View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19444_high_40 (Length: 266)

Name: NF19444_high_40
Description: NF19444
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19444_high_40
NF19444_high_40
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (105-251)||(32766217-32766364)
chr2 (105-251)||(31091506-31091652)
chr2 (109-251)||(32764940-32765081)
chr2 (105-251)||(21733750-21733899)
chr2 (108-248)||(31090165-31090305)
chr2 (153-251)||(14704052-14704149)
chr2 (105-251)||(17330209-17330355)
chr2 (106-244)||(24459432-24459570)
chr2 (110-251)||(34037652-34037793)
chr2 (109-251)||(2910102-2910244)
chr2 (108-249)||(40000315-40000456)
chr2 (105-251)||(24458058-24458204)
chr2 (105-249)||(39016364-39016506)
chr2 (105-244)||(5914978-5915117)
chr2 (128-251)||(17466807-17466930)
chr2 (106-251)||(7073638-7073783)
chr2 (105-249)||(2911468-2911616)
chr2 (114-241)||(38853762-38853889)
chr2 (139-249)||(33161799-33161909)
chr2 (127-244)||(5914324-5914441)
chr2 (139-248)||(7412124-7412233)
chr2 (159-251)||(17466093-17466185)
chr2 (109-236)||(34582664-34582791)
chr2 (154-248)||(37607149-37607243)
chr2 (105-251)||(39015003-39015149)
chr2 (168-251)||(38984967-38985051)
chr2 (105-251)||(31814323-31814467)
chr2 (100-217)||(8420006-8420123)
chr2 (109-241)||(38854791-38854923)
chr2 (109-241)||(31443234-31443365)
chr2 (176-251)||(39999022-39999096)
chr2 (194-248)||(10728990-10729044)
chr2 (194-240)||(26586285-26586331)
chr2 (157-218)||(12746213-12746274)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (105-251)||(32898424-32898570)
chr8 (105-251)||(35177393-35177539)
chr8 (105-251)||(35178784-35178929)
chr8 (106-251)||(10407563-10407708)
chr8 (109-251)||(5738002-5738144)
chr8 (100-251)||(1952949-1953099)
chr8 (109-251)||(5965421-5965563)
chr8 (99-206)||(41753990-41754097)
chr8 (105-251)||(41754776-41754919)
chr8 (168-251)||(45476223-45476306)
chr8 (153-251)||(28619035-28619133)
chr8 (105-251)||(30134564-30134710)
chr8 (168-251)||(5736903-5736986)
chr8 (177-251)||(45476542-45476616)
chr8 (109-251)||(59554-59696)
chr8 (170-251)||(10406269-10406350)
chr8 (159-251)||(28524810-28524902)
chr8 (109-241)||(43539107-43539239)
chr8 (175-242)||(32565696-32565763)
chr8 (158-212)||(41121160-41121214)
chr8 (153-218)||(12637770-12637835)
chr8 (199-251)||(41122730-41122782)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (105-249)||(10332984-10333128)
chr1 (105-251)||(9339644-9339790)
chr1 (105-251)||(32665749-32665895)
chr1 (105-251)||(7945533-7945679)
chr1 (105-251)||(10333165-10333311)
chr1 (106-246)||(7944156-7944294)
chr1 (105-244)||(5782412-5782551)
chr1 (108-251)||(6612420-6612563)
chr1 (105-251)||(9341004-9341150)
chr1 (105-251)||(22856678-22856824)
chr1 (105-251)||(52440539-52440684)
chr1 (105-251)||(52439477-52439619)
chr1 (109-249)||(8975161-8975301)
chr1 (106-250)||(34088449-34088585)
chr1 (190-251)||(22857558-22857619)
chr1 (158-251)||(6613957-6614051)
chr1 (158-248)||(50107185-50107275)
chr1 (105-215)||(3117647-3117757)
chr1 (109-248)||(11060766-11060905)
chr1 (188-251)||(32664585-32664647)
chr1 (134-244)||(5783095-5783205)
chr1 (154-216)||(25037925-25037987)
chr1 (154-216)||(25043137-25043199)
chr1 (117-209)||(44019996-44020088)
chr1 (137-248)||(11829939-11830050)
chr1 (109-251)||(1407642-1407784)
chr1 (190-251)||(534518-534579)
chr1 (202-251)||(33342511-33342560)
chr1 (117-217)||(1001164-1001264)
chr1 (105-165)||(2923861-2923921)
chr1 (51-103)||(12173238-12173290)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (104-251)||(4592858-4593005)
chr5 (105-251)||(2464667-2464813)
chr5 (105-251)||(8074449-8074594)
chr5 (105-249)||(546017-546160)
chr5 (105-251)||(9538028-9538174)
chr5 (105-251)||(21069287-21069433)
chr5 (106-251)||(19182949-19183094)
chr5 (100-251)||(28591092-28591244)
chr5 (105-250)||(2466753-2466899)
chr5 (44-177)||(13651173-13651305)
chr5 (105-251)||(14891126-14891268)
chr5 (139-251)||(32641705-32641817)
chr5 (105-249)||(40612640-40612784)
chr5 (105-251)||(25590429-25590574)
chr5 (106-251)||(19186199-19186344)
chr5 (108-251)||(9537024-9537166)
chr5 (105-244)||(16611726-16611865)
chr5 (144-251)||(32640325-32640432)
chr5 (105-251)||(8075812-8075958)
chr5 (144-251)||(544685-544792)
chr5 (109-251)||(31947016-31947158)
chr5 (140-241)||(19271375-19271476)
chr5 (111-251)||(16978996-16979136)
chr5 (109-201)||(18400192-18400284)
chr5 (147-251)||(28589739-28589843)
chr5 (115-213)||(13483029-13483126)
chr5 (170-216)||(14881010-14881056)
chr5 (155-251)||(4594080-4594174)
chr5 (168-212)||(13483174-13483218)
chr5 (158-250)||(35538281-35538373)
chr5 (167-246)||(18004698-18004777)
chr5 (109-248)||(26327054-26327193)
chr5 (105-151)||(24900411-24900457)
chr5 (197-251)||(40611350-40611404)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (106-251)||(44333138-44333281)
chr7 (102-251)||(48646044-48646193)
chr7 (105-251)||(48777254-48777401)
chr7 (105-251)||(7258273-7258419)
chr7 (105-251)||(44334429-44334574)
chr7 (109-251)||(7259663-7259805)
chr7 (109-251)||(43457459-43457601)
chr7 (105-251)||(48788651-48788797)
chr7 (108-249)||(46286504-46286645)
chr7 (105-249)||(48647424-48647568)
chr7 (100-251)||(10899052-10899203)
chr7 (105-251)||(35727697-35727842)
chr7 (105-251)||(42477379-42477524)
chr7 (108-251)||(30924988-30925130)
chr7 (105-251)||(35729065-35729211)
chr7 (137-248)||(34888905-34889016)
chr7 (110-244)||(8375569-8375703)
chr7 (109-251)||(12223678-12223820)
chr7 (105-251)||(39708101-39708247)
chr7 (158-251)||(13578300-13578392)
chr7 (105-251)||(8048763-8048909)
chr7 (119-229)||(8374926-8375036)
chr7 (105-215)||(45583682-45583792)
chr7 (160-251)||(45584475-45584566)
chr7 (106-251)||(19433913-19434058)
chr7 (95-251)||(12220011-12220166)
chr7 (155-251)||(44529076-44529172)
chr7 (105-251)||(5930112-5930257)
chr7 (154-246)||(44530595-44530687)
chr7 (167-251)||(32793231-32793315)
chr7 (109-179)||(385662-385732)
chr7 (109-207)||(34704911-34705009)
chr7 (139-248)||(2677768-2677877)
chr7 (148-206)||(10894391-10894449)
chr7 (109-186)||(21062819-21062896)
chr7 (188-249)||(46287385-46287446)
chr7 (139-251)||(7509450-7509562)
chr7 (157-241)||(8879532-8879616)
chr7 (194-246)||(24287567-24287619)
chr7 (196-251)||(33060899-33060954)
chr7 (65-103)||(33474296-33474334)
chr7 (153-235)||(33607618-33607700)
chr7 (194-251)||(30917800-30917857)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (106-251)||(48572984-48573129)
chr3 (99-251)||(36278944-36279096)
chr3 (105-232)||(17700516-17700643)
chr3 (100-251)||(55388066-55388217)
chr3 (109-232)||(17701917-17702040)
chr3 (105-251)||(52316977-52317123)
chr3 (105-250)||(52318297-52318442)
chr3 (105-217)||(19114531-19114643)
chr3 (107-251)||(20464069-20464213)
chr3 (105-244)||(33428421-33428560)
chr3 (105-244)||(47118037-47118176)
chr3 (102-244)||(45600925-45601066)
chr3 (105-218)||(2592019-2592132)
chr3 (146-251)||(36280296-36280401)
chr3 (105-249)||(2591625-2591769)
chr3 (144-251)||(53959079-53959186)
chr3 (105-251)||(3671037-3671182)
chr3 (105-251)||(34263803-34263949)
chr3 (153-251)||(48574438-48574536)
chr3 (110-251)||(50753820-50753961)
chr3 (105-246)||(48808362-48808505)
chr3 (107-251)||(55389448-55389592)
chr3 (105-244)||(47075337-47075476)
chr3 (139-228)||(11773053-11773142)
chr3 (105-244)||(19115133-19115271)
chr3 (100-217)||(49261550-49261664)
chr3 (105-251)||(53957673-53957817)
chr3 (159-241)||(40205934-40206016)
chr3 (116-182)||(19331117-19331183)
chr3 (159-248)||(40206919-40207009)
chr3 (132-206)||(47427885-47427959)
chr3 (194-251)||(48809634-48809690)
chr3 (109-252)||(26652583-26652725)
chr3 (196-251)||(36827454-36827509)
chr3 (123-251)||(612230-612358)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (105-244)||(53771035-53771174)
chr4 (105-251)||(42278047-42278193)
chr4 (106-251)||(47878463-47878608)
chr4 (109-248)||(47874566-47874704)
chr4 (105-251)||(31844720-31844865)
chr4 (110-241)||(26172931-26173062)
chr4 (105-244)||(48740006-48740145)
chr4 (105-251)||(26170638-26170784)
chr4 (99-251)||(39868914-39869064)
chr4 (105-214)||(54574423-54574532)
chr4 (105-251)||(4703196-4703342)
chr4 (153-251)||(50694795-50694893)
chr4 (123-251)||(21623096-21623224)
chr4 (104-244)||(53770330-53770470)
chr4 (159-249)||(4701817-4701907)
chr4 (153-251)||(21621869-21621967)
chr4 (105-251)||(31844934-31845080)
chr4 (115-248)||(42391868-42392003)
chr4 (119-244)||(26685408-26685528)
chr4 (105-241)||(44158502-44158638)
chr4 (105-208)||(19051253-19051356)
chr4 (166-251)||(19050297-19050382)
chr4 (154-213)||(54574822-54574881)
chr4 (194-248)||(32244361-32244415)
chr4 (194-251)||(24753540-24753597)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (107-251)||(79073-79217)
scaffold0039 (105-251)||(79662-79808)
scaffold0039 (110-186)||(74357-74433)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (106-218)||(116054-116166)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (105-251)||(30747997-30748143)
chr6 (105-244)||(31218953-31219092)
chr6 (109-244)||(31219146-31219281)
chr6 (105-251)||(23507947-23508092)
chr6 (109-241)||(12676459-12676591)
chr6 (134-248)||(24621104-24621218)
chr6 (128-179)||(6468832-6468883)
chr6 (59-104)||(19645948-19645993)
chr6 (203-251)||(10855902-10855950)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (109-250)||(5601-5742)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32766364 - 32766217
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32766364 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 32766265  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgtt-aaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32766264 tatcactttagtccttgacgttaaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 32766217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31091652 - 31091506
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31091652 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 31091553  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31091552 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31091506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Original strand, 32764940 - 32765081
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32764940 aaatagtcactttagtccctgattctgcagctagttgtcatataggtctctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgttatc 32765039  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32765040 actttaatccctgacgttaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 32765081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21733899 - 21733750
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcat---gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  21733899 gagcaaatagtcactctagtccctgactttgtacatcgttgtcacaaaggtccctgactcatcatgattaaatacaaataagtctctgactctgcacttc 21733800  T
Q  202 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21733799 cgtcatcactttagttgttgcagttaaaaaattctgttaagtgatgatgt 21733750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Original strand, 31090165 - 31090305
Alignment:
Q  108 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 207  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  31090165 caaatagtcaatttagtccctgattctgcagctcgctgtcacataggtccttgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttat 31090264  T
Q  208 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
     | |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  31090265 gattttagtccctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatga 31090305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Original strand, 14704052 - 14704149
Alignment:
Q  153 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14704052 ggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctcactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 14704149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17330355 - 17330209
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  17330355 gagcaaatagtcgctttagtccttgattctgcagctcactgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcatttccgt 17330256  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  17330255 tatcactttagtccatgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 17330209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24459570 - 24459432
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||  ||    
T  24459570 agcaaagagtcactttggtccctgactctgcatctcgctgtcacataggtccctgaatcaggattaaatacaaataagtctctgaccctgcacttctatt 24459471  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  24459470 atcactttagtccctgacattaaaaaaatatgttaagtg 24459432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34037793 - 34037652
Alignment:
Q  110 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||| |  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||    
T  34037793 aatagtcactttagtccttgactctgcaccttgctgtcataaaggtccataactcaggattaaatacaaataagtctatgactctgcacttctgttatca 34037694  T
Q  210 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34037693 ctttagttcccgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 34037652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Original strand, 2910102 - 2910244
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | |||| |||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||    
T  2910102 aaataatcactttagtctttgattttgcagctcgctgtcacatagatccctgactcgggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttcctttgtc 2910201  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2910202 actttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 2910244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40000456 - 40000315
Alignment:
Q  108 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  40000456 caaattgtcactttggtccctgactctgcacctcgctgttacatagatccctgattgaggattaaatacaaataagtctctaaccctgcacttccgttat 40000357  T
Q  208 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40000356 cactttattccctgacgttaagaaaatctgttaagtgatgat 40000315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 24458058 - 24458204
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||| | ||||| |||    
T  24458058 gagcaaatagtcactttagtccctgattatgcagctcgctatcacataggtccctgactcaaaattaaatacaaataagtttctgactctacactttcgt 24458157  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  24458158 tatcactttagtctctaacgttaaaaaaatctattaagtgataatgt 24458204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39016506 - 39016364
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccct--gactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttcc 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||   || ||  |||||| |||||||||||||||||||    ||| |||||||||    
T  39016506 gagcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcacatacatctctctgactcaggattaaatacaaataagtc----actctgcacttcc 39016411  T
Q  203 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39016410 gttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgat 39016364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5915117 - 5914978
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| || ||||  |||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  5915117 gagcaaatagtcactttagtccatgactctgcacctcgctttcaaataggtctttgactcagaattaaatacaaagaagtcactaactctgcacttccgt 5915018  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||| ||| |||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  5915017 tatcaccttaatccccgacgttaaataattctgttaagtg 5914978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17466930 - 17466807
Alignment:
Q  128 tgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgtta 227  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||    
T  17466930 tgactctgcacctcgctgtcacataagccgctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtctaagacgtta 17466831  T
Q  228 aaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  17466830 aataattctgttaagtgatgatgt 17466807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Original strand, 7073638 - 7073783
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||| ||   |||| ||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  7073638 agcaaatagtcactttagtccttcattctgcagcttactgtcgcataggtctctgattcgggattaaatacaaataagtctctgattctgcacttccgtt 7073737  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  7073738 atcactttagtccctgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 7073783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2911616 - 2911468
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  | |||| |||| ||||||||  | || |||||||   ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  2911616 gagcaaatagtcactttggtctctggttctgcagctcgctgtcacataaggccatgactcaaagttaaatataaataagtctctgactttgcacttccgt 2911517  T
Q  205 tatcactt----tagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    ||||||||    |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  2911516 tatcactttagttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 2911468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 38853762 - 38853889
Alignment:
Q  114 gtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 213  Q
    |||||||| |||||||||| | ||  || |||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  38853762 gtcactttggtccctgactctacacttcattgtcataaaggtctctgactcaggattaaatacaaagtagtccctaaatgtgcacttccgttatcaattt 38853861  T
Q  214 agtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||    
T  38853862 agtcactgacgttaaataattatgttaa 38853889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 249
Target Start/End: Original strand, 33161799 - 33161909
Alignment:
Q  139 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 238  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || | |||||||| |||| ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  33161799 ctcgttgtcacaaaggtctctgccttaggattaaatgcaaagaagtctcagactatgtacttccgttatcactttagtccttgacgttaaataattttgt 33161898  T
Q  239 taagtgatgat 249  Q
    |||||||||||    
T  33161899 taagtgatgat 33161909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 5914324 - 5914441
Alignment:
Q  127 ctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgtt 226  Q
    |||||| |||| |||||||| | || |||| ||||||||  |||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  5914324 ctgactttgcacctcgttgtgatataggtctctgactcacaattaaatacaaagaagtcagtgactttgcactcccgttatcactttagaccatgacgtt 5914423  T
Q  227 aaaaaattatgttaagtg 244  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  5914424 aaataattctgttaagtg 5914441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 248
Target Start/End: Original strand, 7412124 - 7412233
Alignment:
Q  139 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 238  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||| ||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||    
T  7412124 ctcgttgtcacatagatctctgactcaagattaaatataaagaagtcactgatagtgcacttccgttatcactttagtccctaacattaaataattatgt 7412223  T
Q  239 taagtgatga 248  Q
    ||||||||||    
T  7412224 taagtgatga 7412233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 251
Target Start/End: Original strand, 17466093 - 17466185
Alignment:
Q  159 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || || ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17466093 tgactcaggattaaatacaaagatatctctgactctgcacttccgttttcactttagtccctgacgtgaaacaattatgttaagtgatgatgt 17466185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34582791 - 34582664
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| || | ||| |||  ||||  ||||||  |||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||    
T  34582791 aaatggtcacgttagtccctgactctgcaccttgctgttacaaaggtcattgactcgggattaaatacaaagtagtccctgaatgtgcacttccgttatc 34582692  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattat 236  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  34582691 actttagtccctgacgttaaataattat 34582664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 248
Target Start/End: Original strand, 37607149 - 37607243
Alignment:
Q  154 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  37607149 gtccctaactcatgattaaatacaaggtagtcctttaatgtgcacttccgttatcactttagtccctgacgttatataattatgttaactgatga 37607243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 39015003 - 39015149
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| | |    
T  39015003 gagcaaataatcacttttgtccctgactctgcacctcgctgccacatagatccttgactcaggattaaatacaaatacgtctttgactctgcactttcat 39015102  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||| ||||||   |  |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39015103 tatcattttagtttctaacgttaaaaatatttgttaagtgatgatgt 39015149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38985051 - 38984967
Alignment:
Q  168 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaa-aaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38985051 attaaatacaaagaagtccttgactctgcacttccgttatcactttagtcactaacgttaaataaattatgttaagtgttgatgt 38984967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31814467 - 31814323
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||| ||| | |  |||| ||||||||  |||||||| ||| ||||   | ||| |||||||||||    
T  31814467 gagcaaatagtcactttagtcatttactctgcacctcgctgttaaa--ggtctctgactcagaattaaatataaagaagtttttgactctgcacttccgt 31814370  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31814369 tatcactttagtccctagcattaaataattctgttaagtgatgatgt 31814323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Original strand, 8420006 - 8420123
Alignment:
Q  100 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 199  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||   |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||||    
T  8420006 aaaatgagtaaatggtcactttggtccctgactctgcatttcgcggtcacaaatgtccctgagtcaagattaaatacaaagtagtccctgaatgtgcact 8420105  T
Q  200 tccgttatcactttagtc 217  Q
    || ||||||| |||||||    
T  8420106 tctgttatcagtttagtc 8420123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Original strand, 38854791 - 38854923
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||  ||| ||||| | |||||||  ||||||    
T  38854791 aaatagtcactttggtccctgactctacacttcgttgtcataaaggtctttgactcaggattaaatacaaagtagttcctaaatgtgcacttatgttatc 38854890  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    | |||||||  ||  |||||| |||||||||||    
T  38854891 aatttagtcactgaagttaaataattatgttaa 38854923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31443365 - 31443234
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||  ||||| || ||||||||||||  ||||||| |   |||||||  ||||||    
T  31443365 aaatggtcactttagtctctgactctgcatctcgttgtcacaaaagtcattgacttataattaaatacaaagtagtccctga-agtgcacttatgttatc 31443267  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    | ||||||| ||| | ||||||| || ||||||    
T  31443266 agtttagtctttgactttaaaaacttttgttaa 31443234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 39999022 - 39999096
Alignment:
Q  176 caaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||| | | |||||||| | |||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39999022 caaataagtccttgattttgcact-cggttatcactttaatctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 39999096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 248
Target Start/End: Original strand, 10728990 - 10729044
Alignment:
Q  194 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10728990 tgcacttccgttatcagtttagcccctgacgttaaaaacttatgttaactgatga 10729044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26586331 - 26586285
Alignment:
Q  194 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgtta 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  26586331 tgcacttccgttatcactttagtctctggcgttaaataattatgtta 26586285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12746274 - 12746213
Alignment:
Q  157 cctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  12746274 cctgactcaggattaaatacaaagtagttcctgaatgtgcccttccgttatcactttagtcc 12746213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32898570 - 32898424
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32898570 gagcaaatagtcactttagtccctgactctgcaactcactgtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 32898471  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32898470 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 32898424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 35177393 - 35177539
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35177393 gagcaaatagtcaatttagtccctaattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactccggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 35177492  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||    
T  35177493 tatcactttagtccctgacgttaaaataatctgttaagtgatgatgt 35177539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35178929 - 35178784
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  35178929 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacatcgctgtcatattggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgattctgcacttccgt 35178830  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35178829 tatcactttagtccctgacgttaaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 35178784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10407708 - 10407563
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||  |||||||| ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10407708 agcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcactgtcacataggtcattgacttaggattaaacacaaataagtccataactttgcacttccgtt 10407609  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10407608 atcactttagttcctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10407563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5738144 - 5738002
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   | ||| || ||||||||||||    
T  5738144 aaatggtcactttagttcctgactttgcatatcgttgtgacataggtccatgactcaagattaaatacaaagaagttattgactctgtacttccgttatc 5738045  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5738044 acttcagtctttggcgttaaataattctgttaagtgatgatgt 5738002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1953099 - 1952949
Alignment:
Q  100 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 199  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || | || |||||| | ||||| |||||||||||||  | ||| || |||    
T  1953099 aaaaagagtaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgttgtcatatagatctctgact-aggattacatacaaataagtctatgactctgtact 1953001  T
Q  200 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  1953000 tccgttatcactttagtctctgacgttaaataaatctgttaagtgatgatgt 1952949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5965563 - 5965421
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||||||| || |||| |||| | | || ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||    
T  5965563 aaatagtcatttcagtctctgattttacacctcgttgtcacaaatgtccctgactcaggattaaatacaaagaagtctttgactctgcacttccgttatc 5965464  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||  || |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  5965463 actttagtctctgacgttaaatgattatgttaagtaatgatgt 5965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 206
Target Start/End: Original strand, 41753990 - 41754097
Alignment:
Q  99 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| | |||    
T  41753990 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctggttctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaacaagtccctgactctacac 41754089  T
Q  199 ttccgtta 206  Q
    || |||||    
T  41754090 tttcgtta 41754097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41754919 - 41754776
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||    
T  41754919 gagcaaatagtcactttaatcc-tgattctgcacctcgctgtcacatagatctctgactcaggattaaatacaaacaagttcctgactctacacttccgt 41754821  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41754820 tattactttag-ccctgccgttaaaaaa-actgttaagtgatgatgt 41754776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 251
Target Start/End: Original strand, 45476223 - 45476306
Alignment:
Q  168 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45476223 attaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgttatcactttagtctctcccgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 45476306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Original strand, 28619035 - 28619133
Alignment:
Q  153 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28619035 ggtccctgacccatgattaaatacaaagaaatcattgactctgcactttcgttatcactttagtctcggccgttaaataattttgttaagtgatgatgt 28619133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 30134564 - 30134710
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||   | ||| |||||||| ||    
T  30134564 gagcaaataatcactttagtccttaactctgcacctcgctgtcacaaaggtcccctactcatgattaaatacaaagaagtgtgtgactctgcacttctgt 30134663  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| |   |  ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  30134664 tatcactttaatatctaacgttatataattatgttaggtgatgatgt 30134710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 251
Target Start/End: Original strand, 5736903 - 5736986
Alignment:
Q  168 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5736903 attaaatacaaagaaatctctaactctacactttcgttatcactttagtccctcacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 5736986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45476616 - 45476542
Alignment:
Q  177 aaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45476616 aaataagtcgctgactctgcacttctcttatcactttagtctctgtcgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 45476542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Original strand, 59554 - 59696
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |  |||||||||||| ||| || ||||||  ||||||| | |  | |  || || |||    
T  59554 aaatagtcactttagtccctgactttacacctcgctgtcactttagtccctgactcaggataaactacaaaatagtccctgaatgggtagatctgtcatc 59653  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  59654 agtttagtccttacaattaaaaaattatgttaaccgatgatgt 59696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 251
Target Start/End: Original strand, 10406269 - 10406350
Alignment:
Q  170 taaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||| ||| ||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10406269 taaataaaaacaagtctctgactctgcacttctattatcactttagtccctggtgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10406350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 251
Target Start/End: Original strand, 28524810 - 28524902
Alignment:
Q  159 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  28524810 tgactcaggattaaatacaaagtaatccttgaatgtgcacttccgttatcattttagtctctgacgttaaataattttgttaactgatgatgt 28524902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Original strand, 43539107 - 43539239
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||| |  ||||| |||||| ||| || ||||||  ||||||| | | || |  || ||||||    
T  43539107 aaatagtcactttggtccctaactttgcacctcgctgtcactttagtccccgactcaggataaactacaaaatagtccctgaatgtgtatatctgttatc 43539206  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43539207 agtttaatccttaccgttaaaaaattctgttaa 43539239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32565763 - 32565696
Alignment:
Q  175 acaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaag 242  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||    
T  32565763 acaaagaagtcccaaattttgcactttcgttatcactttagtcattgatattaaataattatgttaag 32565696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Original strand, 41121160 - 41121214
Alignment:
Q  158 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||  |||||||||    
T  41121160 ctgactcatgattaaatacaaagaagtctctgactatgcacttctattatcactt 41121214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12637835 - 12637770
Alignment:
Q  153 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 218  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  12637835 ggtccctaactcaggattgaatacaaagtagttcctgaatgtgcacttccgttatcactttagtcc 12637770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41122782 - 41122730
Alignment:
Q  199 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||| |||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41122782 ttccattatcattttagtgtttgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 41122730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Original strand, 10332984 - 10333128
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10332984 gagcaaatagtcactttagtccctgactttgcacctcgttgtcacataggtccttgattcaggattaaatataaataagtcccttactctgcacttccgt 10333083  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  10333084 tatcattttagtccttgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 10333128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 9339644 - 9339790
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  9339644 gagcaaatagtccctttagtccctgattctgcagctcgttgttacataggtccctgactcaggattaaatacaaataaatccccgactctgcacttccgt 9339743  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9339744 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 9339790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32665895 - 32665749
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  32665895 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaataagtctttgactctgcacttccgt 32665796  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  32665795 tatcactttagtccctggcgttacaaaaatctgttaagtgatgatgt 32665749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7945679 - 7945533
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7945679 gagcaaataatcattttggtccctgactctgcacctcgctgtcacataggttcctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactatgcacttccgt 7945580  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7945579 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatatgctaagtgatgatgt 7945533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10333311 - 10333165
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||| || || |||| | |||| |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10333311 gagcaaatagtcactataatctctgattctgcagctcgctgttacataggtctctgactcaagattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgt 10333212  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10333211 tatcactttagtctctagcgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10333165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Original strand, 7944156 - 7944294
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  7944156 agcaaatagtcact--agtccctgattttgcaactcgctgtcacataggtccctgactcaaaattaaatacaaataagtccttgactctgcactttcgtt 7944253  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 246  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  7944254 atcaatttagtccctaacgttaaaaaaatatgttaagtgat 7944294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Original strand, 5782412 - 5782551
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||| |    
T  5782412 gagcaaattgtcattttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaagaagtctctgattatgcacttccct 5782511  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| | |||||||    
T  5782512 tatcactttagtctctgacgttaaataattttattaagtg 5782551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 251
Target Start/End: Original strand, 6612420 - 6612563
Alignment:
Q  108 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |   ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  6612420 caaatagtcactttagtccctgactctgcacctcgctgttataaatgtctctgactcatgattaaatacaaacaagtctctgactctgcacttccattat 6612519  T
Q  208 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  6612520 cactttaatccctgacgttaaataattttgttaagtgattatgt 6612563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9341150 - 9341004
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||  ||  | | | ||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  9341150 gagcaaatagtcactttgatcatttattctgcatctcactatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactttgcacttctgt 9341051  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  9341050 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatctattaagtgatgatgt 9341004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 22856678 - 22856824
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22856678 gagcaaatggtcactttagtcactgactctgcaccacgttgttacaaagattcttgactcaggattaaatacaaagaagtctctaactctgcacttccgt 22856777  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22856778 tatcactttagtctccgacgttaaataattatgttaagtgattatgt 22856824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52440684 - 52440539
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |    
T  52440684 gagcaaataatcacattggtctctgactttgcacatcgctgtcacataggtccctgagtcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccat 52440585  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52440584 tatcactttagt-cttgacgttaaaaaaatgtgttaagtgatgatgt 52440539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 52439477 - 52439619
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||     || |||| ||||||    
T  52439477 gagcaaatagtcactttagcccctgattctgcagctcgctgtcacataggtctctggctcaggattaaatacagataagtc----tctctgcatttccgt 52439572  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52439573 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 52439619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 249
Target Start/End: Original strand, 8975161 - 8975301
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| | | | ||||||| |||||||    
T  8975161 aaatggtcactttggtccctaactttgcaccttgttgtcacaaaggtccctgactcaagattaaatataaagtagtccatgaatatgcactttcgttatc 8975260  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  8975261 actttagtctttggcgttaaataattttgttaattgatgat 8975301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34088585 - 34088449
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||        ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||  |    
T  34088585 agcaaattgtcactttagtccctgactctacatctcgctgtcacaaaggtc--------atgattaaatacaaagaagtctctgactctgcacttccact 34088494  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 250  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34088493 atcactttaatccttgacattaaataattatgttaagtgatgatg 34088449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22857619 - 22857558
Alignment:
Q  190 actttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22857619 actttgcacttccgttatcactttagtccatgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 22857558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6614051 - 6613957
Alignment:
Q  158 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcct-tgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6614051 ctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttcagttatcattttagtcctccgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 6613957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50107275 - 50107185
Alignment:
Q  158 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50107275 ctgattcaggattaaatacaaaatagtctctgaatgtgcacttccgttatcactttagtccttggcgttaaataattatgttaactgatga 50107185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Original strand, 3117647 - 3117757
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||  ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| | |||||||||    
T  3117647 gagcaaatagtcattttagtccctaactcttcacatcgttatcacaaaggtctctgactcaagattaaatacaaagaaatctctgactctccacttccgt 3117746  T
Q  205 tatcactttag 215  Q
    |||||||||||    
T  3117747 tatcactttag 3117757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11060905 - 11060766
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||| | |  |||||| |||||||    
T  11060905 aaatggtcactttgatccttgactatgcacctcgctgtcacaaaggtccatgactcaaaattaaatacaaaatagtccctgaatgggcactttcgttatc 11060806  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  11060805 actttagtccccgacgttaaataattctgttaactgatga 11060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 251
Target Start/End: Original strand, 32664585 - 32664647
Alignment:
Q  188 taactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  32664585 taactctgcacttccgttatcactttagtccttgacgttaagaaaat-tgttaagtgatgatgt 32664647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5783205 - 5783095
Alignment:
Q  134 tgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaat 233  Q
    |||| |||| |||||||| | |||  ||||||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||    
T  5783205 tgcacctcgctgtcacatagatcctcgactcagaattaaatacaaagaagtccatgactctgcacttccgttatcactttagtcactagcgttaaataat 5783106  T
Q  234 tatgttaagtg 244  Q
    | |||||||||    
T  5783105 tctgttaagtg 5783095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 216
Target Start/End: Original strand, 25037925 - 25037987
Alignment:
Q  154 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||||||||    
T  25037925 gtccctgactcatgattaaatacaaagaagtcactgactctggacttacgttatcactttagt 25037987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 216
Target Start/End: Original strand, 25043137 - 25043199
Alignment:
Q  154 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||||||||    
T  25043137 gtccctgactcatgattaaatacaaagaagtcactgactctggacttacgttatcactttagt 25043199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 209
Target Start/End: Original strand, 44019996 - 44020088
Alignment:
Q  117 actttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 209  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  44019996 actttggtccctgactttgcaactcgttgtcacaaaagtctctgactcaagattaaatataaagaagtctctgactctgcacttacgttatca 44020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 248
Target Start/End: Original strand, 11829939 - 11830050
Alignment:
Q  137 atctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattat 236  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||| ||||||||| | ||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  11829939 atctcgttgtcacaaaggtcactaactcaagattaaatacaaattagtccttgtatatgcatttccgttattagtttaggctttgacgttaaaaacttat 11830038  T
Q  237 gttaagtgatga 248  Q
    ||||| ||||||    
T  11830039 gttaactgatga 11830050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Original strand, 1407642 - 1407784
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||| |||||||  || |||||| |||| || |||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||  |||  || | | |||||||  ||||||    
T  1407642 aaataatcactttcatctctgactctgcaccttgttgtcacaaaggtccatgacttatgactaaatataaagtagtttctgaatatgcacttatgttatc 1407741  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1407742 actttagtccctgacgttaaataattttgttaactgatgatgt 1407784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 534579 - 534518
Alignment:
Q  190 actttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  534579 actttacacttctgttatcactttagtccctaccgttaaaaaaatctgttaagttatgatgt 534518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 251
Target Start/End: Original strand, 33342511 - 33342560
Alignment:
Q  202 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33342511 cgttatcactttagtctctgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 33342560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 217
Target Start/End: Original strand, 1001164 - 1001264
Alignment:
Q  117 actttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 216  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  ||||| ||||||  |||||||||||||  |||| || | | |||||||| ||||||| ||||||    
T  1001164 actttagtccatgactttgcacctcgttgccacaaaggtccatgactcgggattaaatacaaagtagtctctgaatgtgcacttctgttatcagtttagt 1001263  T
Q  217 c 217  Q
    |    
T  1001264 c 1001264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2923921 - 2923861
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactca 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| | |||||  |||||||||||||    
T  2923921 gagcaaatagtcactttagttcctaactttgcacctcgctatcacaaaggtccctgactca 2923861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12173290 - 12173238
Alignment:
Q  51 attatggatcttggtaaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaa 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12173290 attatgggtcttgttaaccagtgccctcagggtaatggttaaggaaactaaaa 12173238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 251
Target Start/End: Original strand, 4592858 - 4593005
Alignment:
Q  104 ggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4592858 ggagcaaatagtcactttagtccctgattatgtagctcgctgtcacataagtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccg 4592957  T
Q  204 ttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4592958 ttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 4593005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 2464667 - 2464813
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2464667 gagcaaatagtcactttagtcactgattctgcagctcgctgtcatataggtccatgactcatgattaaatacaaataagtccctaactctgcacttacgt 2464766  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2464767 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgatgt 2464813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 8074449 - 8074594
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8074449 gagcaaatagtcactttagtccctgattatgcagctcgctgtcacataagtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 8074548  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  8074549 tatcactttagttcctgacgttaaaaaa-tcggttaagtgatgatgt 8074594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 546160 - 546017
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  546160 gagcaaatagtcactttagtccc-gattttgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacagataagtccttgactctgcacttccgt 546062  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  546061 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgat 546017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9538174 - 9538028
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||    
T  9538174 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcatctcgttgtcatataggtccctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgattgtgcacttccgt 9538075  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9538074 tatcattttagtctctgatgttaaataattatgttaagtgattatgt 9538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 21069287 - 21069433
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  21069287 gagcaaatagtcactttagtctctgactctgcacctcgttgtcacagaggtctctgactcaggattaaatacaaataagtccttgactctgcacttctgt 21069386  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    | |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21069387 tttcactttaatatatgccgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 21069433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Original strand, 19182949 - 19183094
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  19182949 agcaaatagttactttagaacttgactttgcacctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcctgactctacacttccgtt 19183048  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19183049 atcactttagtccttgcgattaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 19183094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28591244 - 28591092
Alignment:
Q  100 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 199  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  28591244 aaaaagagcaaatagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataaatccctgactctgcact 28591145  T
Q  200 tccgttatcactttagtccttgccgtta-aaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  28591144 tcctttatcactttagtccccgacgttacaaaaaatctgttaagtgatgatgt 28591092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2466899 - 2466753
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| | |||||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2466899 gagcaaatagtcactttggtctctgactctgcacctcgctatcacataggtcattgattcaggattaaataaaaataagtccctaactctgcacttccgt 2466800  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgtt-aaaaaattatgttaagtgatgatg 250  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  2466799 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaaatctgttaagtgatgatg 2466753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13651305 - 13651173
Alignment:
Q  44 tactagtattatggatcttggtaaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgt 143  Q
    |||||||||||||||||||  | || | | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  13651305 tactagtattatggatcttactgacgaatgtcctcatggcaatggttaaggaaactaaaatgagcaaatagtcactttagtccttgactgtgcacct-gc 13651207  T
Q  144 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaataca 177  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13651206 tgtcacataggtccctgactcaggattaaataca 13651173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14891268 - 14891126
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |    ||||| || ||| | |||||||||    
T  14891268 gagcaaatagtcactttggtccctcactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcatgattaaatgc----aagtctctgactctacacttccgt 14891173  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14891172 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 14891126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32641817 - 32641705
Alignment:
Q  139 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 238  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  32641817 ctcgttgtcacgtaggtcccttactcaagattaaatacaaataagttgctgactctgcacttccgttatcactttaatccctgacgttaaaaaaatatgt 32641718  T
Q  239 taagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||    
T  32641717 taagtgatgatgt 32641705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40612784 - 40612640
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||||    
T  40612784 gagcaaatagtcactttagtccctgattttgcagctcactgtcacgtaggtccctgactcaggattaaatacagatattttcctgactctgcacttccgt 40612685  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    |||||||||| | | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40612684 tatcactttaattcctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 40612640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 25590429 - 25590574
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||    
T  25590429 gagcaaatagtcactttgttttctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcg-gattaaatacaaataagtctctgattctgcacttctgt 25590527  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25590528 tatcactttaatctctgacgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 25590574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19186344 - 19186199
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    |||||||||||| ||||||| |   || ||||||||   ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||    
T  19186344 agcaaatagtcattttagtctcatgctctgcatctcccagtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaacaagtctctgactctacatttccgtt 19186245  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  19186244 atcactttagtccttgtcgttaaaacaatctgttaagcgatgatgt 19186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 251
Target Start/End: Original strand, 9537024 - 9537166
Alignment:
Q  108 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 207  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  9537024 caaatggtgactttagtccctcactctgcacctcgctgtcacataggtctctgacttagaattaaatacaaagaagtca-tgactgtgcacttccattat 9537122  T
Q  208 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9537123 cactttagtcactgacgttaaataattatggtaagtgatgatgt 9537166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Original strand, 16611726 - 16611865
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||| | || |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| | || | | |||||||||||    
T  16611726 gagcaaatggtcactttaattcttgactctacacctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaagaagcctctgattatgcacttccgt 16611825  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  16611826 tatcactttagtctctgacgttaaataattctgttaagtg 16611865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Original strand, 32640325 - 32640432
Alignment:
Q  144 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 243  Q
    |||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||    
T  32640325 tgtcacataggaccataactcaggattaaatacaaataagtccctaactctaaacttctgttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagt 32640424  T
Q  244 gatgatgt 251  Q
    ||||||||    
T  32640425 gatgatgt 32640432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8075958 - 8075812
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||| ||| | || | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  || | | ||||||| |||    
T  8075958 gagcaaatagtcgctttggtcattgactctgcacctcgctgttagatagatccctgattcaagattaaatacaaaaaagtatctgattctgcactttcgt 8075859  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  8075858 tatcactttagtccctgacgtttaaaaaatctgttaagtgatgatgt 8075812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Original strand, 544685 - 544792
Alignment:
Q  144 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 243  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||   || | |||||||| ||||||||||    
T  544685 tgtcagataggtctctgactcaggattaaatacaaataagtcactgactctgcacttccgttataaatttagtttctgacattaaaaaaatatgttaagt 544784  T
Q  244 gatgatgt 251  Q
    ||| ||||    
T  544785 gattatgt 544792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31947158 - 31947016
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||  | ||||||| || | | ||| ||| |  |||||||||||| |||||  | ||| |  ||||||||||||    
T  31947158 aaatagtcactttagtctctgattctgcactttgttgtcatatagattccttacttaaaattaaatacaaacaagtctatgactctagacttccgttatc 31947059  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31947058 actttagtcactgctgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31947016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 19271375 - 19271476
Alignment:
Q  140 tcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgtt 239  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||  ||||| | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  19271375 tcgttgtcacaagtgtcccaggctcatgattaaatataaagtagtcctttaatgtgcacttccgttatcagtttagtccatgacgttaaaaatttatgtt 19271474  T
Q  240 aa 241  Q
    ||    
T  19271475 aa 19271476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 251
Target Start/End: Original strand, 16978996 - 16979136
Alignment:
Q  111 atagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcac 210  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || | || ||||  ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  16978996 atagtcactttagtccttgactttgcaccttgctgccacaaaggtcattgactcagaattaaatgcaaataagtccctaactctgtacttacgttatcat 16979095  T
Q  211 tttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||  |  ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  16979096 tttagtctctaacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 16979136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Original strand, 18400192 - 18400284
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  18400192 aaatggtcactttagtccctgactctgcacctcactgtcacataggtccttgactcaggattaaataaaaagaagtcactgactctgcacttc 18400284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 251
Target Start/End: Original strand, 28589739 - 28589843
Alignment:
Q  147 cacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 246  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   | |||||| |||||||||| || |||||||  || |||||||||| | |||||||||||    
T  28589739 cacataggtccctgactcataattaaatacaaatacatttttgactttgtacttccgttaccattttagtctctgacgttaaaaaaatctgttaagtgat 28589838  T
Q  247 gatgt 251  Q
    |||||    
T  28589839 gatgt 28589843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 213
Target Start/End: Original strand, 13483029 - 13483126
Alignment:
Q  115 tcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 213  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||   ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  13483029 tcactttagtccc-gactctgtatctcgcattcagataggttcctgactcatgattaaatataaagaagtctcttactctgcactttcgttatcacttt 13483126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 216
Target Start/End: Original strand, 14881010 - 14881056
Alignment:
Q  170 taaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14881010 taaacacaaataagtccctgactctgcacttccgttatcactttagt 14881056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4594174 - 4594080
Alignment:
Q  155 tccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |  |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4594174 tccctgactcaggattaaatacaaataagt-catgactctgcacttccattatcac-ttaatcccttacgttaaaaagatctgttaagtgatgatgt 4594080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13483218 - 13483174
Alignment:
Q  168 attaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactt 212  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13483218 attaaatacaaacaagtctctgactttgcacttccgttatcactt 13483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35538373 - 35538281
Alignment:
Q  158 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| | | | | ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  35538373 ctgactcgtgattaaatacaaagtagttcttcaatgtgcacttccgttatcactttaatccttaatgttaaataattctgttaactgatgatg 35538281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Original strand, 18004698 - 18004777
Alignment:
Q  167 gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 246  Q
    ||||||||||||| | |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||    
T  18004698 gattaaatacaaagaggtctatgactctgcacttccgttatcactttagtctctgatgttaaatagttatgttaagtgat 18004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26327193 - 26327054
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||| |||| |||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| |||  |  || |   | ||||||||||| |||    
T  26327193 aaatagttattttggtcactgactctgcacctcgttgtcataagggctcctgactcaggattaaatataaaataacccttggatgtgcacttccgtaatc 26327094  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    | ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||    
T  26327093 agtttagtccttgacgttaaaaatttctgttaactgatga 26327054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24900457 - 24900411
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacat 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  24900457 gagcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacat 24900411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 251
Target Start/End: Original strand, 40611350 - 40611404
Alignment:
Q  197 acttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40611350 acttcccttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatatgttaggtgatgatgt 40611404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Original strand, 44333138 - 44333281
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  44333138 agcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcatgattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgtt 44333237  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44333238 atcac--tagtccttgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 44333281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 251
Target Start/End: Original strand, 48646044 - 48646193
Alignment:
Q  102 aaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 201  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48646044 aaggagtaaatagtcactttggtccctgactatgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctacacttc 48646143  T
Q  202 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48646144 cgttatcactttagtctctgtcgttaaaaaaatatattaagtgatgatgt 48646193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 48777254 - 48777401
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  48777254 gagcaaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcacataagtccctgactcatgattaaatacaaataattccctgactctgcacttccgt 48777353  T
Q  205 tatcactttagtccttgccg-ttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48777354 tatcactttagtccatgacgtttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 48777401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 7258273 - 7258419
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  7258273 gagcaaatagtcactttggtccctgactctacacctcgttgtcacataggtccctaactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgt 7258372  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7258373 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 7258419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44334574 - 44334429
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  44334574 gagcaaatagtcactttagttcctgattctgcagctcgctgttacataggtccctgactcatgattaaatataaataagtccctgactctgcacttccat 44334475  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44334474 tatcactttagtccctgacattaaaaaa-tatgttaagtgatgatgt 44334429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7259805 - 7259663
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||||||||||||| || |||| | || | |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  7259805 aaatagtcactttaatcgctgattttgtagctcgctgtcacatgggtctctgattcaggattaaatacaaataagtccctgactctacacttccgttatc 7259706  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7259705 actttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 7259663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Original strand, 43457459 - 43457601
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  43457459 aaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcgcataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccccgactctgcacttccgttatc 43457558  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||| | || ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  43457559 actttagttcatgacgttaagttattctgttaagtgatgatgt 43457601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48788797 - 48788651
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||    
T  48788797 gagcaaatagtcactttgatccttgactttgcacctcgctgtcacataggtccctgactcataattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgt 48788698  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  48788697 tatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaggtgatgatgt 48788651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Original strand, 46286504 - 46286645
Alignment:
Q  108 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  46286504 caaatagtcactttagtccctgactcttcatctcgctgttagaaaggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcacttctgttat 46286603  T
Q  208 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46286604 cactttaatctctaccgttaaaaaaatatgttaagtgatgat 46286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48647568 - 48647424
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | || |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||    
T  48647568 gagcaaatagtcactttagaccctgattctacagctcgctatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctcactctgcacttttgt 48647469  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  48647468 tatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgat 48647424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10899203 - 10899052
Alignment:
Q  100 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 199  Q
    |||| ||| |||| || ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10899203 aaaatgagtaaattgttactttggtccctgactctgcacctcgctgtcacatagatccttgacccaggattaaatacaaataagtctctgactctgcact 10899104  T
Q  200 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10899103 tccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 10899052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 35727697 - 35727842
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  35727697 gagcaaacagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacatccgt 35727796  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35727797 tatcactttagtcc-tgacgttaaaaatctctgttaagtgatgatgt 35727842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 42477379 - 42477524
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42477379 gagcaaataatcaatttggtccttgactctgcacctcgttgtcgcataggtctctgactcaggattaaatacaaataagt-cctgactctgcacttccgt 42477477  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42477478 tatcattttaatccctgacgttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 42477524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30925130 - 30924988
Alignment:
Q  108 caaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  30925130 caaatagtcactttaatccctgattctgcagctcccagtcacataggtccttgactcaggattaaatacaaataagtctctgactatgcacttccgttat 30925031  T
Q  208 cactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
     |||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30925030 tactttagtctctgacgttaaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 30924988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35729211 - 35729065
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  35729211 gagcaaatagtcactttattccctgattttgcagctcgctgtcacataggtccttgacttaggattacatacaaataagtcactgactctgcacttccgc 35729112  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||| |||||| || | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  35729111 tatcactgtagtccctgacattaaataaatctgttaagtgatgatgt 35729065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34889016 - 34888905
Alignment:
Q  137 atctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattat 236  Q
    |||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  34889016 atctcgctgtcacaaaggtctctcactcatgattaaatataaagatgtccttaactctgcacttccgttatcactttagtccttgacgtttaataattat 34888917  T
Q  237 gttaagtgatga 248  Q
    ||||||||||||    
T  34888916 gttaagtgatga 34888905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8375703 - 8375569
Alignment:
Q  110 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  8375703 aatagtcacattagtccctgacttcgcaccgcactgtcacataggtccctgactcatgattaaatacaaagaagtttctgactctgcacttccgttatca 8375604  T
Q  210 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
     ||||||||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  8375603 atttagtccgcgacgttaaataattttgttaagtg 8375569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12223820 - 12223678
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||     
T  12223820 aaatggtcactttagtccctgacactgcacatcaatgtcacataggtccctgactcaggattaaatataaagaagtccctgactctgcagttccgttatt 12223721  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12223720 actttagtcactgatgttaaataattctgttaagtgatgatgt 12223678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 39708101 - 39708247
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||  ||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  39708101 gagcatatagtcactttagtctctgactctgtacctcgccgtcacaaaggtccatgactcaagattgaatacaaagaagtcaccgactttgcacttccgt 39708200  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  39708201 tatcactttagtccgtgatgttaaataattatgttatgtgataatgt 39708247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13578392 - 13578300
Alignment:
Q  158 ctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13578392 ctgactcagaattaaatacaaataagtcactgactctgcacttccgttatcactttagtcc-tgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 13578300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8048909 - 8048763
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| || ||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||    
T  8048909 gagcaaatagtcactttaccctctgactctgcacctcgctgacacaaaggtctctgactcaagattaaatacaaagaagtctccgactctgcacttccgt 8048810  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| || ||  ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  8048809 tatcactttaatctttaacgttaaataattctattaagtgatgatgt 8048763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Original strand, 8374926 - 8375036
Alignment:
Q  119 tttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 218  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||     
T  8374926 tttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtctctgactcagaattaaatacaaaaaagtttctgattttgcacttccgttatcactttagtct 8375025  T
Q  219 ttgccgttaaa 229  Q
    ||| |||||||    
T  8375026 ttgacgttaaa 8375036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Original strand, 45583682 - 45583792
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  45583682 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagttcgctatcacataggtccctgactcagaattaaatacagataagttcctgattctgcacttccgt 45583781  T
Q  205 tatcactttag 215  Q
    |||||||||||    
T  45583782 tatcactttag 45583792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45584566 - 45584475
Alignment:
Q  160 gactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45584566 gactcaggattaaatacaaataagccaatgactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 45584475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19434058 - 19433913
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||| |||| | | ||||||||| ||  ||||| |  |||  ||||||| |||    
T  19434058 agcaaattgtcactttagtccctaactctccatctcgttgtcacaaaggtctctgatttaggattaaatataaggaagtcaccgactccgcacttcagtt 19433959  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19433958 atcactttagtctatggcgttaaataattctgttaagtgatgatgt 19433913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 12220011 - 12220166
Alignment:
Q  95 aaactaaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaacttt 194  Q
    |||| |||| ||||||||  ||||||||||  ||  || |||| ||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||| |    
T  12220011 aaacaaaaatgagcaaatgatcactttagtgtctagctatgcacctcgttgtcacaaagattcctgactcaagattaaatagaaagaagtctctgactct 12220110  T
Q  195 gcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12220111 gcacttctgatatcactttagt-cttgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 12220166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 251
Target Start/End: Original strand, 44529076 - 44529172
Alignment:
Q  155 tccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  44529076 tccctgactcatgattaaatacaaataagtctccgactcaacacttctgttatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaagcgatgatgt 44529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5930257 - 5930112
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| ||||  ||| | |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||  || |  | | || |||||||||||    
T  5930257 gagcaaatggtcactttagtctcttactttgcacttcgctatcacaaaggtccctaactcaggattaaatacaagaaattttcga-ctgtgcacttccgt 5930159  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5930158 tatcactttagtccctgccattaaataattctgttaagtgatgatgt 5930112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44530687 - 44530595
Alignment:
Q  154 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 246  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| |||||||||||    
T  44530687 gtccccgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtcattggcgttaagttattctgttaagtgat 44530595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Original strand, 32793231 - 32793315
Alignment:
Q  167 gattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||  | | | |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32793231 gattaaatacaaataagtcattgattctgcatttcggttatcactttagtctttggcgttaaataattatgttaactgatgatgt 32793315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 385732 - 385662
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaa 179  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  385732 aaatggtcactttggtccttgactctgcatctcgttgtcacagaggtccctaactcatgattgaatacaaa 385662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Original strand, 34704911 - 34705009
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttat 207  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| || |||| ||||||    
T  34704911 aaatagtcactttagtctccgactctgcacctcgttgtcacaaaggcctctgactcaggattaaatacaaagaagtctctgactgtgtactttcgttat 34705009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2677877 - 2677768
Alignment:
Q  139 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 238  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| ||  ||    
T  2677877 ctcgttgtcacaaaggtctatgactcatgattaaatacaaagtattccctaaatgtgcactttcgttatcagtttagtccctcgcgttaaaaactttagt 2677778  T
Q  239 taagtgatga 248  Q
    ||| ||||||    
T  2677777 taactgatga 2677768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 10894391 - 10894449
Alignment:
Q  148 acatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 206  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  10894391 acataggtccctgactcaagattaaatataaataagtctctaattctgcacttccgtta 10894449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 21062819 - 21062896
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcc 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  21062819 aaatggtcactttagtccctgactttgcacctcgctgtcataaaggtccttgactcaggattaaatacatagaagtcc 21062896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 46287446 - 46287385
Alignment:
Q  188 taactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||    
T  46287446 taactctgcatttccgttatcactttagtctttggcgttaaaaaaatttgttaaatgatgat 46287385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7509562 - 7509450
Alignment:
Q  139 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgt 238  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||| |  | | |||||||||||||| ||||||  || || ||||||| |||| |||    
T  7509562 ctcgttgtcacaaaggtctttgattcatgattaaatataaagaagtctcagattctgcacttccgttattactttaacccctgacgttaaataattttgt 7509463  T
Q  239 taagtgatgatgt 251  Q
    |||||||| ||||    
T  7509462 taagtgattatgt 7509450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8879616 - 8879532
Alignment:
Q  157 cctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | | |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  8879616 cctgactcaggattaaatacaaagtagttcctgaatgtgcatttctgttatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaa 8879532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Original strand, 24287567 - 24287619
Alignment:
Q  194 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 246  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24287567 tgcacttaagttatcactttagtccttgacgttaaataattatgttaattgat 24287619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 251
Target Start/End: Original strand, 33060899 - 33060954
Alignment:
Q  196 cacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  33060899 cacttccgttatcactttagtctctgacgttaaataattctgttaaatgatgatgt 33060954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 103
Target Start/End: Original strand, 33474296 - 33474334
Alignment:
Q  65 taaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaa 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33474296 taaccagtatcatcagggcaatggttaaggaaactaaaa 33474334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33607700 - 33607618
Alignment:
Q  153 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaatta 235  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||    
T  33607700 ggtctctgattcaggattaaatacaaagaagtctctgattctgcacttccgttatcattttagaccctgacgttaaataatta 33607618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Original strand, 30917800 - 30917857
Alignment:
Q  194 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  30917800 tgcacttccattatcactttaatcctcgacgttaaataattatgctaactgatgatgt 30917857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Original strand, 48572984 - 48573129
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  48572984 agcaaatagtcactttggtccctgactctgcacctcgttatcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagcctctgactctgcacttccgtt 48573083  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48573084 atcactttagtccttgacgttaaaaaaatttgttaagcgatgatgt 48573129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 251
Target Start/End: Original strand, 36278944 - 36279096
Alignment:
Q  99 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  36278944 taaatggagcaaatagtcactttagtccctgattatacagctcgttgtcacataggtccctgattcaggattaaatacaaataagtctctgactctgcac 36279043  T
Q  199 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36279044 ttccgttatcattttagtccctgacgttaaaaaattcttttaagtgatgatgt 36279096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 17700516 - 17700643
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17700516 gagcaaatagtcactttagtctttgactctgcacctcgttgtcacataggttcctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgt 17700615  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaa 232  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||    
T  17700616 tatcactttagtccctgacgttaaaaaa 17700643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Original strand, 55388066 - 55388217
Alignment:
Q  100 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||    
T  55388066 aaaatgagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagctcgctgtcatataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttactgactctgcact 55388165  T
Q  200 tccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  55388166 cccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatttgttaagtgatgatgt 55388217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17702040 - 17701917
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17702040 aaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcatataggtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgactctgcacttccgttatc 17701941  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaa 232  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  17701940 actttagtccctgacgttaaaaaa 17701917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 52316977 - 52317123
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  52316977 gagcaaataatcactttagtctctgattctgcagctcgctgtcatataggtctctgactcatgattaaatacaaataagtctttaactctgcacctccgt 52317076  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  52317077 tatcattttagtccatgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 52317123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 52318442 - 52318297
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |     
T  52318442 gagcaaatagtcactttggtctctgactctgcacttcgctgtcacatagatccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcacttctga 52318343  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 250  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  52318342 tattactttagtccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatg 52318297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Original strand, 19114531 - 19114643
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19114531 gagcaaatgatcactttagtccctgactctgcacttcgttgtcacagaggtccctgactcaagattaaatacaaagaagtcactaactttgcacttccgt 19114630  T
Q  205 tatcactttagtc 217  Q
    |||||||||||||    
T  19114631 tatcactttagtc 19114643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Original strand, 20464069 - 20464213
Alignment:
Q  107 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 206  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  20464069 gcaaatggacactttagtccccgactctgcacctcgttgtcacaaaggtccctggctcatgattaaatacaaagaagtccctgactctgcacttctgtta 20464168  T
Q  207 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20464169 tcactttagtccacgacgttaaataactctgttaagtgatgatgt 20464213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33428560 - 33428421
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||    
T  33428560 gagcaaatggtcactttcgtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcagaattaaatacaaagaagtccttgactctgcatttccgt 33428461  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  33428460 tgtcactttagtcctcagcgttaaataattatgttaagtg 33428421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47118176 - 47118037
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| |||    
T  47118176 gagcaaatggtcactttagtccctgactctgcacctcgttgtcatataagtccccgactcaggattaaatgcaaagaagtctctgactctgcactttcgt 47118077  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  47118076 tatcactttagtccctgacgttaaataattttgttaagtg 47118037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45601066 - 45600925
Alignment:
Q  102 aaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttc 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  45601066 aaggagcaaatcgtcactttagtccctgactctgtccctcgctgtcacataggtccctgattcaggattaaatacaaagaagt-cctgactctgcacttc 45600968  T
Q  202 cgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||    
T  45600967 cgttatcactttagtccacgacgttaaataattctgttaagtg 45600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2592132 - 2592019
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  2592132 gagcaaatagtcactttagtccctaattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactcaatacttccgt 2592033  T
Q  205 tatcactttagtcc 218  Q
    ||||||||||||||    
T  2592032 tatcactttagtcc 2592019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36280401 - 36280296
Alignment:
Q  146 tcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtga 245  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  36280401 tcacataggtctctgactcaggattaaatataaataagtctctgactctgcacttccgttatcactttagtccctgacgttaaaaaaatatgttaagtga 36280302  T
Q  246 tgatgt 251  Q
    ||||||    
T  36280301 tgatgt 36280296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Original strand, 2591625 - 2591769
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  2591625 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcagcttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaacaagtctctgactctgcacttccat 2591724  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
     ||||||||||||| ||  |||||   ||| ||||||||||||||    
T  2591725 gatcactttagtccctgatgttaagttattctgttaagtgatgat 2591769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 53959186 - 53959079
Alignment:
Q  144 tgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagt 243  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||    
T  53959186 tgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaataagttcatgactctgcacttccgttatcactttagtctctgacgttaaaaaaatttgttaagt 53959087  T
Q  244 gatgatgt 251  Q
    ||||||||    
T  53959086 gatgatgt 53959079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 3671037 - 3671182
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||  | |||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||    
T  3671037 gagcatatagtcacttta-tccttgactttgcacctctctatcacaaaggtctctgactcagaattaaatacaaataagtctatgactctccacttccgt 3671135  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671136 tatcactttaatccctgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 3671182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 34263803 - 34263949
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  34263803 gagcaaatagtcactttggcccctgactctgcacctcgctgtcacagaggtccttgattcaggattaaatacaaataagtctctgactctacacttccat 34263902  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34263903 tatcactttaatccctgacattaaaaaaatatgttaagggatgatgt 34263949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48574536 - 48574438
Alignment:
Q  153 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||    
T  48574536 ggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactctgcactttcgttatcactttagtccttgacgttaaaaaaatcttttaaatgatgatgt 48574438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 251
Target Start/End: Original strand, 50753820 - 50753961
Alignment:
Q  110 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 209  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||  || ||| | |||||| |||||||    
T  50753820 aatagtcactttagtccctagctctgcacctcgctgtcacataggtccctaattcaggattaaatataaacaagtttctgactctacacttctgttatca 50753919  T
Q  210 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50753920 ctttagtccctgccgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 50753961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 246
Target Start/End: Original strand, 48808362 - 48808505
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcacttta--gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttcc 202  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| | |||| |||| ||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48808362 gagcaaataatcactttatagtccctgattctgcagctcgctgttagataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcctaactctgcacttcc 48808461  T
Q  203 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgat 246  Q
    ||| ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||    
T  48808462 gttgtcactttagtcccggatgttaaaaaaatatgttaagtgat 48808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 55389592 - 55389448
Alignment:
Q  107 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 206  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  55389592 gcaaatagtcactttggtccctaactctgcacctcgctgtcacataggtcattgactcaaaattaaatacaattaagtccctgactctacacttccgtta 55389493  T
Q  207 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||    ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  55389492 tcactttagtccccaacgttacaacaatatgttaagtgatgatgt 55389448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47075476 - 47075337
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||  |||| ||| | |||||||||    
T  47075476 gagcaaatggtcactttaatccttgactctgcacctcgttgtcacataggtccgtcactcaagattaaatacaaagaaacccctgactctacacttccgt 47075377  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  47075376 tatcactttagtctctgacgttaaataattttgttaagtg 47075337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11773142 - 11773053
Alignment:
Q  139 ctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaa 228  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11773142 ctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtctctgactctacacttccgttatcactttagtccctggcgttaa 11773053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19115271 - 19115133
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| | | ||| |||||||||||    
T  19115271 gagcaaatagtcactttagttcgtgactctgcacctcgatgtcacataggtccttcactcaggattaaatacaaagaagt-catgactctgcacttccgt 19115173  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    | | |||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  19115172 ttttactttagtccctaacgttaaataattctgttaagtg 19115133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49261664 - 49261550
Alignment:
Q  100 aaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcact 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |   ||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||| |||| |    
T  49261664 aaaaagagcaaatagtcactttagtccataattccacacattgttgtcacataggtccctgactcaggattaaataca---aagtctctaactctgcatt 49261568  T
Q  200 tccgttatcactttagtc 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49261567 tccgttatcactttagtc 49261550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 53957673 - 53957817
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| |    
T  53957673 gagcaaatagtcactttagtacttgattctgcaactcgctgttacataggttcctgactcagga-taaatacaaataagtctatgactctgcacttccct 53957771  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    || || |||  ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  53957772 taacaattt-ttccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 53957817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 40205934 - 40206016
Alignment:
Q  159 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||| || | | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40205934 tgactcacgattaaaaacaaagtagtctctgaatgtgcacttccgttatcagtttagtcattggcgttaaaaaattatgttaa 40206016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 182
Target Start/End: Original strand, 19331117 - 19331183
Alignment:
Q  116 cactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataa 182  Q
    |||||| || ||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19331117 cactttcgttcctgactctgcaccttgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataa 19331183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40207009 - 40206919
Alignment:
Q  159 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagt-ccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | | | |||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40207009 tgactcatgattaagtataaattagtccttgaatgtgcatttccgttatcagtttagtcccttaacgttaaaaaattatgttaactgatga 40206919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Original strand, 47427885 - 47427959
Alignment:
Q  132 tgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 206  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  47427885 tgtgcacctcgctgtcacataggtccttgactcaaaattaaatacaaagaagtccctgactgtgcacttacgtta 47427959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48809690 - 48809634
Alignment:
Q  194 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48809690 tgcacttccgttatcactttagtccatgacg-taaaaaaatctgttaagtgatgatgt 48809634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26652725 - 26652583
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| | ||| |||||||||  ||||| | | | || |  || ||||||    
T  26652725 aaatagtcacttgggtccctgactttgcatctcgctgtcactttagtccctgacttaggataaaatacaaaatagtccatgaatgtgtatctctgttatc 26652626  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgtc 252  Q
    | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  26652625 agtttagtccttactgtt-aaaaattctgttaatcgatgatgtc 26652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36827509 - 36827454
Alignment:
Q  196 cacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36827509 cacttccgttatcactttagtctctgatgttaaataattttgttaagtgatgatgt 36827454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 612230 - 612358
Alignment:
Q  123 gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgc 222  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  | |||  || |||  |||||||||||| |||||| | | | || ||||  |||||||||||||| | |      
T  612230 gtccctgactatgcacctcgttgttacaaagatcctcgattcaaaattaaatacaaagaagtccgtgaatgtgtacttatgttatcactttagttcctca 612329  T
Q  223 cgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  612330 cattaaataattatgttaagtgatgatgt 612358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 53771174 - 53771035
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  53771174 gagcaaatggtcactttagtccctgactctgcacctcgttgtcacataggtccctgactcagaattaaatacaaagaagcccctgactctgcacttccgt 53771075  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  53771074 tatcactttagtcattgacgttaaataattctgttaagtg 53771035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 42278047 - 42278193
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42278047 gagcaaatagtcactttagtccttgattctgcagcttgctgtcacataggtccctgactcgggattaaatacaaataagttcctgactctgcacttccgt 42278146  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42278147 tatcactttaatccctgacgttaaaaaaatctgttaagtgatgatgt 42278193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47878608 - 47878463
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  47878608 agcaaatagtcactttgatccctgactctgcacctcgctgttacataggtccctgactctggattaaatacaaataagtccctgactctacacttccgtt 47878509  T
Q  206 atcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  47878508 atcactttagtccatgacgttaataaaatctgttaagcgatgatgt 47878463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Original strand, 47874566 - 47874704
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  47874566 aaatagtcactttagtctctgattctgcagctcgctatcacataggtccctgactcaagattaaatacaaataagtccctgattctgcacttccgttatc 47874665  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  47874666 actttagtcc-tgatgttaaaaaaatatgttaaatgatga 47874704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 31844720 - 31844865
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |    
T  31844720 gagcaaatagtcactttagtccctagctctgcacctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaacaagtccctaactctacacttccct 31844819  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||| |||  || |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  31844820 tatcactttggtcactgtcgtttaaaaa-tctgttaagtgatgatgt 31844865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26173062 - 26172931
Alignment:
Q  110 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatca 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||   ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  26173062 aatagtcactttagtccccaactatgcaccttactgtcagaaaggtccttgactcaagattaaatacaaataagtctctgactctgcacttccgttatca 26172963  T
Q  210 ctttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26172962 ctttagtccatgccgttaaaaaattatgttaa 26172931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48740145 - 48740006
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||| ||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  48740145 gagcaaatggtcactttagtccatgtctctgcacctcattgtcacgtagatccctgactcataattaaatacaaagaagtccccaactctgcacttctgt 48740046  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  48740045 tatcactttagtccctgacgttaaataattctgttaagtg 48740006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 26170638 - 26170784
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||  |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  26170638 gagcaaatagttagtttagtctctgactttgcacctcgttgttacaaaagtatctgacttaagattaaatacaaataagttccttactctgcacttccat 26170737  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26170738 tatcactttagtccatgctgttaaaaaattttgttaagtgatgatgt 26170784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 251
Target Start/End: Original strand, 39868914 - 39869064
Alignment:
Q  99 taaaaggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcac 198  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| |   ||| |||||    
T  39868914 taaaatgagtaaattgttactttagtctctgactctgcacctcgctgttacaaaggtccctgactcataattaaatacaaacaagttcg--actctgcac 39869011  T
Q  199 ttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39869012 ttccgttatcactttagtctctgacgttaaataattatgttaagtgatgatgt 39869064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Original strand, 54574423 - 54574532
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||| |||  | ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  54574423 gagcaaatagtcattttgcttcctcactctgcatctcgctgtcacataggtctctgactcaggattaaatacaaataagttcttaactctgcacttccgt 54574522  T
Q  205 tatcacttta 214  Q
    ||||||||||    
T  54574523 tatcacttta 54574532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4703342 - 4703196
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||  | ||| | |||||||||    
T  4703342 gagcaaattgtcactttagttactgactctacatctcgctgtcacataggtccctaactcagaattaaatacaaagaagtctttgactgtacacttccgt 4703243  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  || | ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4703242 tatcactttagtctctggcattaaataattctattaagtgatgatgt 4703196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Original strand, 50694795 - 50694893
Alignment:
Q  153 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||  || | | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50694795 ggtccctgactcaaaattaaatataaataagtttctgattctgcacttccgttatctctttagtccctgacgttaaaaaattctgttaagtgatgatgt 50694893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21623224 - 21623096
Alignment:
Q  123 gtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgc 222  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||  |     
T  21623224 gtccttgactctgcatctcgttgtcacaatgttccctgattcaggattaaatacaaaatagtccttgaatgtgcacttctgttatcactttagtccccga 21623125  T
Q  223 cgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21623124 cgttaaataattatgttaactaatgatgt 21623096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 244
Target Start/End: Original strand, 53770330 - 53770470
Alignment:
Q  104 ggagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccg 203  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||     
T  53770330 ggagtaaatggtcactttagtctctgactctgcacctcgcattcacataggttcctgactcagaattaaatacaaagaagtctatgactctgcacttcca 53770429  T
Q  204 ttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  53770430 ttatcactctagtctctgccgttaaataattctgttaagtg 53770470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 249
Target Start/End: Original strand, 4701817 - 4701907
Alignment:
Q  159 tgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgat 249  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4701817 tgacttatgattaaatacaaagaagtccccgactatgcacttccgctatcactttagtccctgatgttaaataattctgttaagtgatgat 4701907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 251
Target Start/End: Original strand, 21621869 - 21621967
Alignment:
Q  153 ggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | | | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21621869 ggtccctgactcaggattaaatacaaaatagtcattgaatgtgcacttccgttatcactttagtccctgatgttaaataattatgttaactgatgatgt 21621967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31845080 - 31844934
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| | ||||||| ||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| || |     ||| | |||||||||    
T  31845080 gagcaaatactcactttagtttttgattttgcatcttgttgtcatataggtttctgactcaggattaaatacaaacaaattttagactctacacttccgt 31844981  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31844980 tatcattttcgtccttgcagttaaaaaaatatgttaagtgatgatgt 31844934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42392003 - 42391868
Alignment:
Q  115 tcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcccta--actttgcacttccgttatcactt 212  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||| |||||| ||    
T  42392003 tcactttagtctctgactccgcacctcactgtcacataggtctctgactcatgattaaatacaaattagtccctaataatgtgcacttcctttatcagtt 42391904  T
Q  213 tagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    ||||||  | ||||||||| || | |||| ||||||    
T  42391903 tagtcccagacgttaaaaacttctattaactgatga 42391868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26685528 - 26685408
Alignment:
Q  119 tttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtcc 218  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||     ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  26685528 tttagtccctgactctgcacctcgctgtcacataggtccctcact-----ttaaatacatagaagtccttgactatgcacttccgttatcactttagtct 26685434  T
Q  219 ttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
     || | ||||| |||| |||||||||    
T  26685433 ctgacattaaataattctgttaagtg 26685408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 44158502 - 44158638
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| |||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||  ||    
T  44158502 gagcaaatggtcaatttagcccccgactctgcacctcgttgttacagaggttcctgactcaggattaaatacaaagaagtccctgactctatacttttgt 44158601  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    ||| |||||| ||| |  ||||||| |||||||||||    
T  44158602 tattactttaatccctaacgttaaataattatgttaa 44158638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19051356 - 19051253
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||    
T  19051356 gagcaaatggtcactttagtccctgactctacacctcgttggcacaaaggtcactgactcgagattaaatacaaagaagtctctgactctacactttcgt 19051257  T
Q  205 tatc 208  Q
    ||||    
T  19051256 tatc 19051253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Original strand, 19050297 - 19050382
Alignment:
Q  166 tgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  19050297 tgattaaatacaaagaagtctcggactctgcacttccgttatcactttagtctccgacgttaaataattctattaagtgatgatgt 19050382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54574881 - 54574822
Alignment:
Q  154 gtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcacttt 213  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  54574881 gtccttgactcaggattaaatacaaataaatctctaactctgcacttctgttatcacttt 54574822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 248
Target Start/End: Original strand, 32244361 - 32244415
Alignment:
Q  194 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatga 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32244361 tgcacttccgttatcactttggtccataacgttaaataattatgttaagtgatga 32244415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24753597 - 24753540
Alignment:
Q  194 tgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  24753597 tgcacttctgttatcactttagtcattcgcgttaaataattttgttaactgatgatgt 24753540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Original strand, 79073 - 79217
Alignment:
Q  107 gcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtta 206  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| ||    
T  79073 gcaaatagtcaatttagttcctgactctgcacctcgctgtcacataggtccttgactcatgattaaataaaaagaagtccttgactttgcacctccgata 79172  T
Q  207 tcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  79173 tcactttagtctttgacgttaaataattttgttaagtgatgatgt 79217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 79808 - 79662
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||| |||  |    
T  79808 gagcaaatagtcactttaatccctgactcggcacctcgttgttacataagttcctgactcatgattaaatacaaagaagtctttgactctgcatttctat 79709  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  79708 tatcattttagtctttgacgttaaataattttattaagtgatgatgt 79662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 74433 - 74357
Alignment:
Q  110 aatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtcc 186  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  74433 aatagtcagtttagtccctgactctgcaactcactgtcacataggtccctaactcatgattaaatacaaagaagtcc 74357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 218
Target Start/End: Original strand, 116054 - 116166
Alignment:
Q  106 agcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  116054 agcaaatagtcactttagttcctcattctgcagctcgctgtcacataggtccctgactcaggattaaatacaaataagtccctgactatgcacttccgtt 116153  T
Q  206 atcactttagtcc 218  Q
    |||||||||||||    
T  116154 atcactttagtcc 116166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 30747997 - 30748143
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||    
T  30747997 gagcaaatagtcactttagtccctgattctgcacctcgctgtcacataggtccctgacttaggattaaatacaaacaagtctctgactctacactttcgt 30748096  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  30748097 tatcactttagtcgctgccgttaaaaaaaactattaagtgatgatgt 30748143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Original strand, 31218953 - 31219092
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  31218953 gagcaaatggtcactttaatctctgactctgcacctcgctgtcacataggtccttaactcaggattaaatacaaagaagttcctgactctgcacttccgt 31219052  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||| |||| | |||||||    
T  31219053 tatcactttaatccctgatgttaaataattctcttaagtg 31219092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31219281 - 31219146
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||   |||||||||||||    
T  31219281 aaatggtcactttaatccctgactctgcacctcgctgtcacataggtcattaactcaggattaaatacaaagaagttcctgactcgacacttccgttatc 31219182  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtg 244  Q
    |||||||||  || ||||||| |||| | |||||||    
T  31219181 actttagtctctgacgttaaataattctcttaagtg 31219146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 23507947 - 23508092
Alignment:
Q  105 gagcaaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || | || |||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||| |    
T  23507947 gagcaaatagtcactttagtctctg-ctctacacctccctgtcacataggttcctgattcaggattaaatacaaacaaatctatgactttacacttcctt 23508045  T
Q  205 tatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||||||||||| || |||||||   || ||||||||||| ||||    
T  23508046 tatcactttagtccctgtcgttaaatttttttgttaagtgataatgt 23508092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12676591 - 12676459
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||||||||||||  |  |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||  |||| |||| | |||||||  ||||||    
T  12676591 aaatagtcactttgatatctgactctgcacctcgttgtcacaatggtctctgtctcaggattaaatacaaagtagtctctaaatgtgcacttttgttatc 12676492  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaa 241  Q
    | |||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  12676491 agtttagtctctggcattaaaaatttatgttaa 12676459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 248
Target Start/End: Original strand, 24621104 - 24621218
Alignment:
Q  134 tgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatcactttagtccttgccgttaaaaaat 233  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |  || |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |    
T  24621104 tgcatctcgttatcataaaggtccttgactcatgattaaatacaaagaaatctctaaatgcgcgcttccgttatcagtttagtcattgacattaaaaact 24621203  T
Q  234 tatgttaagtgatga 248  Q
    | | |||| ||||||    
T  24621204 tctattaactgatga 24621218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6468883 - 6468832
Alignment:
Q  128 tgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaa 179  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6468883 tgactctgcatatcgctgtcacaaaggtccctgactcatgattaaatacaaa 6468832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Original strand, 19645948 - 19645993
Alignment:
Q  59 tcttggtaaccagtatcctcagggcaatggtttaggaaactaaaag 104  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19645948 tcttgctaaccattgtcctcagggcaatggttaaggaaactaaaag 19645993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 251
Target Start/End: Original strand, 10855902 - 10855950
Alignment:
Q  203 gttatcactttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatgt 251  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10855902 gttatcgctttagtccctgacgttaaataattatgttaagtgatcatgt 10855950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 250
Target Start/End: Original strand, 5601 - 5742
Alignment:
Q  109 aaatagtcactttagtccctgactgtgcatctcgttgtcacatgggtccctgactcatgattaaatacaaataagtccctaactttgcacttccgttatc 208  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||   ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  5601 aaattgtcactttagtcactcactttgcacctcgttgtgacaaatgtctctgactcagaattaaatacaaagaagtccctgactctacacttccgttatc 5700  T
Q  209 actttagtccttgccgttaaaaaattatgttaagtgatgatg 250  Q
    |||||||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5701 actttagtctctggcgttaaataattatgttatgtgatgatg 5742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University