View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19438_low_20 (Length: 403)

Name: NF19438_low_20
Description: NF19438
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19438_low_20
NF19438_low_20
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (19-393)||(15926843-15927217)
chr6 (278-326)||(30960812-30960860)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (19-393)||(9254675-9255049)
chr1 (19-393)||(9319991-9320365)
chr1 (19-393)||(9350308-9350682)
chr1 (19-393)||(9317937-9318311)
chr1 (25-393)||(8920791-8921159)
chr1 (25-392)||(8932196-8932563)
chr1 (82-393)||(8956175-8956486)
chr1 (82-392)||(8942169-8942479)
chr1 (19-242)||(9453622-9453845)
chr1 (82-392)||(9485837-9486147)
chr1 (19-242)||(9432635-9432858)
chr1 (19-326)||(9399721-9400028)
chr1 (100-355)||(9096494-9096749)
chr1 (100-355)||(9104676-9104931)
chr1 (100-223)||(8873885-8874008)
chr1 (19-223)||(9056650-9056854)
chr1 (278-356)||(8964860-8964938)
chr1 (136-230)||(8999869-8999963)
chr1 (278-343)||(9082236-9082301)
chr1 (22-223)||(9142688-9142889)
chr1 (278-350)||(9142561-9142633)
chr1 (19-59)||(10979413-10979453)
chr1 (100-224)||(11033351-11033475)
chr1 (100-215)||(8964682-8964797)
chr1 (100-223)||(9082356-9082479)
chr1 (278-355)||(9000011-9000088)
chr1 (82-194)||(9384377-9384489)
chr1 (278-389)||(9056909-9057020)
chr1 (136-227)||(11007934-11008025)
chr1 (19-56)||(9082523-9082560)
chr1 (283-371)||(10903782-10903870)
chr1 (19-59)||(11005003-11005043)
chr1 (19-59)||(11007817-11007857)
chr1 (136-224)||(11011096-11011184)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (22-392)||(9159684-9160054)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15927217 - 15926843
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15927217 tcaggagccatgtatccaatcgttcctcttgctgcagttaaagtgacaatactaatctcattaggataaagctttgcaagaccaaagtcggaaactttgg 15927118  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  15927117 ggataaagttctcatcaagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgttacatccttgatgtaagtaagccataccacgagcaac 15927018  T
Q  219 tccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataa 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927017 tccaagagatatctcatacatttgcttataagttagagagatagcatcctcgctagaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataa 15926918  T
Q  319 aaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctatg 393  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15926917 acaagagcacgctttgatccctcaacacaaaatccaataagtcgaactacattggtgtgatgtattcttcctatg 15926843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30960860 - 30960812
Alignment:
Q  278 aaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagc 326  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||    
T  30960860 aaatatatttgtcaagagaaccattggacataaattcatatacaagagc 30960812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9255049 - 9254675
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9255049 tcaggagccatgtatccaattgtcccccttgctgcggttaaagtgacaatactaatctcatttggataaagctgtgcaagaccaaagtctgaaactttgg 9254950  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9254949 ggttaaagttctcatcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatttcgcatccttgatgtaaataagcaataccatgagccac 9254850  T
Q  219 tccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataa 318  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||  ||| |||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9254849 tccaagagatatctcgtacattttctgataacttagagagatagtatcctctctagaggaaatatatttatcaagagaaccattggacatgaattcataa 9254750  T
Q  319 aaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctatg 393  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9254749 acaagagcacgctttgatccctcaacacaaaacccaataagtcgagccacattggtgtgatgtattcttcctatg 9254675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Original strand, 9319991 - 9320365
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9319991 tcaggagccatatatccaattgttcctcttgctgcagttaaagtgacaatgctaatctcattaggataaagcttagcaagaccaaagtctgaaactttgg 9320090  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9320091 ggataaagttctcatcaagaaggatgttatggggcttgatatcaaaatgcaaaatttgcatgtcacatccttgatgtaaataagccataccacgagccac 9320190  T
Q  219 tccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataa 318  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9320191 tccaagagatatctcatacattttctgataatttagagagatagtatcctctctagaggaaatatatttatcaagagagccattggacatgaattcataa 9320290  T
Q  319 aaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctatg 393  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320291 acaagagcacgctttgatccttcaacacaaaacccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctatg 9320365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Original strand, 9350308 - 9350682
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9350308 tcaggagccatatatccaattgttcctcttgctgcagttaaagtgacaatgctaatctcattaggataaagcttagcaagaccaaagtctgaaactttgg 9350407  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9350408 ggataaagttctcatcaagaaggatgttatggggcttgatatcaaaatgcaaaatttgcatgtcacatccttgatgtaaataagccataccacgagccac 9350507  T
Q  219 tccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataa 318  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9350508 tccaacagatatctcatacattttctgataacttagagagatagtatcctctctagaggaaatatatttatcaagagagccattggacatgaattcataa 9350607  T
Q  319 aaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctatg 393  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9350608 acaagagcacgctttgatccttcaacacaaaacccaataagtcaaaccacattggtgtgatgtattcttcctatg 9350682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9318311 - 9317937
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9318311 tcaggagccatgtatccaattgttcctctagctgcagttaaagtgacaatgctaatgtcatttggataaagctttgccagaccaaagtctgaaactttgg 9318212  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9318211 gaataaagttctcatcaagaaggatgttatggggcttgatatcaaaatgcaagatttgcatgtcacatccttcatgcaaataagcaattccacgagccac 9318112  T
Q  219 tccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataa 318  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    ||  |||| ||| | || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9318111 tccaagagatatctcatacattttcttgcaagttagatcaataacatcatctttagaggaaatgtatttatcaagagagccgttgggcatgaattcataa 9318012  T
Q  319 aaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctatg 393  Q
    | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  9318011 acaagtgcacgttttgatctctcaaaacaaaaaccaataagtctaaccacatttgcatggtgtattcttcctatg 9317937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 393
Target Start/End: Original strand, 8920791 - 8921159
Alignment:
Q  25 gccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttggggataa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | | | | |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  8920791 gccatgtaaccaattgttcctcttgcagcagtcaaagttacaatgctattgtcaactggataaagttttgcaagaccgaagtctgaaactttggcgatga 8920890  T
Q  125 agttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactccaag 224  Q
    |||  | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  8920891 agtcatggtcaagaagtatgttatgaggcttgatgtcaaaatgtaaaatttgcatgtcacagccttgatgcaaataagcaattccacgtgcaactccaag 8920990  T
Q  225 tgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaaga 324  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||   ||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  8920991 agatatctcgtacatttgcttataagttaaggaaatgtgatcttctctagaggaaatatatctatcaagagagccatttggcatgaaatcataaacaaga 8921090  T
Q  325 gcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctatg 393  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8921091 gcacgttttgatccctcaacacaaaatccaacaagtcgcaccacattggcgtgatgtatttttcctatg 8921159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 392
Target Start/End: Original strand, 8932196 - 8932563
Alignment:
Q  25 gccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttggggataa 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | ||| | | | | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  8932196 gccatgtaaccaattgttcctcttgcagcagtcaaagttacaatgctattgtcaactggataaagttttgcaagaccaaagtctgatactttggcgatga 8932295  T
Q  125 agttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactccaag 224  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  8932296 agtcctggtcaagaagtatgttatgaggcttgatatcgaaatgtaaaatttgcatgtcacaaccttgatgcaaataagcaattccacgtgcaactccaag 8932395  T
Q  225 tgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaaga 324  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||    || ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8932396 agatatctcgtacatttgcttataagttaaggaaatatggtcttctctagaggaaatatatctatcaagagagccattgggcatgaaatcataaacaaga 8932495  T
Q  325 gcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctat 392  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8932496 gcacgttttgatttctcaacacaaaatccaacaagtcgcaccacattggtgtgatgtatttttcctat 8932563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 393
Target Start/End: Original strand, 8956175 - 8956486
Alignment:
Q  82 ggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgt 181  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||  | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8956175 ggataaagttttgcaagaccaaagtctgaaaccttggcgatgaagtctttgtcaagaagaatgttatgaggcttgatatcaaaatgtaaaatttgcatgt 8956274  T
Q  182 cgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaat 281  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || ||   ||| || || || |||||    
T  8956275 cacaaccttgatgcaaataagcaattccacgtgcaactccaagagatatctcatacatttgcttataagttaaggaaatatgatcttccctagaggaaat 8956374  T
Q  282 atatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgt 381  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8956375 atatctatcaagagagccattgggcatgaaatcataaacaagagcacgttttgatccctcaatgcaaaatccaacaagtcgcaccacattggtgtgatgt 8956474  T
Q  382 attcttcctatg 393  Q
    ||| ||||||||    
T  8956475 atttttcctatg 8956486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 392
Target Start/End: Original strand, 8942169 - 8942479
Alignment:
Q  82 ggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgt 181  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||| || ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8942169 ggataaagttttgcaagaccaaaatctgaaacctttgcaatgaagtcctggtcaagaagtatgttatgaggcttgatatcaaaatgtaaaatttgcatgt 8942268  T
Q  182 cgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaat 281  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||   ||| ||||| || || ||    
T  8942269 cacaaccttgatgcaaataagcaattccacgtgcaacggcaagagatatctcatatatttgtttataagttaaggaaatatgatcttctctagatgatat 8942368  T
Q  282 atatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgt 381  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8942369 atatttatcaagagagccattgggcatgaaatcataaacaagagctctttttgatccctcaacacaaaatccaataagtcgcaccacattggtgtgatgt 8942468  T
Q  382 attcttcctat 392  Q
    |||||||||||    
T  8942469 attcttcctat 8942479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9453845 - 9453622
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||  |||| | | | | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9453845 tcaggagccatgtaaccaattgttcctcttgctgctgtcaaagcgacaatgctattgtcaataggataaagctttgcaagaccaaaatctgaaactttag 9453746  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||| | ||| |||||||||||    
T  9453745 ggatgaaattttcgtcaagaaggatgttgtgaggcttaatatcaaaatgcaaaatttgcatatcacacccttgatgaagatatgaaattccacgagccac 9453646  T
Q  219 tccaagtgatatctcatacatttg 242  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  9453645 tccaagagatatctcatatatttg 9453622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9486147 - 9485837
Alignment:
Q  82 ggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||      
T  9486147 ggataaagctttgcaagaccaaagtccgaaactttagggacaaaattttcgtcaagaagaatgttgtgaggcttaatatcaaaatgcaaaatttgcatac 9486048  T
Q  182 cgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaag-aaa 280  Q
    | || |||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||| || ||  |  ||||| |||  | |||    
T  9486047 cacagccttgatgaagatatgaaattccacgagccactccaagagatatctcatatatttggtcgttagttagagatataactccctct-ttgttgaaaa 9485949  T
Q  281 tatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatg 380  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | || |||| ||||||||| || ||||  || | |||||| ||||| ||||  |||||||| |  ||||     
T  9485948 tatatttatcaagtgagccattgggcatgtactcgtaaacaagagcacgtttcgatccttcgacacaaaacccaatgagtcttaccacatttgaatgata 9485849  T
Q  381 tattcttcctat 392  Q
    ||||||||||||    
T  9485848 tattcttcctat 9485837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9432858 - 9432635
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| || || | |   | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9432858 tcaggagccatgtaaccaattgttcctcttgctgccgtcaaagtggcaatgcttttgtcaataggataaagctttgcaagaccaaagtccgaaactttag 9432759  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| | ||| | ||| ||| |||||||    
T  9432758 ggatgaaattttcgtccagaaggatgttgtgaggcttaatatcaaaatgcaaaatttgcatatcacaaccctgatgaagatatgaaattccaagagccac 9432659  T
Q  219 tccaagtgatatctcatacatttg 242  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  9432658 tccaagagatatctcatatatttg 9432635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 9399721 - 9400028
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| || || | |   | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9399721 tcaggagccatgtaaccaattgttcctcttgctgccatcaaagtggcaatgcttttgtcaataggataaagctttgcaagaccaaagtccgaaactttag 9399820  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| | ||| | ||| ||  |||||||    
T  9399821 ggatgaaattttcgtcaagaaggatgttgtgaggcttaatatcaaaatgcaaaatttgcatatcacaaccctgatgaagatatgaaattccttgagccac 9399920  T
Q  219 tccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaag-aaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcata 317  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | || |||||| || ||  |  ||||| |||  | |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||    
T  9399921 tccaagagatatctcatatatttggtcgttagttagagatataactccctct-ttgttgaaaatatatttatcaagtgagccattgggcatgtactcgta 9400019  T
Q  318 aaaaagagc 326  Q
    || ||||||    
T  9400020 aacaagagc 9400028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9096749 - 9096494
Alignment:
Q  100 ccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaat 199  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||| || || | ||    
T  9096749 ccaaagtcagatagtttagggataaagttctcatcaagaaggatattgtggggcttgatatcaaaatgtaaaatcttcatttcacatccgtggtgaagat 9096650  T
Q  200 aagcaatgccacgagccactccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaa-tatatttatcaagagaac 298  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| || ||| || || ||||  |||||  |||     || ||  |||   ||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  9096649 aagcaatcccacgagctactccaattgctatatcgtaaattttgttgtagcttaaatttat-gctcccttctttggagaaaataaatttatcaagagatc 9096551  T
Q  299 cattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaa 355  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  9096550 cattaggcatgaattcataaacaagagcacgttttgatccctcaatacaaaatccaa 9096494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9104931 - 9104676
Alignment:
Q  100 ccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaat 199  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||| || || | ||    
T  9104931 ccaaagtcagatagtttagggataaagttctcatcaagaaggatattgtggggcttgatatcaaaatgtaaaatcttcatttcacatccgtggtgaagat 9104832  T
Q  200 aagcaatgccacgagccactccaagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaa-tatatttatcaagagaac 298  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| || ||| || || ||||  |||||  |||     || ||  |||   ||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  9104831 aagcaatcccacgagctactccaattgctatatcgtaaattttgttgtagcttaaatttat-gctcccttctttggagaaaataaatttatcaagagatc 9104733  T
Q  299 cattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaa 355  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  9104732 cattaggcatgaattcataaacaagagcacgttttgatccctcaatacaaaatccaa 9104676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8874008 - 8873885
Alignment:
Q  100 ccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaat 199  Q
    |||||||| || ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||| | ||    
T  8874008 ccaaagtcagagactttcggagtaaagttctcatcaagaaggatgttgtgaggcttaatatcaaaatgcaaaatcttcatttcacatccatgatggagat 8873909  T
Q  200 aagcaatgccacgagccactccaa 223  Q
    ||||||| |||||||| |||||||    
T  8873908 aagcaatcccacgagctactccaa 8873885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Original strand, 9056650 - 9056854
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |   ||||| | | | ||  | ||||||| |||||||| || |||||||| || |  || |    
T  9056650 tcaggagccatatatccaattgtgcctttggctgcagtcattgtgacaatgctattcgtaattggatatagctttgcgagtccaaagtcagatatctttg 9056749  T
Q  119 ggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccac 218  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| | ||| | |||| |||| |||||||| ||    
T  9056750 gaataaaattctcgtcaagtaggatattgtgtggcttgatatcaaaatgcaaaattttcatttcacatccattatggagataatcaatcccacgagctac 9056849  T
Q  219 tccaa 223  Q
    |||||    
T  9056850 tccaa 9056854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Original strand, 8964860 - 8964938
Alignment:
Q  278 aaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaat 356  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  8964860 aaataaatttatcaagggatccattagacatgaattcataaacaagagcacggtttgatccctcgacacaaaaaccaat 8964938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 8999869 - 8999963
Alignment:
Q  136 agaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactccaagtgatat 230  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  8999869 agaaggatgttgtgaggcttgatatcaaaatgtaaaatcttcatttcgcatccatggtggagataagcaatcccacgagctactccaactgatat 8999963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9082301 - 9082236
Alignment:
Q  278 aaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaa 343  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  9082301 aaataaatttatcaagagatccattaggcatgaattcataaacaagagcacgtttggatccctcaa 9082236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9142889 - 9142688
Alignment:
Q  22 ggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgggga 121  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |   ||||| | | | ||||| | ||||| |||||||| || |||||||| || |  || || |    
T  9142889 ggagccatatatccaatagtacctcttgctgcagtcattgtgacaatgctattctcaatcggatatagctttgcgagtccaaagtcagatatctttggaa 9142790  T
Q  122 taaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactcc 221  Q
    |||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| || || | ||| || ||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||    
T  9142789 taaagttctcatcaagcagaatattatggggcttgatatcaaaatgtaatatcttcatttcacatccatggtggagataagcaattcctcgagctactcc 9142690  T
Q  222 aa 223  Q
    ||    
T  9142689 aa 9142688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9142633 - 9142561
Alignment:
Q  278 aaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaa 350  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  9142633 aaataaatttatcaagagatccatttgacatgaattcataaataagagcgcgttttgatccctcaatacaaaa 9142561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 10979413 - 10979453
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaa 59  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10979413 tcaggagccatgtatccaatggtccctcttgctgcagttaa 10979453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 224
Target Start/End: Original strand, 11033351 - 11033475
Alignment:
Q  100 ccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaat 199  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||| ||| |||||||| | ||| || |    
T  11033351 ccaaaatcagaaacttttgggttgaaattctcatcaagaaggatgttatgaggctttatgtcaaagtgtagaattttcatatcgcatccattatgcaagt 11033450  T
Q  200 aagcaatgccacgagccactccaag 224  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||    
T  11033451 actcaatgcctcgagccactccaag 11033475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 215
Target Start/End: Original strand, 8964682 - 8964797
Alignment:
Q  100 ccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaat 199  Q
    |||||||| || ||||| ||| | || ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| || || | ||    
T  8964682 ccaaagtcagagacttttggggtgaaattctcatcaagaaggatgttgtgaggcttaatatcaaaatgcaaaatcttcatttcgcatccatggtgaagat 8964781  T
Q  200 aagcaatgccacgagc 215  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8964782 aagcaatcccacgagc 8964797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9082479 - 9082356
Alignment:
Q  100 ccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaat 199  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||| || || | ||    
T  9082479 ccaaagtcagatattttagggataaagttctcatcaagcaagatattgtggggcttgatatcaaaatgtaaaatcttcatttcacatccatggtgaagat 9082380  T
Q  200 aagcaatgccacgagccactccaa 223  Q
    ||||||| |||||||| |||||||    
T  9082379 aagcaatcccacgagctactccaa 9082356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 355
Target Start/End: Original strand, 9000011 - 9000088
Alignment:
Q  278 aaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaa 355  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| | |||||| ||||    
T  9000011 aaataaatttatcaagtgatccattaggcatgaattcataaacaagagcacgtttcgatccctcgatacaaaatccaa 9000088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 194
Target Start/End: Original strand, 9384377 - 9384489
Alignment:
Q  82 ggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttggggataaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgt 181  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || | ||| |  ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  9384377 ggatatagctttgcaagtccaaaatccgaaacctttggaacaaactcttcgtctagaagaatattatgaggcttgatatcaaaatgtagaatttgcatat 9384476  T
Q  182 cgcatccttgatg 194  Q
    | |||||||||||    
T  9384477 cacatccttgatg 9384489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 389
Target Start/End: Original strand, 9056909 - 9057020
Alignment:
Q  278 aaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtg 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||| || ||||| | |||||  ||||| ||||  | | ||||||||||    ||    
T  9056909 aaatatatttatcaagagatccattacgcataaattcataaacaagagctcgttttgacccctcaatgcaaaatccaagtaattgaaccacatttaaatg 9057008  T
Q  378 atgtattcttcc 389  Q
    ||||||||||||    
T  9057009 atgtattcttcc 9057020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Original strand, 11007934 - 11008025
Alignment:
Q  136 agaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactccaagtga 227  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||| ||| | |||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11007934 agaaggatgttatgaggctttatgtcaaagtgtagaattttcatattgcatccattgtgcaagtactcaatgccacgagccactccaagtga 11008025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 9082560 - 9082523
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagt 56  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9082560 tcaggagccatatatccaattgtacctcttgctgcagt 9082523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 371
Target Start/End: Original strand, 10903782 - 10903870
Alignment:
Q  283 tatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaaagagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacatt 371  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |  || | |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  10903782 tatttttcaagtgacccatttggcatgaattcatatattagagcacgctttgacccatccacacaaaatccaataagttgtaccacatt 10903870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11005043 - 11005003
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaa 59  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11005043 tcaggggccatgtatccaatggttcctcttgctgcagttaa 11005003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 11007817 - 11007857
Alignment:
Q  19 tcaggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaa 59  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11007817 tcaggggccatgtatccaatggttcctcttgctgcagttaa 11007857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 224
Target Start/End: Original strand, 11011096 - 11011184
Alignment:
Q  136 agaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactccaag 224  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| || | ||||| ||| | |||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  11011096 agaagaatgttatgaggctttatatcaaagtgtagaattttcatattgcatccatgatgcaagtactcaatgccacgagccactccaag 11011184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 392
Target Start/End: Original strand, 9159684 - 9160054
Alignment:
Q  22 ggagccatgtatccaattgtccctcttgctgcagttaaattgacagtaccaatctcatttggataaagctttgcaagaccaaagtctgaaactttgggga 121  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9159684 ggagccatataaccaattgttcctcttgctgcagttaaatttacaatactattgtcattaggataaagctttgcaagaccaaagtcagaaaccttgggga 9159783  T
Q  122 taaagttctcgtcgagaaggatgttatggggcttgatgtcaaaatgcaaaatttgcatgtcgcatccttgatgtaaataagcaatgccacgagccactcc 221  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9159784 taaagttctcgtcaagaagtatgttatggggcttgatatcaaaatgcaagatttgcatgtcacatccttgatgcaaataagcaattccacgagccactcc 9159883  T
Q  222 aagtgatatctcatacatttgcttgtaagttagtgagattgcatcctctcttgaagaaatatatttatcaagagaaccattgggcatgaattcataaaaa 321  Q
    ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    ||  |||| ||| | || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  9159884 aatagatatctcatacattttcttataagttagattaataacatcatctttagaggaaatgtatttatcaagagagccgttgggcatgaattcataaaca 9159983  T
Q  322 agagcacgctttgatcgctcaaaacaaaaaccaataagtcgaaccacattggtgtgatgtattcttcctat 392  Q
    |||| ||  ||||||| ||| | |||||| ||||||||||  |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  9159984 agagtacattttgatctctccacacaaaatccaataagtcttaccacatttgcatggtgtattcttcctat 9160054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University