View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19441_low_2 (Length: 560)

Name: NF19441_low_2
Description: NF19441
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19441_low_2
NF19441_low_2
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (16-550)||(26862162-26862696)
chr6 (16-495)||(26884707-26885186)
chr6 (16-550)||(26647058-26647595)
chr6 (16-550)||(26753026-26753563)
chr6 (20-550)||(26656544-26657077)
chr6 (20-550)||(26762515-26763048)
chr6 (16-482)||(27337161-27337627)
chr6 (16-482)||(27397901-27398367)
chr6 (25-487)||(26143513-26143975)
chr6 (25-485)||(25483706-25484166)
chr6 (25-485)||(25580369-25580829)
chr6 (25-487)||(25539188-25539650)
chr6 (39-485)||(26056569-26057015)
chr6 (39-485)||(26076539-26076985)
chr6 (38-487)||(27530389-27530838)
chr6 (19-488)||(27717568-27718037)
chr6 (38-488)||(31285203-31285653)
chr6 (39-384)||(25511640-25511985)
chr6 (19-488)||(28793003-28793472)
chr6 (19-488)||(28786882-28787351)
chr6 (19-488)||(27610189-27610658)
chr6 (16-476)||(26803102-26803562)
chr6 (20-476)||(27592091-27592547)
chr6 (20-476)||(27676690-27677146)
chr6 (19-488)||(28781745-28782214)
chr6 (37-488)||(27603791-27604242)
chr6 (19-488)||(25492388-25492857)
chr6 (39-488)||(27697675-27698124)
chr6 (38-476)||(27679606-27680044)
chr6 (20-476)||(27426682-27427138)
chr6 (18-493)||(27215091-27215566)
chr6 (132-476)||(27705586-27705930)
chr6 (38-488)||(26623915-26624365)
chr6 (38-488)||(26729892-26730342)
chr6 (40-488)||(26824463-26824911)
chr6 (289-364)||(28140303-28140378)
chr6 (18-107)||(28227977-28228066)
chr6 (46-234)||(28326376-28326564)
chr6 (46-234)||(28504012-28504200)
chr6 (430-485)||(25511585-25511640)
chr6 (16-234)||(28235463-28235681)
chr6 (18-110)||(28243817-28243909)
chr6 (52-107)||(28182143-28182198)
chr6 (56-107)||(28296846-28296897)
chr6 (56-107)||(28515176-28515227)
chr6 (55-162)||(29469089-29469196)
chr6 (25-104)||(29827014-29827093)
chr6 (24-86)||(26812574-26812636)
chr6 (298-368)||(26937793-26937863)
chr6 (39-97)||(27705343-27705401)
chr6 (301-364)||(28227720-28227783)
chr6 (282-364)||(28097775-28097857)
chr6 (33-107)||(28240379-28240453)
chr6 (17-94)||(26938067-26938144)
chr6 (46-86)||(25074913-25074953)
chr6 (25-93)||(26950782-26950850)
chr6 (301-389)||(28297091-28297179)
chr6 (301-389)||(28514894-28514982)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (19-488)||(28126744-28127213)
chr1 (19-493)||(28163445-28163918)
chr1 (19-488)||(267409-267878)
chr1 (25-93)||(26136927-26136995)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (19-488)||(2608-3077)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (19-488)||(3781-4250)
scaffold0277 (19-488)||(12744-13213)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (19-488)||(8131-8600)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (37-488)||(18698483-18698934)
chr4 (38-488)||(18678644-18679094)
chr4 (37-476)||(18730587-18731026)
chr4 (38-476)||(18654561-18654999)
chr4 (20-476)||(18074417-18074873)
chr4 (37-476)||(18723168-18723607)
chr4 (25-203)||(5090025-5090203)
chr4 (279-389)||(5090282-5090392)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (19-488)||(29272907-29273376)
chr8 (46-157)||(35984274-35984385)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (20-476)||(60225-60681)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (36-95)||(16691904-16691963)
chr5 (282-381)||(16691618-16691717)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (18-234)||(57362-57578)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (43-381)||(3280410-3280748)
chr2 (25-93)||(17992290-17992358)
[»] scaffold0038 (5 HSPs)
scaffold0038 (18-107)||(28475-28564)
scaffold0038 (16-234)||(35625-35843)
scaffold0038 (18-110)||(43979-44071)
scaffold0038 (301-364)||(28218-28281)
scaffold0038 (33-107)||(40541-40615)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (74-155)||(3468248-3468329)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 523; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26862696 - 26862162
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26862696 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccatgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 26862597  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26862596 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 26862497  T
Q  216 cttaatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacataca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26862496 cttaatgttcaatttaactgtttttaaaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacataca 26862397  T
Q  316 ccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26862396 ccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcat 26862297  T
Q  416 cagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatgcaaaacacgttcggtcttgtccaagat 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26862296 cagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacgtgcaaaacacgttcggtcttgtccaagat 26862197  T
Q  516 gtctctgactatcttcccaataaactcatattcat 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26862196 gtctctgactatcttcccaataaactcatattcat 26862162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26885186 - 26884707
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26885186 gttctatctaccctatggcacgttagtaagtgtttatcacgagtggtaatgatgaccctgcttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagccaaagcct 26885087  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26885086 ctagctgctccattttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctatgtagtctttcctttatgagtggaattccctcactaacatctcctaa 26884987  T
Q  216 cttaatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacataca 315  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  26884986 cttaatgtttaatttaattgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaagttattatgagttgaattctccctgactttatgcagaaaacataca 26884887  T
Q  316 ccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcat 415  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26884886 cattcaaattgatcagcaacataattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaattcctaccatgtgtaccccttcgt 26884787  T
Q  416 cagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatgcaaaaca 495  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26884786 tagattccttatcaagaagcaattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacagggtatttggctacatgtaaaaca 26884707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26647595 - 26647058
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  26647595 gttctttctatcccatgacaggttagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcct 26647496  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || | |||||||||||||| |  || ||| ||    
T  26647495 ctagctgatccagttggttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaa 26647396  T
Q  216 cttaatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacataca 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  26647395 cttaatgttcactttaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcataca 26647296  T
Q  316 ccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcat 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26647295 ccttcaaattgatcagcaacaaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcat 26647196  T
Q  416 cagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatgcaaa---acacgttcggtcttgtccaa 512  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| | | ||||||   |    
T  26647195 cagattctttatcaagaagcaatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttgga 26647096  T
Q  513 gatgtctctgactatcttcccaataaactcatattcat 550  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26647095 gatgtcttcgactatcttcccaataaacttgtattcat 26647058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26753563 - 26753026
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  26753563 gttctttctatcccatgacaggttagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcct 26753464  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || | |||||||||||||| |  || ||| ||    
T  26753463 ctagctgatccagttggttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaa 26753364  T
Q  216 cttaatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacataca 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  26753363 cttaatgttcactttaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcataca 26753264  T
Q  316 ccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcat 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26753263 ccttcaaattgatcagcaacaaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcat 26753164  T
Q  416 cagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatgcaaa---acacgttcggtcttgtccaa 512  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| | | ||||||   |    
T  26753163 cagattctttatcaagaagcaatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttgga 26753064  T
Q  513 gatgtctctgactatcttcccaataaactcatattcat 550  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26753063 gatgtcttcgactatcttcccaataaacttgtattcat 26753026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26657077 - 26656544
Alignment:
Q  20 tttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctag 119  Q
    |||||||||| || ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  26657077 tttctatcccgtgacagtttagcaagtgtttatctctagtggtaatgatgactctgcttccacaaccgaaccaatcaagtcctcctgccaaagcctctag 26656978  T
Q  120 ctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactta 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26656977 ctgctccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaactta 26656878  T
Q  220 atgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacctt 319  Q
    || |||| | |||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26656877 atattcactctaacagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacacctt 26656778  T
Q  320 caaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcaga 419  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || | |||    
T  26656777 caaattgatcagcgacaaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttaga 26656678  T
Q  420 ttccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg---caaaacacgttcggtcttgtccaagatg 516  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| | | |||||||  |||||    
T  26656677 tcccttatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgtcggagatg 26656578  T
Q  517 tctctgactatcttcccaataaactcatattcat 550  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  26656577 tctttgactatattctcaataaacttgtattcat 26656544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26763048 - 26762515
Alignment:
Q  20 tttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctag 119  Q
    |||||||||| || ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  26763048 tttctatcccgtgacagtttagcaagtgtttatctctagtggtaatgatgactctgcttccacaaccgaaccaatcaagtcctcctgccaaagcctctag 26762949  T
Q  120 ctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactta 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26762948 ctgctccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaactta 26762849  T
Q  220 atgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacctt 319  Q
    || |||| | |||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26762848 atattcactctaacagtttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacacctt 26762749  T
Q  320 caaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcaga 419  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || | |||    
T  26762748 caaattgatcagcgacaaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttaga 26762649  T
Q  420 ttccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg---caaaacacgttcggtcttgtccaagatg 516  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| | | |||||||  |||||    
T  26762648 tcccttatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgtcggagatg 26762549  T
Q  517 tctctgactatcttcccaataaactcatattcat 550  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  26762548 tctttgactatattctcaataaacttgtattcat 26762515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 27337161 - 27337627
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27337161 gttctttctatcccatgacaggttagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcct 27337260  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||| || | |||||||||||||  | |||||| |||    
T  27337261 ctagctgatccagttggtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaa 27337360  T
Q  216 cttaatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacataca 315  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  27337361 cttaatgttcagttgaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatact 27337460  T
Q  316 ccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcat 415  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27337461 ccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcat 27337560  T
Q  416 cagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggc 482  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27337561 cagattcctcatcaagaagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggc 27337627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 482
Target Start/End: Original strand, 27397901 - 27398367
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27397901 gttctttctatcccatgacaggttagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcct 27398000  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||| || | |||||||||||||  | |||||| |||    
T  27398001 ctagctgatccagttggtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaa 27398100  T
Q  216 cttaatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacataca 315  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  27398101 cttaatgttcagttgaactgtttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatact 27398200  T
Q  316 ccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcat 415  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27398201 ccttcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcat 27398300  T
Q  416 cagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggc 482  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27398301 cagattcctcatcaagaagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggc 27398367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26143975 - 26143513
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgtt 124  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  26143975 atcccatgacaggctagtaagtgtttatcacgagtggtaatgatgaccctgcttccatgaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgct 26143876  T
Q  125 ccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgtt 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  26143875 ccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggtt 26143776  T
Q  225 caatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaat 324  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26143775 caatttaactgttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaat 26143676  T
Q  325 tgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattcca 424  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | || |||||  |||    
T  26143675 tgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagccca 26143576  T
Q  425 tatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacat 487  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26143575 tgtcaagaagcaatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 26143513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25484166 - 25483706
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgtt 124  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  25484166 atcccatgacaggctagtaagtgtttatcacgagtggtaatgatgactctgcttccatgaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgct 25484067  T
Q  125 ccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgtt 224  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  25484066 ccagtttgtcaacatcatcaacaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtc 25483967  T
Q  225 caatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaat 324  Q
     ||||||||| |||||  ||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25483966 aaatttaactatttttgaaaggagcatcttttggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaat 25483867  T
Q  325 tgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattcca 424  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | || |||||  |||    
T  25483866 tgatcagcaagaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagccca 25483767  T
Q  425 tatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 485  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25483766 tgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctac 25483706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25580829 - 25580369
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgtt 124  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  25580829 atcccatgacaggctagtaagtgtttatcacgagtggtaatgatgacactgcttccatgaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgct 25580730  T
Q  125 ccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgtt 224  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||     
T  25580729 ccagtttgtcaacatcatcaaaaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctactaacttaaagta 25580630  T
Q  225 caatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaat 324  Q
     ||||||||| || ||| ||| || |  |  ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25580629 aaatttaactattattaaaaggagataataatggagatgtttcaagttattaagaattgaaatctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaat 25580530  T
Q  325 tgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattcca 424  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||  |||    
T  25580529 tgatcagcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaccacatcctcagagccca 25580430  T
Q  425 tatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 485  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25580429 tgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctac 25580369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25539650 - 25539188
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgtt 124  Q
    |||||||| || | || ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  25539650 atcccatgacaggctaataaatgtgtatcacgagtggtaatgatgactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctctagctgct 25539551  T
Q  125 ccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgtt 224  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||| ||||||||  ||     
T  25539550 ctagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttttagatagtctttcctttatgattgttattccctcactaacatcttctaacttaccgtc 25539451  T
Q  225 caatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaat 324  Q
     ||||||||| |||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25539450 aaatttaactatttttgaaaggagcttcttttggagatgtttcaagttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaacttcaaat 25539351  T
Q  325 tgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattcca 424  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||  |||    
T  25539350 tgatcagcaacaaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagccca 25539251  T
Q  425 tatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacat 487  Q
      ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25539250 agtcaagaagcaatttcacttgttctattggggactgtaatccaacagggtatttggccacat 25539188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 39 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26057015 - 26056569
Alignment:
Q  39 tagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaaca 138  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  26057015 tagtaagcgtttatcacgagtggtaatgatgactctgcttccaagaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcgtctagctgctccagtttgtcaaca 26056916  T
Q  139 tcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgttt 238  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |  ||  ||||||||| |||    
T  26056915 tcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctaactgaccgtcaaatttaactattt 26056816  T
Q  239 ttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaa 338  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  26056815 ttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaataga 26056716  T
Q  339 attataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaat 438  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||| | |  |||||  |||| ||||||||||||    
T  26056715 attaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagcaat 26056616  T
Q  439 ttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 485  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26056615 ttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctac 26056569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 39 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26076985 - 26076539
Alignment:
Q  39 tagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaaca 138  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  26076985 tagtaagcgtttatcacgagtggtaatgatgactctgcttccaagaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcgtctagctgctccagtttgtcaaca 26076886  T
Q  139 tcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgttt 238  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| || |  ||  ||||||||| |||    
T  26076885 tcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaactattt 26076786  T
Q  239 ttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaa 338  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  26076785 ttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaataga 26076686  T
Q  339 attataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaat 438  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||| | |  |||||  |||| ||||||||||||    
T  26076685 attaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagcaat 26076586  T
Q  439 ttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 485  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26076585 ttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctac 26076539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 38 - 487
Target Start/End: Original strand, 27530389 - 27530838
Alignment:
Q  38 ttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaac 137  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27530389 ttagtaagtgtttgtttcgagtagtaatgatgactctactcccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaggcctctagctgatccagtttgtcaac 27530488  T
Q  138 atcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtt 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||| || | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27530489 atcatcaagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttgcttaatgattggaattccctgactaacacctcctaacttaatgtccaatctaactgtt 27530588  T
Q  238 tttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaa 337  Q
    |||| ||| || | ||  ||||||||||||||| |||    ||| |||||| |||| || || |  |||||||||| | ||||||||||||| ||||  |    
T  27530589 tttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatctgaagtcgaattcactctcacattttctagaaaacataaaacttcaaattgatcagcaatga 27530688  T
Q  338 aattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaa 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    ||||||| ||      
T  27530689 aattataaattgcttttgcaagtgttgatttacctatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcagatttttcatcaagatgccc 27530788  T
Q  438 tttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacat 487  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  27530789 tttcacatgttgtactcgggactgtaatccaacaggatatttggcaacat 27530838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 27717568 - 27718037
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || | ||    
T  27717568 ctttttatcccatgacaggttagtaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgactttgcttccacggccgaaccaatcaggtcctccagccaaagcatgta 27717667  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  27717668 gttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaactt 27717767  T
Q  219 aatgttcaattt-aactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacc 317  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||   ||||||||||||||| || || | ||||||||||   |     
T  27717768 aat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctccttctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagca 27717866  T
Q  318 ttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatca 417  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27717867 ttcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatca 27717966  T
Q  418 gattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    |||     |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  27717967 gatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 27718037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 38 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 31285653 - 31285203
Alignment:
Q  38 ttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaac 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |  || || | ||  ||||||||    
T  31285653 ttagtaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgactctgcttccacggccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcatgcagttgattcatattgtcaac 31285554  T
Q  138 atcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || | |||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||  || ||||    
T  31285553 atcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccaattgtt 31285454  T
Q  238 tttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaa 337  Q
    || | ||| |||| ||  ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||  ||| ||    
T  31285453 ttcaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataatccgtcaaattgatcaccaataa 31285354  T
Q  338 aattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaa 437  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||    
T  31285353 aattatagattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctcctatcccataaagtcctaccatgtgtacccctttattagtttccttatcaagaagcaa 31285254  T
Q  438 tttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    ||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  31285253 tttcacttgttgtattcgaaacttaaatccaacagggtaattggcaacatg 31285203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25511985 - 25511640
Alignment:
Q  39 tagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaaca 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25511985 tagtaagtgtttatcacgagtggtaatgatgactctgcttccaggaccgaaccagtcaagtcctccagccaaagcctctagctgctccagtttgtcaaca 25511886  T
Q  139 tcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgttt 238  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| || |  ||  ||||||||| |||    
T  25511885 tcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaactattt 25511786  T
Q  239 ttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaa 338  Q
    ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |    
T  25511785 ttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaataga 25511686  T
Q  339 attataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagta 384  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25511685 attaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctctagta 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28793472 - 28793003
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| || || || | ||    
T  28793472 ctttctatcccatgacttcttagtaagtgtttgtctcgagtcgtaatgatgaccctgcttccacggccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgta 28793373  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28793372 gttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaactt 28793273  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    ||| |||| || || |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||   || |||| ||||||| || || | ||||||||||   | |    
T  28793272 aattttcagttgaagtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatctatttgaagctgaactctctctcacattttcaagaaaacatgagcat 28793173  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||    
T  28793172 tcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcag 28793073  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    || |   |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28793072 atccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 28793003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28787351 - 28786882
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| || || || | ||    
T  28787351 ctttctatcccatgacttcttagtaagtgtttgtctcgagtcgtaatgatgaccctgcttccacggccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgta 28787252  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || | ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28787251 gttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaactt 28787152  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    ||| |||| || || |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |    
T  28787151 aattttcagttgaagtgtttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcat 28787052  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||    
T  28787051 tcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcag 28786952  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    || |   |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28786951 atccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 28786882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 27610189 - 27610658
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || | ||    
T  27610189 ctttttatcccatgacaggttagcaagtgtttgtctcgagtggcaatgatgactttgcttccacggccgaaccaatcaggtcctccagccaaagcatgta 27610288  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  27610289 gttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaactt 27610388  T
Q  219 aatgttcaattt-aactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacc 317  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||   ||||||||||||||| || || | ||||||||||   |     
T  27610389 aat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagca 27610487  T
Q  318 ttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatca 417  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27610488 ttcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatca 27610587  T
Q  418 gattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    |||     |||||||||| ||||||||| || |||| | ||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  27610588 gatctttcatcaagaagcgatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 27610658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26803562 - 26803102
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    |||||||||||  |||| |  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| || || |    
T  26803562 gttctttctatatcatgactggtcagtaaatgtttgtctcgagtggtaatgatgaccctgcttccatggccaaaccaatcaggtcctccagccaaagcat 26803463  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
     ||| || ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||   ||||    
T  26803462 gtagttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttatttctacacagtctttcctttataattggaatcccctcacaaacatgatctaa 26803363  T
Q  216 cttaatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacataca 315  Q
    ||| || ||||||  |  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||| |    
T  26803362 cttgattttcaatccagttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaa 26803263  T
Q  316 ccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcat 415  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||    
T  26803262 ccttcaaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgctgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcat 26803163  T
Q  416 cagattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    ||| | ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||||    
T  26803162 caggtccctcatcaagaagcgatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggta 26803102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 476
Target Start/End: Original strand, 27592091 - 27592547
Alignment:
Q  20 tttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctag 119  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  27592091 tttctatcccatgacagtctagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactctgcttccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcatctag 27592190  T
Q  120 ctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactta 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    |||||||| || ||| ||  ||||||||||    
T  27592191 ctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaactta 27592290  T
Q  220 atgttcaa-tttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    || ||||| || || |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||   || |||| ||||| | || || | ||||||||||   | |    
T  27592291 at-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcat 27592389  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||    
T  27592390 tcaaattgatcagcaataaagttataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcag 27592489  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    || |   |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  27592490 atccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27592547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 476
Target Start/End: Original strand, 27676690 - 27677146
Alignment:
Q  20 tttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctag 119  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  27676690 tttctatcccatgacagtctagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactctgcttccaggaccaaaccaatcgagtcttccagccaaagcctctag 27676789  T
Q  120 ctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactta 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    |||||||| || ||| ||  ||||||||||    
T  27676790 ctgatccagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaactta 27676889  T
Q  220 atgttcaa-tttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    || ||||| || || |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||   || |||| ||||| | || || | ||||||||||   | |    
T  27676890 at-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcat 27676988  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||| | |||||    
T  27676989 tcaaattgatcagcaataaaattataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcag 27677088  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    || |   |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  27677089 atccttcatcaagaagcgatttcatttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27677146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28782214 - 28781745
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| || || || | ||    
T  28782214 ctttctatcccatgacttcttagtaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgaccctgcttccacggccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgta 28782115  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28782114 gttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaactt 28782015  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    ||| |||| || || || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |    
T  28782014 aattttcagttgaagtgcttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcat 28781915  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    || || | ||||     
T  28781914 tcaaattgatcagcaattaagttataaactgcttttacaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatcctgactccattatcat 28781815  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    || |   | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28781814 atccttcaccaagaagcgatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 28781745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 488
Target Start/End: Original strand, 27603791 - 27604242
Alignment:
Q  37 gttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaa 136  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| || |||| || || |||| ||| ||  |||  | |||||    
T  27603791 gttagtaagtgtctgtctcgagtggtaatgatgaccctgcttccaagcccaaaccaatcaggttctcctgccaaagcctgtagttgccccatatcgtcaa 27603890  T
Q  137 catcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaattt-aactg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || || ||    
T  27603891 catcatcgagaatcaaaagaatcttcattgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaat-ttcaagttgaagtg 27603989  T
Q  236 tttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 335  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  27603990 tttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 27604089  T
Q  336 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagc 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||     |||||||||     
T  27604090 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaaga 27604189  T
Q  436 aatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
     |||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||| || ||||| |||||    
T  27604190 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaataggataattggcaacatg 27604242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 25492388 - 25492857
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  25492388 ctttctatcccatgactggttagtatgtgtttgtctcgagtggtaatgataactccgcttccacgaccgaaccaatcaagtccttcagccaaatcctcta 25492487  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||  ||||| | || ||||||||||||| ||  || ||||||    
T  25492488 gctgctccagtctgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctctctacatagtccttgttttatgattgcaattccctcactaacacttcttaactt 25492587  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    |||||  ||| ||||  ||||   ||| || |  | |||||||| ||||||| |  |  |||||||||||||||| || |     |||||||||| ||||    
T  25492588 aatgtctaatctaaccattttcgaaaggagtttttcctggagatctttcaagtttcttggagttgaattctctctcacatctcctagaaaacataaacct 25492687  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||    
T  25492688 tcaaattgatcagcaatgaagttatagattgattttgcaagtgttgatttacctaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaactcatcctcag 25492787  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    || ||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25492788 atacctcatctagaagcaatttcacgtgttgtactcgggattgtaatccaacagggtatttggcaacatg 25492857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 488
Target Start/End: Original strand, 27697675 - 27698124
Alignment:
Q  39 tagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaaca 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  27697675 tagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactctgcttccaggaccaaaccaatcgagtcctccagccaaagcctgtagctgatccagtttgtcaaca 27697774  T
Q  139 tcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgttt 238  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || | ||||||||| |||||| |||   |||| ||||| | | ||  |  |||||    
T  27697775 tcgtcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccgtcactaacatggtctaaattaatttccgatccagttgttt 27697874  T
Q  239 ttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaa 338  Q
    | | ||| |||| ||  |||||||||| |||| |||| | || |||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  27697875 taaaaaggagcttctcttggagatgttccaagttatttttagctgaattcattctcacattatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaaccaa 27697974  T
Q  339 attataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaat 438  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||||| |  |||||||||   ||    
T  27697975 attatagattgctcttgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaattgat 27698074  T
Q  439 ttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    ||||||  || |||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27698075 ttcactctttgtacttgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 27698124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 27680044 - 27679606
Alignment:
Q  38 ttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaac 137  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| || || |  || || | ||  ||||||||    
T  27680044 ttagtaagtctttgtttcgagtggtaatgatgactctgcttccacatccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcatgcagttgcttcaaattgtcaac 27679945  T
Q  138 atcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||      ||||    
T  27679944 atcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacataatctttcctttatgactggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaaacctgttgtt 27679845  T
Q  238 tttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaa 337  Q
    |||| ||| |||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  27679844 tttaaaaggagcttctcttggagatatttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacatgaaccttcgaattgatctgcaacaa 27679745  T
Q  338 aattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaa 437  Q
    ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||  |||||||||| |    
T  27679744 aattatagatttgtcttgcaagtgttgatttccccaaacctccaatgccataaattccaaccatatggaccccatcatcggatccctcatcaagaagcga 27679645  T
Q  438 tttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  27679644 tttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27679606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 476
Target Start/End: Original strand, 27426682 - 27427138
Alignment:
Q  20 tttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctag 119  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||| || || |  ||    
T  27426682 tttctatctcatgacaggctagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactcggcttccaggaccgaaccaatcaactcctccagccaaagcattcag 27426781  T
Q  120 ctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactta 219  Q
     || | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |  ||||||||||| | ||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  27426782 ttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaactta 27426881  T
Q  220 atgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacctt 319  Q
    || |||| || || ||| |||  ||| |||  || ||||| | |||||||||||||   || |||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||    
T  27426882 attttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaacctt 27426981  T
Q  320 caaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcaga 419  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||   ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||     
T  27426982 caaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagg 27427081  T
Q  420 ttccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    | ||  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  27427082 tccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27427138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 27215566 - 27215091
Alignment:
Q  18 tctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctct 117  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27215566 tctttctatcccatgataggttagtaactgtctgtttcgagtcgtaatgatgactctacttccaccaccaaaccaatcaagtcctccagccaaagcctct 27215467  T
Q  118 agctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaact 217  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |  |||  |||  |||||   || ||| ||||||||| || |||||||||    
T  27215466 agctgctctagtttgtcaacatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttgacatagcattttttttatctttgtaatcccctcactaacacctcctaact 27215367  T
Q  218 taatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacc 317  Q
    ||  ||  ||| |||| ||||| | ||| | ||  | ||| || ||||||||| ||||   ||||||||||||| | || |  |  |||||| ||  |||    
T  27215366 tatcgtctaatctaaccgttttcataaggatcttttcctgcaggtgtttcaagttatttaaagttgaattctctttcacatcttctagaaaatatgaacc 27215267  T
Q  318 ttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatca 417  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |    
T  27215266 ttcaaactgatcagcaatgaaattaaaaattgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagctccatgaagtcctaccatgtggacctcttcctta 27215167  T
Q  418 gattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatgcaaaa 493  Q
    ||| || | |||||||||||||| ||||||| || | |||  | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27215166 gatcccttgtcaagaagcaattttacttgttgtatttgggtatgtaatccaacagggtgtttggcaacatgtaaaa 27215091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 132 - 476
Target Start/End: Original strand, 27705586 - 27705930
Alignment:
Q  132 gtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaattta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||| | |||||| ||||||| | |||   ||||||| || ||| ||  |    
T  27705586 gtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacagcctttcctttatgaatggaatcccctcacaaacatgatctaactttattttcgatcca 27705685  T
Q  232 actgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcgg 331  Q
      ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27705686 gttgtttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagtcattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcag 27705785  T
Q  332 caacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaag 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||| | ||  ||||||    
T  27705786 caacaaaattataaattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctccaatgccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaag 27705885  T
Q  432 aagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    |||  |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  27705886 aagtgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27705930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 26624365 - 26623915
Alignment:
Q  38 ttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaac 137  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || ||    |   |||| ||    
T  26624365 ttagtaggtgtttgtttcgagtggtaattatgaccctgcttccacgtccgaaccaatcaagccctccagccaaagcatccagttgccttatactgtctac 26624266  T
Q  138 atcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || | || ||||||||||||| |||   | |||||||| | ||||  |  ||||    
T  26624265 atcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttgtt 26624166  T
Q  238 tttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaa 337  Q
    || | ||| |||| ||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26624165 ttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaa 26624066  T
Q  338 aattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaa 437  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||||||  |    
T  26624065 agttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagtga 26623966  T
Q  438 tttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    ||||||||||| || | | |||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  26623965 tttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatg 26623915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 26730342 - 26729892
Alignment:
Q  38 ttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaac 137  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || ||    |   |||| ||    
T  26730342 ttagtaggtgtttgtttcgagtggtaattatgaccctgcttccacgtccgaaccaatcaagccctccagccaaagcatccagttgccttatactgtctac 26730243  T
Q  138 atcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || | || ||||||||||||| |||   | |||||||| | ||||  |  ||||    
T  26730242 atcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttgtt 26730143  T
Q  238 tttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaa 337  Q
    || | ||| |||| ||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26730142 ttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaa 26730043  T
Q  338 aattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaa 437  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||| |  ||||||||||  |    
T  26730042 agttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagtga 26729943  T
Q  438 tttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    ||||||||||| || | | |||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  26729942 tttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatg 26729892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 26824911 - 26824463
Alignment:
Q  40 agtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacat 139  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  ||| |||||||||| ||||||||| || || ||||| || |||||||||||||  |    
T  26824911 agtaattgtttgtctcgagttgtaatgatgactctgctgccattaccgaaccaatcaaatcctccagccaaagcatctagttgctccagtttgtcaatgt 26824812  T
Q  140 catcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtttt 239  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||||   |||||| || ||||| | | |||| || | |||| || ||||||||||||| |    |  || ||||||    
T  26824811 catcgagaatcagaagaactttctttctgcgtagtctatcttttatgatttgaataccttgactaacacctcctaacttaatttcttctccaattgtttt 26824712  T
Q  240 tagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaa 339  Q
    || ||| || | ||  ||||||| || ||||| ||  | || |||||||||||| || || | ||||||||| | | ||||||||| ||| |||| | ||    
T  26824711 taaaaggagttgctcttggagattttccaagccatgcttagctgaattctctctcacgttctcaagaaaacaaaaaacttcaaatttatcagcaatagaa 26824612  T
Q  340 ttataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaatt 439  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| || |  |||||| |||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||  ||||||||||  |||    
T  26824611 ttaaaagttgcttttgcaagtgttgatttacctaaacctccaataccgtaaagtcctaccatatggaccacatcatcagattcgttatcaagaagagatt 26824512  T
Q  440 tcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26824511 tcacttgttgtactcgggactgtaatccaaccgggtatttggcaacatg 26824463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28140378 - 28140303
Alignment:
Q  289 tctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttg 364  Q
    ||||| || |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28140378 tctctcacattatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcggcaataaaattataaattgcttgtgcaagtgttg 28140303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28228066 - 28227977
Alignment:
Q  18 tctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagc 107  Q
    |||||| |||||||| | || ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28228066 tctttcaatcccatgacttgctagcaattgtttgtttcgagtggtaatgatcactttacttccaggaccaaaccaatcaagtcctccagc 28227977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28326564 - 28326376
Alignment:
Q  46 tgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacatcatcga 145  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||  |  || | ||||| || |||||||||||    
T  28326564 tgtttgtctcgagtggtaacgatcactctactgccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatcga 28326465  T
Q  146 gaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaact 234  Q
    ||||||| |||| |||| |||  |  || |||| |||||| | ||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  28326464 gaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgattggaactccatcattgacatctcctaacttaacgtacaattcaact 28326376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28504200 - 28504012
Alignment:
Q  46 tgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacatcatcga 145  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||  |  || | ||||| || |||||||||||    
T  28504200 tgtttgtctcgagtggtaacgatcactctactgccaggaccgaaccaatcaagtcctccagccaaaacctgcaattgcttcagttcgtgaacatcatcga 28504101  T
Q  146 gaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaact 234  Q
    ||||||| |||| |||| |||  |  || |||| |||||| | ||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  28504100 gaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgattggaactccatcattgacatctcctaacttaacgtacaattcaact 28504012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 430 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511585
Alignment:
Q  430 agaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 485  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctac 25511585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28235681 - 28235463
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||  |||    
T  28235681 gttctttcaatcccatgacttgctagcaattgtttgtctcgagtggtaatgatcactttacttccaggaccaaaccaatcaatttctcccgccaaaacct 28235582  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
      |  || |  |||| || ||||||||| |||||||| |||| |||| |||  |  || |||| |||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  28235581 gcaattgctttagttcgtgaacatcatctagaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgattggaattccctcattgacatctcctaa 28235482  T
Q  216 cttaatgttcaatttaact 234  Q
    || || || ||||| ||||    
T  28235481 ctcaacgtccaattcaact 28235463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28243909 - 28243817
Alignment:
Q  18 tctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaa 110  Q
    |||||| |||||||| | | |||| || ||| | ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28243909 tctttcaatcccatgactttttagcaaatgtctgtctcgagtggtaacgatcactctactaccaggaccgaaccaatcaagtcctccagctaa 28243817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28182198 - 28182143
Alignment:
Q  52 tctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28182198 tctcgagtggtaatgatcactttactaccaggaccaaaccaatcaattcctccagc 28182143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 107
Target Start/End: Original strand, 28296846 - 28296897
Alignment:
Q  56 gagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagc 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28296846 gagtggtaatgatcactttacttccaagaccaaaccaatcaagtcgtccagc 28296897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28515227 - 28515176
Alignment:
Q  56 gagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagc 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28515227 gagtggtaatgatcactttacttccaagaccaaaccaatcaagtcgtccagc 28515176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29469196 - 29469089
Alignment:
Q  55 cgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaa 154  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |  |||||||  || |||   ||||||||||| || |||| |||||    
T  29469196 cgagtggtgatgatgactctactgccacgaccaaaccaatcagatcttccagcaatagcctctaattgctcctccttgtcaacatcgtctagaagcaaaa 29469097  T
Q  155 gaatcttc 162  Q
    ||| ||||    
T  29469096 gaaccttc 29469089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29827093 - 29827014
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctcc 104  Q
    |||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29827093 atcccatgacttgttagcaaatgttggtctcgagtggtaatgatcactatgctgccaggaccaaaccaatcaagtcctcc 29827014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26812636 - 26812574
Alignment:
Q  24 tatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgacc 86  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26812636 tatcccatgacatgatagcaaatgtctgtctcgagtggtaatgatgactctacttccaggacc 26812574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26937863 - 26937793
Alignment:
Q  298 ttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgattt 368  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||  |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26937863 ttatgaagaaaacacaaactttcaaattgatcaccaatcaaattataaattgctcgtgcaagtgttgattt 26937793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 97
Target Start/End: Original strand, 27705343 - 27705401
Alignment:
Q  39 tagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaa 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  27705343 tagtaagtgtttatttcgagtggtgatgataactctgcttccagggccaaaccaatcaa 27705401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28227783 - 28227720
Alignment:
Q  301 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttg 364  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  28227783 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctataaaattataaactgcccttgcaagtgttg 28227720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 364
Target Start/End: Original strand, 28097775 - 28097857
Alignment:
Q  282 tgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttg 364  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28097775 tgaattttctctcacattgtgaaggaaacagacacattcaaattgaccagcaatgaaattataaaccgcttttgcaagtgttg 28097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28240453 - 28240379
Alignment:
Q  33 gcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagc 107  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||  || |||  ||||||||||| ||||||||    
T  28240453 gcatgttagcaaacgtttgtctcgagtggtaatgatgactctgctgtcaggactgaaccaatcaagccctccagc 28240379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26938144 - 26938067
Alignment:
Q  17 ttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaat 94  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||  |||||| | |||||| |||||| |||||    
T  26938144 ttctttcaatcccatgacatgatagcaaatgtttgtctcgagtggtaacaatgactttgcttccatgaccaagccaat 26938067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25074953 - 25074913
Alignment:
Q  46 tgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgacc 86  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25074953 tgtttgtctcgagtggtaatgatgactctgctgccacgacc 25074913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26950850 - 26950782
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaa 93  Q
    |||||||| |||| ||  || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  26950850 atcccatgacatgataacaaatgtttgtcacgagtggtaatgatgactctgctgccacgaccaagccaa 26950782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 389
Target Start/End: Original strand, 28297091 - 28297179
Alignment:
Q  301 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccata 389  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |   ||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||    
T  28297091 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctatggaattataaactgctctggcaagtgttgtctttcccatccctccagtcccata 28297179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28514982 - 28514894
Alignment:
Q  301 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccata 389  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |   ||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||    
T  28514982 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctatggaattataaactgctctggcaagtgttgtctttcccatccctccagtcccata 28514894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 28126744 - 28127213
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28126744 ctttctatcccatgacaggttagtaagtgtttctctcgagtggtaatgatgactttgcttccacgaccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcctcta 28126843  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||| ||||  ||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  28126844 gctgctccagtttgtcgacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctgcatagcctttgttttatgattgcaattccctcactaacacctcctaactt 28126943  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    ||||| ||||  ||||||||| | ||| ||||  |  ||||||||||||||  |||   |||||||| ||||||| || |  |  |||||||||| ||||    
T  28126944 aatgtccaatccaactgttttcaaaaggagcttttcttggagatgtttcaaattatatggagttgaaatctctctcacatcttctagaaaacataaacct 28127043  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  28127044 tcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccaataccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcat 28127143  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    || || |||| |||||||| |||||||||| |||| ||  || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  28127144 atcccttatcgagaagcaaattcacttgttgtacttggtcctgtaatccaacaggatatttggcaacatg 28127213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 493
Target Start/End: Original strand, 28163445 - 28163918
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  28163445 ctttctatcccatgacaggttagtaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgaccctgcttccacgaccgaaccaatcgagtcctccagccaaagcctcca 28163544  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||  ||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  28163545 gctgctccagtttgtcgacatcatcaagaatcaaaagaattttatttctatgtagcctttgttttatgattgtaattccctcactaacacctcctaactt 28163644  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    ||||| | || |||||||||  | ||| ||||| | |||||||||||||||| |     |||||||||||||||| || |  |  |||||||||| ||||    
T  28163645 aatgtccgatctaactgtttcaaaaag-agctcttcctggagatgtttcaagttggatggagttgaattctctctcacatcttctagaaaacataaacct 28163743  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  28163744 tcaaattgatcagcaatgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtatcataaagtcctaccatgtggacctcatcatcat 28163843  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatgcaaaa 493  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  28163844 atcccttatcgagaagcaatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacaggatattttgcaacatgtaaaa 28163918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 267409 - 267878
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||| || |||||| ||||||   || |||||||||||||||||||| || || |  |    
T  267409 ctttctatcccatgacaggttagtaattgcttgtctcgagtggtaacgacgactctgcttccatagccgaaccaatcaagtcctccagccaaagcatgca 267508  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
      ||||  |  | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| || | |||||| ||||||||| |||   |||||||    
T  267509 attgttttatatcgttaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaatgccctcactaacatggtctaactt 267608  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagcta-ttatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacc 317  Q
    ||| | ||||  |  |||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||| || | ||||||||||||||  ||    
T  267609 aatttccaatccagttgtttttaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttacttat-agctgaattttctctcacatcatgaagaaaacataatcc 267707  T
Q  318 ttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatca 417  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||    
T  267708 ttcaaattgatcagcaataaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatca 267807  T
Q  418 gattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  267808 gatccattatcaagaagcaatttcacttgttgtacttgagaccataatccaacagggtaattggcaacatg 267878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26136995 - 26136927
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaa 93  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  26136995 atcccatgacatgatagcaaatgtttgtctcgggtggtaatgatgactctactcccaggaccaagccaa 26136927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 2608 - 3077
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || | ||    
T  2608 ctttttatcccatgacaggttagtaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgactttgcttccacggccgaaccaatcaggtcctccagccaaagcatgta 2707  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  2708 gttgcttcatattgtcaacatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaactt 2807  T
Q  219 aatgttcaattt-aactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacc 317  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   |     
T  2808 aat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctccaactgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagca 2906  T
Q  318 ttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatca 417  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  2907 ttcaaattgatcagcaataaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatca 3006  T
Q  418 gattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    |||     |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  3007 gatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattggcaacatg 3077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 3781 - 4250
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| || |||| || || |||| ||    
T  3781 ctttctatcccatgacttcttagcaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgaccctgcttccaaggccaaaccaatcaggttctcctgccaaagcctgta 3880  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  || |||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||    
T  3881 gttgctccatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaactt 3980  T
Q  219 aatgttcaattt-aactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacc 317  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   |     
T  3981 aat-ttcaagttgaagtgtttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagca 4079  T
Q  318 ttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatca 417  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||    
T  4080 ttcaaattcatcagcaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtgggctccatgatca 4179  T
Q  418 gattccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    ||| |   |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4180 gatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 4250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 12744 - 13213
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| || || || | ||    
T  12744 ctttttatcccatgacttcttagtaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgaccctgcttccacggccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgta 12843  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || | ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  12844 gttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacttcctaactt 12943  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    | | |||  || || |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||  ||||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |    
T  12944 agttttctgttgaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcat 13043  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  13044 tcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcag 13143  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    || |   |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13144 atccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 8600 - 8131
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| || || || | ||    
T  8600 ctttttatcccatgacttcttagtaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgaccctgcttccacggccgaaccaatcaggtcctcctgccaaagcatgta 8501  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || | ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8500 gttgcttcatatcgtcaacatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacttcctaactt 8401  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    | | |||  || || |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||  ||||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |    
T  8400 agttttctgttgaagtgtttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcat 8301  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  8300 tcaaattgatcagaaataaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcag 8201  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    || |   |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8200 atccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatg 8131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 488
Target Start/End: Original strand, 18698483 - 18698934
Alignment:
Q  37 gttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaa 136  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||| || || |  || |||||||  |||||||    
T  18698483 gttagtaagtgtttgttacgagtggtaatgataactctgcttccacagccgaaccaatcacgtcctccagccaaagcatgcagttgttccaaattgtcaa 18698582  T
Q  137 catcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |   | |||    
T  18698583 catcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtgt 18698682  T
Q  237 ttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaaca 336  Q
    ||||| ||| || |||| |||||||||||||||   |||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||| |||| |    
T  18698683 ttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaata 18698782  T
Q  337 aaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagca 436  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| | || || ||||||||| |  |||||||||||     
T  18698783 aaattataaattgctttcgcaagtgttgatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaacatgcggactccatcatcagatcctttatcaagaagcg 18698882  T
Q  437 atttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
     ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18698883 ctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 18698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 38 - 488
Target Start/End: Original strand, 18678644 - 18679094
Alignment:
Q  38 ttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaac 137  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || || |  || |||||||  ||||  ||    
T  18678644 ttagtaagtgtttgttacgagtggtaatgataactctgcttccacaaccgaaccaatcacgtcctccggccaaagcatgcagttgttccaaattgtgcac 18678743  T
Q  138 atcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |  || ||||    
T  18678744 atcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtgtt 18678843  T
Q  238 tttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaa 337  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||||||||   |||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||| |||| ||    
T  18678844 tttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaataa 18678943  T
Q  338 aattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaa 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| | || || |||| ||||     |||||||||| |    
T  18678944 aattataaattgcttttgcaagtgttaatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaccatgcggactccatcataagatcattcatcaagaagcga 18679043  T
Q  438 tttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18679044 tttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatg 18679094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 476
Target Start/End: Original strand, 18730587 - 18731026
Alignment:
Q  37 gttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaa 136  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | |||||||  || ||||||||| |||||||||| || || |  || |||||||  |||||||    
T  18730587 gttagtaagtgtttgttacgagtggtaatgataactatgcttccacagccgaaccaatcacgtcctccagccaaagcatgcagttgttccaaattgtcaa 18730686  T
Q  137 catcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |   | |||    
T  18730687 catcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatatagggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtgt 18730786  T
Q  237 ttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaaca 336  Q
    ||||| ||| || |||| |||||||||||||||   |||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||| |||| |    
T  18730787 ttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaata 18730886  T
Q  337 aaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagca 436  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||  ||| |||| |  |||||||||||     
T  18730887 aaattataaattactttagcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccataagatcctttatcaagaagcg 18730986  T
Q  437 atttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||    
T  18730987 atttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18731026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 476
Target Start/End: Original strand, 18654561 - 18654999
Alignment:
Q  38 ttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaac 137  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || || |  ||  ||||||  ||||| ||    
T  18654561 ttagtaagtgtttgttacgagtggtaatgataactctgcttccacaaccgaaccaatcacgtcctccagccaaagcatgcagtggttccaaattgtccac 18654660  T
Q  138 atcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |  || ||||    
T  18654661 atcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtgtt 18654760  T
Q  238 tttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaa 337  Q
    |||| ||| || |||| |||||||||||||||   |||   || |||||| ||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||| |||| |     
T  18654761 tttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagatgaattttctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaatac 18654860  T
Q  338 aattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagcaa 437  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||  |||||||| |  ||||||||||| |    
T  18654861 aattattaattgattttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccatcagatcctttatcaagaagcga 18654960  T
Q  438 tttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||    
T  18654961 tttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18654999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18074873 - 18074417
Alignment:
Q  20 tttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctag 119  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||| || || |  ||    
T  18074873 tttctatctcatgacaggctagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactcggcttccaggaccgaaccaatcaactcctccagccaaagcattcag 18074774  T
Q  120 ctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactta 219  Q
     || | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |  ||||||||||| | ||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  18074773 ttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaactta 18074674  T
Q  220 atgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacctt 319  Q
    || |||| || || ||| |||  ||| |||  || ||||| | |||||||||||||   || |||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||    
T  18074673 attttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaacctt 18074574  T
Q  320 caaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcaga 419  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||   ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||     
T  18074573 caaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagg 18074474  T
Q  420 ttccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    | ||  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  18074473 tccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 18074417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 476
Target Start/End: Original strand, 18723168 - 18723607
Alignment:
Q  37 gttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaa 136  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||| || || |  || |||| ||  |||||||    
T  18723168 gttagtaattgtttgttacgagtggtaatgataactctgcttccagagccgaaccaatcaggtcctccagccaaagcatgcagttgtttcaaattgtcaa 18723267  T
Q  137 catcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||   ||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||| |  || |||    
T  18723268 catcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagccttttctttatataaggaattctctcactaacacctcctaagttaattttcagtgaaagtgt 18723367  T
Q  237 ttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaaca 336  Q
    ||||| ||| || |||| |||||||||||||||   |||   || |||||||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||| |||| |    
T  18723368 ttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacgttttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaata 18723467  T
Q  337 aaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagca 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||  ||| |||| |  |||||||||||     
T  18723468 aaattataaattccttttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccattagatcctttatcaagaagcg 18723567  T
Q  437 atttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||    
T  18723568 atttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18723607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 5090025 - 5090203
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgtt 124  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || |||| || ||  ||| ||| ||||    
T  5090025 atcccatgacattttagcaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgactctgctgccaagaccaaaccaatcaggttctccggccaaaacctgtagttgtt 5090124  T
Q  125 ccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcact 203  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| | ||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  5090125 tcagtttgtcaatatcatcgagaatcaaaagaactttctttctttgtagccttttctttatgattggaattccctcact 5090203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 389
Target Start/End: Original strand, 5090282 - 5090392
Alignment:
Q  279 agttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcct 378  Q
    ||||||||| ||||| || ||  |||||||||| | || |||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||    
T  5090282 agttgaattttctctcacattgggaagaaaacaaagacattcaaattgatgagcaatgaaattgtaaattgcttttccaagtgtggttttacccattcct 5090381  T
Q  379 ccagtaccata 389  Q
    ||||| |||||    
T  5090382 ccagtcccata 5090392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 29272907 - 29273376
Alignment:
Q  19 ctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctcta 118  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| || || | ||    
T  29272907 ctttttatcccatgacaagttagcaagtgtttgtctcgagtagtaatgatgactttgcttccacggccgaaccaatcatgtcctccagccaaagcatgta 29273006  T
Q  119 gctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactt 218  Q
    | || | ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||    
T  29273007 gttgcttcaaattatcaacatcatcgagaatcaaaagaattttctttctacttagcctctcctttataattggaatcccctcactaacatgatctaactt 29273106  T
Q  219 aatgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacct 318  Q
    ||| | ||||  |  |||||||| ||| || | ||  ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| || | |||||||||||||| | ||    
T  29273107 aatttccaatccagttgtttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaatct 29273206  T
Q  319 tcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcag 418  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||| | ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  29273207 tcaaattgatcagcaaaaaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagccaccaatcccataaattccaaccatatggatcccatcatcag 29273306  T
Q  419 attccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctacatg 488  Q
    || |  ||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29273307 atccattatcaagaagcgatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttggcaacatg 29273376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35984385 - 35984274
Alignment:
Q  46 tgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacatcatcga 145  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||  ||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  35984385 tgtttgtcccgagttgtaatgataactctgctgccagaaccaagccaatcaaaccctccaaccaaggcctctagctgttctattttgtcaacatcatcta 35984286  T
Q  146 gaatcaaaagaa 157  Q
    ||||||||||||    
T  35984285 gaatcaaaagaa 35984274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 60681 - 60225
Alignment:
Q  20 tttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctag 119  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||| || || |  ||    
T  60681 tttctatctcatgacaggctagtaagtgtttatctcgggtggtgatgatgactcggcttccaggaccgaaccaatcaactcctccagccaaagcattcag 60582  T
Q  120 ctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaactta 219  Q
     || | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |  ||||||||||| | ||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  60581 ttgcttcatattgtcaacgtcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaactta 60482  T
Q  220 atgttcaatttaactgtttttagaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacacctt 319  Q
    || |||| || || ||| |||  ||| |||  || ||||| | |||||||||||||   || |||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||    
T  60481 attttcagttgaagtgtctttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaacctt 60382  T
Q  320 caaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcaga 419  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||   ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||     
T  60381 caaattgatcagcaacaaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagg 60282  T
Q  420 ttccatatcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggta 476  Q
    | ||  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  60281 tccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 60225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16691963 - 16691904
Alignment:
Q  36 tgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatc 95  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16691963 tgttagtaagtgtttgtctcgagtggtaatgatgactctacttccaggaccaaaccaatc 16691904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 16691717 - 16691618
Alignment:
Q  282 tgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctcca 381  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||| | || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||   |||||||||| ||| || || ||||||    
T  16691717 tgaattttctctcacgtcatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccgattcctcca 16691618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 57362 - 57578
Alignment:
Q  18 tctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctct 117  Q
    |||||| |||||||| | || ||| || ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  57362 tctttcaatcccatgacctgctagcaattgttcgtctcgagtggtaatgatcactttactaccaggaccaaaccaatcaagtcctccagccaaaacctgt 57461  T
Q  118 agctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaact 217  Q
    |  || | ||| | || |||||||||||||||||| | || |||| |||  |  || |||| |||||| | ||||||||||||  |  ||||| ||||||    
T  57462 aattgcttcagctcgtgaacatcatcgagaatcaacaaaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgattggaattccctcgttgacatctactaact 57561  T
Q  218 taatgttcaatttaact 234  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  57562 taatgtccaattcaact 57578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3280748 - 3280410
Alignment:
Q  43 aagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacatcat 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||  | |  | ||| | || || || ||| ||||    
T  3280748 aagtgtttgtctcgagtggtaatgatcaccctactaccaacactaaaccaatcaagccctccagctaagacttgcacctgcttcaattcgttaacgtcat 3280649  T
Q  143 cgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactgtttttag 242  Q
    | |||| ||| |||| |||  | |  | ||| |||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||       
T  3280648 caagaaccaatagaacctttttccggtgtagcctttgctttatgattggaattccctcactactatctcctaacttaatgtccaatccaacagttttgga 3280549  T
Q  243 aagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaatta 342  Q
    |||||  ||||| |||||||| |  |  | ||  |  | |||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||    
T  3280548 aagaaaatccttttggagatgctctagaccatgttttgctgaattttctctcacattgtgaagaaaacatacacattcaaattgattagcaatgaaatta 3280449  T
Q  343 taaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctcca 381  Q
    |||| |||| ||||||| ||||  || ||||| ||||||    
T  3280448 taaactgctcttgcaagagttgtcttacccattcctcca 3280410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 93
Target Start/End: Original strand, 17992290 - 17992358
Alignment:
Q  25 atcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaa 93  Q
    |||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  17992290 atcccatgacatgttaacaaatgtttgtctcgagtggtaatgatgactctgctgccacgaccaagccaa 17992358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28564 - 28475
Alignment:
Q  18 tctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagc 107  Q
    |||||| |||||||| | || ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28564 tctttcaatcccatgacttgctagcaattgtttgtttcgagtggtaatgatcactttacttccaggaccaaaccaatcaagtcctccagc 28475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35843 - 35625
Alignment:
Q  16 gttctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcct 115  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||  |||    
T  35843 gttctttcaatcccatgacttgctagcaattgtttgtctcgagtggtaatgatcactttacttccaggaccaaaccaatcaatttctcccgccaaaacct 35744  T
Q  116 ctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaa 215  Q
      |  || |  |||| || ||||||||| |||||||| |||| |||| |||  |  || |||| |||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  35743 gcaattgctttagttcgtgaacatcatctagaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgattggaattccctcattgacatctcctaa 35644  T
Q  216 cttaatgttcaatttaact 234  Q
    || || || ||||| ||||    
T  35643 ctcaacgtccaattcaact 35625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 44071 - 43979
Alignment:
Q  18 tctttctatcccatggcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaa 110  Q
    |||||| |||||||| | | |||| || ||| | ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44071 tctttcaatcccatgactttttagcaaatgtctgtctcgagtggtaacgatcactctactaccaggaccgaaccaatcaagtcctccagctaa 43979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28281 - 28218
Alignment:
Q  301 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaattgcttttgcaagtgttg 364  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  28281 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctataaaattataaactgcccttgcaagtgttg 28218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40615 - 40541
Alignment:
Q  33 gcatgttagtaagtgtttatctcgagtggtaatgatgactctacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagc 107  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||  || |||  ||||||||||| ||||||||    
T  40615 gcatgttagcaaacgtttgtctcgagtggtaatgatgactctgctgtcaggactgaaccaatcaagccctccagc 40541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Original strand, 3468248 - 3468329
Alignment:
Q  74 tacttccacgaccaaaccaatcaagtcctccagctaatgcctctagctgttccagtttgtcaacatcatcgagaatcaaaag 155  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3468248 tacttccaaaaccgaaccaatcacgtcctccggctaatgcttgaatctgttccaatttgtcaacatcatcaagaatcaaaag 3468329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University