View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19401_high_1 (Length: 690)

Name: NF19401_high_1
Description: NF19401
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19401_high_1
NF19401_high_1
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (137-256)||(4739430-4739549)
chr4 (124-292)||(22129966-22130135)
chr4 (133-313)||(7061672-7061852)
chr4 (137-292)||(16821360-16821516)
chr4 (133-313)||(49428350-49428529)
chr4 (133-313)||(5841435-5841616)
chr4 (132-290)||(49175965-49176124)
chr4 (133-313)||(47773027-47773207)
chr4 (435-509)||(4730521-4730595)
chr4 (133-313)||(38405110-38405291)
chr4 (133-326)||(52859794-52859982)
chr4 (97-307)||(17512353-17512562)
chr4 (133-292)||(42616932-42617091)
chr4 (133-251)||(35311293-35311413)
chr4 (133-313)||(11907607-11907787)
chr4 (181-299)||(4744758-4744876)
chr4 (132-310)||(36985718-36985896)
chr4 (135-307)||(49746895-49747068)
chr4 (18-74)||(4739915-4739971)
chr4 (137-313)||(34360592-34360768)
chr4 (133-292)||(35380362-35380522)
chr4 (133-313)||(21240712-21240888)
chr4 (133-292)||(26147644-26147806)
chr4 (133-326)||(2066724-2066915)
chr4 (137-313)||(17114377-17114553)
chr4 (137-293)||(53412044-53412201)
chr4 (434-509)||(4734294-4734367)
chr4 (156-292)||(54506744-54506880)
chr4 (137-292)||(2653357-2653512)
chr4 (163-326)||(3689525-3689688)
chr4 (133-324)||(25233115-25233305)
chr4 (138-292)||(35998750-35998903)
chr4 (133-243)||(51624719-51624829)
chr4 (137-313)||(2942653-2942831)
chr4 (435-506)||(4751112-4751182)
chr4 (220-326)||(6609781-6609887)
chr4 (137-195)||(9301469-9301527)
chr4 (134-313)||(6643668-6643846)
chr4 (137-313)||(47464373-47464550)
chr4 (220-289)||(52247460-52247529)
chr4 (138-289)||(30682228-30682380)
chr4 (304-407)||(4751187-4751290)
chr4 (138-292)||(7986914-7987066)
chr4 (156-203)||(17121200-17121247)
chr4 (170-313)||(17237304-17237447)
chr4 (125-307)||(20612185-20612365)
chr4 (162-326)||(43237203-43237369)
chr4 (227-326)||(44536191-44536290)
chr4 (220-318)||(461978-462076)
chr4 (220-326)||(11288625-11288730)
chr4 (220-313)||(40122862-40122955)
chr4 (133-326)||(33790726-33790921)
chr4 (134-190)||(39139868-39139923)
chr4 (220-292)||(47358978-47359050)
chr4 (154-289)||(18532133-18532268)
chr4 (137-184)||(28911293-28911340)
chr4 (227-313)||(23915438-23915524)
chr4 (139-185)||(30471794-30471840)
chr4 (139-213)||(31096234-31096308)
chr4 (131-237)||(35251830-35251936)
chr4 (125-202)||(8175709-8175785)
chr4 (220-293)||(18741502-18741575)
chr4 (133-186)||(28501020-28501073)
chr4 (235-352)||(32469917-32470034)
chr4 (220-313)||(32884821-32884914)
chr4 (220-313)||(38502490-38502583)
chr4 (220-292)||(43902271-43902346)
chr4 (262-302)||(2158019-2158059)
chr4 (137-185)||(21698645-21698693)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (109-313)||(50113-50317)
scaffold0095 (108-289)||(22254-22437)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (109-313)||(39405671-39405875)
chr8 (137-313)||(10179950-10180126)
chr8 (133-291)||(17719283-17719441)
chr8 (124-326)||(22771825-22772027)
chr8 (137-313)||(396614-396790)
chr8 (135-313)||(45425669-45425848)
chr8 (133-326)||(26626102-26626295)
chr8 (114-306)||(36006897-36007091)
chr8 (122-252)||(39301020-39301150)
chr8 (124-313)||(4428354-4428541)
chr8 (220-313)||(31331428-31331521)
chr8 (170-289)||(4924094-4924214)
chr8 (133-320)||(34948683-34948868)
chr8 (133-326)||(13335150-13335342)
chr8 (137-290)||(31231667-31231820)
chr8 (229-313)||(2767294-2767378)
chr8 (124-292)||(17823846-17824013)
chr8 (133-292)||(32476221-32476379)
chr8 (108-289)||(39466064-39466247)
chr8 (137-313)||(21216104-21216279)
chr8 (133-195)||(40109646-40109707)
chr8 (133-310)||(44761500-44761675)
chr8 (133-313)||(10097994-10098175)
chr8 (220-313)||(31082639-31082732)
chr8 (133-313)||(39482545-39482728)
chr8 (124-212)||(41091921-41092007)
chr8 (169-313)||(7172883-7173027)
chr8 (135-251)||(29226593-29226708)
chr8 (137-212)||(50753-50828)
chr8 (156-307)||(44648541-44648686)
chr8 (133-292)||(9300137-9300298)
chr8 (124-185)||(13831703-13831764)
chr8 (220-289)||(27294086-27294155)
chr8 (125-213)||(42182033-42182119)
chr8 (133-176)||(5053292-5053335)
chr8 (162-292)||(31270985-31271113)
chr8 (133-212)||(36967307-36967385)
chr8 (232-326)||(40996355-40996449)
chr8 (220-310)||(5356620-5356709)
chr8 (220-313)||(51133-51225)
chr8 (232-313)||(1875595-1875676)
chr8 (139-212)||(1875843-1875916)
chr8 (137-181)||(32678353-32678397)
chr8 (220-272)||(32678423-32678475)
chr8 (139-179)||(34455812-34455852)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (133-313)||(1248604-1248784)
chr5 (133-289)||(6315801-6315957)
chr5 (137-313)||(7827926-7828102)
chr5 (133-313)||(40899851-40900031)
chr5 (138-289)||(21060569-21060719)
chr5 (124-307)||(41496004-41496187)
chr5 (135-289)||(6753682-6753836)
chr5 (133-313)||(8725009-8725189)
chr5 (133-307)||(6615886-6616060)
chr5 (135-323)||(31654987-31655176)
chr5 (131-307)||(7330439-7330614)
chr5 (136-292)||(19929882-19930038)
chr5 (135-313)||(40530224-40530403)
chr5 (166-307)||(4440987-4441128)
chr5 (133-313)||(4818483-4818664)
chr5 (133-292)||(41062181-41062339)
chr5 (133-313)||(8698241-8698422)
chr5 (133-251)||(6753962-6754080)
chr5 (133-307)||(26285484-26285658)
chr5 (220-310)||(27580620-27580710)
chr5 (154-212)||(41480103-41480163)
chr5 (220-292)||(11796188-11796260)
chr5 (133-313)||(27542728-27542908)
chr5 (176-292)||(29374318-29374434)
chr5 (133-184)||(3348259-3348310)
chr5 (141-292)||(24454982-24455130)
chr5 (154-212)||(41478737-41478797)
chr5 (133-185)||(2588192-2588243)
chr5 (222-313)||(5129232-5129323)
chr5 (125-220)||(30118310-30118404)
chr5 (131-185)||(41478637-41478691)
chr5 (131-185)||(41492189-41492243)
chr5 (262-307)||(29412049-29412094)
chr5 (263-307)||(176731-176775)
chr5 (133-185)||(2232200-2232252)
chr5 (253-313)||(18890555-18890615)
chr5 (151-198)||(29424432-29424480)
chr5 (220-292)||(29856067-29856139)
chr5 (220-284)||(38161441-38161505)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (133-313)||(14523372-14523552)
chr2 (133-313)||(17695261-17695443)
chr2 (137-313)||(43410363-43410539)
chr2 (133-326)||(36354430-36354622)
chr2 (135-318)||(8947047-8947232)
chr2 (137-293)||(34225527-34225683)
chr2 (133-313)||(16463620-16463802)
chr2 (124-326)||(35242284-35242486)
chr2 (131-288)||(19444077-19444234)
chr2 (135-313)||(16377656-16377833)
chr2 (85-174)||(34451471-34451560)
chr2 (133-313)||(5789648-5789827)
chr2 (154-313)||(16805836-16805994)
chr2 (154-313)||(16845117-16845275)
chr2 (133-313)||(35313820-35314000)
chr2 (133-292)||(37322362-37322520)
chr2 (133-292)||(15359108-15359269)
chr2 (86-251)||(19937270-19937436)
chr2 (167-313)||(39691457-39691603)
chr2 (135-292)||(38187904-38188060)
chr2 (133-313)||(9458271-9458445)
chr2 (133-312)||(25637413-25637593)
chr2 (133-313)||(36794217-36794397)
chr2 (156-313)||(43115802-43115959)
chr2 (133-185)||(45235512-45235564)
chr2 (133-242)||(7494909-7495019)
chr2 (135-184)||(11366719-11366768)
chr2 (235-292)||(27866527-27866583)
chr2 (154-230)||(16028270-16028345)
chr2 (86-173)||(7491041-7491128)
chr2 (190-297)||(12872762-12872869)
chr2 (135-186)||(25904722-25904773)
chr2 (133-186)||(11742656-11742709)
chr2 (132-292)||(28186146-28186306)
chr2 (123-195)||(36004877-36004948)
chr2 (220-292)||(41220967-41221039)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (114-292)||(34299908-34300087)
chr6 (134-302)||(181491-181658)
chr6 (133-326)||(29363237-29363432)
chr6 (133-313)||(24983450-24983628)
chr6 (125-326)||(1063591-1063791)
chr6 (133-313)||(11655947-11656128)
chr6 (133-313)||(31894211-31894388)
chr6 (133-292)||(7920174-7920330)
chr6 (133-310)||(32440649-32440828)
chr6 (133-313)||(30716832-30717013)
chr6 (133-292)||(5302284-5302443)
chr6 (133-292)||(6801863-6802023)
chr6 (138-313)||(13909361-13909537)
chr6 (88-178)||(23397753-23397844)
chr6 (133-187)||(27367226-27367280)
chr6 (133-187)||(27457573-27457627)
chr6 (220-313)||(3291769-3291862)
chr6 (137-289)||(15058055-15058206)
chr6 (133-292)||(11143609-11143767)
chr6 (125-179)||(12307729-12307783)
chr6 (132-186)||(13207220-13207274)
chr6 (135-185)||(21425688-21425738)
chr6 (220-292)||(13087550-13087622)
chr6 (133-185)||(21478224-21478276)
chr6 (144-195)||(8694989-8695040)
chr6 (220-279)||(17828960-17829019)
chr6 (137-179)||(15582222-15582264)
chr6 (133-175)||(23142601-23142643)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (134-313)||(39864045-39864224)
chr1 (133-313)||(31042730-31042910)
chr1 (133-313)||(37506057-37506240)
chr1 (109-313)||(12038991-12039195)
chr1 (133-292)||(49224012-49224171)
chr1 (131-313)||(27896886-27897068)
chr1 (124-310)||(41121833-41122017)
chr1 (124-326)||(9379156-9379358)
chr1 (133-246)||(37177769-37177882)
chr1 (133-292)||(7351572-7351728)
chr1 (133-292)||(20209866-20210025)
chr1 (135-362)||(40144803-40145030)
chr1 (137-259)||(52429279-52429403)
chr1 (131-323)||(6160454-6160637)
chr1 (135-307)||(7759150-7759322)
chr1 (124-187)||(6268375-6268438)
chr1 (133-252)||(35367735-35367854)
chr1 (133-259)||(6785189-6785315)
chr1 (124-313)||(23168998-23169185)
chr1 (220-313)||(26093414-26093507)
chr1 (138-313)||(9307564-9307740)
chr1 (154-292)||(8896358-8896497)
chr1 (109-246)||(24991725-24991863)
chr1 (133-326)||(16395039-16395230)
chr1 (156-280)||(22856275-22856399)
chr1 (135-292)||(12151123-12151268)
chr1 (137-313)||(13579626-13579801)
chr1 (132-196)||(17988867-17988931)
chr1 (133-313)||(33733268-33733447)
chr1 (133-240)||(4659710-4659816)
chr1 (133-212)||(35682900-35682978)
chr1 (124-179)||(37238951-37239006)
chr1 (223-321)||(978854-978952)
chr1 (133-212)||(26252565-26252646)
chr1 (133-326)||(38787271-38787467)
chr1 (218-307)||(44426746-44426838)
chr1 (135-289)||(44761560-44761710)
chr1 (220-292)||(15699142-15699214)
chr1 (133-185)||(21910141-21910193)
chr1 (161-293)||(44707785-44707917)
chr1 (137-196)||(3312056-3312115)
chr1 (235-326)||(35538678-35538769)
chr1 (230-313)||(36701951-36702034)
chr1 (230-313)||(36718055-36718138)
chr1 (268-323)||(37177913-37177968)
chr1 (133-184)||(43500874-43500925)
chr1 (124-246)||(2137441-2137562)
chr1 (139-245)||(31879177-31879281)
chr1 (135-173)||(37275536-37275574)
chr1 (86-184)||(44426840-44426938)
chr1 (227-292)||(3312138-3312203)
chr1 (133-174)||(15699073-15699114)
chr1 (220-292)||(917044-917116)
chr1 (219-259)||(15904770-15904810)
chr1 (233-289)||(29778425-29778481)
chr1 (230-326)||(37276491-37276587)
chr1 (160-196)||(39395249-39395285)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (133-326)||(759087-759280)
chr7 (133-313)||(34947440-34947620)
chr7 (133-313)||(7463152-7463333)
chr7 (133-313)||(9785928-9786108)
chr7 (133-292)||(24516319-24516478)
chr7 (133-326)||(83324-83518)
chr7 (133-254)||(23745399-23745521)
chr7 (124-259)||(38032668-38032804)
chr7 (133-313)||(21759993-21760173)
chr7 (133-313)||(28202318-28202498)
chr7 (134-326)||(41506061-41506253)
chr7 (124-299)||(17610561-17610736)
chr7 (109-326)||(21390210-21390428)
chr7 (135-252)||(2459413-2459530)
chr7 (220-313)||(13961986-13962079)
chr7 (133-313)||(11373437-11373617)
chr7 (133-252)||(21350695-21350815)
chr7 (133-313)||(32346061-32346241)
chr7 (135-324)||(33819154-33819345)
chr7 (133-313)||(43873863-43874043)
chr7 (133-272)||(25571360-25571498)
chr7 (139-313)||(21937796-21937970)
chr7 (156-290)||(22738665-22738798)
chr7 (137-313)||(34100556-34100732)
chr7 (124-212)||(37245621-37245709)
chr7 (220-308)||(39005448-39005536)
chr7 (133-292)||(6494964-6495122)
chr7 (135-302)||(10042223-10042389)
chr7 (124-313)||(32769725-32769914)
chr7 (133-252)||(36790678-36790799)
chr7 (133-326)||(38391692-38391881)
chr7 (135-292)||(7457451-7457607)
chr7 (132-246)||(16904316-16904432)
chr7 (123-252)||(44424075-44424203)
chr7 (133-313)||(8592449-8592629)
chr7 (233-313)||(12631345-12631425)
chr7 (133-184)||(27920926-27920977)
chr7 (133-184)||(31930640-31930691)
chr7 (124-246)||(36425106-36425228)
chr7 (220-326)||(16560566-16560672)
chr7 (220-326)||(16604990-16605096)
chr7 (133-246)||(19271809-19271921)
chr7 (133-183)||(37850864-37850914)
chr7 (140-292)||(17828381-17828533)
chr7 (124-173)||(49101602-49101651)
chr7 (156-240)||(37490338-37490422)
chr7 (264-307)||(40614658-40614701)
chr7 (137-292)||(3178234-3178391)
chr7 (131-173)||(30546499-30546540)
chr7 (133-179)||(42935598-42935644)
chr7 (86-313)||(48608760-48608982)
chr7 (262-307)||(6855254-6855299)
chr7 (262-303)||(17609349-17609390)
chr7 (262-303)||(17609592-17609633)
chr7 (262-303)||(17609835-17609876)
chr7 (262-303)||(17610078-17610119)
chr7 (262-303)||(17610321-17610362)
chr7 (227-292)||(31930527-31930592)
chr7 (220-292)||(27921015-27921087)
chr7 (220-292)||(35333070-35333142)
chr7 (234-302)||(41499069-41499137)
chr7 (229-313)||(42935697-42935781)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (133-311)||(30190664-30190842)
chr3 (109-313)||(43253865-43254070)
chr3 (133-313)||(44301494-44301675)
chr3 (133-313)||(19822944-19823124)
chr3 (131-313)||(30711005-30711186)
chr3 (125-313)||(12736574-12736761)
chr3 (133-279)||(36460452-36460598)
chr3 (137-326)||(37311886-37312076)
chr3 (129-185)||(30710578-30710634)
chr3 (138-273)||(39043799-39043932)
chr3 (124-326)||(37497415-37497618)
chr3 (137-326)||(11905760-11905948)
chr3 (145-313)||(37695668-37695837)
chr3 (133-313)||(51837961-51838142)
chr3 (133-316)||(3901148-3901331)
chr3 (133-246)||(10366718-10366831)
chr3 (132-292)||(12904796-12904957)
chr3 (162-326)||(8679043-8679206)
chr3 (133-313)||(36476517-36476697)
chr3 (124-179)||(33458973-33459028)
chr3 (133-313)||(37772966-37773148)
chr3 (220-326)||(24569089-24569195)
chr3 (222-292)||(34750518-34750588)
chr3 (131-313)||(38795275-38795457)
chr3 (133-326)||(34957437-34957629)
chr3 (140-313)||(52290834-52291006)
chr3 (220-292)||(19611929-19612000)
chr3 (220-292)||(29023989-29024060)
chr3 (137-185)||(48541122-48541170)
chr3 (126-272)||(42469724-42469868)
chr3 (133-184)||(43715239-43715290)
chr3 (130-176)||(37804668-37804714)
chr3 (175-292)||(14194531-14194647)
chr3 (220-313)||(30682068-30682161)
chr3 (220-293)||(36462968-36463041)
chr3 (220-292)||(54477482-54477554)
chr3 (109-236)||(27471244-27471371)
chr3 (220-313)||(23004384-23004477)
chr3 (131-236)||(33634267-33634372)
chr3 (135-212)||(38137549-38137626)
chr3 (133-190)||(51065139-51065195)
chr3 (137-212)||(27549388-27549464)
chr3 (222-310)||(30861417-30861505)
chr3 (220-292)||(54726505-54726577)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (133-284)||(5325-5474)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (133-313)||(34021-34200)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (133-313)||(7983-8164)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (184-299)||(389-504)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (124-272)||(252848-252994)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (223-289)||(2048-2114)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (220-292)||(20376-20448)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (131-193)||(5976-6037)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (124-173)||(16884-16933)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4739549 - 4739430
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4739549 aaaataattgtcttttcagaatatcgatgcaacatttattattatttttcactaatatacccttattaatttaattataatccacttaattactccacta 4739450  T
Q  237 actacaattattaaggatat 256  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4739449 actacaattattaaggatat 4739430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 22129966 - 22130135
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccact 222  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||    
T  22129966 ttttttttttctcaaaataattgtcattttacaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaact 22130065  T
Q  223 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||    
T  22130066 taattactccactaactacaattaataaggatgtttttgtaaatgatactaattataccattgaaatcaa 22130135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7061852 - 7061672
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || ||||||||| |||    
T  7061852 tctcaaaataattgttactttaaaatatcaatacaacatttattatttattttcactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaattaatcc 7061753  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  7061752 actaactacaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 7061672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16821516 - 16821360
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 235  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||||||||    
T  16821516 aaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattatttttgcactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaatactccact 16821417  T
Q  236 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16821416 aactataattaataaggatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaa 16821360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49428529 - 49428350
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||||||    
T  49428529 tctcaaaataattgtcactttagaa-atcaatgcaacatttattacttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactcc 49428431  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  49428430 actaactacaattaataagggtattttagtaaattatattaattttaccattgaaatcaacacaaataatcatttccttaa 49428350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5841616 - 5841435
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt-aattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||| || |||||    
T  5841616 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttattattaatttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaaactactc 5841517  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  5841516 cactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacgcaatcaatcatttccttaa 5841435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 49176124 - 49175965
Alignment:
Q  132 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||    
T  49176124 gtctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacaattattatttttttcccactattatacccttatttattgaattttatccaacttaactact 49176025  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 290  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49176024 ccgctaactacaattaataaggttattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatc 49175965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47773207 - 47773027
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  47773207 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 47773108  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  47773107 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 47773027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4730595 - 4730521
Alignment:
Q  435 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaacttcct 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4730595 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtctcacactttaatttaaataatgttgtcctttgaacttcct 4730521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38405291 - 38405110
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||| |    
T  38405291 tctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcaacatttattactttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactacac 38405192  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  38405191 cactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaatcaacagaattaatcatttccttaa 38405110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 52859982 - 52859794
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||  || || |||||| |  | ||||| |||| |||     ||| ||||||    
T  52859982 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttcccattattataccctattgaatttcattcaact-----taactactcc 52859888  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  52859887 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 52859794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17512562 - 17512353
Alignment:
Q  97 tcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 196  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | | || |||||  || |||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||||| |    
T  17512562 tcttattttaattgtcactttaatattttctttat--cttaaaataattgtcattttaaaatatgaatgtaatatttattatttttttccactaatatgc 17512465  T
Q  197 ctttat-taatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattc 295  Q
      |||| | ||| ||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||    
T  17512464 acttatattattgaattcaactctacttaattattcgacaaactacaattaataatggtattttagtaaattatattaattttacctttaaaatcaactc 17512365  T
Q  296 aactaattattt 307  Q
    ||||||| ||||    
T  17512364 aactaatcattt 17512353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42617091 - 42616932
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  42617091 tctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattattattttccattattatacacttatttattgaatttcattcgacttaactactcc 42616992  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||| |||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  42616991 acttactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 42616932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35311413 - 35311293
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||||||||    
T  35311413 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattattttttccaatattatacctttatttattgaatttcatccaacttaattact 35311314  T
Q  231 ccactaactacaattattaag 251  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  35311313 ccactaactacaattaataag 35311293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11907787 - 11907607
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  |||| |||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  11907787 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatacatttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 11907688  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    | |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  11907687 aataactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 11907607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4744876 - 4744758
Alignment:
Q  181 tttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttat 280  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| |||| | |  |||||||| |||||||||||||||||      
T  4744876 tttttcattaatataacattatttatttaattccacttcacttaactactcgattaactacgattaattaatatatttttgtaaattatactaatttttc 4744777  T
Q  281 cattaaaatcaattcaact 299  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4744776 cattaaaatcaattcaact 4744758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 310
Target Start/End: Original strand, 36985718 - 36985896
Alignment:
Q  132 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || |||| ||| | |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||| ||    
T  36985718 gtctcaaaataattgtcagtttagaatatcaatgaagcatttactgtttttttccaccattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattattc 36985817  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 310  Q
     |||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  36985818 tactaactacaattaatacgggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 36985896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 307
Target Start/End: Original strand, 49746895 - 49747068
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 233  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||| |    
T  49746895 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattatttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaa 49746994  T
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    ||||||| ||||| | | | ||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  49746995 ctaactataattaatgaaggtattttagtaaatactactaattttatcattgaaatcaacacaattaattattt 49747068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4739971 - 4739915
Alignment:
Q  18 agttaaaatctcaacatatggaatacttataaaacggttcttaaagccactgatata 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4739971 agttaaaatctcaacatatggaatacttataaaacggttcacaaagccactgatata 4739915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Original strand, 34360592 - 34360768
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||  ||||||| || || |||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| || || |||||| ||||||||||    
T  34360592 aaaataattgtcactttacaataccaatttaacattttttttttttttccactattatacccttatttattgaattttattcaacttaactactccacta 34360691  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  34360692 actacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatttctttaa 34360768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35380522 - 35380362
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | ||||||  ||||    
T  35380522 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccactc 35380423  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  35380422 cactaactacaattaataatgatgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaatcaa 35380362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21240888 - 21240712
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    ||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||     
T  21240888 tctcaaaataaatgtcactttagaatatcaatgcaacatttat----attttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactca 21240793  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  21240792 actaactacaattaataaggatgtgttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacagttaatcatttccttaa 21240712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26147806 - 26147644
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt--attatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattac 229  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||  ||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||   |  |||| |||||||||    
T  26147806 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatacaacatttattttatttttttccattattatacccttatttattgaaaattcatccaacttaattac 26147707  T
Q  230 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26147706 tccactaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 26147644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 2066724 - 2066915
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||| || |||||||||||| ||| ||||  |    |||||| ||| ||    
T  2066724 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcatttattat--tttttcattattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactacccc 2066821  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  2066822 actaactaaaattaataagggtgttttaataaataatactaactttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 2066915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Original strand, 17114377 - 17114553
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccac-ttaattactccact 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||||| | ||||||||| |||| || ||  ||||||||||| ||| || | | |||||  |||| |||||||||    
T  17114377 aaaataattgtcattttagaatacttatgcagcgtttattatttttttccattataatacctttatttattgaact-tcctccaaattaactactccact 17114475  T
Q  236 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  17114476 aactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 17114553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Original strand, 53412044 - 53412201
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatta-ttatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 235  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||||| || |||||     
T  53412044 aaaataattgtcattttagaataccaatgtaacatctattatttttttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaactattccaca 53412143  T
Q  236 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 293  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  53412144 aactataattaataaaaatattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaat 53412201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4734367 - 4734294
Alignment:
Q  434 gtttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaacttcct 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4734367 gtttattttataatgttgttacgtttatgatttgt--ctcactttaatttaaataatgttgtcctttgaacttcct 4734294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 292
Target Start/End: Original strand, 54506744 - 54506880
Alignment:
Q  156 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| ||||  |    |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  54506744 aatatcgatgcaacatttattattatttttcattattatattcttattaattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattgataatgata 54506843  T
Q  256 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  54506844 ttttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaa 54506880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Original strand, 2653357 - 2653512
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | | |||| ||||||  ||    
T  2653357 aaaatagttgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaatttaactactccttta 2653456  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  2653457 actacaattaataagagtattttaataaatgatactaattttacaattgaaatcaa 2653512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 326
Target Start/End: Original strand, 3689525 - 3689688
Alignment:
Q  163 atgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttct 262  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||  |    ||||||  |||| |||||||| ||||| ||||  | ||||  |    
T  3689525 atgcaacatttattattattttccattattatacccttattaatttaatttcatctaacttaacaactcaactaactataattaataagagtgttttagt 3689624  T
Q  263 aaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  3689625 aaatgatactaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcatttctttaataaccgtacataa 3689688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 324
Target Start/End: Original strand, 25233115 - 25233305
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||| || |  |  | |||||| |||| |    
T  25233115 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatt-tttttcattataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactacttc 25233213  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 324  Q
    |||||||| ||||| ||    | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||| |||||||||| |||| || |||||||    
T  25233214 actaactataattaatactagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaattaattatttctttaataactgtacat 25233305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 292
Target Start/End: Original strand, 35998750 - 35998903
Alignment:
Q  138 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 237  Q
    |||||||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |  | |||||| |||||||  ||    
T  35998750 aaataattgtcaatttacaatatcaatatagcatttattattctttttcactattatatctttatttattgaattc-atccaacttaactactccatcaa 35998848  T
Q  238 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||  |||||||||||   ||||||||||    
T  35998849 ctacaattaataatgatattttaataaatgttactaattttactgttaaaatcaa 35998903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 243
Target Start/End: Original strand, 51624719 - 51624829
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  51624719 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattatttttttccactatcatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 51624818  T
Q  233 actaactacaa 243  Q
    |||||||||||    
T  51624819 actaactacaa 51624829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2942831 - 2942653
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt---cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 233  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||   ||||| |||| |||| || ||| || |  | || ||||||  ||||||    
T  2942831 aaaataattgtcattttacaatatcaatgaaatatttattattatttttttccactattatatctttgtttattgaaattcattcaacttaaccactcca 2942732  T
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  2942731 ctaactacaattaataagg-tgttttagtaaatgctactaattttatcatcgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 2942653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4751182 - 4751112
Alignment:
Q  435 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaactt 506  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4751182 tttattttataatgttattacgtttatgaccattcgcacactttaatttaaataa-tttgtcctttaaactt 4751112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Original strand, 6609781 - 6609887
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 319  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  6609781 acttaactactccaataattacaattaataaagatgtttttgtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcg 6609880  T
Q  320 tacataa 326  Q
    | |||||    
T  6609881 tgcataa 6609887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 195
Target Start/End: Original strand, 9301469 - 9301527
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  9301469 aaaataattgtcattttagaatatcaatgtattgtttattattatttttcactaatata 9301527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6643846 - 6643668
Alignment:
Q  134 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||  ||    
T  6643846 ctcaaaataattgtcactttacaatttcaacgcagcatttatt--tatttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactatacc 6643749  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  6643748 actaactacaattaataaagatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 6643668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47464550 - 47464373
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 235  Q
    ||||||||| || ||| | |||| |||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||     
T  47464550 aaaataattatcgttttacaataccaatgcattatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccacc 47464451  T
Q  236 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  47464450 aactacaattaataagagttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 47464373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 52247529 - 52247460
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| |||| ||||    
T  52247529 acttaactactccactaactacaattaataaggatattttagtaaattgtattaattttaccattgaaat 52247460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30682380 - 30682228
Alignment:
Q  138 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattat-ttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| ||| ||||  | || | |||| ||||| ||||    
T  30682380 aaataattgtcactttagaaaatcaatgtagcatttattattattttttcattattatgcttttatttattgaatttcattcaaattaactactctacta 30682281  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    ||||||| || |||||||||| |  ||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  30682280 actacaactaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccaataaaat 30682228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4751290 - 4751187
Alignment:
Q  304 atttccttaacaattgtacataactctataacaactattagtttgagatggtgggagtaattttatttgcttttaaacctaaaattttatttgcatgtct 403  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| || ||||   ||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||     
T  4751290 atttccttaataatcgcacacaactctaaaacgaccattaaaatgagacggagggaggaattttatttgctcttaagcctaaaatttaatttgcatgtca 4751191  T
Q  404 taac 407  Q
    ||||    
T  4751190 taac 4751187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 292
Target Start/End: Original strand, 7986914 - 7987066
Alignment:
Q  138 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 237  Q
    |||||||| ||| || | |||||||||| |||| |||||||   ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||  | |  |||||| ||||| |||||    
T  7986914 aaataattatcactttaaaatatcaatgtaacacttattata--ttttccctattatacttttatttatttaatttcattaaacttaactactctactaa 7987011  T
Q  238 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    | | ||||| |||  |||||||  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  7987012 caataattaataataatattttagtagatgatactaattttatcattaaaatcaa 7987066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 17121200 - 17121247
Alignment:
Q  156 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttatt 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17121200 aataccaatgcaacatttattattatttttcactaacataccattatt 17121247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17237447 - 17237304
Alignment:
Q  170 atttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattat 269  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |    
T  17237447 atttattagttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggttgttttagtaaatgtt 17237348  T
Q  270 actaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  17237347 actaattttaccattgcaatcaacacaattaattattttcttaa 17237304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20612365 - 20612185
Alignment:
Q  125 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactta 224  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    |||||| ||  |||| || ||||||||  ||||| ||| ||||  | | ||||||    
T  20612365 tttttatgtctctaaataattatcattttagaatatcaatgttgtatttatcat--ttttccattaatatactattatttattgaatttcaattcactta 20612268  T
Q  225 attactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    | |||| || || ||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||||    
T  20612267 actacttcattatctacaattaataatggtgttttagtaaattatactaactttagcaatgaaatcaactcaactaatcattt 20612185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 326
Target Start/End: Original strand, 43237203 - 43237369
Alignment:
Q  162 aatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  43237203 aatgcaacatttattattatttttttcactattatacacttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactataattaataatgatttttt 43237302  T
Q  260 tctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
      |||||  ||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  43237303 agtaaatattactaattttaccattgaaataaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 43237369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44536290 - 44536191
Alignment:
Q  227 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  | ||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  44536290 tactccactaactacaattaataagggtgttttaataaatcctgctaattttaccattaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 44536191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 318
Target Start/End: Original strand, 461978 - 462076
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaatt 318  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||    
T  461978 acttaactactccgctaattacaattaataaggatattttagtaaataatattacttttaccattgaaatcaatacaattaatcattttcttaaaaatt 462076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11288730 - 11288625
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 319  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| |||||||  |||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| ||| |    
T  11288730 acttaactactccaccaactacaattaataa-gatattttagtaaatgatattaattttgccattgaaatcaatacaattaatcattttcttaataatcg 11288632  T
Q  320 tacataa 326  Q
    |||||||    
T  11288631 tacataa 11288625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40122955 - 40122862
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  40122955 acttaactgctccactaactacaatcaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaacattaaaatcaacgcaattaatcatttccttaa 40122862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33790921 - 33790726
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||| ||| |||||||| || || ||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||    
T  33790921 tctcaaaataattgtcactttagaattccaacgcagcatttattttttttctttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactact 33790822  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||   |||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  33790821 ccactaactacaattaataagggtgttttagcaaatgaaactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 33790726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39139923 - 39139868
Alignment:
Q  134 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcacta 190  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39139923 ctcataataattgtcattt-agaataacaatgcaacattcattattattttccacta 39139868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47359050 - 47358978
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47359050 acttaattactccactgactacaattaataaaagtattttagaaaattattctaattttatcattgaaatcaa 47358978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Original strand, 18532133 - 18532268
Alignment:
Q  154 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaagga 253  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||| ||||  |  | | ||||  |||||||| |||| ||||| |||       
T  18532133 agaatatcaatgtaatatttattattatttttcactattatatcataatttattgaatttcatcctagttaaccactccacttactataattaataaaac 18532232  T
Q  254 tatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18532233 tattttaataaatcatactaattttaccattaaaat 18532268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28911340 - 28911293
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 184  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28911340 aaaataattgtcgatttagaatatcaatgcaacatttattattttttt 28911293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23915524 - 23915438
Alignment:
Q  227 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  23915524 tactccactaactataattaataatgatgttttagtaaattaaacatattttaccattaaaatcaacactactaatcatttccttaa 23915438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Original strand, 30471794 - 30471840
Alignment:
Q  139 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30471794 aataattgtctctttaaaatatcaatgcaacatttattattattttt 30471840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31096308 - 31096234
Alignment:
Q  139 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattc 213  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  31096308 aataattgtcattttataatatcaaaacaacatttattatttttttctactgatatatctttatttattgaattc 31096234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 237
Target Start/End: Original strand, 35251830 - 35251936
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |    |||||||||||    
T  35251830 tgtctccaaataattatcaatttagaataccaaaacaacatttattattatttttcattattatatccttatttattgaatttcatctaacttaattact 35251929  T
Q  231 ccactaa 237  Q
    |||||||    
T  35251930 ccactaa 35251936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8175785 - 8175709
Alignment:
Q  125 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttat 202  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||  |||||||||||    
T  8175785 tttttctgtctcaaaata-ttgtcactttagaatattaatgcaacatttattaattttttctactgttatacctttat 8175709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18741575 - 18741502
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 293  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||    
T  18741575 acttaactactccattaactacaattaataaagatattttaataaatgacactaattttaccgttgaaatcaat 18741502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28501073 - 28501020
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 186  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  28501073 tctcaaaataattgtctctttagaataccaatacaacatttattattttttttc 28501020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 32470034 - 32469917
Alignment:
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataactctataa 334  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| ||| | |||| | ||||| |||  ||    
T  32470034 taactacagttaataagaatgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattttctttaaaattatgcataaatcttaaa 32469935  T
Q  335 caactattagtttgagat 352  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  32469934 caaatattattttgagat 32469917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 32884821 - 32884914
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||  |||||||| || |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  32884821 acttaactactccactaactacaattaataagagtgttttactaaatgctactaattctaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 32884914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38502583 - 38502490
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||| |||   ||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  38502583 acttaactactacattaactataattaataaaagtattttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 38502490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 43902271 - 43902346
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttcta---aattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||  ||   ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43902271 acttaattactccactaactatgattaataagaatattttaataaataataatattaattttatcattaaaatcaa 43902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2158059 - 2158019
Alignment:
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2158059 taaatgatactaattttatcattgaaatcaattcaattaat 2158019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21698693 - 21698645
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21698693 aaaataattgtcactttaaaatatcaatgcaatatttattattaatttt 21698645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 313
Target Start/End: Original strand, 50113 - 50317
Alignment:
Q  109 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaattt 208  Q
    |||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  50113 tgtctctttagcattttttttctttgtcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattatttttcactattatacccttatttattt 50212  T
Q  209 aattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 308  Q
    ||||  | || ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| |||||    
T  50213 aatttcattcaacttaattactccactaactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttc 50312  T
Q  309 cttaa 313  Q
    |||||    
T  50313 cttaa 50317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 289
Target Start/End: Original strand, 22254 - 22437
Alignment:
Q  108 ctgtctctttag--tttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaa 205  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||| ||| || | |||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |    
T  22254 ctgtctctttagccttttttttctctgtctcaaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattatt-tttttcactattatatccttattta 22352  T
Q  206 tttaattctactcca--cttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    || |||| || ||||   |||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22353 ttgaatttta-tccaattttaactactgcactaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattttagcattaaaat 22437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 313
Target Start/End: Original strand, 39405671 - 39405875
Alignment:
Q  109 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaattt 208  Q
    |||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  39405671 tgtctctttagcattttttttctttgtcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattatttttcactattatacccttatttattt 39405770  T
Q  209 aattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 308  Q
    ||||  | || ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| |||||    
T  39405771 aatttcattcaacttaattactccactaactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttc 39405870  T
Q  309 cttaa 313  Q
    |||||    
T  39405871 cttaa 39405875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10180126 - 10179950
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||  ||||||||| ||||  | || |||||| ||||||||||    
T  10180126 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttctattattatacacttattaattgaatttcattcaacttaactactccacta 10180027  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||| |||||    
T  10180026 actacaattaataagtgtattttagtaaattatactaattttaccattgaaatcaatacaactactcattttcttaa 10179950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17719441 - 17719283
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  17719441 tctctaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactactcc 17719342  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatca 291  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  17719341 actaactataattaataaggatattttagtaaataatactaactttaccattaaaatca 17719283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22772027 - 22771825
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | || |    
T  22772027 ttttttttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattacttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacat 22771928  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| | |||||||| || ||| ||    
T  22771927 aattacttcactaactacaattaataagggtgttttaataaatgacactaattttaccatcaaaatcaacccaattaatcaattccttaataactgtgca 22771828  T
Q  324 taa 326  Q
    |||    
T  22771827 taa 22771825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 396790 - 396614
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccact-taattactccact 235  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| || |||| | ||| |||| || |    
T  396790 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattatttttcattattatacccttattaattgaatttta-tccaatataactacttcatt 396692  T
Q  236 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||| | || |||||||   || |||| ||||||||||    
T  396691 aactacaattaataaggatattgtagtaaatgatactaattttaccgttgaaatcaacataattaatcatttccttaa 396614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45425848 - 45425669
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 233  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||||||||    
T  45425848 tcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatacaacttaattactcca 45425749  T
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||  |||||  || |||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  45425748 ctaactacaattaataagaatgttttaataaatgttattaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 45425669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26626295 - 26626102
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||  || || |||||| ||||| ||| ||||  | || ||   | ||||||    
T  26626295 tctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttattattttttcccattattatacccttatttattgaatttcattcaaccggactactcc 26626196  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  26626195 actaactacaattaataaggatattttaataaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 26626102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36007091 - 36006897
Alignment:
Q  114 ctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaat 211  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| |  ||||| ||| |||    
T  36007091 ctttagatttttttttccgtctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcaacaattatttttatttttttcactattatgctcttatttattgaat 36006992  T
Q  212 tctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatt 306  Q
    |  |    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36006991 ttcatcaaacttaattaccccactaactacaattaatagggatattttagtcaataatattaattttatcattaaaatcaacacaactaattatt 36006897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39301150 - 39301020
Alignment:
Q  122 tcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccac 221  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||||  | || ||    
T  39301150 tcttttttttctctcaaaataattgtcattttagaatatcaatgaatcgtttattattattttccattattatacttttatttattgaatttcattcaac 39301051  T
Q  222 ttaattactccactaactacaattattaagg 252  Q
    | || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  39301050 tgaactacttcactaactacaattaataagg 39301020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4428541 - 4428354
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||  |    ||||    
T  4428541 ttttctatgcctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaacaattattat--ttttccactattatacttttatttattgaatttcatctaactt 4428444  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    || || | ||||||||||||||| |||   ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  4428443 aactaattcactaactacaattaataattgtattttagtaaatgataataattttatcattaaaatcaacacaaataatcattttcttaa 4428354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 31331428 - 31331521
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  31331428 acttaattacttcactaactacaattaataatgatattttagtaaataataataattttataattgaaatcaatacaattaatcatttccttaa 31331521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4924214 - 4924094
Alignment:
Q  170 atttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaatta 268  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||  | || |||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |    
T  4924214 atttattattattttttcactaatatacccttatttattaagtttcattcaacttaactactctattaactacaattaataaagatattttagtaaataa 4924115  T
Q  269 tactaattttatcattaaaat 289  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  4924114 tactaattttaccattaaaat 4924094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34948868 - 34948683
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  34948868 tctcaaaataattgttactttagaataccaatgcaatatttattatt-tttttcattgttatacctt-atttattgaatttcatccaacttaactactcc 34948771  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgt 320  Q
    |||||||||||||| |||   | ||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  34948770 actaactacaattaataaatgtgtttctgtaaatgatactaattttactatttaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgt 34948683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 13335150 - 13335342
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||| ||| ||||  |    |||||| |||||     
T  13335150 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-ttttccattattataccctgatttattgaatttcatcaaacttaactactct 13335248  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    ||||||| |||||| |||   | |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||  |||||||||| ||| || |||||    
T  13335249 actaactgcaattaataaatgtgttttactaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaaccatttccttaataatcgtgcataa 13335342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 290
Target Start/End: Original strand, 31231667 - 31231820
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || | ||  | |||||| ||||||||||    
T  31231667 aaaataattgtcattttataataccaatgcatcatttattatttttttccattataatacccttatttattgaactttatccaacttaactactccacta 31231766  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 290  Q
    |||||||||| ||||| | |||   ||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  31231767 actacaattaataagggtgtttcagtaaatgatattaattttaccatcaaaatc 31231820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2767378 - 2767294
Alignment:
Q  229 ctccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  2767378 ctccactaactacaaataataaggatgttttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 2767294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 292
Target Start/End: Original strand, 17823846 - 17824013
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||| |||||||||| |  | ||||| |||||  ||||| ||||||||  |  | ||||    
T  17823846 ttttttctgtctcaaaataattgtcaatttataataacaatacaatatttattatt-tcctccactattatactattatttatttaatttcatccaactt 17823944  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||| | |||| |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17823945 aactacttcactaactacaattaataaaggtattctagtaaaagatactaattttatcattgaaatcaa 17824013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Original strand, 32476221 - 32476379
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||| |    
T  32476221 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcgtatattatt-tttttcattgttatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactacttc 32476319  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  32476320 attaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttatcattgaaatcaa 32476379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39466247 - 39466064
Alignment:
Q  108 ctgtctctttag--tttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaa 205  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||| ||| || | |||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |    
T  39466247 ctgtctctttagccttttttttctctgtctcaaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattatt-tttttcactattatatccttattta 39466149  T
Q  206 tttaattctactcca--cttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    || |||| || ||||   |||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39466148 ttgaatttta-tccaattttaactactgcactaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattttagcattaaaat 39466064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21216279 - 21216104
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 235  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||| || |  ||| ||||  |  | |||||| |||||||||    
T  21216279 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttatttatttttttctactattataccatttt--attgaatttcatccaacttaactactccact 21216182  T
Q  236 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  21216181 aactacaattaataaggatgttttagtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 21216104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 40109646 - 40109707
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  40109646 tctcaaaataattgtcattttagaatat-aatgcaacatttattatatttttccactaatata 40109707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44761675 - 44761500
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||  |||| | |||| ||||| |||||| | ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  44761675 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcat--attagttttttccactattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactcc 44761578  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 310  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  44761577 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 44761500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10098175 - 10097994
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata-tacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |||| || ||||||||||| ||||||  | ||| || ||||||| ||| || |  |  | |||||| |||||    
T  10098175 tctcaaaataattgttactttagaataccaatacatcatttattattttttttccattataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactactc 10098076  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | || |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  10098075 cactaactacaattaataagggtgttatagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcattttcttaa 10097994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 31082639 - 31082732
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  31082639 acttaactactccactaactataattaataagggtgttttagtaaataccactaattttatcattaaaatcaagacaattaatcatttccttaa 31082732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 39482545 - 39482728
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatat---acctttattaatttaattctactccacttaattac 229  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||  |||||||||| |||  ||||| |||   ||| ||||| ||| ||||  | ||||||||| ||     
T  39482545 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagtatttattattttttcccactattattatacccttatttattgaatttcattccacttaactag 39482644  T
Q  230 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  39482645 tccactaactataattaataagggtgttttagtaaattctactaattttacccttgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 39482728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 41091921 - 41092007
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  41091921 ttttttttgtctcaacataattgccaatttagaatatcaatgcagcatttat--ttatttttcactattatacccttatttattgaatt 41092007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Original strand, 7172883 - 7173027
Alignment:
Q  169 catttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaatta 268  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||| || |||||||||||| |||  || ||||  |||||      
T  7172883 catttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactacttcattaactacaattaataaatatgttttagtaaatgc 7172982  T
Q  269 tactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  7172983 tactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 7173027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29226708 - 29226593
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||||    
T  29226708 tcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttatta-tatttttcattattgtacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccac 29226610  T
Q  235 taactacaattattaag 251  Q
    |||||||||||| ||||    
T  29226609 taactacaattaataag 29226593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 50753 - 50828
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||    
T  50753 aaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatt 50828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44648686 - 44648541
Alignment:
Q  156 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 255  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| |||||||| |     || || || ||||||||||||| |||||||| |||| ||     
T  44648686 aatatcaatacaacatttattaattttgttcattaatatccctt-attaatttca-----ctacattttattactccactaattacaattagtaagtatg 44648593  T
Q  256 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  44648592 ttttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaactaaactaatcattt 44648541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9300298 - 9300137
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc--actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||  ||||||||||  ||| |  |||| |||| | ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||    
T  9300298 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagtatttattatttctttccccactattatatccttatttattgaatttcattcaacttaactact 9300199  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  9300198 ccactaactaaaattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattaaaatcaa 9300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13831764 - 13831703
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13831764 tttttcatatctcaaaagaactgtcactttagaatatcaatgcaacatttatcattattttt 13831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27294155 - 27294086
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27294155 acttaattactccactaactgcaattaataaatatattttagtaaaagatactaattttatcattcaaat 27294086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42182119 - 42182033
Alignment:
Q  125 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattc 213  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||    
T  42182119 tttttttgtcttaaaataattgtcgttttagaata-caatgcaacatttataatta-ttttcaccaatgtacccttatttattgaattc 42182033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5053335 - 5053292
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt 176  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  5053335 tctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcaacatttatt 5053292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 292
Target Start/End: Original strand, 31270985 - 31271113
Alignment:
Q  162 aatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttc 261  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  | || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||      
T  31270985 aatgcaatatttattattttttt--attactatacccttatttattgaattttatccaacttaactactccactaactataattaataagagtattttag 31271082  T
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  31271083 tatatgatattaattttaccattaaaatcaa 31271113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 36967307 - 36967385
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||    
T  36967307 tctcaaaataattgttactttagaatatcaatgcataatttattatt-tttttcattattatacccttatttattgaatt 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40996449 - 40996355
Alignment:
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt-aaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| |||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40996449 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgaaactaatttta-cattcaaaatcaacacaattaatcatttccttaacaattgtgcataa 40996355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 310
Target Start/End: Original strand, 5356620 - 5356709
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 310  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  5356620 acttaattattccattaactacaattaataaag-tacattagtaaatgatattaattttatcattaaaatcaacacaactaatcatttcct 5356709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 51133 - 51225
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  51133 acttaattaatccactaactacaattaataaatgtgtttttgtaaatgatacttatttta-cattaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 51225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1875676 - 1875595
Alignment:
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  1875676 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 1875595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1875916 - 1875843
Alignment:
Q  139 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  1875916 aataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattacttttttccactagtatacccttatttattaaatt 1875843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 181
Target Start/End: Original strand, 32678353 - 32678397
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattat 181  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  32678353 aaaataattgtcactttaaaatatcaatgcatcatttattattat 32678397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 272
Target Start/End: Original strand, 32678423 - 32678475
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||    
T  32678423 acttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatact 32678475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34455852 - 34455812
Alignment:
Q  139 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 179  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  34455852 aataattgtcaatttaaaatatcaatgcaacatttattatt 34455812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1248784 - 1248604
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| || || |||||| |||| |    
T  1248784 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattatttttcattattatacccttattaattgaattttattcaacttaactacttc 1248685  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  1248684 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacataattaataatttccttaa 1248604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6315957 - 6315801
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  6315957 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttc 6315858  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  6315857 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaat 6315801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7828102 - 7827926
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||||    
T  7828102 aaaaaaattatcattttaaaatatcaatgcaatatttattatcttttttcattattatatccttatttattaaatttcatccaacttaactactccacta 7828003  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  7828002 actacaattaataagggtattttaataaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattttcttaa 7827926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 40899851 - 40900031
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  40899851 tctcaaaataattgtcactttagaataacattgcagcatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 40899950  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||  ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  40899951 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttgccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 40900031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Original strand, 21060569 - 21060719
Alignment:
Q  138 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 237  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||    
T  21060569 aaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttatt-ttattttccattattataccattatttattgaattttatccaacttaactactccactaa 21060667  T
Q  238 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    ||||||||| ||||  ||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  21060668 ctacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttaccatcaaaat 21060719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 307
Target Start/End: Original strand, 41496004 - 41496187
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||  |||  |  | | ||    
T  41496004 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattcttttccactattatacctttatttattgcatttcatccaattt 41496103  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  41496104 aactactccactaactacaattaataatgatgttttactaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattt 41496187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6753836 - 6753682
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  6753836 tcaaaataattatcactttagaataccaatgcaacatttattatctttttccattattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactactccac 6753737  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  6753736 taactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaat 6753682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8725189 - 8725009
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  | || | |||| ||||||    
T  8725189 tctcaaaataattgtcattttagaataacaatgcagcagtttttattatttttcattattatactattatttattgaatttcattcaagttaactactcc 8725090  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8725089 actaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8725009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6616060 - 6615886
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||  ||||    
T  6616060 tctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaattcatc-caacttaaccactc 6615962  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  6615961 cactaactaaaattaataaggatgttttggtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattt 6615886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 323
Target Start/End: Original strand, 31654987 - 31655176
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtca-tttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 233  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| |||| ||| | ||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || || |||||||||||    
T  31654987 tcaaaataattgtcactttaaaaataccaatacaataattattatttatttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacataattactcca 31655086  T
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 323  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| |||| ||| |||||    
T  31655087 ctaactacaattaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtaca 31655176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 307
Target Start/End: Original strand, 7330439 - 7330614
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||  ||| |||| || |||| |||| ||||    
T  7330439 tgtctcaaaataattatcattttaaaatatcaatgcaacattaattatttttttctagtaatatacctttatgtattaaatttta-tccaattaactact 7330537  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    ||||||| || ||||| ||||  | |||| || ||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||| | ||||||||    
T  7330538 ccactaattagaattaataagagtgttttactgaatgatattaattttacgattaaaaccgattcaccaaattattt 7330614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 292
Target Start/End: Original strand, 19929882 - 19930038
Alignment:
Q  136 caaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 235  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | ||||    
T  19929882 caaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactatttcact 19929981  T
Q  236 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||    
T  19929982 aactacaattaataaggatgttttagtaaatgacgctagttttaccatcaaaatcaa 19930038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40530403 - 40530224
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt-atttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 233  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||  |  | ||||||  ||||||    
T  40530403 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattatttatttcccactattatacccttatttatttaatttcatccaacttaaccactcca 40530304  T
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  40530303 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 40530224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 307
Target Start/End: Original strand, 4440987 - 4441128
Alignment:
Q  166 caacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaa 265  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | | |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||    
T  4440987 caacatttattatttttttctactattataccgttatttattgaatttcatccaatttaactactccactaactacaattaataaaaatattttagtaaa 4441086  T
Q  266 ttatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  4441087 taatattaattttatcattaaaatcaacacaattaattattt 4441128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 4818483 - 4818664
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||  |    ||||||| ||||    
T  4818483 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgtagcatttattatttttttcccactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaatcactc 4818582  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  4818583 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttacaattgaaatcaacacaattaattatttccttaa 4818664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41062339 - 41062181
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactc 231  Q
    ||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || || | |||| |||||||| ||    
T  41062339 tctcaaaataattataactttagaataccaatgcaacatttattatt-ttttccattataatacccttatttattgaactcca-tccagcttaattattc 41062242  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41062241 tactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttatcatcaaaatcaa 41062181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 8698241 - 8698422
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||  ||||    
T  8698241 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtagtatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaccactc 8698340  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8698341 cactaactacaattaataagggtgttttggtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8698422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 251
Target Start/End: Original strand, 6753962 - 6754080
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| || || |||| ||  |||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  6753962 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacattttttttttttttccatcaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 6754061  T
Q  233 actaactacaattattaag 251  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  6754062 actaactacaattaataag 6754080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26285658 - 26285484
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |  |||||||  | |||  |||||| |||| |||||| ||| |||| ||  | |||||| |||| |    
T  26285658 tctcaaaataattgtcaattgagaatattaatgtagtatttattgatttttcccactaacatacatttatttattgaattttatacaacttaactacttc 26285559  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    | |||||||||||| || |  | ||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  26285558 attaactacaattaatacgtgtgttttcataaatgatactaattttaccgttaaaatcaagtcaactaatcattt 26285484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 310
Target Start/End: Original strand, 27580620 - 27580710
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  27580620 acttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 27580710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Original strand, 41480103 - 41480163
Alignment:
Q  154 agaatatcaatgcaacatttattatta--tttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41480103 agaatatcaatgcaacatttattattatttttttcactattatacctttatttattgaatt 41480163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11796260 - 11796188
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11796260 acttaactactacactaactacaattaataataatattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaa 11796188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 27542728 - 27542908
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||  |||||| ||| ||||| | |||| || || |||||  ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||||    
T  27542728 tctcaaaataattgtgactttagaatactaatgcagcatgtattacttttttccattattatactcttatttattgaattttatccaacttaactactcc 27542827  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  |||||  || |||||||| |||| |||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  27542828 actaactacaattaataagagtattttagtaaatggtattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcatttccttaa 27542908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 292
Target Start/End: Original strand, 29374318 - 29374434
Alignment:
Q  176 tattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaat 275  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||| || || | |||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||  || ||||    
T  29374318 tattttttttcactattatacccttatttattgaattttattcaatttaactactccactaactacaattaataaaggtcttttagtaaatgctattaat 29374417  T
Q  276 tttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||||||| |||||||    
T  29374418 tttatcattgaaatcaa 29374434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3348310 - 3348259
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3348310 tctcaaaataattgtcattttagaataccaatgcagcatttattattttttt 3348259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24455130 - 24454982
Alignment:
Q  141 taattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaacta 240  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||   ||  |||||||||   ||||| ||| ||||  |||||  ||| ||||||||| |||||    
T  24455130 taattgtcacattagaatatcaatacaacatttattatt---ttcgactaatatagtcttatttattaaatttcactccgtttagttactccacaaacta 24455034  T
Q  241 caattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| |||   ||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24455033 caattaataaaagtattttaataagttatactagttttataattaaaatcaa 24454982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 212
Target Start/End: Original strand, 41478737 - 41478797
Alignment:
Q  154 agaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41478737 agaatatcaatgcaacatttattattattttttctactattatacctttatttattgaatt 41478797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2588243 - 2588192
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2588243 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttatt-ttattttt 2588192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5129323 - 5129232
Alignment:
Q  222 ttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| |||| || || |  ||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  5129323 ttaactactctaataactacaattaataagaatgttatagtaaattatattaattttaccattcaaaccaatgcaactaattattttcttaa 5129232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30118404 - 30118310
Alignment:
Q  125 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca 220  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  30118404 tttttatatcttaaaataattgtaactttagaatattcatgcaacatttattttta-ttttcattagtatacatttatttattgaattttactcca 30118310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 41478637 - 41478691
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  41478637 tgtctcaaaataattatcactttagaatattaatgcagcacttattattattttt 41478691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 185
Target Start/End: Original strand, 41492189 - 41492243
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  41492189 tgtctcaaaataattgtcactttagaatatcaataaagcacttattattattttt 41492243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29412094 - 29412049
Alignment:
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  29412094 taaatcatactaattttaccattaaaatcaatcgaactaattattt 29412049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 176731 - 176775
Alignment:
Q  263 aaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  176731 aaatgatactagttttaacattaaaatcaattcaactatttattt 176775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2232252 - 2232200
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  2232252 tctctaaataattgtcattttacaataccaatgtagcatttattattattttt 2232200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18890615 - 18890555
Alignment:
Q  253 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  18890615 atattttaataaatgatactaattttaccattaaaaacaactcaactaatcattttcttaa 18890555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 29424432 - 29424480
Alignment:
Q  151 ttcagaatatcaatgcaaca-tttattattatttttcactaatatacct 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  29424432 ttcagaatatcaatgcaacattttattaattcttttcactaatatacct 29424480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 29856067 - 29856139
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||   || | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  29856067 acttaactactccactaactacaattaataagagtattttagcaagtgatattaattttatcattgaaatcaa 29856139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38161505 - 38161441
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||    
T  38161505 acttaactactccactaactacgattaataaggatattttagtaaatgatatgaattttaccatt 38161441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14523552 - 14523372
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| | ||||||||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  14523552 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttccattattatatccttattaattgaatttcatctaacttaactactcc 14523453  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  14523452 actaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaaaaaatcatttccttaa 14523372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 17695261 - 17695443
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||    
T  17695261 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattattttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactact 17695360  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  17695361 ctactaactataattaataagaatatttttgtaaatgatatcaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatttccttaa 17695443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Original strand, 43410363 - 43410539
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| || || |||||  | ||| ||| ||||  | || |||||| ||||||| ||    
T  43410363 aaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattatttttttccattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccatta 43410462  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||    
T  43410463 actacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatcaacacaattaataatttccttaa 43410539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36354622 - 36354430
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  36354622 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagaatttattatt-ttttccattattataccattatttattgaatttcatccaacttaactactcc 36354524  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||   ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  36354523 actaactacaattaataagagtgtttcaataaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaactagtcatttccttaataatcgtacataa 36354430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8947232 - 8947047
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcattt---cagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||||    | |||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  8947232 tcaaaataattgtcattttacaacaataccaatgcaatatttattatt-tttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 8947134  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaatt 318  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||||    
T  8947133 cactaactataattaataaggatgttttagtaaatattactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatt 8947047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Original strand, 34225527 - 34225683
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||| ||    
T  34225527 aaaataattgtcactttggaataccaatgcagtatttattattttttttcattattatacccttatttattaaatttcattcaacttaaatactccatta 34225626  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 293  Q
    |||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  34225627 actacaattaataagggtgttttagtaaataatactaagtttaccattaaaatcaat 34225683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 16463620 - 16463802
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || | |||| ||||| ||| ||||  |    |||| | ||||    
T  16463620 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattttaccattatttattaaatttcatcaaactttactact 16463719  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  16463720 ccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 16463802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35242486 - 35242284
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||| ||||||| |||||| || | | || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | ||||    
T  35242486 ttttctatgtctgaaaatagttataactttagaataccaatgcaatatttattattagttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaactt 35242387  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 323  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||  ||||| |  ||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||  || ||||||| |||||| ||    
T  35242386 aactactcaactaactacaattaataaatatattctagtaaatgattctaattttaacattaaaatcaacacaattaaacatctccttaaaaattgtgca 35242287  T
Q  324 taa 326  Q
    |||    
T  35242286 taa 35242284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 288
Target Start/End: Original strand, 19444077 - 19444234
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattac 229  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| || || ||| || | || |||| ||||| |||    
T  19444077 tgtcttaaaataattgtcacttcaaaatatcaatgcaacatttattatttttttacattattatacccttgtttattgaaattta-tccatcttaactac 19444175  T
Q  230 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaa 288  Q
    || ||||| |||||||| |||  | |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19444176 tcgactaattacaattaataataacattttagtaaataatattaattttatcattaaaa 19444234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16377833 - 16377656
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaat----tact 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||||||    ||||    
T  16377833 tcaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaacatt-----ttttttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattaactact 16377739  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16377738 ccactaactacaattaataaggttattttggtaaatgatattaattttaccattgtaatcaacacaattaatcatttctttaa 16377656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34451560 - 34451471
Alignment:
Q  85 ttactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta 174  Q
    ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34451560 ttactccctccatctcaaaataattgtctctttagtattttttttctatctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacattta 34451471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5789827 - 5789648
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | |    
T  5789827 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatt-ttttccactattataccattatttattgaatttcatccaacttaactatttc 5789729  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   ||||||||||  ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  5789728 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcatttccttaa 5789648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Original strand, 16805836 - 16805994
Alignment:
Q  154 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaagg 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| |||| ||  ||| |||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16805836 agaatatcaatgcatcatttattatcttttttcattattatccctt-atctattaaatt-taatccaacttaacaactccactaactacaattaataagg 16805933  T
Q  253 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16805934 atattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 16805994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Original strand, 16845117 - 16845275
Alignment:
Q  154 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaagg 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| |||| ||  ||| |||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16845117 agaatatcaatgcatcatttattatcttttttcattattatccctt-atctattaaatt-taatccaacttaacaactccactaactacaattaataagg 16845214  T
Q  253 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16845215 atattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 16845275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 35313820 - 35314000
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  35313820 tctcaaaataattgtcactttacaataataatgcaacatttattacttttttccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 35313919  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  35313920 actaactacaattaataaggttgctttaataaatactactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 35314000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Original strand, 37322362 - 37322520
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||| | ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  37322362 tctcaaaataattgtcactttagaatacctatgtagcatttattatt-ttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 37322460  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  37322461 actaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaa 37322520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15359269 - 15359108
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||    
T  15359269 tctcaaaataattgttactttagaatatcaatgcagtatttattagtatttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactact 15359170  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  15359169 ccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttatcatcaaaatcaa 15359108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Original strand, 19937270 - 19937436
Alignment:
Q  86 tactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    |||||||||| ||| ||  ||| ||| | |||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||| | || ||||     
T  19937270 tactccctccgtctcatgataattgtttttttagttttttttctttttctcataataattgtcactttagtataacaatgcaacatttaatttttttttc 19937369  T
Q  186 c-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaag 251  Q
    | | || |||||||||||| ||| |||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19937370 ccattattatacctttatttattgaattttattcaacttaactactccactaactacaattaataag 19937436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Original strand, 39691457 - 39691603
Alignment:
Q  167 aacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaat 266  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||| | ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||  |||||    
T  39691457 aacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcattcaactttactactccactaactgcaattaataagagtattttagtaaat 39691556  T
Q  267 tatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  39691557 gatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 39691603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38188060 - 38187904
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||||||  ||||| ||    
T  38188060 tcaaactaaatgtcattttagaataccaaatcaacatttattaat-ttttccactcatataccattatttattgaatttcacttcacttacatactcgac 38187962  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||| || || | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  38187961 taactacaattaataggggtgttttagtaaattaaactaattttaccattaaagtcaa 38187904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9458445 - 9458271
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  9458445 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatt-ttttccattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactcc 9458347  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||     | || |||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  9458346 actaactacaattaataagggtgtttt-----aatacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattttcttaa 9458271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 312
Target Start/End: Original strand, 25637413 - 25637593
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  25637413 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattattacacccttatttattaaatttcatccaacttaactactc 25637512  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcctta 312  Q
    |  |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  25637513 ctataactacaattaataaaggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcctta 25637593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 36794217 - 36794397
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  36794217 tctcaaaataattatcactttaaaataccaatgcagcatttattattttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 36794316  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||||  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  36794317 actaactacagttaataagggcgttttagtaaaagatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 36794397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43115959 - 43115802
Alignment:
Q  156 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 255  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||| || || |||||| |||||  || ||||  | || |||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  43115959 aatatcaatgtagcatttattatttttttccattattataccattattcgttgaatttcattcaacttaactactccactaactacaataaataagagta 43115860  T
Q  256 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||  |||||  |||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  43115859 ttttagtaaatgctactaactttatcattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 43115802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 45235512 - 45235564
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45235512 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattattttt 45235564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7495019 - 7494909
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatta-ttatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  7495019 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 7494920  T
Q  232 cactaactaca 242  Q
    | |||||||||    
T  7494919 cgctaactaca 7494909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 184
Target Start/End: Original strand, 11366719 - 11366768
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 184  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11366719 tcaaaatatttgtcattttacaatatcaatgcaacatttattattttttt 11366768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 292
Target Start/End: Original strand, 27866527 - 27866583
Alignment:
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27866527 taactacaattaataaggatattttactaaa-gatattaattttatcattaaaatcaa 27866583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Original strand, 16028270 - 16028345
Alignment:
Q  154 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  16028270 agaatattaatgcaacatttataatt-tttttcactattatacatttatttattgaatttcactccacttaactact 16028345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 173
Target Start/End: Original strand, 7491041 - 7491128
Alignment:
Q  86 tactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 173  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||  |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  7491041 tactctcttcatctcattttaattgttacttttgtattttttctatgtctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgaaacattt 7491128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 297
Target Start/End: Original strand, 12872762 - 12872869
Alignment:
Q  190 aatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| || | ||||| |||| ||| |||  | |  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12872762 aatattcctttattaattgaatttcactccatttaattactacattcactacgattaataatgatggtgtagtaaattatattaattttaccattaaaat 12872861  T
Q  290 caattcaa 297  Q
    ||| ||||    
T  12872862 caactcaa 12872869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 186
Target Start/End: Original strand, 25904722 - 25904773
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 186  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25904722 tcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcatcatttattattatttttc 25904773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11742709 - 11742656
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 186  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11742709 tctcaaaataattgtcactttagaatacgaatgaaacatttattattttttttc 11742656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 292
Target Start/End: Original strand, 28186146 - 28186306
Alignment:
Q  132 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||  ||| |||||  |||| ||||| |||   |||||| ||| ||||  | || |||||| |||||    
T  28186146 gtctcaaaataattgtcactttataatataaatgcagtattaattatatttttccactattatttttttatttattgaatttcattcaacttaactactc 28186245  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
      ||||||| ||| | ||||||||||||  ||||| ||  |||||||| |||||| |||||    
T  28186246 tgctaactaaaatgaataaggatattttaataaatgattataattttaccattaatatcaa 28186306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 36004877 - 36004948
Alignment:
Q  123 cttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  36004877 cttttttctgtctcaaaataattttcatttta-aaaagcaatgcaacatttattatatttctgcactaatata 36004948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41221039 - 41220967
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  41221039 acttaactacttcattaactacaattaataaaaatattttaataaatgatactaattttataattgaaatcaa 41220967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 292
Target Start/End: Original strand, 34299908 - 34300087
Alignment:
Q  114 ctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||| ||| |||     
T  34299908 ctttagtttttttcttttgtcttaaaataattgtcactttagaatatcaatacaacatttattattttctttccactaatatatccttatttattgaata 34300007  T
Q  213 ctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    | |  | |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34300008 ccatccaacttaactacttcactaaccacaattaataaggatattttagtaaataatactaattttatcattcaaatcaa 34300087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 302
Target Start/End: Original strand, 181491 - 181658
Alignment:
Q  134 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 233  Q
    |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  181491 ctcaaaataattgtcactttacaata-caatgcaacatttattattatttttcactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 181589  T
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 302  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||    
T  181590 ctaactataattaataatgatgttttagtaaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaat 181658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 29363237 - 29363432
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| || |    
T  29363237 tctcaaaataattgtcacttcagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactaat 29363336  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  29363337 ccgctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataa 29363432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24983628 - 24983450
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||| || ||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| ||| ||||  || | |||||| ||||||    
T  24983628 tctcaaaataattgtcactttagattaccaacgccacatt-attttt-ttatccactaatatacccttatttattgaatttcacccaacttaactactcc 24983531  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24983530 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccattgaaatcaactcaactaatcatttccttaa 24983450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1063791 - 1063591
Alignment:
Q  125 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactta 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||||||||| |||| ||  | |||||| ||| | ||| ||||  | |  |||||    
T  1063791 tttttctgtctcaaaataattgtcattttaaaataccgatgtagcatttattatt-ttttccatcattatacccttacttattaaatttcatttaactta 1063693  T
Q  225 attactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 324  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| |||| |||||    
T  1063692 actactccactaactacaattactcagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaattatacat 1063593  T
Q  325 aa 326  Q
    ||    
T  1063592 aa 1063591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11656128 - 11655947
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | |||||    
T  11656128 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaactttactactc 11656029  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  11656028 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 11655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31894388 - 31894211
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  31894388 tctcaaaataaatgtcattt-acaatatcaatgcaacatttattatt--ttttcactattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactacttc 31894292  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  31894291 actaactacaattaataatgacgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 31894211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Original strand, 7920174 - 7920330
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || | |||| |||| |    
T  7920174 tctcaaaataattatcactttagaatatcaatgcaacatttat--ttatttttcactattataccattatttattgaatttcattcaaattaaatacttc 7920271  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||  |  |||||||| |||| |||||||    
T  7920272 actaactacaattaataa-gatattttagtaaatggttttaattttaccattgaaatcaa 7920330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32440828 - 32440649
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaa--tatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||| |||  |||  |  | |||||| ||||    
T  32440828 tctcaaaataattgtcactttagaaaatatcaatgcagcatttattattattttccattattgtacctttatttattacatttcatccaacttaactact 32440729  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 310  Q
    | ||||| |||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||    
T  32440728 ctactaattacaattaataagggtgttttagtaaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcct 32440649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 30716832 - 30717013
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||| || ||  ||||  ||||| ||| |||| ||  | |||| | |||||    
T  30716832 tctcaaaataattgtcactttagaataccagtgcaacatttattattttttttccattataatactcttatttattgaattttatccaactttactactc 30716931  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||   ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||||    
T  30716932 cactaactacaattaataagggtgtttaagtaaatgatactaattttaccatcaaagtcaataaaattaatcatttccttaa 30717013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Original strand, 5302284 - 5302443
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||| |||| || ||  |||||  |||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  5302284 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattatttttttccattataatacccgtatttattgaacttcatccaacttaactactcc 5302383  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  5302384 attaactacaattaataaggatgttttggtaaattatattaattttaccatcaaaatcaa 5302443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Original strand, 6801863 - 6802023
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||||| ||  || |  |  | |||||| |||||    
T  6801863 tctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattattttttttccattataatacccttatttatcgaacttcatccaacttaactactc 6801962  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  6801963 cactaactacaattaataagggcgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 6802023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Original strand, 13909361 - 13909537
Alignment:
Q  138 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||    
T  13909361 aaataattgtaattttacgatatcaatacaacatttattatttttttctcattattatactcttatttattcaatttcatctaacttaattactccacta 13909460  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  13909461 actacaattaataagggtattttagtaaatgtcactaattttaccattgaaatcaacacatttaatcatttccttaa 13909537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23397844 - 23397753
Alignment:
Q  88 ctccctccatcttattttaactgtc-tctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattat 178  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||  || |||| | | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23397844 ctccctccatctcattttaattgtcatctttacattattttctttttatcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattat 23397753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27367280 - 27367226
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 187  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27367280 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttattattatttttca 27367226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27457627 - 27457573
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 187  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27457627 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttattattatttttca 27457573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3291862 - 3291769
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  3291862 acttaactacttcactaactacaattaataaaggtattttagtaaataatactaatattaccattaaaatcgatacaattaatcatttccttaa 3291769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 289
Target Start/End: Original strand, 15058055 - 15058206
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |||||    
T  15058055 aaaataattgtcactttataataccgatgcaacatttattattttttgt-actattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaatacttcacta 15058153  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||||| |||| ||||    
T  15058154 actacaattaataagggtattttagtaaatgccactaattttaccattgaaat 15058206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11143767 - 11143609
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    |||||||| |||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| |||| |    
T  11143767 tctcaaaaaaattgtcactttagactaccaatgcagcatttattatt-tttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactacttc 11143669  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11143668 actaactataattaataagggtgatttagtaaatgatactaattttatcatcaaaatcaa 11143609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12307783 - 12307729
Alignment:
Q  125 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12307783 tttttatgtctcaaaataattgtcactttaaaatattaatacaacatttattatt 12307729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13207274 - 13207220
Alignment:
Q  132 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 186  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13207274 gtctcataataattgtcactttagactaccaatgcaacatttattattatttttc 13207220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21425738 - 21425688
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21425738 tcaaaataattgttactttacaatatcaatgcaacatttattattattttt 21425688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 13087550 - 13087622
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  13087550 acttaattacttcactaactataattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 13087622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21478276 - 21478224
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21478276 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatacaacatttattattattttt 21478224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 195
Target Start/End: Original strand, 8694989 - 8695040
Alignment:
Q  144 ttgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 195  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8694989 ttgtcattacatattatcaatgcaacatttattattattttccactagtata 8695040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 279
Target Start/End: Original strand, 17828960 - 17829019
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaatttta 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  17828960 acttaattacttcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaatttta 17829019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 179
Target Start/End: Original strand, 15582222 - 15582264
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15582222 aaaataattgtcattttagaatatcaatgcaataattattatt 15582264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 175
Target Start/End: Original strand, 23142601 - 23142643
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttat 175  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  23142601 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttat 23142643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 313
Target Start/End: Original strand, 39864045 - 39864224
Alignment:
Q  134 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 233  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  39864045 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 39864144  T
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  39864145 ctaactacaattaataagagtattttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 39864224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 31042730 - 31042910
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| ||| ||||  | || ||||||||||| |    
T  31042730 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatacatcatttattatttttttccactatgatatctttatttattgaatttcattcaacttaattacttc 31042829  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  31042830 actacctacaattaataagggtattacagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 31042910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 37506057 - 37506240
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  37506057 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatttttttccattataatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactcc 37506156  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaatta---tactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| |||   | ||||  ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  37506157 actaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatagtactaattttatcatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 37506240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 313
Target Start/End: Original strand, 12038991 - 12039195
Alignment:
Q  109 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaattt 208  Q
    |||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||     
T  12038991 tgtctctttagtatttttttattttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattattttccactattatacccttatttattg 12039090  T
Q  209 aattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 308  Q
    ||||  |  | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||  | | ||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||    
T  12039091 aattacatccaacttaaatactccattaactacaattaataagagtgtattagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttc 12039190  T
Q  309 cttaa 313  Q
    |||||    
T  12039191 cttaa 12039195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 49224171 - 49224012
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  49224171 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattattttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 49224072  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  49224071 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 49224012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 313
Target Start/End: Original strand, 27896886 - 27897068
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    |||||| ||||| || ||| || |||||||| || ||  || ||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||  |  | ||| |||||||    
T  27896886 tgtctccaaatatttatcactttagaatatctattcagtatatattatttttttcgactattatacctttatttattaaatttcatccaactaaattact 27896985  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||    
T  27896986 ccactaactataattaataagaatattttgataaattatactaattttatcattaaaatcaacacgtttaattatttccttaa 27897068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41122017 - 41121833
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||| ||  | | ||       
T  41122017 ttttttttttctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatacaacatttattattttttttcattattatacccttat-aattta-ttaaatttcatca 41121920  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 310  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||    
T  41121919 aactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaattatgctaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcct 41121833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 326
Target Start/End: Original strand, 9379156 - 9379358
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccact 222  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||| |||| ||| ||||  |    |||    
T  9379156 ttttttctttcttaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaatatttatt--tatttttccattattatacctatatttattaaatttcatcaaact 9379253  T
Q  223 taattactcc-actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgta 321  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| ||||||     
T  9379254 taactactcccactaactacaattaataaatatattttaataaatgatattaattttatcattaaaatcattacaattaatcatttctttaaaaattgtg 9379353  T
Q  322 cataa 326  Q
    |||||    
T  9379354 cataa 9379358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 246
Target Start/End: Original strand, 37177769 - 37177882
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||  | |||||| ||||      
T  37177769 tctcaaaataattgtcattttagaatgtcaatgtaacacttattattatttttcactattatactcttatttatttaattttatccaacttaactactat 37177868  T
Q  233 actaactacaatta 246  Q
    ||||||||| ||||    
T  37177869 actaactaccatta 37177882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Original strand, 7351572 - 7351728
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||  |||||| || |||||  ||||| ||| |||| |   | ||||||||| |||    
T  7351572 tctcaaaataattgtcattttagaatactaatgcaac-tttatcatt--ttttcattattatactcttatttattgaattttgtccaacttaattattcc 7351668  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7351669 actaactagaattaataaggttattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaa 7351728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20210025 - 20209866
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  20210025 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 20209926  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  20209925 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaa 20209866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40145030 - 40144803
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| |||||||     
T  40145030 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccat 40144931  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataactctataa 334  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| || ||| ||| | |||  ||    
T  40144930 taactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataactgtgcatcaatcttgaa 40144831  T
Q  335 caactattagtttgagatggtgggagta 362  Q
    | ||||||| || ||||| | |||||||    
T  40144830 cgactattatttagagattgagggagta 40144803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 259
Target Start/End: Original strand, 52429279 - 52429403
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcac--taatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||| ||||| | | ||||  | || |||||| ||||||||    
T  52429279 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattattttttttctcattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactactccac 52429378  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttt 259  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  52429379 taactacaattaataagggtatttt 52429403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6160637 - 6160454
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         | || || |||||| || || ||| ||||  | || |||||| || |    
T  6160637 tgtctcaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaacattta---------tgcattattatacccttgtttattgaattacattcaacttaactatt 6160547  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 323  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| |||||    
T  6160546 ccattaactacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaatcgtaca 6160454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 307
Target Start/End: Original strand, 7759150 - 7759322
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||||||| || | ||||  |||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| || |||||    
T  7759150 tcaaaataattgtcactttacaataataatgcatcatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactattccac 7759249  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||| |||||| | |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  7759250 taactacaattaataagagtattttagtaaatgatattaatttcaccattgaaatcaacacaattaattattt 7759322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6268438 - 6268375
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 187  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6268438 ttttttctgtctccaaataattgtcattttagaatatcaatgtaacatttattaatatttttca 6268375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Original strand, 35367735 - 35367854
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  35367735 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgaaacatttattagtctttttcactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 35367834  T
Q  233 actaactacaattattaagg 252  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  35367835 actaactacaattaataagg 35367854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Original strand, 6785189 - 6785315
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  6785189 tctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 6785288  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttt 259  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||    
T  6785289 actaactacaattaatgaagatatttt 6785315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23169185 - 23168998
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  ||  |||||    
T  23169185 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttatta--cttttccactattatactcttatttattgaatttcacctcactt 23169088  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    || || |  |||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  23169087 aactatttaactaactataattaataaggatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattttcttaa 23168998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 26093414 - 26093507
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  26093414 acttaattacttcactaactacaattaataaggatattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 26093507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Original strand, 9307564 - 9307740
Alignment:
Q  138 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||||    
T  9307564 aaataattgtcattttacgatatcaatgtagtatttattatttttttcccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactactccacta 9307663  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||  |||| | ||||  |||||  || ||||||||||||| |||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  9307664 actacaattaacaagggtgttttagtaaatgctattaattttatcattgaaatcaacacagttaatcatttccttaa 9307740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8896497 - 8896358
Alignment:
Q  154 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaat-atacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaagg 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | || ||||||||||| ||| ||||  |  | ||||||  ||||||||||||||||||| |||      
T  8896497 agaatatcaatgcaacatttattatttttttcccatgattatacctttatttattgaatttcatccaacttaaccactccactaactacaattaataaat 8896398  T
Q  253 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  8896397 atattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 8896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24991863 - 24991725
Alignment:
Q  109 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatt 207  Q
    |||||||||||  | ||||||   ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||    
T  24991863 tgtctctttagcattttttttccttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatttttttcccactattatacctttatttatt 24991764  T
Q  208 taattctactccacttaattactccactaactacaatta 246  Q
     ||||  |  | |||||| || |||||||||||||||||    
T  24991763 gaatttcatccaacttaactattccactaactacaatta 24991725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16395230 - 16395039
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||| ||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  16395230 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgtaggatttattatt-tttttcattattatatcattatttattgaatttcatctaacttaactactcc 16395132  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  16395131 actaactacaattaaaaagg-tattttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 16395039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22856399 - 22856275
Alignment:
Q  156 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaaggat 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22856399 aatatcaattcaacatttattatttttttgcactattatacttttatttattgaatt-tcatccagcttaactactccactaactacaattaattagggt 22856301  T
Q  255 atttttctaaattatactaattttat 280  Q
    |||||  |||||  || |||||||||    
T  22856300 attttagtaaatggtattaattttat 22856275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 292
Target Start/End: Original strand, 12151123 - 12151268
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||             ||||| || | |||||| | ||||||    
T  12151123 tcaaaataattgtcactttataatatcaatgcagcatttattattatttttcattattatag------------aattccacccaacttaactgctccac 12151210  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||| | |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12151211 taactacaattaattacaatattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaa 12151268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13579801 - 13579626
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||||||| || | |||| | |||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||||||    
T  13579801 aaaataattgtcactttaaaataccgatgcaatatttattattattttt-attattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaaatactccacta 13579703  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| || || | ||||| ||||| ||| |||| || |||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  13579702 actacaattaatatgggtgtttttgtaaatgatattaatattgtcatcaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 13579626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17988931 - 17988867
Alignment:
Q  132 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 196  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  17988931 gtctcaaaataattgtcattttaaaatattaatgcaacatttattatttctttccactattatac 17988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33733447 - 33733268
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || || |||  ||||     
T  33733447 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcatttattattcttttccattattatacccttatttattgaatttcattctacctaaccactct 33733348  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||  |||||  || |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  33733347 actaactacaattaataaaagtattttagtaaatgttaataattttaccattgaaatcaacacaa-taatcatttccttaa 33733268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 240
Target Start/End: Original strand, 4659710 - 4659816
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||| | ||||| ||| ||||  | || |||||||||||||    
T  4659710 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacattatttatt-ttttccactattatatccttatttattgaatttcattcaacttaattactcc 4659808  T
Q  233 actaacta 240  Q
    ||||||||    
T  4659809 actaacta 4659816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35682978 - 35682900
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  35682978 tctcaaaataattgccaatttagaatatcaatgcaatatttattatt-ttttccactattatacccttatttattgaatt 35682900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 179
Target Start/End: Original strand, 37238951 - 37239006
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  37238951 ttttttctgtctcaaaataattgtcattttaaaatattaatgcagcatttattatt 37239006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 978952 - 978854
Alignment:
Q  223 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgta 321  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||| | ||  ||||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  978952 taattgctccactaactactattaataaggatatttcattaaatgaaacacattttatcattgaaatcaacacaactaatcattttcttaagaattgta 978854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26252646 - 26252565
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta--ttattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  26252646 tctcaaaataattgtcattttacaatttcaaagcaacatttattttattttttttcattaatatacccttatttattgaatt 26252565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 38787271 - 38787467
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt---cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattac 229  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||||| ||||||| || |||||   || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | | |||| |||    
T  38787271 tctcaaaataattgtcactttagaaaagcaatgcaaaatttattttttttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaatttaactac 38787370  T
Q  230 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||| |||||| ||||| ||| ||||||||  |||  ||| |||||||||| ||| || |||||    
T  38787371 tccactaactataattaataaggatgttttggcaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcataa 38787467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44426838 - 44426746
Alignment:
Q  218 ccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatacta---attttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||||| ||||||   |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44426838 ccacttaattgctccactaattacaattaataaagatgttttagtaaatgatactacaaattttaccattgaaatcaactcaactaattattt 44426746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44761710 - 44761560
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||  || ||||| ||    | |||||| ||||| ||| ||||  | || ||||||  | |||||    
T  44761710 tcaaaataattgtcactttagaatattaacgcaacattattttttattatt----attatacccttatttattgaatttcattcaacttaaccattccac 44761615  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44761614 taactataattaataaagatattttagtaaatgatattaattttatcattaaaat 44761560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 15699142 - 15699214
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  15699142 acttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 15699214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21910193 - 21910141
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21910193 tctcagaataattgtcactttaaaatatcaatgccacatttattattattttt 21910141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44707917 - 44707785
Alignment:
Q  161 caatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatattttt 260  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| | || ||||||||||||||| |||   | ||||     
T  44707917 caatgcaatatttattatttgtttccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactgcttcactaactacaattaataaatgtgtttta 44707818  T
Q  261 ctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 293  Q
     |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  44707817 gtaaatactactaattttatcattgaaatcaat 44707785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Original strand, 3312056 - 3312115
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 196  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3312056 aaaataattgtcactttataatatcaatacaacatttattattatattccactattatac 3312115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 326
Target Start/End: Original strand, 35538678 - 35538769
Alignment:
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||   ||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  35538678 taactacaattaataaggatattttagtaaataatatccattttatcattgaaatcaacacaattaataattttcttaaaaattgtaaataa 35538769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 313
Target Start/End: Original strand, 36701951 - 36702034
Alignment:
Q  230 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  36701951 tccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacataattaatcatttccttaa 36702034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 313
Target Start/End: Original strand, 36718055 - 36718138
Alignment:
Q  230 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  36718055 tccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacataattaatcatttccttaa 36718138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 323
Target Start/End: Original strand, 37177913 - 37177968
Alignment:
Q  268 atactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  37177913 atactaattttatcattaaaatcaatgcaattaattgttttcttaaaaatcgtaca 37177968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43500925 - 43500874
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 184  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43500925 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattattatttt 43500874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2137562 - 2137441
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||  ||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||| |||| ||  | ||||    
T  2137562 ttttttttctcttaaaataattaacatattagaatatttatgcaacatttattatt-tttttcattattatatctttatttattgaattttatccaactt 2137464  T
Q  224 aattactccactaactacaatta 246  Q
    || ||||||| |||| |||||||    
T  2137463 aaatactccaataacaacaatta 2137441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Original strand, 31879177 - 31879281
Alignment:
Q  139 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 238  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||   ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  31879177 aataattgtcattttgaaatatcaatgcaatattt-ttatt-tttttcattaatatattattatttattgaattttactccacgttattactcctctaac 31879274  T
Q  239 tacaatt 245  Q
    || ||||    
T  31879275 tataatt 31879281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 173
Target Start/End: Original strand, 37275536 - 37275574
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 173  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37275536 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacattt 37275574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44426938 - 44426840
Alignment:
Q  86 tactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 184  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||    |||| | ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  44426938 tactccctccgtctcatttttattgtcactttagcactttttctctgtctcaaaattattgtcactttagaatataaatacaacatttattattttttt 44426840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 292
Target Start/End: Original strand, 3312138 - 3312203
Alignment:
Q  227 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3312138 tactccactaactacaattaatatcaatattatagtaaatgatactaatttaatcattaaaatcaa 3312203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Original strand, 15699073 - 15699114
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta 174  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  15699073 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcattta 15699114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 917044 - 917116
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  917044 acttaactaatctactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaatcaa 917116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 259
Target Start/End: Original strand, 15904770 - 15904810
Alignment:
Q  219 cacttaattactccactaactacaattattaaggatatttt 259  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15904770 cacttaactacttcactaactacaattaataaggatatttt 15904810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29778481 - 29778425
Alignment:
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  29778481 actaactacaattaataatgatattttagtaaatgatactaattttaccattgaaat 29778425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Original strand, 37276491 - 37276587
Alignment:
Q  230 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  37276491 tccactaactacaattaataagggtgttttagtaaacgatactaattttaccatcaaaatcaacacagttaatcatttccttaataatcgtgcataa 37276587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39395285 - 39395249
Alignment:
Q  160 tcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 196  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39395285 tcaatacaacatttattattctttttcactaatatac 39395249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 759280 - 759087
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  759280 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 759181  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  759180 gctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataa 759087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 34947440 - 34947620
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  34947440 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatttttttccattattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactcc 34947539  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  34947540 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgataataattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 34947620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 7463152 - 7463333
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaa-tgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    |||||||||||| |||| || | |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  7463152 tctcaaaataatcgtcactttacaataacaaatgcatcatttattattatttttcactattctatctttatttattgaatttcatccaacttaactactc 7463251  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  7463252 cactaactacaattaatgagggtatttaagtaaatgctactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 7463333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 9785928 - 9786108
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||| |    
T  9785928 tctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagcatttattattatttttctttattatacccttatttattgaattttatccaacttaactacttc 9786027  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| | | |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  9786028 actaactacaattaataagcgtgttttagtaaatgaaattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 9786108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24516478 - 24516319
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  ||||| | || ||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  24516478 tctcgaaataattgtcattttacaatatcaatgcaacatttattatcttttcccactattttatctttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 24516379  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  24516378 actaactacaattaataaggtttttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaa 24516319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 83324 - 83518
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaat-atacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | || ||||  ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||    
T  83324 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattatcatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 83423  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    | ||||||||||||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  83424 cgctaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataa 83518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23745521 - 23745399
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattat-tatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||    
T  23745521 tctcaaaataattgttattttagaatattaatgcaacatttattatatttttttcactaatatacacttatttattgaattatattccacttaactactc 23745422  T
Q  232 cactaactacaattattaaggat 254  Q
     |  || |||||||| |||||||    
T  23745421 taagaagtacaattaataaggat 23745399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 259
Target Start/End: Original strand, 38032668 - 38032804
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata---cctttattaatttaattctactcca 220  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||   || ||||| ||||||||  ||||||    
T  38032668 ttttctatgtctcaaaataactgtcattttaaaatatcattgcaaaatttattat--tttttcattaatatataccccttatttatttaattgcactcca 38032765  T
Q  221 cttaattactccactaactacaattattaaggatatttt 259  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38032766 cttaactaatacactaactacaattaataagaatatttt 38032804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21760173 - 21759993
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |  || |||||| | | | ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  21760173 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatatttttcctttattataccctcaattattgaatttcatccaacttaactactcc 21760074  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    | |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  21760073 attaactacaattagtaagggtgttttattaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 21759993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28202498 - 28202318
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||| |||| || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  28202498 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatacagcatttattatttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaactttactactcc 28202399  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| | | |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  28202398 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgacattaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattttcttaa 28202318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41506253 - 41506061
Alignment:
Q  134 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 233  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  41506253 ctcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaatatttattaatttttttcaatattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 41506154  T
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  41506153 ctaactacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 41506061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17610736 - 17610561
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||  | |||| |||||||||| |  |||| ||| ||||  |||| | ||    
T  17610736 ttttttatgtcttcaaataactgtgactttagaatatcaatataacatttatttattttttccactaatatatccctatttattgaatttcactctaatt 17610637  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaact 299  Q
    || || | |||||| || ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17610636 aactatttcactaattaaaattaataagaatattttaataaattatactaattttaccattaaaatcaactcaact 17610561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 326
Target Start/End: Original strand, 21390210 - 21390428
Alignment:
Q  109 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatt 207  Q
    |||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| |||    
T  21390210 tgtctctttagcatcttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacgtttattattttttttccattattatacccttatttatt 21390309  T
Q  208 taattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
     ||||  |    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||| || ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| ||||    
T  21390310 gaatttcatctaacttaactactccactaactacaatcaataaggatgttttagtaaatgatattagttttaccatcaaaattaacacaattaatcattt 21390409  T
Q  308 ccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||| ||| || |||||    
T  21390410 ccttaataatcgtgcataa 21390428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 2459413 - 2459530
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    |||||||||||| || || | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  2459413 tcaaaataattgacactttacaataccaatgcagcatttattattttttttcactattatacccttatttattgaatttcatcctacttaactactccac 2459512  T
Q  235 taactacaattattaagg 252  Q
    |||||||||||| |||||    
T  2459513 taactacaattaataagg 2459530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 13961986 - 13962079
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  13961986 acttaactactccactaactacacttaataaggatattttattaagtgatattaattttatcattaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 13962079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11373617 - 11373437
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  11373617 tctcaaaataattgttactttacaatatcaatgcagcatttattattttttcccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 11373518  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||  |||||||  ||| |||  ||||||||||    
T  11373517 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccatcgaaatcaacacaattaaacatttccttaa 11373437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21350815 - 21350695
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  21350815 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 21350716  T
Q  232 cactaactacaattattaagg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  21350715 cactaactacaattaataagg 21350695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32346241 - 32346061
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||  |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  32346241 tctcaaaataattatcattttagaatactaatgcagcatttattatctttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactcc 32346142  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||||  || || ||| |||||||| |||| |||||||  |||  ||||||||||||||    
T  32346141 actaattataattaataagagtattttagtagatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaattatttccttaa 32346061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 324
Target Start/End: Original strand, 33819154 - 33819345
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattat--ttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| | | ||||  | || |||| | ||||||    
T  33819154 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattattattttcactattatacccttatttaatgaatttcattcaacttcactactcc 33819253  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 324  Q
    || ||| ||||||| ||||  |  |||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  33819254 acaaacaacaattaataagagtgattttgtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtacat 33819345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 43873863 - 43874043
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||  |||| |||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  43873863 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattttttcccattataatacatttatttattaaacttcatccaacttaactactcc 43873962  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  43873963 actaactacatttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 43874043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 272
Target Start/End: Original strand, 25571360 - 25571498
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || |||    
T  25571360 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-tttttaattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattcc 25571458  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 272  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||| |||||    
T  25571459 actaactacaactaataagggtattttagtaaatgatact 25571498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21937970 - 21937796
Alignment:
Q  139 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 238  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| |    |||||||| ||| || || ||| ||||| ||  || |||| ||||||||||||    
T  21937970 aataattgtcaatttagaatgccaatgcagcatttattattttcccccactaatacacccttgtttattaaattccacctcaattaactactccactaac 21937871  T
Q  239 tacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||| ||||  |  |||  ||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  21937870 tacaattaataagagtgctttagtaaatgacactaattttatcattaaaataaagttaactaatcatttccttaa 21937796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 290
Target Start/End: Original strand, 22738665 - 22738798
Alignment:
Q  156 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 255  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| || || |||||||||||||| | ||||||    
T  22738665 aataccaatggaacatttattatt-ttttccactattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactaatctactaactacaattaatgaggata 22738763  T
Q  256 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 290  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22738764 ttttagtaaatgatactaattttaccattgaaatc 22738798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34100732 - 34100556
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| |||   |  | |||||| |||| || ||    
T  34100732 aaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatgttttttcactattatacccttatttattgaatgtcatccaacttaactacttcagta 34100633  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  34100632 actacaattaataaagatattttagtaaatgctactaattttactattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 34100556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 37245621 - 37245709
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  37245621 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattttttctcactattatacccttatttattgaatt 37245709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 308
Target Start/End: Original strand, 39005448 - 39005536
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 308  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  39005448 acttaattaatctactaactacaattattaaaggtattttagtaaatgatactaattttaccattttaatcaactcaactaataatttc 39005536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6495122 - 6494964
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  6495122 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtagcatttatt-ttttttttcattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactcc 6495024  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||| |||   | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  6495023 actaactacaattaataaaagtgttttagtaaataacactaattttaccatcaaaatcaa 6494964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 302
Target Start/End: Original strand, 10042223 - 10042389
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| ||| | ||||| |  |||||| |||||||     
T  10042223 tcaaaataatcttcattttagaatatcaatgcatcgtttattattttttctcactgatatactcttatttattgagttctattttacttaactactccaa 10042322  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 302  Q
    ||| || ||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| |||| || |||||| |||| |||||||    
T  10042323 taattataattaataagaatattttaataaatgatattaagtttacca-taaaataaatttaactaat 10042389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32769914 - 32769725
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||   ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| | | ||||  | | || ||    
T  32769914 ttttttctgtctcagaataattgtcattctaaaatatcaatgttgcatttattattcttttccactaacataccattattcaatgaatttcatttcattt 32769815  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt-aaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    || |||||||  ||||||||||| |||| ||  |||  ||||||||||| |||| | |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  32769814 aactactccatcaactacaattaataagaat-gtttagtaaattatacttatttaaccattaaaaatcaatctaactaatcatttccttaa 32769725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 252
Target Start/End: Original strand, 36790678 - 36790799
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | || ||| ||||    
T  36790678 tctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcagcatttattattattttttccattattatacccttatttattgaatttcatccgacataactact 36790777  T
Q  231 ccactaactacaattattaagg 252  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  36790778 caactaactacaattaataagg 36790799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 38391692 - 38391881
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||     |||||||||| ||||| || || ||||| |||||| ||| ||||  |  | ||||||||| ||    
T  38391692 tctcaaaataattgtcactttataatatcaat-----atttattatttttttttcattattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattattc 38391786  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||||||||||  |||  | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  38391787 cactaactacaattaacaagagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataa 38391881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7457607 - 7457451
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  | |  ||||||||| ||| |    
T  7457607 tcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaacatttattatt-ttttccactattatactcttatttattgaatttaatttaacttaattattccgc 7457509  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  7457508 taactacatttaataagggtcttttagtaaatgtaactaattttaccattgaaatcaa 7457451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 246
Target Start/End: Original strand, 16904316 - 16904432
Alignment:
Q  132 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattac 229  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||     
T  16904316 gtctcaaaataattgtctttttagaatatcaatgtagtatttattattattttttccactattatacccttatttattgaatttgatccaacttaattat 16904415  T
Q  230 tccactaactacaatta 246  Q
    | ||||||||| |||||    
T  16904416 ttcactaactataatta 16904432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 252
Target Start/End: Original strand, 44424075 - 44424203
Alignment:
Q  123 cttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccact 222  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||    
T  44424075 cttttttttttctcaaaataattatcactttaaaatatcaatgcagcatttattatt-tttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaact 44424173  T
Q  223 taattactccactaactacaattattaagg 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44424174 taattactccactaactacatttaataagg 44424203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8592629 - 8592449
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||  ||||| ||| ||||  |    |||| | ||||||    
T  8592629 tctcaaaataattttcattttacaatatcaatgcagcatttattattttttcctactattatactcttatttattaaatttcatctaactttactactcc 8592530  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||| | |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8592529 actaactacaattaataagggtgttttattaaatactactaatttaaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8592449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 313
Target Start/End: Original strand, 12631345 - 12631425
Alignment:
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12631345 actaactacaattaataaggatgttttgataaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaattatttccttaa 12631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 184
Target Start/End: Original strand, 27920926 - 27920977
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 184  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27920926 tctcaaaataattgtcactttagaatattaatgcaacatttattattttttt 27920977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31930691 - 31930640
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 184  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31930691 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgaaacatttattattttttt 31930640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36425228 - 36425106
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatt-taattctactccact 222  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||| ||| || ||| ||| |||     
T  36425228 ttttttatttctaaaaataattgtcatttcaaaatattaatttaacatttattatt-ttttgcaataatgtacccttatttattatacttcaacttcacg 36425130  T
Q  223 taattactccactaactacaatta 246  Q
    ||| || | |||||||||||||||    
T  36425129 taactatttcactaactacaatta 36425106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16560672 - 16560566
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 319  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  16560672 acttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttccttaataatcg 16560573  T
Q  320 tacataa 326  Q
    | |||||    
T  16560572 tgcataa 16560566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Original strand, 16604990 - 16605096
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 319  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  16604990 acttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttccttaataatcg 16605089  T
Q  320 tacataa 326  Q
    | |||||    
T  16605090 tgcataa 16605096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19271921 - 19271809
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcc-acttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||| | |||||| |  ||| |||||| |||||    
T  19271921 tctcaaaataattgttactttacaataccaatgcaacatttattatt-ttttccaatattatacccttattta-ttaattttcatccaacttaactactc 19271824  T
Q  232 cactaactacaatta 246  Q
    |||||||||||||||    
T  19271823 cactaactacaatta 19271809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37850914 - 37850864
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattt 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  37850914 tctcaaaataattgtcattttagaatattaattcatcatttattattattt 37850864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17828533 - 17828381
Alignment:
Q  140 ataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 238  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||| ||||| || || |||| | ||||| ||| |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  17828533 ataattgtcattttcgaataccaatgttgcatttattatttttttttcattattatatcattatttattgaattcatc-caacttaattactccactaac 17828435  T
Q  239 tacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||  ||||  || |||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  17828434 tacaattgataagagtaattttgtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 17828381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 173
Target Start/End: Original strand, 49101602 - 49101651
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 173  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49101602 ttttttttgtcttaaactaattgtcattttagaatatcaatgcaacattt 49101651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Original strand, 37490338 - 37490422
Alignment:
Q  156 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaacta 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||| ||||  | || | |||||||||||||||||||    
T  37490338 aataccaatgcaacatttattattattttttactagtatgctcttatttattgaatttcattcaatttaattactccactaacta 37490422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40614701 - 40614658
Alignment:
Q  264 aattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40614701 aattatattaattttatcattgaaatcaattcaattaattattt 40614658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3178391 - 3178234
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacat--ttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 234  Q
    ||||||||||| | || ||||||  ||||||||||  |||||||  |||  || ||||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  3178391 aaaataattgttactttagaatactaatgcaacatatttattatgttttcccattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccac 3178292  T
Q  235 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  3178291 taactacaattaataaaggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 3178234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30546540 - 30546499
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30546540 tgtctcaaaataattgtcattt-ggaatatcaatgcaacattt 30546499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 179
Target Start/End: Original strand, 42935598 - 42935644
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 179  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||    
T  42935598 tctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattatt 42935644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 313
Target Start/End: Original strand, 48608760 - 48608982
Alignment:
Q  86 tactccctccatcttattttaactgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||   |||||| | | ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||  |||||||||| ||||     
T  48608760 tactccctccgtctcataataactgtctctttaccatcttttctttttctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagtatttattatt-ttttc 48608858  T
Q  186 cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatta 285  Q
    || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||  |||||||||| |||| ||||||| ||||    | | |||||| ||||| ||| |    
T  48608859 cattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactacatcactaactacgattaataaggatgtttt----agtaatactagttttaccatca 48608954  T
Q  286 aaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  48608955 aaatcaacacaattaatcatttccttaa 48608982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 307
Target Start/End: Original strand, 6855254 - 6855299
Alignment:
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6855254 taaataatactaattttaccattaaaataaattcaactaatcattt 6855299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17609390 - 17609349
Alignment:
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609390 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17609633 - 17609592
Alignment:
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609633 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17609876 - 17609835
Alignment:
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609876 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17610119 - 17610078
Alignment:
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17610119 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17610078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17610362 - 17610321
Alignment:
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17610362 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17610321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31930592 - 31930527
Alignment:
Q  227 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  31930592 tactccactaactacaattaataagggtattttaaaaaattagattagttttaccattaaaatcaa 31930527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 27921015 - 27921087
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27921015 acttaactaatgcactaactacaattaataagagtgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaa 27921087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 35333070 - 35333142
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  35333070 acttaactactccactaactacaattaataataatattttaataaataatattaattatataattgaaatcaa 35333142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41499137 - 41499069
Alignment:
Q  234 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 302  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41499137 ctaactgctattaataaggatattttcgtaaataaaactcattttatcattaaaatcaacacaactaat 41499069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 313
Target Start/End: Original strand, 42935697 - 42935781
Alignment:
Q  229 ctccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  42935697 ctccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 42935781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30190842 - 30190664
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||| ||| || || | |||| ||||||||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  30190842 tctcaaaataattgtcactttagaataaaaatgtaacatttattattaatttccattattttacccttattaattgaatttcatccaacttaactactcc 30190743  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcctt 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||    
T  30190742 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcctt 30190664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43254070 - 43253865
Alignment:
Q  109 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatt 207  Q
    |||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| | |    
T  43254070 tgtctctttagcattttttctatttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattagtttttttccactattatacccttatttaat 43253971  T
Q  208 taattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 307  Q
     ||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||    
T  43253970 gaatttcatcccacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattt 43253871  T
Q  308 ccttaa 313  Q
    ||||||    
T  43253870 ccttaa 43253865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 44301494 - 44301675
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  44301494 tctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattaatatttttccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactc 44301593  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||   || ||| |||||||||||    
T  44301594 cactaattacaattgataagggtattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataattaaatatttccttaa 44301675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 19822944 - 19823124
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtca-tttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || ||    
T  19822944 tctcaaaataattgtcacttttagaataccaatgcagcatttattatt-tttttcattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattc 19823042  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||||| || ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  19823043 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattctaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 19823124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 313
Target Start/End: Original strand, 30711005 - 30711186
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| ||| ||||  |    |||||||| ||    
T  30711005 tgtctcaacataattgtcattttagaatatcaatacaacatttattatt-tttttcactattataatcttatttattgaatttcatctaacttaattgct 30711103  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||| |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||    
T  30711104 ccattaactacaattaataatggtgttttagtaaatgatattaattttatcattaaaatcaacataattaattatttctttaa 30711186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12736761 - 12736574
Alignment:
Q  125 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactta 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |  |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| ||  | | |||    
T  12736761 tttttctgtctcaaaataattgtcactttagaatgtcaatctagtatttattattgtttt-cactattatacccttatttattgaattttatccaaatta 12736663  T
Q  225 attactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  12736662 actactacactaagtacaattaataagggtattgtagtaaatgatactaattttatcattagaatcaacacaattaatcatttccttaa 12736574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36460598 - 36460452
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||||||    
T  36460598 tctcaaaataattgtcactttacgatatcaatgcaatatttattatttgtttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactcc 36460499  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaatttta 279  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||||    
T  36460498 attaactacaattaataagaatattttaataaatgttactaatttta 36460452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 326
Target Start/End: Original strand, 37311886 - 37312076
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 235  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  ||||| ||| ||||  | |  | |||| |||||||||    
T  37311886 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcagcatttattattatttttctattattatactcttatttattgaatttcattaaatttaactactccact 37311985  T
Q  236 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  37311986 aactacaattaataagggttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 37312076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Original strand, 30710578 - 30710634
Alignment:
Q  129 tatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30710578 tatgtctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttt 30710634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39043932 - 39043799
Alignment:
Q  138 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 237  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||||||||||    
T  39043932 aaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattat--tttttcattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaa 39043835  T
Q  238 ctacaattattaaggatatttttctaaattatacta 273  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  ||||| ||||||    
T  39043834 ctacaattaataaaggtattttagtaaatgatacta 39043799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 326
Target Start/End: Original strand, 37497415 - 37497618
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatta-tttttcactaatatacctttattaatttaattctactccact 222  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||    
T  37497415 ttttttttctctcaaaataattgtcactttataataccaatacaacatttattattattttttcattattatacgtttatttattgaatttcatccaact 37497514  T
Q  223 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtac 322  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  || | | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||  ||| |||||||||| ||| || |    
T  37497515 taactactccactaactacagttaacaacggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaataaatcatttccttaataatcgtgc 37497614  T
Q  323 ataa 326  Q
    ||||    
T  37497615 ataa 37497618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 326
Target Start/End: Original strand, 11905760 - 11905948
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||| ||| ||||  |  | ||||||  |||||| ||    
T  11905760 aaaataatttttattttagaatatcaatgcaacatttattatt-ttttccattattatatctttatttattgaatttcatccaacttaacaactccatta 11905858  T
Q  237 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||||| ||||| |  |||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  11905859 actacaattaataagggtgctttagtaaatgatactaattttatcatcaaaattaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 11905948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37695837 - 37695668
Alignment:
Q  145 tgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaa 243  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||||||||||||||    
T  37695837 tgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaa 37695738  T
Q  244 ttattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  37695737 ttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 37695668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 51838142 - 51837961
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || | |||   |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | | ||||  | || || ||| |||||    
T  51838142 tctcaaaataattgtcactttacaattataatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttaatgaatttcattcaacgtaactactc 51838043  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  51838042 cactagctacaactaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttacttaa 51837961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3901331 - 3901148
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||| | |   ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||| ||    
T  3901331 tctcaaaataattgttactcttgaataccaatgtaacatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaagtacccc 3901232  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaa 316  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  3901231 actaactacaactaataagaatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaatacaattaatcattttcttaacaa 3901148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10366831 - 10366718
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  10366831 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttc 10366732  T
Q  233 actaactacaatta 246  Q
    ||||||||||||||    
T  10366731 actaactacaatta 10366718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 292
Target Start/End: Original strand, 12904796 - 12904957
Alignment:
Q  132 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    |||||||||||||||| | || | ||||  |||| | | |||||| || |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||||||    
T  12904796 gtctcaaaataattgttaatttataatactaatggagcttttattttttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactc 12904895  T
Q  232 cactaactacaatt-attaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12904896 cactaactacaattaataaaagatattttgataaatcatactaattttataattgaaatcaa 12904957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8679206 - 8679043
Alignment:
Q  162 aatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttc 261  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||      
T  8679206 aatgcatcatttattatt-ttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattaattcactaactataattaataaggatcttttag 8679108  T
Q  262 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  8679107 taaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 8679043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Original strand, 36476517 - 36476697
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| | ||||  | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||     
T  36476517 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattacttttttctattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactct 36476616  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||  |||  |||||||| |||||    
T  36476617 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgcaatcaacacaatcaattattttcttaa 36476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 179
Target Start/End: Original strand, 33458973 - 33459028
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33458973 ttttttttgtctcaaaataattgtcattttagattatcaatacaacatttattatt 33459028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37773148 - 37772966
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta--ttattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||  ||||| |||| || || |||||| ||||| | | ||||  | || |||||| || |    
T  37773148 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattttatttttttccattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactatt 37773049  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  37773048 ccactgactataattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgtaatcaatacaattaatcatttccttaa 37772966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24569195 - 24569089
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| |    
T  24569195 acttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcg 24569096  T
Q  320 tacataa 326  Q
    | |||||    
T  24569095 tgcataa 24569089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 292
Target Start/End: Original strand, 34750518 - 34750588
Alignment:
Q  222 ttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34750518 ttaactactccaccaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccattaaaatcaa 34750588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 313
Target Start/End: Original strand, 38795275 - 38795457
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||  | ||||||| ||||| ||| || || || ||| ||||  |  | ||||||  |||    
T  38795275 tgtctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaatattttattttattttccactattatgcccttttttattaaatttcatccaacttaacaact 38795374  T
Q  231 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||   ||||| |||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  38795375 ccaccaactacaattaataagggcatttgggtaaatgatactaattttaccattgaaataaacacaattaatcatttccttaa 38795457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 34957437 - 34957629
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| |||| |  || |||| | ||||| ||| ||||  | |  ||| || ||||||    
T  34957437 tctcaaaataattatcactttaaaataccaatgtaacatttattatt-ttttccgttactatatccttatttattgaatttcatttaactgaactactcc 34957535  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 326  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| |||||||||  |||||| |||||    
T  34957536 actaactataattaataaggatatttaagtaaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcatttccttagtaattgtccataa 34957629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 313
Target Start/End: Original strand, 52290834 - 52291006
Alignment:
Q  140 ataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaact 239  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||| | ||||| ||| || | || || |||||| |||||||||||||    
T  52290834 ataattgtgactttagaataccaatgcagcatttattatt-ttttacattataatatccttatttattgaactttattcaacttaactactccactaact 52290932  T
Q  240 acaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    | ||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  52290933 ataattaataaggctgttttaataaatggtactaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcattttcttaa 52291006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 19611929 - 19612000
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  19611929 acttaactactccactaacaacaattaataaggatattttagtaaattata-taattttaacattgaaatcaa 19612000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29024060 - 29023989
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  29024060 acttaattactccactaactacaattaataa-gatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 29023989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48541170 - 48541122
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48541170 aaaataattgtcattttataatatcagtgcaacatttattattattttt 48541122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42469868 - 42469724
Alignment:
Q  126 ttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaa 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||   |||||||| | ||||||||  ||||| ||| |||| || ||||| |||    
T  42469868 ttttttgtctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgtaacattta--cttatttttaattaatatactcttatttattgaattataatccacctaa 42469771  T
Q  226 ttactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 272  Q
     ||||| |||||||| | ||| ||||  ||||||  |||||||||||    
T  42469770 atactcaactaactagagttaataagagtattttagtaaattatact 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 184
Target Start/End: Original strand, 43715239 - 43715290
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 184  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43715239 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaacatttattattttttt 43715290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 176
Target Start/End: Original strand, 37804668 - 37804714
Alignment:
Q  130 atgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt 176  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  37804668 atgtctcaaaataattgtccctttagaatatcaatgcaacatttatt 37804714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 292
Target Start/End: Original strand, 14194531 - 14194647
Alignment:
Q  175 ttattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaa 274  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||   ||||||  |||||  ||||||    
T  14194531 ttattatttgtcattattatacctttattaattgaatttcatccaacttaattactccactaac-acaattcataaaagtattttagtaaatggtactaa 14194629  T
Q  275 ttttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||||||| |||||||    
T  14194630 ttttatcattgaaatcaa 14194647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30682161 - 30682068
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  30682161 acttaattattccattaactacaattaataagattattttagtaaatgatactcattttaacattaaaattaaaacaattaatcatttccttaa 30682068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36463041 - 36462968
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 293  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  36463041 acttaattactccacaaacaacaattaataaggttattttagtaaatgctaccaattttaacattaaaatcaat 36462968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 54477554 - 54477482
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  54477554 acttaactactccattaactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaa 54477482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 236
Target Start/End: Original strand, 27471244 - 27471371
Alignment:
Q  109 tgtctctttagtttcttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaattt 208  Q
    |||||||||||  | |||| | | ||||||||||||||||| || | |||| |||| || ||||||||||| || | |||||  ||||||||||| |||     
T  27471244 tgtctctttagcattttttctttttctcaaaataattgtcactttataataccaatacagcatttattatttttgtccactaccatacctttatttattg 27471343  T
Q  209 aattctactccacttaattactccacta 236  Q
    ||||  | || |||||| ||||||||||    
T  27471344 aatttcattcaacttaactactccacta 27471371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23004477 - 23004384
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  || ||  ||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||    
T  23004477 acttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtatatactactaattttaccattgaaatcgacacaattaatcatttccttaa 23004384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 236
Target Start/End: Original strand, 33634267 - 33634372
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 230  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||  |||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33634267 tgtcttaaaataattatcatattataatattaatacaatatttattatttttttccatcaatatatcattatttattgaattagactccacttaattact 33634366  T
Q  231 ccacta 236  Q
     |||||    
T  33634367 acacta 33634372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38137626 - 38137549
Alignment:
Q  135 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  38137626 tcaaaataattgtcactttgcaatactaatgcaatatttattattattttccactattatatctttatttattgaatt 38137549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 51065195 - 51065139
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcacta 190  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51065195 tctctaaataattgtcattttacaataccaatgcagcatttattatt-tttttcacta 51065139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27549464 - 27549388
Alignment:
Q  137 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaatt 212  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  27549464 aaaataactgtcactttacaatatcaatgcaacatttattatttttttcccactattataactttatttattgaatt 27549388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 310
Target Start/End: Original strand, 30861417 - 30861505
Alignment:
Q  222 ttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |  | |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  30861417 ttaattactctactaactataattaataaggatattttaacaaattaaataatttttatcattgaaatcaacacaattaataatttcct 30861505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Original strand, 54726505 - 54726577
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  54726505 acttaactactccattaactacaattaataaagatgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 54726577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Original strand, 5325 - 5474
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||| | || |||||  |||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  5325 tctcaaaataattgttactttagaatgccaatacaacatttattatt--ttttccattatatacctttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 5422  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt 284  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  5423 actaactaaaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccatt 5474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34021
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 232  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | |    
T  34200 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatt-ttttccactattataccattatttattgaatttcatccaacttaactatttc 34102  T
Q  233 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   ||||||||||  ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  34101 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcatttccttaa 34021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8164 - 7983
Alignment:
Q  133 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata-tacctttattaatttaattctactccacttaattactc 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  | ||| |||| ||||| ||| || |  |  | ||||||||||||    
T  8164 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaattactc 8065  T
Q  232 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||  |||||||   || |||| ||||||||||    
T  8064 cactaactacaattaataagggtgttttggtaaataatattaattttaccatccaaatcaacaaaattaatcatttccttaa 7983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 299
Target Start/End: Original strand, 389 - 504
Alignment:
Q  184 ttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcat 283  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||  | ||| |||||||||||| |||    
T  389 ttcattaatatacccttatttattgaattctaccttacttaattaatccactaactactattaataagggtgttttattgaatgatactaattttaacat 488  T
Q  284 taaaatcaattcaact 299  Q
    |||||| || ||||||    
T  489 taaaataaaatcaact 504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 252994 - 252848
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 223  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  | || ||||    
T  252994 ttttttttttctcaaaaaaattgtcactttataataccaatgcaacatttattatt-tttttcattattatactcttatttattgaatttcattcaactt 252896  T
Q  224 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 272  Q
    || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||    
T  252895 aactactccaat-actacaattaataacgatattttagtaaatgatact 252848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Original strand, 2048 - 2114
Alignment:
Q  223 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  2048 taattaatccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaat 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20448 - 20376
Alignment:
Q  220 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 292  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  20448 acttaactacttcactaactgcaattaataagggtattttactaaatgatactaattttacaatcaaaatcaa 20376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Original strand, 5976 - 6037
Alignment:
Q  131 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata 193  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  5976 tgtctcaaaataattatcactttagaatatcaatccagcatttattatt-gttttcactaata 6037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16933 - 16884
Alignment:
Q  124 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 173  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  16933 ttttttttgtctcaaaataatttttattttagaatatcaatgcaagattt 16884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University