View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19445_high_12 (Length: 517)

Name: NF19445_high_12
Description: NF19445
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19445_high_12
NF19445_high_12
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-498)||(26830169-26830666)
chr6 (1-498)||(21593292-21593786)
chr6 (7-498)||(3808754-3809245)
chr6 (6-498)||(2972985-2973477)
chr6 (25-498)||(5043278-5043749)
chr6 (1-498)||(17762613-17763112)
chr6 (73-498)||(603134-603550)
chr6 (11-498)||(22424872-22425358)
chr6 (330-498)||(9183077-9183245)
chr6 (330-498)||(28137454-28137622)
chr6 (357-498)||(21588913-21589053)
chr6 (347-498)||(17757994-17758145)
chr6 (330-496)||(3038951-3039117)
chr6 (330-498)||(5406246-5406412)
chr6 (330-498)||(5410571-5410737)
chr6 (330-498)||(26954332-26954499)
chr6 (319-498)||(31404721-31404897)
chr6 (90-286)||(17757797-17757995)
chr6 (330-494)||(2171582-2171744)
chr6 (271-498)||(25073463-25073691)
chr6 (330-498)||(5413440-5413606)
chr6 (43-239)||(26800438-26800634)
chr6 (330-498)||(33211231-33211399)
chr6 (330-494)||(30834586-30834750)
chr6 (330-494)||(16452379-16452543)
chr6 (317-498)||(4045364-4045546)
chr6 (330-498)||(33160398-33160567)
chr6 (7-263)||(25072817-25073072)
chr6 (213-355)||(5740978-5741120)
chr6 (378-494)||(3072809-3072926)
chr6 (419-498)||(26800630-26800709)
chr6 (380-498)||(16569037-16569144)
chr6 (378-494)||(412103-412220)
chr6 (378-494)||(27647863-27647978)
chr6 (446-498)||(5409115-5409167)
chr6 (378-494)||(16554871-16554987)
chr6 (378-494)||(16631427-16631543)
chr6 (378-494)||(16578568-16578684)
chr6 (378-494)||(16616696-16616812)
chr6 (378-494)||(16653114-16653230)
chr6 (378-494)||(6097501-6097606)
chr6 (219-343)||(11660452-11660574)
chr6 (330-444)||(16567160-16567265)
chr6 (6-47)||(26661580-26661621)
chr6 (6-47)||(26767551-26767592)
chr6 (421-498)||(2908503-2908581)
chr6 (390-448)||(99245-99302)
chr6 (378-494)||(6027248-6027365)
chr6 (378-494)||(25421307-25421424)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (1-498)||(40146887-40147383)
chr5 (1-498)||(213094-213587)
chr5 (7-498)||(38746637-38747127)
chr5 (25-498)||(5057698-5058167)
chr5 (5-498)||(28277943-28278438)
chr5 (10-498)||(27015168-27015645)
chr5 (1-498)||(27637659-27638156)
chr5 (1-498)||(316385-316885)
chr5 (13-484)||(35615809-35616278)
chr5 (319-498)||(13488147-13488325)
chr5 (330-498)||(42428476-42428644)
chr5 (214-498)||(16640986-16641269)
chr5 (330-498)||(533723-533891)
chr5 (330-498)||(39468595-39468763)
chr5 (25-435)||(4160284-4160690)
chr5 (330-498)||(42426281-42426449)
chr5 (319-498)||(33831624-33831802)
chr5 (333-498)||(537982-538147)
chr5 (80-498)||(33906076-33906491)
chr5 (330-498)||(32636778-32636946)
chr5 (1-213)||(16642208-16642419)
chr5 (330-498)||(8565992-8566160)
chr5 (9-333)||(14689622-14689942)
chr5 (330-498)||(28750701-28750869)
chr5 (330-498)||(25412716-25412882)
chr5 (330-498)||(13239706-13239873)
chr5 (330-496)||(16452035-16452200)
chr5 (330-494)||(30182543-30182706)
chr5 (330-497)||(31182927-31183092)
chr5 (330-494)||(13343015-13343178)
chr5 (330-498)||(30682968-30683134)
chr5 (330-498)||(3075704-3075872)
chr5 (330-473)||(5887487-5887630)
chr5 (320-498)||(9049388-9049565)
chr5 (319-498)||(42309981-42310159)
chr5 (321-496)||(13695738-13695914)
chr5 (330-494)||(36074093-36074258)
chr5 (13-216)||(30802579-30802782)
chr5 (330-498)||(37439088-37439263)
chr5 (7-208)||(30792872-30793072)
chr5 (330-443)||(19806338-19806449)
chr5 (378-494)||(16409477-16409593)
chr5 (12-218)||(10055031-10055238)
chr5 (378-494)||(26177885-26178000)
chr5 (378-494)||(18441698-18441814)
chr5 (378-494)||(9789274-9789390)
chr5 (119-353)||(21205842-21206076)
chr5 (396-498)||(3325933-3326036)
chr5 (378-494)||(29720366-29720482)
chr5 (378-494)||(29722526-29722642)
chr5 (378-494)||(29751210-29751326)
chr5 (420-477)||(42926911-42926968)
chr5 (391-498)||(10054862-10054969)
chr5 (246-497)||(10700695-10700945)
chr5 (378-490)||(22536344-22536455)
chr5 (390-481)||(30802843-30802934)
chr5 (389-494)||(22097877-22097981)
chr5 (9-96)||(33906578-33906665)
chr5 (378-494)||(10593260-10593376)
chr5 (330-391)||(42926847-42926908)
chr5 (378-494)||(26170776-26170880)
chr5 (347-483)||(6016979-6017115)
chr5 (425-488)||(8445764-8445828)
chr5 (450-489)||(42926965-42927004)
chr5 (413-481)||(32609572-32609641)
chr5 (251-346)||(8019464-8019557)
chr5 (435-497)||(30793195-30793258)
chr5 (422-497)||(32576344-32576419)
chr5 (390-450)||(33030891-33030950)
chr5 (378-494)||(25078122-25078239)
chr5 (378-494)||(25136091-25136208)
chr5 (397-459)||(30899945-30900006)
[»] chr1 (92 HSPs)
chr1 (1-498)||(11348324-11348820)
chr1 (7-498)||(29135880-29136369)
chr1 (7-498)||(13547135-13547625)
chr1 (7-498)||(13549046-13549536)
chr1 (7-496)||(37033120-37033605)
chr1 (1-498)||(42298021-42298517)
chr1 (5-498)||(47255386-47255872)
chr1 (7-498)||(193244-193733)
chr1 (26-498)||(37167948-37168420)
chr1 (1-498)||(19754117-19754617)
chr1 (1-498)||(34603202-34603699)
chr1 (28-498)||(47114825-47115294)
chr1 (6-498)||(7482276-7482768)
chr1 (7-449)||(37879006-37879447)
chr1 (1-498)||(19752312-19752808)
chr1 (150-498)||(31925753-31926099)
chr1 (28-371)||(28242041-28242385)
chr1 (1-323)||(34602560-34602881)
chr1 (7-481)||(41135452-41135926)
chr1 (12-498)||(6808083-6808575)
chr1 (330-498)||(31659192-31659360)
chr1 (335-498)||(49918309-49918472)
chr1 (330-498)||(28220272-28220440)
chr1 (330-498)||(28265600-28265768)
chr1 (330-498)||(3156820-3156987)
chr1 (330-498)||(44455114-44455282)
chr1 (330-497)||(834214-834381)
chr1 (330-498)||(37503603-37503768)
chr1 (337-498)||(28223467-28223628)
chr1 (330-498)||(1833476-1833644)
chr1 (330-498)||(8550833-8551001)
chr1 (330-498)||(50167221-50167389)
chr1 (330-497)||(3847168-3847335)
chr1 (330-498)||(37559914-37560083)
chr1 (330-498)||(4552683-4552851)
chr1 (333-498)||(41360872-41361036)
chr1 (330-498)||(50169256-50169424)
chr1 (330-496)||(196956-197122)
chr1 (28-498)||(22078995-22079439)
chr1 (321-498)||(46064864-46065040)
chr1 (330-498)||(13659382-13659550)
chr1 (330-498)||(10925177-10925348)
chr1 (330-495)||(13138025-13138188)
chr1 (330-498)||(3189285-3189452)
chr1 (330-498)||(3198102-3198269)
chr1 (330-498)||(3206941-3207108)
chr1 (330-494)||(23555315-23555479)
chr1 (319-498)||(45644400-45644579)
chr1 (317-496)||(15820249-15820427)
chr1 (339-498)||(16455585-16455743)
chr1 (330-498)||(20762626-20762794)
chr1 (330-498)||(30476492-30476662)
chr1 (319-495)||(928025-928202)
chr1 (330-498)||(40122242-40122412)
chr1 (378-494)||(13316402-13316518)
chr1 (27-263)||(9109681-9109918)
chr1 (1-148)||(31928203-31928343)
chr1 (388-498)||(3460707-3460819)
chr1 (212-484)||(25651922-25652195)
chr1 (330-494)||(51765349-51765515)
chr1 (319-496)||(37282739-37282916)
chr1 (331-463)||(8871129-8871259)
chr1 (378-494)||(9987204-9987319)
chr1 (378-494)||(20622287-20622404)
chr1 (380-457)||(36683694-36683771)
chr1 (70-332)||(16216709-16216966)
chr1 (318-498)||(44650208-44650389)
chr1 (413-498)||(2263020-2263106)
chr1 (360-481)||(12318585-12318706)
chr1 (381-497)||(13938143-13938259)
chr1 (378-494)||(40282379-40282495)
chr1 (360-498)||(9109465-9109603)
chr1 (366-484)||(16914234-16914353)
chr1 (378-494)||(9036419-9036534)
chr1 (134-305)||(12318720-12318889)
chr1 (445-498)||(37876812-37876865)
chr1 (378-494)||(21053960-21054076)
chr1 (393-494)||(32471478-32471579)
chr1 (396-497)||(4535527-4535629)
chr1 (304-484)||(1050503-1050683)
chr1 (224-329)||(3331403-3331505)
chr1 (426-498)||(5459956-5460028)
chr1 (453-498)||(28242382-28242426)
chr1 (157-234)||(4535783-4535861)
chr1 (271-332)||(10157511-10157571)
chr1 (383-498)||(2926516-2926631)
chr1 (348-494)||(6398618-6398764)
chr1 (394-460)||(35109492-35109557)
chr1 (114-165)||(3331283-3331333)
chr1 (114-207)||(38747052-38747144)
chr1 (462-498)||(36683766-36683802)
chr1 (378-494)||(44203633-44203750)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (1-498)||(1631778-1632274)
chr2 (1-498)||(45726556-45727051)
chr2 (1-498)||(35446930-35447426)
chr2 (24-498)||(42288156-42288628)
chr2 (5-498)||(17450221-17450700)
chr2 (12-498)||(24397701-24398180)
chr2 (24-498)||(33647817-33648294)
chr2 (1-233)||(7450926-7451158)
chr2 (330-498)||(36318055-36318223)
chr2 (330-498)||(29867823-29867991)
chr2 (330-498)||(36773516-36773684)
chr2 (7-498)||(30218090-30218570)
chr2 (330-497)||(42362306-42362473)
chr2 (317-498)||(33162496-33162676)
chr2 (330-498)||(17057415-17057583)
chr2 (330-498)||(17085398-17085566)
chr2 (330-498)||(38312194-38312362)
chr2 (330-498)||(723790-723958)
chr2 (330-498)||(11151637-11151805)
chr2 (330-498)||(11690455-11690623)
chr2 (7-329)||(42261826-42262146)
chr2 (330-498)||(34139816-34139985)
chr2 (330-498)||(2334464-2334631)
chr2 (330-498)||(14633871-14634040)
chr2 (330-498)||(11067259-11067427)
chr2 (330-498)||(5723302-5723468)
chr2 (333-498)||(36988122-36988286)
chr2 (329-498)||(6595052-6595221)
chr2 (319-498)||(13121712-13121889)
chr2 (330-494)||(45099709-45099872)
chr2 (330-478)||(24885615-24885763)
chr2 (330-494)||(4503183-4503346)
chr2 (333-494)||(36205715-36205874)
chr2 (330-494)||(4484380-4484544)
chr2 (325-496)||(7815321-7815492)
chr2 (330-494)||(30833300-30833464)
chr2 (317-498)||(17490194-17490368)
chr2 (319-498)||(11049493-11049676)
chr2 (330-498)||(14202458-14202621)
chr2 (410-498)||(26353218-26353306)
chr2 (319-484)||(12123644-12123809)
chr2 (424-498)||(7451166-7451240)
chr2 (378-498)||(32289567-32289686)
chr2 (330-420)||(39284839-39284929)
chr2 (378-494)||(6266693-6266809)
chr2 (397-499)||(42261530-42261633)
chr2 (396-497)||(41454254-41454356)
chr2 (219-331)||(43730992-43731101)
chr2 (396-484)||(34811281-34811370)
chr2 (422-498)||(42019916-42019995)
chr2 (385-497)||(24197906-24198018)
chr2 (396-496)||(41446159-41446260)
chr2 (390-464)||(15903841-15903913)
chr2 (378-494)||(13656082-13656198)
chr2 (390-447)||(28770725-28770781)
chr2 (119-177)||(24197643-24197700)
chr2 (339-497)||(7597057-7597217)
chr2 (158-263)||(16676027-16676133)
chr2 (425-468)||(4561137-4561180)
chr2 (390-464)||(2869643-2869717)
chr2 (427-496)||(3897041-3897111)
chr2 (22-55)||(44750240-44750273)
chr2 (378-494)||(12647436-12647553)
chr2 (435-498)||(28671989-28672053)
chr2 (470-498)||(39284930-39284958)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (7-498)||(6960-7449)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (2-498)||(6431598-6432093)
chr7 (1-498)||(34310762-34311259)
chr7 (1-498)||(4512436-4512931)
chr7 (7-498)||(29608373-29608859)
chr7 (7-498)||(2361018-2361507)
chr7 (27-498)||(2389934-2390404)
chr7 (9-498)||(48599380-48599858)
chr7 (1-498)||(4508752-4509239)
chr7 (5-498)||(22269604-22270095)
chr7 (1-498)||(4510594-4511081)
chr7 (1-498)||(3258621-3259117)
chr7 (7-378)||(6360077-6360448)
chr7 (158-498)||(8359362-8359703)
chr7 (12-498)||(22328436-22328931)
chr7 (319-498)||(47673989-47674167)
chr7 (1-190)||(32358189-32358378)
chr7 (330-498)||(48491533-48491701)
chr7 (331-498)||(30024778-30024945)
chr7 (330-498)||(4586115-4586283)
chr7 (330-498)||(14069879-14070047)
chr7 (330-498)||(14379907-14380075)
chr7 (330-498)||(26417270-26417438)
chr7 (330-498)||(27347771-27347939)
chr7 (330-498)||(31733015-31733183)
chr7 (319-498)||(36146454-36146633)
chr7 (330-496)||(31105441-31105607)
chr7 (330-498)||(47676182-47676350)
chr7 (330-498)||(1113611-1113779)
chr7 (330-498)||(43864198-43864366)
chr7 (330-498)||(8153296-8153464)
chr7 (330-498)||(41317480-41317648)
chr7 (330-492)||(18126598-18126760)
chr7 (330-496)||(38671270-38671436)
chr7 (330-498)||(496029-496197)
chr7 (330-494)||(35853869-35854032)
chr7 (330-498)||(48489385-48489553)
chr7 (330-498)||(41649057-41649224)
chr7 (319-486)||(31518739-31518905)
chr7 (317-498)||(23554982-23555162)
chr7 (31-292)||(5116290-5116551)
chr7 (330-498)||(29991009-29991175)
chr7 (323-498)||(23565107-23565282)
chr7 (330-462)||(12097941-12098073)
chr7 (330-489)||(4178729-4178886)
chr7 (319-498)||(36574561-36574740)
chr7 (319-498)||(4253574-4253754)
chr7 (330-498)||(19502132-19502300)
chr7 (380-498)||(25615857-25615975)
chr7 (330-494)||(25767010-25767171)
chr7 (409-498)||(32358100-32358189)
chr7 (219-469)||(1360226-1360478)
chr7 (7-115)||(30814397-30814505)
chr7 (330-494)||(48408757-48408922)
chr7 (329-457)||(4538627-4538755)
chr7 (402-498)||(2759243-2759339)
chr7 (335-493)||(23343934-23344092)
chr7 (419-498)||(6359998-6360077)
chr7 (330-455)||(24525985-24526111)
chr7 (384-498)||(31518911-31519024)
chr7 (378-494)||(39731371-39731487)
chr7 (378-494)||(43504204-43504321)
chr7 (325-484)||(3904676-3904836)
chr7 (330-407)||(2761439-2761516)
chr7 (360-496)||(5116589-5116725)
chr7 (450-498)||(24525548-24525596)
chr7 (378-494)||(20343899-20344015)
chr7 (192-346)||(23794024-23794176)
chr7 (319-440)||(5514113-5514234)
chr7 (114-294)||(22552683-22552866)
chr7 (382-494)||(24789847-24789959)
chr7 (396-497)||(43363518-43363622)
chr7 (330-393)||(24514912-24514974)
chr7 (116-291)||(43363667-43363839)
chr7 (388-484)||(27073828-27073925)
chr7 (388-484)||(27204388-27204485)
chr7 (378-494)||(6592390-6592507)
chr7 (410-498)||(18396352-18396440)
chr7 (381-458)||(26639326-26639402)
chr7 (378-494)||(6594608-6594725)
chr7 (378-494)||(18388810-18388927)
chr7 (378-494)||(18392246-18392363)
chr7 (319-370)||(25615807-25615858)
chr7 (390-464)||(28617176-28617249)
chr7 (470-498)||(30814530-30814558)
[»] chr4 (103 HSPs)
chr4 (7-498)||(54882652-54883142)
chr4 (7-498)||(6655588-6656078)
chr4 (1-498)||(8665032-8665530)
chr4 (7-498)||(50673893-50674382)
chr4 (24-498)||(12073042-12073514)
chr4 (7-498)||(50262747-50263234)
chr4 (7-496)||(2209340-2209834)
chr4 (1-498)||(27417011-27417493)
chr4 (1-498)||(41964042-41964538)
chr4 (9-498)||(46703135-46703623)
chr4 (7-467)||(55085442-55085902)
chr4 (27-498)||(35662094-35662563)
chr4 (25-498)||(379028-379502)
chr4 (102-498)||(8647865-8648261)
chr4 (1-332)||(26363891-26364222)
chr4 (265-498)||(40632335-40632567)
chr4 (14-498)||(33989501-33989967)
chr4 (7-269)||(40630616-40630878)
chr4 (116-498)||(12119281-12119662)
chr4 (9-498)||(22882796-22883287)
chr4 (9-498)||(22934460-22934951)
chr4 (12-498)||(26699488-26699979)
chr4 (4-261)||(46569828-46570085)
chr4 (294-498)||(41639345-41639548)
chr4 (58-498)||(33089582-33090001)
chr4 (330-498)||(26175682-26175850)
chr4 (330-498)||(36994478-36994646)
chr4 (330-499)||(54199951-54200120)
chr4 (330-498)||(5429633-5429801)
chr4 (330-498)||(9927504-9927671)
chr4 (319-496)||(24969055-24969232)
chr4 (330-498)||(34570460-34570628)
chr4 (330-498)||(52095408-52095576)
chr4 (330-498)||(56178683-56178850)
chr4 (7-443)||(35369542-35369971)
chr4 (317-498)||(36463435-36463615)
chr4 (330-498)||(37740580-37740747)
chr4 (330-498)||(48893684-48893856)
chr4 (336-498)||(3913408-3913570)
chr4 (332-498)||(12745482-12745648)
chr4 (313-498)||(21688186-21688371)
chr4 (7-443)||(35370449-35370874)
chr4 (1-160)||(8653225-8653385)
chr4 (319-498)||(52467400-52467579)
chr4 (330-498)||(48142996-48143165)
chr4 (330-498)||(12739596-12739764)
chr4 (330-498)||(12747802-12747970)
chr4 (330-498)||(29254448-29254616)
chr4 (334-498)||(47038457-47038619)
chr4 (1-184)||(10071510-10071693)
chr4 (362-498)||(26364223-26364358)
chr4 (330-495)||(4587912-4588078)
chr4 (330-498)||(5871774-5871942)
chr4 (330-496)||(31474104-31474271)
chr4 (319-498)||(37229767-37229947)
chr4 (7-321)||(3785722-3786034)
chr4 (330-486)||(52082715-52082871)
chr4 (330-498)||(6542225-6542395)
chr4 (326-464)||(41639214-41639351)
chr4 (364-498)||(46147437-46147570)
chr4 (330-497)||(45687229-45687397)
chr4 (330-498)||(29999852-30000019)
chr4 (389-498)||(12743971-12744080)
chr4 (389-498)||(12745360-12745469)
chr4 (396-498)||(12744093-12744195)
chr4 (319-498)||(51337008-51337186)
chr4 (320-498)||(5207888-5208066)
chr4 (32-218)||(38811404-38811590)
chr4 (330-498)||(5370129-5370300)
chr4 (330-497)||(13009491-13009645)
chr4 (220-480)||(32091324-32091583)
chr4 (86-303)||(34112323-34112539)
chr4 (378-494)||(13992343-13992459)
chr4 (119-333)||(41961152-41961368)
chr4 (67-169)||(10071963-10072065)
chr4 (7-332)||(25723433-25723752)
chr4 (317-481)||(48142440-48142605)
chr4 (319-495)||(29056301-29056478)
chr4 (378-494)||(31495366-31495483)
chr4 (28-130)||(32091222-32091326)
chr4 (348-498)||(53345189-53345340)
chr4 (309-497)||(52065530-52065719)
chr4 (22-159)||(47514885-47515023)
chr4 (421-497)||(34112862-34112939)
chr4 (390-481)||(5349924-5350016)
chr4 (421-498)||(6677514-6677592)
chr4 (396-497)||(16422653-16422755)
chr4 (33-286)||(22629147-22629399)
chr4 (396-468)||(34788851-34788923)
chr4 (378-494)||(8393396-8393512)
chr4 (378-494)||(8395605-8395721)
chr4 (396-482)||(44570427-44570514)
chr4 (422-498)||(21703881-21703958)
chr4 (381-468)||(44967906-44967992)
chr4 (113-174)||(6719324-6719384)
chr4 (410-465)||(1983272-1983325)
chr4 (390-464)||(37781935-37782008)
chr4 (424-496)||(40975057-40975129)
chr4 (116-329)||(6200078-6200291)
chr4 (389-464)||(18377432-18377507)
chr4 (391-448)||(33706593-33706649)
chr4 (390-427)||(42234320-42234357)
chr4 (413-464)||(39774280-39774329)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (7-498)||(42435037-42435527)
chr8 (1-493)||(11383612-11384102)
chr8 (3-498)||(44353423-44353915)
chr8 (7-498)||(40221376-40221867)
chr8 (7-498)||(4283178-4283646)
chr8 (88-498)||(40328492-40328902)
chr8 (220-498)||(18655246-18655522)
chr8 (319-498)||(27811222-27811400)
chr8 (330-497)||(4731612-4731779)
chr8 (1-231)||(22976160-22976389)
chr8 (330-498)||(15212740-15212908)
chr8 (318-498)||(10930245-10930424)
chr8 (319-498)||(18141764-18141942)
chr8 (330-498)||(33352104-33352272)
chr8 (330-498)||(30143296-30143462)
chr8 (330-498)||(43036377-43036545)
chr8 (330-494)||(9765703-9765863)
chr8 (333-498)||(19491745-19491909)
chr8 (317-498)||(40321022-40321202)
chr8 (330-498)||(5689225-5689393)
chr8 (319-498)||(30291549-30291729)
chr8 (330-494)||(1345421-1345585)
chr8 (330-498)||(3303716-3303884)
chr8 (331-498)||(42498149-42498316)
chr8 (336-493)||(1292514-1292671)
chr8 (330-498)||(34254377-34254543)
chr8 (7-327)||(40585356-40585675)
chr8 (330-498)||(6598926-6599094)
chr8 (330-498)||(6674379-6674547)
chr8 (330-498)||(34256553-34256719)
chr8 (27-240)||(2999823-3000037)
chr8 (330-498)||(12702680-12702852)
chr8 (330-494)||(17982607-17982771)
chr8 (330-498)||(41366660-41366828)
chr8 (319-498)||(4162444-4162618)
chr8 (330-494)||(31218211-31218375)
chr8 (325-496)||(8965739-8965910)
chr8 (330-498)||(18106126-18106292)
chr8 (330-494)||(44303808-44303973)
chr8 (330-494)||(19945409-19945574)
chr8 (348-498)||(3772164-3772314)
chr8 (330-494)||(1746269-1746432)
chr8 (330-495)||(10929753-10929907)
chr8 (330-465)||(41364926-41365061)
chr8 (330-498)||(4743260-4743417)
chr8 (14-144)||(20686456-20686586)
chr8 (414-496)||(10015119-10015200)
chr8 (378-494)||(2627737-2627854)
chr8 (319-498)||(8153705-8153880)
chr8 (40-333)||(3846032-3846321)
chr8 (279-485)||(10240061-10240264)
chr8 (219-447)||(33655402-33655628)
chr8 (410-498)||(1822326-1822415)
chr8 (410-498)||(1856771-1856860)
chr8 (410-498)||(7597648-7597737)
chr8 (410-498)||(11712046-11712135)
chr8 (119-263)||(9633817-9633959)
chr8 (378-494)||(25689957-25690072)
chr8 (37-196)||(3817679-3817840)
chr8 (436-498)||(3073919-3073981)
chr8 (378-494)||(3439506-3439621)
chr8 (410-480)||(3231859-3231930)
chr8 (454-497)||(4733784-4733827)
chr8 (421-496)||(30909413-30909487)
chr8 (426-498)||(32902219-32902292)
chr8 (61-356)||(40535538-40535819)
chr8 (1-69)||(10239714-10239782)
chr8 (424-493)||(11137073-11137146)
chr8 (220-329)||(10020292-10020398)
chr8 (417-483)||(40585754-40585822)
chr8 (390-464)||(9054788-9054861)
chr8 (219-345)||(10101351-10101475)
chr8 (410-498)||(29796366-29796456)
chr8 (348-484)||(7444878-7445014)
chr8 (86-159)||(10020151-10020224)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (7-496)||(49199517-49200007)
chr3 (1-498)||(30235750-30236247)
chr3 (24-498)||(34490862-34491334)
chr3 (14-498)||(6095645-6096128)
chr3 (1-498)||(54593330-54593826)
chr3 (7-498)||(4569583-4570074)
chr3 (1-498)||(47303877-47304373)
chr3 (7-493)||(43401852-43402326)
chr3 (25-498)||(46860120-46860596)
chr3 (7-496)||(43403792-43404269)
chr3 (7-494)||(36018482-36018970)
chr3 (24-498)||(41819569-41820040)
chr3 (1-498)||(55302018-55302507)
chr3 (7-378)||(40912969-40913346)
chr3 (12-468)||(5433952-5434410)
chr3 (5-247)||(28074247-28074488)
chr3 (287-477)||(31340268-31340457)
chr3 (7-487)||(35138762-35139250)
chr3 (319-498)||(44700524-44700703)
chr3 (330-498)||(5236502-5236670)
chr3 (330-498)||(40734452-40734620)
chr3 (319-498)||(29196432-29196612)
chr3 (330-498)||(44331499-44331667)
chr3 (330-498)||(22835048-22835216)
chr3 (330-498)||(29810822-29810990)
chr3 (330-498)||(40735337-40735505)
chr3 (320-498)||(46173311-46173479)
chr3 (330-498)||(19683935-19684103)
chr3 (330-496)||(51398768-51398934)
chr3 (334-498)||(760805-760969)
chr3 (330-498)||(29682313-29682481)
chr3 (330-498)||(31314399-31314567)
chr3 (319-498)||(53921549-53921727)
chr3 (330-498)||(45095119-45095285)
chr3 (318-496)||(9666514-9666693)
chr3 (330-496)||(32891057-32891224)
chr3 (330-495)||(39153410-39153575)
chr3 (330-498)||(7762220-7762387)
chr3 (330-498)||(9581237-9581404)
chr3 (330-498)||(16498984-16499151)
chr3 (330-498)||(29813017-29813185)
chr3 (330-498)||(37408413-37408580)
chr3 (330-494)||(5258194-5258358)
chr3 (330-496)||(7764422-7764584)
chr3 (330-494)||(5260373-5260537)
chr3 (330-494)||(23200188-23200350)
chr3 (13-323)||(34795507-34795815)
chr3 (330-496)||(23391957-23392123)
chr3 (233-493)||(26323124-26323385)
chr3 (330-494)||(9636176-9636340)
chr3 (330-494)||(23197989-23198151)
chr3 (33-329)||(1683146-1683440)
chr3 (319-496)||(23410377-23410553)
chr3 (219-498)||(20937501-20937778)
chr3 (7-443)||(39127191-39127614)
chr3 (14-235)||(26323821-26324042)
chr3 (379-496)||(32744484-32744600)
chr3 (379-494)||(7780054-7780168)
chr3 (7-83)||(31340501-31340577)
chr3 (378-494)||(801093-801210)
chr3 (343-495)||(5373198-5373353)
chr3 (366-497)||(4055810-4055941)
chr3 (333-428)||(26386597-26386692)
chr3 (435-498)||(40913352-40913415)
chr3 (360-498)||(51352157-51352293)
chr3 (378-494)||(6716502-6716617)
chr3 (378-494)||(54635127-54635242)
chr3 (398-497)||(25491014-25491114)
chr3 (396-493)||(54739004-54739102)
chr3 (320-496)||(1313852-1314029)
chr3 (410-498)||(33191866-33191953)
chr3 (116-171)||(31340448-31340503)
chr3 (319-446)||(2075156-2075281)
chr3 (317-484)||(8166516-8166685)
chr3 (381-498)||(4075516-4075636)
chr3 (378-494)||(45282985-45283104)
chr3 (390-464)||(4386868-4386941)
chr3 (391-497)||(3148037-3148144)
chr3 (424-481)||(2020187-2020245)
chr3 (396-465)||(28253346-28253416)
chr3 (395-484)||(24635276-24635366)
chr3 (271-329)||(36796692-36796749)
chr3 (219-277)||(50432840-50432898)
chr3 (7-40)||(20937375-20937408)
chr3 (450-479)||(31340242-31340271)
chr3 (378-494)||(3617451-3617568)
chr3 (378-494)||(25637428-25637545)
chr3 (410-465)||(37761548-37761604)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (9-489)||(80338-80817)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (7-494)||(11190-11675)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (3-498)||(18050-18540)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (7-329)||(490661-490981)
scaffold0002 (319-494)||(434477-434651)
scaffold0002 (397-499)||(490365-490468)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (330-498)||(149143-149311)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (330-498)||(114557-114724)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (330-498)||(20461-20629)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (1-462)||(1477-1948)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (330-494)||(871-1033)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (330-494)||(11211-11375)
scaffold0491 (360-494)||(8785-8919)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (317-498)||(27488-27670)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (304-497)||(24981-25175)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (360-498)||(10475-10611)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (378-494)||(2654-2771)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (378-494)||(6274-6391)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 462; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26830666 - 26830169
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830666 actccatgatccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 26830567  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830566 aaggtttaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggagtctcttgggaaaaaggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 26830467  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830466 cagatgagcgcagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 26830367  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26830366 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattggaaaaatgggtag 26830267  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830266 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 26830169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 21593292 - 21593786
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  21593292 actccataacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggttagaacttttagggttttagatactaaatgttgagggtctttgggt 21593391  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21593392 gaggttcaaagatttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaa 21593491  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21593492 cacatgagtggagagtcatttttgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttt 21593589  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21593590 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtag 21593688  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593689 aaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 21593786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3809245 - 3808754
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  3809245 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 3809146  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt-ctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3809145 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgtgaaaagggttggttccttttggagaagattcatggggttgggaaacacat 3809046  T
Q  206 gagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3809045 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct-ttttgggg 3808947  T
Q  306 gttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 405  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3808946 gttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcacaagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaataggtagaaatt 3808848  T
Q  406 agagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808847 agggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 3808754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2973477 - 2972985
Alignment:
Q  6 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaagg 104  Q
    ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| || |||    
T  2973477 atgacccatttgttaagagaccttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtttgtagatactaaaggttgaaggtctttgggtgagg 2973378  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  2973377 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgcttttttgggaagattcatggggttgggaaacaca 2973278  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2973277 tgaatgcagagtcatttgtgaacaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttagg 2973178  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaat 404  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2973177 gattagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcataagtgtcgtgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaat 2973079  T
Q  405 tagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973078 taggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 2972985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 498
Target Start/End: Original strand, 5043278 - 5043749
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||    
T  5043278 agcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgaga 5043377  T
Q  125 atcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtg 224  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  5043378 atcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtg 5043476  T
Q  225 agcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgga 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5043477 agcaatttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtggaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattctagagttggg 5043576  T
Q  325 aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagc 424  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5043577 aaacaattgtaaacaccttgtgagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-cgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggtttgttctttgtgagc 5043675  T
Q  425 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5043676 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatca 5043749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 17762613 - 17763112
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  17762613 actccatggcccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgaggatctttgggt 17762712  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga--agattcatggggttggga 198  Q
     | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  17762713 gaagttcaaggcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggtttggtgccttttgggggttagattcatggggttggga 17762812  T
Q  199 aacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctct 298  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762813 aacacatgagtggagagtcttttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctct 17762912  T
Q  299 tttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatggg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17762913 tttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacactttgagagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgagaaaatggg 17763011  T
Q  398 tagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17763012 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatc 17763111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 73 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 603550 - 603134
Alignment:
Q  73 agataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcct 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  603550 agatagtaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgaggaaagggttggtgcct 603451  T
Q  173 tttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtga 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  603450 tttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagtgtcctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtga 603351  T
Q  273 aatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgtt 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  603350 aatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaatcatgagtgtcttgtt 603251  T
Q  373 cattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaac 472  Q
    |||| ||||||||        |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603250 catt-ggtgagat--------tgggtagaaatttgtgttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaac 603160  T
Q  473 tcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || |||||||||||||||||| ||||    
T  603159 tcgttgatagtggattggagaaatca 603134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22425358 - 22424872
Alignment:
Q  11 ccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||| |    
T  22425358 ccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttt-agggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgtggttcaga 22425260  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt--ctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  22425259 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggcctcttgggataagggttggtgcattttggggaagattcatggggttgtgaaacacatggg 22425160  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
     | ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22425159 tgaagagtcatttaagagcaacttcggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctctttt-ggggtt 22425063  T
Q  309 agattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 407  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22425062 agattatagagttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgtt-ggtgagattggaaaaatgggtagaaattag 22424964  T
Q  408 agttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22424963 ggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatca 22424872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 9183245 - 9183077
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  9183245 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatttgt 9183147  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9183146 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 9183077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28137622 - 28137454
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28137622 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 28137524  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137523 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 28137454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 357 - 498
Target Start/End: Original strand, 21588913 - 21589053
Alignment:
Q  357 tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 456  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21588913 tcatgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 21589011  T
Q  457 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21589012 atctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 21589053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 347 - 498
Target Start/End: Original strand, 17757994 - 17758145
Alignment:
Q  347 agagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 445  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17757994 agagtgaaaattcatgagtgtcttcttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 17758092  T
Q  446 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758093 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 17758145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 3039117 - 3038951
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  3039117 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagctttt 3039019  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3039018 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttaatagtggattggagagat 3038951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5406412 - 5406246
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5406412 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 5406316  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5406315 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 5406246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5410737 - 5410571
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5410737 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 5410641  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5410640 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 5410571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26954499 - 26954332
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26954499 attgtaaacacctttggggagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatatg-tgagattgggaaattgg-tataaattagggttgttctttgtgagcttgt 26954402  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26954401 tgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 26954332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 31404897 - 31404721
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31404897 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcag-tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctt 31404802  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404801 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 31404721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 286
Target Start/End: Original strand, 17757797 - 17757995
Alignment:
Q  90 ggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga--agattca 187  Q
    |||||||| || || |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |   |||||||    
T  17757797 ggtctttgggtgagattcaaagcttgaagatgtgaatgttggagaaccaaaatagggggctcttgtgaaaagggttggtgcattttgggggttagattca 17757896  T
Q  188 tggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaag 286  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  17757897 tggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatcatcagtgaaatcaaaggctaag 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 2171744 - 2171582
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2171744 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 2171647  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171646 caaagctaatttcttgtaaccc-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 2171582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 271 - 498
Target Start/End: Original strand, 25073463 - 25073691
Alignment:
Q  271 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtct 368  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||    
T  25073463 gaaattaaaggctaagggttgattctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgggaaacatcttgggtgagtg-aaatcattgagtatct 25073561  T
Q  369 tgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-a 467  Q
    ||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  25073562 tgttcatgggaggagattgaaaaaat-ggtagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaagctattttattgtaacccttttgtatctctatgtaa 25073660  T
Q  468 agaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25073661 agaactcattgatagtggattagagaaatca 25073691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5413606 - 5413440
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  5413606 attgtaaacacattggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttgttctttgcgaacttgt 5413510  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413509 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 5413440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 26800438 - 26800634
Alignment:
Q  43 gaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaa 141  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  26800438 gaaaccaaaggagaaaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtggatcatggataaccaaaa 26800537  T
Q  142 gaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgag 239  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  26800538 gagggggctcttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcat-gggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagcaacttgggtgag 26800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 33211399 - 33211231
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  33211399 attgtaaacaccttgggtcactgaaaatcattgagtgttttgttcattgg-tgagattgggaaaattggtagaaattatggttgttctttgtgagcttga 33211301  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33211300 tgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattggagagatca 33211231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 30834750 - 30834586
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30834750 attgtaaacacctcggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 30834653  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834652 tcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagag 30834586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16452543 - 16452379
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16452543 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 16452446  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452445 tcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttggaagaactcattgatagtggattggagag 16452379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 317 - 498
Target Start/End: Original strand, 4045364 - 4045546
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gtt 414  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  4045364 gagttgggaaacatttgtaaacacctagggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttattgga-gagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgtt 4045461  T
Q  415 ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4045462 ctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatca 4045546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 33160567 - 33160398
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttctttgtgagctt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33160567 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaaatcattgagtgtcttattcattgg-tgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagttgttctttgtgaactt 33160470  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33160469 gtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatggtggattggagagatca 33160398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 25072817 - 25073072
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  25072817 tgactcatttgttgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaagaagtgaacttttagggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 25072916  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcct-tttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||  |||||||| ||||| ||||||| |    
T  25072917 tcaaagcttcaagatgtgaatctttgagaacccaaag-gggggctctt-ggaaaagggattgtgcctcttgggaagagattcatagggtttggaaacaca 25073014  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagat 263  Q
    | |  |||||||| ||| || | ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  25073015 tcaaaggagagtc-tttatgtgaaacttggataggtcttgggaaaccaaaagagaagat 25073072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5741120 - 5740978
Alignment:
Q  213 gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagat 312  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  5741120 gagtcttttgtgagcaatttgggtgaatcttgagaaacaaaaagtgaagatccttagt-aaatcaaaggctaagggttggttacttttggggggttagat 5741022  T
Q  313 tctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaa 355  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  5741021 tctaaagttggaaaacaattggaaaacaccttcggtgagtgaaa 5740978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3072926 - 3072809
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  3072926 ggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca 3072828  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  3072827 ttgatagtgaattggagag 3072809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 419 - 498
Target Start/End: Original strand, 26800630 - 26800709
Alignment:
Q  419 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26800630 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatca 26800709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 380 - 498
Target Start/End: Original strand, 16569037 - 16569144
Alignment:
Q  380 tgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg 478  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||    
T  16569037 tgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaac------------ctttgtaagaactcattg 16569124  T
Q  479 atagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16569125 atagtggattggagagatca 16569144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 412103 - 412220
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||| |  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  412103 ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca 412201  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  412202 ttgatagtggattagagag 412220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 27647863 - 27647978
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  27647863 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 27647959  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27647960 ttgatagtggattggagag 27647978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5409167 - 5409115
Alignment:
Q  446 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409167 aacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 5409115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 16554871 - 16554987
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  16554871 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 16554967  T
Q  476 -ttgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16554968 tttgatagtggattggagag 16554987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 16631427 - 16631543
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  16631427 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 16631523  T
Q  476 -ttgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16631524 tttgatagtggattggagag 16631543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16578684 - 16578568
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  16578684 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactca 16578588  T
Q  476 tt-gatagtggattggagag 494  Q
    || |||||||||||||||||    
T  16578587 tttgatagtggattggagag 16578568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 16616696 - 16616812
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  16616696 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 16616792  T
Q  476 -ttgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16616793 tttgatagtggattggagag 16616812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 16653114 - 16653230
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  16653114 ggtgagattgggaaaa-gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 16653210  T
Q  476 -ttgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  16653211 tttgatagtggattggagag 16653230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6097606 - 6097501
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 477  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||    
T  6097606 ggtgagattggaaaaatgg-tagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac---------tct-tttgtaagaactcatt 6097518  T
Q  478 gatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||    
T  6097517 gatagtggattggagag 6097501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Original strand, 11660452 - 11660574
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctaga 318  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||| | |  | ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  11660452 tttgtgagcaatttggatgaatcttgggagaccaaaagaggataaccatag-gaattcaaaggctaagggttggttcatttt--ggggttagattctaga 11660548  T
Q  319 gttggaaaacaa-ttgtaaacacctt 343  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||    
T  11660549 gttcggaaacaatttgtaaacacctt 11660574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 444
Target Start/End: Original strand, 16567160 - 16567265
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  16567160 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-----------agattgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttg 16567248  T
Q  428 ttgaagctaatttcttg 444  Q
    || ||||||||||||||    
T  16567249 tttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Original strand, 26661580 - 26661621
Alignment:
Q  6 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 47  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661580 atgaccaatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 26661621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Original strand, 26767551 - 26767592
Alignment:
Q  6 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 47  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26767551 atgaccaatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 26767592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 421 - 498
Target Start/End: Original strand, 2908503 - 2908581
Alignment:
Q  421 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2908503 gagcttgttgaagataattttttacaactcttttgtatcttattgtaaagaactcattgatagtggattgaagaaatca 2908581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 99302 - 99245
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 448  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  99302 aaaatgggtagaaattaaagtttgttctctgtgagcttct--aagctaatttcttgtaac 99245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 6027248 - 6027365
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  6027248 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactc 6027344  T
Q  475 a-ttgatagtggattggagag 494  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  6027345 atttgatagtggattggagag 6027365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 25421307 - 25421424
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  25421307 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactc 25421403  T
Q  475 a-ttgatagtggattggagag 494  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  25421404 atttgatagtggattggagag 25421424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 40146887 - 40147383
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  40146887 actccatgacccatttgttggttaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 40146986  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40146987 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 40147086  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147087 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 40147186  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40147187 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtggaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtag 40147285  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147286 aaattagggttgttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 40147383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 213094 - 213587
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  213094 actccatgacccattttttgggtaagcttgatgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 213193  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaa-aaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213194 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 213293  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  213294 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaag----ggttctctt 213389  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  213390 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggta 213488  T
Q  400 gaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213489 gaaattagggttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 213587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 38746637 - 38747127
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  38746637 tgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 38746736  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  38746737 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacgtg 38746836  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746837 agtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttattgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 38746936  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  38746937 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtatcttgttcatt-aatgagattgggaaaatgggtagaaatta 38747035  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38747036 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaaaactcattgatagaggattggagagatca 38747127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 498
Target Start/End: Original strand, 5057698 - 5058167
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtga 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  5057698 agctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaaagcttcaagatgtga 5057797  T
Q  125 atcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtg 224  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5057798 atctttgagaaccaaaagagggg-cttttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtg 5057896  T
Q  225 agcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgga 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5057897 agcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgga 5057996  T
Q  325 aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagc 424  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  5057997 aaacaattgtaaacaccttggaagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc--tgtgagc 5058093  T
Q  425 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058094 ttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 5058167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 498
Target Start/End: Original strand, 28277943 - 28278438
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttggg--taagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaa 102  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |    
T  28277943 catgacccatttgttgaaaataagcttggtgaatctcaaggaaactaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggatga 28278042  T
Q  103 ggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt-ctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaac 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28278043 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaac 28278142  T
Q  202 agatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt 301  Q
    | ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28278143 acatgagtggagagactattgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagattgttagtgaaatcaaatgctaagggttggctctctttt 28278242  T
Q  302 gggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtaga 401  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28278243 aggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtaga 28278341  T
Q  402 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278342 aattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatca 28278438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 10 - 498
Target Start/End: Original strand, 27015168 - 27015645
Alignment:
Q  10 cccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaa 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||    
T  27015168 cccatttgt-gggtatgcttggcgaatctaatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaa 27015266  T
Q  110 aacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  27015267 agcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagaatcatggggttgggaaacacatgagt 27015366  T
Q  210 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtta 309  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015367 ggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtta 27015466  T
Q  310 gattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagag 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27015467 gattctagagttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatgagtgt-ttggtcatt-ggtgagattgggaaaataggtagaaattaggg 27015564  T
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27015565 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaat--------acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgtacagatca 27015645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27638156 - 27637659
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||    
T  27638156 actctatgacccatttgttaaaaaggcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagaatctttgggt 27638057  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27638056 gaggttcaaag-ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgcattttgg-gaagattcatggggttaggaaa 27637959  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaga--agattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctct 298  Q
    || ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  27637958 cacatgagtgaagagtcttttatgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagagaagatccttagtgaaatcaaagactaaaagtttgttctct 27637859  T
Q  299 tttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatggg 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27637858 tttgggggttagatgctagagttgggaaacaattgtgaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgagaaaatggg 27637760  T
Q  398 tagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27637759 tagaaattagggttgttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagat 27637661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 316385 - 316885
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggt------gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtc 93  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  316385 actccttgacccatttgttgagtaagcttggtaatggtgaatctcatggaaactaaaggagagaacttttattgtacttagatactaaaggttgagggtc 316484  T
Q  94 tttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatgggg 192  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  316485 tttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagggggggctcttggg-agagggttggtgccttttggggagagattcataagg 316583  T
Q  193 ttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 292  Q
    |||||||||| || |   ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  316584 ttgggaaacacatcaaaagagagtc-tttgtgagcaactt-ggtgaatcttgggagaccaaaagagaa-aatcctag-gaaatcaaaggctaagggttgg 316679  T
Q  293 ttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || | || ||| ||||| |||||| || || ||||||| |  ||   |||||| |||    
T  316680 ttctcttttgggggttagattttaaagttggaaaacaattgggaaaaactcgggtgagtg-aaatcattgggtctcttgtttaggggaaaagattgagaa 316778  T
Q  392 aatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattgg 490  Q
    ||  ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  316779 aa-aggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggatcgg 316877  T
Q  491 agagatca 498  Q
    || |||||    
T  316878 agggatca 316885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 484
Target Start/End: Original strand, 35615809 - 35616278
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  35615809 atttgttgcgtaagcttggtgaatctccttgaaaccaaatgaaaaaacttttagagtatttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaag 35615908  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| || |||||||||| |||| |||||| || |  |    
T  35615909 cttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttggg-aaaggggtgatgccttttggggagagattcatggagttgagaaacacataaaag 35616007  T
Q  211 gagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttag 310  Q
     |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |   ||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||||||    
T  35616008 aagagtc-tttgtaatcaactttggtgagtcttgggaaaccaaaagcgaaga-tcatcaagaaatcaaaggct-agagttgattctctttt-gtggttag 35616103  T
Q  311 attctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattaga 408  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||  ||  ||||||| | ||||| |||||||||||     
T  35616104 attctagagtttggaaacaattaggaaacaccttgggtgagtg-aaatcattgagtctcttgttcacgggaagagattgag-aaatgagtagaaattagg 35616201  T
Q  409 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 484  Q
     |||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35616202 tttgttcttggagagctcgtttaagttaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 13488147 - 13488325
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13488147 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattgg-taagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 13488244  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13488245 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 13488325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42428644 - 42428476
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  42428644 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattatggtttttctttgtgaacttgt 42428546  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42428545 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 42428476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 214 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16641269 - 16640986
Alignment:
Q  214 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagatt 313  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16641269 agtcaattgtgaacaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatacttaaa-aaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggggattagatt 16641171  T
Q  314 ctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg--ggtagaaattagagt 410  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||    |||||||||||| ||    
T  16641170 ctagagttggggaacatttgtaaacaccttgagtgagtgaaattcattaagtgtcttgttcattggc-gagattgagaaaaaaatggtagaaattagtgt 16641072  T
Q  411 t-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  16641071 ttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctctttgtaagaac---ttgatagtggattggagagatca 16640986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 533723 - 533891
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  533723 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggtctttgtgagcttgt 533821  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  533822 tgaagctaattttttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatca 533891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 39468763 - 39468595
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39468763 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattag-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 39468665  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39468664 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatca 39468595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 435
Target Start/End: Original strand, 4160284 - 4160690
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| || | |||||||  || |||| |||    
T  4160284 agctcggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacatttagggtatttagatactaaagtttgagggt-tttgggtgatgttcaaagtttaaagaagtg 4160382  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttg 222  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||||| ||  | || |||||||||||||    
T  4160383 aatcctggagaactaaaagagggggctcttgggaga-gggtaagtgtcttttggggagagattcatagggttgggaa-cacgtaagtggagagtcatttg 4160480  T
Q  223 tgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 322  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4160481 tgagcaactagggtgaatcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gtaattaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattc-agagttg 4160578  T
Q  323 gaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||| ||| ||| ||||  |  |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| | ||    
T  4160579 agaaacaattgtaaacacattggttgagtgaaatcaatgaatgttttgctcatgagaggagatttggaaaat-ggtagaaattaggtttgttcttggaga 4160677  T
Q  423 gcttgttgaagct 435  Q
     ||||||||||||    
T  4160678 acttgttgaagct 4160690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42426449 - 42426281
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  42426449 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgt 42426351  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42426350 tgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 42426281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 33831624 - 33831802
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33831624 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttg-tgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 33831721  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33831722 tgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatca 33831802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 333 - 498
Target Start/End: Original strand, 537982 - 538147
Alignment:
Q  333 gtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttga 431  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  537982 gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattag-tgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgctctttgtgagcttgttga 538080  T
Q  432 agctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  538081 agctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatca 538147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 33906491 - 33906076
Alignment:
Q  80 aaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag 179  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  33906491 aaaggttgagggtctttgagtgaggttcgaagcctcaaaatgtgaatcttgtagaaccaaaaaagggggctcttgggaga-gggttggtgccttttgggg 33906393  T
Q  180 a-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaa 278  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || |  |||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33906392 agagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagac-ttagtgagcaacttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaa 33906295  T
Q  279 aggctaagggttggttctctttt-gggggttagattctagagttggaaaacaattg-taaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcat 375  Q
    ||||||| |  |||   |||||| ||||| || ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    ||||    
T  33906294 aggctaatgactggcgttcttttggggggatatattctagagttgtgaaacaaatgagaaacaccttgcgagagtgaacatcattgagtgtc----tcat 33906199  T
Q  376 tgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactc 474  Q
     ||  || |||| | ||||||||| |||||||  | || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  33906198 gggaagaaattgtg-aaatgggtataaattaggttagtgcttggagagcttgtcgaagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactc 33906100  T
Q  475 attgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  33906099 attgatagtagattggaaagatca 33906076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 32636778 - 32636946
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  32636778 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgt 32636876  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32636877 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 32636946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16642419 - 16642208
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |    
T  16642419 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagcacttttagggtatttagatactaaaggttgatggtctttggg 16642320  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttggga 198  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  16642319 tgaggttcaaagcttcaagaagtgaatcttgaagaaccaaaagaggg--ctcttggg-aaagggttggtgccttttggggacagattcatggggttagga 16642223  T
Q  199 aacagatgagcggag 213  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16642222 aacacatgagtggag 16642208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8566160 - 8565992
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  8566160 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgagaaaatgggtagaacttaggtttgttctttgtgagcttgt 8566062  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8566061 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctctgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 8565992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14689942 - 14689622
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggg-ttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttc 107  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| | |||| | ||||||||||||| | ||||    
T  14689942 acccatttgttgagtaggcttggtgaatctcatggaaactaaaggagaaaacttttagggcatttagatagtgaaggttaagggtctttgagtgatgttc 14689843  T
Q  108 aaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatga 207  Q
    |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || |  ||||||||| || |    
T  14689842 aaagtttcaagatgtgaattttggagaaccaaaagaaggggttcttgtg-aaagggttggtgccttttggag-agattcgtgagaatgggaaacacataa 14689745  T
Q  208 gcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggt 307  Q
      ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  14689744 aaggagagt-atttgtgagcaacttagataagtcttgggacaccaaaagaaaagatccttag-aaaatcaaaggctaggggttggttctctttt-gggga 14689648  T
Q  308 tagattctagagttggaaaacaattg 333  Q
    |||||||||||||||  |||||||||    
T  14689647 tagattctagagttgtgaaacaattg 14689622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28750869 - 28750701
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||    
T  28750869 attgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaattgt 28750771  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750770 tgaagttaatttcctgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 28750701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 25412716 - 25412882
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25412716 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 25412812  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412813 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 25412882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 13239706 - 13239873
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  13239706 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaaatggtagaaattagggtttttctttgtgaacttgt 13239803  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239804 tgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 13239873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Original strand, 16452035 - 16452200
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  16452035 attgtaaacaccttggta-agtgacaatcattgagtgtcttgttcattga-tgagattggaaaaatgggtagaaattaagtttgttctttctgagcttgt 16452132  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16452133 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagat 16452200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 30182543 - 30182706
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30182543 attgcaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 30182640  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
      |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182641 caaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttggaagaactcattgatagtggattggagag 30182706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 31182927 - 31183092
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  31182927 attgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgg-aaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagtttgt 31183024  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31183025 ttaagttaatttcttgtaa-ccatttgtatccctttgtaagaactcattgatactggattggagagatc 31183092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 13343015 - 13343178
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13343015 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 13343112  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13343113 tcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagag 13343178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30683134 - 30682968
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||| |||||    
T  30683134 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt---ctttgtgaacttgt 30683040  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga--actcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683039 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaatactcattgatagtggattggagagatca 30682968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3075872 - 3075704
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  3075872 attgtaaacacctttgatgagtgaaaatcattgagtgtctcgttcatttg-tgagattgagaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgc 3075774  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  3075773 tgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatca 3075704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5887630 - 5887487
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5887630 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttg-tgagattgagaaaatggatagaaattagatttgttctttgtgagcttgt 5887532  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaact 473  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5887531 ttaagctaatttcttgcaacccatttgtatcactttgtaagaact 5887487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 9049565 - 9049388
Alignment:
Q  320 ttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttcttt 418  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||  |||||||||| |||  | |||    
T  9049565 ttgggaaacatttgtaaacactttgggtgagtaaaaatcactgagtgtcttgttgattag-tgagtttgggaaaatga-tagaaattagtgtttgttttt 9049468  T
Q  419 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9049467 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagagatca 9049388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42310159 - 42309981
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |   ||| ||||    
T  42310159 gttggaaaaca-ttgtaaacattttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgctcattgg-tgagattgagaaattgggtagaaatcaagtttgatctt 42310062  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  42310061 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattagcgagatca 42309981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 321 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13695914 - 13695738
Alignment:
Q  321 tggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttcttt 418  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||    
T  13695914 tggaaaacatttgtaaacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtatctttttctttgga-gagattgggaaaa-gggtacaaattagggtttgttcttt 13695817  T
Q  419 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13695816 gtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagat 13695738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 36074258 - 36074093
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat---gggtagaaattagagttgttctttgtgagct 425  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  36074258 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgcgaact 36074161  T
Q  426 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074160 tgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagag 36074093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 30802579 - 30802782
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaa 111  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||  || |||||||||     
T  30802579 atttgttgagtacgcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggtatttagatattctaggttgagggtctttaggtgaggttcaaag 30802678  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcg 210  Q
    ||||| |||||  ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  30802679 cttcatgatgt-tatcttagagaaccaaaagaggaggctcttggg-aaagggtttgtgccttttggggagagattcatggggttagaaaacacatgagtg 30802776  T
Q  211 gagagt 216  Q
    ||||||    
T  30802777 gagagt 30802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 37439088 - 37439263
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaa--------aatgggtagaaattagagttgttctttgt 420  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||        ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  37439088 attgtaaacactttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttattcattgg-tgagattgggaaggaaaaataaaaggtagaaattagggttgttctttgt 37439185  T
Q  421 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439186 gaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 37439263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 30792872 - 30793072
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  || | ||    
T  30792872 tgacccatttgttaagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagtaaacttttagggtaattagatactaaaggttgagggtctttaggtgatgt 30792971  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| | | | || ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |    
T  30792972 tcaaagcttcaagatgt-tatcttggagaaccaaaatatgtggct-ttgggaaaa-ggttggtgccttttggggagatattcatggggttgggaaacaca 30793068  T
Q  205 tgag 208  Q
    ||||    
T  30793069 tgag 30793072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 330 - 443
Target Start/End: Original strand, 19806338 - 19806449
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19806338 attgtaaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattag-gttgttctttgtgagtttgt 19806434  T
Q  429 tgaagctaatttctt 443  Q
    |||||||||||||||    
T  19806435 tgaagctaatttctt 19806449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 16409477 - 16409593
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcat 476  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  16409477 ggtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcat 16409575  T
Q  477 tgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16409576 tgatagtggattggagag 16409593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10055238 - 10055031
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||| ||  || |||| |||||  ||| ||| |||| || || ||||||    
T  10055238 catttgttgagtaagtttggtgaatctcatagaaatcaaatgatggaacatttagagtacttggatactaaagattgaaggtttttgggtgagattcaaa 10055139  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||     
T  10055138 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagagggctcttggg-aaaggtttggtgccttatggggagagattcacggggttgggaaacacatgagt 10055040  T
Q  210 ggagagtca 218  Q
     ||||||||    
T  10055039 agagagtca 10055031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 26177885 - 26178000
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcat 476  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  26177885 ggtgagattggaaaa--gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcat 26177982  T
Q  477 tgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26177983 tgatagtggattggagag 26178000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18441814 - 18441698
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcat 476  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  18441814 ggtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcat 18441716  T
Q  477 tgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18441715 tgatagtggattggagag 18441698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 9789390 - 9789274
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcat 476  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  9789390 ggtgagattggaaaaa-gggtagaaattaaggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcat 9789292  T
Q  477 tgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9789291 tgatagtggattggagag 9789274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21206076 - 21205842
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcctttt--ggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagt 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||| |||||  ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  21206076 atgtgaatcttagagaaccaaaagatggggttctttggaaa-gggttggtgtctttttcggagagg-ttcatagggttgggaaacacatgagtgaggagt 21205979  T
Q  217 catttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattcta 316  Q
    ||||||| || || |||||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |     
T  21205978 catttgtcagaaatttgggtgaattttaggaaactaaaagtgaagaacctta-tgaaatcaaagactaaggattggttctcttttgagggttagattatg 21205880  T
Q  317 gagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtga 353  Q
    ||||||||| | |||| | |||||||||| | ||||||    
T  21205879 gagttggaatataattgggaaacaccttgagtgagtga 21205842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 498
Target Start/End: Original strand, 3325933 - 3326036
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  3325933 ggtagaaattagttttgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattgtgtatctctttgtaaagaactcaatgatggtggattagagag 3326032  T
Q  495 atca 498  Q
    ||||    
T  3326033 atca 3326036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 29720366 - 29720482
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  29720366 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 29720463  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29720464 ttgatagtggattggagag 29720482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 29722526 - 29722642
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  29722526 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 29722623  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29722624 ttgatagtggattggagag 29722642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 29751326 - 29751210
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  29751326 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 29751229  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29751228 ttgatagtggattggagag 29751210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 42926911 - 42926968
Alignment:
Q  420 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 477  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42926911 tgagattgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 391 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10054969 - 10054862
Alignment:
Q  391 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattg 489  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10054969 aaatgggtagaaattatgtttgttcttgaagagtttgttgaagctaatttcttataa-ccttttgtatctctttgtaatgaactcattgatagtgtattg 10054871  T
Q  490 gagagatca 498  Q
    |||| ||||    
T  10054870 gagatatca 10054862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10700945 - 10700695
Alignment:
Q  246 gaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttg 344  Q
    ||||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||| | ||||||||||    
T  10700945 gaaaccaaacgtgaagatcctcag-gaaataaaaggctaaggtttggtga-cttttgggggctagattctaaaaatgggaaacaattaggaaacaccttg 10700848  T
Q  345 ggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttctt 443  Q
    || | ||||||||||| |||| | ||||||||      ||||||| |||| || ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  10700847 ggtgcgtgaaaatcattgagtattttgttcatgaaaatagattggaaaaaagg-tagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaagctaa-ttctt 10700750  T
Q  444 gtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
     ||||   |||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10700749 ataacatttttgtatctctttaaaaagaactcattgatagtgaagtggagagatc 10700695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22536455 - 22536344
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  22536455 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 22536359  T
Q  476 ttgatagtggattgg 490  Q
    |||||||||||||||    
T  22536358 ttgatagtggattgg 22536344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Original strand, 30802843 - 30802934
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 481  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30802843 aaaatgggtagaa-ttaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 30802934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 494
Target Start/End: Original strand, 22097877 - 22097981
Alignment:
Q  389 gaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggat 487  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  22097877 gaaaaagggtagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataaccc--ttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtggat 22097974  T
Q  488 tggagag 494  Q
    | |||||    
T  22097975 tagagag 22097981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 33906665 - 33906578
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtcttt 96  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  33906665 acccatttgttgaacaagcttggtgaatctcat-gaaaccaaagaagagaacttttagggtatttagatattaaaggttgaggttcttt 33906578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 10593260 - 10593376
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  10593260 ggtgagattgggagaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 10593356  T
Q  476 -ttgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  10593357 tttgatagtggattggagag 10593376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 391
Target Start/End: Original strand, 42926847 - 42926908
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaa 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42926847 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-tttggtgagattgggaa 42926908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 26170776 - 26170880
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 477  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||    
T  26170776 ggtgagattggaaaa--gggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac---------tct-tttgtaagaactcatt 26170863  T
Q  478 gatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||    
T  26170864 gatagtggattggagag 26170880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 483
Target Start/End: Original strand, 6016979 - 6017115
Alignment:
Q  347 agagtgaaaat-catgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaag-ctaatttcttg 444  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||| |||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  6016979 agagtgaaaattcttgagtctcttgttcattagatgaaattgg--aaattggtagaaattag-gttcttctttgagaacctgttgaagactaatttcttg 6017075  T
Q  445 taacccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagt 483  Q
    |||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  6017076 taacctttttttatttcttcgtaagaaactcattgatagt 6017115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 488
Target Start/End: Original strand, 8445764 - 8445828
Alignment:
Q  425 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggatt 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  8445764 ttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagatt 8445828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 489
Target Start/End: Original strand, 42926965 - 42927004
Alignment:
Q  450 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42926965 catttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattg 42927004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 413 - 481
Target Start/End: Original strand, 32609572 - 32609641
Alignment:
Q  413 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 481  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  32609572 ttctttgagagtttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatttctttgtaaagaacttattgata 32609641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 346
Target Start/End: Original strand, 8019464 - 8019557
Alignment:
Q  251 caaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttggg 346  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||    
T  8019464 caaaagtgaagatccttaga-aaatcaaaggctaagg-ttggttat-ttttgggggttagattctatagttgggaaataattaggaaacaccttggg 8019557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 497
Target Start/End: Original strand, 30793195 - 30793258
Alignment:
Q  435 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  30793195 taatttattgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactaattgatagtgaagtggagagatc 30793258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32576419 - 32576344
Alignment:
Q  422 agcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| | | ||||||||    
T  32576419 agcttgttgaagctaattacttataaccattttgtatctcttttaaagaactaattaatagtgaagttgagagatc 32576344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 450
Target Start/End: Original strand, 33030891 - 33030950
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccc 450  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33030891 aaaatgggtagaaattatgttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaaccc 33030950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 25078122 - 25078239
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  25078122 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactc 25078218  T
Q  475 a-ttgatagtggattggagag 494  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  25078219 atttgatagtggattggagag 25078239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 25136091 - 25136208
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  25136091 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactc 25136187  T
Q  475 a-ttgatagtggattggagag 494  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  25136188 atttgatagtggattggagag 25136208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 397 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 30900006 - 30899945
Alignment:
Q  397 gtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc 459  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  30900006 gtagaaaatagagtttgttctttgtgagcttgtag--gctaatttcttgtaacctctttgtatc 30899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 11348324 - 11348820
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||    
T  11348324 actccatgacccatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaagggttgagggtctttgggt 11348423  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11348424 gaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaggtctggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaa 11348523  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348524 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 11348623  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11348624 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaattggtag 11348722  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348723 aaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttctaagaactcattgatagtggattggagagatca 11348820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 29135880 - 29136369
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29135880 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggtt 29135979  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||    
T  29135980 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt-ggaaaaacatg 29136078  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29136079 agtggagagttttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttggggg 29136178  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29136179 ttagattctagagttgtgaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 29136277  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29136278 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatcgtggattggagagatca 29136369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13547625 - 13547135
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  13547625 tgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 13547526  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  13547525 caaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatg 13547426  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547425 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 13547326  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547325 ttagattctagatttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 13547227  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547226 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 13547135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13549536 - 13549046
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  13549536 tgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 13549437  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  13549436 caaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatg 13549337  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549336 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 13549237  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549236 ttagattctagatttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 13549138  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549137 gggttgttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 13549046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 37033605 - 37033120
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||| || |||||    
T  37033605 tgacccttttgttgagtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttac----taaaggttgagggtctttgggtgaggtt 37033510  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  37033509 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatgaggttgggaaacacatg 37033410  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37033409 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttttgggg 37033310  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033309 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 37033211  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033210 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 37033120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42298517 - 42298021
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  42298517 actccctgatccatttgttgggtaagcttggtgaatcccataacaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 42298418  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298417 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 42298318  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42298317 cacatgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctaagtgaaatcaaaggctaagagttggttctcttt 42298218  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42298217 tgggggttagattctagagttgtgaaacaattgtaaacaccttgggagagtaaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaattggtag 42298119  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42298118 aaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatca 42298021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 47255872 - 47255386
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||    
T  47255872 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 47255773  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  47255772 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttgggaaaa----tggtgccttttggggaagattcat-gggttgggaaacaca 47255678  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47255677 tgattggagagtcttttgtgagcaactt-agtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttggg 47255579  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaat 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47255578 ggttagattctagagttgggaaataattgtaaatgccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattggaaaaatgggtagaaat 47255480  T
Q  405 tagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255479 tagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 47255386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 193244 - 193733
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||||    
T  193244 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttcggtgaggtt 193343  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  193344 caaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaaaggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatg 193442  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
     | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193443 tgtgaagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 193542  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  193543 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagggtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgagaaaatgggtagaaatta 193641  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  193642 gggttgttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatca 193733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 498
Target Start/End: Original strand, 37167948 - 37168420
Alignment:
Q  26 gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  37167948 gcttggggaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttacagttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 37168047  T
Q  126 tcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtga 225  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  37168048 tcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtga 37168147  T
Q  226 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37168148 gcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttgattctcttttgggggttagattctagagttggga 37168247  T
Q  326 aacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagct 425  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37168248 aacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagct 37168346  T
Q  426 tgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168347 tgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 37168420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 19754117 - 19754617
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  19754117 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttctagatactaaaggttaagggtctttgggt 19754216  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19754217 gaggttcaaagcaccatgatttgaatcttggaaaaccaagagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 19754316  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattctt---agtgaaatcaaaggctaagggttggttctc 297  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19754317 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttataagtgaaatcaaaggataatggttggttctc 19754416  T
Q  298 ttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattg-ggaaaatgg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  19754417 ttttgggggttagattctagagttgggaaacattcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgagaaaaatgg 19754515  T
Q  397 gtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754516 gtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 19754615  T
Q  497 ca 498  Q
    ||    
T  19754616 ca 19754617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 34603202 - 34603699
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  34603202 actctatgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctttgggt 34603301  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34603302 gatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa 34603401  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603402 cacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 34603500  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggta 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  34603501 tggaggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgaaaaaatgggta 34603599  T
Q  400 gaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34603600 gaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctctttgtaagaactcattgatggtggattgaagagatca 34603699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 498
Target Start/End: Original strand, 47114825 - 47115294
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47114825 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggctttagatattaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagctgtgaatc 47114924  T
Q  128 ttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagc 227  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  47114925 ttggagaaccaaaagagggggctcttgggaacagggttggtaccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatgaatggagagtcttttgtgagc 47115023  T
Q  228 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47115024 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttaatgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaa 47115123  T
Q  328 caattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47115124 caattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttg 47115222  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47115223 tttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatca 47115294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 7482768 - 7482276
Alignment:
Q  6 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||    
T  7482768 atgacccatttagtgaataagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaacggttgagggtctttgggtgaggt 7482669  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt-ctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  7482668 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacaca 7482569  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7482568 tgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttggg 7482471  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaa 403  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7482470 ggttagattctagagttgggaagcaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtattgttcatt-ggtgagattgggtaaatgggtagaaa 7482372  T
Q  404 ttagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7482371 ttagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattggagagatca 7482276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 37879447 - 37879006
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| || |||||    
T  37879447 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggaaggaactgttagggttttagatactaaatgttgaggatctttgggtgaggtt 37879348  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  37879347 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaaaggttggtgccttttggggaaaattcatggggttgggaaacacatg 37879248  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37879247 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttggggg 37879148  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37879147 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaataggtagaaatta 37879049  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 449  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879048 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 37879006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 19752312 - 19752808
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  19752312 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaatgagggaatttttagggttttagatactaaaggttgaaggtctttgggt 19752411  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     |||||| || | |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  19752412 gaggttctaagcgtcataatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttatgaaaagg-ttggtgccttttggggaagattcattgagttgggaaa 19752510  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19752511 cacatgagtggagagtattttgtgagcaacttagatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatgattggttctcttt 19752610  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattg-ggaaaatgggta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  19752611 tgggggttagattctagagttgggaaataatcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgagtaaaatgggta 19752709  T
Q  400 gaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19752710 gaaattagggttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagaggattggagagatca 19752808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 150 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 31926099 - 31925753
Alignment:
Q  150 tcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaa 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31926099 tcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggtttgggaaacacgtgagtggagaatcttttgtgagcaacttgggtgagacttgtgaaa 31926000  T
Q  250 ccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggaga 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  31925999 ccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg-aagcagttgtaaacaccttgggaga 31925901  T
Q  350 gtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925900 gtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 31925802  T
Q  450 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925801 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 31925753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 371
Target Start/End: Original strand, 28242041 - 28242385
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaat 126  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
T  28242041 ttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaat 28242140  T
Q  127 cttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgag 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28242141 cttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcataaggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgag 28242239  T
Q  227 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28242240 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttttaggggttagattctagagttggaaa 28242339  T
Q  327 acaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28242340 acaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcttgagtgtcttgt 28242385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34602881 - 34602560
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  34602881 actctatgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctttgggt 34602782  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34602781 gatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggtaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa 34602682  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34602681 cacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 34602583  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgg 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  34602582 tggaggttagattctagagttgg 34602560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 481
Target Start/End: Original strand, 41135452 - 41135926
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  41135452 tgacccatttgttgaataagcttggttaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttaatgtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 41135551  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    | |||||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |    
T  41135552 tcaaaccttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagaggaagattttgggaga-gggttggtgccttttagggagagattcatggggttgggaaacaca 41135650  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    | |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41135651 tcaaaggagagtc-tttgtgagaaacttgggtgagtcttaggaaaccaaaagagaagatcatttg-gaaattaaaggctaaggattggttctcttttggg 41135748  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaacaattg-taaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaa 402  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||| |  |  |||| |  ||||| ||||||||    
T  41135749 ggttagattctagagttgagaaacatttgaaaaacaccttgggtgag-ggaaatcattgagtctcttgttcctgtgaggagaat-agaaaaagggtagaa 41135846  T
Q  403 attagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 481  Q
    |||||| ||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  41135847 attagatttgttcttgaagaactttttgaagttaatttcttgtaaaccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 41135926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 6808083 - 6808575
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttag-ggttttagataataaaggctga-gggtctttgagtaaggttcaa 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||| ||| ||||||||  || ||||||||    
T  6808083 catttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagattttttagatactaaaggttgaggggtctttaggtgaggttcaa 6808182  T
Q  110 aacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcctttt-ggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||  | ||  || ||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  6808183 aacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagattgggctcttgg--agagattttgtgtcttttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgaa 6808280  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||  ||| || |||||||| |  | ||||||||||| ||| | ||||    
T  6808281 tgaagagtcatttgtgagcaactagggtgagtaatggaaaaccaaaagagaagatcatta-tgtaatcaaagacggaaggttggttctc-tttcgaggtt 6808378  T
Q  309 agattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 407  Q
    ||||||||||||||  ||||| | | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |  |||||| || |||| ||||||||||||    
T  6808379 agattctagagttgagaaacattgggaaacactttgggagagtgaaaattattgagtgtcttgttcatgagtagagattagggaaat-ggtagaaattag 6808477  T
Q  408 ----ag--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
        ||  |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6808478 gattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatca 6808575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 31659192 - 31659360
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31659192 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggctgttctttgtgagcttgt 31659290  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31659291 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatca 31659360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 335 - 498
Target Start/End: Original strand, 49918309 - 49918472
Alignment:
Q  335 aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaag 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49918309 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 49918407  T
Q  434 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49918408 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 49918472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28220440 - 28220272
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28220440 attgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattgg-tgagattcggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 28220342  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220341 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 28220272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28265768 - 28265600
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28265768 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggc-gagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgt 28265670  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28265669 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 28265600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 3156820 - 3156987
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3156820 attgtaaacaccctggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 3156917  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156918 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 3156987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 44455114 - 44455282
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44455114 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 44455212  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44455213 tgaaactaatttcttgtaactcatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 44455282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 834381 - 834214
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  834381 attgtaaacaccttgggtgcgtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 834283  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834282 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 834214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37503768 - 37503603
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37503768 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgt 37503670  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37503669 tgaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 37503603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 337 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28223628 - 28223467
Alignment:
Q  337 acaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagct 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  28223628 acaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgatctttctgaacttgttgaagct 28223530  T
Q  436 aatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28223529 aatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 28223467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 1833476 - 1833644
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |    
T  1833476 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatctat 1833574  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833575 tgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 1833644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8551001 - 8550833
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8551001 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 8550903  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550902 ttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 8550833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 50167389 - 50167221
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  50167389 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaattagtagaaattagggttgttatttgtgagcttgt 50167291  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167290 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatca 50167221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3847335 - 3847168
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3847335 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgt 3847237  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3847236 ttaagctaaatttttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 3847168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37560083 - 37559914
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37560083 attgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattaggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgt 37559985  T
Q  429 tgaa-gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37559984 tgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtgaattggagagatca 37559914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4552851 - 4552683
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  4552851 attgtaaacaccttgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgtcctttgtgagcttgt 4552753  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4552752 tgaagctaatttcttgtaacccctttgtatccctttgtaagaactcattgataatggattggagagatca 4552683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 333 - 498
Target Start/End: Original strand, 41360872 - 41361036
Alignment:
Q  333 gtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaa 432  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41360872 gtaaacatcttgggtgagtgaaaatattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaa 41360970  T
Q  433 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  41360971 actaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatca 41361036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 50169424 - 50169256
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50169424 attgtaaataccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 50169326  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50169325 caaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagtactcattgatagtggattgaagagatca 50169256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 197122 - 196956
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  197122 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgagaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 197024  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197023 ttaagttaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 196956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 498
Target Start/End: Original strand, 22078995 - 22079439
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatc 127  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||       |||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22078995 ttggtgaatcttatggaaactaaatgatggaacttttagggtatta-------aagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatc 22079087  T
Q  128 ttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagc 227  Q
    ||  | |||||||||||||| |  |||||  | ||||||||| | ||||| ||           ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||    
T  22079088 ttaaagaaccaaaagagggggcaattgggtga-gggttggtgtcgtttgggga-----------gttgggaaacacatcaagggagagtc-tttgtgagc 22079174  T
Q  228 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaa 327  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22079175 aacttaggtgagtcttggcaaaccaaaatataagatgctta-tgaaatcaaaggctaaggattg-ttctcttttgggggttagattctagagttgagaaa 22079272  T
Q  328 caattgtaaacaccttg-ggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagctt 426  Q
    ||||||  || | |||  || ||||||||  |||     |||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  22079273 caattgggaaaaacttcaggtgagtgaaac-catt----tcttgttcatgggaagagattggaaaaatgg-tagaaattatgtttgttctttgtgagctt 22079366  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22079367 gttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattgatattggattggagagatca 22079439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 321 - 498
Target Start/End: Original strand, 46064864 - 46065040
Alignment:
Q  321 tggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttg 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  46064864 tggaaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatggataaaaattaggtttgttctttg 46064961  T
Q  420 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46064962 tgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagatca 46065040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13659550 - 13659382
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  13659550 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgt 13659452  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13659451 tgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 13659382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 10925177 - 10925348
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10925177 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgaaaaaatggatagaaattatggttgttctttgtgagcttgt 10925275  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10925276 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaagaattcattgatagtggattggagaaatca 10925348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 13138188 - 13138025
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13138188 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattga-aaaatggatagaaattag-gtcgttctttgtgagcttgt 13138092  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13138091 tgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaacacattgatagtggattgaagaga 13138025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 3189285 - 3189452
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3189285 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattgg-tgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgt 3189382  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189383 tgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 3189452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 3198102 - 3198269
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3198102 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattgg-tgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgt 3198199  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3198200 tgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 3198269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 3206941 - 3207108
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3206941 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattgg-tgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgt 3207038  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3207039 tgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 3207108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23555479 - 23555315
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23555479 attgtaaacaccttgggtgaatgaaaattattgagtgtcttattctttgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 23555381  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555380 tgaaactaatttcttataactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 23555315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 45644579 - 45644400
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgttct 416  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||    
T  45644579 gttggaaaaca-ttgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttct 45644482  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45644481 ttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 45644400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 317 - 496
Target Start/End: Original strand, 15820249 - 15820427
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttc 415  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||||  ||||||    
T  15820249 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttgg-tgatattggaaagatgggtaaaaattaggtttgttc 15820346  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15820347 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttttaagaactcattgatagtgcattgaagagat 15820427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 339 - 498
Target Start/End: Original strand, 16455585 - 16455743
Alignment:
Q  339 accttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaa 437  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  16455585 accttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggtaaaatggtgagaaattagattttttcta-gtgagcttgttgaagctaa 16455682  T
Q  438 tttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455683 tttcttgtaacccatttgtatctctgtgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 16455743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 20762626 - 20762794
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20762626 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtatcttgttcattgg-tgagattgagaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 20762723  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20762724 tcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 20762794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30476662 - 30476492
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattg--ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagctt 426  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  30476662 attgtaaacaccttgggtgggtgaaaatcattgagt-tcttgttcaatattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttatgaactt 30476564  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30476563 gttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggacagatca 30476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 319 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 928202 - 928025
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||  | |||||||||| ||| |||||    
T  928202 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttctttgg-tgatattggaaaaaatgatagaaattagggtttgttct 928104  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  928103 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctctttgtaaaaactcattaatagtggattagagaga 928025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 40122412 - 40122242
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40122412 attgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgaatgtcttgttcatttg-tgagattggaaaaatgggtcgaaattagatttgttctttgtgagcttgt 40122314  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg--atagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  40122313 ttaagctaatttcttataactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatatagtggattagagagatca 40122242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13316518 - 13316402
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 477  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13316518 ggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcatt 13316419  T
Q  478 gatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||    
T  13316418 gatagtggattggagag 13316402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9109918 - 9109681
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaa 125  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || | ||||||| |||| | || ||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9109918 cttggtgaatgtcatggaaatcaaatgatgaaacttttggggtatataaatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 9109819  T
Q  126 tcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtg 224  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| |||| | ||||||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| ||| || |   ||||||| ||||||    
T  9109818 tcttggagaaccaaaaaaggggactcatggg-agagggttgatgtcttttggggagagattcatgaggttgggagacacatcaaatgagagtcttttgtg 9109720  T
Q  225 agcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagat 263  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  9109719 agcaatttggatgagtcttgggaaatcaaaatagaagat 9109681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31928343 - 31928203
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttg-ttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||| |||| |||||||      
T  31928343 actccatgacccatttgattgggtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggaactt--------ttagatactaaaggttgagagtctttgga 31928252  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggt 148  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31928251 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagaaaaccaaaagatgggt 31928203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 388 - 498
Target Start/End: Original strand, 3460707 - 3460819
Alignment:
Q  388 ggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtgg 485  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  3460707 ggaaaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcg 3460806  T
Q  486 attggagagatca 498  Q
    |||||||||||||    
T  3460807 attggagagatca 3460819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 484
Target Start/End: Original strand, 25651922 - 25652195
Alignment:
Q  212 agagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg-gttag 310  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||  ||||||||   ||||  |||||||||||||  |  | |||    
T  25651922 agagttatatgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaagcaaaagtgaagatccttaga-aaatcaaatattaagaattggttctcttttatgaaggtag 25652020  T
Q  311 attctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagag 409  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||| | ||||||||  |   | |||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  25652021 attctagagttgggaaacaattgtaaacaccttaagtgtgtgaaaatcattgagtattttgttcatgagaaaatattgagaaattgg-tagaaatta-ag 25652118  T
Q  410 t-tgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 484  Q
    | |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25652119 tgtgttatttgagagtttgttgaagctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 51765349 - 51765515
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattggga-aaatgggtagaaattagagttgttc-tttgtgagctt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||    
T  51765349 attgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttctt--ggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaactt 51765445  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51765446 gtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagag 51765515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 37282916 - 37282739
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||||||||  || |||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||||     
T  37282916 gttggaaaacttttttaaacaccttgtatgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattgga-gagattg--aaaaatggtataaattagggtttgttcc 37282820  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37282819 ttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagat 37282739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8871259 - 8871129
Alignment:
Q  331 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgtt 429  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  8871259 ttgtaaacaccttggatgagcgaaaatcat-agtgtcttgttcttttg-tgagatttggaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagttcgtt 8871163  T
Q  430 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 463  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  8871162 gaagctaatttcttgtaaccattttgtaactctt 8871129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 9987204 - 9987319
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 476  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||||  |||||||| |||| | ||||||||||    
T  9987204 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaacct-tttgtatcccttttgcaagaactcat 9987301  T
Q  477 tgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9987302 tgatagtggattggagag 9987319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20622404 - 20622287
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc---tctttgtaagaactc 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| || ||||||||   | |||||||||||||    
T  20622404 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttttgtaagaactc 20622307  T
Q  475 attgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  20622306 tttgatagtggattggagag 20622287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 380 - 457
Target Start/End: Original strand, 36683694 - 36683771
Alignment:
Q  380 tgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 457  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36683694 tgagattgggaaaataggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta 36683771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16216966 - 16216709
Alignment:
Q  70 tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtg 169  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||| || |  ||||||  ||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16216966 tttagaaactaaaggttaagggtctttgggtgatattcaaaggttcaagatgtatatcttgaagaaccaaaagagggggctctt-cgaaaagggttggtg 16216868  T
Q  170 ccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattctta 268  Q
    | ||||||| | | |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||  ||   |||||||||||| ||||    
T  16216867 cattttggatagaaattcat-gtgttggcaaacacatgagaggagagtca-ttgtgagcaacttgagtgaattttgaaaacttaaaagagaagatcctta 16216770  T
Q  269 gtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt 332  Q
    | |||||||||||||| | |||||||   |||   |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16216769 g-gaaatcaaaggctacgagttggtttagttt--agggttagattctagagttgagaaacaatt 16216709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 318 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44650389 - 44650208
Alignment:
Q  318 agttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgttc 415  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |||||   ||| |||||| |  ||||||    
T  44650389 agttggaaaacatttgtaaacactttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcatt-ggagagattgagaaaa-atgtaaaaattatggtttgttc 44650292  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||||  | ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44650291 tttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaaatcttttatatctctttgtaaataattcattaatagtggattgaagagatca 44650208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2263106 - 2263020
Alignment:
Q  413 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2263106 ttcttggtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatca 2263020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 360 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12318706 - 12318585
Alignment:
Q  360 tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc 459  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  12318706 tgagtttcttgttcatgggtagagatttggaaa-tgggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatg 12318608  T
Q  460 tctt-tgtaagaactcattgata 481  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  12318607 tcttctttaagaactcattgata 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 497
Target Start/End: Original strand, 13938143 - 13938259
Alignment:
Q  381 gagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctttgtaagaa-ctcattg 478  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13938143 gagattgggaaa-tgggtagaaattag-gttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattg 13938240  T
Q  479 atagtggattggagagatc 497  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13938241 atagtggattggagagatc 13938259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 40282379 - 40282495
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  40282379 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 40282476  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40282477 ttgatagtggattggagag 40282495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 360 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 9109603 - 9109465
Alignment:
Q  360 tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgtt-ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 458  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||  |||||||| |||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9109603 tgagtgtcttgttcatggtaggagattgagaaaatgga-agaaatta-agtttttacttggagaacttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtat 9109506  T
Q  459 ctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  9109505 ctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatca 9109465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 366 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16914353 - 16914234
Alignment:
Q  366 tcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaa-tttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| | |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  16914353 tcttgttcatgggaagagattgggaaa-tgggtaaaaattatgtttgttcttggagagcctgttgaagctaagtttcttctaacccttttgtatctcttt 16914255  T
Q  465 gt-aagaactcattgatagtg 484  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16914254 gtaaagaactcattgatagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 9036419 - 9036534
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  9036419 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 9036515  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  9036516 ttgatagtggattgaagag 9036534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12318889 - 12318720
Alignment:
Q  134 aaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttgg--agaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaact 231  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||| |||||| || |  |||||||  ||| |||||||||    
T  12318889 aaccaaatgagagggctcttgggaga-gggttggtgccttttggggagaag-ttcataggattgagaaacacatcaaaggagagtt-tttatgagcaact 12318793  T
Q  232 tgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12318792 tgggtgagtcttgggagaccaaaatagaaaatcttttg-gaaatcaaaggctaagggttggttctctttggggg 12318720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37876865 - 37876812
Alignment:
Q  445 taacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37876865 taacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatca 37876812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 21053960 - 21054076
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  21053960 ggtgagattgggaaaa-gtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 21054057  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21054058 ttgatagtggattggagag 21054076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 494
Target Start/End: Original strand, 32471478 - 32471579
Alignment:
Q  393 atgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattgga 491  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| || || ||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32471478 atgggtataaattaggtttgttctttgagaact-gttgaagttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattcga 32471576  T
Q  492 gag 494  Q
    |||    
T  32471577 gag 32471579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4535629 - 4535527
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||   |||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  4535629 ggtagaaattaagtttgttcttggagagcttattgaagtcaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagttaagtggagag 4535530  T
Q  495 atc 497  Q
    |||    
T  4535529 atc 4535527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1050683 - 1050503
Alignment:
Q  304 gggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaa 403  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||| ||||| |||| |||   |||||||| |  ||||| ||||||||||  |  |||||||||||| |||||  |||    
T  1050683 gggtgagattcttgggttgggaaacatttgtacacacattgaatgagtgaaattattgagtctcttgttcatgtgaagagattgggaaa-tgggtgaaaa 1050585  T
Q  404 ttagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 484  Q
    ||||   ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1050584 ttaggtgtgttcttcgagagcttattgaagctaatttcttgtaacatttttgtgtctctttgtaaataactcgttgatagtg 1050503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 329
Target Start/End: Original strand, 3331403 - 3331505
Alignment:
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 323  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3331403 gagcaacttaggtgaatcttagggtaccaaaagaggagatccttag-gaaatcaaaggctaagggtttgtt-tctttt-ggggttggattctagagttgg 3331499  T
Q  324 aaaaca 329  Q
     |||||    
T  3331500 gaaaca 3331505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 498
Target Start/End: Original strand, 5459956 - 5460028
Alignment:
Q  426 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5459956 tgttgaagctaatttcttgtaacat-tttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatca 5460028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 498
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242426
Alignment:
Q  453 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatca 28242426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4535861 - 4535783
Alignment:
Q  157 aaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgg 234  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  4535861 aaaagggttggtgtcttttgggaatagattcatggggttgaaaaacacatgagtggatagtcgtttgtgagcaacttgg 4535783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 332
Target Start/End: Original strand, 10157511 - 10157571
Alignment:
Q  271 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10157511 gaaatcaaagactaagggttggttca-tttagggggttagattctaaagttgaaaaacaatt 10157571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 498
Target Start/End: Original strand, 2926516 - 2926631
Alignment:
Q  383 gattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgata 481  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||   || |||||| ||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  2926516 gattggaaaaatgg-tagaaattaggtttgtgcttgaagaacttgttaaagttaatttattgtaacctttttgcatctctttgaaacgaattcattggta 2926614  T
Q  482 gtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||    
T  2926615 gtggattggagagatca 2926631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 494
Target Start/End: Original strand, 6398618 - 6398764
Alignment:
Q  348 gagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 446  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||| |||| | ||||| ||| |     
T  6398618 gagtgaaaatctgtgagtttcttgttcatgggaagagattgggaaa-tgagtagaaattag-gttgttcttggagaacttattgaggttaattacttttt 6398715  T
Q  447 acccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagag 494  Q
     | | || |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6398716 tctctttagtatatctttgtaagaaactcattgatagtgaattggagag 6398764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 460
Target Start/End: Original strand, 35109492 - 35109557
Alignment:
Q  394 tgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct 460  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35109492 tgggtagaaattaaggtttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacctatttgtatct 35109557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Original strand, 3331283 - 3331333
Alignment:
Q  114 tcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggtt 165  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3331283 tcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggtt 3331333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38747144 - 38747052
Alignment:
Q  114 tcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatga 207  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  38747144 tcaagatatgaatcttagacaaccaaaacggggg-ctcttga-aaaagggttggtgccttttggagagaggttcatagggttggaaaacacatga 38747052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 462 - 498
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683802
Alignment:
Q  462 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36683766 tttgtaagaactcattgatagtggattgtagaaatca 36683802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 44203633 - 44203750
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  44203633 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactc 44203729  T
Q  475 a-ttgatagtggattggagag 494  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  44203730 atttgatagtggattggagag 44203750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1632274 - 1631778
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1632274 actccatgacctatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagt 1632175  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1632174 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggggaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaa 1632075  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1632074 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 1631975  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1631974 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattggaaaaatgggtag 1631876  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1631875 aaattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatca 1631778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 45726556 - 45727051
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||    
T  45726556 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 45726655  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45726656 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaa 45726754  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726755 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 45726854  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45726855 tgggggttagattctagggttaggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttattcatt-ggtgagattgggaaaatgggtag 45726953  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726954 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 45727051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 35447426 - 35446930
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||    
T  35447426 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtatttgtgt 35447327  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttg-gaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35447326 gaggttcaaagcttcaagatgtgagtcttgagagaaccaaaagagggg-ctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaa 35447228  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447227 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 35447128  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  35447127 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattggtaaaattggta 35447029  T
Q  400 gaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447028 gaaattagggttgttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 35446930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42288628 - 42288156
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42288628 aagctaggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 42288529  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  42288528 aatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 42288430  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42288429 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttcgggtttagattctagagttgg 42288330  T
Q  324 aaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgag 423  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42288329 gaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcacgagtgtcttgtgcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgag 42288231  T
Q  424 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288230 cttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttctttgtaagagctcattgataatggattggagagatca 42288156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 498
Target Start/End: Original strand, 17450221 - 17450700
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaagg 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  17450221 catgacccatttgttgggcaaacttagagaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgagg 17450320  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||| |    
T  17450321 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccctttgtgaaagattcatggggatgggaaacaca 17450419  T
Q  205 tgagcgga-gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgg 303  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17450420 tgagcgaaggagtcaattgtgagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattag-gaaatcaaaggctaagggttgattctctattgg 17450518  T
Q  304 gggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaa 402  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||     
T  17450519 gggttggattctagagttggcaaacatttgcaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt-ggtgagatttgaaaaatgggtagag 17450617  T
Q  403 attagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17450618 attaggcttgttctttgtgagcttgttgaagctaattt-ttgtaacccatttgt------------gaactcattgatagtggattggagagatca 17450700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Original strand, 24397701 - 24398180
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  24397701 catttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaa--------cttttagggtatttagatactaaaggttgacggtctttgtgtgaggttcaaa 24397792  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||| ||| ||||| |||||     
T  24397793 gcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttagggagagactcatcgggctggtaaacacatgagt 24397892  T
Q  210 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtta 309  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
T  24397893 ggagagtcatttgtgaccaatttgggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-aaagtcaaa-gctaagggttggttc---tttgggggtta 24397987  T
Q  310 gattctagagttggaaaacaattgtaaacacc-ttgggagagtgaaaatc-atgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaa-aatgggtagaaatt- 405  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||     
T  24397988 gattatagagttgggaaacaattgtaaacacctttggaagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgtgaagaaagggtagaagtta 24398086  T
Q  406 agagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24398087 aggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatca 24398180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 498
Target Start/End: Original strand, 33647817 - 33648294
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgt 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  33647817 aagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagagaacttttagagtatttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgt 33647916  T
Q  123 gaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcattt 221  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  33647917 gaatcttggagaatcaaaagaggaggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggagagattcacgaggttggaaaacatatgagtagagagtcattt 33648016  T
Q  222 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 321  Q
    || ||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33648017 gttagctacttaggcgagtcttataaaaccaaaagagaagatccttagggaaatcaaag--caagggttaattatcttttgggggttagattctagagtt 33648114  T
Q  322 ggaaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagag-ttgttcttt 418  Q
    || | | ||  || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  |  ||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  33648115 gggacataaccgtaaaacatcttgggagagtgaaaataattgagtgtcttgtacatgagaggagattgagaaaat-ggtaaaaattagggtttgttcttt 33648213  T
Q  419 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33648214 gtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatca 33648294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 7450926 - 7451158
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| |    
T  7450926 actccatgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttg-gcgtctttggg 7451024  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7451025 tgaggttcaaagcttcaggatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctttggtaaagggttgatgacttttggagaagatttatggggttggaaa 7451124  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttg 233  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7451125 acacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttg 7451158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36318223 - 36318055
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36318223 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 36318125  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36318124 tgaaactaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 36318055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 29867823 - 29867991
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29867823 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 29867921  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29867922 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 29867991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 36773516 - 36773684
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36773516 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggaataaattagggttgttctttgtgagcttgt 36773614  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36773615 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 36773684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30218570 - 30218090
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||| || ||||    
T  30218570 tgacctattcgttgggtaatcttggtgaatattatggaactcaaaggagggaacttttagggtatttagatactatatgttgagggtctttgggtgaggt 30218471  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||  |||| | || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  30218470 tcaaaacatcaaaatgtgaatcttggacaaccaaaaatgagggcttatggg-agagagttagtgccttttggggagagattcatggggttgggaaacaca 30218372  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
      |  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  30218371 ccaaaggagaatc-tttgtgagcaacttgagtgagtcttgcgaaaccaaaag-ggggatccttag-gaaatcaaaagctaaatattggttctcttttggg 30218275  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaa 403  Q
    ||||||  ||||||||||          | ||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||| |   ||||||| | ||||||||||||     
T  30218274 ggttaggctctagagttg----------ggaaacaccttgacagagtggaaatcattgagtgtcttgttcatggaaggagattgag-aaatgggtagaag 30218186  T
Q  404 ttagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  30218185 ttaggtttgttcttggagagcttattgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaataattcattgatagtgggttgaaaagatca 30218090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 42362306 - 42362473
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42362306 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 42362404  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42362405 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 42362473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 317 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 33162676 - 33162496
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttc 415  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33162676 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcatcgagtgtcttgttcattgg-tgaaattaggaaaatgggtagaaattagggttgttc 33162579  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33162578 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctctgtaagaactcattgatagtggattagagagatca 33162496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17057583 - 17057415
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  17057583 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgt 17057485  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17057484 tgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 17057415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17085566 - 17085398
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  17085566 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgt 17085468  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17085467 tgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 17085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 38312194 - 38312362
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38312194 attgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 38312292  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38312293 tgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattggagagatca 38312362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 723958 - 723790
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  723958 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattggaaaactgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 723860  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  723859 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 723790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11151805 - 11151637
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11151805 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattgg-tgaaattgggaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgt 11151707  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11151706 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactcttagatagtggattggagagatca 11151637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 11690455 - 11690623
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11690455 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 11690553  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11690554 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaaatcgttgatagtggattggagagatca 11690623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42262146 - 42261826
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  42262146 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 42262047  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |    
T  42262046 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctttgg-agagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacaca 42261948  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    | |  |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||| | ||  |||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||| ||    
T  42261947 tcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc-cttttagg 42261851  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaaca 329  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  42261850 ggttagaatctagagttgggaaaca 42261826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 34139985 - 34139816
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34139985 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 34139887  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139886 ttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 34139816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2334631 - 2334464
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  2334631 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaataagggttgttctttgtgaacttgt 2334534  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334533 tgaagctaatttctagtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 2334464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14634040 - 14633871
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14634040 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattggtaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgt 14633942  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14633941 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatca 14633871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 11067259 - 11067427
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11067259 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattgg-tgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgttgtactttgtgagcttgt 11067357  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11067358 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattgaagagatca 11067427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5723468 - 5723302
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  5723468 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaa-gggtagaaattaggcttgttctttgtgaacttgt 5723372  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723371 caaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 5723302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 333 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36988286 - 36988122
Alignment:
Q  333 gtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttga 431  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |    
T  36988286 gtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgggattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctatgtgagcttgtcaa 36988189  T
Q  432 agctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988188 aactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 36988122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 329 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 6595221 - 6595052
Alignment:
Q  329 aattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttctttgtgagctt 426  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6595221 aattgtaaacactttgg-agagtgagaatcattgggtgtcttgttcattgg-tgagattaggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 6595124  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6595123 gttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatca 6595052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 13121712 - 13121889
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  13121712 gttgggaaacatttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagactgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttct 13121809  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13121810 ttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc--tttgtatctctttgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatca 13121889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 45099709 - 45099872
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45099709 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 45099806  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099807 tcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagag 45099872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 330 - 478
Target Start/End: Original strand, 24885615 - 24885763
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24885615 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-taaaattgggaaaatgagtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 24885713  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg 478  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  24885714 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctctgtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4503346 - 4503183
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4503346 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgga-gagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 4503249  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503248 tcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagag 4503183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 333 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 36205874 - 36205715
Alignment:
Q  333 gtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttga 431  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |    
T  36205874 gtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaa 36205777  T
Q  432 agctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  36205776 agctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgacagcggattggagag 36205715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4484544 - 4484380
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattggga-aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4484544 attgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttctt--ggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 4484448  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4484447 tcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagag 4484380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 325 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 7815492 - 7815321
Alignment:
Q  325 aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtga 422  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||   |    
T  7815492 aaacatttgtaaacaccttaggtgggtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaaaggtt-gaaattagggtttgttctttagaa 7815395  T
Q  423 gcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7815394 gcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagat 7815321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 30833300 - 30833464
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattggga-aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30833300 attgtaaacactttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttctt--ggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 30833396  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30833397 tcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagag 30833464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 317 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17490368 - 17490194
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttc 415  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    || |||    
T  17490368 gagttggaaaaca-ttgcaaacacagtgggtgggtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgt-tgagattgg-aaaatgg-tagaaatt----ttattc 17490277  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17490276 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttgtaagaactcattgatagtggattgtagagatca 17490194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 11049493 - 11049676
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  11049493 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttttttgg-tgagattaggaaaatgg-tataaattagggtttgttct 11049590  T
Q  417 ---ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11049591 aatttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatca 11049676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14202621 - 14202458
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagctt 426  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||   | ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  14202621 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtgtctttttcatttc-tgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagctt 14202523  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14202522 gtttaagctaatttcttgtaactcat-------cctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatca 14202458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Original strand, 26353218 - 26353306
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26353218 ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaagtactcattgatagtggattggagagatca 26353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 319 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12123809 - 12123644
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12123809 gttgggaaacatttataaacaccttggatgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcatttga-gagattgg-aaaatgagtataaattagagttgttctt 12123712  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 484  Q
    | |||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  12123711 tatgattttgttgaagcttatttcttgtaactcttttgtatcattttgtaaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 498
Target Start/End: Original strand, 7451166 - 7451240
Alignment:
Q  424 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7451166 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatca 7451240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 378 - 498
Target Start/End: Original strand, 32289567 - 32289686
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcat 476  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  32289567 ggtgagattggaaaa--gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcat 32289664  T
Q  477 tgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||  ||| |||||||||    
T  32289665 tgatagtaaattagagagatca 32289686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 420
Target Start/End: Original strand, 39284839 - 39284929
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgt 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39284839 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgctctttgt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 6266693 - 6266809
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  6266693 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 6266790  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6266791 ttgatagtggattggagag 6266809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 42261633 - 42261530
Alignment:
Q  397 gtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    ||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  42261633 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 42261534  T
Q  496 tcat 499  Q
    ||||    
T  42261533 tcat 42261530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Original strand, 41454254 - 41454356
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||| ||    
T  41454254 ggtagaaattagatttgttttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgatagtgaagtggacag 41454353  T
Q  495 atc 497  Q
    |||    
T  41454354 atc 41454356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 331
Target Start/End: Original strand, 43730992 - 43731101
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctaga 318  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| || | ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  43730992 tttgtgagcaatttgggtgaatcttgggaaaccaaaatagaatatccgtag-gaaatcaaagtctaaaggttggtt-tctttt-ggggttaaattctaga 43731088  T
Q  319 gttggaaaacaat 331  Q
    ||||||| |||||    
T  43731089 gttggaagacaat 43731101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 34811370 - 34811281
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtg 484  Q
    |||||||||||   ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34811370 ggtagaaattaagattgctcttagagagcttgttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattgatagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42019995 - 42019916
Alignment:
Q  422 agcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42019995 agcttgtagaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatca 42019916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 497
Target Start/End: Original strand, 24197906 - 24198018
Alignment:
Q  385 ttgggaaaatgggtagaaattagagttgtt-ctttgtgagcttgttgaag-ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgata 481  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24197906 ttgggaaaa-gggtagaaattaaagttttttcttggagaacttgttgaaggctaatttcttgtaaccc--ttgtatctctttgcaagaaactctttgata 24198002  T
Q  482 gtggattggagagatc 497  Q
     |||||||||||||||    
T  24198003 atggattggagagatc 24198018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 496
Target Start/End: Original strand, 41446159 - 41446260
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| | |||||||  |||| |||| | |||||||    
T  41446159 ggtagaaattatgtttgttctttgagagcttgttgaagctaattttaagtaacccttttgtatctctttataaagaactggttgacagtgaagtggagag 41446258  T
Q  495 at 496  Q
    ||    
T  41446259 at 41446260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 464
Target Start/End: Original strand, 15903841 - 15903913
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15903841 aaaatgggtagaaattagaatttgttctttgtgagcttgt--aagcta-tttcttgtaacccctttgtatcacttt 15903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13656198 - 13656082
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||    
T  13656198 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaagaactca 13656102  T
Q  476 tt-gatagtggattggagag 494  Q
    || |||||||||||||||||    
T  13656101 tttgatagtggattggagag 13656082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 447
Target Start/End: Original strand, 28770725 - 28770781
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa 447  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28770725 aaaatgggtagaaattagagtttgttctttgtgagct--tttaagctaatttcttgtaa 28770781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 177
Target Start/End: Original strand, 24197643 - 24197700
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttgg 177  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24197643 atgtgaatcttggggaaccaaaagaggggactcttggg-agagggttggtgccttttgg 24197700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 7597217 - 7597057
Alignment:
Q  339 accttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagcta 436  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||  ||||||||||  || |||| || ||| ||||| ||| |||    
T  7597217 accttaggtgagtgaaaatcactcagtgtcttgttcatgggaagagattgagaaa-tgaatagaaattaggttttgttccttatgaacttgtcgaaacta 7597119  T
Q  437 atttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    |||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  7597118 atttcttgtaagtcttttgtatctttttgtaaagaactcattgattgtagaacggagagatc 7597057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 263
Target Start/End: Original strand, 16676027 - 16676133
Alignment:
Q  158 aaagggttggtgcctttt--ggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaa 255  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||| || | |||  |||| || |||||||    
T  16676027 aaagggttggtgccttttaaggagaa-attcatttggttgggaaacatatgagagaagagttatttctgagcaagttagttgaaacttgggagaccaaaa 16676125  T
Q  256 gagaagat 263  Q
    ||||||||    
T  16676126 gagaagat 16676133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 468
Target Start/End: Original strand, 4561137 - 4561180
Alignment:
Q  425 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4561137 ttgttgaagctaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaa 4561180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 464
Target Start/End: Original strand, 2869643 - 2869717
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagtt--gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  2869643 aaaatgggtagaaattaggtttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaactcctttgtatcacttt 2869717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 496
Target Start/End: Original strand, 3897041 - 3897111
Alignment:
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3897041 gttgaagctaattttttgtaactcttttgtataattttgtaaagaactcattgaaagtggattagagagat 3897111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Original strand, 44750240 - 44750273
Alignment:
Q  22 gtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggag 55  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44750240 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggag 44750273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 12647553 - 12647436
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  12647553 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactc 12647457  T
Q  475 att-gatagtggattggagag 494  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  12647456 atttgatagtggattggagag 12647436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 435 - 498
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672053
Alignment:
Q  435 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatca 28672053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 498
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39284958
Alignment:
Q  470 aactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatca 39284958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 6960 - 7449
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  6960 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 7059  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7060 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 7159  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7160 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 7259  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7260 ttagattctagagctgg-aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattggaaaaatgggtagaaatta 7357  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7358 aggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatca 7449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 498
Target Start/End: Original strand, 6431598 - 6432093
Alignment:
Q  2 ctccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagta 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||     
T  6431598 ctccatgacccatttattgggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtg 6431697  T
Q  102 aggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6431698 aggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaac 6431797  T
Q  202 agatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt 301  Q
    | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6431798 acatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctttt 6431897  T
Q  302 gggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtaga 401  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6431898 gagggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggttagattgggaaaatgggtaga 6431996  T
Q  402 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6431997 aattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatca 6432093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 34311259 - 34310762
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  34311259 actccatgaccaattttttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaaggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtccttggg 34311160  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  34311159 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaaggttcatggggatggaaa 34311060  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34311059 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctctt 34310960  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34310959 ttgggggttagattctagagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggta 34310861  T
Q  400 gaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310860 gaaattagggttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 34310762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4512931 - 4512436
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||    
T  4512931 actccatgacccatttaatgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagattctaaaggttgagggtctttgggt 4512832  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4512831 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaa 4512733  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4512732 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttt 4512633  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4512632 tgggggttatattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgccttgttgatt-ggtgagatttggaaaatgggtag 4512534  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4512533 aaattaaggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatca 4512436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 29608373 - 29608859
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  29608373 tgacccatatgttgataaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 29608472  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||    
T  29608473 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgga-----ttcatggggttgggaaacacatg 29608567  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608568 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 29608667  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaa-atcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 405  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608668 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagcgaaacttcatgagtgtcttgttc-tttggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 29608766  T
Q  406 agagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29608767 agggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatca 29608859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2361507 - 2361018
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| || || ||    
T  2361507 tgacccatttgttgggcaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggattttagatactaaagattgagggtctttgggtgagatt 2361408  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  2361407 caatccttcaagatgtgaatcttgaagaatcaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatg 2361308  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2361307 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gagg 2361209  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361208 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 2361110  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2361109 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagatatca 2361018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 498
Target Start/End: Original strand, 2389934 - 2390404
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  2389934 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaat 2390033  T
Q  127 cttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgag 226  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  2390034 cttggaaaaccaaaagagggggctattgcgaaaagggttggtggcttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggatagtcttttgtgag 2390133  T
Q  227 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2390134 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaa 2390233  T
Q  327 acaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagctt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2390234 acaattgtaaacaccttgggagagcgaaaatcataagtgtcttgttcatt-ggtgaaattcgaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagctt 2390332  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2390333 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcatatatagtggattggagagatca 2390404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 48599858 - 48599380
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  48599858 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 48599759  T
Q  109 aaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    || ||||||||||||||          |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  48599758 aagcttcaagatgtgaa----------ccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaaaacatgag 48599669  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599668 tagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtt 48599569  T
Q  309 agattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattaga 408  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  48599568 atattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttggaggagtgaaaatcatgattgtcttgttcatt-ggtgatattgggaaaatgggtagaaattagg 48599470  T
Q  409 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48599469 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttggaagagctcattgatagtggattggagagatca 48599380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4509239 - 4508752
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  4509239 actctatgacccatttgttgggtaagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggt 4509140  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4509139 gaggttcaaagcttcaagatgtgag--------aaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 4509049  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4509048 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagataagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttt 4508949  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4508948 tatgggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttgatt-ggtgagattgggaaaatgagtag 4508850  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4508849 aaattagggttgttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgagagtggattggagagatca 4508752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 498
Target Start/End: Original strand, 22269604 - 22270095
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaag 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  |||||||||||| || ||    
T  22269604 catgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacatttagggtatgtagatactaaagtttgagggtctttgggtgag 22269703  T
Q  104 gttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacag 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  22269704 gttcaaagctacaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaa-gagttggtgccttttggggaagattcatggggaggggaaacac 22269801  T
Q  204 atgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgg 303  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22269802 atgagtggagagtctattgagagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcataggctatgggttggttctcttttgg 22269901  T
Q  304 gggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaa 402  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22269902 gggttagattctagagttgg-aaacaattctaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaa 22269999  T
Q  403 attagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22270000 attagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactgattgatagtggattggagagatca 22270095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4511081 - 4510594
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  4511081 actctatgacccatttgttgggtaagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggt 4510982  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4510981 gaggttcaaagcttcaagatgtgag--------aaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 4510891  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4510890 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaacgattggttctcttt 4510791  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4510790 tatgggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgccttgttgatt-ggtgagatttggaaaatgggtag 4510692  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4510691 aaattaaggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatca 4510594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 3258621 - 3259117
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||| |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  3258621 actctatgacccatttggtgaaaaaacttggtgaatctcatggaaaccagaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttggg 3258720  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3258721 tgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaacaaaaagatggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaa 3258820  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |    
T  3258821 acatatgagtggagagtcttttattagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-cctaagggttggttctcat 3258918  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3258919 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggt 3259017  T
Q  399 agaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3259018 agaaactagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatca 3259117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6360448 - 6360077
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  6360448 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6360349  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
     |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  6360348 aaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaaggaatggtgccttttgaagaagattcatggagttgaaaaacacatg 6360249  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360248 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 6360149  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgg 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6360148 ttagattctagagttgggaaacaattttaaacaccttgggagaatgaaaatcatgagtgacttgttcattgg 6360077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 158 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 8359703 - 8359362
Alignment:
Q  158 aaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaaga 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8359703 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaaga 8359604  T
Q  258 gaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg-ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa 356  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8359603 gaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagagttggttattttttgggggtttagattcttgagttggaaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaa 8359504  T
Q  357 tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  8359503 tcatgagtgtcttgttcattggg-gagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttg 8359405  T
Q  456 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8359404 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 8359362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22328931 - 22328436
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||    ||||| |||    
T  22328931 catttgttaagtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtatttagatactaaaggttgaggatctttggtggaggttaaaa 22328832  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||     
T  22328831 gcttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagagttggtgccttttggggagagattcatagggttgggaaaaacatgagt 22328732  T
Q  210 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gggggtt 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22328731 agagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaactaaaagagaatatcctta-tgtaatcaaaagctaagggttggttctcttttggggggtt 22328633  T
Q  309 agattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtc----ttgttcattgggtgagattgggaa-aatgggtagaa 402  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||    |||||||||  | ||||||||||| || || |||||    
T  22328632 agatcctaaagttgggaaacaattgtaaacaccttgagggaatgaaaatcattgagtgtcttgtttgttcatt-agagagattgggaagaaaggttagaa 22328534  T
Q  403 attagag-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  22328533 attagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatca 22328436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 47674167 - 47673989
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47674167 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctt 47674070  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47674069 tgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 47673989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32358378 - 32358189
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  32358378 actccatgacccatttgttgaaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 32358279  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatgg 190  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32358278 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaaaattcatgg 32358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 48491533 - 48491701
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48491533 attgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 48491631  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491632 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattggagagatca 48491701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 331 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30024945 - 30024778
Alignment:
Q  331 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgtt 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30024945 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgtt 30024847  T
Q  430 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30024846 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 30024778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 4586115 - 4586283
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4586115 attgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 4586213  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4586214 tgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 4586283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14070047 - 14069879
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14070047 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 14069949  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14069948 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 14069879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14380075 - 14379907
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14380075 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 14379977  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14379976 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 14379907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 26417270 - 26417438
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26417270 attgtaaacaccttgagcgggtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 26417368  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26417369 tgaagataatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatca 26417438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 27347771 - 27347939
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  27347771 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgt 27347869  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27347870 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgcagagatca 27347939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 31733183 - 31733015
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  31733183 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagactgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgg 31733085  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31733084 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggagagatca 31733015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36146633 - 36146454
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36146633 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttat 36146535  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36146534 ttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatca 36146454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31105607 - 31105441
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31105607 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagattttttctttgtgagcttgt 31105509  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31105508 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatggtggattggagagat 31105441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 47676350 - 47676182
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  47676350 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatttgt 47676252  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47676251 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcaatgatagtggaatggagagatca 47676182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 1113611 - 1113779
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1113611 attgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgagaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 1113709  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1113710 tgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatca 1113779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 43864198 - 43864366
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43864198 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaagtgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 43864296  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43864297 tgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactaattgatagtggattggagagatca 43864366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 8153296 - 8153464
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8153296 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagattgt 8153394  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153395 caaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatca 8153464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41317648 - 41317480
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41317648 attgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattgg-tgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 41317550  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317549 caaagctaatttcttgtaatccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 41317480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 330 - 492
Target Start/End: Original strand, 18126598 - 18126760
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18126598 attgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttcattgg-tgagattggaaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 18126696  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggag 492  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126697 tcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggag 18126760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 38671436 - 38671270
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38671436 attgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 38671338  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38671337 ttaagctaatttattgtaacacatttgtatcactttgtaagaactcattgatagtggattgaagagat 38671270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 496197 - 496029
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  496197 attgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgttttgttaatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtagttctttgtgagcttgt 496099  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  496098 tgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattggagagatca 496029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 35853869 - 35854032
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35853869 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 35853966  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853967 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 35854032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 48489385 - 48489553
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgag-tgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||    
T  48489385 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgaaaacttgt 48489483  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48489484 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgcaataactcattcatagtggattggagagatca 48489553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41649224 - 41649057
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41649224 attgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattggaaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 41649126  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41649125 tta-gctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 41649057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 486
Target Start/End: Original strand, 31518739 - 31518905
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  31518739 gttggaaaaca-tcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaataggtagaaattaggtttgttctt 31518836  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 486  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31518837 tgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 317 - 498
Target Start/End: Original strand, 23554982 - 23555162
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgtt 414  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  23554982 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgtt 23555078  T
Q  415 ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555079 ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 23555162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Original strand, 5116290 - 5116551
Alignment:
Q  31 gtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatctt 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5116290 gtgaatctcatggataccaaaggaggggacttttagggtatttaaatactaaaggttgagggtctttaggtgatgttcaaaacttcaagatgtgaatctt 5116389  T
Q  130 ggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagca 228  Q
     || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||  | |   ||| |||||||||||  |    
T  5116390 tgagaaccaaaagagggggctcttggg-agagggtcggtgccttttggagagagattcattggattggtaaacacttcaaatgagggtcatttgtgataa 5116488  T
Q  229 acttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 292  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  5116489 acttaggtgagtcttgggtaaccaaaagagaagatcctcag-gaaatcaaaggttaagagttgg 5116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 29991009 - 29991175
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  29991009 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaa-ggatagaaattagggttgttatttgtgaacttgt 29991105  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29991106 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttctaataactcattgatagtggattggagagatca 29991175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 323 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23565282 - 23565107
Alignment:
Q  323 gaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaa--tgggtagaaattagag-ttgttctttg 419  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||   ||||||||||    
T  23565282 gaaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaacatga--agtgtcttgttcattgg-tgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttg 23565186  T
Q  420 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23565185 tgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 23565107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12098073 - 12097941
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12098073 attgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtt-agattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgt 12097975  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctct 462  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097974 tgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct 12097941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 489
Target Start/End: Original strand, 4178729 - 4178886
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  4178729 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgg 4178826  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 489  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4178827 gaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattg 4178886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36574740 - 36574561
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgttct 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||    
T  36574740 gttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaattatcgagtgtcttgtttattgga-gagattggggaaa--ggtagaaattaagatttgttct 36574644  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36574643 ttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactcattgatagtggtttggagagatca 36574561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4253754 - 4253574
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  4253754 gttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtttcttgttcattgg-tgaaattggtaaaatgg-tagaaattagggtttgttct 4253657  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4253656 ttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactcattgataatggattagagagatca 4253574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 19502132 - 19502300
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggt-agaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  19502132 attgtaaacaccttggt-gagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtgg-tgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggttgttttttgtgagcttg 19502229  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502230 tcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 19502300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 380 - 498
Target Start/End: Original strand, 25615857 - 25615975
Alignment:
Q  380 tgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattga 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25615857 tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcattttgtaagaactcattga 25615956  T
Q  480 tagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  25615957 tagtggattagagagatca 25615975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25767171 - 25767010
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25767171 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg----agattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 25767077  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaa-cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
      ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767076 caaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcattgatagtggattggagag 25767010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 409 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 32358189 - 32358100
Alignment:
Q  409 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358189 gttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 32358100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 219 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1360478 - 1360226
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg-ttagattctag 317  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| || | ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1360478 tttgcgagcaacttgagtgagtcttggaaaaccaaaagagaatatttttgg-gaaatcaaaggatatggattggttctcttttggggggttagattctag 1360380  T
Q  318 agttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttc 415  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||  ||  ||    
T  1360379 agttgaaaaacaattgggaaacacctttggtgagtg-aaatcattgagtctcttgttcatggaatgagattgggaaaa-aggtagaaattaggttttgtc 1360282  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccc--atttgtatctctttgtaag 469  Q
    || | || ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  1360281 ttggagaacttgttgaagcgaatttcttgtaacccttttttgtatctctttgtaag 1360226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 115
Target Start/End: Original strand, 30814397 - 30814505
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| || |||||    
T  30814397 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatacttaaggttgagggtctttgggtgaggtt 30814496  T
Q  107 caaaacttc 115  Q
    |||| ||||    
T  30814497 caaagcttc 30814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 48408757 - 48408922
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||||    
T  48408757 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagggtagaaattaatgttgttctttgtaaacttgt 48408854  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaa-cccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
      ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  48408855 caaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagag 48408922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 329 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4538755 - 4538627
Alignment:
Q  329 aattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||     
T  4538755 aattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaattt 4538657  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 457  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4538656 tttaagctaatttcttgtaacccatttgta 4538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 402 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759243
Alignment:
Q  402 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatca 2759243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 335 - 493
Target Start/End: Original strand, 23343934 - 23344092
Alignment:
Q  335 aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttg-ttctttgtgagcttgttgaa 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  23343934 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctagttcattgg-tgagatttggaaaa-gggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaa 23344031  T
Q  433 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 493  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  23344032 gctaatttcttgtaaccctttagtatatctttgtgagaactcattgataatagattggaga 23344092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 419 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 6360077 - 6359998
Alignment:
Q  419 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6360077 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatca 6359998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 24526111 - 24525985
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  24526111 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttg 24526013  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttg 455  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  24526012 tcaaagctaatttcttgtaactcatttg 24525985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 384 - 498
Target Start/End: Original strand, 31518911 - 31519024
Alignment:
Q  384 attgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 483  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31518911 attgggaaaataggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagctagtt-cttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagt 31519009  T
Q  484 ggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||    
T  31519010 ggattggagagatca 31519024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 39731371 - 39731487
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcat 476  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  39731371 ggtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcat 39731469  T
Q  477 tgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39731470 tgatagtggattggagag 39731487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 43504321 - 43504204
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-ccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  43504321 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca 43504223  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  43504222 ttgatagtgaattggagag 43504204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 3904836 - 3904676
Alignment:
Q  325 aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtga 422  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||    
T  3904836 aaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgggaaaatgg-tagaaattaggttttgttctttgaga 3904739  T
Q  423 gcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 484  Q
    || | |||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3904738 gcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtg 3904676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 330 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2761516 - 2761439
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 407  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2761516 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaattggtagaaattag 2761439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 360 - 496
Target Start/End: Original strand, 5116589 - 5116725
Alignment:
Q  360 tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc 459  Q
    ||||| ||||||| || ||  |||||| |||||| | |||||||||||  |||||||| |  || ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  5116589 tgagtctcttgtttatgggaggagattaggaaaa-gagtagaaattaggtttgttcttggatagtttgttgaagataatttattgtaaaccttttgtatc 5116687  T
Q  460 tctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5116688 tctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagagat 5116725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 450 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24525596 - 24525548
Alignment:
Q  450 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525596 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 24525548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 20343899 - 20344015
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  20343899 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 20343995  T
Q  476 -ttgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  20343996 tttgatagtggattggagag 20344015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23794176 - 23794024
Alignment:
Q  192 gttgggaaacagatgagcgga-gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggtt 290  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |  || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  23794176 gttgagaaacacatgagcggatgagtc-tttgtgagcaatttgggtgaatcgtaagagaccaaaagaggagatccttaga-aaatcaaaggctaatggtt 23794079  T
Q  291 ggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaa-ttgtaaacaccttggg 346  Q
    |||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  23794078 ggttcatttt--gtggttagattctagagttgaaaaacaatttgtaaacacattggg 23794024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5514234 - 5514113
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgttct 416  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||  |||| | |||||||||| |  |||||||    
T  5514234 gttgggaaacacttgtaaacaccttcgatgagtgaaaatcattgagtttcttgttcatttga-gagattgaaaaaa-gagtagaaattatgttttgttct 5514137  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaattt 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5514136 ttgtgagcttgttgaagctaattt 5514113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22552866 - 22552683
Alignment:
Q  114 tcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-agaagattcatggggttgg--------gaaacaga 204  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||        |||||| |    
T  22552866 tcaaaatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgg--aaacggttggtgccttttgggaaaagattcatggctttggaaagatgggaaacaca 22552769  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 294  Q
    |||| || |  || ||||||| | || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22552768 tgagaggtg--tc-tttgtgaactacatgggtgaatcttgggagaccaaaagagaagattcatag-gaaatcaaaggataagggttggtt 22552683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 382 - 494
Target Start/End: Original strand, 24789847 - 24789959
Alignment:
Q  382 agattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattga 479  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||||||| |||| |||| ||||| ||||    
T  24789847 agattgggaaaa-gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacat-tttgtatcccttttgtaaaaactctttga 24789944  T
Q  480 tagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||    
T  24789945 tagtggattggagag 24789959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 43363622 - 43363518
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc--tttgt-aagaactcattgatagtggattggag 492  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||||     
T  43363622 ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctctatttgtaaataactcattgatagtgaagtggat 43363523  T
Q  493 agatc 497  Q
    |||||    
T  43363522 agatc 43363518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24514974 - 24514912
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaa 393  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24514974 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaa 24514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43363839 - 43363667
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggaga 214  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |  | ||||| ||||||||  | ||||||| ||| ||| |||||| |||||  ||||    
T  43363839 aagatgtgtatcttggagaactaaaagagggagctcttgggacattg-ttggttccttttgggaagagattcaaggg-ttgagaaacacatgagatgaga 43363742  T
Q  215 gtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttg 291  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  43363741 gtcctt-gtgagcaatttgggtgaatcttgagagaccaaaagagaagatctttag-gaaattaaatgctaagggttg 43363667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 484
Target Start/End: Original strand, 27073828 - 27073925
Alignment:
Q  388 ggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 484  Q
    ||||||| |||||||||  |  |||||| || |||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27073828 ggaaaattggtagaaatatgttttgttcgttatgagtttattgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27073925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 27204485 - 27204388
Alignment:
Q  388 ggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 484  Q
    ||||||| |||||||||  |  |||||| || |||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27204485 ggaaaattggtagaaatatgttttgttcgttatgagtttattgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27204388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6592507 - 6592390
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 474  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  6592507 ggtgagattgggaaa-tgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactc 6592411  T
Q  475 att-gatagtggattggagag 494  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  6592410 atttgatagtggattggagag 6592390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Original strand, 18396352 - 18396440
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||| ||| |||||||   ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18396352 ttgttcttggagagtttgttgaacctatttttttgtaacat-tttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatca 18396440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 458
Target Start/End: Original strand, 26639326 - 26639402
Alignment:
Q  381 gagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 458  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  26639326 gagattgtgaaaatgg-tagaaattaggtatgttcttggagagtttgttgatgttaatttcttgtaacccttttgtat 26639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6594725 - 6594608
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  6594725 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactc 6594629  T
Q  475 att-gatagtggattggagag 494  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  6594628 atttgatagtggattggagag 6594608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18388927 - 18388810
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  18388927 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactc 18388831  T
Q  475 att-gatagtggattggagag 494  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  18388830 atttgatagtggattggagag 18388810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 18392363 - 18392246
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  18392363 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactc 18392267  T
Q  475 att-gatagtggattggagag 494  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  18392266 atttgatagtggattggagag 18392246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 319 - 370
Target Start/End: Original strand, 25615807 - 25615858
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttg 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  25615807 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg 25615858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 464
Target Start/End: Original strand, 28617176 - 28617249
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  28617176 aaaataggtagaaattaggttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaaccccattgtatcacttt 28617249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 498
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814558
Alignment:
Q  470 aactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatca 30814558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 54882652 - 54883142
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  54882652 tgactcatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 54882751  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54882752 caaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 54882851  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || | |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882852 agtgtagagtcttttgtgagaaacttgggtgagtctcgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 54882951  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882952 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 54883050  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54883051 gggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagggatca 54883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 6655588 - 6656078
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  6655588 tgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6655687  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6655688 caaaactttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 6655787  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  6655788 agtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttgggg 6655887  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  6655888 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcact-tgtgagattgaaaaaatgggtagaaatta 6655986  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6655987 aggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 6656078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 8665032 - 8665530
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  8665032 actccatgacccattttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 8665131  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8665132 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaa 8665231  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||    
T  8665232 acacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggttatgtgttggttttctt 8665331  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggt 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8665332 ttgggggttagattctggagttgggaaacaattgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagaatgggaaaatgggt 8665430  T
Q  399 agaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665431 agaaattagggttgttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 8665530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 50674382 - 50673893
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | |||||||||| || |||||    
T  50674382 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttaaatactaaatgttaagggtctttgggtgaggtt 50674283  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50674282 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctaatgaaaagggttggtgccttatgggaaagattcatggggttgggaaacacatg 50674183  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674182 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 50674083  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50674082 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcgtgttcatt-tgtgagattgagaaaatgagtagaaatta 50673984  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50673983 ggattg-tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 50673893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 498
Target Start/End: Original strand, 12073042 - 12073514
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||     
T  12073042 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgta 12073141  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaa-gggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttg 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||    
T  12073142 aatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaagagtcttttg 12073239  T
Q  223 tgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073240 tgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 12073339  T
Q  323 gaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtga 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12073340 ggaaacaattgtaaacaccttgggagtgtgaaaatcatgagtgtcttgcttatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtga 12073438  T
Q  423 gcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073439 gcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 12073514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 50263234 - 50262747
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| || |||||    
T  50263234 tgacccatttgttgaaaaagtttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagacactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 50263135  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  50263134 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 50263035  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50263034 agtggagagtcttttgtgagcaacctcggtgactcttgtgaaaccaaaagagaagacccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttggggg 50262935  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||    
T  50262934 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgtttat----tgagattgggaaaatggatcgaaatta 50262839  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50262838 cggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagatatca 50262747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 496
Target Start/End: Original strand, 2209340 - 2209834
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||    
T  2209340 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaagcaaatgagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggtt 2209439  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2209440 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaacgaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 2209539  T
Q  207 agcggagagtca-----tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt 301  Q
    || |||||||||     | || |       |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2209540 agtggagagtcaaaggctatgggttggttctcagcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt 2209639  T
Q  302 gggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2209640 gggggttagattctagagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-gttgagattgggaaaatgggtaga 2209738  T
Q  402 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209739 aattagggtttttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 2209834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27417493 - 27417011
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  27417493 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 27417394  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27417393 gaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaggggctcttgggaaaggggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaa 27417294  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||| |||          |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27417293 cacatgagtggagagtctttt----------tgggtgagtcttgtaaaaccaaaaaagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttt 27417204  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  27417203 tgggggttagattcttgagttttgaaacaattgtaaaca----gggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgg-tgagattggtaaaatgtgtag 27417109  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27417108 aaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatca 27417011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 41964042 - 41964538
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  41964042 actctatgacccatttggtgagaaagtttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttggg 41964141  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41964142 tgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagt--cttttgggaaagattcatggggttgggaa 41964239  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964240 acacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 41964339  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggt 398  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  41964340 tt-ggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgtt-ggtgaaattgggaaaatgggt 41964437  T
Q  399 agaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964438 agaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 41964537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 498
Target Start/End: Original strand, 46703135 - 46703623
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttca 108  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  46703135 acccatttgctgaggaggcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 46703234  T
Q  109 aaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    || |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||     
T  46703235 aagcttcaagatgtgaatcttcgagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaa-acatgaa 46703333  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  46703334 tggagagtcttttgtcagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttag-gaaatcaaaggctaaaagttggttctcttttgggggtt 46703432  T
Q  309 agattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 407  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46703433 agattatagtgttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgagtagaaattag 46703531  T
Q  408 agttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46703532 ggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatca 46703623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 55085902 - 55085442
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  55085902 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 55085803  T
Q  107 caaaactt-caagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 205  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  55085802 aaaagctttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 55085703  T
Q  206 gagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  55085702 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgtgtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgattctcctttgggg 55085603  T
Q  306 gttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaat 404  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55085602 gttagattctagagttcggaaacaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcatt-ggtgagatt-ggaaaataggtagaaat 55085505  T
Q  405 tagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgta 467  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55085504 taaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctctttgta 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 27 - 498
Target Start/End: Original strand, 35662094 - 35662563
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaat 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
T  35662094 cttggtgaatctcatggacaccaaatgagagaacttttaggattttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaatatgtgaat 35662193  T
Q  127 cttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgag 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||    
T  35662194 cttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgaatggagagttctttgtgag 35662293  T
Q  227 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  35662294 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttgggtgttagattctagagttgggaa 35662391  T
Q  327 acaattgtaaacaccttgggagagtg-aaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagct 425  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  35662392 acaattgtaaacaccttgagagtgtgaaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagtt 35662490  T
Q  426 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35662491 tgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 35662563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 498
Target Start/End: Original strand, 379028 - 379502
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  379028 agcttggtgaatctcgtggaaaccaaaggagagaacttttaggatttgtagatactaaaggttgagggactttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 379127  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  379128 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggtcggtgccttttggggaagattcatgagaatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 379227  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  379228 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgtgggttagattctagagttgg 379326  T
Q  324 aaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat--catgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtg 421  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  379327 gaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaattagtatcttgttcatt-tgtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtg 379425  T
Q  422 agcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  379426 agcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgctttgtaagaactaattgatagtggattggagagatca 379502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 102 - 498
Target Start/End: Original strand, 8647865 - 8648261
Alignment:
Q  102 aggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaac 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8647865 aggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaac 8647964  T
Q  202 agatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt 301  Q
    | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  8647965 acaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgttatgtgttggttctctttt 8648064  T
Q  302 gggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  8648065 gggggttagattctggagttaggaaacaactgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagaatgggaaaatggatag 8648163  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8648164 aaattagggttgttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatca 8648261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 26363891 - 26364222
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  26363891 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaagggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggcctttgggt 26363990  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26363991 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggggccttttggagaagattcatggggttgggaaa 26364090  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26364091 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttt 26364190  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaatt 332  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26364191 tggtggttagattttagagttgggaaacaatt 26364222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 265 - 498
Target Start/End: Original strand, 40632335 - 40632567
Alignment:
Q  265 cttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagt 364  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632335 cttagtgaaatcaaatgttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagt 40632434  T
Q  365 gtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40632435 gtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt 40632533  T
Q  465 gtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632534 gtaagaactcattgatagtggattggagagatca 40632567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 33989501 - 33989967
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaac 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |    
T  33989501 tttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaagcagataacttttagggtatttagatactaaagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagc 33989600  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcgga 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  33989601 ttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaatagggggctcttgggagaagg-ttggtgccttttgggagagattcatgggattgggaaacacatgagtgga 33989699  T
Q  213 gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  33989700 gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttttgaaaccaaaagagaagatccttag-gtaatcaaaggctaaggatttgttctcttttggaggttagat 33989798  T
Q  313 tctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt 411  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||| ||||||                   ||||| ||||| |||  ||    
T  33989799 tctagagttgggaaacaactgtaaacaccttggttgagtaaaaattattgagtgttttgttc-------------------atgggaagaaactaggttt 33989879  T
Q  412 gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33989880 gttcttagagagtttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatca 33989967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 40630616 - 40630878
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  40630616 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 40630715  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  40630716 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 40630815  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttag 269  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40630816 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 40630878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 498
Target Start/End: Original strand, 12119281 - 12119662
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagag 215  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||| || || || ||     
T  12119281 aagatatgaatcttggagaattaaaaaagggaactcttgggaaa-gggttggttcccttttgggaagattcatggggttgcgaaacacattagtggtgaa 12119379  T
Q  216 tcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 315  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12119380 tcatttgtgagcaatttgggtgtgtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttaa-gaaatcgaagt-taagggttggttctcttttgggggttagattat 12119477  T
Q  316 agagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatc-atgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgt 413  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||| |  ||||    
T  12119478 agagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttca-taggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgt 12119576  T
Q  414 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12119577 tctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatca 12119662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22883287 - 22882796
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttc 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||  | ||||||| ||||||    
T  22883287 acccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttc 22883188  T
Q  108 aaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| || | ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||     
T  22883187 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttggg-agagggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatc 22883089  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gggg 305  Q
    |   ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22883088 aaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttggggg 22882991  T
Q  306 gttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaa 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| | ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||| | ||||||| || |||    
T  22882990 gttagattctagaattggaaaacaattaggtaacgctttgagaaagtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagatt-gaaaaatggataaaaa 22882892  T
Q  404 ttagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22882891 ttaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatca 22882796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22934951 - 22934460
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttc 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||  | ||||||| ||||||    
T  22934951 acccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttc 22934852  T
Q  108 aaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| || | ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| ||     
T  22934851 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttggg-agagggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatc 22934753  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gggg 305  Q
    |   ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22934752 aaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttggggg 22934655  T
Q  306 gttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaa 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| | ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||| | ||||||| || |||    
T  22934654 gttagattctagaattggaaaacaattaggtaacgctttgagaaagtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagatt-gaaaaatggataaaaa 22934556  T
Q  404 ttagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22934555 ttaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatca 22934460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26699979 - 26699488
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||| | ||||||  | |||||||||    
T  26699979 catttgttgagcaagctttgtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttgtagggcatttagatactaaaggttgaagatctttggttgaggttcaaa 26699880  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaaga-ggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttg-gagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| | | |||||    
T  26699879 acttcaagatgtgaatcttagagagccaaatgaagggggatcttggaaaaagggttggtgccttttcagaagagattcatggggtcgggagatacatgag 26699780  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
     ||||| ||||| |||| |||||  | ||||||||   |||| |||||||| |||  ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26699779 tggagattcattagtgaacaactcagatgagtcttagaaaactaaaagagatgatcttta-tgtaatcaaaggttaaaggttggttctcttttaggggtt 26699681  T
Q  309 agattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaa-aatgggtagaaatta 406  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||  | ||||||  ||| || ||||| | ||||    
T  26699680 agattataaagttgggaaacaattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgtttatt-agagagattcagaagaaagggtatagatta 26699582  T
Q  407 gag-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26699581 gggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatca 26699488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 46570085 - 46569828
Alignment:
Q  4 ccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaag 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||  || ||    
T  46570085 ccatgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttagggttttagatactaaatgttgaaggtctttaggtgag 46569986  T
Q  104 gttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacag 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  46569985 gttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggattggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacaa 46569886  T
Q  204 atgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaag 261  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  46569885 atgagtggaaagtcttttgtgaacaacttaggtgaatcttatgaaaccaaaagagaag 46569828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 294 - 498
Target Start/End: Original strand, 41639345 - 41639548
Alignment:
Q  294 tctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaa 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  41639345 tctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcacgagtgtcttgtttattgg-taagattgggaaaa 41639443  T
Q  394 tgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 493  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41639444 tgggtagaaattagggttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcatcgatagtggattggaga 41639543  T
Q  494 gatca 498  Q
    |||||    
T  41639544 gatca 41639548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 498
Target Start/End: Original strand, 33089582 - 33090001
Alignment:
Q  58 aacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttggga 157  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  33089582 aacttttaggtatttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagtttgaagatgtgaatcttggagaatcaaaagagggggctcttggg- 33089680  T
Q  158 aaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaag 256  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||           || ||||||||    
T  33089681 agagggttggtgtcttttggagagagattcatggggtcgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgg-----------gagaccaaaag 33089769  T
Q  257 agaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa 356  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||          | ||||||||||| ||||||||||    
T  33089770 agaagatccttag-aaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggaggttagattatagagttg----------ggaaacaccttggaagagtgaaaa 33089858  T
Q  357 tca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg 455  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  ||||||| | | |||  |||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  33089859 tcattgagtgtcttgttcatgggaagagattgag-agatgaatagaaattatgtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttattataaccattttg 33089957  T
Q  456 tatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33089958 tatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatca 33090001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26175850 - 26175682
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26175850 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatggggagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 26175752  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26175751 tgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 26175682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 36994478 - 36994646
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36994478 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgt 36994576  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36994577 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 36994646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 54200120 - 54199951
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  54200120 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 54200022  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcat 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54200021 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattagagagatcat 54199951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 5429633 - 5429801
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  5429633 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgagtagaaattagggttattcttcgtgagcttgt 5429731  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429732 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 5429801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 9927671 - 9927504
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9927671 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttattcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 9927574  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9927573 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 9927504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 319 - 496
Target Start/End: Original strand, 24969055 - 24969232
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24969055 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagagtcttgttctttgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagatttgttctt 24969153  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24969154 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactaattgatagtggattggagagat 24969232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 34570628 - 34570460
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34570628 attgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 34570530  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34570529 tgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 34570460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 52095576 - 52095408
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  52095576 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 52095478  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  52095477 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtggattggagagatca 52095408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 56178850 - 56178683
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  56178850 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 56178753  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178752 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 56178683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35369971 - 35369542
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  35369971 tgacccatctgttgagtaagcttgatgaatctcatggaaattaaaggagggaactttta----tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 35369876  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaacc-aaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||||||| ||||  |||||| |    
T  35369875 caaagatttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttgggaga-gggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggtttagaaacaca 35369777  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    | |   || |||| ||||| ||||||||||||||||||   || | ||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35369776 tcaaaagatagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggatagcaaaatagaagat-ctttgggaa-tcaaaggctaagggttggttctctttt-gg 35369681  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaa 402  Q
    |||| |||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||    
T  35369680 ggttggattatagaattgggaaacaattgggaaacacctt-gtagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgcaagacattggg-aaatgagtagaa 35369583  T
Q  403 attagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttctt 443  Q
    |||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35369582 attaggtttgttcttggtgagcttgatgaaactaatttctt 35369542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 317 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36463615 - 36463435
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttc 415  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  36463615 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaattcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatggatagaaattagggctgttc 36463518  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36463517 attgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgacagtggattggagagatca 36463435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 37740580 - 37740747
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37740580 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattgg-tgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgt 37740677  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740678 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 37740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 48893856 - 48893684
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttc----tttgtgagc 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||    
T  48893856 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtttgtgagc 48893758  T
Q  425 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48893757 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 48893684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 3913408 - 3913570
Alignment:
Q  336 aacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagc 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3913408 aacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaagc 3913506  T
Q  435 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913507 taatttcttttaacccatttgtatatctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 3913570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 332 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12745648 - 12745482
Alignment:
Q  332 tgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttg 430  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||      
T  12745648 tgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggc-gagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtca 12745550  T
Q  431 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745549 aaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 12745482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 313 - 498
Target Start/End: Original strand, 21688186 - 21688371
Alignment:
Q  313 tctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaa-tgggtagaaattagagtt 411  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  21688186 tctagagttgggaaacaattctaaacaccttgggggagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatcgg-tgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt 21688284  T
Q  412 gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21688285 gttctttgtgagcttgttgaaactaattttttgtaactcatttgtatctcttcggaagaactcattgataatgaattggagagatca 21688371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35370874 - 35370449
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||    
T  35370874 tgacccatctattgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggagaggt 35370775  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaacc-aaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacag 203  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| || | ||||||||| |||||  ||| |     
T  35370774 tcaaagctttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttggg-agagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggttgataaaaac 35370676  T
Q  204 atgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgg 303  Q
    || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  35370675 atcaaaggagagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggataccaaaatagaaga-tctttgggaaatcaaaggctaatggttggttctctttt-g 35370579  T
Q  304 gggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaa 402  Q
    | |||||||| |||| |||          | ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||    
T  35370578 gagttagattatagaattg----------ggaaacaccttgtaagagtgaaaattattgagtgtcttgttcattgcaagacattggg-aaatgagtagaa 35370490  T
Q  403 attagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttctt 443  Q
    |||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35370489 attaggtttgttcttggtgagcttgatgaaactaatttctt 35370449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 8653225 - 8653385
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  8653225 actccatgacccattttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 8653324  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaa 160  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8653325 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 8653385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 52467579 - 52467400
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52467579 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgaggttgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 52467481  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52467480 tgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcactttgtaataactttttgatagtggattggagagatca 52467400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 48142996 - 48143165
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48142996 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 48143094  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48143095 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcataagaactcattgatagtggattggagagatca 48143165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12739764 - 12739596
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12739764 attgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 12739666  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739665 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatca 12739596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12747970 - 12747802
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12747970 attgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 12747872  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747871 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatca 12747802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 29254448 - 29254616
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29254448 attgtaaacacattgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaattgggtagaaattagagttgttttttatgagcttgt 29254546  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29254547 tgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatca 29254616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 47038619 - 47038457
Alignment:
Q  334 taaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaa 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47038619 taaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaa 47038522  T
Q  433 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47038521 gctaatttcttgtaa-tcatttgtatctgtttgtaaggactcattgatagtggattggagagatca 47038457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 10071510 - 10071693
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  10071510 actccatgacccattttgttgggtaatcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 10071609  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagat 184  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  10071610 tgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttgatg-tttttggagaagat 10071693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 362 - 498
Target Start/End: Original strand, 26364223 - 26364358
Alignment:
Q  362 agtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc 461  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26364223 agtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc 26364321  T
Q  462 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26364322 tttgtaagaactcattaatagtggattggagagatca 26364358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 330 - 495
Target Start/End: Original strand, 4587912 - 4588078
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  4587912 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcatgttcattgg-tgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttg 4588010  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588011 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 4588078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 5871774 - 5871942
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5871774 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 5871872  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5871873 ttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcactttgcaagaactctttgatagtggattagagagatca 5871942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Original strand, 31474104 - 31474271
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagag-ttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||    
T  31474104 attgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttg 31474202  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31474203 ttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagat 31474271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37229947 - 37229767
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagt-tgttct 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  37229947 gttggaaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtgtgttct 37229850  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg-tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37229849 ttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatca 37229767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 321
Target Start/End: Original strand, 3785722 - 3786034
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |   | |||| |||||| |||| ||||||  |  || |    
T  3785722 tgacccatttgttgagtaagtttggtggatctcatggaaatcaaaggatggaacttttaggatacatggatactaaaggttgagagtctttaggcgagat 3785821  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||| | | ||||      
T  3785822 tcaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgg-aaaagggttggtgccttttgaggagagaattatggggtcgaggaacact 3785920  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3785921 tcaaaggagagtc-tttgtgagcaaattgtgcgagtcttgggagaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggttctcttttggg 3786018  T
Q  305 ggttagattctagagtt 321  Q
    || ||||||||||||||    
T  3786019 gg-tagattctagagtt 3786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 330 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 52082871 - 52082715
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  52082871 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgaacttgt 52082773  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 486  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52082772 caaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtgga 52082715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 6542395 - 6542225
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattag-agttgttctttgtgagctt 426  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6542395 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggg-gagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagctt 6542297  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6542296 gttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatca 6542225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 326 - 464
Target Start/End: Original strand, 41639214 - 41639351
Alignment:
Q  326 aacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagct 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  41639214 aacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcacgagtgtcttgtttattgg-taagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtaaact 41639312  T
Q  426 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639313 ttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 364 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 46147570 - 46147437
Alignment:
Q  364 tgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 463  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46147570 tgtcttgttcatcgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctt 46147472  T
Q  464 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  46147471 tgtaagaactctttgatagtggattggagacatca 46147437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 45687397 - 45687229
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  45687397 attgtaaacaccttgggtgagtgaaattttttgattgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttg 45687299  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45687298 tcaaagctaatttcttataactcatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 45687229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30000019 - 29999852
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  30000019 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacatgt 29999923  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc-tctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999922 caaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 29999852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 389 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12744080 - 12743971
Alignment:
Q  389 gaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 488  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744080 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12743981  T
Q  489 ggagagatca 498  Q
    ||||||||||    
T  12743980 ggagagatca 12743971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 389 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12745469 - 12745360
Alignment:
Q  389 gaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 488  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745469 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12745370  T
Q  489 ggagagatca 498  Q
    ||||||||||    
T  12745369 ggagagatca 12745360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 396 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744093
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12744096  T
Q  496 tca 498  Q
    |||    
T  12744095 tca 12744093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 51337008 - 51337186
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta--gagttgttc 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||    
T  51337008 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattgg-tgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttc 51337105  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51337106 tttgtgagctttt--aagataatttattataacccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtgtattagagagatca 51337186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5208066 - 5207888
Alignment:
Q  320 ttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctt 417  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5208066 ttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgacttgttcattgga-gtgattggaaaaa-gggtagaaattagggtttgttctt 5207969  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5207968 tgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatatctatttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatca 5207888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38811590 - 38811404
Alignment:
Q  32 tgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38811590 tgaatctcatggaaactaaaggagggaacttttagggtacttagatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttg 38811491  T
Q  131 gaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtca 218  Q
    || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||    
T  38811490 gagaacccaaagagggg-ctcttggg-aaagggttggtgtcttttgcggagagattcatgaggttaggaaacacataagtggagagtca 38811404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5370300 - 5370129
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg---ggtagaaattagagttgttctttgtgagct 425  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||     |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5370300 attgtaaacactttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggttgttctttgtgaact 5370203  T
Q  426 tgttgaa-gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5370202 tgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggactagagagatca 5370129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13009645 - 13009491
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||        
T  13009645 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgtgaaaatgggtagaaattaggtttgttcttcgtgagc---- 13009551  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
             ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13009550 ---------tttcttgtaaaacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 13009491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 480
Target Start/End: Original strand, 32091324 - 32091583
Alignment:
Q  220 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagag 319  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||| || |||| | |||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  32091324 ttgtgaacaacttgggtaagttttgggagaccagaggagaagatccttag-gaaatcaaaggcaaagtgttggttcttttttgggg-taagattctaaag 32091421  T
Q  320 ttggaaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    || | |||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||| |||||||||| ||   ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  32091422 tttggaaacaattgagaaacacattgggtgagcgaaa-tcattgagtctcttgttcatgggagaagattgggaaaatgc-tagaaattaggtttgttctt 32091519  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgat 480  Q
     | ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32091520 ggagagtttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaacacattgat 32091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 303
Target Start/End: Original strand, 34112323 - 34112539
Alignment:
Q  86 tgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agat 184  Q
    |||||||||||| || || |||||||  || |  ||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| | ||||||||||||||||||||| || || |    
T  34112323 tgagggtctttgtgtgagattcaaaatgtccaattgtgaatcttggataacctaaagacgaggctcttag-aaaagggttggtgccttttggggagaggt 34112421  T
Q  185 tcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggcta 284  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34112422 tcacggggttggaaaacacatgagtggagagtcatctgtgagcaacttggatgaatcttggaaaaacaaaactgaagatccttag-gaaatcaaaggcta 34112520  T
Q  285 agggttggttctcttttgg 303  Q
    | | |||||||||||||||    
T  34112521 aagtttggttctcttttgg 34112539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13992459 - 13992343
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcat 476  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  13992459 ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctc-ttgtaagaactcat 13992361  T
Q  477 tgatagtggattggagag 494  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13992360 tgatagtggattggagag 13992343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 333
Target Start/End: Original strand, 41961152 - 41961368
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtc 217  Q
    |||||||||||| | |||| ||| ||||| |||| |||| || ||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||    
T  41961152 atgtgaatcttgtagaaccgaaaaagggggctctagggagaa-ggtcggtgctttttggggagagattcat-gggttgggaaacacattaaaggagagtc 41961249  T
Q  218 atttgtgagc-----aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagat 312  Q
     | |||||||     ||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41961250 -tatgtgagcaacgtaacttgggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagat 41961347  T
Q  313 tctagagttggaaaacaattg 333  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  41961348 tctagagttgggaaacaattg 41961368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 169
Target Start/End: Original strand, 10071963 - 10072065
Alignment:
Q  67 ggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttg 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10071963 ggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaaaagggttg 10072062  T
Q  167 gtg 169  Q
    |||    
T  10072063 gtg 10072065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25723752 - 25723433
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttg-agtaagg 104  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||  ||| |||| | ||||  |||||| ||  |||    
T  25723752 tgacctatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaatgagtgaactcttagggtacttcaatactaaatgttgag--tctttggagggagg 25723655  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacag 203  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| || ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||     
T  25723654 ttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctctt-ggataatggttaatgccttttggagagagcttcgtggggttgggaaacac 25723556  T
Q  204 atgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgg 303  Q
    || |   ||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| || ||    |||||||||||||    
T  25723555 atcaaaagagagtc-tttgtgaacaacttaagtgagttttggtagaccgaaagagaagaccctta-agtaatcaaagactgag----ggttctcttttgg 25723462  T
Q  304 gggttagattctagagttggaaaacaatt 332  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25723461 gtgttagattctagagatggaaaacaatt 25723433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 317 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 48142605 - 48142440
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gtt 414  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  48142605 gagttgggaaacatttttaaacacttcgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgcccattga-tgagattgggaacatga-tagaaattagggtttgtt 48142508  T
Q  415 ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 481  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48142507 ctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaactcattgata 48142440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 319 - 495
Target Start/End: Original strand, 29056301 - 29056478
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  29056301 gttgggaaacatttggaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgttttgttcattaga-gagattgggaaaatgg-taggaattagagtttgttct 29056398  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagaga 495  Q
    ||||| |||||||  | ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  29056399 ttgtgtgcttgttagaactaatttcttgcaatccttttatatctctttgtaacaacctcattgataatggattagagaga 29056478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 31495483 - 31495366
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  31495483 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca 31495385  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  31495384 ttgatagttgattggagag 31495366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Original strand, 32091222 - 32091326
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt--tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaa 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32091222 ttggtgaatttcatggaaactaaaagagggaatttttaaggtattttggatactaaatgttgagggtctttgagtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 32091321  T
Q  126 tcttg 130  Q
    |||||    
T  32091322 tcttg 32091326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 498
Target Start/End: Original strand, 53345189 - 53345340
Alignment:
Q  348 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttg-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 445  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||  ||||||| |||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53345189 gagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatcgga-gagattgagaaaatga-tagaaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgt 53345286  T
Q  446 aacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  53345287 aacccttttatatctttttgtaaagaactcattaatattggattgtagggatca 53345340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 497
Target Start/End: Original strand, 52065530 - 52065719
Alignment:
Q  309 agattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 407  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||  ||  || |||||| |||  ||||||||||||    
T  52065530 agattcttgggttgggaaacaattgtgaaccccttgggtgagtgaaaatcatcgagtctcttgatcaacggaagatattggg-aaacaggtagaaattag 52065628  T
Q  408 agttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-cccatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
     ||||||||| | |||||| ||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52065629 -gttgttcttagagagcttattgaagctatttttctgtaaccccttttgtatctctttgttagaaactcattgatagtgaagtggagagatc 52065719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 47515023 - 47514885
Alignment:
Q  22 gtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagat 120  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| | | |||||| ||| |||||| | || | ||||||| |||||||||    
T  47515023 gtaagcttgtggaatctcatggaaaccaaatgagtgaacttttagggtacttaaacactaaaggttgaaggtcttcgggtgaagttcaaagcttcaagat 47514924  T
Q  121 gtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaa 159  Q
     ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  47514923 atgaatcttggtgaaccaaaagagtggactcttgggaaa 47514885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 497
Target Start/End: Original strand, 34112862 - 34112939
Alignment:
Q  421 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34112862 gagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtggagagatc 34112939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 390 - 481
Target Start/End: Original strand, 5349924 - 5350016
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 481  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5349924 aaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaaagaactcgttgata 5350016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 421 - 498
Target Start/End: Original strand, 6677514 - 6677592
Alignment:
Q  421 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  6677514 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctttgtaaagaagtctttgataatggatttgagagatca 6677592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16422755 - 16422653
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||   ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  16422755 ggtagaaattatgtttgttttttgagagctttttgaagctaatttctagaaacccttttgtatatctttgtaatgaactcatggatagtgaagtggagag 16422656  T
Q  495 atc 497  Q
    |||    
T  16422655 atc 16422653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22629399 - 22629147
Alignment:
Q  33 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgg 131  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||   |||||| | |||||| | || |||| || || || || |||| |||||||||||||||||||    
T  22629399 gaatctcatagaaaccaaatgagtgaacttttaggaaatttagaaactaaaggttcagtgtctctgggtgagatttaaaagttcaagatgtgaatcttgg 22629300  T
Q  132 aaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaag--attcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaa 229  Q
    | |||||||| ||| |  | || | |||| |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| || | |||||||    
T  22629299 agaaccaaaataggagaatatt-gaaaaatggttagtgccttttgg-gaagatatttatggggttgagaaacacatgagaggagagt-atctctgagcaa 22629203  T
Q  230 cttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaag 286  Q
     ||| |||| ||||| || ||||| | | ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  22629202 tttgagtgaatcttgggagaccaacataaaagatccttag-aaaatcaaaggctaag 22629147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 34788923 - 34788851
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 468  Q
    ||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34788923 ggtagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 34788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 8393396 - 8393512
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| | |||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  8393396 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 8393492  T
Q  476 -ttgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  8393493 tttgatagtggattggagag 8393512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 8395605 - 8395721
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| | |||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  8395605 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 8395701  T
Q  476 -ttgatagtggattggagag 494  Q
     |||||||||||||||||||    
T  8395702 tttgatagtggattggagag 8395721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44570514 - 44570427
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatag 482  Q
    |||||||||||   ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44570514 ggtagaaattatgtttgttgttggagagcttgttgaaactaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21703958 - 21703881
Alignment:
Q  422 agcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21703958 agcttgttgaagatgatttcttgtaccctttttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggagatatca 21703881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967906
Alignment:
Q  381 gagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 468  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || | |||| | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44967992 gagattgggaaaatgg-tagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaa-ccatttgtatctctttgtaa 44967906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Original strand, 6719324 - 6719384
Alignment:
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  6719324 ttcaagatgtgaatcttggaaaactaaaagagtggattcttggg-aaagggttgatgccttt 6719384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 465
Target Start/End: Original strand, 1983272 - 1983325
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 465  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1983272 ttgttctttgtgagcttgc--aagctaatttcttgtaacccctttgtatcactttg 1983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 37782008 - 37781935
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  37782008 aaaatgggtagaaattaagatttgttctttgtgagttttt--aagctaatttcttgtaacctctttgtatcacttt 37781935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 424 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 40975129 - 40975057
Alignment:
Q  424 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||    
T  40975129 cttgttgaagttaatttctggtaactctattgtatctctttgtaatgactctttgatagtagattagagagat 40975057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6200291 - 6200078
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggaga 214  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |  | | ||| |||||||| || ||||   |||||||| |||||| |||||  ||||    
T  6200291 aagatgtgtatcttggagaactaaaagatggagctcttgggacagagttgggttccttttggggagagatatgtggggttgagaaacacatgagatgaga 6200192  T
Q  215 gtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttg-gttctcttttgggggttagatt 313  Q
    ||| ||  ||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||| | || ||||| | |||||||||  || | |||||||  |||||||    
T  6200191 gtcctta-tgagcaatttggatgaatcttgagataccaaaagagaagatcctta-taaagtcaaatgataagggttgattttttttttgggcattagatt 6200094  T
Q  314 ctagagttggaaaaca 329  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6200093 ctagaattggaaaaca 6200078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18377507 - 18377432
Alignment:
Q  389 gaaaatgggtagaaattagag-ttgtt-ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18377507 gaaaatgggtagaaattagggcttgtttctttgtgagctttt--aagctgatttcttataacccatttgtatcacttt 18377432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33706649 - 33706593
Alignment:
Q  391 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 448  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33706649 aaatgggtagaaatta-agtttttcattgagatcttgttgaagctaatttcttataac 33706593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 427
Target Start/End: Original strand, 42234320 - 42234357
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42234320 aaaatgagtagaaattagagttgttctttgtgaacttg 42234357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 413 - 464
Target Start/End: Original strand, 39774280 - 39774329
Alignment:
Q  413 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39774280 ttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 39774329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42435527 - 42435037
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  42435527 tgacccatttgttcggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 42435428  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42435427 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaaggttggtgacttttggggaagattcatggggttgggaaacatatg 42435328  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42435327 aatggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgaggg 42435228  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42435227 ttagattctagagttggtaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattggaaaaatgggtagaaatta 42435129  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42435128 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatca 42435037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 493
Target Start/End: Original strand, 11383612 - 11384102
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  11383612 actccatgtcccatttgttaggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 11383711  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11383712 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatggggttgggaaa 11383811  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
     | || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383812 tacataagtggaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 11383911  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  11383912 tgggggttagattctagagttgggaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt--atgagattggaaaaatgggtag 11384009  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 493  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11384010 aaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaacccattgatactggattggaga 11384102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 498
Target Start/End: Original strand, 44353423 - 44353915
Alignment:
Q  3 tccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaa 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |    
T  44353423 tccatgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtga 44353522  T
Q  103 ggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaaca 202  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44353523 ggtttaaaacttcaaga---gaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaagagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaaca 44353619  T
Q  203 gatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttg 302  Q
     ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353620 catgagtggagagtcatcggtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttg 44353719  T
Q  303 ggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44353720 ggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacacattgggtgagtaaaaatcattgagtatcttgttcatt-tgtgagattgggaaaatgggtaga 44353818  T
Q  402 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44353819 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaaaagatca 44353915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 40221376 - 40221867
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggg-aacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||  | ||||    
T  40221376 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccataggaggggaacttttagggtttttgatactaaaggtggaaggtctttggatgaggt 40221475  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 205  Q
    | | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40221476 ttagaacttcaagatgtgaatcttcgagaaccaaaatagggggctcttgggaaaggggttagtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 40221575  T
Q  206 gagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40221576 gagtggagagtcttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggg 40221675  T
Q  306 gttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 405  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221676 gttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttc-tttggtgagattggtaaaatgggtagaaatt 40221774  T
Q  406 agagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40221775 agggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatca 40221867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 4283178 - 4283646
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  4283178 tgacccatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4283277  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||                      ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4283278 caaagcttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagagggggcttttggga----------------------aagattcatggggttgggaaacacatg 4283355  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283356 agtggaaagtcttttgtgagaaacttggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 4283455  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283456 ttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 4283554  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283555 gggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 4283646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 88 - 498
Target Start/End: Original strand, 40328492 - 40328902
Alignment:
Q  88 agggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattca 187  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40328492 agggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggaaaagggttggtgccttttagggaagattca 40328591  T
Q  188 tggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagg 287  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |     
T  40328592 tggggatgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatctttagtgaaatcaaaggctatga 40328691  T
Q  288 gttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattg 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  40328692 gttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatgaatgtcttgttcatt-tgtgagattg 40328790  T
Q  388 ggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 486  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328791 ggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 40328890  T
Q  487 ttggagagatca 498  Q
    ||||||||||||    
T  40328891 ttggagagatca 40328902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 220 - 498
Target Start/End: Original strand, 18655246 - 18655522
Alignment:
Q  220 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagag 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||     
T  18655246 ttgtgagcaacttcggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgatactcttttgggg-ttagattctagac 18655344  T
Q  320 ttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttg 419  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18655345 ttaggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgttttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattaaggttgttctttg 18655443  T
Q  420 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18655444 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatca 18655522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 27811222 - 27811400
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27811222 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 27811319  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27811320 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacccattgatagtggattgaagagatca 27811400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 4731612 - 4731779
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4731612 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgctctttgtgagcttgt 4731710  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731711 tgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 4731779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22976160 - 22976389
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  22976160 actccataacccatttgttgggtaagcttagtgaatctcttcgaaaccaaaggagtgaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 22976259  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  22976260 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggaggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt-gaaaa 22976358  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaact 231  Q
    || ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  22976359 cacatgagtgaagagtctattgtgagcaact 22976389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 15212740 - 15212908
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15212740 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 15212838  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15212839 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattggagagatca 15212908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 318 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10930424 - 10930245
Alignment:
Q  318 agttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  10930424 agttgggaaacaattgtaaacattttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatcgg-tgagattgggaaaatggatagaaattagggttgctctt 10930326  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10930325 tgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctctttgtaagaacacattgatagtggattggagagatca 10930245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 18141764 - 18141942
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18141764 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgtgaaaatgggtagaaattag-gttgttctt 18141861  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18141862 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 18141942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 33352104 - 33352272
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33352104 attgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgt 33352202  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33352203 tgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 33352272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 30143296 - 30143462
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgtt 429  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30143296 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatt-gtgtcttgttcattggcc-agattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 30143393  T
Q  430 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30143394 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 30143462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 43036377 - 43036545
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43036377 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 43036475  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43036476 tgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatca 43036545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 9765703 - 9765863
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgtt 429  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  9765703 attgtaaacaccttgggtgagtgaaatt---gagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttggc 9765798  T
Q  430 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765799 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 333 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19491909 - 19491745
Alignment:
Q  333 gtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaa 432  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19491909 gtaaacatcttgggtgagtgaaaatattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaa 19491811  T
Q  433 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  19491810 actaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatca 19491745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 317 - 498
Target Start/End: Original strand, 40321022 - 40321202
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttc 415  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40321022 gagttgggaaaca-ttgtaaacaccttgagtgactgaaaatcattgagtgtcttgttcatagg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc 40321119  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40321120 attgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctctttgtaaaaactctttgatagtggattggagagatca 40321202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 5689225 - 5689393
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  5689225 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattaa-tgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtggtgctttgtgagcttgt 5689323  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5689324 caaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 5689393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 30291549 - 30291729
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||    
T  30291549 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttct 30291647  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30291648 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaattctttgatagtggattggagagatca 30291729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 1345585 - 1345421
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  1345585 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagtttat 1345487  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1345486 tgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattgaagag 1345421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3303884 - 3303716
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3303884 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtatcttgtttattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgt 3303786  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3303785 ttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatca 3303716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 331 - 498
Target Start/End: Original strand, 42498149 - 42498316
Alignment:
Q  331 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42498149 ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 42498246  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42498247 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 42498316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 336 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1292671 - 1292514
Alignment:
Q  336 aacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagc 434  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  1292671 aacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttctttgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgttgaagc 1292573  T
Q  435 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 493  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1292572 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgaga 1292514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 34254543 - 34254377
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34254543 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 34254447  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34254446 caaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatca 34254377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 327
Target Start/End: Original strand, 40585356 - 40585675
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||  | ||||    
T  40585356 tgacccatttgttgcgtgagcttgattaatctcatgaaaaccaaaggaaataacttttagagtatttagatactaaaggttaagagtctttggttgaggt 40585455  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||  | | ||||||| || ||||||| || |||||||||||||| | ||||| |    
T  40585456 tcaaagcttcaagatgtgaatatttgagaatcaaaagagtgggctcttttggagagggttgatgtcttttggtgagagattcatggggtttgaaaacaca 40585555  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40585556 tcaaaggagagtc-tttgtgagcaatttgggtgagtattggtagaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagggttggttctcttttggg 40585653  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaa 327  Q
    || ||||||||| |||| |||||    
T  40585654 gg-tagattctaaagtttgaaaa 40585675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 6598926 - 6599094
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  6598926 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgt 6599024  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6599025 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatca 6599094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 6674379 - 6674547
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  6674379 attgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgt 6674477  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6674478 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatca 6674547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 34256719 - 34256553
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34256719 attgtaaacaccttggt-gtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 34256623  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256622 caaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 34256553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3000037 - 2999823
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaa 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  3000037 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagagaacttttagggaatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaa 2999938  T
Q  126 tcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag-aagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtg 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||    
T  2999937 tcttggagaaccaaaagagggggttcttggg-atatggttggtgtcttttggggaaagattcatggggatgagaaacacatgagtagagagtcaattgtg 2999839  T
Q  225 agcaacttgggtgagt 240  Q
    ||||||||||| ||||    
T  2999838 agcaacttgggcgagt 2999823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12702852 - 12702680
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-----gggtagaaattagagttgttctttgtgag 423  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12702852 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 12702755  T
Q  424 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12702754 cttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatca 12702680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 17982607 - 17982771
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17982607 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 17982704  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982705 tcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagag 17982771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41366828 - 41366660
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  41366828 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaa-gactgagattgagaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtaagcttgt 41366730  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41366729 ttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatca 41366660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 4162444 - 4162618
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  4162444 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattag-tgaga---ggaaaatgggtagaagttaggtttgttctt 4162538  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4162539 tgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatag-ggattggagatatca 4162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 31218211 - 31218375
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31218211 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 31218308  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  31218309 tcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagag 31218375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 325 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 8965910 - 8965739
Alignment:
Q  325 aaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtga 422  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||    
T  8965910 aaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttctttatga 8965813  T
Q  423 gcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8965812 gtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctctttgtaagaactcattgatagtgcatcggagagat 8965739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18106292 - 18106126
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  18106292 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaattgttgagtgtcttgttcatcgg-tgagattggaaaaatggatagaaactatagttgttctttgcgagcttgt 18106194  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18106193 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-tttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatca 18106126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 44303808 - 44303973
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagagttgttctttgtgagctt 426  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  44303808 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggttgttctttgtgaactt 44303905  T
Q  427 gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44303906 gtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtggattggagag 44303973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19945574 - 19945409
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  19945574 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaagggtagaaattatggttgttctttgtgaacttg 19945477  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacc-catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945476 tcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagag 19945409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 348 - 498
Target Start/End: Original strand, 3772164 - 3772314
Alignment:
Q  348 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 446  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3772164 gagtgaaaatgattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaattgatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgta 3772262  T
Q  447 acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3772263 actcatttgtatatctttgtaagaatttattgatagtggattggagagatca 3772314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 1746432 - 1746269
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1746432 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 1746335  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746334 tcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagag 1746269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 495
Target Start/End: Original strand, 10929753 - 10929907
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  10929753 attgtaaacaccttggattagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttgg-tgagatatggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgt 10929851  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    |||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10929852 tgaagctaatttcttgtaa-----------ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 10929907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41365061 - 41364926
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  41365061 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaa-gactgagattgggaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagtttgt 41364963  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 465  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41364962 ttaagctaatttcttgtaacacatttgtatccctttg 41364926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4743417 - 4743260
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||    
T  4743417 attgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaa-ttaggtttgttctttgtgtgtttgt 4743320  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||  ||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743319 tgaagctaaaatcttgtaacccatt----------tgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 4743260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20686586 - 20686456
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaac 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||||| |||||| || | ||||||| |    
T  20686586 tttgttgggtaagctcggtgaatctcattgaaaccaaaggagggaactttcagggtacttagatactaaatgttgaggatctttg-gtgaagttcaaagc 20686488  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20686487 ttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagag 20686456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 414 - 496
Target Start/End: Original strand, 10015119 - 10015200
Alignment:
Q  414 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10015119 tctttgtgtgcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagat 10015200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 2627737 - 2627854
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctctt-tgtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2627737 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactca 2627835  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2627836 ttgatagtggattggagag 2627854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Original strand, 8153705 - 8153880
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttc 415  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||   | ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||        
T  8153705 gttgggaaacatttgtatacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtgtcatgttcattgg-tgagattgagaaaatgg-tagaaattagggtt---- 8153798  T
Q  416 tttgtgagctt-gttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      | ||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8153799 --tctgagctttgttgaagctaaattcgtgtaactcttttgtatatctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatca 8153880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3846321 - 3846032
Alignment:
Q  40 atggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaacca 138  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||  || || | |||||| |||||||  |||||| || ||||||  ||||  |||||||||||| | |||||    
T  3846321 atggaaaccaaaggagaaaactttcagggtactttgaaactaaaggttgagggttcttgagtgagattcaaaggttcataatgtgaatcttgaagaacca 3846222  T
Q  139 aaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtg 237  Q
    ||||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||| ||||||     
T  3846221 aaagaagag-ctcttgg-aaaagagttggtgtcttttggggagagattcatggggttgggaaacacatgagagaagattc-tttgtgagcaaattgggta 3846125  T
Q  238 agtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattg 333  Q
    | ||||  || ||||||||||| || ||||   |||||||||||  || |||||||  || ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  3846124 aatctttggataccaaaagagacga-tcttttggaaatcaaaggtaaatggttggt--tcattttggggttagaatctagagtcagaaaacaattg 3846032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 485
Target Start/End: Original strand, 10240061 - 10240264
Alignment:
Q  279 aggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattg 377  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| || ||| |||| ||  |||| |||||||| | |    
T  10240061 aggctaagagttggttctcttt--ggggttagattctagatttgggaaacaattgagaaacatcttaggtgagcgaaa-tc--gagtctcttgttcttgg 10240155  T
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactca 475  Q
    |  |||||||||| || |  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  10240156 gaggagattgggacaaaga-tagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactca 10240254  T
Q  476 ttgatagtgg 485  Q
    ||||||||||    
T  10240255 ttgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33655628 - 33655402
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctaga 318  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  || | ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||    
T  33655628 tttgtgagcaatttgggtgaatcttaggagaacaaaagagaagatccttaga-aaatcaaaggttaagggttggttctctttcaagggttaaattttaga 33655530  T
Q  319 gttggaaaacaa-ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttct 416  Q
    ||||||||| || ||| ||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || |||  | |||| | ||||||||||| |||||||    
T  33655529 gttggaaaataatttgaaaacatcttggatgagtg-aaatcattgagtgtcttgttca-tggaagatattaag-aaatagatagaaattagatttgttct 33655433  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa 447  Q
    | | ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  33655432 tagagagtttgttgaagctgatttctcgtaa 33655402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Original strand, 1822326 - 1822415
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  1822326 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttgtaaataactcactaatagtgaattggagagatca 1822415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Original strand, 1856771 - 1856860
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  1856771 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttgtaaataactcactaatagtgaattggagagatca 1856860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Original strand, 7597648 - 7597737
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7597648 ttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatca 7597737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11712135 - 11712046
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11712135 ttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatca 11712046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9633959 - 9633817
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtca 218  Q
    |||||||||||| | || ||||||| ||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||||| || ||  ||||||||    
T  9633959 atgtgaatcttgaataatcaaaagatggcgctcttg--aaaaaggttggtaccttttgggagagattaatggggttggtaaacacataagatgagagtca 9633862  T
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagat 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  9633861 tttgtgagcaacttgggtgaatcttaggaaaccaaacgagaagat 9633817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 25689957 - 25690072
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  25689957 ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 25690053  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25690054 ttgatagtggattggagag 25690072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3817840 - 3817679
Alignment:
Q  37 ctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaa 135  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||  || |||||| || ||||| | ||    
T  3817840 ctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtacttagaaactaaaggttgagggtttctgagtaaa-ttcaaaggttgaagatgggattcttgaagaa 3817742  T
Q  136 ccaaaagagg--ggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag-aagattcatggggttgg 196  Q
    ||||||||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3817741 ccaaaagaattagggctcttgg-aaaagggttggtgccttttggagaaagattcatggggttgg 3817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073919
Alignment:
Q  436 aatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatca 3073919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 3439506 - 3439621
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||   |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  3439506 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 3439602  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3439603 ttgatagtggattggagag 3439621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3231930 - 3231859
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgat 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3231930 ttgttcttcgtgagcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttgtaaagaacttattgat 3231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 497
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733827
Alignment:
Q  454 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatc 4733827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 496
Target Start/End: Original strand, 30909413 - 30909487
Alignment:
Q  421 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30909413 gagcttgtttaaactaatttcttgtaactc-tttgtatctctttgtaatgactcgttgatagtgaattggagagat 30909487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 32902292 - 32902219
Alignment:
Q  426 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  32902292 tgttgaagctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaatttgagagatca 32902219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 356
Target Start/End: Original strand, 40535538 - 40535819
Alignment:
Q  61 ttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaa 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||| ||  ||||||||  |||||| |||| |||||  | ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  40535538 ttttagggtatttagatactaaagattgatggtctttgggt--ggttcaaagtttcaagttgtggatcttttagaaccaaaagagggggttcttgag-aa 40535634  T
Q  160 agggttggtgccttttggagaaga-ttcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagag 258  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||           ||||||||||    
T  40535635 agggttgatgccttttggataaaagttcatgtgattggaaaacacatgagagaagagtca-ttgtgagcaacttaggtg-----------accaaaagag 40535722  T
Q  259 aagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaa 356  Q
    ||||| || || ||||||||||  ||  | |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||    
T  40535723 aagatcctaagagaaatcaaagtttatcgattggtt-tctttt-gaggttagattatagagttggaaaacaattaggaaacacctttgggtagtgaaaa 40535819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 10239714 - 10239782
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt 69  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  10239714 actccttgacccttttgttgagtaagcttgacgaatctcatggaaatcaatagagggaacttttagggt 10239782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Original strand, 11137073 - 11137146
Alignment:
Q  424 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt----aagaactcattgatagtggattggaga 493  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11137073 cttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatctctttgtaaaaaaaaactcattgatagtgaattggaga 11137146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 10020292 - 10020398
Alignment:
Q  220 ttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagag 319  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  10020292 ttgtgaacaacttaggtgaatcttagggtaccaaaagaggagatccttag-gaaatcaaaggctaagggtttgtt-tctttt-tgggttggattctagag 10020388  T
Q  320 ttggaaaaca 329  Q
    |||| |||||    
T  10020389 ttgggaaaca 10020398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 483
Target Start/End: Original strand, 40585754 - 40585822
Alignment:
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt--aagaactcattgatagt 483  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  40585754 ttgtgagcttgttgaaacgaattttttgtaagccttttgtatctttttgtaaaagaactcattgatagt 40585822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 464
Target Start/End: Original strand, 9054788 - 9054861
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9054788 aaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgcgctttt--aagctaatttcttgtaaccactttgtatcacttt 9054861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10101475 - 10101351
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctaga 318  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  || | |||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||     
T  10101475 tttgtgagcaacttggatgaatcttaggagatcaaaagaggagatccttatt-aaatcaaagtctaagggttggt--acgttttggggttagattctagt 10101379  T
Q  319 gtt-ggaaaacaattgtaaacaccttgg 345  Q
    ||| |||||  | |||||||||||||||    
T  10101378 gttaggaaataatttgtaaacaccttgg 10101351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29796456 - 29796366
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt--aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29796456 ttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttttgtacctatttgtaaaaaaactcatttataatggattggagagatca 29796366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 7445014 - 7444878
Alignment:
Q  348 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 446  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||| ||  ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||     ||||||||||||  ||||| |||||    
T  7445014 gagtgaaaatctttgagtctcttgttcatgggaagagattgagaaattgg-tagaaattagatttgttctaatatagcttgttgaagtaaatttgttgta 7444916  T
Q  447 acccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtg 484  Q
    |||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7444915 accc-tctatatctctttgtaagaatctcattgctagtg 7444878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 10020151 - 10020224
Alignment:
Q  86 tgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaa 159  Q
    |||||||||||  || || ||||||   |||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  10020151 tgagggtctttaggtgagattcaaatgatcaatatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 10020224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 49200007 - 49199517
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  49200007 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 49199908  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  49199907 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacatatg 49199808  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttggg-tgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49199807 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggg 49199708  T
Q  306 gttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 405  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199707 gttagattctagagttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcgtt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 49199609  T
Q  406 agagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199608 aaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 49199517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 30235750 - 30236247
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  30235750 actccatgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 30235849  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  30235850 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaatattcatggggttggaaa 30235949  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  30235950 acacaagagtggagagtcatttgtgagcaagttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcgaaggctaatgattggttctctt 30236049  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30236050 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-gatgagattgggaaaatgggta 30236148  T
Q  400 gaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30236149 gaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 30236247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 498
Target Start/End: Original strand, 34490862 - 34491334
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  34490862 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 34490961  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34490962 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagtcatttgt 34491061  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491062 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 34491161  T
Q  324 aaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgag 423  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34491162 gaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaattc-tgagtgtgttattcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgag 34491259  T
Q  424 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491260 cttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 34491334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 6096128 - 6095645
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaact 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  6096128 tttgttgggaaagcttggtgaatctcatggaaatcagaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagct 6096029  T
Q  114 tcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6096028 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttttgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggag 6095929  T
Q  214 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagatt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6095928 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaaaggttggttctcttttgggggttagatt 6095829  T
Q  314 ctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgt 413  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6095828 ctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttattcatt-ggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgt 6095730  T
Q  414 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095729 tctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 6095645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 54593330 - 54593826
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  54593330 actccatgacccatttgttcgaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtccttggg 54593429  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  54593430 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtaccttttggggaagattcatggggatggaaa 54593529  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54593530 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctctt 54593628  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  54593629 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgtgca 54593727  T
Q  400 gaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593728 gaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 54593826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 498
Target Start/End: Original strand, 4569583 - 4570074
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  4569583 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4569682  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4569683 caaagcttcaagatgtaaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggggtgtgcctattggggaagattcatggggttgggaaacacatg 4569782  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4569783 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagatgatctttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggtgg 4569882  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569883 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttc-tttggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 4569981  T
Q  406 agagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569982 agggttgttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 4570074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Original strand, 47303877 - 47304373
Alignment:
Q  1 actccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||| |    
T  47303877 actccacgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagagaacttttatggttttagatactaaatgttgaaggtctttggg 47303976  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 199  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47303977 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaa 47304076  T
Q  200 acagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 299  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47304077 acacatgagtggagagt-ttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaaactaagggttggttctctt 47304175  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  47304176 ttgggggttagattctagagttggaaaacaattttaaacaccctgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-tgtgagattgagaaaatgggta 47304274  T
Q  400 gaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47304275 gaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 47304373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 43402326 - 43401852
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  43402326 tgactcatttgttgggtgagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 43402227  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  43402226 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 43402127  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  43402126 agtggagaatcatttgtgaacaacttgggtaagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctt------- 43402034  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
         |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402033 -----ttctagagttgggaaacgattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 43401940  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 493  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401939 gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 43401852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 498
Target Start/End: Original strand, 46860120 - 46860596
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  46860120 agcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 46860219  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46860220 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatagggatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 46860319  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggcta--agggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860320 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagagggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 46860418  T
Q  322 ggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaat--catgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttg 419  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46860419 gagaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttg 46860517  T
Q  420 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860518 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatca 46860596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 43404269 - 43403792
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||    
T  43404269 tgacccatttgttgggtgagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttgggtgaggtt 43404170  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  43404169 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 43404070  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  43404069 agtggagagtcatttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctt------- 43403977  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 406  Q
         ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403976 -----ttctaaagttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaatta 43403883  T
Q  407 gagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccat-ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403882 ggcttgttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 43403792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 7 - 494
Target Start/End: Original strand, 36018482 - 36018970
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||||  | ||||    
T  36018482 tgacccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaactttcagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttggatgaggt 36018581  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  36018582 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgggaaaagggttggtgccttttggggaagatccatggggatgggaaacacat 36018681  T
Q  206 gagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36018682 gaatggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatggattggttctcttttgggg 36018781  T
Q  306 gttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaat 404  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36018782 tttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattaacgagtgacttgttcatt-ggtgaaattgggaaaatgggttgaaat 36018880  T
Q  405 tagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36018881 tagggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagag 36018970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 24 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41820040 - 41819569
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  41820040 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttaggtttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 41819941  T
Q  124 aatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgt 223  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41819940 aatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgg-gaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagactcatttgt 41819842  T
Q  224 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 323  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41819841 gagcaacttgagtgagtcttatgaaaccaaaagagaaga-tctttatgaaatcaaa-gctaagggttggttctcttttagcggttagattctagagttgg 41819744  T
Q  324 aaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaa-tcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtga 422  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41819743 gaaataattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtga 41819645  T
Q  423 gcttgttgaagctaatttcttgtaaccca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41819644 gcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagacatca 41819569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 55302507 - 55302018
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  |    
T  55302507 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatttcattgaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttggat 55302408  T
Q  101 aaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||    
T  55302407 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaaaaattcatgaggttggaaaa 55302308  T
Q  201 cagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 300  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55302307 cacatgagtggagattcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaggggttggttctcttt 55302208  T
Q  301 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtag 400  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||    
T  55302207 tgtaggttagattatagagttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcat-----------------atgggtag 55302125  T
Q  401 aaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagcta---------atttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgga 491  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55302124 aaattagggttgttctttgtaagtttgttgaagctaatttcttgtatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattgga 55302025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 378
Target Start/End: Original strand, 40912969 - 40913346
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaa-gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||    
T  40912969 tgacccatttgttgggtaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggggacttttagggttttagatactaaaggtttagggtctttgggtgaggt 40913068  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcctttt-ggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40913069 tcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttttggagaagattcatggggttgggaaacaca 40913168  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40913169 tgagtggagagtcatttgtgagcaaattgggtgagtcttgtgaaagcaaaagagaagatccttagtgaaattaaaggttaagggttggttctcttttggg 40913268  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggaga----gtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgg 378  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40913269 ggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtacgtgaaaattatgagtgtcttgttcattgg 40913346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5434410 - 5433952
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| | | ||||||||||||  ||||| |||    
T  5434410 catttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaggatatttagataccaaaagttaagggtctttgagggaggtttaaa 5434311  T
Q  111 acttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagc 209  Q
     ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||     
T  5434310 gcttcaagatgtaaatcttatagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagtgttttttagggagagattcatggggttaggaaacacatgagt 5434211  T
Q  210 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtta 309  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5434210 ggagagtcttttgtgagcaagttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctta-tgtaatcaaagactaaagattgattctcttttgggggtta 5434112  T
Q  310 gattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattggga-aaatgggtagaaattag 407  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  5434111 gattatagagttgggaaacaattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggagaaaatggtagaaattag 5434014  T
Q  408 ag-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 468  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5434013 ggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaa 5433952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 28074247 - 28074488
Alignment:
Q  5 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||    
T  28074247 catgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 28074346  T
Q  105 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  28074347 ttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaatagttggtgcgttttggggaagattcatggggatgggaaacaca 28074445  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtga 247  Q
    |||| ||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28074446 tgagtggagagtctattgagagaaacttaggtgagtcttgtga 28074488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 287 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 31340457 - 31340268
Alignment:
Q  287 ggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagatt 386  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31340457 ggttggtgcccttttaggggttagattctagagttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgttttgttcattgg-tgagatt 31340359  T
Q  387 gggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatt 477  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340358 gggaaaattggtagaaattgaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 35139250 - 35138762
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||   | ||||    
T  35139250 tgacccatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggtactttttgggtatttagatactaaacgttgagggtctttagatgaggt 35139151  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgt-------gaatcttggaaaaccaaaagag--gggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttg 195  Q
    ||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||   |||| |||| ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||| |||||    
T  35139150 tcaaaactttaagatgtaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaatgggt-tcttcggaaa-gggttgatgccttttgaggagagattcatgaggttg 35139053  T
Q  196 ggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaag-gctaagggttggtt 294  Q
    | ||||| || |   ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||  ||    
T  35139052 gaaaacaaatcaaatgagagtc-tttatgagcaacttgaatgagtcttgggagaccaaaatagaagatccttag-gaaataaaaaagctaagggttaatt 35138955  T
Q  295 ctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaattgt-aaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaa 392  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||| ||||    
T  35138954 ctcttttgggg-ttaaattttaaagttggaaa-caattgtgaaacaccttgggagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatggaaagagattgagaaa 35138857  T
Q  393 atgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggat 487  Q
     |||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35138856 -tgggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaagttaatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtggat 35138762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44700703 - 44700524
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44700703 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 44700605  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44700604 tgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 44700524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5236670 - 5236502
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5236670 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 5236572  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5236571 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattcgagagatca 5236502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 40734452 - 40734620
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40734452 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 40734550  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734551 tgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 40734620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29196612 - 29196432
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29196612 gttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttct 29196514  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29196513 ttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 29196432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 44331499 - 44331667
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44331499 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgt 44331597  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44331598 tgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatca 44331667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22835216 - 22835048
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22835216 attgtaatcaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 22835118  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22835117 ttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 22835048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 29810822 - 29810990
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29810822 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttattcattgg-tgagattaggaaaatatgtagaaattagagttgttctttgtgaacttgt 29810920  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29810921 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 29810990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 40735337 - 40735505
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40735337 attgtaaacaccttggaaaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 40735435  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735436 tgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 40735505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 320 - 498
Target Start/End: Original strand, 46173311 - 46173479
Alignment:
Q  320 ttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttg 419  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  46173311 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattggt----------aaaattggtagaaattagggttgttctttg 46173400  T
Q  420 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46173401 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatca 46173479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19684103 - 19683935
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19684103 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 19684005  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19684004 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 19683935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Original strand, 51398768 - 51398934
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  51398768 attgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattga-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttagtgaacttgt 51398866  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51398867 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 51398934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Original strand, 760805 - 760969
Alignment:
Q  334 taaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaa 432  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  760805 taaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtctgttctttgtgagcttgtttaa 760903  T
Q  433 gctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  760904 gctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 760969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 29682313 - 29682481
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  29682313 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgt 29682411  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29682412 ttaagctaatttcttgtcacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 29682481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 31314399 - 31314567
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  31314399 attgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatagg-tgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgatcttgt 31314497  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31314498 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatca 31314567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 319 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 53921727 - 53921549
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  53921727 gttggaaaaca-ttgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttgtt 53921630  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53921629 tgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 53921549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 45095119 - 45095285
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45095119 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 45095215  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095216 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 45095285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 318 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9666693 - 9666514
Alignment:
Q  318 agttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttc 415  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  9666693 agttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttc 9666595  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9666594 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctctttgtaagaattctttgatagtggattggagagat 9666514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Original strand, 32891057 - 32891224
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32891057 attgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgtcttgttc-ttcggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttg 32891155  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32891156 ttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagat 32891224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 330 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 39153575 - 39153410
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  39153575 attgtaaacaccttgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcat-gtgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcattgtgagcttgt 39153477  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39153476 ttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttataagaactcattgatagtggattggagaga 39153410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 7762220 - 7762387
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7762220 attgtgaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttattcattgg-tgagattgagaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 7762317  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762318 tgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 7762387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 9581237 - 9581404
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9581237 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgggattcggaaa-tgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 9581334  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581335 ttaagctaatttcttttaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 9581404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 16498984 - 16499151
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16498984 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaacggatagaaattagggttgtt-tttgtaagcttgt 16499081  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16499082 tgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 16499151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 29813017 - 29813185
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29813017 attgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgaggggcttgttaattgg-tgagattggaaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 29813115  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29813116 tgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatca 29813185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 37408413 - 37408580
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37408413 attgtaaacaccttagt-gagtgaaaattattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 37408510  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37408511 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatca 37408580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5258358 - 5258194
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5258358 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 5258261  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258260 tcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagag 5258194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Original strand, 7764422 - 7764584
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7764422 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgaga--gggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 7764516  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7764517 taaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 7764584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5260537 - 5260373
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5260537 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattgg-tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 5260440  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5260439 tcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagag 5260373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23200350 - 23200188
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23200350 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttctt--ggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgt 23200254  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23200253 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagag 23200188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 323
Target Start/End: Original strand, 34795507 - 34795815
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||| || | |||||||     
T  34795507 atttgttgggtaagtttggtgaatcctatgaaaaccaaaggagagatcttttagggtatttagatactaaaggttgatggtcgttgggtgatgttcaaag 34795606  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcg 210  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| | ||| ||  |||||||||  || |||||||||||||||||| ||| || |  |    
T  34795607 cttcaagatctgaatcttggagaaccagaagagggggttctaggg-agaggtttcatgccttttgaggagagattcatggggttgggatacacatcaaag 34795705  T
Q  211 gagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttag 310  Q
    ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  34795706 gagagt-ttttgtaagaaacttgggtgagtcttgggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggatggttctctttt-gtggttaa 34795802  T
Q  311 attctagagttgg 323  Q
    |||||| ||||||    
T  34795803 attctaaagttgg 34795815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 330 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23392123 - 23391957
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatg-agtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23392123 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtctttttcattgg-tgagtttgggaaaatgagtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgt 23392025  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23392024 ttaagataatttcttgtaacccatttgtatcactttgcaagaactctttgatagtggattgtagagat 23391957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26323385 - 26323124
Alignment:
Q  233 gggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt 332  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26323385 gggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattttagagttgggaaacaatt 26323287  T
Q  333 -gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttg 430  Q
     | |||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| ||   ||| ||||||    
T  26323286 gggaaacaccttgagtgagtgaacatcattaagtgtcttgttcatgggatgagattgagaaaa-gggtaaaaattaggtttgtttttgaagagtttgttg 26323188  T
Q  431 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggaga 493  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  26323187 aagctaatttcttgtaacctttttgtatatcttggtaaaaaactcattgatagtgaagtggaga 26323124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 9636340 - 9636176
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattggga-aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9636340 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattgg-tgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 9636243  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9636242 tcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagag 9636176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23198151 - 23197989
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23198151 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttctt--ggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgttttttgtgaacttgt 23198055  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23198054 caaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagag 23197989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 1683146 - 1683440
Alignment:
Q  33 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgga 132  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||   ||||| | |||||| |||||||||||| || || ||||||  ||  | ||||||||||||||    
T  1683146 gaatctcatggaaatcaaatgagagaaatttatggaacttagaaactaaaggttgagggtctttgggtgagattcaaatgtttcaaatgtgaatcttgga 1683245  T
Q  133 aaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacagatgagcggagagtcatttgtgagcaact 231  Q
     |||||||||||  |  | || ||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  1683246 gaaccaaaagagaaggtttttcggaaa-gggttggtgcattttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgagtggataatcatttatgagcaact 1683344  T
Q  232 tgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaaca 329  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1683345 ttggtgagtcttgtgagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggttggttatctttt-ggggttagaatctagagttgggaaaca 1683440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 319 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23410553 - 23410377
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   || |||||    
T  23410553 gttggaaaaca-ttgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattag-tgaaatttggaaaatgggtagaaattatgtttattctt 23410456  T
Q  418 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  23410455 tgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcactttgtaagaactcttagataatggattggagagat 23410377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 498
Target Start/End: Original strand, 20937501 - 20937778
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctaga 318  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20937501 tttgtgacaaacttgggtgattcttgggagaccaaaagagaagattcttag-gaaatcaaaggataaaggttggttctcttttgggag-tagattctaga 20937598  T
Q  319 gttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttct 416  Q
    ||||  ||| |||| | ||||| ||| |  |||||  ||||| ||||| |||||||||| |   |||| | ||||||| |||||||||||   ||||| |    
T  20937599 gttgagaaataattggaaaacagcttagatgagtg-caatcattgagtctcttgttcatagaaagaga-tcggaaaataggtagaaattatgtttgtttt 20937696  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg-taagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20937697 tggagagcttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgata-tagattggagagatca 20937778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 443
Target Start/End: Original strand, 39127191 - 39127614
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||| ||||| || ||||    
T  39127191 tgactcatttgttgagtaagcttagtgaatctcatggaaatcaacggagagaacttttagggtatttacatactaaaggtttggggcctttg-gtgaggt 39127289  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| |    
T  39127290 tcaaagcttcaagatatgaatcttagagaactaaaataggggactctt-ggaagagagttggtgcctttttgggagagattcatgaggttgggaaacaca 39127388  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    | |     ||||| |||||| ||||           |||| || |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  39127389 tcaaatatgagtc-tttgtgggcaa-----------cttgagagaccaaaagagaatacccttag-gaaatcaaaggctaagggttagttctctttt-gt 39127474  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaa 402  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||  |  ||||||| | ||||  ||| ||    
T  39127475 ggttaaattctagagtttggaaacaattggaaaataccttggaagagtgaaaatcattgagcgtcttattcatgagaagagattgag-aaataagtataa 39127573  T
Q  403 attagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttctt 443  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39127574 attatgtttgttcttggtgagcttgttgaagctaatttctt 39127614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26324042 - 26323821
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttcaaaac 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||| |||||||| ||| || | ||||||| |    
T  26324042 tttgttgagtaagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttaagatatttagatactaaaggttgagggtcattgggtgaagttcaaagc 26323943  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcctttt--ggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcg 210  Q
    |||||||||| ||||||| | || |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||| |||||| || |  |    
T  26323942 ttcaagatgtaaatcttgaagaatcaaaagagagggctattggg-aaagggttggtgcattttcagcag-agattcatggggttgagaaacacatcaaag 26323845  T
Q  211 gagagtcatttgtgagcaacttggg 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  26323844 gagagtc-tttgtgagcaacttggg 26323821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 379 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 32744600 - 32744484
Alignment:
Q  379 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattg 478  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32744600 gtgagattgaaaaaatgggtagaaattagt-ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaactctttg 32744502  T
Q  479 atagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  32744501 atagtggattgaagagat 32744484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 379 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7780168 - 7780054
Alignment:
Q  379 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 477  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7780168 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatctcttttgtaagaactcatt 7780071  T
Q  478 gatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||    
T  7780070 gatagtggattggagag 7780054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31340577 - 31340501
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaag 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31340577 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaag 31340501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 801093 - 801210
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattt-gtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  801093 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactca 801191  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  801192 ttgatagtggattggagag 801210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 343 - 495
Target Start/End: Original strand, 5373198 - 5373353
Alignment:
Q  343 tgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatt 439  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5373198 tgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattgaa-gagattgggaaaaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaatt 5373296  T
Q  440 tcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  5373297 tattgtaacccttttatatctctttgtaaggaactcattgccaatggattggagaga 5373353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 366 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4055941 - 4055810
Alignment:
Q  366 tcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc-catttgtatctcttt 464  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4055941 tcttgttcatgggaagagattgggaaa-tgggtagaaattag-gttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctcttt 4055844  T
Q  465 gtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4055843 gtaagaaactcattgatagtggattgaagagatc 4055810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 333 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26386692 - 26386597
Alignment:
Q  333 gtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26386692 gtaaatactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 26386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 435 - 498
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913415
Alignment:
Q  435 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatca 40913415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 51352293 - 51352157
Alignment:
Q  360 tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 458  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| |||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51352293 tgagtgtcttgtttattgg-tgagattaggaaaatga-tagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaa-ccatttgtat 51352197  T
Q  459 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  51352196 ttctttgtaataactcattgagagtggatttgagagatca 51352157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 6716502 - 6716617
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  6716502 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 6716598  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6716599 ttgatagtggattggagag 6716617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 54635127 - 54635242
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactca 475  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  54635127 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 54635223  T
Q  476 ttgatagtggattggagag 494  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54635224 ttgatagtggattggagag 54635242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 398 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25491114 - 25491014
Alignment:
Q  398 tagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  25491114 tagaaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtgaagtggagagat 25491015  T
Q  497 c 497  Q
    |    
T  25491014 c 25491014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 396 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 54739102 - 54739004
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggaga 493  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54739102 ggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttat-gtaactcttttatatctctctgtaaagaactcattgatagtggattggaga 54739004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1314029 - 1313852
Alignment:
Q  320 ttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgttcttt 418  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||| ||| |  |  ||||||| ||||| ||||| |||||| |  ||||||||     
T  1314029 ttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaattattgagtctcttattcttgagaagagattgagaaaa-gggtaaaaattatgttttgttcttg 1313931  T
Q  419 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg-taagaactcattgatagtggattggagagat 496  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1313930 gagagcttgttaaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactcattgatattggattagagagat 1313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Original strand, 33191866 - 33191953
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33191866 ttgttcttagagagcttgttgaagctaagttcttgtaa-ccattt-tatgtctttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatca 33191953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31340503 - 31340448
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgcc 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31340503 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgcc 31340448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2075281 - 2075156
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttct 416  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||    
T  2075281 gttgggaaacatttataaacaccttgct-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgatattgggaaaaatggtagtaattagagttggttct 2075184  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 446  Q
    |||||||||  || |||||||||| |||||    
T  2075183 ttgtgagct--tttaagctaatttattgta 2075156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8166685 - 8166516
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat---gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgt 413  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||   | |||||||||||| |||  |||||| |  ||||| |||||||||||  ||||    
T  8166685 gagttgaaaaacatttgtaaacacattgggtgggtgaaaatcattgagtgtgtcttgttca-tggaagagatt-gataaatgagtagaaattaggtttgt 8166588  T
Q  414 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 484  Q
    |||| | ||| ||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  8166587 tcttggagagtttgttgaagttaatatcttataacctttttgtatctctttgtaaagaacttgttgatagtg 8166516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 381 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4075636 - 4075516
Alignment:
Q  381 gagattgggaaaatgggtagaaattaga--gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc-catttgtatctctttgtaagaa-ctcat 476  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    | ||||||| | || |||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |    
T  4075636 gagattgggaaa-tgggtagaaattattaggctgttcttagagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatcactttgtaagaaactctt 4075538  T
Q  477 tgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4075537 tgatagtggattggagagatca 4075516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 45282985 - 45283104
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc----tctttgtaagaac 472  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    | |||||||||||    
T  45282985 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatccctttttttgtaagaac 45283081  T
Q  473 tca-ttgatagtggattggagag 494  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  45283082 tcatttgatagtggattggagag 45283104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 464
Target Start/End: Original strand, 4386868 - 4386941
Alignment:
Q  390 aaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 464  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4386868 aaaatgagtagaaattaggttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt 4386941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 391 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3148144 - 3148037
Alignment:
Q  391 aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattg 489  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||    
T  3148144 aaatggatagaaattaggtttcttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccttattgtatttgtttgtaagaatctcattgattgtgaagtg 3148045  T
Q  490 gagagatc 497  Q
     |||||||    
T  3148044 cagagatc 3148037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 481
Target Start/End: Original strand, 2020187 - 2020245
Alignment:
Q  424 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 481  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2020187 cttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatttctttgtaaagaactcattgata 2020245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28253416 - 28253346
Alignment:
Q  396 ggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 465  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  28253416 ggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacgattttgtatttctttg 28253346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 484
Target Start/End: Original strand, 24635276 - 24635366
Alignment:
Q  395 gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtg 484  Q
    ||||||||||||   |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  24635276 gggtagaaattaagtttgttcttggagagtttgttgaagctaattttttgtaactattttgtatctctttataatcaattcattgatagtg 24635366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 329
Target Start/End: Original strand, 36796692 - 36796749
Alignment:
Q  271 gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaaca 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36796692 gaaatcaaaggctaagggttgatt-acttttgagggttagattcaagagttgggaaaca 36796749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50432898 - 50432840
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatca 277  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  50432898 tttgtgagcaacttggttgaatcttgagagaccaaaaaaggagatccttagtgaaatca 50432840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 20937375 - 20937408
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctca 40  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20937375 tgacccattagttgggtaagcttggtgaatctca 20937408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 31340271 - 31340242
Alignment:
Q  450 catttgtatctctttgtaagaactcattga 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340271 catttgtatctctttgtaagaactcattga 31340242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 3617451 - 3617568
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  3617451 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactc 3617547  T
Q  475 a-ttgatagtggattggagag 494  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  3617548 atttgatagtggattggagag 3617568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 25637428 - 25637545
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  25637428 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaactc 25637524  T
Q  475 a-ttgatagtggattggagag 494  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  25637525 atttgatagtggattggagag 25637545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 410 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 37761604 - 37761548
Alignment:
Q  410 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttg-tatctctttg 465  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  37761604 ttgttctttgtgggcttgttaaaactaatttattgtaacccttttgatatctctttg 37761548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 80817 - 80338
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggttca 108  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  80817 acccatttgttggaaaatcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactagaggttgagggtctttgggtgaggttca 80718  T
Q  109 aaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgag 208  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  80717 aagcttcaagatttgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgag 80618  T
Q  209 cggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  80617 cggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgggaaactaaaagagtagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctattttgggggtt 80518  T
Q  309 agattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattaga 408  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  80517 agattctagagttaggaaacaattgtgaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcatt-gctgagattgggaaaatgggtagaaattagg 80419  T
Q  409 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  80418 gttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctttttgtaagaactcatagatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 494
Target Start/End: Original strand, 11190 - 11675
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  11190 tgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 11289  T
Q  107 caaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11290 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 11389  T
Q  207 agcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  11390 agtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttgggg 11489  T
Q  307 ttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatt 405  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11490 ttagattctagagttgggaaac-attgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaaatggtagaaatt 11586  T
Q  406 agagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11587 agggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 11675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 3 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18540 - 18050
Alignment:
Q  3 tccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaa 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||| || |    
T  18540 tccatgacacatttgttgggtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttatagg-ttttagatactaaaggttgcgggtctttgggtga 18442  T
Q  103 ggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggag-aagattcatggggttgggaaac 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||    
T  18441 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggggaagattcatgaggttga-aaac 18343  T
Q  202 agatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt 301  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18342 acatgagtggagagttatttgtgagcaacttgagtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagagttggttctctttt 18243  T
Q  302 gggggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtaga 401  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  18242 -ggggttagattatagagttgg-aaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcatgagtgttttgttcatt-ggtgagagtgggaaaattggtaga 18146  T
Q  402 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18145 aattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa-aactcattgatagtggattggagagatca 18050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 490981 - 490661
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagataataaaggctgagggtctttgagtaaggt 105  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||| || ||||    
T  490981 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 490882  T
Q  106 tcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttgggaaacaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |    
T  490881 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctttgg-agagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacaca 490783  T
Q  205 tgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 304  Q
    | |  |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||| | ||  |||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||| ||    
T  490782 tcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc-cttttagg 490686  T
Q  305 ggttagattctagagttggaaaaca 329  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  490685 ggttagaatctagagttgggaaaca 490661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 319 - 494
Target Start/End: Original strand, 434477 - 434651
Alignment:
Q  319 gttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagagttgttct 416  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  434477 gttggaaaaca-tggtaaataccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattggggaaaaagggtagaaattagggttgttct 434573  T
Q  417 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434574 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 434651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 490468 - 490365
Alignment:
Q  397 gtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagaga 495  Q
    ||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  490468 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 490369  T
Q  496 tcat 499  Q
    ||||    
T  490368 tcat 490365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 149311 - 149143
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  149311 attgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttg-tgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgt 149213  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149212 tgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 149143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 114557 - 114724
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  114557 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaaagggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgt 114654  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
      |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114655 caaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 114724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20629 - 20461
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  20629 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtttattattcattgg-tgagattgggaaaatgagcagaaattaggtttgttttttgtgaacttgt 20531  T
Q  429 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20530 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatattggattggagagatca 20461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1948 - 1477
Alignment:
Q  1 actccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagataataaaggctgagggtctttgag 99  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |    
T  1948 actccttgacctatttgttaagtaaacttggtgaattttatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatttagatactaaaggttgaaggtctttggg 1849  T
Q  100 taaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagaggggtctcttgggaaaagggttggtgccttttggaga-agattcatggggttggga 198  Q
    | || | |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||||||  || |||||||||  |||| ||    
T  1848 tgagctccaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagaggggactcttggg-cgaggcttggtgtcttttgtggagagattcatgtagttgaga 1750  T
Q  199 aacagatgagcggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggc----------taaggg 288  Q
    |||| || |   |||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||          |||| |    
T  1749 aacacatcatatgagagtca-ttgtgagcaacttgggcgagtcttgggagatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaagcttataacttataagtg 1652  T
Q  289 ttggttctcttttgggggttagattctagagttggaaaacaatt-gtaaacaccttgggaga-gtgaaaatca-tgagtgtcttgttcattgggtgagat 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  || |||| | |||||  ||||||||| ||  |||||    
T  1651 ttggttctctttt-ggggttagattctagagttgggaaacaattagaaaacaccttgggagacttgtaaataattgagttacttgttcatgggaagagat 1553  T
Q  386 tgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctct 462  Q
    || | |||| |||| |||||||  |||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  1552 tgtg-aaattggtaaaaattaggtttgttctgggtgagcttggtgaagttgattttttgcaacccttttgtttctct 1477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Original strand, 871 - 1033
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  871 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttctt--ggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 967  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  968 tcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aacaactcattgatagtggattggagag 1033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11375 - 11211
Alignment:
Q  330 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattggga-aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttg 427  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11375 attgtaaacaccttggt-gagtgtaaatcattgagtgtcttgttctt--ggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 11279  T
Q  428 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11278 taaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagag 11211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8919 - 8785
Alignment:
Q  360 tgagtgtcttgttcattgggtgagattggga-aaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 458  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  8919 tgagtgtcttgttctt--ggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtat 8822  T
Q  459 ctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 494  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8821 ctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagag 8785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 317 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27670 - 27488
Alignment:
Q  317 gagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gagttgttc 415  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||    ||||| ||||||||   ||  ||||||| ||||| | |||||||||| |  ||||||    
T  27670 gagttgggaaacatttgtaaacaccttggatgagtgaaatctttgagtctcttgttctagggaagagattgtgaaaa-gagtagaaattatgtattgttc 27572  T
Q  416 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27571 ttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatca 27488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 497
Target Start/End: Original strand, 24981 - 25175
Alignment:
Q  304 gggttagattctagagttggaaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagatt-gggaaaatgggtaga 401  Q
    |||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||   |   ||||| |||||||||| ||||    
T  24981 gggtgagattcttgggtttggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaa-tcattgagtctgttgatcacatgacaagattcgggaaaatgg-taga 25078  T
Q  402 aattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 497  Q
    || |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  25079 aactagttttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtagagagatc 25175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 360 - 498
Target Start/End: Original strand, 10475 - 10611
Alignment:
Q  360 tgagtgtcttgttcattgggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 458  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  | || ||||||| ||| ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||  |||||||    
T  10475 tgagtgtcttgttcatttg-tgagattggaaaaaaagatataaattagggtttgttctttgtgagctc-ttgt-gctaatttattgtaaccattttgtat 10571  T
Q  459 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10572 ctctttgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatca 10611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 2771 - 2654
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  2771 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaactc 2675  T
Q  475 att-gatagtggattggagag 494  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  2674 atttgatagtggattggagag 2654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 6274 - 6391
Alignment:
Q  378 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 474  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||    
T  6274 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaagccctt-gtatcccttttgtaaagaactc 6370  T
Q  475 att-gatagtggattggagag 494  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  6371 atttgatagtggattggagag 6391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University