View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19448_low_2 (Length: 552)

Name: NF19448_low_2
Description: NF19448
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19448_low_2
NF19448_low_2
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (23-318)||(45648098-45648393)
chr7 (24-318)||(42040331-42040626)
chr7 (25-318)||(47843644-47843934)
chr7 (25-268)||(48152986-48153229)
chr7 (25-263)||(40836343-40836583)
chr7 (37-318)||(45492125-45492420)
chr7 (38-296)||(3751392-3751650)
chr7 (37-293)||(25482505-25482772)
chr7 (38-268)||(43495674-43495908)
chr7 (28-318)||(2185621-2185902)
chr7 (32-318)||(25310882-25311159)
chr7 (26-168)||(34471717-34471858)
chr7 (76-314)||(42509185-42509414)
chr7 (38-196)||(22201069-22201225)
chr7 (38-196)||(22236596-22236752)
chr7 (420-497)||(45647926-45648003)
chr7 (122-247)||(7857938-7858065)
chr7 (420-497)||(42040155-42040231)
chr7 (45-159)||(22543396-22543507)
chr7 (144-263)||(45804918-45805037)
chr7 (420-497)||(25310707-25310785)
chr7 (245-317)||(43728101-43728173)
chr7 (38-154)||(48138467-48138583)
chr7 (38-149)||(2483735-2483846)
chr7 (37-298)||(31397082-31397346)
chr7 (420-497)||(40837286-40837365)
chr7 (424-498)||(44797885-44797960)
chr7 (420-498)||(48153243-48153322)
chr7 (424-489)||(9229336-9229402)
chr7 (158-224)||(22542930-22542996)
chr7 (420-457)||(47843504-47843541)
chr7 (427-498)||(43495581-43495653)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (23-318)||(11789248-11789543)
chr8 (28-318)||(6166392-6166682)
chr8 (23-267)||(9409885-9410127)
chr8 (23-318)||(25429975-25430272)
chr8 (37-268)||(32855986-32856217)
chr8 (23-318)||(18928433-18928730)
chr8 (34-318)||(24888641-24888927)
chr8 (23-318)||(24728432-24728724)
chr8 (25-252)||(23877331-23877560)
chr8 (25-166)||(17748925-17749066)
chr8 (144-268)||(17748796-17748922)
chr8 (39-193)||(12006684-12006836)
chr8 (38-318)||(11990714-11990997)
chr8 (89-169)||(13003382-13003460)
chr8 (221-318)||(31332506-31332603)
chr8 (74-295)||(31431283-31431512)
chr8 (38-154)||(14180015-14180131)
chr8 (427-498)||(11789071-11789142)
chr8 (88-205)||(18320728-18320844)
chr8 (420-496)||(9410216-9410292)
chr8 (37-189)||(9136732-9136883)
chr8 (130-197)||(11755701-11755768)
chr8 (221-295)||(12006850-12006924)
chr8 (26-77)||(18320681-18320732)
chr8 (420-498)||(23877193-23877272)
chr8 (71-154)||(37231776-37231859)
chr8 (74-143)||(26079438-26079507)
chr8 (420-483)||(16591134-16591198)
chr8 (424-498)||(2813461-2813536)
chr8 (24-115)||(16591534-16591624)
chr8 (35-77)||(11755783-11755825)
chr8 (234-268)||(23877286-23877320)
chr8 (420-462)||(24728279-24728321)
chr8 (38-100)||(35536903-35536965)
chr8 (228-298)||(37231936-37232006)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (23-318)||(7856-8151)
scaffold0565 (420-494)||(8250-8329)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (23-318)||(29230952-29231247)
chr5 (23-318)||(19099923-19100202)
chr5 (38-306)||(3387249-3387517)
chr5 (26-268)||(26564911-26565155)
chr5 (37-300)||(31113888-31114152)
chr5 (25-268)||(2627881-2628131)
chr5 (74-314)||(32076413-32076655)
chr5 (34-268)||(34510806-34511039)
chr5 (28-318)||(39935575-39935861)
chr5 (40-293)||(5836480-5836729)
chr5 (95-268)||(8229316-8229489)
chr5 (26-257)||(7057059-7057287)
chr5 (29-184)||(27925519-27925673)
chr5 (45-317)||(31210725-31211007)
chr5 (28-196)||(13407257-13407424)
chr5 (23-295)||(16755974-16756245)
chr5 (140-268)||(34764588-34764716)
chr5 (420-498)||(19099744-19099822)
chr5 (24-165)||(42990636-42990778)
chr5 (422-498)||(26565171-26565248)
chr5 (420-477)||(29230795-29230852)
chr5 (424-498)||(2627788-2627863)
chr5 (424-497)||(7057361-7057435)
chr5 (228-316)||(8802687-8802779)
chr5 (420-498)||(8229503-8229582)
chr5 (60-266)||(41368597-41368806)
chr5 (49-154)||(12118293-12118395)
chr5 (137-268)||(29674927-29675060)
chr5 (421-498)||(7732556-7732633)
chr5 (74-143)||(28470234-28470303)
chr5 (441-498)||(39730581-39730639)
chr5 (220-257)||(27925692-27925729)
chr5 (24-76)||(28470331-28470383)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (45-318)||(45773984-45774254)
chr4 (23-318)||(19721581-19721876)
chr4 (23-318)||(2295328-2295622)
chr4 (23-309)||(53018448-53018734)
chr4 (23-318)||(15476620-15476915)
chr4 (37-317)||(35103389-35103669)
chr4 (37-250)||(53586368-53586583)
chr4 (28-318)||(27675397-27675692)
chr4 (37-318)||(40217526-40217811)
chr4 (38-275)||(44987234-44987471)
chr4 (177-305)||(2242769-2242899)
chr4 (73-268)||(6008208-6008403)
chr4 (36-191)||(10037865-10038019)
chr4 (38-285)||(4775760-4776007)
chr4 (26-257)||(24917493-24917714)
chr4 (132-318)||(7208396-7208583)
chr4 (23-187)||(47922951-47923116)
chr4 (134-268)||(1052368-1052505)
chr4 (420-496)||(15476442-15476518)
chr4 (48-138)||(2242914-2243004)
chr4 (420-498)||(19721403-19721481)
chr4 (45-139)||(53014846-53014936)
chr4 (37-295)||(35823493-35823742)
chr4 (25-109)||(24913807-24913890)
chr4 (23-186)||(23241801-23241962)
chr4 (23-143)||(45661792-45661911)
chr4 (420-497)||(2295721-2295797)
chr4 (420-498)||(2242579-2242656)
chr4 (74-184)||(28102017-28102126)
chr4 (230-295)||(25059434-25059499)
chr4 (424-497)||(45774356-45774429)
chr4 (420-535)||(6008417-6008531)
chr4 (38-102)||(7208592-7208656)
chr4 (37-164)||(43770594-43770722)
chr4 (420-497)||(40217911-40217989)
chr4 (243-309)||(47922891-47922957)
chr4 (36-166)||(22198899-22199029)
chr4 (424-493)||(38947583-38947653)
chr4 (424-492)||(34072724-34072793)
chr4 (420-498)||(53586600-53586678)
chr4 (89-143)||(21619576-21619630)
chr4 (420-462)||(53018302-53018344)
chr4 (74-115)||(4110266-4110307)
chr4 (420-498)||(7208217-7208297)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (23-318)||(2032229-2032526)
chr6 (27-318)||(687957-688245)
chr6 (23-318)||(32340151-32340444)
chr6 (25-268)||(2988051-2988295)
chr6 (47-270)||(10229422-10229647)
chr6 (37-295)||(8485910-8486168)
chr6 (37-295)||(12311922-12312179)
chr6 (88-257)||(30928331-30928500)
chr6 (124-295)||(12283617-12283790)
chr6 (105-205)||(10567321-10567414)
chr6 (23-149)||(22297370-22297495)
chr6 (104-268)||(7434853-7435019)
chr6 (219-314)||(22297248-22297343)
chr6 (420-497)||(2032048-2032125)
chr6 (74-267)||(22053889-22054080)
chr6 (420-494)||(687783-687857)
chr6 (420-498)||(2987958-2988037)
chr6 (244-295)||(26546013-26546063)
chr6 (424-493)||(1929240-1929310)
chr6 (38-166)||(6724502-6724636)
chr6 (421-498)||(10229660-10229738)
chr6 (420-498)||(7435033-7435113)
chr6 (36-93)||(17533522-17533579)
chr6 (73-139)||(26546168-26546234)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (48-318)||(42794648-42794918)
chr2 (48-317)||(41323867-41324135)
chr2 (23-261)||(7017788-7018028)
chr2 (37-318)||(30485559-30485841)
chr2 (99-318)||(30382682-30382903)
chr2 (26-304)||(17328663-17328947)
chr2 (25-247)||(38221559-38221781)
chr2 (24-318)||(37272784-37273078)
chr2 (38-245)||(11562673-11562877)
chr2 (23-257)||(36467161-36467396)
chr2 (23-189)||(35298388-35298555)
chr2 (125-268)||(40498676-40498821)
chr2 (25-268)||(40363767-40364009)
chr2 (23-165)||(38140535-38140681)
chr2 (34-205)||(16496782-16496953)
chr2 (26-162)||(40498537-40498672)
chr2 (165-318)||(38140833-38140992)
chr2 (74-267)||(44364274-44364465)
chr2 (74-205)||(38558636-38558765)
chr2 (220-318)||(35306240-35306337)
chr2 (420-498)||(40498835-40498913)
chr2 (48-142)||(18561078-18561171)
chr2 (74-143)||(21812975-21813044)
chr2 (34-135)||(35428729-35428829)
chr2 (420-481)||(42794488-42794549)
chr2 (73-166)||(3353116-3353209)
chr2 (38-138)||(30776645-30776744)
chr2 (38-168)||(2788872-2789001)
chr2 (420-497)||(35306439-35306517)
chr2 (38-169)||(26352561-26352689)
chr2 (441-497)||(38141972-38142028)
chr2 (221-293)||(40083089-40083161)
chr2 (420-498)||(40364023-40364102)
chr2 (45-166)||(43355765-43355890)
chr2 (420-497)||(7018173-7018251)
chr2 (421-498)||(41324244-41324319)
chr2 (221-286)||(12599175-12599240)
chr2 (421-488)||(37272614-37272683)
chr2 (228-286)||(11457972-11458030)
chr2 (238-266)||(41952415-41952443)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (34-318)||(46979227-46979511)
chr3 (23-318)||(7629071-7629364)
chr3 (26-318)||(29324037-29324332)
chr3 (66-268)||(45472595-45472797)
chr3 (26-257)||(27163964-27164193)
chr3 (51-268)||(36504803-36505020)
chr3 (26-268)||(38489651-38489893)
chr3 (23-275)||(40614775-40615026)
chr3 (64-202)||(32835231-32835370)
chr3 (48-257)||(20178972-20179174)
chr3 (34-205)||(52204113-52204283)
chr3 (23-182)||(20369258-20369415)
chr3 (23-248)||(52695505-52695732)
chr3 (23-307)||(39614930-39615207)
chr3 (26-205)||(20619218-20619396)
chr3 (420-497)||(46979051-46979128)
chr3 (23-117)||(51241341-51241434)
chr3 (26-184)||(35296380-35296536)
chr3 (219-314)||(51240854-51240948)
chr3 (420-498)||(7628886-7628964)
chr3 (24-117)||(17063930-17064023)
chr3 (37-185)||(24611468-24611617)
chr3 (37-166)||(47014226-47014357)
chr3 (222-268)||(17063888-17063934)
chr3 (96-190)||(52203963-52204057)
chr3 (422-498)||(21858532-21858609)
chr3 (424-493)||(16343233-16343303)
chr3 (424-493)||(43472038-43472108)
chr3 (192-268)||(53530625-53530701)
chr3 (220-295)||(21853838-21853913)
chr3 (420-498)||(45472811-45472890)
chr3 (424-493)||(12176473-12176543)
chr3 (420-497)||(27163791-27163869)
chr3 (420-462)||(35296689-35296731)
chr3 (424-493)||(35433570-35433640)
chr3 (37-98)||(2111391-2111452)
chr3 (453-498)||(17063819-17063864)
chr3 (23-63)||(32834947-32834987)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (23-317)||(17116201-17116497)
chr1 (48-279)||(50726630-50726861)
chr1 (25-318)||(41827636-41827922)
chr1 (23-318)||(31513501-31513787)
chr1 (23-318)||(38682790-38683091)
chr1 (26-318)||(14286975-14287270)
chr1 (25-268)||(13558438-13558682)
chr1 (27-259)||(40693887-40694120)
chr1 (23-308)||(4966637-4966923)
chr1 (23-308)||(4972959-4973251)
chr1 (128-318)||(25294510-25294700)
chr1 (37-268)||(11767567-11767801)
chr1 (128-306)||(40032690-40032871)
chr1 (38-202)||(16122756-16122921)
chr1 (26-162)||(10443522-10443657)
chr1 (219-318)||(13643921-13644020)
chr1 (23-149)||(13643769-13643894)
chr1 (86-295)||(51898831-51899041)
chr1 (26-205)||(270890-271067)
chr1 (424-498)||(25294332-25294406)
chr1 (45-190)||(30902365-30902511)
chr1 (420-498)||(31513323-31513401)
chr1 (38-166)||(46594253-46594385)
chr1 (38-166)||(22791116-22791245)
chr1 (420-497)||(41828021-41828098)
chr1 (37-166)||(50709492-50709624)
chr1 (424-493)||(46593986-46594056)
chr1 (421-498)||(4967038-4967115)
chr1 (423-498)||(4972767-4972843)
chr1 (38-154)||(29488210-29488325)
chr1 (420-498)||(11767474-11767553)
chr1 (435-497)||(17116619-17116681)
chr1 (420-477)||(40694198-40694255)
chr1 (49-149)||(781830-781929)
chr1 (424-498)||(31183803-31183878)
chr1 (23-103)||(40032600-40032683)
chr1 (73-166)||(50461234-50461327)
chr1 (424-498)||(49899513-49899588)
chr1 (420-477)||(38682633-38682691)
chr1 (424-493)||(50709801-50709871)
[»] scaffold0495 (2 HSPs)
scaffold0495 (47-270)||(6137-6362)
scaffold0495 (421-498)||(6375-6452)
[»] scaffold0581 (1 HSPs)
scaffold0581 (47-108)||(10046-10106)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (424-493)||(53877-53947)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (26-63)||(38405-38442)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45648393 - 45648098
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648393 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaggagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 45648294  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648293 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcggtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 45648194  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648193 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 45648098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42040626 - 42040331
Alignment:
Q  24 acagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaa-gtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42040626 acagatacacaaggatacttctaagatacttcgcagacacgtattctagaaaaagatgaagagtaaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 42040527  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||    
T  42040526 gatgtatatgactcaattttagatatgcatcaatagaattgtctctcgatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaacgcatcgagagatgtga 42040427  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42040426 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttattgatgtttctctcaatatcccaacatatgaaaatgtaatatgctttataag 42040331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47843934 - 47843644
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||    
T  47843934 cagatagacaaggatacttctaagatacttcacgtatgcgtatcctagaaaaagatgaagggtaaaaaagttagacaatgttgtaaaaactcagtagaga 47843835  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgatt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||  | ||||||    
T  47843834 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaataaaattgtttcctgacgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa---ggagagataggtgatt 47843738  T
Q  225 cagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  47843737 cagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatatgaaaatataatatggtttataag 47843644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 48152986 - 48153229
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||    
T  48152986 cagatacacaaggatacttataagatatttcacatatacgtatcctagaaaaagatgaagaataaaaaagtgagaaaatgttgtaaacattccgtagaga 48153085  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtga 222  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  | ||| || ||||    
T  48153086 tgtatacgattcaattttagacatgcatcactagaattgtttctcgatgaaccacttgaaattatacttcttgtggatgaatgtaacgagagagaggtga 48153185  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48153186 ttcagttaatcaacattagataaaatt--tcttgagttcttttaat 48153229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 40836343 - 40836583
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||    
T  40836343 cagatacacaaacatacttataaggtacttcacagatacgtatcatagaaaaagatgaggagtaaaaaagtgagacaacgttgtaaacatctagtagaga 40836442  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  | ||| || ||||    
T  40836443 tctatatgattcaattttagatatgcatcactagaattgtttctcgatgaaccacttaaaattatacttcttatggatgaaggtaacgagagagaggtga 40836542  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttctt 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  40836543 ttcagttaatcaacattcgataaaatttgtgttaagttctt 40836583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 318
Target Start/End: Original strand, 45492125 - 45492420
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagag----taaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatg 132  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  45492125 gatacttataagatacttcgcatatatgtatcctagaaaaagatgaagggaaattaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcaggagagacgtatatg 45492224  T
Q  133 attcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatga--------acatagcgagggacgtgatt 224  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | | || ||| || ||||||    
T  45492225 attcaattttagatatgcattagtcgaattgtttcacagtgaatcacttaaaattatacttcttgtggatgaaggtaatgagagagagagagaggtgatt 45492324  T
Q  225 cagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatata--aaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||  ||| | ||||||| ||||||||    
T  45492325 cagttaatcaacattagataaaatatgtgttgagttcttttaattattcttctctcgatatccaaacatatatgaaagtataatatggtttataag 45492420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3751650 - 3751392
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaa-gtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| | | || |||||||||||||||    
T  3751650 atacttttaagatacttcacatatacatatctta-aaaaagatgcagggtaaaaaaagtgagacaatgttgtgaaaacttagtagagatgtatatgattc 3751552  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| || ||||||||||||||||||    
T  3751551 aattttagatatgcatcaataaaattgtttctcgatgaatcacttaaaattatacttcttgtgaatgaaggtaacgagagaggtgattcagttaatcaac 3751452  T
Q  237 attagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatata 296  Q
    |||| ||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||    
T  3751451 attaaataaaatttatgttgagtgtttttaatgatgcttctctcaatttcctaacatata 3751392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25482772 - 25482505
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaat-------------tcattatag 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||    
T  25482772 gatacttctaagatacttcacaaatacgtattttagaaaaggatgaaaattaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaatatgctttaaaaattcattatag 25482673  T
Q  124 atgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||  | |||||||||| | ||||||| || ||||     
T  25482672 atgtatatgattcaattttagatatgcatcaatataattgtttttcgatgaaacacttaaaaatata--tgttgtggatgatcgtagcgagagaggtgac 25482575  T
Q  224 tcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||    
T  25482574 tcagttaatcaacattagataaaatatatgttgagttcttttaatgatatttctctcaatattccaacat 25482505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43495908 - 43495674
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || |||| |||||||||||    
T  43495908 atacttataagatacttcacagatatgtatcctataaaaaggtgaagagtaaaaaagtgagacaatcttgtaaacatccagtagagatatatatgattca 43495809  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgaggga----cgtgattcagttaatc 233  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||| ||     |||||||| |||||     
T  43495808 attttagatatgcatcactaaaattgtttctcgatgaaccacttaaaattatacatcttgtgaatgaaggtaacgagagaggtgagtgattcatttaatt 43495709  T
Q  234 aacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  43495708 aacattagataaaatttgagttaagttcttttaat 43495674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2185902 - 2185621
Alignment:
Q  28 atacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgt 127  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |  | |||| |    
T  2185902 atacacaaggatacttataagatacttcacatatatgtatcctagaaaaagataaaaggtaaaaaaacgagacaatgttgtaaaaattaaggagagatat 2185803  T
Q  128 atatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacat----agcgagggacgtgat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||  |    || ||| ||  ||||    
T  2185802 atatgattcaattttagatatgcattagtagaattgtttc-------------aaaaattatacttcttgtggatgaaggtaatgagggagagagatgat 2185716  T
Q  224 tcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2185715 tcatttaatcaacatttgataaaatttgtgttgagttcttttaattattcttctgtcgatatccaaacatatgaaaatataatatgatttataag 2185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25311159 - 25310882
Alignment:
Q  32 ataaggatacttctaagatacttcacagatacgt--atcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtat 129  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||        || ||||||||    
T  25311159 ataaagatacttagaagatacttcacagaaacgtgtatcctagaaaaatatgaag-gtcaaaaagtgagacaatgttgtaag-------tagagatgtat 25311068  T
Q  130 atgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagtt 229  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||   |    ||| || |    
T  25311067 atgattaaattttaaatatgcaacagtataattgtttcttgatgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaaggtaatgaaaaaa---atttagct 25310971  T
Q  230 aatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  25310970 aatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaacgatgcttctctcaatatcccaacatatgaaaatataatatgatatataag 25310882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 34471717 - 34471858
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  34471717 agatacacaagaatacttataagatacttcacatatacgtatcctaggaaat-atgaagtgtaaaaaagtgacacaatgttgtagaaattcagtagagat 34471815  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttct 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  34471816 gtatataattcaattttagatatgcatctctagaactgtttct 34471858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 314
Target Start/End: Original strand, 42509185 - 42509414
Alignment:
Q  76 aagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaa 175  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  ||||||||||||| |||||| | |||||||  ||     ||||    
T  42509185 aagatgatgggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcagtaaaaatatata--attcaattttagacatgcattagtagaatttattga---tgaa 42509279  T
Q  176 ccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgttt 275  Q
    ||  |||||||||  |||||| ||||||||  ||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  42509280 ccgtttaaaatta--cttcttatggatgaaggtaaagagagatgt--ttcaattaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgctt 42509375  T
Q  276 ctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgattta 314  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  42509376 ctctcgatatcccaacatatgaaagtataatatggttta 42509414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 196
Target Start/End: Original strand, 22201069 - 22201225
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| || |    
T  22201069 atacttataagatacttcacaggtacgtatcatagaaaa-gatgaatggtaaaaaaatgagacaatgttctaaaaattcagtggagatgtatatgtttta 22201167  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttctt 196  Q
    ||||||||| || |||  ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  22201168 attttagat-tgtatcggtagaattgtttctcgataaaccacttaaaattatgcttctt 22201225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22236752 - 22236596
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| || |    
T  22236752 atacttataagatacttcacaggtacgtatcatagaaaa-gatgaatggtaaaaaaatgagacaatgttctaaaaattcagtggagatgtatatgtttta 22236654  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttctt 196  Q
    ||||||||| || |||  ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  22236653 attttagat-tgtatcggtagaattgtttctcgataaaccacttaaaattatgcttctt 22236596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 45648003 - 45647926
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45648003 cttcaagtattttacatatagataagttttattataaatttttgttcatgtatcctaactgtaccgtatcctaaattt 45647926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 247
Target Start/End: Original strand, 7857938 - 7858065
Alignment:
Q  122 agatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagc--gagggacg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||   || |  ||| || |    
T  7857938 agatgtatatgattcaattttagatatgaaacagtagaattgtttctcattgaaccacttaaaaatatatttattgtggatgatggtaacaagagagagg 7858037  T
Q  220 tgattcagttaatcaacattagataaaa 247  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7858038 agattcaattaatcaacattagataaaa 7858065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 42040231 - 42040155
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42040231 cttcaagtattt-acatacatataagttttattataaatttttgttaacgtatcctaaccgtatcgtatcctaaattt 42040155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22543507 - 22543396
Alignment:
Q  45 taagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttag 144  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22543507 taagatacttcacatatacatatcttagaaaaagatgacaggtaaaaa-gtgaga--atgttgtaaacattcagttgagatgtatatgattcaattttag 22543411  T
Q  145 atatgcatcaataga 159  Q
    || ||||||||||||    
T  22543410 atgtgcatcaataga 22543396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 263
Target Start/End: Original strand, 45804918 - 45805037
Alignment:
Q  144 gatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagat 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||  || |||| ||  ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  45804918 gatatgcatcattagaattgtttcctgatgaaccacttaaatttatacttttcgtggatgaaggtaacgagagagatgattcaattaatcatcatcagat 45805017  T
Q  244 aaaatttgtcttgagttctt 263  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  45805018 aaaatttgtgttgagttctt 45805037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25310785 - 25310707
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataa-atttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25310785 cttcaaatattttacatacatataagttttagtataatatttttgttaacgtatcttaactgtatcgtatcctaaattt 25310707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 43728101 - 43728173
Alignment:
Q  245 aaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataa 317  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  43728101 aaatttgtgttgagtttttttaatgatgcttctctcgatatcccaacatatgaaaatataatatggtttataa 43728173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 48138467 - 48138583
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||  |||| | |||||| | |  ||||||||||||||||    
T  48138467 atacttataagatacttcacagagacgtatcctggaaaaaaatgaagcttaaataaatgagactgtgttctgaaaatttaatggagatgtatatgattca 48138566  T
Q  138 attttagatatgcatca 154  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  48138567 atttaagatatgaatca 48138583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 149
Target Start/End: Original strand, 2483735 - 2483846
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||| || || | |||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||    
T  2483735 atacttataagatacttcaaagagacgtattctggagagagaaaaattgtaaaaaagtgagactatgttgtgaaaatgcaatgaagatgtatatgattca 2483834  T
Q  138 attttagatatg 149  Q
    |||| |||||||    
T  2483835 atttaagatatg 2483846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31397346 - 31397082
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||  |||||| |||||| | |  | || ||||||| ||    
T  31397346 gatacttataagatgtttcacacatacgtatcctggaaaaaaacgaaaggtaaaaaagtgagactgtgttgtgaaaattgaatggaaatatatatgactc 31397247  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccactt-aaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatc 233  Q
    ||||| ||||||  |||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||  |  | ||| |||||  ||  | ||| || |  ||||| | ||||    
T  31397246 aatttaagatataaatcactataattgtttttcaattaaccaattgaaaattatgttattggtgaatgaaagtaacgagagagaagatattcaatcaatc 31397147  T
Q  234 aacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaa 298  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  31397146 aacattaaacaaactttgttttgagttcttttattgatgcatttgttgatatcccaacatataaa 31397082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Original strand, 40837286 - 40837365
Alignment:
Q  420 cttcaagtatttt-acatacagataaattttattataaattttt-gttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40837286 cttcaagtatttttacatacatataagttttagtataaattttttgttaatgtatcttaaccgtatcgtatcctaaattt 40837365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44797960 - 44797885
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  44797960 aagtattttacatatatataaattttagtagaaatattttgttaacgtatcttagatgtatggtatcctaaatttt 44797885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Original strand, 48153243 - 48153322
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattat-aaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||  |  | ||||| |||||||||||||    
T  48153243 cttcaagtattttacatacatataaattttagtataaaatttttgttaacatattttggccgtatcatatcctaaatttt 48153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 9229402 - 9229336
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatc 489  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  9229402 aagtattttacatacatataaattttagtataaataatttgttaacgtatcttagccgtatcgtatc 9229336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22542996 - 22542930
Alignment:
Q  158 gaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgatt 224  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||| || ||||||    
T  22542996 gaattgtttctccatgaaccacttaaaattatatttcttatagatgaagataacgagagaggtgatt 22542930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 47843541 - 47843504
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaa 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47843541 cttcaagtattttacatacatataagttttattataaa 47843504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 43495653 - 43495581
Alignment:
Q  427 tattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||||||    
T  43495653 tattttacatacatataagttttagtataaaatttttgttaacgtatcttaaccgtattatatcttaaatttt 43495581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11789543 - 11789248
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11789543 cacaaatacacaatgatacttccaagatacttcacagacacatatcctagaaaaagatgaagagtaagaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 11789444  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11789443 gatgtatatgactcaattttagatatgcatcaatagaactgtttctcgatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagagatgtga 11789344  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11789343 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgtttctctcaatatcccaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 11789248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Original strand, 6166392 - 6166682
Alignment:
Q  28 atacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgt 127  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6166392 atacacaaggatatttctaagatactttatagatacgtatcctagaaaaacatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataaatgt 6166491  T
Q  128 atatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||||||||    
T  6166492 atatgattcaattttagatatgcatcagtataattgattctcgatgaaacacttaaaattatatttcttgtggaagaacgtagcgagagaggtgattcag 6166591  T
Q  228 ttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||  |||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6166592 ttagacaacattaaataaaattaatgttaagttcttttaatgatgtttctctcaatatcacatcatatgaaaatgtaatatgatttataag 6166682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 9409885 - 9410127
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  9409885 cacagatacacaaggatacttctaagatacttcagagacatgtatcctagaaaaaaatgaagagtaaaaaagtaagac--ttttgtaaaaattcattata 9409982  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  9409983 gatgtatatgactcaattttacatattcatcaatagaattatttctcgatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaacgtagcgagagatgtga 9410082  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaa 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9410083 ttcagttaatcaatattagataaattttgtgttgagttcttttaa 9410127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Original strand, 25429975 - 25430272
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25429975 cacagatacacaaggatacttataagatacttcgcatatatgtatcctagaaaaagatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcatgaca 25430074  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgt 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  | ||| |  ||    
T  25430075 gatatatatgattcaattttagatatgcattagtagaattgtttcacgatgaaccacttaaaattatacttcttgtgaatgaaggtaatgagagaggggt 25430174  T
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||| |  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  25430175 gattcagttaatcaacattaaataaaatatgtgttgagttcttttaattattcttctctcgataacaaaacatatgaaaatataatatggtttataag 25430272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Original strand, 32855986 - 32856217
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  32855986 gatacttataagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagcgagacaatgttgtaaacattcagtagagatgtatatgattc 32856085  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatca 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  | |||  | |||| |||||||||||    
T  32856086 aattttagatatg-atcactagaattgtttctcgatgaaccacttaaaactatacttcttgtggatgaaggtaatgagagaaaggtga-tcagttaatca 32856183  T
Q  235 acattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  32856184 acattagataaaattcgtgttgaattcttttaat 32856217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18928730 - 18928433
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |    
T  18928730 cacatatacacaatgatacttataagatactttacatatacttatcctagaaaat-atgaggagtaaaaaattgagacaatgttgtaaaaattgaattga 18928632  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgt-ggatgaacata--gcgagggacg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||  | ||| || |    
T  18928631 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcagtagaattgtttctcgatgaaccacttaaaattatattttttgtgggatgaagataacgagagagatg 18928532  T
Q  220 tgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  18928531 tgattcagttaatcaatattaaataaaatttgtgttgagttcttttaattatgcttcactcgatatctgaacatatgaaaatataatatggtttataag 18928433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24888927 - 24888641
Alignment:
Q  34 aaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatga 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||    
T  24888927 aaggatacttataagatacttcgcatatatgtatcctaaaaaaagatgaagggtaaacaagtgagacaatattgtaaaaattcatgacaaatatatatga 24888828  T
Q  134 ttcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaa 231  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  | ||| |  |||||||||||||    
T  24888827 ttcaattttagatatgcattagtagaattgtttcacggtgaaccacttaaaattatacttcttgtgaatgaaggtaatgagagaggggtgattcagttaa 24888728  T
Q  232 tcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||  |||||| |||| |  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  24888727 tcaacattagataaaatatatgttgagttcttttaattattcttctctcgataacaaaacatatgaaaatataatatggtttataag 24888641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24728724 - 24728432
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  24728724 cacaaatacacaaggatacttataagatacttcgcatatatgtatcctagaaaaagatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcaggaga 24728625  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgt 220  Q
    ||| |||||||||||     |||||||||| | | ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||| || ||    
T  24728624 gatctatatgattca-----agatatgcattagtggaattgtttcatggtgaaccatttaaaattatacttcttgtggatgaaggtaacgagagagaggt 24728530  T
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  24728529 gattcagttaatcaacattagataaaatttatgttgacttcttttaattattcttctctcgatatccaaacatatgaaaatataatatggtttataag 24728432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23877560 - 23877331
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| || |||    
T  23877560 cagatacacaatgatacttataaaatacttcacataaacatatcctacaaaaagatgaagagtaagaaagtgagatcatgttgtaaacattcagtagaga 23877461  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||  | ||| || |||     
T  23877460 tatatatgattcaattttagatatgcatgactagaattgttttccgatgaaccacttaaaattatacttattgtggataaaggtaacgagagagaggtgg 23877361  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgt 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23877360 ttcagttaattaacattagataaaatttgt 23877331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17749066 - 17748925
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||    
T  17749066 cagatacacatggatacttataagatacttcacaaatacgtatcctagaaaaatacgaagagtaaaaaagtgagacaacgttgtatacattcagtagaga 17748967  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  17748966 tgtatatgattcaatttatgatatgcatcactagaattgttt 17748925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17748922 - 17748796
Alignment:
Q  144 gatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgaggg--acgtgattcagttaatcaacattag 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |  | |||||| ||||||||||||||||    
T  17748922 gatatgcatcactagaattgtttctcaatgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaagttaacgagagaaaggtgattaagttaatcaacattag 17748823  T
Q  242 ataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  17748822 ataaaatttgtgttcagttcttttaat 17748796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 12006684 - 12006836
Alignment:
Q  39 tacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaa 138  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  12006684 tacttataagatatttcccatatacgcatcctagaaaaa-ataaagggtgaaaaagtg-gacaatgttgtgaaaattcagtggagatgtatatgattcaa 12006781  T
Q  139 ttttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatactt 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||    
T  12006782 ttttagatatgcatcactagaattgttttttgatgaaccgcttaaaattatactt 12006836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 318
Target Start/End: Original strand, 11990714 - 11990997
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| ||| |||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||  |||||||| |  | |||||||| | |||    
T  11990714 atacttataaaatacttaaaatatacatatcctagaaaa-gatgaagggtagaaaagtgtgacattgttgcgaaaattcagtggatatgtatataactca 11990812  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgaggg--acgtgattcagttaatcaa 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||| |||  || |||| |  |   |||||| ||||||||    
T  11990813 attttagatatgcattagtagaattgtttctagataaaccactaaaaattatact--ctgtggacgaaggtaacgagagaaagaagattcaattaatcaa 11990910  T
Q  236 cattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacat----ataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
     |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  11990911 tattagacaaaatttgtattgaattcttttaatgatgcttatgttgatatcccaacatttgaataaaaatataatatggtttataag 11990997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 169
Target Start/End: Original strand, 13003382 - 13003460
Alignment:
Q  89 aaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctc 169  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13003382 aaaaagtgagacaatgttgtagaaattca--atagatgtatatgattcaattttagatatgcataactagaattgtttctc 13003460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31332603 - 31332506
Alignment:
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  31332603 gattcaattaatcaacattagataaaatttgtgttgaatttttttaataatgtttctgtccatatcccaacatataaaaaaataatatggtttataag 31332506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31431512 - 31431283
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaatt-ttagatatgcatcaatagaattgtttctcagt 172  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |   |    
T  31431512 aaaagatggaggataaaagagtgagacaatattgtaaaaattcagcgcagatgtatatgattcaattattagatatgtattaatagaattgttttttgat 31431413  T
Q  173 gaaccacttaaaat----tatacttcttgtggatga-acatagc--gagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttctttt 265  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| |||||||    || |  ||| || | ||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31431412 gaaccacttaaaattatatatatttcttatggatgaggggtaacaagagagatgagattcaaataatcaagattagacaaaatttgtgttgagttctttt 31431313  T
Q  266 aatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  31431312 aatgatgtttctgtggatatcttaacatat 31431283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 14180015 - 14180131
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||   |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  14180015 atacttataagatacttcacagagacgtatcttggaaaaaaatgaagggtaaaaaagtgagaatgtgttttgaaaattcaatggagatgtatatgattca 14180114  T
Q  138 attttagatatgcatca 154  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  14180115 atttaagatatgtatca 14180131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 427 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11789142 - 11789071
Alignment:
Q  427 tattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11789142 tattttacatacatataagttttattataaaattttgttaacgtatcctaaccgtatcgtatcctaaatttt 11789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 205
Target Start/End: Original strand, 18320728 - 18320844
Alignment:
Q  88 aaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaatt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||   |||| | || ||||||    
T  18320728 aaaaaagtgagacaatgttgtgaaattt-agtggagatgtatatgattcaattttagatatgcataagtagaaatgtttcttgatgaatcgctcaaaatt 18320826  T
Q  188 atacttcttgtggatgaa 205  Q
    |||||||||| |||||||    
T  18320827 atacttcttgcggatgaa 18320844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 420 - 496
Target Start/End: Original strand, 9410216 - 9410292
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatt 496  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9410216 cttcaagtatttttcatacatataagttttattataattttttgttaacgtatcttaaccgtatcgtatcctaaatt 9410292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9136883 - 9136732
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||| |  |||  ||||||||||    
T  9136883 gatacttataacatacttcacagagacgtatcctggaaaaa-atgaagggtaaaaaagtgagattgtgttgtgaaaattcaatggagacatatatgattc 9136785  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattat 189  Q
    ||||| | ||| | |||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||    
T  9136784 aatttaaaataagaatcactataattgtttttcgattaaccaattaaaattat 9136732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11755768 - 11755701
Alignment:
Q  130 atgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  11755768 atgattcaattttagatatgcattagtagaattgtttcttgatgaaccgcttaaaattatacttcttg 11755701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Original strand, 12006850 - 12006924
Alignment:
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    ||||||  ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  12006850 gattcaactaatcaacattggacaaaatttgtgtagagttcttttaattatgcttttcttgatatcccaacatat 12006924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 18320681 - 18320732
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaa 77  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18320681 agatatatcaggatacttataagatacttcacatatacgtatcctagaaaaa 18320732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23877272 - 23877193
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaattttt-gttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  23877272 cttcaagtattttacttacatataagttgtagtataaattttttgttaacgtatcttagccgtatcgtatcctaaatttt 23877193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 154
Target Start/End: Original strand, 37231776 - 37231859
Alignment:
Q  71 agaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatca 154  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  37231776 agaaaaaaatgaagggtaaaaaagtgagattgtgttgtgaaaattcaatggagatgtatacgattcaatttaagatatgaatca 37231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 143
Target Start/End: Original strand, 26079438 - 26079507
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaatttta 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |  | |||||||  |||||||||||    
T  26079438 aaaagatgaagagtacaaaagtgagacaatattgtgaaaattcagtggaaatgtataaaattcaatttta 26079507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 16591198 - 16591134
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattat-aaatttttgttcacgtatcctaactgtat 483  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  16591198 cttcaagtattttacatgcatataagttttattataaaatttttgttaacgtatcttaaccgtat 16591134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2813536 - 2813461
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||| || | |||||||||||||||||||    
T  2813536 aagtattttacacacatataaattttaatataaatattttgttaacacatcttagccgtatcgtatcctaaatttt 2813461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16591624 - 16591534
Alignment:
Q  24 acagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaatt 115  Q
    |||| |||| || ||||||| ||| |||||||| |  || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16591624 acagttacacaaagatacttataaaatacttcaaaagtatgtatcctataaaaa-attaagagtaaaaaagcgagacaatgttgtgaaaatt 16591534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11755825 - 11755783
Alignment:
Q  35 aggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaa 77  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11755825 aggatacttataagatacttcacatatacatatcctagaaaaa 11755783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23877320 - 23877286
Alignment:
Q  234 aacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23877320 aacattagataaaatttgtgttgagttcttttaat 23877286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24728321 - 24728279
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaattttt 462  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  24728321 cttcaagtattttacatacaaataagttttagtataaattttt 24728279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Original strand, 35536903 - 35536965
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagac 100  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35536903 atacttttaagatatttcacatatacgcatccttgaaaaaaatgaatggtaaaaaagtgagac 35536965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Original strand, 37231936 - 37232006
Alignment:
Q  228 ttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaa 298  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||    
T  37231936 ttaatcaacattaaacaaactttgttttgagttcttttattgatgcatttgttgatatcctaacatataaa 37232006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Original strand, 7856 - 8151
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7856 cacagatacacaaggatacttctaagatacttcacagacacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 7955  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  7956 gatgtatatgactcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcgatgaaacactaaaaagtatacttcttgtggatgaacgtagcgagagatgtga 8055  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8056 ttcagttaatcaaaattagataaaatttgtgttgggttcttttaacgatgtttctctcaacatcccaacatatgaaaatgtaatacgatttataag 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 494
Target Start/End: Original strand, 8250 - 8329
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaa-----ttttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaa 494  Q
    |||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  8250 cttcaagtattttacatacatataatataacttttattataaatttttgttaacgtatcttaaccgtatcgtatcttaaa 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29231247 - 29230952
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29231247 cacatatacacaaggatatttttaagatacttcacagacacgtatcctagaaaaagatgaagactaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 29231148  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||    
T  29231147 gatgtatatgactcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcgatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaatgtagcgagagatgtga 29231048  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29231047 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgaattcttttaatgatgtttctctcaatatcccaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 29230952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19100202 - 19099923
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  19100202 cacatatacacaaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagataaagagtaaaaaagtgagaca----tgtaaaaattcattata 19100107  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||||||            ||||||||||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||    
T  19100106 gatgtatatgat------------atgcatcaatataattgtttctcgatgaaacacctaaaattatacttcttgtggatgaacgtaacgagagatgtga 19100019  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19100018 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagtttttttaatgatgtttctttcgatatcccaacatatgaaaatgtaatataatttataag 19099923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 306
Target Start/End: Original strand, 3387249 - 3387517
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||  ||||    
T  3387249 atacttataagatgcttcgcaaatacgtatcctagaaaa-gatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcagtagagacgtgtatatttca 3387347  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacat-agcgagggacgtgattcagttaatcaac 236  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||  | | ||||  | |||||||| |||||||||    
T  3387348 attttatttatgcatcattagaattgtttctcaatgaaccacttaaatttatacttcttgtatatgaagttaatcgagatatgtgattcacttaatcaac 3387447  T
Q  237 attagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaat 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3387448 attagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgtttctctcgatatcccaacatatgaaaatataat 3387517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 26564911 - 26565155
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   ||    
T  26564911 agatacacaaagatacttataagatacttcaaagatatctatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagataatgttgtaaacattcaatagcaat 26565010  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||   | |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||  | |||||| |||||    
T  26565011 gtatatgattcaattttagatatgtatcactataattgtttcttgataaaccacttaaaattatacttatcgtggatgaaggtaaggagagggaggtgat 26565110  T
Q  224 tcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26565111 tcagttaatcaatattagataaaatttatgttgagttcttttaat 26565155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31114152 - 31113888
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  31114152 gatacttataagatacttcgcatatgtgtatcctagaaaaaaatgaagggtaaaaaagtgagacaatatt--aaaaattaaggagagatgtatatgattc 31114055  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa---catagcgagggacgtgattcagttaatc 233  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |  | ||| || ||||||| |||||||    
T  31114054 aattttagatatgcattagtaaaattgtttcacggtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaagggtaacgagagagaggtgattcggttaatc 31113955  T
Q  234 aacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31113954 aacattagataaaatttgttttgacttcttttaattattcttctctcgatatccaaacatataaaaa 31113888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2628131 - 2627881
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaa-gatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatag 123  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  2628131 cagatacacaaggttacttataagatacttcacatatatgtatcctagaaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacagtgttgtaaacattcagtagag 2628032  T
Q  124 atgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatg------aacatagcgaggga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||      || | ||  || ||    
T  2628031 atgtatatgattcaattttagatatgcataattagaattgtttatcgatgaaccacttaaaattatactttctgtggatgaaggtaaagagagatagaga 2627932  T
Q  218 cgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2627931 ggtgattcaattaatcaacattaaataaaatttgtgttgagttattttaat 2627881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32076655 - 32076413
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtg 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||        
T  32076655 aaaagatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaatttcagtagagatgtgtatagttcaattttagatatgcatcattaaaattgtttctcgaca 32076556  T
Q  174 aaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgaggg--acgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgat 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||  || |||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32076555 aaccacttaaatttatacttcttgtcaatgaagttaacgagagataagtgattcacttaatcaacattagataaaatttgtgttgaattcttttaatgat 32076456  T
Q  272 gtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgattta 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  32076455 gtttctctcgatatcccaacatatgaaaatatgatatggttta 32076413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 268
Target Start/End: Original strand, 34510806 - 34511039
Alignment:
Q  34 aaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatga 133  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  34510806 aaggatacttataagatacttcagagatacgtatcgtagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagataatattgtaaacactcaatagagatgtatatga 34510905  T
Q  134 ttcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatc 233  Q
    || || ||||||||||||| | ||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||  || |||||| ||||||||    
T  34510906 tttaaatttagatatgcataactaacattgtttttcgatgaaccacttaaaattatacttcttatggatgaaagtaatgaaagaggtgatt-agttaatc 34511004  T
Q  234 aacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  34511005 aacatgagatagaatttgagttgagttattttaat 34511039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Original strand, 39935575 - 39935861
Alignment:
Q  28 atacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgt 127  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  39935575 atacacaaagatacttataagatactt-atagatatgtatgctagaaaa-gatgaaagataaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattagagat-- 39935670  T
Q  128 atatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattc 225  Q
      ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||    ||| || ||||| |    
T  39935671 --atggttcaattttagatatacatcattagagttgtttctcgataaaccacttaaatttatacttttagtggatgaaggtaatctgagagatgtgatcc 39935768  T
Q  226 agttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  39935769 aattaatcaacatcagataaaatttgtgttgtgttcttttaatgatgtttctctcaatattccaacatatgaaaatataatatggtttataag 39935861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 5836480 - 5836729
Alignment:
Q  40 acttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaat 139  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5836480 acttataagatacttcagagatacgtattctagaaaat-atgaagggtgcaaaggtgagacaatgttgtgaaaattcagtgaagatgtatatgattcaat 5836578  T
Q  140 tttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacatt 239  Q
    |||| ||||| |||  || |||||||||||  |||||||||||||||||||   ||  || || ||  || |||| || | |||||| ||||||| ||||    
T  5836579 tttatatatgtatcggtataattgtttctcgatgaaccacttaaaattata---ctaatgtataaaggtaacgagagaggagattcaattaatcaccatt 5836675  T
Q  240 agataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacat 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  5836676 agataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgcttatgttgatatcctaacat 5836729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 268
Target Start/End: Original strand, 8229316 - 8229489
Alignment:
Q  95 tgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  8229316 tgagacaatgttgtaaacattcaatagagatgtatatgatttagttttagatatgcatcactagaattgtttctcaatgaatcacttaaaatcatacttc 8229415  T
Q  195 ttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    | |||||  ||  ||  | | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8229416 tcgtggacaaaggtaatgcgagaggtgattcggttaatcaacattagataaaatttgtgttgagtttttttaat 8229489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 7057059 - 7057287
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  7057059 agatacacaaggatacttataagatgcttcacatatatgtatcctagaaaaa--tgaagggtaaaa-agtgagacaatgttgtagaaattcagtagagat 7057155  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattc 225  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| |||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||  || |||   |||||||||    
T  7057156 gtatatgattcacatttacatatggatcagtataattgtgtctcgatgaacaacttaaaattatatttctaatagatgaaggtaacgaaatacgtgattc 7057255  T
Q  226 agttaatcaacattagataaaatttgtcttga 257  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7057256 aattaatcaacattggataaaatttgtgttga 7057287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 184
Target Start/End: Original strand, 27925519 - 27925673
Alignment:
Q  29 tacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgta 128  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||| |     
T  27925519 tacacaaggacacttacaagatacttcacatatacgtatcctagaaaa-gatgaagtgtaaaaaaatgagacaatgttgtagaaattcagcagagatatc 27925617  T
Q  129 tatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaa 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27925618 tatgattcaattttagatattcatcagtagaattgtttctcgatgaaccacttaaa 27925673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31211007 - 31210725
Alignment:
Q  45 taagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttag 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||     
T  31211007 taagatacttcacagatatgtatcttagaaaat-atgaagggtaaaaaaatgagacagtgttgtaaaaattcagtagaaatgtatatgatttaattttaa 31210909  T
Q  145 atatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacatt----- 239  Q
    | |||||||| |||||||   | ||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  || | || || |||||||| ||||||||||||         
T  31210908 acatgcatcagtagaatt---tatcgatgaaccacctaaaattatatttcttatggatgaaggtaacaagagaggtgattcaattaatcaacattatata 31210812  T
Q  240 -------agataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttg--atatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataa 317  Q
           | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  31210811 aaaacccatataaaatttgtgttgtgttcttttaatgatgtttctctcggtatatcccaacatatgaaagtataatatgattcataa 31210725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13407424 - 13407257
Alignment:
Q  28 atacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgt 127  Q
    ||||| ||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||| || | |  |    
T  13407424 atacacaagaatatttataagatacgtcacaaatacgtatcctagaaaa-gatgaaggagaaaaaattgagacaatgttgtagaaattcagtagaaactt 13407326  T
Q  128 atatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttctt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  13407325 atatgattcaattttagatatacatcagtataattgtttctcgatgaaccagttaaaattatacttctt 13407257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16756245 - 16755974
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||  ||| |||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||  ||| ||||    |    
T  16756245 cacaaatacataatgatacttataagatattttacgtatatgtatcctagaaaat-atgaaggacaaaaaagtgagacaatgttgcgaaagttcaacgga 16756147  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagc--gagggacgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||  || |  ||| || |     
T  16756146 gatgtatatgattcaattttagatatgcattagtaaaattgtttatcgattgaccacttaaaattataattcttgtggatgaaggtaacaagagagaaga 16756047  T
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    |||||| |||||||||||||||  | |||||| || |||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16756046 gattcaattaatcaacattagactagatttgtgttaagttc--ttaacgatgtttatcttgatatcccaatatat 16755974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34764716 - 34764588
Alignment:
Q  140 tttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacatt 239  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||  ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  34764716 tttagatatgcatcactagaactgtttttcgatgaaccacttaaaattacacgtcttgtggataaaggtaatgagagaggtgattcaattaatcaacatt 34764617  T
Q  240 agataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34764616 aaataaaatttgtgttgagttcttttaat 34764588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19099822 - 19099744
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19099822 cttcaagtattttacatacatataagttttactataaatttttgttaacgtatcataaccgtatcgtatcctaaatttt 19099744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 165
Target Start/End: Original strand, 42990636 - 42990778
Alignment:
Q  24 acagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaag-tgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||||  ||||||  |||||| |||||||| |  |    
T  42990636 acagatacacacagatacttataagatactttacagagacgtatcctggacaaaaatgaagtgtaaaaaaaatgagactgtgttgtgaaaattcaatgga 42990735  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtt 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||    
T  42990736 gatgtatatgattcaatttaagatatgaatcactataattgtt 42990778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 422 - 498
Target Start/End: Original strand, 26565171 - 26565248
Alignment:
Q  422 tcaagtattttacatacagataaattttattat-aaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26565171 tcaagtattttacatacatttaagttttagtattaaatttttgttaacgtatcttaactgtatcgtatcctaaatttt 26565248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 29230852 - 29230795
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaa 477  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29230852 cttcaagtattttacatacatataagttttattataaatttttgttaacgtatcctaa 29230795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2627863 - 2627788
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2627863 aagtattttacatacatataagttttagtataaaatttttgttaacgtatcttaaccgtatcgtatcctaaatttt 2627788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 424 - 497
Target Start/End: Original strand, 7057361 - 7057435
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattat-aaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7057361 aagtattttacatacatataaattttagtataaaatttttgctaacgtatcttaaccgtatcgtatcctaaattt 7057435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8802779 - 8802687
Alignment:
Q  228 ttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacat----ataaaaatgtaatatgatttata 316  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  8802779 ttaatcaatattaaacaaaatttgtgttgagttcttttgatgatgcttctattgatatcctaacatatgaataaaaatataatatgatttata 8802687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Original strand, 8229503 - 8229582
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  8229503 cttcaagtattttacatacatataagttttaatataaattttttattaacgtatcttagtcgtatcgtatcctaaatttt 8229582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 41368597 - 41368806
Alignment:
Q  60 atacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaataga 159  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    | |||||  | |||||||||||||||||||||  |  |    
T  41368597 atacatatcctagaaaa-gatgaaaggtaaaaaagtgagacaatcttgtgaaaattcagcgaa-atgtacgttattcaattttagatatgcatcggtgta 41368694  T
Q  160 attgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggac-----gtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtct 254  Q
    | |||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||  ||  ||| ||      | |||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  41368695 aatgtttcttgatgaaccactaaaaattatactttttgtgagtgaaagtaatgagagattaaaagagattcagttaatcaacattaaataaaatttaagt 41368794  T
Q  255 tgagttctttta 266  Q
    ||||||||||||    
T  41368795 tgagttctttta 41368806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 12118293 - 12118395
Alignment:
Q  49 atacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||   |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  12118293 atactttacagatacgtatcctggaaaaa-atgaagggtaaaaaagt--gaatgtgttgtgaaaattcaatgaaaatgtatatgattcaatttaagatat 12118389  T
Q  149 gcatca 154  Q
    | ||||    
T  12118390 gaatca 12118395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 268
Target Start/End: Original strand, 29674927 - 29675060
Alignment:
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatca 234  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  || || || |||||||| |||| ||    
T  29674927 aattttagatatgtattagtagaattattttacgatgaaccacttaaaattatacttcttatagatgaagataatgcaagagaggtgattcaattaacca 29675026  T
Q  235 acattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |  ||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  29675027 atcttaaataaaatttgtgttgatatcttttaat 29675060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 498
Target Start/End: Original strand, 7732556 - 7732633
Alignment:
Q  421 ttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| || || |||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  7732556 ttcaagtattttacatgcatataaattttagtataaatattttttaacatatattaaccgtatcgtatcctgaatttt 7732633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28470303 - 28470234
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaatttta 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| || | |||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  28470303 aaaagttgaagggtaaaaaagtgagataattttatgaaaattcactagagatgtatataattcaatttta 28470234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 39730639 - 39730581
Alignment:
Q  441 ataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39730639 ataagttttattataaaatttttgttaacatatcataattgtatcgtatcctaaatttt 39730581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 257
Target Start/End: Original strand, 27925692 - 27925729
Alignment:
Q  220 tgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttga 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27925692 tgattcaattaatcaacattagataaaatttgtgttga 27925729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 28470383 - 28470331
Alignment:
Q  24 acagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaa 76  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  28470383 acagatacacaaggatacttataagatacttcacatatatgtgtcttagaaaa 28470331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 45 - 318
Target Start/End: Original strand, 45773984 - 45774254
Alignment:
Q  45 taagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45773984 taagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagaataaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttag 45774083  T
Q  145 atatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagata 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45774084 atatacatcaatagaattgtttctcgatgaaccacttaaaattata---cttatggatgaacgtagcgagagaggtgattcagttaaccaacatttgata 45774180  T
Q  245 aaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45774181 aaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcctgatatcccaacgtataaaaatgtaatatgatttataag 45774254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19721876 - 19721581
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19721876 cacagatacacaatgatatttctaagatacttcacatacacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacgatgttgtaaaaattcattata 19721777  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  19721776 gatatatatgacttaattttggatatgcatcaatagaattgtttctcaattaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaacgtagcgagagatgtga 19721677  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  19721676 ttcaattaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgtttctctcaatatcctaacatatgaaaatttaatatggtttataag 19721581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Original strand, 2295328 - 2295622
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2295328 cacagatacacaatgatacttctaagatacttcacagacacgtatcctaaaaaaagatgaagaataaaaat-tgagacaatgttgtaaaaattcattata 2295426  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |    
T  2295427 gatgtataggactcaatttaagatattcatcaatagaattgtttctcgatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaacgtagcgagagatgtaa 2295526  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2295527 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaacgatgtttctctcaatatcccaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 2295622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 53018734 - 53018448
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||    
T  53018734 cacatatacacaaggatacatctaagatacttcacatatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaaatgagacaatcttttaaaaattcattcta 53018635  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  53018634 gctgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcaatgaatcagttaaaattatacttattgtggatgaacatagcgagataggtga 53018535  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatg 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  53018534 ttcagttaatcaacattaaataaaatttatgttgagttcttttaatgatgtttctctcgatgtcctgacatatgaaaatgtaatatg 53018448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15476915 - 15476620
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15476915 cacagatacacaaggatacttctaagatacttcaaagatacgtatcttagaaaaagatgaagagtaaaaaggtgagacaatgttgtaagaattcattata 15476816  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgttt-ctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtg 221  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  15476815 gatgtgtaagattcaattttagatatgcattaattgaattgtttactga-tgaaccacttaaaattataattcttatggatgaacgtagcgagagaagtg 15476717  T
Q  222 attcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15476716 atttaattaatcaacattagataaaatttgcgttgagttcttttaatgatgtttttctcgataacccaacttatgaaaatgtaatatggtttataag 15476620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35103669 - 35103389
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35103669 gatacttctaagatacttcatagatatgtatcctagaaaaacatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataaatgtatatgattc 35103570  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaac 236  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| |||||  ||||    
T  35103569 aattttagatatgcatcattataattgattccggatgaaacacttaaaattatacttcttgtggaagaacgtagcgagagaggtgatttagttacacaac 35103470  T
Q  237 attagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataa 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  35103469 attagataaaatttgtgttgagttcttttaataatgtttctctcgatatcccaacatatgaaaatataatatgttttataa 35103389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Original strand, 53586368 - 53586583
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  53586368 gatacttataagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagggtaaaatagtgagacaatgttgtaaacattcaatagagatgtatatgattc 53586467  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagc--gagggacgtgattcagttaatca 234  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || |  ||| || ||||||||||||||||    
T  53586468 aatttcagatatgcatcactataattgtttctcgatgaactacttaaaattatacttctcgtggatgaaggtaacaagagagaggtgattcagttaatca 53586567  T
Q  235 acattagataaaattt 250  Q
    | ||||||||||||||    
T  53586568 atattagataaaattt 53586583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Original strand, 27675397 - 27675692
Alignment:
Q  28 atacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaaga-tgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatg 126  Q
    ||||| ||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||  | |||||    
T  27675397 atacacaaggacatttataagacacttcacatatacgtatcctagaaaaaaaatgaagggtaaaatagtgagacaatgttgtgaagattcagcagagatg 27675496  T
Q  127 tatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctc---agtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagc--gagggacgtg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |   || || |||    
T  27675497 tatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcaatattgaaccacttaaaa-tatactttttgtggatgaaggtaacaaaagagaggtg 27675595  T
Q  222 attcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27675596 atttagttaattaatatcagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgcttatctcgatatcccaacatatgaaaatataatatggtttataag 27675692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 318
Target Start/End: Original strand, 40217526 - 40217811
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  40217526 gatacttatatgatacttcacatatacatatcctagaaaaagatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttataaaaattcagtaaagatgtatatgattc 40217625  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaa----ttatacttcttgtggatgaacatagcgaggg--acgtgattcagtta 230  Q
    |||||||  ||||| ||  |||||||||||||  |  || |||||||||    || || || || ||||||||  || |||| |  | ||||||||||||    
T  40217626 aattttatgtatgcgtcggtagaattgtttct-tgataaacacttaaaaatatttttattttttttggatgaaggtaacgagagaaatgtgattcagtta 40217724  T
Q  231 atcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  40217725 aacaacattagataaaatttgtgttgagtt-ttataatgatgtttctcgcgatatcccaacatatgaaaatataatatggtttataag 40217811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 275
Target Start/End: Original strand, 44987234 - 44987471
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaa-aagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  44987234 atacttataagatgtttcacaaatacgtatcctagaaaa-gatgaaaggtaaaaaaagtgagataatgttgtaaaaattcactcgagatgtacatgattc 44987332  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcg--agggacgtgattcagttaatca 234  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||  || || | |||||| |||||||    
T  44987333 aattttagatatgcatcggtagaattgtttctcaatgaactacttaaaattatacttcttgtggatgaaggtaacgaaagagaagagattcaattaatca 44987432  T
Q  235 acattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgttt 275  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44987433 acattatacaaaatttgtc--gagttcttttaatgatgttt 44987471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2242899 - 2242769
Alignment:
Q  177 cacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagc--gagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2242899 cacttaaaattatacttcttgtagatgaacatagcaagagagagatgattcagttaatcaatattagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgtt 2242800  T
Q  275 tctcttgatatcccaacatataaaaatgtaa 305  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2242799 tctctcgatatcccaacatatgaaaatgtaa 2242769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 268
Target Start/End: Original strand, 6008208 - 6008403
Alignment:
Q  73 aaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagt 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| ||| |  | ||| | ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||  |    
T  6008208 aaaaagatgaggagtaaaaaagtgaggcaatttgttaaacatttaggagagagggatatgattcaattatagatatgtataactagaattgtttctcgat 6008307  T
Q  173 gaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6008308 gaaccacttaaaattatacttcttgtggataaaagtaacgagagaggtgattcagttaataaacattaaataaaatttgtgttgagttcttttaat 6008403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10038019 - 10037865
Alignment:
Q  36 ggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgatt 135  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||    
T  10038019 ggataattataagatatttcacatatatgtatcctagaaaa-gatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgcgaaaattcaatggagatgtatatgatt 10037921  T
Q  136 caattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatac 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  10037920 caattttagatatgcatcagtagatttgtttctcgatgaaccacttaaaataatac 10037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 285
Target Start/End: Original strand, 4775760 - 4776007
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | |  | ||||||||||| ||    
T  4775760 atacttataagatgcttcacaaatatatatcctagaaaa-gatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtgataatttagtggaaatgtatatgat-ca 4775857  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgag--ggacgtgattcagttaatcaa 235  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||   || | |||| ||||||||      
T  4775858 attttagatatgcatcaaagtaattgtttctcgataatccacttaaaattatacttattgtggatgaagttagcgagaaagaggagatttagttaatcgg 4775957  T
Q  236 cattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatat 285  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||||    
T  4775958 cattagacaaaatttgtgttgagttctttcaatgatgcttatgttgatat 4776007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 24917493 - 24917714
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||           || ||||    
T  24917493 agatacacaaggatacttataagatatttcacagatacgtatcctag-aaaagatgaaggggaaaaaagtgagacgatgttg-----------tagagat 24917580  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgat 223  Q
    ||  | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||  | ||| ||  ||||    
T  24917581 gttaaagattcaattttagatatacattagtagaattgtttctcgatgaaccacttaaaattattcttcttatggatgaaggtaatgagagagagatgat 24917680  T
Q  224 tcagttaatcaacattagataaaatttgtcttga 257  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  24917681 tcaattaatcaacgttggataaaatttgtgttga 24917714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7208583 - 7208396
Alignment:
Q  132 gattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagc--gagggacgtgattcagtt 229  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||   | |  ||| || || ||| ||||    
T  7208583 gattcaatttcagacgtgcatcaatagaattgtttttcgataaaccacttgaaattatacttcttgtggatgaagtcaacaagagagaagtaatttagtt 7208484  T
Q  230 aatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7208483 aatcaactttagataaaaattttgttgagtccttttaatgatgtttctctcgatatccctacgtat-aaaatataatatggtttataag 7208396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47923116 - 47922951
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaaga-tgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattat 121  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||| | |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||  ||     
T  47923116 cacagatacacaatgatacttctaagatacttcacatttacatatcttaaaaaaaaaatgaagagtaacaaagtgacataatgttgtaaaaactctgtag 47923017  T
Q  122 agatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaatt 187  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  47923016 agatccatatgattcaattttagatacgcatcaataaaattgtttcttgatgaaccagttaaaatt 47922951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Original strand, 1052368 - 1052505
Alignment:
Q  134 ttcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgt-gattcagtta 230  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  | ||| || || |||  |||||    
T  1052368 ttcaattttacatatgcatcactagaattgtttctcgattaaccacttaaaattatatttcttgtggatgaaggtaacgagagagaggtggatctagtta 1052467  T
Q  231 atcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1052468 atcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaat 1052505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 420 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 15476518 - 15476442
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatt 496  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15476518 cttcaagtattttacatacatataaattttattataaatttttgttaacgtatcctaaccgtattgtatcctaaatt 15476442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2243004 - 2242914
Alignment:
Q  48 gatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaa 138  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2243004 gatacttcacatatatatatcctaaaaaatgatgaacagtaaaaaagtgagacaatgttataaaaatttattatagatgtatatgattcaa 2242914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19721481 - 19721403
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19721481 cttcaagtattttacatacatataagttttattataaatttttgttaacgtatcctaaccatatcgtatcctaaatttt 19721403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 53014936 - 53014846
Alignment:
Q  45 taagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaat 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53014936 taagatacttcacaaatacgtatcctaaaaaaa----atgattaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgactcaat 53014846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35823742 - 35823493
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||   |||  | |||||||| ||||    
T  35823742 gatacttataagatacttcaaagatgcctatcgtagaaaa-gatgaagggtaagaaagtgagacaatgttgtgaaaaaatattggaaatgtatataattc 35823644  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatca 234  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||||| ||          | ||||||||||||  ||  | ||| || | |||||| |||||||    
T  35823643 aattttagatatgaattagtagaattgtttctcgataaaccattt----------tacttgtggatgaagttaacgagagagaagagattcaattaatca 35823554  T
Q  235 acattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||    
T  35823553 acattatacaaaatttgtgttgagttcttttaatgacacttctattgatatcctaacatat 35823493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 24913807 - 24913890
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgta 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  24913807 cagatacacaaggatacttataagatatttcacagatacgtatcctag-aaaagatgaaggggaaaaaagtgagacgatgttgta 24913890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Original strand, 23241801 - 23241962
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||||||  |  |    
T  23241801 cacaaatacataaggatacttatatgatactttacagttacgtattctag-aaaagatg-agtgtaaaaaagtaagataatgttataaaaattcgatgga 23241898  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaat 186  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||   |   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23241899 gatgcatatgtttcgattttagatataattttgtagaattgtttttcagtgaaccacttaaaat 23241962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Original strand, 45661792 - 45661911
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| || ||||||| || ||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       
T  45661792 cacatatacacaatgatacttttacgatacttcaaagatatctatcctataaaa-gatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtgaaaattcagtggg 45661890  T
Q  123 gatgtatatgattcaatttta 143  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  45661891 aacgtatatgattcaatttta 45661911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Original strand, 2295721 - 2295797
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2295721 cttcaagtattttatatacatataagttt-attataattttttgttaacgtatcctaaccgtatcgtatcctaaattt 2295797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2242656 - 2242579
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  2242656 cttcaagtattttacatacatataagttttattataaatttttcttaatgtatcataac-gtattgtatcctaaatttt 2242579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28102126 - 28102017
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtg 173  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||| || | || |||||||||||  ||    
T  28102126 aaaagatgaagggtaaaaaa-tgagacgatgttatgaaaattcagttgagatgtatattattcaattttatatatgaataagtaaaattgtttctcgatg 28102028  T
Q  174 aaccacttaaa 184  Q
    |||||||||||    
T  28102027 aaccacttaaa 28102017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25059499 - 25059434
Alignment:
Q  230 aatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||    
T  25059499 aatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttgatgatgtttatgttgatatactaacatat 25059434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 497
Target Start/End: Original strand, 45774356 - 45774429
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45774356 aagtattttacatatagataagtattattataagtttttgttaatgtatcctaaccgtaccgtatcctaaattt 45774429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 535
Target Start/End: Original strand, 6008417 - 6008531
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattttnnnnnnnnntcacgtatccg 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||         |||||||||||    
T  6008417 cttcaagtattttacatacatataagttttaatataaattttttgtttaagtatcttagccgtatcgtatcctaaatttt--gaaatattcacgtatccg 6008514  T
Q  519 catatcagtatcgtatc 535  Q
    |||||| ||||||||||    
T  6008515 catatctgtatcgtatc 6008531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 7208656 - 7208592
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  7208656 atacttataagatacttcacagatacatatcctagaaaaagatgaaagataaacaagtgagacaa 7208592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43770722 - 43770594
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaaga-tgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgatt 135  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| | | |||||| | | ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  43770722 gatacttataagatatttcacagagacgtaacttggaaaaaaaataaagggtaaaaatgtgagactgtgttgtgaaaattcaatgaagatgtatatgatt 43770623  T
Q  136 caattttagatatgcatcaatagaattgt 164  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  43770622 caatttaagatatgaatcactacaattgt 43770594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Original strand, 40217911 - 40217989
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  40217911 cttcaagtattttatatacatataagttttagtataaatattttgttaacgtatcttagccgtatcgtatcctaaattt 40217989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 47922957 - 47922891
Alignment:
Q  243 taaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatg 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  47922957 taaaatttgtgttgagttcttttaatgacgcttctctcgatatcccaacatatgataatataatatg 47922891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22199029 - 22198899
Alignment:
Q  36 ggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgatt 135  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||||  | ||| |||||||||||||    ||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  22199029 ggatacttataagatactttacagagacgtatcgaaaaaaaaactaaagggtaaaaaagtgaggttgtgttgtaaaaattaaatgaagatgtatatgatt 22198930  T
Q  136 caattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    |||||| ||| | | |||| || ||||||||    
T  22198929 caatttaagacacgaatcactataattgttt 22198899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 38947653 - 38947583
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||||    
T  38947653 aagtattttacatgcatataaattttagtataaatattttgttaacatatcttaaccgtatcgtatcctaa 38947583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34072793 - 34072724
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatccta 492  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  34072793 aagtattttacatgcatataaattttagtataaatattttgttaacgtatcttagccgtatcgtatccta 34072724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Original strand, 53586600 - 53586678
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| || | ||||||||| |||||||||    
T  53586600 cttcaagtattttacataaatataagttttagtataaattttttgttaacgtatcttagccgtatcgtat-ctaaatttt 53586678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 143
Target Start/End: Original strand, 21619576 - 21619630
Alignment:
Q  89 aaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaatttta 143  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  21619576 aaaaagtgagacaactttgtgaaaattcaatgaagatgtatatgattcaatttta 21619630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 53018344 - 53018302
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaattttt 462  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  53018344 cttcaagtattttacatacatataagttttattataatttttt 53018302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4110307 - 4110266
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  4110307 aaaagatgaagagtaaaaaagtggtacaatgttgtgaaaatt 4110266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 7208297 - 7208217
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaattttt--gttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||  |||| |||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7208297 cttcaaatattttacatacatataagttttaggataattttttttgttaatgtatcctaaccgtatcgtatcctaattttt 7208217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2032526 - 2032229
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2032526 cacatatacacaaggatacttctaagatacttcacagacatgtatcctagaaaaaggtgaagagtaaaaaagtgagacaatattgtaaaaattcattatt 2032427  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcag-tgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtg 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||     
T  2032426 gatgtatatgactcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcggatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaacgtagcgagagatgtt 2032327  T
Q  222 attcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttc-ttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2032326 attcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttctttttaatgatgtttctctcaatatcctaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 2032229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 688245 - 687957
Alignment:
Q  27 gatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatg 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  688245 gatacacaaggatacttctaagatacttcacgtatacgtatcaaagaaaaagatgaagagtaaaaaaatgagacaatgctgtaaaaattcattatagatg 688146  T
Q  127 tatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattca 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  | ||||||||    
T  688145 tatattattcaattttagatatgcatcaatataattgtttctcgatgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaatgtagcaagaaaggtgattca 688046  T
Q  227 gttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  688045 gttaat---cattagataaaatttgtgtcgagttcttttaatgatgtttctctcgatatcctaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 687957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32340444 - 32340151
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  32340444 cacagatacacaag-ataattctaagatacttcacatatatgtatcctagaaaaagatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaa-ttcagtaaa 32340347  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  || | || || || |    
T  32340346 gatgtatataattcaatttcatatatgcatcaatagaattgtttttcgatgaaccatttaaaattatacttcttgggaatgaaggtaacaagagaggtaa 32340247  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  32340246 ttcagctaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttgatgatgattctctcgatatcccaacatatgaaaatataatacgatttataag 32340151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2988295 - 2988051
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||| || |||    
T  2988295 cagatacacaatgatacttataagatagttcacaaatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaa-gtcagataatgttataaacattcagtagaga 2988197  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||  | ||| ||  |||    
T  2988196 tgtatatgattcaattttagatatgcatcactaaaattgtttctcgatgaaccacttaaaattatattttttgtggaagaaggtaacgagagagagctga 2988097  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  2988096 ttcagttaatcaatattagataatatatgtgttgagttcttttaat 2988051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Original strand, 10229422 - 10229647
Alignment:
Q  47 agatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagat 146  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||    
T  10229422 agatatttcacatatacgtatccttcaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgcaaacattcgatagagatgtatatgattcaattatagat 10229521  T
Q  147 atgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatcaacattagata 244  Q
    |||||| | ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  10229522 atgcataactagaattgttttttgatgaaccacttaaaattatacttcttgtgaacaaatgtaacgagagtgaggtgatttagttaatcaacattagata 10229621  T
Q  245 aaatttgtcttgagttcttttaatga 270  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||    
T  10229622 aaatttaggttgagttattttaatga 10229647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 295
Target Start/End: Original strand, 8485910 - 8486168
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| | |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8485910 gatacttataagacacttcacatatacgtatcctagaaaaa-ataaagggtaaaaaattgagatagtgttgtgaaa-ttcagtgtagatgtatatgattc 8486007  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatca 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||  | ||| || | ||||||  ||||||    
T  8486008 aattttagatatgcatcagtagaattgtttcttgatgaaccgcttaaaattatacttcttgcggatggaggtaacgagagagatgagattcaactaatca 8486107  T
Q  235 acattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    |||||||| ||||||||  | || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8486108 acattagacaaaatttgcgtagaattattttaatgatgcttctcttgatatctcaacatat 8486168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12312179 - 12311922
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtga-gacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgatt 135  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| | | |  | |||||||  |||    
T  12312179 gatacttataagatacttcaaagatatgtatcctagaaaaa-atgaagggtaagaaagtaaagacaatgttgtgaaaaataagtggaaatgtatacaatt 12312081  T
Q  136 caattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    |||||||||||  ||  | ||| || |  ||||| ||||||    
T  12312080 caattttagatatgcatcaatagaattgtttctcgatcaaccactttaaattata---gttgtggatgaagttaacgagagagaggatattcaattaatc 12311984  T
Q  234 aacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    ||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12311983 aacattaaacaaaacttgtgttgagttcttttgatgatgcttctattgatatcccaacatat 12311922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 257
Target Start/End: Original strand, 30928331 - 30928500
Alignment:
Q  88 aaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaatt 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30928331 aaaaaagcgagacaatgttgtagaaattaagtagagatgtatatgattcaattttatatatgcaccagtataattgtttcttgatgaaccacttaaaatt 30928430  T
Q  188 atacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttga 257  Q
    ||||||||| || |||||  || |||| ||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  30928431 atacttcttatgaatgaaggtaacgagagagatgattcaattaatcaacattgaataaaatttgtgttga 30928500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12283790 - 12283617
Alignment:
Q  124 atgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggac--gtg 221  Q
    |||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||| ||   | |    
T  12283790 atgtatacaattcagtattagatatgcatcagtagaattgtttctggatgaaccactttaaattatactttttgtggatgaagttaacgagagagaggag 12283691  T
Q  222 attcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12283690 attcaattaatcaacattaatcaaaatttgtgttgaattcttttaatgatgcttctattgatatcccaacatat 12283617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 205
Target Start/End: Original strand, 10567321 - 10567414
Alignment:
Q  105 ttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10567321 ttgtaaaaattcattatagatgtatatg-------tttagatatgcatcaatagaattgtttctcgatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatga 10567413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22297495 - 22297370
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  22297495 cacatatacacaaggatacttgtaacgtacttcacagaaacgtatcataaaaaaagatgaaggg-aaaaaagtgagacaacgttgtaaaaattcaataga 22297397  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatg 149  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||    
T  22297396 gatgtatatgacttaattttagatatg 22297370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 7434853 - 7435019
Alignment:
Q  104 gttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatg 203  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||      
T  7434853 gttgtaaacattcaatagagatctatatgattcaatcttagatatgcgttacgagaattgtttctcgatggaccacttaaaattatactttttatggaca 7434952  T
Q  204 aacata--gcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||  ||  | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7434953 aaggtaacgagagagaggtgattcagttaatcaacactagataacatttgtgttgagttcttttaat 7435019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22297343 - 22297248
Alignment:
Q  219 gtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgattta 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  22297343 gtgattcagttaatcaacattagataaaatttatgttgagttcttttaacaatgcttatcttgatatcccaacatatgaaaatataatatggttta 22297248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2032125 - 2032048
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2032125 cttcaagtattttacatacatataagttttattataaatttttgttaatgtatcctaattgtatcgtatcctaaattt 2032048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 267
Target Start/End: Original strand, 22053889 - 22054080
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtg 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||    
T  22053889 aaaagatgaagggtaaaaaagtgagatagtgttgtaaaaattcagtagagatgtgtacggttcaattttagatacgcatcattggaattgtttct-aatg 22053987  T
Q  174 aaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaa 267  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||||  ||  ||| ||  | ||||| ||||||||| |||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  22053988 aaccac-taaatttatacttcctctggatgaaggtaatgagagagatcattcaattaatcaactttagatgaaatgcatgttgagttcttttaa 22054080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 687857 - 687783
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaa 494  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  687857 cttcaattattttacatacatataaattttattataaatttttggtatcgtatcctaaccgtatcatatcctaaa 687783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2988037 - 2987958
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||  |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  2988037 cttcaagtattttacatacatataaggtttagtataatgtttttgttaacgtatcttagccgtatcgtatcctaaatttt 2987958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26546063 - 26546013
Alignment:
Q  244 aaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26546063 aaaatttgtcttgagttctttt-atgatgtttctgttgatatcctaacatat 26546013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Original strand, 1929240 - 1929310
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1929240 aagtattttacatgcatataaattttagtataaataatttgttaacgtatcttaactatatcgtatcctaa 1929310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6724636 - 6724502
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaa-----aaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaatt-cattatagatgtatat 131  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||     ||| |||||  ||||||||||||| |  |||||| |||||| || |  ||||||||||    
T  6724636 atacttataagatacttcacatagacgtatcctggaaggaaaaaaaatgaatggtaaaaaagtgaggctgtgttgtgaaaatttcaatggagatgtatat 6724537  T
Q  132 gattcaattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  6724536 gattcaatttaagatatgaatcagtataattgttt 6724502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 498
Target Start/End: Original strand, 10229660 - 10229738
Alignment:
Q  421 ttcaagtattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  10229660 ttcaagtattttacatacatatatgttttagtataaattttttattaacgtatcttagttgtatcgtatcctaaatttt 10229738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Original strand, 7435033 - 7435113
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaa--tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  7435033 cttcaagtattttacatacatagaagttttagtataaaattttttgttaacgtatcttactcgtatcgtatcctaaatttt 7435113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17533579 - 17533522
Alignment:
Q  36 ggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaa 93  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  17533579 ggatacttataagatacttcacagagacgtatcttagaaaaaaatgaaatgtaaaaaa 17533522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26546234 - 26546168
Alignment:
Q  73 aaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaat 139  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | || ||||||||||| ||||||    
T  26546234 aaaaaaatgaagggtaaaaaagtgagataatgttgtgaagatttaataaagatgtatatggttcaat 26546168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 48 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42794918 - 42794648
Alignment:
Q  48 gatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagata 147  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42794918 gatacttcacaaacacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatgtgactcaattttagata 42794819  T
Q  148 tgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42794818 tgcatcaatagaattgtttctcgatgaaacacttaaaattatacttattgtggatgaacgtagcgagaaatatgatttagttaatcaacattagataaaa 42794719  T
Q  248 tttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42794718 tttgtgttgagttcttttaatgatgtttctctcaatatcccaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 42794648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 317
Target Start/End: Original strand, 41323867 - 41324135
Alignment:
Q  48 gatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagata 147  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41323867 gatacttcacatatatgtatcctagaaaaagatgaacggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcagtagagatgtatatgattcaattttagata 41323966  T
Q  148 tgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaa 247  Q
    ||||||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  41323967 tgcatcagtaaaattgtttctcgatgaaccgcttaaaattatacttcttgtggatgaaggtaacgagagaggtgattcagtttat-aacattagatacaa 41324065  T
Q  248 tttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataa 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  41324066 tttgtgttgagttcttttaatgatacttctctcgatatcccaacatatgaaaatataatatggtttataa 41324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 7017788 - 7018028
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| || |||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7017788 cacaaatacacaaagatatttataagatacttcacatatatgtttcctagaaaaagatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcagtaga 7017887  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||| || ||    
T  7017888 gatgtatatgattcaattttagatatgcatgggtagaattgtttctcgataaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaaggtaacgagagagaggt 7017987  T
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttc 261  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7017988 aattcggttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttc 7018028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 318
Target Start/End: Original strand, 30485559 - 30485841
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||| | || |||    
T  30485559 gatacttataagatatttcacaaatatgtattctagaaaa-gatgaaaggtaaaaaagtgagataatgctctaaaaattcagtagagatgtgtgtggttc 30485657  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatca 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  | |||  | |||||||| |||||||    
T  30485658 aattttagatatgcatcattagaattgtttctcggtgaaccacttaaatttatacttcttgtggatgaaggtaatgagagaaaggtgattcaattaatca 30485757  T
Q  235 acattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  30485758 acattagataaagtttgtgttgagttcttttaatgatgtttctttctatatcccaacatatgaaaatataatatagtttataag 30485841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30382903 - 30382682
Alignment:
Q  99 acaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30382903 acaatgttgtaaaaattcattagagatgtgtattgttcacttttagatatacatcattagaattgtttctcgatgaaccacttaaatttatacttcttgt 30382804  T
Q  199 ggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatata 296  Q
    |||||||  ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  30382803 ggatgaatgtaatgagagagatgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtattgaattcttttaatgatgtttctctcgatatcccaacatatg 30382704  T
Q  297 aaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  30382703 aaaatataatatggtttataag 30382682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 304
Target Start/End: Original strand, 17328663 - 17328947
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||    
T  17328663 agatacacaatgatacttataagatacttcacatatatgtatcctaggaaaagatgaagcgtagaaaagtgagacaaggttgtaaaaattcaggagagat 17328762  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa------catagcgagggacg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||       | || ||| ||      
T  17328763 gtatatgattcaattttagatatgcattagtcgaattgtttcacggggaaccacttaaagttatacttcttgtggatgaaggtaacgaaagagagagaga 17328862  T
Q  220 tgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgta 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  17328863 tgattcagttaatcaacattaaataaaatttgtgttgagttcttttaattattcttctctcgatatccaaagatatgaaaatgta 17328947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38221781 - 38221559
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  38221781 cagatacacaaggatatttacaagatacttcacatatatgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaagagtgagacaatgttgtaaacattcaatagaga 38221682  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgatt 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||  || |||| || ||||||    
T  38221681 tgtatatgattcaattttggatatgcatcactagaattgtttcttgatgaatcacttaaaattatacttcttgtggacaaaggtaacgagagaggtgatt 38221582  T
Q  225 cagttaatcaacattagataaaa 247  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  38221581 caattgatcaacattagataaaa 38221559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37273078 - 37272784
Alignment:
Q  24 acagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatag 123  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||| |||  ||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  37273078 acagatacacaatgatacttgtaagatatttcacatatatgtaatctaaacaaagatgaaaggtaaaaaagtaagacaatgttgtaaaaattcagtagag 37272979  T
Q  124 atgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtg 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  | |||||| |||    
T  37272978 atgtatatgattcaattttagacatgcatcaataaaattgtttttcgatgaaccacttaaaattatacttctcgtggatgaaggtaacgagagggaggtg 37272879  T
Q  222 attcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||| |||| |||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  37272878 atttagtt-atcaatcttagacaaaatttatgttgagttcttttaatgatatttttctcgatatccctacatat-gaaatataataagatttataag 37272784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11562877 - 11562673
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  11562877 atacttataagatacttcacaaatacgtattcgagaaaa-gatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtagaaattcagtagagatatatatgattca 11562779  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaaca 237  Q
    ||||| |||||| ||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  11562778 attttggatatgaatca--acaattgtttctcgataaaccacttaaaattatacttcttgtagatgaaaataacgagagaggtgattcaattaatcaaca 11562681  T
Q  238 ttagataa 245  Q
    || |||||    
T  11562680 ttggataa 11562673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 257
Target Start/End: Original strand, 36467161 - 36467396
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  36467161 cacagatacacaaagatacttataagatacttcacagatatgtaaactagagat-gatgacgggtaagaaagtgagacaatgttgtaaaaattcagttga 36467259  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgt 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||  | ||| || ||    
T  36467260 aatgtatatgattcaattttagatatgcataagtaaaattgtttctcgatgaaccacttaaaattatgattcttgtggatgaaggtaatgagagagatgt 36467359  T
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttga 257  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36467360 gattcaattaatcaacaatagataaaatttgtgttga 36467396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 189
Target Start/End: Original strand, 35298388 - 35298555
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaa-gatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattat 121  Q
    |||||||||| || |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  35298388 cacagatacacaaagatatttataagatacttcacatatacgtattctagaaaaaagataaaaggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcagtag 35298487  T
Q  122 agatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattat 189  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  35298488 agatgtatataattcaattttagaaatgcatcaatagaattatttctcgatgaaccacttaaaattat 35298555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Original strand, 40498676 - 40498821
Alignment:
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacg--tga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||    |||    
T  40498676 tgtatatgattcaattttagatatgcatcactagaattgtttctcgatgaaccacttaaaattatacttcttttggatgaagataacgagagagagctga 40498775  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40498776 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaat 40498821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 40363767 - 40364009
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  40363767 cagatacacaatgatacttttaaaatacttcacagatacttatcctagaaaaagaaaaagagcaaaaaagtgagacaatgttgtaaacattcagtaaaga 40363866  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgatt 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||   |||| ||  ||||||| ||  ||||  | |||||||||||||| ||||| | |||  || ||||  | ||||||    
T  40363867 tgtgtatgattcaattttagatacagatcactatgattgtttgtcgatgaataatttaaaattatactttttgtgaaggaatgtaacgagataggtgatt 40363966  T
Q  225 cagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    || |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40363967 caattaatc-atattagataaaatgtgtgttgagttcttttaat 40364009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 38140535 - 38140681
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38140535 cacacatacacaatgatatttccaagatacttcacatatacgtatcctaagaaaagatgaagagtaaaaatgtgagacaatgttgtaagaattcattata 38140634  T
Q  123 ----gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtt 165  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38140635 gattgatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatataattgtt 38140681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16496953 - 16496782
Alignment:
Q  34 aaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaa-gtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatg 132  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  16496953 aaggatactaataagatacttaacatatatgtatcctagaaaa-gataaagagtaaaaaaagtgggacaatgttgtgaaaattcaatgaagatgtatatg 16496855  T
Q  133 attcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa 205  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  16496854 attcaattttagatgtgaatcagtaaaattgtttctcgatgaaccacttaaaagtatattttttgtggatgaa 16496782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Original strand, 40498537 - 40498672
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  40498537 agatacacaaggatatttataagatacttcatatatacgtatcctaggaaaagatgaagagtataaaagtgagacaatgttgtaaacattcagtagagat 40498636  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaatt 162  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  40498637 gtatacgattcaa-tttcgatatgcatcactagaatt 40498672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 165 - 318
Target Start/End: Original strand, 38140833 - 38140992
Alignment:
Q  165 ttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttc--- 261  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||       
T  38140833 ttctcaatgaaccacttaatat-atacttcttatggatgaacgtagcgagagaggtgattcagttaatcaacattagataaattttgtgttgagttcttt 38140931  T
Q  262 ----ttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
        |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38140932 taaattttaatgatatttttctcgatatcccaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 38140992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 267
Target Start/End: Original strand, 44364274 - 44364465
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtg 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||    
T  44364274 aaaagatgaagggtaaaaaagtgagatagtgttgtaaaaattcagtagagatgtgtacggttcaattttagatacgcatcattggaattgtttct-aatg 44364372  T
Q  174 aaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaa 267  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||||  ||  ||| ||  | ||||| ||||||||| |||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  44364373 aaccac-taaatttatacttcctctggatgaaggtaatgagagagatcattcaattaatcaactttagatgaaatgcatgttgagttcttttaa 44364465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38558765 - 38558636
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtg 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||  |||| |||  |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||    
T  38558765 aaaagatgaaaggtaaaaaagtgagacagagttgtgaaaatttattgaagatatatc-gattcaattttagatatatatcagtataattgtttctc-gtg 38558668  T
Q  174 aaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38558667 aaccacttaaaattacacttcttgtggatgaa 38558636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 318
Target Start/End: Original strand, 35306240 - 35306337
Alignment:
Q  220 tgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35306240 tgatttagttaatcaacattagataaaatttgtgtggagttc-tttaacgatatttctctcgatatccctacatatgaaaatataatatggtttataag 35306337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Original strand, 40498835 - 40498913
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40498835 cttcaagtattttacatacatataagttttagtataaattttttttaacgtatcttagctgtatcgtatcctaaatttt 40498913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 142
Target Start/End: Original strand, 18561078 - 18561171
Alignment:
Q  48 gatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaatttt 142  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  18561078 gatacttcaaagatatgtatcctataaaac-atgaagagtaaaaaagtgagacaatgttttgaaaattcagtggaaatgtatatgattcaatttt 18561171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 143
Target Start/End: Original strand, 21812975 - 21813044
Alignment:
Q  74 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaatttta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||| ||||||||||||||||    
T  21812975 aaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtataaattcaatggaaatgaatatgattcaatttta 21813044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 135
Target Start/End: Original strand, 35428729 - 35428829
Alignment:
Q  34 aaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatga 133  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |  ||||||||||||    
T  35428729 aaggatacttagaagatacttcacacatacgtatcttacaaaa-gatgaagggtaaaaaagtgagacaatgatctgaaaattcagtggagatgtatatga 35428827  T
Q  134 tt 135  Q
    ||    
T  35428828 tt 35428829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 42794549 - 42794488
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgt 481  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42794549 cttcaagtattttacatacatacaagttttattataaatttttgttaacgtatcctaactgt 42794488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 166
Target Start/End: Original strand, 3353116 - 3353209
Alignment:
Q  73 aaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |  | |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  3353116 aaaaaaatgaagagtcaaaaagtgagactatgttgtgaaaatttaatggaaatgtatatgattcaatttaagatatgaatcattataattgttt 3353209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Original strand, 30776645 - 30776744
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  30776645 atacttataagatacttcacagttaagtatccttgagaaat-tgaagggtaaaaaagtgagactgtgttataaaaattcaatcgagatgtatatgattca 30776743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 2788872 - 2789001
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||| ||| || | |  | |||||||| |||||    
T  2788872 atacttatatgatacttcacacatacatatcatagaaaa-gatgaatgttaaaaaagtgagacaatattgtgaaagtttaatggaaatgtatatcattca 2788970  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttct 168  Q
    |||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  2788971 attttaaatatgcattagtaaaattgtttct 2789001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Original strand, 35306439 - 35306517
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaattttt-gttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35306439 cttcaagtattttacatgcatataaattttagtattatttttttgttaacgtatcctaaccgtatcatatcctaaattt 35306517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 169
Target Start/End: Original strand, 26352561 - 26352689
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||   ||||  ||||||||||||| |  | |||| |||||||| |  |||||| |||||||||    
T  26352561 atacttataagatacttcacataaacgtatcctaaaaaa---tgaaaggtaaaaaagtgagtctgttttgtgaaaattcaatggagatgtgtatgattca 26352657  T
Q  138 attttagatatgcatcaatagaattgtttctc 169  Q
    |||| |||||||  ||| || |||||||||||    
T  26352658 atttaagatatgagtcactataattgtttctc 26352689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 497
Target Start/End: Original strand, 38141972 - 38142028
Alignment:
Q  441 ataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38141972 ataagttttattataaatttttattaacgtatcctaacggtatcatatcctaaattt 38142028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Original strand, 40083089 - 40083161
Alignment:
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacat 293  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||    
T  40083089 gattcaattaatcaacattaggcaaaatttgtgttgagttctgttaatcatgtttctgtagatatcctaacat 40083161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Original strand, 40364023 - 40364102
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  40364023 cttcaagtattttacgtacatataagttttagtataaattttttgttaacgtatcttagtcgtatcgtatcctaaatttt 40364102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43355890 - 43355765
Alignment:
Q  45 taagatacttcacagatacgtatcct-agaaaaagatgaagagtaaaaaag---tgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaatt 140  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    ||||||  |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  43355890 taagatacttcatagagacgtatcctgaaaaaaaaatgaagtgtaaaaaaaaaatgagactgtgttgtgaaaattcaatggagatgtatatgattcaagt 43355791  T
Q  141 ttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    | ||||||| |||| || ||||||||    
T  43355790 taagatatgaatcactataattgttt 43355765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Original strand, 7018173 - 7018251
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  7018173 cttcaagtattttacatacatgtaagttttagtataaaaattttgttaacgtatcttagccgtatcgtatcctaaattt 7018251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 498
Target Start/End: Original strand, 41324244 - 41324319
Alignment:
Q  421 ttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||| || ||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  41324244 ttcaagtattttacatacatataagttttatcat--attttttttaacgtatcttaaccgtatcatatcctaaatttt 41324319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 286
Target Start/End: Original strand, 12599175 - 12599240
Alignment:
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatc 286  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  12599175 gattcaattaatcaacattagacaacatttgtgttgtgttcttttaatgatttttttgttgatatc 12599240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 37272683 - 37272614
Alignment:
Q  421 ttcaagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaa-ctgtatcgtat 488  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  37272683 ttcaagtattttacatacatataaatttttatataaattttttgttaacgtatcttaacctgtatcgtat 37272614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 286
Target Start/End: Original strand, 11457972 - 11458030
Alignment:
Q  228 ttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatc 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  11457972 ttaatcaacattagacaaaatttgtgttgcgttattttaatgatgcttatgttgatatc 11458030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 266
Target Start/End: Original strand, 41952415 - 41952443
Alignment:
Q  238 ttagataaaatttgtcttgagttctttta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41952415 ttagataaaatttgtcttgagttctttta 41952443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 46979511 - 46979227
Alignment:
Q  34 aaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatga 133  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46979511 aaggatacttctaaaatacttcaaagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaacgttgtaaaaattcattatagatgtataaga 46979412  T
Q  134 ttcaattttagatatgcatcaatagaattgttt-ctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaat 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  46979411 ttcaattttagatatacattaatagaattgtttactga-tgaatcacttaaaattatacttcttgtggatgaacgtagcgagagaggtgatttagttaat 46979313  T
Q  233 caacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  46979312 caacatcacataaaatttgcgttgagttcttttaatgatgtttctctcgatatcgcaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 46979227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7629364 - 7629071
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7629364 cacatatacacaaggatacttctaagatacttcacagaagcatatcctagaaaaagatgcacagtaaaaa--tgagacaatgttgtaaaaattcataata 7629267  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||    
T  7629266 gatgtatatgactcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcgatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaccacagcgagagatgtga 7629167  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7629166 ttcagttaatcaacaatagataaaatttgcattgatttcttgtaatgatgtttctcccaatatcccaacatattaaaatgtaatatggtttataag 7629071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Original strand, 29324037 - 29324332
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||    
T  29324037 agatacacaatgatacttctactatacttcacaaatacgtatcctaaaaaaagatgaagagtaaaaaagtgaggcaatgttgtaaaacttcaataaagat 29324136  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgat 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||  | ||| || |||||    
T  29324137 gtatatcattcaattttagatatgcatcaatataattgtttctcgatgaaccacttaaaattatatttcttgtggataaaggtaacgagagagaagtgat 29324236  T
Q  224 tcagttaatcaacattagataaaatttgtcttga-gttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||    
T  29324237 taagttaatacacattagataaaatttatgttgatttttttttaatgatgtttctctcgatatcccaacatatgtaaatataatattgtttataag 29324332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 268
Target Start/End: Original strand, 45472595 - 45472797
Alignment:
Q  66 atcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtt 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45472595 atcctataaaaagatgaagagtaaaaaagttagacaatgttgtaaacattcaatagagatgtatatgattcaattttagatatgcatcactagaattgtt 45472694  T
Q  166 tctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttctttt 265  Q
    ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45472695 tctcgatgaatcacgtaaaattatacttcttgtggatgaaggtaacgagagaggtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgggttctttt 45472794  T
Q  266 aat 268  Q
    |||    
T  45472795 aat 45472797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27164193 - 27163964
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||    
T  27164193 agatacacaaggatacttataagatacttcacatatacgtatcctagaaaa-gatgaaggg-aaaaaagtgagacaacgttgtagaaattcagtagagat 27164096  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||| || |||||||    
T  27164095 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatataattatttctcgatgaaccacttaaatttatacttcttatggatgaaggtaacgagagaggtgattc 27163996  T
Q  226 agttaatcaacattagataaaatttgtcttga 257  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27163995 aattaatcaacattgaataaaatttgtgttga 27163964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 36504803 - 36505020
Alignment:
Q  51 acttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgc 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36504803 acttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaacaagtgagacaatgttgtaaca-ttcagtag-gatgtatatggttcaattttagatatgc 36504900  T
Q  151 atcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaat 248  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||||| | || |||||||||||||||||    
T  36504901 atcactagaattgtttctcgatgaaccaattaaaattctacttcttatggatgaagataacgagagagaggtgattcggatattcaacattagataaaat 36505000  T
Q  249 ttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  36505001 ttgtgttgagttcttttaat 36505020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38489893 - 38489651
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagata--cgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatag 123  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||    
T  38489893 agatacacaatgatacttataagatatttcacacatatacgtatcctaaaaaaa--tgaatagtaaaaaagtgatataatgttgtaaacattcagtagag 38489796  T
Q  124 atgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||  ||||    
T  38489795 atgtatatgattcaattttagatatgcataactataattgtttctcgatgaaccacttaaaattatacttcttgcggatgaaagtaacgagagagttgat 38489696  T
Q  224 tcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  38489695 tcagttaatcaacattagataaaattggtgttgaattcttttaat 38489651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Original strand, 40614775 - 40615026
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  40614775 cacagatacacaaagatacttataagatacttcatagatacgtatcttagaaaa-gatgaaaggtaaaaaagtgagacaatattgtaaaaattcattaga 40614873  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||  ||  | ||| || ||    
T  40614874 gatgtatatggttcaattttagatatacatcattagagttgtttctcgatgaaccacttaaatttat--ttactgtggatgaaagtaatgagagagaagt 40614971  T
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgttt 275  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40614972 gatccaattaatcaacattatataaaatttgtgttgcgttcttttaatgatgttt 40615026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 202
Target Start/End: Original strand, 32835231 - 32835370
Alignment:
Q  64 gtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgatt--caattttagatatgcatcaatagaat 161  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32835231 gtatcttagaaaaagatgaagggtaaaaa-gtgagacaatgttgtaaaaattcagttgagatgtatatgattttcaattttagatatgcattaatagaat 32835329  T
Q  162 tgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggat 202  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32835330 tgttgctcaatgaaccacttaaaattatacttattgtggat 32835370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20179174 - 20178972
Alignment:
Q  48 gatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagata 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  20179174 gatacttcacagaaacgtatcctagaaaa-gatgaaggggaaaaa-gtgagacaatgttgtagaaattcagga--gatgtatatgattcaattttagata 20179079  T
Q  148 tgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaa 247  Q
    || |||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || |||| || |||||||| |||   |||||| |||||||    
T  20179078 tgtatcagttgaattgtttcttgatgaaccacttaaaattatatttcttatggatgaatgtaacgagagaggtgattcaatta---aacattggataaaa 20178982  T
Q  248 tttgtcttga 257  Q
    ||||| ||||    
T  20178981 tttgtgttga 20178972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52204283 - 52204113
Alignment:
Q  34 aaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatga 133  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  52204283 aaggatacttataagatatttcacaaatacgtatcctagaaat-gatgaagggtaagaaagtgagacaatgttgtaaaaatttagtagaaatgtatatga 52204185  T
Q  134 ttcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa 205  Q
     ||||||||| ||||| || | || ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52204184 atcaattttaaatatgaatgagtaaaattgtttcccgatgaactacttaaaattatacttattgtggatgaa 52204113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20369415 - 20369258
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |    
T  20369415 cacagatacacaaggatacttataagatatttcacatatacatatccttgaaaa-gattaagggtaaaaaagtgatacaatgttgtgaaaattaatttga 20369317  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccactta 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  20369316 gatgtatatgattcaattttagat-tgcatcaatataattgtttctcgatgaatcactta 20369258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52695732 - 52695505
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  52695732 cacaaatacacaaagatgcttataagatatttcacagatacttatcctataaaa-gatgaagggtcaaaaagtgagacaattttgtaaaaattccgtaga 52695634  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaac--cacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggac 218  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||  ||  | ||| |      
T  52695633 gatgtgtatggttcaattttagatatgcatcattagaattatttcttgatgaaccacacttaaatttat-cttcttgtggatgaaggtaatgagagaggg 52695535  T
Q  219 gtgattcagttaatcaacattagataaaat 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52695534 gtgattcaattaatcaacattagataaaat 52695505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 39615207 - 39614930
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||        |||||||||||||||||  | |    
T  39615207 cacagatacacaatgatacttataagatacttcacaaatacgtatcttagaaaa-gatgaagggtaaaaat-------aatgttgtaaaaattcagaaga 39615116  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattg--tttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || | ||| |||| | |  ||| |   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||  |    
T  39615115 gatgtatgtgattcaatttta-acatacttcagtagagtagaatttttggatgaaccaattaaaattatacttcttatggatgaaggtaacgagagatat 39615017  T
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaata 307  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||    
T  39615016 gatttaattaatcaacgttagataaaatttgtgatgagttcttttaataatgtttttctcgttctcccaacatatgaaaatataata 39614930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 20619218 - 20619396
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  ||  || |||||||||| | |||||||||| |||||||| |  | ||    
T  20619218 agatacacaaggatatttataagatacttcaaatatatgtattctagaaaat-atatagggtaaaaaagtcaaacaatgttgtgaaaattcagtggaaat 20619316  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20619317 gtatatgattcaattttagatatgcataagtataattatttttcgatcaaccacttaaaattatatttcttgtggatgaa 20619396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 46979128 - 46979051
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  46979128 cttctagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttaacgtatcctgaccgtatcatatcctaaattt 46979051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 51241434 - 51241341
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattca 117  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51241434 cacagatacacaaagatacttataagatacttcacattaacgtatcctagaaaa-gatgatgggtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattca 51241341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Original strand, 35296380 - 35296536
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatac--gtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatag 123  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |   ||||||| || ||    
T  35296380 agatacacaatgatacttataagatacttcctagatacatgtatcatagaaaa-gatgaagtgtaaaaaagtgagacaatatag---aaattcagtagag 35296475  T
Q  124 atgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaa 184  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||| ||||||||    
T  35296476 atatatacgattcaattttagatatgcataagtataattgtttctcgatgaatcacttaaa 35296536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51240948 - 51240854
Alignment:
Q  219 gtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgattta 314  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  51240948 gtgattcaattaatcaatattagataaaatttgtgttgagttctttttacgatgttt-tctcgatatcccaacatatgaaaatataatatggttta 51240854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 7628964 - 7628886
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7628964 cttcaagtgttttacatacatataagtttaattataaatttttgttaacgtatcctaaccgtattgtatcctaaatttt 7628886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17064023 - 17063930
Alignment:
Q  24 acagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattca 117  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  17064023 acagatacacaaggatacttataagatactttaaatatacgtatcctacaaaaacatgaagagtagaaaagtgagagaatgttgcaaacattca 17063930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24611617 - 24611468
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctag-aaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgatt 135  Q
    ||||||| || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||| |  ||||||||||||||    
T  24611617 gatacttgtacgatactacacagagacgtatcctgggaaaaaaatgaagggtaaaaaagtgagattgtgttgtgaaaaatcaatggagatgtatatgatt 24611518  T
Q  136 caattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaa 185  Q
    |||||| | ||||| |||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  24611517 caatttaatatatgaatcactataattgtttttcaattaaccaattaaaa 24611468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 47014226 - 47014357
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatccta-gaa--aaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatga 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||  ||| || | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  47014226 gatacttataagatacttcacaaagacgtatcctaagaagaaaaaataaggagtaaaaaagtgagaatatgttgtgaaaattcaatgaagatgtatatga 47014325  T
Q  134 ttcaattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    ||||| |||||||||  |||| || ||||||||    
T  47014326 ttcaa-tttagatataaatcattataattgttt 47014357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17063934 - 17063888
Alignment:
Q  222 attcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17063934 attcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcctttaat 17063888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52204057 - 52203963
Alignment:
Q  96 gagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattata 190  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| ||||||||| ||||| || | || ||||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  52204057 gagacaatgttgtaaaaatttagtagaaatgtatatgaatcaattttaaatatgaatgagtaaaattgtttcccgatgaactacttaaaattata 52203963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 498
Target Start/End: Original strand, 21858532 - 21858609
Alignment:
Q  422 tcaagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21858532 tcaaatattttgcatgcatataaattttagtataaatattttgttaacgtatcttaactgtatcgtatcctgaatttt 21858609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Original strand, 16343233 - 16343303
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16343233 aagtattttacatgcatataaattttagtataaataatttgttgacgtatcttaaccgtatcgtatcctaa 16343303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Original strand, 43472038 - 43472108
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||    
T  43472038 aagtattttacatgcatataaattttagtataaatattttgttaacgtatcttagccgtatcgtatcctaa 43472108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53530701 - 53530625
Alignment:
Q  192 ttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||   |||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  53530701 ttcttgtggatgaagataacgagagagtagattcaattaatcaatattaaacaaaatttgtgttgagttcttttaat 53530625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Original strand, 21853838 - 21853913
Alignment:
Q  220 tgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatat 295  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  21853838 tgattcaatcaatcaacattaaataaaatttgtttagagttcttttattgatgcatttgttgatatcctaacatat 21853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Original strand, 45472811 - 45472890
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattat-aaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||| || |  ||||||||||||||||||    
T  45472811 cttcaagtattttacatacatataagttttaatataaaaattttgttaacatatcttagccatatcgtatcctaaatttt 45472890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12176543 - 12176473
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaatt-tttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || ||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12176543 aagtattttacatgcatataaattttagtacaaataatttgttaacgtatcttaaccgtatcgtatcctaa 12176473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27163869 - 27163791
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaa-tttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  27163869 cttcaagaattttacatatatataagttttagtataaaatttttgttaacgtatcttagccgtatcgtatcttaaattt 27163791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 462
Target Start/End: Original strand, 35296689 - 35296731
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaattttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  35296689 cttcaagtattttacatacatgtaaattttagtataaattttt 35296731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Original strand, 35433570 - 35433640
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  35433570 aagtattttacatgcatataaattttagtataaataatttgttaacgtatcttaaacgtatcgtatcctaa 35433640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 98
Target Start/End: Original strand, 2111391 - 2111452
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgag 98  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||    
T  2111391 gatacttataagatacttcatagagacgtatcctgggaaaaaatgaagtgtaaaaaaatgag 2111452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17063864 - 17063819
Alignment:
Q  453 ataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  17063864 ataaatttttgttaacgtatcttagccgtatcgtatcctaaatttt 17063819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 63
Target Start/End: Original strand, 32834947 - 32834987
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatac 63  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32834947 cacatatacacaaggatacttctaagatacttcacaaatac 32834987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Original strand, 17116201 - 17116497
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtat--cctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcatta 120  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17116201 cacagatacacaagaatacttctaagatacttcacatacacgtatatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagataatgttgtaaaaattcttta 17116300  T
Q  121 tagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgt 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||    
T  17116301 tagatgtatatgactcaattttagatatgcatcaatagaattatttttcgatgaaacacttaaaattatacttcttgtggatgaacgtaacgagagatgt 17116400  T
Q  221 gattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataa 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  17116401 gatttagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaattatgtttctctcaatatcccaacatatgaatatgtaatatggtttataa 17116497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 48 - 279
Target Start/End: Original strand, 50726630 - 50726861
Alignment:
Q  48 gatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagata 147  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50726630 gatacttcacagacacgtattatagaaaaagaagaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgactcaattttagata 50726729  T
Q  148 tgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcagttaatcaacattagataaaa 247  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50726730 tgcgtcaatagaattgtttctcgatgaaacgcttaaaattatacttcttgtggatgaacgtagcgagagatgtgattcagttaatcaacattagataaaa 50726829  T
Q  248 tttgtcttgagttcttttaatgatgtttctct 279  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50726830 tttgtgttgaattcttttaatgatgtttctct 50726861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 318
Target Start/End: Original strand, 41827636 - 41827922
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||    
T  41827636 cagatacacaaggatacttctaagatacttcacagacacgtattctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgag------ttgtaaaaattcattattga 41827729  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgatt 224  Q
     |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||    
T  41827730 ggtatatgactcaattttatatatgtatgaatagaattgattctcaatgaaacacttaaaattatactt-ttgtggatgaacgtagcgagaaatgtgatt 41827828  T
Q  225 cagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41827829 cagttaatcaacattagataaaatttgtgttgggatcttttaatgatgtttctctcaatatcccagcatatgaaaatgtaatatggtttataag 41827922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31513787 - 31513501
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31513787 cacagatacacaaggatacttctaagatacttcacagacacgtatcctagaaaaagatgaggagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaatttattata 31513688  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtga 222  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |  ||||||| | || |||| || ||||    
T  31513687 ggtgtatatgactcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcgatgaaacagttaaaattatacttatgttggatgatcgtaacgagagatgtga 31513588  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||||||||||||||| |     ||   ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31513587 ttcagttaatcaacattagaga-----tg---tga-ttcttttaatgatgtttctctcaatatcccaacatatgaaaatgtaatatggtttataag 31513501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38683091 - 38682790
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| | |  |    
T  38683091 cacatatacataaagatacttctaaaatacttcacagatatgtatcctagaaaaagatgaagggtaaaaaaatgaaataatgttgtaacaatttagtgga 38682992  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgaggga----- 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||         
T  38682991 gatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcgattaaccacttaaaattataattcttgtggatgaaggtaacgagagaggtga 38682892  T
Q  218 -cgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttata 316  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  38682891 tggtgattcagctaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttcattatgtttctctcgatatcccaacatttaaaaatataatatggtttata 38682792  T
Q  317 ag 318  Q
    ||    
T  38682791 ag 38682790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Original strand, 14286975 - 14287270
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  14286975 agatacacaatgatacttataagatacttcgcatatatgtatcctagaaaaagatgaagggaaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcaggagagat 14287074  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattc 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| || |||||||    
T  14287075 gtatatgatgcaattttagatatgcattagtagaattgtttcacggtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaaggtaatgagagaggtgattc 14287174  T
Q  226 agttaatc-aacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatata--aaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||  ||| | ||||||| ||||||||    
T  14287175 aattaatcaaacattagataaaatatgtgttgagttcttttaattattcttctctcgatatccaaacatatatgaaagtataatatggtttataag 14287270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 13558438 - 13558682
Alignment:
Q  25 cagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattataga 124  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  13558438 cagatacacaaggataattata-gatacttcacatatatgtatcctaaaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaacattcaataggga 13558536  T
Q  125 tgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||| ||  |||    
T  13558537 tgtatatgattcaattttagatatgcatcactaaaattgtttctcgatgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaaggtaacgagagagagatga 13558636  T
Q  223 ttcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13558637 ttcagttaatcaacattagataaaatgtgtgttgagttcttttaat 13558682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 40693887 - 40694120
Alignment:
Q  27 gatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaag-agtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40693887 gatacacaagaatacttctaagatacttcacagaaacgtattctagaaaaatatgaaggagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattattgat 40693986  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattc 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| || || ||||    
T  40693987 gtatatgactcaatattagatatgcatcaatagaattgtttttcgatgaaacacttaaaattatacttcttttggatgaatgcagcgagagatgtcattc 40694086  T
Q  226 agttaatcaacattagataaaatttgtcttgagt 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  40694087 agttaatcaatattagataaaatttatgttgagt 40694120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 308
Target Start/End: Original strand, 4966637 - 4966923
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaaga-tgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattat 121  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  4966637 cacaaatacacaaggatacttataagatactttacatatatgtatcctagaaaaaaaatgaagggtaataaagtgagacaatattgtaaaa-ttcactat 4966735  T
Q  122 agatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacg 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||  | ||| ||      
T  4966736 agatatatatgattcaattttagatatacatctgtagaattgtttctcgatgaacaacttaaaa-tatacttcttgtggatgaaagtaacgagagagaga 4966834  T
Q  220 tgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatat 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4966835 tgattcagttaatcaacattaaataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgtttctctcaatatcccaacatatgaaaatataatat 4966923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4973251 - 4972959
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaaga--tgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcatta 120  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |  ||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  4973251 cacaaatacacaaagatacttataagatactttacatatatgtatcctagaaaaaaaaatgaagggcaataaagtgagacaatattgtaaaaattcagtg 4973152  T
Q  121 tagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa------catagcgag 214  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||       | || |||    
T  4973151 gagatatatatgattcaattttagatatacatctgtagaattgtttctcgatgaacaacttaaaa-tatacttcttgtggatgaaagtaaggaaagagag 4973053  T
Q  215 ggacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatat 308  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4973052 agagatgattcagttaatcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgtttctctcaatatcccaacatataaaaatataatat 4972959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 128 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25294700 - 25294510
Alignment:
Q  128 atatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgagggacgtgattcag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25294700 atatgattcaattttagatatgcatcaatagaagtgtttctcgataaaacacttaaaattatactttttgtggatgaacatagcgagatatgtgattcag 25294601  T
Q  228 ttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  25294600 ttaatcaacattagataaaatttgtgttgaattcttttaatgatgtttctctcaatattccaacacatgaaaatgtaatatggtttataag 25294510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11767801 - 11767567
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||    
T  11767801 gatacttataagatacttcagagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaatgtgagacaatgttgtaaaaattcggtagcgatatatatgattc 11767702  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaa---ttatacttcttgtggatgaacatagcgaggg--acgtgattcagttaa 231  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||||||||||   |||||||||||| |||||||  || |||| |  | |||||||||||||    
T  11767701 aattttagatatgcataactagaattttttctcgattaaccacttaaaattattatacttcttgcggatgaaagtaacgagagaaatgtgattcagttaa 11767602  T
Q  232 tcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11767601 tcaacattagataaaatttg--ttgagttcttttaat 11767567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 306
Target Start/End: Original strand, 40032690 - 40032871
Alignment:
Q  128 atatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcag-tgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacatagcgaggg--acgtgatt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |  | ||||||    
T  40032690 atatgattcaattttatatatgcgtcaatataattgtttaccaaatgaatcacttaaaattatacttcttgtgaatgaaggtaacgagaggaaggtgatt 40032789  T
Q  225 cagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaat 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40032790 cagttaatcaacattatataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgtttttctcgatatcccaacatatgaaaatataat 40032871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Original strand, 16122756 - 16122921
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaa--aaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgatt 135  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||    
T  16122756 atacttataagatacttcacatatacgtatcataggacaaaaaatgaagggtaaaaaagtgagacaatgttgtgaaa-ttcattggaaatgtatatgatt 16122854  T
Q  136 caattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggat 202  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  16122855 caattttagatatgcatcagtataattgtttcttgatgaaccacttcaaattacacttcttgcggat 16122921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Original strand, 10443522 - 10443657
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||    
T  10443522 agatacacaaggatacttccaagatactttacatatatgtatcctagaaaa-gatgaagtataaaaaagtgagagaatgttgtagaaatccagtagagat 10443620  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaatt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10443621 gtatatgattcaattttagatattcatcagtagaatt 10443657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 219 - 318
Target Start/End: Original strand, 13643921 - 13644020
Alignment:
Q  219 gtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgatatcccaacatataaaaatgtaatatgatttataag 318  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13643921 gtgattcaattattcaacattagataaaatttgtgttgagttcttttaatgatgcttatcttgatatcccaacatatgaaaatataatatgatttataag 13644020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Original strand, 13643769 - 13643894
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattata 122  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  13643769 cacatatacacaaggatacttgtaaggtacttcacatacacgtatcataagaaaagatgaaggg-aaaaaagtgagacaacgttgtaaaaattcaataga 13643867  T
Q  123 gatgtatatgattcaattttagatatg 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13643868 gatgtatatgattcaattttagatatg 13643894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51899041 - 51898831
Alignment:
Q  86 gtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaa 185  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||  |  | ||||||||||||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  51899041 gtaaaaaacggagacaaagttgtgaaaattcggtgaaaatgtatatgattttattttagacatgcaccgatataattgtttctcgatgaaccaccgaaaa 51898942  T
Q  186 ttatacttcttgtggatgaacatagcgagg--gacgtgattcagttaatcaacattagataaaatttgtcttgagttcttttaatgatgtttctcttgat 283  Q
    ||| ||||||||||||||||  || ||||   || | |||  | ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51898941 ttacacttcttgtggatgaaggtaacgagaaagaggagatagaattaatcaacattagacaaaaattgt-ttgagttcttttaatgatgtttctattgat 51898843  T
Q  284 atcccaacatat 295  Q
    ||||||||||||    
T  51898842 atcccaacatat 51898831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 270890 - 271067
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagat 125  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| || || ||| ||||||| |||||||  |||||  || |||||||||||| |||||||  |  ||||    
T  270890 agatacacaagaatacttataagatatttcacaaatgcgcatcttagaaaa-gatgaaggataaaag-gtaagacaatgttgtgaaaattcgatggagat 270987  T
Q  126 gtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaa 205  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  270988 atatatgattcaattttagatatacatcagtataattctttctctatgaatcacttaaaattatactatttgtggatgaa 271067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 25294406 - 25294332
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25294406 aagtattttacatacatataagttttattataaatttttgttaacgtatcataaccgtatcgtatcctaaatttt 25294332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30902511 - 30902365
Alignment:
Q  45 taagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatg---ttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattt 141  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||  || |||||||||||||||    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  30902511 taagatacttcatagatacatataccagaaaa-gatgaactgttaaaaagtgagacaataattttgtgaaaattcaatggagatgtatatgattcaattt 30902413  T
Q  142 tagatatgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattata 190  Q
    || |||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30902412 taaatatgcatcagtag-actgttcctcaatgaaccacttaaaattata 30902365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 31513401 - 31513323
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||    
T  31513401 cttcaagtattttacatacatataagttttattataaatttttgttaacgtatcataaccgtattgtatcttaaatttt 31513323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 46594385 - 46594253
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcct----agaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatga 133  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||    | ||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  46594385 atacttataagatacttcacagagacatatcctgaagaaaaaaaaatgaagtataaaaaaatgagactatgttgtgaaaattcaatggagatgtatatga 46594286  T
Q  134 ttcaattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    |||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  46594285 ttcaatttaagatatgaatcactataattgttt 46594253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22791245 - 22791116
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaag-tgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattc 136  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||  |||||| |||||||| |  | |||||||||||||    
T  22791245 atacttataagttacttcacaaagacgtatcctggaaaaaaatgaagtgtaaaaaaaatgagactgtgttgtgaaaattcaatggatatgtatatgattc 22791146  T
Q  137 aattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  22791145 aatttaagatatgaatcactacaattgttt 22791116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 497
Target Start/End: Original strand, 41828021 - 41828098
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  41828021 cttcaagtattttacatacatataagttttattataaatttttattaacttatcttaatcgtatcgtatcctaaattt 41828098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Original strand, 50709492 - 50709624
Alignment:
Q  37 gatacttctaagatacttcacagatacgtatcct--agaaaaagatgaagagtaaaaaag-tgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatga 133  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||||  | ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  50709492 gatacttataagatattttacagagacgtatcctgaaaaaaaaaatgaagtgtaaaaaaaatgagacagtgttgtgaaaattcaatggagatgtatatga 50709591  T
Q  134 ttcaattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    |||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  50709592 ttcaatttaagatatgaatcattataattgttt 50709624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 46594056 - 46593986
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46594056 aagtattttacatgcatataaattttagtataaatattttgttaacgtatcttaactgtatcgtatcctaa 46593986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 498
Target Start/End: Original strand, 4967038 - 4967115
Alignment:
Q  421 ttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4967038 ttcaagtgttttacatacatataagttttagtataatttttttttaacgtatcctagttgtatcgtatcctaaatttt 4967115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4972843 - 4972767
Alignment:
Q  423 caagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4972843 caagtattttacatacatataagttttagtataaaaattttgttaacgtatcctagttgtatcgtatcctaaatttt 4972767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 29488210 - 29488325
Alignment:
Q  38 atacttctaagatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattca 137  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||  |||||| |||||| | |  |||||||||||||| |    
T  29488210 atacttataagatacttcactgatacgtatcctggaaaaa-atgaagggggaaaaagtgagactttgttgtgaaaatttagtggagatgtatatgattaa 29488308  T
Q  138 attttagatatgcatca 154  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  29488309 gtttaagatatgtatca 29488325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11767553 - 11767474
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11767553 cttcaagtattttacatacatatatgttttagtataaaaattttgttaacgtatcttaaccgtatcgtatcctaaatttt 11767474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 497
Target Start/End: Original strand, 17116619 - 17116681
Alignment:
Q  435 atacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaattt 497  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17116619 atacatataagtttaattataaatttttgttaacgtatcctaaccgtatcgtatcttaaattt 17116681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Original strand, 40694198 - 40694255
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaa 477  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40694198 cttcaagtattttacataaatataagtttcattataaatttttgttaacgtatcctaa 40694255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 149
Target Start/End: Original strand, 781830 - 781929
Alignment:
Q  49 atacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatat 148  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  781830 atacttcacagataattatactaggaaa-gatgaaagttaaaaatttgagacaatgttgtgaaaattcaatgaatatgtatatgattcaattttagatat 781928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 498
Target Start/End: Original strand, 31183803 - 31183878
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  31183803 aagtattttacatgcatataaattttagaataaatattttgttaacgtatcttagccgtatcgtatcctaaatttt 31183878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Original strand, 40032600 - 40032683
Alignment:
Q  23 cacagatacataaggatacttctaagata---cttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaat 103  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  40032600 cacagatatacaaggatacttctaagatacttcttcatagatacatattctagaaagagatgtagggtaaaaaaatgagacaat 40032683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 50461327 - 50461234
Alignment:
Q  73 aaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagatatgcatcaatagaattgttt 166  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||  || | || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  50461327 aaaaaaatgaagggtaaagaagtgagattatatggtgaaaattcaatagagatgtatatggttcaatttaagatatgaatcgatataattgttt 50461234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 498
Target Start/End: Original strand, 49899513 - 49899588
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaatttttg-ttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49899513 aagtattttacttacatataagttttagtataaatatttggttaatgtatcttaactttatcgtatcctaaatttt 49899588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 420 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 38682691 - 38682633
Alignment:
Q  420 cttcaagtattttacatacagataaattttattata-aatttttgttcacgtatcctaa 477  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  38682691 cttcaagtattttacatatatttaagttttattatagaatttttgttaacgtatcctaa 38682633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Original strand, 50709801 - 50709871
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| || ||||||| || | ||||||||||||||    
T  50709801 aagtattttacatgcatataaattttagtataaatattttattaacgtatcttagccgtatcgtatcctaa 50709871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0495
Description:

Target: scaffold0495; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Original strand, 6137 - 6362
Alignment:
Q  47 agatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgtaaaaattcattatagatgtatatgattcaattttagat 146  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||    
T  6137 agatatttcacatatacgtatccttcaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgcaaacattcgatagagatgtatatgattcaattatagat 6236  T
Q  147 atgcatcaatagaattgtttctcagtgaaccacttaaaattatacttcttgtggatgaacata--gcgagggacgtgattcagttaatcaacattagata 244  Q
    |||||| | ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  6237 atgcataactagaattgttttttgatgaaccacttaaaattatacttcttgtgaacaaatgtaacgagagtgaggtgatttagttaatcaacattagata 6336  T
Q  245 aaatttgtcttgagttcttttaatga 270  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||    
T  6337 aaatttaggttgagttattttaatga 6362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 498
Target Start/End: Original strand, 6375 - 6452
Alignment:
Q  421 ttcaagtattttacatacagataaattttattataaatttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaaatttt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  6375 ttcaagtattttacatacatatatgttttagtataaatttttattaacgtatcttagttgtatcgtatcctaaatttt 6452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0581 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0581
Description:

Target: scaffold0581; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 108
Target Start/End: Original strand, 10046 - 10106
Alignment:
Q  47 agatacttcacagatacgtatcctagaaaaagatgaagagtaaaaaagtgagacaatgttgt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10046 agatacttcacagatgcgtatcctag-aaaatataaagggtaaaaaagtgagacaatgttgt 10106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 493
Target Start/End: Original strand, 53877 - 53947
Alignment:
Q  424 aagtattttacatacagataaattttattataaat-ttttgttcacgtatcctaactgtatcgtatcctaa 493  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||| || |||| |||| ||||||||||||||    
T  53877 aagtattttacatgcatataaattttagtataaataatttgttgacatatcttaaccgtatcgtatcctaa 53947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 38442 - 38405
Alignment:
Q  26 agatacataaggatacttctaagatacttcacagatac 63  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38442 agatacataaggatacttataagatacttcagagatac 38405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University