View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF19413_low_18 (Length: 282)
Name: NF19413_low_18
Description: NF19413
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19413_low_18 |
 | |
|
| [»] scaffold0340 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0002 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0113 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6336885 - 6336631
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
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| T |
6336885 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaccatagtaaagtacaac |
6336786 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
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|
|
| T |
6336785 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
6336686 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
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|
|
| T |
6336685 |
tggctttgctattgctaattttaaccacactaaaaatttccacttcctttatatt |
6336631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 56443398 - 56443652
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
56443398 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaatcatgtcttagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
56443497 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
56443498 |
cacacttgtcagatggaaaactaacacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaaaaattacaaagatgtcaaagtata |
56443597 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56443598 |
tggctttgctattgctaattttaaccacatcaaaaatttccacttcctttatatt |
56443652 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Original strand, 55082708 - 55082958
Alignment:
| Q |
19 |
ttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaacca |
118 |
Q |
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| T |
55082708 |
ttttgacggtatacaacaatatatgttcctttaaacgatcaaacattaactatgtattagagtttaacgatatgaaagtcaacatagtaaaggacaacca |
55082807 |
T |
|
| Q |
119 |
cacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatg |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55082808 |
tacttgtcagatagaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatg |
55082907 |
T |
|
| Q |
219 |
actttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
269 |
Q |
| |
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|
|
| T |
55082908 |
gctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
55082958 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 1613718 - 1613940
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1613718 |
agttttgatggtatacaaccatatatgtccctttaaacaatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
1613817 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1613818 |
cacacttgtgagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
1613917 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaatttta |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
1613918 |
tggctttgttattgttaatttta |
1613940 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 271
Target Start/End: Original strand, 48083216 - 48083468
Alignment:
| Q |
19 |
ttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaacca |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| || |
|
|
| T |
48083216 |
ttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcttaatgatatgaaagtcagcatagcaaaatacagtca |
48083315 |
T |
|
| Q |
119 |
cacttgtcagatggaaaactaatacatg--tcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48083316 |
cacctgtcagatggaaaactaatgcatgacacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaaatata |
48083415 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48083416 |
tggctttgc--ttgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttctcttatatt |
48083468 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 12800507 - 12800675
Alignment:
| Q |
69 |
catgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataa |
168 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12800507 |
catgtattggagcctaatgatatgaaagtcaacatagcaaagtacaaccacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacaaaatgaagcacataa |
12800606 |
T |
|
| Q |
169 |
ataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgctattactaattt |
237 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12800607 |
ataacatatgattgacataaccaaaaactacaaagatgtcaaaatatatggctttgctattgctaattt |
12800675 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42260130 - 42259977
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
42260130 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatgtatttgaacttaatgatatgaaagtcagcatagcaaagtacagt |
42260031 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaat |
170 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42260030 |
cacacctgtcagaaggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaat |
42259977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 271
Target Start/End: Original strand, 1614324 - 1614363
Alignment:
| Q |
232 |
taattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1614324 |
taattttaaccacaccaaaaatttccactttctttatatt |
1614363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 17215204 - 17215248
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
17215204 |
agttttgacggtattcaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
17215248 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 39334242 - 39334198
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
39334242 |
agttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
39334198 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42259968 - 42259931
Alignment:
| Q |
234 |
attttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42259968 |
attttaaccacacaaaaaatttccatttcctttatatt |
42259931 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Original strand, 17215246 - 17215306
Alignment:
| Q |
134 |
aaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaaga |
194 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | | || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17215246 |
aaactaatgcatggcatacataatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga |
17215306 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 39365110 - 39365362
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39365110 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtccaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
39365209 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39365210 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataattaagaattaccaagatgtcatagtata |
39365309 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
269 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39365310 |
tggctttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
39365362 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16835280 - 16835026
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16835280 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagttcaacgatatgaaagtcagcataataaagtacaac |
16835181 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16835180 |
cacatttgtcagatggaaaactaatacatgtcttacataatgaagcacataaataatacatgattgacatacccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
16835081 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16835080 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttctacttcctttatatt |
16835026 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 44431456 - 44431710
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44431456 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcttttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaatgatatgaaagtcaacatagtaaagtacaac |
44431555 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44431556 |
cgcacttgttagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
44431655 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
44431656 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaaatttcacttcctttatatt |
44431710 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46295340 - 46295086
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46295340 |
agttttgacgatatacaacgatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattatagtctaacggtatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
46295241 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46295240 |
cacatttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattatcaagatgtcaaagtata |
46295141 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46295140 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
46295086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1799617 - 1799355
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1799617 |
agttttgacggtatacaaccatatttgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtactagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
1799518 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtc-------- |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1799517 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatatatgattggcataatcaagaattaccaagatgtcaaaggatg |
1799418 |
T |
|
| Q |
209 |
--aaagtatatgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
269 |
Q |
| |
|
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| T |
1799417 |
tcaaagtatatggctttcctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
1799355 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21247362 - 21247108
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |
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| T |
21247362 |
agttttgattgtatacaaccatatatgatcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattaaggtataatgatatgaaagtcagcatagtaaagtacagc |
21247263 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21247262 |
catacttgtcagatggaaaactaatacatgtgatacataatgaagcacataaataatatatgattggcataaccaagaataaccaagatgtcaaaatata |
21247163 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21247162 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
21247108 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Original strand, 29487556 - 29487756
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
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|
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| T |
29487556 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttccctcaaacgatcaaacattaatcatgtattagagtctaatgatatgaaagtcagcatagcaaagtacagc |
29487655 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
29487656 |
cacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgatatatgattcgcataaccaagaattaccaagatgtcaaagcata |
29487755 |
T |
|
| Q |
217 |
t |
217 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
29487756 |
t |
29487756 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 25377001 - 25377250
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |
|
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| T |
25377001 |
agttttgacgctatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatatgaaagtcaacatagcaaagtacagt |
25377100 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
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||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
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|
| T |
25377101 |
cacacctgtcggatagaaaactaatgcatgacatacatagtgaagcacataaatcacatagaatttgcataaccaagaattactaagatgtcaaaatata |
25377200 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttccttta |
267 |
Q |
| |
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||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
25377201 |
tga-ttttctattgttaattttaaccacaccaataatttccacttccttta |
25377250 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 42774989 - 42775200
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
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| T |
42774989 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcagacatttaccatgtattagagcctaatgatatgaa-gtcagcatagcaaagtacagc |
42775087 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
42775088 |
cacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataataaagcacagaaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatata |
42775187 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctatt |
229 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
42775188 |
tggctttgctatt |
42775200 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16798074 - 16797891
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtc-agcatactaaagtacaa |
115 |
Q |
| |
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| T |
16798074 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaactatatattagagcctaatgatatgaaagtccaacatagcaaagtaaag |
16797975 |
T |
|
| Q |
116 |
ccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattac |
199 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16797974 |
tcacacctgtcagatgaaaaactaatatatggcatacataatgaagcacataaatggcacatgattgacataaccaagaattac |
16797891 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 48731444 - 48731384
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtatta |
77 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
48731444 |
agttttgacagcatataaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatgtatta |
48731384 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 45141740 - 45141784
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
45141740 |
agttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
45141784 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16797402 - 16797356
Alignment:
| Q |
153 |
ataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattac |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16797402 |
ataatgaagcacataaatgacatatgattgacataatcaagaattac |
16797356 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15565439 - 15565185
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15565439 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacgttaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
15565340 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15565339 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
15565240 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
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|
| T |
15565239 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttacacgtcctttatatt |
15565185 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 20831984 - 20832234
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20831984 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcatttaaacgataaaacattaaaaatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
20832083 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20832084 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatgcatgattgacataaccaaaaattaccaagatgtcaaagtata |
20832183 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
269 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20832184 |
tggctttgctattgctaattttaac--caccaaaaatttccacttcctttata |
20832234 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 44308378 - 44308628
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44308378 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaacatagtaaagtacaac |
44308477 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44308478 |
cac----gttagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
44308573 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
44308574 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccatttcatttatatt |
44308628 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 26090 - 26353
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26090 |
agttttgacggtacacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattatagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
26189 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaa----------gatg |
206 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
26190 |
cacgcttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaggatg |
26289 |
T |
|
| Q |
207 |
tcaaagtatatgactttgctattac-taattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttata |
269 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
26290 |
tcaaagtatatggctttgctattgcttaattttaaccacaccaaaaatcttcacttcctttata |
26353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 25630446 - 25630690
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | | |
|
|
| T |
25630446 |
agttttgacggtatacaaccatatatgctccctgaagcgatcaaacattaaccatgtattagagcctaatgatatgaaagtcagcatagcaaagtagagc |
25630545 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| | |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25630546 |
cacacctttcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcata----------aacaagatgtcaaaatata |
25630635 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
25630636 |
tggctttgttattgctaattttaaccacaccataaatttccacttcctttatatt |
25630690 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 271
Target Start/End: Original strand, 12502369 - 12502602
Alignment:
| Q |
28 |
tatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaaccacacttgtca |
127 |
Q |
| |
|
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|
| T |
12502369 |
tatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaaccatatattagagcttaatgatatgaacgtcagcataacaaagtacaaccacacatgtca |
12502468 |
T |
|
| Q |
128 |
gatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgcta |
227 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12502469 |
gatggaaaactaatgcataacatacataataaagcacataaatgacatatgattgacataaccaagaa----------gtcaaaatatatcgctttgcta |
12502558 |
T |
|
| Q |
228 |
ttactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12502559 |
ttgctcattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
12502602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 6869250 - 6869311
Alignment:
| Q |
19 |
ttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagag |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6869250 |
ttttgacggtatacaatcatatatgttccatgaaacgatcaaacattaactatgtattagag |
6869311 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 35235114 - 35235367
Alignment:
| Q |
18 |
gttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaacc |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
35235114 |
gttttgatggtatataaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaacc |
35235213 |
T |
|
| Q |
118 |
acacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatat |
217 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35235214 |
acacatgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaattatat |
35235313 |
T |
|
| Q |
218 |
gactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35235314 |
ggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
35235367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40066404 - 40066150
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
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| T |
40066404 |
agttttgacggtatagaaccatatatgttcttttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaacatagtaaagtacaac |
40066305 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
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|
| T |
40066304 |
cacacttgtcaaatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggtgtaaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
40066205 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
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|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
40066204 |
tgactttgatattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
40066150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54603040 - 54602786
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54603040 |
agttttaacgatatacaaccatatatgtttctttaaacgatcgaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
54602941 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54602940 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataagacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
54602841 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
54602840 |
tgactttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcatttcctttatatt |
54602786 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 1092283 - 1092537
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1092283 |
agttttgacggtatacaatcatatatgttcctttaaacgatcaaaaattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
1092382 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1092383 |
cacacttgccagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacttaattgacataaccaagaattaccaagatgtcacaatata |
1092482 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1092483 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatatt |
1092537 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 20819492 - 20819745
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20819492 |
agttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacaatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgattagaaagtcagcatagtaaagtacaac |
20819591 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20819592 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
20819691 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20819692 |
tggccttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattt-cacttcctttatatt |
20819745 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32751600 - 32751347
Alignment:
| Q |
18 |
gttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaacc |
117 |
Q |
| |
|
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|
| T |
32751600 |
gttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaatgtagtaaagtacaacc |
32751501 |
T |
|
| Q |
118 |
acacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatat |
217 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32751500 |
acacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaacaattatcaacatgtcaaaatatat |
32751401 |
T |
|
| Q |
218 |
gactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32751400 |
ggttttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
32751347 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24782998 - 24782735
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24782998 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaatgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgagagtcagcatagtaaagtacaat |
24782899 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagat--------ggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaa-taatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24782898 |
cacacttgtcagattgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataataaagcacataaaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgt |
24782799 |
T |
|
| Q |
208 |
caaagtatatgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24782798 |
caaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
24782735 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54627939 - 54627686
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54627939 |
agttttgacgatatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaa-gtctgcatagtaaagtacaac |
54627841 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54627840 |
cacatttgtctgatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacacatatataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
54627741 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54627740 |
ttgctttgctattgctaattttaaccacacaaaaaatttccacttcctttatatt |
54627686 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 35234011 - 35234265
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||| |||||||| | |
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|
| T |
35234011 |
agtttttacggtatacaaccatatattttctctgaaacgatcaaacattaaccatgtattagtgcctaatgatataaaagacagcatagcaaagtacagc |
35234110 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
35234111 |
cacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacatgaatgacatatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaatata |
35234210 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35234211 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccactccctttatatt |
35234265 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 54492987 - 54493208
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
54492987 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttctccgaaacgatcaaacattaatgatgtattagagcctaatgatatgaaagtcagcataacaaagtataac |
54493086 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataacc-aagaattaccaagatgtcaaagtat |
215 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| || || ||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
54493087 |
cacacctgtcaaatgaaaaactaatgcatggtatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcatagccaaaaaattatcaagatgtcaaaatat |
54493186 |
T |
|
| Q |
216 |
atgactttgctattactaattt |
237 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
54493187 |
atggctttgctattgctaattt |
54493208 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 55482160 - 55482038
Alignment:
| Q |
69 |
catgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataa |
168 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55482160 |
catgtattatagcataatgatatgaaagtcagcatagcaacgtacagccacacttgtcatatgaaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataa |
55482061 |
T |
|
| Q |
169 |
ataatacatgattgacataacca |
191 |
Q |
| |
|
|| | | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
55482060 |
atgacatatgattggcataacca |
55482038 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55481641 - 55481556
Alignment:
| Q |
119 |
cacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaaga |
204 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
55481641 |
cacttgttagattaaaaactaatgcattacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaataattaccaaga |
55481556 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20411041 - 20410997
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20411041 |
agttttgacggtatacaaccatatatgtttctttaaacgatcaaa |
20410997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 77
Target Start/End: Original strand, 41221894 - 41221943
Alignment:
| Q |
28 |
tatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtatta |
77 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41221894 |
tatacaaccatatatgttccctgaaatgatcaaacattaaccatgtatta |
41221943 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 40791624 - 40791668
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
40791624 |
agttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
40791668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 26831801 - 26832055
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
26831801 |
agttttgacggtatacaataatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaacatagtaaagtacagc |
26831900 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26831901 |
cacacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcacagtata |
26832000 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26832001 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
26832055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14103733 - 14103479
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14103733 |
agttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaat |
14103634 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
14103633 |
catacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatatcaaaatata |
14103534 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14103533 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
14103479 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14413750 - 14413496
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14413750 |
agttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaat |
14413651 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
14413650 |
catacttgtcagatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaaacacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatatcaaaatata |
14413551 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14413550 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
14413496 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 36897664 - 36897916
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36897664 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
36897763 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36897764 |
cacacttg--agatgaaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcatagtcaagaattaccaagatgtcaaagtata |
36897861 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36897862 |
tgactttgctattgcaaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatatt |
36897916 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 26928345 - 26928510
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26928345 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaaatcagcatagtaaagtacaac |
26928444 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattg |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26928445 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattg |
26928510 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 15752492 - 15752742
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
15752492 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaccgatcaaacattaaccatccattagagcctaatgatataaaagtcagcatagcaaagaacaac |
15752591 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |
|
|
| T |
15752592 |
cc----tgtcaaatagaaaagtaatgcatatcatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaagaattaccgagatgtcgaaatata |
15752687 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15752688 |
tggctttgttattgctaatcttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
15752742 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 237
Target Start/End: Original strand, 42261057 - 42261242
Alignment:
| Q |
51 |
aaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcat |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||| |
|
|
| T |
42261057 |
aaacgatcaaacattaaccatgtattagagcttaatcaaatgaaattcagtata-gcaagtacaaccacacatgtcagatagaaaaataatgcatgacat |
42261155 |
T |
|
| Q |
151 |
acataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgctattactaattt |
237 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| | | ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42261156 |
acataataaagcacataaatgacatatgtttggtataaccaaaaattatcaagatgtcaaaatatatggttttgctattgctaattt |
42261242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 17774560 - 17774604
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
17774560 |
agttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
17774604 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 29417961 - 29417917
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
29417961 |
agttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
29417917 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 34956263 - 34956229
Alignment:
| Q |
27 |
gtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34956263 |
gtatacaaccatatatgttccttgaaacgatcaaa |
34956229 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 42260952 - 42260994
Alignment:
| Q |
19 |
ttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
42260952 |
ttttgacggtatacaaccatatatgttctctgaaacgatcaaa |
42260994 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 5574235 - 5574489
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
5574235 |
agttttgacggtatacaatcatatatgtttctttaaacgttcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacagc |
5574334 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5574335 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccgataattaccaagatgtcacagtata |
5574434 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5574435 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
5574489 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17648201 - 17647948
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17648201 |
agttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacaatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtacaac |
17648102 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17648101 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcaaacataatgaagcacataaataatatatgattgacataaccaagaattaacaagatgtcagagtata |
17648002 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17648001 |
tggccttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattt-cacttcctttatatt |
17647948 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6915266 - 6915022
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6915266 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaacattaatcatgtattagagcctaatgatatgaaagtcaacataacaaagtacaac |
6915167 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
6915166 |
cacacctgtcagatggaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacataacc----------aagacgtcaaaatata |
6915077 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6915076 |
tggctttgttattgctaattttaaccacaccaaaaattcccacttcctttatatt |
6915022 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24087324 - 24087224
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| | |
|
|
| T |
24087324 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacaatcaaacattaaccaagtattagag------gatatgaaagtcaacataat-aagtacagc |
24087232 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
24087231 |
cacacttg |
24087224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20731544 - 20731469
Alignment:
| Q |
127 |
agatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaa |
202 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20731544 |
agatgaaaaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacataactaagaattaccaa |
20731469 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20731157 - 20731095
Alignment:
| Q |
107 |
aaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaat |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20731157 |
aaagtacaaccacactc-tcggatggaaaaataatacatgacatgcataatgaagcacataaat |
20731095 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5577211 - 5577167
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
5577211 |
agttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
5577167 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19293066 - 19293022
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
19293066 |
agttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
19293022 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15830767 - 15830513
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15830767 |
agttttgatggtatacaaccatatatgttcctttaaacaatcaaacattaatcatgtattagagtctaacgatatgaaagtcaacatagtaaagtacaac |
15830668 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15830667 |
cacacttgtgagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
15830568 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15830567 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaaatttcacttcctttatatt |
15830513 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9708796 - 9708532
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
9708796 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagtagaat |
9708697 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtc-------- |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9708696 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaaggatg |
9708597 |
T |
|
| Q |
209 |
--aaagtatatgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9708596 |
tcaaagtatatggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatatt |
9708532 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 36207241 - 36207486
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtata--caaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtaca |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
36207241 |
agttttgacggtatatacaaccatatatgttccctgaaacgaacaaacattaaccatgtattagag-ctaatgatatgaaagtcagcatagcaaagtaca |
36207339 |
T |
|
| Q |
115 |
accacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagta |
214 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
36207340 |
accacacctgtcacatggaaaattaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattgacata----------accaagatgtcaacata |
36207429 |
T |
|
| Q |
215 |
tatgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36207430 |
tatgcctttgttattgctaattttaaccacaccaaaaatttcaacttcctttatatt |
36207486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 194
Target Start/End: Original strand, 38937627 - 38937804
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
38937627 |
agttttgacggtatacaaccacatatgttacatgaaacgatcaaaaattaaccatgtattagagcctgatgatgtgaaagtcagcataataaagtacaac |
38937726 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaaga |
194 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| | | || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38937727 |
tacacctgtcagatgaaaaactaatgcatagcatacacgatgaaacacataaatgacatataattggcataaccaaga |
38937804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3106893 - 3106830
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagag |
80 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3106893 |
agttttaacgatatacaaccatatatgttccctgaaacgaccaaacattaaccatgtattagag |
3106830 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 120
Target Start/End: Original strand, 7278053 - 7278139
Alignment:
| Q |
34 |
accatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaaccaca |
120 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7278053 |
accatatatgttccataaaacgatcaaacattaaccgcgtattagagcataatgatatgatagtcagcatagcaaagtacacccaca |
7278139 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0340 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:
Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 1576 - 1829
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
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|
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| T |
1576 |
agttttgacgatatacaaccatatatgttcctttaatcgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaa-gtcagcatagtaaagtacaac |
1674 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1675 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattcgcataactaagaattatcaagatgtcaaagtata |
1774 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
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|
| T |
1775 |
tggctttgctattgctaattttaaccacaccaaaaattttcacttcctttatatt |
1829 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 129 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11099737 - 11099595
Alignment:
| Q |
129 |
atggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgctat |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
11099737 |
atggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattggcataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatggcttcgctat |
11099638 |
T |
|
| Q |
229 |
tactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11099637 |
tgctaattttaaccacacaaaaaatttccacttcctttatatt |
11099595 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1563819 - 1563569
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagtacaac |
116 |
Q |
| |
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| T |
1563819 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttccctgaaccgatcaaacattaaccatccattagagcctaatgatataaaagtcagcatagcaaagaacaac |
1563720 |
T |
|
| Q |
117 |
cacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtata |
216 |
Q |
| |
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| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |
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|
| T |
1563719 |
cc----tgtcaaatagaaaagtaatgcatatcatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaagaattaccgagatgtcgaaatata |
1563624 |
T |
|
| Q |
217 |
tgactttgctattactaattttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
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|
| T |
1563623 |
tggctttgttattgctaatcttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
1563569 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11099808 - 11099739
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaac |
86 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11099808 |
agttttgacggtatacaaccatatatgctcctttatacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaac |
11099739 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28538108 - 28538051
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgta |
74 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28538108 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgta |
28538051 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 23075163 - 23075119
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaa |
61 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23075163 |
agttttgtcggtatacaaccatatatgttccctgaaacgatcaaa |
23075119 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 42293 - 42198
Alignment:
| Q |
17 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaatattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatactaaagta |
112 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42293 |
agttttgacggtatacaaccatatatgttcctttaaacgatcaaacattaaccatgtattagagtctaacgatatgaaagtcagcatagtaaagta |
42198 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 425159 - 425054
Alignment:
| Q |
89 |
tatgaaagtcagcatactaaagtacaaccacacttgtcagatggaaaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataa |
188 |
Q |
| |
|
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| T |
425159 |
tatgaaagtcagcatagcaaagtacaacaacacctgtcagattgaaaactaatccatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataa |
425060 |
T |
|
| Q |
189 |
ccaaga |
194 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
425059 |
ccaaga |
425054 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0113 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:
Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13098 - 12971
Alignment:
| Q |
134 |
aaactaatacatgtcatacataatgaagcacataaataatacatgattgacataaccaagaattaccaagatgtcaaagtatatgactttgctattacta |
233 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||| |
|
|
| T |
13098 |
aaactaatgcatgacatacataatgaagcacataaatgacatatgattggcataaccaaga----------tgtcaaaatatatggctttgttattgcta |
13009 |
T |
|
| Q |
234 |
attttaaccacaccaaaaatttccacttcctttatatt |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13008 |
attttaaccacacaaaaaatttccacttcctttatatt |
12971 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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