtgtttaccaatgtttcc 5611395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24553543 - 24553499
Alignment:
Q  20 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 65  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24553543 tccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaattagctt 24553499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33030979 - 33030784
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| || ||||||||||  |||||    |||||     
T  33030979 caattcactaagatgaaagtgatgcaatggggttacaagaaattagcttaaaagctcaca-aagaacaaaacataatttctacccatttttcaagtcact 33030881  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaa-----acacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    ||| ||| ||||  |||||||| ||||||     |||| ||||||||||||||| ||    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||    
T  33030880 cacactctcaat--gaatcctaagagaaattaaaacactaaaggaagctttttgttct---caatggtgaaatctcactacccaagatgattacaatatt 33030786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 29159861 - 29160057
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt-gtgtcaccc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  29159861 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcaccc 29159960  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159961 actctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatgttgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 29160057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Original strand, 56005 - 56195
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  56005 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 56104  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaat 206  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56105 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaat 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 49091719 - 49091915
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  49091719 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattctgtgtcaccca 49091818  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49091819 cactctccataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgttttcaatgtttcc 49091915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2647735 - 2647542
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2647735 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 2647636  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2647635 cactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaatgaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgcttaccatgtttcc 2647542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 21983342 - 21983538
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaa-gagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21983342 caatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagtttctacccattttgtgtcaccc 21983441  T
Q  116 actctcacaatatgaatcct-aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21983442 actctcaaaatatgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagc-ttatgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 21983538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46516349 - 46516150
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  46516349 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccattttgtgtcaccca 46516250  T
Q  117 ctctcac----aatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | | |||       ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46516249 cacacactccaccaatgaatcttaagagaaaacacaaaatgaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 46516150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4796705 - 4796515
Alignment:
Q  18 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccac 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| ||    
T  4796705 aatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctcatttatacccattttgtgtcacctac 4796606  T
Q  118 tctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
      || ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4796605 attctcaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 4796515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33332489 - 33332296
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctac-aaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |    
T  33332489 caatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctactcatttttgtatcacgc 33332390  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    || ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33332389 acactctca--atgattcctaagagaaaacacaaagggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttc 33332296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 35960878 - 35961069
Alignment:
Q  21 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg-tgtcacccactc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||  | |||||||| |    
T  35960878 ccactatgatgaaagtgttacaaatgagttagaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttcatatcacccacac 35960977  T
Q  120 tcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35960978 tca-aagatgaatcttaagagaaaacgcaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacctaaggtgtttacaatgtttcc 35961069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 20284147 - 20284341
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||   | |||||    
T  20284147 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gcgttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccttttttcatatcacc 20284245  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284246 cacactctcaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 20284341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 2580448 - 2580640
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt--gtgtcacc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||   | |||||    
T  2580448 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttttcatatcacc 2580546  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2580547 cacactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 2580640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9190047 - 9189852
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcac 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   | ||||    
T  9190047 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcac 9189949  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||| |||  |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9189948 ccacactcttaat--gaatcctaagagaaaacacacaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 9189852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23403052 - 23402858
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtg--tcacc 114  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||     ||||     
T  23403052 caatctactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcacatcact 23402954  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402953 cacactctcaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 23402858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 21988964 - 21989160
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaa-gagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21988964 caatccactttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagattgcaagcttatacaagaataaaacctagtttctacccattttgtgtcaccc 21989063  T
Q  116 actctcacaatatgaatcct-aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| | |||||||| ||| | |||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21989064 actctaaaaatatgaaccctaaagagaaaacaataaaggaagc-ttatgatccttccaatggtaaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 21989160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 2479395 - 2479588
Alignment:
Q  18 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||  |||||    
T  2479395 aatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttataagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccca-tgtgtgtttcccac 2479492  T
Q  118 tctcacaat-atgaatcct-aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||| |||| ||||| ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479493 tctctcaataatgaaccctaaagagaagatataaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 2479588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9185189 - 9185019
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacccactctcacaatatgaatcctagga 139  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   | |||||||| |||  |||  |||||||| ||    
T  9185189 aaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactcttaat--gaatcctaaga 9185092  T
Q  140 gaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185091 gaaaacacacaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 9185019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9235605 - 9235427
Alignment:
Q  33 aagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacccactctcacaatatga 130  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||   | |||||| | ||| |||   ||    
T  9235605 aagtgttacaat-gagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccgcactctcaac--ga 9235509  T
Q  131 atcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9235508 atcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttgcaatggtgaaatatcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 9235427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 21639866 - 21640060
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  21639866 caatccactataatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 21639963  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21639964 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 21640060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 21646064 - 21646258
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  21646064 caatccactatgatgaaagtgtta-aaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 21646161  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21646162 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagattta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 21646258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 3047313 - 3047506
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt-gtcaccc 115  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| || || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||    
T  3047313 caatccactaatatgaaagtggtacaaatgagttacaagaaatcaacttaaaagctcaca-aagaacaagacctaatttctacccatttttaagtcaccc 3047411  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || ||| ||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||    
T  3047412 acactctcaat--gaatcttaagataaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaagatgattatagtgtttcc 3047506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 18413697 - 18413890
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  18413697 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagattgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-cc 18413794  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaa-acacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || || |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18413795 cactctcacaatatgaaccctaaaaggaagacacaagaggaagcttaa-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacattgttt 18413890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 47263749 - 47263918
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctagg-ag 140  Q
    |||| |||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||   ||    
T  47263749 aaagtgttataagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctatccattt-gtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaatag 47263847  T
Q  141 aaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47263848 aagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtatttacaatgtttcc 47263918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5817309 - 5817115
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || ||  | || ||| |||||||| ||||||||||||   |||||    |||||     
T  5817309 caatccactaatatgaaagtgatacaaaggggttacaagaaatttgcataagagctcaca-aagaacaaaacctaatttctatccatttttcaagtcact 5817211  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5817210 cacactctcaat--gaatcctaagaaaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactccccaaggtatttacaatgtttcc 5817115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 18408821 - 18409014
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  18408821 caatccagtatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-cc 18408918  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaa-acacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || || |||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18408919 cactctcacaatatgaaccctaaaaggaagacacaagaggaagcttaa-gatccttttaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 18409014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44848723 - 44848567
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||  ||||    
T  44848723 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaaaagcttgcaagcttacacaagaataagacctaatttctaccca-tttgtgtttccca 44848626  T
Q  117 ctctcacaat-atgaa-tcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaat 174  Q
    ||||| |||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44848625 ctctctcaataatgaactctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaat 44848567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1533483 - 1533286
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttacaaacttacacaagaa-caagacctaatttctacaaattttgtgtca- 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||   ||| ||||       
T  1533483 caatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccc-tttggtgtttt 1533386  T
Q  113 cccactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1533385 cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtt 1533287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 28617264 - 28617183
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28617264 caatccactaagatgaaagtgatacaatggggttacaagaaattagcttaaaagctcaca-aagaacaaaacctaatttctac 28617183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44848015 - 44847970
Alignment:
Q  167 cttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44848015 cttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 44847970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 136
Target Start/End: Original strand, 2058023 - 2058144
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttcta--caaattttgtgtca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||| |||||||||||||||| ||||  |||||  || || |||| ||     
T  2058023 caatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttc- 2058120  T
Q  113 cccactctcacaatatgaatccta 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  2058121 cccactctcacaatatgaacccta 2058144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Original strand, 23565148 - 23565209
Alignment:
Q  39 tacaaaagagttacaagaaattagctt--acaaacttacacaagaacaagacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23565148 tacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaagctcaca-aagaacaagacctaatttctac 23565209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3716031 - 3715836
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3716031 caatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccca 3715932  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3715931 ctttcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 3715836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 36029151 - 36029345
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  36029151 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcactca 36029250  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36029251 ctctcaaaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 36029345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40592811 - 40592616
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  40592811 caatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaaaatctaatttctacccattttgtgtcaccca 40592712  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40592711 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 40592616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18552912 - 18552719
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18552912 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 18552813  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18552812 cactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 18552719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 48438272 - 48438468
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48438272 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcatataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 48438371  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48438372 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 48438468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1736334 - 1736138
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  1736334 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccaa 1736235  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736234 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 1736138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8370515 - 8370323
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  8370515 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccattt-gtgtcaccca 8370418  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8370417 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaaac-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcc 8370323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24695192 - 24695000
Alignment:
Q  18 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccac 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24695192 aatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaacttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccac 24695093  T
Q  118 tctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
     ||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24695092 actctca--atgaatcctaaaagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcaccacccaaggtgtttacaatgtttcc 24695000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 35925538 - 35925730
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  35925538 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagtttataagcttacactagaacaaaacctaatttctacccattt-gtgtcaccca 35925635  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35925636 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 35925730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Original strand, 47649652 - 47649822
Alignment:
Q  42 aaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaggaga 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47649652 aaaagagttacaagaaattaacttacaagcttccacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccactctcgcaatatgaatcctaagaga 47649751  T
Q  142 aaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  47649752 aaacacaaaaggaagctttttgatccttcaaatggtgaaatctaactacccaaggtgtttacaatgtttcc 47649822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 25795839 - 25796032
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25795839 caatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 25795938  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25795939 cactctca--atgaatcctaagagaaaacataaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacattgtttcc 25796032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30709819 - 30709623
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  30709819 caatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatcttgtgtcaccca 30709720  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30709719 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctatttgatcattccaatgatgaaatctcactccccaaggtgtttacaatgtttcc 30709623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 26299046 - 26299240
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26299046 caatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaacttagacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 26299145  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacac-aaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |  || ||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299146 caatctca--attaatcctaagagaaaacacaaaaaggaagctttttgataattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 26299240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 40844710 - 40844906
Alignment:
Q  18 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40844710 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccac 40844809  T
Q  118 tctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtga-----aatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
     ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  40844810 actctcaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtcaggtcaaatctcattactcaaggtgtttacaatgtttc 40844906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47923935 - 47923738
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaa-gaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  47923935 caatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaagaaattagcttaaaagtttacacaaagagcaaaacctaatttatacccattttgtgtcatcc 47923836  T
Q  116 actctcacaata-tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47923835 acactctcaataatgaatcctacgagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 47923738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6794742 - 6794549
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa-ttagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  6794742 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaattagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccattt-gtgtcaccc 6794645  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6794644 actctcacaatatgaaccctaagagaaaatacaaaaggaagc-ttttgttcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 6794549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 16264408 - 16264601
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  16264408 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttccacaagaacaagacctaatttctacacattt-gtgttaccca 16264505  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264506 ctctctcaatgatgaaccctaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 16264601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 21711282 - 21711474
Alignment:
Q  18 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  21711282 aatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccattt-gtgttacccac 21711379  T
Q  118 tctcacaata-tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
     ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21711380 actctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcc 21711474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 8126688 - 8126882
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt-gtgtcaccc 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  8126688 caatccactacgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacttaatttctacccatttttgtgtcaccc 8126787  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || ||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8126788 acactctcaat--gaatcttaagagaaaacacaaaaagaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 8126882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27974981 - 27974786
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||    
T  27974981 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttccc 27974884  T
Q  116 actctcacaata-tgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | |||| ||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27974883 attctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 27974786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3328385 - 3328193
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||   | |||||    
T  3328385 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacc 3328287  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3328286 cacactctcaatgt--atcctaagagaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatgctgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 3328193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3323719 - 3323525
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||| |   | |||||    
T  3323719 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcataatttctacccattgttcatatcacc 3323621  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323620 cacactctcaat--gaattctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 3323525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1417519 - 1417325
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt--gtgtcacc 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||   | |||||    
T  1417519 caatccactaagaagaaagtgttacaat-gagttataagaaattagcttataaacttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacc 1417421  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  1417420 cacactccca--atgaatcctaagagaaaacacaaaagaaaactttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacctaaagtgtttacaatgtttcc 1417325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26928630 - 26928433
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || |    
T  26928630 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-c 26928533  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26928532 ccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttc 26928434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 27453016 - 27453210
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  27453016 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttc-cc 27453113  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27453114 cactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 27453210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 32143379 - 32143573
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  32143379 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 32143476  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32143477 cactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 32143573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27986441 - 27986290
Alignment:
Q  61 agcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagct 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||| |||||| || ||||   ||||| |||||||||||||||    
T  27986441 agcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttcccactctctcaatatcaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagct 27986343  T
Q  159 ttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986342 ttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 27986290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39032555 - 39032390
Alignment:
Q  44 aagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaat-atgaatcctaggagaa 142  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||   ||||  |||  | ||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  39032555 aagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacgcaagagcaagatctaatttctatccattta-tgtttctcactctctcaatgatgaaccctaagagaa 39032457  T
Q  143 aacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39032456 gacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 39032390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33386680 - 33386510
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctag--g 138  Q
    |||| |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||   |    
T  33386680 aaagtgttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccattt-gtgtttcccactctctcaataatgaaccctaaaag 33386582  T
Q  139 agaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33386581 agaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 33386510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 37466349 - 37466547
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||   | ||||     
T  37466349 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaattaatttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcact 37466447  T
Q  115 cactctcacaat--atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| | |||  |  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37466448 cacccgcactctcaatgaatcctaaaataaaacacaaaaggaagcttttcgatctttccaatggtgaaatctcacaacccaaagtgtttacaatgtttcc 37466547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 1306006 - 1306200
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||| | || |||||||  |||| ||| || ||    
T  1306006 caatccactacgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttc-cc 1306103  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1306104 cactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaa-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 1306200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25929370 - 25929232
Alignment:
Q  72 ttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg-tgtcacccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaag--gaagctttttgatcct 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  25929370 ttacaaaagaacaagacctagtttctactcattttcatgtcacccacactcacaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaaaagaagctttttgatcct 25929273  T
Q  169 tccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25929272 tccgatggtgaaatctcactacccaa-gtgtttacaatgttt 25929232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 21353620 - 21353815
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacc 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  | || ||| |||||||  |||||||||||||  |||||   || |||     
T  21353620 caatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcacaagagctcaca-aagaacacaacctaatttctacccatttttcatgccact 21353718  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtga-aatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| || |||||  ||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21353719 cacacttacaat--gaatcttaagagaaaacactaaaggaaacttttggatccttccaatggtgacattctcactacccaaagtgtttacgatgtttcc 21353815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40372834 - 40372638
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaat-tttgtgtcacc 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  || | ||| || ||    
T  40372834 caatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cc 40372737  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcct--aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa-tggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||||||| |||||||| |||  | ||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40372736 cactctcataatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc-tttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 40372638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 37725874 - 37725927
Alignment:
Q  159 ttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37725874 ttttgatcctttcaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttataatgtttcc 37725927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5366243 - 5366164
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa-tggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaa 205  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5366243 atgaatcctaagcgaaaacactaaaggaaacttttcgatccttccaattattgaaatcttactacccaaggtgtttacaa 5366164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4386956 - 4386875
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctac 99  Q
    ||||||| || ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||    
T  4386956 caatccaataagataaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaagctcaca-aagaacaaaacctaatttctac 4386875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Original strand, 21156596 - 21156682
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgttta-caatgtttcc 212  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||  ||||||| || || | |||||||||| ||||||||||    
T  21156596 atgattcctaagagaaaacactaaagcaagctttttgatcttttcaataatgaaatctcattaactaaggtgtttaccaatgtttcc 21156682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 212
Target Start/End: Original strand, 27026925 - 27026958
Alignment:
Q  179 aaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27026925 aaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 27026958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47703975 - 47703780
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47703975 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 47703876  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47703875 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagtttttttatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 47703780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 13598456 - 13598650
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  13598456 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctactcattttgtgtcaccca 13598555  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13598556 cactctcaatgatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 13598650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16124555 - 16124359
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  16124555 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacataagaacaagacctaatttctacccattttgtgttaccca 16124456  T
Q  117 ctctcacaata-tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124455 cactttcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 16124359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 29651869 - 29652065
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29651869 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 29651968  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29651969 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaaactttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 29652065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 9476319 - 9476514
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  9476319 caatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctatccattttgtgtcactca 9476418  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9476419 ctctcacaatgtgaatcttaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttcaaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcc 9476514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 19072986 - 19073180
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  19072986 caatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttgtgtcactca 19073085  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19073086 cactctcaa-atgaaccctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 19073180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 19120876 - 19121070
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  19120876 caatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttgtgtcactca 19120975  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19120976 cactctcaa-atgaaccctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 19121070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40816842 - 40816661
Alignment:
Q  28 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||     
T  40816842 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctactcattt-gtgtcacccacactctcaat- 40816745  T
Q  128 tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40816744 -gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 40816661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 3281766 - 3281959
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||    
T  3281766 caatccacgatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttccca 3281863  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281864 ctctctcaatgatgaaccctaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 3281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26644936 - 26644743
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  | ||    
T  26644936 caatccattatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttctca 26644839  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26644838 ctctctcaatgatgaaccctaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcc 26644743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13604662 - 13604467
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||    
T  13604662 caatccactatgatgaaaatgttacaaa-gagttacaagaaaaatagcttgcaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttccc 13604565  T
Q  116 actctcacaata-tgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| ||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13604564 actctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 13604467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47098863 - 47098670
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtg-tcaccc 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||    ||||||    
T  47098863 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccattttcacatcaccc 47098765  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || ||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47098764 acactctcaat--gaaacctaagaaaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 47098670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21536608 - 21536417
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||    ||||||| |||||    
T  21536608 caatccactataatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaatacttaatttctac-ccgtttgtgttaccca 21536511  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21536510 ctctctcaatgatgaaccctaagagaagacacaaaaggaagc-tttcgatccttccaatggtgaaatcttactacccaaggtgtttacaatgttt 21536417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 32889497 - 32889690
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt--gtgtcac 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   | ||||    
T  32889497 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcac 32889595  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32889596 ccacactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaa-gaagc-ttttgaaccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 32889690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19358882 - 19358688
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  19358882 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 19358785  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19358784 cactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 19358688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19361471 - 19361277
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  19361471 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 19361374  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19361373 cactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 19361277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19380111 - 19379917
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  19380111 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 19380014  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19380013 cactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 19379917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 37069830 - 37070019
Alignment:
Q  19 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccact 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  37069830 atccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaaaa---tagtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttacccact 37069924  T
Q  119 ctcacaata-tgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | | ||||| |||| | ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  37069925 cactcaataatgaaccataaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcattatccaaggtgtttacaatgtttcc 37070019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47102880 - 47102684
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttcta----caaattttgtgtca 112  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||| |||||||||||    ||  |||  | |||    
T  47102880 caatccactaagatgaaaatgttacaat-gagttacaagaaattaacttataagcatacaaaagaacaagtcctaatttctatacccatttttcatatca 47102782  T
Q  113 cccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||| ||||  |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47102781 ctcacactctcaat--gaatcctaagaaaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 47102684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24202808 - 24202614
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  24202808 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 24202711  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24202710 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgagatctcactacccaaggtgattacaatgttt 24202614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 22819487 - 22819683
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   | || ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||    ||||||    
T  22819487 caatccaccaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagctttttagctcaca-aagaataagacataatttctaaccatttttcaagtcacc 22819585  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaa--cacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||| ||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22819586 cacactctcaat--gaatcctaagagaaaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatgtaactacccaaggtgtttacaatgtttcc 22819683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27104330 - 27104246
Alignment:
Q  128 tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27104330 tgaatcttaagagaaaacacaaaaggaagctttttgattcttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgcttataatgtttcc 27104246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19366293 - 19366157
Alignment:
Q  71 cttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacccactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatcc 167  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  19366293 cttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta-gatcc 19366196  T
Q  168 ttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaat 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19366195 ttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaat 19366157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27104411 - 27104337
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  27104411 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagct--------tacacaagaacaagacctaatttctac 27104337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9022834 - 9022752
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  9022834 atgaatcctaagagaaaactcaa--ggaagcttttttatccttccaatggtgaaatctcactacgaaaggtgtttacaatgtttc 9022752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11031389 - 11031327
Alignment:
Q  141 aaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  11031389 aaaacactaaaggaagctttttgatccttccaataatgaa--ctcactacccacggtgtttacaa 11031327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35109545 - 35109423
Alignment:
Q  48 gttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctac--aaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaggagaaaac 145  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||  | ||||||||||  || |||   ||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||     
T  35109545 gttacaagaaattagcttaaaagctcaca-aagaacaaaccttaatttctacccaattttcaagtcacacacactcacaat--gaatcctacgagaaaat 35109449  T
Q  146 acaaaaggaagctttttgatccttcc 171  Q
    || |||||||||||||| ||||||||    
T  35109448 actaaaggaagcttttttatccttcc 35109423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Original strand, 8281485 - 8281563
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaa 205  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| || |||||  |  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8281485 atgaatccaaagagaaaacactaaaggaagtttttttattcttcctctaatgagatctcactacccaaggtgtttacaa 8281563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9023878 - 9023797
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| |||||||| || || || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9023878 caatccactaagatgaaagtgatacaaatgggatacaataaattagcataaaagctcaca-aagaataagacctaatttctac 9023797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 48382520 - 48382468
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaa 69  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  48382520 caatccaatatgatgaaagtgatacaaataggttacaagaaattaacttacaa 48382468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23799616 - 23799424
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23799616 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 23799517  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  23799516 ctgtcacaatatgaatcctaagggaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctccctactcaaggtgtttacaatgtt 23799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26403269 - 26403074
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  26403269 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaaattagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcactca 26403170  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26403169 ctctcacaatatgaatcataagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 26403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 6127279 - 6127475
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6127279 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 6127378  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6127379 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaaatgtttacaatgtttcc 6127475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5702522 - 5702325
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  5702522 caatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaaaacctaatttctacccattttgagtcaccca 5702423  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggag-aaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5702422 cactctcaataatgaatcctaagagaaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttcc 5702325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4696620 - 4696453
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaggagaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||    
T  4696620 aaagagttacaagaaattagcttataagcttacgcaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcatt--gaatcctaagagaa 4696523  T
Q  143 aacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4696522 aacacaaaaggaagctttttgatctttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 4696453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 7412399 - 7412592
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||    
T  7412399 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttccca 7412496  T
Q  117 ctctcacaata-tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412497 ctctctcaataatgaaccctaagagaagacataaaaggaagctttt-gatcctttcaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 7412592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 4456086 - 4456280
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  4456086 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagctggcaagcttacacaagaacaagacataatttctacccattt-gtgttaccca 4456183  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456184 ctctctcaatgatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttctaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 4456280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19175793 - 19175599
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||    
T  19175793 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaaatagcctgcaagcttacacaagaacaagacctaacttctacacattt-gtgtttccc 19175696  T
Q  116 actctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19175695 actctctcaatgatgaaccctaagagaagacacaaaaggaaactttt-gatccttccaatagtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 19175599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19752433 - 19752240
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt--gtgtcac 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   | ||||    
T  19752433 caatccactaagatgaaagtgttacaat-gagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcac 19752335  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19752334 ccacactctca--atgaatcctaagagaaaacac-aaaggaagctttttgatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttc 19752240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31071268 - 31071074
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| || ||    
T  31071268 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-cc 31071171  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31071170 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaa-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 31071074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 3051178 - 3051372
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacc 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  | || ||| |||||||| || ||||||||||  |||||   ||||||     
T  3051178 caatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcataagagctcaca-aagaacaaaacttaatttctacccatttttcatgtcact 3051276  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
     || ||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3051277 tacactctcaat--gaatcctaagagaaagcacaaaaggaagctttttgatctttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcc 3051372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1261993 - 1261799
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  1261993 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 1261896  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1261895 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattacaatgttt 1261799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7493214 - 7493018
Alignment:
Q  15 cacaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtca 112  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | || || || ||||| |||||| |||||||||||||   ||||    ||||    
T  7493214 cacaatccactaagatgaaagtgatacaaagaagttataagaaattaacataaaagctcacaca-gaacaaaacctaatttctacctgtttttcaagtca 7493116  T
Q  113 cccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7493115 cccacactctcaata--aatcctaagaaaaaacactaaaggaagctttttgatccttctaattgtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 7493018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 26287974 - 26288142
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctag--ga 139  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  26287974 aaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccattt-gtgttccccactctcacaatatgaaccctaaaaga 26288072  T
Q  140 gaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26288073 gaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 26288142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 26301231 - 26301399
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctag--ga 139  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  26301231 aaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccattt-gtgttccccactctcacaatatgaaccctaaaaga 26301329  T
Q  140 gaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26301330 gaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 26301399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 26313225 - 26313393
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctag--ga 139  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  26313225 aaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccattt-gtgttccccactctcacaatatgaaccctaaaaga 26313323  T
Q  140 gaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26313324 gaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 26313393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 28307730 - 28307814
Alignment:
Q  128 tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28307730 tgaatcctaaaagaaaacacaaaagaaagcttttttatccttccaattgtgaaatctcactacccaaggtgttaacaatgtttcc 28307814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9054324 - 9054267
Alignment:
Q  153 gaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  9054324 gaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattataatgttt 9054267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5990491 - 5990406
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||    
T  5990491 atgaatcctaagagaaaacactaaagaaagctttttgacctttcgaatggtgaaatctcacaaaccaagatgattacaatgtttcc 5990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13204713 - 13204634
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaat 206  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13204713 atgaatcctatgagaaaatattaaataaagctttttgattctcccaacggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaat 13204634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4760114 - 4759917
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaat-tttgtgtcac 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  || | ||| || |    
T  4760114 caatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-c 4760017  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcct--aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa-tggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4760016 ccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc-tttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtt 4759918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18853207 - 18853137
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaaacttacacaagaacaa 85  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| | ||| |||||||||||||||    
T  18853207 caatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaa 18853137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18870601 - 18870531
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaaacttacacaagaacaa 85  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| | ||| |||||||||||||||    
T  18870601 caatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaa 18870531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 95
Target Start/End: Original strand, 6813741 - 6813818
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaattt 95  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  6813741 caatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagctcaca-aagaacaaaacctaattt 6813818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30291695 - 30291627
Alignment:
Q  32 aaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt--acaaacttacacaagaacaagacctaatttctac 99  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||| |||||||||||||    
T  30291695 aaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcaca-aagaacaaaacctaatttctac 30291627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9054875 - 9054795
Alignment:
Q  18 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctac 99  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||| | |||||||||||    
T  9054875 aatccactaagatgaaagtgatacaaagtggttacaagaaattagcttaaaagcgcaca-aagaacaaaatctaatttctac 9054795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33037749 - 33037650
Alignment:
Q  113 cccactctcacaatatgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa-tggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33037749 cccactctcacaatatgaaccctaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtt 33037651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 8040118 - 8040316
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagag--ttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8040118 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacc 8040217  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggag-aaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8040218 cactctcacaatatgaatcctaagagaaaaacataaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 8040316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10707291 - 10707098
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  10707291 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatct-gtgtcaccca 10707193  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10707192 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttctaatggtgaaatctaactacccaaggtgtttacaatgtttc 10707098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8390189 - 8389994
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8390189 caatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 8390090  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8390089 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaagaggaagctttttgattcttccaatggtaaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 8389994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 34388916 - 34389103
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34388916 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta--------cacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 34389007  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34389008 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 34389103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 21630001 - 21630197
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21630001 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccca 21630100  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21630101 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 21630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 13569386 - 13569581
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||    
T  13569386 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagtttacacaagaacaagacctaatttctaccctttgtttgtcaccca 13569485  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13569486 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttataatgtttcc 13569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14699046 - 14698854
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14699046 caatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 14698948  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698947 cactctcaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatagtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 14698854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34682373 - 34682180
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  34682373 caatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaggcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccca 34682274  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34682273 ctctcacaaggtgaatcctaagagaaaacacaaaaggaaacattttgatccttcaagtggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 34682180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 31056102 - 31056295
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31056102 caatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaataaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 31056201  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31056202 cactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcctttcaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 31056295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 39482989 - 39483185
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  39482989 caatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttatgtcaccca 39483088  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39483089 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagttttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatatttcc 39483185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 17865261 - 17865457
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  17865261 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacataatttctacctattttatgtcatcca 17865360  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865361 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttctatttgtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 17865457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33528660 - 33528469
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33528660 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagct-----aagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 33528566  T
Q  117 ctctcacaata-tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
      ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33528565 aactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaatgtgtttacaatgtttcc 33528469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 33118194 - 33118384
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||     
T  33118194 caatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccct 33118293  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    | ||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33118294 cactctca--atgaatcttaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggcgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtt 33118384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 20522278 - 20522474
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20522278 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaattagattataagcttacaaaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccca 20522377  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20522378 cactctcaataatgagtcctaagaaaaaacacaaaaggaagctttttgatcattcaaatggtgaaatctcactacccaagttgtttacaatgcttcc 20522474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23078509 - 23078316
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  23078509 caatccactatgatgaaagtgttagaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattt-gtgttaccca 23078412  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078411 cactctcaatgatgaaccctaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 23078316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 40014983 - 40015177
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg-tgtcaccc 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  40014983 caatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttgcgagaaattagcttaaaaactcacaaaagaacaagacctaatttctactcattttcatgtcaccc 40015082  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || ||| |||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40015083 acactctcaata--aatcctaagaaaaatcacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaatgtgtttacaatgtttcc 40015177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28259216 - 28259022
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||  ||||    
T  28259216 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagatctaatttctaccca-tttgtgtttccca 28259119  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcct-aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||  ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28259118 ctctctcaataatgacccctaaagagaagacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaagatgtttacaatgtttcc 28259022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42039707 - 42039555
Alignment:
Q  18 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa-ttagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42039707 aatccactatgatgaaagtgttacgaa-gagttacaagaaaattagcttgcaagcttacacaaaaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 42039609  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttc 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  42039608 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaacataaaaggaagttttttgattcttc 42039555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36757801 - 36757607
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||    
T  36757801 caatccagtatgatgaaagtgtttcaaa-gagttataagaaaaaagctttcaagcttacacaagaacaaaacctaatttctacccattt-gtgttaccca 36757704  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757703 ctctctcaatgatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 36757607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10445483 - 10445375
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10445483 caatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaatcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 10445384  T
Q  117 ctctcacaa 125  Q
    |||||||||    
T  10445383 ctctcacaa 10445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2869732 - 2869539
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaaga-cctaatttctacaaattttgt--gtcac 113  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||    |||||    
T  2869732 caatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaagaaattagcttaaaagctcaca-aagaacaaaaacctaatttctacccatttttcaagtcac 2869634  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2869633 ccacactctcaat--gaatcctaagagaaaacactaacggaagctttttgattcttccaatggcgaaatctcactacccaatgtgtttacaatgttt 2869539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 3491808 - 3492002
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||    
T  3491808 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cc 3491905  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3491906 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttaa-gatccttccaatggtggaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 3492002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10445379 - 10445312
Alignment:
Q  145 cacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10445379 cacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 10445312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 40738915 - 40739086
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacccactctcacaatatgaatcctag--g 138  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||   |    
T  40738915 aaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcttagtttctacccatttgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaag 40739013  T
Q  139 agaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40739014 agaagacacaatagtaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcc 40739086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15903928 - 15903735
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||   |||||||||||  |||||    ||||||    
T  15903928 caatccactaagataaaagtgatacaaaggggttacaagaaat-agcttacaagctcaca-aagaacaaattctaatttctacccatttttcaagtcacc 15903831  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
T  15903830 cacactctcaat--gaatcctatgagaaaacacaaaagaaatcttttttatcattccaatggtgaaatctcattatccaatgtgtttacaatgtttcc 15903735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2837960 - 2837874
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaa-tcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2837960 atgaatcctaagagaaaacactaaaggaatattttttatccttccaatggtgaaattctcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 2837874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9296440 - 9296244
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcac 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| | ||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||  || | ||| || |    
T  9296440 caatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-c 9296343  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9296342 ccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 9296244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 25398553 - 25398710
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| ||  |    
T  25398553 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-tc 25398650  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcct--aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa 173  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25398651 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagc-tttagatccttccaa 25398710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 25403691 - 25403848
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| ||  |    
T  25403691 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-tc 25403788  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcct--aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa 173  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25403789 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagc-tttagatccttccaa 25403848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 25407680 - 25407837
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| ||  |    
T  25407680 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-tc 25407777  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcct--aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa 173  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25407778 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagc-tttagatccttccaa 25407837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16940248 - 16940199
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16940248 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagctta 16940199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17010913 - 17010864
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17010913 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagctta 17010864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Original strand, 35397677 - 35397759
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  35397677 atgaatcctaagagaaaatacaatttgaag-ttattgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtaattacaatgttt 35397759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 14291546 - 14291743
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaat-tttgtgtcac 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  || | ||| || |    
T  14291546 caatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-c 14291643  T
Q  114 ccactctcacaatatgaatcct--aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa-tggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14291644 ccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc-tttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtt 14291742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18674347 - 18674245
Alignment:
Q  109 gtcacccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttac-aatg 207  Q
    ||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  18674347 gtcacccacactcataa-atgaatcataagagaaaacattaaaggaagctttttgatcctt-caataatgaaatctcactgctcaaggtgtttacgaatg 18674250  T
Q  208 tttcc 212  Q
    |||||    
T  18674249 tttcc 18674245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 210
Target Start/End: Original strand, 25409842 - 25409881
Alignment:
Q  171 caatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25409842 caatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 25409881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Original strand, 3278167 - 3278245
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaa 205  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3278167 atgaaccctaagagaaaacgctaaaggaagttttttgatccgtcctataatgaaatctcactatccaaggtgtttacaa 3278245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28770704 - 28770626
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaa 205  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||   |  ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28770704 atgaatcctaagagaaaacactaaaggaaacttttttatccttcagctaatgagatctcactacccaaggtgtttacaa 28770626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11098966 - 11098897
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaaacttacacaagaacaa 85  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||    
T  11098966 caatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaagaacaa 11098897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27149333 - 27149207
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||| ||||||   |||| |  ||||||    
T  27149333 caatccactataatgaaagtgatacaaaggggtaacaagaaattaccttaaaagctcaca-aagaacaagacttaacttctacctgttttttaagtcacc 27149235  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaa 144  Q
    ||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  27149234 cacactcaca--atgaatcctaagagaaaa 27149207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2838069 - 2838024
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattag 62  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2838069 caatccactaaaatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattag 2838024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 65
Target Start/End: Original strand, 17490228 - 17490261
Alignment:
Q  32 aaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 65  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17490228 aaagagttacaaaagagttacaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 3777607 - 3777801
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  3777607 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaaacttacacaagaacaagatctaatttctacccattttgtgtcaccca 3777705  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3777706 ctctcacaatatgaatcctaagagaaaatacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 3777801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16623332 - 16623138
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16623332 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctaataagcttacagaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 16623233  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623232 ctctcacaatatgaatcctaaaagaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 16623138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 10047437 - 10047633
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10047437 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 10047536  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10047537 cactctcaataatgaatcctaagacaaaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 10047633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 24333867 - 24334063
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaaga-cctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  24333867 caatccactatgatgaacgtgttacaaaagagttataaaaaattagcttacaagcttacacaagaaaaaaaacctaatttctacccattttgtgtcagcc 24333966  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24333967 actctcacaatatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 24334063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38152478 - 38152283
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38152478 caatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccaattttgtgtcaccca 38152379  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38152378 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaatggaagc-ttttgatccttccaatggtgaattgtcactacccaaggtgtttacaatatttcc 38152283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6743454 - 6743260
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6743454 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagctacaaaaaattagcttatag-cttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 6743356  T
Q  117 ctctcacaata-tgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6743355 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaag-tttttgatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcc 6743260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5269215 - 5269045
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaata-tgaatcctaggaga 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5269215 aaagtgttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattgtgtgtcacccacactctcaataatgaatcctaagaga 5269116  T
Q  142 aaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5269115 aaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 5269045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 5147738 - 5147930
Alignment:
Q  20 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactc 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  5147738 tccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaaggcctaatttctacccattttgtgtcacccattc 5147837  T
Q  120 tcacaatatgaatcct-aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
T  5147838 tcacaatatgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagc-ttatgatccttccaatggtgaaatctcattatccaatgtgtttacaatgtttcc 5147930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 5143321 - 5143512
Alignment:
Q  21 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactct 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  5143321 ccactatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaaaatagcttgcaagcatacacaagaacaagacctaatttctactcattttgtgtcagccactct 5143420  T
Q  121 cacaatatgaatcct-aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5143421 cagaatatgaaccctaaagagaaaacacaaaaggaagc-ttatgatccttccaatggtgaaatctcactacctaaggtgtttacaaagtttcc 5143512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36315268 - 36315075
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  36315268 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctaccca-tttgtgttaccca 36315171  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36315170 cactctcaataatgaatcctacgaaaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggttaaatctcactacccaatgtgtttacaatgtttcc 36315075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36329477 - 36329284
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  36329477 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctaccca-tttgtgttaccca 36329380  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36329379 cactctcaataatgaatcctacgaaaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggttaaatctcactacccaatgtgtttacaatgtttcc 36329284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42599611 - 42599419
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  42599611 caatccactaagatgaaaatgttacaat-gagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccg 42599513  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42599512 cactctcaat--gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagtttttttatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttagaatgtttcc 42599419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25862046 - 25861878
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaggagaa 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||    
T  25862046 aaagtgttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaattcctacccattttgtgtcacccacactctcaat--gaatcctaagagaa 25861949  T
Q  143 aa-cacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25861948 aaacacaaaaggaagttttttgatccttccaatggtgaaatctcactactcaaggtgtttacaatgtttcc 25861878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 54867241 - 54867427
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  54867241 caatcaactatgatgaaaatgttacaaaatagttataagaaattagcttataagcttacacaagaacaatacctaatttctacccattttgtgtcatcca 54867340  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacac--aaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaa 205  Q
    | ||||    |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  54867341 cactca----atgaatcctaagagaaaacacaaaaaagaaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccatagtgtttacaa 54867427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5396710 - 5396516
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||    
T  5396710 caatccactatgatgaaagtgttgcaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttactca 5396613  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396612 ctctctcaatgatgaaccctaaagagaagacacaaaagaaagctttt-gattcttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 5396516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 5112295 - 5112489
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| | | || ||| ||||||||||| |||  ||||| |  |||||     
T  5112295 caatccactaatatgaaagtgttacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaactcataaaa-aacgagacctaatttgtacctattttttaagtcact 5112393  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5112394 cacactcacaat--gaatcctaagagaaaacataaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 5112489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16628839 - 16628717
Alignment:
Q  89 ctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccact 188  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16628839 ctaatttctacccattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaaaagaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcact 16628741  T
Q  189 acccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16628740 acccaaggtgtttacaatgtttcc 16628717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31985673 - 31985478
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||  |||    
T  31985673 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccattt-gtgtttccc 31985576  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31985575 actctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttcccatggtgaaatttcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 31985478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8689509 - 8689341
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaat-atgaatcctaggaga 141  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||| |||| ||||    
T  8689509 aaagtgttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccaa-tttgtgtttcccactctctcaatgatgaaccctaagaga 8689411  T
Q  142 aaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8689410 agacacaaaaggaaac-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttaaaatgtttcc 8689341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39774344 - 39774150
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg-tgtcaccc 115  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| || || ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  39774344 caatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaagaaattagcttaaaagctcacaaagaaacaagacctaatttctaccaattttcatgtcactc 39774245  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    || ||| ||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39774244 acactctcaat--gaatcccaagagaaaatacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaaactcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 39774150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3796557 - 3796458
Alignment:
Q  18 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3796557 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccac 3796458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 18377420 - 18377609
Alignment:
Q  20 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg-tgtcacccact 118  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| || || ||| |  |||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||     
T  18377420 tccactaagatgaaagtgatacaaatgggttataagaaatcagcttaaaagctcacaaagaaacaagccctaatttctacccattttcatgtcacccaca 18377519  T
Q  119 ctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    || |||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  18377520 cttacaat--gaatcctaagaaaaaacacaaaatgaagctttttgatccttccaatggtaaaatctcattacccaaggggtttacaatgttt 18377609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3794023 - 3793927
Alignment:
Q  114 ccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3794023 ccactctctcagtatgaatcctaagagcaaacacaaaaggaagctttttgatcctttctatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 3793927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16630719 - 16630642
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  16630719 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagatctaatt 16630642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1983339 - 1983148
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt-gtcaccc 115  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| || |||||||||    ||||   ||||||     
T  1983339 caatccactaggatcaaagtgatacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagctcaca-aagaacaaaacataatttctatcctttttcaagtcacct 1983241  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtg-aaatcccactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    || ||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  1983240 acactctcaat--gaatcctaagagaaaacccaaaaggaagcttttttatccttccaatggtgaaaatcttactaaccagggtgtttacaatgtt 1983148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28468523 - 28468387
Alignment:
Q  71 cttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacccactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatcc 167  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||  |||| ||| || ||||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  28468523 cttacacaataacaagacctagattctacccatttgtgtttc-cccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta-gatcc 28468426  T
Q  168 ttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaat 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28468425 ttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaat 28468387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 37781920 - 37782108
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgt--gtcacc 114  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  | ||||||||||  |||||    ||||||    
T  37781920 caatccactataataaaagtgatacaaagaggttacaagaaattagcttaaaaactcaca-aagaacaaatcttaatttctacccatttttcaagtcacc 37782018  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaa 205  Q
     || |||  || ||||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37782019 tacactcgtaa-atgaatcttaagagaaaacactaaaagagactttttgattcttccaataatgaaatctcactacccaaggtgtttacaa 37782108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 39246052 - 39246094
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246052 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 39246094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 29760699 - 29760895
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttacaaacttacacaagaa-caagacctaatttctacaaattt-tgtgtca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| | ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||   ||  ||| ||     
T  29760699 caatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagcctgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttc- 29760796  T
Q  113 cccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaa-tggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29760797 cccactctcacactatgaaccctaagagaagacactagaggaagc-tttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttt 29760895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 873437 - 873370
Alignment:
Q  138 gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaa 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |  ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  873437 gagaaaacacaaaatgaagctttttgatcctccctctaatgagatctcactactcaaggtgtttacaa 873370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31474232 - 31474171
Alignment:
Q  39 tacaaaagagttacaagaaattagctt--acaaacttacacaagaacaagacctaatttctac 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  31474232 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactca-aaaagaacaagacctaatttctac 31474171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18912402 - 18912335
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaa 85  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  18912402 caatccactatgataagagtgatacaaaaaggatacaagaaattagtttacaaactcaca-aagaacaa 18912335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 5741 - 5935
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  5741 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctactcattttgtgtcaccca 5840  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5841 cactctcaatgatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 5935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 2550 - 2746
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  2550 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattataagaaattagcttataagcttacacaagaacaagaactaatttctacccattttgtgtcaccca 2649  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2650 cactctcaatgatgaatcctaagataaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacgcaaggtgtttacaatgtttcc 2746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 133319 - 133124
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||    
T  133319 caatccactatgatgaaaatgttacaaa-gagttacaagaaaaatagcttgcaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttccc 133222  T
Q  116 actctcacaata-tgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| ||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  133221 actctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 133124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 10787 - 10983
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  10787 caatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctatctattttgtgtcaccca 10886  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaaca-caaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10887 ctctcatgatatgaatcctaagagaaaacagaaaaaagaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 10983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 18232903 - 18233098
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18232903 caattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatcagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 18233002  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18233003 cactctcaataatgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 18233098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5572280 - 5572088
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5572280 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacgcattttgtgtcaccca 5572181  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5572180 cactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagc-ttttgatcattccaatagtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 5572088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21801383 - 21801189
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21801383 caatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaaattatcttataagcttacaaaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccca 21801284  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21801283 cactctcaa-atgaaccctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatgttgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 21801189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31086512 - 31086320
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31086512 caatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaaattagcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 31086413  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    | |||| |  |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31086412 cactca-ataatgaatcctaagagaaaacataaaaagaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcacaacccaaggtgtttacaatgtttc 31086320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10077204 - 10077027
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10077204 caatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcaccca 10077105  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtg 198  Q
    | ||||    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10077104 cactca----atgaatcctaagataaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtcaaatctcactacccaaggtg 10077027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 31979571 - 31979763
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttcta-caaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  31979571 caatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcaccc 31979670  T
Q  116 actctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    || ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31979671 acactctca--atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 31979763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 4630012 - 4630205
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4630012 caatccactaagatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaattaacttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacctattttgtgtcaccca 4630111  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
      ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4630112 aactctcaa-atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaatgtgtttaaaatgtttcc 4630205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 22963757 - 22963951
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||| |||||| ||    
T  22963757 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaccttacacaa-aacaagccgtaatttctacccattttttgtcactca 22963855  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22963856 cactctcaataatgaatcctaaaagaaaacacaaagggaa-atttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 22963951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23824636 - 23824442
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||| |||||| ||    
T  23824636 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaccttacacaa-aacaagccgtaatttctacccattttttgtcactca 23824538  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | ||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23824537 cactctcaataatgaatcctaaaagaaaacacaaagggaa-atttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 23824442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24436008 - 24435816
Alignment:
Q  19 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg-tgtcacccac 117  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||    
T  24436008 atccactaggatgaaaatgttacaaatgaattacaagaaattagcttataagcttacaaaaaaacaagacctaatttctacccatttttatatcacccac 24435909  T
Q  118 tctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
      ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24435908 attcataat--gaatcctaagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 24435816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5757517 - 5757323
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||  | |     
T  5757517 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttatacaagaacaagacctaatttctaccca-tttgtgttccact 5757420  T
Q  117 ctctcacaat-atgaatcct-aggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757419 ctctctcaataatgaaccctaaagagaagacacggaaggaagc-ttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 5757323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 31936660 - 31936827
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaatttt--gtgtcacccactctcacaatatgaatcctaggag 140  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||   | |||||||| ||| ||  |||||||||| |||    
T  31936660 aaagtgttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaaatcctaatttctacccatttttcatatcacccacactctca--atgaatcctaagag 31936757  T
Q  141 aaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31936758 aaaacacaaa--gaagctttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 31936827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 21356094 - 21356289
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  | |    
T  21356094 caatccactatgatgaaagtgttactaa-gagttacaagaaaaataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgtttctc 21356191  T
Q  116 actctcacaata-tgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| ||||| |||| ||||  || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21356192 actctctcaataatgaaccctaaagaaaagacacaaaaggaagctttt-gattcttccaatgatgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 21356289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 22709091 - 22709262
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacccactctcacaatatgaatcctag--g 138  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||   |    
T  22709091 aaagtgttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaag 22709189  T
Q  139 agaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709190 agaagacacaagaggaag-tttttgatccttccaatggtgaaatctcactatccaaggtgtttacaatgtttcc 22709262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5017493 - 5017341
Alignment:
Q  43 aaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaggagaa 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||   |||              
T  5017493 aaagtgttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccacactctcaat---aat---------- 5017407  T
Q  143 aacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5017406 ----gaaaaggaagcttttcgatccttccaatggtgaaatctcattacccaaggtgtttacaatgtttcc 5017341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 14521743 - 14521926
Alignment:
Q  28 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttg--tgtcacccactctcacaa 125  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |  | || ||| |||||||  |||||||||||||| |||||   |||||||||| ||| |||    
T  14521743 gatgaaagtgatacaaatgagttacaa-aaattagcacaagagctcaca-aagaacacaacctaatttctacacatttttcatgtcacccacactctcaa 14521840  T
Q  126 tatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaa-tcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14521841 ta--aatcctaagagaaaacattaaaggaagattttttatccttccaatggtgaaattctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 14521926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5674809 - 5674612
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttacaaacttacacaagaa-caagacctaatttctacaaattt-tgtgtca 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||   ||  ||| ||     
T  5674809 caatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttc- 5674712  T
Q  113 cccactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcc-cactacccaaggtgtttacaatgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5674711 cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtt 5674613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31076867 - 31076782
Alignment:
Q  126 tatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||    
T  31076867 tatgaatcctaagagaaaacactaaagaaatttttttgatcattccaatggtgaaatctcaatacctaaggtgtttacaaagtttc 31076782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 211
Target Start/End: Original strand, 5385777 - 5385846
Alignment:
Q  142 aaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||    
T  5385777 aaacactaaagaaagcttttttatccttctaatggtgaaatctcactacttaaggtgattgcaatgtttc 5385846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30518071 - 30517998
Alignment:
Q  112 acccactctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccact 188  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  30518071 acccacactcacaa-atgaatcttag-agaaaacactaaaggaag-tttttgatccttccaataatgaaatctcact 30517998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 85741 - 85935
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  85741 caatccaccatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccattttgtgtctccca 85839  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggag-aaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  85840 ctcccacaatatgaattctaagagaaaaacacaaaaggaag-tttttgatccttccaatggtgaaatctcactacccaaagtgtttacaatgtttcc 85935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 17321 - 17503
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  17321 caatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacctattttgtgtcactca 17420  T
Q  117 ctctcacaatatgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    | |||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421 cactctta--atgaatcctaagagaaaacacaaaaggaag-tttttga----------ggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 17503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44000 - 43806
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  | |     
T  44000 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttatacaagaacaagacctaatttctacccattt-gtgttccact 43903  T
Q  117 ctctcacaata-tgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    ||||| ||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43902 ctctctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 43806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36867 - 36679
Alignment:
Q  21 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcacccactct 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||  ||||||||    
T  36867 ccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacatgatttctacccattt-gtgtttcccactct 36770  T
Q  121 cacaata-tgaatcctag-gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    | ||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36769 ctcaataatgaaccctaaagagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgttt 36679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8458 - 8262
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattttgtgtcaccc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||    
T  8458 caatccactatgatgaaagtgttacaaa-gagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacgtattt-gtgtttccc 8361  T
Q  116 actctcacaata-tgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttcc 212  Q
    |||||| ||||| |||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8360 actctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaagctttta-atccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttcc 8262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17991 - 17797
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||  |||| ||| || ||    
T  17991 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttc-cc 17894  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17893 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattacaatgttt 17797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24084 - 23890
Alignment:
Q  17 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-tagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacaaattt-tgtgtcacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||  |||| ||| || ||    
T  24084 caatccactatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttc-cc 23987  T
Q  115 cactctcacaatatgaatcctag--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23986 cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgattacaatgttt 23890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 211
Target Start/End: Original strand, 45377 - 45449
Alignment:
Q  138 gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaatgtttc 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45377 gagaagacacaaaaggaagctttt-gatccttccaatggtgaaatctcactacccaaggtgtttacaatgtttc 45449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 23698 - 23778
Alignment:
Q  127 atgaatcctaggagaaaacacaaaaggaagc-tttttgatccttccaatggtgaaatcccactacccaaggtgtttacaat 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  23698 atgaatcctaagagaaaacacaaaatgatgccttttttatccttctaatggtgacatctcactacccaaggtgattacaat 23778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University