View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19390_high_2 (Length: 588)

Name: NF19390_high_2
Description: NF19390
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19390_high_2
NF19390_high_2
[»] chr5 (141 HSPs)
chr5 (15-559)||(31179337-31179894)
chr5 (35-559)||(31542502-31543029)
chr5 (15-399)||(25921437-25921836)
chr5 (32-399)||(38882021-38882403)
chr5 (13-399)||(4236545-4236945)
chr5 (33-420)||(31544975-31545377)
chr5 (32-371)||(2174863-2175216)
chr5 (331-569)||(15354777-15355015)
chr5 (331-569)||(15357053-15357291)
chr5 (15-372)||(10529062-10529435)
chr5 (36-397)||(16776075-16776451)
chr5 (334-569)||(10757010-10757245)
chr5 (36-372)||(39854427-39854777)
chr5 (36-399)||(21947943-21948320)
chr5 (15-370)||(18466625-18466999)
chr5 (328-569)||(23664884-23665125)
chr5 (328-569)||(23793462-23793703)
chr5 (15-399)||(21684416-21684824)
chr5 (15-372)||(18468950-18469324)
chr5 (15-331)||(25804009-25804339)
chr5 (328-569)||(23667159-23667400)
chr5 (15-372)||(27912473-27912851)
chr5 (26-399)||(2818311-2818699)
chr5 (15-331)||(34477017-34477349)
chr5 (15-331)||(34479382-34479714)
chr5 (26-372)||(6747247-6747608)
chr5 (32-372)||(27910388-27910748)
chr5 (26-369)||(18511188-18511547)
chr5 (36-331)||(6745053-6745362)
chr5 (36-372)||(26097676-26098025)
chr5 (40-372)||(40221465-40221813)
chr5 (36-371)||(1189592-1189949)
chr5 (36-368)||(10474308-10474655)
chr5 (15-331)||(15552229-15552561)
chr5 (26-369)||(18509294-18509652)
chr5 (26-372)||(18596590-18596950)
chr5 (36-371)||(25904047-25904397)
chr5 (42-371)||(17072827-17073172)
chr5 (36-371)||(24126800-24127150)
chr5 (136-372)||(6756437-6756674)
chr5 (27-371)||(31472589-31472948)
chr5 (26-363)||(2954368-2954719)
chr5 (410-569)||(10749555-10749714)
chr5 (328-495)||(38960334-38960501)
chr5 (26-293)||(658332-658610)
chr5 (26-331)||(16092175-16092495)
chr5 (26-372)||(36402304-36402664)
chr5 (36-371)||(695833-696172)
chr5 (121-371)||(34530750-34531001)
chr5 (36-371)||(39397978-39398327)
chr5 (36-364)||(17818477-17818817)
chr5 (158-371)||(20042994-20043208)
chr5 (129-372)||(12556016-12556259)
chr5 (128-399)||(31466070-31466341)
chr5 (121-372)||(37705864-37706116)
chr5 (158-371)||(20044954-20045168)
chr5 (32-372)||(10586782-10587130)
chr5 (26-248)||(4410090-4410326)
chr5 (424-559)||(34477437-34477572)
chr5 (36-364)||(21288715-21289055)
chr5 (189-372)||(26098403-26098587)
chr5 (328-524)||(23742057-23742256)
chr5 (32-239)||(39798123-39798345)
chr5 (239-372)||(20507665-20507798)
chr5 (121-366)||(6661270-6661512)
chr5 (36-236)||(20505828-20506041)
chr5 (434-559)||(38881905-38882031)
chr5 (33-220)||(10749796-10749996)
chr5 (425-559)||(31544858-31544993)
chr5 (36-248)||(41585729-41585956)
chr5 (13-220)||(23665140-23665360)
chr5 (13-220)||(23793227-23793447)
chr5 (33-220)||(3373119-3373320)
chr5 (13-220)||(15354537-15354757)
chr5 (275-372)||(4410000-4410101)
chr5 (33-220)||(10757273-10757472)
chr5 (33-220)||(38960114-38960314)
chr5 (13-220)||(15356813-15357033)
chr5 (36-253)||(2723964-2724187)
chr5 (13-200)||(23741821-23742020)
chr5 (121-370)||(9020167-9020413)
chr5 (431-528)||(21684811-21684909)
chr5 (41-371)||(36208524-36208865)
chr5 (424-495)||(34479798-34479869)
chr5 (472-552)||(4236438-4236517)
chr5 (134-328)||(20053834-20054020)
chr5 (335-398)||(10749704-10749767)
chr5 (502-569)||(38960487-38960554)
chr5 (472-534)||(16775982-16776044)
chr5 (502-559)||(34479855-34479912)
chr5 (276-372)||(41585946-41586042)
chr5 (148-372)||(42770717-42770934)
chr5 (502-559)||(2174740-2174797)
chr5 (327-372)||(3373332-3373377)
chr5 (449-526)||(4409890-4409967)
chr5 (121-315)||(17413251-17413441)
chr5 (502-559)||(25921874-25921932)
chr5 (343-420)||(34477379-34477456)
chr5 (449-526)||(39854317-39854394)
chr5 (36-121)||(26098273-26098360)
chr5 (484-534)||(659850-659900)
chr5 (26-103)||(6756718-6756795)
chr5 (121-233)||(15143547-15143661)
chr5 (36-97)||(20043222-20043284)
chr5 (345-399)||(39798004-39798058)
chr5 (121-175)||(42770951-42771005)
chr5 (158-219)||(1170811-1170871)
chr5 (449-526)||(1240171-1240248)
chr5 (449-526)||(6744894-6744971)
chr5 (449-526)||(6747137-6747214)
chr5 (343-420)||(34479740-34479817)
chr5 (158-219)||(35385574-35385634)
chr5 (450-526)||(42238047-42238123)
chr5 (36-105)||(12555908-12555978)
chr5 (158-216)||(25452498-25452555)
chr5 (158-219)||(2298123-2298183)
chr5 (449-526)||(10529468-10529545)
chr5 (158-211)||(25445504-25445556)
chr5 (26-102)||(31465965-31466041)
chr5 (502-559)||(39797909-39797966)
chr5 (58-121)||(23667526-23667590)
chr5 (122-216)||(4897828-4897923)
chr5 (162-315)||(29748352-29748502)
chr5 (321-371)||(2723911-2723961)
chr5 (267-301)||(13295755-13295789)
chr5 (158-216)||(28786407-28786464)
chr5 (75-115)||(1170926-1170967)
chr5 (158-219)||(1240428-1240488)
chr5 (343-372)||(2144899-2144928)
chr5 (343-372)||(15552178-15552207)
chr5 (75-115)||(22672950-22672991)
chr5 (75-115)||(25445612-25445653)
chr5 (343-372)||(25803959-25803988)
chr5 (158-219)||(31782579-31782639)
chr5 (75-115)||(35385477-35385518)
chr5 (45-121)||(37705774-37705851)
chr5 (502-534)||(659797-659829)
chr5 (55-114)||(9353361-9353421)
chr5 (75-115)||(15445291-15445331)
chr5 (343-371)||(29748285-29748313)
chr5 (55-114)||(36932379-36932439)
[»] chr3 (203 HSPs)
chr3 (33-559)||(50493736-50494276)
chr3 (15-399)||(5191549-5191946)
chr3 (32-399)||(3859424-3859805)
chr3 (26-372)||(4308255-4308615)
chr3 (15-559)||(38210127-38210666)
chr3 (15-420)||(38889914-38890335)
chr3 (15-399)||(6065757-6066158)
chr3 (36-399)||(11170300-11170678)
chr3 (15-372)||(4103858-4104233)
chr3 (15-420)||(6063407-6063830)
chr3 (15-399)||(5522589-5522976)
chr3 (36-372)||(43228214-43228565)
chr3 (15-371)||(10084351-10084726)
chr3 (15-372)||(51726969-51727340)
chr3 (36-399)||(45882835-45883214)
chr3 (15-399)||(10955989-10956388)
chr3 (36-399)||(18099153-18099531)
chr3 (45-372)||(43226009-43226350)
chr3 (15-399)||(22114267-22114666)
chr3 (15-399)||(26720444-26720842)
chr3 (26-399)||(18096874-18097262)
chr3 (15-399)||(10958285-10958684)
chr3 (32-372)||(25533357-25533720)
chr3 (131-399)||(35777317-35777587)
chr3 (26-420)||(25388773-25389189)
chr3 (26-331)||(30005805-30006124)
chr3 (36-331)||(42990268-42990578)
chr3 (26-372)||(1313333-1313692)
chr3 (15-372)||(10191274-10191647)
chr3 (15-372)||(458203-458580)
chr3 (15-372)||(746674-747053)
chr3 (36-371)||(1626666-1627016)
chr3 (36-372)||(27101164-27101519)
chr3 (26-372)||(53917638-53917998)
chr3 (26-371)||(43423437-43423796)
chr3 (15-372)||(455826-456203)
chr3 (15-291)||(1321483-1321774)
chr3 (36-371)||(3314608-3314959)
chr3 (121-365)||(6561740-6561985)
chr3 (36-399)||(32264021-32264404)
chr3 (27-372)||(9604582-9604946)
chr3 (26-370)||(43421389-43421747)
chr3 (26-399)||(24979603-24979991)
chr3 (36-371)||(28101985-28102335)
chr3 (26-372)||(12267949-12268300)
chr3 (26-372)||(53915470-53915830)
chr3 (15-331)||(10621491-10621823)
chr3 (26-371)||(880425-880785)
chr3 (26-399)||(18162560-18162946)
chr3 (36-372)||(51943294-51943644)
chr3 (26-371)||(36011751-36012110)
chr3 (121-372)||(35918025-35918283)
chr3 (44-371)||(5926755-5927097)
chr3 (36-399)||(48361654-48362031)
chr3 (128-399)||(15780756-15781039)
chr3 (121-331)||(29956650-29956861)
chr3 (15-305)||(28412992-28413299)
chr3 (36-371)||(53468436-53468788)
chr3 (121-372)||(39715393-39715644)
chr3 (32-273)||(7606567-7606822)
chr3 (141-371)||(28100143-28100374)
chr3 (121-371)||(47148977-47149233)
chr3 (36-331)||(47148878-47149188)
chr3 (227-399)||(11163046-11163218)
chr3 (26-370)||(51674740-51675087)
chr3 (121-372)||(28761511-28761762)
chr3 (136-371)||(28180948-28181182)
chr3 (26-399)||(32218991-32219368)
chr3 (36-372)||(42992205-42992544)
chr3 (59-371)||(889779-890104)
chr3 (36-372)||(23633383-23633727)
chr3 (121-371)||(54691656-54691906)
chr3 (36-244)||(25688143-25688367)
chr3 (425-559)||(25388657-25388791)
chr3 (36-234)||(5886261-5886472)
chr3 (425-559)||(5899519-5899653)
chr3 (36-234)||(5899734-5899945)
chr3 (425-559)||(53896560-53896694)
chr3 (134-371)||(31151271-31151507)
chr3 (15-225)||(11168172-11168396)
chr3 (55-371)||(53591119-53591438)
chr3 (121-370)||(23636952-23637198)
chr3 (425-559)||(5886044-5886178)
chr3 (425-559)||(6063812-6063946)
chr3 (36-282)||(6484372-6484634)
chr3 (148-371)||(28137415-28137628)
chr3 (121-372)||(13420268-13420506)
chr3 (241-371)||(47701798-47701928)
chr3 (121-371)||(54884081-54884329)
chr3 (26-332)||(4666488-4666797)
chr3 (204-330)||(41849117-41849244)
chr3 (241-370)||(27635830-27635959)
chr3 (242-370)||(6231374-6231502)
chr3 (128-372)||(53597164-53597404)
chr3 (317-420)||(53896475-53896578)
chr3 (434-559)||(22114656-22114782)
chr3 (434-552)||(18099521-18099639)
chr3 (26-247)||(6231849-6232083)
chr3 (295-399)||(1321337-1321441)
chr3 (128-372)||(1673898-1674140)
chr3 (192-372)||(24177202-24177380)
chr3 (252-370)||(3306724-3306842)
chr3 (128-324)||(561866-562058)
chr3 (128-288)||(25635391-25635549)
chr3 (434-533)||(10956378-10956478)
chr3 (425-496)||(6066139-6066210)
chr3 (121-288)||(17795269-17795433)
chr3 (121-288)||(19103709-19103873)
chr3 (323-420)||(6719396-6719493)
chr3 (32-116)||(35919094-35919179)
chr3 (158-365)||(36871421-36871624)
chr3 (36-121)||(27635641-27635727)
chr3 (434-569)||(5191423-5191559)
chr3 (434-526)||(10958674-10958767)
chr3 (434-517)||(3859350-3859434)
chr3 (158-372)||(4560403-4560599)
chr3 (26-121)||(41849247-41849342)
chr3 (15-116)||(53894018-53894121)
chr3 (434-534)||(1321246-1321347)
chr3 (434-534)||(5522966-5523067)
chr3 (36-169)||(47701654-47701801)
chr3 (128-178)||(24181498-24181548)
chr3 (472-534)||(26720353-26720415)
chr3 (490-559)||(10192401-10192469)
chr3 (502-559)||(35777223-35777280)
chr3 (338-422)||(5899633-5899717)
chr3 (338-417)||(5886163-5886242)
chr3 (121-218)||(3306839-3306936)
chr3 (490-559)||(10085481-10085549)
chr3 (502-559)||(38889818-38889875)
chr3 (449-526)||(4308648-4308725)
chr3 (502-559)||(11162951-11163008)
chr3 (434-552)||(32264394-32264513)
chr3 (36-91)||(42992605-42992660)
chr3 (307-372)||(6484308-6484373)
chr3 (158-219)||(10094196-10094256)
chr3 (158-219)||(10201076-10201136)
chr3 (26-98)||(15781090-15781162)
chr3 (158-219)||(16462203-16462263)
chr3 (158-219)||(22626106-22626166)
chr3 (449-526)||(27101627-27101704)
chr3 (449-526)||(35918316-35918393)
chr3 (449-522)||(43228108-43228181)
chr3 (158-219)||(47883004-47883064)
chr3 (488-552)||(18097291-18097354)
chr3 (474-526)||(45882752-45882804)
chr3 (75-115)||(54188625-54188665)
chr3 (504-559)||(11170205-11170260)
chr3 (434-532)||(24177086-24177185)
chr3 (425-495)||(38889861-38889932)
chr3 (158-216)||(10897008-10897065)
chr3 (158-216)||(29914075-29914132)
chr3 (425-495)||(35777266-35777336)
chr3 (158-216)||(47878293-47878350)
chr3 (158-216)||(54193229-54193286)
chr3 (299-372)||(1618916-1618992)
chr3 (158-219)||(4535614-4535674)
chr3 (518-559)||(6066211-6066252)
chr3 (158-219)||(10100213-10100273)
chr3 (158-219)||(10208122-10208182)
chr3 (449-526)||(25690723-25690800)
chr3 (449-526)||(51727373-51727450)
chr3 (55-114)||(1736324-1736384)
chr3 (171-219)||(6303310-6303358)
chr3 (502-550)||(6719532-6719579)
chr3 (55-114)||(18552902-18552962)
chr3 (55-114)||(30709809-30709869)
chr3 (57-115)||(36871304-36871364)
chr3 (425-495)||(6719475-6719546)
chr3 (449-520)||(9604979-9605050)
chr3 (434-492)||(11162997-11163056)
chr3 (192-316)||(13419864-13419983)
chr3 (333-372)||(25690651-25690690)
chr3 (158-216)||(20031440-20031497)
chr3 (192-288)||(25633930-25634024)
chr3 (67-105)||(28181192-28181230)
chr3 (60-114)||(40844665-40844719)
chr3 (158-216)||(54188512-54188569)
chr3 (75-115)||(1620483-1620524)
chr3 (36-97)||(3306974-3307034)
chr3 (75-115)||(6303425-6303466)
chr3 (75-115)||(10094100-10094141)
chr3 (75-115)||(10100117-10100158)
chr3 (75-115)||(10200980-10201021)
chr3 (75-115)||(10208026-10208067)
chr3 (343-372)||(10621847-10621876)
chr3 (75-115)||(10897121-10897162)
chr3 (75-115)||(27544388-27544429)
chr3 (36-115)||(28761410-28761491)
chr3 (88-121)||(29956874-29956907)
chr3 (341-370)||(31021450-31021479)
chr3 (75-115)||(31151538-31151579)
chr3 (343-372)||(42990205-42990234)
chr3 (75-115)||(54193342-54193383)
chr3 (158-233)||(1620581-1620657)
chr3 (55-114)||(8370505-8370565)
chr3 (57-113)||(25929463-25929519)
chr3 (336-372)||(27101558-27101594)
chr3 (55-114)||(27974971-27975031)
chr3 (55-114)||(27986465-27986525)
chr3 (159-211)||(38002877-38002928)
chr3 (55-114)||(48438222-48438282)
chr3 (29-120)||(54691551-54691642)
[»] chr4 (169 HSPs)
chr4 (26-559)||(16931764-16932300)
chr4 (26-559)||(16934118-16934654)
chr4 (15-559)||(22782701-22783257)
chr4 (15-559)||(22780336-22780892)
chr4 (15-420)||(18847102-18847521)
chr4 (15-399)||(11434925-11435323)
chr4 (15-399)||(22044355-22044753)
chr4 (15-399)||(22046650-22047048)
chr4 (15-399)||(51015216-51015614)
chr4 (15-372)||(8631383-8631759)
chr4 (15-420)||(11008532-11008954)
chr4 (15-399)||(37089336-37089737)
chr4 (15-399)||(38409169-38409573)
chr4 (30-399)||(47274697-47275079)
chr4 (15-372)||(2484837-2485209)
chr4 (27-372)||(6764836-6765201)
chr4 (32-399)||(9148221-9148604)
chr4 (32-399)||(5198390-5198772)
chr4 (32-372)||(24348211-24348570)
chr4 (15-399)||(31849563-31849962)
chr4 (15-399)||(7941289-7941692)
chr4 (26-372)||(40637071-40637431)
chr4 (38-399)||(24888766-24889142)
chr4 (15-420)||(9176438-9176858)
chr4 (15-399)||(9174110-9174509)
chr4 (32-399)||(11006218-11006604)
chr4 (36-399)||(22802719-22803097)
chr4 (15-372)||(14633317-14633687)
chr4 (26-399)||(22800838-22801225)
chr4 (13-372)||(47868398-47868772)
chr4 (26-372)||(40091391-40091751)
chr4 (33-372)||(44599820-44600174)
chr4 (29-399)||(48486289-48486673)
chr4 (36-372)||(24878986-24879338)
chr4 (36-399)||(24880421-24880800)
chr4 (26-372)||(17662221-17662574)
chr4 (36-399)||(36919569-36919950)
chr4 (15-372)||(22132355-22132735)
chr4 (26-399)||(36921469-36921858)
chr4 (121-399)||(5637549-5637832)
chr4 (15-331)||(22134582-22134909)
chr4 (26-371)||(38928153-38928513)
chr4 (26-370)||(33415464-33415821)
chr4 (15-331)||(18709127-18709458)
chr4 (36-372)||(619433-619783)
chr4 (36-371)||(12395830-12396180)
chr4 (26-372)||(36378289-36378650)
chr4 (26-372)||(14787406-14787769)
chr4 (121-399)||(3824654-3824936)
chr4 (21-296)||(26085947-26086236)
chr4 (36-371)||(12400792-12401142)
chr4 (54-372)||(47210755-47211082)
chr4 (36-371)||(19095880-19096231)
chr4 (26-372)||(16453306-16453667)
chr4 (20-372)||(53405124-53405497)
chr4 (121-370)||(37313150-37313400)
chr4 (55-370)||(56030443-56030770)
chr4 (121-370)||(13543953-13544208)
chr4 (121-399)||(52942543-52942810)
chr4 (59-367)||(41997494-41997817)
chr4 (121-365)||(19322701-19322942)
chr4 (142-371)||(3937314-3937543)
chr4 (121-371)||(18409431-18409681)
chr4 (121-371)||(18537559-18537806)
chr4 (152-371)||(6132871-6133090)
chr4 (121-372)||(8756336-8756586)
chr4 (26-293)||(36380425-36380707)
chr4 (15-175)||(5635440-5635614)
chr4 (15-176)||(11437557-11437731)
chr4 (121-371)||(18534917-18535164)
chr4 (213-371)||(38270162-38270321)
chr4 (233-372)||(5100994-5101133)
chr4 (213-371)||(24446760-24446914)
chr4 (433-559)||(9176848-9176975)
chr4 (425-559)||(11006585-11006720)
chr4 (425-558)||(9174490-9174624)
chr4 (252-371)||(2891314-2891434)
chr4 (121-256)||(16455354-16455490)
chr4 (121-289)||(38890310-38890476)
chr4 (36-193)||(4215483-4215654)
chr4 (472-559)||(51015100-51015187)
chr4 (425-537)||(11008936-11009049)
chr4 (121-372)||(15032633-15032872)
chr4 (36-286)||(27499128-27499390)
chr4 (434-559)||(37089727-37089854)
chr4 (36-222)||(13547302-13547502)
chr4 (431-552)||(18846993-18847114)
chr4 (434-534)||(36919940-36920041)
chr4 (121-225)||(2891436-2891540)
chr4 (434-534)||(38409078-38409179)
chr4 (434-533)||(31849952-31850052)
chr4 (472-559)||(22044781-22044870)
chr4 (36-121)||(5101191-5101276)
chr4 (472-552)||(22803125-22803204)
chr4 (434-552)||(3824926-3825044)
chr4 (434-559)||(5637822-5637946)
chr4 (137-370)||(28453686-28453915)
chr4 (434-534)||(24888675-24888776)
chr4 (434-552)||(36921848-36921966)
chr4 (434-534)||(5198299-5198400)
chr4 (26-115)||(14789405-14789495)
chr4 (159-365)||(9863712-9863917)
chr4 (36-121)||(47563023-47563109)
chr4 (481-534)||(9148139-9148192)
chr4 (472-532)||(22047076-22047135)
chr4 (26-115)||(6133105-6133194)
chr4 (299-372)||(16186099-16186173)
chr4 (121-281)||(30136640-30136798)
chr4 (121-233)||(47150978-47151092)
chr4 (121-371)||(12102088-12102336)
chr4 (299-372)||(25357634-25357713)
chr4 (158-370)||(40999072-40999281)
chr4 (26-89)||(52942464-52942526)
chr4 (502-559)||(7941193-7941251)
chr4 (502-559)||(11434829-11434887)
chr4 (470-515)||(619837-619882)
chr4 (158-219)||(7050379-7050439)
chr4 (158-219)||(11853549-11853609)
chr4 (158-219)||(16185957-16186018)
chr4 (449-526)||(16689303-16689380)
chr4 (450-522)||(4556422-4556494)
chr4 (300-372)||(16455284-16455356)
chr4 (75-115)||(31300540-31300580)
chr4 (45-115)||(16455510-16455581)
chr4 (55-114)||(31985663-31985722)
chr4 (434-552)||(48486181-48486299)
chr4 (55-102)||(54867192-54867239)
chr4 (158-216)||(4556181-4556238)
chr4 (158-216)||(4558314-4558371)
chr4 (158-216)||(8529270-8529327)
chr4 (158-315)||(9022362-9022515)
chr4 (158-216)||(15316961-15317018)
chr4 (158-216)||(16689062-16689119)
chr4 (158-216)||(18586969-18587026)
chr4 (158-216)||(31300427-31300484)
chr4 (158-219)||(5336904-5336964)
chr4 (449-526)||(47868288-47868365)
chr4 (158-219)||(55822265-55822325)
chr4 (55-114)||(10047387-10047447)
chr4 (434-553)||(24880312-24880431)
chr4 (36-115)||(37313050-37313130)
chr4 (55-114)||(39246002-39246062)
chr4 (75-115)||(55822380-55822420)
chr4 (36-98)||(2891577-2891640)
chr4 (449-520)||(8631792-8631863)
chr4 (44-95)||(49088860-49088911)
chr4 (36-86)||(3937259-3937309)
chr4 (158-216)||(15831144-15831201)
chr4 (342-372)||(22134936-22134966)
chr4 (502-552)||(22801262-22801311)
chr4 (158-216)||(25699752-25699809)
chr4 (472-514)||(52942839-52942881)
chr4 (128-169)||(5101130-5101171)
chr4 (75-115)||(11853664-11853705)
chr4 (75-116)||(16489464-16489505)
chr4 (75-115)||(18587082-18587123)
chr4 (36-115)||(19322962-19323043)
chr4 (158-234)||(31983650-31983727)
chr4 (478-523)||(40091813-40091858)
chr4 (240-315)||(54906631-54906702)
chr4 (55-114)||(5269220-5269280)
chr4 (55-114)||(5396700-5396760)
chr4 (55-114)||(6743444-6743504)
chr4 (477-525)||(8529012-8529060)
chr4 (75-115)||(15317074-15317114)
chr4 (26-74)||(24446630-24446677)
chr4 (55-114)||(36315258-36315318)
chr4 (55-114)||(36329467-36329527)
chr4 (343-371)||(52043737-52043765)
[»] chr7 (140 HSPs)
chr7 (15-559)||(1046888-1047443)
chr7 (15-399)||(40836707-40837105)
chr7 (20-399)||(1049264-1049658)
chr7 (15-372)||(38393935-38394311)
chr7 (15-399)||(35555-35954)
chr7 (13-384)||(25542472-25542855)
chr7 (13-369)||(7469984-7470359)
chr7 (15-372)||(48457602-48457978)
chr7 (13-369)||(7471942-7472317)
chr7 (15-399)||(3878497-3878902)
chr7 (328-569)||(22136928-22137169)
chr7 (328-569)||(40551955-40552196)
chr7 (328-569)||(9027396-9027637)
chr7 (328-569)||(22107917-22108158)
chr7 (328-569)||(40549677-40549918)
chr7 (15-372)||(44517-44889)
chr7 (36-371)||(44724533-44724883)
chr7 (15-372)||(3035670-3036049)
chr7 (45-399)||(27306224-27306592)
chr7 (15-372)||(40946277-40946653)
chr7 (15-372)||(20299407-20299785)
chr7 (15-372)||(18345490-18345866)
chr7 (36-369)||(20625990-20626342)
chr7 (36-369)||(20629881-20630233)
chr7 (36-369)||(20642300-20642652)
chr7 (20-331)||(1849975-1850301)
chr7 (32-372)||(31155892-31156247)
chr7 (26-372)||(31435022-31435383)
chr7 (26-371)||(20137085-20137444)
chr7 (36-372)||(13099459-13099812)
chr7 (15-372)||(20297311-20297687)
chr7 (15-372)||(7351615-7351994)
chr7 (329-569)||(2935120-2935349)
chr7 (36-370)||(37412110-37412462)
chr7 (121-371)||(21679981-21680232)
chr7 (15-372)||(43253481-43253860)
chr7 (36-371)||(11355212-11355562)
chr7 (20-372)||(28487502-28487873)
chr7 (36-372)||(42330982-42331335)
chr7 (36-372)||(443548-443900)
chr7 (20-372)||(28485515-28485885)
chr7 (65-372)||(7349287-7349615)
chr7 (36-371)||(24748548-24748899)
chr7 (133-399)||(26804499-26804765)
chr7 (26-371)||(4295910-4296271)
chr7 (121-372)||(11757177-11757435)
chr7 (36-370)||(21990106-21990454)
chr7 (121-371)||(25276095-25276346)
chr7 (128-371)||(21678020-21678264)
chr7 (26-338)||(21592119-21592445)
chr7 (38-370)||(9679009-9679361)
chr7 (36-371)||(9680768-9681124)
chr7 (121-371)||(39146071-39146322)
chr7 (15-255)||(7092177-7092431)
chr7 (15-247)||(38396713-38396959)
chr7 (120-371)||(27832716-27832969)
chr7 (128-372)||(22251641-22251878)
chr7 (26-371)||(42223110-42223471)
chr7 (121-365)||(24258423-24258668)
chr7 (121-372)||(22828717-22828969)
chr7 (208-372)||(18567566-18567731)
chr7 (15-255)||(7094424-7094678)
chr7 (128-372)||(7188496-7188737)
chr7 (121-369)||(24817438-24817682)
chr7 (121-372)||(20091629-20091877)
chr7 (181-372)||(22392426-22392606)
chr7 (33-220)||(2935374-2935575)
chr7 (13-220)||(22137184-22137404)
chr7 (13-220)||(40552211-40552431)
chr7 (131-296)||(24813593-24813755)
chr7 (13-220)||(22108173-22108393)
chr7 (13-220)||(40549933-40550153)
chr7 (128-370)||(24465503-24465735)
chr7 (33-220)||(1606486-1606686)
chr7 (33-220)||(9027176-9027376)
chr7 (276-369)||(7094662-7094759)
chr7 (276-369)||(7092414-7092512)
chr7 (472-552)||(25542348-25542427)
chr7 (434-552)||(27306582-27306700)
chr7 (435-532)||(44401-44499)
chr7 (472-534)||(3878407-3878469)
chr7 (271-325)||(38396316-38396370)
chr7 (434-534)||(35464-35565)
chr7 (15-102)||(11759364-11759452)
chr7 (323-372)||(1606423-1606472)
chr7 (502-559)||(40837144-40837201)
chr7 (36-172)||(22393876-22394027)
chr7 (181-315)||(11081522-11081651)
chr7 (121-175)||(6348933-6348987)
chr7 (121-175)||(26295598-26295652)
chr7 (55-114)||(55956-56015)
chr7 (303-370)||(3677235-3677301)
chr7 (158-315)||(6048885-6049038)
chr7 (26-88)||(26804762-26804823)
chr7 (158-219)||(2120899-2120959)
chr7 (158-219)||(3320172-3320232)
chr7 (158-219)||(3324920-3324980)
chr7 (158-219)||(7069780-7069840)
chr7 (158-219)||(7074787-7074847)
chr7 (157-233)||(16297145-16297222)
chr7 (158-219)||(25351353-25351413)
chr7 (158-219)||(25357047-25357107)
chr7 (158-219)||(25405393-25405453)
chr7 (158-219)||(25410130-25410190)
chr7 (449-526)||(40946167-40946244)
chr7 (158-219)||(42006663-42006723)
chr7 (328-372)||(1849918-1849962)
chr7 (240-365)||(6348778-6348903)
chr7 (313-372)||(30906327-30906386)
chr7 (158-216)||(30246973-30247030)
chr7 (158-216)||(44512647-44512704)
chr7 (158-219)||(8378626-8378686)
chr7 (158-219)||(15541117-15541177)
chr7 (472-552)||(18567431-18567510)
chr7 (472-552)||(31435439-31435518)
chr7 (168-216)||(44143997-44144045)
chr7 (55-114)||(46516339-46516399)
chr7 (26-115)||(6067173-6067264)
chr7 (55-113)||(9190038-9190097)
chr7 (55-113)||(20284097-20284156)
chr7 (45-119)||(21678286-21678361)
chr7 (65-115)||(24258691-24258742)
chr7 (158-371)||(26210500-26210709)
chr7 (36-83)||(39145971-39146018)
chr7 (434-495)||(1049648-1049710)
chr7 (121-372)||(6332179-6332425)
chr7 (60-121)||(21680245-21680307)
chr7 (473-523)||(22392319-22392369)
chr7 (502-552)||(26804413-26804462)
chr7 (158-216)||(34546985-34547042)
chr7 (75-115)||(2121015-2121056)
chr7 (75-115)||(3320076-3320117)
chr7 (75-115)||(3324824-3324865)
chr7 (60-113)||(5817300-5817353)
chr7 (75-115)||(25405508-25405549)
chr7 (343-372)||(38396239-38396268)
chr7 (55-114)||(21983292-21983352)
chr7 (55-114)||(29159811-29159871)
chr7 (480-532)||(42006404-42006456)
chr7 (75-115)||(44143892-44143932)
[»] chr1 (139 HSPs)
chr1 (15-399)||(51749955-51750354)
chr1 (15-399)||(28840594-28840994)
chr1 (15-399)||(13761753-13762151)
chr1 (15-420)||(16226062-16226483)
chr1 (15-399)||(10399794-10400193)
chr1 (15-420)||(47179604-47180028)
chr1 (26-399)||(15823462-15823849)
chr1 (15-372)||(31735487-31735863)
chr1 (29-371)||(2617460-2617817)
chr1 (15-372)||(28842436-28842809)
chr1 (15-399)||(51752281-51752678)
chr1 (32-373)||(20302401-20302756)
chr1 (15-420)||(47177253-47177677)
chr1 (38-399)||(6822931-6823306)
chr1 (15-382)||(20291390-20291771)
chr1 (15-369)||(39932017-39932389)
chr1 (26-323)||(46431683-46431996)
chr1 (13-372)||(24325599-24325980)
chr1 (36-372)||(27336927-27337280)
chr1 (41-399)||(13214997-13215375)
chr1 (15-369)||(15294800-15295183)
chr1 (26-372)||(38925459-38925816)
chr1 (85-369)||(21948225-21948526)
chr1 (36-372)||(27339118-27339472)
chr1 (26-399)||(39462435-39462822)
chr1 (26-372)||(47906207-47906573)
chr1 (36-372)||(17324623-17324974)
chr1 (36-399)||(41646836-41647214)
chr1 (36-372)||(14097956-14098308)
chr1 (32-372)||(9463227-9463588)
chr1 (32-372)||(2510308-2510666)
chr1 (32-372)||(9459400-9459761)
chr1 (26-372)||(12302483-12302848)
chr1 (36-370)||(18307054-18307403)
chr1 (26-371)||(50076650-50077009)
chr1 (43-371)||(50307540-50307884)
chr1 (36-372)||(6995687-6996038)
chr1 (121-399)||(6823800-6824087)
chr1 (36-371)||(17186114-17186465)
chr1 (121-372)||(48665114-48665373)
chr1 (26-399)||(28207046-28207431)
chr1 (26-372)||(16428596-16428957)
chr1 (26-371)||(18839531-18839891)
chr1 (36-372)||(28998240-28998591)
chr1 (36-372)||(29003956-29004307)
chr1 (36-371)||(31489859-31490206)
chr1 (26-371)||(50078798-50079158)
chr1 (26-371)||(11457453-11457812)
chr1 (36-372)||(9241072-9241424)
chr1 (26-350)||(31424993-31425335)
chr1 (36-372)||(2949219-2949569)
chr1 (36-331)||(4131362-4131676)
chr1 (36-370)||(25251261-25251611)
chr1 (26-370)||(17318838-17319190)
chr1 (38-372)||(3579606-3579956)
chr1 (129-371)||(50248666-50248909)
chr1 (129-372)||(31422967-31423212)
chr1 (26-372)||(6756470-6756831)
chr1 (36-331)||(25127856-25128167)
chr1 (333-516)||(23783362-23783533)
chr1 (55-372)||(47451591-47451917)
chr1 (121-371)||(17324009-17324258)
chr1 (36-322)||(40133937-40134239)
chr1 (15-224)||(51757623-51757845)
chr1 (425-559)||(47179488-47179622)
chr1 (275-420)||(16231496-16231641)
chr1 (121-372)||(42922177-42922425)
chr1 (425-559)||(16225947-16226080)
chr1 (425-559)||(47177138-47177271)
chr1 (121-372)||(8347359-8347607)
chr1 (121-371)||(14183678-14183923)
chr1 (122-372)||(15669481-15669729)
chr1 (121-372)||(18800659-18800907)
chr1 (15-248)||(16231630-16231878)
chr1 (26-324)||(16432396-16432699)
chr1 (121-370)||(8349138-8349385)
chr1 (33-220)||(23785935-23786136)
chr1 (481-569)||(23783288-23783376)
chr1 (434-559)||(6823683-6823810)
chr1 (26-226)||(16429047-16429261)
chr1 (434-559)||(51752164-51752291)
chr1 (121-372)||(49495297-49495537)
chr1 (15-118)||(13358784-13358888)
chr1 (434-556)||(51749841-51749965)
chr1 (434-559)||(13761637-13761763)
chr1 (38-248)||(25248540-25248766)
chr1 (36-175)||(23816027-23816180)
chr1 (434-559)||(20302258-20302385)
chr1 (276-370)||(25248756-25248850)
chr1 (121-365)||(13125544-13125787)
chr1 (434-534)||(10400183-10400284)
chr1 (128-365)||(26520206-26520449)
chr1 (425-495)||(16231444-16231514)
chr1 (26-235)||(6115080-6115304)
chr1 (434-552)||(28840486-28840604)
chr1 (479-552)||(28842301-28842373)
chr1 (475-534)||(15823371-15823430)
chr1 (449-526)||(13449919-13449996)
chr1 (502-559)||(16231401-16231458)
chr1 (299-399)||(30790658-30790759)
chr1 (434-532)||(30790749-30790848)
chr1 (502-559)||(6822835-6822893)
chr1 (158-233)||(155788-155864)
chr1 (21-77)||(13447245-13447301)
chr1 (434-512)||(28207421-28207500)
chr1 (121-233)||(30738716-30738830)
chr1 (158-219)||(2232597-2232657)
chr1 (121-225)||(30790487-30790591)
chr1 (470-534)||(3580010-3580074)
chr1 (57-115)||(15916605-15916665)
chr1 (40-103)||(31422851-31422915)
chr1 (299-338)||(6115344-6115383)
chr1 (300-371)||(26613503-26613577)
chr1 (158-216)||(2401343-2401400)
chr1 (434-495)||(6822879-6822941)
chr1 (158-216)||(9526469-9526526)
chr1 (158-216)||(21353468-21353525)
chr1 (158-216)||(25134074-25134131)
chr1 (121-233)||(26613326-26613440)
chr1 (240-365)||(13127837-13127959)
chr1 (158-219)||(14997040-14997100)
chr1 (75-115)||(2393308-2393348)
chr1 (320-372)||(16431044-16431096)
chr1 (36-95)||(50248557-50248617)
chr1 (45-115)||(17324278-17324349)
chr1 (73-115)||(155921-155963)
chr1 (158-216)||(9521718-9521775)
chr1 (40-115)||(14183581-14183658)
chr1 (75-115)||(21353373-21353414)
chr1 (75-115)||(27916711-27916752)
chr1 (299-371)||(30738890-30738963)
chr1 (343-372)||(43104102-43104131)
chr1 (343-372)||(46432037-46432066)
chr1 (55-114)||(9476269-9476329)
chr1 (55-114)||(13598406-13598466)
chr1 (55-114)||(16124545-16124605)
chr1 (55-114)||(29651819-29651879)
chr1 (55-114)||(37069778-37069838)
chr1 (55-114)||(47703965-47704025)
[»] chr8 (105 HSPs)
chr8 (15-399)||(27829269-27829667)
chr8 (15-399)||(27826958-27827356)
chr8 (15-420)||(44720794-44721214)
chr8 (33-559)||(43081782-43082326)
chr8 (15-420)||(18810659-18811078)
chr8 (26-399)||(14807723-14808120)
chr8 (26-399)||(28251543-28251930)
chr8 (15-399)||(4423990-4424389)
chr8 (15-372)||(32339304-32339680)
chr8 (15-372)||(28283185-28283561)
chr8 (15-372)||(15809214-15809589)
chr8 (32-372)||(3874005-3874364)
chr8 (15-420)||(18812844-18813252)
chr8 (20-362)||(608735-609101)
chr8 (15-372)||(22684617-22685002)
chr8 (26-372)||(15072709-15073070)
chr8 (37-399)||(15067953-15068330)
chr8 (40-372)||(27911014-27911359)
chr8 (40-372)||(27957433-27957778)
chr8 (38-371)||(27106884-27107232)
chr8 (20-372)||(43530123-43530481)
chr8 (26-371)||(30480479-30480838)
chr8 (26-372)||(1225165-1225526)
chr8 (26-372)||(14419166-14419527)
chr8 (35-323)||(43079650-43079953)
chr8 (26-371)||(14477276-14477610)
chr8 (65-372)||(24873195-24873523)
chr8 (131-372)||(13858578-13858820)
chr8 (158-371)||(33541509-33541723)
chr8 (36-370)||(36865538-36865887)
chr8 (36-372)||(41384744-41385094)
chr8 (343-559)||(43079407-43079614)
chr8 (36-372)||(41382672-41383012)
chr8 (36-371)||(25952521-25952871)
chr8 (128-371)||(5372269-5372512)
chr8 (405-559)||(18812728-18812881)
chr8 (195-372)||(26775200-26775378)
chr8 (181-371)||(5622882-5623073)
chr8 (36-372)||(15185699-15186046)
chr8 (405-559)||(18810543-18810696)
chr8 (271-372)||(3886153-3886254)
chr8 (121-371)||(21482322-21482561)
chr8 (121-372)||(31162212-31162460)
chr8 (213-371)||(35872559-35872713)
chr8 (26-281)||(15956051-15956317)
chr8 (260-372)||(12517248-12517362)
chr8 (121-338)||(3005716-3005929)
chr8 (121-338)||(21480547-21480753)
chr8 (425-552)||(44720686-44720812)
chr8 (276-372)||(181536-181632)
chr8 (434-559)||(27826842-27826968)
chr8 (434-559)||(27829153-27829279)
chr8 (158-338)||(37214321-37214512)
chr8 (299-372)||(2468361-2468434)
chr8 (121-248)||(181622-181753)
chr8 (472-534)||(14807633-14807695)
chr8 (36-121)||(33541395-33541481)
chr8 (472-552)||(12517418-12517497)
chr8 (434-532)||(15067864-15067963)
chr8 (202-370)||(31035068-31035236)
chr8 (481-534)||(28251988-28252041)
chr8 (158-315)||(31573848-31574000)
chr8 (29-105)||(37214243-37214319)
chr8 (121-236)||(31035252-31035369)
chr8 (158-233)||(31578400-31578476)
chr8 (434-532)||(15072593-15072692)
chr8 (121-166)||(2468214-2468259)
chr8 (158-219)||(9021229-9021289)
chr8 (158-219)||(16752644-16752704)
chr8 (158-219)||(16757389-16757449)
chr8 (158-219)||(28327908-28327968)
chr8 (158-219)||(28895502-28895562)
chr8 (158-216)||(590797-590854)
chr8 (502-559)||(3886322-3886380)
chr8 (502-552)||(4423903-4423952)
chr8 (158-216)||(33032657-33032714)
chr8 (158-219)||(4812609-4812669)
chr8 (57-105)||(21482591-21482640)
chr8 (449-526)||(22685035-22685112)
chr8 (158-219)||(28332631-28332691)
chr8 (159-216)||(29554908-29554964)
chr8 (328-372)||(6375988-6376032)
chr8 (44-103)||(13858477-13858537)
chr8 (75-115)||(16752549-16752589)
chr8 (450-526)||(21033613-21033689)
chr8 (168-216)||(23179692-23179740)
chr8 (472-516)||(28251958-28252002)
chr8 (35-115)||(5372160-5372242)
chr8 (57-103)||(21480785-21480832)
chr8 (158-216)||(3276347-3276404)
chr8 (434-495)||(4423938-4424000)
chr8 (158-219)||(13985200-13985262)
chr8 (158-220)||(17847677-17847739)
chr8 (75-115)||(4812513-4812554)
chr8 (75-115)||(16757293-16757334)
chr8 (343-372)||(17847527-17847556)
chr8 (75-115)||(25684758-25684799)
chr8 (75-115)||(28890881-28890922)
chr8 (75-115)||(29554810-29554851)
chr8 (55-114)||(4696625-4696685)
chr8 (55-114)||(9765848-9765908)
chr8 (171-219)||(17799558-17799606)
chr8 (55-114)||(23799606-23799666)
chr8 (55-114)||(26403259-26403319)
chr8 (26-74)||(35872429-35872476)
[»] chr2 (114 HSPs)
chr2 (15-399)||(27104691-27105088)
chr2 (21-399)||(19504316-19504708)
chr2 (15-399)||(13910009-13910407)
chr2 (20-370)||(19501980-19502345)
chr2 (33-399)||(42064407-42064788)
chr2 (15-372)||(23452201-23452577)
chr2 (32-372)||(42452702-42453054)
chr2 (21-399)||(24162193-24162575)
chr2 (32-372)||(45279965-45280321)
chr2 (328-569)||(36559067-36559308)
chr2 (36-372)||(40032038-40032394)
chr2 (328-569)||(45332384-45332625)
chr2 (36-372)||(21520678-21521031)
chr2 (36-372)||(22287321-22287672)
chr2 (36-371)||(19007560-19007910)
chr2 (36-372)||(6258802-6259151)
chr2 (328-516)||(36561344-36561532)
chr2 (26-372)||(42923485-42923847)
chr2 (26-399)||(43623556-43623931)
chr2 (36-399)||(6264133-6264508)
chr2 (26-371)||(11739535-11739895)
chr2 (33-372)||(35215568-35215932)
chr2 (33-331)||(35217945-35218258)
chr2 (26-371)||(28196557-28196914)
chr2 (128-370)||(15539566-15539809)
chr2 (36-371)||(17849037-17849387)
chr2 (121-371)||(31732861-31733100)
chr2 (36-363)||(34979562-34979906)
chr2 (121-368)||(3022086-3022334)
chr2 (26-371)||(17848365-17848719)
chr2 (36-371)||(14837193-14837538)
chr2 (225-399)||(22407598-22407772)
chr2 (121-371)||(44289152-44289403)
chr2 (121-371)||(11578193-11578439)
chr2 (74-331)||(45239000-45239271)
chr2 (207-371)||(22163117-22163282)
chr2 (26-241)||(5375322-5375550)
chr2 (121-372)||(18800398-18800638)
chr2 (192-331)||(38020162-38020302)
chr2 (238-372)||(5377631-5377769)
chr2 (32-220)||(36558845-36559047)
chr2 (33-220)||(36561123-36561324)
chr2 (471-559)||(19502402-19502490)
chr2 (471-559)||(19504736-19504824)
chr2 (121-372)||(22874061-22874301)
chr2 (481-569)||(36561539-36561627)
chr2 (434-559)||(24162565-24162692)
chr2 (15-220)||(45332144-45332364)
chr2 (121-370)||(20146693-20146941)
chr2 (434-559)||(27104575-27104701)
chr2 (121-281)||(28459274-28459435)
chr2 (128-372)||(17897337-17897578)
chr2 (36-178)||(22407439-22407595)
chr2 (126-372)||(37963028-37963263)
chr2 (277-370)||(38020064-38020157)
chr2 (434-527)||(13910397-13910491)
chr2 (135-372)||(35107219-35107452)
chr2 (26-121)||(22162998-22163093)
chr2 (50-166)||(7462946-7463077)
chr2 (434-532)||(21521048-21521147)
chr2 (472-534)||(42064316-42064378)
chr2 (121-219)||(20589763-20589862)
chr2 (36-100)||(3022377-3022442)
chr2 (434-526)||(6259168-6259261)
chr2 (300-372)||(12342673-12342746)
chr2 (121-255)||(27136209-27136343)
chr2 (158-235)||(40699429-40699507)
chr2 (36-157)||(22707736-22707873)
chr2 (150-248)||(38414194-38414291)
chr2 (158-219)||(2736205-2736265)
chr2 (158-219)||(17462436-17462496)
chr2 (158-219)||(20054887-20054947)
chr2 (434-534)||(22407762-22407863)
chr2 (158-219)||(22712638-22712698)
chr2 (158-219)||(22717347-22717407)
chr2 (158-219)||(39686983-39687043)
chr2 (158-219)||(45567409-45567469)
chr2 (276-371)||(38414281-38414365)
chr2 (158-220)||(17921769-17921832)
chr2 (36-83)||(44289052-44289099)
chr2 (449-520)||(45280354-45280425)
chr2 (158-216)||(12781343-12781400)
chr2 (158-216)||(17932637-17932694)
chr2 (158-216)||(17943540-17943597)
chr2 (26-115)||(18800289-18800378)
chr2 (328-370)||(20147040-20147082)
chr2 (158-216)||(27517761-27517818)
chr2 (55-114)||(14699036-14699096)
chr2 (75-115)||(17921887-17921927)
chr2 (75-115)||(37170778-37170818)
chr2 (158-315)||(43139356-43139508)
chr2 (55-114)||(21629952-21630011)
chr2 (36-115)||(28459175-28459254)
chr2 (36-121)||(23871000-23871086)
chr2 (158-216)||(37170874-37170931)
chr2 (135-173)||(38020311-38020349)
chr2 (243-315)||(39287188-39287256)
chr2 (502-552)||(43623968-43624017)
chr2 (75-115)||(2736320-2736361)
chr2 (75-115)||(2741056-2741097)
chr2 (75-115)||(17462551-17462592)
chr2 (158-219)||(28458950-28459011)
chr2 (65-105)||(31732790-31732831)
chr2 (75-115)||(33670992-33671033)
chr2 (323-372)||(40699229-40699278)
chr2 (274-315)||(41304627-41304667)
chr2 (75-115)||(45679838-45679879)
chr2 (502-534)||(6264546-6264578)
chr2 (55-114)||(8390179-8390239)
chr2 (55-114)||(13569336-13569396)
chr2 (55-114)||(20522228-20522288)
chr2 (343-371)||(20589581-20589609)
chr2 (36-103)||(22874333-22874401)
chr2 (171-219)||(38190997-38191045)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (20-372)||(41452-41819)
scaffold0038 (449-526)||(41853-41930)
[»] chr6 (109 HSPs)
chr6 (20-372)||(28241290-28241657)
chr6 (15-397)||(14507140-14507536)
chr6 (15-372)||(1230213-1230585)
chr6 (26-399)||(11983005-11983392)
chr6 (15-364)||(14458731-14459093)
chr6 (15-552)||(4816195-4816738)
chr6 (323-569)||(29754983-29755229)
chr6 (15-414)||(20915321-20915736)
chr6 (15-372)||(30967176-30967551)
chr6 (15-372)||(12195478-12195851)
chr6 (338-569)||(33311004-33311235)
chr6 (15-366)||(19704531-19704905)
chr6 (338-569)||(33308735-33308966)
chr6 (327-559)||(26066319-26066551)
chr6 (15-372)||(2628850-2629226)
chr6 (15-372)||(30034567-30034943)
chr6 (36-399)||(9019877-9020255)
chr6 (327-559)||(26068590-26068822)
chr6 (36-331)||(26065005-26065310)
chr6 (36-331)||(26084974-26085279)
chr6 (26-371)||(3629841-3630199)
chr6 (36-371)||(13057173-13057524)
chr6 (38-399)||(30728811-30729191)
chr6 (143-399)||(19227514-19227771)
chr6 (36-372)||(15541125-15541476)
chr6 (40-372)||(3390357-3390705)
chr6 (43-372)||(15532674-15533017)
chr6 (38-369)||(3631926-3632271)
chr6 (121-371)||(25477253-25477504)
chr6 (36-399)||(32279948-32280326)
chr6 (36-371)||(13039733-13040084)
chr6 (33-372)||(26932543-26932906)
chr6 (121-372)||(15530207-15530458)
chr6 (129-371)||(3233822-3234065)
chr6 (226-399)||(1072067-1072240)
chr6 (121-371)||(22490618-22490870)
chr6 (121-371)||(24338531-24338783)
chr6 (121-371)||(12161641-12161889)
chr6 (55-251)||(5273220-5273431)
chr6 (121-372)||(3027938-3028186)
chr6 (225-371)||(32447504-32447651)
chr6 (251-399)||(8995430-8995578)
chr6 (242-372)||(17852520-17852650)
chr6 (33-220)||(26066106-26066307)
chr6 (121-338)||(15719666-15719872)
chr6 (33-220)||(26068377-26068578)
chr6 (225-364)||(13870611-13870749)
chr6 (33-220)||(29754691-29754892)
chr6 (33-220)||(33308988-33309188)
chr6 (33-220)||(33311257-33311457)
chr6 (121-315)||(16455510-16455701)
chr6 (26-225)||(1069694-1069907)
chr6 (121-371)||(14466312-14466553)
chr6 (121-365)||(17012029-17012270)
chr6 (470-559)||(19227799-19227888)
chr6 (57-255)||(15367129-15367340)
chr6 (474-552)||(8995323-8995400)
chr6 (474-552)||(9019770-9019847)
chr6 (434-527)||(11983382-11983476)
chr6 (474-559)||(14507569-14507656)
chr6 (206-372)||(15346369-15346524)
chr6 (121-371)||(19696420-19696670)
chr6 (259-371)||(10584105-10584212)
chr6 (36-234)||(12186056-12186271)
chr6 (449-526)||(26084818-26084895)
chr6 (36-115)||(10584245-10584325)
chr6 (121-225)||(26945269-26945374)
chr6 (434-534)||(30729181-30729282)
chr6 (299-372)||(12186330-12186405)
chr6 (57-122)||(15346589-15346655)
chr6 (472-534)||(15530514-15530576)
chr6 (158-219)||(13878727-13878787)
chr6 (158-219)||(13883475-13883535)
chr6 (158-219)||(16785919-16785979)
chr6 (158-219)||(26887346-26887406)
chr6 (158-219)||(31248836-31248896)
chr6 (158-219)||(35201448-35201508)
chr6 (36-103)||(25477543-25477611)
chr6 (76-115)||(12937219-12937258)
chr6 (158-219)||(3577637-3577696)
chr6 (158-216)||(17036058-17036115)
chr6 (158-216)||(17694973-17695030)
chr6 (158-211)||(12166268-12166320)
chr6 (449-526)||(22352216-22352293)
chr6 (449-526)||(28241691-28241768)
chr6 (75-115)||(3577515-3577555)
chr6 (75-115)||(13467492-13467532)
chr6 (328-372)||(18318004-18318048)
chr6 (36-83)||(14466606-14466653)
chr6 (55-114)||(22963708-22963767)
chr6 (55-114)||(23824626-23824685)
chr6 (122-176)||(15346522-15346576)
chr6 (158-216)||(22351974-22352031)
chr6 (65-115)||(24338462-24338511)
chr6 (158-211)||(25941652-25941703)
chr6 (36-115)||(3233710-3233795)
chr6 (75-115)||(13878842-13878883)
chr6 (75-115)||(13883590-13883631)
chr6 (75-115)||(16786034-16786075)
chr6 (159-216)||(19701985-19702041)
chr6 (57-113)||(24436001-24436058)
chr6 (75-115)||(35201352-35201393)
chr6 (55-114)||(5572270-5572330)
chr6 (55-114)||(5757507-5757567)
chr6 (55-114)||(10077194-10077254)
chr6 (76-115)||(12911471-12911511)
chr6 (240-310)||(17904566-17904632)
chr6 (55-114)||(21356044-21356104)
chr6 (75-115)||(26887252-26887291)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (15-399)||(69256-69658)
scaffold0025 (225-372)||(73212-73363)
scaffold0025 (472-534)||(69686-69748)
scaffold0025 (213-259)||(73163-73210)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (15-399)||(2805-3203)
scaffold0250 (434-552)||(2697-2815)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (33-420)||(6103-6505)
scaffold0472 (431-569)||(5977-6115)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (30-399)||(3922-4304)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (328-569)||(21965-22206)
scaffold0140 (328-569)||(24240-24481)
scaffold0140 (13-220)||(22221-22441)
scaffold0140 (13-220)||(24496-24716)
scaffold0140 (55-114)||(8448-8508)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (15-372)||(183605-183975)
scaffold0005 (26-372)||(51961-52324)
scaffold0005 (26-115)||(50235-50325)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (26-369)||(79140-79497)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (15-399)||(29086-29494)
scaffold0068 (431-528)||(29001-29099)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (26-372)||(11449-11809)
[»] scaffold0131 (4 HSPs)
scaffold0131 (45-359)||(14376-14707)
scaffold0131 (121-399)||(14944-15223)
scaffold0131 (434-534)||(14853-14954)
scaffold0131 (60-121)||(15236-15298)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (32-331)||(34-348)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (26-257)||(1428-1673)
[»] scaffold0511 (2 HSPs)
scaffold0511 (121-372)||(1988-2245)
scaffold0511 (85-121)||(2258-2294)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (145-371)||(35593-35819)
scaffold0011 (26-115)||(35817-35906)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (40-371)||(79812-80158)
scaffold0004 (158-219)||(188364-188424)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (121-371)||(85184-85434)
scaffold0045 (26-115)||(85454-85543)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (433-559)||(12868-12994)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (121-372)||(15906-16154)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (121-370)||(16735-16981)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (258-372)||(1053-1167)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (121-362)||(1727-1958)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (121-365)||(4773-5014)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (15-85)||(1415-1485)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (33-104)||(4661-4733)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (158-219)||(224819-224879)
scaffold0006 (55-114)||(5691-5751)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (158-216)||(16328-16385)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (75-115)||(3095-3136)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (75-115)||(17011-17052)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 141)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 559
Target Start/End: Original strand, 31179337 - 31179894
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31179337 gagaagaacacaaagaagagaagaacacagaa--atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 31179434  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  31179435 tatgatgagtttcgttacaaagagaaatgaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 31179534  T
Q  202 tc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179535 tccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 31179634  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31179635 ttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgc 31179734  T
Q  400 ctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcga 499  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31179735 tttaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttacccgccagcgcaccatcgtgccacgatgaga 31179834  T
Q  500 ccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31179835 ccccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 31179894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 35 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 31543029 - 31542502
Alignment:
Q  35 aagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------ 121  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||                
T  31543029 aagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaa 31542930  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttc 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  31542929 agagaaatcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 31542831  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542830 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31542731  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  31542730 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaatct 31542631  T
Q  420 gtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattt 518  Q
    ||||            ||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31542630 gtaa------------caaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttatccgccagcgcaccatcgtgtctcgatgagaccccatcgtgccacgattt 31542543  T
Q  519 ttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31542542 ttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 31542502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 25921437 - 25921836
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  25921437 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccacta 25921536  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25921537 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 25921636  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25921637 ctcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 25921736  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  25921737 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 25921836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 32 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38882403 - 38882021
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  38882403 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 38882304  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38882303 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 38882204  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882203 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 38882104  T
Q  318 gc-cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  38882103 gcccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 38882021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4236945 - 4236545
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccac 111  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4236945 gtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccac 4236847  T
Q  112 tatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    ||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4236846 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 4236747  T
Q  199 gagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc 297  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236746 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 4236647  T
Q  298 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatct 397  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||    
T  4236646 ctttctaaactcttgtttcagccccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatct 4236547  T
Q  398 gc 399  Q
    ||    
T  4236546 gc 4236545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 33 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31545377 - 31544975
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  31545377 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttac 31545278  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  31545277 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtt 31545178  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545177 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 31545078  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaat 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  31545077 gccccctttatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaataaat 31544978  T
Q  418 ctg 420  Q
    |||    
T  31544977 ctg 31544975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 32 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2175216 - 2174863
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |             
T  2175216 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgataagtaacgtta 2175117  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  2175116 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 2175017  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175016 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 2174917  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  2174916 gccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctgtatttatagtaaaag 2174863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 331 - 569
Target Start/End: Original strand, 15354777 - 15355015
Alignment:
Q  331 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaac 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15354777 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaac 15354876  T
Q  431 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354877 tgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 15354976  T
Q  531 gcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354977 gcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 15355015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 331 - 569
Target Start/End: Original strand, 15357053 - 15357291
Alignment:
Q  331 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaac 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15357053 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaac 15357152  T
Q  431 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357153 tgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 15357252  T
Q  531 gcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357253 gcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 15357291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 10529062 - 10529435
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaa-gaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  10529062 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcact 10529161  T
Q  113 atatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagag 199  Q
    |||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  10529162 atatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagag 10529261  T
Q  200 agtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10529262 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcc 10529361  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10529362 tttctaaacccttgtttcaacccactctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 10529435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 36 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16776451 - 16776075
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |                 
T  16776451 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaa 16776352  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16776351 agagaaatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 16776253  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16776252 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttcagcc 16776153  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctata-tttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatct 397  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||    
T  16776152 ccctctatctcaaagtttgctcagatacaaggtctatattttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatct 16776075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 334 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 10757245 - 10757010
Alignment:
Q  334 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10757245 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatttgtaacaaaaactgt 10757146  T
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 533  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757145 aacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcc 10757046  T
Q  534 taaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757045 caaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 10757010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39854777 - 39854427
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  39854777 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaa 39854678  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  39854677 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcc 39854578  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39854577 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-c 39854479  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39854478 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 39854427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21948320 - 21947943
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  21948320 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 21948221  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21948220 agagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 21948121  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21948120 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag-c 21948022  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  21948021 ccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 21947943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18466999 - 18466625
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||    
T  18466999 gagaagaacacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccatta 18466900  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18466899 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagaga 18466800  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18466799 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcct 18466700  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466699 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 18466625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23665125 - 23664884
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23665125 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 23665026  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23665025 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgc 23664926  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23664925 ctttcccaaaaaaataaaaactccatcgtgccgcgaagccca 23664884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Original strand, 23793462 - 23793703
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23793462 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 23793561  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23793562 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgc 23793661  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23793662 ctttcccaaaaaaataaaaactccatcgtgccgcgaagccca 23793703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 21684416 - 21684824
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21684416 gagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 21684515  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||     
T  21684516 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagac 21684615  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaagt-gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684616 tcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 21684715  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataa 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  21684716 tttaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttgtaa 21684815  T
Q  391 caaatctgc 399  Q
    |||||||||    
T  21684816 caaatctgc 21684824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18469324 - 18468950
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||     
T  18469324 gagaagaacacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctggg-agagagcagctcttcgttccactag 18469226  T
Q  115 atgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    |||||||             |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18469225 atgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 18469126  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469125 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 18469026  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469025 tctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttatcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18468950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25804339 - 25804009
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25804339 gagaagaacacaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgttccactat 25804240  T
Q  115 atgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||     
T  25804239 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagac 25804140  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25804139 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccat 25804040  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25804039 tctaaacccttgtttgagccccctctatctc 25804009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23667400 - 23667159
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23667400 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagttaaagtcatgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 23667301  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23667300 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgc 23667201  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23667200 ctttcccaaaaaaataaaaactccatcgtgccgcgaagccca 23667159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27912851 - 27912473
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||    
T  27912851 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccacta 27912752  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  27912751 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagaga 27912652  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912651 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 27912552  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912551 ttctaaacccttgtttcagcaccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27912473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 2818311 - 2818699
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||       
T  2818311 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactatatgatgagta 2818409  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||    
T  2818410 acgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaa 2818509  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaa-cccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
     ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2818510 tagtgttttccaaggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttacctttctaaaccc 2818609  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  2818610 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 2818699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 34477017 - 34477349
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34477017 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 34477116  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  34477117 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 34477216  T
Q  201 gt-caatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477217 ctccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 34477316  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477317 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34477349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 34479382 - 34479714
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34479382 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 34479481  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  34479482 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagaga 34479581  T
Q  201 gt-caatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479582 ctccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 34479681  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479682 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34479714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6747608 - 6747247
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  6747608 aaagaagaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactatatgacgagta 6747509  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 212  Q
             | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  6747508 acgttacaaaaagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 6747409  T
Q  213 agtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6747408 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaaccctt 6747310  T
Q  312 gtttcagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6747309 gtttcagccccctctatctctttctctttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 6747247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27910748 - 27910388
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||             
T  27910748 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgtta 27910649  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27910648 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 27910549  T
Q  218 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27910548 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaa-ccttgtttc 27910450  T
Q  317 agcccc------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||      |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910449 agcccccgctatctctctctcaaagtttaacctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27910388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 18511188 - 18511547
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||       
T  18511188 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagta 18511286  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18511287 actttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 18511386  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18511387 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccct 18511486  T
Q  311 tgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18511487 tgtttcagccccctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatattaaa 18511547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6745362 - 6745053
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  6745362 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 6745263  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6745262 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 6745163  T
Q  222 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6745162 caaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagcc 6745064  T
Q  321 ccctctatctc 331  Q
    |||| ||||||    
T  6745063 ccctttatctc 6745053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26098025 - 26097676
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||                 
T  26098025 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 26097927  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  26097926 agagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgtttcc 26097827  T
Q  222 caagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
     | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  26097826 aaggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgccattctaaacctttatttcagccc 26097727  T
Q  322 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26097726 cctctatctcaaagtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 26097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40221813 - 40221465
Alignment:
Q  40 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------aga 124  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||             |||    
T  40221813 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 40221714  T
Q  125 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  40221713 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 40221614  T
Q  225 g-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 323  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40221613 ggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccc 40221514  T
Q  324 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||| |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  40221513 tctatctcaaggtttactctgagtcaatgtctatatttatagtaaaagt 40221465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 1189592 - 1189949
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg--gagagagcagccctccgatccactata-tgatga----------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||               
T  1189592 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttaca 1189691  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
      ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  1189692 aaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 1189791  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1189792 cccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcag 1189891  T
Q  319 ccccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||    |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189892 ccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 1189949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 10474308 - 10474655
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||                 
T  10474308 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaa 10474407  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10474408 agagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcc 10474507  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10474508 caaggtgtatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcc 10474607  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 368  Q
    |||||||| |||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10474608 ccctctatttcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaa 10474655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15552561 - 15552229
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15552561 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 15552462  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  15552461 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagaga 15552362  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15552361 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgct 15552262  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15552261 tttctaaacccttgtttcagtcccctctatctc 15552229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 18509294 - 18509652
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||       
T  18509294 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagta 18509392  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18509393 actttacaaaatagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 18509492  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18509493 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccct 18509592  T
Q  311 tgtttcagcccc-ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18509593 tgtttcagcccctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 18509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18596950 - 18596590
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||      
T  18596950 aaagaagagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagt 18596851  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18596850 aactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 18596751  T
Q  211 acagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  18596750 acagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctt--tataccc 18596653  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18596652 ttgtttcagccccctctatcccaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 18596590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25904397 - 25904047
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||| |                 
T  25904397 agaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaat 25904298  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25904297 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 25904198  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25904197 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcc 25904098  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25904097 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 25904047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17073172 - 17072827
Alignment:
Q  42 caaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------agaga 126  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||             |||||    
T  17073172 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 17073073  T
Q  127 aatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag- 225  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  17073072 tatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagg 17072973  T
Q  226 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17072972 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctc 17072873  T
Q  326 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17072872 tatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 17072827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24127150 - 24126800
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  24127150 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 24127051  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24127050 agagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcc 24126951  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| | |||||| |  ||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24126950 caaggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcc 24126851  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || |||||||||| |||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24126850 ccatctatctcaaggtttacactgatataatgtctatatttatagtaaaag 24126800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6756674 - 6756437
Alignment:
Q  136 gttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagt-gaatcaac 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  6756674 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaac 6756575  T
Q  235 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaa 334  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6756574 cctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcagctccctctatctcaaa 6756475  T
Q  335 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6756474 gtttaatatgatacaagatctatattaatagtaaaagt 6756437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 371
Target Start/End: Original strand, 31472589 - 31472948
Alignment:
Q  27 aagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga--- 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||       
T  31472589 aagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagta 31472687  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||||||| ||||| | |  ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  31472688 actttacaaaagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 31472787  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472788 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 31472887  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31472888 tgttttagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 31472948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2954719 - 2954368
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||       
T  2954719 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactatatgatgagta 2954621  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 212  Q
             ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| |||||| ||||||||||     
T  2954620 actttacaaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaat 2954521  T
Q  213 agtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2954520 agtgttttccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgttgctgtctttctaaaccct 2954421  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttat 363  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||| | ||||||||||    
T  2954420 tgtttcatactcctctatctcaaagtttacactgatacaaagcctatatttat 2954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 410 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 10749714 - 10749555
Alignment:
Q  410 taacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749714 taacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtg 10749615  T
Q  510 ccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749614 ccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 10749555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 328 - 495
Target Start/End: Original strand, 38960334 - 38960501
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38960334 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 38960433  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38960434 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccaacgcaccatcgtgccacgat 38960501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Original strand, 658332 - 658610
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga---- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||        
T  658332 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagag--cagccatccgtttcactatatgatgagtaa 658428  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 212  Q
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||     
T  658429 cgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaat 658528  T
Q  213 agtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttg 293  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  658529 agtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Original strand, 16092175 - 16092495
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||      
T  16092175 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagt 16092273  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16092274 aaccttacaaaagagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 16092373  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092374 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaaccc 16092473  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  16092474 ttgtttcaaccccctctatctc 16092495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 36402304 - 36402664
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| | || | | |||||||||||||       
T  36402304 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactatatgatgagta 36402402  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36402403 acgttacaaaagagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaa 36402502  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||    
T  36402503 tagtattttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgtcattctaaaccct 36402602  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36402603 tgtttcagccccctctatctcaacgtttactctgatataaggtctatatttatagtaaaagt 36402664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 696172 - 695833
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgaa----------- 122  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||               
T  696172 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaa 696073  T
Q  123 --gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  696072 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 695973  T
Q  221 ccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  695972 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaag-----------atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatcc 695884  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||| |||||||| |||| |  | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  695883 ccctttatctcaaggtttacactcatacaatgtctatattcatagtaaaag 695833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 34530750 - 34531001
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34530750 aagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctaatagtgtttc 34530849  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34530850 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacacttgtttcagc 34530949  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  34530950 cccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttacagtaaaag 34531001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 39397978 - 39398327
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||| ||              |    
T  39397978 agaacacaaaagaatgttttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaa 39398077  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39398078 agagatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 39398177  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39398178 caaggtgaatcaaccctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 39398275  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| |   | ||||| || |||||||||||||||||    
T  39398276 cccctctatctcaaggtttacaccggtacaatgtttatatttatagtaaaag 39398327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Original strand, 17818477 - 17818817
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||||             |    
T  17818477 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggg-gagagaagccctctgttccactgtatgatgagtaactttacaaaa 17818575  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  17818576 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttccc 17818675  T
Q  223 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
    ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17818676 aaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcag-cc 17818774  T
Q  322 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 364  Q
    ||||| |||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  17818775 cctctttctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttata 17818817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 158 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20042994
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 356  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctatgatacaaagccta 20043009  T
Q  357 tatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||    
T  20043008 tatttatagtaaaag 20042994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 372
Target Start/End: Original strand, 12556016 - 12556259
Alignment:
Q  129 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tg 227  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||| | | |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12556016 tcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaactccaatc-tcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtg 12556114  T
Q  228 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 327  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12556115 aatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcagccccctcta 12556214  T
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12556215 tctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 12556259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 399
Target Start/End: Original strand, 31466070 - 31466341
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| |    
T  31466070 atcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttctcaaggt 31466168  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| | |    
T  31466169 gaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtcgttacttttttaaacctttgtttcagcccctttt 31466268  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  31466269 atctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtgtcgcttaaaatttggaacaaatctgc 31466341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 37705864 - 37706116
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  || |  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37705864 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 37705963  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  37705964 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatttgtcgttgcctttctaaacctttatttcagc 37706063  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37706064 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 37706116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20045168 - 20044954
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20045168 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 20045069  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 356  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  20045068 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctcaaggtttgctctgatacaaagccta 20044969  T
Q  357 tatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||    
T  20044968 tatttatagtaaaag 20044954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10587130 - 10586782
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg--agagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  10587130 gagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt 10587031  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  10587030 acaaagagaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgt 10586931  T
Q  218 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||           |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10586930 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagag-----------acaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 10586842  T
Q  316 cagcccc---ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||    ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586841 cagcccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10586782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4410326 - 4410090
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||       
T  4410326 aaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagta 4410227  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 212  Q
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  4410226 tcgttacaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 4410127  T
Q  213 agtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410126 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 559
Target Start/End: Original strand, 34477437 - 34477572
Alignment:
Q  424 caaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 523  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477437 caaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 34477536  T
Q  524 gtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34477537 gtgccttgcctaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 34477572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21289055 - 21288715
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgaagaga-----aat 129  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||  |       ||     
T  21289055 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaaa 21288956  T
Q  130 caatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagtgaa 229  Q
      ||| |||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| | | |||||    
T  21288955 agatgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttttcaaggtgaa 21288856  T
Q  230 tcaacccacaaacccta------gtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 323  Q
    ||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  21288855 tcaaccctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaacccttatttcaaccccc 21288756  T
Q  324 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 364  Q
    |||||||||| |||| || | || |||||||||||||||||    
T  21288755 tctatctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttata 21288715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 26098403 - 26098587
Alignment:
Q  189 gtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagtt 287  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  26098403 gtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtc 26098502  T
Q  288 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26098503 ttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 26098587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 328 - 524
Target Start/End: Original strand, 23742057 - 23742256
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgctt-aaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaa 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23742057 tctcaaagtttgctttgacacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgctttaaaacctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaa 23742156  T
Q  427 aaactgtaacaaatctgctccc-aaaaatacgttttatttttat-ccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  23742157 aatctgtaactaatctgctcccaaaaaatttgttttatttttatcccgccaagataccattgtgccacgatgtgatcctatcgtgccacgaattttccag 23742256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39798345 - 39798123
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  39798345 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatacgatgagtatcatta 39798246  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39798245 taaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 39798146  T
Q  218 ttcccaa-gtgaatcaacccaca 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  39798145 ttcccaaggtgaatcaacccaca 39798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Original strand, 20507665 - 20507798
Alignment:
Q  239 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagttt 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20507665 aaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagttt 20507764  T
Q  339 gctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20507765 actctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 20507798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 366
Target Start/End: Original strand, 6661270 - 6661512
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||   |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6661270 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 6661369  T
Q  221 cca-agtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||  |||||||||||  | ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  6661370 ccatggtgaatcaacc--ccaactctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaac 6661465  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 366  Q
    || ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6661466 cctctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagt 6661512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 20505828 - 20506041
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||             |    
T  20505828 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaa 20505926  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20505927 gagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 20506026  T
Q  223 aa-gtgaatcaaccc 236  Q
    || ||||||||||||    
T  20506027 aaggtgaatcaaccc 20506041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 38882031 - 38881905
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882031 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 38881932  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  38881931 ctcaaaaactaaaacctccatcgtgcc 38881905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10749996 - 10749796
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  10749996 agaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 10749898  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10749897 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 10749798  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  10749797 tc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 31544993 - 31544858
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 523  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31544993 aaaatctgtaataaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttatccgccagcgcaccatcgtgtctcgatgagaccccatcgtgccacgatttttcca 31544894  T
Q  524 gtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31544893 gtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 31544858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Original strand, 41585729 - 41585956
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  41585729 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaa 41585828  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| |||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  41585829 agagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcc 41585928  T
Q  222 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 248  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41585929 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23665360 - 23665140
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23665360 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatcca 23665262  T
Q  111 ctatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  23665261 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 23665163  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  23665162 gactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 23793227 - 23793447
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23793227 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatcca 23793325  T
Q  111 ctatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  23793326 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 23793424  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  23793425 gactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 3373119 - 3373320
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||              
T  3373119 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 3373218  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga-gtcaatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  3373219 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtt 3373318  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  3373319 tc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15354537 - 15354757
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15354537 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T
Q  111 ctatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| | ||||            |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15354636 ctatttaatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 15354734  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  15354735 gactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410000
Alignment:
Q  275 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 4410002  T
Q  371 gt 372  Q
    ||    
T  4410001 gt 4410000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10757472 - 10757273
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  10757472 agaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 10757374  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10757373 aaagaaaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 10757275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 38960114 - 38960314
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  38960114 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 38960213  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  38960214 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 38960312  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  38960313 tc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15356813 - 15357033
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15356813 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatcca 15356911  T
Q  111 ctatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| | ||||            |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15356912 ctatttaatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 15357010  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  15357011 gactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2724187 - 2723964
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||             |    
T  2724187 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaa 2724088  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||         |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  2724087 agagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattcta---------ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcc 2723997  T
Q  222 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 253  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2723996 caaggtgaatcatccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 23741821 - 23742020
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23741821 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatcca 23741919  T
Q  111 ctatatgatg------------aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| |||||            |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||    
T  23741920 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaaga 23742018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9020413 - 9020167
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||  ||||||| || ||||||| | |||||| ||| |||||||     
T  9020413 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgtttt 9020314  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 318  Q
    |||| |||||||||  |   |||||||||||||||| | |||||   || ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  9020313 ccaaggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgttgccaagag--caactctatacaaaccctacttttg-tgttgcc-tcccaaacccttgttttcag 9020220  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    | ||||||| | ||| |||| | | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9020219 ctccctctagcacaaggtttacatctgatacaaggtatgtatttatagtaaaa 9020167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 431 - 528
Target Start/End: Original strand, 21684811 - 21684909
Alignment:
Q  431 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 528  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684811 tgtaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 21684909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36208865 - 36208524
Alignment:
Q  41 acaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------agaga 126  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||             |||||    
T  36208865 acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggggaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagaga 36208766  T
Q  127 aatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||  | |||||||||||    
T  36208765 tatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaag 36208666  T
Q  226 -tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaat-tctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagcccc 322  Q
     |||||||||  |  |||||||||  || | ||    ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  36208665 gtgaatcaac--aacaaccctagt--ttctcccgcttagagaaatctctcta-aaaccctagttt-gttgtttg-tttctaaacccttgttttcagcccc 36208573  T
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208572 ctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 36208524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 495
Target Start/End: Original strand, 34479798 - 34479869
Alignment:
Q  424 caaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479798 caaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 34479869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 472 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4236517 - 4236438
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  4236517 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccattgtgccacgatttttccagtgccttgccttaa-aactgaaacctcca 4236438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20054020 - 20053834
Alignment:
Q  134 gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  |||       |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20054020 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctcca-----aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 20053926  T
Q  233 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 328  Q
    |||    |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20053925 acc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactctagtttttgtgttgcc-ttctaaacccttgtttcagcgccctctat 20053834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10749767 - 10749704
Alignment:
Q  335 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10749767 gtttgctttgatacaaggtctatatttatactaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctg 10749704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 502 - 569
Target Start/End: Original strand, 38960487 - 38960554
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38960487 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcaaagccca 38960554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 472 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16776044 - 16775982
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16776044 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttttcagtgctttgcct 16775982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Original strand, 34479855 - 34479912
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34479855 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 34479912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 372
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586042
Alignment:
Q  276 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaagt 41586042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770717
Alignment:
Q  148 agtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacccta 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||  |||||| | ||||| |||||   |||| ||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaatagt--ttcccatggtgaatgaacccc--aacctta 42770839  T
Q  247 gtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttga 345  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||  ||    
T  42770838 gtgtttgttgccaagag-caaattctatataaacc-taattttgt-gttgccttcc-aaacccttgttttcagtcccctctatctcaaggtttactc-ga 42770744  T
Q  346 tacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||    
T  42770743 tacaaagtttatatttatagtaaaagt 42770717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 2174797 - 2174740
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2174797 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 2174740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 372
Target Start/End: Original strand, 3373332 - 3373377
Alignment:
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373332 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3373377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4409967 - 4409890
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  4409967 aaaaatacgttttatttttatctgccatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaattgtggcacgatttttccagtg 4409890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Original strand, 17413251 - 17413441
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |   | |||||||||| |||||| ||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17413251 aagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17413350  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| ||||  || |||||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  17413351 cccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaa--ctctacaaaccatagttttagtgctgcc-ttctaaacccttgttt 17413441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Original strand, 25921874 - 25921932
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  25921874 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 25921932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 420
Target Start/End: Original strand, 34477379 - 34477456
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  34477379 tgatacaaggtctatttttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgctcaaaatctgtaacaaatctg 34477456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39854394 - 39854317
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||    
T  39854394 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtgccacgatgcgattcaaccgtgacacgatttttccagtg 39854317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 26098273 - 26098360
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  26098273 agaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccatatgatga 26098360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 534
Target Start/End: Original strand, 659850 - 659900
Alignment:
Q  484 tcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  659850 tcgtgccacaatgcgacctcatcgtgccacgatttttccagtgacttgcct 659900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 6756795 - 6756718
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6756795 aaagaagaga-gaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc 6756718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15143661 - 15143547
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15143661 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgctt 15143562  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaa 233  Q
    || || |||||||||    
T  15143561 ccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20043284 - 20043222
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagca 97  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20043284 agaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 39798058 - 39798004
Alignment:
Q  345 atacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39798058 atacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatctgc 39798004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42771005 - 42770951
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 175  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42771005 aagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 42770951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1170871 - 1170811
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1170871 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1240248 - 1240171
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  1240248 aaaaatacgttttatttttatcttcaattgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 1240171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6744971 - 6744894
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||  |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  6744971 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtagcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 6744894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6747214 - 6747137
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  6747214 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgacttttccagtg 6747137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 420
Target Start/End: Original strand, 34479740 - 34479817
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  34479740 tgatacaaggtctatttttatagtaaaggtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgctcaaaatctgtaacaaatctg 34479817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 35385574 - 35385634
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35385574 ctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 42238123 - 42238047
Alignment:
Q  450 aaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  42238123 aaaatacgtttttgttttatcctcaatcgcaccatcgtgccacgttgcgatttcatcgtggcacgatttttccagtg 42238047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 105
Target Start/End: Original strand, 12555908 - 12555978
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccg 105  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  12555908 agaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccg 12555978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25452555 - 25452498
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25452555 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 2298123 - 2298183
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2298123 ctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 10529468 - 10529545
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  10529468 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcatcatcgtggcacgattcgatctaatcgtggcacgatttttccagtg 10529545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25445556 - 25445504
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  25445556 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 25445504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Original strand, 31465965 - 31466041
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccct 102  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31465965 aaagaagaga-gaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagccct 31466041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 39797966 - 39797909
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  39797966 ccatcgtgccatgatttttccggtgccttgcctcaaaaactgaaacctccatcatgcc 39797909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23667590 - 23667526
Alignment:
Q  58 cccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23667590 cccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatga 23667526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4897923 - 4897828
Alignment:
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccc-gtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||    
T  4897923 agagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29748502 - 29748352
Alignment:
Q  162 ttctacccaaagtccc-agcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc-ccaagt-gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcca 258  Q
    |||||||||||||||| |  || |||| || ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  ||||||| ||   ||||||| |||||||| |     
T  29748502 ttctacccaaagtcccgaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatcct--aaccctactgtttgttgcc 29748405  T
Q  259 aagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  29748404 aagaga---attctctacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttt 29748352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2723961 - 2723911
Alignment:
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2723961 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 2723911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13295789 - 13295755
Alignment:
Q  267 aattctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13295789 aattctatacaaaccctagttttgttgttggcttt 13295755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28786464 - 28786407
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  28786464 ctaattctgcccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 28786407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1170967 - 1170926
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1170967 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 1170926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1240488 - 1240428
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| |||||||    
T  1240488 ctaattctacccaaa-tcccagcctcttcccgtgcctaagagactcaatcctaatagtgttt 1240428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Original strand, 2144899 - 2144928
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144899 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2144928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15552207 - 15552178
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552207 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15552178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22672991 - 22672950
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22672991 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 22672950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25445653 - 25445612
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25445653 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25445612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25803988 - 25803959
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803988 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25803959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 31782579 - 31782639
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31782579 ctaattctacccaat-tcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 35385477 - 35385518
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35385477 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 35385518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Original strand, 37705774 - 37705851
Alignment:
Q  45 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | || | |||||||||||||    
T  37705774 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactatatgatga 37705851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 659829 - 659797
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  659829 ccatcgtgccacgatttttccagtgacttgcct 659797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9353421 - 9353361
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9353421 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 15445291 - 15445331
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  15445291 tgacctagtctgggaagagagcagcccttcgttccactata 15445331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29748313 - 29748285
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748313 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 29748285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36932439 - 36932379
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36932439 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 203)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 50494276 - 50493736
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  50494276 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 50494177  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  50494176 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 50494077  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50494076 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 50493977  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaat 417  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  50493976 gccccctctatctctcagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaat 50493877  T
Q  418 ctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatt 517  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50493876 ttgtaac-aaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagactccatcgtgccacgatt 50493778  T
Q  518 tttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  50493777 tttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 50493736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5191946 - 5191549
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5191946 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagaacagccctctgatccactat 5191847  T
Q  115 atgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt 202  Q
    |||||||            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5191846 atgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagact 5191747  T
Q  203 caatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191746 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 5191647  T
Q  302 ctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  |||||||||||    
T  5191646 ctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgcttagatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgc 5191549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3859805 - 3859424
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||             
T  3859805 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactatatgatgagtattgtta 3859706  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3859705 caaagagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3859606  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859605 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 3859506  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  3859505 gccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgc 3859424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 4308255 - 4308615
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  4308255 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagta 4308353  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4308354 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 4308453  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308454 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 4308553  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4308554 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 4308615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 38210666 - 38210127
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagag-aagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  38210666 gagaagaacacaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccact 38210567  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  38210566 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaga 38210467  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38210466 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgct 38210367  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc---aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||  | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  38210366 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaaatagc-ctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaat 38210268  T
Q  396 ctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    |           ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38210267 c-----------tgtaacaa------------aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcactatcgtgccacgat 38210191  T
Q  496 gcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38210190 gagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 38210127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 38890335 - 38889914
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890335 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccacta 38890236  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  38890235 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 38890136  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38890135 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcct 38890036  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||    
T  38890035 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgct---atacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaat 38889939  T
Q  396 ctgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    |||| ||| || |||||||||||||    
T  38889938 ctgcttaaaatctgtaacaaatctg 38889914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 6065757 - 6066158
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaag-agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6065757 gagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccact 6065856  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  6065857 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 6065956  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065957 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcc 6066056  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcag-ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatct 397  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6066057 tttctaaacccttgtttcagcccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctgtaacaaatct 6066156  T
Q  398 gc 399  Q
    ||    
T  6066157 gc 6066158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170300
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 11170579  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  11170578 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcc 11170479  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170478 caaggtgaatcaatccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 11170379  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  11170378 ccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 11170300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 4103858 - 4104233
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4103858 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccacta 4103957  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4103958 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 4104057  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104058 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 4104157  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104158 tctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 4104233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Original strand, 6063407 - 6063830
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaag-agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6063407 gagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 6063506  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  6063507 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 6063606  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063607 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 6063706  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  6063707 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatc 6063806  T
Q  397 tgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    ||| ||| || |||||||||||||    
T  6063807 tgcttaaaatctgtaacaaatctg 6063830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 5522589 - 5522976
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5522589 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccacta 5522688  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  5522689 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 5522788  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||           ||||||||||||||||||||||||||    
T  5522789 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctt 5522877  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  5522878 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgc 5522976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43228565 - 43228214
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  43228565 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 43228466  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43228465 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 43228366  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43228365 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcc 43228266  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43228265 ccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagt 43228214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 10084351 - 10084726
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084351 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccacta 10084450  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10084451 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 10084550  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10084551 ctcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcct 10084650  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084651 ttctaaacccttgttccagccccctctatctctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaag 10084726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 51726969 - 51727340
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  51726969 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccacta 51727068  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  51727069 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagaga 51727168  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51727169 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc-agtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcct 51727267  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51727268 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 51727340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 45883214 - 45882835
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||                
T  45883214 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 45883115  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45883114 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 45883015  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883014 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 45882915  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  45882914 cccctctatctcatagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaattttcaacaaatctgc 45882835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 10955989 - 10956388
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10955989 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccacta 10956088  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10956089 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagaga 10956188  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10956189 ctcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcca 10956288  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |  |||||||||||    
T  10956289 ttctaaacccttgtttcagccccctctatcttcatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattgcttaaaatttggaacaaatctgc 10956388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Original strand, 18099153 - 18099531
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  18099153 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaa 18099252  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18099253 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18099352  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18099353 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 18099452  T
Q  321 ccctctatctc-aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  18099453 ccctctatctctcaagtttactctgatacaaggtctata-ttatagtaaaagtctcgcttaaaatttggaacaaatctgc 18099531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 45 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43226350 - 43226009
Alignment:
Q  45 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatc 130  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||    
T  43226350 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 43226251  T
Q  131 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43226250 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43226151  T
Q  230 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226150 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa-cgtagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 43226052  T
Q  330 tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43226051 tccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagt 43226009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 22114267 - 22114666
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | || ||||| ||||| || ||||||||| || ||    
T  22114267 gagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcatta 22114366  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22114367 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagaga 22114466  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22114467 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcct 22114566  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  22114567 ttctaaacccttgtttcagccccttctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 22114666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26720842 - 26720444
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26720842 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccacta 26720743  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26720742 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaa 26720643  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26720642 ctcaatcctaatagt-taacccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 26720544  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  26720543 ttctaaacccttatttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgc 26720444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 18096874 - 18097262
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       
T  18096874 aaagaagaga-gaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagta 18096972  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18096973 acgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 18097072  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18097073 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccct 18097172  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctc-aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  18097173 tgtttgagccccctctatctctcaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatttgaaacaaatctgc 18097262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 10958285 - 10958684
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10958285 gagaagaacacaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccacta 10958384  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||| ||             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  10958385 tatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagaga 10958484  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10958485 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcca 10958584  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |  |||||||||||    
T  10958585 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctttatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaaaaattgcttaaaatttggaacaaatctgc 10958684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25533720 - 25533357
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  25533720 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 25533621  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  25533620 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 25533521  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533520 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 25533421  T
Q  317 agccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||        |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533420 agccccctctatctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25533357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777317
Alignment:
Q  131 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  229 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 35777388  T
Q  329 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  35777387 ctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 35777317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25389189 - 25388773
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  25389189 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 25389090  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaa 211  Q
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  25389089 acgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaa 25388990  T
Q  212 cagtgtttcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 311  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25388989 tagtgtttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaaccctt 25388890  T
Q  312 gtttcagccccctctatctc---------aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgccta 402  Q
    |||||||| | |||| ||||          ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25388889 gtttcagctctctctctctctctctctctcaaaatagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgctta 25388791  T
Q  403 atatttgtaacaaatctg 420  Q
    | || |||||||||||||    
T  25388790 aaatctgtaacaaatctg 25388773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30006124 - 30005805
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  30006124 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagta 30006026  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  30006025 acgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaa 30005926  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005925 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 30005826  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctc 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30005825 tgtttcagccccctctatctc 30005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42990578 - 42990268
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||                 
T  42990578 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaa 42990479  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42990478 agagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 42990379  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990378 caaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 42990279  T
Q  321 ccctctatctc 331  Q
    |||||||||||    
T  42990278 ccctctatctc 42990268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1313692 - 1313333
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||       
T  1313692 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagta 1313594  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  1313593 acgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaa 1313494  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  1313493 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattgtaaa-cct 1313395  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1313394 tgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 1313333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 10191274 - 10191647
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10191274 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaata--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccacta 10191371  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10191372 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagaga 10191470  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10191471 ctcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcct 10191570  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccc----tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191571 ttctaaacccttgttccagccccctttatctctctcaaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10191647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 458580 - 458203
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  458580 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 458481  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  458480 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 458381  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  458380 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 458281  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458280 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 458203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 747053 - 746674
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  747053 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccact 746954  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  746953 atatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 746854  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  746853 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgct 746754  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746753 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 746674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 1626666 - 1627016
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  1626666 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 1626765  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  1626766 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 1626865  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626866 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 1626965  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1626966 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 1627016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 27101164 - 27101519
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||                 
T  27101164 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaa 27101263  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27101264 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 27101363  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101364 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 27101463  T
Q  321 ccctctatctcaa----agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     |||||||||| |    | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101464 tcctctatctctatctcaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 27101519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 53917638 - 53917998
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||       
T  53917638 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagta 53917736  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53917737 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 53917836  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  53917837 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccat 53917936  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53917937 tgtttcagccccctccatctcaaggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 53917998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 43423437 - 43423796
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||       
T  43423437 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactatatgatgagta 43423535  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43423536 acgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 43423635  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423636 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 43423735  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43423736 tgtttcagccccctctttctcaaggtttacagtgatacaatgtctatatttatagtaaaag 43423796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 456203 - 455826
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  456203 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 456104  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  456103 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 456004  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456003 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 455904  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455903 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 455826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1321774 - 1321483
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1321774 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 1321675  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1321674 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagaga 1321575  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgt 291  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1321574 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3314959 - 3314608
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgaa----------- 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||               
T  3314959 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaa 3314860  T
Q  123 --gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3314859 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 3314760  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3314759 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttcagc 3314660  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3314659 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 3314608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 121 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6561985 - 6561740
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6561985 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 6561886  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561885 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 6561786  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 365  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6561785 cccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 6561740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Original strand, 32264021 - 32264404
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  32264021 agaacacaaaagaattgt-tgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 32264119  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32264120 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttt 32264219  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32264220 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgag 32264319  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtt----tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  32264320 ccccctctatctcaaagttaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgc 32264404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 372
Target Start/End: Original strand, 9604582 - 9604946
Alignment:
Q  27 aagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---- 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  9604582 aagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaa 9604680  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 212  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| ||||||||||     
T  9604681 cgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaat 9604780  T
Q  213 agtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9604781 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaa-cctt 9604879  T
Q  312 gtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||      ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9604880 gtttcagccccctctatctctctctcagagttttctctaatacaaggtctatatttatagtgaaagt 9604946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 370
Target Start/End: Original strand, 43421389 - 43421747
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||||||       
T  43421389 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactatatgatgagta 43421487  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  43421488 acgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaa 43421587  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421588 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 43421687  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43421688 tgtttcaaccccttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 43421747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24979991 - 24979603
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||       
T  24979991 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagta 24979893  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               | ||| || |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  24979892 acgtttacaaaaaagatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatccta 24979793  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24979792 atagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccc 24979693  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||| |  |||||||||||    
T  24979692 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtatatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgc 24979603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 28101985 - 28102335
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctag-tctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |                 
T  28101985 agaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaaa 28102084  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  28102085 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcc 28102184  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102185 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 28102284  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||| | || || | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  28102285 ccctctatctcaagggttactctaatacaacgcttatatttatagtaaaag 28102335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 12267949 - 12268300
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgaaga 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  |    
T  12267949 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagta 12268047  T
Q  125 --gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
      |  |  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  12268048 acgttacaaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccg 12268147  T
Q  223 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagtttt-gttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12268148 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagc 12268247  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12268248 tccctctatctcaaagtttactctgatacaagttctatatttatagtaaaagt 12268300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 53915470 - 53915830
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||       
T  53915470 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactaaatgatgagta 53915568  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53915569 acattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 53915668  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     | |||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  53915669 taatgtttcacaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgtcatcctaaaccct 53915768  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53915769 tgtttcagccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 53915830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 10621491 - 10621823
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10621491 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 10621590  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  10621591 atatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 10621690  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10621691 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgct 10621790  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10621791 tttctaaacccttgtttcagcaccctctatctc 10621823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 880425 - 880785
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||       
T  880425 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactatatgatgagta 880523  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  880524 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaa 880623  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  880624 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaactc 880723  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  880724 ttgtttcagacccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 880785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18162946 - 18162560
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||       
T  18162946 aaagaagaga-gaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagta 18162849  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               | | | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18162848 acgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 18162749  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162748 atagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 18162649  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgct-ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||   ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  18162648 ttgtttca--tccctctatctccaagtttactcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 18162560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 51943644 - 51943294
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||                 
T  51943644 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 51943545  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  51943544 agagacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 51943446  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  51943445 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagca 51943346  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943345 ccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 51943294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36012110 - 36011751
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||       
T  36012110 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactatatgatgagta 36012012  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  36012011 acgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaa 36011912  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  36011911 tagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatcct 36011812  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36011811 tgtttcagccccctttatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 36011751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 35918025 - 35918283
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  35918025 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttc 35918124  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgt------ttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 313  Q
     |||| ||||||||||| ||||| |||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918125 gcaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 35918224  T
Q  314 ttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35918225 ttcagccccctctatctcaaaatttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 35918283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 371
Target Start/End: Original strand, 5926755 - 5927097
Alignment:
Q  44 aaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaat 129  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | || ||||||||||             ||| | ||    
T  5926755 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatat 5926854  T
Q  130 caatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagt-ga 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  5926855 aaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcga 5926954  T
Q  229 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5926955 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctctctat 5927054  T
Q  329 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||| |||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5927055 ctcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaag 5927097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Original strand, 48361654 - 48362031
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||| ||||                 
T  48361654 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaaa 48361753  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  48361754 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcc 48361853  T
Q  222 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  48361854 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaa-ccttgtttcagcc 48361952  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  48361953 ccctgtatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 48362031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 128 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15781039 - 15780756
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||    
T  15781039 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaaggt 15780940  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagag-----------acaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15780939 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 15780840  T
Q  316 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  15780839 cagccccctctatctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 15780756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29956861 - 29956650
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29956861 aagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttc 29956762  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29956761 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttcagc 29956662  T
Q  320 cccctctatctc 331  Q
    ||||||||||||    
T  29956661 cccctctatctc 29956650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Original strand, 28412992 - 28413299
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttat-gacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccac 111  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| | | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28412992 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccac 28413091  T
Q  112 tatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagag 199  Q
    ||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  28413092 tatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 28413191  T
Q  200 agt-caatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc 297  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413192 acttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 28413291  T
Q  298 ctttctaa 305  Q
     |||||||    
T  28413292 ttttctaa 28413299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 53468436 - 53468788
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagt--ctggggag-agagcagccctccgatccactata-tgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||              
T  53468436 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttac 53468535  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53468536 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtt 53468635  T
Q  219 tcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    |||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53468636 tcccaaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa-cctggttttgttgttgccattctaaacccttgtttca 53468734  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||| ||||| || |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53468735 gccccctttatctaaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 53468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39715644 - 39715393
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39715644 aagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 39715545  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  39715544 tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcctctctaaacccttatttcag- 39715446  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39715445 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 39715393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 273
Target Start/End: Original strand, 7606567 - 7606822
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||             
T  7606567 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgtta 7606666  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7606667 caaatagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 7606766  T
Q  219 tcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattcta 273  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7606767 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 141 - 371
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100374
Alignment:
Q  141 aagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccaca 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  240 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttg 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggtta 28100342  T
Q  340 ctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28100343 ctctgatacaacgcttatatttatagtaaaag 28100374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 47148977 - 47149233
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  47148977 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttc 47149076  T
Q  221 ccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    | | |||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149077 caaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 47149176  T
Q  320 cccctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||    || |  | | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149177 cccctctatctccctcaaggcctacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 47149233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Original strand, 47148878 - 47149188
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 121  Q
    |||||||| || |||||  ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||             |    
T  47148878 agaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaa 47148977  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  47148978 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 47149077  T
Q  222 caagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg-ttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
     | |||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149078 aaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 47149177  T
Q  321 ccctctatctc 331  Q
    |||||||||||    
T  47149178 ccctctatctc 47149188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163046
Alignment:
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11163119  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  11163118 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 11163046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 370
Target Start/End: Original strand, 51674740 - 51675087
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||       
T  51674740 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtatatgatgagta 51674838  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  51674839 acattacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaa 51674938  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |           ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51674939 tagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaaggg-----------acaaaccttagttttgttgttgtctttctaaaccct 51675027  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51675028 tgtttcagccccctctatctcaacgtttacattgatacaacgtctatatttatagtaaaa 51675087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 28761511 - 28761762
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||   |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  28761511 aagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 28761610  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28761611 ccaaggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcaac 28761709  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28761710 cccctctatctcaaggtttactctgatgcaaagtctatatttatagtaaaagt 28761762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28180948
Alignment:
Q  136 gttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaac 234  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  235 ccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaa 334  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  28181082 cctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc--tatttcagccccctctatctcaag 28180985  T
Q  335 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28180984 gtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 28180948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32219368 - 32218991
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||       
T  32219368 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactatatgatgagta 32219270  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||     
T  32219269 acgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctg 32219170  T
Q  211 acagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||           |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32219169 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttacaaagag-----------acaaactctagttttgttgttgcctttctgaaccc 32219081  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| | |||||  | |||||||| |  |||||||||||    
T  32219080 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtcagatacaaggtctatatttatactgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgc 32218991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42992544 - 42992205
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||                 
T  42992544 agaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaa 42992445  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||               ||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  42992444 agagaaatcaatgagttacaagaataa---------------ctacccaaagtcc-actctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttct 42992361  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42992360 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagcc 42992261  T
Q  321 ccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42992260 ccctctatctctcttaaagtttagcatgatacaaggtatatatttatagtaaaagt 42992205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 371
Target Start/End: Original strand, 889779 - 890104
Alignment:
Q  59 ccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaaga 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||||             ||||| |||| ||||||||||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 889878  T
Q  145 ataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacc 243  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  889879 ataactctcctgcctaattctacccaaagccccaac-tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacc 889977  T
Q  244 ctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctt 342  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |      
T  889978 ccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggttt--tgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctctatctcaaggtttacac 890075  T
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  890076 tgatacaatatctatatttatagtaaaag 890104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23633727 - 23633383
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------a 122  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||            |    
T  23633727 agaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctggggagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa 23633628  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23633627 gagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 23633528  T
Q  223 aagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 322  Q
      || ||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||     
T  23633527 -ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaatccttgttttagccct 23633433  T
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23633432 ctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 23633383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 54691656 - 54691906
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |  |||||||  ||||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  54691656 aagagatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttc 54691755  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  54691756 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttta-c 54691854  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54691855 cccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 54691906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 244
Target Start/End: Original strand, 25688143 - 25688367
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------- 120  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||                  
T  25688143 agaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaa 25688242  T
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25688243 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 25688342  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccc 244  Q
    |||| |||||||||||| |||||||    
T  25688343 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 25388791 - 25388657
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25388791 aaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatctgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccag 25388692  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25388691 tgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 25388657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5886472 - 5886261
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |    
T  5886472 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttcaaa 5886373  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||     
T  5886372 gacaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcca 5886273  T
Q  223 aagtgaatcaac 234  Q
    | ||||||||||    
T  5886272 aggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 5899653 - 5899519
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5899653 aaaatctgtaacaaatctgtacccaaaaatacgttttatttttatctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccatgatttttccag 5899554  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5899553 tgccttgcctaaaaaactaaaacatccatcgtgcc 5899519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5899945 - 5899734
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |    
T  5899945 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgcaaa 5899846  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||     
T  5899845 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcca 5899746  T
Q  223 aagtgaatcaac 234  Q
    | ||||||||||    
T  5899745 aggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Original strand, 53896560 - 53896694
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53896560 aaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgcaagagcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccag 53896659  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  53896660 taccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 53896694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31151507 - 31151271
Alignment:
Q  134 gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatca 232  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31151507 gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 31151408  T
Q  233 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 331  Q
    |||  | |||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31151407 acc--ccaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttctaaacccttgttttcagccccctctatctc 31151312  T
Q  332 aaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
     | |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31151311 gaggtttacatctgatacaaagtctatatttatagtaaaag 31151271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11168396 - 11168172
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  11168396 gagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaata 11168297  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||| |             |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  11168296 tatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagaca 11168197  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag 225  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
T  11168196 ctcaatcctaatagtgtttcccaag 11168172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 53591438 - 53591119
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa-------------gagaaatcaatgggttaca 141  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||              |||| |||||||| ||| |    
T  53591438 tgacctagttcgatccaaattgacctagtctggggagagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatggattaga 53591339  T
Q  142 agaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaa 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  || |||  |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  53591338 agaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 53591239  T
Q  241 accctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  53591238 accctagtgtttgttctaaagaga-----------caaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaaggtttac 53591150  T
Q  341 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
      | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53591149 acttatacaatgtctatatttatagtaaaag 53591119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23637198 - 23636952
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23637198 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtttc 23637099  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
     ||| || ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  23637098 tcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttttagc 23637003  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    | |||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||| |||||    
T  23637002 ctcctctatctcaaggtttactctgatacaaagtatatatttatattaaaa 23636952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 5886178 - 5886044
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886178 aaaatctgtaacaaatttgcacccaaaaatacgttttatttttatctgccagcgcaccatcgtaccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 5886079  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5886078 taccttgcctaaaaaactaaaacatccatcgtgcc 5886044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Original strand, 6063812 - 6063946
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6063812 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagtccaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttttcag 6063911  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  6063912 tgccttgcccaaaaaactaaaacctccattgtgcc 6063946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6484634 - 6484372
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  6484634 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 6484535  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  6484534 aaagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcc 6484435  T
Q  222 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccc 282  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  || |||||| || |||||||||| |||| ||||||||    
T  6484434 caaggtgaatcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 371
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137628
Alignment:
Q  148 agtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacccta 246  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  247 gtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgat 346  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaactcta-----------gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgat 28137603  T
Q  347 acaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||| |  |||||||||||||||||    
T  28137604 acaacgcatatatttatagtaaaag 28137628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 13420268 - 13420506
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13420268 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 13420367  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||||||| |   |||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||          |||||||||||||||||    
T  13420368 ccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgcctagaga-aaactctatacaaaccctagtttgatt----------taaacccttgtttcagc 13420453  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13420454 ctcctatatctcaaggtttgctttgatacaaaacctatatttatagtaaaagt 13420506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 241 - 371
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701928
Alignment:
Q  241 accctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc 340  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  47701798 accctggtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttac 47701897  T
Q  341 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47701898 actgatacaatgtctatatttatagtaaaag 47701928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 54884329 - 54884081
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  54884329 aagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 54884231  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54884230 ccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactcta--caaattctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttcgagc 54884133  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
     ||||||||||||| |||| |  |||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  54884132 tccctctatctcaaggtttacaatgatccaatgtttatatttatggtaaaag 54884081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4666797 - 4666488
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||       
T  4666797 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctggggagag--cagccctccgtttcactataatgatgagta 4666701  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataag--tctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcct 209  Q
              ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||| |||||| |    
T  4666700 accttacaaaagagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcat 4666601  T
Q  210 aacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 308  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||           |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  4666600 aatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagag-----------acaaaccctatttttgttgttgtcttactagacc 4666512  T
Q  309 cttgtttcagccccctctatctca 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  4666511 cttctttcagccccctctatctca 4666488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849117
Alignment:
Q  204 aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc 302  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  303 taaacccttgtttcagccccctctatct 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849144 taaacccttgtttcagccccctctatct 41849117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 370
Target Start/End: Original strand, 27635830 - 27635959
Alignment:
Q  241 accctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27635830 accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttac 27635929  T
Q  341 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    | | || |||||||||||||| ||||||||    
T  27635930 tctaattcaaggtctatatttgtagtaaaa 27635959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231374
Alignment:
Q  242 ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgct 341  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |     
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctcaagatttaca 6231403  T
Q  342 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6231402 ctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 6231374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 53597404 - 53597164
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| || ||  || |||   | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  53597404 atcaacgggttacaagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 53597305  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    ||||||||     |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  53597304 gaatcaacttc--aaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaacccctagttttcttgttgactta-taaacccttgtttcatcccc-tct 53597210  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597209 atctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 53597164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 317 - 420
Target Start/End: Original strand, 53896475 - 53896578
Alignment:
Q  317 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  53896475 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaa 53896574  T
Q  417 tctg 420  Q
    ||||    
T  53896575 tctg 53896578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Original strand, 22114656 - 22114782
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22114656 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccatcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacaatttttccagtgccttgc 22114755  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || || |||| ||||||||||||||||    
T  22114756 ctcaaaaactgaaacctccatcgtgcc 22114782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Original strand, 18099521 - 18099639
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18099521 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctattgttcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgc 18099620  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcca 552  Q
    || || |||| |||||||||    
T  18099621 ctcaa-aactgaaacctcca 18099639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6232083 - 6231849
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| || ||| || ||||||      
T  6232083 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccgttc-actgtaatgatgagt 6231986  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||  |||    
T  6231985 agctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacacta 6231887  T
Q  211 acagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctag 247  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6231886 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1321441 - 1321337
Alignment:
Q  295 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| |  ||||||    
T  1321441 tgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaa 1321342  T
Q  395 tctgc 399  Q
    |||||    
T  1321341 tctgc 1321337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1674140 - 1673898
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca-agt 226  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||||||  ||    
T  1674140 atcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggt 1674041  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt-gtttcagccccctc 325  Q
    ||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||  ||||||  | |||    
T  1674040 gaatcaatc--ctaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagttttcttgttaac-ttctaaacccttattttcag-actctc 1673946  T
Q  326 tatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||  |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1673945 tacatcaaggtttacttttgatacaagttctatatttatagtaaaagt 1673898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177202
Alignment:
Q  192 accaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttg 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccc--aaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttc 24177284  T
Q  291 ttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177283 ttgttgacat-ctaaactcttgttttcagccccctctagctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaaagt 24177202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3306842 - 3306724
Alignment:
Q  252 tgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaag 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |  ||||||||     
T  3306842 tgttccaaagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctctaggtttacactgatacaat 3306743  T
Q  352 gtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3306742 gtctatatttatagtaaaa 3306724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 324
Target Start/End: Original strand, 561866 - 562058
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gt 226  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  561866 atcaatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgt 561965  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 324  Q
    |||||||||    |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  561966 gaatcaacc--tgaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaaccctag-tttcatgttgac-ttctaaacccttgtttcaaccccct 562058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25635549 - 25635391
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  25635549 atcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggt 25635450  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttt 288  Q
    ||| ||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  25635449 gaaccaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttt 25635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 533
Target Start/End: Original strand, 10956378 - 10956478
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956378 aacaaatctgcacctaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 10956477  T
Q  533 c 533  Q
    |    
T  10956478 c 10956478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 425 - 496
Target Start/End: Original strand, 6066139 - 6066210
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatg 496  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066139 aaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaatacattttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatg 6066210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17795433 - 17795269
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||  ||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  17795433 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 17795334  T
Q  221 cc-aagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttt 288  Q
    || ||||||||||||||   |||||||||||||||| | || || |||| |||||||| || |||||||    
T  17795333 ccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 17795269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19103873 - 19103709
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||  ||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  19103873 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 19103774  T
Q  221 cc-aagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttt 288  Q
    || ||||||||||||||   |||||||||||||||| | || || |||| |||||||| || |||||||    
T  19103773 ccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacagactctagttt 19103709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 323 - 420
Target Start/End: Original strand, 6719396 - 6719493
Alignment:
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  6719396 ctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtatcaaatctg 6719493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 35919094 - 35919179
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatat 116  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35919094 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 365
Target Start/End: Original strand, 36871421 - 36871624
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  | |||||| |||||||||     
T  36871421 ctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaatc--ctaaccctggtgtttgttg 36871518  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 356  Q
    | ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||  | | | |||| || ||||||||||| ||    
T  36871519 ccaagag-caaactctatacaagccctagttttcttgttggc-ttgtaaacccttgtttcagccccc-ctccccctaggtttactatgatacaaggttta 36871615  T
Q  357 tatttatag 365  Q
    |||||||||    
T  36871616 tatttatag 36871624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 27635641 - 27635727
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27635641 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatga 27635727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 434 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 5191559 - 5191423
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5191559 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgagatcccatcgtgccacgatttttccagtaccttgc 5191460  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcc-atcgtgccgcgaagccca 569  Q
    || || |||| |||||||| |||||||| ||| |||||    
T  5191459 ctcaa-aactgaaacctccaatcgtgccacgatgccca 5191423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 434 - 526
Target Start/End: Original strand, 10958674 - 10958767
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958674 aacaaatctgcacctaaaaatacgtttctgttattggctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 10958767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 434 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 3859434 - 3859350
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatt 517  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3859434 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatattattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgtgaccccatcgtgccacgatt 3859350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 372
Target Start/End: Original strand, 4560403 - 4560599
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||         
T  4560403 ctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt----- 4560497  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 356  Q
       ||||||||| ||||           ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||    
T  4560498 ---agagacaaactcta-----------gttttgttgttacctttataaaccattgtttcagccccctctatctcaatgtttactatgatacatagtcta 4560583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41849342 - 41849247
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  41849342 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatga 41849247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 116
Target Start/End: Original strand, 53894018 - 53894121
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  53894018 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaat 53894117  T
Q  113 atat 116  Q
    ||||    
T  53894118 atat 53894121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1321347 - 1321246
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1321347 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttttcagtgctttgc 1321248  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  1321247 ct 1321246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Original strand, 5522966 - 5523067
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5522966 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccattgtgccacgatttttccagtaccttgc 5523065  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  5523066 ct 5523067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 169
Target Start/End: Original strand, 47701654 - 47701801
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 121  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||             |    
T  47701654 agaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 47701753  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccc 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47701754 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24181548 - 24181498
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181548 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 24181498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 26720415 - 26720353
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26720415 gccagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcct 26720353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 490 - 559
Target Start/End: Original strand, 10192401 - 10192469
Alignment:
Q  490 cacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  10192401 cacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaa-aactgaaacctccatcgtgcc 10192469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 35777280 - 35777223
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35777280 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 35777223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5899717 - 5899633
Alignment:
Q  338 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgta 422  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  5899717 tgctctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtctcgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaatctgta 5899633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5886242 - 5886163
Alignment:
Q  338 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaat 417  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  5886242 tgctctgataaaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaat 5886163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3306936 - 3306839
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||   |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3306936 aagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 490 - 559
Target Start/End: Original strand, 10085481 - 10085549
Alignment:
Q  490 cacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  10085481 cacgatgtgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaa-aactgaaacctccatcgtgcc 10085549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 38889875 - 38889818
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38889875 ccatcgtgccacgatttttccaatgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 38889818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 4308648 - 4308725
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  4308648 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 4308725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11163008 - 11162951
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  11163008 ccatcgtgccacaatttttccagtgccttgcctcaaaaactgaaacctccatcgtgcc 11162951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Original strand, 32264394 - 32264513
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | || ||  | |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    ||||||| |||||    
T  32264394 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgttgcaagcccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgc 32264493  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcca 552  Q
    || || |||| |||||||||    
T  32264494 ctcaaaaactgaaacctcca 32264513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42992660 - 42992605
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggag 91  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42992660 agaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggag 42992605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6484373 - 6484308
Alignment:
Q  307 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  6484373 cccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagcaaaagt 6484308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 10094196 - 10094256
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10094196 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 10201076 - 10201136
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10201076 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15781162 - 15781090
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15781162 aaagaagaga-gaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcag 15781090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16462263 - 16462203
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16462263 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 22626106 - 22626166
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22626106 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 27101627 - 27101704
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| || |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  27101627 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcttggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 27101704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 35918316 - 35918393
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  35918316 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcactattcgatccaatcgtgctacgatttttccagtg 35918393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 43228181 - 43228108
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcc 522  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  43228181 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttcc 43228108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 47883004 - 47883064
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47883004 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 552
Target Start/End: Original strand, 18097291 - 18097354
Alignment:
Q  488 gccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||    
T  18097291 gccactatgcgaccccatcgtgccacgatttttcctatgccttgcctcaa-aactgaaacctcca 18097354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 45882804 - 45882752
Alignment:
Q  474 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45882804 cagcgcaccatcgtgccacgttgcaatcccatcgtggcacgatttttccagtg 45882752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 54188665 - 54188625
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54188665 tgacctagtctggggagagagcagctctccgatccactata 54188625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 504 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11170260 - 11170205
Alignment:
Q  504 atcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  11170260 atcgagccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaccgaaacctccatcgtgcc 11170205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 24177185 - 24177086
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| | |||||  || ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  24177185 aacaaatctgcacttaaaaatacgtttatgtttttcgcctccaacgcaccatcgtgccacattgcgatcccatcgtgccacattttttccagtgacttgc 24177086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38889932 - 38889861
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38889932 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgat 38889861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10897065 - 10897008
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  10897065 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 29914075 - 29914132
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  29914075 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 35777336 - 35777266
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  35777336 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttatgtttttgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 35777266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 47878293 - 47878350
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  47878293 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54193286 - 54193229
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  54193286 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 54193229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Original strand, 1618916 - 1618992
Alignment:
Q  299 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||| || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1618916 tttctaaacccttgttttcagccccctctgtctctcaaggtttactatggtacaaggtctatatttatagtcaaagt 1618992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4535674 - 4535614
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4535674 ctaattctacccaat-tcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacggtgttt 4535614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 559
Target Start/End: Original strand, 6066211 - 6066252
Alignment:
Q  518 tttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6066211 tttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 6066252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 10100213 - 10100273
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10100213 ctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 10208122 - 10208182
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  10208122 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 25690723 - 25690800
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||| || ||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  25690723 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacaattcgatccaatcatggcacgatttttccagtg 25690800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 51727373 - 51727450
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | | |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  51727373 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcacaccatcgtggcacgattcgatcaaatcgtggcacgatttttccagtg 51727450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1736384 - 1736324
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1736384 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 1736324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6303358 - 6303310
Alignment:
Q  171 aagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6303358 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 502 - 550
Target Start/End: Original strand, 6719532 - 6719579
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  6719532 ccatcgtgccacgatttttccagtgcattgcctaaa-aactgaaacctc 6719579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18552962 - 18552902
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18552962 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18552902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 30709869 - 30709809
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30709869 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 30709809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 115
Target Start/End: Original strand, 36871304 - 36871364
Alignment:
Q  57 acccagtccggtccaa-attgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36871304 acccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 36871364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 495
Target Start/End: Original strand, 6719475 - 6719546
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6719475 aaaatctgtatcaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgat 6719546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 520
Target Start/End: Original strand, 9604979 - 9605050
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttt 520  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  9604979 aaaaatatgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtgccacgatgcgattcagtcgtggcacgattttt 9605050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11163056 - 11162997
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccac 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||    
T  11163056 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccac 11162997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13419983 - 13419864
Alignment:
Q  192 accaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttg 290  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||  ||||||||||||||     
T  13419983 accaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta--caaaccctagttttc 13419889  T
Q  291 ttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||    
T  13419888 ttgttggcttt-taaacctttgtttc 13419864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 372
Target Start/End: Original strand, 25690651 - 25690690
Alignment:
Q  333 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25690651 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 25690690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 20031440 - 20031497
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  20031440 ctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20031497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633930
Alignment:
Q  192 accaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttt 288  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||   | |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatccc--agccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt 25633930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28181230 - 28181192
Alignment:
Q  67 gtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccg 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28181230 gtccaaattgacctagtctagggagagagcagccttccg 28181192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 114
Target Start/End: Original strand, 40844665 - 40844719
Alignment:
Q  60 cagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40844665 cagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctcaaatccactat 40844719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54188569 - 54188512
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  54188569 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaattctaatagtg 54188512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 1620483 - 1620524
Alignment:
Q  75 tgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1620483 tgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactata 1620524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3307034 - 3306974
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagca 97  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3307034 agaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtct-aggagagagca 3306974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 6303466 - 6303425
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6303466 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 6303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 10094100 - 10094141
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10094100 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10094141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 10100117 - 10100158
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10100117 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10100158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 10200980 - 10201021
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10200980 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10201021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 10208026 - 10208067
Alignment:
Q  75 tgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10208026 tgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactata 10208067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Original strand, 10621847 - 10621876
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621847 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 10621876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 10897162 - 10897121
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10897162 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10897121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 27544429 - 27544388
Alignment:
Q  75 tgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27544429 tgacctagtctgagggagagagcagctctccgatccactata 27544388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 28761410 - 28761491
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaa-ttgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  28761410 agaaaacaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactata 28761491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956874
Alignment:
Q  88 ggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactatatgatga 29956874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 370
Target Start/End: Original strand, 31021450 - 31021479
Alignment:
Q  341 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021450 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 31021479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31151579 - 31151538
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31151579 tgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 31151538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42990234 - 42990205
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990234 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 42990205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 54193383 - 54193342
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  54193383 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 54193342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Original strand, 1620581 - 1620657
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||   |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1620581 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8370565 - 8370505
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8370565 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8370505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25929519 - 25929463
Alignment:
Q  57 acccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    ||||||| ||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25929519 acccagttcggtccaatacgacctactctggggggagagcagccctccaatccacta 25929463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 372
Target Start/End: Original strand, 27101558 - 27101594
Alignment:
Q  336 tttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101558 tttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 27101594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27975031 - 27974971
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27975031 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27986525 - 27986465
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27986525 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27986465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38002928 - 38002877
Alignment:
Q  159 taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  38002928 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaaacctaa 38002877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 48438222 - 48438282
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48438222 tgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 48438282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 120
Target Start/End: Original strand, 54691551 - 54691642
Alignment:
Q  29 gaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||   |||| ||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  54691551 gaagagaa-aacataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactatatgatg 54691642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 169)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 559
Target Start/End: Original strand, 16931764 - 16932300
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  16931764 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtt 16931863  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaa 211  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16931864 tcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaa 16931963  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16931964 tagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaaccct 16932063  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgt 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||            
T  16932064 tgtatcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgctta-------- 16932155  T
Q  411 aacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgc 510  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16932156 ---aaatctgtaac-aaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgc 16932251  T
Q  511 cacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16932252 cacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 16932300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 559
Target Start/End: Original strand, 16934118 - 16934654
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  16934118 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtt 16934217  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaa 211  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16934218 tcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaa 16934317  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16934318 tagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaaccct 16934417  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgt 410  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||            
T  16934418 tgtatcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgctta-------- 16934509  T
Q  411 aacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgc 510  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16934510 ---aaatctgtaac-aaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgacagcgcaccatcgtgccaggatgagaccccatcgtgc 16934605  T
Q  511 cacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16934606 cacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 16934654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 559
Target Start/End: Original strand, 22782701 - 22783257
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22782701 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 22782800  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  22782801 atatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 22782900  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22782901 ctccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgct 22783000  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||        ||||  || ||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22783001 tttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaa 22783100  T
Q  391 caaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgcc 490  Q
    ||||||||| ||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783101 caaatctgctta-----------aaatctgtaac-aaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgcc 22783188  T
Q  491 acgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22783189 acgatgagaccccatcgtgccatgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 22783257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 559
Target Start/End: Original strand, 22780336 - 22780892
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22780336 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 22780435  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  22780436 atatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 22780535  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22780536 ctccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgct 22780635  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataa 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||        ||||  || ||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22780636 tttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaa 22780735  T
Q  391 caaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgcc 490  Q
    ||||||||| ||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780736 caaatctgctta-----------aaatctgtaac-aaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgcc 22780823  T
Q  491 acgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22780824 acaatgagaccccatcgtgccatgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 22780892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18847521 - 18847102
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18847521 gagaagaacacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccaatccactat 18847422  T
Q  115 atgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt 202  Q
    |||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |    
T  18847421 atgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact 18847322  T
Q  203 c-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847321 ccaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 18847222  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcc 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  18847221 tctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaagtttgttttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgct 18847122  T
Q  401 taatatttgtaacaaatctg 420  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  18847121 ttaaatttgtaacaaatctg 18847102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11435323 - 11434925
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435323 gagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccacta 11435224  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||     
T  11435223 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagac 11435124  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435123 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 11435024  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  11435023 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 11434925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 22044355 - 22044753
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22044355 gagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccacta 22044454  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22044455 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 22044554  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaagtg-aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044555 tcaatcctaatagtgtttcccaaggggaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 22044654  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  22044655 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 22044753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 22046650 - 22047048
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22046650 gagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccacta 22046749  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22046750 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 22046849  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046850 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 22046949  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  22046950 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctccgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 22047048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51015614 - 51015216
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  51015614 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccacta 51015515  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  51015514 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 51015415  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015414 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctt 51015315  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  51015314 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 51015216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 8631383 - 8631759
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8631383 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 8631482  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8631483 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 8631582  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631583 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 8631682  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8631683 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaagtctatatttatagtgaaagt 8631759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Original strand, 11008532 - 11008954
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11008532 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 11008631  T
Q  114 tatgatga----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc 203  Q
    ||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  11008632 tatgatgagtaccattacaaagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactc 11008731  T
Q  204 -aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 301  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008732 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 11008831  T
Q  302 ctaaacccttgtttcagccccctctatctc-----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11008832 ctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaaatagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatc 11008930  T
Q  397 tgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    ||| ||| || |||||||||||||    
T  11008931 tgcttaaaatctgtaacaaatctg 11008954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 37089336 - 37089737
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37089336 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccacta 37089435  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  37089436 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagac 37089535  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37089536 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccat 37089635  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctc---aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatct 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  37089636 tctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttggaacaaatct 37089735  T
Q  398 gc 399  Q
    ||    
T  37089736 gc 37089737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38409573 - 38409169
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38409573 gagaagaacaaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccacta 38409474  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38409473 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 38409374  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409373 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 38409274  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaa 394  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  ||||||    
T  38409273 tttaaaccattgtttcagccccctctatctccctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaa 38409174  T
Q  395 tctgc 399  Q
    |||||    
T  38409173 tctgc 38409169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47275079 - 47274697
Alignment:
Q  30 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||            
T  47275079 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacttt 47274980  T
Q  122 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  47274979 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 47274880  T
Q  217 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274879 tttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 47274781  T
Q  316 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  47274780 cagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgaaacaaatctgc 47274697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 2484837 - 2485209
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2484837 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 2484936  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2484937 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 2485036  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485037 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 2485136  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccc-tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2485137 tctaaacccttgttttagcccccttctagctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 2485209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 27 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6765201 - 6764836
Alignment:
Q  27 aagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---- 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||        
T  6765201 aagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaa 6765102  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 212  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  6765101 cgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaac 6765002  T
Q  213 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa-----gagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765001 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 6764902  T
Q  307 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6764901 cccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 6764836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 32 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9148604 - 9148221
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||             
T  9148604 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgtta 9148505  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9148504 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 9148405  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9148404 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttca 9148305  T
Q  318 gccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  9148304 gccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 9148221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 32 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5198772 - 5198390
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  5198772 gagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgtta 5198673  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  5198672 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 5198573  T
Q  218 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198572 ttcccaaagtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 5198473  T
Q  317 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  5198472 agccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 5198390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24348570 - 24348211
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  24348570 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 24348471  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24348470 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 24348371  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348370 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 24348271  T
Q  317 agccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348270 agccccctctatctctctcaaagtttagcttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24348211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 31849563 - 31849962
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31849563 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 31849662  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  31849663 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagac 31849762  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccct-agtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849763 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 31849862  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  31849863 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcctagtttgctctgatacaagacctatatttctagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 31849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7941692 - 7941289
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7941692 gagaagaacacaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 7941593  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7941592 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagaga 7941493  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtg--tttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc 297  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941492 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 7941393  T
Q  298 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaa--gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||    
T  7941392 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcccggtttgctctgatacaacgtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaat 7941293  T
Q  396 ctgc 399  Q
    ||||    
T  7941292 ctgc 7941289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40637431 - 40637071
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||       
T  40637431 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagta 40637333  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  40637332 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaa 40637233  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637232 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 40637133  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40637132 tgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 40637071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 38 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24889142 - 24888766
Alignment:
Q  38 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |             ||    
T  24889142 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaag 24889043  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24889042 agatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 24888943  T
Q  224 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 322  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888942 aggtgaatcaaccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 24888843  T
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  24888842 ctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgc 24888766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Original strand, 9176438 - 9176858
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9176438 gagaagaacacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 9176537  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||     
T  9176538 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 9176637  T
Q  202 tc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9176638 tccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgctt 9176737  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  9176738 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaatgtcttgcttaaaaactgtaacaaatctgc 9176837  T
Q  400 ctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
     | | |||| |||||||||||    
T  9176838 tttaaatttataacaaatctg 9176858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 9174110 - 9174509
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  9174110 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccacta 9174209  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||     
T  9174210 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 9174309  T
Q  202 t-caatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9174310 ttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctt 9174409  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  9174410 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaaactgtaacaaatctgc 9174509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 399
Target Start/End: Original strand, 11006218 - 11006604
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  11006218 gagaagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccatta 11006317  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  11006318 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 11006417  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006418 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 11006517  T
Q  317 agccccctctatctc-----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||      ||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  11006518 agccccctctatctctctctcaaaatag-tctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 11006604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Original strand, 22802719 - 22803097
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||                 
T  22802719 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaa 22802818  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22802819 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 22802918  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22802919 caaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 22803018  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  22803019 ccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 22803097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14633687 - 14633317
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  14633687 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcacta 14633588  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  14633587 tatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccg-taaccaagaga 14633489  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14633488 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcct 14633389  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14633388 ttctaaacctttgtttcag-cccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 14633317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 22800838 - 22801225
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       
T  22800838 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagta 22800936  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  22800937 acgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaa 22801036  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22801037 tagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaaccct 22801136  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  22801137 tgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttgaaacaaatctgc 22801225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 47868772 - 47868398
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccac 111  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  47868772 gtgagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccac 47868673  T
Q  112 tatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    ||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47868672 tatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaga 47868573  T
Q  199 gagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc 297  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868572 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 47868473  T
Q  298 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47868472 ctttctaaacccttctttcagccctctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 47868398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 40091391 - 40091751
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||       
T  40091391 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagta 40091489  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  40091490 acattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataa 40091589  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40091590 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagttttgttgttgtctttctaaaccct 40091689  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091690 tgtttcagccccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 40091751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 33 - 372
Target Start/End: Original strand, 44599820 - 44600174
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  44599820 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 44599919  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  44599920 aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 44600019  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44600020 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 44600119  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600120 gccccctctatctcaaagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 44600174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 48486673 - 48486289
Alignment:
Q  29 gaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------ 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||          
T  48486673 gaagagaa-aacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacg 48486575  T
Q  122 -------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacag 214  Q
           |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  48486574 ttacaaaagagatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 48486475  T
Q  215 tgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48486474 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgt 48486375  T
Q  314 ttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  48486374 ttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 48486289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24879338 - 24878986
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------- 120  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||                  
T  24879338 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaa 24879239  T
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24879238 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 24879139  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24879138 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcagc 24879039  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879038 cccctctatctccaagtttactcggatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24878986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24880800 - 24880421
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------- 120  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||                  
T  24880800 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaa 24880701  T
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24880700 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 24880601  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  24880600 ccaaggtgaaccaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacgc 24880501  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  24880500 cccctctatctccaagtttactccgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 24880421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 17662221 - 17662574
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  17662221 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 17662319  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17662320 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaa 17662419  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662420 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 17662508  T
Q  311 tgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662509 tgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17662574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Original strand, 36919569 - 36919950
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa------------ 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||                
T  36919569 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaaa 36919668  T
Q  123 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36919669 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 36919768  T
Q  222 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919769 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 36919868  T
Q  320 cccctctatc--tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  36919869 cccctatatctatcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 36919950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 22132355 - 22132735
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttat-gacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22132355 gagaagaacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccact 22132454  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22132455 atatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 22132554  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22132555 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-cgaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcct 22132653  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagcccc---------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132654 ttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22132735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 36921469 - 36921858
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||       
T  36921469 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagta 36921567  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36921568 acgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 36921667  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36921668 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagccc 36921767  T
Q  310 ttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  36921768 ttgtttca-ccccctctatctctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 36921858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 121 - 399
Target Start/End: Original strand, 5637549 - 5637832
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5637549 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 5637648  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5637649 ccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagc 5637748  T
Q  320 cccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  5637749 cccctctatctctctcaaagtttgctcttatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 5637832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 22134582 - 22134909
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22134582 gagaagaacacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccaatccactat 22134681  T
Q  115 atgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt 202  Q
    |||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  22134682 atgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagact 22134781  T
Q  203 caatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 301  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134782 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 22134880  T
Q  302 ctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22134881 ctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 22134909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 38928153 - 38928513
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||       
T  38928153 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactatatgatgagta 38928251  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38928252 acgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 38928351  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38928352 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactc 38928451  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38928452 ttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctaatacaaagcctatatttatagtaaaag 38928513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 370
Target Start/End: Original strand, 33415464 - 33415821
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||       
T  33415464 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagta 33415562  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| || ||| |||    
T  33415563 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaa 33415662  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33415663 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttccaa-gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaaccct 33415761  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  33415762 tgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttgtagtaaaa 33415821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 18709127 - 18709458
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  18709127 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccact 18709226  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  18709227 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagaga 18709326  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709327 ctcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 18709426  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709427 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 18709458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 619433 - 619783
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 122  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||             |    
T  619433 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttaggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaa 619532  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  619533 gagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttccc 619632  T
Q  223 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  619633 aaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttcagccc 619732  T
Q  322 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619733 cctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 619783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 12395830 - 12396180
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||                 
T  12395830 agaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 12395929  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12395930 agagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 12396029  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12396030 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcc 12396129  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || |||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12396130 ccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12396180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36378650 - 36378289
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  36378650 aaagaagaga-gaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagt 36378552  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  36378551 aacttcacaagagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatccta 36378452  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378451 atagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 36378352  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36378351 ttgtttcagccccgtctatctcaaggtttattctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 36378289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 14787406 - 14787769
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg---agagagcagccctccgatccactatatgatga- 121  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  14787406 aaagaagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgag 14787503  T
Q  122 ------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcct 209  Q
                |||||  |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14787504 taacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 14787603  T
Q  210 aacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 308  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14787604 aatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacc 14787703  T
Q  309 cttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787704 cttgtttcagccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 14787769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 121 - 399
Target Start/End: Original strand, 3824654 - 3824936
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  3824654 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttc 3824753  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  3824754 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacc--tgtttcagc 3824851  T
Q  320 cccctcta----tctcaaag-tttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||    ||||||||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  3824852 cccctctatctctctcaaagaaatactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgc 3824936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 26085947 - 26086236
Alignment:
Q  21 aacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26085947 aacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactatatgat 26086046  T
Q  120 ga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatc 207  Q
    ||            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26086047 gagtatcgttacaaagagaaaacaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 26086146  T
Q  208 ctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttg 296  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26086147 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 26086236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 12400792 - 12401142
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||                 
T  12400792 agaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 12400891  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12400892 agagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 12400991  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12400992 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcc 12401091  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || |||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12401092 ccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12401142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 372
Target Start/End: Original strand, 47210755 - 47211082
Alignment:
Q  54 atgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatcaatgggtta 139  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||    
T  47210755 atgactcagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggtta 47210854  T
Q  140 caagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagtgaatcaacccaca 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||           ||||    
T  47210855 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa-----------caca 47210943  T
Q  240 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaa 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  47210944 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctctcaa 47211043  T
Q  334 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211044 agtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 47211082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19096231 - 19095880
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |                 
T  19096231 agaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaa 19096132  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  19096131 agagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttca 19096032  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19096031 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 19095932  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19095931 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 19095880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16453667 - 16453306
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | | ||||||| ||||||      
T  16453667 aaagaagaga-gaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagt 16453569  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16453568 aaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatccta 16453469  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16453468 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctagttttgttgttgcctttttaaaccc 16453369  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16453368 ttgtttcagccccctctatctctcggtttgctctgatacaaagcctatatttatagcaaaagt 16453306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 53405497 - 53405124
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgat 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  53405497 gaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-gagagcagctctctgttccactatatgat 53405399  T
Q  120 ga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataag------tctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||             ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  53405398 gagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagaga 53405299  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405298 ctcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 53405200  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccc---tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405199 ttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 53405124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Original strand, 37313150 - 37313400
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37313150 aagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 37313249  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
     |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313250 tcaaggtgaatcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 37313349  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  37313350 cccctctatctcaaggtttactttgatacaaaacctatatttatagtaaaa 37313400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030443
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaaga-----------gaaat--caatgggttac 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||   ||||||||| |           |||||  ||||| |||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttac 56030674  T
Q  141 aagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccaca 239  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  56030673 aagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 56030574  T
Q  240 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttg 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  56030573 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaggttta 56030474  T
Q  340 ctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  56030473 ctctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 56030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13544208 - 13543953
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13544208 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 13544109  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  13544108 ccaaggtgaatcaatcctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcag 13544010  T
Q  319 ccccctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||    ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13544009 ccccctctatctctctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaa 13543953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 121 - 399
Target Start/End: Original strand, 52942543 - 52942810
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  52942543 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 52942629  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52942630 ccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 52942728  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttg--atacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |  |||||||||||    
T  52942729 cccctctatctcaaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgc 52942810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41997817 - 41997494
Alignment:
Q  59 ccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat-atgatga-------------agagaaatcaatgggttacaaga 144  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||             ||||| || || |||||||||||    
T  41997817 ccagttcggtccaaattaacctagtctggggagagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaaga 41997718  T
Q  145 ataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacc 243  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||  || |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  41997717 ataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacc 41997618  T
Q  244 ctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgcttt 343  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  41997617 ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagccccctttatctcaaggtttactct 41997518  T
Q  344 gatacaaggtctatatttatagta 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  41997517 gatacaaagtctatatttatagta 41997494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 121 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19322942 - 19322701
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19322942 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 19322843  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  19322842 ccaaggtgaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcatc 19322747  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 365  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  19322746 cccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatag 19322701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 142 - 371
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937543
Alignment:
Q  142 agaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaa 240  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  241 accctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc 340  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaggtttac 3937513  T
Q  341 tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3937514 tctgata-aaagtctatatttatagtaaaag 3937543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 18409431 - 18409681
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |    
T  18409431 aagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcc 18409530  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18409531 cgaaggttaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 18409629  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || ||||||||||  |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18409630 cctctctatctcattgtttacactgatacaaattctatatttatagtaaaag 18409681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 18537559 - 18537806
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18537559 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18537658  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 318  Q
    | || |||||||||||  | |||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  18537659 ctaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcag 18537753  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18537754 ccccctctatctcaatgtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 18537806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132871
Alignment:
Q  152 tcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgt 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  251 ttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaa 350  Q
    ||||| | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |   |||||||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaacccttg-ttcagcctcctctatctcaatgtttacaccgatacaa 6132892  T
Q  351 ggtctatatttatagtaaaag 371  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6132891 tgtctatatttatagtaaaag 6132871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 8756336 - 8756586
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaacc-aagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  8756336 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgttt 8756435  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttca 317  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||    
T  8756436 cccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgttttca 8756531  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8756532 gccccttctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 8756586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36380707 - 36380425
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||      
T  36380707 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagt 36380609  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36380608 aactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatccta 36380509  T
Q  211 acagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttg 293  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36380508 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 5635440 - 5635614
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635440 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 5635539  T
Q  114 tatgatg-------------aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 175  Q
    |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5635540 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11437731 - 11437557
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437731 gagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccacta 11437632  T
Q  114 tatgatg------------aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcc 176  Q
    |||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11437631 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11437557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 18534917 - 18535164
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18534917 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18535016  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 318  Q
     ||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||| ||||||    
T  18535017 tcaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttttaaacacttgttttcag 18535111  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||| |||||||    
T  18535112 ccccctctatctcaaggtttactctgaatcgaggtctatatttattgtaaaag 18535164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 371
Target Start/End: Original strand, 38270162 - 38270321
Alignment:
Q  213 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 311  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270162 agtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 38270261  T
Q  312 gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38270262 gtttcagcctcttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 38270321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5100994
Alignment:
Q  233 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctca 5101034  T
Q  333 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    | |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5101033 aggtttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 5100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 371
Target Start/End: Original strand, 24446760 - 24446914
Alignment:
Q  213 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  24446760 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaaccctt 24446854  T
Q  312 gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24446855 gtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24446914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 433 - 559
Target Start/End: Original strand, 9176848 - 9176975
Alignment:
Q  433 taacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttg 531  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176848 taacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttg 9176947  T
Q  532 cctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9176948 cctaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 9176975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Original strand, 11006585 - 11006720
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 523  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006585 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttttttgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 11006684  T
Q  524 gtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  11006685 gtgccttgcctaaaaaattgaaacctccatcgtgcc 11006720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 425 - 558
Target Start/End: Original strand, 9174490 - 9174624
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 523  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9174490 aaaaactgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccctgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccatgatttttcca 9174589  T
Q  524 gtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgc 558  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9174590 gtgccttgcctaataaactaaaacctccatcgtgc 9174624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2891434 - 2891314
Alignment:
Q  252 tgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttga-tacaa 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||| |||||    
T  2891434 tgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgattacaa 2891335  T
Q  351 ggtctatatttatagtaaaag 371  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  2891334 tgtctatatttatagtaaaag 2891314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16455490 - 16455354
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16455490 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 16455391  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455390 ccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttc 16455354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 289
Target Start/End: Original strand, 38890310 - 38890476
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  38890310 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttc 38890409  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagtttt 289  Q
    ||||  ||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  38890410 ccaatatgaatcaacc--ccaaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttt 38890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4215654 - 4215483
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||             |    
T  4215654 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 4215555  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaac 193  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  4215554 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 472 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 51015187 - 51015100
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51015187 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacaatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 51015100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 425 - 537
Target Start/End: Original strand, 11008936 - 11009049
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 523  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008936 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttttttgctgccagtgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 11009035  T
Q  524 gtgccttgcctaaa 537  Q
    ||||||||||||||    
T  11009036 gtgccttgcctaaa 11009049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 15032633 - 15032872
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |  || |||  ||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15032633 aagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttc 15032732  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    | ||  ||||||||||  ||          |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15032733 caaatatgaatcaacct-ca----------tttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgactt-ctaaacccttgtttcagc 15032819  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||| |||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  15032820 cccctttatctcaaggtttactctggtaccaagtctatatttatagtaaaagt 15032872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27499390 - 27499128
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-----------ag 123  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||||||           |     
T  27499390 agaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaa 27499291  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    ||| || | | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||   |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  27499290 agagat-attaggttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctca 27499192  T
Q  224 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagt 286  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27499191 ggatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 27499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Original strand, 37089727 - 37089854
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37089727 aacaaatctgcacctaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctcac 37089826  T
Q  533 ctaaataactaaaacctc-catcgtgcc 559  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||    
T  37089827 ctaaaaaactaaaacatctcatcgtgcc 37089854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13547502 - 13547302
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||                 
T  13547502 agaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaa 13547403  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13547402 agatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 13547303  T
Q  222 c 222  Q
    |    
T  13547302 c 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 431 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 18847114 - 18846993
Alignment:
Q  431 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcct 529  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18847114 tgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttccccgcgagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtaccacgatttttccagtacct 18847015  T
Q  530 tgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    ||||| || |||| |||||||||    
T  18847014 tgcctcaa-aactgaaacctcca 18846993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Original strand, 36919940 - 36920041
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36919940 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctactattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgacttgc 36920039  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  36920040 ct 36920041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2891540 - 2891436
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2891540 aagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 2891441  T
Q  221 ccaag 225  Q
    |||||    
T  2891440 ccaag 2891436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 38409179 - 38409078
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38409179 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgccgccaacgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgc 38409080  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  38409079 ct 38409078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 434 - 533
Target Start/End: Original strand, 31849952 - 31850052
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31849952 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccaagatttttccagtgccttgc 31850051  T
Q  533 c 533  Q
    |    
T  31850052 c 31850052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 472 - 559
Target Start/End: Original strand, 22044781 - 22044870
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct--aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||    
T  22044781 gccagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaaaatgaaacctccatcgtgcc 22044870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5101276 - 5101191
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5101276 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagatagcagccctccgttttactatatgatga 5101191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 472 - 552
Target Start/End: Original strand, 22803125 - 22803204
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  22803125 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgagccacgatttttccagtgcctttcctcaa-aactgaaacctcca 22803204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Original strand, 3824926 - 3825044
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  3824926 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgtcgccaacgcaccatcgtgccacgatgcgaccccattgtgccatgatttttccagtgctttgc 3825025  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcca 552  Q
    || || |||| |||||||||    
T  3825026 ctcaa-aactgaaacctcca 3825044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Original strand, 5637822 - 5637946
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5637822 aacaaatctgcacccaaaa-tacgtttctgtttttcgctgccagctcaccatcatgccacgatgcgatcccatcgtgacatgatttttccagtgccttgc 5637920  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || || |||| ||||||||||||||||    
T  5637921 ctcaa-aactgaaacctccatcgtgcc 5637946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28453915 - 28453686
Alignment:
Q  137 ttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacc 235  Q
    |||||||||| ||||| |   |||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28453915 ttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc 28453816  T
Q  236 cacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctcaaa 334  Q
      | ||||||||||||| || | ||||| ||||  || | ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||     
T  28453815 --ccaaccctagtgtttcttgccaagag-caaa--ctctgcaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgttttcag-actctctacctcaag 28453723  T
Q  335 gtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453722 gttcacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 28453686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24888776 - 24888675
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24888776 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgc 24888677  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  24888676 ct 24888675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Original strand, 36921848 - 36921966
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | || ||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36921848 aacaaatctgcatccaaaaatacgtttctgttattcgctgccaatgcaccatcgtgccacaatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgacttgc 36921947  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcca 552  Q
    || || |||| |||||||||    
T  36921948 ctcaa-aactgaaacctcca 36921966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5198400 - 5198299
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5198400 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgtgatcccatcgtgccacgatttttccagagctttgc 5198301  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  5198300 ct 5198299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Original strand, 14789405 - 14789495
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg---gagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  14789405 aaagaagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9863917 - 9863712
Alignment:
Q  159 taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 257  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |  | |||| ||||||||||| |    
T  9863917 taattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggtgaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgc 9863820  T
Q  258 aaagagacaaattctatacaaaccctag-ttttgttgttgcctttctaaacccttg--tttcagccccct-ctatctcaaagtttgctttgatacaaggt 353  Q
     |||| |||||  || |||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||| | || ||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  9863819 caaga-acaaa--ctctacaaaccctagtttttgtttttggc-ttctaaacccttgtttttcagctctctactatctcaaggtttcatctgatacaaggt 9863724  T
Q  354 ctatatttatag 365  Q
    ||||||||||||    
T  9863723 ctatatttatag 9863712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47563109 - 47563023
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  47563109 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataagatga 47563023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9148192 - 9148139
Alignment:
Q  481 ccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9148192 ccatcgtgccacgatgcaaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcct 9148139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 472 - 532
Target Start/End: Original strand, 22047076 - 22047135
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22047076 gccagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgcca-gatttttccagtgccttgc 22047135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 6133194 - 6133105
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  6133194 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Original strand, 16186099 - 16186173
Alignment:
Q  299 tttctaaacccttgtttc-agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16186099 tttctaaacccttgtttttagccccctctctctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 16186173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30136798 - 30136640
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||   |||||  || |||||||||  ||||| ||  ||||||||    
T  30136798 aagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttc 30136699  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaacc 281  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||    
T  30136698 ccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 47150978 - 47151092
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| || ||  ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47150978 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 47151077  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaa 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  47151078 cccaaggtgaatcaa 47151092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12102336 - 12102088
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  || ||||  | ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  12102336 aagagatatcagtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgttt 12102237  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaat-tctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttc 316  Q
    ||||| |||||||||  ||  |||||||  |||| | ||    ||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  12102236 cccaaggtgaatcaa--caacaacccta--gtttctcccgcttagagaaatctctcta-aaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttc 12102144  T
Q  317 ag-ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || ||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12102143 agcccccctctatctcaaggttttatctgatacaagatctatatttatagtaaaag 12102088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25357713 - 25357634
Alignment:
Q  299 tttctaaacccttgttt-cagcccc-----ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||| |||||||     |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357713 tttctaaacccttgttttcagcccctctcactctctctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25357634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 370
Target Start/End: Original strand, 40999072 - 40999281
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||| || || |||||||| |    || |||||||||||||     
T  40999072 ctaattctacccaaagtctcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaatctc--aatcctagtgtttgttg 40999169  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtct 355  Q
      ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||| ||||| |||| || ||||| ||||| |    
T  40999170 tcaagag-caaactctatacaacccctagttttcttgttgacgt-ctaaacccttgttttcagactc-tctacctcaaggtttactctgatataaggttt 40999266  T
Q  356 atatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||||    
T  40999267 atatttatagtaaaa 40999281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 89
Target Start/End: Original strand, 52942464 - 52942526
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg 89  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52942464 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 52942526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 7941251 - 7941193
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  7941251 ccatcgtgccaccatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 7941193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11434887 - 11434829
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  11434887 ccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 11434829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 470 - 515
Target Start/End: Original strand, 619837 - 619882
Alignment:
Q  470 ccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacga 515  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  619837 ccgccagcgcaccattgtgccacgttgcgaccccatcgtgccacga 619882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 7050379 - 7050439
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7050379 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11853609 - 11853549
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11853609 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 16185957 - 16186018
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16185957 ctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 16689303 - 16689380
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    |||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  16689303 aaaaatacgtttttattttatcctcaatcgcaccatcgtgccacgttgcgatttcatcgtggcacgatttttccagtg 16689380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 522
Target Start/End: Original strand, 4556422 - 4556494
Alignment:
Q  450 aaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcc 522  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||    
T  4556422 aaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtgccacgttgcgatttcatcgtggcacgatttttcc 4556494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16455356 - 16455284
Alignment:
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16455356 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctcggtttgctctgatacaaagcctatattaatagcaaaagt 16455284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31300580 - 31300540
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31300580 tgacctagtctggggagagagcagccctccgttccactata 31300540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16455581 - 16455510
Alignment:
Q  45 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||    
T  16455581 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata 16455510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 31985722 - 31985663
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31985722 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactat 31985663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 48486299 - 48486181
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    ||||||| |||||    
T  48486299 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcaccattgtgccacattgtgaccccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgc 48486200  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcca 552  Q
    || || |||| |||||||||    
T  48486199 ctcaa-aactgaaacctcca 48486181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 102
Target Start/End: Original strand, 54867192 - 54867239
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccct 102  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54867192 tgacccagttcggtccaatatgacctagtctggggagagagcagccct 54867239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 4556181 - 4556238
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  4556181 ctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4556238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4558371 - 4558314
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  4558371 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8529327 - 8529270
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  8529327 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9022515 - 9022362
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc-ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 255  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||||| || ||||||| | || ||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||    
T  9022515 ctaattcaacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatccc--aaccatagtgtttgtt 9022418  T
Q  256 ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
     | ||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  9022417 gccaagaga---attctctacaaaccctagttttgatgttgac-ttctaaacccttgttt 9022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15317018 - 15316961
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15317018 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15316961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 16689062 - 16689119
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  16689062 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18587026 - 18586969
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  18587026 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18586969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31300484 - 31300427
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  31300484 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 5336904 - 5336964
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5336904 ctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47868365 - 47868288
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||||| ||||||  || || |||||| ||||||||||||||||    
T  47868365 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcactatcgtggcacgattagatccaatcgtggcacgatttttccagtg 47868288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 55822325 - 55822265
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  55822325 ctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 10047387 - 10047447
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10047387 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10047447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24880431 - 24880312
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||    ||||||| |||||    
T  24880431 aacaaatctgcatccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgttgcaatcccatcgtgccgcgaaaaatccagtgacttgc 24880332  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccat 553  Q
    || || |||| ||||||||||    
T  24880331 ctcaa-aactgaaacctccat 24880312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 37313050 - 37313130
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37313050 agaaaacaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactata 37313130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 39246002 - 39246062
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39246002 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 39246062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 55822420 - 55822380
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55822420 tgacctagtatggggagagagcagctctccgatccactata 55822380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 2891640 - 2891577
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcag 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  2891640 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcag 2891577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 520
Target Start/End: Original strand, 8631792 - 8631863
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| ||| || ||| || ||||||||||    
T  8631792 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcttggcacgattttt 8631863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 49088911 - 49088860
Alignment:
Q  44 aaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagag 95  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  49088911 aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagag 49088860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 86
Target Start/End: Original strand, 3937259 - 3937309
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg 86  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3937259 agaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctg 3937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15831201 - 15831144
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15831201 ctaattctacgcaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15831144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 372
Target Start/End: Original strand, 22134936 - 22134966
Alignment:
Q  342 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134936 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22134966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 502 - 552
Target Start/End: Original strand, 22801262 - 22801311
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  22801262 ccatcgtgccacgatttttccagttccttgcctcaa-aactgaaacctcca 22801311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25699809 - 25699752
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25699809 ctaattctacc-aaagtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 514
Target Start/End: Original strand, 52942839 - 52942881
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacg 514  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52942839 gccagcgcatcatcgtgccacgttgtgaccccatcgtgccacg 52942881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5101171 - 5101130
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5101171 atcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11853705 - 11853664
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11853705 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 11853664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16489505 - 16489464
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatat 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16489505 tgacctagtctagggagagagcagctctccgttccactatat 16489464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18587123 - 18587082
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18587123 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 18587082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19323043 - 19322962
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||| |||||||||  | | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  19323043 agaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactata 19322962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 234
Target Start/End: Original strand, 31983650 - 31983727
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaac 234  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||  | ||||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31983650 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 523
Target Start/End: Original strand, 40091813 - 40091858
Alignment:
Q  478 gcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 523  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  40091813 gcaccatcgtgtcacgttgcgaccccatcatggcacgatttttcca 40091858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 54906702 - 54906631
Alignment:
Q  240 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||   || |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  54906702 aaccctagtgtttgttgcaaagagaaaa---ctttacaaaccctagttttattgttggc-ttctaagcccttgttt 54906631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5269280 - 5269220
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5269280 tgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 5269220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5396760 - 5396700
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  5396760 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6743504 - 6743444
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6743504 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactat 6743444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8529060 - 8529012
Alignment:
Q  477 cgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagt 525  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||    
T  8529060 cgcaccatcgtggcacgatgcggcttcatcgtggcacgatttttccagt 8529012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15317114 - 15317074
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  15317114 tgacctagtctggggagagagcagctctctgttccactata 15317074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 74
Target Start/End: Original strand, 24446630 - 24446677
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaat 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  24446630 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat 24446677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36315318 - 36315258
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36315318 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36315258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36329527 - 36329467
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36329527 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36329467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Original strand, 52043737 - 52043765
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043737 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 52043765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 140)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 15 - 559
Target Start/End: Original strand, 1046888 - 1047443
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaa-cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1046888 gagaagaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccact 1046987  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1046988 atatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 1047087  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1047088 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctt 1047187  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataac 391  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||        ||||  || ||   |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1047188 ttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctctcttagattagcttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaac 1047287  T
Q  392 aaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgcca 491  Q
    |||||||| ||           ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047288 aaatctgctta-----------aaatctgtaac-aaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgcca 1047375  T
Q  492 cgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1047376 cgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 1047443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 40836707 - 40837105
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40836707 gagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 40836806  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  40836807 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagac 40836906  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836907 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 40837006  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  |||||||||||    
T  40837007 tctaaacccttctttcagccccctcaatctccaaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgc 40837105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 399
Target Start/End: Original strand, 1049264 - 1049658
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaa-cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatg 117  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049264 gaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatg 1049363  T
Q  118 atga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaa 205  Q
    ||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1049364 atgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaa 1049463  T
Q  206 tcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 304  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049464 tcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 1049563  T
Q  305 aacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  1049564 aacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 1049658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38394311 - 38393935
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38394311 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 38394212  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38394211 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 38394112  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394111 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 38394012  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394011 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38393935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35954 - 35555
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  35954 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccacta 35855  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35854 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 35755  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35754 ctcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtct 35655  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  35654 ttctgaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 35555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25542855 - 25542472
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccac 111  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25542855 gtgagaagaacacaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccac 25542756  T
Q  112 tatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagag 199  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25542755 tatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagag 25542656  T
Q  200 agtcaatcctaacagtgtttcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25542655 actcaatcctaatagtctttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacct 25542556  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaat 384  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25542555 ttctaaacctttgtttcag-cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaat 25542472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 7469984 - 7470359
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccac 111  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7469984 gtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccac 7470083  T
Q  112 tatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    ||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7470084 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaga 7470183  T
Q  199 gagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc 297  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470184 gactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgc 7470283  T
Q  298 ctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7470284 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7470359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 48457978 - 48457602
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48457978 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccacta 48457879  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48457878 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 48457779  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457778 ctcaatcctaatagtgtttccctaggtgaatgaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 48457679  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48457678 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 48457602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 7471942 - 7472317
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccac 111  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7471942 gtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccac 7472041  T
Q  112 tatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    ||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7472042 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaaga 7472141  T
Q  199 gagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc 297  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472142 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgc 7472241  T
Q  298 ctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7472242 ttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7472317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3878902 - 3878497
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3878902 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 3878803  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3878802 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagaga 3878703  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3878702 ctcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtct 3878603  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctat----atttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaa 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||   ||||||||| |  |||||    
T  3878602 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatattaatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaa 3878503  T
Q  394 atctgc 399  Q
    ||||||    
T  3878502 atctgc 3878497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22137169 - 22136928
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22137169 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 22137070  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137069 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 22136970  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136969 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 22136928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 40552196 - 40551955
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40552196 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 40552097  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552096 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 40551997  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551996 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 40551955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Original strand, 9027396 - 9027637
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9027396 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 9027495  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027496 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 9027595  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027596 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 9027637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22108158 - 22107917
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22108158 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 22108059  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108058 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 22107959  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22107958 cttgcccaaaaaactaaaacctgcatcgtgccgcgaagccca 22107917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 40549918 - 40549677
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40549918 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 40549819  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549818 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 40549719  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40549718 cttgcccaaaaaactaaaacctgcatcgtgccgcgaagccca 40549677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44889 - 44517
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||    
T  44889 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccacta 44790  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  44789 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaaga 44690  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44689 ctcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcct 44590  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44589 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 44517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44724883 - 44724533
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||                 
T  44724883 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 44724784  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44724783 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 44724684  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724683 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 44724584  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||| |||||| | |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44724583 ccctatatctccaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 44724533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3036049 - 3035670
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3036049 gagaagaacacaaagaagagaggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 3035950  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttc---cggtaaccaag 197  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  3035949 tatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaag 3035850  T
Q  198 agagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttg 296  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3035849 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttg 3035750  T
Q  297 cctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035749 cctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3035670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 45 - 399
Target Start/End: Original strand, 27306224 - 27306592
Alignment:
Q  45 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatc 130  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||| |||    
T  27306224 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatc 27306323  T
Q  131 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaa 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27306324 aatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27306423  T
Q  230 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 329  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306424 tcaaccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27306522  T
Q  330 tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  27306523 tcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 27306592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40946653 - 40946277
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40946653 gagaagaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccacta 40946554  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40946553 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagaga 40946454  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946453 ctcaatcctaatagtgttttccaaagtaaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 40946354  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctct----atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  40946353 ttctaaacccttgtttcagccccctctgtccctctcaaagtttgctatgaaacaaggtttatatttatagtgaaagt 40946277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20299785 - 20299407
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20299785 gagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccacta 20299686  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20299685 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 20299586  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaa-ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20299585 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtc 20299486  T
Q  299 tttctaaaccc-ttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299485 attctaaaccccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 20299407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18345866 - 18345490
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18345866 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccacta 18345767  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  18345766 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagaga 18345667  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345666 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 18345567  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctat----ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345566 ttctaaacccttgtttcaaccccctctatctccctcaaagttcagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20626342 - 20625990
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20626342 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 20626243  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20626242 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20626143  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626142 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 20626043  T
Q  321 ccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20626042 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20625990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20630233 - 20629881
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20630233 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 20630134  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20630133 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20630034  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630033 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 20629934  T
Q  321 ccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20629933 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20629881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20642652 - 20642300
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20642652 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 20642553  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20642552 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20642453  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642452 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 20642353  T
Q  321 ccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||    |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20642352 ccctctatctctctcaaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaa 20642300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1850301 - 1849975
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatga 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850301 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatga 1850202  T
Q  119 tga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaa 205  Q
    |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||    
T  1850201 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaa 1850102  T
Q  206 tcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 304  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1850101 tcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttcta 1850002  T
Q  305 aacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1850001 aacccttgtttcagccccctctatctc 1849975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 31155892 - 31156247
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||             
T  31155892 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgtta 31155991  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  31155992 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgt 31156091  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156092 ttcccaaggtgaatcaacccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 31156191  T
Q  317 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31156192 agccccctctatctcaaagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagt 31156247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 31435022 - 31435383
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  31435022 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagt 31435120  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31435121 aactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 31435220  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435221 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 31435320  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31435321 ttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 31435383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 20137085 - 20137444
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||       
T  20137085 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagta 20137183  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||| |||    
T  20137184 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaa 20137283  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137284 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaaccct 20137383  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  20137384 tgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagccaatatttatagtaaaag 20137444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 13099459 - 13099812
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||                
T  13099459 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 13099558  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  13099559 aaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgttt 13099658  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  13099659 cccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaa 13099758  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13099759 ccccctctatctcaaggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 13099812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20297687 - 20297311
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20297687 gagaagaacacaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 20297588  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  20297587 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaga 20297488  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20297487 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcca 20297388  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20297387 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtccatatttttagtaaaagt 20297311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 7351615 - 7351994
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7351615 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccact 7351714  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  7351715 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 7351814  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7351815 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcc 7351914  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7351915 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 7351994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 329 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 2935349 - 2935120
Alignment:
Q  329 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaa 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||    
T  2935349 ctcagagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaa-----------aatctgtaacaaaa 2935261  T
Q  429 actgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935260 actgtaacaaatctgctctcaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 2935161  T
Q  529 ttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935160 ttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 2935120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 370
Target Start/End: Original strand, 37412110 - 37412462
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||                
T  37412110 agaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaa 37412209  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
      ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37412210 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 37412309  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc-aaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37412310 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttca 37412409  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||| |||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37412410 gccccctatatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 37412462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21680232 - 21679981
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21680232 aagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 21680133  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680132 ccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 21680033  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21680032 cccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 21679981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 43253481 - 43253860
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43253481 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccacta 43253580  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  43253581 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagaga 43253680  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43253681 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtca 43253779  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagcc--------ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||| |||||||||||||        | |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253780 ttctaaaaccttgtttcagccctctttctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43253860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11355562 - 11355212
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||                 
T  11355562 agaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactatatgatgagaaacgttacaaa 11355463  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11355462 aaagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 11355363  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355362 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 11355263  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11355262 ccctctatctcaaggtttacactgatacaaagcctatatttatagtaaaag 11355212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28487873 - 28487502
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatga 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  28487873 gaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactatatga 28487774  T
Q  119 tga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaa 205  Q
    |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28487773 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaa 28487674  T
Q  206 tcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 304  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28487673 tcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttcta 28487574  T
Q  305 aacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28487573 aacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacatggtctatatttataggaaaagt 28487502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 42330982 - 42331335
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| | |||||||| ||||                 
T  42330982 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactatataatgagtaactttacaaa 42331081  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggt--aaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42331082 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42331181  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42331182 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag 42331281  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42331282 ccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 42331335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 443900 - 443548
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg--agagagcagccctccgatccactatatgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||                
T  443900 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttataa 443801  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  443800 aagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttc 443701  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  443700 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgttttagc 443601  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     ||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  443600 tccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 443548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28485885 - 28485515
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgat 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||    
T  28485885 gaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgaggagagagcaaccctctgattcattatatgat 28485786  T
Q  120 ga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaat 206  Q
    ||             |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||    
T  28485785 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaat 28485686  T
Q  207 cctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 305  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485685 cctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 28485586  T
Q  306 acccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485585 acccttgtttcaaccccttctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 28485515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 372
Target Start/End: Original strand, 7349287 - 7349615
Alignment:
Q  65 cggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtc 151  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349287 cggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 7349386  T
Q  152 tcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtg 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7349387 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 7349486  T
Q  250 tttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgcttt 343  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||    |    
T  7349487 tttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcct 7349586  T
Q  344 gatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349587 gatacaaggtctatatttatagtaaaagt 7349615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24748899 - 24748548
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||                
T  24748899 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 24748800  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  24748799 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttc 24748700  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24748699 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagc 24748600  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||  ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24748599 cccctctaagtcaaagtttacactgatacaatgtctatatttataataaaag 24748548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 133 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26804765 - 26804499
Alignment:
Q  133 tgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26804765 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 26804666  T
Q  232 aacccacaaacccta---gtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 328  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804665 aaccctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 26804566  T
Q  329 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  26804565 ctcaaagtttact----cacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 26804499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 4295910 - 4296271
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||||       
T  4295910 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactatatgatgagta 4296008  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4296009 acgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 4296108  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
     |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4296109 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccc 4296208  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatac-aaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4296209 ttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaatgtctatatttatagtaaaag 4296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11757435 - 11757177
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11757435 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 11757336  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaa-ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc-ttgtttca 317  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  11757335 ccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtttca 11757236  T
Q  318 gccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757235 gccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11757177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21990454 - 21990106
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||                 
T  21990454 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 21990355  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||     
T  21990354 agagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttct 21990255  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  21990254 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-c 21990156  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21990155 ccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 21990106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25276346 - 25276095
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25276346 aagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 25276247  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||    
T  25276246 ccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaattattgttttagc 25276147  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25276146 cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 25276095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21678264 - 21678020
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  21678264 atcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 21678165  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678164 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 21678065  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21678064 atctcaaggtttacattgatacaatatctatatttatagtaaaag 21678020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 338
Target Start/End: Original strand, 21592119 - 21592445
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||       
T  21592119 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagta 21592217  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              |||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  21592218 acgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaa 21592317  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  21592318 tagtgcttgccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctt 21592417  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagttt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592418 tgtttcagccccctctatctcaaagttt 21592445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9679361 - 9679009
Alignment:
Q  38 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 123  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||||             ||    
T  9679361 aacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaag 9679262  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9679261 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 9679162  T
Q  224 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
    || |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  9679161 aggtgaatcaatcctcaaacc-tagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccc 9679063  T
Q  322 cctctatctc----aaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||    ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9679062 cctctatctctctcaaagtttacatctgatacaagatctatatttatagtaaaa 9679009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9681124 - 9680768
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||                 
T  9681124 agaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaa 9681025  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9681024 agatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9680925  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9680924 cgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaac 9680825  T
Q  320 cccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||    |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680824 cccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 9680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 39146071 - 39146322
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||     
T  39146071 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttt 39146170  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39146171 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcagc 39146270  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||| ||||||| |||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39146271 cccctccatctcaaggtttacactgatacagtgtctatatttatagtaaaag 39146322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Original strand, 7092177 - 7092431
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7092177 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgattcactat 7092276  T
Q  115 atgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||     
T  7092277 atgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagac 7092376  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 255  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7092377 tcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 7092431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38396959 - 38396713
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38396959 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccacta 38396860  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  38396859 tatgatgagtaaagttacaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 38396760  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctag 247  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38396759 tcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 371
Target Start/End: Original strand, 27832716 - 27832969
Alignment:
Q  120 gaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27832716 gaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27832815  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27832816 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatgttgccaagagacaaactctatacaaaccttagttctgttgttgcctttttaaacccttgtttcag 27832915  T
Q  319 c-cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    | || ||||||| ||| ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||    
T  27832916 ctccactctatcacaaggtttgctctgatacacaacctatatttatagtaaaag 27832969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 372
Target Start/End: Original strand, 22251641 - 22251878
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||| |    
T  22251641 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggt 22251732  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22251733 gaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctcctct 22251832  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22251833 atctcaaagtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaaagt 22251878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42223471 - 42223110
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||       
T  42223471 aaagaagaga-gaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgagta 42223373  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42223372 acgttacaaaagagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 42223273  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42223272 tagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccc 42223173  T
Q  310 ttgtttcagccc-cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42223172 ttgtttcatcccacatctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 42223110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24258668 - 24258423
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||  || |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  24258668 aagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 24258569  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258568 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 24258469  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 365  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||||||||    
T  24258468 cccctctatctcaatgtttactctgatacaaaacctatatttatag 24258423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 22828717 - 22828969
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  22828717 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 22828816  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    | ||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828817 ctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagc 22828916  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| |||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22828917 cccctctatctcaaggtttactcggatacaaagcctatatttatagtaaaagt 22828969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 208 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567566
Alignment:
Q  208 ctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 306  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 18567632  T
Q  307 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18567631 cccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 18567566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Original strand, 7094424 - 7094678
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7094424 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcacta 7094523  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||    
T  7094524 tatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagaga 7094623  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 255  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7094624 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta-tgtttgtt 7094678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 128 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 7188737 - 7188496
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  7188737 atcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggt 7188638  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7188637 gaatcaacccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctatacaaaccctatttttattgttgactt-ctaaacccttgtttcagccccctct 7188542  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7188541 atctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 7188496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Original strand, 24817438 - 24817682
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg-ttt 219  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| | || |||    
T  24817438 aagagacatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgcttt 24817537  T
Q  220 cccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    || | ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||     
T  24817538 ccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttgac-ttctaaacccttgtttcag- 24817631  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24817632 cccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatattaaa 24817682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 20091629 - 20091877
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20091629 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttc 20091728  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 318  Q
    |||| |||||||||||  | ||||||| | |||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||    
T  20091729 ccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-tccgaaacccttgttttcag 20091823  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20091824 ccccctctatctcaaggtttactctgataaaaagtctatatttatagtaaaagt 20091877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22392606 - 22392426
Alignment:
Q  181 ctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaa 279  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| | || || |||||||||||||||    
T  22392606 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca---accctagtgtttgttgccaatag-caaattctatacaaa 22392511  T
Q  280 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||  ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22392510 ccctagtttgatt--------tataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22392426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2935575 - 2935374
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    ||||||||||||   |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  2935575 agaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 2935476  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  2935475 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 2935376  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  2935375 tc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22137404 - 22137184
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22137404 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T
Q  111 ctatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  22137305 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 22137207  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  22137206 gactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40552431 - 40552211
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40552431 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T
Q  111 ctatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  40552332 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 40552234  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  40552233 gactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 296
Target Start/End: Original strand, 24813593 - 24813755
Alignment:
Q  131 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  24813593 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaa 24813692  T
Q  230 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttg 296  Q
    |||||||   ||||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813693 tcaaccc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22108393 - 22108173
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22108393 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T
Q  111 ctatatgatg------------aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| |||||            |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  22108294 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaaga 22108196  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  22108195 gactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40550153 - 40549933
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40550153 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T
Q  111 ctatatgatg------------aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| |||||            |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  40550054 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaaga 40549956  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  40549955 gactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24465735 - 24465503
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gt 226  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  24465735 atcaatgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggt 24465636  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    |||||||  |   |||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24465635 gaatcaattc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctct 24465548  T
Q  327 atctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||| |||| | | |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24465547 atctcaaggtttacatctgatacaaagtctatatctatagtaaaa 24465503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1606686 - 1606486
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    ||||||||||||   |||||  ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  1606686 agaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 1606587  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1606586 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 1606488  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  1606487 tc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 9027176 - 9027376
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    ||||||||||| |  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||              
T  9027176 agaagaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttac 9027275  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  9027276 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 9027374  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  9027375 tc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 369
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094759
Alignment:
Q  276 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaa 7094759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 369
Target Start/End: Original strand, 7092414 - 7092512
Alignment:
Q  276 caaaccctagt-tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7092414 caaaccctagtgtttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctccatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 7092512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 472 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 25542427 - 25542348
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  25542427 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttcaagtgccttgccttaa-aactgaaacctcca 25542348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Original strand, 27306582 - 27306700
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27306582 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgctagcgcaccatcgtgccacgaagcgaccccatcgtgccacgatttttccaatgacttgc 27306681  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcca 552  Q
    || || |||| |||||||||    
T  27306682 ctcaa-aactgaaacctcca 27306700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 435 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 44499 - 44401
Alignment:
Q  435 acaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44499 acaaatctgcacccaaaaatatgtttatgttatttgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccatgatttttccagtgctttgc 44401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 472 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3878469 - 3878407
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3878469 gccagcgtaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcct 3878407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38396370 - 38396316
Alignment:
Q  271 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396370 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 38396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 35565 - 35464
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35565 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgctatttgctgccagcgcacgatcgggccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgc 35466  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  35465 ct 35464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 11759452 - 11759364
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccct 102  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11759452 gagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccct 11759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1606472 - 1606423
Alignment:
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606472 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 1606423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Original strand, 40837144 - 40837201
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40837144 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 40837201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22394027 - 22393876
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||                
T  22394027 agaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 22393928  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaa 172  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22393927 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11081651 - 11081522
Alignment:
Q  181 ctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaa 279  Q
    ||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    |||||||||||||||| | ||||||   ||||| ||||||    
T  11081651 ctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaatctc--aaccctagtgtttgttgccaagaga---attctctacaaa 11081557  T
Q  280 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11081556 ccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgttt 11081522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6348987 - 6348933
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 175  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6348987 aagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 6348933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26295652 - 26295598
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26295652 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtc 26295598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 55956 - 56015
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55956 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctccaatccactat 56015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3677301 - 3677235
Alignment:
Q  303 taaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3677301 taaacccttgtttcagcccc-tctatctccaagtttactctgattcaagatctatatttatagtaaaa 3677235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6049038 - 6048885
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc--ccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 255  Q
    ||||||||| |||||||| ||   |||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||  | | ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  6049038 ctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcc-caaacc-tagtgtttgtt 6048941  T
Q  256 ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
     | ||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6048940 gccaagaga---attctttacaaaccctagttttgatgttggc-ttctaaacccttgttt 6048885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26804823 - 26804762
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg 88  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26804823 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2120959 - 2120899
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2120959 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2120899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 3320172 - 3320232
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3320172 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 3324920 - 3324980
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3324920 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7069840 - 7069780
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7069840 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7074847 - 7074787
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7074847 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Original strand, 16297145 - 16297222
Alignment:
Q  157 tctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  16297145 tctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25351413 - 25351353
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25351413 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25357107 - 25357047
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25357107 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25405453 - 25405393
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25405453 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25410190 - 25410130
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25410190 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40946244 - 40946167
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  40946244 aaaaatatgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtgacacgatttttccagtg 40946167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42006723 - 42006663
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42006723 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1849962 - 1849918
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1849962 tctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtaaaagt 1849918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6348903 - 6348778
Alignment:
Q  240 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagttt 338  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  6348903 aaccctaatgtttgttgccaagag-caaactcgatacaaaccctagttttcttttttactt-ctaaacccttgttttcagtcctctctatctcaatgttt 6348806  T
Q  339 gctt-tgatacaaggtctatatttatag 365  Q
     | | ||||||||||| |||||||||||    
T  6348805 acatctgatacaaggtttatatttatag 6348778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 372
Target Start/End: Original strand, 30906327 - 30906386
Alignment:
Q  313 tttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30906327 tttcagccccctctatctcaagatttactcttatacaaggtctatatttatagcaaaagt 30906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30247030 - 30246973
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  30247030 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 30246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 44512647 - 44512704
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  44512647 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 8378626 - 8378686
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  8378626 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 15541117 - 15541177
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15541117 ctaattatacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 18567510 - 18567431
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  18567510 gccagcgcaccatcgtgccaagttgtgaccccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgcctcaa-aactgaaacctcca 18567431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 552
Target Start/End: Original strand, 31435439 - 31435518
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  31435439 gccagcgcaccatcgtgccaagttgtgaccccatcgtgccacgaaaaatccagtgacttgcctcaa-aactgaaacctcca 31435518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Original strand, 44143997 - 44144045
Alignment:
Q  168 ccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  44143997 ccaaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44144045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 46516399 - 46516339
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46516399 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 46516339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Original strand, 6067173 - 6067264
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaa-attgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  6067173 aaagaaaagaagaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactata 6067264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9190097 - 9190038
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9190097 tgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 9190038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Original strand, 20284097 - 20284156
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20284097 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 20284156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21678361 - 21678286
Alignment:
Q  45 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgat 119  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  21678361 aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactatatgat 21678286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24258742 - 24258691
Alignment:
Q  65 cggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24258742 cggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactata 24258691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26210709 - 26210500
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtccc-agcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc-ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 254  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||    
T  26210709 ctaattctaccgaaagtcccgaatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaatc-acaa-ccctagtgtt-gt 26210613  T
Q  255 tccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggt 353  Q
    | | ||||||   ||||| |||||||||||||||||  ||||  || ||||| |||||||||  ||||| || |||||| |||| | ||||||||||| |    
T  26210612 tgccaagaga---attctctacaaaccctagttttgaggttggatt-ctaaaaccttgtttcctccccc-ctctctcaaggtttacatttgatacaagtt 26210518  T
Q  354 ctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  26210517 ctatatttatactaaaag 26210500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 83
Target Start/End: Original strand, 39145971 - 39146018
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagt 83  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39145971 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagt 39146018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 495
Target Start/End: Original strand, 1049648 - 1049710
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049648 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcaccttcgtgccacgat 1049710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6332425 - 6332179
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccc-gtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg-tt 218  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||| ||  ||||||  || ||||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  6332425 aagagatattaaagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 6332326  T
Q  219 tcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgt-tgcctttctaaacccttgttt-c 316  Q
    ||| || |||||||| |    || ||||||||||||| | |||||  ||| |||||  ||||||||| | |||||| ||  ||| ||||||||||||| |    
T  6332325 tccaaactgaatcaatc--tcaatcctagtgtttgttgccaagag-taaactctat--aaaccctag-tctgttgtatg--tttataaacccttgtttcc 6332234  T
Q  317 agccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||| |||| ||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6332233 agccccctctctctc-aaggttactctgatacaagttttatatttatagtaaaagt 6332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21680307 - 21680245
Alignment:
Q  60 cagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  21680307 cagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactatatgatga 21680245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 473 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 22392369 - 22392319
Alignment:
Q  473 ccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcca 523  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  22392369 ccagcgcaccatcgtaccacgttgcgatcccatcgtggcacgatttctcca 22392319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 502 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 26804462 - 26804413
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  26804462 ccatcgtgccacgatttttccactgccttgcctcaa-aactgaaacctcca 26804413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 34546985 - 34547042
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  34546985 ctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 34547042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2121056 - 2121015
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2121056 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 2121015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 3320076 - 3320117
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3320076 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3320117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 3324824 - 3324865
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3324824 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3324865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5817353 - 5817300
Alignment:
Q  60 cagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5817353 cagttcggtccaatatgacctactctggggagagagcagctctccaatccacta 5817300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25405549 - 25405508
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25405549 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25405508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38396268 - 38396239
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396268 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38396239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 21983292 - 21983352
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  21983292 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 21983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 29159811 - 29159871
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29159811 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 42006456 - 42006404
Alignment:
Q  480 accatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42006456 accatcgtgccacgttacgattccatcgtgccacgattttttcagtgacttgc 42006404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 44143892 - 44143932
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  44143892 tgacctagtctggggagagagcaactctccgttccactata 44143932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 139)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51750354 - 51749955
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51750354 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 51750255  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51750254 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 51750155  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750154 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 51750055  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  51750054 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 51749955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28840994 - 28840594
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28840994 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 28840895  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  28840894 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 28840795  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28840794 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctt 28840695  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctg 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  ||||||||||    
T  28840694 tctaaacccttgtttcatccccctgtatctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctg 28840595  T
Q  399 c 399  Q
    |    
T  28840594 c 28840594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13762151 - 13761753
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  13762151 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccacta 13762052  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     
T  13762051 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagac 13761952  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaagt-gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13761951 tcaatcctaatagtgttttccaagttgaatcaacccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctt 13761852  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  13761851 tctaaacccttgtttcagccctctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 13761753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16226483 - 16226062
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16226483 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 16226384  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16226383 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 16226284  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16226283 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgct 16226184  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctg 398  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  16226183 tttctaaacccttgttttagacccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatcta 16226084  T
Q  399 cctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    | ||| || |||||||||||||    
T  16226083 cttaaaatctgtaacaaatctg 16226062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 10399794 - 10400193
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10399794 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 10399893  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  10399894 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 10399993  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  10399994 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtca 10400093  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  10400094 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcccagtttgctctgatacaaggtctatatttatagaaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 10400193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 47180028 - 47179604
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47180028 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggagagagcagccctccaatccacta 47179929  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  47179928 tatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 47179829  T
Q  202 tc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47179828 tccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctt 47179729  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47179728 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaat 47179629  T
Q  396 ctgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    || | ||| || |||||||||||||    
T  47179628 ctacttaaaatctgtaacaaatctg 47179604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15823849 - 15823462
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||       
T  15823849 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagta 15823751  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||    
T  15823750 acgttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaa 15823651  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823650 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 15823551  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  15823550 tgtttcagccccctttatctctaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 15823462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 31735487 - 31735863
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31735487 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 31735586  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31735587 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 31735686  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735687 ctcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 31735786  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatc----tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735787 ttctaaacccttgttttagccccctctatctcattcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31735863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2617817 - 2617460
Alignment:
Q  29 gaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------ 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  2617817 gaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacg 2617718  T
Q  122 -------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacag 214  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  2617717 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 2617618  T
Q  215 tgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2617617 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgt 2617518  T
Q  314 ttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2617517 ttcagcctcctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaag 2617460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28842809 - 28842436
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  28842809 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccacta 28842710  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||     
T  28842709 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagac 28842610  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842609 tcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 28842510  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28842509 tctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 28842436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51752678 - 51752281
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51752678 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 51752579  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    |||| |||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  51752578 tatggtgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagac 51752479  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  51752478 tcaatc-taatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctt 51752380  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  51752379 tctaaactcttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 51752281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20302756 - 20302401
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||             
T  20302756 gagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgtta 20302657  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20302656 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtt 20302557  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302556 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 20302457  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20302456 gccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaaagtt 20302401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 47177677 - 47177253
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47177677 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctggggagagagcagccctccaatccacta 47177578  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  47177577 tatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 47177478  T
Q  202 tca-atcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47177477 tcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctt 47177378  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47177377 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaat 47177278  T
Q  396 ctgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    || | ||| || |||||||||||||    
T  47177277 ctacttaaaatctgtaacaaatctg 47177253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 38 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6822931
Alignment:
Q  38 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             ||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaag 6823207  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  6823206 agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttccca 6823107  T
Q  224 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 322  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823106 aggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 6823008  T
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  6823007 ctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 6822931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20291771 - 20291390
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20291771 gagaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccacta 20291672  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||     
T  20291671 tatgatgagaatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagac 20291572  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291571 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 20291472  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaa 382  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20291471 tctaaacccttgtttcatctccctctatctcaaaatttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaa 20291390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39932389 - 39932017
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg--agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  39932389 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccact 39932290  T
Q  113 atatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagag 199  Q
    |||||||||             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  39932289 atatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagag 39932190  T
Q  200 agtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932189 attcaatcctaatagtgtttcccaaggttaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc 39932090  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  39932089 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagttttgtctcatacaaggtctatatttatagtaaa 39932017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 323
Target Start/End: Original strand, 46431683 - 46431996
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg---agagagcagccctccgatccactatatgatga- 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46431683 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgag 46431782  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  46431783 tatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 46431882  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46431883 atagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaaccc 46431982  T
Q  310 ttgtttcagccccc 323  Q
    ||||||||||||||    
T  46431983 ttgtttcagccccc 46431996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24325980 - 24325599
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccac 111  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  24325980 gtgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcac 24325881  T
Q  112 tatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    ||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24325880 tatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaaga 24325781  T
Q  199 gagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc 297  Q
    || |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325780 gactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 24325681  T
Q  298 ctttctaaacccttgtttcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325680 ctttct-aacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24325599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 27336927 - 27337280
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |    
T  27336927 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 27337026  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27337027 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttccc 27337126  T
Q  223 aa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337127 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 27337225  T
Q  322 cctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||    |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337226 cctctatctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27337280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13215375 - 13214997
Alignment:
Q  41 acaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------agag 125  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||             ||||    
T  13215375 acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagag 13215276  T
Q  126 aaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13215275 aaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 13215176  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215175 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 13215076  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  13215075 ccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 13214997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 15294800 - 15295183
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15294800 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcacta 15294899  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15294900 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagaga 15294999  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295000 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 15295099  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta--------------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||              |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15295100 ttctaaacccttgtttcagccctctctatctctctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaa 15295183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 38925459 - 38925816
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat-atgatgaa-- 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||  ||      
T  38925459 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgttttactatgatgagtaacg 38925557  T
Q  123 --------gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacag 214  Q
            |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  38925558 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 38925657  T
Q  215 tgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 313  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38925658 tgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgt 38925757  T
Q  314 ttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925758 ttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38925816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 85 - 369
Target Start/End: Original strand, 21948225 - 21948526
Alignment:
Q  85 tggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21948225 tggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaa 21948324  T
Q  172 agtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattc 271  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21948325 agtcccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactc 21948424  T
Q  272 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagta 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  21948425 tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagta 21948524  T
Q  368 aa 369  Q
    ||    
T  21948525 aa 21948526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 27339118 - 27339472
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------a 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||            |    
T  27339118 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 27339217  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||    
T  27339218 gagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttccc 27339317  T
Q  223 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27339318 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagccc 27339417  T
Q  322 cctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||    |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339418 cctctatctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27339472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 39462822 - 39462435
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgaa-- 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||      
T  39462822 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgaata 39462724  T
Q  123 -----------gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
               |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39462723 acttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 39462624  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  39462623 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctt 39462524  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |  |||||||||||    
T  39462523 tgtttcagccttctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtattacttaaaatttggaacaaatctgc 39462435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 47906573 - 47906207
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  47906573 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagta 47906475  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47906474 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 47906375  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47906374 tagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgccattctaaaccct 47906275  T
Q  311 tgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906274 tgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 47906207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 17324623 - 17324974
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  17324623 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 17324722  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17324723 agagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 17324822  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17324823 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgttttagcc 17324922  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||| |||||  | |||| || || | |||||||||||||||||||||||||    
T  17324923 ccctgtatcttcaggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagt 17324974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41647214 - 41646836
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  41647214 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41647115  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  41647114 agagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcc 41647015  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41647014 caaggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagcc 41646915  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  41646914 ccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 41646836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 14097956 - 14098308
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  14097956 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 14098055  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  14098056 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 14098155  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||     
T  14098156 ccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcagt 14098255  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14098256 cccctctatctcaaagtttagtttgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 14098308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 9463227 - 9463588
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  9463227 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgtta 9463326  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgt 217  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9463327 caaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgt 9463426  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463427 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 9463526  T
Q  317 agccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463527 agccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 9463588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 2510308 - 2510666
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||             
T  2510308 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacttta 2510407  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  2510408 caagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 2510506  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2510507 ttccaaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttc 2510606  T
Q  317 agccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510607 agccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2510666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 9459400 - 9459761
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  9459400 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgtta 9459499  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgt 217  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9459500 caaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgt 9459599  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9459600 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttc 9459699  T
Q  317 agccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459700 agccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 9459761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 12302483 - 12302848
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||       
T  12302483 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagta 12302581  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              |||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12302582 acgttacaaaagagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 12302681  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12302682 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaaccct 12302781  T
Q  311 tgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302782 tgtttcagccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 12302848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18307403 - 18307054
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||                 
T  18307403 agaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaa 18307304  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18307303 agagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18307204  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307203 cgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18307104  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18307103 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaa 18307054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 50076650 - 50077009
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||       
T  50076650 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagta 50076748  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50076749 actttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 50076848  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50076849 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaatcct 50076948  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50076949 tgtttcagccctttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50077009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 371
Target Start/End: Original strand, 50307540 - 50307884
Alignment:
Q  43 aaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaa 128  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||             |||||      
T  50307540 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatg 50307639  T
Q  129 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tg 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50307640 tcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 50307739  T
Q  228 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  50307740 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttttttcagccccatat 50307839  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  50307840 atctcaaggtttactttgatacaaagcttatatttatagtaaaag 50307884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 6995687 - 6996038
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||                 
T  6995687 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaa 6995786  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  6995787 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 6995886  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6995887 caaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggcc 6995986  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6995987 ccctctatctcaagatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagt 6996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 121 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6824087 - 6823800
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaacc-------aagagagtcaatcctaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||       |||||| |||||| ||| |    
T  6824087 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgtaata 6823988  T
Q  214 gtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823987 gtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 6823888  T
Q  313 tttcagc-cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  6823887 tttcagcccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 6823800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 17186114 - 17186465
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||                
T  17186114 agaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaa 17186213  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  17186214 aagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttc 17186313  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17186314 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagc 17186413  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  17186414 cccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaatctatatttatattaaaag 17186465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 48665373 - 48665114
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttcc-ggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48665373 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 48665274  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca- 317  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48665273 ctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaa 48665174  T
Q  318 -----gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
          |||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48665173 ccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 48665114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 28207046 - 28207431
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat-atgatgaa- 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||  ||     
T  28207046 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatgatgagtaac 28207144  T
Q  123 ---------gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaaca 213  Q
             ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |    
T  28207145 gttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaata 28207244  T
Q  214 gtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 312  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28207245 gtgtttcccaaggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttg 28207344  T
Q  313 tttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  28207345 tttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 28207431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16428957 - 16428596
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||      
T  16428957 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagt 16428859  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16428858 aaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 16428759  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428758 atagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 16428659  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  16428658 ttgtttcagccccctctatctaatggtttgctctgatataaaacctatatttatagtaaaagt 16428596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18839891 - 18839531
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | ||||||| ||||||      
T  18839891 aaagaagaga-gaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagt 18839793  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18839792 aaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatccta 18839693  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18839692 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctatctaaaccc 18839593  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18839592 ttgtttcagccccctctatctcatggtttacaataatacaatgtctatatttatagtaaaag 18839531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 28998240 - 28998591
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| |||||||||                 
T  28998240 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaa 28998339  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28998340 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28998439  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28998440 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcc 28998539  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28998540 tcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 28998591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 29003956 - 29004307
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| |||||||||                 
T  29003956 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaa 29004055  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29004056 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 29004155  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29004156 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcc 29004255  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29004256 tcctctatctcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 29004307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31490206 - 31489859
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa------------- 122  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||                 
T  31490206 agaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggggagagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaa 31490107  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  31490106 gagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttccc 31490007  T
Q  223 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31490006 aaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaa--ctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcaaccc 31489909  T
Q  322 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31489908 cctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 31489859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 50078798 - 50079158
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatgaa- 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | ||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||     
T  50078798 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaat 50078896  T
Q  123 ------------gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
                |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  50078897 aactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatccta 50078996  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  50078997 atagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtctttctaaaccc 50079096  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50079097 ttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 50079158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 11457453 - 11457812
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||       
T  11457453 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactatatgatgagta 11457551  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  11457552 actttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataa 11457651  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11457652 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccat 11457751  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11457752 tgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 11457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 9241072 - 9241424
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  9241072 agaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 9241171  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| | |||||     
T  9241172 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttt 9241271  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 318  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9241272 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagc 9241370  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9241371 ccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagt 9241424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 350
Target Start/End: Original strand, 31424993 - 31425335
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||       
T  31424993 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggagagagcagccttccgtttcactataatgatgagta 31425091  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag---tcaatcc 208  Q
              ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||    |||||||    
T  31425092 accttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcc 31425191  T
Q  209 taacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 306  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425192 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 31425291  T
Q  307 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaa 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  31425292 cccttgtttcagccccctttatctcaaggtttacattgatacaa 31425335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 2949219 - 2949569
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||             |    
T  2949219 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaa 2949318  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    ||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2949319 gagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttccc 2949418  T
Q  223 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
    ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2949419 aaggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccc 2949518  T
Q  322 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  2949519 cctctatctcaaggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagt 2949569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Original strand, 4131362 - 4131676
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  4131362 agaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 4131461  T
Q  122 -agagaaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
     |||||||    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4131462 aagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 4131560  T
Q  217 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4131561 tttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgttt 4131660  T
Q  316 cagccccctctatctc 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  4131661 cagccccctctatctc 4131676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 370
Target Start/End: Original strand, 25251261 - 25251611
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | | ||||||| |||| |                
T  25251261 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaa 25251360  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  25251361 aagatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttc 25251460  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25251461 ctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcagc 25251560  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25251561 cccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 25251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17319190 - 17318838
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||       
T  17319190 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggagagagcagccctccgttttactataatgatgagta 17319092  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| ||||||||      
T  17319091 acttaacaaaagagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatcct-- 17318994  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
        |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318993 ----gtttcccaaggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 17318898  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  17318897 tgtttcagccccctctatctcaaggtttactatgatacaaaacctatatttatagtaaaa 17318838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 372
Target Start/End: Original strand, 3579606 - 3579956
Alignment:
Q  38 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| | ||||| |||||||             ||    
T  3579606 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atgatgagtaactttacaaaag 3579704  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||| | |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  3579705 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttccta 3579804  T
Q  224 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag--cc 320  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  3579805 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgtttcagcccc 3579904  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3579905 ccctctatctcaaattttacgctgatacaaggtctatatttaaagtaaaagt 3579956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 129 - 371
Target Start/End: Original strand, 50248666 - 50248909
Alignment:
Q  129 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  50248666 tcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtg 50248765  T
Q  228 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  50248766 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcatagttttgttgttgtctttttaaacctttgtttcagctccctcta 50248865  T
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50248866 tctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50248909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 372
Target Start/End: Original strand, 31422967 - 31423212
Alignment:
Q  129 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  31422967 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtg 31423066  T
Q  228 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    |||||||   |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423067 aatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 31423166  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||| |||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  31423167 atctcaaggtttacactgatacaatgcttatatttatagtaaaagt 31423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6756831 - 6756470
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactat-atgatg-- 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||      
T  6756831 aaagaagaga-gaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgag 6756733  T
Q  121 -----------aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcct 209  Q
               |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||  ||| ||||||||    
T  6756732 taactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatca--agactcaatcct 6756635  T
Q  210 aacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 307  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6756634 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagc 6756535  T
Q  308 ccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6756534 ccttgtttcagtcccctctatttcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagcaaaagt 6756470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25128167 - 25127856
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| ||||||                
T  25128167 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaa 25128068  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  25128067 aagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttc 25127968  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25127967 acaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagg 25127868  T
Q  320 cccctctatctc 331  Q
    ||||||||||||    
T  25127867 cccctctatctc 25127856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 333 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 23783533 - 23783362
Alignment:
Q  333 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||             
T  23783533 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaa--------- 23783443  T
Q  433 taacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgat 516  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783442 ---caaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgat 23783362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 55 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 47451917 - 47451591
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------aagagaaatcaatgggttac 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | || | ||||||||||||             ||||||  |||||| |||||    
T  47451917 tgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttac 47451818  T
Q  141 aagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcct-aacagtgtttcccaagtgaatcaacccaca 239  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||      |  | |||||||||||| ||    
T  47451817 aagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaaaca------ctaatgtgaatcaaccctca 47451724  T
Q  240 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttg 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  47451723 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctctatctcaaagttta 47451624  T
Q  340 ctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451623 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 47451591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17324258 - 17324009
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||  ||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17324258 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttc 17324159  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  17324158 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaatc--agttttgttgtggcctttctgaacccttgttttagc 17324061  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || ||||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17324060 cctctctatctcaaggtttactctaatacaaagtctatatttataataaaag 17324009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40134239 - 40133937
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||                
T  40134239 agaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 40134140  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||  ||| ||||    
T  40134139 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttc 40134040  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40134039 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 40133940  T
Q  320 ccc 322  Q
    |||    
T  40133939 ccc 40133937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51757845 - 51757623
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51757845 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 51757746  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    |||| |||            ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  51757745 tatggtgagtatcgttacaaagagaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagac 51757646  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaa 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  51757645 tcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 47179622 - 47179488
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  47179622 aaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgcaagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgattttttcag 47179523  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47179522 tgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 47179488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231496
Alignment:
Q  275 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttc 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtct 16231542  T
Q  375 tgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  16231541 tgcttaaaatctgtaacaaatctgcttaaaatctgtaacaaatctg 16231496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42922425 - 42922177
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  42922425 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 42922326  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
     ||| |||||||||||    |||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  42922325 gcaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaac 42922230  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42922229 cccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagt 42922177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 16226080 - 16225947
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226080 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaa-tatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 16225982  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16225981 tgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 16225947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 425 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 47177271 - 47177138
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47177271 aaaatctgtaacaaatctgctcccaaaaataggttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccag 47177172  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47177171 tgtcttgcccaaa-aactaaaacctccatcgtgcc 47177138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 8347359 - 8347607
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8347359 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttc 8347458  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    | || |||||||||||  | |||| | ||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  8347459 ctaaggtgaatcaacc--ctaaccttggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcaac 8347554  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8347555 cccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctat-tttatagtaaaagt 8347607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 14183678 - 14183923
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |  ||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||     
T  14183678 aagagatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgtttt 14183777  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14183778 ccaaggtgaatcaacccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagtttg--tgttgcatt-ctaaacccttgtttcagc 14183871  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14183872 cctctctatctcaaggtttactctgatacatggtctatatttatagtaaaag 14183923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 122 - 372
Target Start/End: Original strand, 15669481 - 15669729
Alignment:
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15669481 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 15669580  T
Q  222 caa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcagc 319  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| || |||| | | ||||||| | |||||||    
T  15669581 caaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctacttttg-tgctgcc-tcccaaaccctagttttcagc 15669675  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||| ||| |||| | | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15669676 cccctctatcccaatgtttacatctgctacaaggtctgtatttatagtaaaagt 15669729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 18800659 - 18800907
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |  |||| || || ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  18800659 aagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttc 18800758  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
     || | |||||||||||   ||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  18800759 tcagggtgaatcaacccc--aaccctagtatttgtggccaagag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttgactt-ctaaacctttgtttcagc 18800854  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800855 cccttgtatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18800907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16231878 - 16231630
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16231878 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 16231780  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||    
T  16231779 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagaga 16231680  T
Q  201 gt-caatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 248  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16231679 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16432699 - 16432396
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||     
T  16432699 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgag 16432601  T
Q  122 ------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcct 209  Q
                ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  16432600 taacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcct 16432501  T
Q  210 aacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 308  Q
    || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432500 aataatgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 16432412  T
Q  309 cttgtttcagccccct 324  Q
    |||||||| |||||||    
T  16432411 cttgtttctgccccct 16432396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Original strand, 8349138 - 8349385
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||| || ||||  | | |||||||||| ||||||||    
T  8349138 aagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtttc 8349237  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||| ||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8349238 ccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccttaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagc 8349333  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    || ||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  8349334 cctctctatctcaaggtttgcatctaatacaagatctatatttataataaaa 8349385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23786136 - 23785935
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    ||||||||||||   |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  23786136 agaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 23786037  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23786036 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 23785937  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  23785936 tc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 481 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23783376 - 23783288
Alignment:
Q  481 ccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783376 ccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 23783288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 6823810 - 6823683
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6823810 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcatgccacgatttttccagtgccttgc 6823711  T
Q  533 ct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  6823710 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 6823683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16429261 - 16429047
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||      
T  16429261 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagt 16429163  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  16429162 aaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatccta 16429063  T
Q  211 acagtgtttcccaagt 226  Q
    | ||||||||||||||    
T  16429062 atagtgtttcccaagt 16429047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 51752291 - 51752164
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752291 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcggccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 51752192  T
Q  533 ct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  51752191 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 51752164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 49495297 - 49495537
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| | || ||||| ||| |||||  ||  ||||||||    
T  49495297 aagagatatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttc 49495396  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||| ||   ||| ||||||||||| | ||||| |||| | ||| |||||||||||||  ||        | |||||||||||||||||    
T  49495397 ccaaggtgaatcaactca---accatagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctagtttgatt--------tataaacccttgtttcagc 49495484  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49495485 cccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 49495537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13358888 - 13358784
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358888 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 13358789  T
Q  114 tatga 118  Q
    |||||    
T  13358788 tatga 13358784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 434 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 51749965 - 51749841
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749965 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcgcactatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 51749866  T
Q  533 ct-aaataactaaaacctccatcgt 556  Q
    || ||| |||| |||||||||||||    
T  51749865 ctcaaaaaactgaaacctccatcgt 51749841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 13761763 - 13761637
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761763 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgccgccagcacaccatcgtgccgcgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 13761664  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || || |||| ||||||||||| ||||    
T  13761663 ctcaaaaactgaaacctccatcatgcc 13761637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 248
Target Start/End: Original strand, 25248540 - 25248766
Alignment:
Q  38 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------a 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||| | ||||             |    
T  25248540 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaa 25248639  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  25248640 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttcc 25248739  T
Q  223 aa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 248  Q
    || |||||||||||| |||||||||||    
T  25248740 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23816180 - 23816027
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||             |    
T  23816180 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaa 23816081  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtc 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23816080 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 20302385 - 20302258
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20302385 aacaaatatgcacccaaaaatatgtttctgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacaatttttccagtgccttgc 20302286  T
Q  533 ct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  20302285 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 20302258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 276 - 370
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248850
Alignment:
Q  276 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttctagaaaaa 25248850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 365
Target Start/End: Original strand, 13125544 - 13125787
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  13125544 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgttt 13125643  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctata-caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||| |||||||||||    |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||    
T  13125644 cccaatgtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaaccctagtttccttgttggc-ttcttaacccttgtttca 13125739  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 365  Q
    ||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  13125740 gccccctttctctcaagttttactctgatacaaggtttctatttatag 13125787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Original strand, 10400183 - 10400284
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10400183 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttatttgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatatttccagtgctttgc 10400282  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  10400283 ct 10400284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 365
Target Start/End: Original strand, 26520206 - 26520449
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaac------caagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||      ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  26520206 atcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 26520305  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cag 318  Q
    ||||| ||||||||||    || | ||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  26520306 ccaaggtgaatcaacctc--aatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttgactt-ctaaaccgttgttttcag 26520401  T
Q  319 cccc-ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 365  Q
    |||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  26520402 cccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 26520449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 425 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 16231514 - 16231444
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231514 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 16231444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 6115080 - 6115304
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||      
T  6115080 aaagaagaga-gaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagt 6115178  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  6115179 aattttacaaaagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatccta 6115278  T
Q  211 acagtgtttcccaa-gtgaatcaacc 235  Q
    | |||||||  ||| |||||||||||    
T  6115279 atagtgtttttcaaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 28840604 - 28840486
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28840604 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacaatttttccagtaccttgc 28840505  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcca 552  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  28840504 ctaaa-aactgaaacctcca 28840486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 479 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 28842373 - 28842301
Alignment:
Q  479 caccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  28842373 caccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcctaaa-aactgaaacctcca 28842301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 475 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 15823430 - 15823371
Alignment:
Q  475 agcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15823430 agcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttctagtgctttgcct 15823371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 13449919 - 13449996
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  13449919 aaaaatacgttttatttttatctaccatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgatttttccagtg 13449996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 16231458 - 16231401
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16231458 ccatcgtgccacgatttttccagtgtcttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 16231401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 399
Target Start/End: Original strand, 30790658 - 30790759
Alignment:
Q  299 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatct 397  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||    
T  30790658 tttctaaactcttgttttcagctccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatct 30790757  T
Q  398 gc 399  Q
    ||    
T  30790758 gc 30790759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Original strand, 30790749 - 30790848
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30790749 aacaaatctgcactgaaaaatacgtttatgtttttcccctccagcgcaccatcgtgccacattgcgatcccatcgtgccacgttttttccagtgacttgc 30790848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 6822893 - 6822835
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  6822893 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 6822835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 155864 - 155788
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaa 233  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  155864 ctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 13447245 - 13447301
Alignment:
Q  21 aacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattga 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  13447245 aacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 512
Target Start/End: Original strand, 28207421 - 28207500
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgcca 512  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28207421 aacaaatctgcacccaaaaaaacgtttatgttattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgttgtgaccccatcgtgcca 28207500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 30738716 - 30738830
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| |||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30738716 aagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 30738815  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaa 233  Q
     |||| |||||||||    
T  30738816 tccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2232657 - 2232597
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2232657 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 225
Target Start/End: Original strand, 30790487 - 30790591
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||| |   ||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  30790487 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactc-atcctaacagtgttt 30790585  T
Q  220 cccaag 225  Q
    ||||||    
T  30790586 cccaag 30790591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 534
Target Start/End: Original strand, 3580010 - 3580074
Alignment:
Q  470 ccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  3580010 ccgccagcgcaccatcgtgccacgttgcaatcccaccgtaccacgatttttccaatgacttgcct 3580074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15916665 - 15916605
Alignment:
Q  57 acccagtccggtccaaa-ttgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15916665 acccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 15916605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 103
Target Start/End: Original strand, 31422851 - 31422915
Alignment:
Q  40 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctc 103  Q
    |||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31422851 cacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctc 31422915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 338
Target Start/End: Original strand, 6115344 - 6115383
Alignment:
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagttt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6115344 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttt 6115383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 26613503 - 26613577
Alignment:
Q  300 ttctaaacccttgttt-cagccccctctatctc--aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26613503 ttctaaacccttgttttcagccccctctatctctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatagcaaaag 26613577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 2401343 - 2401400
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  2401343 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2401400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 6822941 - 6822879
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6822941 aacaaatctgcacccaaaaatacatttctattattcgccgccagcgcaccatcgtgccacgat 6822879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9526526 - 9526469
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  9526526 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 9526469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 21353468 - 21353525
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21353468 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25134131 - 25134074
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  25134131 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 26613326 - 26613440
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||| | ||  ||||||| || |||||| || ||||||| || |||||||    
T  26613326 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgttt 26613425  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaa 233  Q
    ||||| |||||||||    
T  26613426 cccaaggtgaatcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 365
Target Start/End: Original strand, 13127837 - 13127959
Alignment:
Q  240 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttg 339  Q
    |||||||||||||||| | || ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||     
T  13127837 aaccctagtgtttgttgccaaaagg-aaactctatataaaccctacttttcttgttggctt-ctaaacccttgtttca-acccctctctctaaaggttta 13127933  T
Q  340 ctttgatacaaggtctatatttatag 365  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||    
T  13127934 ctccgatacaaggtttatatttatag 13127959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14997100 - 14997040
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14997100 ctaattctacccaa-gtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 2393308 - 2393348
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2393308 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 2393348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16431096 - 16431044
Alignment:
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  16431096 cccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaacctatatttatagtaaaagt 16431044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 95
Target Start/End: Original strand, 50248557 - 50248617
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagag 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50248557 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagag 50248617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17324349 - 17324278
Alignment:
Q  45 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtc-tggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  17324349 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactata 17324278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155921
Alignment:
Q  73 attgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  155963 attgacctagtttggggagagagcagccatccgttccactata 155921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9521775 - 9521718
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||    
T  9521775 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 9521718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 115
Target Start/End: Original strand, 14183581 - 14183658
Alignment:
Q  40 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaat-tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||| |||||  | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  14183581 cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata 14183658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 21353373 - 21353414
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21353373 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 21353414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 27916752 - 27916711
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27916752 tgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 27916711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Original strand, 30738890 - 30738963
Alignment:
Q  299 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30738890 tttctaaacccttgttttcagtcacctgtatctcaaggtttcatctgatacaaggactatgtttatagtaaaag 30738963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43104131 - 43104102
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104131 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43104102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Original strand, 46432037 - 46432066
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432037 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 46432066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 9476269 - 9476329
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9476269 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 13598406 - 13598466
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  13598406 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 13598466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16124605 - 16124545
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16124605 tgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 16124545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 29651819 - 29651879
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29651819 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactat 29651879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 37069778 - 37069838
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  37069778 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactat 37069838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 47704025 - 47703965
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  47704025 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 47703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 105)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27829667 - 27829269
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27829667 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 27829568  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27829567 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 27829468  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829467 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 27829368  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  27829367 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 27829269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27827356 - 27826958
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27827356 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 27827257  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27827256 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagac 27827157  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827156 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 27827057  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  27827056 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 27826958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 44721214 - 44720794
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44721214 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccacta 44721115  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44721114 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 44721015  T
Q  202 tcaatcctaacagtgttt-cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44721014 tcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcct 44720915  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  44720914 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatataaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatctgc 44720815  T
Q  400 ctaatatttgtaacaaatctg 420  Q
     ||| || |||||||||||||    
T  44720814 ttaaaatctgtaacaaatctg 44720794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 43082326 - 43081782
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  43082326 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 43082227  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  43082226 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtt 43082127  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082126 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 43082027  T
Q  318 gccccctcta----------------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcct 401  Q
    ||||||||||                |||| ||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  43082026 gccccctctatctctctctatctctctctccaaaatagcct-gatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgctt 43081928  T
Q  402 aatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgacc 501  Q
    ||           |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43081927 aa-----------aatctgtaacaaaa-ctataacaaatctgctcccaaagatacgttttatttttatccgccagcgtaccatcgtgccacgatgagacc 43081840  T
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43081839 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 43081782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18811078 - 18810659
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18811078 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 18810979  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  18810978 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagac 18810879  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810878 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 18810779  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||     
T  18810778 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttgtaacaaatctgct 18810679  T
Q  401 taatatttgtaacaaatctg 420  Q
     || || |||||||||||||    
T  18810678 caaaatctgtaacaaatctg 18810659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14808120 - 14807723
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-----------agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||    
T  14808120 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactat 14808022  T
Q  115 atgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14808021 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 14807922  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807921 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 14807822  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  14807821 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 14807723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 28251543 - 28251930
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28251543 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 28251641  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28251642 acattacaaaagagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 28251741  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28251742 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccct 28251841  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  28251842 tgtttcaacccactctatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 28251930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4424389 - 4423990
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4424389 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccacta 4424290  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||||||| ||||||||||||    
T  4424289 tatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaga 4424190  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424189 ctcaatcctaatagtgtttcccacggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 4424090  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  4424089 ttctaaatccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctgtatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 4423990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32339680 - 32339304
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32339680 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 32339581  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  32339580 tatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaga 32339481  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339480 ctcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 32339381  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339380 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 32339304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 28283185 - 28283561
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283185 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 28283284  T
Q  115 atgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt 202  Q
    |||||||            ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |    
T  28283285 atgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagatt 28283384  T
Q  203 caatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgccttt 301  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28283385 caatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccatt 28283484  T
Q  302 ctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283485 ctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 28283561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15809589 - 15809214
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15809589 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccacta 15809490  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  15809489 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagaga 15809390  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809389 ctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaa-agacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 15809291  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809290 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15809214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3874364 - 3874005
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  3874364 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 3874265  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  3874264 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgt 3874165  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3874164 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttc 3874065  T
Q  317 agccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||| |||||||    |||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3874064 agcccccgctatctctctcaaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 3874005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18813252 - 18812844
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18813252 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccacta 18813153  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
T  18813152 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagac 18813053  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||| |||||||||||||||||||    
T  18813052 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagag-----------acaaactctagttttgttgttgcctt 18812964  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcc 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||     
T  18812963 tctaaacccttgtttcagcctcctctatctccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttgtaacaaatctgct 18812864  T
Q  401 taatatttgtaacaaatctg 420  Q
     || || |||||||||||||    
T  18812863 caaaatctgtaacaaatctg 18812844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 609101 - 608735
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaa-gaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  609101 gaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatg 609002  T
Q  118 atga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtca 204  Q
    ||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  609001 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactca 608902  T
Q  205 atcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttct 303  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  608901 atcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttct 608802  T
Q  304 aaacccttgtttcagccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatattta 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  608801 aaacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagtttgctatgatataaggtctatattta 608735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 22684617 - 22685002
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22684617 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccacta 22684716  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaat---gggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaag 197  Q
    ||||||||             ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22684717 tatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 22684816  T
Q  198 agagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttg 296  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22684817 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 22684916  T
Q  297 cctttctaaacccttgtttcagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684917 tctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 22685002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15073070 - 15072709
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||       
T  15073070 aaagaagaga-gaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgtatgatgagta 15072972  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcc-tcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15072971 acgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatccta 15072872  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15072871 atagtgttttccaaggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcctttctaaaccc 15072772  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072771 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15072709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15068330 - 15067953
Alignment:
Q  37 gaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------a 122  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||             |    
T  15068330 gaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaa 15068231  T
Q  123 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  15068230 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttccc 15068131  T
Q  223 aag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068130 aaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 15068031  T
Q  322 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    | |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  15068030 cttctatctcaaagtttaggttgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 15067953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27911359 - 27911014
Alignment:
Q  40 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agaga 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||             |||||    
T  27911359 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagaga 27911260  T
Q  127 aatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-g 225  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  27911259 tatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 27911160  T
Q  226 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911159 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctc 27911061  T
Q  326 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27911060 tatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagt 27911014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27957778 - 27957433
Alignment:
Q  40 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agaga 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||             |||||    
T  27957778 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagaga 27957679  T
Q  127 aatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-g 225  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  27957678 tatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 27957579  T
Q  226 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957578 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcc-ttctaaacccttgtttcagccccctc 27957480  T
Q  326 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  27957479 tatctcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagt 27957433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 371
Target Start/End: Original strand, 27106884 - 27107232
Alignment:
Q  38 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 123  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||             ||    
T  27106884 aacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaag 27106983  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27106984 agatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 27107083  T
Q  224 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 322  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107084 aggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 27107183  T
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27107184 ctctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 27107232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43530481 - 43530123
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatga 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43530481 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactatatga 43530382  T
Q  119 tga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaa 205  Q
    |||             |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  43530381 tgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaa 43530282  T
Q  206 tcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 304  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||             |||||||| ||||||    
T  43530281 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacac-------------gttgttgcttttcta 43530195  T
Q  305 aacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530194 aacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 43530123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 30480479 - 30480838
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||       
T  30480479 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgacta 30480577  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  30480578 acgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 30480677  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480678 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaaccct 30480777  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30480778 tgtttcaaccccttctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 30480838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1225526 - 1225165
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||       
T  1225526 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactatatgatgagta 1225428  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1225427 acgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 1225328  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1225327 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccc 1225228  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1225227 ttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagtaaaagt 1225165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 14419166 - 14419527
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| ||||||      
T  14419166 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagt 14419264  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  14419265 aaccttacaaaagacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatctta 14419364  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14419365 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaaccc 14419464  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14419465 ttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 14419527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43079953 - 43079650
Alignment:
Q  35 aagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------ 121  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||                
T  43079953 aagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaa 43079854  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  43079853 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 43079754  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43079753 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 43079654  T
Q  320 cccc 323  Q
    ||||    
T  43079653 cccc 43079650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14477610 - 14477276
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacc-cagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgaag 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| | ||||||             
T  14477610 aaagaaga-aagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagccatccgtttcactat--------- 14477521  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
        |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  14477520 ----atcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttccca 14477425  T
Q  224 a-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 322  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14477424 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacccc 14477325  T
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14477324 ctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 14477276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 372
Target Start/End: Original strand, 24873195 - 24873523
Alignment:
Q  65 cggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtc 151  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24873195 cggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatcggttacaagaataagtc 24873294  T
Q  152 tcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtg 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24873295 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 24873394  T
Q  250 tttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctcaaagtttgcttt 343  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    |    
T  24873395 tttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcct 24873494  T
Q  344 gatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873495 gatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24873523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 372
Target Start/End: Original strand, 13858578 - 13858820
Alignment:
Q  131 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaa 229  Q
    |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13858578 aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 13858677  T
Q  230 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13858678 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctctatc 13858777  T
Q  330 tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13858778 tcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 13858820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 158 - 371
Target Start/End: Original strand, 33541509 - 33541723
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33541509 ctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttc 33541608  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtcta 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||    
T  33541609 caaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttacactgatacaatgtcta 33541708  T
Q  357 tatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||    
T  33541709 tatttatagtaaaag 33541723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36865887 - 36865538
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga----------- 121  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||               
T  36865887 agaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttaca 36865788  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
      ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| || |   ||||| |||||||||| |||||||    
T  36865787 aaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtga---agagactcaatcctaatagtgttt 36865691  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865690 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 36865591  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36865590 ccccctctatcttaaggtttacatctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 36865538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41385094 - 41384744
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||                 
T  41385094 agaacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41384995  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||  |||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  41384994 agagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcc 41384895  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  41384894 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-c 41384796  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41384795 ccctctatctcaatttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 41384744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 343 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 43079614 - 43079407
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatct 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||         |||||| ||||||||||    
T  43079614 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcttaaaatctgtaaaaaa---------aaaactataacaaatct 43079524  T
Q  443 gctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataact 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43079523 gctcccaaagatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtaccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaact 43079424  T
Q  543 aaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||    
T  43079423 aaaacctccatcgtgcc 43079407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41383012 - 41382672
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||                 
T  41383012 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41382913  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||           
T  41382912 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatag------- 41382820  T
Q  222 caagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 321  Q
       ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  41382819 ---gtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttttagccc 41382723  T
Q  322 cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    | |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41382722 catctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 41382672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25952871 - 25952521
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  25952871 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaa 25952772  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||   |||||  |||||||||||| |||||||||| | |||||     
T  25952771 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttt 25952672  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25952671 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatacaa-ccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttcagc 25952573  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25952572 cccctctatctcaaggtttcctctgatacaaagcttatatttatagtaaaag 25952521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 371
Target Start/End: Original strand, 5372269 - 5372512
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  5372269 atcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 5372368  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5372369 gaattaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctct 5372467  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5372468 atctcaagatttacactgatacaatgtctataattatagtaaaag 5372512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 405 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 18812881 - 18812728
Alignment:
Q  405 atttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgacccca 504  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812881 atttgtaacaaatctgct-caaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgacccca 18812783  T
Q  505 tcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18812782 tcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 18812728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775200
Alignment:
Q  195 aagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttg 293  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttg 26775279  T
Q  294 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26775278 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaagt 26775200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 181 - 371
Target Start/End: Original strand, 5622882 - 5623073
Alignment:
Q  181 ctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaa 279  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  5622882 ctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctatacaaa 5622981  T
Q  280 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5622982 ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttattctgatacaaaacctatatttatagtaaaag 5623073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 15185699 - 15186046
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||                
T  15185699 agaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaa 15185798  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag--tcaatcctaacagtgtt 218  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||||    
T  15185799 aagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaat-------ctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgtt 15185891  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  15185892 ttacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccatagttttgttattttctttctaaacccttgtttca 15185991  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    | | ||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15185992 gtcacctttatctcaaggtttactctgatacaaagtttatatttatagtaaaagt 15186046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 405 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 18810696 - 18810543
Alignment:
Q  405 atttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgacccca 504  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18810696 atttgtaacaaatctgct-caaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatgtgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgtgacccca 18810598  T
Q  505 tcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18810597 tcgtgccgcaatttttccagtgccttgcctaaaaaaataaaacctccatcgtgcc 18810543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 271 - 372
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886254
Alignment:
Q  271 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 3886252  T
Q  371 gt 372  Q
    ||    
T  3886253 gt 3886254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21482561 - 21482322
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21482561 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 21482462  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||| |||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||     
T  21482461 ccaaggtgactcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagt 21482374  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21482373 ccactctatctcaaagtttactctgatacaaattctatatttatagtaaaag 21482322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31162460 - 31162212
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31162460 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 31162361  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttg-ttgcctttctaaacccttg-tttca 317  Q
    |||| |||||||||||  | |||  ||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||| ||| ||| |    
T  31162360 ccaaggtgaatcaacc--ctaacgttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacacta-atttgttgcttg--tttctaaacctttgttttta 31162267  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162266 gccccctctttctcaaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31162212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 371
Target Start/End: Original strand, 35872559 - 35872713
Alignment:
Q  213 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  35872559 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt-----gttgcctttctaaaccctt 35872653  T
Q  312 gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35872654 gtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 35872713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15956317 - 15956051
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||      
T  15956317 aaagaagaga-gaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagt 15956219  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  15956218 aactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatccta 15956119  T
Q  211 acagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaacc 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||    
T  15956118 acagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 260 - 372
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517362
Alignment:
Q  260 agagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctat 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttgctctgatacaaggtatat 12517347  T
Q  358 atttatagtaaaagt 372  Q
    || ||||||||||||    
T  12517348 atatatagtaaaagt 12517362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Original strand, 3005716 - 3005929
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||| ||||| |||| |||||||     
T  3005716 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgtttt 3005815  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc-ag 318  Q
    |||| ||||||||| |||   |||||| ||||||||   ||||| |||| ||||||||||| |||||||  |  |||  |||||||||||||||||| ||    
T  3005816 ccaaagtgaatcaatcca---accctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaactctagtttgttatttg--tttctaaacccttgtttccag 3005909  T
Q  319 ccccctctatctcaaagttt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  3005910 ccccctctatctcaaggttt 3005929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21480753 - 21480547
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21480753 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttc 21480654  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| ||||||||||||   || ||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  21480653 ccaaggtgaatcaaccc---aaacctagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagc 21480566  T
Q  320 cccctctatctcaaagttt 338  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  21480565 cccatctatctcaaggttt 21480547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 44720812 - 44720686
Alignment:
Q  425 aaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 524  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720812 aaaatctgtaacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgtttttgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccag 44720713  T
Q  525 tgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    | |||||||| || |||| |||||||||    
T  44720712 taccttgcctcaa-aactgaaacctcca 44720686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181536
Alignment:
Q  276 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagt 181536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 27826968 - 27826842
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgtttta-tttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27826968 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttttgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgc 27826869  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
     | || || | ||||||||||||||||    
T  27826868 ttcaaaaaatgaaacctccatcgtgcc 27826842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 27829279 - 27829153
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgtttta-tttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27829279 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttttgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgttttgc 27829180  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || || || | ||||||||||||||||    
T  27829179 ctcaaaaaatgaaacctccatcgtgcc 27829153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Original strand, 37214321 - 37214512
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||| |||||         |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37214321 ctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttc 37214411  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccct-------------------agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtt 337  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37214412 caaagagacaaactctatacaaaccctcaatctcttcccgtaaccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtt 37214511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Original strand, 2468361 - 2468434
Alignment:
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2468361 tttctaaatccttgtttcagctccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2468434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 181753 - 181622
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttcc--ggtaaccaagagagtcaatcct-aacagtgt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||||| | |||||| || |||||    
T  181753 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtgt 181654  T
Q  218 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 248  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  181653 ttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 472 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14807695 - 14807633
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14807695 gccagcgcaccaccgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcct 14807633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 33541395 - 33541481
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  33541395 agaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactatatgatga 33541481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 552
Target Start/End: Original strand, 12517418 - 12517497
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||    
T  12517418 gccagcacaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtacattgcctcaa-aactgaaacctcca 12517497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 15067963 - 15067864
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttttattt-ttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  15067963 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttttgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgttgcgatcccatcgtggcatgatttttccagtggcttgc 15067864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31035236 - 31035068
Alignment:
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  31035236 tcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatccc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-t 31035141  T
Q  301 tctaaacccttg-tttcagccccctcta--tctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||| ||| ||||||  | |||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31035140 tctaaaccattgttttcag-actctctacctctcaaagtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 31035068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 534
Target Start/End: Original strand, 28251988 - 28252041
Alignment:
Q  481 ccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28251988 ccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcct 28252041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Original strand, 31573848 - 31574000
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||| |||||||||||     
T  31573848 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttg 31573945  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    | |||||| ||   || |||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||    
T  31573946 ccaagagaaaa---ctctacaaatcctagttttcgtgttggc-ttctaaacctttgttt 31574000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Original strand, 37214243 - 37214319
Alignment:
Q  29 gaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccg 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37214243 gaagagaa-aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31035369 - 31035252
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   | |||||||||| |||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  31035369 aagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgttt 31035270  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaaccc 236  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  31035269 cccaaggtgaatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Original strand, 31578400 - 31578476
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31578400 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 15072692 - 15072593
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  15072692 aacaaatttgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcaccatcatgccacgttgcgatcccatcgtgacacgatttttctagtggcttgc 15072593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 166
Target Start/End: Original strand, 2468214 - 2468259
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattcta 166  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2468214 aagagatatcaatgggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 9021229 - 9021289
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9021229 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 16752644 - 16752704
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16752644 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 16757389 - 16757449
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16757389 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28327968 - 28327908
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28327968 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28895562 - 28895502
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28895562 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 590854 - 590797
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  590854 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 559
Target Start/End: Original strand, 3886322 - 3886380
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  3886322 ccatcgtaccacgatttttccagtgtcttgcctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 3886380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4423952 - 4423903
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  4423952 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgccttaa-aactgaaacctcca 4423903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33032714 - 33032657
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  33032714 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 4812609 - 4812669
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  4812609 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 4812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21482640 - 21482591
Alignment:
Q  57 acccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21482640 acccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccg 21482591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 22685035 - 22685112
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| |||  | |||||| ||| ||||||||||||    
T  22685035 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgattcgatcgtggcacaatttttccagtg 22685112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28332691 - 28332631
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28332691 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 216
Target Start/End: Original strand, 29554908 - 29554964
Alignment:
Q  159 taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  29554908 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6376032 - 6375988
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6376032 tctcaatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6375988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 103
Target Start/End: Original strand, 13858477 - 13858537
Alignment:
Q  44 aaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 103  Q
    |||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13858477 aaagaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 13858537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 16752549 - 16752589
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16752549 tgacctagtctggggagagagtagctctccgatccactata 16752589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21033689 - 21033613
Alignment:
Q  450 aaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| |||  | || ||| ||||||||||||||||    
T  21033689 aaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgattcaattgtggcacgatttttccagtg 21033613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Original strand, 23179692 - 23179740
Alignment:
Q  168 ccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  23179692 ccaaagtcacagcctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtg 23179740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 516
Target Start/End: Original strand, 28251958 - 28252002
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgat 516  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28251958 gccaacgcaccatcgtaccacgatgcgatcccatcgtgccacgat 28252002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Original strand, 5372160 - 5372242
Alignment:
Q  35 aagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct--ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||| |||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  5372160 aagaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactata 5372242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21480832 - 21480785
Alignment:
Q  57 acccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21480832 acccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctc 21480785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3276404 - 3276347
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  3276404 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 3276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4424000 - 4423938
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgat 495  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  4424000 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctatttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgat 4423938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 13985200 - 13985262
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtccc-agcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13985200 ctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17847739 - 17847677
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17847739 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttc 17847677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 4812513 - 4812554
Alignment:
Q  75 tgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4812513 tgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 4812554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 16757293 - 16757334
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16757293 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 16757334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17847556 - 17847527
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847556 tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17847527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25684799 - 25684758
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25684799 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 25684758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 28890922 - 28890881
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28890922 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 28890881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 29554810 - 29554851
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29554810 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 29554851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 4696685 - 4696625
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4696685 tgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 4696625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9765908 - 9765848
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9765908 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 17799558 - 17799606
Alignment:
Q  171 aagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17799558 aagtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23799666 - 23799606
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23799666 tgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactat 23799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 26403319 - 26403259
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  26403319 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 26403259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 74
Target Start/End: Original strand, 35872429 - 35872476
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaat 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  35872429 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat 35872476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 114)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27105088 - 27104691
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27105088 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 27104989  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27104988 tatgatgagtaatgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 27104889  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104888 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 27104790  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  27104789 tctgaacccttgtttcagccccctctatctcaaagttttctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 27104691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 399
Target Start/End: Original strand, 19504316 - 19504708
Alignment:
Q  21 aacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19504316 aacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgat 19504415  T
Q  120 ga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaat 206  Q
    ||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19504416 gagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccg-taaccaagagactcaat 19504514  T
Q  207 cctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 305  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504515 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 19504614  T
Q  306 acccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  |||||||||||    
T  19504615 acccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgc 19504708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 13910009 - 13910407
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13910009 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccacta 13910108  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||     
T  13910109 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagac 13910208  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910209 tcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 13910308  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  |||||||||||    
T  13910309 tctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgc 13910407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 19501980 - 19502345
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatga 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19501980 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatga 19502079  T
Q  119 tga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaa 205  Q
    |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19502080 tgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaa 19502179  T
Q  206 tcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 304  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502180 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 19502279  T
Q  305 aacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502280 aactcttgtttcagccccctttatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 19502345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 33 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 42064788 - 42064407
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaatt-gacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  42064788 agaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgtta 42064689  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42064688 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 42064589  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064588 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 42064489  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  42064488 gctccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 42064407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 23452201 - 23452577
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23452201 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 23452300  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23452301 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 23452400  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452401 ctcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 23452500  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452501 ttctaaacccttgtttcagccccctctgtctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 23452577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42453054 - 42452702
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  42453054 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 42452955  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtt 218  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42452954 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 42452855  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452854 tcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttaca--gagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 42452757  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42452756 gccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagt 42452702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 399
Target Start/End: Original strand, 24162193 - 24162575
Alignment:
Q  21 aacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24162193 aacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactatatgat 24162292  T
Q  120 ga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatc 207  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||||||||| ||||||    
T  24162293 gagtagcattacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagc----------aaccaagagactcaatc 24162382  T
Q  208 ctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 306  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162383 ttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 24162482  T
Q  307 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  24162483 cccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttgaaacaaatctgc 24162575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 45279965 - 45280321
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  45279965 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 45280064  T
Q  122 ----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgt 217  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45280065 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 45280164  T
Q  218 ttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc-ctttctaaacccttgttt 315  Q
     |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45280165 atcccaaggtgaatcaaccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgttt 45280264  T
Q  316 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45280265 cagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtatatatttatagtgaaagt 45280321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Original strand, 36559067 - 36559308
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36559067 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 36559166  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559167 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 36559266  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559267 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 36559308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 40032038 - 40032394
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||                
T  40032038 agaatacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaa 40032137  T
Q  122 -agagaaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
     |||||||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40032138 aagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 40032237  T
Q  217 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032238 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 40032337  T
Q  316 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032338 cagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 40032394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Original strand, 45332384 - 45332625
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaa-tctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaa 426  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45332384 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaaatctataacaaatctgcctaaaatctgtaacaaatctgtaacaa 45332483  T
Q  427 aaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  45332484 aa-ctgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgtgaccccatcgttccacgatttttccagtt 45332582  T
Q  527 ccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45332583 ccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 45332625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 21520678 - 21521031
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||                 
T  21520678 agaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 21520777  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21520778 agagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 21520877  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520878 taaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 21520977  T
Q  321 ccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    || ||||  |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21520978 ccatctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 21521031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 22287321 - 22287672
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||                 
T  22287321 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaa 22287420  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |  ||||||    
T  22287421 agagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcc 22287520  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287521 caaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 22287620  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287621 ccctatatctcaaagtttactttaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22287672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19007910 - 19007560
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||                 
T  19007910 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 19007811  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  19007810 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcc 19007711  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19007710 caaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 19007611  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19007610 ccctctatctcaaggtttactatgatacaaagcctatatttatagtaaaag 19007560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 6258802 - 6259151
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||                 
T  6258802 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaa 6258901  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6258902 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaa--tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 6258999  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6259000 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttcatcc 6259099  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259100 tcctctatctcaaagtttagtctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6259151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 328 - 516
Target Start/End: Original strand, 36561344 - 36561532
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36561344 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 36561443  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgat 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561444 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgat 36561532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 42923485 - 42923847
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||       
T  42923485 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactatatgacgagta 42923583  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  42923584 actttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaa 42923683  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42923684 tagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaaccct 42923783  T
Q  311 tgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42923784 tgtttcagcctcctctatctctcaaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 42923847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 43623556 - 43623931
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  43623556 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagta 43623654  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43623655 acgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 43623754  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||            |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43623755 tattgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt------------gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccat 43623842  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  43623843 tgtttcacccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatttttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgc 43623931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Original strand, 6264133 - 6264508
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||                
T  6264133 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 6264232  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||   |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  6264233 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttc 6264332  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6264333 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccct----ttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagc 6264428  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |  |||||||||||    
T  6264429 cccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 6264508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 11739535 - 11739895
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||      
T  11739535 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagt 11739633  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  11739634 aacctttcaaaagagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatccta 11739733  T
Q  211 acagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11739734 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaaccc 11739833  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11739834 ttgttccagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 11739895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 372
Target Start/End: Original strand, 35215568 - 35215932
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  35215568 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 35215667  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  35215668 aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 35215767  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35215768 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 35215867  T
Q  318 gccccctctatctc----------aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||          |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215868 gccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 35215932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 35217945 - 35218258
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  35217945 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 35218044  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  35218045 aaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 35218144  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35218145 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttca 35218244  T
Q  318 gccccctctatctc 331  Q
    ||||||||||||||    
T  35218245 gccccctctatctc 35218258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28196914 - 28196557
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||       
T  28196914 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactatatgatgagta 28196818  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28196817 atgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaa 28196718  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28196717 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctt 28196618  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28196617 tgtttcagccccctctatctcaatgtttactctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 28196557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 128 - 370
Target Start/End: Original strand, 15539566 - 15539809
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  15539566 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggt 15539665  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |    
T  15539666 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcaaccccctat 15539765  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    ||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15539766 atctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 15539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17849387 - 17849037
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||                
T  17849387 agaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 17849289  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  17849288 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 17849189  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17849188 tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctagttttgttgttatctttctaaacccttgtttcagc 17849089  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  17849088 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttatatttatagtaaaag 17849037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 31732861 - 31733100
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||            |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31732861 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca------------aaccaagagactcaatcctaacagtgtttc 31732948  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732949 ccaacgtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 31733048  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31733049 cccctctatctcaatgtttactctgttacaaagtctatatttatagtaaaag 31733100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 363
Target Start/End: Original strand, 34979562 - 34979906
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggag--agagcagccctccgatccactata-tgatga----------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||| || ||||||||| ||||||               
T  34979562 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttaca 34979661  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
      ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  34979662 aaagagatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgttt 34979761  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34979762 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttcag 34979861  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttat 363  Q
    ||||||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||    
T  34979862 ccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttat 34979906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 121 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3022334 - 3022086
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3022334 aagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 3022235  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3022234 ctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgtttcagc 3022135  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaa 368  Q
    | ||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  3022134 ctcctatatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaa 3022086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17848719 - 17848365
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||       
T  17848719 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagta 17848621  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17848620 acgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 17848525  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 309  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17848524 tagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccc 17848425  T
Q  310 ttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    | |||| ||||||||||||||||| | || |  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17848424 tcgtttgagccccctctatctcaaggattac--tgatacaaagcctatatttatagtaaaag 17848365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14837538 - 14837193
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||| ||||||                
T  14837538 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 14837439  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||  |||||||      ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14837438 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttcc------caagagactcaatcctaatagtgtttc 14837345  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  14837344 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgtttcagc 14837245  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
     ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14837244 tccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 14837193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 225 - 399
Target Start/End: Original strand, 22407598 - 22407772
Alignment:
Q  225 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22407598 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcaccct 22407697  T
Q  325 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
     ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  22407698 atatctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaattttgaacaaatctgc 22407772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 44289152 - 44289403
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  44289152 aagagatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttc 44289251  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  44289252 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagttttgttgttgccttcctaaacctttgttttagt 44289351  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  44289352 cccctctatatcaaggtttgctatgatacaaaacctatatttatagtaaaag 44289403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 11578193 - 11578439
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11578193 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 11578292  T
Q  221 cc-aagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    || | |||||||||||  | |||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11578293 ccgaggtgaatcaacc--ccaacccta--gtttgttgccaagagaaaaattctatacaaaccctagtttttttgttgac-ttctaaacccttgtttcagc 11578387  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    || |||||||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11578388 ccactctatctcaagatttaccctgatataaggtctatatttatagtaaaag 11578439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 331
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239271
Alignment:
Q  74 ttgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtct 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgctt 45239099  T
Q  160 aattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-cc 257  Q
    ||||||||| |||  ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  45239100 aattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 45239199  T
Q  258 aaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45239200 aaagag--aaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctc 45239271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 22163117 - 22163282
Alignment:
Q  207 cctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaa 305  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22163117 cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttgttgcctttctaa 22163216  T
Q  306 acccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22163217 atccttgtttcagccccctctatctcaaagtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 22163282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 5375322 - 5375550
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  5375322 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagta 5375420  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5375421 atgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc-gcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 5375519  T
Q  212 cagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaa 241  Q
     ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  5375520 tagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 18800398 - 18800638
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18800398 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18800497  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||    
T  18800498 ccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagctt--------gatttctaaacccttgtttcagc 18800585  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||| |||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800586 cccctatatctccatgtttaccctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18800638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38020302 - 38020162
Alignment:
Q  192 accaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttg 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38020302 accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttg 38020203  T
Q  291 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020202 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38020162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Original strand, 5377631 - 5377769
Alignment:
Q  238 caaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaa 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||    
T  5377631 caaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctcaa 5377730  T
Q  334 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5377731 agtttgctctgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 5377769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 220
Target Start/End: Original strand, 36558845 - 36559047
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||             
T  36558845 gagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgtta 36558944  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgt 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  36558945 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 36559044  T
Q  218 ttc 220  Q
    |||    
T  36559045 ttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 36561123 - 36561324
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  36561123 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 36561222  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  36561223 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 36561322  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  36561323 tc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 471 - 559
Target Start/End: Original strand, 19502402 - 19502490
Alignment:
Q  471 cgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19502402 cgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 19502490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 471 - 559
Target Start/End: Original strand, 19504736 - 19504824
Alignment:
Q  471 cgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19504736 cgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaaaaattaaaacctccatcgtgcc 19504824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22874301 - 22874061
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||  ||||||| || || |||||| |||||||||| | |||||     
T  22874301 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgtttt 22874202  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  22874201 ccaaggtgaatcaaccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagc 22874114  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||    
T  22874113 cccctctatctccaggtttgctctgatacaaagcctgtatttatagcaaaagt 22874061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 569
Target Start/End: Original strand, 36561539 - 36561627
Alignment:
Q  481 ccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36561539 ccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgtgaagccca 36561627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Original strand, 24162565 - 24162692
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162565 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctaatattcgcagccagcgcacaatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 24162664  T
Q  533 ct-aaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  24162665 ctcaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 24162692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Original strand, 45332144 - 45332364
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  45332144 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcact 45332243  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  45332244 atatgatgagtacctttacaaagagaaatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagaga 45332343  T
Q  201 gt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  45332344 ctccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Original strand, 20146693 - 20146941
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||| |||||||||  | ||||||    
T  20146693 aagagatatcaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttc 20146792  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| ||||||||| |  | |||| ||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||        
T  20146793 ccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttttcaa 20146888  T
Q  320 cccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
     | |||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146889 actctctacctcttaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 20146941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 434 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 27104701 - 27104575
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104701 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttatgtttttccctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 27104602  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    || || |||| ||||||||||||||||    
T  27104601 ctcaaaaactgaaacctccatcgtgcc 27104575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 281
Target Start/End: Original strand, 28459274 - 28459435
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  28459274 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttg 28459373  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaacc 281  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  28459374 ccaaggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 372
Target Start/End: Original strand, 17897337 - 17897578
Alignment:
Q  128 atcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-t 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||  || |||   | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  17897337 atcaaagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 17897436  T
Q  227 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt-tcagccccctc 325  Q
    ||||||| |  |||  ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||  | |||    
T  17897437 gaatcaatct-caa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactctatacaaaccctagttttattgttgac-ttctaaacccttgttctcag-actctc 17897530  T
Q  326 tatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    || |||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897531 tacctcaagttttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 17897578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 22407439 - 22407595
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg-------------a 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||             |    
T  22407439 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 22407538  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtccca 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  22407539 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtccca 22407595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 372
Target Start/End: Original strand, 37963028 - 37963263
Alignment:
Q  126 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||  || | ||||| | |||    
T  37963028 aaatcaatggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaag 37963127  T
Q  226 tg-aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 324  Q
     | ||||||| ||   ||| | |||||||||   ||||| |||| | || ||||||||||||||  ||        ||||||||||||||||||||||||    
T  37963128 gggaatcaacaca---accatggtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaaccctagtttgatt--------tctaaacccttgtttcagccccct 37963215  T
Q  325 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37963216 ctatctcaaggtttactcttatacaaagtctatatttatagtaaaagt 37963263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020064
Alignment:
Q  277 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctctatctccaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaa 38020064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 434 - 527
Target Start/End: Original strand, 13910397 - 13910491
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910397 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacaatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 13910491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35107452 - 35107219
Alignment:
Q  135 ggttacaagaataagtctcccg--tctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatc 231  Q
    |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  35107452 ggttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatc 35107353  T
Q  232 aacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt-gtttcagccccctctatct 330  Q
    || || ||| ||    |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||| ||  | ||||| ||    
T  35107352 aatcc-caaccc----tgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaactcttggttttag-actctctacct 35107261  T
Q  331 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35107260 caaggtttactatgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 35107219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 121
Target Start/End: Original strand, 22162998 - 22163093
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  22162998 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatga 22163093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 166
Target Start/End: Original strand, 7462946 - 7463077
Alignment:
Q  50 ttttatgacccagtccggtccaaa-ttgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatg-------------aagagaaatcaatg 134  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||             ||||||||||||||    
T  7462946 ttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatg 7463045  T
Q  135 ggttacaagaataagtctcccgtctaattcta 166  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7463046 agttacaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Original strand, 21521048 - 21521147
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21521048 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgttgcgatcccatcgtggcacgatttttccagtggcttgc 21521147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 42064378 - 42064316
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42064378 gccagcgcaccatcgtgccacgatgtgatcccatcgtgccacgatttttccagtgctttgcct 42064316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20589862 - 20589763
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20589862 aagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3022442 - 3022377
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagcc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3022442 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 3022377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 526
Target Start/End: Original strand, 6259168 - 6259261
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | || ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6259168 aacaagtctgcacccaaaaatatgtttctgttattcaccgccagcgcaccatcgtgtcacgttgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtg 6259261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Original strand, 12342673 - 12342746
Alignment:
Q  300 ttctaaaccctt-gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12342673 ttctaaaccctttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtgtatatttatagtaaaagt 12342746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 255
Target Start/End: Original strand, 27136209 - 27136343
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||   |||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27136209 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 27136308  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 255  Q
     ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27136309 tccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgtt 27136343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40699507 - 40699429
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacc 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40699507 ctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Original strand, 22707736 - 22707873
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct---ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg------------ 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | | ||||||||||||                
T  22707736 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttaca 22707835  T
Q  121 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgt 157  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22707836 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgt 22707873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414291
Alignment:
Q  150 tctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagt 248  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttccg-tgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2736265 - 2736205
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2736265 ctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17462496 - 17462436
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17462496 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 20054887 - 20054947
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20054887 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Original strand, 22407762 - 22407863
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  22407762 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccaacgcaccatcgtgccacgttgtgatcccatcgtgccacaattttttcactgacttgc 22407861  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  22407862 ct 22407863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 22712638 - 22712698
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22712638 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 22717347 - 22717407
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22717347 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39687043 - 39686983
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39687043 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45567469 - 45567409
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45567469 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 371
Target Start/End: Original strand, 38414281 - 38414365
Alignment:
Q  276 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||| |     ||||| | ||||||||||||||||||    
T  38414281 caaaccctagttttgttgttgcctttctaa------gtttcagccccctctatctcaaggtttac-----tacaaagcctatatttatagtaaaag 38414365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17921832 - 17921769
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtccc-agcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17921832 ctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 17921769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 83
Target Start/End: Original strand, 44289052 - 44289099
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagt 83  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44289052 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt 44289099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 520
Target Start/End: Original strand, 45280354 - 45280425
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgattttt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||    
T  45280354 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacgattttt 45280425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 12781343 - 12781400
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  12781343 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 12781400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17932694 - 17932637
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17932694 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17943597 - 17943540
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17943597 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Original strand, 18800289 - 18800378
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaat-tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  18800289 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctggggagagagtagccctccgtttcactata 18800378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 370
Target Start/End: Original strand, 20147040 - 20147082
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147040 tctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 20147082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 27517761 - 27517818
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  27517761 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14699096 - 14699036
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14699096 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 14699036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17921927 - 17921887
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17921927 tgacctagtctgggtagagagcagccctccgttccactata 17921887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 37170778 - 37170818
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37170778 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 37170818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43139508 - 43139356
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 256  Q
    ||||||||||| |||||| ||   |||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||     
T  43139508 ctaattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttg 43139411  T
Q  257 caaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    | ||||| ||||  || ||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  43139410 ccaagag-caaa--ctctacaaacccaagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgttt 43139356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 21629952 - 21630011
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21629952 tgacccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactat 21630011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 28459175 - 28459254
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||||||  | | | ||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||    
T  28459175 agaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggtagagagaagccctccgtttcactata 28459254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23871086 - 23871000
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  23871086 agaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactatatgatga 23871000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 37170874 - 37170931
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  37170874 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 37170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020311
Alignment:
Q  135 ggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaag 173  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaag 38020311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39287256 - 39287188
Alignment:
Q  243 cctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||||||||| | ||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  39287256 cctagtgtttgttgctaagaga---attctctacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgttt 39287188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 502 - 552
Target Start/End: Original strand, 43623968 - 43624017
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  43623968 ccatcgtgccacgattttttcagtgccttgcctcaa-aactgaaacctcca 43624017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2736361 - 2736320
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2736361 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 2736320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2741097 - 2741056
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2741097 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 2741056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17462592 - 17462551
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17462592 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 17462551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 28458950 - 28459011
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28458950 ctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Original strand, 31732790 - 31732831
Alignment:
Q  65 cggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31732790 cggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccg 31732831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 33670992 - 33671033
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33670992 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 33671033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 40699278 - 40699229
Alignment:
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40699278 ctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagt 40699229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 315
Target Start/End: Original strand, 41304627 - 41304667
Alignment:
Q  274 tacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41304627 tacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgttt 41304667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 45679879 - 45679838
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45679879 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 45679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 534
Target Start/End: Original strand, 6264546 - 6264578
Alignment:
Q  502 ccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6264546 ccatcgtgccacgatttttccagtgacttgcct 6264578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8390239 - 8390179
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8390239 tgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 8390179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 13569336 - 13569396
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  13569336 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 13569396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 20522228 - 20522288
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  20522228 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactat 20522288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20589609 - 20589581
Alignment:
Q  343 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589609 tgatacaaggtctatatttatagtaaaag 20589581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22874401 - 22874333
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctc 103  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  22874401 agaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctc 22874333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38191045 - 38190997
Alignment:
Q  171 aagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  38191045 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Original strand, 41452 - 41819
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatga 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41452 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatga 41551  T
Q  119 tga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaa 205  Q
    |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41552 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaa 41651  T
Q  206 tcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 304  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41652 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 41751  T
Q  305 aacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41752 aacccttgtttcagccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 41819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 41853 - 41930
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||||| |||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  41853 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcactatcgtggcacgattcgatacaatcgtggcacgatttttccagtg 41930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 109)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Original strand, 28241290 - 28241657
Alignment:
Q  20 gaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatga 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28241290 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatga 28241389  T
Q  119 tga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaa 205  Q
    |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28241390 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaa 28241489  T
Q  206 tcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 304  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241490 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 28241589  T
Q  305 aacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28241590 aacccttgtttcagccccctctatctctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 28241657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 397
Target Start/End: Original strand, 14507140 - 14507536
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14507140 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcacta 14507239  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    |||||| |            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14507240 tatgataagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 14507339  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507340 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 14507439  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatct 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||    
T  14507440 tctaaacccttgttttagccccctctatctcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatct 14507536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 1230213 - 1230585
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  1230213 gagaagaacacaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccacta 1230312  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1230313 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagaga 1230412  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230413 gtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 1230512  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1230513 ttctaaacccttgtttcaaccctctctatctcaaagtttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 1230585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 399
Target Start/End: Original strand, 11983005 - 11983392
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  11983005 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 11983103  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11983104 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 11983203  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11983204 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctt 11983303  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||    
T  11983304 tgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtttcgtttaaaatttgaaacaaatctgc 11983392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 14458731 - 14459093
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14458731 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccacta 14458830  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14458831 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 14458930  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaagtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458931 ctcaatcctaatagtgtttcccaag-gaatcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 14459029  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14459030 tctaaacccttatttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 552
Target Start/End: Original strand, 4816195 - 4816738
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4816195 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 4816294  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4816295 tatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagaga 4816394  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816395 ctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 4816494  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta--------------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4816495 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatc 4816594  T
Q  386 tataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatc 485  Q
    | |||||||||||| |||          |||||||            |||||||||||| || ||||||| ||||   ||||  |  ||||| |||||||    
T  4816595 tgtaacaaatctgcttaa----------aaatctg------------taacaaatctgcaccaaaaaatatgtttctgtttttgctaccagcacaccatc 4816672  T
Q  486 gtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  4816673 gtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtaccttgcctcaa-aactgaaacctcca 4816738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 323 - 569
Target Start/End: Original strand, 29754983 - 29755229
Alignment:
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgta 422  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29754983 ctctctctcagagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgccttaaatttgtaacaaatctgta 29755082  T
Q  423 acaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcc 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755083 acaaaaactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttcc 29755182  T
Q  523 agtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755183 agtgccttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 29755229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 414
Target Start/End: Original strand, 20915321 - 20915736
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20915321 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 20915419  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||     
T  20915420 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagac 20915519  T
Q  202 tc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20915520 tccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcct 20915619  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc---aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20915620 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaatttagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcttgcttaaaatctgtaacaaatc 20915718  T
Q  397 tgcctaatatttgtaaca 414  Q
    ||| ||| || |||||||    
T  20915719 tgcttaaaatctgtaaca 20915736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30967551 - 30967176
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30967551 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccacta 30967452  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  30967451 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagaga 30967352  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30967351 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtct 30967252  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagttt-gctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967251 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcct--atacaaggtctatatttatagtaaaagt 30967176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 12195478 - 12195851
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccact 112  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  || ||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12195478 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 12195577  T
Q  113 atatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    |||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12195578 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 12195677  T
Q  201 gtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcc 298  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12195678 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgct 12195777  T
Q  299 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195778 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 12195851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 338 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 33311235 - 33311004
Alignment:
Q  338 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311235 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaaca 33311136  T
Q  438 aatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaa 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33311135 aatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaa 33311036  T
Q  538 taactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33311035 aaactaaaacctccatcgtgccacgaagccca 33311004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 19704531 - 19704905
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19704531 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 19704630  T
Q  114 tatgatga--------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagag 199  Q
    ||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19704631 tatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 19704730  T
Q  200 agtc-aatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgc 297  Q
    | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704731 actccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 19704830  T
Q  298 ctttctaaacccttgtttcagcccc------ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19704831 ctttctaaacccttgtttcagccccctccatctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 19704905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 338 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 33308966 - 33308735
Alignment:
Q  338 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaaaactgtaaca 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33308966 tgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaaaaatgtaaca 33308867  T
Q  438 aatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaa 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33308866 aatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaa 33308767  T
Q  538 taactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33308766 aaactaaaacctccatcgtgccacgaagccca 33308735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 327 - 559
Target Start/End: Original strand, 26066319 - 26066551
Alignment:
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  26066319 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctactttaaatttgtaacaaatctgtaacaa 26066418  T
Q  427 aaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066419 aaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccattgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 26066518  T
Q  527 ccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26066519 ccttgcccaaataactaaaacctccatcgtgcc 26066551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 2628850 - 2629226
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2628850 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 2628949  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  2628950 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 2629049  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629050 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 2629149  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagcccc-----ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629150 tctaaacccttgtttcagcccctctatctctctctcaaagtttaacatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 2629226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 30034567 - 30034943
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30034567 gagaagaacacaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgcta 30034666  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||    
T  30034667 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattga 30034766  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30034767 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcct 30034866  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctc----aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034867 ttctaaacccttgttttagctccctctatctctcttaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 30034943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9020255 - 9019877
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------- 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||                 
T  9020255 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 9020156  T
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9020155 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9020056  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9020055 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcc 9019956  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  9019955 ccctctatctctcagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 9019877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 327 - 559
Target Start/End: Original strand, 26068590 - 26068822
Alignment:
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaa 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  26068590 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctgtaacaaatctgctttaaatttgtaacaaatctgtaacaa 26068689  T
Q  427 aaactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068690 aaacggtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtg 26068789  T
Q  527 ccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  26068790 ccttgcccaaaaaactaaaacctccatcatgcc 26068822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26065310 - 26065005
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------ag 123  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||            ||    
T  26065310 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaag 26065211  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26065210 agaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 26065111  T
Q  224 a-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 322  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26065110 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc 26065014  T
Q  323 ctctatctc 331  Q
    |||||||||    
T  26065013 ctctatctc 26065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26085279 - 26084974
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga------------ag 123  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||            ||    
T  26085279 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaag 26085180  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26085179 agaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 26085080  T
Q  224 a-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 322  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26085079 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc 26084983  T
Q  323 ctctatctc 331  Q
    |||||||||    
T  26084982 ctctatctc 26084974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 371
Target Start/End: Original strand, 3629841 - 3630199
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga---- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| || |        
T  3629841 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggggagagagcagccctcagtttcactatattattagtaa 3629939  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 212  Q
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  3629940 ctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaat 3630039  T
Q  213 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3630040 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgat 3630139  T
Q  312 gtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3630140 gtttcagccccctctatctcaagttttacattgatacaatgtctatatttatagtaaaag 3630199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13057524 - 13057173
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||                
T  13057524 agaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 13057425  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  13057424 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttc 13057325  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13057324 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagc 13057225  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13057224 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 13057173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 38 - 399
Target Start/End: Original strand, 30728811 - 30729191
Alignment:
Q  38 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------ag 123  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||             ||    
T  30728811 aacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataatatgagtaactttacaaaag 30728910  T
Q  124 agaaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30728911 agaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgttt 30729010  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  30729011 cccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcag 30729110  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||    
T  30729111 ccccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagtaccgcttaaaatttggaacaaatctgc 30729191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 143 - 399
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227771
Alignment:
Q  143 gaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaa 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  242 ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgct 341  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19227614 ccctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctttatctcaaagtttgct 19227713  T
Q  342 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |  |||||||||||    
T  19227714 ctgatacaagatctatatttatagtaaaagtttcccttaaaatttggaacaaatctgc 19227771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Original strand, 15541125 - 15541476
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa------------ 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||||||||||||||                
T  15541125 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactatatgatgaataactttacaaa 15541224  T
Q  123 -gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcc 221  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||  || ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  15541225 agagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcc 15541324  T
Q  222 caag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 320  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15541325 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagcc 15541424  T
Q  321 ccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541425 ccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15541476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3390705 - 3390357
Alignment:
Q  40 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat-atgatg-------------aaga 124  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||             ||||    
T  3390705 cacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaaga 3390606  T
Q  125 gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3390605 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 3390506  T
Q  225 -gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 323  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3390505 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccg 3390406  T
Q  324 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3390405 tctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 3390357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 43 - 372
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15533017
Alignment:
Q  43 aaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaat 129  Q
    ||||||||||  ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||             ||||| ||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctagggatagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatat 15532773  T
Q  130 caatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  15532774 caatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 15532873  T
Q  229 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 328  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532874 atcaaccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctat 15532973  T
Q  329 ctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532974 ctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15533017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Original strand, 3631926 - 3632271
Alignment:
Q  38 aacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga-------------ag 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||             ||    
T  3631926 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-acagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaag 3632024  T
Q  124 agaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttccca 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3632025 agatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttccca 3632124  T
Q  224 ag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 322  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3632125 agatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaactcc 3632224  T
Q  323 ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3632225 ctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaa 3632271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25477504 - 25477253
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25477504 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 25477405  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477404 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 25477305  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25477304 cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 25477253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32280326 - 32279948
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatat-gatga------------ 121  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||                
T  32280326 agaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaa 32280227  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32280226 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 32280127  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  32280126 ccaaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttcag- 32280028  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  32280027 cccctctatctccaagtttactatgatacaaggtctatatatataggaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 32279948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13040084 - 13039733
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||                
T  13040084 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 13039985  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||     
T  13039984 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttt 13039885  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13039884 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagc 13039785  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    | ||| |||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13039784 ctcctatatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 13039733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 372
Target Start/End: Original strand, 26932543 - 26932906
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttat-gacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||             
T  26932543 agaagaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgtta 26932642  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  26932643 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 26932742  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  26932743 ttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgtttc 26932842  T
Q  317 agccccctcta--------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    | |||||||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26932843 aaccccctctatctctctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 26932906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 15530207 - 15530458
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15530207 aagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 15530305  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  15530306 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaagcccttgcttcagc 15530405  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530406 cccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15530458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 129 - 371
Target Start/End: Original strand, 3233822 - 3234065
Alignment:
Q  129 tcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtg 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  3233822 tcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 3233921  T
Q  228 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3233922 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctct 3234021  T
Q  327 atctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||| || |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3234022 atcttaaggtttacactgatacaa-gtctatatttatagtaaaag 3234065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 226 - 399
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072240
Alignment:
Q  226 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccttc 1072166  T
Q  326 tatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  1072167 tatctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttggaacaaatctgc 1072240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22490870 - 22490618
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22490870 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 22490771  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttc-taaacccttgtttcag 318  Q
     |||| || ||    || |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22490770 gcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttcaaaaacccttgtttcag 22490671  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||| |||||||    
T  22490670 ccccctctatctcaaggtttacactaattcaatgtctatatttatggtaaaag 22490618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 24338531 - 24338783
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  |  ||||| |  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||     
T  24338531 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgtttt 24338630  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccc-tagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338631 ccaaggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 24338730  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24338731 ccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24338783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Original strand, 12161641 - 12161889
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||  ||||||| |||||||| ||| || ||| ||| ||||||||    
T  12161641 aagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttc 12161740  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12161741 ccaacgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcca--gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcag- 12161837  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||| |||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12161838 cccctttatctcaaggtttacaatgatacaatgtctatatttaaagtaaaag 12161889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 251
Target Start/End: Original strand, 5273220 - 5273431
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga------------agagaaatcaatgggttaca 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||            ||||||||||||||||||||    
T  5273220 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttaca 5273319  T
Q  142 agaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccaca 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5273320 agaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 5273419  T
Q  240 aaccctagtgtt 251  Q
    ||||||||||||    
T  5273420 aaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 3027938 - 3028186
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3027938 aagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 3028037  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 318  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  3028038 ccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcc-ttccaaacccttgttttcag 3028132  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028133 ccccttttatctcatggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3028186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 225 - 371
Target Start/End: Original strand, 32447504 - 32447651
Alignment:
Q  225 gtgaatcaacccacaaacc-ctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 323  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447504 gtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 32447603  T
Q  324 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32447604 tctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 32447651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 251 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8995578 - 8995430
Alignment:
Q  251 ttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaa 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  8995578 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaa 8995479  T
Q  351 ggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    | ||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  8995478 gatctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 8995430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852520
Alignment:
Q  242 ccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgct 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttact 17852551  T
Q  342 ttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17852550 ctgattcaaagtctatatttatagtaaaagt 17852520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 26066106 - 26066307
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |              
T  26066106 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttac 26066205  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  26066206 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 26066305  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  26066306 tc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15719872 - 15719666
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  15719872 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 15719773  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||||||| |   |||||||||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||    
T  15719772 ccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccctagttt--------gatttctaaacccttgtttcagc 15719685  T
Q  320 cccctctatctcaaagttt 338  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  15719684 cccctctatctcaaggttt 15719666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 26068377 - 26068578
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatg----------- 120  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||               
T  26068377 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttac 26068476  T
Q  121 -aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  26068477 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtt 26068576  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  26068577 tc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 225 - 364
Target Start/End: Original strand, 13870611 - 13870749
Alignment:
Q  225 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 324  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13870611 gtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag-cccct 13870709  T
Q  325 ctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttata 364  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13870710 ctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 29754691 - 29754892
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  29754691 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 29754790  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  29754791 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 29754890  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  29754891 tc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33309188 - 33308988
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  33309188 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 33309089  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  33309088 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 33308990  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  33308989 tc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33311457 - 33311257
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||              
T  33311457 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 33311358  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  33311357 aaagagaaatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 33311259  T
Q  219 tc 220  Q
    ||    
T  33311258 tc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Original strand, 16455510 - 16455701
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | || | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  16455510 aagagatatcaaagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttc 16455609  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  16455610 ccaaggtgaatcaa-ccac-aaccctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctagtttttgtgttgac-ttctaaacccttgttt 16455701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 1069694 - 1069907
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggga-gagagcagccctccgatccactata-tgatga-- 121  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||      
T  1069694 aaagaagaga-gaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagt 1069792  T
Q  122 -----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatccta 210  Q
               ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1069793 aaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatccta 1069892  T
Q  211 acagtgtttcccaag 225  Q
    | |||||||||||||    
T  1069893 atagtgtttcccaag 1069907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14466553 - 14466312
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14466553 aagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 14466454  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccac-aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 318  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| | ||           || |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  14466453 ccaagatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaa-----------tagacaaactctagttttgctgttgtctttctaaactcttgtttcaa 14466365  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||| ||||||||||| ||||  | | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14466364 ccctctctatctcaaggtttattctaatacaaagtctatatctatagtaaaag 14466312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17012270 - 17012029
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||  ||||||  || ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  17012270 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatattgtttc 17012171  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt-ttcag 318  Q
      || |||||||||||    |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||    
T  17012170 agaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgtttac-ttctaaacccttttattcag 17012076  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 365  Q
     |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  17012075 acccctctatctcaaggtttactccgatacaaggtctatatttatag 17012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 470 - 559
Target Start/End: Original strand, 19227799 - 19227888
Alignment:
Q  470 ccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||    
T  19227799 ccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctcaaaaattgaaacctccatcatgcc 19227888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15367340 - 15367129
Alignment:
Q  57 acccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagag--cagccctccgatccactatatgatgaa-------------gagaaatcaatgggttaca 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||             |||| || |||||||||||    
T  15367340 acccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatgggttaca 15367241  T
Q  142 agaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaa 240  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  ||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |    
T  15367240 agaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---a 15367144  T
Q  241 accctagtgtttgtt 255  Q
    |||||||||||||||    
T  15367143 accctagtgtttgtt 15367129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 8995400 - 8995323
Alignment:
Q  474 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  8995400 cagcgcaccatcgtgccacgatgtgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaa-aactgaaacctcca 8995323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 9019847 - 9019770
Alignment:
Q  474 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcctaaataactaaaacctcca 552  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  9019847 cagcgcaccatcgtgccacgatgtgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcccaaa-aactgaaacctcca 9019770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 434 - 527
Target Start/End: Original strand, 11983382 - 11983476
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983382 aacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 11983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 474 - 559
Target Start/End: Original strand, 14507569 - 14507656
Alignment:
Q  474 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttg--cctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  14507569 cagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccaccatttttccagtgccttgtatcaaaaaaactgaaacctccatcgtgcc 14507656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346369
Alignment:
Q  206 tcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttcta 304  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||   |        ||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccca---accctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaaccctagtttgaat--------tcta 15346437  T
Q  305 aacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15346436 aacccttggttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 15346369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19696670 - 19696420
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||| |   | |||||||| |||||||| ||  ||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  19696670 aagagatatcaaaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgttt 19696571  T
Q  220 cccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-ca 317  Q
    |||||| ||||||||      |||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  19696570 cccaaggtgaatcaatttg--aaccctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaaccctaattt-gttgtttg-tttctaaacccttgttttca 19696476  T
Q  318 gccc--cctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||  |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  19696475 gccctccctctctctcaaggtttcatcatatacaaggtctatatttatagtaaaag 19696420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10584212 - 10584105
Alignment:
Q  259 aagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctata 358  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||     ||||||||||||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  10584212 aagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgttt-----ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttata 10584118  T
Q  359 tttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||||||    
T  10584117 tttatagtaaaag 10584105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 234
Target Start/End: Original strand, 12186056 - 12186271
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata-tgatga------------ 121  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||                
T  12186056 agaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 12186155  T
Q  122 -agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||  ||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  12186156 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgttt 12186255  T
Q  220 cccaa-gtgaatcaac 234  Q
    ||||| ||||||||||    
T  12186256 cccaaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26084895 - 26084818
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  26084895 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcaccatcgtgccacgatgcgattcaatcgtggcacgatttttccagtg 26084818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 10584325 - 10584245
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  10584325 agaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactata 10584245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26945374 - 26945269
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtc-taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |   | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  26945374 aagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgttt 26945275  T
Q  220 cccaag 225  Q
    ||||||    
T  26945274 cccaag 26945269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Original strand, 30729181 - 30729282
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||    
T  30729181 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttctgttattcgctgccagcgcactatcgtgccacgttgtgaccccatcgtggcacgaaatttccagtgacttgc 30729280  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  30729281 ct 30729282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Original strand, 12186330 - 12186405
Alignment:
Q  299 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctcaaagtttgctt-tgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12186330 tttctaaacccttgttttcagccccttctatctcaaggtttacatgtgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 12186405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15346655 - 15346589
Alignment:
Q  57 acccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatgaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  15346655 acccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactatatgatgaa 15346589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 472 - 534
Target Start/End: Original strand, 15530514 - 15530576
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15530514 gccagcacaccatcgtgccacgatgcggccccatcgtaccacgaattttcgagtgctttgcct 15530576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13878787 - 13878727
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13878787 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13883535 - 13883475
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13883535 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16785979 - 16785919
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16785979 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 26887346 - 26887406
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26887346 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 31248836 - 31248896
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31248836 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 35201448 - 35201508
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35201448 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25477611 - 25477543
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctc 103  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25477611 agaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctc 25477543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 115
Target Start/End: Original strand, 12937219 - 12937258
Alignment:
Q  76 gacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12937219 gacctagtctggggagagagcagccctccgttccactata 12937258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 3577637 - 3577696
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3577637 ctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17036115 - 17036058
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17036115 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17036058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 17694973 - 17695030
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  17694973 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 12166268 - 12166320
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  12166268 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 12166320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 22352216 - 22352293
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  22352216 aaaaatacgttttgtttttatcttcaatcgcaccatcgtggcacgattcgatccaatcgtggcacaatttttccagtg 22352293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 526
Target Start/End: Original strand, 28241691 - 28241768
Alignment:
Q  449 aaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||||| |||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  28241691 aaaaatacgttttatttttatcttcaatcgcactatcgtggcacgattcgatacaatcgtggcacgatttttccagtg 28241768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 3577515 - 3577555
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3577515 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 3577555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 13467492 - 13467532
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13467492 tgacctagtctggggagagagcagctctccgttccactata 13467532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18318048 - 18318004
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18318048 tctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 18318004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14466653 - 14466606
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagt 83  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14466653 agaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagt 14466606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 22963708 - 22963767
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22963708 tgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactat 22963767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23824685 - 23824626
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23824685 tgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactat 23824626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15346576 - 15346522
Alignment:
Q  122 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcc 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||    
T  15346576 agagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcttaattttactcaaagtcc 15346522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 22351974 - 22352031
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  22351974 ctaattctacccaaa-tctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 115
Target Start/End: Original strand, 24338462 - 24338511
Alignment:
Q  65 cggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  24338462 cggtccaaattgacatagtctgggg-gagagcagccctccgtttcactata 24338511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25941703 - 25941652
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  25941703 ctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 25941652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 3233710 - 3233795
Alignment:
Q  36 agaacacaaaagaattttatgacccagtcc-----ggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |     |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  3233710 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactata 3233795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13878883 - 13878842
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13878883 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 13878842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13883631 - 13883590
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13883631 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 13883590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16786075 - 16786034
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16786075 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 16786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 216
Target Start/End: Original strand, 19701985 - 19702041
Alignment:
Q  159 taattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  19701985 taattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24436058 - 24436001
Alignment:
Q  57 acccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    ||||||| || |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24436058 acccagttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccacta 24436001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 35201352 - 35201393
Alignment:
Q  75 tgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201352 tgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 35201393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5572330 - 5572270
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5572330 tgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 5572270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5757567 - 5757507
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  5757567 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10077254 - 10077194
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10077254 tgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10077194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 115
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911511
Alignment:
Q  76 gacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 12911511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Original strand, 17904566 - 17904632
Alignment:
Q  240 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17904566 aaccttagtgtttgttgcaaagagaaaa---ctctacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaaccct 17904632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 21356044 - 21356104
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgg-ggagagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21356044 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 26887252 - 26887291
Alignment:
Q  75 tgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26887252 tgacctagtctgggg-gagagcagctctccgatccactata 26887291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Original strand, 69256 - 69658
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  69256 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccacta 69355  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  69356 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagac 69455  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69456 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 69555  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctcta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |  ||||||||    
T  69556 tctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatataaggtctatatttattgtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatc 69655  T
Q  397 tgc 399  Q
    |||    
T  69656 tgc 69658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 225 - 372
Target Start/End: Original strand, 73212 - 73363
Alignment:
Q  225 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73212 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 73311  T
Q  325 cta----tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  73312 ctatctctctcaaagtttcctttgatacacggtctatatttatagtaaaagt 73363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 472 - 534
Target Start/End: Original strand, 69686 - 69748
Alignment:
Q  472 gccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgcct 534  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  69686 gccagcacaccatcgtgcaacgatgcgatcccattgtgctacgatttttccagtgctttgcct 69748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 73163 - 73210
Alignment:
Q  213 agtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaa 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  73163 agtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttttttccaa 73210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3203 - 2805
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3203 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccacta 3104  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||     
T  3103 tatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagac 3004  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3003 tcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 2904  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  2903 tctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaagttctatatttatagtaaaagtttcgcttaaaatttggaacaaatctgc 2805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 434 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2815 - 2697
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2815 aacaaatctgcacccaaaaatacgtttatgttattcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgatcccatcgtgccacgatttttccagtaccttgc 2716  T
Q  533 ctaaataactaaaacctcca 552  Q
    || || |||| |||||||||    
T  2715 ctcaa-aactgaaacctcca 2697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 33 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 6505 - 6103
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga---------- 121  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  6505 agaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 6406  T
Q  122 --agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagt-caatcctaacagtgtt 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  6405 aaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtt 6306  T
Q  219 tcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6305 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttca 6206  T
Q  318 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  6205 gccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaaactgtaacaaatctgctttaaatttgtaacaaat 6106  T
Q  418 ctg 420  Q
    |||    
T  6105 ctg 6103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 431 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 6115 - 5977
Alignment:
Q  431 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcctt 530  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6115 tgtaacaaatctgcacccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccatgatgagaccccatcatgccacgatttttccagtgcctt 6016  T
Q  531 gcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6015 gcctaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 5977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4304 - 3922
Alignment:
Q  30 aagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------- 121  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||            
T  4304 aagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacttt 4205  T
Q  122 -----agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4204 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 4105  T
Q  217 tttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104 tttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4006  T
Q  316 cagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  4005 cagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtattgcttaaaatttgaaacaaatctgc 3922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22206 - 21965
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22206 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 22107  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22106 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 22007  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 21965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 328 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 24481 - 24240
Alignment:
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgcctaatatttgtaacaaatctgtaacaaa 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24481 tctccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtcctgcttaaaatctataacaaatctgcctaaaatttgtaacaaatctgtaacaaa 24382  T
Q  428 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24381 aactgtaacaaatctgctcccaaaaatatgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgc 24282  T
Q  528 cttgcctaaataactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 569  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24281 cttgcccaaaaaactaaaacctccatcgtgccgcgaagccca 24240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22441 - 22221
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22441 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T
Q  111 ctatatgatg------------aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| |||||            |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  22342 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 22244  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  22243 gactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24716 - 24496
Alignment:
Q  13 gtgagatgaacataaagaaga-gaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatcca 110  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24716 gtgagaagaaca-aaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T
Q  111 ctatatgatg------------aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaaga 198  Q
    |||| |||||            |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24617 ctatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 24519  T
Q  199 gagt-caatcctaacagtgtttc 220  Q
    || | ||||||||| ||||||||    
T  24518 gactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8508 - 8448
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8508 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 183605 - 183975
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  183605 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcacta 183704  T
Q  114 tatgatga-------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagaga 200  Q
    ||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  183705 tatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccg-taaccaagaga 183803  T
Q  201 gtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcct 299  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  183804 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcct 183903  T
Q  300 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  183904 ttctaaacctttgtttcag-cccttctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagt 183975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52324 - 51961
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg---agagagcagccctccgatccactatatgatga- 121  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  52324 aaagaagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgag 52227  T
Q  122 ------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcct 209  Q
                |||||  |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52226 taacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 52127  T
Q  210 aacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 308  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52126 aatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacc 52027  T
Q  309 cttgtttcagccccctcta--tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52026 cttgtttcagccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 51961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 50325 - 50235
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctggg---gagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  50325 aaagaagagaagaacacaa--gaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 79497 - 79140
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  79497 aaagaagaga-gaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagta 79399  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  79398 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 79299  T
Q  212 cagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79298 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 79199  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaa 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  79198 tgttttagccccctctatctcaagttttactctgattcaaggtctatatttatagtaaa 79140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 29494 - 29086
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 113  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29494 gagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 29395  T
Q  114 tatgatga------------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagag 201  Q
    ||||||||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||     
T  29394 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagac 29295  T
Q  202 tcaatcctaacagtgtttcccaagt-gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29294 tcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 29195  T
Q  301 tctaaacccttgtttcagccccctcta----------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataa 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  29194 tttaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagttttgcttaaaatttgtaa 29095  T
Q  391 caaatctgc 399  Q
    |||||||||    
T  29094 caaatctgc 29086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 431 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 29099 - 29001
Alignment:
Q  431 tgtaacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 528  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099 tgtaacaaatctgcactcaaaaatatgtttctgtttttcgctgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgcc 29001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 11449 - 11809
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||       
T  11449 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagta 11547  T
Q  122 ----------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaa 211  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11548 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 11647  T
Q  212 cagtgtttcccaagtgaa-tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 310  Q
     |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||     
T  11648 tagtgtttcccaaggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccc 11747  T
Q  311 tgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11748 tgtttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagt 11809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 359
Target Start/End: Original strand, 14376 - 14707
Alignment:
Q  45 aagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agagaaatc 130  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||             ||||| |||    
T  14376 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatc 14475  T
Q  131 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14476 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 14575  T
Q  230 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta-- 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||      
T  14576 tcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctctatc 14675  T
Q  328 tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatat 359  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  14676 tctcaaagtttgctctaaaacaaggtctatat 14707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 121 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15223 - 14944
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15223 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 15124  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15123 ccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgtttcagc 15024  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagttctgcttaaaatctataacaaatctgc 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  |||||||||||    
T  15023 cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatcgcttaaaatttggaacaaatctgc 14944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14954 - 14853
Alignment:
Q  434 aacaaatctgctcccaaaaatacgttt-tatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | || ||  | ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  14954 aacaaatctgcacccaaaaatatgtttctgttattcgctgccagcgcaccatcgtgtcacgttgtgatcccatcgtgccacgaaatttccagtgacttgc 14855  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  14854 ct 14853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15298 - 15236
Alignment:
Q  60 cagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15298 cagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatga 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 348 - 34
Alignment:
Q  32 gagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--------- 121  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||             
T  348 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgtta 249  T
Q  122 ---agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtc-aatcctaacagtgt 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  248 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 149  T
Q  218 ttcccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  148 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttc 49  T
Q  317 agccccctctatctc 331  Q
    |||||||||||||||    
T  48 agccccctctatctc 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1673
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga--- 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  1428 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 1527  T
Q  122 ---------agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaac 212  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  1528 tcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 1627  T
Q  213 agtgtttcccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1628 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2245 - 1988
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2245 aagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 2146  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaactctgtacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 2047  T
Q  320 cccctcta------tctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||| ||      |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2046 cccctatatctttctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2294 - 2258
Alignment:
Q  85 tggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2294 tggggagagagtagccctccgattcactatatgatga 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 145 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35593
Alignment:
Q  145 ataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag-tgaatcaacccacaaacc 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  244 ctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgcttt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |   |||||   |    
T  35719 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cgcctctatcacccggtttgtact 35621  T
Q  344 gatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35620 gatacaatgtctatatttatagtaaaag 35593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 35906 - 35817
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  35906 aaagaagaga-gaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 80158 - 79812
Alignment:
Q  40 cacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatga-------------agag 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||             ||||    
T  80158 cacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagag 80059  T
Q  126 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttcccaag 225  Q
    |  |||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  80058 atgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaag 79960  T
Q  226 -tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 323  Q
     ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  79959 gtgaatcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccc 79860  T
Q  324 tctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  79859 tctatctcaaggtttacactgatacaaaaactatatttatagtaaaag 79812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 188364 - 188424
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  188364 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 85434 - 85184
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||  |||||||| ||| |||||||||  |||||||     
T  85434 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgtttt 85335  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |    
T  85334 ccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttttaaatccttgtttc-tc 85236  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaag 371  Q
    | | |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  85235 ctcttctatctcaaggtttactttgatacaaagcctatatttatagtaaaag 85184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 85543 - 85454
Alignment:
Q  26 aaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctccgatccactata 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  | |||  || | || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  85543 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactata 85454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 433 - 559
Target Start/End: Original strand, 12868 - 12994
Alignment:
Q  433 taacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgcgaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12868 taacaaatctgctcccaaaaatacgttttatttttatccgccagcgcaccatcgtgccacgatgagaccccatcgtgccacgatttttccagtgccttgc 12967  T
Q  533 ctaaataactaaaacctccatcgtgcc 559  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12968 ccaaaaaactaaaacctccatcgtgcc 12994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Original strand, 15906 - 16154
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15906 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 16005  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
     ||| |||||||||||    |||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  16006 gcaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttatttcaac 16101  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16102 cccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagt 16154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Original strand, 16735 - 16981
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  16735 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttc 16834  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttg-tttcag 318  Q
    | || ||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  16835 ctaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgtctttc-aaacccttgttttcag 16929  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaa 370  Q
    || |||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16930 cctcctctatctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatattaaaa 16981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 258 - 372
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1167
Alignment:
Q  258 aaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctat 357  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1053 aaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctat 1152  T
Q  358 atttatagtaaaagt 372  Q
    ||||||||| |||||    
T  1153 atttatagtgaaagt 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Original strand, 1727 - 1958
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  1727 aagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttc 1826  T
Q  221 ccaa-gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 319  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||          ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1827 ccaaggtgaatcaa-ccac-aaccctagtgtttgtt---------gaaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttcagc 1914  T
Q  320 cccctctatctcaaagtttgc-tttgatacaaggtctatattta 362  Q
    | |||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  1915 cacctctatctctaggtttacatctgatacaaggtctatattta 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5014 - 4773
Alignment:
Q  121 aagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgtttc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||  ||||||   | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5014 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 4915  T
Q  221 ccaag-tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaattctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt-cag 318  Q
    ||||  |||||||| |    ||| |||||||||||| |  ||||| |||  ||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |||| ||| |||    
T  4914 ccaacatgaatcaaactc--aactctagtgtttgttgctgagaga-aaacgctatataaaccctagttt-gttgcttactt-ctaaatcctttttttcag 4820  T
Q  319 ccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 365  Q
     |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4819 acccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 4773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 1415 - 1485
Alignment:
Q  15 gagatgaacataaagaagagaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct 85  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1415 gagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 104
Target Start/End: Original strand, 4661 - 4733
Alignment:
Q  33 agaagaacacaaaagaattttatgacccagtccggtccaaattgacctagtct-ggggagagagcagccctcc 104  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4661 agaacaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 224879 - 224819
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtgttt 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  224879 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 5691 - 5751
Alignment:
Q  55 tgacccagtccggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactat 114  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  5691 tgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16385 - 16328
Alignment:
Q  158 ctaattctacccaaagtcccagcctcttccggtaaccaagagagtcaatcctaacagtg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  16385 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3136
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3095 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 17011 - 17052
Alignment:
Q  75 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactata 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17011 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 17052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University