View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1946_low_101 (Length: 300)

Name: NF1946_low_101
Description: NF1946
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1946_low_101
NF1946_low_101
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (19-297)||(39811950-39812227)
chr2 (19-300)||(32246627-32246911)
chr2 (19-300)||(44312585-44312866)
chr2 (19-297)||(19344266-19344546)
chr2 (19-297)||(19349124-19349404)
chr2 (47-297)||(11098928-11099176)
chr2 (47-295)||(14291337-14291584)
chr2 (47-297)||(9296402-9296651)
chr2 (47-254)||(25398386-25398591)
chr2 (47-254)||(25403524-25403729)
chr2 (47-141)||(3491751-3491846)
chr2 (56-142)||(8040059-8040147)
chr2 (59-141)||(40738844-40738926)
chr2 (47-138)||(13569331-13569425)
chr2 (47-142)||(21629943-21630040)
chr2 (30-141)||(28259161-28259274)
chr2 (47-142)||(10445444-10445542)
chr2 (47-142)||(17865202-17865300)
chr2 (47-142)||(20522219-20522317)
chr2 (47-142)||(34682334-34682432)
chr2 (47-111)||(25407653-25407718)
chr2 (47-140)||(34388859-34388955)
chr2 (47-142)||(14699008-14699105)
chr2 (30-140)||(10707235-10707348)
chr2 (30-138)||(8390133-8390244)
chr2 (30-141)||(23078454-23078567)
chr2 (56-119)||(31056067-31056131)
chr2 (47-142)||(33528621-33528719)
chr2 (47-142)||(39482930-39483028)
chr2 (47-120)||(42039670-42039744)
chr2 (56-142)||(16940219-16940307)
chr2 (56-142)||(17010884-17010972)
chr2 (57-120)||(33118158-33118222)
chr2 (58-141)||(36757774-36757859)
chr2 (58-120)||(27149306-27149369)
chr2 (78-138)||(1345574-1345635)
chr2 (78-138)||(2838063-2838124)
chr2 (78-137)||(35215586-35215646)
chr2 (78-137)||(35217963-35218023)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (19-297)||(39784784-39785063)
chr8 (19-300)||(25328240-25328520)
chr8 (19-298)||(7289887-7290167)
chr8 (24-300)||(6311140-6311417)
chr8 (19-300)||(35745234-35745516)
chr8 (47-297)||(33037808-33038056)
chr8 (47-297)||(36979225-36979473)
chr8 (47-297)||(4760076-4760325)
chr8 (47-297)||(18853168-18853418)
chr8 (47-297)||(30655488-30655742)
chr8 (24-297)||(10684229-10684504)
chr8 (47-297)||(10689144-10689392)
chr8 (47-297)||(18870562-18870809)
chr8 (47-141)||(1261955-1262050)
chr8 (59-141)||(26287902-26287985)
chr8 (59-141)||(26301159-26301242)
chr8 (59-141)||(26313153-26313236)
chr8 (56-142)||(26403240-26403328)
chr8 (47-141)||(31071230-31071326)
chr8 (47-120)||(4456050-4456124)
chr8 (59-142)||(4696609-4696694)
chr8 (47-138)||(7412344-7412437)
chr8 (47-141)||(19175755-19175851)
chr8 (30-142)||(23799560-23799675)
chr8 (47-120)||(6127243-6127318)
chr8 (47-142)||(5702483-5702581)
chr8 (78-139)||(9765852-9765914)
chr8 (59-142)||(19752407-19752492)
chr8 (78-111)||(18810982-18811015)
chr8 (78-137)||(43079877-43079937)
chr8 (78-137)||(43082248-43082308)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (19-300)||(14737538-14737819)
chr6 (19-300)||(28184345-28184628)
chr6 (19-300)||(14742398-14742678)
chr6 (19-300)||(22010658-22010939)
chr6 (19-300)||(11856814-11857098)
chr6 (19-300)||(28155531-28155813)
chr6 (19-300)||(6438343-6438624)
chr6 (19-300)||(6005260-6005542)
chr6 (19-300)||(16838587-16838869)
chr6 (21-300)||(33330407-33330689)
chr6 (21-300)||(33335904-33336186)
chr6 (47-164)||(5674771-5674889)
chr6 (96-300)||(5343323-5343527)
chr6 (30-141)||(5757462-5757575)
chr6 (47-141)||(21356036-21356132)
chr6 (57-142)||(10077176-10077263)
chr6 (47-142)||(5572241-5572339)
chr6 (58-142)||(31086485-31086571)
chr6 (197-297)||(30125944-30126044)
chr6 (57-141)||(4629954-4630040)
chr6 (47-142)||(31979512-31979610)
chr6 (59-119)||(22709041-22709102)
chr6 (47-120)||(18232867-18232942)
chr6 (47-120)||(21801344-21801419)
chr6 (47-142)||(22963699-22963796)
chr6 (47-142)||(23824597-23824694)
chr6 (59-142)||(5017482-5017567)
chr6 (78-142)||(31936586-31936651)
chr6 (78-137)||(12195515-12195575)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (19-300)||(31109545-31109825)
chr7 (19-300)||(12406174-12406455)
chr7 (19-300)||(12396754-12397035)
chr7 (19-300)||(24024288-24024570)
chr7 (19-297)||(19992158-19992437)
chr7 (52-300)||(4866572-4866820)
chr7 (19-297)||(21812199-21812478)
chr7 (19-297)||(20357519-20357797)
chr7 (47-297)||(2057806-2058061)
chr7 (24-297)||(24261288-24261563)
chr7 (24-297)||(24266167-24266442)
chr7 (24-297)||(16879918-16880192)
chr7 (24-297)||(16884774-16885048)
chr7 (47-297)||(1533445-1533690)
chr7 (47-164)||(18408742-18408859)
chr7 (47-254)||(21639701-21639904)
chr7 (47-164)||(18413619-18413735)
chr7 (47-254)||(21645899-21646102)
chr7 (30-142)||(29159802-29159917)
chr7 (57-140)||(21983285-21983370)
chr7 (47-142)||(33332450-33332548)
chr7 (47-142)||(46516310-46516408)
chr7 (47-142)||(49091660-49091758)
chr7 (47-141)||(44848685-44848781)
chr7 (47-142)||(2647696-2647794)
chr7 (59-142)||(9190021-9190106)
chr7 (59-142)||(20284088-20284173)
chr7 (47-142)||(55947-56044)
chr7 (30-142)||(2580389-2580503)
chr7 (58-119)||(35960839-35960901)
chr7 (59-142)||(9185178-9185263)
chr7 (47-142)||(4796667-4796765)
chr7 (78-120)||(28617258-28617300)
chr7 (62-141)||(47263678-47263757)
chr7 (58-141)||(2479337-2479421)
chr7 (57-140)||(21988909-21988992)
chr7 (78-137)||(31155911-31155971)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (19-300)||(45357258-45357539)
chr4 (19-300)||(9224368-9224649)
chr4 (19-300)||(9229155-9229436)
chr4 (19-300)||(5732504-5732788)
chr4 (19-300)||(45347778-45348060)
chr4 (19-300)||(18855569-18855850)
chr4 (19-300)||(51520299-51520581)
chr4 (19-300)||(56146672-56146954)
chr4 (19-300)||(3813866-3814147)
chr4 (47-297)||(24741788-24742036)
chr4 (47-297)||(29760490-29760737)
chr4 (59-141)||(28468542-28468625)
chr4 (47-142)||(10047378-10047476)
chr4 (47-142)||(39245993-39246091)
chr4 (47-142)||(36315230-36315327)
chr4 (47-142)||(36329439-36329536)
chr4 (47-141)||(31985635-31985730)
chr4 (47-142)||(16623293-16623391)
chr4 (30-141)||(5396655-5396768)
chr4 (56-142)||(38152449-38152537)
chr4 (59-144)||(5269204-5269291)
chr4 (30-141)||(3796502-3796616)
chr4 (57-140)||(5143260-5143345)
chr4 (57-140)||(5147678-5147763)
chr4 (56-120)||(24333831-24333896)
chr4 (47-140)||(3777550-3777645)
chr4 (47-120)||(16630680-16630755)
chr4 (56-136)||(6743425-6743507)
chr4 (59-142)||(25862035-25862120)
chr4 (47-120)||(39774305-39774380)
chr4 (78-137)||(16931789-16931849)
chr4 (78-137)||(16934143-16934203)
chr4 (78-137)||(22780373-22780433)
chr4 (78-137)||(44599838-44599898)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (19-300)||(22173156-22173437)
chr3 (19-300)||(18656274-18656558)
chr3 (24-300)||(28503841-28504107)
chr3 (47-297)||(7167092-7167340)
chr3 (47-297)||(2671587-2671836)
chr3 (21-300)||(2677049-2677330)
chr3 (21-300)||(2672893-2673174)
chr3 (24-300)||(8512058-8512337)
chr3 (24-300)||(8516938-8517217)
chr3 (19-293)||(24967957-24968232)
chr3 (47-297)||(8739064-8739314)
chr3 (47-297)||(9091302-9091552)
chr3 (24-297)||(32475330-32475603)
chr3 (24-297)||(32480188-32480461)
chr3 (47-159)||(40372796-40372908)
chr3 (47-164)||(8477340-8477458)
chr3 (93-300)||(10207776-10207983)
chr3 (47-164)||(26928592-26928709)
chr3 (47-141)||(1305949-1306044)
chr3 (24-98)||(28501674-28501750)
chr3 (47-141)||(8370477-8370573)
chr3 (47-141)||(27974943-27975039)
chr3 (47-141)||(32143321-32143417)
chr3 (47-142)||(18552873-18552971)
chr3 (30-141)||(16264350-16264463)
chr3 (47-142)||(21711222-21711319)
chr3 (47-141)||(27452958-27453054)
chr3 (59-141)||(27986449-27986533)
chr3 (47-140)||(36029094-36029190)
chr3 (47-138)||(1736295-1736389)
chr3 (47-141)||(30709780-30709877)
chr3 (59-141)||(33386669-33386753)
chr3 (30-142)||(40592755-40592870)
chr3 (47-120)||(48438236-48438311)
chr3 (47-142)||(3715992-3716090)
chr3 (47-120)||(6794704-6794778)
chr3 (47-142)||(26298987-26299085)
chr3 (47-142)||(47923896-47923994)
chr3 (59-142)||(1417493-1417578)
chr3 (47-141)||(25795781-25795878)
chr3 (59-142)||(3328359-3328444)
chr3 (59-142)||(37466290-37466375)
chr3 (59-141)||(39039995-39040079)
chr3 (47-120)||(40844674-40844748)
chr3 (75-116)||(4386947-4386988)
chr3 (231-295)||(40372980-40373043)
chr3 (59-120)||(3323693-3323755)
chr3 (47-142)||(24695154-24695252)
chr3 (74-111)||(53894082-53894119)
chr3 (78-137)||(38210569-38210629)
chr3 (78-137)||(50494198-50494258)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (19-300)||(35023-35304)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (19-300)||(15044529-15044809)
chr5 (19-300)||(43592121-43592403)
chr5 (19-300)||(43598566-43598848)
chr5 (19-300)||(43604058-43604340)
chr5 (19-300)||(43609550-43609832)
chr5 (19-300)||(27444812-27445094)
chr5 (19-300)||(27449656-27449938)
chr5 (19-300)||(1457123-1457404)
chr5 (19-300)||(28807535-28807817)
chr5 (19-297)||(37556583-37556863)
chr5 (19-297)||(37561405-37561685)
chr5 (19-300)||(30631250-30631531)
chr5 (19-300)||(2785218-2785500)
chr5 (19-300)||(33791159-33791441)
chr5 (24-300)||(31401815-31402092)
chr5 (24-219)||(31180138-31180334)
chr5 (24-300)||(31396958-31397235)
chr5 (19-300)||(33768022-33768304)
chr5 (47-254)||(38192064-38192269)
chr5 (47-254)||(38219289-38219494)
chr5 (47-254)||(24135740-24135944)
chr5 (47-141)||(35387663-35387758)
chr5 (47-141)||(9353333-9353429)
chr5 (47-141)||(36932351-36932447)
chr5 (30-141)||(10281751-10281865)
chr5 (47-141)||(15464532-15464628)
chr5 (47-140)||(11916972-11917068)
chr5 (30-141)||(14520230-14520343)
chr5 (56-142)||(17003970-17004058)
chr5 (47-120)||(3880321-3880396)
chr5 (47-138)||(12084176-12084269)
chr5 (47-141)||(19588746-19588843)
chr5 (59-142)||(28832258-28832343)
chr5 (59-142)||(42127423-42127508)
chr5 (78-137)||(4410241-4410301)
chr5 (62-142)||(31300612-31300694)
chr5 (78-137)||(15552464-15552524)
chr5 (78-137)||(31179371-31179431)
chr5 (78-137)||(31542953-31543013)
chr5 (78-137)||(31545299-31545359)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (19-300)||(9604-9882)
scaffold0355 (199-278)||(28-107)
scaffold0355 (19-55)||(3809-3845)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (19-300)||(25445050-25445332)
chr1 (19-300)||(39445342-39445623)
chr1 (19-300)||(44023835-44024115)
chr1 (19-296)||(41398084-41398359)
chr1 (19-300)||(1054973-1055254)
chr1 (19-245)||(41390483-41390704)
chr1 (47-297)||(24787366-24787617)
chr1 (24-300)||(43988429-43988708)
chr1 (47-254)||(24202770-24202973)
chr1 (47-141)||(19358844-19358939)
chr1 (47-141)||(19361433-19361528)
chr1 (47-141)||(19380073-19380168)
chr1 (241-300)||(41386591-41386650)
chr1 (30-141)||(26644881-26644994)
chr1 (56-142)||(47703946-47704034)
chr1 (47-141)||(19072928-19073025)
chr1 (47-141)||(19120818-19120915)
chr1 (47-142)||(16124516-16124614)
chr1 (47-142)||(27104372-27104470)
chr1 (30-141)||(3281708-3281821)
chr1 (56-142)||(9476260-9476348)
chr1 (56-142)||(13598397-13598485)
chr1 (56-142)||(29651810-29651898)
chr1 (49-141)||(37069770-37069864)
chr1 (56-142)||(775671-775759)
chr1 (30-111)||(21536553-21536635)
chr1 (47-119)||(13604624-13604697)
chr1 (59-142)||(47098837-47098922)
chr1 (59-120)||(32889461-32889523)
chr1 (78-138)||(47102874-47102935)
chr1 (78-137)||(9459419-9459479)
chr1 (78-137)||(9463246-9463306)
chr1 (78-137)||(16226386-16226446)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (19-297)||(208-486)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (24-300)||(148921-149198)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (24-300)||(2216-2493)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (24-300)||(19130-19407)
scaffold0197 (24-297)||(14274-14549)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (73-297)||(181980-182204)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (47-141)||(17953-18048)
scaffold0188 (47-141)||(24046-24141)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (109-297)||(300-487)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (241-300)||(34132-34191)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (47-141)||(8420-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (47-140)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (30-141)||(43945-44058)
scaffold0087 (30-141)||(36816-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (56-142)||(2491-2579)
scaffold0006 (56-142)||(5682-5770)
scaffold0006 (47-119)||(133281-133354)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (47-142)||(10728-10826)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (59-119)||(45276-45337)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (258-293)||(13198-13233)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (47-119)||(17286-17360)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (78-111)||(11500-11533)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (78-137)||(269-329)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 39811950 - 39812227
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811950 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 39812049  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacact 218  Q
    || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39812050 ggctgaactggttcaacaatcttct-cggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacact 39812148  T
Q  219 agcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812149 agcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 39812227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32246911 - 32246627
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246911 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 32246812  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct---ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatac 215  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32246811 ggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatac 32246712  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32246711 actagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcatt 32246627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 44312585 - 44312866
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312585 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 44312684  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44312685 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctataca 44312782  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    || |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44312783 cttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 44312866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19344546 - 19344266
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19344546 gttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccaca 19344447  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19344446 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctat 19344350  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19344349 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 19344266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19349404 - 19349124
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19349404 gttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccaca 19349305  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19349304 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctat 19349208  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19349207 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 19349124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 11098928 - 11099176
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  11098928 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 11099026  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 243  Q
    |||||||||||||| ||||   | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  11099027 ggtgttttgttcttcctttcttc-cttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 11099123  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11099124 tgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatc 11099176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14291584 - 14291337
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  14291584 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 14291486  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtt 243  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||  || ||||||||| |||||||||    
T  14291485 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtt 14291388  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 295  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14291387 tgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 14291337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 9296402 - 9296651
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  9296402 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 9296500  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtt 243  Q
    |||||||||||||| ||||    |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  9296501 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt 9296598  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  9296599 tgcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatc 9296651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25398591 - 25398386
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  25398591 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 25398493  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 243  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  25398492 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 25398397  T
Q  244 tgcttggagac 254  Q
    |||||||||||    
T  25398396 tgcttggagac 25398386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25403729 - 25403524
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||     
T  25403729 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctt-ttt 25403631  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 243  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  25403630 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 25403535  T
Q  244 tgcttggagac 254  Q
    |||||||||||    
T  25403534 tgcttggagac 25403524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3491846 - 3491751
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3491846 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 3491751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040059
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 8040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738844
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 40738844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13569425 - 13569331
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  13569425 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21630040 - 21629943
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21630040 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 21629943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 28259161 - 28259274
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||    
T  28259161 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaact 28259260  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  28259261 gggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 10445444 - 10445542
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  10445444 tcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 10445542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17865300 - 17865202
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  17865300 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttg 17865202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20522317 - 20522219
Alignment:
Q  47 tcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20522317 tcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 34682334 - 34682432
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34682334 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 34682432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25407718 - 25407653
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407718 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34388955 - 34388859
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  34388955 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 14699008 - 14699105
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14699008 tcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 14699105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 10707235 - 10707348
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaac 126  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||   ||||    
T  10707235 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaac 10707334  T
Q  127 tgggtcaacaatct 140  Q
    ||||||||||||||    
T  10707335 tgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 8390133 - 8390244
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaac 126  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||   ||||    
T  8390133 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaac 8390232  T
Q  127 tgggtcaacaat 138  Q
    ||||||||||||    
T  8390233 tgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 23078454 - 23078567
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  23078454 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaact 23078553  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||| ||||    
T  23078554 gggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056067
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 119  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattg 31056067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 33528621 - 33528719
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33528621 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 33528719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 39483028 - 39482930
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  39483028 tcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 39482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Original strand, 42039670 - 42039744
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42039670 tcttgtaactcttcgtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattgg 42039744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940307
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 16940307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010972
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 17010972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 33118222 - 33118158
Alignment:
Q  57 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33118222 ttttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 33118158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 36757774 - 36757859
Alignment:
Q  58 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  36757774 tttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 120
Target Start/End: Original strand, 27149306 - 27149369
Alignment:
Q  58 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  27149306 tttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgg 27149369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Original strand, 1345574 - 1345635
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 138  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  1345574 tggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1345635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Original strand, 2838063 - 2838124
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 138  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  2838063 tggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 39784784 - 39785063
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784784 gttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 39784882  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39784883 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctataca 39784982  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784983 ctagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 39785063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 25328240 - 25328520
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328240 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 25328339  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacac 217  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328340 ggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttttcctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatctcttgtgtggttttgctatacac 25328438  T
Q  218 tagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25328439 tag-ttagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccgcacatcatt 25328520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 298
Target Start/End: Original strand, 7289887 - 7290167
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289887 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 7289986  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7289987 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctataca 7290085  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatca 298  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7290086 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatca 7290167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6311417 - 6311140
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6311417 tgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggc 6311318  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactag 220  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6311317 tgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactag 6311220  T
Q  221 cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
      || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6311219 tctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 6311140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35745516 - 35745234
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35745516 gttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccaca 35745417  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  35745416 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctat 35745321  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35745320 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 35745234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 33037808 - 33038056
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcg 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  33037808 tcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-g 33037906  T
Q  147 gtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgtt--ttgttgttgtt 243  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||||||||| |    
T  33037907 gtgttttgttc-ttcttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttg-t 33038003  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33038004 tgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatc 33038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36979473 - 36979225
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  36979473 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 36979375  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtt 243  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  36979374 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 36979277  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36979276 -gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccacacatc 36979225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 4760076 - 4760325
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  4760076 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 4760174  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtt 243  Q
    | |||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  4760175 gatgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 4760273  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  4760274 -gcttggaaaccattt-tgctcattgattaccactatctctagctccacacatc 4760325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 18853168 - 18853418
Alignment:
Q  47 tcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgtt 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18853168 tcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 18853267  T
Q  145 cggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggc-tgttttgttgttgt 242  Q
     |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||  || ||| | |||| |||||||    
T  18853268 -ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgt 18853364  T
Q  243 ttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18853365 ttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 18853418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30655742 - 30655488
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  30655742 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 30655644  T
Q  146 ggtgttttgttctttct---tttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtggttttgctatacactagcttatggctg--ttttgttgt 239  Q
    |||||||| ||  ||||   |||   ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||  |||||||||    
T  30655643 ggtgttttttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgt 30655544  T
Q  240 tgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    || ||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30655543 tg-ttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatc 30655488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Original strand, 10684229 - 10684504
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10684229 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 10684328  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 218  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| |    
T  10684329 tgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatt 10684424  T
Q  219 a-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  10684425 aggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 10684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 10689144 - 10689392
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  10689144 tcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 10689242  T
Q  146 ggtgttttgttctttctt--ttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttg 241  Q
    |||||||||||||| |||  |||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   || || || |||||||||||    
T  10689243 ggtgttttgttcttcctttctta---cttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttg 10689338  T
Q  242 tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10689339 -ttgcttggaaaccattag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 10689392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 18870562 - 18870809
Alignment:
Q  47 tcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgtt 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18870562 tcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttctt 18870661  T
Q  145 cggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtt 243  Q
     |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||  || ||| ||||| ||||||||    
T  18870662 -ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggc-gtttt-ttgttgtt 18870756  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||| |||||||   ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  18870757 tgcttggaaaccattt-aactcatagattaccattatctcttgctccacacatc 18870809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 1261955 - 1262050
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1261955 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctt 1262050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287902
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301159
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26301159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313153
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26313153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403328
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 26403328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 31071230 - 31071326
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  31071230 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctt 31071326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4456124 - 4456050
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456124 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 4456050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696694
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 4696694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7412437 - 7412344
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 138  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  7412437 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 7412344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 19175755 - 19175851
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  19175755 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Original strand, 23799560 - 23799675
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaac 126  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||   ||||    
T  23799560 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaac 23799659  T
Q  127 tgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||||||    
T  23799660 tgggtcaacaatcttg 23799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6127318 - 6127243
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  6127318 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattgg 6127243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 5702483 - 5702581
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5702483 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 139
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752492
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 19752492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 111
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811015
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattagg 18811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 14737538 - 14737819
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737538 gttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 14737637  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc--ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14737638 ggctgaactggatcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctcttttgtgtggttttgctataca 14737735  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737736 ctagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 14737819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28184628 - 28184345
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184628 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtgttgtaaccttttgtaacactttctcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 28184529  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacac 217  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28184528 ggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacac 28184430  T
Q  218 tagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagacca--tttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184429 tagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 28184345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 14742398 - 14742678
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14742398 gttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatatt 14742497  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacac 217  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14742498 ggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatctctttgtgtggttttgctatacac 14742595  T
Q  218 tagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742596 tagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 14742678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 22010658 - 22010939
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010658 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 22010757  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22010758 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctataca 22010855  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    || |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22010856 cttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 22010939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11857098 - 11856814
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11857098 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatat 11856999  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg---ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctat 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11856998 tggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtttttttgttcttccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctat 11856901  T
Q  214 acactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11856900 acactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 11856814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 28155531 - 28155813
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28155531 gttcatgtgtaaagcttgaaagctaaattcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt 28155630  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctataca 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  28155631 ggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctataca 28155729  T
Q  217 ctag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    | || | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155730 caagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 28155813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6438624 - 6438343
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438624 gttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 6438526  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  6438525 tggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatac 6438427  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6438426 actagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccattggttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 6438343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6005542 - 6005260
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6005542 gttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccaca 6005443  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  6005442 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctat 6005347  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6005346 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 6005260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16838869 - 16838587
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  16838869 gttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccaca 16838770  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  16838769 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctat 16838674  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16838673 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttgaaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacatatcatt 16838587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 33330407 - 33330689
Alignment:
Q  21 tcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33330407 tcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt 33330506  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtgg-ttttgctata 214  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  33330507 ggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggtttttgctata 33330603  T
Q  215 cacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33330604 cattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33330689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 33335904 - 33336186
Alignment:
Q  21 tcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  33335904 tcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacatt 33336003  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtgg-ttttgctata 214  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| |||||| |||| |||||    
T  33336004 ggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggtttttactata 33336100  T
Q  215 cacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33336101 cattaggctta-ggctgttttgttgttgttagtttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33336186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Original strand, 5674771 - 5674889
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||     
T  5674771 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc-tcttt 5674869  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttt 164  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5674870 ggtgtgtttgttctttcttt 5674889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343323
Alignment:
Q  96 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtat 193  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| ||     
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcctttatcgtttatcttgtatgc---ttgttag 5343432  T
Q  194 ctctt-gtgtggtttt-gctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 290  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5343431 ctcttagtgtggtttttgctatactttaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 5343333  T
Q  291 acacatcatt 300  Q
    ||||||||||    
T  5343332 acacatcatt 5343323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 5757462 - 5757575
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  5757462 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 5757561  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  5757562 gggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21356132 - 21356036
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21356132 tcttgtaactcttagtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 142
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077263
Alignment:
Q  57 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 10077263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 5572241 - 5572339
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  5572241 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 5572339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 142
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086571
Alignment:
Q  58 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 31086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 297
Target Start/End: Original strand, 30125944 - 30126044
Alignment:
Q  197 ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  30125944 ttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttgg-ctcatagattatcactacctcttgctccacaca 30126042  T
Q  296 tc 297  Q
    ||    
T  30126043 tc 30126044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  57 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31979610 - 31979512
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31979610 tcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31979512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22709041
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 119  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattg 22709041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18232942 - 18232867
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232942 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Original strand, 21801344 - 21801419
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21801344 tcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattgg 21801419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22963796 - 22963699
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  22963796 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 22963699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 23824597 - 23824694
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  23824597 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 23824694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017567
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata-ttggttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttg 5017567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936586
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 31936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 31109545 - 31109825
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31109545 gttcatgtgcaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatatt 31109644  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacact 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31109645 ggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttccttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacact 31109744  T
Q  219 agcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31109745 ag-ttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctgcacacatcatt 31109825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12406455 - 12406174
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12406455 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatat 12406356  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12406355 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctataca 12406258  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12406257 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 12406174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12397035 - 12396754
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12397035 gttcatgtgtaaagattaaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatat 12396936  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12396935 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccctttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctataca 12396838  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12396837 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 12396754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 24024288 - 24024570
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024288 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaacattttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 24024387  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg-ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |    
T  24024388 ggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatata 24024486  T
Q  217 ctag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24024487 ctagtcata-ggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 24024570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19992437 - 19992158
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992437 gttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 19992338  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  19992337 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatac 19992239  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19992238 actagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacctgctccacacatc 19992158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 52 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4866820 - 4866572
Alignment:
Q  52 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4866820 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgtt 4866722  T
Q  152 ttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc-tcttgtgtgg-ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttg 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  4866721 ttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttg 4866623  T
Q  250 gagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4866622 gagaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 4866572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 21812199 - 21812478
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagctt-ga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21812199 gttcatgtgtaaagctttgacaagctagagtcttggaaccttttgtaagactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccaca 21812297  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctata 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  21812298 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttaactctttgtgtggttttgctata 21812396  T
Q  215 cactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21812397 cactagcttagggctg-tttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 21812478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 20357519 - 20357797
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20357519 gttcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccata 20357618  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatac 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||   ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  20357619 ttggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtattttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctac 20357715  T
Q  216 actagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20357716 actagtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 20357797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2058061 - 2057806
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  2058061 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 2057963  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg----tttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgt 239  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||  || ||| | |||||||||    
T  2057962 ggtgttttgttcttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgt 2057863  T
Q  240 tgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2057862 tgtttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 2057806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Original strand, 24261288 - 24261563
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24261288 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 24261387  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 218  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| |    
T  24261388 tgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatt 24261483  T
Q  219 a-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24261484 aggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 24261563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Original strand, 24266167 - 24266442
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24266167 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 24266266  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 218  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| |    
T  24266267 tgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatt 24266362  T
Q  219 a-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24266363 aggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 24266442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16880192 - 16879918
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt 122  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16880192 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct 16880093  T
Q  123 gaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 219  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  16880092 gaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatta 16879997  T
Q  220 -gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16879996 ggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 16879918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16885048 - 16884774
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt 122  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16885048 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct 16884949  T
Q  123 gaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 219  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  16884948 gaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatta 16884853  T
Q  220 -gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16884852 ggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 16884774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 1533445 - 1533690
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  1533445 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttatt- 1533543  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggct-gttttgttgttgtt 243  Q
    ||||| ||||||||||| |||   |||||| |||||  |||||||   |||||| |||||| ||||| ||||||||  |  |||| |||||||||||| |    
T  1533544 ggtgtgtttgttctttc-tttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt-tgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttg-t 1533638  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  1533639 tgcttggaaac--ttttttctcattgattaccactatattttgctccacacatc 1533690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18408859 - 18408742
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18408859 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 18408762  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttt 164  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  18408761 ggtgtgtttgttctttcttt 18408742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21639904 - 21639701
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  21639904 tcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 21639806  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 243  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   |||||  |||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  21639805 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 21639712  T
Q  244 tgcttggagac 254  Q
    |||||||||||    
T  21639711 tgcttggagac 21639701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18413735 - 18413619
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18413735 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 18413639  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttt 164  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  18413638 ggtgtgtttgttctttcttt 18413619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21646102 - 21645899
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  21646102 tcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 21646004  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 243  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||||   ||| |||| |||  |||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  21646003 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtttg---ttttgtat-tctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 21645910  T
Q  244 tgcttggagac 254  Q
    |||||||||||    
T  21645909 tgcttggagac 21645899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29159917 - 29159802
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaac 126  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||    
T  29159917 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaac 29159818  T
Q  127 tgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||||||    
T  29159817 tgggtcaacaatcttg 29159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  57 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 33332450 - 33332548
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  33332450 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 33332548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 46516310 - 46516408
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  46516310 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 46516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 49091758 - 49091660
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  49091758 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttg 49091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 44848685 - 44848781
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||||||||    
T  44848685 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 2647696 - 2647794
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  2647696 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttg 2647794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190106
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9190106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284088
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20284088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 56044 - 55947
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  56044 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 55947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2580503 - 2580389
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||   ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||| |    
T  2580503 aagcttgcaagctattttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaatt 2580404  T
Q  128 gggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||    
T  2580403 gggtcaacaatcttg 2580389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960839
Alignment:
Q  58 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattg 35960839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185263
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 4796667 - 4796765
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| ||||||||||    
T  4796667 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttg 4796765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 120
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617300
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattgg 28617300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  62 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgc--tctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2479421 - 2479337
Alignment:
Q  58 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    |||||||||||||||||||    
T  2479421 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  57 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatct 140  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctc--ctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 45357258 - 45357539
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45357258 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatatt 45357357  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacac 217  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  45357358 ggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctttacac 45357456  T
Q  218 tagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||  || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45357457 tagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcatt 45357539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 9224368 - 9224649
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224368 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 9224467  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9224468 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctataca 9224565  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9224566 ctagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 9224649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 9229155 - 9229436
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229155 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 9229254  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9229255 tggctgaactgggttaacaatcttct-cggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctataca 9229352  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9229353 ctagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 9229436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5732788 - 5732504
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732788 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 5732689  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  5732688 ggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggttttactat 5732591  T
Q  214 acactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5732590 acactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcatt 5732504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 45347778 - 45348060
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagag-tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45347778 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatat 45347877  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45347878 tggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctttaca 45347976  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45347977 ctagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcatt 45348060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18855850 - 18855569
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855850 gttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 18855752  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18855751 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatac 18855653  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855652 actagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 18855569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51520581 - 51520299
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520581 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 51520482  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  51520481 tggcagaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtatggttttgctataca 51520383  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  51520382 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 51520299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 56146672 - 56146954
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146672 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 56146771  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  56146772 tggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctataca 56146870  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  56146871 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 56146954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3814147 - 3813866
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814147 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 3814048  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtttt-gctataca 216  Q
    || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||| || |||||    
T  3814047 ggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtggtttttgcgataca 3813950  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3813949 ctagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgctctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 3813866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24742036 - 24741788
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  24742036 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 24741938  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtt 243  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  24741937 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 24741840  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24741839 -gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccacacatc 24741788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29760737 - 29760490
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  29760737 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 29760639  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgttt 244  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||| ||    
T  29760638 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgttg-tt 29760542  T
Q  245 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||||||| ||||||| |  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29760541 gcttggaaaccattt-tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatc 29760490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468625
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 28468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10047476 - 10047378
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10047476 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 10047378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 39246091 - 39245993
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  39246091 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 39245993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 36315230 - 36315327
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  36315230 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36315327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 36329439 - 36329536
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  36329439 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36329536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 31985635 - 31985730
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31985635 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31985730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 16623293 - 16623391
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16623293 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 16623391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 5396655 - 5396768
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||    
T  5396655 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaact 5396754  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  5396755 gggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152537
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 38152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269291
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttgtt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgtt 5269291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 3796502 - 3796616
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaac 126  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||    
T  3796502 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaac 3796601  T
Q  127 tgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||||||||    
T  3796602 tgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  57 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  57 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333831
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 24333831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3777645 - 3777550
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 140  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||    
T  3777645 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Original strand, 16630680 - 16630755
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||    
T  16630680 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattgg 16630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaaca 136  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862120
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 25862120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Original strand, 39774305 - 39774380
Alignment:
Q  47 tcttgtaacct-tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  39774305 tcttgtaacctatttgtatcactttcattttagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattgg 39774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 22173156 - 22173437
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173156 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 22173255  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22173256 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttattt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctataca 22173353  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22173354 ctagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 22173437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18656558 - 18656274
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656558 gttcatgtgtaaagcttgaatgctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 18656459  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  18656458 ggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggtttttctat 18656361  T
Q  214 acactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18656360 acactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcatt 18656274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 28503841 - 28504107
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28503841 tgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggc 28503940  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactag 220  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||          |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28503941 tgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctt----------tcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactag 28504029  T
Q  221 cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
       | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28504030 tcaagggctgttttgttgttg-ttgcttggaaaccattt-ttctcatagattatcactaccttttgctccacacatcatt 28504107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7167340 - 7167092
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  7167340 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 7167242  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgttt 244  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| ||    
T  7167241 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgttg-tt 7167144  T
Q  245 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7167143 gcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 7167092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 2671587 - 2671836
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  2671587 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 2671685  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtt 243  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  2671686 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt 2671783  T
Q  244 tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2671784 tgcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 2671836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 2677049 - 2677330
Alignment:
Q  21 tcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2677049 tcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt 2677148  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatac 215  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  2677149 ggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatac 2677245  T
Q  216 acta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2677246 attaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 2677330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 2672893 - 2673174
Alignment:
Q  21 tcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2672893 tcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt 2672992  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatac 215  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  2672993 ggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatac 2673089  T
Q  216 acta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2673090 attaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttactctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 2673174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8512337 - 8512058
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8512337 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 8512238  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccg-cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacac 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||| ||||| |||     
T  8512237 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttgtatg---cttgttaactcttagtgtggttgtgctacacat 8512141  T
Q  218 ta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8512140 taggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 8512058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8517217 - 8516938
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8517217 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 8517118  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccg-cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacac 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||| ||||| |||     
T  8517117 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttgtatg---cttgttaactcttagtgtggttgtgctacacat 8517021  T
Q  218 ta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8517020 taggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 8516938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24968232 - 24967957
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaa-agctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |    
T  24968232 gttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaaattaagccaca 24968133  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  24968132 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctat 24968037  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 293  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24968036 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 8739064 - 8739314
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  8739064 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 8739162  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgt 242  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || || ||  || ||| | |||||||||| |    
T  8739163 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttat 8739260  T
Q  243 ttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  8739261 ttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatc 8739314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 9091302 - 9091552
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  9091302 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 9091400  T
Q  146 ggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgt 242  Q
    |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || || ||  || ||| | |||||||||| |    
T  9091401 ggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttat 9091498  T
Q  243 ttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  9091499 ttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatc 9091552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32475603 - 32475330
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt 122  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32475603 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct 32475505  T
Q  123 gaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 219  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  32475504 gaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatta 32475409  T
Q  220 -gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  32475408 ggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 32475330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32480461 - 32480188
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt 122  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32480461 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct 32480363  T
Q  123 gaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 219  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  32480362 gaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatta 32480267  T
Q  220 -gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  32480266 ggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 32480188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Original strand, 40372796 - 40372908
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  40372796 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 40372894  T
Q  146 ggtgttttgttctt 159  Q
    ||||||||||||||    
T  40372895 ggtgttttgttctt 40372908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8477458 - 8477340
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  8477458 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 8477360  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttt 164  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  8477359 ggtgtgtttgttctttcttt 8477340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207776
Alignment:
Q  93 ctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-ctttt-accgcttatcttgtttgtgctttgg 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |  | ||||||||||  ||||| |     
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtta-tgctt-gt 10207887  T
Q  191 tatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgct 288  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10207886 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 10207788  T
Q  289 ccacacatcatt 300  Q
    ||||||||||||    
T  10207787 ccacacatcatt 10207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 164
Target Start/End: Original strand, 26928592 - 26928709
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  26928592 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatct--ttt 26928689  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttt 164  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  26928690 ggtgtgtttgttctttcttt 26928709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1306044 - 1305949
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1306044 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1305949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Original strand, 28501674 - 28501750
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501674 tgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 8370477 - 8370573
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8370477 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 27974943 - 27975039
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27974943 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 32143417 - 32143321
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  32143417 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 32143321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 18552873 - 18552971
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18552873 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 18552971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16264463 - 16264350
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  16264463 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 16264364  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
     |||||||||||||    
T  16264363 aggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21711319 - 21711222
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21711319 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 21711222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27453054 - 27452958
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  27453054 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 27452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986533
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27986533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36029190 - 36029094
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36029190 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 138
Target Start/End: Original strand, 1736295 - 1736389
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  1736295 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 30709780 - 30709877
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30709780 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Original strand, 40592755 - 40592870
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaac 126  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||    
T  40592755 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaac 40592854  T
Q  127 tgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||||||    
T  40592855 tgggtcaacaatcttg 40592870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 48438311 - 48438236
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48438311 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 48438236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 3715992 - 3716090
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3715992 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 3716090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Original strand, 6794704 - 6794778
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6794704 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 6794778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26299085 - 26298987
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  26299085 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 26298987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 47923896 - 47923994
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47923896 tcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417578
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 1417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25795878 - 25795781
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  25795878 tcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328444
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttg 3328444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466290
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 37466290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 40844748 - 40844674
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40844748 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattgg 40844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 116
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4386988
Alignment:
Q  75 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcata 4386988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 40372980 - 40373043
Alignment:
Q  231 ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 295  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40372980 ttttgatgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 40373043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 120
Target Start/End: Original strand, 3323693 - 3323755
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3323693 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 24695154 - 24695252
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  24695154 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 24695252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894082
Alignment:
Q  74 atattggattggagagctgctctctcccccagattagg 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactagg 53894082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 35023 - 35304
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35023 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 35122  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35123 tggctgaactgggttaacaatcttct-cggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctataca 35220  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35221 ctagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 35304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15044809 - 15044529
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15044809 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatatt 15044710  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacact 218  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15044709 ggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacact 15044611  T
Q  219 agcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  15044610 agtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctctacacgtcatt 15044529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43592403 - 43592121
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592403 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 43592304  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43592303 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctataca 43592205  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43592204 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 43592121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43598848 - 43598566
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598848 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 43598749  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43598748 tggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctataca 43598650  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43598649 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 43598566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43604340 - 43604058
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604340 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 43604241  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43604240 tggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctataca 43604142  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43604141 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 43604058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43609832 - 43609550
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609832 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 43609733  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43609732 tggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctataca 43609634  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43609633 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 43609550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27445094 - 27444812
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27445094 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatat 27444995  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27444994 tgcctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctataca 27444896  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27444895 ctagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 27444812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27449938 - 27449656
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27449938 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatat 27449839  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27449838 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctataca 27449740  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27449739 ctagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctccacatatcatt 27449656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 1457123 - 1457404
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1457123 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacat 1457222  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1457223 tggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttcctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctataca 1457320  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1457321 ctagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 1457404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 28807535 - 28807817
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28807535 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagattcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt 28807633  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg--ttttgctata 214  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||| ||||  ||||||||||    
T  28807634 ggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgagtggttttttgctata 28807732  T
Q  215 cactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807733 cactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 28807817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 37556583 - 37556863
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37556583 gttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacat 37556682  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  37556683 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatac 37556781  T
Q  216 actag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    || || | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556782 acaagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatc 37556863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 37561405 - 37561685
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37561405 gttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacat 37561504  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  37561505 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatac 37561603  T
Q  216 actag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    || || | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561604 acaagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatc 37561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30631531 - 30631250
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30631531 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccaca 30631432  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttctt--ttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||   |||||||||||| ||||||| ||||| | | |||| |||||||||    
T  30631431 ttggctgaactgagtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctttctta---cttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctat 30631336  T
Q  214 acactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||||||  || |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30631335 acactagtctagggctgttttgttgttg-ttgcttgaaaaccatttgttctcatagattaccactatctcttgctccacacatcatt 30631250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2785500 - 2785218
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2785500 gttcatgagtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccaca 2785401  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  2785400 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctat 2785305  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2785304 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 2785218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33791441 - 33791159
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33791441 gttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctttcccccagattaggccaca 33791342  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || |||| | ||||||||||||||    
T  33791341 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctctatatgtggttttgctat 33791246  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33791245 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33791159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 31401815 - 31402092
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  31401815 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattggc 31401914  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||||||||||| |||| |    
T  31401915 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctttacatt 31402010  T
Q  219 a-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31402011 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 31402092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31180334 - 31180138
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31180334 tgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggc 31180235  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacacta 219  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31180234 tgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttc-tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 31396958 - 31397235
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31396958 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 31397057  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttt-tgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  31397058 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctttacatta 31397154  T
Q  220 -gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
     ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31397155 ggctta-ggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 31397235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33768304 - 33768022
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33768304 gttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccaca 33768205  T
Q  117 ttggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtggttttgctat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||| ||| ||    ||| || |||| | ||||||||||||||    
T  33768204 ttggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctgtatg---cttgttagctctatatgtggttttgctat 33768109  T
Q  214 acacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33768108 acattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33768022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38192269 - 38192064
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  38192269 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 38192171  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 243  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  38192170 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 38192075  T
Q  244 tgcttggagac 254  Q
    |||||||||||    
T  38192074 tgcttggagac 38192064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38219494 - 38219289
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  38219494 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 38219396  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtt 243  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |    
T  38219395 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-t 38219300  T
Q  244 tgcttggagac 254  Q
    |||||||||||    
T  38219299 tgcttggagac 38219289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24135944 - 24135740
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  24135944 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt- 24135846  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgttt 244  Q
    ||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||  |||||||   | |||  |||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  24135845 ggtgtgtttgttcttccttttctagcttatcttgtt--tgctttgtattatct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgttt 24135750  T
Q  245 gcttggagac 254  Q
    ||||||||||    
T  24135749 gcttggagac 24135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35387758 - 35387663
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35387758 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctt 35387663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 9353333 - 9353429
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9353333 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 36932351 - 36932447
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  36932351 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10281865 - 10281751
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaac 126  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||    
T  10281865 aagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaac 10281766  T
Q  127 tgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||||||||    
T  10281765 tgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15464628 - 15464532
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15464628 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Original strand, 11916972 - 11917068
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  11916972 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14520343 - 14520230
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||    
T  14520343 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaact 14520244  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  14520243 gggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004058
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 17004058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3880396 - 3880321
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  3880396 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattgg 3880321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 138
Target Start/End: Original strand, 12084176 - 12084269
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 138  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||||||||||||||||    
T  12084176 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19588843 - 19588746
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19588843 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832258
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttg 28832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127508
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 42127508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 142
Target Start/End: Original strand, 31300612 - 31300694
Alignment:
Q  62 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31300612 taacactttcatcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31300694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 9604 - 9882
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 9703  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacact 218  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||    
T  9704 ggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctcttgtgtggttttgctatatact 9800  T
Q  219 agcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9801 agcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 278
Target Start/End: Original strand, 28 - 107
Alignment:
Q  199 gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcattgattatcact 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Original strand, 3809 - 3845
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaac 55  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3809 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaac 3845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 25445050 - 25445332
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445050 gttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 25445149  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  25445150 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttacgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatac 25445248  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25445249 actagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcgcttgctccacacatcatt 25445332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39445623 - 39445342
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445623 gttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 39445525  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  39445524 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatac 39445426  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445425 actagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 39445342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 44023835 - 44024115
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023835 gttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 44023933  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctataca 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  44023934 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttaccatttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctataca 44024032  T
Q  217 ctagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44024033 ctagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcagttgctccacacatcatt 44024115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41398359 - 41398084
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398359 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 41398260  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg--ttttgctatac 215  Q
    || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||      |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  41398259 ggctgacctgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctt------cttatcttgtttatgctttggtatctctttgtgtggttttttgctatac 41398167  T
Q  216 actagcttatggctgtt---ttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacat 296  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398166 actag-ttagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccatatgttctcattgattatcactatcacttgctccacacat 41398084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 1054973 - 1055254
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1054973 gttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatat 1055071  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  1055072 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatac 1055170  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055171 actagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagacatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 1055254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41390704 - 41390483
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390704 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt 41390605  T
Q  119 ggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg--ttttgctatac 215  Q
    || ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||      |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  41390604 ggctgatctgggtcaacaatctt-ctcgatgttttgttcttcctt------cttatcttgtttatgctttgatatctctttgtgtggttttttgctatac 41390512  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttg 245  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41390511 actag-ttagggctgttttgttgttgtttg 41390483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 24787366 - 24787617
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcg 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  24787366 tcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-g 24787464  T
Q  147 gtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg--ttttgttgttgt- 242  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||  || |||||  ||||||||||||     
T  24787465 gtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgtt 24787562  T
Q  243 -ttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24787563 gttgcttggaaaccattt-tgctcatttattaccactatctcttgctccacacatc 24787617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 43988429 - 43988708
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43988429 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 43988528  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccg--cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacac 217  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||   |   ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||| |||||||||     
T  43988529 tgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttgtgctatacat 43988625  T
Q  218 ta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43988626 taggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 43988708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Original strand, 24202770 - 24202973
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttc 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  24202770 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttt 24202868  T
Q  146 ggtgt-tttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgttt 244  Q
    ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||  |||||||   |||||  |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24202869 ggtgtgtttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgttt 24202963  T
Q  245 gcttggagac 254  Q
    ||||||||||    
T  24202964 gcttggagac 24202973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 19358844 - 19358939
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19358844 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 19361433 - 19361528
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19361433 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19361528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 19380073 - 19380168
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19380073 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19380168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41386650 - 41386591
Alignment:
Q  241 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386650 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 41386591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 26644881 - 26644994
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  26644881 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 26644980  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  26644981 gggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704034
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19073025 - 19072928
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19073025 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19120915 - 19120818
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19120915 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 16124516 - 16124614
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  16124516 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 16124614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 27104372 - 27104470
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||| |||||||||||||    
T  27104372 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 27104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3281821 - 3281708
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  3281821 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 3281722  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||| ||||||    
T  3281721 gggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476260
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9476260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598397
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 13598397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651810
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttg 29651810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37069864 - 37069770
Alignment:
Q  49 ttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  37069864 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775671
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 21536553 - 21536635
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 111  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536553 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 21536635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 119
Target Start/End: Original strand, 13604624 - 13604697
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 119  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13604624 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 13604697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098922
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47098922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 32889523 - 32889461
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  32889523 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattgg 32889461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Original strand, 47102874 - 47102935
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 138  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  47102874 tggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 47102935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 208
Alignment:
Q  19 gttcatgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  486 gttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatat 388  T
Q  118 tggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  387 tggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatac 289  T
Q  216 actagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  288 actagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcaccatcacttgctccacacatc 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 148921 - 149198
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  148921 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggc 149020  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |    
T  149021 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctatacatt 149116  T
Q  219 a-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  149117 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 149198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 2216 - 2493
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  2216 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggc 2315  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |    
T  2316 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctatacatt 2411  T
Q  219 a-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2412 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctccacacatcatt 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 19130 - 19407
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  19130 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagctgctctctcccccagattaggccacaatggc 19229  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |    
T  19230 tgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggttttgctatacatt 19325  T
Q  219 a-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19326 aggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 19407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Original strand, 14274 - 14549
Alignment:
Q  24 tgtgtaaagcttga-aagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14274 tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc 14373  T
Q  122 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacact 218  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| |    
T  14374 tgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacatt 14469  T
Q  219 a-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14470 aggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 14549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 297
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182204
Alignment:
Q  73 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  171 ttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcat 267  Q
    ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||    
T  182080 ttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcat 182174  T
Q  268 tgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
     ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  182175 agattacctctatctcttgctccacacatc 182204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 17953 - 18048
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17953 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 24046 - 24141
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24046 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 300 - 487
Alignment:
Q  109 aggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttt-taccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 206  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttctttcta--gcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggtt 395  T
Q  207 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtt--tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 297  Q
    |||||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  396 ttgctcctcactagtttagggctgtttt-ttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 300
Target Start/End: Original strand, 34132 - 34191
Alignment:
Q  241 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 34191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 8420 - 8516
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 141  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8420 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 85779 - 85684
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 140  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  85779 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 43945 - 44058
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   |||||    
T  43945 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaact 44044  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  44045 gggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 36816 - 36929
Alignment:
Q  30 aagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaact 127  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   |||||    
T  36816 aagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaact 36915  T
Q  128 gggtcaacaatctt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  36916 gggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2491
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttg 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5682
Alignment:
Q  56 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 119
Target Start/End: Original strand, 133281 - 133354
Alignment:
Q  47 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 119  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  133281 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 133354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10826 - 10728
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  10826 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45276
Alignment:
Q  59 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 119  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattg 45276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13198
Alignment:
Q  258 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 13198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 17360 - 17286
Alignment:
Q  47 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  17360 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattg 17286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11500
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccagactagg 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  78 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University