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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF19395_high_7 (Length: 352)
Name: NF19395_high_7
Description: NF19395
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19395_high_7 |
 |  |
|
| [»] scaffold0023 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25175563 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25175662 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175663 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25175762 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25175763 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca |
25175815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27654235 |
catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat |
27654136 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27654135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
27654036 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27654035 |
acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
27653983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16826006 |
catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
16825907 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac |
220 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16825906 |
taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac |
16825807 |
T |
 |
| Q |
221 |
taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16825806 |
taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
16825752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153756
Alignment:
| Q |
34 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23153458 |
catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
23153557 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
23153558 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
23153656 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23153657 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
23153756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626088
Alignment:
| Q |
27 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
14626377 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac |
14626278 |
T |
 |
| Q |
127 |
aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
14626277 |
aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
14626179 |
T |
 |
| Q |
227 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14626178 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaattt |
14626088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650105
Alignment:
| Q |
27 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
1650352 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
1650253 |
T |
 |
| Q |
127 |
aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
226 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
1650252 |
cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
1650154 |
T |
 |
| Q |
227 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
1650153 |
caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca |
1650105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
| Q |
34 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |
|
|
| T |
1657999 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaataact |
1657901 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
1657900 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
1657802 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1657801 |
tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
1657748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| | || || | | | |
|
|
| T |
35009702 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
35009603 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
35009602 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
35009504 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35009503 |
tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
35009439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
| Q |
34 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| || || ||||||| | | |||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |
|
|
| T |
15862484 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactca-attcacaataact |
15862581 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
15862582 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
15862680 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
15862681 |
tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat |
15862734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 287
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
| Q |
91 |
aacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat |
189 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | |||| | ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||| |||||| | | |
|
|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt |
29666038 |
T |
 |
| Q |
190 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| || |||||| || || | ||| ||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
29666039 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat |
29666137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 331
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148305
Alignment:
| Q |
292 |
aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23148266 |
aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
23148305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 287
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
| Q |
202 |
tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat |
27751688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
| Q |
187 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt |
271 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||| |||||||| || |||| || ||| |||||||| |
|
|
| T |
29605612 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
29605696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25426628 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
25426727 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25426728 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
25426827 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25426828 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
25426880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12374 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
12473 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12474 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
12573 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12574 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
12626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
22366733 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat |
22366634 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22366633 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
22366534 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22366533 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
22366481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778017
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
18778244 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
18778145 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18778144 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
18778045 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18778044 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
18778017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19499899 |
catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
19499998 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19499999 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19500098 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19500099 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
19500151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21073847 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
21073748 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073747 |
taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
21073648 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21073647 |
acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
21073595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443420
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
43443647 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat |
43443548 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43443547 |
caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
43443448 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43443447 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
43443420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200010
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
4200237 |
catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
4200138 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4200137 |
caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
4200038 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4200037 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
4200010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507266
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
23506965 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
23507064 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
23507065 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
23507163 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23507164 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaa |
23507263 |
T |
 |
| Q |
323 |
atg |
325 |
Q |
| |
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||| |
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|
| T |
23507264 |
atg |
23507266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010068
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
27009841 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
27009940 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27009941 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca |
27010040 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27010041 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
27010068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182501
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27182810 |
catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
27182711 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |
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|
| T |
27182710 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta |
27182612 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27182611 |
tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
27182512 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
27182511 |
aaatgatgatg |
27182501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531021
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||| | |
|
|
| T |
18531330 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
18531231 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18531230 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
18531132 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18531131 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca |
18531032 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18531031 |
aaatgatgatg |
18531021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053786
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||| | |
|
|
| T |
22054096 |
catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
22053997 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22053996 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
22053898 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttg-aaaatttac |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22053897 |
tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttca |
22053798 |
T |
 |
| Q |
320 |
aaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
22053797 |
aaaatgatgatg |
22053786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
| Q |
34 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| |
|
|
| T |
34939289 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaatgact |
34939387 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
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|
| T |
34939388 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
34939486 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
34939487 |
tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat |
34939540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
| Q |
75 |
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174 |
Q |
| |
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||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| ||||||| |
|
|
| T |
29188483 |
atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat |
29188385 |
T |
 |
| Q |
175 |
catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagc |
274 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
29188384 |
catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc |
29188285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623085 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
20623184 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20623185 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
20623232 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
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|
| T |
21233675 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
21233576 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21233575 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21233528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
| Q |
141 |
aattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac |
240 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900552 |
aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
25900453 |
T |
 |
| Q |
241 |
aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcc |
285 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25900452 |
aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc |
25900408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
16536313 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata |
16536412 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16536413 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
16536460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37052860 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
37052959 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37052960 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
37053007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
| Q |
27 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
67 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29190522 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa |
29190482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17471844 |
catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat |
17471803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
| Q |
187 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||| |||||| || |||||||| || |||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
29918127 |
tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt |
29918212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
| Q |
191 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32950862 |
aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat |
32950951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19886913 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
19886814 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886813 |
taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
19886714 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19886713 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
19886661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 331
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463045
Alignment:
| Q |
28 |
tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaaca |
127 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
462743 |
tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
462842 |
T |
 |
| Q |
128 |
acaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc |
227 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
462843 |
acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc |
462941 |
T |
 |
| Q |
228 |
aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
462942 |
aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat |
463041 |
T |
 |
| Q |
328 |
gatg |
331 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
463042 |
gatg |
463045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396653
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
17396916 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
17396817 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
17396816 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
17396717 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17396716 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
17396653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891551
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8891242 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
8891341 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
8891342 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta |
8891440 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8891441 |
tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
8891540 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
8891541 |
aaatgatgatg |
8891551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627268
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| | | |||| || |
|
|
| T |
20627576 |
catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat |
20627477 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |
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| T |
20627476 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20627378 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaa |
321 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |
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| T |
20627377 |
tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaa |
20627278 |
T |
 |
| Q |
322 |
aatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
20627277 |
aatgatgatg |
20627268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794659
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
19794967 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
19794868 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
19794867 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
19794769 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
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| T |
19794768 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttaca |
19794670 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |
|
|
| T |
19794669 |
aaataatgatg |
19794659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982394
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| | |
|
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| T |
36982704 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
36982605 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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||||||||||| | | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |
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| T |
36982604 |
caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta |
36982506 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- |
319 |
Q |
| |
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|
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| T |
36982505 |
tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
36982406 |
T |
 |
| Q |
320 |
aaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
36982405 |
aaaatgatgatg |
36982394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642911
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43643220 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat |
43643121 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
43643120 |
taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43643022 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
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|
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| T |
43643021 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca |
43642922 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
43642921 |
aaatgatgatg |
43642911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341342
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24341652 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
24341553 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
24341552 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta |
24341454 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttac- |
319 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24341453 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca |
24341354 |
T |
 |
| Q |
320 |
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331 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
24341353 |
aaaatgatgatg |
24341342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaca |
121 |
Q |
| |
|
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|
| T |
7508107 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctca-a |
7508009 |
T |
 |
| Q |
122 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
221 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
7508008 |
ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
7507910 |
T |
 |
| Q |
222 |
aacatcaattcatgca |
237 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7507909 |
atcatcaattcatgca |
7507894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| | || || | | | |
|
|
| T |
25265653 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
25265554 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
25265553 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
25265455 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25265454 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
25265390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19689548 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
19689449 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19689448 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
19689401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23820187 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
23820286 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23820287 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
23820334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906587 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
14906488 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14906487 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
14906440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
20015127 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg |
20015226 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20015227 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
20015274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 331
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863237
Alignment:
| Q |
265 |
cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22863169 |
cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatg |
22863237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 270
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
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189 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
68156 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
68238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
47357654 |
catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
47357753 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357754 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
47357853 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
47357854 |
acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
47357906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644446
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
10644219 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
10644318 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
10644319 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
10644418 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644419 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
10644446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246739
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13246430 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
13246529 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
13246530 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
13246628 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13246629 |
tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
13246728 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
13246729 |
aaatgatgatg |
13246739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
| Q |
31 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaaca |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
13048477 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca |
13048378 |
T |
 |
| Q |
131 |
acttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
13048377 |
acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa |
13048278 |
T |
 |
| Q |
231 |
tcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13048277 |
tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat |
13048221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118198
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
54118507 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc |
54118408 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
54118407 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
54118309 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
54118308 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca |
54118209 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |
|
|
| T |
54118208 |
aaataatgatg |
54118198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 331
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122196
Alignment:
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
121989 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
122087 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
122088 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
122187 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
122188 |
atgatgatg |
122196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675042
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||| | |
|
|
| T |
15675352 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
15675253 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
15675252 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
15675154 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttac- |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || | |
|
|
| T |
15675153 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca |
15675054 |
T |
 |
| Q |
320 |
aaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
15675053 |
aaaatgatgatg |
15675042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | |||| | |
|
|
| T |
26680201 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
26680300 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
26680301 |
caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
26680398 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26680399 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
26680463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||| | |
|
|
| T |
31115629 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
31115728 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
31115729 |
caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
31115827 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttgg |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
31115828 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
31115865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104221
Alignment:
| Q |
91 |
aacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg |
190 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | |||| | ||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |
|
|
| T |
10104445 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg |
10104347 |
T |
 |
| Q |
191 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--ta |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
10104346 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta |
10104247 |
T |
 |
| Q |
289 |
atcaaaattcatacaacatttgaaaa |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10104246 |
tgaaaaattcataccacatttgaaaa |
10104221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
| Q |
140 |
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239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488678 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
10488777 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10488778 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
10488825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16328073 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
16327974 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16327973 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
16327926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111491
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactca |
119 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
111395 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactca |
111491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 331
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241010
Alignment:
| Q |
224 |
catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttac-a |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || | | |
|
|
| T |
33240900 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa |
33240999 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
33241000 |
aaatgatgatg |
33241010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40885652 - 40885570
Alignment:
| Q |
189 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40885652 |
tgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt |
40885570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
67 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10104494 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa |
10104450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 270
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
| Q |
189 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt |
270 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
15044992 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
15045074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10989410 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
10989509 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10989510 |
ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
10989608 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10989609 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
10989661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437684
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
2437457 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat |
2437556 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2437557 |
taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
2437656 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2437657 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
2437684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911049
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
13911277 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
13911178 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaactt-aggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
221 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
13911177 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
13911078 |
T |
 |
| Q |
222 |
aacatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13911077 |
aacatcaattcatgcatacaaacataaca |
13911049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572903
Alignment:
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23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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|
| T |
13572676 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13572775 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
13572776 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca |
13572875 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
13572876 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
13572903 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060273
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
3059966 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
3060065 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
3060066 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta |
3060164 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
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| T |
3060165 |
tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa |
3060264 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
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||||||||| |
|
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| T |
3060265 |
atgatgatg |
3060273 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036968
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
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catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc |
13037178 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
13037177 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta |
13037079 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
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| T |
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tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
13036979 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
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| T |
13036978 |
aaatgatgatg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212073
Alignment:
| Q |
25 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacatta |
124 |
Q |
| |
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| T |
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tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta |
16211867 |
T |
 |
| Q |
125 |
acaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
224 |
Q |
| |
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| T |
16211868 |
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16211966 |
T |
 |
| Q |
225 |
atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat |
324 |
Q |
| |
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| T |
16211967 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaat |
16212066 |
T |
 |
| Q |
325 |
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331 |
Q |
| |
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| T |
16212067 |
gatgatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
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catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
18253999 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
18253998 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
18253900 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat |
280 |
Q |
| |
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| T |
18253899 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat |
18253842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292338
Alignment:
| Q |
29 |
caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaa |
128 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25292595 |
caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga |
25292496 |
T |
 |
| Q |
129 |
caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca |
228 |
Q |
| |
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| T |
25292495 |
caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca |
25292397 |
T |
 |
| Q |
229 |
attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
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| T |
25292396 |
attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat |
25292338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580691
Alignment:
| Q |
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tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaaca |
127 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |
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| T |
11580997 |
tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca |
11580898 |
T |
 |
| Q |
128 |
acaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc |
227 |
Q |
| |
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| T |
11580897 |
acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc |
11580799 |
T |
 |
| Q |
228 |
aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaa |
323 |
Q |
| |
|
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| T |
11580798 |
aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaa |
11580699 |
T |
 |
| Q |
324 |
tgatgatg |
331 |
Q |
| |
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|||||||| |
|
|
| T |
11580698 |
tgatgatg |
11580691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052973
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
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| T |
36052667 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
36052766 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
36052767 |
taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta |
36052862 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
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| T |
36052863 |
tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca |
36052962 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
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||||||||||| |
|
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| T |
36052963 |
aaatgatgatg |
36052973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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|
| T |
47481294 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt |
47481195 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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|
| T |
47481194 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
47481096 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47481095 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16479213 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat |
16479114 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||| || |||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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| T |
16479113 |
taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16479015 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16479014 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
16478987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
7293017 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
7293116 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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||||||||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
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|
| T |
7293117 |
caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
7293214 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
7293215 |
ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||| | |
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|
| T |
13321014 |
catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt |
13321113 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaa-caacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa |
219 |
Q |
| |
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||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
13321114 |
caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa |
13321211 |
T |
 |
| Q |
220 |
ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca |
286 |
Q |
| |
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|
| T |
13321212 |
ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca |
13321278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
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140 |
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239 |
Q |
| |
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| T |
11516343 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
11516442 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
11516443 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
11516490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
| Q |
140 |
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239 |
Q |
| |
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||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
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| T |
15441711 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
15441612 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
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| T |
15441611 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
15441564 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
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|
| T |
30262276 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
30262177 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30262176 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
30262129 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295936
Alignment:
| Q |
166 |
ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtac |
265 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||| | | || || || |
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|
| T |
296087 |
ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac |
295988 |
T |
 |
| Q |
266 |
gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaat |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
295987 |
gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaat |
295936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 270
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
| Q |
189 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt |
270 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
13377693 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
13377775 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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|
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| T |
30120722 |
catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
30120821 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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|
| T |
30120822 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
30120921 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
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| T |
30120922 |
acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
30120974 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
222943 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
222844 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
213 |
Q |
| |
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|
|
| T |
222843 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
222753 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
736566 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
736467 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
213 |
Q |
| |
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|
|
| T |
736466 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
736376 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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| T |
860461 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat |
860362 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
213 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
860361 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
860271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193672
Alignment:
| Q |
22 |
acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaca |
121 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| | |
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|
| T |
16193980 |
acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa |
16193881 |
T |
 |
| Q |
122 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
221 |
Q |
| |
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| T |
16193880 |
ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt |
16193782 |
T |
 |
| Q |
222 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
321 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |
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|
| T |
16193781 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttacca |
16193682 |
T |
 |
| Q |
322 |
aatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16193681 |
aatgatgatg |
16193672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
16674644 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
16674545 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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|
| T |
16674544 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
16674445 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16674444 |
acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca |
16674392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844597
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |
|
|
| T |
21844824 |
catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat |
21844725 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21844724 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
21844625 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
21844624 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
21844597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851990
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
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|
| T |
21852217 |
catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat |
21852118 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21852117 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca |
21852018 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21852017 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
21851990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373422
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
43373731 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
43373632 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
43373631 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta |
43373533 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
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| T |
43373532 |
tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca |
43373433 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
43373432 |
aaatgatgatg |
43373422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928746
Alignment:
| Q |
34 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact |
133 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24929043 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact |
24928944 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
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|
| T |
24928943 |
tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
24928845 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24928844 |
tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatg |
24928746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
| Q |
27 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||| |
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|
| T |
6774505 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
6774406 |
T |
 |
| Q |
127 |
aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
226 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
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|
| T |
6774405 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
6774307 |
T |
 |
| Q |
227 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
6774306 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca |
6774258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404938
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
16405235 |
catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt |
16405136 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
16405135 |
taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16405040 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16405039 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
16404940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 275
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
| Q |
27 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac |
126 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24548986 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
24549085 |
T |
 |
| Q |
127 |
aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
226 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
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|
| T |
24549086 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
24549184 |
T |
 |
| Q |
227 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
24549185 |
caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca |
24549233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | |||| | |
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|
| T |
22907476 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
22907377 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
22907376 |
caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
22907279 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22907278 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
22907214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
| Q |
34 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |
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|
| T |
17345581 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactca-attcacaataact |
17345679 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
|
||| | |||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
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|
| T |
17345680 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
17345778 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
17345779 |
tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat |
17345832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
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||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
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|
| T |
5238203 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
5238302 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5238303 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
5238350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661395 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
24661296 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24661295 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
24661248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685662 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
43685761 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43685762 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
43685809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
| Q |
151 |
tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691970 |
tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
691908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 270
Target Start/End: Original strand, 38533855 - 38533895
Alignment:
| Q |
230 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt |
270 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38533855 |
ttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaatt |
38533895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
55316219 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
55316318 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55316319 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
55316418 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
55316419 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
55316471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
41270075 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
41270174 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41270175 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta |
41270274 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41270275 |
acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
41270327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842517
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
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|
| T |
14842824 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
14842725 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
14842724 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta |
14842626 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |
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|
| T |
14842625 |
tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa |
14842526 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
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| T |
14842525 |
gtgaagatg |
14842517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030103
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| || |
|
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| T |
12030410 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat |
12030311 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
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|
| T |
12030310 |
taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
12030212 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
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| T |
12030211 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaa |
12030112 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12030111 |
atgatgatg |
12030103 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
16821139 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
16821238 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
16821239 |
caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
16821338 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821339 |
tcatcaatttatgcatacaaacataaca |
16821366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050117
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||| || |
|
|
| T |
2049810 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat |
2049909 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
2049910 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
2050008 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |
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|
| T |
2050009 |
tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaa |
2050108 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
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2050109 |
atgatgatg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
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Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
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23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
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| T |
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catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
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| T |
13975885 |
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13975786 |
T |
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| Q |
223 |
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287 |
Q |
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| T |
13975785 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
13975722 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858986
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
123 |
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222 |
Q |
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| T |
15859187 |
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15859089 |
T |
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| Q |
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320 |
Q |
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| T |
15859088 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttaca |
15858990 |
T |
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| Q |
321 |
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324 |
Q |
| |
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|||| |
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15858989 |
aaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861068
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122 |
Q |
| |
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| T |
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catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
45860904 |
T |
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| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
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| T |
45860905 |
taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca |
45861004 |
T |
 |
| Q |
223 |
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287 |
Q |
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| T |
45861005 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
45861068 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
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121 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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221 |
Q |
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| T |
51158182 |
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T |
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| Q |
222 |
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297 |
Q |
| |
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| T |
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51158008 |
T |
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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839202
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133 |
Q |
| |
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| T |
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catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
13839004 |
T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
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| T |
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13839103 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
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| T |
13839104 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954890
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
13955153 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
13955054 |
T |
 |
| Q |
123 |
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222 |
Q |
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| T |
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13954954 |
T |
 |
| Q |
223 |
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287 |
Q |
| |
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| T |
13954953 |
tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
13954890 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
15936890 |
catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
15936791 |
T |
 |
| Q |
123 |
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222 |
Q |
| |
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| T |
15936790 |
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15936692 |
T |
 |
| Q |
223 |
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280 |
Q |
| |
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|
| T |
15936691 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat |
15936634 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
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Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
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125 |
Q |
| |
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| T |
15938729 |
catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa |
15938630 |
T |
 |
| Q |
126 |
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225 |
Q |
| |
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| T |
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15938531 |
T |
 |
| Q |
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280 |
Q |
| |
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| T |
15938530 |
tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744071
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt |
16744278 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
16744277 |
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16744180 |
T |
 |
| Q |
223 |
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322 |
Q |
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| T |
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16744080 |
T |
 |
| Q |
323 |
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331 |
Q |
| |
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| T |
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atgatgatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac |
126 |
Q |
| |
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| T |
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atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac |
15614937 |
T |
 |
| Q |
127 |
aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
226 |
Q |
| |
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| T |
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aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat |
15615036 |
T |
 |
| Q |
227 |
caattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
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| T |
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caattcatgcatacaaatataaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
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Q |
| |
|
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| T |
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catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt |
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T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
17912644 |
caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
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T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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Q |
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T |
 |
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caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
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Target: chr3; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 241 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260779
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
| Q |
187 |
tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4145898 |
tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt |
4145814 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15468596 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat |
15468555 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
47984650 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
47984749 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttag |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
47984750 |
caacaacaacttag |
47984763 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
47993937 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
47994036 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttag |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
47994037 |
caacaacaacttag |
47994050 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
48003224 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
48003323 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttag |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
48003324 |
caacaacaacttag |
48003337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
48012510 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc |
48012609 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttag |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
48012610 |
caacaacaacttag |
48012623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
| Q |
191 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11986262 |
aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat |
11986173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
| Q |
230 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14080715 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
14080756 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 64
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat |
64 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
22275209 |
catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat |
22275250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
36093 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat |
36192 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36193 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
36292 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36293 |
acatcaattcatacatacaaacataaca |
36320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48905
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48598 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
48697 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
48698 |
tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
48796 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48797 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
48896 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
48897 |
atgatgatg |
48905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601143
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
18601370 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
18601271 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18601270 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
18601171 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18601170 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
18601143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
5072640 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact |
5072541 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5072540 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta |
5072441 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5072440 |
acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
5072388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931652
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
20931345 |
catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
20931444 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
20931445 |
taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
20931543 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
20931544 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaa |
20931643 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
20931644 |
atgaggatg |
20931652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394529
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |
|
|
| T |
41394222 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca |
41394321 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
41394322 |
taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta |
41394420 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394421 |
tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
41394520 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
41394521 |
atgatgatg |
41394529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913337
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
20913037 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaa-------t |
20913129 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
20913130 |
taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
20913228 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
20913229 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaa |
20913328 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
20913329 |
atgaggatg |
20913337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893581
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
20893889 |
catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc |
20893790 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |
|
|
| T |
20893789 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta |
20893691 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20893690 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttaca |
20893592 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
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20893591 |
aaatgatgatg |
20893581 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445989
Alignment:
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23 |
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122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |
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|
| T |
20445679 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20445778 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20445779 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20445877 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-ac |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20445878 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcac |
20445977 |
T |
 |
| Q |
320 |
aaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
20445978 |
aaaatgatgatg |
20445989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844404
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37844714 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc |
37844615 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||| || ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
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|
| T |
37844614 |
taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
37844516 |
T |
 |
| Q |
222 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac |
319 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37844515 |
atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcac |
37844416 |
T |
 |
| Q |
320 |
aaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
37844415 |
aaaatgatgatg |
37844404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531753
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || | |
|
|
| T |
20531444 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt |
20531543 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
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| T |
20531544 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
20531642 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
20531643 |
tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca |
20531742 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
20531743 |
aaatgatgatg |
20531753 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
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23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
22227809 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
22227909 |
taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
22228007 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
22228008 |
tcatcaattcatgca |
22228022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
22232506 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
22232605 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
22232606 |
taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta |
22232704 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
22232705 |
tcatcaattcatgca |
22232719 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116481
Alignment:
| Q |
27 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcacattaa |
125 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
2116258 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa |
2116357 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca |
225 |
Q |
| |
|
||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
2116358 |
caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
2116456 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2116457 |
tcaattcatgcatacaaacataaca |
2116481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 250
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051649
Alignment:
| Q |
89 |
ataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata |
188 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45051489 |
ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt |
45051587 |
T |
 |
| Q |
189 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45051588 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaaca |
45051649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452608 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
51452707 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51452708 |
caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat |
51452755 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
| Q |
27 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa |
67 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
45051446 |
atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa |
45051486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3538
Alignment:
| Q |
25 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacatta |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
3843 |
tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta |
3744 |
T |
 |
| Q |
125 |
acaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
3743 |
acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc |
3645 |
T |
 |
| Q |
225 |
atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat |
324 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3644 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaat |
3545 |
T |
 |
| Q |
325 |
gatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|| |||| |
|
|
| T |
3544 |
gaagatg |
3538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1432
Alignment:
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
1124 |
catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
1223 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
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| T |
1224 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
1322 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1323 |
ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa |
1422 |
T |
 |
| Q |
322 |
aatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
1423 |
aatgatgatg |
1432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |
|
|
| T |
42997 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat |
43096 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
43097 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
43196 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43197 |
tcatcaattcatgcatagaaacataaca |
43224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6029
Alignment:
| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
6326 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctca-at |
6228 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
6227 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
6129 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
6128 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa |
6029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 926
Alignment:
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23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||| || |
|
|
| T |
1218 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctca-at |
1120 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
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| T |
1119 |
taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
1021 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt |
317 |
Q |
| |
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| T |
1020 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaattt |
926 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
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Target: scaffold0008; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
31928 |
catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat |
31829 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaactt-aggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
221 |
Q |
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| T |
31828 |
caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact |
31729 |
T |
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| Q |
222 |
aacatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
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| T |
31728 |
aacatcaattcatgcattcaaacataaca |
31700 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128125
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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|
|
| T |
128431 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctca-at |
128333 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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| T |
128332 |
taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
128234 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
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| T |
128233 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaa |
128134 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
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|||| |||| |
|
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| T |
128133 |
atgaagatg |
128125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
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47 |
acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaacttaggagaaattca |
146 |
Q |
| |
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|
| T |
5552 |
acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca |
5651 |
T |
 |
| Q |
147 |
cccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat |
246 |
Q |
| |
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| T |
5652 |
ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat |
5751 |
T |
 |
| Q |
247 |
aacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat |
280 |
Q |
| |
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|||| || |||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
5752 |
aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat |
5785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9185
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23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
8878 |
catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
8977 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
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| T |
8978 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
9076 |
T |
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| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa |
322 |
Q |
| |
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| T |
9077 |
tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaa |
9176 |
T |
 |
| Q |
323 |
atgatgatg |
331 |
Q |
| |
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|||| |||| |
|
|
| T |
9177 |
atgaagatg |
9185 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 313
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12403
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12115 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctca-at |
12213 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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| T |
12214 |
ta-caacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta |
12311 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaa |
313 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12312 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttgaaa |
12403 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 35 - 262
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23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
35 |
catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
134 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
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| T |
135 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca |
234 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
235 |
tcatcaattcatgcatacaaacataaca |
262 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5020
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5324 |
catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc |
5225 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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|
| T |
5224 |
taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta |
5126 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5125 |
tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
5026 |
T |
 |
| Q |
322 |
aatgat |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
5025 |
aatgat |
5020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19507
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
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| T |
19206 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
19305 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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| T |
19306 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
19404 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19405 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
19504 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaa |
323 |
Q |
| |
|
||| |
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| T |
19505 |
aaa |
19507 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
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23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| | |
|
|
| T |
21290 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt |
21389 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
21390 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
21488 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21489 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
21553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
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Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172212
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catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
171916 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
172015 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
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||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |
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|
| T |
172016 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
172114 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
172115 |
tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177915
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34 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaacaact |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
177619 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
177718 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
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||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
177719 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
177817 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
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| |||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
177818 |
tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
177915 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42036
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27 |
atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaac |
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Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || | ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |
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| T |
41733 |
atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac |
41832 |
T |
 |
| Q |
127 |
aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| |
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|
| T |
41833 |
aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat |
41931 |
T |
 |
| Q |
227 |
caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga |
326 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
41932 |
caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga |
42031 |
T |
 |
| Q |
327 |
tgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
42032 |
tgatg |
42036 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64584
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122 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
64780 |
catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat |
64681 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaa |
219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
64680 |
taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa |
64584 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
107747 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
107846 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
107847 |
taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
107945 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
107946 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat |
108003 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
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| Q |
230 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattta |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
89905 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta |
89863 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26374
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23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26678 |
catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc |
26579 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26578 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta |
26480 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
26479 |
tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa |
26380 |
T |
 |
| Q |
322 |
aatgat |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
26379 |
aatgat |
26374 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
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Q |
| |
|
||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
8327 |
aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata |
8228 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8227 |
caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
8180 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
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Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
48187 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
48286 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
48287 |
taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
48385 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat |
280 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48386 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat |
48443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247396
Alignment:
| Q |
34 |
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133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
247694 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
247595 |
T |
 |
| Q |
134 |
taggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca |
233 |
Q |
| |
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||| | ||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
247594 |
tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca |
247496 |
T |
 |
| Q |
234 |
tgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
247495 |
tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
247396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36867
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| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
37176 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc |
37077 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
37076 |
caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta |
36978 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
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|
|
| T |
36977 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca |
36878 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
36877 |
aaatgatgatg |
36867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123126
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
123427 |
catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc |
123328 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
123327 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
123229 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
123228 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttaca |
123129 |
T |
 |
| Q |
321 |
aaa |
323 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
123128 |
aaa |
123126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
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Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
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Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21141
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
21367 |
catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat |
21268 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || || |
|
|
| T |
21267 |
taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta |
21169 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21168 |
tcatcaattaatggatacaaacataaca |
21141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
14312 |
catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat |
14213 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || || |
|
|
| T |
14212 |
tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta |
14114 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14113 |
tcatcaattcatgcatacagacataaca |
14086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 313
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
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| Q |
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
148721 |
catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
148820 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |
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|
| T |
148821 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta |
148919 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
148920 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa |
149012 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9159
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| | |||| | |
|
|
| T |
8849 |
catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt |
8948 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
8949 |
caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
9047 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttac- |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || | |
|
|
| T |
9048 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgca |
9147 |
T |
 |
| Q |
320 |
aaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
9148 |
aaaatgatgatg |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
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266 |
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Q |
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|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
146843 |
gaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
146908 |
T |
 |
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Target: scaffold0009 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
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Target: scaffold0009; HSP #1
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caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacattaacaa |
128 |
Q |
| |
|
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|
| T |
272031 |
caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca |
272130 |
T |
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| Q |
129 |
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228 |
Q |
| |
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| T |
272131 |
caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca |
272229 |
T |
 |
| Q |
229 |
attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg |
328 |
Q |
| |
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| T |
272230 |
attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatg |
272329 |
T |
 |
| Q |
329 |
atg |
331 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
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272330 |
atg |
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T |
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Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
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Target: scaffold0022; HSP #1
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Q |
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catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
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T |
 |
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taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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||||||||||| || | ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
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taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
5269 |
T |
 |
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223 |
acatcaattcatgca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
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tcatcaattcatgca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
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Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |
|
|
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catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat |
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T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
221 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3822 |
taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
3920 |
T |
 |
| Q |
222 |
aacatcaattcatgca |
237 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| |
|
|
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atcatcaattcatgca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
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Target: scaffold0018; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
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aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac |
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T |
 |
| Q |
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aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
51138 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
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Q |
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|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |
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|
| T |
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atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
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T |
 |
| Q |
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aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
226 |
Q |
| |
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|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
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|
| T |
9496 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
9398 |
T |
 |
| Q |
227 |
caattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| |
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| T |
9397 |
caattcatgcatacaaacataaca |
9374 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
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atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac |
16395 |
T |
 |
| Q |
127 |
aacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat |
226 |
Q |
| |
|
|| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
16394 |
aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat |
16296 |
T |
 |
| Q |
227 |
caattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16295 |
caattcatgcatacaaacataaca |
16272 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:
Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
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228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca |
1351 |
T |
 |
| Q |
229 |
attcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagca |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1350 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca |
1304 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
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Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
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122 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || || |||||||||| || ||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
797 |
catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc |
698 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
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||||| ||||||| | ||||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
697 |
taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
599 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
598 |
tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
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Target: scaffold0028; HSP #1
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240 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89600 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
89501 |
T |
 |
| Q |
241 |
aaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
331 |
Q |
| |
|
||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89500 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107738
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Q |
| |
|
|||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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107835 |
catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
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Target: scaffold0075; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || || || |||||| | |||| |
|
|
| T |
34724 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat |
34625 |
T |
 |
| Q |
122 |
ttaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact |
221 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||| |||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
34624 |
tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt |
34526 |
T |
 |
| Q |
222 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
34525 |
atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat |
34460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||| ||| |||||||||| | |||| |
|
|
| T |
37328 |
catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc |
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T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||| ||||| | | ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
37228 |
caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta |
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T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37130 |
ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
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Q |
| |
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|
| T |
41648 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt |
41747 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta |
222 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||| || | |||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |
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|
| T |
41748 |
caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta |
41846 |
T |
 |
| Q |
223 |
acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41847 |
tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat |
41911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
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catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
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Q |
| |
|
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|
| T |
115 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat |
16 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaac |
129 |
Q |
| |
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||||||| |
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| T |
15 |
taacaac |
9 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0529 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
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Target: scaffold0529; HSP #1
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27 |
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125 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2966 |
atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa |
3065 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
3066 |
caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca |
3164 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaa |
276 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3165 |
tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa |
3215 |
T |
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Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
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Target: scaffold0132; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 13636 - 13769
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154 |
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253 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13636 |
agcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
13735 |
T |
 |
| Q |
254 |
tagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13736 |
aagttagagcacgaatttagcaacaattatccat |
13769 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
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Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
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Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcacat |
122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
48514 |
catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat |
48613 |
T |
 |
| Q |
123 |
taacaac |
129 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
48614 |
taacaac |
48620 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13478 - 13350
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| Q |
121 |
attaacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaac |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13478 |
attaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaat |
13380 |
T |
 |
| Q |
221 |
taacatcaattcatgcatacaaacataaca |
250 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13379 |
tatcatcaattcatgcatacaaacataaca |
13350 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
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Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
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| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26911 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
27010 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27011 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
27058 |
T |
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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
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Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22656 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
22755 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat |
280 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22756 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat |
22796 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
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| Q |
140 |
aaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata |
239 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1729 |
aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata |
1630 |
T |
 |
| Q |
240 |
caaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1629 |
caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat |
1582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 119
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9478
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| Q |
23 |
catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactca |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9382 |
catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactca |
9478 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:
Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 287
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
| Q |
194 |
atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaatcatccat |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
3360 |
atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat |
3453 |
T |
 |
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Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
| Q |
25 |
tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa |
79 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
3210 |
tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa |
3264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:
Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 56106
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| Q |
124 |
aacaacaacttaggagaaattcacccttttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaa--catgtaatttcaccaacaattatacaact |
221 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| | |||| | || |||||||||||| | ||||| |||||| | |
|
|
| T |
56262 |
aacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaatt |
56165 |
T |
 |
| Q |
222 |
aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatttagcaacaat |
280 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
56164 |
atcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat |
56106 |
T |
 |
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Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
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Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
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| Q |
230 |
ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70348 |
ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt |
70307 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
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Target: scaffold0123; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
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189 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaattt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
8174 |
tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
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Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
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189 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagtacgaatt |
270 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
2399 |
tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
2317 |
T |
 |
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Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
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191 |
aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca |
237 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
45198 |
aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
45244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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