View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19391_low_13 (Length: 304)

Name: NF19391_low_13
Description: NF19391
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19391_low_13
NF19391_low_13
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (13-209)||(26704351-26704547)
chr6 (13-214)||(30691845-30692046)
chr6 (13-209)||(2837544-2837740)
chr6 (13-209)||(6086611-6086807)
chr6 (13-215)||(26946888-26947090)
chr6 (17-204)||(3955782-3955969)
chr6 (13-209)||(3347535-3347731)
chr6 (13-204)||(17261085-17261276)
chr6 (13-214)||(9459557-9459758)
chr6 (13-209)||(21893454-21893650)
chr6 (13-212)||(20726787-20726982)
chr6 (13-209)||(11167239-11167435)
chr6 (13-209)||(18613537-18613733)
chr6 (13-204)||(34887304-34887495)
chr6 (16-209)||(16307023-16307216)
chr6 (13-198)||(1153603-1153788)
chr6 (13-205)||(30698941-30699133)
chr6 (13-204)||(28199520-28199712)
chr6 (22-209)||(35198283-35198469)
chr6 (45-209)||(52835-52999)
chr6 (13-138)||(33464399-33464524)
chr6 (13-115)||(53001-53103)
chr6 (130-204)||(33463705-33463779)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (13-216)||(14422695-14422898)
chr8 (13-209)||(18594536-18594732)
chr8 (13-209)||(39206585-39206781)
chr8 (16-209)||(10836770-10836963)
chr8 (13-210)||(29938059-29938256)
chr8 (13-209)||(22260642-22260838)
chr8 (13-204)||(2042536-2042727)
chr8 (13-204)||(13110408-13110599)
chr8 (16-210)||(35118046-35118240)
chr8 (13-209)||(7774763-7774959)
chr8 (13-209)||(24113178-24113374)
chr8 (13-204)||(144398-144589)
chr8 (13-214)||(4035841-4036042)
chr8 (13-209)||(33278399-33278595)
chr8 (13-212)||(38167167-38167366)
chr8 (13-203)||(34679469-34679659)
chr8 (13-209)||(6144285-6144481)
chr8 (13-209)||(39218776-39218972)
chr8 (13-217)||(44804956-44805160)
chr8 (13-204)||(7791415-7791606)
chr8 (13-204)||(34842377-34842568)
chr8 (13-200)||(34998908-34999095)
chr8 (16-204)||(41575517-41575705)
chr8 (16-209)||(7811994-7812187)
chr8 (16-202)||(36491163-36491349)
chr8 (13-210)||(5320562-5320759)
chr8 (52-209)||(40117903-40118060)
chr8 (13-204)||(28639282-28639475)
chr8 (69-209)||(26783801-26783941)
chr8 (45-209)||(33287069-33287233)
chr8 (17-213)||(8021714-8021902)
chr8 (16-205)||(42571597-42571783)
chr8 (13-204)||(66191-66383)
chr8 (13-129)||(9807339-9807455)
chr8 (57-209)||(2322068-2322220)
chr8 (80-203)||(5005171-5005294)
chr8 (57-204)||(39220260-39220407)
chr8 (121-204)||(9806877-9806960)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (17-216)||(25999375-25999574)
chr3 (13-209)||(37698141-37698337)
chr3 (16-209)||(42307906-42308099)
chr3 (16-216)||(15520143-15520343)
chr3 (16-204)||(38856092-38856280)
chr3 (13-212)||(25494283-25494482)
chr3 (13-203)||(21581042-21581232)
chr3 (13-209)||(22174988-22175184)
chr3 (13-214)||(8042596-8042797)
chr3 (13-209)||(29445482-29445678)
chr3 (13-209)||(50528923-50529119)
chr3 (13-204)||(32244119-32244310)
chr3 (13-209)||(20842346-20842542)
chr3 (13-209)||(46452160-46452356)
chr3 (16-214)||(12117659-12117857)
chr3 (13-209)||(15520630-15520826)
chr3 (13-209)||(54870172-54870368)
chr3 (13-204)||(20699148-20699339)
chr3 (13-203)||(35226447-35226637)
chr3 (13-209)||(38933940-38934135)
chr3 (13-209)||(54534326-54534520)
chr3 (16-203)||(44609334-44609521)
chr3 (13-199)||(42104969-42105155)
chr3 (13-209)||(24835697-24835893)
chr3 (13-204)||(32359258-32359449)
chr3 (13-202)||(2895186-2895379)
chr3 (19-203)||(26122814-26122998)
chr3 (11-209)||(34700335-34700533)
chr3 (13-203)||(53028225-53028407)
chr3 (14-158)||(16354391-16354535)
chr3 (13-182)||(44688782-44688950)
chr3 (52-204)||(35643216-35643368)
chr3 (13-203)||(48925001-48925189)
chr3 (69-203)||(50529827-50529961)
chr3 (13-176)||(12915934-12916096)
chr3 (75-214)||(49128038-49128177)
chr3 (13-89)||(24366143-24366219)
chr3 (5-82)||(13696914-13696991)
chr3 (16-49)||(50528883-50528916)
chr3 (161-202)||(24366093-24366134)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (17-218)||(9008073-9008274)
chr5 (13-209)||(27679181-27679377)
chr5 (13-204)||(24105683-24105874)
chr5 (13-209)||(1579036-1579232)
chr5 (13-209)||(1605583-1605779)
chr5 (13-209)||(33491208-33491404)
chr5 (13-206)||(16737459-16737652)
chr5 (13-204)||(16069358-16069549)
chr5 (13-203)||(3386498-3386688)
chr5 (16-209)||(27420858-27421051)
chr5 (13-209)||(20992158-20992354)
chr5 (5-209)||(4120937-4121141)
chr5 (13-204)||(31883149-31883340)
chr5 (13-209)||(19358526-19358722)
chr5 (13-204)||(3921586-3921777)
chr5 (17-212)||(5202969-5203164)
chr5 (13-202)||(1165613-1165802)
chr5 (13-209)||(8374351-8374546)
chr5 (16-209)||(33991140-33991333)
chr5 (16-214)||(35782659-35782857)
chr5 (17-203)||(38598466-38598652)
chr5 (13-210)||(31410475-31410672)
chr5 (16-172)||(26602957-26603113)
chr5 (13-164)||(27025001-27025152)
chr5 (74-203)||(20992354-20992487)
chr5 (68-201)||(33284642-33284775)
chr5 (13-59)||(35420436-35420482)
chr5 (73-158)||(31638196-31638281)
chr5 (90-143)||(41818552-41818605)
chr5 (57-209)||(25634582-25634732)
chr5 (75-158)||(19516044-19516127)
chr5 (178-210)||(26603109-26603141)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (5-209)||(1168500-1168704)
chr1 (13-203)||(29078519-29078709)
chr1 (13-209)||(25897371-25897567)
chr1 (13-209)||(39260358-39260554)
chr1 (13-215)||(20089462-20089664)
chr1 (13-209)||(26580282-26580478)
chr1 (13-209)||(52753159-52753355)
chr1 (13-209)||(33510481-33510677)
chr1 (5-204)||(8079713-8079912)
chr1 (13-204)||(26663260-26663451)
chr1 (13-209)||(29288146-29288340)
chr1 (13-209)||(16052093-16052289)
chr1 (15-203)||(38829072-38829260)
chr1 (13-217)||(970536-970742)
chr1 (13-204)||(43905656-43905847)
chr1 (13-209)||(1940759-1940955)
chr1 (17-209)||(41928511-41928703)
chr1 (13-209)||(52696788-52696984)
chr1 (13-204)||(19715173-19715364)
chr1 (13-203)||(12682823-12683013)
chr1 (13-219)||(42370807-42371013)
chr1 (13-209)||(1170456-1170652)
chr1 (17-203)||(40092494-40092680)
chr1 (13-209)||(32671576-32671772)
chr1 (13-204)||(5215387-5215578)
chr1 (13-204)||(8120871-8121062)
chr1 (13-204)||(46760968-46761159)
chr1 (13-209)||(2347653-2347850)
chr1 (13-209)||(17591688-17591881)
chr1 (13-190)||(17587517-17587694)
chr1 (19-204)||(49146174-49146359)
chr1 (13-210)||(51359229-51359425)
chr1 (17-217)||(15203101-15203301)
chr1 (13-204)||(2473724-2473915)
chr1 (16-203)||(13996738-13996925)
chr1 (13-204)||(46409437-46409630)
chr1 (13-206)||(15717785-15717977)
chr1 (13-204)||(7145209-7145400)
chr1 (16-212)||(23498454-23498650)
chr1 (13-204)||(6765461-6765652)
chr1 (40-203)||(29695678-29695842)
chr1 (13-209)||(15554164-15554352)
chr1 (13-172)||(40149497-40149656)
chr1 (77-203)||(52086270-52086396)
chr1 (13-204)||(38171834-38172012)
chr1 (58-193)||(23322897-23323032)
chr1 (227-280)||(20279752-20279805)
chr1 (57-209)||(5217840-5217991)
chr1 (216-289)||(33308905-33308978)
chr1 (162-217)||(5675094-5675149)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (13-214)||(33359092-33359293)
chr7 (13-209)||(30181026-30181222)
chr7 (13-202)||(12101180-12101369)
chr7 (13-202)||(42964998-42965187)
chr7 (16-204)||(7164187-7164375)
chr7 (13-209)||(24792334-24792530)
chr7 (16-214)||(22649699-22649897)
chr7 (13-214)||(42204147-42204349)
chr7 (13-209)||(43067975-43068171)
chr7 (13-204)||(3511326-3511517)
chr7 (13-204)||(4477323-4477514)
chr7 (13-204)||(5280863-5281054)
chr7 (13-204)||(20346491-20346682)
chr7 (13-215)||(25748479-25748681)
chr7 (13-204)||(1803029-1803220)
chr7 (13-203)||(933289-933479)
chr7 (13-214)||(15655905-15656106)
chr7 (13-210)||(43156710-43156907)
chr7 (17-209)||(32041540-32041732)
chr7 (13-209)||(33846531-33846722)
chr7 (13-206)||(38866545-38866738)
chr7 (18-214)||(4347266-4347462)
chr7 (13-209)||(6394749-6394945)
chr7 (13-215)||(12097592-12097794)
chr7 (13-209)||(36890832-36891027)
chr7 (13-204)||(42673468-42673655)
chr7 (13-204)||(9452593-9452784)
chr7 (20-204)||(8630669-8630853)
chr7 (16-204)||(46134309-46134497)
chr7 (13-204)||(46891341-46891533)
chr7 (13-204)||(17753603-17753794)
chr7 (13-151)||(48865689-48865827)
chr7 (13-215)||(16894509-16894701)
chr7 (13-202)||(43021582-43021767)
chr7 (62-209)||(19828268-19828415)
chr7 (57-204)||(37005857-37006004)
chr7 (57-214)||(43405013-43405170)
chr7 (112-209)||(37704978-37705075)
chr7 (57-209)||(15655458-15655610)
chr7 (64-211)||(36849590-36849737)
chr7 (118-202)||(27691433-27691517)
chr7 (57-212)||(30075277-30075429)
chr7 (73-140)||(20163886-20163953)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (13-209)||(36702-36898)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (13-209)||(54189542-54189738)
chr4 (13-209)||(15241028-15241224)
chr4 (13-211)||(19913630-19913828)
chr4 (15-220)||(38055143-38055348)
chr4 (17-209)||(23776463-23776655)
chr4 (13-209)||(50055101-50055297)
chr4 (16-204)||(1756767-1756955)
chr4 (13-209)||(14987789-14987985)
chr4 (13-209)||(53717464-53717660)
chr4 (13-204)||(16700783-16700974)
chr4 (13-204)||(20877049-20877240)
chr4 (13-204)||(52139205-52139396)
chr4 (13-204)||(54412630-54412821)
chr4 (13-203)||(28032712-28032902)
chr4 (13-204)||(19164973-19165163)
chr4 (13-209)||(27488648-27488844)
chr4 (13-209)||(50353798-50353994)
chr4 (13-204)||(1617086-1617277)
chr4 (5-204)||(11639570-11639769)
chr4 (13-204)||(43289960-43290151)
chr4 (13-215)||(31969672-31969874)
chr4 (13-198)||(37968757-37968942)
chr4 (13-209)||(2481408-2481604)
chr4 (13-209)||(6611360-6611556)
chr4 (13-209)||(44784917-44785113)
chr4 (13-209)||(45424534-45424730)
chr4 (13-196)||(8591092-8591275)
chr4 (13-204)||(40428720-40428911)
chr4 (5-203)||(23704201-23704399)
chr4 (13-203)||(48909849-48910039)
chr4 (13-214)||(8932178-8932379)
chr4 (13-204)||(30423565-30423755)
chr4 (13-204)||(35490773-35490964)
chr4 (13-209)||(6688627-6688817)
chr4 (13-209)||(15669180-15669376)
chr4 (13-209)||(37464718-37464914)
chr4 (13-204)||(47632036-47632228)
chr4 (13-204)||(53875659-53875850)
chr4 (13-209)||(53353052-53353256)
chr4 (13-210)||(33703837-33704034)
chr4 (13-202)||(27583632-27583821)
chr4 (13-209)||(27536104-27536296)
chr4 (16-202)||(40680041-40680227)
chr4 (13-203)||(44379187-44379377)
chr4 (13-204)||(30171582-30171773)
chr4 (13-204)||(44375847-44376038)
chr4 (35-203)||(28360433-28360602)
chr4 (5-209)||(55344817-55345021)
chr4 (17-197)||(38071327-38071504)
chr4 (57-209)||(50053440-50053592)
chr4 (13-209)||(16703822-16704014)
chr4 (13-129)||(23269046-23269162)
chr4 (121-204)||(23265865-23265948)
chr4 (58-140)||(51780763-51780845)
chr4 (57-209)||(44548185-44548338)
chr4 (13-88)||(53408137-53408213)
chr4 (57-169)||(17493370-17493482)
chr4 (13-64)||(23261886-23261937)
chr4 (13-104)||(9595902-9595982)
chr4 (13-50)||(50055301-50055338)
chr4 (62-119)||(55344724-55344781)
chr4 (13-67)||(48748197-48748251)
chr4 (161-209)||(9595983-9596030)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (13-209)||(22963-23159)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (16-212)||(3873259-3873455)
chr2 (13-212)||(31517227-31517426)
chr2 (13-203)||(33906059-33906249)
chr2 (16-209)||(26323201-26323394)
chr2 (13-209)||(18806896-18807092)
chr2 (16-209)||(4232157-4232350)
chr2 (21-209)||(1108277-1108464)
chr2 (13-209)||(2178781-2178977)
chr2 (13-204)||(28329851-28330040)
chr2 (13-209)||(39635449-39635645)
chr2 (13-204)||(4016041-4016232)
chr2 (13-202)||(16066306-16066495)
chr2 (13-204)||(42937721-42937913)
chr2 (13-198)||(5733407-5733592)
chr2 (13-209)||(6174840-6175036)
chr2 (15-204)||(16588790-16588979)
chr2 (13-204)||(1482915-1483105)
chr2 (13-192)||(19383947-19384126)
chr2 (16-214)||(19901153-19901350)
chr2 (13-204)||(850999-851190)
chr2 (57-204)||(30420223-30420370)
chr2 (13-209)||(30270691-30270887)
chr2 (16-192)||(429830-430006)
chr2 (13-202)||(44947561-44947743)
chr2 (216-291)||(32688711-32688786)
chr2 (57-209)||(42446625-42446777)
chr2 (64-158)||(22101210-22101304)
chr2 (57-148)||(3585348-3585439)
chr2 (234-291)||(10068353-10068410)
chr2 (216-272)||(15691952-15692008)
chr2 (73-203)||(12517256-12517385)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (13-209)||(18-214)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (5-204)||(3712-3911)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (13-204)||(307-498)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (13-204)||(145257-145448)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (13-209)||(10235-10431)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (13-204)||(18-210)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 26704351 - 26704547
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704351 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 26704450  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26704451 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30692046 - 30691845
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692046 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30691947  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30691946 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcccta 30691847  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  30691846 at 30691845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2837740 - 2837544
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2837740 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatga 2837641  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2837640 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 2837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 6086611 - 6086807
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6086611 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 6086710  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6086711 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 6086807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 26946888 - 26947090
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26946888 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 26946987  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26946988 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcccta 26947087  T
Q  213 atc 215  Q
    |||    
T  26947088 atc 26947090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 204
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955969
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 3955969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 3347535 - 3347731
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3347535 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 3347634  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3347635 taagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 3347731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 17261085 - 17261276
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  17261085 aaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatatta 17261184  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17261185 taagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 17261276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9459758 - 9459557
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459758 aaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 9459659  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9459658 taagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcccta 9459559  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  9459558 at 9459557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21893650 - 21893454
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893650 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 21893551  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  21893550 taagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcc 21893454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20726982 - 20726787
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726982 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20726883  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20726882 taagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccata 20726787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11167435 - 11167239
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11167435 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 11167336  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11167335 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 11167239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18613733 - 18613537
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18613733 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatga 18613634  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18613633 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 18613537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 34887304 - 34887495
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34887304 aaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 34887403  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34887404 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 34887495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 16307023 - 16307216
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307023 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16307122  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16307123 gctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 16307216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1153788 - 1153603
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153788 aaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1153689  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatc 198  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  1153688 taatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 30698941 - 30699133
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30698941 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatga 30699040  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  30699041 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacga 30699133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 28199520 - 28199712
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28199520 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatga 28199618  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagta---gataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28199619 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 28199712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198283
Alignment:
Q  22 acataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  122 tttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaag-cttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcc 35198283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52835
Alignment:
Q  45 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  145 ttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||  |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33464524 - 33464399
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464524 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33464425  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaa 138  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33464424 taaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 53103 - 53001
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53103 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 53004  T
Q  113 taa 115  Q
    |||    
T  53003 taa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463705
Alignment:
Q  130 tttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacg 33463705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14422898 - 14422695
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422898 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 14422799  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14422798 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggccata 14422699  T
Q  213 atca 216  Q
    ||||    
T  14422698 atca 14422695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18594732 - 18594536
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18594732 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 18594633  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18594632 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 18594536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39206781 - 39206585
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206781 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 39206682  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39206681 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 10836770 - 10836963
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10836770 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 10836869  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836870 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 10836963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29938256 - 29938059
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938256 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29938157  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29938156 taagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 29938059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 22260642 - 22260838
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22260642 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactagga 22260741  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22260742 taagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 22260838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 2042536 - 2042727
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2042536 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 2042635  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2042636 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13110599 - 13110408
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13110599 aaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatga 13110500  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13110499 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 13110408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 35118046 - 35118240
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35118046 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 35118145  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35118146 gctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 35118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7774959 - 7774763
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7774959 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 7774860  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7774859 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatctaaacgaggcc 7774763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 24113178 - 24113374
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24113178 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 24113277  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24113278 taatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 24113374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 144589 - 144398
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144589 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 144490  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  144489 taaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacg 144398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4036042 - 4035841
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036042 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4035943  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  4035942 taagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcctta 4035843  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  4035842 at 4035841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33278595 - 33278399
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278595 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33278496  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33278495 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 38167167 - 38167366
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167167 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 38167266  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  38167267 taaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggccata 38167366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 34679469 - 34679659
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34679469 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 34679568  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34679569 taaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 6144285 - 6144481
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144285 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 6144384  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6144385 taagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6144481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39218972 - 39218776
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39218972 aaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatga 39218873  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39218872 taaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 39218776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 44804956 - 44805160
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44804956 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 44805055  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44805056 taagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaaatgaggccata 44805155  T
Q  213 atcaa 217  Q
    |||||    
T  44805156 atcaa 44805160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7791606 - 7791415
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7791606 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 7791507  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7791506 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacg 7791415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 34842377 - 34842568
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842377 aaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 34842476  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34842477 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 34842568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 34998908 - 34999095
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34998908 aaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaaga 34999007  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  34999008 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatcca 34999095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41575705 - 41575517
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41575705 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 41575606  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41575605 gcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacg 41575517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7812187 - 7811994
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7812187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7812088  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7812087 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcc 7811994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36491349 - 36491163
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36491349 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataa 36491250  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36491249 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaa 36491163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5320759 - 5320562
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5320759 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatga 5320660  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5320659 taaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 5320562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118060
Alignment:
Q  52 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  152 gacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 40118060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28639475 - 28639282
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639475 aaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 28639378  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagact----tataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28639377 taaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattcaaacg 28639282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783941
Alignment:
Q  69 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  169 aagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 26783941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 33287069 - 33287233
Alignment:
Q  45 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33287069 taagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacct 33287168  T
Q  145 ttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||  | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33287169 ttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 33287233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8021902 - 8021714
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8021902 aggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 8021811  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8021810 ctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccataa 8021714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42571783 - 42571597
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42571783 gaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42571686  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacga 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571685 gctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacga 42571597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 66191 - 66383
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  66191 aaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatt 66290  T
Q  112 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  66291 ataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatctaaacg 66383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9807455 - 9807339
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9807455 aaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatga 9807356  T
Q  113 taagctatttttattta 129  Q
    |||||||||||||||||    
T  9807355 taagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322220
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||   |||||||||  |||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcc 2322220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005171
Alignment:
Q  80 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgta 179  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  180 agctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220260
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    || |  |||||||||  ||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacg 39220260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806877
Alignment:
Q  121 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacg 9806877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25999574 - 25999375
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999574 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 25999475  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25999474 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccataatca 25999375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 37698141 - 37698337
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37698141 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 37698240  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37698241 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 37698337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 42307906 - 42308099
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307906 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42308005  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42308006 gctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 42308099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 15520143 - 15520343
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15520143 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataa 15520242  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataatc 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15520243 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaatc 15520342  T
Q  216 a 216  Q
    |    
T  15520343 a 15520343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38856280 - 38856092
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856280 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38856181  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38856180 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 38856092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 25494283 - 25494482
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494283 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25494382  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25494383 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccata 25494482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21581232 - 21581042
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581232 aaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 21581133  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21581132 taagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 22174988 - 22175184
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174988 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 22175087  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22175088 taagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 22175184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8042797 - 8042596
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042797 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 8042698  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  8042697 taaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcctta 8042598  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  8042597 at 8042596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29445678 - 29445482
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29445678 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatga 29445579  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29445578 taagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29445482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50529119 - 50528923
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529119 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 50529020  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50529019 taagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50528923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32244310 - 32244119
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244310 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 32244211  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32244210 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 32244119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 20842346 - 20842542
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20842346 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatga 20842445  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20842446 taagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20842542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 46452160 - 46452356
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46452160 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 46452259  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  46452260 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 46452356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 12117659 - 12117857
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12117659 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 12117758  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataat 214  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12117759 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggccttaat 12117857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15520826 - 15520630
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520826 aaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 15520727  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15520726 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 15520630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 54870172 - 54870368
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  54870172 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatga 54870271  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54870272 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 54870368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20699339 - 20699148
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699339 aaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20699240  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20699239 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 20699148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 35226637 - 35226447
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226637 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 35226538  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35226537 taagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaac 35226447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38934135 - 38933940
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38934135 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 38934036  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38934035 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 38933940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 54534326 - 54534520
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54534326 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatga 54534423  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54534424 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 54534520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 44609334 - 44609521
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609334 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44609433  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44609434 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 42104969 - 42105155
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42104969 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 42105068  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 199  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42105069 taaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 24835697 - 24835893
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24835697 aaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataa 24835796  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24835797 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcc 24835893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32359449 - 32359258
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359449 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 32359350  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| | | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32359349 taaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 32359258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2895379 - 2895186
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 108  Q
    |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895379 aaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 2895280  T
Q  109 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  2895279 atgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaa 2895186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26122998 - 26122814
Alignment:
Q  19 gttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122998 gttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagct 26122899  T
Q  119 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26122898 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaac 26122814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34700533 - 34700335
Alignment:
Q  11 caaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34700533 caaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 34700434  T
Q  111 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  34700433 gataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcc 34700335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 53028407 - 53028225
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  53028407 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatga 53028308  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53028307 taagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 53028225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16354535 - 16354391
Alignment:
Q  14 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16354535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgat 16354436  T
Q  114 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 158  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354435 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 16354391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44688950 - 44688782
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44688950 aaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatga 44688852  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagc 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  44688851 taagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35643368 - 35643216
Alignment:
Q  52 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35643368 gagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaa 35643269  T
Q  152 gacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    | ||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643268 ggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 35643216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 48925001 - 48925189
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  48925001 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatga 48925100  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48925101 taaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 203
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  69 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  169 aagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12916096 - 12915934
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  12916096 aagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatga 12915997  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccac 176  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  12915996 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccac 12915934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128038
Alignment:
Q  75 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagccc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  175 acgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataat 214  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggccttaat 49128038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24366219 - 24366143
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366219 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13696991 - 13696914
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 82  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696991 gagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 49
Target Start/End: Original strand, 50528883 - 50528916
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528883 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24366134 - 24366093
Alignment:
Q  161 gagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24366134 gagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 24366093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 9008073 - 9008274
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008073 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 9008172  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9008173 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaatca 9008272  T
Q  217 ag 218  Q
    ||    
T  9008273 ag 9008274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 27679181 - 27679377
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679181 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 27679280  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27679281 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 27679377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 24105683 - 24105874
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24105683 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 24105782  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24105783 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 24105874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1579232 - 1579036
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579232 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1579133  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1579132 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1579036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 1605583 - 1605779
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605583 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1605682  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1605683 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1605779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 33491208 - 33491404
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33491208 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatga 33491307  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33491308 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33491404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 16737459 - 16737652
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737459 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16737558  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16737559 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattcaaacgag 16737652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16069549 - 16069358
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069549 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16069450  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16069449 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 16069358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 3386498 - 3386688
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386498 aaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3386597  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386598 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27421051 - 27420858
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27420952  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27420951 actatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 27420858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 20992158 - 20992354
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20992158 aagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatga 20992257  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20992258 tatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4121141 - 4120937
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121141 gagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 4121042  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4121041 aactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacg 4120942  T
Q  205 aggcc 209  Q
     ||||    
T  4120941 gggcc 4120937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31883340 - 31883149
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31883340 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 31883241  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31883240 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 31883149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19358722 - 19358526
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358722 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 19358623  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19358622 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcc 19358526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3921777 - 3921586
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921777 aaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3921678  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  3921677 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacg 3921586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5203164 - 5202969
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5203164 aggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 5203065  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5203064 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggccata 5202969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 1165613 - 1165802
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1165613 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatga 1165712  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1165713 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 8374351 - 8374546
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374351 aaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 8374449  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  8374450 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcc 8374546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33991333 - 33991140
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33991333 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 33991234  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  33991233 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggcc 33991140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 35782659 - 35782857
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782659 gaggttacataaattcataagctccttgt-aagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 35782757  T
Q  115 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  35782758 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggccttaat 35782857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 203
Target Start/End: Original strand, 38598466 - 38598652
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598466 aggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 38598565  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  38598566 ctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaac 38598652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31410672 - 31410475
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31410672 aaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatga 31410573  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31410572 taagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcca 31410475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 26602957 - 26603113
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26602957 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 26603056  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26603057 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26603113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27025152 - 27025001
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025152 aaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatga 27025053  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  27025052 taagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 203
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992487
Alignment:
Q  74 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  174 c----acgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaac 20992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  68 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtaga 167  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  168 taagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 201  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 35420436 - 35420482
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35420436 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638196
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 158  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttat 31638196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 143
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  90 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacc 143  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634582
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||   ||||||||||||||   ||| |||   |||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||   ||||||||| | | | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcc 25634582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 158
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516127
Alignment:
Q  75 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 158  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||  |||  |||||| || ||||||||||||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttat 19516127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 210
Target Start/End: Original strand, 26603109 - 26603141
Alignment:
Q  178 taagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26603109 taagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 26603141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1168704 - 1168500
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168704 gagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 1168605  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1168604 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 1168505  T
Q  205 aggcc 209  Q
     ||||    
T  1168504 gggcc 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29078709 - 29078519
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078709 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29078610  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29078609 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25897567 - 25897371
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897567 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25897468  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25897467 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25897371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 39260358 - 39260554
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39260358 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 39260457  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39260458 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 39260554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20089664 - 20089462
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20089664 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20089565  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20089564 taagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 20089465  T
Q  213 atc 215  Q
    |||    
T  20089464 atc 20089462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 26580282 - 26580478
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580282 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 26580381  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26580382 taagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26580478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 52753159 - 52753355
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52753159 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 52753258  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52753259 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52753355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33510677 - 33510481
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510677 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33510578  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33510577 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33510481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 8079713 - 8079912
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8079713 gagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatga 8079812  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8079813 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 8079912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26663451 - 26663260
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26663451 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 26663352  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26663351 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 26663260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29288340 - 29288146
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288340 aaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29288243  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29288242 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 29288146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16052289 - 16052093
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052289 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16052190  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16052189 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 16052093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38829260 - 38829072
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38829260 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgata 38829161  T
Q  115 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38829160 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 970536 - 970742
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac--tat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  970536 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatat 970635  T
Q  111 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  970636 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcca 970735  T
Q  211 taatcaa 217  Q
     ||||||    
T  970736 caatcaa 970742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43905847 - 43905656
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905847 aaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 43905748  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43905747 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacg 43905656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 1940759 - 1940955
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  1940759 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatga 1940858  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1940859 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1940955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 41928511 - 41928703
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41928511 aggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 41928610  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41928611 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 41928703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52696984 - 52696788
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696984 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 52696885  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52696884 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 19715173 - 19715364
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19715173 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatga 19715272  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19715273 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacg 19715364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12683013 - 12682823
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683013 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 12682914  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12682913 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 12682823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 42370807 - 42371013
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42370807 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatga 42370906  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  42370907 taagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccaaa 42371006  T
Q  213 atcaaga 219  Q
    || ||||    
T  42371007 ataaaga 42371013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 1170456 - 1170652
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1170456 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 1170555  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1170556 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092494
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaac 40092494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32671772 - 32671576
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32671772 aagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 32671673  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32671672 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 32671576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5215578 - 5215387
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5215578 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 5215479  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5215478 taagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 5215387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8121062 - 8120871
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8121062 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 8120963  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8120962 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 8120871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46761159 - 46760968
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46761159 aaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 46761060  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  46761059 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacg 46760968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2347850 - 2347653
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2347850 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatg 2347751  T
Q  112 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  2347750 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggcc 2347653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17591881 - 17591688
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17591881 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 17591782  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  17591781 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcc 17591688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 17587517 - 17587694
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17587517 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatga 17587616  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 190  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17587617 taagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49146359 - 49146174
Alignment:
Q  19 gttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146359 gttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 49146260  T
Q  119 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  49146259 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacg 49146174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 51359229 - 51359425
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51359229 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatga 51359328  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51359329 taagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 51359425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15203301 - 15203101
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203301 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataag 15203202  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataatca 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  15203201 ctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggccatagtca 15203102  T
Q  217 a 217  Q
    |    
T  15203101 a 15203101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2473915 - 2473724
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2473915 aaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataa 2473816  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2473815 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacg 2473724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 13996738 - 13996925
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996738 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataa 13996837  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13996838 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaac 13996925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46409630 - 46409437
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409630 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 46409531  T
Q  111 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  46409530 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 46409437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15717977 - 15717785
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15717977 aaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga 15717878  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgag 206  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   | |||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15717877 -aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacgag 15717785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7145400 - 7145209
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145400 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 7145301  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctc-aaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7145300 taaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacg 7145209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23498650 - 23498454
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23498650 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatga 23498551  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  23498550 actatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattcaaacagggccata 23498454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6765652 - 6765461
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  6765652 aaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatga 6765553  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6765552 taaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacg 6765461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695678
Alignment:
Q  40 cttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaa 139  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  140 caccttta-aaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 29695678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 15554164 - 15554352
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           
T  15554164 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa------- 15554256  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  15554257 -atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 15554352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40149656 - 40149497
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40149656 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatga 40149557  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagc 172  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  40149556 taaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086270
Alignment:
Q  77 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccac 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  177 gtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaac 52086270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38172012 - 38171834
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||    
T  38172012 aaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactatga 38171926  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||  ||| |||  |||||||||| |||| ||||||    
T  38171925 taaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaaacg 38171834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 193
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  58 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactta 157  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||   |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  158 taggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagc 193  Q
    | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 20279752 - 20279805
Alignment:
Q  227 ctactcataatcaaaagagacatggctacaagattaagaaattacacatgaata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20279752 ctactcataatcaaaagagacatgacaacaagattaagaaattacacatgaata 20279805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217991
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||   |||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||   ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcc 5217991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 289
Target Start/End: Original strand, 33308905 - 33308978
Alignment:
Q  216 aagaaatctaactactcataatcaaaagagacatggctacaagattaagaaattacacatgaatagatgatgaa 289  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33308905 aagaaatctagctattcataaccaaaatgcgcatggcaacaagattaagaaattatacatgaatagatgatgaa 33308978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5675149 - 5675094
Alignment:
Q  162 agtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataatcaa 217  Q
    |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5675149 agtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggccttaatcaa 5675094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 33359092 - 33359293
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359092 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33359191  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33359192 taagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccata 33359291  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  33359292 at 33359293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 30181026 - 30181222
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181026 aagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30181125  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30181126 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 30181222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 12101180 - 12101369
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101180 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 12101279  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12101280 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaa 12101369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 42964998 - 42965187
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964998 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42965097  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42965098 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 42965187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7164375 - 7164187
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164375 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7164276  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7164275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 7164187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 24792334 - 24792530
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792334 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 24792433  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  24792434 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 24792530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 22649699 - 22649897
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22649699 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataa 22649798  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataat 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22649799 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggccataat 22649897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42204349 - 42204147
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204349 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42204250  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccat 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  42204249 taagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctt 42204150  T
Q  212 aat 214  Q
    |||    
T  42204149 aat 42204147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 43067975 - 43068171
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43067975 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatga 43068074  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43068075 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 43068171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3511517 - 3511326
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511517 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3511418  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3511417 taagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacg 3511326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 4477323 - 4477514
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4477323 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 4477422  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4477423 taagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 4477514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5281054 - 5280863
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5281054 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 5280955  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5280954 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacg 5280863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20346682 - 20346491
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346682 aaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20346583  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20346582 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 20346491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25748681 - 25748479
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748681 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25748582  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |  |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  25748581 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggccaaa 25748482  T
Q  213 atc 215  Q
    |||    
T  25748481 atc 25748479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1803220 - 1803029
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1803220 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatga 1803121  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1803120 taagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 933479 - 933289
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933479 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 933380  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  933379 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaac 933289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15656106 - 15655905
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656106 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 15656007  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15656006 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 15655907  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  15655906 at 15655905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43156907 - 43156710
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43156907 aaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatga 43156808  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43156807 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaatgaggcca 43156710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041540
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcc 32041540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 33846531 - 33846722
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33846531 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatga 33846625  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33846626 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33846722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38866738 - 38866545
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38866738 aaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 38866639  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgag 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38866638 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaaacgag 38866545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4347462 - 4347266
Alignment:
Q  18 ggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4347462 ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 4347363  T
Q  118 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  4347362 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccttaat 4347266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6394945 - 6394749
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6394945 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 6394846  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6394845 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcc 6394749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 12097592 - 12097794
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12097592 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatga 12097691  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||| | |||| ||    
T  12097692 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggcccta 12097791  T
Q  213 atc 215  Q
    |||    
T  12097792 atc 12097794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 36890832 - 36891027
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36890832 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 36890931  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  36890932 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggcc 36891027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42673655 - 42673468
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673655 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42673556  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42673555 taagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacg 42673468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9452784 - 9452593
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9452784 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatga 9452685  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9452684 taaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 9452593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8630853 - 8630669
Alignment:
Q  20 ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8630853 ttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 8630754  T
Q  120 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  8630753 tttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacg 8630669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 46134309 - 46134497
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  46134309 gaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataa 46134408  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  46134409 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 46134497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 46891341 - 46891533
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46891341 aaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatga 46891440  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  46891441 caaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacg 46891533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17753794 - 17753603
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17753794 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgt 17753695  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17753694 taagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacg 17753603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 48865827 - 48865689
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865827 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 48865728  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 151  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865727 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 48865689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 16894509 - 16894701
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894509 aaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16894608  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16894609 taaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataag----------ctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 16894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 43021582 - 43021767
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  43021582 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataa 43021677  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  43021678 taagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaa 43021767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828268
Alignment:
Q  62 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  162 agtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcc 19828268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 204
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006004
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacg 37006004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405013
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataat 214  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggccttaat 43405013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704978
Alignment:
Q  112 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcc 37704978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655610
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||   |||||| |||| ||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcc 15655610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 211
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849737
Alignment:
Q  64 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggag 163  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||   ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  164 tagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccat 211  Q
    |||| || ||||| ||||||   |||||| ||||||||||| ||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggccat 36849737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691517
Alignment:
Q  118 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||| ||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaattcaaa 27691517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075429
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||   | | ||| | |||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccata 30075429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 140  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36898 - 36702
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36898 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 36799  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36798 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 36702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 54189738 - 54189542
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189738 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 54189639  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54189638 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 54189542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 15241028 - 15241224
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15241028 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 15241127  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241128 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 15241224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 19913630 - 19913828
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19913630 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 19913729  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccat 211  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19913730 taagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccat 19913828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38055348 - 38055143
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055348 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 38055249  T
Q  115 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataat 214  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  38055248 aaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccatatt 38055149  T
Q  215 caagaa 220  Q
    ||||||    
T  38055148 caagaa 38055143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 23776463 - 23776655
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776463 aggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 23776562  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23776563 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 50055101 - 50055297
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50055101 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 50055200  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50055201 taagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50055297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 1756767 - 1756955
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756767 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1756866  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1756867 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 1756955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14987985 - 14987789
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14987985 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 14987886  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14987885 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 14987789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 53717464 - 53717660
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53717464 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatga 53717563  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53717564 taagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 53717660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16700974 - 16700783
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16700974 aaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 16700875  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16700874 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 16700783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20877240 - 20877049
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20877240 aaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20877141  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20877140 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 20877049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52139396 - 52139205
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139396 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 52139297  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  52139296 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacg 52139205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54412821 - 54412630
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54412821 aaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatga 54412722  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54412721 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 54412630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 28032712 - 28032902
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28032712 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatga 28032811  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28032812 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatctaaac 28032902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 19164973 - 19165163
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164973 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatga 19165070  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19165071 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 19165163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 27488648 - 27488844
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488648 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 27488747  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  27488748 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 27488844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50353994 - 50353798
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50353994 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatca 50353895  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50353894 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50353798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1617277 - 1617086
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1617277 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatga 1617178  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1617177 taagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacg 1617086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 11639570 - 11639769
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639570 gagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 11639669  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11639670 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacg 11639769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 43289960 - 43290151
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289960 aaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 43290059  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  43290060 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacg 43290151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31969874 - 31969672
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31969874 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 31969775  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||    
T  31969774 taaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattcaaacgggaccata 31969675  T
Q  213 atc 215  Q
    |||    
T  31969674 atc 31969672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 37968757 - 37968942
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968757 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 37968856  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37968857 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 37968942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 2481408 - 2481604
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481408 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 2481507  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2481508 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 2481604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 6611360 - 6611556
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6611360 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatga 6611459  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6611460 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 6611556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 44784917 - 44785113
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44784917 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 44785016  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44785017 taagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 44785113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 45424534 - 45424730
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424534 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 45424633  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45424634 taaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 45424730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 8591092 - 8591275
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591092 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatga 8591191  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  8591192 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaa 8591275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 40428720 - 40428911
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40428720 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 40428819  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40428820 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacg 40428911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 23704201 - 23704399
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23704201 gagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatga 23704300  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23704301 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaac 23704399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48910039 - 48909849
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48910039 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 48909940  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48909939 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaac 48909849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 8932178 - 8932379
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  8932178 aaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgt 8932277  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  8932278 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 8932377  T
Q  213 at 214  Q
    ||    
T  8932378 at 8932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 30423565 - 30423755
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423565 aaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30423663  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30423664 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacg 30423755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 35490773 - 35490964
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35490773 aaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 35490872  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35490873 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 35490964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 6688627 - 6688817
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  6688627 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatga 6688720  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6688721 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15669376 - 15669180
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15669376 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatga 15669277  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15669276 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 15669180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37464914 - 37464718
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464914 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 37464815  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37464814 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 37464718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47632228 - 47632036
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632228 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 47632129  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47632128 gaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacg 47632036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53875850 - 53875659
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53875850 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatga 53875751  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53875750 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacg 53875659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53353256 - 53353052
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaact 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353256 aaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 53353157  T
Q  109 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagccc----acgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  53353156 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacg 53353057  T
Q  205 aggcc 209  Q
     ||||    
T  53353056 gggcc 53353052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33704034 - 33703837
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33704034 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 33703935  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcca 210  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33703934 taagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaattaaaacgaggcca 33703837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 27583632 - 27583821
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27583632 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatga 27583731  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  27583732 taagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 27536104 - 27536296
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27536104 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 27536203  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27536204 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggagta----agcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 27536296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 40680041 - 40680227
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680041 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 40680140  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  40680141 gctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaaa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 44379187 - 44379377
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44379187 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatga 44379286  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44379287 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaac 44379377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30171773 - 30171582
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30171773 aaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 30171674  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30171673 taagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacg 30171582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44376038 - 44375847
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44376038 aaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatga 44375939  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44375938 taaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacg 44375847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  35 agctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttattta 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  134 cccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 55344817 - 55345021
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||     
T  55344817 gagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgc 55344916  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55344917 aaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacg 55345016  T
Q  205 aggcc 209  Q
     ||||    
T  55345017 gggcc 55345021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  117 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053440
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50053440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16704014 - 16703822
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704014 aagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16703915  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||  ||| |||||||    |||| ||||||||||||||||    
T  16703914 taaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc----taagtcaatccaaacgaggcc 16703822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 23269046 - 23269162
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23269046 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 23269145  T
Q  113 taagctatttttattta 129  Q
    |||||||||||||||||    
T  23269146 taagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 204
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265948
Alignment:
Q  121 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 23265948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 140
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  58 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 140  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548338
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataa-gccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcc 44548338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 53408213 - 53408137
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccag-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408213 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493370
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||  |||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  157 ataggagtagata 169  Q
    |||||||||||||    
T  17493382 ataggagtagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 23261886 - 23261937
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23261886 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 9595902 - 9595982
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595902 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 50055338 - 50055301
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055338 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 119
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  62 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 48748251 - 48748197
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaa 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  48748251 aaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 9595983 - 9596030
Alignment:
Q  161 gagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9595983 gagtagataagcccacataaactcaaa-taagccaatccaaacggggcc 9596030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 22963 - 23159
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22963 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 23062  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23063 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 3873259 - 3873455
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873259 gaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3873358  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873359 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 3873455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 31517227 - 31517426
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31517227 aaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 31517326  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31517327 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggccata 31517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 33906059 - 33906249
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906059 aaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33906158  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  33906159 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaac 33906249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 26323201 - 26323394
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323201 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26323300  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26323301 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26323394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 18806896 - 18807092
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18806896 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 18806995  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18806996 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 18807092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 4232157 - 4232350
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232157 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4232256  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4232257 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcc 4232350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108277
Alignment:
Q  21 tacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  121 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 1108277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 2178781 - 2178977
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178781 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 2178880  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||| || |||||||  ||||||||||| ||||    
T  2178881 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcc 2178977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 28329851 - 28330040
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28329851 aaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 28329948  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28329949 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 28330040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39635645 - 39635449
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39635645 aaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 39635546  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  39635545 taagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcc 39635449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4016232 - 4016041
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016232 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4016133  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4016132 tacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacg 4016041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 16066306 - 16066495
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066306 aaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16066405  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16066406 taagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42937913 - 42937721
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937913 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 42937814  T
Q  112 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42937813 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42937721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5733592 - 5733407
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5733592 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 5733493  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatc 198  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5733492 taagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 5733407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 6174840 - 6175036
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6174840 aaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 6174939  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6174940 taaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 6175036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Original strand, 16588790 - 16588979
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16588790 ggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 16588889  T
Q  115 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  16588890 agctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacg 16588979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 1482915 - 1483105
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1482915 aaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataa 1483014  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1483015 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaaaacg 1483105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 19383947 - 19384126
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19383947 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatga 19384046  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataag 192  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||  ||| |||||||||||    
T  19384047 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 19901153 - 19901350
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19901153 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 19901252  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggccataat 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19901253 gctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaat 19901350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 851190 - 850999
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  851190 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatga 851091  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  851090 taagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacg 850999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 204
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420370
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 30420370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 30270691 - 30270887
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30270691 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 30270790  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30270791 taaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcc 30270887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 430006 - 429830
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  430006 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataa 429907  T
Q  116 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataag 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  |||| |||  ||||||||||    
T  429906 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataag 429830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 44947561 - 44947743
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947561 aaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatga 44947653  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  44947654 taaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaatacaaa 44947743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 291
Target Start/End: Original strand, 32688711 - 32688786
Alignment:
Q  216 aagaaatctaactactcataatcaaaagagacatggctacaagattaagaaattacacatgaatagatgatgaaga 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32688711 aagaaatctaactactcataatcaaaagagacatggctacaagattaagaaattacacatgaacagatgatgaaga 32688786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446777
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactt 156  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  157 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||   ||||||||||  | | ||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcc 42446777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 158
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101304
Alignment:
Q  64 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttat 22101304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585348
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaa 148  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaa 3585348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 291
Target Start/End: Original strand, 10068353 - 10068410
Alignment:
Q  234 taatcaaaagagacatggctacaagattaagaaattacacatgaatagatgatgaaga 291  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10068353 taattaaaagagacatggaaacaagattaggaatttacacatgaatggatgatgaaga 10068410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 15691952 - 15692008
Alignment:
Q  216 aagaaatctaactactcataatcaaaagagacatggctacaagattaagaaattaca 272  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15691952 aagaattctagctactcataattaaaagagacatgacaactagattaagaaattaca 15692008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517385
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagc 172  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||| |  || |||||||| ||||  ||  |||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  173 ccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
     ||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  12517356 tcacataagcttaaa-taagccaatccaaac 12517385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 18 - 214
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 117  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  118 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggcc 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3911 - 3712
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3911 gagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 3812  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3811 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacg 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 307 - 498
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  307 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 406  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  407 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacg 498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 145257 - 145448
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145257 aaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 145356  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  145357 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacg 145448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10431 - 10235
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10431 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 10332  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10331 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 10235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 18 - 210
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatga 116  T
Q  113 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagta---gataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  117 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University