View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1946_low_43 (Length: 428)

Name: NF1946_low_43
Description: NF1946
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1946_low_43
NF1946_low_43
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (9-425)||(39811812-39812227)
chr2 (26-428)||(32246627-32247031)
chr2 (124-428)||(44312563-44312866)
chr2 (90-425)||(11098843-11099176)
chr2 (39-425)||(19344266-19344655)
chr2 (39-425)||(19349124-19349513)
chr2 (90-423)||(14291337-14291669)
chr2 (90-425)||(9296317-9296651)
chr2 (90-269)||(3491751-3491930)
chr2 (90-382)||(25398386-25398675)
chr2 (90-382)||(25403524-25403813)
chr2 (14-90)||(11098714-11098790)
chr2 (184-270)||(8040059-8040147)
chr2 (14-90)||(9296189-9296265)
chr2 (14-90)||(14291722-14291798)
chr2 (90-239)||(25407653-25407802)
chr2 (187-269)||(40738844-40738926)
chr2 (184-266)||(13569331-13569415)
chr2 (184-270)||(21629943-21630030)
chr2 (183-270)||(20522219-20522308)
chr2 (186-269)||(28259189-28259274)
chr2 (184-270)||(10445454-10445542)
chr2 (184-270)||(17865202-17865290)
chr2 (184-270)||(34682344-34682432)
chr2 (28-90)||(25409860-25409922)
chr2 (184-268)||(34388859-34388945)
chr2 (184-270)||(14699018-14699105)
chr2 (184-268)||(10707262-10707348)
chr2 (184-266)||(8390160-8390244)
chr2 (184-247)||(31056067-31056131)
chr2 (28-90)||(3491981-3492043)
chr2 (190-269)||(23078486-23078567)
chr2 (184-270)||(16940219-16940307)
chr2 (184-270)||(17010884-17010972)
chr2 (185-248)||(33118158-33118222)
chr2 (184-270)||(33528631-33528719)
chr2 (184-270)||(39482930-39483018)
chr2 (189-248)||(42039684-42039744)
chr2 (186-269)||(36757774-36757859)
chr2 (90-139)||(40738963-40739012)
chr2 (186-248)||(27149306-27149369)
chr2 (28-90)||(36757570-36757630)
chr2 (28-90)||(39483162-39483222)
chr2 (28-90)||(40739063-40739123)
chr2 (206-266)||(1345574-1345635)
chr2 (206-266)||(2838063-2838124)
chr2 (30-90)||(21630174-21630232)
chr2 (28-68)||(20522471-20522511)
chr2 (27-90)||(23078278-23078339)
chr2 (27-90)||(29867780-29867840)
chr2 (206-265)||(35215586-35215646)
chr2 (206-265)||(35217963-35218023)
chr2 (28-90)||(41586358-41586419)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (14-428)||(14737406-14737819)
chr6 (9-428)||(22010521-22010939)
chr6 (9-428)||(11856814-11857235)
chr6 (14-428)||(14742266-14742678)
chr6 (20-428)||(28184345-28184757)
chr6 (26-428)||(28155412-28155813)
chr6 (26-428)||(6438343-6438743)
chr6 (39-428)||(6005260-6005650)
chr6 (39-428)||(16838587-16838977)
chr6 (39-428)||(33330297-33330689)
chr6 (39-428)||(33335794-33336186)
chr6 (90-292)||(5674685-5674889)
chr6 (224-428)||(5343323-5343527)
chr6 (14-90)||(5674557-5674633)
chr6 (186-269)||(5757490-5757575)
chr6 (185-270)||(10077176-10077263)
chr6 (189-269)||(21356036-21356118)
chr6 (186-270)||(31086485-31086571)
chr6 (325-425)||(30125944-30126044)
chr6 (184-270)||(5572251-5572339)
chr6 (185-269)||(4629954-4630040)
chr6 (187-247)||(22709041-22709102)
chr6 (184-270)||(31979512-31979600)
chr6 (184-248)||(18232867-18232932)
chr6 (184-248)||(21801354-21801419)
chr6 (184-270)||(22963699-22963786)
chr6 (184-270)||(23824607-23824694)
chr6 (90-141)||(22709137-22709188)
chr6 (187-270)||(5017482-5017567)
chr6 (206-270)||(31936586-31936651)
chr6 (28-90)||(5017304-5017364)
chr6 (28-88)||(22709241-22709299)
chr6 (206-265)||(12195515-12195575)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (16-428)||(12406174-12406585)
chr7 (9-428)||(12396754-12397172)
chr7 (9-428)||(31109407-31109825)
chr7 (9-428)||(24024151-24024570)
chr7 (39-425)||(19992158-19992544)
chr7 (181-428)||(4866572-4866819)
chr7 (39-425)||(21812092-21812478)
chr7 (90-425)||(20357463-20357797)
chr7 (90-425)||(2057806-2058147)
chr7 (39-425)||(24266054-24266442)
chr7 (39-425)||(24261175-24261563)
chr7 (90-425)||(1533359-1533690)
chr7 (39-425)||(16884774-16885162)
chr7 (39-425)||(16879918-16880306)
chr7 (90-382)||(21639701-21639988)
chr7 (90-292)||(18408742-18408943)
chr7 (90-382)||(21645899-21646186)
chr7 (14-88)||(4873310-4873384)
chr7 (90-292)||(18413619-18413819)
chr7 (14-90)||(20357334-20357410)
chr7 (14-90)||(1533231-1533307)
chr7 (14-90)||(2058202-2058278)
chr7 (185-268)||(21983285-21983370)
chr7 (184-270)||(29159802-29159890)
chr7 (184-270)||(33332460-33332548)
chr7 (184-270)||(46516320-46516408)
chr7 (184-270)||(49091660-49091748)
chr7 (28-90)||(21640039-21640101)
chr7 (28-90)||(21646237-21646299)
chr7 (187-270)||(9190021-9190106)
chr7 (187-270)||(20284088-20284173)
chr7 (186-269)||(44848696-44848781)
chr7 (184-270)||(2647706-2647794)
chr7 (28-90)||(18408993-18409055)
chr7 (187-270)||(2580389-2580474)
chr7 (184-270)||(55947-56034)
chr7 (28-90)||(18413869-18413931)
chr7 (186-247)||(35960839-35960901)
chr7 (187-270)||(9185178-9185263)
chr7 (206-248)||(28617258-28617300)
chr7 (190-269)||(47263678-47263757)
chr7 (186-269)||(2479337-2479421)
chr7 (184-270)||(4796677-4796765)
chr7 (28-90)||(20284318-20284378)
chr7 (28-90)||(23402821-23402881)
chr7 (29-90)||(4796477-4796536)
chr7 (185-268)||(21988909-21988992)
chr7 (28-88)||(44847933-44847991)
chr7 (31-90)||(21989137-21989194)
chr7 (206-265)||(31155911-31155971)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (17-428)||(22173027-22173437)
chr3 (26-428)||(18656274-18656677)
chr3 (90-428)||(28503780-28504107)
chr3 (90-425)||(7167092-7167425)
chr3 (39-428)||(2676939-2677330)
chr3 (39-428)||(2672783-2673174)
chr3 (90-425)||(2671502-2671836)
chr3 (39-428)||(8512058-8512450)
chr3 (39-428)||(8516938-8517330)
chr3 (39-421)||(24967957-24968340)
chr3 (93-425)||(8738982-8739314)
chr3 (93-425)||(9091220-9091552)
chr3 (90-226)||(28501613-28501750)
chr3 (90-292)||(8477340-8477545)
chr3 (39-425)||(32475330-32475717)
chr3 (39-425)||(32480188-32480575)
chr3 (90-287)||(40372712-40372908)
chr3 (90-292)||(26928507-26928709)
chr3 (221-428)||(10207776-10207983)
chr3 (14-90)||(2671373-2671449)
chr3 (14-90)||(8477598-8477674)
chr3 (14-90)||(8738850-8738926)
chr3 (14-90)||(40372583-40372659)
chr3 (90-269)||(32143321-32143501)
chr3 (14-90)||(7167478-7167555)
chr3 (14-90)||(9091088-9091164)
chr3 (90-269)||(1305949-1306128)
chr3 (14-90)||(28501483-28501560)
chr3 (14-90)||(28503650-28503727)
chr3 (90-269)||(27452958-27453138)
chr3 (186-269)||(8370488-8370573)
chr3 (186-269)||(27974954-27975039)
chr3 (184-270)||(18552883-18552971)
chr3 (187-269)||(27986449-27986533)
chr3 (186-270)||(21711222-21711308)
chr3 (184-268)||(36029094-36029180)
chr3 (186-269)||(16264350-16264435)
chr3 (184-266)||(1736305-1736389)
chr3 (187-269)||(33386669-33386753)
chr3 (184-269)||(30709790-30709877)
chr3 (184-248)||(48438236-48438301)
chr3 (184-270)||(3716002-3716090)
chr3 (184-270)||(40592782-40592870)
chr3 (186-248)||(6794715-6794778)
chr3 (187-270)||(1417493-1417578)
chr3 (30-90)||(1306179-1306239)
chr3 (184-270)||(26298987-26299075)
chr3 (184-270)||(47923906-47923994)
chr3 (184-269)||(25795781-25795868)
chr3 (187-270)||(3328359-3328444)
chr3 (187-270)||(37466290-37466375)
chr3 (187-269)||(39039995-39040079)
chr3 (203-244)||(4386947-4386988)
chr3 (184-248)||(40844674-40844738)
chr3 (28-87)||(4386774-4386831)
chr3 (359-423)||(40372980-40373043)
chr3 (28-90)||(23392106-23392166)
chr3 (28-90)||(24694963-24695023)
chr3 (28-90)||(26928396-26928456)
chr3 (28-90)||(27986253-27986313)
chr3 (28-90)||(36029322-36029382)
chr3 (28-90)||(40592579-40592639)
chr3 (187-248)||(3323693-3323755)
chr3 (202-239)||(53894082-53894119)
chr3 (28-87)||(21711454-21711511)
chr3 (28-87)||(23410529-23410586)
chr3 (184-270)||(24695164-24695252)
chr3 (206-265)||(38210569-38210629)
chr3 (31-90)||(47923704-47923761)
chr3 (206-265)||(50494198-50494258)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (9-428)||(43592121-43592540)
chr5 (9-428)||(1456986-1457404)
chr5 (9-428)||(43598566-43598985)
chr5 (9-428)||(43604058-43604477)
chr5 (9-428)||(43609550-43609969)
chr5 (9-428)||(27444812-27445231)
chr5 (9-428)||(27449656-27450075)
chr5 (9-428)||(15044529-15044947)
chr5 (39-428)||(28807429-28807817)
chr5 (39-425)||(37556478-37556863)
chr5 (39-425)||(37561300-37561685)
chr5 (91-428)||(30631250-30631586)
chr5 (90-347)||(31180138-31180394)
chr5 (39-428)||(2785218-2785608)
chr5 (39-428)||(33791159-33791549)
chr5 (39-428)||(31396843-31397235)
chr5 (39-428)||(31401700-31402092)
chr5 (150-428)||(33768022-33768299)
chr5 (90-382)||(24135740-24136028)
chr5 (90-382)||(38192064-38192353)
chr5 (90-382)||(38219289-38219578)
chr5 (14-90)||(30631640-30631716)
chr5 (90-269)||(35387663-35387842)
chr5 (14-90)||(31180447-31180523)
chr5 (14-90)||(24136080-24136156)
chr5 (186-269)||(9353344-9353429)
chr5 (186-269)||(36932362-36932447)
chr5 (184-269)||(10281751-10281838)
chr5 (28-90)||(35387893-35387955)
chr5 (186-269)||(15464532-15464617)
chr5 (184-268)||(11916982-11917068)
chr5 (184-270)||(17003970-17004058)
chr5 (28-90)||(38219629-38219691)
chr5 (184-248)||(3880321-3880386)
chr5 (186-269)||(14520230-14520315)
chr5 (187-270)||(28832258-28832343)
chr5 (187-270)||(42127423-42127508)
chr5 (184-269)||(19588746-19588833)
chr5 (186-266)||(12084187-12084269)
chr5 (206-265)||(4410241-4410301)
chr5 (28-90)||(24553335-24553395)
chr5 (29-90)||(11181641-11181700)
chr5 (190-270)||(31300612-31300694)
chr5 (28-88)||(7160712-7160770)
chr5 (28-88)||(14520461-14520519)
chr5 (30-90)||(28832486-28832544)
chr5 (39-89)||(33768365-33768417)
chr5 (206-265)||(15552464-15552524)
chr5 (206-265)||(31179371-31179431)
chr5 (206-265)||(31542953-31543013)
chr5 (206-265)||(31545299-31545359)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (9-428)||(9224231-9224649)
chr4 (9-428)||(9229018-9229436)
chr4 (14-428)||(51520299-51520713)
chr4 (26-428)||(45347658-45348060)
chr4 (26-428)||(45357138-45357539)
chr4 (26-428)||(5732504-5732907)
chr4 (14-428)||(3813866-3814278)
chr4 (39-428)||(18855569-18855956)
chr4 (150-428)||(56146677-56146954)
chr4 (90-425)||(24741788-24742121)
chr4 (92-425)||(29760490-29760821)
chr4 (9-96)||(18712590-18712677)
chr4 (14-90)||(24742174-24742250)
chr4 (14-90)||(29760874-29760951)
chr4 (187-269)||(28468542-28468625)
chr4 (184-270)||(10047378-10047466)
chr4 (184-270)||(39245993-39246081)
chr4 (186-270)||(36315241-36315327)
chr4 (186-270)||(36329450-36329536)
chr4 (174-269)||(31985634-31985730)
chr4 (184-270)||(16623303-16623391)
chr4 (184-270)||(38152449-38152537)
chr4 (187-272)||(5269204-5269291)
chr4 (185-268)||(5143260-5143345)
chr4 (186-269)||(5396683-5396768)
chr4 (184-269)||(3796529-3796616)
chr4 (185-268)||(5147678-5147763)
chr4 (184-248)||(24333831-24333896)
chr4 (184-264)||(6743425-6743507)
chr4 (184-248)||(16630690-16630755)
chr4 (186-268)||(3777550-3777634)
chr4 (90-141)||(28468455-28468506)
chr4 (28-90)||(28468342-28468404)
chr4 (187-270)||(25862035-25862120)
chr4 (31-90)||(5112466-5112523)
chr4 (28-90)||(3777778-3777838)
chr4 (28-90)||(5396479-5396539)
chr4 (28-90)||(16623101-16623161)
chr4 (28-90)||(16628680-16628740)
chr4 (206-248)||(39774338-39774380)
chr4 (28-88)||(5269008-5269066)
chr4 (31-90)||(6743226-6743283)
chr4 (206-265)||(16931789-16931849)
chr4 (206-265)||(16934143-16934203)
chr4 (206-265)||(22780373-22780433)
chr4 (28-87)||(25861841-25861898)
chr4 (206-265)||(44599838-44599898)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (9-428)||(34886-35304)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (9-426)||(7289750-7290167)
chr8 (14-428)||(25328108-25328520)
chr8 (26-425)||(39784665-39785063)
chr8 (90-428)||(6311140-6311477)
chr8 (90-425)||(36979225-36979558)
chr8 (91-425)||(33037724-33038056)
chr8 (39-428)||(35745234-35745624)
chr8 (90-425)||(30655488-30655827)
chr8 (90-425)||(18853083-18853418)
chr8 (90-425)||(4759991-4760325)
chr8 (90-425)||(18870477-18870809)
chr8 (39-425)||(10684116-10684504)
chr8 (90-425)||(10689058-10689392)
chr8 (90-269)||(1261871-1262050)
chr8 (9-90)||(6311532-6311613)
chr8 (14-90)||(18870348-18870424)
chr8 (14-102)||(25327982-25328070)
chr8 (14-90)||(30655880-30655956)
chr8 (14-90)||(10688927-10689003)
chr8 (14-90)||(18852954-18853030)
chr8 (187-269)||(26287902-26287985)
chr8 (187-269)||(26301159-26301242)
chr8 (187-269)||(26313153-26313236)
chr8 (90-269)||(31071146-31071326)
chr8 (14-90)||(33037595-33037671)
chr8 (184-270)||(26403240-26403328)
chr8 (28-90)||(1261758-1261820)
chr8 (14-90)||(4759861-4759938)
chr8 (17-90)||(36979611-36979683)
chr8 (186-248)||(4456050-4456113)
chr8 (187-270)||(4696609-4696694)
chr8 (186-266)||(7412344-7412426)
chr8 (186-269)||(19175766-19175851)
chr8 (184-270)||(23799587-23799675)
chr8 (206-267)||(9765852-9765914)
chr8 (184-248)||(6127243-6127308)
chr8 (184-270)||(5702493-5702581)
chr8 (30-90)||(31071035-31071095)
chr8 (28-90)||(26288121-26288183)
chr8 (28-90)||(26301378-26301440)
chr8 (28-90)||(26313372-26313434)
chr8 (187-270)||(19752407-19752492)
chr8 (28-90)||(7412569-7412629)
chr8 (28-90)||(4696416-4696476)
chr8 (206-239)||(18810982-18811015)
chr8 (28-87)||(23799384-23799441)
chr8 (206-265)||(43079877-43079937)
chr8 (206-265)||(43082248-43082308)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (9-424)||(41398084-41398497)
chr1 (26-428)||(25444931-25445332)
chr1 (26-428)||(39445342-39445742)
chr1 (26-428)||(44023716-44024115)
chr1 (9-373)||(41390483-41390842)
chr1 (26-428)||(1054854-1055254)
chr1 (90-425)||(24787280-24787617)
chr1 (39-428)||(43988314-43988708)
chr1 (90-382)||(24202686-24202973)
chr1 (90-269)||(19358760-19358939)
chr1 (90-269)||(19361349-19361528)
chr1 (90-269)||(19379989-19380168)
chr1 (14-89)||(24787151-24787226)
chr1 (26-165)||(25439738-25439877)
chr1 (369-428)||(41386591-41386650)
chr1 (28-90)||(24202573-24202635)
chr1 (184-270)||(47703946-47704034)
chr1 (186-269)||(26644909-26644994)
chr1 (184-269)||(19072928-19073015)
chr1 (184-269)||(19120818-19120905)
chr1 (184-270)||(9476260-9476348)
chr1 (184-270)||(13598397-13598485)
chr1 (184-270)||(16124526-16124614)
chr1 (184-270)||(27104382-27104470)
chr1 (184-270)||(29651810-29651898)
chr1 (186-269)||(3281708-3281793)
chr1 (186-269)||(37069770-37069855)
chr1 (184-270)||(775671-775759)
chr1 (187-270)||(47098837-47098922)
chr1 (186-247)||(13604635-13604697)
chr1 (28-90)||(19366112-19366174)
chr1 (186-239)||(21536581-21536635)
chr1 (90-141)||(19366225-19366276)
chr1 (28-90)||(19361237-19361298)
chr1 (187-248)||(32889461-32889523)
chr1 (28-90)||(47098633-47098693)
chr1 (28-90)||(47102647-47102707)
chr1 (29-90)||(3281936-3281995)
chr1 (28-90)||(19358648-19358709)
chr1 (206-266)||(47102874-47102935)
chr1 (206-265)||(9459419-9459479)
chr1 (206-265)||(9463246-9463306)
chr1 (206-265)||(16226386-16226446)
chr1 (29-88)||(37069998-37070055)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (55-428)||(9514-9882)
scaffold0355 (9-172)||(3672-3836)
scaffold0355 (327-406)||(28-107)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (26-425)||(208-605)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (39-428)||(148808-149198)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (39-428)||(2103-2493)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (39-428)||(19017-19407)
scaffold0197 (39-425)||(14161-14549)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (201-425)||(181980-182204)
scaffold0009 (39-133)||(176829-176925)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (90-269)||(17869-18048)
scaffold0188 (90-269)||(23962-24141)
scaffold0188 (28-90)||(17756-17818)
scaffold0188 (28-90)||(23849-23911)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (237-425)||(300-487)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (369-428)||(34132-34191)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (186-269)||(8431-8516)
scaffold0140 (28-90)||(8225-8285)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (186-268)||(85684-85768)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (184-270)||(2491-2579)
scaffold0006 (184-270)||(5682-5770)
scaffold0006 (186-247)||(133292-133354)
[»] scaffold0087 (3 HSPs)
scaffold0087 (186-269)||(43973-44058)
scaffold0087 (186-269)||(36844-36929)
scaffold0087 (28-90)||(36640-36700)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (184-270)||(10728-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (187-247)||(45276-45337)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (386-421)||(13198-13233)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (206-239)||(11500-11533)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (206-265)||(269-329)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (184-247)||(17286-17350)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 9 - 425
Target Start/End: Original strand, 39811812 - 39812227
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39811812 agcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttgagaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgt 39811911  T
Q  108 gagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatatt 206  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39811912 gagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 39812009  T
Q  207 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812010 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttct-cggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg 39812108  T
Q  307 tttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812109 tttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcact 39812208  T
Q  407 atcacttgctccacacatc 425  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39812209 atcacttgctccacacatc 39812227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32247031 - 32246627
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  32247031 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 32246932  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 224  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246931 aagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 32246834  T
Q  225 ctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct---ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||   ||||||||||||| |||||||| ||    
T  32246833 ctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaat 32246734  T
Q  322 ctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32246733 ctcttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccaca 32246634  T
Q  422 catcatt 428  Q
    |||||||    
T  32246633 catcatt 32246627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 124 - 428
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312866
Alignment:
Q  124 caaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 44312661  T
Q  223 ctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44312662 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatc 44312759  T
Q  323 tc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44312760 tctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 44312859  T
Q  422 catcatt 428  Q
    |||||||    
T  44312860 catcatt 44312866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 11098843 - 11099176
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||||  | |||||| |||| |||    
T  11098843 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaacccttt 11098941  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11098942 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 11099040  T
Q  288 tcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccat 385  Q
     ||||   | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11099041 cctttcttc-cttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-ttgcttggaaaccat 11099137  T
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    || |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11099138 tt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatc 11099176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19344655 - 19344266
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaca---ttgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaa 135  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||      
T  19344655 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg- 19344557  T
Q  136 tctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 232  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19344556 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctccccta 19344459  T
Q  233 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  19344458 gattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtg 19344362  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19344361 tggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 19344266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19349513 - 19349124
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaca---ttgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaa 135  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||      
T  19349513 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg- 19349415  T
Q  136 tctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 232  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19349414 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctccccta 19349317  T
Q  233 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  19349316 gattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtg 19349220  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19349219 tggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 19349124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14291669 - 14291337
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  14291669 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 14291571  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14291570 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 14291472  T
Q  288 tcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccat 385  Q
     ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14291471 cctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccat 14291374  T
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 423  Q
    || | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14291373 tt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 14291337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 9296317 - 9296651
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  9296317 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtataa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 9296415  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9296416 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 9296514  T
Q  288 tcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccat 385  Q
     ||||    |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9296515 cctttctt-gcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccat 9296612  T
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    || | ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  9296613 tt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatc 9296651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3491930 - 3491751
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  3491930 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 3491833  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3491832 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 3491751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25398675 - 25398386
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  25398675 ttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 25398578  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  25398577 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc- 25398480  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25398479 ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac 25398386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25403813 - 25403524
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  25403813 ttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 25403716  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||     
T  25403715 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc- 25403618  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25403617 ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac 25403524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 11098714 - 11098790
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098714 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 11098790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040059
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 8040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 9296189 - 9296265
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296189 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctattgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 9296265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14291798 - 14291722
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291798 aggagggaaccaaagggttgagcgtctttgtagatagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 14291722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25407802 - 25407653
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  25407802 ttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 25407705  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 239  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407704 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738844
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 40738844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13569415 - 13569331
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 266  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  13569415 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21630030 - 21629943
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21630030 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 21629943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20522308 - 20522219
Alignment:
Q  183 ccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20522308 ccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 28259189 - 28259274
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  28259189 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 10445454 - 10445542
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  10445454 cttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 10445542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17865290 - 17865202
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  17865290 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttg 17865202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 34682344 - 34682432
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34682344 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 34682432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 25409922 - 25409860
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25409922 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 25409860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34388945 - 34388859
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  34388945 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 14699018 - 14699105
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14699018 cttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 14699105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 268
Target Start/End: Original strand, 10707262 - 10707348
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10707262 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 266
Target Start/End: Original strand, 8390160 - 8390244
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 266  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||   ||||||||||||||||    
T  8390160 cttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056067
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 247  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattg 31056067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3492043 - 3491981
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3492043 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggaaaaaacattgtaaacaccttgggt 3491981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Original strand, 23078486 - 23078567
Alignment:
Q  190 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23078486 taacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940307
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 16940307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010972
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 17010972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33118222 - 33118158
Alignment:
Q  185 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33118222 ttttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 33118158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 33528631 - 33528719
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33528631 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 33528719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39483018 - 39482930
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  39483018 cttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 39482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 248
Target Start/End: Original strand, 42039684 - 42039744
Alignment:
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42039684 gtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattgg 42039744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 36757774 - 36757859
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  36757774 tttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40739012 - 40738963
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatcta 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  40739012 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaacta 40738963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Original strand, 27149306 - 27149369
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  27149306 tttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgg 27149369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 36757570 - 36757630
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  36757570 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 36757630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 39483222 - 39483162
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  39483222 gggttgagtgtctttgttgtgaggatctcttgggttggg--aaatattgtaaacaccttgggt 39483162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 40739123 - 40739063
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  40739123 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 40739063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Original strand, 1345574 - 1345635
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 266  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  1345574 tggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1345635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Original strand, 2838063 - 2838124
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 266  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  2838063 tggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21630232 - 21630174
Alignment:
Q  30 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  21630232 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 21630174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20522511 - 20522471
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaa 68  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  20522511 gggttgagtgtctttgtagtgagtatctcttgggttgggaa 20522471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 23078278 - 23078339
Alignment:
Q  27 tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23078278 tgggttgagtgtctttgtgatgagaatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 23078339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 90
Target Start/End: Original strand, 29867780 - 29867840
Alignment:
Q  27 tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  29867780 tgggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 29867840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 41586358 - 41586419
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaca-ttgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  41586358 gggttgagtgtctttggtgagagcttctcttgggttgg--aaaacagttgtaaacaccttgggt 41586419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 428
Target Start/End: Original strand, 14737406 - 14737819
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14737406 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagt 14737505  T
Q  114 ggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattg 212  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737506 gggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattg 14737603  T
Q  213 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14737604 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tg 14737701  T
Q  313 ctttggtatctc--ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatca 410  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737702 ctttggtatctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatca 14737801  T
Q  411 cttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14737802 cttgctccacacatcatt 14737819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Original strand, 22010521 - 22010939
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22010521 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtg 22010620  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22010621 agagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 22010719  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22010720 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgt 22010818  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22010819 tt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccact 22010917  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22010918 atcacttgctccacacatcatt 22010939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11857235 - 11856814
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11857235 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtg 11857136  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11857135 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 11857037  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg---ttttgttctttcttttaccgcttatct 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||| |||||| ||||| |||    
T  11857036 gattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtttttttgttcttccttttatcgcttgtct 11856938  T
Q  305 tgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatc 403  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11856937 tgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacc 11856839  T
Q  404 actatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  11856838 actatctcttgctccacacatcatt 11856814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 14 - 428
Target Start/End: Original strand, 14742266 - 14742678
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14742266 aggagggaaccaatgggttaagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcactttgggttttagggttcatagtgtgagagt 14742365  T
Q  114 ggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattg 212  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742366 gggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattg 14742463  T
Q  213 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtg 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14742464 gagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tg 14742561  T
Q  313 ctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcac 411  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742562 ctttgatatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcac 14742661  T
Q  412 ttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||||||    
T  14742662 ttgctccacacatcatt 14742678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28184757 - 28184345
Alignment:
Q  20 gaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg---aaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggg 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28184757 gaacaaatgggttgagggtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaaaacatagtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtggg 28184658  T
Q  117 gaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggag 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28184657 aaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tgttgtaaccttttgtaacactttctcatattagattggag 28184560  T
Q  216 agctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28184559 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctttttaccgcttatcttgtttatgct 28184461  T
Q  315 ttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagacca--tttgttctcattgattatcactatcact 412  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184460 ttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttgttctcattgattatcactatcact 28184361  T
Q  413 tgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||||    
T  28184360 tgctccacacatcatt 28184345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Original strand, 28155412 - 28155813
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  28155412 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 28155511  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 224  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155512 aagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaa--ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 28155608  T
Q  225 ctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatct 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||    
T  28155609 ctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagct 28155707  T
Q  324 ctt-gtgtggttttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155708 cttagtgtggttttgctatacacaagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccaca 28155806  T
Q  422 catcatt 428  Q
    |||||||    
T  28155807 catcatt 28155813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6438743 - 6438343
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  6438743 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 6438644  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 223  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6438643 aagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctc 6438548  T
Q  224 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |    
T  6438547 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagc 6438449  T
Q  323 tc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6438448 tctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccattggttctcattgattaccactatcacttgctccaca 6438350  T
Q  422 catcatt 428  Q
    |||||||    
T  6438349 catcatt 6438343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6005650 - 6005260
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |    
T  6005650 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-t 6005552  T
Q  137 ctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005551 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 6005454  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  6005453 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 6005358  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6005357 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 6005260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16838977 - 16838587
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  16838977 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 16838879  T
Q  137 ctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838878 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 16838781  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  16838780 attaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 16838685  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16838684 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttgaaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacatatcatt 16838587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 33330297 - 33330689
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  33330297 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 33330395  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330396 ctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 33330493  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| ||||    
T  33330494 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgt 33330590  T
Q  331 gg-ttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33330591 ggtttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33330689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 33335794 - 33336186
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  33335794 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 33335892  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33335893 ctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 33335990  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| ||||    
T  33335991 attaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgt 33336087  T
Q  331 gg-ttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    || |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33336088 ggtttttactatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagtttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33336186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Original strand, 5674685 - 5674889
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||  |||||  | |||||| |||| ||    
T  5674685 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctt 5674783  T
Q  188 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttc 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  5674784 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc-tctttggtgtgtttgttc 5674882  T
Q  286 tttcttt 292  Q
    |||||||    
T  5674883 tttcttt 5674889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343323
Alignment:
Q  224 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtat 321  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| ||     
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcctttatcgtttatcttgtatgc---ttgttag 5343432  T
Q  322 ctctt-gtgtggtttt-gctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 418  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5343431 ctcttagtgtggtttttgctatactttaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 5343333  T
Q  419 acacatcatt 428  Q
    ||||||||||    
T  5343332 acacatcatt 5343323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 5674557 - 5674633
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674557 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 5674633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 5757490 - 5757575
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  5757490 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 270
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077263
Alignment:
Q  185 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 10077263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21356118 - 21356036
Alignment:
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21356118 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 270
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086571
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 31086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 425
Target Start/End: Original strand, 30125944 - 30126044
Alignment:
Q  325 ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  30125944 ttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttgg-ctcatagattatcactacctcttgctccacaca 30126042  T
Q  424 tc 425  Q
    ||    
T  30126043 tc 30126044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 5572251 - 5572339
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  5572251 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 5572339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  185 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22709041
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 247  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattg 22709041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31979600 - 31979512
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31979600 cttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31979512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18232932 - 18232867
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232932 cttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 21801354 - 21801419
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21801354 cttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattgg 21801419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22963786 - 22963699
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  22963786 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 22963699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 23824607 - 23824694
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  23824607 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 23824694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22709188 - 22709137
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  22709188 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactagg 22709137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017567
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata-ttggttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttg 5017567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936586
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 31936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 5017304 - 5017364
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5017304 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 5017364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22709299 - 22709241
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 88  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22709299 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgg 22709241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12406585 - 12406174
Alignment:
Q  16 gagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12406585 gagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggcttttagggttcatattgtgagagtgg 12406486  T
Q  116 ggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattgga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406485 ggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattgga 12406387  T
Q  215 gagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgct 314  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12406386 gagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgct 12406289  T
Q  315 ttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcactt 413  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12406288 ttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctctt 12406189  T
Q  414 gctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||||    
T  12406188 gctccacacatcatt 12406174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12397172 - 12396754
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12397172 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtg 12397073  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12397072 atagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 12396974  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12396973 gattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccctttaccgcttatcttgt 12396875  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12396874 tt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccact 12396776  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12396775 atctcttgctccacacatcatt 12396754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Original strand, 31109407 - 31109825
Alignment:
Q  9 agcataggagggaacca-atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgt 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31109407 agcaaaggagggaaccatatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgt 31109506  T
Q  108 gagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatatt 206  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31109507 gagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 31109604  T
Q  207 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||    
T  31109605 ggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttccttttcttgtttatcttg 31109704  T
Q  307 tttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109705 tttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcact 31109803  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  31109804 atcacttgctgcacacatcatt 31109825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Original strand, 24024151 - 24024570
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  24024151 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttggaaaaacattgtaatcaccgtgggttttagggttcatcgtgtg 24024250  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24024251 agagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacattttgtaacactttctcatattg 24024348  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg-ttttgttctttcttttaccgcttatcttg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||    
T  24024349 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttcttccttttcttgcttatcttg 24024448  T
Q  307 tttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatca 404  Q
    ||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24024449 tttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatatactagtcata-ggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 24024546  T
Q  405 ctatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24024547 ctatcacttgctccacacatcatt 24024570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19992544 - 19992158
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatc 137  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  19992544 ctttgatgtgagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tc 19992446  T
Q  138 tagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 235  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992445 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 19992348  T
Q  236 taggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggt 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||    
T  19992347 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggt 19992249  T
Q  334 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19992248 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacctgctccacacatc 19992158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 181 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4866819 - 4866572
Alignment:
Q  181 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4866819 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttt 4866721  T
Q  281 tgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc-tcttgtgtgg-ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttgg 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  4866720 tgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttgg 4866622  T
Q  379 agaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4866621 agaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 4866572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Original strand, 21812092 - 21812478
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatc 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  21812092 ctttgatgagagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tc 21812190  T
Q  138 tagggtctgt-cttgtgtaaagctt-gata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 234  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21812191 tagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagag--tcttggaaccttttgtaagactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccaga 21812287  T
Q  235 ttaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg 332  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||    
T  21812288 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttaactctttgtgtgg 21812386  T
Q  333 ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21812387 ttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 21812478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 20357463 - 20357797
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  20357463 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 20357562  T
Q  189 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  20357563 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtattttgttcttc 20357661  T
Q  289 cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccatt 386  Q
    |||||   ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357662 cttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccatt 20357759  T
Q  387 tgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20357760 tg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 20357797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2058147 - 2057806
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaa-gggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| ||    
T  2058147 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaaccctt 2058049  T
Q  188 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2058048 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttct 2057950  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttg----tttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggag 380  Q
    | ||||||  ||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||  || ||| | |||||||||||||||||||||     
T  2057949 tccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgttgtttgcttggaa 2057850  T
Q  381 accatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2057849 accatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 2057806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Original strand, 24266054 - 24266442
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||  |    
T  24266054 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 24266152  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266153 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 24266250  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  24266251 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 24266347  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24266348 ggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 24266442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Original strand, 24261175 - 24261563
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||  |    
T  24261175 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 24261273  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261274 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 24261371  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  24261372 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 24261468  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24261469 ggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 24261563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 1533359 - 1533690
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||  |||||  | |||||| |||| ||    
T  1533359 ttttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctt 1533457  T
Q  188 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttc 285  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  1533458 tgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttatt-ggtgtgtttgttc 1533556  T
Q  286 tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggct-gttttgttgttgtttgcttggagacca 384  Q
    |||| |||   |||||| |||||  |||||||   |||||| |||||| ||||| ||||||||  |  |||| |||||||||||| ||||||||| ||      
T  1533557 tttc-tttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt-tgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttg-ttgcttggaaac-- 1533649  T
Q  385 tttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  1533650 ttttttctcattgattaccactatattttgctccacacatc 1533690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16885162 - 16884774
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaac--accaaagggtaga 134  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||  |||||| || ||||||   | ||||||||||     
T  16885162 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgag-gttgggaaatttatcaaagggtagg 16885064  T
Q  135 atctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 232  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16885063 -tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctccccca 16884967  T
Q  233 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  16884966 gattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtg 16884870  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16884869 tggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 16884774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16880306 - 16879918
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaac--accaaagggtaga 134  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||  |||||| || ||||||   | ||||||||||     
T  16880306 ctttgatgagagtgaatcttaggttggaaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgag-gttgggaaatttatcaaagggtagg 16880208  T
Q  135 atctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 232  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880207 -tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctccccca 16880111  T
Q  233 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  16880110 gattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtg 16880014  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16880013 tggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 16879918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21639988 - 21639701
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  21639988 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 21639891  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  21639890 gtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc- 21639793  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    ||| |||   ||||||||||||  |||||||   |||||  |||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21639792 ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac 21639701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18408943 - 18408742
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  || ||    |||||| |||| |||    
T  18408943 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttattt-ttcttgtaacccttt 18408846  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  18408845 gtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--tttggtgtgtttgttct 18408748  T
Q  287 ttcttt 292  Q
    ||||||    
T  18408747 ttcttt 18408742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21646186 - 21645899
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  21646186 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 21646089  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  21646088 ttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc- 21645991  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    ||| |||   ||||||||||||||   ||| |||| |||  |||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21645990 ttcctttcttgcttatcttgtttg---ttttgtat-tctcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac 21645899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4873384 - 4873310
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873384 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 4873310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18413819 - 18413619
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| |||| |||    
T  18413819 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaatctattt-ttcttgtaacccttt 18413722  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  18413721 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct--tttggtgtgtttgttct 18413625  T
Q  287 ttcttt 292  Q
    ||||||    
T  18413624 ttcttt 18413619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 20357334 - 20357410
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357334 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 20357410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 1533231 - 1533307
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533231 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 1533307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2058278 - 2058202
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058278 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 2058202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  185 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29159890 - 29159802
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  29159890 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 29159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 33332460 - 33332548
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  33332460 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 33332548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 46516320 - 46516408
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  46516320 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 46516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 49091748 - 49091660
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  49091748 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttg 49091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21640101 - 21640039
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21640101 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 21640039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21646299 - 21646237
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21646299 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 21646237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190106
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9190106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284088
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20284088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 44848696 - 44848781
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||||||||    
T  44848696 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 2647706 - 2647794
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  2647706 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttg 2647794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18409055 - 18408993
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18409055 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 18408993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2580474 - 2580389
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  2580474 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 2580389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 56034 - 55947
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  56034 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 55947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18413931 - 18413869
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18413931 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacaatgtaaacaccttgggt 18413869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960839
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattg 35960839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185263
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617300
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattgg 28617300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  190 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgc--tctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2479421 - 2479337
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    |||||||||||||||||||    
T  2479421 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 4796677 - 4796765
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| ||||||||||    
T  4796677 cttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttg 4796765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 20284378 - 20284318
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  20284378 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 20284318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 23402821 - 23402881
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23402821 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 23402881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Original strand, 4796477 - 4796536
Alignment:
Q  29 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  4796477 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggt 4796536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  185 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatct 268  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctc--ctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 44847933 - 44847991
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 88  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  44847933 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgg 44847991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21989194 - 21989137
Alignment:
Q  31 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  21989194 ttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 21989137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 22173027 - 22173437
Alignment:
Q  17 agggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  22173027 agggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaggagagtggg 22173126  T
Q  117 gaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173127 gaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggag 22173225  T
Q  216 agctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22173226 agctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttattt-tgctt 22173323  T
Q  316 tggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttg 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22173324 tggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttg 22173423  T
Q  415 ctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||    
T  22173424 ctccacacatcatt 22173437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18656677 - 18656274
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||| ||| ||||    
T  18656677 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattaagggtttatagtgtgagagtgggaaaatacca 18656578  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 224  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656577 aagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 18656481  T
Q  225 ctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  18656480 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgtta 18656383  T
Q  321 tctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 419  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18656382 gctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctcca 18656283  T
Q  420 cacatcatt 428  Q
    |||||||||    
T  18656282 cacatcatt 18656274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 90 - 428
Target Start/End: Original strand, 28503780 - 28504107
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  28503780 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 28503879  T
Q  189 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  28503880 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 28503978  T
Q  289 cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 387  Q
    |||          |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28503979 ctt----------tcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggctgttttgttgttg-ttgcttggaaaccattt 28504067  T
Q  388 gttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
     ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  28504068 -ttctcatagattatcactaccttttgctccacacatcatt 28504107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7167425 - 7167092
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  7167425 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 7167327  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7167326 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 7167228  T
Q  288 tcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatt 386  Q
     ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7167227 cctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgttg-ttgcttggaaaccatt 7167130  T
Q  387 tgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    | | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7167129 t-tgctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 7167092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 2676939 - 2677330
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  2676939 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 2677037  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677038 ctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 2677135  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| ||||    
T  2677136 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgt 2677232  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2677233 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 2677330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 2672783 - 2673174
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |    
T  2672783 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttaaggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 2672881  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672882 ctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 2672979  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttctttt-accgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |  | |||||||| || ||| ||| || ||||| ||||    
T  2672980 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgt 2673076  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2673077 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttactctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 2673174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 2671502 - 2671836
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||||| |||||  | |||  | |||||| |||| |||    
T  2671502 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaa-gcttgcaatctattgtttcttgtaacccttt 2671600  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2671601 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 2671699  T
Q  288 tcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccat 385  Q
     ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2671700 cctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggagaccat 2671797  T
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    |||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2671798 ttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 2671836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8512450 - 8512058
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||  |    
T  8512450 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 8512352  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512351 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 8512254  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccg-cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  8512253 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttgtatg---cttgttaactcttagtg 8512157  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8512156 tggttgtgctacacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 8512058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8517330 - 8516938
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||  |    
T  8517330 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 8517232  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517231 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 8517134  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccg-cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  8517133 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttgtatg---cttgttaactcttagtg 8517037  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8517036 tggttgtgctacacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 8516938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24968340 - 24967957
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||| |    
T  24968340 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaagtaccaaagggtaga-t 24968242  T
Q  137 ctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    || |||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  24968241 ctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaa 24968144  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  24968143 attaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 24968048  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24968047 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 425
Target Start/End: Original strand, 8738982 - 8739314
Alignment:
Q  93 tagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgta 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| ||||||    
T  8738982 tagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgta 8739080  T
Q  192 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttct 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  8739081 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcct 8739179  T
Q  291 tttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccattt 387  Q
    ||    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || || ||  || ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8739180 ttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccattt 8739277  T
Q  388 gttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    |  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  8739278 g-actcatagattaccactatttcttgctccacacatc 8739314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 425
Target Start/End: Original strand, 9091220 - 9091552
Alignment:
Q  93 tagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgta 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| ||||||    
T  9091220 tagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgta 9091318  T
Q  192 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttct 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  9091319 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcct 9091417  T
Q  291 tttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagaccattt 387  Q
    ||    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || || ||  || ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9091418 ttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccattt 9091515  T
Q  388 gttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    |  ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  9091516 g-actcatagattaccactatttcttgctccacacatc 9091552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Original strand, 28501613 - 28501750
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  28501613 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 28501712  T
Q  189 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501713 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8477545 - 8477340
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtgggg-aaacaccaaagggtagaatctagggtctgtct--tgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctt 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |  ||||||| |||||  |||||  | |||||| |||| |    
T  8477545 ttttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccct 8477447  T
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgtt 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  8477446 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtgtttgtt 8477348  T
Q  285 ctttcttt 292  Q
    ||||||||    
T  8477347 ctttcttt 8477340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32475717 - 32475330
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaac--accaaagggtaga 134  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||  |||||| || ||||||   | ||||||||||     
T  32475717 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgag-gttgggaaatttatcaaagggtagg 32475619  T
Q  135 atctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 232  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475618 -tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctccccca 32475523  T
Q  233 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  32475522 gattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtg 32475426  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  32475425 tggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 32475330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32480575 - 32480188
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaac--accaaagggtaga 134  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||  ||||||||  |||||| || ||||||   | ||||||||||     
T  32480575 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgag-gttgggaaatttatcaaagggtagg 32480477  T
Q  135 atctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 232  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480476 -tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctccccca 32480381  T
Q  233 gattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  32480380 gattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtg 32480284  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  32480283 tggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 32480188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 287
Target Start/End: Original strand, 40372712 - 40372908
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  40372712 ttttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 40372809  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40372810 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 40372908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Original strand, 26928507 - 26928709
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  26928507 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttttcttgtaacccttt 26928605  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  26928606 gtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatct--tttggtgtgtttgttct 26928703  T
Q  287 ttcttt 292  Q
    ||||||    
T  26928704 ttcttt 26928709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207776
Alignment:
Q  221 ctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-ctttt-accgcttatcttgtttgtgctttgg 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |  | ||||||||||  ||||| |     
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtta-tgctt-gt 10207887  T
Q  319 tatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgct 416  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10207886 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 10207788  T
Q  417 ccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||    
T  10207787 ccacacatcatt 10207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 2671373 - 2671449
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671373 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 2671449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8477674 - 8477598
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477674 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 8477598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 8738850 - 8738926
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8738850 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 8738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 40372583 - 40372659
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372583 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 40372659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32143501 - 32143321
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  32143501 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 32143404  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  32143403 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 32143321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7167555 - 7167478
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggga-aaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7167555 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggt 7167478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 9091088 - 9091164
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091088 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 9091164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1306128 - 1305949
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| |||| |||    
T  1306128 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt-ttcttgtaacccttt 1306031  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1306030 gtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1305949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 28501483 - 28501560
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaat-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501483 aggagggaaccaaaagggatgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 28501560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 28503650 - 28503727
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaat-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28503650 aggagggaaccaaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggt 28503727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27453138 - 27452958
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  27453138 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaataggaattgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 27453041  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  27453040 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 27452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 8370488 - 8370573
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8370488 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 27974954 - 27975039
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27974954 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 18552883 - 18552971
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18552883 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 18552971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986533
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27986533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21711308 - 21711222
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21711308 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 21711222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36029180 - 36029094
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36029180 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16264435 - 16264350
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  16264435 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 266
Target Start/End: Original strand, 1736305 - 1736389
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 266  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  1736305 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Original strand, 30709790 - 30709877
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  30709790 cttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48438301 - 48438236
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48438301 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 48438236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 3716002 - 3716090
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3716002 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 3716090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 40592782 - 40592870
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  40592782 cttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 40592870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Original strand, 6794715 - 6794778
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6794715 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 6794778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417578
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 1417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1306239 - 1306179
Alignment:
Q  30 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1306239 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 1306179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26299075 - 26298987
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  26299075 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 26298987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 47923906 - 47923994
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47923906 cttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25795868 - 25795781
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  25795868 ctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328444
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttg 3328444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466290
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 37466290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 244
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4386988
Alignment:
Q  203 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcata 4386988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40844738 - 40844674
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40844738 cttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattgg 40844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Original strand, 4386774 - 4386831
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttg 87  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4386774 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaatcaccttg 4386831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 423
Target Start/End: Original strand, 40372980 - 40373043
Alignment:
Q  359 ttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 423  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40372980 ttttgatgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 40373043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23392166 - 23392106
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23392166 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 23392106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 24694963 - 24695023
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  24694963 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 24695023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 26928396 - 26928456
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26928396 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 26928456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 27986253 - 27986313
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  27986253 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 27986313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 36029382 - 36029322
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  36029382 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 36029322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 40592579 - 40592639
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  40592579 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 40592639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 248
Target Start/End: Original strand, 3323693 - 3323755
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3323693 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894082
Alignment:
Q  202 atattggattggagagctgctctctcccccagattagg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactagg 53894082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 21711511 - 21711454
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttg 87  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  21711511 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttg 21711454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23410586 - 23410529
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttg 87  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  23410586 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttg 23410529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 24695164 - 24695252
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  24695164 cttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 24695252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 47923704 - 47923761
Alignment:
Q  31 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  47923704 ttgagtgtctttgtagtgagaatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 47923761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43592540 - 43592121
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  43592540 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaag 43592441  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43592440 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 43592342  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43592341 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgt 43592243  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43592242 ttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccact 43592143  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  43592142 atctcttgctccacacatcatt 43592121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Original strand, 1456986 - 1457404
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1456986 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtg 1457085  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1457086 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 1457184  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||    ||||||||||    
T  1457185 gattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttcctttctttcttatcttgt 1457282  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1457283 ttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccact 1457382  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  1457383 atctcttgctccacacatcatt 1457404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43598985 - 43598566
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  43598985 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaag 43598886  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43598885 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 43598787  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43598786 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgt 43598688  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43598687 ttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccact 43598588  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  43598587 atctcttgctccacacatcatt 43598566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43604477 - 43604058
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  43604477 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaag 43604378  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43604377 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 43604279  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43604278 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgt 43604180  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43604179 ttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccact 43604080  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  43604079 atctcttgctccacacatcatt 43604058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43609969 - 43609550
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  43609969 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaag 43609870  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43609869 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 43609771  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43609770 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgt 43609672  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43609671 ttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccact 43609572  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  43609571 atctcttgctccacacatcatt 43609550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27445231 - 27444812
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27445231 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaag 27445132  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27445131 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 27445033  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  27445032 gattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgt 27444934  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27444933 ttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccact 27444834  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  27444833 atctcttgctccacacatcatt 27444812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27450075 - 27449656
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27450075 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaag 27449976  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27449975 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 27449877  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  27449876 gattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgt 27449778  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27449777 ttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccact 27449678  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  27449677 atctcttgctccacatatcatt 27449656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15044947 - 15044529
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15044947 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgt 15044848  T
Q  108 gagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatatt 206  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15044847 gagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 15044750  T
Q  207 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  15044749 ggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttg 15044651  T
Q  307 tttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15044650 tttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttctcattgattaccact 15044551  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  15044550 atcacttgctctacacgtcatt 15044529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 28807429 - 28807817
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatct 138  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  28807429 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tct 28807527  T
Q  139 agggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 237  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807528 agggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaga--ttcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagatta 28807624  T
Q  238 ggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg--t 333  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||| ||||  |    
T  28807625 ggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgagtggttt 28807723  T
Q  334 tttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807724 tttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 28807817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Original strand, 37556478 - 37556863
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatct 138  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  37556478 ctttgatgtgagtgtttcttaggttgggaaaa-cattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tct 37556575  T
Q  139 agggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatt 236  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556576 agggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagatt 37556673  T
Q  237 aggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 334  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  37556674 aggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggtt 37556772  T
Q  335 ttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556773 ttgctatacacaagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatc 37556863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Original strand, 37561300 - 37561685
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatct 138  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  37561300 ctttgatgtgagtgtttcttaggttgggaaaa-cattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tct 37561397  T
Q  139 agggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatt 236  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561398 agggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagatt 37561495  T
Q  237 aggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 334  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  37561496 aggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggtt 37561594  T
Q  335 ttgctatacactag-cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561595 ttgctatacacaagtcata-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatc 37561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30631586 - 30631250
Alignment:
Q  91 tttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||    
T  30631586 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttg 30631487  T
Q  190 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  30631486 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcc 30631388  T
Q  290 tt--ttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatt 386  Q
    ||  |||   |||||||||||| ||||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  30631387 tttctta---cttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggctgttttgttgttg-ttgcttgaaaaccatt 30631292  T
Q  387 tgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30631291 tgttctcatagattaccactatctcttgctccacacatcatt 30631250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31180394 - 31180138
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 189  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||    
T  31180394 ttttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttg 31180295  T
Q  190 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31180294 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttc 31180196  T
Q  290 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacacta 347  Q
     |||    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31180195 -tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2785608 - 2785218
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |    
T  2785608 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-t 2785510  T
Q  137 ctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785509 ctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 2785412  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  2785411 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 2785316  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2785315 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 2785218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33791549 - 33791159
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |    
T  33791549 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-t 33791451  T
Q  137 ctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33791450 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctttcccccag 33791353  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || |||| | |||    
T  33791352 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctctatatgt 33791257  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33791256 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33791159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 31396843 - 31397235
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| |||  |||||||||||| |    
T  31396843 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-t 31396941  T
Q  137 ctagggtct---gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 231  Q
    ||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31396942 ctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctccccc 31397039  T
Q  232 agattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttt-tgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtg 329  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| |||    
T  31397040 agattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtg 31397136  T
Q  330 tggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31397137 tggttttgctttacattaggctta-ggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 31397235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 31401700 - 31402092
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| |||  |||||||||||| |    
T  31401700 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-t 31401798  T
Q  137 ctagggtct---gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 231  Q
    |||| || |   |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31401799 ctagagttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctccccc 31401896  T
Q  232 agattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gt 328  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||    
T  31401897 atattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagt 31401992  T
Q  329 gtggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcat 427  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31401993 gtggttttgctttacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcat 31402091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33768299 - 33768022
Alignment:
Q  150 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 247  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33768299 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccacattg 33768202  T
Q  248 gttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtggttttgctataca 344  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||| ||| ||    ||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  33768201 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctgtatg---cttgttagctctatatgtggttttgctataca 33768106  T
Q  345 cta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33768105 ttaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 33768022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24136028 - 24135740
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  24136028 ttttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 24135931  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24135930 gtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtgtttgttct 24135832  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    | |||||   ||||||||||||  |||||||   | |||  |||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135831 tccttttctagcttatcttgtt--tgctttgtattatct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagac 24135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38192353 - 38192064
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  38192353 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 38192256  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  38192255 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc- 38192158  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38192157 ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac 38192064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38219578 - 38219289
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  38219578 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 38219481  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  38219480 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc- 38219383  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    ||| |||   ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38219382 ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttg-ttgcttggagac 38219289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 30631716 - 30631640
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631716 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 30631640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35387842 - 35387663
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   | | ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  35387842 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 35387745  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35387744 gtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctt 35387663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 31180523 - 31180447
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180523 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 31180447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24136156 - 24136080
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24136156 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 24136080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 9353344 - 9353429
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9353344 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 36932362 - 36932447
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  36932362 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10281838 - 10281751
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  10281838 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 35387955 - 35387893
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35387955 gggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttggaaaaaacattgtaatcaccttgggt 35387893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15464617 - 15464532
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15464617 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 268
Target Start/End: Original strand, 11916982 - 11917068
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  11916982 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004058
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 17004058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 38219691 - 38219629
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38219691 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 38219629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3880386 - 3880321
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  3880386 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattgg 3880321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14520315 - 14520230
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14520315 tttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832258
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttg 28832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127508
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 42127508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19588833 - 19588746
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19588833 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Original strand, 12084187 - 12084269
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 266  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||   ||||||||||||||||    
T  12084187 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 24553335 - 24553395
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  24553335 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 24553395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Original strand, 11181641 - 11181700
Alignment:
Q  29 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  11181641 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 11181700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 270
Target Start/End: Original strand, 31300612 - 31300694
Alignment:
Q  190 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31300612 taacactttcatcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31300694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 7160712 - 7160770
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 88  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7160712 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttggattggg--aaacattgtaatcaccttgg 7160770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14520519 - 14520461
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 88  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14520519 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgg 14520461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 28832544 - 28832486
Alignment:
Q  30 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28832544 gttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 28832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 33768417 - 33768365
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 89  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33768417 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33768365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Original strand, 9224231 - 9224649
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9224231 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtg 9224330  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9224331 agagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaaccttttgtaacactttctcatattg 9224429  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9224430 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgt 9224528  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9224529 tt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccact 9224627  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  9224628 atctcttgctccacacatcatt 9224649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Original strand, 9229018 - 9229436
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9229018 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtg 9229117  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9229118 agagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaaccttttgtaacactttctcatattg 9229216  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9229217 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgt 9229315  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9229316 tt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccact 9229414  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  9229415 atctcttgctccacacatcatt 9229436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 51520713 - 51520299
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  51520713 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaagagagt 51520614  T
Q  114 ggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520613 ggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattg 51520515  T
Q  213 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||    
T  51520514 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatg 51520416  T
Q  313 ctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcac 411  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  51520415 ctttgttatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctc 51520316  T
Q  412 ttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||||||    
T  51520315 ttgctccacacatcatt 51520299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Original strand, 45347658 - 45348060
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  45347658 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtctcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggggtttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 45347757  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 224  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347758 aagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 45347856  T
Q  225 ctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatct 323  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45347857 ctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatct 45347955  T
Q  324 cttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45347956 cttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacaca 45348055  T
Q  424 tcatt 428  Q
    |||||    
T  45348056 tcatt 45348060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Original strand, 45357138 - 45357539
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  45357138 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggggtttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 45357237  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 224  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357238 aagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 45357335  T
Q  225 ctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatct 323  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45357336 ctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatct 45357434  T
Q  324 cttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45357435 cttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacaca 45357534  T
Q  424 tcatt 428  Q
    |||||    
T  45357535 tcatt 45357539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5732907 - 5732504
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||| ||| ||||    
T  5732907 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattaagggtttatagtgtgagagtgggaaaatacca 5732808  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 224  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732807 aagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 5732711  T
Q  225 ctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  5732710 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgtta 5732613  T
Q  321 tctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 419  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5732612 gctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctcca 5732513  T
Q  420 cacatcatt 428  Q
    |||||||||    
T  5732512 cacatcatt 5732504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3814278 - 3813866
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagt 113  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3814278 aggagggatcctatggggtgtgtgtctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagt 3814179  T
Q  114 ggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattg 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3814178 gggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattg 3814082  T
Q  213 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||    
T  3814081 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatg 3813983  T
Q  313 ctttggtatctctt-gtgtggtttt-gctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatca 410  Q
    ||| | || ||||| |||||||||| || |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3813982 ctt-gttagctctttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgctctcattgattaccactatca 3813884  T
Q  411 cttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3813883 cttgctccacacatcatt 3813866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18855956 - 18855569
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatct 138  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  18855956 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattgtgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tct 18855858  T
Q  139 agggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatt 236  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855857 agggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagatt 18855761  T
Q  237 aggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggtt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||    
T  18855760 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggtt 18855662  T
Q  335 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855661 ttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 18855569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 150 - 428
Target Start/End: Original strand, 56146677 - 56146954
Alignment:
Q  150 tgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggt 249  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  56146677 tgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggc 56146775  T
Q  250 tgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactag 348  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56146776 tgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactag 56146874  T
Q  349 cttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
      || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  56146875 tctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt 56146954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24742121 - 24741788
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  24742121 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 24742023  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24742022 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 24741924  T
Q  288 tcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccat 385  Q
     ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  24741923 cctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccat 24741827  T
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24741826 tttgt-tcattgattaccactatctcttgctccacacatc 24741788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 92 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29760821 - 29760490
Alignment:
Q  92 ttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 189  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||   ||||  | |||||| |||| ||||    
T  29760821 ttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaggctattgtttcttgtaaccctttg 29760723  T
Q  190 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  29760722 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttc 29760624  T
Q  289 cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 387  Q
    ||||    ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29760623 ctttctt-gcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgttg-ttgcttggaaaccattt 29760527  T
Q  388 gttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
     |  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29760526 -tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatc 29760490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 18712590 - 18712677
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagg 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18712590 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgttatcaccttgggttttagg 18712677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24742250 - 24742174
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742250 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 24742174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 29760951 - 29760874
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggga-aaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29760951 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggt 29760874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468625
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 28468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10047466 - 10047378
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10047466 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 10047378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39246081 - 39245993
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  39246081 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 39245993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 270
Target Start/End: Original strand, 36315241 - 36315327
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  36315241 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36315327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 270
Target Start/End: Original strand, 36329450 - 36329536
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  36329450 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36329536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Original strand, 31985634 - 31985730
Alignment:
Q  174 ttcttgcaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31985634 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31985730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 16623303 - 16623391
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16623303 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 16623391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152537
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 38152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 272
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269291
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttgtt 272  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgtt 5269291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  185 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 5396683 - 5396768
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  5396683 tttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Original strand, 3796529 - 3796616
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3796529 cttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  185 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333831
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 24333831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 264
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaaca 264  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 16630690 - 16630755
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||    
T  16630690 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattgg 16630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3777634 - 3777550
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||    
T  3777634 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 28468455 - 28468506
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 141  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28468455 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctagg 28468506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 28468342 - 28468404
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28468342 gggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggt 28468404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862120
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggtt-gaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 25862120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5112523 - 5112466
Alignment:
Q  31 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5112523 ttgagtgtctttgttgtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 5112466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3777838 - 3777778
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  3777838 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 3777778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 5396479 - 5396539
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5396479 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 5396539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 16623101 - 16623161
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16623101 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 16623161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 16628680 - 16628740
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16628680 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 16628740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Original strand, 39774338 - 39774380
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  39774338 tggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattgg 39774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 5269008 - 5269066
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 88  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  5269008 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgg 5269066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 6743226 - 6743283
Alignment:
Q  31 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  6743226 ttgagtgtctttgtagcgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 6743283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Original strand, 25861841 - 25861898
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttg 87  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25861841 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttg 25861898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 428
Target Start/End: Original strand, 34886 - 35304
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34886 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtg 34985  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34986 agagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaaccttttgtaacactttctcatattg 35084  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35085 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatcttgt 35183  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35184 tt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccact 35282  T
Q  407 atcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  35283 atctcttgctccacacatcatt 35304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 426
Target Start/End: Original strand, 7289750 - 7290167
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtg 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7289750 agcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattgtg 7289849  T
Q  109 agagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7289850 agagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattg 7289948  T
Q  208 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  7289949 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgt 7290047  T
Q  308 ttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7290048 ttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgttctcattgattaccact 7290147  T
Q  407 atcacttgctccacacatca 426  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  7290148 atctcttgctccacacatca 7290167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 428
Target Start/End: Original strand, 25328108 - 25328520
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagt 113  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328108 aggagggatcctatgggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagt 25328207  T
Q  114 ggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328208 ggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattg 25328305  T
Q  213 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccgcttatcttgtttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |    
T  25328306 gagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttttcctttaccgtttatctcgtttat 25328404  T
Q  312 gctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcac 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328405 gttttggtatctcttgtgtggttttgctatacactag-ttagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcac 25328503  T
Q  412 ttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||| |||||||||    
T  25328504 ttgctccgcacatcatt 25328520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 26 - 425
Target Start/End: Original strand, 39784665 - 39785063
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  39784665 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtctcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 39784764  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 223  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39784765 aagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctc 39784860  T
Q  224 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39784861 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatc 39784960  T
Q  323 tcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784961 tcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 39785060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 90 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6311477 - 6311140
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  6311477 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttg 6311378  T
Q  190 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  6311377 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttcttcc 6311279  T
Q  290 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 388  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6311278 tttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaaccatttg 6311180  T
Q  389 ttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6311179 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 6311140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36979558 - 36979225
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  36979558 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 36979460  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36979459 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 36979361  T
Q  288 tcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccat 385  Q
     ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  36979360 cctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccat 36979264  T
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36979263 tttgt-tcattgattaccactatctcttgctccacacatc 36979225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 425
Target Start/End: Original strand, 33037724 - 33038056
Alignment:
Q  91 tttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| ||||    
T  33037724 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 33037822  T
Q  190 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  33037823 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttc 33037920  T
Q  290 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgtt--ttgttgttgtttgcttggagaccatt 386  Q
    ||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33037921 ttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttg-ttgcttggaaaccatt 33038018  T
Q  387 tgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33038019 t-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatc 33038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 35745624 - 35745234
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |    
T  35745624 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-t 35745526  T
Q  137 ctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745525 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 35745428  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  35745427 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 35745332  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35745331 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 35745234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30655827 - 30655488
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  30655827 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 30655729  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |    
T  30655728 gtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttttttgt 30655630  T
Q  288 tct---tttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctct-tgtgtggttttgctatacactagcttatggctg--ttttgttgttgtttgcttggaga 381  Q
    |||   |||   ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||  ||||||||||| ||||||||| |    
T  30655629 tcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgttg-ttgcttggaaa 30655531  T
Q  382 ccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    |||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30655530 ccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatc 30655488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 18853083 - 18853418
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacc-ttt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  18853083 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttt 18853181  T
Q  188 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct 286  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18853182 tgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttct 18853280  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggc-tgttttgttgttgtttgcttggagacca 384  Q
    | ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||  || ||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18853281 tcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgcttggaaacca 18853378  T
Q  385 tttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18853379 tttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 18853418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 4759991 - 4760325
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  4759991 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 4760089  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  4760090 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-gatgttttgttctt 4760188  T
Q  288 tcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttatggctgtttt-gttgttgtttgcttggagaccat 385  Q
     ||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  4760189 cctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccat 4760286  T
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    || | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  4760287 tt-tgctcattgattaccactatctctagctccacacatc 4760325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 18870477 - 18870809
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacc-ttt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  18870477 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttt 18870575  T
Q  188 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct 286  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18870576 tgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttct 18870674  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccat 385  Q
    | ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18870675 tcctttctt-gcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggc-gtttt-ttgttgtttgcttggaaaccat 18870770  T
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    ||   ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  18870771 tt-aactcatagattaccattatctcttgctccacacatc 18870809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Original strand, 10684116 - 10684504
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||  |    
T  10684116 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 10684214  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684215 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 10684312  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  10684313 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 10684409  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  10684410 ggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 10684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 10689058 - 10689392
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaa-gggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |     
T  10689058 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctc 10689156  T
Q  188 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10689157 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttct 10689255  T
Q  287 ttctt--ttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg-ttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    | |||  |||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   || || || ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10689256 tcctttctta---cttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttg-ttgcttggaaac 10689350  T
Q  383 catttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    |||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10689351 cattag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc 10689392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 1261871 - 1262050
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  1261871 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 1261968  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1261969 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctt 1262050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 6311613 - 6311532
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311613 agcaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 6311532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 18870348 - 18870424
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870348 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 18870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Original strand, 25327982 - 25328070
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcat 102  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25327982 aggagggatcctatgggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcat 25328070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 30655956 - 30655880
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655956 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 30655880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 10688927 - 10689003
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10688927 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 10689003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 18852954 - 18853030
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18852954 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggt 18853030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287902
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301159
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26301159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313153
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26313153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 31071146 - 31071326
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  31071146 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 31071243  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  31071244 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctt 31071326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 33037595 - 33037671
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037595 aggagggaaccaaagggttgagtgtcttcgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 33037671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403328
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 26403328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 1261758 - 1261820
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1261758 gggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 1261820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 4759861 - 4759938
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4759861 aggaggtaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagagtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggt 4759938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 36979683 - 36979611
Alignment:
Q  17 agggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36979683 agggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttaggttggg-aaaacattgtaatcaccttgggt 36979611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4456113 - 4456050
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456113 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 4456050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696694
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 4696694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7412426 - 7412344
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 266  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  7412426 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 7412344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 19175766 - 19175851
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  19175766 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 23799587 - 23799675
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23799587 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 23799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 267
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6127308 - 6127243
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  6127308 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattgg 6127243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 5702493 - 5702581
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5702493 cttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Original strand, 31071035 - 31071095
Alignment:
Q  30 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31071035 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 31071095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26288183 - 26288121
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26288183 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 26288121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26301440 - 26301378
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26301440 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 26301378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26313434 - 26313372
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26313434 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggt 26313372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752492
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 19752492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7412629 - 7412569
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7412629 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 7412569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 4696416 - 4696476
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  4696416 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 4696476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 239
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811015
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattagg 18811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Original strand, 23799384 - 23799441
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttg 87  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  23799384 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg--gaacattgtaaacaccttg 23799441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41398497 - 41398084
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  41398497 agcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgt 41398398  T
Q  108 gagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatatt 206  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41398397 gagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 41398300  T
Q  207 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||      |||||||||    
T  41398299 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcctt------cttatcttg 41398207  T
Q  307 tttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttatggctgtt---ttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgatt 400  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41398206 tttatgctttggtatctctttgtgtggttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccatatgttctcattgatt 41398108  T
Q  401 atcactatcacttgctccacacat 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41398107 atcactatcacttgctccacacat 41398084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Original strand, 25444931 - 25445332
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  25444931 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 25445030  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 223  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445031 aagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 25445127  T
Q  224 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||| || |    
T  25445128 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttacgc-ttgttagc 25445226  T
Q  323 tc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25445227 tctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcgcttgctccaca 25445325  T
Q  422 catcatt 428  Q
    |||||||    
T  25445326 catcatt 25445332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 39445742 - 39445342
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  39445742 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 39445643  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 223  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39445642 aagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctc 39445547  T
Q  224 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |    
T  39445546 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagc 39445448  T
Q  323 tc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445447 tctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttcacattgattatcactatcacttgctccaca 39445349  T
Q  422 catcatt 428  Q
    |||||||    
T  39445348 catcatt 39445342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Original strand, 44023716 - 44024115
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  44023716 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 44023815  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 223  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44023816 aagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctc 44023911  T
Q  224 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatct 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||| || ||    
T  44023912 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttaccatttatcttgtttatgc-ttgttagct 44024010  T
Q  324 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacac 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44024011 ctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcagttgctccacac 44024109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41390842 - 41390483
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  41390842 agcaaaggagggaaccaaatggattgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgt 41390743  T
Q  108 gagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatatt 206  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41390742 gagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 41390645  T
Q  207 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||      |||||||||    
T  41390644 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatctt-ctcgatgttttgttcttcctt------cttatcttg 41390552  T
Q  307 tttgtgctttggtatctc-ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttg 373  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41390551 tttatgctttgatatctctttgtgtggttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgtttg 41390483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Original strand, 1054854 - 1055254
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  1054854 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 1054953  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 223  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  1054954 aagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagttgctc 1055049  T
Q  224 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |    
T  1055050 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagc 1055148  T
Q  323 tc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055149 tctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagacatttgttcacattgattatcactatcacttgctccaca 1055247  T
Q  422 catcatt 428  Q
    |||||||    
T  1055248 catcatt 1055254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 90 - 425
Target Start/End: Original strand, 24787280 - 24787617
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||  ||||  | |||||| |||| |||    
T  24787280 ttttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 24787379  T
Q  189 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  24787380 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttc 24787478  T
Q  289 cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctg--ttttgttgttgt--ttgcttggagacc 383  Q
    |||||   ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||  || |||||  ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  24787479 cttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgttgttgcttggaaacc 24787576  T
Q  384 atttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    |||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24787577 attt-tgctcatttattaccactatctcttgctccacacatc 24787617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 43988314 - 43988708
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| |||  |||||||||||| |    
T  43988314 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-t 43988412  T
Q  137 ctagggtct---gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccc 231  Q
    ||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988413 ctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctccccc 43988510  T
Q  232 agattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcttttaccg--cttatcttgtttgtgctttggtatctctt-g 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||   |   ||||||||| ||    ||| || ||||| |    
T  43988511 agattaggccacattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatg---cttgttagctcttag 43988607  T
Q  328 tgtggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatca 426  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43988608 tgtggttgtgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatca 43988706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 382
Target Start/End: Original strand, 24202686 - 24202973
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  24202686 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 24202783  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 286  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  24202784 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc- 24202881  T
Q  287 ttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagac 382  Q
    ||| |||   ||||||||||||  |||||||   |||||  |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202882 ttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgtttgcttggagac 24202973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 19358760 - 19358939
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  19358760 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 19358857  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19358858 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 19361349 - 19361528
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| |||| |||    
T  19361349 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt-ttcttgtaacccttt 19361446  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19361447 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19361528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 19379989 - 19380168
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| |||| |||    
T  19379989 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt-ttcttgtaacccttt 19380086  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19380087 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19380168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 24787151 - 24787226
Alignment:
Q  14 aggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24787151 aggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattataatcaccttggg 24787226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Original strand, 25439738 - 25439877
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  25439738 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 25439837  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgata 165  Q
    ||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  25439838 aagggtag-ctctagggtttgttcatgtgtaaagcttgata 25439877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 369 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41386650 - 41386591
Alignment:
Q  369 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386650 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 41386591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 24202573 - 24202635
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202573 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 24202635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704034
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 26644909 - 26644994
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  26644909 tttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19073015 - 19072928
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19073015 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19120905 - 19120818
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19120905 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476260
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9476260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598397
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 13598397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 16124526 - 16124614
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  16124526 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 16124614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Original strand, 27104382 - 27104470
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||| |||||||||||||    
T  27104382 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 27104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651810
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttg 29651810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3281793 - 3281708
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  3281793 tttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37069855 - 37069770
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  37069855 tttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775671
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098922
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47098922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Original strand, 13604635 - 13604697
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 247  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13604635 tttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 13604697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 19366112 - 19366174
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19366112 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggt 19366174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Original strand, 21536581 - 21536635
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 239  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536581 tttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 21536635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 141
Target Start/End: Original strand, 19366225 - 19366276
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 141  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19366225 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctagg 19366276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 19361237 - 19361298
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19361237 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg-aaaacattgtaaacaccttgggt 19361298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32889523 - 32889461
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 248  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  32889523 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattgg 32889461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 47098633 - 47098693
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  47098633 gggttgagtgtctttgtagcgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 47098693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 47102647 - 47102707
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  47102647 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 47102707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3281995 - 3281936
Alignment:
Q  29 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  3281995 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 3281936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 19358648 - 19358709
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19358648 gggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttggg-aaaacattgtaaacaccttgggt 19358709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Original strand, 47102874 - 47102935
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaat 266  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  47102874 tggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 47102935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 37070055 - 37069998
Alignment:
Q  29 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 88  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  37070055 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgg 37069998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 55 - 428
Target Start/End: Original strand, 9514 - 9882
Alignment:
Q  55 tcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtg 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||    
T  9514 tcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtg 9612  T
Q  154 taaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaa 253  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9613 taaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaa 9710  T
Q  254 ctgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctcttgtgtggttttgctatacactagcttat 353  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  9711 ctgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctcttgtgtggttttgctatatactagcttag 9807  T
Q  354 ggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9808 ggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 3672 - 3836
Alignment:
Q  9 agcataggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgt 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3672 agcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttaggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgt 3771  T
Q  108 gagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 172  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||    
T  3772 gagagtgggaaaataccaaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag 3836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 406
Target Start/End: Original strand, 28 - 107
Alignment:
Q  327 gtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcact 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcattgattatcact 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 26 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 208
Alignment:
Q  26 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacca 125  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  605 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacca 506  T
Q  126 aagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 223  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  505 aagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctc 410  T
Q  224 tctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt-cttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |    
T  409 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagc 311  T
Q  323 tc-ttgtgtggttttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  310 tctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcaccatcacttgctccaca 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 148808 - 149198
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||| |    
T  148808 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-t 148906  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  148907 ctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccag 149004  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  149005 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 149100  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  149101 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 149198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 2103 - 2493
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||| |    
T  2103 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-t 2201  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2202 ctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccag 2299  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  2300 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 2395  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2396 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctccacacatcatt 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 428
Target Start/End: Original strand, 19017 - 19407
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||| |    
T  19017 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggaattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-t 19115  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19116 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagctgctctctcccccag 19213  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  19214 attaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 19309  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19310 ggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 19407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 425
Target Start/End: Original strand, 14161 - 14549
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaat 136  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||  |    
T  14161 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 14259  T
Q  137 ctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14260 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 14357  T
Q  234 attaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgt 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||    ||| || ||||| ||||    
T  14358 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgt 14454  T
Q  331 ggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14455 ggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 14549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 425
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182204
Alignment:
Q  201 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcttttaccgc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  299 ttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttatggctgttttgttgttg-tttgcttggagaccatttgttctcat 395  Q
    ||||||||| ||    ||| || ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||    
T  182080 ttatcttgtatg---cttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcat 182174  T
Q  396 tgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
     ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  182175 agattacctctatctcttgctccacacatc 182204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 133
Target Start/End: Original strand, 176829 - 176925
Alignment:
Q  39 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtag 133  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  176829 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtag 176925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 17869 - 18048
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  17869 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 17966  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17967 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 269
Target Start/End: Original strand, 23962 - 24141
Alignment:
Q  90 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||    
T  23962 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaacccttt 24059  T
Q  189 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24060 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 17756 - 17818
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17756 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 17818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 23849 - 23911
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23849 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 23911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 425
Target Start/End: Original strand, 300 - 487
Alignment:
Q  237 aggccatattggttgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcttt-taccgcttatcttgtttgtgctttggtatctctt-gtgtggtt 334  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttctttcta--gcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggtt 395  T
Q  335 ttgctatacactagcttatggctgttttgttgttgtt--tgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 425  Q
    |||||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  396 ttgctcctcactagtttagggctgtttt-ttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 369 - 428
Target Start/End: Original strand, 34132 - 34191
Alignment:
Q  369 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt 34191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 8431 - 8516
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8431 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 8225 - 8285
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  8225 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 8285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 85768 - 85684
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatct 268  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  85768 tttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2491
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttg 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5682
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Original strand, 133292 - 133354
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 247  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  133292 tttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 133354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 43973 - 44058
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  43973 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 36844 - 36929
Alignment:
Q  186 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatctt 269  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  36844 tttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 90
Target Start/End: Original strand, 36640 - 36700
Alignment:
Q  28 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  36640 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggt 36700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10816 - 10728
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaatcttg 270  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  10816 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45276
Alignment:
Q  187 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 247  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattg 45276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13198
Alignment:
Q  386 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccaca 13198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11500
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccagactagg 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 265
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  206 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ttgaactgggtcaacaa 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17350 - 17286
Alignment:
Q  184 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 247  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  17350 cttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattg 17286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University